View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11599_high_24 (Length: 369)

Name: NF11599_high_24
Description: NF11599
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11599_high_24
NF11599_high_24
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (39-357)||(23967725-23968038)
chr8 (39-357)||(42061999-42062312)
chr8 (39-357)||(44938911-44939224)
chr8 (39-357)||(6301811-6302124)
chr8 (39-357)||(37028306-37028619)
chr8 (39-355)||(41975801-41976117)
chr8 (39-357)||(12758837-12759155)
chr8 (39-336)||(19246515-19246812)
chr8 (39-336)||(19319699-19319996)
chr8 (39-355)||(45295391-45295707)
chr8 (52-357)||(41906205-41906509)
chr8 (39-357)||(29432654-29432972)
chr8 (39-357)||(44384277-44384595)
chr8 (39-354)||(39202975-39203289)
chr8 (127-357)||(14080167-14080397)
chr8 (127-357)||(19396683-19396913)
chr8 (127-357)||(22357782-22358013)
chr8 (127-357)||(44598196-44598426)
chr8 (127-355)||(33425594-33425822)
chr8 (127-355)||(30824874-30825104)
chr8 (139-357)||(36603405-36603623)
chr8 (138-357)||(41155073-41155292)
chr8 (127-355)||(41627323-41627551)
chr8 (127-357)||(38960989-38961219)
chr8 (127-357)||(38991334-38991564)
chr8 (133-357)||(42812287-42812511)
chr8 (39-225)||(23627163-23627348)
chr8 (220-357)||(20664265-20664402)
chr8 (220-357)||(30549631-30549768)
chr8 (220-357)||(44214381-44214518)
chr8 (39-142)||(41154509-41154612)
chr8 (39-124)||(29644768-29644854)
chr8 (271-357)||(27629246-27629332)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (39-357)||(47574674-47574987)
chr7 (39-357)||(6912696-6913009)
chr7 (39-357)||(27736401-27736719)
chr7 (39-357)||(17169652-17169970)
chr7 (39-354)||(47173082-47173397)
chr7 (39-357)||(31899132-31899449)
chr7 (41-357)||(33640038-33640354)
chr7 (39-355)||(47164912-47165228)
chr7 (39-357)||(9147984-9148302)
chr7 (43-342)||(3794109-3794408)
chr7 (39-357)||(39650292-39650610)
chr7 (39-357)||(9227574-9227891)
chr7 (39-355)||(48529105-48529421)
chr7 (127-355)||(23767791-23768019)
chr7 (127-357)||(19518704-19518935)
chr7 (128-357)||(19519276-19519509)
chr7 (128-357)||(19519850-19520083)
chr7 (39-357)||(42916451-42916760)
chr7 (127-357)||(5961380-5961609)
chr7 (127-342)||(17481067-17481282)
chr7 (127-342)||(17571932-17572147)
chr7 (127-357)||(42686249-42686479)
chr7 (53-357)||(42245935-42246227)
chr7 (127-355)||(11499312-11499540)
chr7 (127-342)||(17476621-17476836)
chr7 (127-342)||(17512264-17512479)
chr7 (127-342)||(17540735-17540950)
chr7 (127-342)||(17576378-17576593)
chr7 (127-355)||(8927246-8927476)
chr7 (127-355)||(14307601-14307839)
chr7 (220-357)||(19034999-19035136)
chr7 (220-357)||(20719500-20719637)
chr7 (220-357)||(20764170-20764307)
chr7 (220-357)||(29489748-29489885)
chr7 (220-357)||(33231299-33231436)
chr7 (220-357)||(34283442-34283579)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (39-357)||(13458069-13458382)
chr6 (39-357)||(9980403-9980721)
chr6 (39-357)||(24444553-24444871)
chr6 (39-357)||(33977542-33977860)
chr6 (39-357)||(1219150-1219468)
chr6 (39-355)||(25531841-25532157)
chr6 (39-357)||(3052136-3052455)
chr6 (51-357)||(34319674-34319981)
chr6 (127-357)||(1074620-1074850)
chr6 (127-357)||(18600343-18600573)
chr6 (127-357)||(7221404-7221634)
chr6 (127-355)||(34854616-34854844)
chr6 (127-355)||(14889297-14889525)
chr6 (127-350)||(4423058-4423281)
chr6 (127-355)||(2519817-2520045)
chr6 (127-357)||(15274263-15274493)
chr6 (127-353)||(1080951-1081176)
chr6 (127-357)||(7220150-7220380)
chr6 (39-263)||(11269182-11269408)
chr6 (128-355)||(11937145-11937363)
chr6 (197-357)||(17938253-17938412)
chr6 (220-357)||(248681-248818)
chr6 (227-357)||(3089387-3089517)
chr6 (39-171)||(11518346-11518480)
chr6 (220-357)||(12581135-12581272)
chr6 (41-138)||(3089519-3089620)
chr6 (160-263)||(11517944-11518047)
chr6 (266-357)||(11517731-11517822)
chr6 (303-357)||(22375203-22375257)
chr6 (127-175)||(22375250-22375298)
chr6 (274-307)||(11269536-11269569)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (39-357)||(15519460-15519773)
chr4 (39-357)||(741642-741955)
chr4 (39-357)||(19589454-19589772)
chr4 (39-357)||(575368-575686)
chr4 (39-357)||(52799652-52799970)
chr4 (39-357)||(39715861-39716179)
chr4 (39-355)||(35496880-35497199)
chr4 (39-357)||(16903879-16904200)
chr4 (79-357)||(17738689-17738967)
chr4 (39-352)||(1943106-1943419)
chr4 (127-355)||(33504353-33504581)
chr4 (115-342)||(35713485-35713712)
chr4 (39-238)||(41984705-41984904)
chr4 (127-355)||(14830876-14831104)
chr4 (139-357)||(56000063-56000281)
chr4 (127-355)||(23477599-23477827)
chr4 (127-351)||(7645481-7645705)
chr4 (127-355)||(34057930-34058158)
chr4 (127-355)||(5275111-5275339)
chr4 (127-355)||(15656177-15656404)
chr4 (39-243)||(40618415-40618619)
chr4 (159-357)||(28971820-28972018)
chr4 (127-357)||(36855826-36856055)
chr4 (154-357)||(19832750-19832953)
chr4 (127-350)||(39746216-39746439)
chr4 (127-357)||(53341104-53341334)
chr4 (127-357)||(13626746-13626977)
chr4 (41-263)||(16891641-16891863)
chr4 (127-357)||(28136419-28136649)
chr4 (94-357)||(47721428-47721689)
chr4 (220-357)||(10260671-10260808)
chr4 (220-357)||(21563647-21563784)
chr4 (220-357)||(26925613-26925750)
chr4 (220-357)||(43331168-43331305)
chr4 (220-357)||(51451234-51451371)
chr4 (220-357)||(24078741-24078878)
chr4 (265-357)||(40620979-40621071)
chr4 (274-357)||(16891991-16892074)
chr4 (39-71)||(35713724-35713756)
chr4 (39-75)||(47721684-47721720)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (39-357)||(6344062-6344375)
chr2 (39-357)||(14324546-14324859)
chr2 (39-357)||(1994274-1994587)
chr2 (39-357)||(28500910-28501223)
chr2 (39-342)||(9918052-9918355)
chr2 (39-357)||(10049333-10049651)
chr2 (39-357)||(4291985-4292303)
chr2 (39-357)||(9544963-9545281)
chr2 (39-357)||(28607851-28608165)
chr2 (39-357)||(14751795-14752112)
chr2 (39-357)||(18094062-18094379)
chr2 (39-357)||(16882556-16882874)
chr2 (39-357)||(17040246-17040564)
chr2 (127-355)||(21096412-21096640)
chr2 (127-357)||(19168966-19169196)
chr2 (127-357)||(26826240-26826469)
chr2 (127-357)||(33905008-33905238)
chr2 (127-355)||(42884104-42884332)
chr2 (127-355)||(36634427-36634655)
chr2 (127-357)||(30568204-30568434)
chr2 (127-357)||(45206305-45206535)
chr2 (125-355)||(26820339-26820559)
chr2 (39-225)||(17091051-17091236)
chr2 (39-263)||(7360537-7360762)
chr2 (39-225)||(17036543-17036728)
chr2 (39-225)||(17024866-17025051)
chr2 (128-242)||(4810281-4810395)
chr2 (220-357)||(3709715-3709852)
chr2 (220-357)||(11867564-11867701)
chr2 (220-357)||(35358957-35359094)
chr2 (274-357)||(4810407-4810490)
chr2 (266-357)||(7360882-7360973)
chr2 (296-355)||(33665115-33665174)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (39-357)||(18110319-18110632)
chr1 (39-357)||(43255889-43256202)
chr1 (39-357)||(50396303-50396616)
chr1 (39-357)||(29842021-29842339)
chr1 (39-357)||(10695525-10695843)
chr1 (39-342)||(42680993-42681296)
chr1 (39-357)||(4890726-4891044)
chr1 (39-357)||(29187443-29187761)
chr1 (39-357)||(51967067-51967384)
chr1 (39-357)||(33360328-33360646)
chr1 (39-350)||(28567060-28567371)
chr1 (39-355)||(13663753-13664069)
chr1 (39-357)||(52308432-52308750)
chr1 (39-357)||(50559647-50559965)
chr1 (39-357)||(49224882-49225192)
chr1 (41-357)||(18095411-18095727)
chr1 (39-252)||(10700519-10700732)
chr1 (39-272)||(21729347-21729580)
chr1 (127-355)||(18812903-18813131)
chr1 (127-355)||(41964267-41964495)
chr1 (127-355)||(31618373-31618602)
chr1 (39-319)||(17709792-17710079)
chr1 (127-355)||(41831392-41831619)
chr1 (127-355)||(34686272-34686500)
chr1 (127-355)||(34690810-34691038)
chr1 (125-357)||(38846559-38846791)
chr1 (127-357)||(48339079-48339308)
chr1 (128-355)||(52522906-52523122)
chr1 (39-148)||(17363955-17364064)
chr1 (266-357)||(15314077-15314168)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (39-357)||(19394043-19394361)
chr5 (39-357)||(31296879-31297192)
chr5 (39-357)||(34716214-34716532)
chr5 (39-342)||(12589635-12589938)
chr5 (39-357)||(25697863-25698180)
chr5 (39-353)||(41689901-41690215)
chr5 (39-357)||(12420344-12420662)
chr5 (39-357)||(30141129-30141447)
chr5 (39-357)||(289163-289480)
chr5 (42-357)||(3211544-3211858)
chr5 (127-357)||(20997285-20997515)
chr5 (127-357)||(34375748-34375978)
chr5 (127-357)||(19446786-19447016)
chr5 (127-357)||(3027101-3027331)
chr5 (127-355)||(2193429-2193657)
chr5 (127-357)||(27064544-27064774)
chr5 (127-355)||(26322422-26322651)
chr5 (127-355)||(33612488-33612717)
chr5 (127-342)||(20348628-20348843)
chr5 (127-358)||(21028850-21029081)
chr5 (146-357)||(35541207-35541418)
chr5 (127-357)||(4880927-4881157)
chr5 (127-357)||(3151951-3152188)
chr5 (127-357)||(1853265-1853493)
chr5 (127-357)||(3398679-3398910)
chr5 (39-225)||(9701457-9701642)
chr5 (127-355)||(7284337-7284547)
chr5 (39-238)||(18039615-18039808)
chr5 (220-357)||(37463135-37463272)
chr5 (234-357)||(18037361-18037476)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (39-357)||(39797679-39797992)
chr3 (39-357)||(5253591-5253904)
chr3 (43-357)||(54794303-54794617)
chr3 (39-357)||(11952626-11952944)
chr3 (43-355)||(40828278-40828591)
chr3 (39-354)||(8241298-8241609)
chr3 (39-355)||(16494469-16494785)
chr3 (39-357)||(35435564-35435882)
chr3 (39-342)||(22476307-22476604)
chr3 (39-355)||(12169285-12169602)
chr3 (127-357)||(6105463-6105693)
chr3 (127-358)||(16340350-16340581)
chr3 (125-355)||(35089186-35089416)
chr3 (127-355)||(31370368-31370596)
chr3 (39-351)||(36168807-36169123)
chr3 (127-357)||(52841871-52842101)
chr3 (39-238)||(52463389-52463588)
chr3 (131-357)||(21700907-21701133)
chr3 (127-354)||(48975359-48975586)
chr3 (127-342)||(50772559-50772774)
chr3 (127-357)||(18742137-18742367)
chr3 (127-357)||(54648859-54649089)
chr3 (127-357)||(52854790-52855020)
chr3 (127-357)||(17911100-17911329)
chr3 (127-357)||(23192208-23192438)
chr3 (127-342)||(50740079-50740295)
chr3 (132-357)||(49111759-49111979)
chr3 (39-195)||(55296220-55296376)
chr3 (133-357)||(2846096-2846323)
chr3 (195-357)||(51247115-51247277)
chr3 (245-357)||(11326991-11327103)
chr3 (263-357)||(55296128-55296222)
chr3 (220-357)||(917468-917605)
chr3 (220-357)||(44074059-44074196)
chr3 (132-240)||(11327299-11327407)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (39-357)||(19722-20040)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (39-355)||(59206-59522)
scaffold0010 (71-357)||(118662-118948)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (39-357)||(14195-14512)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (39-355)||(153518-153834)
scaffold0006 (39-352)||(65981-66294)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (39-357)||(12396-12714)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (45-357)||(5602-5914)
scaffold0032 (45-357)||(12051-12363)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (39-354)||(48655-48971)
scaffold0051 (39-354)||(64040-64356)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (127-355)||(8605-8833)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (127-355)||(27710-27938)
[»] scaffold1884 (1 HSPs)
scaffold1884 (127-357)||(506-736)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (125-357)||(16679-16911)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23968038 - 23967725
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23968038 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 23967939  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967938 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 23967839  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23967838 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 23967744  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23967743 attggtcaggttcgaggct 23967725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42062312 - 42061999
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42062312 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 42062213  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42062212 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 42062113  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42062112 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 42062018  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  42062017 attggtcaggttcgaggct 42061999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 44938911 - 44939224
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44938911 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaaggtaaaaggtattat 44939010  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44939011 tttttaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 44939110  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44939111 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 44939205  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  44939206 attggtcaggttcgaggct 44939224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6302124 - 6301811
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6302124 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 6302025  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6302024 tttctaatttgtcaacgtcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgtaaca 6301925  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6301924 ctatgggaaaaatactctgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 6301830  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6301829 attggtcaggttcgaggct 6301811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 37028306 - 37028619
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028306 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 37028405  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028406 tttttaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttctttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 37028505  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37028506 ctatggaaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttatcttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 37028600  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  37028601 attggtcaggttcgaggct 37028619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Original strand, 41975801 - 41976117
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41975801 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgccaagacaatgtcaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 41975900  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41975901 tttctaatttgtcagcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 41976000  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41976001 ctatgggaaaaatattccgtagctttatcatttaacatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 41976100  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||| ||||||||||||    
T  41976101 attggtcaggttcgagg 41976117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 12758837 - 12759155
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12758837 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattggggctagaaagaaactgtgtatgaacattgtgttcaaagataaaagatattat 12758936  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12758937 tttataatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatataaca 12759036  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  12759037 ctatgggaaaaatattacgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatgacaacccaaatatatataaca 12759136  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  12759137 attagtcaggttcgaggct 12759155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 336
Target Start/End: Original strand, 19246515 - 19246812
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19246515 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactagaaagaaattgtgaacgaacattttgttgaaagataaaaggtattat 19246614  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19246615 tttctaatttatcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 19246714  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaa 336  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19246715 ctatgggaaatatattccgtagctttataatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaa 19246812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 336
Target Start/End: Original strand, 19319699 - 19319996
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19319699 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactagaaagaaattgtgaacgaacattttgttgaaagataaaaggtattat 19319798  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19319799 tttctaatttatcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 19319898  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaa 336  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19319899 ctatgggaaatatattccgtagctttataatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaa 19319996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45295707 - 45295391
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45295707 agaaatcattgggtttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactgaaaaaaaactgtgtacgaacattttattgaaagataaaaggtattat 45295608  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45295607 tttctaatttatcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaaca 45295508  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  45295507 ctatgggaaaaatattttgtagctttatcatttatcatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 45295408  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||| ||||    
T  45295407 attgatcaggtttgagg 45295391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 52 - 357
Target Start/End: Original strand, 41906205 - 41906509
Alignment:
Q  52 cttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41906205 cttcttcatgagattgtcaagacaactccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtcttgaaagataaaaggtattattttttaatttgtc 41906304  T
Q  152 aacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaat 251  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  41906305 agcatcagatgataagattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatggttgatgtgacactatg-gaaaaat 41906403  T
Q  252 actccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttc 351  Q
    | | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41906404 atttcgtagctttatcatttaccatatatttaccctgagtactttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 41906503  T
Q  352 gaggct 357  Q
    ||||||    
T  41906504 gaggct 41906509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 29432654 - 29432972
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggctt-cttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtatta 137  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29432654 agaaatcatcggactttcttcgtgagattgtcaagacaacgtcaattgggactggaaagaaatcgtgtac-aacattgtgttgaaagataaaatgtatta 29432752  T
Q  138 ttttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaac 237  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  29432753 ttttctaatttgttagcatcagatgataaaattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtagaaatatggttgatgtaac 29432852  T
Q  238 actatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaac 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  29432853 actatgagaaaaatacttcgtagctttaccatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacctaaatatatacaac 29432952  T
Q  338 aattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  29432953 aattggtcaggttcgaggct 29432972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44384595 - 44384277
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384595 agaaatcatcggacttcttcatgagactgtcaagacaatgccaattgggactaaaaagaaactatgtaagaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 44384496  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44384495 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaaaatgtcttttcttatgtagtgaggatatagttgatgtaaca 44384396  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  44384395 ctatggaaaaaatatttcgtagctttgtcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgcagttaatgacaacccaaatatatgtaaca 44384296  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  44384295 attggtcaggttcgaggct 44384277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 354
Target Start/End: Original strand, 39202975 - 39203289
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39202975 agaaatcatcgggcttcttcacgagattgtcaaaacaacgccaattgagactggaaagaaaccgtatacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 39203074  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||    
T  39203075 tttctaatttgtcagcattagaagata-aattttgtataagtttgataatgatctgaaatatgtatttccttatgcagtgggaatatggttggattaaca 39203173  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||    
T  39203174 ctatgggaaaaatactttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaataacaatcaaaatatatgtaaca 39203273  T
Q  339 attgatcaggttcgag 354  Q
    |||| |||||||||||    
T  39203274 attggtcaggttcgag 39203289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14080397 - 14080167
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14080397 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 14080298  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14080297 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 14080198  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14080197 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 14080167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19396913 - 19396683
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19396913 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcggatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 19396814  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19396813 gttgatgtaacactatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 19396714  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19396713 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 19396683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22358013 - 22357782
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  22358013 aaaaggtattattttatattttgtcaacatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtggaaatata 22357914  T
Q  227 gttgatgtaacactatg-agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22357913 gttgatgtaacactatggaaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggcaaccca 22357814  T
Q  326 aatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22357813 aatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 22357782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 44598196 - 44598426
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44598196 aaaagatattattttctattttgtcagcatcagatgttagaattttgtataagtttgataatgacccgaataatgtctttccttatgtagtgggaatata 44598295  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  44598296 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 44598395  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44598396 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 44598426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33425822 - 33425594
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||    
T  33425822 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaaaatgtttttccttatatagtgggaatata 33425723  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  33425722 gttgatgtaacactatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaacttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 33425623  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33425622 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 33425594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 30824874 - 30825104
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  30824874 aaaaggtattattttctattttctcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatatctttccttatgtagtgggaatata 30824973  T
Q  227 gttgatgtaacactatg--agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacct 324  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  30824974 gttgatgtaacactatggaaaaaaaatactctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaggtctttgcttccattttgtagtcaatggcaaccc 30825073  T
Q  325 aaatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30825074 aaatatatgtaacaattggtcaggttcgagg 30825104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 139 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36603623 - 36603405
Alignment:
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  36603623 tttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtaatgggaatatagttgatgtaaca 36603524  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36603523 ctatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttagcttgagttctttgcttccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 36603424  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  36603423 attggtcaggttcgaggct 36603405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 138 - 357
Target Start/End: Original strand, 41155073 - 41155292
Alignment:
Q  138 ttttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaac 237  Q
    ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41155073 ttttcaaatttgtcagcataaggtgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaac 41155172  T
Q  238 actatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaac 337  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41155173 actatgggaaaactatttcgtagctttttcatttaccatctatttaccttgagttccttacttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaac 41155272  T
Q  338 aattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41155273 aattggtcaggttcgaggct 41155292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 41627323 - 41627551
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41627323 aaaatgtattattttttattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgatgatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 41627422  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  41627423 gttgatgtaacactataggaaaaatactctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaactcaa 41627522  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41627523 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 41627551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 38960989 - 38961219
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38960989 aaaaggtattattttctattttgtcagcattagatgataggattttgtataagtttggtaatgatccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 38961088  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  38961089 gttgatgtaacactatgagaaaaatactttgtaactttatcatttaacatctatttaccttgagttctttgcatccattttatagtcaatggcaacccaa 38961188  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38961189 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 38961219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 38991334 - 38991564
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38991334 aaaaggtattattttctattttgtcagcattagatgataggattttgtataagtttggtaatgatccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 38991433  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  38991434 gttgatgtaacactatgagaaaaatactttgtaactttatcatttaacatctatttaccttgagttctttgcatccattttatagtcaatggcaacccaa 38991533  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38991534 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 38991564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 133 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42812511 - 42812287
Alignment:
Q  133 tattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgat 232  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  42812511 tattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataattacccgaaagatgtctttcctaatgtagtggaaatatagttgat 42812412  T
Q  233 gtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  42812411 gtaacactatgggaaaaatacgccatagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatat 42812312  T
Q  333 gtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||    
T  42812311 gtaataattggtcagattagaggct 42812287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23627348 - 23627163
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23627348 agaaatcatcgggtttcttcatgagattgtcaagccaacgccaattgggacgggaaagaaatcgtgtacaaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 23627249  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatat 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23627248 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca-tgagaatat 23627163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20664402 - 20664265
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  20664402 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 20664303  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20664302 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 20664265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30549768 - 30549631
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  30549768 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 30549669  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30549668 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 30549631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44214518 - 44214381
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  44214518 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 44214419  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44214418 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 44214381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 142
Target Start/End: Original strand, 41154509 - 41154612
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41154509 agaaatcatcgggcttctttatgagattgtcaagacaatgtcaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 41154608  T
Q  139 tttc 142  Q
    ||||    
T  41154609 tttc 41154612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29644854 - 29644768
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttctt-catgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaag 124  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  29644854 agaaatcatcgggtttttttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtgtctgaacattttgttgaaag 29644768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 357
Target Start/End: Original strand, 27629246 - 27629332
Alignment:
Q  271 taccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||    | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27629246 taccatctatttatcttgagttctttgcttccattttgtacacaatgacatgacagatatatgtaacaattggttaggttcgaggct 27629332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47574987 - 47574674
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574987 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 47574888  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574887 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 47574788  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47574787 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 47574693  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  47574692 attggtcaggttcgaggct 47574674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6913009 - 6912696
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6913009 agaaatcatcgggattcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgtgattagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 6912910  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912909 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 6912810  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6912809 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 6912715  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6912714 attggtcaggttcgaggct 6912696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27736719 - 27736401
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27736719 agaaatcatcgggcttcttcatgtgattgtcaagacaataccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 27736620  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27736619 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 27736520  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27736519 ctattggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatggcaaccaaaatatatgtaaca 27736420  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27736419 attggtcaggttcgaggct 27736401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 17169652 - 17169970
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17169652 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 17169751  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17169752 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 17169851  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17169852 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 17169951  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  17169952 attggtcaggttcgaggct 17169970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 354
Target Start/End: Original strand, 47173082 - 47173397
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47173082 agaaatcatcgtgcttcatcattagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaactgtgtacgagcattgtgttgaaagataaaaggtattat 47173181  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47173182 tttctaatttttcagcatcagatgatagaattttgtataagtttaataatgacttgaaagatgtctttccttatggagtgggaatatagttgatgtaaca 47173281  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  47173282 ctatgggaaaaatactctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatataaaaca 47173381  T
Q  339 attgatcaggttcgag 354  Q
    |||| |||||||||||    
T  47173382 attggtcaggttcgag 47173397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31899449 - 31899132
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31899449 agaaatcatcgggctt-ttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 31899351  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899350 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 31899251  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31899250 ctatgagaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacctaaatatatgtaaca 31899151  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31899150 attggtcaggttcgaggct 31899132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33640354 - 33640038
Alignment:
Q  41 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  33640354 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaaaaaattgtgtacgaacattgtgttgaaagatgaaaggtattattg 33640255  T
Q  141 tctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacact 240  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33640254 tctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttaataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagcgagaatatagttgatgtaacact 33640155  T
Q  241 atgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaat 340  Q
    ||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33640154 atgggaaaaatattttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaat 33640055  T
Q  341 tgatcaggttcgaggct 357  Q
    || ||||||||||||||    
T  33640054 tggtcaggttcgaggct 33640038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47165228 - 47164912
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47165228 agaaatcattgtggttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgagattggaaagacatcgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 47165129  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  47165128 tttctaatttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgatctaaaagatgtatttccttatgcagtgggaatatggctgatgtaaca 47165029  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47165028 ccatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 47164929  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||| ||||||||||||    
T  47164928 attggtcaggttcgagg 47164912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 9147984 - 9148302
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9147984 agaaatcatcggtcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgaaactagaaagaaactgtgtatgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 9148083  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148084 tttctaatttgccagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 9148183  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  9148184 ctatggtaaaaatatttcgaagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatttatgtaaca 9148283  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9148284 attggtcaggttcgaggct 9148302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 342
Target Start/End: Original strand, 3794109 - 3794408
Alignment:
Q  43 atcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttc 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3794109 atcatcgggctttttcatgagattgtcaagacaatgtcaattgggactaaaaataaactgtttacaaacatagtgttgaaagataaaaggtattattttc 3794208  T
Q  143 taatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactat 242  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3794209 taatttgtcagcataagatgatagaattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactat 3794308  T
Q  243 gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattg 342  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  3794309 gggaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaactcaaatatatgtaacaattg 3794408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39650610 - 39650292
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39650610 agaaatcatcgggcatcttcaagatattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 39650511  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39650510 tttcttatttgtcagcagaagatgataggattttgtataagtttgttaatgacctgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 39650411  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  39650410 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttgtagtaaatggcaacccaaatatatataaca 39650311  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  39650310 attggtcaggttcgaggct 39650292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9227891 - 9227574
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9227891 agaaatcatcggacttcttcatgaaattgtcaagacaccgccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 9227792  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9227791 tttataatttttcagaatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 9227692  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    || ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9227691 ctgtggaaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgctt-cattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 9227593  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9227592 attggtcaggttcgaggct 9227574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48529421 - 48529105
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48529421 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaataaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 48529322  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| ||||||   ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48529321 tttcttatttgttggcataagattataggattttgtataattttgataatgatctgaaagatgtcttttcttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 48529222  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  48529221 ctatggaaaaaatatttcgtagccttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 48529122  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  48529121 atttttcaggtttgagg 48529105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23768019 - 23767791
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  23768019 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatatctttccttatgtagtgggaatata 23767920  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23767919 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 23767820  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23767819 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 23767791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 19518704 - 19518935
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19518704 aaaaggtattattttttattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 19518803  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatcta-tttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  19518804 gttgatgtaacactatggaaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctattttaccttgagttctttgcttccattttgtattcaatggcaaccca 19518903  T
Q  326 aatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19518904 aatatatgtaaaaattggtcaggttcgaggct 19518935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Original strand, 19519276 - 19519509
Alignment:
Q  128 aaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatag 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19519276 aaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatag 19519375  T
Q  228 ttgatgtaacactatg---agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatcta-tttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacc 323  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19519376 ttgatgtaacactatggaaaaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctattttaccttgagttctttgcttccattttgtattcaatggcaacc 19519475  T
Q  324 taaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19519476 caaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 19519509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Original strand, 19519850 - 19520083
Alignment:
Q  128 aaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatag 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19519850 aaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatag 19519949  T
Q  228 ttgatgtaacactatg---agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatcta-tttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacc 323  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19519950 ttgatgtaacactatggaaaaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctattttaccttgagttctttgcttccattttgtattcaatggcaacc 19520049  T
Q  324 taaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19520050 caaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 19520083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 42916451 - 42916760
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42916451 agaaatcatcggatttcttcatgagattgttaagacaacgccaattgggactagaaagaaactgtgtatgaacattttgttgaaagataaaaggtattat 42916550  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42916551 tttctaatttatcagcatcagatgataggattttgtataaatttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgggaatatagttgatgtaaca 42916650  T
Q  239 ctatg--agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaa 336  Q
    |||||  | ||| ||| |  ||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  42916651 ctatggaaaaaatatattatgtagctttatc-----------atttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaa 42916739  T
Q  337 caattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||| |  |||||||||||    
T  42916740 caattggtgtggttcgaggct 42916760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 5961380 - 5961609
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5961380 aaaaggtattattt-ctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 5961478  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  5961479 gttgatgtaacactatgggaaaaatactatgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 5961578  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5961579 atacatgtaacaattggtcaggttcgaggct 5961609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 17481067 - 17481282
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17481067 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 17481166  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  17481167 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 17481266  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17481267 atatatgtaacaattg 17481282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17572147 - 17571932
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17572147 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 17572048  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  17572047 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 17571948  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17571947 atatatgtaacaattg 17571932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 42686249 - 42686479
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42686249 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgataggtttttttataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 42686348  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  42686349 gttgatgtaacactatgagaaaactatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttgtagtcaatgacaatccaa 42686448  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42686449 atatatgtaataattggtcaggttcgaggct 42686479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42246227 - 42245935
Alignment:
Q  53 ttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtca 152  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  42246227 ttcttcgtgagattgtcaagacatcgtcaattgggactggaaagaaatcgtatac-aacattgtgttgaaagataaaatgtattattttctaatttgtta 42246129  T
Q  153 acatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaata 252  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42246128 gcatcagatgataaaattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtagaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaata 42246029  T
Q  253 ctccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcg 352  Q
    || ||||||       ||||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  42246028 cttcgtagc-------tttacc----atttaccttgagtcctttgcttccatttcgtagtcaattgcaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 42245940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 11499312 - 11499540
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  11499312 aaaatgtattattttctattttgtcagcagcagatgataggattttgtataagtttgataatgatccgaaagatatctttccttatgtagtgggaatata 11499411  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||    
T  11499412 gttgatgtaacactatgagaaaaatactacgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttatttgtttccattttgtagtcaatgacagcccaa 11499511  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499512 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 11499540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 17476621 - 17476836
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  17476621 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatata 17476720  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  17476721 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 17476820  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17476821 atatatgtaacaattg 17476836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 17512264 - 17512479
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17512264 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 17512363  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  17512364 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatctcaacccaa 17512463  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17512464 atatatgtaacaattg 17512479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17540950 - 17540735
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17540950 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 17540851  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  17540850 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatctcaacccaa 17540751  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17540750 atatatgtaacaattg 17540735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17576593 - 17576378
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  17576593 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatata 17576494  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  17576493 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 17576394  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17576393 atatatgtaacaattg 17576378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8927476 - 8927246
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  8927476 aaaaggtattattttctattttgtaaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtcttttcttatgtagtgggaatata 8927377  T
Q  227 gttgatgtaacactat--gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacct 324  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  8927376 gttgatgcaacactatgggaaaaaaatactctgtagctttatcatttatcatctatttaccttgagtttcttgcttccattttatagtcaatggcaaccc 8927277  T
Q  325 aaatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8927276 aaatatatgtaacaattggtcaggctcgagg 8927246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 14307601 - 14307839
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | || |||||||    
T  14307601 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtcttcccttatgtaatgggaatata 14307700  T
Q  227 gttgatgtaacactat--gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcat--------t 316  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |    
T  14307701 gttgatgtaacactatgggaaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcatgtagtcaat 14307800  T
Q  317 ggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14307801 ggaaacccaaatatatgtaacaattggtcgggttcgagg 14307839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19035136 - 19034999
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  19035136 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 19035037  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19035036 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 19034999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 20719500 - 20719637
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  20719500 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 20719599  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20719600 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 20719637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 20764170 - 20764307
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  20764170 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 20764269  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20764270 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 20764307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 29489748 - 29489885
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  29489748 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 29489847  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29489848 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 29489885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33231436 - 33231299
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33231436 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 33231337  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33231336 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 33231299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34283579 - 34283442
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  34283579 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 34283480  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34283479 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 34283442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13458382 - 13458069
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458382 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 13458283  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458282 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 13458183  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13458182 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 13458088  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13458087 attggtcaggttcgaggct 13458069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9980721 - 9980403
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9980721 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 9980622  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9980621 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 9980522  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9980521 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 9980422  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9980421 attggtcaggttcgaggct 9980403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 24444553 - 24444871
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24444553 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 24444652  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24444653 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 24444752  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24444753 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 24444852  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  24444853 attggtcaggttcgaggct 24444871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 33977542 - 33977860
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33977542 agaaatcattgggttttttcatgagattgtcaagacaactccaatttggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 33977641  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33977642 tttctaatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcctttcttatgcagtggtaatatagttgatgtaaca 33977741  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  33977742 ctatgggtaaaatactctgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatagatgtaaca 33977841  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  33977842 attggtcaggttcgaggct 33977860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 1219150 - 1219468
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1219150 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactaaaaagaaatagtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 1219249  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219250 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgaccttaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 1219349  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1219350 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttcttggcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 1219449  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  1219450 attggtcaggttcgaggct 1219468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Original strand, 25531841 - 25532157
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531841 agaaatcattggacttcttcataagattgtcaagtaaatgccaattgggactataaagaaattgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 25531940  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531941 tttctaatttgttagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaaaatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 25532040  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  25532041 ctatgagaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcatccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 25532140  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||| ||||||||||||    
T  25532141 attggtcaggttcgagg 25532157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3052455 - 3052136
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaag-gtatta 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3052455 agaaatcatcgggcttcttcaggagattgtcaaaacaacgtcaattcggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaaagtatta 3052356  T
Q  138 ttttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaac 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3052355 ttttttaatttgtcaacatcagatggtaagattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaac 3052256  T
Q  238 actatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaac 337  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  3052255 actatgggaaaaatattttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaaccaaaatatatgtaac 3052156  T
Q  338 aattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  3052155 aattggtcaagttcgaggct 3052136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 51 - 357
Target Start/End: Original strand, 34319674 - 34319981
Alignment:
Q  51 gcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34319674 gcttcttaatgagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaactgtgtacgaacattttgtttaaagataaaagatattattttctaatttgt 34319773  T
Q  151 caacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttc-cttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaa 249  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  34319774 cagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttctcttatgcagtgggaatatagtcgatgtaacactatgggtaaa 34319873  T
Q  250 atactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggt 349  Q
    ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||    
T  34319874 atatttcgtagctttatcatttacaatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatatatgtaagaattggttaggt 34319973  T
Q  350 tcgaggct 357  Q
    ||||||||    
T  34319974 tcgaggct 34319981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1074850 - 1074620
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1074850 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 1074751  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1074750 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 1074651  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1074650 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 1074620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18600573 - 18600343
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18600573 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 18600474  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18600473 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 18600374  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18600373 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 18600343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 7221404 - 7221634
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7221404 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 7221503  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7221504 gttgatgtaacactatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 7221603  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7221604 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 7221634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 34854616 - 34854844
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  34854616 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgcctttccttatgtagtgggaatata 34854715  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34854716 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccgtctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 34854815  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34854816 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 34854844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14889525 - 14889297
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14889525 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgaagtgggaatata 14889426  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14889425 gttgatgtaacactataggaaaaatactccgtagatttatcatttaccatctatttactttgagttccttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 14889326  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14889325 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 14889297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 127 - 350
Target Start/End: Original strand, 4423058 - 4423281
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  4423058 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtggaaatcta 4423157  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4423158 gttgatgtaacactgtgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 4423257  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggtt 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  4423258 atatatgtaacaattggtcaggtt 4423281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 2519817 - 2520045
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  2519817 aaaatgtattattttctattttgttaacatcagatgatagaattttgtataagtttaataatgacccgaaaaatctctttccttatgtagtgggaatata 2519916  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  2519917 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccag 2520016  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2520017 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 2520045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 15274263 - 15274493
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15274263 aaaatgtattattttctattttgtcagcattaaatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtaggaatata 15274362  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||    
T  15274363 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaataacaaacaaa 15274462  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15274463 atatatgtaacaattggtcaggtttgaggct 15274493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1081176 - 1080951
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| || ||||    
T  1081176 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccatatgtagtggga-tata 1081078  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||| ||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1081077 gttaatgcaacactatggaaaaaatactccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 1080978  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcga 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1080977 atatatgtaacaattggtcaggttcga 1080951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7220380 - 7220150
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  7220380 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttatataagtttaataatgacccgaaagatgtttttccttatgtagtgggaatata 7220281  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| | ||    
T  7220280 gttgatgtaacactatgggaaaaatactcagtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccatattgtagtcaaagacaaaccaa 7220181  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  7220180 atatatgtaacaattagtcaagttcgaggct 7220150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 263
Target Start/End: Original strand, 11269182 - 11269408
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11269182 agaaattatcgagcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattgggactggaaaaaaaccgtgtacgaacattgtgttgagagatcaaaggtattat 11269281  T
Q  139 tttct-aatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatg-cagtgagaatatagttgatgtaa 236  Q
    ||||| ||||  |||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  11269282 tttctaaattcatcagtatcaaatgataggattttgtataggtttgataatgacttgaaagatgtcttttcttatgccaatgacaatatgattgatgtaa 11269381  T
Q  237 cactatgagaaaaatactccgtagctt 263  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11269382 cacaatgggaaaaatactccgtagctt 11269408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11937363 - 11937145
Alignment:
Q  128 aaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatag 227  Q
    |||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||     
T  11937363 aaagatatcattttatattttgtcaacattagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatatagtgggaatataa 11937264  T
Q  228 ttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaa 327  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  11937263 ttgatgtaacactatgggaaaaataatctgtatctttatcatttaccatctatttacc---------ttgcttccattttgtagtcaatgaaaacccaaa 11937173  T
Q  328 tatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11937172 tatatgtaacaattggtcaggttcgagg 11937145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Original strand, 17938253 - 17938412
Alignment:
Q  197 agatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttcttt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17938253 agatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatg-gaaaaatattttatagctttatcatttactatctatttaccttgagttcttt 17938351  T
Q  297 gcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17938352 gcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 17938412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 248681 - 248818
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  248681 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 248780  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  248781 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 248818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3089517 - 3089387
Alignment:
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||    
T  3089517 gttgatgtaacactataggaaaaatacttcgtaactttatcatttaccatatatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgacaacacaa 3089418  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3089417 ataaatgtaacaattggtcaggttcgaggct 3089387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11518480 - 11518346
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaa-ccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtatta 137  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11518480 agaaattatcgagcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattgggactggaaaaaaaaccgtgtacgaacattgtgttgagagatgaaaggtatta 11518381  T
Q  138 ttttct-aatttgtcaacatcagatgatagaattt 171  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  11518380 ttttctaaatttgtcagtatcaaatgataggattt 11518346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12581272 - 12581135
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  12581272 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 12581173  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12581172 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaagttcgaggct 12581135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3089620 - 3089519
Alignment:
Q  41 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaac----cgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtatt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3089620 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtccagacaacgccaattggtactggaaagaaaccgtacgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaatgtatt 3089521  T
Q  137 at 138  Q
    ||    
T  3089520 at 3089519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11518047 - 11517944
Alignment:
Q  160 atgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgta 259  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11518047 atgataggattttgtataggtttgataatgacttgaaagatgtcttttcttatgcaatggcaatatgattgatgtaacacaatgggaaaaatactccgta 11517948  T
Q  260 gctt 263  Q
    ||||    
T  11517947 gctt 11517944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11517822 - 11517731
Alignment:
Q  266 tcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  | |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  11517822 tcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttaaagaaaatggcaagccaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggct 11517731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22375257 - 22375203
Alignment:
Q  303 attttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22375257 attttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 22375203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22375298 - 22375250
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgta 175  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22375298 aaaatgtattattttctattttgttaacatcagatgataggattttgta 22375250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 307
Target Start/End: Original strand, 11269536 - 11269569
Alignment:
Q  274 catctatttaccttgagttctttgcttccatttt 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11269536 catctatttaccttgagttatttgcttccatttt 11269569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 15519460 - 15519773
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519460 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 15519559  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519560 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 15519659  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15519660 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 15519754  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  15519755 attggtcaggttcgaggct 15519773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 741955 - 741642
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  741955 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattggcactagaaagaaaccgtgtatgaacactgtgttgaaagataaaaggtattat 741856  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  741855 tttctagtttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 741756  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  741755 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattcgcaacccaaatatatgtaaca 741661  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  741660 attggtcaggttcgaggct 741642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 19589454 - 19589772
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19589454 agaaatcattgggtttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 19589553  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19589554 tttctaatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtccttccttatgcagtgggaatacagttgatgtaaca 19589653  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  19589654 ctatgggtaaaatactctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatagatgtaaca 19589753  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19589754 attggtcaggttcgaggct 19589772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 575686 - 575368
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  575686 agaaatcattgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtttacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 575587  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  575586 tttttaatttgtcaacataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 575487  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  575486 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 575387  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  575386 attggttaggttcgaggct 575368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 52799652 - 52799970
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52799652 agaaatcatcggccttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 52799751  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52799752 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 52799851  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  52799852 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 52799951  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  52799952 attggtcaggttcgaggct 52799970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39716179 - 39715861
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39716179 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaagtattat 39716080  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39716079 tttcttatttgtcagcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 39715980  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39715979 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacatcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacctaaatatatgtaaca 39715880  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  39715879 attggtcaggttcgaggct 39715861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35497199 - 35496880
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35497199 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaaaaaactgtgtacgaacattgtattgaaagataaaaggtattat 35497100  T
Q  139 tttctaatttgtca--acatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaa 236  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35497099 tttctaatttgtcagcatataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaa 35497000  T
Q  237 cactat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgta 335  Q
    |||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  35496999 cactatggaaaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgta 35496900  T
Q  336 acaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  35496899 acaattggtcaggtttgagg 35496880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 16903879 - 16904200
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16903879 agaaatcatcggacttcttcatgagattgtcaaaacaatgccaattgagactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaagatattat 16903978  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttcc---ttatgcagtgagaatatagttgatgta 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16903979 tttctaatttgtcagcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttattatgcagtgagaatatagttgatgta 16904078  T
Q  236 acactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgta 335  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  16904079 acactatgggaaaaatattctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaagatatgta 16904178  T
Q  336 acaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  16904179 acaattgttcaggttcgaggct 16904200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 17738689 - 17738967
Alignment:
Q  79 ccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataa 178  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  17738689 ccaattgggactagaaagaaactgtgtacaaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataa 17738788  T
Q  179 gtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  17738789 gtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgagaatatagttgatgaaacactatgagaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatct 17738888  T
Q  279 atttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17738889 atttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggaaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 17738967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 352
Target Start/End: Original strand, 1943106 - 1943419
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1943106 agaaatcattgtggttcttcataagattgtcaagacaacaccaatggagactggaaagacaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaagtattat 1943205  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1943206 tttctaatttgtcagcatcatatgatagaattttatataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 1943305  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    | |||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1943306 caatggaaaaaatacttcgtagctttattatttaccatctatttaccttgagttctatgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 1943405  T
Q  339 attgatcaggttcg 352  Q
    |||| |||||||||    
T  1943406 attggtcaggttcg 1943419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33504581 - 33504353
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33504581 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 33504482  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  33504481 gatgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttccttccattttgtagtcaatgacaacccaa 33504382  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33504381 atatatgtaacaattgttcaggttcgagg 33504353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35713712 - 35713485
Alignment:
Q  115 gtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35713712 gtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtcagcataagatgatatgattttgtagaagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgc 35713613  T
Q  215 agtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35713612 agtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatattctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtca 35713513  T
Q  315 ttggcaacctaaatatatgtaacaattg 342  Q
     || ||||  ||||||||||||||||||    
T  35713512 atgacaacacaaatatatgtaacaattg 35713485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41984904 - 41984705
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41984904 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 41984805  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41984804 tttctaatttgtcagcatcagatgatatgattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtaggaatatagttgatgtaaca 41984705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14831104 - 14830876
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14831104 aaaaggtattattttctattttgtgaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 14831005  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  14831004 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttacttccattttgtagtcaatgacaacccaa 14830905  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14830904 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 14830876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 139 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 56000281 - 56000063
Alignment:
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  56000281 tttctattttgtcagcatcagatgatatgattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtaggaatatagttgatgtaaca 56000182  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  56000181 ctatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 56000082  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  56000081 attggtcaggttcgaggct 56000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 23477599 - 23477827
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  23477599 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccaaaaaatgtcattccttatgtagtgggaatatt 23477698  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23477699 gttgatgtaacactatggaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 23477798  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23477799 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 23477827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7645705 - 7645481
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7645705 aaaatgtattattttctattttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 7645606  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  7645605 gttgatgtaacactatgtgaaaaatactccatagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattttgtagtcaatgccaacccaa 7645506  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttc 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  7645505 atatatgtaacaattggtcaggttc 7645481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34058158 - 34057930
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34058158 aaaatgtattattttctattttatagacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 34058059  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  34058058 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 34057959  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34057958 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 34057930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5275339 - 5275111
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5275339 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgattcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 5275240  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5275239 gttgatgcaacactatgggaaaaatacttcgtaactttatcatttactatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 5275140  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5275139 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 5275111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15656404 - 15656177
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15656404 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatatagttttgtataagtttgataaagatccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 15656305  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  15656304 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttcccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtca-tggaaacccaa 15656206  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15656205 atatatgtaataattgatcaggttcgagg 15656177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 243
Target Start/End: Original strand, 40618415 - 40618619
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40618415 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatttcaattgggactagaaagaaactgtgtacggacattgtgttgaaagatgaaaggtattat 40618514  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40618515 tttctaatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacatgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttcatgtaaca 40618614  T
Q  239 ctatg 243  Q
    |||||    
T  40618615 ctatg 40618619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 159 - 357
Target Start/End: Original strand, 28971820 - 28972018
Alignment:
Q  159 gatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28971820 gatgatagaattttgtataagtttgataatgatccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatactccgt 28971919  T
Q  259 agcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28971920 agctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 28972018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 36855826 - 36856055
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36855826 aaaaggtattattttctattttatcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 36855925  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  36855926 gttgatgtaacactatg-ggaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttcttttcttccattttgtagtcaatggcaacccta 36856024  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36856025 atacatgtaacaattggtcaggttcgaggct 36856055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19832953 - 19832750
Alignment:
Q  154 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatac 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19832953 catcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttattaagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 19832854  T
Q  254 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcga 353  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19832853 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttccttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 19832754  T
Q  354 ggct 357  Q
    ||||    
T  19832753 ggct 19832750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39746439 - 39746216
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  39746439 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatata 39746340  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||    
T  39746339 gttgatgtaacactatggaaaaaatactttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgggttatttggttccattttgtagtcaatgacaacccaa 39746240  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggtt 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  39746239 atatatgtaacaattggtcaggtt 39746216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 53341104 - 53341334
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  53341104 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatata 53341203  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  53341204 attgatgtaacagtatggaaaaaatactctctagcttcatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 53341303  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  53341304 atatatgtaataattggtcacgttcgaggct 53341334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 13626746 - 13626977
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||    
T  13626746 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcatatgataggattttgtataagtttggtaatgacccgaaagaggtctttccttgtgtagtgggaatata 13626845  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttc-tttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  13626846 gttgatgtaacactatgggaaaaatactatgtagctttatcatttaccatctatttaccttaagttcttttgcttccattttgaagtaaatggcaaccca 13626945  T
Q  326 aatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13626946 aatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 13626977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 16891641 - 16891863
Alignment:
Q  41 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattt 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16891641 aaattatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaactgggactggaaaaaaaccgtgtacgaacattgtgttgagaggtgaaaggtattattt 16891740  T
Q  141 tctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacact 240  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||  |||||||||||||    
T  16891741 tctaatttgtcagcatcaaattattggattttgtataggtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcaatggaaatatgattgatgtaacact 16891840  T
Q  241 atgagaaaaatactccgtagctt 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  16891841 atgggaaaaatactccgtagctt 16891863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28136649 - 28136419
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28136649 aaaatgtattattttctattttttcaccatcagatgataagattttgtataaatttgatgatgactcgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 28136550  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  28136549 gttgatgcaacactatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttttcttgagttctttgcttccattttgtagtcaataacaacccaa 28136450  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28136449 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 28136419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47721689 - 47721428
Alignment:
Q  94 aagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacct 193  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47721689 aagacaccgtgtacgaacattgttttgaaagataaaaagtattattttctaatttttcaggatcaggtgatacaattttatataagtttgataatgacct 47721590  T
Q  194 gaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttc 293  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||  |||     ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||     
T  47721589 gaaagatgtatttacttatacagtgggaatatggttga--taatgacctgaaaaaaatactttgtagctttatcatttactatctatatacattgagtta 47721492  T
Q  294 tttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47721491 tttgcttctattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 47721428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10260808 - 10260671
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  10260808 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 10260709  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10260708 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 10260671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 21563647 - 21563784
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  21563647 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 21563746  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21563747 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 21563784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26925750 - 26925613
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  26925750 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 26925651  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26925650 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 26925613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 43331168 - 43331305
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  43331168 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 43331267  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43331268 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 43331305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 51451234 - 51451371
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  51451234 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 51451333  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51451334 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 51451371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24078878 - 24078741
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  24078878 gaatatagttgatgtaaccttatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 24078779  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24078778 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 24078741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 357
Target Start/End: Original strand, 40620979 - 40621071
Alignment:
Q  265 atcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40620979 atcatttatcatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 40621071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 357
Target Start/End: Original strand, 16891991 - 16892074
Alignment:
Q  274 catctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  16891991 catctatttaccttgagttatttgcttccattttatagaaaatggcaagccaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggct 16892074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 35713756 - 35713724
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35713756 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaa 35713724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 47721720 - 47721684
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagaca 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47721720 agaaatcatcggacttcttcatgagattgtcaagaca 47721684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6344375 - 6344062
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6344375 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 6344276  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6344275 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 6344176  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6344175 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 6344081  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6344080 attggtcaggttcgaggct 6344062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14324859 - 14324546
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324859 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 14324760  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324759 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 14324660  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14324659 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 14324565  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14324564 attggtcaggttcgaggct 14324546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1994587 - 1994274
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994587 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtttacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 1994488  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994487 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 1994388  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1994387 ctatgggaaaaatactccggagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatataagtaaca 1994293  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  1994292 attggtcaggttcgaggct 1994274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 28500910 - 28501223
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28500910 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtatacgaacattttgttgaaagataaaaggtattat 28501009  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28501010 tttttaatttgtcaacatcagatgatagaatttcgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatataattgatgtaaca 28501109  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501110 ctatggcaaaaatacttcgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 28501204  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  28501205 attggtcaggttcgaggct 28501223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 39 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9918355 - 9918052
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9918355 agaaatcatcgagcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtttacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 9918256  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9918255 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 9918156  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9918155 ctatgggaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattgacaacccaaatatatgtaaca 9918056  T
Q  339 attg 342  Q
    ||||    
T  9918055 attg 9918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10049651 - 10049333
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10049651 agaaatcatcgggcttcttgatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 10049552  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049551 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 10049452  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10049451 ctatggaaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 10049352  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  10049351 attggtcaggttcgaggct 10049333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4292303 - 4291985
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4292303 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactaaaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 4292204  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4292203 tttcttatttgtcagcataagataataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 4292104  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4292103 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 4292004  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  4292003 attggtcaggttcgaggct 4291985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9545281 - 9544963
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9545281 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 9545182  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| ||||||   ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545181 tttcttatttgttggcataagattataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 9545082  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9545081 ctatgggaaaaatatttcgtagccttatcatttaccatctatttacctttagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 9544982  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9544981 attggtcaggttcgaggct 9544963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 28607851 - 28608165
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28607851 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaattccaattgggact----agaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtaatat 28607946  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28607947 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtttttccttatgtagtgagaatatagttgatgtaaca 28608046  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28608047 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatatatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 28608146  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  28608147 attggtcaggttcgaggct 28608165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 14751795 - 14752112
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14751795 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaccgccaattgagactagaaagaaaccgtgtacgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 14751894  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14751895 tttctaatttttcaggatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtg-gaatatggttgatgtaaca 14751993  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14751994 ctatggaaaaaatactttgtagctttatcatttaccctctatatacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 14752093  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14752094 attggtcaggttcgaggct 14752112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18094379 - 18094062
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18094379 agaaatcatcggacttcttcatgagattgtcaagacaatgtcaattgggactataaagaaactgtgtacgagcattgtattgaaagataaaaggtattat 18094280  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18094279 tttctaatttgtcggcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgacaatatagttgacgtaaca 18094180  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  18094179 ctatgag-aaaatatttcgtagcttaatcatttaccatttatttaccttgagttctttgcttcaattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 18094081  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18094080 attggtcaggttcgaggct 18094062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 16882556 - 16882874
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  16882556 agaaatcatcgcgtttcttcataagattttcaagacaacggcaattgggactggaaagaaactgtgtacaaacattttgtcgaaacataaaaggtattat 16882655  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16882656 tttctaatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtattttcttatgcagtgaaaatatgattgatgtaaca 16882755  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16882756 ctatgggaaaaatacttcgtagttttgtcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccaatttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 16882855  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  16882856 attggtcaggttcgaggct 16882874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 17040246 - 17040564
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  17040246 agaaatcatcgcgtttcttcataagattttcaagacaacggcaattgggactggaaagaaactgtgtacaaacattttgtcgaaacataaaaggtattat 17040345  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17040346 tttctaatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtattttcttatgcagtgaaaatatgattgatgtaaca 17040445  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17040446 ctatgggaaaaatacttcgtagttttgtcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccaatttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 17040545  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  17040546 attggtcaggttcgaggct 17040564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 21096412 - 21096640
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  21096412 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagtattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatatctttccttatgtagtgggaatata 21096511  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21096512 gttgatgcaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 21096611  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21096612 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 21096640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19169196 - 19168966
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  19169196 aaaaggtattattttatattttgtcagcatcagatgataggattttgtagaagtttgataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatata 19169097  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19169096 gttgatgtaacaatatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 19168997  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19168996 atatatgtaacaattaatcaggttcgaggct 19168966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 26826240 - 26826469
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  26826240 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgaccaaaaaaatatctttccttatgtagtgggaatata 26826339  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  26826340 gttgatgtaacactatg-gaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 26826438  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26826439 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 26826469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 33905008 - 33905238
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33905008 aaaaggtattattttctattttgtcagtatcagatgataaaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 33905107  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  33905108 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 33905207  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33905208 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 33905238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 42884104 - 42884332
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  42884104 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtggaaatata 42884203  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  42884204 gttgatgtaacactatgagaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 42884303  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42884304 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 42884332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36634655 - 36634427
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||||| |||  |||||||    
T  36634655 aaaagatattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataaagacccgagaaatgtatttccttatgtagtaggaatata 36634556  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36634555 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 36634456  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36634455 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 36634427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30568434 - 30568204
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30568434 aaaaggtattattttctattttgtcagctatagatgataggattttgtataaatttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 30568335  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||    
T  30568334 attgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagttaatgacaacccaa 30568235  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30568234 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 30568204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45206535 - 45206305
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  45206535 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttatataagtttaataatgacccgaaagatgtttttccttatgtagtgggaatata 45206436  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||    
T  45206435 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagttaatgacagcccaa 45206336  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  45206335 atatatgtaacaattggttaagttcgaggct 45206305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 125 - 355
Target Start/End: Original strand, 26820339 - 26820559
Alignment:
Q  125 ataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaata 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||       
T  26820339 ataaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtggga--- 26820435  T
Q  225 tagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacct 324  Q
           |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26820436 -------tgtaacactatgggaaaaatactccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaaccc 26820528  T
Q  325 aaatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26820529 aaatatatgtaacaattggtcaggttcgagg 26820559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 17091051 - 17091236
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17091051 agaaatcatcgggtttcttcatgagattgtcaagccaacgccaattgggacgggaaagaaatcgtgtacaaacattgtgttgaaagataaactgtattat 17091150  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatat 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17091151 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca-tgagaatat 17091236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 263
Target Start/End: Original strand, 7360537 - 7360762
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7360537 agaaattatcgagcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattgggattggaaaaaaaccgtgtacaaacattgtgttgagagatgaaaggtattat 7360636  T
Q  139 tttct-aatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaac 237  Q
    ||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||  ||||||||||    
T  7360637 tttctaaatttgtcagtatcaaatgataggattttgtataggtttgataatgacttgaaagatgtcttttcttatgcaatggcaatatgattgatgtaac 7360736  T
Q  238 actatgagaaaaatactccgtagctt 263  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  7360737 acaatgggaaaaatactccgtagctt 7360762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 17036543 - 17036728
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17036543 agaaatcatcgggtttcttcatgagattgtcaagccaacgccaattgggacgggaaagaaatcgtgtacaaacattgtgttgaaagataaactgtattat 17036642  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatat 225  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17036643 tttctaatttgtcagtatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca-tgagaatat 17036728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 17024866 - 17025051
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  17024866 agaaatcatcgggtttcttcatgagattgtcaagccaacgccaattgggacgggaaagaaatcgtgtacaaatattgtgttgaaagataaactgtattat 17024965  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatat 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17024966 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaatgatgtatttccttatgca-tgagaatat 17025051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 4810281 - 4810395
Alignment:
Q  128 aaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatag 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4810281 aaaggtattattttctcatttgtcagcatcagatgataggattttatataagtttgataatgacatgaaatatgtctttccttatgtagtgggaatatag 4810380  T
Q  228 ttgatgtaacactat 242  Q
    |||||||||||||||    
T  4810381 ttgatgtaacactat 4810395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 3709715 - 3709852
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  3709715 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 3709814  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3709815 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 3709852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11867701 - 11867564
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  11867701 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 11867602  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11867601 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 11867564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35359094 - 35358957
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  35359094 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 35358995  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35358994 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 35358957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 357
Target Start/End: Original strand, 4810407 - 4810490
Alignment:
Q  274 catctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4810407 catcaatttatcttgagttctttgctaccattttgtagtcaatggcaatccaaatatatgtgacaattggtcaggttcgaggct 4810490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 7360882 - 7360973
Alignment:
Q  266 tcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  | |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7360882 tcatctaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttaaagaaaatggcaagccaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggct 7360973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33665174 - 33665115
Alignment:
Q  296 tgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33665174 tgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgagg 33665115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 18110319 - 18110632
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110319 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 18110418  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110419 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 18110518  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18110519 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 18110613  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18110614 attggtcaggttcgaggct 18110632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43256202 - 43255889
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256202 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 43256103  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256102 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 43256003  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43256002 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 43255908  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  43255907 attggtcaggttcgaggct 43255889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50396616 - 50396303
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396616 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 50396517  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396516 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 50396417  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50396416 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 50396322  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  50396321 attggtcaggttcgaggct 50396303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29842339 - 29842021
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29842339 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtttacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 29842240  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29842239 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 29842140  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29842139 ctatgggaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 29842040  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  29842039 attggttaggttcgaggct 29842021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10695843 - 10695525
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695843 agaaatcatctggcttcttcatgagattgtcaagacaatgtcaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 10695744  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695743 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 10695644  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||    
T  10695643 ctatgggaaaaatattctgtagctttatcatttaccatatatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgaaaactcaaatatatgtaaca 10695544  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  10695543 attggtcaggttcgaggct 10695525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 39 - 342
Target Start/End: Original strand, 42680993 - 42681296
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42680993 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtttacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 42681092  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42681093 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 42681192  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  42681193 ctatgggaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 42681292  T
Q  339 attg 342  Q
    ||||    
T  42681293 attg 42681296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 4890726 - 4891044
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4890726 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 4890825  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4890826 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 4890925  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4890926 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 4891025  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  4891026 attggtcaggttcgaggct 4891044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29187761 - 29187443
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29187761 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 29187662  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29187661 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 29187562  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29187561 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 29187462  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  29187461 attggtcaggttcgaggct 29187443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 51967384 - 51967067
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51967384 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaatgtattat 51967285  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51967284 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagttt-ataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatataattgatgtaaca 51967186  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  51967185 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgcgttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 51967086  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  51967085 attgatcaggttcaaggct 51967067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 33360328 - 33360646
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33360328 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactaaaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 33360427  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33360428 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 33360527  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33360528 ctatggaaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 33360627  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  33360628 attggtcaggttcgaggct 33360646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 39 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28567371 - 28567060
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28567371 agaaatcatcaggcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattggaattggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaaaataaaaggtattat 28567272  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  28567271 tttctaatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttggtaatgacctgaaagatgtattcccttatgtagtgggaatatggctgatgtaaca 28567172  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28567171 ctatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 28567072  T
Q  339 attgatcaggtt 350  Q
    |||| |||||||    
T  28567071 attggtcaggtt 28567060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13664069 - 13663753
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13664069 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaaaataaaaggtattat 13663970  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | | ||| ||||    
T  13663969 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatggctaatgcaaca 13663870  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13663869 ctatgggaaaaatacttcgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaacggcaacccaaatatatgtaaca 13663770  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  13663769 attagtcaggtttgagg 13663753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 52308432 - 52308750
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52308432 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaattgtgtacgagcattgtgttgaaagataaatggtattat 52308531  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52308532 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataaatttgataatgacctggaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 52308631  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  52308632 ctatgggaaaaatattttgtagctttgtcatttatcatctatttaccttgagttttttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtagca 52308731  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  52308732 attggtcaggttcgaggct 52308750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 50559647 - 50559965
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50559647 agaaatcgttgggcttattcatgagattgtcaagacaatgccaattgggactagaaaaaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 50559746  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50559747 tttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtcttttcttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 50559846  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  50559847 ctatgggaaaaatattccgtagctttatcatttgccatatatttaccttgagttatttgttttcattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 50559946  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  50559947 attggtcaggttcgaggct 50559965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 49224882 - 49225192
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49224882 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattggaactggaaagaaaccgtgtacgaacattctgttgaaagataaaagatattat 49224981  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||  ||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  49224982 tttctaatttgtcagaat-----gataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttt---tatgtagtggaaatttagttgatgtaaca 49225073  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  49225074 ctatgggaaaaatactctgtagctttatcatttaccttctatttaccttgagttctttgctacctttttgtagtcaacgtcaacccaaatatatgtaaca 49225173  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  49225174 attggtcaggttcgaggct 49225192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 357
Target Start/End: Original strand, 18095411 - 18095727
Alignment:
Q  41 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||    
T  18095411 aaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattaagactggaaaaaaatcatgtacgaacattgtgttgagagatgaatgatattattt 18095510  T
Q  141 tctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacact 240  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18095511 tctaatttgtcagcgtcagatgataggattttgtataggtttgataatgacctgaaaaatgtctttccttatgcagtgagaatatggttgatgtaacatt 18095610  T
Q  241 atgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaat 340  Q
    ||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||| |||||||    
T  18095611 atgggaaaaatacatcgtagctttatcatctaccatctatttgccttgagttctttgcttccattttgtagacaatggcaagccagatatatttaacaat 18095710  T
Q  341 tgatcaggttcgaggct 357  Q
    || ||||||| ||||||    
T  18095711 tggtcaggtttgaggct 18095727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10700732 - 10700519
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700732 agaaatcatcaggcttcttcatgagattgtcaagacaatgacaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 10700633  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700632 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 10700533  T
Q  239 ctatgagaaaaata 252  Q
    ||||| ||||||||    
T  10700532 ctatgggaaaaata 10700519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Original strand, 21729347 - 21729580
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21729347 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcagttgggactggaaagaaatcgtgtatgaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 21729446  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21729447 tttctaatttgttagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaatatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaaca 21729546  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcattta 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21729547 ctatgggaaaaatactccgtagctttatcattta 21729580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 18812903 - 18813131
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18812903 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataataacccaaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 18813002  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18813003 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 18813102  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18813103 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 18813131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41964495 - 41964267
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41964495 aaaaggtattattctctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataataacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 41964396  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41964395 attgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 41964296  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41964295 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 41964267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 31618373 - 31618602
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31618373 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 31618472  T
Q  227 gttgatgtaacactat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  31618473 gttgatgtaacactatggaaaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaaccca 31618572  T
Q  326 aatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31618573 aatatatgtaacaattggtcaggttcgagg 31618602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17710079 - 17709792
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  17710079 agaaatcatcaggcttcttcatgtgattgt-aagacaacgccaattgggactggaaagaaaccgtgtatgaatattgtgttgaaagataaaaaatattat 17709981  T
Q  139 tttctaatt----tgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgt 234  Q
    |||||||||    |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17709980 tttctaattaatttgtcattatcagaggataggattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgt 17709881  T
Q  235 aacactatg-----agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    |||||||||     | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  17709880 aacactatgaaacaaaaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttacttcca-tttgtagtcaatggc 17709792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41831619 - 41831392
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41831619 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatataattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 41831520  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  41831519 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagatttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaat-gcaacccaa 41831421  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41831420 atatatgtaacaattggtcaggtttgagg 41831392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 34686272 - 34686500
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34686272 aaaatgtattattttctattttatagacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 34686371  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  34686372 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 34686471  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34686472 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 34686500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 34690810 - 34691038
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34690810 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcaaatgatagaattttggataagtttgataatgacccaaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 34690909  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34690910 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 34691009  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34691010 atatatgtaacaattggtaaggttcgagg 34691038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38846791 - 38846559
Alignment:
Q  125 ataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaata 224  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  38846791 ataaaatgtattattttctattttgtcagcattagacgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttctttatgtagtgggaata 38846692  T
Q  225 tagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacct 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  38846691 tagttgatgtaacactatgggaaaaatactatgtagctttatcatttaccatctagataccttgagttctttgcttccattttgtagtcaacggcaatcc 38846592  T
Q  325 aaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38846591 aaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 38846559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 48339079 - 48339308
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  48339079 aaaaggtgttattttctattttgtcagcatcagatgataggattttatataagtttaataatgacccgaaagatgtttttcattatgtagtgggaatata 48339178  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || || || ||    
T  48339179 gttgatgtaacactatg-ggaaaatactccatagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagttaatgacagcccaa 48339277  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  48339278 atatatgtaacaattggttaagttcgaggct 48339308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52523122 - 52522906
Alignment:
Q  128 aaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatag 227  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||     
T  52523122 aaaggtgttattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaaaatgtctttccatatgtagtgggaatataa 52523023  T
Q  228 ttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaa 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| |||    
T  52523022 ttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatc-----------atttaccttgagttccttgcttccattttgtagttaatggaaacccaaa 52522934  T
Q  328 tatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52522933 tatatgtaacaattggtcaggttcgagg 52522906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17364064 - 17363955
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17364064 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 17363965  T
Q  139 tttctaattt 148  Q
    ||||| ||||    
T  17363964 tttcttattt 17363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 15314077 - 15314168
Alignment:
Q  266 tcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15314077 tcatttgccatctatttacattaagttctttgattccattttttagtcaatggcaacctaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 15314168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 19394043 - 19394361
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394043 agaaatcattgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgcgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 19394142  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19394143 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgtaaca 19394242  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19394243 ttatgggaaaaatactctgtagcttgattatttaccatttatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 19394342  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19394343 attggtcaggttcgaggct 19394361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31297192 - 31296879
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31297192 agaaatcatcgagcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaagatattat 31297093  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31297092 tttttaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 31296993  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31296992 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 31296898  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31296897 attggtcaggttcgaggct 31296879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 34716214 - 34716532
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34716214 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 34716313  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34716314 tttcttatttgtcaacataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 34716413  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34716414 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 34716513  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  34716514 attggtcaggttcgaggct 34716532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 39 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12589938 - 12589635
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12589938 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgtcaattgggactagaaagaaactgtttacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 12589839  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589838 cttctaatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 12589739  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12589738 ctatgggaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 12589639  T
Q  339 attg 342  Q
    ||||    
T  12589638 attg 12589635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25698180 - 25697863
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25698180 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 25698081  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25698080 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgc-gttagaatatagttgatgtaaca 25697982  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25697981 ctatgagaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattgtgtagtcaatggcaacctaaatatatgtaaca 25697882  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  25697881 attggtcaggttcgaggct 25697863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 353
Target Start/End: Original strand, 41689901 - 41690215
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41689901 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 41690000  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690001 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 41690100  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41690101 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 41690200  T
Q  339 attgatcaggttcga 353  Q
    |||| ||||||||||    
T  41690201 attggtcaggttcga 41690215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12420662 - 12420344
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12420662 agaaatcatcggccttcttcatgagattgtcaagacaatgtcagttgggactagaaagaaactgtgtacgaacattatgttgaaagataaaatgtattat 12420563  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12420562 tttctaatttgtcagcattagatgatatgattttgtataagtttgataataagctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatataattgatgtaaca 12420463  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  12420462 ctatggaaaaaatattatgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggaatcccaaatatatgtaaca 12420363  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12420362 attggtcaggttcgaggct 12420344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 30141129 - 30141447
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30141129 agaaatcatcgggcttcttcaagagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 30141228  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||  ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141229 tttcttatttgtcggcagaagatgataggattttgtatacgtttgttaatgacctgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 30141328  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |    
T  30141329 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttgtagtaaatggcaacccaaatatatataata 30141428  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  30141429 attggtcaggttcgaggct 30141447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 289163 - 289480
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  289163 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcatgacactgccaattgggactagaaagaaaccttgtacgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 289262  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  289263 tttctaatttttcaggatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 289362  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
     ||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  289363 ttatggaaaaaatacttcgtggctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacc-aaatatatgtaaca 289461  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  289462 attggtcaggttcgaggct 289480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3211858 - 3211544
Alignment:
Q  42 aatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattatttt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3211858 aatcatcgggcttcttcatgagattgtcaaaacaacgtcaattgagactagaaagaaaacgtgtacccatattgtgttgaaagataaaatgtattatttt 3211759  T
Q  142 ctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacacta 241  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  3211758 ctaatttgtcagcattagaagata-aattttgtataagtttaataatgacctgaaatatgtatttccttatgtagtgggaatatggttgatgtaacacta 3211660  T
Q  242 tgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaatt 341  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  3211659 tgggaaaaatacttcgtagctttatcttttaccatatatttacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaatccaaatatatgtaacaatt 3211560  T
Q  342 gatcaggttcgaggct 357  Q
    | ||||||||||||||    
T  3211559 ggtcaggttcgaggct 3211544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20997515 - 20997285
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||    
T  20997515 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtatttccttatgtagtggaaatata 20997416  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20997415 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 20997316  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20997315 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 20997285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34375978 - 34375748
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  34375978 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtggcaatata 34375879  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  34375878 gttgatgtaacactatgggaaaaatactacgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 34375779  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34375778 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 34375748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 19446786 - 19447016
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  19446786 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagttttataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatata 19446885  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  19446886 gttgatgtaacactatggaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgaagtcaatgacaacccaa 19446985  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19446986 atatatgtaacaattgttcaggttcgaggct 19447016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 3027101 - 3027331
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  3027101 aaaaggtattattttatattttggcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtattttcttatgtagtgggaatata 3027200  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3027201 gttgatgtaacactatgaggaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 3027300  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3027301 atatatgtaacaattggttaggttcgaggct 3027331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 2193429 - 2193657
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  2193429 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccaaaaaatgtcttttcttatgtagtgggaatata 2193528  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2193529 gctgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcgtttaccatctatttaccttaagttccttccttccattttgtagtcaatggcaacccaa 2193628  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2193629 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 2193657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 27064544 - 27064774
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27064544 aaaagttattattttatattgtgtcagcattagatgataggattttgtataagtttgataatgacccggaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 27064643  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27064644 gctgatgtaacactatggaaaaaatactccgtagctttaccatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 27064743  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064744 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 27064774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26322651 - 26322422
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26322651 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 26322552  T
Q  227 gttgatgtaacactatgag-aaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  26322551 gttgatgtaacactatgggaaaaaatactccgtaactttatcatttactatctatttaccttgagttcctttcttgcattttgtagtcaatggcaaccca 26322452  T
Q  326 aatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26322451 aatatatgtaacaattggtgaggttcgagg 26322422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33612717 - 33612488
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33612717 aaaatgtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgaataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 33612618  T
Q  227 gttgatgtaacactat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33612617 gttgatgtaacactatggaaaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagtttcttgcttccattttgtagtcaatggcaaccca 33612518  T
Q  326 aatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  33612517 aatatatataacaattggtaaggttcgagg 33612488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 20348628 - 20348843
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20348628 aaaagatattattttctattttgccagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgagaatata 20348727  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  20348728 tttgatgtaacactatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 20348827  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  20348828 atatatgtaacaattg 20348843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 358
Target Start/End: Original strand, 21028850 - 21029081
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  21028850 aaaaggaattattttctattttatcaacatcatatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgttttttcttatgtagtgggaatata 21028949  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21028950 gttgatgtaacactatgggaaaaataatatgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 21029049  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggctc 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21029050 atatatgtaacaattggtcaggttcaaggctc 21029081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35541418 - 35541207
Alignment:
Q  146 tttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgag 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||      
T  35541418 tttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgga 35541319  T
Q  246 aaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatc 345  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  35541318 aaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttatcttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattagtc 35541219  T
Q  346 aggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||    
T  35541218 aggttcgaggct 35541207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 4880927 - 4881157
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  4880927 aaaaggtattattttctattttgtcaccatcagatgataagattttgtataagtttgataataacccgaaagatatctttccttatgtaataagaatata 4881026  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||    
T  4881027 gttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagttatatcatttaccatctatttaccttgagttctttgctttcattttgtagtcaatgataacccaa 4881126  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4881127 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 4881157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3152188 - 3151951
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaa-------gatgtctttccttatgcagtga 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||| ||||     
T  3152188 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcaaatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaacccgaaagatgtctttccttatgtagtgg 3152089  T
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  3152088 gaatatagttgatgtaacactatggaaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttctattttgtagtcaatgac 3151989  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3151988 aatccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 3151951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1853493 - 1853265
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1853493 aaaagatattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattgtgtataagtttgataatgacccgaaatatgtctttccttatgcagtgggaatata 1853394  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  1853393 gttgatgtaacattatg-ggaaaatacttcgtagctttatcatttatcgtctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaa 1853295  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  1853294 atat-tgtaacaattggtcatcttcgaggct 1853265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3398910 - 3398679
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||  ||||||    
T  3398910 aaaagatattattttatattttgtcagcatcagatgataggattttgtttaagtttgataatgacccgaaagatgtatttccttatgttgtgtaaatata 3398811  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||    
T  3398810 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccttctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaacgacaatccaa 3398711  T
Q  327 atatatgtaacaa-ttgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3398710 atatatgtaacaatttggtcaggttcgaggct 3398679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 225
Target Start/End: Original strand, 9701457 - 9701642
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9701457 agaaatcatcgggtttcttcatgagattgtcaagccaacgccaattgggacgggaaagaaatcgtgtacaaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 9701556  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatat 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9701557 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca-tgagaatat 9701642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 7284337 - 7284547
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||                  |||    
T  7284337 aaaaggtaatattttctattttgtcaacatcggatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctt------------------ata 7284418  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  7284419 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtaaatggcaacccaa 7284518  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7284519 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 7284547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18039808 - 18039615
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18039808 agaaatcatcaggcttctttaggagattgtcaagacaacatcaattgggactggaaagaaaccgtgtatgaacattgtgttgaaagataaaaagtattat 18039709  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18039708 tttttaatttgtcaacatcagatggtaagattttgtataagtttgat------ttgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 18039615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 37463135 - 37463272
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  37463135 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttatcttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 37463234  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37463235 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 37463272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18037476 - 18037361
Alignment:
Q  234 taacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||         |||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  18037476 taacactatgggaaaaatacttcgtagttttatcatttatcatctatttacctg--------tgcttctattttatagtcaatgacaacccaaatatatg 18037385  T
Q  334 taacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18037384 taacaattggtcaagttcgaggct 18037361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39797992 - 39797679
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797992 agaaatcatcgggctgcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 39797893  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797892 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 39797793  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39797792 ctatgggaaaaatacttcgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 39797698  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  39797697 attggtcaggttcgaggct 39797679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5253904 - 5253591
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253904 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacatcaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 5253805  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253804 tttttaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 5253705  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5253704 ctatgggaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaaca 5253610  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5253609 attggtcaggttcgaggct 5253591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 43 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54794617 - 54794303
Alignment:
Q  43 atcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54794617 atcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaaaataaaaggtattattttc 54794518  T
Q  143 taatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactat 242  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  54794517 taatttgttagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtatttccctatgtagtgggaatatggtagatgtaacactat 54794418  T
Q  243 gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattg 342  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54794417 gtgaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattg 54794318  T
Q  343 atcaggttcgaggct 357  Q
     ||||||| ||||||    
T  54794317 gtcaggtttgaggct 54794303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11952944 - 11952626
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11952944 agaaatcatcgggcttctacatgtgattgtcaagacaatgccaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 11952845  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11952844 tttctaatttgtcagcttaagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 11952745  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11952744 ctatggaaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaaccgaaatatatgtaaca 11952645  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  11952644 attggttaggttcgaggct 11952626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40828591 - 40828278
Alignment:
Q  43 atcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttc 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40828591 atcatcggccttcttcaagagattgtcaagacaatgtcaattgggactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttc 40828492  T
Q  143 taattt-gtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacacta 241  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40828491 taattttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacacta 40828392  T
Q  242 tgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaatt 341  Q
       |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  40828391 caggaaaaatattccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaatt 40828292  T
Q  342 gatcaggttcgagg 355  Q
    | ||||||||||||    
T  40828291 ggtcaggttcgagg 40828278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 354
Target Start/End: Original strand, 8241298 - 8241609
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8241298 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacacctattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattag 8241397  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
         ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  8241398 a----aaaatgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtagca 8241493  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8241494 ttatgagaaaaatactttgtagctttatcatttaccatctatttactttgagttctttgctaccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 8241593  T
Q  339 attgatcaggttcgag 354  Q
    |||| |||||||||||    
T  8241594 attggtcaggttcgag 8241609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Original strand, 16494469 - 16494785
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16494469 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaaaataaaaggtattat 16494568  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | | ||| ||||    
T  16494569 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatggctaatgcaaca 16494668  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16494669 ctatgggaaaaatacttcgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaacggcaacccaaatatatgtaaca 16494768  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  16494769 attagtcaggtttgagg 16494785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 35435564 - 35435882
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35435564 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcatgacactgccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 35435663  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35435664 tttctaatttttcaggatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatagttgatgtaaca 35435763  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
     ||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35435764 ttatggaaaaaatacttcgtggctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 35435863  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  35435864 atttgtcaggttcgaggct 35435882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 39 - 342
Target Start/End: Original strand, 22476307 - 22476604
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22476307 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccaattgg-actagaaagaaactgtttacgaacatagtgttgaaagataaaaggtattat 22476405  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22476406 tttctaatttgtcagcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgatttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 22476505  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22476506 ctatgggaaaaatattctgtagct-----atttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaaca 22476600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12169602 - 12169285
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12169602 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaccgccaattgggactagaaagaaaccgtgtacgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 12169503  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  12169502 tttctaatttttcaggatcagatgatataattttatataagtttgataatgacatgaaagaagtatttacttatacagtgggcatatggttgatgtaaca 12169403  T
Q  239 ctat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaac 337  Q
    |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  12169402 ctatagaaaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttctattttgtattcaatgacaacccaaatatatgtaac 12169303  T
Q  338 aattgatcaggttcgagg 355  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12169302 aattggtcaggttcgagg 12169285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6105693 - 6105463
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6105693 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 6105594  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6105593 gttgatgtaacactttgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 6105494  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6105493 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 6105463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 127 - 358
Target Start/End: Original strand, 16340350 - 16340581
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16340350 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtccttccttatgtagtgggaatata 16340449  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  16340450 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaaccaaa 16340549  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggctc 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16340550 atatatgtaacaattggtcaggtttgaggctc 16340581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 125 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35089416 - 35089186
Alignment:
Q  125 ataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaata 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  35089416 ataaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaata 35089317  T
Q  225 tagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacct 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |     
T  35089316 tagttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaatcc 35089217  T
Q  325 aaatatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35089216 aaatatatgtaacaattggtcaggttcgagg 35089186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31370596 - 31370368
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  31370596 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttctttatgtagtgggaatata 31370497  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31370496 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtacctttatcatttaccatctatttaccttaagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 31370397  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31370396 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 31370368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36169123 - 36168807
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36169123 agaaatcattggacttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgagactagaaagaaactgtttacgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 36169024  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  36169023 tttctaatttgtcaggatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacatatgtagtgggaatatggttgatgtaaca 36168924  T
Q  239 ctatg-----agaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatg 333  Q
    |||||     | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  36168923 ctatggaaaaaaaaaaaaacttcgtagcttgattatttaccatctatatacattgagttatttgcttccattttgt-gtcaatgtaaacccaaatatatg 36168825  T
Q  334 taacaattgatcaggttc 351  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  36168824 taacaattggtcaggttc 36168807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52842101 - 52841871
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  52842101 aaaagatattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatatctttccttatgtagtgggaatata 52842002  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  52842001 gttgatgtaacactatggaaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaattgcaaccaaa 52841902  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52841901 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 52841871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52463588 - 52463389
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52463588 agaagtcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 52463489  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52463488 tttcttatttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttggtaatgacctgaaagatgtctttctttatgcagtgggaatatagttgatgtaaca 52463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 131 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21701133 - 21700907
Alignment:
Q  131 ggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  21701133 ggtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacgcgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatataattg 21701034  T
Q  231 atgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatat 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21701033 atgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctttttactttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatat 21700934  T
Q  331 atgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21700933 atgtaacaattggtcaggttcaaggct 21700907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 127 - 354
Target Start/End: Original strand, 48975359 - 48975586
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||     
T  48975359 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtttttccttatgtagtgggaatatg 48975458  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  48975459 gttgatgtaacactatggaaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 48975558  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgag 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48975559 atatatgtaacaattggtcaggttcgag 48975586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50772774 - 50772559
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50772774 aaaagatattattttccattttgccaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 50772675  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  50772674 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgtgttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 50772575  T
Q  327 atatatgtaacaattg 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  50772574 atatatgtaacaattg 50772559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18742367 - 18742137
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  18742367 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtggaaatatg 18742268  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||    
T  18742267 gttgatgtaacactatgagaaaaatactctgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttggttccattttgtagtcaatgacaacacaa 18742168  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18742167 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 18742137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54649089 - 54648859
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  54649089 aaaagatattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccgtatgtagtgggaatata 54648990  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  54648989 gttggtgtaacactatggaaaaaatacttcatagctttatcatttaccatctatttagcttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 54648890  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54648889 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 54648859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52855020 - 52854790
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52855020 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcatatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaatatgtctttccttatgtagtgggaatata 52854921  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  52854920 gttgatgtaacactatgggaaaaatattccgtagctttatcatttaccatttatttaccttgatttctttgcttccattttgtagtcaatggaaacccaa 52854821  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52854820 atttatgtaacaattggtcaggtttgaggct 52854790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17911329 - 17911100
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17911329 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcagatgattgaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtaat-agaatata 17911231  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  17911230 gtagatgttacattatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatataccttgagttctttgcttccgttttgtagtcaatgacaacccaa 17911131  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17911130 ataaatgtaacaattggtcaggttcgaggct 17911100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 23192208 - 23192438
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  23192208 aaaatgtattattttctattttgtcagcatcagatgatatgattttatataagtttagtaatgacccgaaatatgtttttccttatgtagtgggaatata 23192307  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  23192308 gttgatgtaacattatgggaaaagtactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggaaacccaa 23192407  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23192408 atatatgtaacaattgatcaagttcgaggct 23192438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 50740079 - 50740295
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50740079 aaaagatattattttccattttgccaacatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatata 50740178  T
Q  227 gttgatgtaacactat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaaccta 325  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  50740179 gttgatgtaacaccatggaaaaaaatacttcgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatggcaaccca 50740278  T
Q  326 aatatatgtaacaattg 342  Q
    |||||||||||||||||    
T  50740279 aatatatgtaacaattg 50740295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 357
Target Start/End: Original strand, 49111759 - 49111979
Alignment:
Q  132 gtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttga 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49111759 gtattattttctattttgtcaattttagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttga 49111858  T
Q  232 tgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatata 331  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     |||||||    
T  49111859 tgtgacactatgggaaaaatacttcgtagctttatcatttactatctatttaccttgagttctttgcatccattttgtagtcaatggc-----aaatata 49111953  T
Q  332 tgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49111954 tgtaacaattggtcaggtttgaggct 49111979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55296376 - 55296220
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55296376 agaaatcaccgggcttcttcatgagattgtcaagacaataccaattgggactagaaaaaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 55296277  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctga 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55296276 tttctaatttgtcaacataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctga 55296220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 133 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2846323 - 2846096
Alignment:
Q  133 tattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgat 232  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  2846323 tattattttctatttag-cagcatcagatgatagaattttgtatacatttaataatgacctgaaagatgtctttccttatgcaccgggaatatagttgat 2846225  T
Q  233 gtaacactatgagaaaaa----tactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaat 328  Q
    ||||||||||| ||||||    ||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||    
T  2846224 gtaacactatgggaaaaaggcatactttgtggctttattatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagttaatggcagcccaaat 2846125  T
Q  329 atatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2846124 atatgtaacaattggtcaggttcgaggct 2846096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 357
Target Start/End: Original strand, 51247115 - 51247277
Alignment:
Q  195 aaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttct 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  51247115 aaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttatcatttaccgtctatttaccttgagttat 51247214  T
Q  295 ttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51247215 ttgcttccattttgtagtcaatggcaatccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 51247277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11327103 - 11326991
Alignment:
Q  245 gaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgat 344  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  11327103 gaaaaatactctgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgaaaacccaaatatatgtaacaattggt 11327004  T
Q  345 caggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||    
T  11327003 caggttcgaggct 11326991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 55296222 - 55296128
Alignment:
Q  263 tgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55296222 tgataatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 55296128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 917468 - 917605
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |    
T  917468 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaatactttgcttctattttgtagtcaatgac 917567  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  917568 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 917605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44074196 - 44074059
Alignment:
Q  220 gaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  44074196 gaatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtacctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgac 44074097  T
Q  320 aacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44074096 aacgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggct 44074059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11327407 - 11327299
Alignment:
Q  132 gtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttga 231  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  11327407 gtattattttctattttgtcagcatcagatgataggattttgtataagttttataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagttggaatatagttga 11327308  T
Q  232 tgtaacact 240  Q
    |||||||||    
T  11327307 tgtaacact 11327299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20040 - 19722
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20040 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 19941  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19940 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 19841  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19840 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 19741  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19740 attggtcaggttcgaggct 19722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Original strand, 59206 - 59522
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  59206 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaatgtattat 59305  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  59306 tttttaatttgtcagcatcagatgataggattttgtgtaagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtggtgggaatatagttgatgtaaca 59405  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
     |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  59406 ttatgggaaaaatagtctgtagctttatcatttaccatctatttaccttaagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatataaaaca 59505  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||| ||||||||||||    
T  59506 attggtcaggttcgagg 59522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 357
Target Start/End: Original strand, 118662 - 118948
Alignment:
Q  71 agacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaatt 170  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||    
T  118662 agacaacgccatttgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaatgtattattttttaatttgtaagcatcagatgataggatt 118761  T
Q  171 ttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatt 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| || |||    
T  118762 ttgtgtaagtttgataatgacctgaaagatgtcattccttatgcagtgggaatatagttgatgtaacattatgggaaaaatagtatgtagctttattatt 118861  T
Q  271 taccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  118862 taccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatgacaacccaaatatataaaacaattggtcaggttcgaggct 118948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14512 - 14195
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14512 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgttaagacaatgccaattgggactagaaagaaattgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 14413  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14412 tttctaatatttcaggatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatataaca 14313  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14312 ctatgagaaaaatattccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttctattttgtagtcaatgacaacccaaata-atgtaaca 14214  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  14213 attggttaggttcgaggct 14195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 153834 - 153518
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  153834 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacgtcaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaaaataaaaggtattat 153735  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | | ||| ||||    
T  153734 tttctaatttgtcagcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatggctaatgcaaca 153635  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  153634 ctatgggaaaaatacttcgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaacggcaacccaaatatatgtaaca 153535  T
Q  339 attgatcaggttcgagg 355  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  153534 attagtcaggtttgagg 153518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 66294 - 65981
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  66294 agaaatcattgtggttcttcataagattgtcaagacaacaccaatggagactggaaagacaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaagtattat 66195  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66194 tttctaatttgtcagcatcatatgatagaattttatataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 66095  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    | |||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  66094 caatggaaaaaatacttcgtagctttattatttaccatctatttaccttgagttctatgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaaca 65995  T
Q  339 attgatcaggttcg 352  Q
    |||| |||||||||    
T  65994 attggtcaggttcg 65981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 12396 - 12714
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12396 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagataattacaattggaactagaaagaaattgtgtacgaatattgtgttgaaagataaaaggtattat 12495  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12496 tttcttatttgtcagcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgaagtgagaatatagttgatgtaaca 12595  T
Q  239 ctatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaaca 338  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12596 ctatgggaaaaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttacttccattttgtagtcaatgacaacctaaatatatgtaaca 12695  T
Q  339 attgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12696 attggtcaggttcgaggct 12714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 45 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5914 - 5602
Alignment:
Q  45 catcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttcta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5914 catcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccgattgagactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaacgtattattttcta 5815  T
Q  145 atttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatga 244  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  5814 atttgtcagcataagatgacaggattttatataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgttgtaacactatcg 5715  T
Q  245 gaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgat 344  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5714 gaaaaatattccgtagctttatcttttaccatctctttaccttgagttatttgcttccatttggtagtgaatggcaacccaaatatatgtaacaattggt 5615  T
Q  345 caggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||    
T  5614 caggttcgaggct 5602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 45 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12363 - 12051
Alignment:
Q  45 catcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattattttcta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12363 catcgggcttcttcatgagattgtcaagacaatgccgattgagactagaaagaaactgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaacgtattattttcta 12264  T
Q  145 atttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatga 244  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  12263 atttgtcagcataagatgacaggattttatataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgttgtaacactatcg 12164  T
Q  245 gaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaacaattgat 344  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12163 gaaaaatattccgtagctttatcttttaccatctctttaccttgagttatttgcttccatttggtagtgaatggcaacccaaatatatgtaacaattggt 12064  T
Q  345 caggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||    
T  12063 caggttcgaggct 12051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 354
Target Start/End: Original strand, 48655 - 48971
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48655 agaaatcatcgggcttctgcatgagattgtcaagacactgccaattgggactagaaagaaaccgtgtatgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 48754  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  48755 tttctaatttttcaagatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaatgatgtatttacttatacagtgggcatatggttgatgtaaca 48854  T
Q  239 ctat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaac 337  Q
    |||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48855 ctatggaaaaaagtacttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttctattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaac 48954  T
Q  338 aattgatcaggttcgag 354  Q
    ||||| |||||||||||    
T  48955 aattggtcaggttcgag 48971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 354
Target Start/End: Original strand, 64040 - 64356
Alignment:
Q  39 agaaatcatcgggcttcttcatgagattgtcaagacaacaccaattgggactggaaagaaaccgtgtacgaacattgtgttgaaagataaaaggtattat 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  64040 agaaatcatcgggcttctgcatgagattgtcaagacactgccaattgggactagaaagaaaccgtgtatgaacattgttttgaaagataaaaggtattat 64139  T
Q  139 tttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaaca 238  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  64140 tttctaatttttcaagatcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaatgatgtatttacttatacagtgggcatatggttgatgtaaca 64239  T
Q  239 ctat-gagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaaatatatgtaac 337  Q
    |||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  64240 ctatggaaaaaagtacttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttctattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaac 64339  T
Q  338 aattgatcaggttcgag 354  Q
    ||||| |||||||||||    
T  64340 aattggtcaggttcgag 64356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Original strand, 8605 - 8833
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8605 aaaaggtattattttctattttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 8704  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8705 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaa 8804  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8805 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 8833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27938 - 27710
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27938 aaaaggtattattttctattttgtgaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatata 27839  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  27838 gttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttacttccattttgtagtcaatgacaacccaa 27739  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgagg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27738 atatatgtaacaattggtcaggttcgagg 27710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1884
Description:

Target: scaffold1884; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 127 - 357
Target Start/End: Original strand, 506 - 736
Alignment:
Q  127 aaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatata 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  506 aaaaggtattattttctattttgtcagcatcaaatgatagaattttatataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgttgtgggaatata 605  T
Q  227 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacctaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  606 gttgatgtaacactatgggaaaaatactacgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaa 705  T
Q  327 atatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  706 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 125 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16911 - 16679
Alignment:
Q  125 ataaaaggtattattttctaatttgtcaacatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaata 224  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16911 ataaaatgtattattttctattttgtcagcattagacgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttctttatgtagtgggaata 16812  T
Q  225 tagttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacct 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  16811 tagttgatgtaacactatgggaaaaatactctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaacggcaatcc 16712  T
Q  325 aaatatatgtaacaattgatcaggttcgaggct 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16711 aaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 16679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University