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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11594_high_7 (Length: 357)

Name: NF11594_high_7
Description: NF11594
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11594_high_7
NF11594_high_7
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (1-352)||(22256827-22257176)
chr7 (1-352)||(22232827-22233185)
chr7 (1-352)||(22253554-22253912)
chr7 (1-231)||(20100331-20100562)
chr7 (1-229)||(748241-748471)
chr7 (1-230)||(5826908-5827138)
chr7 (1-270)||(11825555-11825828)
chr7 (24-229)||(2349164-2349368)
chr7 (1-270)||(8397504-8397763)
chr7 (1-229)||(26460157-26460384)
chr7 (1-229)||(23598963-23599189)
chr7 (1-207)||(26182014-26182220)
chr7 (1-229)||(710217-710444)
chr7 (1-229)||(2251563-2251789)
chr7 (1-158)||(3541368-3541524)
chr7 (1-158)||(22083643-22083798)
chr7 (1-156)||(44017992-44018146)
chr7 (1-158)||(38431155-38431311)
chr7 (1-158)||(12803465-12803620)
chr7 (1-158)||(26152913-26153069)
chr7 (158-272)||(23467442-23467558)
chr7 (1-158)||(6964049-6964205)
chr7 (1-158)||(43548955-43549111)
chr7 (129-213)||(42606060-42606142)
chr7 (19-106)||(23467349-23467437)
chr7 (281-346)||(8276580-8276644)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (1-352)||(11702787-11703137)
chr4 (1-270)||(18859424-18859697)
chr4 (1-229)||(3734005-3734232)
chr4 (1-229)||(49636723-49636950)
chr4 (1-229)||(49640016-49640243)
chr4 (1-229)||(3719696-3719923)
chr4 (1-229)||(14701597-14701824)
chr4 (33-223)||(17670099-17670304)
chr4 (17-272)||(10385611-10385853)
chr4 (1-270)||(10247452-10247739)
chr4 (15-322)||(33400546-33400840)
chr4 (8-231)||(23652968-23653195)
chr4 (1-158)||(56089514-56089670)
chr4 (1-158)||(13978896-13979052)
chr4 (15-231)||(11560500-11560718)
chr4 (1-158)||(15850935-15851091)
chr4 (1-158)||(26703691-26703847)
chr4 (21-158)||(19928666-19928802)
chr4 (225-271)||(5670226-5670272)
chr4 (281-334)||(33410412-33410465)
chr4 (225-272)||(27013926-27013973)
chr4 (225-271)||(5672545-5672591)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (1-353)||(1503633-1503982)
chr2 (1-343)||(1506837-1507177)
chr2 (1-231)||(18011637-18011869)
chr2 (1-248)||(13517972-13518223)
chr2 (1-248)||(11059464-11059718)
chr2 (1-322)||(15704170-15704493)
chr2 (1-301)||(29435368-29435669)
chr2 (1-255)||(38326471-38326726)
chr2 (15-255)||(38326033-38326274)
chr2 (47-334)||(15719470-15719759)
chr2 (1-229)||(18938586-18938813)
chr2 (1-229)||(22592206-22592433)
chr2 (1-272)||(4577498-4577770)
chr2 (1-158)||(38316247-38316403)
chr2 (1-158)||(40677972-40678128)
chr2 (1-162)||(30719535-30719693)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (1-352)||(42354611-42354961)
chr3 (1-231)||(10963095-10963326)
chr3 (1-231)||(10966604-10966835)
chr3 (1-270)||(30158231-30158509)
chr3 (1-231)||(10959588-10959819)
chr3 (1-248)||(2783789-2784040)
chr3 (15-348)||(9154387-9154720)
chr3 (1-250)||(9157658-9157907)
chr3 (1-322)||(2279818-2280138)
chr3 (1-229)||(29233786-29234013)
chr3 (1-246)||(44508481-44508727)
chr3 (1-229)||(5887182-5887409)
chr3 (1-231)||(18882901-18883132)
chr3 (1-229)||(5897166-5897393)
chr3 (1-229)||(23374928-23375155)
chr3 (1-229)||(6173551-6173778)
chr3 (1-229)||(16414954-16415180)
chr3 (1-229)||(18515928-18516154)
chr3 (1-229)||(16314788-16315014)
chr3 (1-229)||(18495782-18496008)
chr3 (116-272)||(25888727-25888884)
chr3 (1-158)||(19868744-19868901)
chr3 (8-230)||(20536784-20537004)
chr3 (1-158)||(4250148-4250304)
chr3 (1-158)||(28327206-28327362)
chr3 (1-158)||(28330531-28330687)
chr3 (1-158)||(27054633-27054789)
chr3 (1-158)||(3305612-3305768)
chr3 (6-183)||(18551406-18551582)
chr3 (1-77)||(54736330-54736406)
chr3 (1-72)||(4226051-4226122)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-270)||(37641513-37641786)
chr1 (1-231)||(17902987-17903217)
chr1 (1-227)||(28918065-28918293)
chr1 (1-301)||(49715988-49716289)
chr1 (1-301)||(49719471-49719773)
chr1 (1-229)||(16839133-16839360)
chr1 (1-229)||(16849063-16849290)
chr1 (1-229)||(20964148-20964375)
chr1 (1-229)||(24200444-24200670)
chr1 (1-229)||(20981051-20981278)
chr1 (1-158)||(23441484-23441640)
chr1 (1-158)||(33898088-33898244)
chr1 (1-158)||(34552884-34553040)
chr1 (1-158)||(18392155-18392311)
chr1 (1-111)||(3087925-3088035)
chr1 (1-158)||(6195580-6195736)
chr1 (1-71)||(50197160-50197230)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (1-231)||(22653949-22654181)
chr8 (1-231)||(14187688-14187920)
chr8 (1-231)||(27863754-27863986)
chr8 (1-270)||(5963902-5964175)
chr8 (1-230)||(20262246-20262474)
chr8 (1-230)||(21048876-21049104)
chr8 (1-272)||(30645120-30645392)
chr8 (47-322)||(18696171-18696449)
chr8 (1-229)||(24434723-24434950)
chr8 (1-229)||(24444769-24444996)
chr8 (1-229)||(24903684-24903910)
chr8 (1-229)||(17543742-17543969)
chr8 (1-229)||(17013232-17013459)
chr8 (1-240)||(31981038-31981267)
chr8 (1-322)||(31984592-31984908)
chr8 (1-158)||(5827789-5827945)
chr8 (1-159)||(9466889-9467046)
chr8 (1-158)||(39660157-39660313)
chr8 (2-158)||(13331851-13332006)
chr8 (225-334)||(23613140-23613248)
chr8 (110-231)||(452843-452954)
chr8 (225-322)||(18721693-18721790)
chr8 (225-322)||(25595069-25595166)
chr8 (230-316)||(25591890-25591976)
chr8 (42-89)||(452959-453006)
chr8 (235-272)||(45155692-45155729)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-270)||(26547739-26548012)
chr5 (1-270)||(26551298-26551571)
chr5 (1-231)||(4732031-4732263)
chr5 (1-248)||(28562559-28562810)
chr5 (1-248)||(28566127-28566378)
chr5 (1-272)||(34652955-34653225)
chr5 (20-231)||(25185073-25185286)
chr5 (1-231)||(19685855-19686088)
chr5 (1-231)||(19689238-19689471)
chr5 (1-229)||(26726638-26726864)
chr5 (1-162)||(17944409-17944569)
chr5 (66-248)||(2453008-2453186)
chr5 (1-119)||(40800116-40800234)
chr5 (1-158)||(33920904-33921060)
chr5 (1-158)||(1810608-1810765)
chr5 (1-158)||(26337745-26337901)
chr5 (1-156)||(2500208-2500362)
chr5 (1-158)||(9690525-9690681)
chr5 (15-136)||(3194943-3195063)
chr5 (1-154)||(33321124-33321276)
chr5 (193-272)||(3194845-3194925)
chr5 (235-346)||(21333103-21333213)
chr5 (235-346)||(21336119-21336229)
chr5 (281-318)||(39192043-39192080)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-251)||(14969334-14969586)
chr6 (1-301)||(11410382-11410683)
chr6 (1-231)||(17231545-17231774)
chr6 (1-229)||(22920220-22920447)
chr6 (1-216)||(13095898-13096112)
chr6 (1-231)||(34502024-34502261)
chr6 (16-209)||(3827018-3827225)
chr6 (1-230)||(2330318-2330548)
chr6 (8-231)||(17696276-17696500)
chr6 (1-272)||(31262427-31262689)
chr6 (1-162)||(9313985-9314145)
chr6 (1-162)||(28117598-28117758)
chr6 (1-158)||(12746568-12746724)
chr6 (15-231)||(31123117-31123334)
chr6 (1-158)||(35027333-35027489)
chr6 (15-158)||(33679402-33679544)
chr6 (1-150)||(5618509-5618656)
chr6 (1-158)||(28894681-28894837)
chr6 (61-230)||(7560435-7560605)
chr6 (1-230)||(2330981-2331200)
chr6 (225-322)||(23388511-23388608)
chr6 (225-334)||(9953572-9953679)
chr6 (94-162)||(22464173-22464240)
chr6 (225-301)||(5738496-5738572)
chr6 (16-72)||(15579130-15579186)
chr6 (1-44)||(5618414-5618457)
chr6 (203-248)||(20189837-20189882)
chr6 (203-248)||(22146109-22146154)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (1-322)||(53082-53405)
scaffold0062 (47-334)||(68027-68316)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (1-301)||(19675-19974)
scaffold0214 (1-301)||(13225-13525)
scaffold0214 (28-301)||(27241-27514)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-229)||(28860-29087)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (1-229)||(27053-27280)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-207)||(27079-27285)
scaffold0012 (83-229)||(31347-31492)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (1-265)||(5960-6204)
scaffold0360 (1-324)||(2075-2367)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-162)||(6996-7156)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-158)||(13354-13510)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-322)||(226950-227266)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (1-158)||(4021-4177)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (1-131)||(1192-1320)
[»] scaffold0911 (1 HSPs)
scaffold0911 (1-158)||(4327-4481)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (1-158)||(29084-29240)
scaffold0083 (1-158)||(52881-53037)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (1-88)||(2022-2109)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (281-321)||(26803-26843)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (225-272)||(5811-5858)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (225-269)||(62183-62227)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22257176 - 22256827
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22257176 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 22257077  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257076 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacgttaataataaagagagtatcaactacattcatat 22256977  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaat-aaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |        |||||||||||||||||||    
T  22256976 attacaataggttcatcatggctcaatcaaaggaaattaactagacatgattaaataaaaaaaacaacataataaagaaaataaaccgatagagtttcgt 22256877  T
Q  300 cgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 352  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22256876 cga---cggcgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttcactct 22256827  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 22232827 - 22233185
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22232827 ttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 22232926  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac------at 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||    
T  22232927 agtcatacaaaacaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactaaataacattaatagtaaagagagtatcaactacattcatat 22233026  T
Q  195 tcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaat-aaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |        |||||||||||||    
T  22233027 tcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaaaaaaacaacataataaaaaaaataaaccgatagag 22233126  T
Q  294 tttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 352  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22233127 tttcatcgatatcggcgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 22233185  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22253912 - 22253554
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22253912 ttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 22253813  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattc---- 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        
T  22253812 agtcatacaaaacaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactaaataacattaatagtaaagagagtatcaactacattcatat 22253713  T
Q  197 --atatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaat-aaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagag 293  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |        |||||||||||||    
T  22253712 tcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaaaaaaacaacataataaaaaaaataaaccgatagag 22253613  T
Q  294 tttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 352  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22253612 tttcatcgatatcggcgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 22253554  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20100562 - 20100331
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20100562 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 20100463  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20100462 agtcatacaaagcaattatat-aaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 20100364  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20100363 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 20100331  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 748241 - 748471
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  748241 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaaa 748340  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  748341 agtcatacaaagcagtcatataaaaaacaatgaacacaagtaattctgaataaagacagaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 748440  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  748441 atattacaataggttcatcatggctcaatca 748471  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5826908 - 5827138
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5826908 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaacagtcattcaattcataatatcaattcatgtaattgcacgaagctatggttaat 5827007  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5827008 agtcatacaaagcaattatttgaaaa-caatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 5827106  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5827107 atattacaataggttcatcatggcttaatcaa 5827138  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 11825555 - 11825828
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11825555 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctgatatcgagacatgtaattgcacgaagctagggttaat 11825654  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11825655 agtcatataaaacaattatgtgaaaagtaatgaacacaagtaattctgaataaagattgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 11825754  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  11825755 atattacaataggttcatcatggcttaatcaacaaggaaattagctagacatgatcaaacgaataaacaacata 11825828  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2349368 - 2349164
Alignment:
Q  24 tcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataa 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  2349368 tcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaaca---atataa 2349272  T
Q  124 aaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatgg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  2349271 aaagaaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgatttacatattacaataggtttatcatgg 2349172  T
Q  222 ctcaatca 229  Q
    ||||||||    
T  2349171 ctcaatca 2349164  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8397763 - 8397504
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8397763 ttgaatcaaacatgattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 8397664  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    | ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |            ||||||||    
T  8397663 aatcatacaaaacaattatctgaaaaacaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataatttactg------------attcatat 8397576  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  8397575 attacaataggttcatcatgacttaatcaacaaggaaattagctagacatgatcaaaggaataaacaacata 8397504  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26460384 - 26460157
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  26460384 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 26460286  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  26460285 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 26460187  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26460186 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 26460157  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23598963 - 23599189
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  23598963 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctatggttaat 23599061  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  23599062 agtcatac-aagcaattatat-gaaggcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 23599159  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23599160 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 23599189  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26182220 - 26182014
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  26182220 ttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcttaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 26182122  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  26182121 agtcatacaa-gcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 26182023  T
Q  199 atattacaa 207  Q
    |||||||||    
T  26182022 atattacaa 26182014  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 710217 - 710444
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  710217 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaat 710316  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  710317 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 710414  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  710415 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 710444  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2251789 - 2251563
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  2251789 ttgaatcaaacagaattagtaattcaggattaaaaactagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 2251691  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||  | ||||    
T  2251690 agtcata-aaagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaaggctgaataatattattaaataagagagtatcaaccactaaatcat 2251593  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2251592 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 2251563  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 3541368 - 3541524
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3541368 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaat 3541467  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3541468 agtcattcaaa-caatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaatgaagact 3541524  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 22083643 - 22083798
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  22083643 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaga-ttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaat 22083741  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22083742 agtcatgcaaa-caatcatataaaaagcaatgaacataaataattctgaataaagact 22083798  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 44017992 - 44018146
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  44017992 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 44018091  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaaga 156  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  44018092 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaaga 44018146  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38431311 - 38431155
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  38431311 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 38431212  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38431211 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcagtaagcacaaataattctgaataaagact 38431155  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 12803465 - 12803620
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  12803465 ttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggt-agtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 12803563  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||| ||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  12803564 agtcatataaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 12803620  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26153069 - 26152913
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  26153069 ttgaataaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 26152970  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||  | | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  26152969 agtcataaaaag-aatcataaaaaaagcgttaagcacaaataattatgaataaagact 26152913  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 272
Target Start/End: Original strand, 23467442 - 23467558
Alignment:
Q  158 tgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaa 255  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23467442 tgaataatattgataataaagagagtttcaactactgattcatatattacaatagattcatcatggctcaatcaaa-ggaattagctagacataattaaa 23467540  T
Q  256 taaagaaac-aacatagt 272  Q
     ||| |||| ||||||||    
T  23467541 gaaataaactaacatagt 23467558  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6964205 - 6964049
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  6964205 ttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaaggtagggttagt 6964106  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||| || | | ||| | ||||||||||||||||||    
T  6964105 agtcatacaaa-caatcataagaaaaacattaagcaccaataattctgaataaagact 6964049  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43549111 - 43548955
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  43549111 ttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaagttcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 43549012  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  43549011 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattttgaataaagact 43548955  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Original strand, 42606060 - 42606142
Alignment:
Q  129 aatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatatattacaataggtt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42606060 aatgaacacaa-taattctgaataaagattgaattacattaacaataaagagagtatcaacta-attcatatgttacaataggtt 42606142  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 23467349 - 23467437
Alignment:
Q  19 ctatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaa-ttcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcat 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  23467349 ctatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattaaatttcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcat 23467437  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8276644 - 8276580
Alignment:
Q  281 taaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttctt 346  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8276644 taaactgatagagttccgtcgttgccggc-ttgctcctcaattttctttcaatcggtgttgttctt 8276580  T

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Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 11702787 - 11703137
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  11702787 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 11702886  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11702887 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaattattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactacattcatat 11702985  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtc 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||| |||||||    
T  11702986 attacaataggtttatcatggctcaatcaaagagaattagctagacatgattaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagaatttcgtc 11703085  T
Q  301 gatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 352  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11703086 gatgtcggcgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 11703137  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18859697 - 18859424
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18859697 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 18859598  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18859597 agtcatacaaatcaattatttgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataattttaataataaagagagtatcaactactaattcat 18859498  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  18859497 atattacaataggttcatcatggcttaatcaacaaggaaattagctaaacatgatcaaacgaataaacaacata 18859424  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3734232 - 3734005
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  3734232 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 3734134  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  3734133 agttat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 3734035  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3734034 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 3734005  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 49636723 - 49636950
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  49636723 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 49636821  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  49636822 agttatac-gagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 49636920  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49636921 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 49636950  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 49640016 - 49640243
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  49640016 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 49640114  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  49640115 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 49640213  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49640214 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 49640243  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3719696 - 3719923
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  3719696 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaat 3719795  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  3719796 agtcatac-aagcaattatat-gaaatcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 3719893  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3719894 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 3719923  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14701824 - 14701597
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  14701824 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaat 14701725  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||  | ||||    
T  14701724 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtattaactactaaatcat 14701627  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14701626 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 14701597  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17670304 - 17670099
Alignment:
Q  33 aaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatg 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17670304 aaaggtagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaattatttaaaaagcaatg 17670205  T
Q  133 aacacaagta-------------attctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatc 217  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17670204 aacacaagtaattttgaataaagattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactaattcatatattacaatacgttcatc 17670105  T
Q  218 atggct 223  Q
    ||||||    
T  17670104 atggct 17670099  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10385853 - 10385611
Alignment:
Q  17 tactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaat 116  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10385853 tactatatcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgc-aagcaat 10385755  T
Q  117 tatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttc 214  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||                  
T  10385754 catatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactactaattcatat-------------- 10385669  T
Q  215 atcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  10385668 atcatggctcaatcaaagagaattaactagacatgaataaagaaacaaacaacatagt 10385611  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10247739 - 10247452
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  10247739 ttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaat 10247640  T
Q  101 agtcatacaaag-----------------caattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagt 183  Q
    |||||| ||||                  |||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  10247639 agtcatgcaaacaatgcaaacaatgcaaacaatcatatgaaaggcaatgaacacagataattctgaataaagactgaataatattgataataaaaagagt 10247540  T
Q  184 atcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
     | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  10247539 tttaactactgattcatatattacaataggttcatcgtgactcaatcaaatggaattaactagacat-attaaaggaataaacaacata 10247452  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 33400546 - 33400840
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||    
T  33400546 attactatttcagaattaaaagttagggttagtagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcaagcaaa-ca 33400644  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatatattacaataggttc 214  Q
    || |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||           |||  || ||| |||||||||    
T  33400645 atcatatgaaaagcaattaacataaataattctgaataaagaccgaataatattgataacaaagagag-----------ttccaattttataataggttc 33400733  T
Q  215 atcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgc 314  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  33400734 attatggttcaatcaaagggaattagatagacatgattaaa-gaataaacaacatagtaaagaaaataaatcgatagaatctcgtcgttatcgacgttgc 33400832  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23653195 - 23652968
Alignment:
Q  8 aaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaatt---cctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||    ||| | ||||||| |  | |||| |||||| || | |||||||||    
T  23653195 aaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaattaataatacctgagatcaattaacatgattgaaagaagttaggtttaatagtc 23653096  T
Q  105 atacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac---attcatata 201  Q
    || |||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||| |||    
T  23653095 atgcaaa-caatcataataaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagattgaataacattgataataaagagagt-tcaactacttggttcacata 23652998  T
Q  202 ttacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23652997 ttacaataggttcatcatggctcaatcaaa 23652968  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 56089514 - 56089670
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  56089514 ttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaat 56089613  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56089614 agtcatgcaaa-caatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagact 56089670  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13979052 - 13978896
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  13979052 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 13978953  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| | |  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13978952 agtcatacaaa-caatcagaagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 13978896  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11560718 - 11560500
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| |||||  |||||| |  | | |  |||||| || ||||||||||||| |||| ||    
T  11560718 attactattttaggattaaaagatagggttactagtcaattaatacctaaggtcaattaacatgactaaaagaagttagggttaatagtcatgcaaa-ca 11560620  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacat---tcatatattacaatagg 211  Q
    || |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||     
T  11560619 atcataataaaagcaatgaacacaaataattttgaataaagattgtataacattgataataaagagagtttcaactacttggatcacatattacaataga 11560520  T
Q  212 ttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  11560519 ttcatcatgtctcaatcaaa 11560500  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15851091 - 15850935
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  15851091 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattgaaagaagttagggttatt 15850992  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  15850991 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattttgaataaagact 15850935  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 26703691 - 26703847
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||||||||  |||| |    
T  26703691 ttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatatgattgaaagaagctagagttagt 26703790  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  26703791 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 26703847  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19928802 - 19928666
Alignment:
Q  21 atttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattata 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |    
T  19928802 atttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa-caatcaga 19928704  T
Q  121 taaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
      ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  19928703 agaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 19928666  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5670272 - 5670226
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatag 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5670272 aatcaaaggaaattagctagacatgattaaagaaataaacaacatag 5670226  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 334
Target Start/End: Original strand, 33410412 - 33410465
Alignment:
Q  281 taaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatc 334  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33410412 taaaccgatagagttccgtcgttttcgacggtgcttctcaatcttctttcaatc 33410465  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27013973 - 27013926
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27013973 aatcaaaggaaattagctagacatgattaaaataataaacaacatagt 27013926  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5672591 - 5672545
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatag 271  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5672591 aatcaaagaaaattagctagacatgattaaagaaataaacaacatag 5672545  T

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Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 1503633 - 1503982
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  1503633 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 1503732  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1503733 agtcatgcaa-gcaatcatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactacattcatat 1503831  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| |||||||||||||||    
T  1503832 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagagaattagctagacatgattaaataaataaacaacatagt-aagaaaataaatcgatagagtttcgtc 1503930  T
Q  301 gatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctctc 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1503931 gatgtcggcgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgtt-ttctctctc 1503982  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 1506837 - 1507177
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  1506837 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 1506936  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1506937 agtcatgcaa-gcaatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactacattcatat 1507035  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  1507036 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagagaattagctagacatgattaaataaataaacaacatagt-aagaaaataaaccgatagagtttcgtc 1507134  T
Q  301 gatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgtt 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1507135 gatgtcggcgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgtt 1507177  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18011869 - 18011637
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18011869 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 18011770  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  18011769 agtcatacaaagcaactatataaaaagcaatgaacacaagtaattataaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgatttat 18011670  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18011669 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 18011637  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13518223 - 13517972
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13518223 ttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 13518124  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||    
T  13518123 agtcatacaaatcaattatttgaaaagctatgaacacaagtaattttgaataaagactgaataacattaataataaagagaggataaactactgattcat 13518024  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa-aggg-aattagctagacat 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  13518023 atattacaataggttcatcatagcttaatcaagagggaaattagctagacat 13517972  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11059718 - 11059464
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11059718 ttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 11059619  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactga---ataacattaataataaagagagtatcaactac--att 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11059618 agtcatacaaagcaattatctgaaaaacaatgaacacaagtaactctgaataaagactgaataataacattaataataaagagagtatcaactactgatt 11059519  T
Q  196 catatattacaataggttcatcatggctcaatcaa-aggg-aattagctagacat 248  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  11059518 catttattacaataggttcatcatggcttaatcaagagggaaattagctagacat 11059464  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 15704170 - 15704493
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  15704170 ttgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaggaagttagggttaat 15704269  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  15704270 agtcatac-aagcaattatataaaaa-caatgaacacaaataattctaaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaacttctaattcat 15704367  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | | | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||    
T  15704368 atattacaa-aggttcatcatggctcaatgaaactaagaatttaactagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtt 15704466  T
Q  296 tcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  15704467 tcgtcgttgatgactttgctcctcaat 15704493  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29435669 - 29435368
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29435669 ttgaaacaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaat 29435570  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  29435569 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaatagcattattaat-aagagaatatcaactactaattcat 29435473  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||    
T  29435472 atattacaa-aggttcatcatggctcaatcaaactaagagtttagctagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtt 29435374  T
Q  296 tcgtcg 301  Q
     |||||    
T  29435373 ccgtcg 29435368  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 38326471 - 38326726
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  38326471 ttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 38326570  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||    
T  38326571 agtcatgcaaa-caatcatatcaaaagtaatgaacacaaataattctgaataaagacggaataatattgataataaagaaagtttcaactactgattcat 38326669  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaa 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38326670 atattccaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaa 38326726  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38326274 - 38326033
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  38326274 attattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa-ca 38326176  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggt 212  Q
    || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  38326175 atcatatcaaaagtaatgaacacaaataattctgaataaagacggaataatattgataataaagaaagtttcaactactgattcatatattccaataggt 38326076  T
Q  213 tcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38326075 tcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaa 38326033  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 334
Target Start/End: Original strand, 15719470 - 15719759
Alignment:
Q  47 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15719470 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcatataa-gcaattatataaaaa-caatgaacacaagtaattc 15719567  T
Q  147 tgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |   | ||| |    
T  15719568 tgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactaattcatatattacaa-aggttcatcatggctcaatgaaactaataatttaac 15719666  T
Q  242 tagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatc 334  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  15719667 tagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgatgactttgctcctcaatcttttctcaatc 15719759  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18938813 - 18938586
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  18938813 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 18938715  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  18938714 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 18938616  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18938615 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 18938586  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22592433 - 22592206
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  22592433 ttgaatcaaacagaattactaattcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatctcaattcatataaattcaagaagctagggttaat 22592334  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  22592333 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacatgtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 22592236  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22592235 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 22592206  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4577770 - 4577498
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  4577770 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagg-ttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagatagggttaat 4577672  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||   ||||| ||||    
T  4577671 agtcatgcaaa-caattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaata---actgaataatattgataataaaaagagtgtca---acatttatat 4577579  T
Q  201 attaca---------ataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    ||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  4577578 attacaataggtaatataggttcatcatgactcaatcaaagggaattagctagacataattaaagaaataaacaacatagt 4577498  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 38316247 - 38316403
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  38316247 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctacggttagt 38316346  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||| || | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38316347 agtcatacaaa-caatcataagaaaaacattaagcacaaataattctgaataaagact 38316403  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 40677972 - 40678128
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  40677972 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 40678071  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  40678072 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 40678128  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30719693 - 30719535
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  30719693 ttgaattaaacagaattactattttaggattaaaagttagagttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaat 30719594  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaat 162  Q
    |||||| |||   ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  30719593 agtcatgcaa---aatcatataaaaagcaatgaacttaaataattctgaataaaaactgaat 30719535  T

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Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 42354611 - 42354961
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  42354611 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 42354710  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  42354711 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaatgattctgaataaagactgaataatattgataataaagacaatttcaactacattcatat 42354809  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt-nnnnnnnntaaaccgatagagtttcgt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  42354810 attacaataggttcatcatgactcaatcaaa-ggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtaaaaaaaaataaaccgatagagtttcgt 42354908  T
Q  300 cgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttctctct 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42354909 cgatgtcggcgttgctcctcaatcttctttcaatctttgttgttcttctctct 42354961  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10963326 - 10963095
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10963326 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 10963227  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10963226 agtcatacaaa-caattatatgaaaagcaatgaacacacgtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 10963128  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10963127 atattacaaaaggttcatcatggctcaatcaaa 10963095  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10966835 - 10966604
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10966835 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 10966736  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10966735 agtcatacaaa-caattatatgaaaagcaatgaacacacgtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 10966637  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10966636 atattacaaaaggttcatcatggctcaatcaaa 10966604  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 30158231 - 30158509
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30158231 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 30158330  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatg-----aacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--a 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  30158331 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatgaacacaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactga 30158430  T
Q  194 ttcatatattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  30158431 ttcatatattacaatagggtcatcatggcttaatcaataaggaaattagctagacatgatcaaacgaataaacaacata 30158509  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10959819 - 10959588
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  10959819 ttgaatcaaacaggattactatttcagaattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttgat 10959720  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10959719 agtcatac-aagcaattatatgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaaggctgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 10959621  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10959620 atattacaaaaggttcatcatgcctcaatcaaa 10959588  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2784040 - 2783789
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  2784040 ttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttgcacgaagctagggttaat 2783941  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaacta--cattcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  2783940 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaatactaaagagaggatcaactactcattcat 2783841  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa-aggg-aattagctagacat 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  2783840 atattacaatagattcatcatggcttaatcaagagggaaattagctagacat 2783789  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9154720 - 9154387
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || | ||| ||||||| |||| ||    
T  9154720 attactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttaggattactagtcatgcaaa-ca 9154622  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggt 212  Q
    || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9154621 atcatatgaaaagcaatgaatacaaataattctgaataaagaccgagtaatatcgataataaagagatt-tcaactactgattcatatattacaataggt 9154523  T
Q  213 tcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||        ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  9154522 tcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaatacataaacaacatagtaaaaaaaataaacagataaagttccgtcgatgtcgacgtt 9154423  T
Q  313 gctcctcaatcttctttcaatctgtgttgttcttct 348  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  9154422 gctcctcaatcttcttccaattcgtgttgttcttct 9154387  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9157907 - 9157658
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |    
T  9157907 ttgaattaaatagaattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttact 9157808  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  9157807 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagt-tcaactactgattcat 9157710  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9157709 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaaggaaattagctagacatga 9157658  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 2279818 - 2280138
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2279818 ttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctaaggttaat 2279917  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||  | ||||    
T  2279918 agtcatac-aggcaattaaat-gaaagcaatgaacacaaataattctgaataaaaactgaataacattattaaataagagagtatcagctactaaatcat 2280015  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcg 298  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||        |||||||||||| || ||    
T  2280016 atattataa-aggttcatcatggctcaatcatatgaaattagctagacatgaataaagaaacaaacaacattgtaaagaaaataaaccgatagaattccg 2280114  T
Q  299 tcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  2280115 tcgttgccggcgttgctcctcaat 2280138  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29233786 - 29234013
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  29233786 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 29233884  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||  ||||||    
T  29233885 agtcatac-aagcaattatatgaaaaacaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaatacgagagtatcaactactaattcat 29233983  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29233984 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 29234013  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44508727 - 44508481
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  44508727 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctcgggttagtagtcattcaattcttaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 44508628  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||    
T  44508627 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattctgaataaagattgaataatattgataataaagagagttttaactactgattcat 44508529  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44508528 atattacaataggttcatcatggctcaattaaagggaattaactagac 44508481  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5887182 - 5887409
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  5887182 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 5887280  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5887281 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 5887379  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5887380 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 5887409  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18883132 - 18882901
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  18883132 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaatccctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaat 18883033  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||    
T  18883032 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagattttcaactactgattcat 18882934  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18882933 atattacaatagattcatcatggctcaatcaaa 18882901  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5897166 - 5897393
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  5897166 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-taagaagctagggttaat 5897264  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5897265 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 5897363  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5897364 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 5897393  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23374928 - 23375155
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  23374928 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagatagggttaaaagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 23375026  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  23375027 agtcatac-gagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaaaactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 23375125  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23375126 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 23375155  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6173551 - 6173778
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6173551 ttgaatcaaacatgattactaattcaggattaaaatctagggttagtggtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaat 6173650  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  6173651 agtcatacaaa-caattaaat-gaaagcaatgaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 6173748  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6173749 atattacaa-aggttcatcatggcttaatca 6173778  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16414954 - 16415180
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16414954 ttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaattcataatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 16415052  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  16415053 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagcgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 16415150  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16415151 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 16415180  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18515928 - 18516154
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  18515928 ttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaattcataatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 18516026  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  18516027 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagcgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 18516124  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18516125 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 18516154  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16314788 - 16315014
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16314788 ttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 16314886  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  16314887 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacataagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 16314984  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16314985 atatcacaa-aggttcattatggctcaatca 16315014  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18495782 - 18496008
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  18495782 ttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 18495880  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  18495881 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacataagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 18495978  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  18495979 atatcacaa-aggttcattatggctcaatca 18496008  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Original strand, 25888727 - 25888884
Alignment:
Q  116 ttatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggtt 213  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  25888727 ttatgtaaaaaacaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcatatattacaatagatt 25888826  T
Q  214 catcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  25888827 catcatggcttaatcaaa-agaattagctagacatgattaaaggaataaacaacatagt 25888884  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19868901 - 19868744
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19868901 ttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaagatcaatttatgtaattggaagaagctagggttaat 19868802  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19868801 agtcatgcaaagcaatcatatgaaaagcaacaaacacaaataattctgaataaagact 19868744  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Original strand, 20536784 - 20537004
Alignment:
Q  8 aaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcata 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || | |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  20536784 aaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcaattaattcctaagatcaattaatatgattg-aagaagttagggttaatagtcata 20536882  T
Q  108 caaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattac 205  Q
    |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  20536883 caaa-caatcataagaaaagcaatgaacacaaataattttgaataaagactgcataatattgataataaagag--tttcaaccactgattcacatattac 20536979  T
Q  206 aataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
     ||||||||||||||  ||||||||    
T  20536980 cataggttcatcatgtttcaatcaa 20537004  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4250304 - 4250148
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  4250304 ttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttaat 4250205  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4250204 agtcatgcaaa-caatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagact 4250148  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28327362 - 28327206
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  28327362 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 28327263  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  28327262 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 28327206  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28330687 - 28330531
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  28330687 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 28330588  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  28330587 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 28330531  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27054789 - 27054633
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  27054789 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 27054690  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  27054689 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataatgact 27054633  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3305768 - 3305612
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  3305768 ttgaattaaacagaattactatttcattattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctattatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 3305669  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3305668 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 3305612  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18551582 - 18551406
Alignment:
Q  6 tcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtca 105  Q
    |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||| ||| ||    
T  18551582 tcaaacagaatcactatttcaggtttaatagctagggttagtagtcaattaactcctaagatcaattaatacaattgaaagaagctagggttagtagcca 18551483  T
Q  106 tacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagt 183  Q
    |||||| |||| |||  |||| |||| | ||    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  18551482 tacaaa-caatcataagaaaatcaataagcatgtataattctgaataaagactgaatgttattgataataaagagagt 18551406  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 54736330 - 54736406
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgt 77  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  54736330 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaggattagtagcgattcaattcttaagatcaatttatgt 54736406  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 4226051 - 4226122
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaatt 72  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||    
T  4226051 ttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagcaatcattcaatttctaagatcaatt 4226122  T

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Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37641786 - 37641513
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37641786 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 37641687  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  37641686 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 37641587  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  37641586 atattacaataggtttatcatggcttaatcaacaaggaaattagctagacatgatcaaacgaataaacaacata 37641513  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17902987 - 17903217
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17902987 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaat 17903086  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  17903087 agtcatac-aagaaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataattaagagagtatcaactactaattcat 17903184  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17903185 atattacaaaatgttcatcatggctcaatcaaa 17903217  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28918293 - 28918065
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  28918293 ttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaatttatttaatttcatgatgctagggttaat 28918194  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28918193 agtcatacaacacaattatatgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 28918094  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaat 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28918093 atattacaaaaggttcatcatggctcaat 28918065  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49716289 - 49715988
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49716289 ttgaatcaaacagtattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaat 49716190  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  49716189 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaatagcattattaat-aagagaatatcaactactaattcat 49716093  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||    
T  49716092 atattacaa-aggttcatcatggctcaatcaaactaagagtttagctagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtt 49715994  T
Q  296 tcgtcg 301  Q
     |||||    
T  49715993 ccgtcg 49715988  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49719773 - 49719471
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactattt-caggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49719773 ttgaatcaaacagtattacttttttcaagattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaa 49719674  T
Q  100 tagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attca 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  49719673 tagtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaatagcattattaat-aagagaatatcaactactaattca 49719577  T
Q  198 tatattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagt 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||    
T  49719576 tatattacaa-aggttcatcatggctcaatcaaactaagagtttagctagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagt 49719478  T
Q  295 ttcgtcg 301  Q
    | |||||    
T  49719477 tccgtcg 49719471  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16839133 - 16839360
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16839133 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 16839231  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  16839232 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 16839330  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16839331 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 16839360  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16849063 - 16849290
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16849063 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 16849161  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  16849162 agtcat-ccgagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 16849260  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16849261 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 16849290  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20964375 - 20964148
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20964375 ttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatacatgtaatttcaagaagctatggttaat 20964276  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  20964275 agtcatac-aagcaattaaat-gaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataacattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 20964178  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20964177 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 20964148  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24200444 - 24200670
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  24200444 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 24200542  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  24200543 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattttgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 24200640  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24200641 atattacaa-aggttcatcattgctcaatca 24200670  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20981278 - 20981051
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  20981278 ttgaatcaaacaaaattattaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcttaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaat 20981179  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||  | ||||    
T  20981178 agtcatac-atgcaattaaat-gaaagcaatgaacacaaataattctgaatatagactgaataacattattaaataagatagtatcaactactaaatcat 20981081  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20981080 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 20981051  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 23441484 - 23441640
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  23441484 ttgaattaaacagaattactatttcaggataaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 23441583  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  23441584 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 23441640  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33898244 - 33898088
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  33898244 ttgaattaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaacatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 33898145  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  33898144 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 33898088  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 34552884 - 34553040
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  34552884 ttgaataaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattgaaagaaactagggttagt 34552983  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  34552984 agtcatacaaa-caatcataaaaaaaacattaagcacaaataattctgaataaagact 34553040  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18392311 - 18392155
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  18392311 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 18392212  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||| || | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  18392211 agtcatacaaa-caatcataagaaaaccattaagcacaaataattctgaataaagact 18392155  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 3087925 - 3088035
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |  ||| |||||| || ||||| |    
T  3087925 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagttattcaattcctaagatcaatttatatggttgaaagaagttagggttatt 3088024  T
Q  101 agtcatacaaa 111  Q
    |||||||||||    
T  3088025 agtcatacaaa 3088035  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6195736 - 6195580
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||| |||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | ||||| |    
T  6195736 ttgaattaaacataattactatttcaagattaaaagttatggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagccagggttagt 6195637  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  6195636 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcgttaagcacaaataattctgaataaagact 6195580  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 50197160 - 50197230
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaat 71  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  50197160 ttgaattaaacagaataactatttcaagattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaagatcaat 50197230  T

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Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22654181 - 22653949
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22654181 ttgaatcaaacaagattactatttcaggattaaaagttggggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 22654082  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaacta--cattcat 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  22654081 agtcatacaaagcaataatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactattgattcat 22653982  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22653981 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 22653949  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14187920 - 14187688
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
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T  14187920 ttgaatcaaacaggattactacttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagttagggtttat 14187821  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14187820 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 14187721  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  14187720 atattacaatagatttatcatggctcgatcaaa 14187688  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27863754 - 27863986
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27863754 ttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaagatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 27863853  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27863854 agtcatacaaaacaatcatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 27863953  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27863954 atagtacaataggttcatcatggctcaatcaaa 27863986  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5964175 - 5963902
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5964175 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 5964076  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  5964075 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaatcgcattaataatacagagagtatcaactactgattcat 5963976  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  5963975 atattacaataggatcatcatggcttaatcaacaaggaaattagctagacatgatcaaacgaataaacaacata 5963902  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20262474 - 20262246
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  20262474 ttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaat 20262375  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20262374 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactaattcat 20262277  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20262276 atattacaa-aggttcatcatggctcaatcaa 20262246  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21049104 - 21048876
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21049104 ttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaat 21049005  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21049004 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactaattcat 21048907  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21048906 atattacaa-aggttcatcatggctcaatcaa 21048876  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30645392 - 30645120
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  30645392 ttgaattaaacagaattactatttcaaaattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaat 30645293  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  30645292 agtcatgcaaa-caatcatatcaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactggataatattaataataaagagagtttcaactattaattcat 30645194  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  30645193 atattacaataggttcatcataactcaatcaaagggaattagttagacatgattaaaggaataaacaacatagt 30645120  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 322
Target Start/End: Original strand, 18696171 - 18696449
Alignment:
Q  47 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaag-aagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18696171 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaaggaagttagggttaatagtcatacaa-gcaattatataaaaa-caatgaacacaaataatt 18696268  T
Q  146 ctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattag 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | | | |||     
T  18696269 ctaaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaacttctaattcatatattacaa-aggttcatcatggctcaatgaaactaagaatttaa 18696367  T
Q  241 ctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  18696368 ctagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgatgactttgctcctcaat 18696449  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24434950 - 24434723
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  24434950 ttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 24434852  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  24434851 agtcatac-gagtaattatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 24434753  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24434752 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 24434723  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24444996 - 24444769
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  24444996 ttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctaggattaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 24444898  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  24444897 agtcatac-gagtaattatatgaaaagaaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 24444799  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24444798 atattacaa-cggttcatcatggctcaatca 24444769  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24903684 - 24903910
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  24903684 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaat 24903783  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||  |  |||    
T  24903784 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataata-tattaaataagagagtatcaactactaaaccat 24903880  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903881 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 24903910  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17543969 - 17543742
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||    
T  17543969 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatataaattcaataagctagggttaat 17543870  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  17543869 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 17543772  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  17543771 atattacga-aagttcatcatggctaaatca 17543742  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17013232 - 17013459
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||    
T  17013232 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatataaattcaataagctagggttaat 17013331  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  17013332 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaatattattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 17013429  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  17013430 atattacga-aagttcatcatggctaaatca 17013459  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31981267 - 31981038
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  31981267 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatttatgtgattgtaagaagctatggttaat 31981168  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||  ||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||           |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||    
T  31981167 agtcattgaaa-caatcatatgaaaatcaatgaacacaaataatt-----------ctgaataatattgataataaaaagagtttcaactactgattcat 31981080  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattag 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31981079 atattacaataggtttatcatggctcaatcaaagggaattag 31981038  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31984908 - 31984592
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  31984908 ttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctatggttaat 31984809  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaat-----aataaagagagtatcaactac--a 193  Q
    |||||| | || |||| |||| |||||||||||| |||          |||||||||||||||| ||| ||     |||||| ||||| ||||||||  |    
T  31984808 agtcatgc-aaccaatcatatgaaaagcaatgaataca----------aataaagactgaataatattgataataaaataaaaagagtttcaactactga 31984720  T
Q  194 ttcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagag 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||  || ||||||||||||        |||||||||||||    
T  31984719 ttcatatattacaataggtttatcatggcccaatcaaagggaattagttaaacat-atcaaaggaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagag 31984621  T
Q  294 tttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
     ||||||| ||||| | || |||||||||    
T  31984620 cttcgtcgttgtcggctttactcctcaat 31984592  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5827945 - 5827789
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  5827945 ttgaattaaacagaattactctttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagattaatttatgtgattgaaagaagctagggttaat 5827846  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||  |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5827845 agtcaagcaaa-caatcataagaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagact 5827789  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9467046 - 9466889
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  9467046 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 9466947  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactg 159  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9466946 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattatgaataaagactg 9466889  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 39660157 - 39660313
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  39660157 ttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 39660256  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  39660257 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 39660313  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13332006 - 13331851
Alignment:
Q  2 tgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaata 101  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  13332006 tgaattaaacagaattactatttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagta 13331907  T
Q  102 gtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||| || |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13331906 gtcatacgaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattatgaataaagact 13331851  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23613248 - 23613140
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatct 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23613248 aatcaaaggaaattagctagacatggttaaatacataaataacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgtcgacgttgct-ctcaatct 23613150  T
Q  325 tctttcaatc 334  Q
    ||||||||||    
T  23613149 tctttcaatc 23613140  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 452954 - 452843
Alignment:
Q  110 aagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaa 207  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  452954 aagcaattata-agaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacatt----------agagtatcaactactaattcatatattacaa 452866  T
Q  208 taggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
     || |||||||| |||||||||||    
T  452865 -agattcatcatagctcaatcaaa 452843  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Original strand, 18721693 - 18721790
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18721693 aatcaaaggaaattagctagacatggttaaatacataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgtcggcgttgctcctcaat 18721790  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Original strand, 25595069 - 25595166
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25595069 aatcaatggaaattagctagacatgattaaatacataaacaacatagtaaaaaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgtcggcgttgctcctcaat 25595166  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 316
Target Start/End: Original strand, 25591890 - 25591976
Alignment:
Q  230 aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctc 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25591890 aaggaaattagctagacatgattaaatacataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgtcgacgttgctc 25591976  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 453006 - 452959
Alignment:
Q  42 gttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaag 89  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  453006 gttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaag 452959  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Original strand, 45155692 - 45155729
Alignment:
Q  235 aattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45155692 aattagctagacatgattaaagaaataaacaacatagt 45155729  T

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Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26548012 - 26547739
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26548012 ttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 26547913  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  26547912 agtcatacaaaacaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 26547813  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  26547812 atattaaaataggttcatcatggcttaatcaacaaggaaattagctagacatgatcaaacgaataaacaacata 26547739  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26551571 - 26551298
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26551571 ttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 26551472  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  26551471 agtcatacaaaacaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 26551372  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacata 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  26551371 atattaaaataggttcatcatggcttaatcaacaaggaaattagctagacatgatcaaacgaataaacaacata 26551298  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4732031 - 4732263
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4732031 ttgaatcaaacatgattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtcatccaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaat 4732130  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  4732131 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataagattaataataaagagaagatcaactactgattcat 4732230  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4732231 atattacaataggttcaacatggctcaatcaaa 4732263  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 28562559 - 28562810
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  28562559 ttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttgcacgaagctagggttaat 28562658  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  28562659 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagaggatcaactactgattcat 28562758  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa-aggg-aattagctagacat 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28562759 atattacaatagattcatcatggcttaatcaagagggaaattagctagacat 28562810  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 28566127 - 28566378
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  28566127 ttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttgcacgaagctagggttaat 28566226  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  28566227 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagaggatcaactactgattcat 28566326  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa-aggg-aattagctagacat 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28566327 atattacaatagattcatcatggcttaatcaagagggaaattagctagacat 28566378  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 34652955 - 34653225
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  34652955 ttgaattaaacaaaattattatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaat 34653054  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  34653055 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactactaattcat 34653153  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaata-aagaaacaacatagt 272  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  34653154 atattacaatagat---tcatggctcaatcaaatggaattagctagacatgattaaaaagaataaacaacatagt 34653225  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25185286 - 25185073
Alignment:
Q  20 tatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattat 119  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  25185286 tattttaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttattagtcatataaaacaatcat 25185187  T
Q  120 ataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25185186 ataaaaagcaatgaacacaagtatttctaaataaagattgaataatattaataacaaagagagtatcaactactgattcatatattacaataggttcatc 25185087  T
Q  218 atggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||||||||    
T  25185086 atggctcaatcaaa 25185073  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19686088 - 19685855
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  19686088 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttattagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaat 19685989  T
Q  101 agtcatacaaagcaat--tatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attc 196  Q
    |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  19685988 agtcatgcaaa-caatcatatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactactgattc 19685890  T
Q  197 atatattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19685889 atatattacaatagatttatcatggctcaatcaaa 19685855  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19689471 - 19689238
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  19689471 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaat 19689372  T
Q  101 agtcatacaaagcaat--tatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attc 196  Q
    |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  19689371 agtcatgcaaa-caatcatatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactactgattc 19689273  T
Q  197 atatattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19689272 atatattacaatagattcatcatggctcaatcaaa 19689238  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26726864 - 26726638
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  26726864 ttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctatggttaat 26726766  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  26726765 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagacttaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 26726668  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26726667 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 26726638  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17944569 - 17944409
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  17944569 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 17944470  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaat 162  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17944469 agtcatgcaaa-caatcatataaaaagcaatgaacataaataattctgaataaagactgaat 17944409  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2453186 - 2453008
Alignment:
Q  66 atcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataac 165  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||     ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  2453186 atcaatttatgtggttgcaagaagttagggttaatagtcat-----gcaatcatatgaaaagcaatgaatacaaataattctgaataaagactgaataat 2453092  T
Q  166 attaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacat 248  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2453091 attgataataaa-agagtttcaactactaattcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacat 2453008  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 40800116 - 40800234
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40800116 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaaggtagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 40800215  T
Q  101 agtcatacaaagcaattat 119  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  40800216 agtcatacaaaacaattat 40800234  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33921060 - 33920904
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  33921060 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaat 33920961  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33920960 agtcatgcaaa-caatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagact 33920904  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 1810608 - 1810765
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||    
T  1810608 ttgaattaaacagaattacaatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaatttctaagatcaatttatgtaattgtaagaagttagggttaat 1810707  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1810708 agtcatgcaaaacaatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattctcaataaagact 1810765  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26337901 - 26337745
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  26337901 ttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaaactagggttaat 26337802  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| || | |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26337801 agtcattcata-caatcatacgaaaagcaataaacacaaataattctgaataaagact 26337745  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 2500208 - 2500362
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  2500208 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 2500307  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaaga 156  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| || |||||||||||||    
T  2500308 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaatatttctgaataaaga 2500362  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9690681 - 9690525
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||    
T  9690681 ttgaattaaacataattactatttcaggattaaaaactagggttagtagtcgttcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaataagctagggttaat 9690582  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| ||||  ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9690581 agtcatgcaaa-caatcgtacgaaaagcaatgaacacaaataattatgaataaagact 9690525  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3195063 - 3194943
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||    
T  3195063 attattatttcaggattaaaagctaaggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa-ca 3194965  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaaca 136  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  3194964 atcatatgaaaagcaatgaaca 3194943  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 33321124 - 33321276
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  33321124 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggctagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 33321223  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaa 154  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||    
T  33321224 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattttgaataaa 33321276  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3194925 - 3194845
Alignment:
Q  193 attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaata-aagaaacaacatagt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  3194925 attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctatacatgattaaaaagaataaacaacatagt 3194845  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 346
Target Start/End: Original strand, 21333103 - 21333213
Alignment:
Q  235 aattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatc 334  Q
    |||||||||||||| || |||  || ||||||||||||        ||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||    
T  21333103 aattagctagacataataaaaggaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagttccgtcgctgccggc-ttgctcctcaattttctttcaatc 21333201  T
Q  335 tgtgttgttctt 346  Q
     |||||||||||    
T  21333202 ggtgttgttctt 21333213  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 346
Target Start/End: Original strand, 21336119 - 21336229
Alignment:
Q  235 aattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatc 334  Q
    |||||||||||||| || |||  || ||||||||||||        ||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||    
T  21336119 aattagctagacataataaaaggaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagttccgtcgctgccggc-ttgctcctcaattttctttcaatc 21336217  T
Q  335 tgtgttgttctt 346  Q
     |||||||||||    
T  21336218 ggtgttgttctt 21336229  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39192080 - 39192043
Alignment:
Q  281 taaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcct 318  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39192080 taaatcgatagagtttcgtcgttgtcgacgttgctcct 39192043  T

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Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14969586 - 14969334
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14969586 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaat 14969487  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14969486 agtcatacaaagcaattatctgaaaagcaatga--acaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactgattcat 14969389  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca--aagggaattagctagacatgat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  14969388 atattacaataggttcatcatggcttaatcaacaaggaaattagcaagacatgat 14969334  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11410683 - 11410382
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11410683 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaat 11410584  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  11410583 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatggacacaagtaattctgaataaagactgaataacattattaat-aagagagtatcaactactaattcat 11410487  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||    
T  11410486 atattacaa-aggttcatcatggctcaatcaaactaagagtttagctagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtt 11410388  T
Q  296 tcgtcg 301  Q
     |||||    
T  11410387 ccgtcg 11410382  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17231774 - 17231545
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  17231774 ttgaatcaaacaggattacaatttcagaattaaaagatagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagatagggttaat 17231675  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  17231674 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcgactactaattcat 17231577  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17231576 atattacaa-agcttcatcatggctcaatcaaa 17231545  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22920447 - 22920220
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22920447 ttgaatcaaacagaattactaattcaggataaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 22920349  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  22920348 agtcatac-aagcaattatatgaaaagcaatgaacacaaataactctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 22920250  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22920249 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 22920220  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13095898 - 13096112
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13095898 ttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaat 13095997  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13095998 agtcatac-aagcaattatat-gaaatcaatgaatacaagtaattctgaataaagactgaataacattattaataaagagagtatcaactactaattcat 13096095  T
Q  199 atattacaataggttcat 216  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  13096096 atattacaa-aggttcat 13096112  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34502261 - 34502024
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  34502261 ttgaattaaacagaattactacttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaat 34502162  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  34502161 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattgataataaagagagtttcaactactgattcat 34502063  T
Q  199 at------attacaataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34502062 atattacaattacaatagattcatcatggctcaatcaaa 34502024  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 3827018 - 3827225
Alignment:
Q  16 ttactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaa-------------ttcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatag 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3827018 ttactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagttagggttaatag 3827117  T
Q  103 tcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  3827118 tcatacaaagcaattatataaaaaacaataaatacaaataattctgaataaagactgaataacattaataataaa-agagtatcaactactaattcatat 3827216  T
Q  201 attacaata 209  Q
    | |||||||    
T  3827217 aatacaata 3827225  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2330548 - 2330318
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||| |||  ||||||    
T  2330548 ttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgttattgaaagaatctagagttaat 2330449  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  || |||    
T  2330448 agtcatgcaaa-taatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattatgaataaagactgaataatattgataataaagagagcttcaactactgatccat 2330350  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2330349 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 2330318  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17696500 - 17696276
Alignment:
Q  8 aaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcata 107  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17696500 aaacagaattacaatttcaggattaagagccagggctagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcata 17696401  T
Q  108 caaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataa-cattaataataaagagagtatcaactac--attcatatatta 204  Q
    |||| || | |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17696400 caaa-cagtcatatgaaaagcgatgaacacaaataattctaaataaagactgaataatcattgataataaagagagt-tcaactactgattcatatatta 17696303  T
Q  205 caataggttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17696302 caataggttcatcatggctcaatcaaa 17696276  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31262689 - 31262427
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  31262689 ttgaattaaacagaactactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagagttaat 31262590  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    | |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||       |    
T  31262589 aatcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagaccgaataaaattgataataaagagagtttcaaatac-------t 31262498  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    | | | |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31262497 aattc-atagattcatcttggcttaatcaaaggaaattagttagatatgattaaagaaataaacaacatagt 31262427  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 9313985 - 9314145
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9313985 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaagagctatggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaataagctagggttaat 9314084  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaat 162  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9314085 agtcatgcaaa-caatcatataaaaagcaatgaacataaataattctgaataaagactgaat 9314145  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28117758 - 28117598
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  28117758 ttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 28117659  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaat 162  Q
    | ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28117658 aatcat-gaaaacaatcatataaaaagcaatgaacataaataattctgaataaagactgaat 28117598  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12746724 - 12746568
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  12746724 ttgaattaaacagaattactatttcacgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaat 12746625  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12746624 agtcatgcaaa-caatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagact 12746568  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31123334 - 31123117
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||| ||||| ||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  31123334 attactatttcaggattaaaagctagggaaagtagtcaattaatacctaagatcaattaacatgattgaaagaagctagggttaatagtcatgcaaa-ca 31123236  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac---attcatatattacaatagg 211  Q
    || |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||     
T  31123235 atcataataaaagcaatgaaaacaaataattctgaataaagactacatatcatttataataaagagagt-tcaactacttggttcacatattacaatagc 31123137  T
Q  212 ttcatcatggctcaatcaaa 231  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  31123136 ttcataatggctcaatcaaa 31123117  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 35027333 - 35027489
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  35027333 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 35027432  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||| ||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35027433 agtcatataaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 35027489  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 33679402 - 33679544
Alignment:
Q  15 attactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||    
T  33679402 attactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattgaaagaagttagggttaatagtcatgcaaa-ca 33679500  T
Q  115 attatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    || |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33679501 atcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctaaataaagact 33679544  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 5618509 - 5618656
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  5618509 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagaagtcattcaattcttaa-atcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 5618607  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaa 150  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  5618608 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaataaacacaaataattatgaa 5618656  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 28894681 - 28894837
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||| |    
T  28894681 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagt 28894780  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  28894781 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagact 28894837  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Original strand, 7560435 - 7560605
Alignment:
Q  61 ctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactga 160  Q
    |||| ||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||  |||| || |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7560435 ctaagatcaattaatatgattgaaagaagctagggttaattgtcatacaaa-caatcataagaaaaacactgaacataaataattctgaataaagactga 7560533  T
Q  161 ataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7560534 ataatattgataataaagagagtttcaactactgattcacatatcacaataggttcatcatggttcaatcaa 7560605  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2331200 - 2330981
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| | | |||    
T  2331200 ttgaattaaacagaattgatatttcatgattaaaagctggtgttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgttattgaaagaagctaggatcaat 2331101  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||            ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  || |||    
T  2331100 agtcatgcaaa-caatcatatgaaaagcaatgaacacaaataatt-----------atgaataatattgataataaagagagcttcaactactgatccat 2331013  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2331012 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa 2330981  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Original strand, 23388511 - 23388608
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23388511 aatcaaaggaaattagctagacatggttaaatacataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgtcggcgttgctcctcaat 23388608  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9953679 - 9953572
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatct 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |        ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |    
T  9953679 aatcaaaggaaattagctagacatggttaaatacataaacaacataataaaaaaaataagccgatagagtttcgtcgttgtcggcgttgctcctcaa--t 9953582  T
Q  325 tctttcaatc 334  Q
    ||||||||||    
T  9953581 tctttcaatc 9953572  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22464240 - 22464173
Alignment:
Q  94 ggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaat 162  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  22464240 ggttaatagtcatgcaaa-caatcatataaaaagcaatgaacataaataattctgaataaaaactgaat 22464173  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 301
Target Start/End: Original strand, 5738496 - 5738572
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcg 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||    
T  5738496 aatcaaaggaaattagctagacatgattaaaataataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagttccgtcg 5738572  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Original strand, 15579130 - 15579186
Alignment:
Q  16 ttactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaatt 72  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15579130 ttactatttcatgattaaaatatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatt 15579186  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 5618414 - 5618457
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggtt 44  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5618414 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtt 5618457  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Original strand, 20189837 - 20189882
Alignment:
Q  203 tacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacat 248  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20189837 tacaatagattcatcttggcttaatcaaaggaaattagctagacat 20189882  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22146154 - 22146109
Alignment:
Q  203 tacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacat 248  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22146154 tacaatagattcatcttggcttaatcaaaggaaattagctagacat 22146109  T

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Target: scaffold0062 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 53082 - 53405
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  53082 ttgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaggaagttagggttaat 53181  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  53182 agtcatac-aagcaattatataaaaa-caatgaacacaaataattctaaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaacttctaattcat 53279  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | | | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||    
T  53280 atattacaa-aggttcatcatggctcaatgaaactaagaatttaactagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtt 53378  T
Q  296 tcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  53379 tcgtcgttgatgactttgctcctcaat 53405  T

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Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 334
Target Start/End: Original strand, 68027 - 68316
Alignment:
Q  47 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  68027 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcatataa-gcaattatataaaaa-caatgaacacaagtaattc 68124  T
Q  147 tgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaa---agggaattagc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |   | ||| |    
T  68125 tgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactactaattcatatattacaa-aggttcatcatggctcaatgaaactaataatttaac 68223  T
Q  242 tagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaatcttctttcaatc 334  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  68224 tagacatgatcaaataaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagtttcgtcgttgatgactttgctcctcaatcttttctcaatc 68316  T

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Target: scaffold0214 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19974 - 19675
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  19974 ttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaat 19875  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  19874 agtcatgcaaa-caataatatgaaaag--atgaacacaaataattctggataaagagtgaataatattgataataaagagagtttcaactactgattcat 19778  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||        ||||||||||||| ||||    
T  19777 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacataattaaagaattaaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagcttcg 19678  T

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Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13525 - 13225
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  13525 ttgaattaaacataattcctatttgaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaat 13426  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||| ||||  ||| |||| ||||||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||  ||||||    
T  13425 agtcatgcaaaa-aatcatatgaaaagcagttaacacaaataattttggataaagactgaataatattgataataaa-agagtttcaattactgattcat 13328  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||| ||||    
T  13327 atattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacataattaaaaaaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagcttcg 13228  T
Q  299 tcg 301  Q
    |||    
T  13227 tcg 13225  T

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Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27514 - 27241
Alignment:
Q  28 gattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaag 127  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||    
T  27514 gattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgcaaaa-aatcatatgaaaag 27416  T
Q  128 caatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctca 225  Q
    || | ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27415 cagttaacacaaataattttggataaagactgaataatattgataataaa-agagtttcaattactgattcatatattacaataggttcatcatggctca 27317  T
Q  226 atcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtcg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||| |||||||    
T  27316 atcaaagggaattagctagacataattaaaaaaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagagcttcgtcg 27241  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28860 - 29087
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  28860 ttgaatcaaacaggattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataatttcaagaagctagggttaat 28959  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  28960 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaatactattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 29057  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29058 atattacaa-aggttcatcatggctcaatca 29087  T

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Target: scaffold0067 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27280 - 27053
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  27280 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaat 27182  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  27181 agtcatac-tagcaattatctgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaattcat 27083  T
Q  199 atattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27082 atattacaa-cggttcattatggctcaatca 27053  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 27079 - 27285
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||    
T  27079 ttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataaattcaagaagttagggttaat 27178  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactac--attcat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||||    
T  27179 agtcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagagtatcaactactaaatcat 27276  T
Q  199 atattacaa 207  Q
    |||||||||    
T  27277 atattacaa 27285  T

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Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 31347 - 31492
Alignment:
Q  83 caagaagctaaggttaatagtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagag 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||    
T  31347 caagaagctagggttaatagtcatacaa-gcaattatatgaaa-gcaataaacacaagtgattctgaataaagactgaataatattattaaataagagag 31444  T
Q  183 tatcaactac--attcatatattacaataggttcatcatggctcaatca 229  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31445 tatcaactactaaatcatatattacaa-aggttcatcatggctcaatca 31492  T

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Target: scaffold0360 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6204 - 5960
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | |||||    
T  6204 ttgaatcaaacaggattcctatttcagaattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatt----gaagctatgattaat 6109  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     ||||    
T  6108 aatcatac-aagcaattatat-gaaagcaataaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattattaataaagaaagtatcaacta----tatat 6015  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaaca 265  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  6014 atta----------atcatggctcaatcaaagggaattagctaaacatgaataaagaaacaaaca 5960  T

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Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2367 - 2075
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||               ||||||| | |||||    
T  2367 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaa---------------gaagctatgattaat 2283  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaataataaagagagtatcaactacattcatat 200  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     ||||    
T  2282 aatcatacaa-gcaattatatgaaa-gcaatgaacacaactaattctgaataaagactgaataacattattaataaagaaagtatcaacta----tatat 2189  T
Q  201 attacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagagtttcgtc 300  Q
    ||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |        ||||||||||||||| ||||    
T  2188 atta----------atcatggctcaatcaaagggaattagctagacatcaataaagaaacaaacaacataataaagaaaataaaccgatagagttccgtc 2099  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7156 - 6996
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  7156 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaat 7057  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaat 162  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7056 agtcatgcaaa-caatcatataaaaagcaatgaacataaataattctgaataaagactgaat 6996  T

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Target: scaffold0043 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13510 - 13354
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||    
T  13510 ttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttaat 13411  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13410 agtcatgcaaa-caattatacaaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagact 13354  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 227266 - 226950
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  227266 ttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctatggttaat 227167  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagactgaataacattaat-----aataaagagagtatcaactac--a 193  Q
    |||||| | || |||| |||| |||||||||||| |||          |||||||||||||||| ||| ||     |||||| ||||| ||||||||  |    
T  227166 agtcatgc-aaccaatcatatgaaaagcaatgaataca----------aataaagactgaataatattgataataaaataaaaagagtttcaactactga 227078  T
Q  194 ttcatatattacaataggttcatcatggctcaatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagtnnnnnnnntaaaccgatagag 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||  || ||||||||||||        |||||||||||||    
T  227077 ttcatatattacaataggtttatcatggcccaatcaaagggaattagttaaacat-atcaaaggaataaacaacatagtaaagaaaataaaccgatagag 226979  T
Q  294 tttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaat 322  Q
     ||||||| ||||| | || |||||||||    
T  226978 cttcgtcgttgtcggctttactcctcaat 226950  T

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Target: scaffold0401 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 4021
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4177 ttgaatgaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaat 4078  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| | || |||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4077 agtcatgc-aaccaatcatacgaaaaccaatgaacacaaataattctgaataaagact 4021  T

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Target: scaffold1048 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1320 - 1192
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  1320 ttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt-caaaaagctagggttaat 1222  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1221 agtcatac-aagcaattatatgaaaagcaat 1192  T

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Target: scaffold0911 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4481 - 4327
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  4481 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagt 4382  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  4381 agtcatacaaa-caatcataagaaaagcaa--agcacaaataattctgaataaagact 4327  T

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Target: scaffold0083 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29240 - 29084
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||    
T  29240 ttgaattaaacagaattactatttcaggaataaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctaggtttaat 29141  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| | || |||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29140 agtcatgc-aatcaatcatatgaaaatctttgaacacaaataattctgaataaagact 29084  T

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Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 53037 - 52881
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctaaggttaat 100  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||    
T  53037 ttgaattaaacagaattattatttcaagattaaaagatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctaggattaat 52938  T
Q  101 agtcatacaaagcaattatataaaaagcaatgaacacaagtaattctgaataaagact 158  Q
    |||||| |||| |||| |||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52937 agtcatgcaaa-caatcatacgaaaagctttgaacacaaataattctgaataaagact 52881  T

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Target: scaffold0637 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 2022
Alignment:
Q  1 ttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaa 88  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  2109 ttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcagttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 2022  T

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Target: scaffold0080 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26843 - 26803
Alignment:
Q  281 taaaccgatagagtttcgtcgatgtcgacgttgctcctcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26843 taaaccgatagagtttcgtcgttgtcgacgttgctcctcaa 26803  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Original strand, 5811 - 5858
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacatagt 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5811 aatcaaaggaaattagctagacatgattaaaataataaacaacatagt 5858  T

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Target: scaffold0035 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 62227 - 62183
Alignment:
Q  225 aatcaaagggaattagctagacatgattaaataaagaaacaacat 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  62227 aatcaaaggaaattagctagacatgattaaaataataaacaacat 62183  T

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