View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11603_low_1 (Length: 662)

Name: NF11603_low_1
Description: NF11603
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11603_low_1
NF11603_low_1
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (19-651)||(16657309-16657941)
chr2 (20-648)||(16661787-16662415)
chr2 (101-651)||(43625238-43625788)
chr2 (120-649)||(7542071-7542600)
chr2 (101-651)||(12234515-12235065)
chr2 (101-651)||(14703234-14703784)
chr2 (101-549)||(12258475-12258923)
chr2 (26-651)||(12245198-12245823)
chr2 (103-651)||(11999235-11999770)
chr2 (510-651)||(17716485-17716626)
chr2 (443-473)||(17704013-17704043)
chr2 (443-480)||(273279-273316)
chr2 (437-473)||(17648005-17648041)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (23-652)||(8659111-8659740)
chr7 (19-651)||(10494166-10494798)
chr7 (19-642)||(8654194-8654817)
chr7 (23-648)||(1301208-1301837)
chr7 (86-651)||(13333248-13333813)
chr7 (20-651)||(8667164-8667795)
chr7 (101-648)||(8585501-8586048)
chr7 (22-633)||(27830685-27831296)
chr7 (101-648)||(17260067-17260614)
chr7 (101-649)||(17267765-17268313)
chr7 (102-651)||(8646704-8647253)
chr7 (94-651)||(3147083-3147648)
chr7 (101-648)||(6789338-6789885)
chr7 (352-648)||(8628609-8628905)
chr7 (467-651)||(8671422-8671606)
chr7 (332-651)||(8636135-8636454)
chr7 (112-651)||(8570148-8570687)
chr7 (242-483)||(8545600-8545841)
chr7 (242-651)||(29581633-29582042)
chr7 (242-635)||(8576293-8576686)
chr7 (338-651)||(8602037-8602350)
chr7 (242-651)||(7877525-7877934)
chr7 (242-633)||(29577479-29577873)
chr7 (242-636)||(8609884-8610278)
chr7 (242-642)||(8382677-8383077)
chr7 (242-651)||(8581667-8582076)
chr7 (242-651)||(8590605-8591014)
chr7 (22-627)||(8537783-8538388)
chr7 (237-651)||(39985608-39986022)
chr7 (565-651)||(8640339-8640425)
chr7 (328-650)||(8559386-8559708)
chr7 (524-652)||(8017204-8017332)
chr7 (20-183)||(8616426-8616589)
chr7 (101-168)||(8673896-8673963)
chr7 (509-651)||(8102901-8103043)
chr7 (134-192)||(8664919-8664977)
chr7 (112-192)||(8576163-8576243)
chr7 (137-197)||(8609779-8609839)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (19-652)||(4678349-4678981)
chr1 (139-651)||(34466585-34467089)
chr1 (101-648)||(15594860-15595414)
chr1 (110-191)||(52549264-52549345)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (23-651)||(9335683-9336311)
chr4 (20-636)||(30774997-30775613)
chr4 (100-651)||(35132282-35132824)
chr4 (507-651)||(23587525-23587669)
chr4 (517-652)||(54396665-54396800)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (108-402)||(28219751-28220045)
chr5 (423-651)||(28220099-28220327)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (26-393)||(43744567-43744934)
chr8 (268-651)||(12528497-12528880)
chr8 (423-651)||(43744997-43745223)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (343-651)||(28910650-28910958)
chr6 (510-592)||(11200123-11200205)
chr6 (346-405)||(11133065-11133124)
chr6 (518-592)||(11170813-11170887)
chr6 (518-592)||(11209635-11209709)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 593; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16657941 - 16657309
Alignment:
Q  19 atcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16657941 atcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcacgaagacaattctcaacagtt 16657842  T
Q  119 ttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcta 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16657841 ttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcaa 16657742  T
Q  219 cagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttatt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16657741 cagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttatgtccaccttatt 16657642  T
Q  319 cttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaaca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657641 cttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaaca 16657542  T
Q  419 tcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatac 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16657541 tcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaagac 16657442  T
Q  519 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657441 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 16657342  T
Q  619 gaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657341 gaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 16657309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16662415 - 16661787
Alignment:
Q  20 tcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  | | | ||  ||| ||||||||||||  | | |||| |||||||| | |    
T  16662415 tcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatct 16662316  T
Q  120 tcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctac 219  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||  |||   ||||| |||| | ||| |     
T  16662315 tcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaat 16662216  T
Q  220 agtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc 319  Q
    || |||||| ||    |||||||||||||| || ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| || |||    
T  16662215 agcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttc 16662116  T
Q  320 ttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacat 419  Q
    ||| | | ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||    
T  16662115 ttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacat 16662016  T
Q  420 cacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatacc 519  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  16662015 cacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggcc 16661916  T
Q  520 atatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattg 619  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  16661915 atatgcaatagctgctgcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgtta 16661816  T
Q  620 aagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  16661815 aaataagcaggaacagtgacaactgcatt 16661787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 101 - 651
Target Start/End: Original strand, 43625238 - 43625788
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||  | |    
T  43625238 agacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaataccacgga 43625337  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||   |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||  || ||    
T  43625338 ataaagaatctacctcaatagtgctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttcc 43625437  T
Q  301 acttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtg 400  Q
    | | || ||||| || |||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43625438 aataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtg 43625537  T
Q  401 gcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaat 500  Q
    ||||| ||    || || |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  ||| ||||||    
T  43625538 gctttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaat 43625637  T
Q  501 cacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggc 600  Q
     | ||||||||| ||  || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  43625638 taattctcttgttaaggccgtatgctagagcagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggc 43625737  T
Q  601 ttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  43625738 ttttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcacggtaacaactgcattctt 43625788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 120 - 649
Target Start/End: Original strand, 7542071 - 7542600
Alignment:
Q  120 tcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctac 219  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |     
T  7542071 tcatacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaat 7542170  T
Q  220 agtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc 319  Q
    |||||  |||| |   ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||    
T  7542171 agtggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttc 7542270  T
Q  320 -ttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaaca 418  Q
     |||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |  ||        
T  7542271 tttctcttg-aactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttg 7542369  T
Q  419 tcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatac 518  Q
    |  |||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  7542370 ttgcccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggc 7542469  T
Q  519 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 618  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    |  |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7542470 catatgcaacagctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcatt 7542569  T
Q  619 gaagtaagctggcacagtaacaacagcattc 649  Q
     || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7542570 aaaataagcaggtacagtaacaactgcattc 7542600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 651
Target Start/End: Original strand, 12234515 - 12235065
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||| || | ||    
T  12234515 agacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttcaa 12234614  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    |||||||||||||||| |  || |  |||| |   ||||| | ||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12234615 ataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaagacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttcc 12234714  T
Q  301 acttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagt 399  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| |   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12234715 actcatgtccacttttttctttctattgaa-ctcttgagcaaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgt 12234813  T
Q  400 ggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaa 499  Q
    |||||| || |  || |||| ||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  12234814 ggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaa 12234913  T
Q  500 tcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtgg 599  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||  | ||||| || || |  |  |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  12234914 tcagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgggttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttg 12235013  T
Q  600 cttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  12235014 cttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaactgcattctt 12235065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 651
Target Start/End: Original strand, 14703234 - 14703784
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  14703234 agacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgcattgaa 14703333  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| |||||     ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  14703334 ataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttggatttcc 14703433  T
Q  301 acttatgtccac-cttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagt 399  Q
    ||| |||||||  ||  || |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14703434 actaatgtccaatctgttttttctcttgaa-ctcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagt 14703532  T
Q  400 ggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaa 499  Q
     || || |  |  || ||    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| || ||    
T  14703533 agccttaatttggaagacggtgcccttaattgttaggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataa 14703632  T
Q  500 tcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtgg 599  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |  |  ||||| ||||| |||||  |||||||||| || ||||    
T  14703633 tcagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtgg 14703732  T
Q  600 cttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||  || |||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14703733 cttttctttgagaatcactaaaataagcaggcaccgtaacaactgcattctt 14703784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 12258923 - 12258475
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| || | |     
T  12258923 agacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatcac 12258824  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |  |||| |  | |||| ||||  || ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12258823 ataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttcc 12258724  T
Q  301 acttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagt 399  Q
    |||||| || || || ||||| || ||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  12258723 acttatatctactttgttctttctcttgaa-ctcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgt 12258625  T
Q  400 ggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaa 499  Q
     || || || | ||| |||| | ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  12258624 agccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcgacacaa 12258525  T
Q  500 tcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcatt 549  Q
    | | |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12258524 ttaattcttttgtcaaggccatatgcaaaagctgcagcagtaggttcatt 12258475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 12245823 - 12245198
Alignment:
Q  26 actttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttcatac 125  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| |||  ||   ||| |||||||| |||    | |||| |||||||||| || ||||    
T  12245823 actttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatcatctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttatac 12245724  T
Q  126 actcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagtggt 225  Q
    | ||||| | ||| || | ||| | |||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |     
T  12245723 aatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgc 12245624  T
Q  226 gacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-ctt 324  Q
     |||| |  ||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |  |||| || ||||  || ||||| ||     
T  12245623 aacaacaagaaacgaaagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctc 12245524  T
Q  325 ttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcaccc 424  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |  || |  | | ||    
T  12245523 ttgaa-ctcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatcc 12245425  T
Q  425 ttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatg 524  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||  ||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||    
T  12245424 ttaatagttaggatagaaacgtcaaaagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatg 12245325  T
Q  525 caatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagta 624  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| || |  |  |  ||||| || |||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||    
T  12245324 caacagctgcagcagtgggttcattcattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaata 12245225  T
Q  625 agctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12245224 agcaggtacagtaacaacagcattctt 12245198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 651
Target Start/End: Original strand, 11999235 - 11999770
Alignment:
Q  103 acaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaat 202  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||| | ||| || | ||| | |||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  11999235 acaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaat 11999334  T
Q  203 aaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccac 302  Q
    |||||||||||||| | ||| |  |||| |  ||| || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  11999335 aaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaatgatagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttgaacttccac 11999434  T
Q  303 ttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggc 402  Q
    | || ||||| |  |||||  | |  ||||| | |||||||||             |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||||    
T  11999435 taatatccacttcgttctttatcttgaactcttgtacaaagta-------------ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggc 11999521  T
Q  403 ttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatca 502  Q
     || || |  || ||||   |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||  ||| ||||||||    
T  11999522 cttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccaccgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatca 11999621  T
Q  503 cttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggctt 602  Q
      |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |  |  |  ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11999622 gctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattacccttataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggctt 11999721  T
Q  603 ttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    |||| || |||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11999722 ttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattctt 11999770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17716626 - 17716485
Alignment:
Q  510 tgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctg 609  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||  | || |||||| |||||||| ||||||||||   | || |||| || |||    
T  17716626 tgtcaaaaccataagcaatggctgcagcagtgggctcattaataattctcatgaaattaagaccagcaatagcaccagcatgcttagtagcttgtctctg 17716527  T
Q  610 cgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
     |||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17716526 agaaaaattaaagtaagcagggacagtaacaacggcattctt 17716485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 443 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17704043 - 17704013
Alignment:
Q  443 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17704043 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 17704013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 273316 - 273279
Alignment:
Q  443 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaat 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  273316 acatcaaaagtaccacctccaaggtcaaagaccaaaat 273279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 437 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17648041 - 17648005
Alignment:
Q  437 atagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 473  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17648041 atagagacgtcaaaagtaccaccgccaaggtcaaaga 17648005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 652
Target Start/End: Original strand, 8659111 - 8659740
Alignment:
Q  23 tgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttca 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||  || || || |||||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  8659111 tgcactttgggaatcctagacgaaccacccacaagaacaatatcgtcaatatcactcatctgtatttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttca 8659210  T
Q  123 tacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagt 222  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8659211 tacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacagaagtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagt 8659310  T
Q  223 ggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  8659311 ggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttattcttc 8659410  T
Q  323 ttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcac 422  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||    
T  8659411 tttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagtggcttttacttcaaagacatcac 8659510  T
Q  423 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccata 522  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8659511 ccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtttaccatcacagtcacctctcttgtcaaaaccata 8659610  T
Q  523 tgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8659611 tgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaac 8659710  T
Q  623 taagctggcacagtaacaacagcattcttc 652  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8659711 tatgcaggcactgtaacaacagcattcttc 8659740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10494798 - 10494166
Alignment:
Q  19 atcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagtt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||  ||||||||||| | ||||||| | |||||| |     
T  10494798 atcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaata 10494699  T
Q  119 ttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcta 218  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| |    
T  10494698 ttcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaa 10494599  T
Q  219 cagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttatt 318  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10494598 cggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttatt 10494499  T
Q  319 cttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaaca 418  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  10494498 cttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagaca 10494399  T
Q  419 tcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatac 518  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  10494398 tcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggc 10494299  T
Q  519 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||    
T  10494298 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgtt 10494199  T
Q  619 gaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10494198 gaagtaagccggcacagtaacaacagcattctt 10494166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 642
Target Start/End: Original strand, 8654194 - 8654817
Alignment:
Q  19 atcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagtt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    |||  ||||||||||| | ||||||| | |||||| |     
T  8654194 atcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacgagtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaata 8654293  T
Q  119 ttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcta 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  8654294 ttgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaa 8654393  T
Q  219 cagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttatt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || || || || ||||| |||||    
T  8654394 cagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttatt 8654493  T
Q  319 cttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaaca 418  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  8654494 cttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagaca 8654593  T
Q  419 tcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatac 518  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||  |    
T  8654594 tcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggc 8654693  T
Q  519 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 618  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  8654694 catatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcatt 8654793  T
Q  619 gaagtaagctggcacagtaacaac 642  Q
    |||||| || ||||||||||||||    
T  8654794 gaagtatgccggcacagtaacaac 8654817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 648
Target Start/End: Original strand, 1301208 - 1301837
Alignment:
Q  23 tgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttca 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||   || |||||||| |  |||||| ||||||| |||||      
T  1301208 tgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttg 1301307  T
Q  123 tacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagt 222  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  1301308 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggt 1301407  T
Q  223 ggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttc 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |  | || ||||| |||||||| |||||||||    
T  1301408 ggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttc 1301507  T
Q  323 ttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcac 422  Q
    |||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  1301508 tttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgc 1301607  T
Q  423 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccata 522  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1301608 ccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtcacttctcttgtcaaaaccata 1301707  T
Q  523 tgcaatagctgcagcag----taggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 618  Q
     ||||||||||||||||    |||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1301708 cgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgagaatcatt 1301807  T
Q  619 gaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    ||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  1301808 gaaatgtgcaggcacagtaacaacagcatt 1301837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13333813 - 13333248
Alignment:
Q  86 atctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaa 185  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||| | |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13333813 atctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaa 13333714  T
Q  186 agtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaa 285  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13333713 agtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 13333614  T
Q  286 ggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtga 385  Q
    || | |||| |||||||| || || || |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13333613 ggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtga 13333514  T
Q  386 gtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattcc 485  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  13333513 gtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttc 13333414  T
Q  486 gtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcacc 585  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  13333413 gcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcacc 13333314  T
Q  586 agcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13333313 agcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagccggcacagtaacaacggcattctt 13333248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 651
Target Start/End: Original strand, 8667164 - 8667795
Alignment:
Q  20 tcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    |||  ||||||||||| | ||||||  | |||||  | |    
T  8667164 tcctgcactttgggaatcctagacgagccaccgacaagtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaactatat 8667263  T
Q  120 tcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctac 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||    
T  8667264 tcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttagcacgagtaattgatgaacaaaagtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaac 8667363  T
Q  220 agtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||  ||| |||||||| ||||||    
T  8667364 agtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgactgatgtccactttattc 8667463  T
Q  320 ttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacat 419  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  8667464 ttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacat 8667563  T
Q  420 cacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatacc 519  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  8667564 cacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaaggcc 8667663  T
Q  520 atatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattg 619  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8667664 atatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattg 8667763  T
Q  620 aagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8667764 aagtaagctggcacagtaacaacggcattctt 8667795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 101 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8586048 - 8585501
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |  |||| |     
T  8586048 agacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccctcac 8585949  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    ||||| |||| |  || | ||| ||||| ||    ||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||      
T  8585948 ataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttctt 8585849  T
Q  301 acttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtg 400  Q
    | | || ||||| || |||||  | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||     
T  8585848 agtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggtt 8585749  T
Q  401 gcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaat 500  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  8585748 gctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacagt 8585649  T
Q  501 cacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggc 600  Q
     || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8585648 tacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggc 8585549  T
Q  601 ttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8585548 ttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacagtcacaactgcatt 8585501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 27831296 - 27830685
Alignment:
Q  22 ctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttc 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||   ||| |||||| || |||  ||||||| |||||||||| | |    
T  27831296 ctgcactttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatcttagagtcagtgagacaactctcaacagtctcc 27831197  T
Q  122 atacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||   |||| | |||||||| |||| |||||| | ||||| ||| | ||    
T  27831196 atacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccctcaaataaggcatctatctcaatag 27831097  T
Q  222 tggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt 321  Q
    | ||| ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||    
T  27831096 tagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttcccactaatgtccactcttttctt 27830997  T
Q  322 cttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatca 421  Q
    ||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |  || || | |    
T  27830996 cttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagttgccttaacttggaagacctta 27830897  T
Q  422 cccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccat 521  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  | | |   ||| | ||||||  ||||    
T  27830896 tccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatattttgttcccgtgtcaaggccat 27830797  T
Q  522 atgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaa 621  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | || || || |  ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| || || ||||||||    
T  27830796 atgcaatagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggcttttcgttgagagtcattgaa 27830697  T
Q  622 gtaagctggcac 633  Q
     |||||||||||    
T  27830696 ataagctggcac 27830685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 101 - 648
Target Start/End: Original strand, 17260067 - 17260614
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    ||||| ||||||||| | | ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  |||| ||    
T  17260067 agacacttctcaacaatctccatgcactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaacacccttaa 17260166  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    ||||||  |||||||| ||| |||| ||| | |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  17260167 ataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttccc 17260266  T
Q  301 acttatgtccaccttattc-ttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagt 399  Q
    | | |||||||  || ||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | ||    
T  17260267 aataatgtccaattttttcgttcttttg-atctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggt 17260365  T
Q  400 ggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaa 499  Q
    ||| || || || || || | | |||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     | |||||    
T  17260366 ggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaa 17260465  T
Q  500 tcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattga-taattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtg 598  Q
    | | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |  ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17260466 ttagttctcttgacaaggccatatgcaatagctgcagcaataggttcattaattaacttcaaa-acataaaggccagcaataacaccagcatctatggtg 17260564  T
Q  599 gcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||| ||||    
T  17260565 gcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggaacagtaataacaacatt 17260614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 101 - 649
Target Start/End: Original strand, 17267765 - 17268313
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    ||||| ||||||||| | | ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||| ||    
T  17267765 agacacttctcaacaatctccatgcactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaacacccttaa 17267864  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    ||||||  |||||||| ||| |||| ||| | || ||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  17267865 ataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttccc 17267964  T
Q  301 acttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtg 400  Q
    |   || | ||  || || ||| |||  |  ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | |||    
T  17267965 aacaattttcaatttttttttccttttgatttcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtg 17268064  T
Q  401 gcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaat 500  Q
    || || || || || || | | |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |    
T  17268065 gccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagt 17268164  T
Q  501 cacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggc 600  Q
     | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17268165 tagttctcttgccaaggccatatgcaatagctgcagcagttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggc 17268264  T
Q  601 ttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattc 649  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  17268265 ttttcgctgagaatcgttgaagtaagccgggacagtaatgacagcattc 17268313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 102 - 651
Target Start/End: Original strand, 8646704 - 8647253
Alignment:
Q  102 gacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaa 201  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| ||  |||| || |||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| || | |||    
T  8646704 gacaactctcaacagtttccaaacattcgatgaacagatccatattgattgcgtcaaatttggcacgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaa 8646803  T
Q  202 taaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccca 301  Q
    |||||||||||  || |  ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||    
T  8646804 taaagaatctaattcaatggtggtgcaagaagcaaaagatagtgtcctttttgctctctcgcatgccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttcca 8646903  T
Q  302 cttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtgg 401  Q
     | ||||||||||| |||||||| | ||| || | | |||||| || |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  8646904 gtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtgg 8647003  T
Q  402 cttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatc 501  Q
    |||| || | ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||   || ||||||     
T  8647004 ctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaatt 8647103  T
Q  502 acttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggct 601  Q
      ||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || | || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  8647104 tgttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagcagctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggct 8647203  T
Q  602 tttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  8647204 tttcgctgataatcattgaagtatgcaggcacagtaacaactgcattctt 8647253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 651
Target Start/End: Original strand, 3147083 - 3147648
Alignment:
Q  94 atcaccgagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaatt 193  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |    
T  3147083 atcagcgaaacaactcttaacagtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaat 3147182  T
Q  194 ccctgaaataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||  | ||||||||| ||| | |  ||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3147183 ccctgaaataaagaatctatctcaatggtggtgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttg 3147282  T
Q  294 gattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttcc 393  Q
      ||| |||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||  | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3147283 agttctcactaatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcc 3147382  T
Q  394 ggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccg------t 487  Q
     ||  |||| || || | ||| || | | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| ||      |    
T  3147383 tgcgatggccttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctct 3147482  T
Q  488 ttaccat--cacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcacc 585  Q
      || ||  |||||| | |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |  | |||||||||||||||  ||||    
T  3147483 acacaattacacaattagttctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacacc 3147582  T
Q  586 agcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  3147583 agcatctattgtcgctttccgctgagcatcattgaaataagcaggtacggtaacaactgcattctt 3147648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 648
Target Start/End: Original strand, 6789338 - 6789885
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||   ||||| || |||||||    
T  6789338 agacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaa 6789437  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||| | | |||||||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||    
T  6789438 ataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttcc 6789537  T
Q  301 acttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtg 400  Q
    | | || ||||| || |||||| | | |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||    
T  6789538 agtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtg 6789637  T
Q  401 gcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaat 500  Q
    || || || |  || || | | | || ||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||  ||| |  |||    
T  6789638 gccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaat 6789737  T
Q  501 cacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggc 600  Q
     | ||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6789738 tagttctcttatcaaggccatatgcaagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggc 6789837  T
Q  601 ttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  6789838 tttccgttgagaatcattgaaataagcaggcacagtaataactgcatt 6789885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 352 - 648
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8628905
Alignment:
Q  352 cattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaa 451  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 8628708  T
Q  452 gtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattga 551  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||   || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8628709 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattga 8628808  T
Q  552 taattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  8628809 ttatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 8628905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 8671606 - 8671422
Alignment:
Q  467 tcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacat 566  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  8671606 tcaaagacaaaaatatttcggttaccttcacggtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacat 8671507  T
Q  567 taaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8671506 taagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattctt 8671422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 332 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 8636454 - 8636135
Alignment:
Q  332 tcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattg 431  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  8636454 tcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaacttcaaagacttcacctttaattt 8636355  T
Q  432 taaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagc 531  Q
    | || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  |    | |||| | || |||||| | ||  ||||| |||| |||    
T  8636354 tgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagttacctctcttttgaagtccatacgcaaaagc 8636255  T
Q  532 tgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggc 631  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8636254 tgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggatttacgctgagaatcattgaaataagcgggc 8636155  T
Q  632 acagtaacaacagcattctt 651  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  8636154 acagtaatgactgcattctt 8636135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 651
Target Start/End: Original strand, 8570148 - 8570687
Alignment:
Q  112 aacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatct 211  Q
    |||||||| ||||||||  |  || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| | ||| || ||||    
T  8570148 aacagtttccatacacttttcaaagaggttcatattcatttcctcaaacttggcccgggttattgatgaactgaagtcaattcccttatatatagcatct 8570247  T
Q  212 acctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtcca 311  Q
    | ||| |  ||||   ||  | || | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || |||     
T  8570248 agctcaattgtggcctcagtatcatatgaaagtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcct 8570347  T
Q  312 ccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctc 411  Q
    | || |||||||| |  |||| ||  |||||||   ||| ||||||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||||| || || ||    
T  8570348 cgttgttcttcttcttgaacttcttcacaaagtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttc 8570447  T
Q  412 aaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttg 511  Q
    | |    | | |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || || ||| |  ||||||     
T  8570448 atagttgttatccttaactgtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacaaaattagctctcttt 8570547  T
Q  512 tcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcg 611  Q
    | ||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||| || ||||||||  |||| |||||| | |||||| |||| || |    
T  8570548 tgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtg 8570647  T
Q  612 aatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||    
T  8570648 aatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattctt 8570687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 483
Target Start/End: Original strand, 8545600 - 8545841
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || ||| | || |||||| | |  |||||||  ||||    
T  8545600 agtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaa 8545699  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||||| ||| |||||||| || || ||||| || | |   ||||||||||| |||||    
T  8545700 agtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 8545799  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatatt 483  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8545800 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatt 8545841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 29582042 - 29581633
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| || ||| |||| |||||||| |||||||  || |||||| | |  ||||| |   |||    
T  29582042 agtgtcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaagcttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaa 29581943  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||| || || |||||   |||| |||| | ||| || | |||    
T  29581942 agtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaagaga 29581843  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 541  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||| ||| || ||| || || ||| | ||||||||||||||  || ||||||||     
T  29581842 cacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgttttccaacaaaattacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagcagtt 29581743  T
Q  542 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaa 641  Q
    ||||| ||||| || |  |  ||||| |||||||| ||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |    
T  29581742 ggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaatca 29581643  T
Q  642 cagcattctt 651  Q
    | ||||||||    
T  29581642 ctgcattctt 29581633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 635
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576686
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| || ||| | || | ||| ||    |||||||  ||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaa 8576392  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    |||  | ||||||| ||||||||||||| |  || || |||||||||| |||||||||||| || || || || ||||    ||||| ||| || |||||    
T  8576393 agtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaataga 8576492  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 541  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||| |  |||||| | ||  ||||| |||| |||||| |||||     
T  8576493 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagagctgccgcagtc 8576592  T
Q  542 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacag 635  Q
    ||||||||||| ||  | | |||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  8576593 ggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcaggcacag 8576686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 338 - 651
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602350
Alignment:
Q  338 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaagga 437  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| || || ||||| | || |  ||||||||| || |    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  438 tagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagc 537  Q
     ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||| |  |   || |||||| |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || ||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgc 8602236  T
Q  538 agtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagta 637  Q
    ||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  8602237 agttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagta 8602336  T
Q  638 acaacagcattctt 651  Q
    ||||| ||||||||    
T  8602337 acaactgcattctt 8602350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 7877934 - 7877525
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||   || |    
T  7877934 agtgtccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttccaccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcacta 7877835  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||   |||| | || | ||| || | |||    
T  7877834 aatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagctattacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagaga 7877735  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttacc-atcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 540  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||  || | ||| ||||| || ||   | | | ||||||| | ||  ||||||||||  || ||||||||    
T  7877734 cacatcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttattta-ttctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagt 7877636  T
Q  541 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaaca 640  Q
     |||||||| || || || |  ||||| ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7877635 tggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggcttttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaaca 7877536  T
Q  641 acagcattctt 651  Q
    || ||||||||    
T  7877535 actgcattctt 7877525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 29577873 - 29577479
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||| |||| |||  ||| |||||||| || |||||| | |  ||||| |  ||||    
T  29577873 agtgccctctttgccctctcacaagcagttctcagcttccttaaagcttttgggttcaaactaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaa 29577774  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    ||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||| || | |||    
T  29577773 agtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggcctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagaga 29577674  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgttt---accatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagca 538  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||  || | ||| || ||   | || || ||| || |||||| | ||| ||||||||||  || ||||||    
T  29577673 cacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttcgctttccaacaacaaaattacctctcttttgaattccatatgcaagtgcagcagca 29577574  T
Q  539 gtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcac 633  Q
    || ||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29577573 gttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagctggcac 29577479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 636
Target Start/End: Original strand, 8609884 - 8610278
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || |  |||||||| || ||      || |||| |||  |||||||  ||||    
T  8609884 agtgtcctctttgccctctcacaagcagtcctcaacctcctaagagccctcgagttcccactgatatcttttgaatgcttccttttgaactccttcacaa 8609983  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    |||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || || || || ||| |||     |||||||| || | |||    
T  8609984 agtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtgagaacaga 8610083  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccg-tttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 540  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||| ||| |||||| |  |||||| | || ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  8610084 cacatcgaaagtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttctattttcca-cacaattagctctcttctgaagaccatatgcaagagccgcagccgt 8610182  T
Q  541 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagt 636  Q
     |||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  8610183 tggttcattgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatcattaaaataagcaggcacagt 8610278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 8383077 - 8382677
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || |  ||  |||| |||||||| ||||||   |||| |||| | |  ||||| || ||||    
T  8383077 agtgtcctttttgccctctcgcaagccgttcttaaccttctaagagcctttgggttcccactaatgtccttattatgcttcctcttgaactcgtcaacaa 8382978  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||| |||||||||||| || ||  |||| |||| |  ||||||||| |||| |||    
T  8382977 agtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagacattattcttaattgtgaggagaga 8382878  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagta 541  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  |   ||  ||||| |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || |||||     
T  8382877 cacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaattagctctcttctgaaggccatatgcaagagcagcggcagtt 8382778  T
Q  542 ggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaa 641  Q
    || |||||||| || || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  8382777 ggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcattgaaatatgcaggcacggtaacaa 8382678  T
Q  642 c 642  Q
    |    
T  8382677 c 8382677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 651
Target Start/End: Original strand, 8581667 - 8582076
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttat-tcttcttttgaaactcctctaca 340  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || | |||| ||||||| ||| | || ||| | |||| | |||| ||||| ||||   |||    
T  8581667 agtgtccttttcgctctctcacaagcagtcctcaaccttctaatggcttttggatttccaataatctcctctttatgttttctcttgaa-ctccgacaca 8581765  T
Q  341 aagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatag 440  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||||| || || ||| |  | | |  ||||| ||| || ||||    
T  8581766 aagtgattcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaatag 8581865  T
Q  441 acacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 540  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||| || |||||| |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8581866 acacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagt 8581965  T
Q  541 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaaca 640  Q
     ||||||||||| || || |  ||||| || || |||||  |||| |||||| | |||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||      
T  8581966 cggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatc 8582065  T
Q  641 acagcattctt 651  Q
    || ||||||||    
T  8582066 actgcattctt 8582076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 651
Target Start/End: Original strand, 8590605 - 8591014
Alignment:
Q  242 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 341  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| |   ||||||||  || |    
T  8590605 agtgtccttttagccctctcacaagctgttttcaacctcctaagagcccttgcgttcccacttaaatccactttattcttcctcctaaactccttcacca 8590704  T
Q  342 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 441  Q
    | | ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||| |||||||||||| |||||   |||||| || | ||| || | |||    
T  8590705 aatggtgaaccattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagaga 8590804  T
Q  442 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttacc-atcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagt 540  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  || | ||| ||||| || ||   | |  | |||||| | ||  ||||||||||   | || |||||    
T  8590805 cacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgttactttc-tctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagt 8590903  T
Q  541 aggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaaca 640  Q
     |||||||| || || || |  ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8590904 tggttcattaattatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaaca 8591003  T
Q  641 acagcattctt 651  Q
    || ||||||||    
T  8591004 actgcattctt 8591014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 627
Target Start/End: Original strand, 8537783 - 8538388
Alignment:
Q  22 ctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttc 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  || | ||| |||||| | ||||   | |||| ||| ||||||||||    
T  8537783 ctgcactttgggaatcctagaagagccaccaactagtacaacatcatccatactactactgtccatcttagcatcattaaaacaactcttaacagttttc 8537882  T
Q  122 atacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacag 221  Q
    |||||||  |  || |||||||| || | || |||||||||||| || |||||||||||| | || ||||  |||||| ||| || |||||  || |  |    
T  8537883 atacacttttcaaagaggtccatgttgagttgctcaaacttggcccgagtgattgatgaacagaaatcaacaccctgacatatagcatctatatcaattg 8537982  T
Q  222 tggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt 321  Q
    |||   ||    |  |||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||| || || || ||    
T  8537983 tggcttcagtgtcgtaagaaagcgacctttttgccctctcgcatgcagttctcaacttcctcagagcttttgaatttccactaatgtcaactttgttttt 8538082  T
Q  322 cttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatca 421  Q
    | | |  || || |  ||||| |  |||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||  ||| |    
T  8538083 cctcttcaattcattcacaaaatgattcaccaaccgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccggcagtggccttgactgtaaaggcatta 8538182  T
Q  422 cccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccat 521  Q
      ||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||  || |  |   || |||||| |  |||||| | ||  || |    
T  8538183 ttcttcaatgtaaggagagatacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaacttttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccgt 8538282  T
Q  522 atgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaa 621  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8538283 atgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattgaa 8538382  T
Q  622 gtaagc 627  Q
     |||||    
T  8538383 ataagc 8538388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 651
Target Start/End: Original strand, 39985608 - 39986022
Alignment:
Q  237 aagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcct 335  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||  ||| ||||| || ||||| ||| |    
T  39985608 aagagagagttctcttcgctctttcacaagcagtcctcaacctcctaagagctctggggttgccactgatgtccttcttgttctttctcttgaa-ctctt 39985706  T
Q  336 ctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaag 435  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||| | | |  | | ||| || ||    
T  39985707 gaacaaagtggttcaccattctgttgtcaaaatcctcacctccaagatgggtgtctccggctgtggctttcacctcaaagataccctcttcaatagttag 39985806  T
Q  436 gatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaa-tcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgc 534  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||   |  ||| |||   |  ||| ||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  39985807 caaagagacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatcaagacattcttctctccaacactggttgctt-tcttgtcaagaccataagcaatggcagc 39985905  T
Q  535 agcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcaca 634  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||  | ||||||||  |||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  39985906 agcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatccttggtagcttgacgctgggagtcattaaagtaagcagggaca 39986005  T
Q  635 gtaacaacagcattctt 651  Q
    |||||||||||||||||    
T  39986006 gtaacaacagcattctt 39986022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 565 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 8640425 - 8640339
Alignment:
Q  565 attaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8640425 attaaggccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcattctt 8640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 650
Target Start/End: Original strand, 8559386 - 8559708
Alignment:
Q  328 aaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcaccctta 427  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||| || || ||||| | || |  ||||    
T  8559386 aaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattctta 8559485  T
Q  428 attgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaa 527  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||  |||||||| |  |    | |||||| |  |||||| | ||  ||||||||||    
T  8559486 attgtgagaagagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttgaagtccatatgcaa 8559585  T
Q  528 tagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagc 627  Q
     ||| || ||||| ||||||||||| ||  | |  |||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||| |||  || |||||||| || |||||    
T  8559586 gagcagctgcagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaatcattaaaataagc 8559685  T
Q  628 tggcacagtaacaacagcattct 650  Q
     || || ||||  ||||||||||    
T  8559686 aggtacggtaatcacagcattct 8559708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8017332 - 8017204
Alignment:
Q  524 gcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagt 623  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||  || ||||| || || |||||| |||| |||||  | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  8017332 gcaatagctgcagctgttggctcgttgataattctcaaaacattgagtcctgcaatgacaccggcatcctttgtggcttgacgctgcgaatcattgaagt 8017233  T
Q  624 aagctggcacagtaacaacagcattcttc 652  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8017232 aagctggaactgtaacaacggcattcttc 8017204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 8616426 - 8616589
Alignment:
Q  20 tcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |  ||   | |  ||||| ||||||   | |||| |||||||||| |    
T  8616426 tcctgcactttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttctctatcttagaatcattaaaacaactctcaacagtct 8616525  T
Q  120 tcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaaga 183  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8616526 ttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaaga 8616589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8673963 - 8673896
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacg 168  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8673963 agacaattctcaacagtttccaaacactcgttgaaaagattgatattgatttcctcaaacttggcacg 8673896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 651
Target Start/End: Original strand, 8102901 - 8103043
Alignment:
Q  509 ttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgct 608  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||  || ||||| |  ||||| ||  ||||||||||| | || ||||  ||||    
T  8102901 ttgtcaagaccgtaggcaatagcagcagcagttggctcattaataattctcaaaacatttaaaccagcgataacaccagcatctttagttgcttgacgct 8103000  T
Q  609 gcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  8103001 gagaatcattgaagtaagcagggacagtgacgacggcattctt 8103043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 8664919 - 8664977
Alignment:
Q  134 aaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaat 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  8664919 aaaaggtccatattgatttcctcaaacctcgcacgagttattgatgaacaaaattcaat 8664977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Original strand, 8576163 - 8576243
Alignment:
Q  112 aacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaat 192  Q
    |||||| ||||||||||  |  || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  8576163 aacagtattcatacacttttcaaagaggttcatattcatttcctcaaacttggcccgggttattgaggaacagaagtcaat 8576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 8609779 - 8609839
Alignment:
Q  137 aggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccct 197  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  8609779 aggtccatgttaagttgctcaaacttcgcacgagtgattgatgaacaaaaatcaataccct 8609839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 4678981 - 4678349
Alignment:
Q  19 atcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    | |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  4678981 atcctgcactttgggaatcctcgatgaaccacccacaagaacaacatcatcaatattactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtt 4678882  T
Q  119 ttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcta 218  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  4678881 tccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatctac-tcaa 4678783  T
Q  219 cagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttatt 318  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||  |||  ||| |||||||| |||||    
T  4678782 cagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattatt 4678683  T
Q  319 cttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaaca 418  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  4678682 cttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagaca 4678583  T
Q  419 tcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatac 518  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  4678582 ccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacaatcactttcacttctcttgtcaaaac 4678483  T
Q  519 catatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcatt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  4678482 catatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgttgagaatcatt 4678383  T
Q  619 gaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttc 652  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  4678382 gaagtatgcaggcacagtaacaacgacattcttc 4678349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 139 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 34467089 - 34466585
Alignment:
Q  139 gtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaa 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||| ||| | ||||||||||||  || ||||| | ||||||||         
T  34467089 gtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgacaaaag----- 34466995  T
Q  239 gagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctcta 338  Q
       ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||   |||| |||| | |  ||||||| |     
T  34466994 ---agtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttg 34466898  T
Q  339 caaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggat 438  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  34466897 caaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggag 34466798  T
Q  439 agacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaata-ttccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagc 537  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | | ||| || | |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34466797 agacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttcca-caaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgcagc 34466699  T
Q  538 agtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagta 637  Q
    ||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||| |  || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  34466698 agtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacggtg 34466599  T
Q  638 acaacagcattctt 651  Q
    | ||| ||||||||    
T  34466598 ataactgcattctt 34466585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 648
Target Start/End: Original strand, 15594860 - 15595414
Alignment:
Q  101 agacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaa 200  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || || |||| |||||| || ||||| |||||||||| ||| || |  |||||| | |||||||| || | ||    
T  15594860 agacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgttaa 15594959  T
Q  201 ataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattccc 300  Q
    ||||| |||||||||| |  || ||||||  || ||||||||||  ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15594960 ataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttccc 15595059  T
Q  301 acttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtg 400  Q
    | | || ||||| || |||||| | |  || ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  15595060 agtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtg 15595159  T
Q  401 gcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaat 500  Q
    || || || |  || || |   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||| |    
T  15595160 gccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagt 15595259  T
Q  501 cacttctcttgtcaataccatatgcaatagctg-------cagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatcta 593  Q
     | | ||||||||||  ||||||||||||||||       |||| || ||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15595260 taatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatcta 15595359  T
Q  594 tggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcatt 648  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15595360 tagtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggcacggtaacaactgcatt 15595414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52549345 - 52549264
Alignment:
Q  110 tcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaa 191  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||    
T  52549345 tcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaa 52549264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9336311 - 9335683
Alignment:
Q  23 tgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttca 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||   |||  ||||||||||| | ||||||  | |||||| | ||||    
T  9336311 tgcactttcggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatattactcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattca 9336212  T
Q  123 tacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagt 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  9336211 tacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagt 9336112  T
Q  223 ggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttc 322  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||    | |||||||| |||||||||    
T  9336111 ggtaacaaaagcaaaagacagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattcttc 9336012  T
Q  323 ttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcac 422  Q
    ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||    
T  9336011 ttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcac 9335912  T
Q  423 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccata 522  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||    
T  9335911 ccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatttctcttatcaaggccata 9335812  T
Q  523 tgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaag 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9335811 tgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaag 9335712  T
Q  623 taagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9335711 taagctggcacggtaacaacggcattctt 9335683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 636
Target Start/End: Original strand, 30774997 - 30775613
Alignment:
Q  20 tcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| | |  ||   |||  | ||||||||||   |||||| |||||||||| |    
T  30774997 tcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtct 30775096  T
Q  120 tcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctac 219  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||| ||    
T  30775097 gtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtgattgatgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaac 30775196  T
Q  220 agtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattc 319  Q
    |   |||| |||    || ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || |||    
T  30775197 aaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttc 30775296  T
Q  320 ttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacat 419  Q
    ||| | | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  30775297 ttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacat 30775396  T
Q  420 cacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaatacc 519  Q
    || |  |||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||   || |||||| ||||  ||    
T  30775397 catctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtcc 30775496  T
Q  520 atatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattg 619  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  30775497 atatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattg 30775596  T
Q  620 aagtaagctggcacagt 636  Q
    || ||||| ||||||||    
T  30775597 aaataagcaggcacagt 30775613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 651
Target Start/End: Original strand, 35132282 - 35132824
Alignment:
Q  100 gagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctga 199  Q
    ||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||    
T  35132282 gagacaactctctacggtattcatacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatgccttga 35132381  T
Q  200 aataaagaatctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcc 299  Q
    |||||||||||||| || | | |||  |||| |   ||||| ||||  |||||||||||||  || |||||||||||         |||| ||| |||||    
T  35132382 aataaagaatctacttcaatattggcaacaacaaggaaagaaagtgatctctttgccctctagcaggcagttctcaa---------ggcttttgaattcc 35132472  T
Q  300 cacttatgtccaccttattctt-cttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcag 398  Q
    |||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  35132473 cactaatgtctactttgttctttctcttgaa-ctcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggcag 35132571  T
Q  399 tggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcaca 498  Q
    |||| || || |  || |||| | ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  |||  ||| ||||    
T  35132572 tggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaatattttgttctccagcaca 35132671  T
Q  499 atcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtg 598  Q
    ||||  |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || | ||  |  |||||  | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  35132672 atcagatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtg 35132771  T
Q  599 gcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    |||||||| || |||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35132772 gcttttcgttgagaatcactaaaataagcaggcacagtaacaactgcattctt 35132824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 507 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 23587669 - 23587525
Alignment:
Q  507 tcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcg 606  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||| || |||| |||| |||| |||||| | || ||||  ||    
T  23587669 tcttatcaagaccataagcaatagcagcagcggtaggttcattaataattctcaacacattgagtccagaaatgacaccggcatcttttgtagcttgacg 23587570  T
Q  607 ctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  23587569 ttgtgaatcgttgaagtaagcaggcacagttacaacggcattctt 23587525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 517 - 652
Target Start/End: Original strand, 54396665 - 54396800
Alignment:
Q  517 accatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatca 616  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |  || | ||| |||||||||||| | || ||||  || || ||||||    
T  54396665 accataagcaattgcagcagcagtaggctcattaataatcctcaacacattcaaacccgaaatagcaccagcatctttcgtagcttgacgttgagaatca 54396764  T
Q  617 ttgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttc 652  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  54396765 ttgaaataagcaggaacagtaacaacagcattcttc 54396800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 402
Target Start/End: Original strand, 28219751 - 28220045
Alignment:
Q  108 tctcaacagttttcatacactcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaaga 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| || | |||||||||    
T  28219751 tctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaaataaaga 28219850  T
Q  208 atctacctctacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatg 307  Q
    ||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||  || ||| | |||    
T  28219851 atctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatg 28219950  T
Q  308 tccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggc 402  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  28219951 tccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtggc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 423 - 651
Target Start/End: Original strand, 28220099 - 28220327
Alignment:
Q  423 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtt-taccatcacaatcacttctcttgtcaataccat 521  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||| | ||||  || | | |||| ||||| |  ||||    
T  28220099 cctttattctaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcccatg-cagttagttcttttgtccaatccat 28220197  T
Q  522 atgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaa 621  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  || |  |  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28220198 atgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcattgaa 28220297  T
Q  622 gtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
     ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  28220298 ataagcaggcacagtaataactgcattctt 28220327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 393
Target Start/End: Original strand, 43744567 - 43744934
Alignment:
Q  26 actttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcaccgagacaattctcaacagttttcatac 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |   ||| |||||| | ||||   |||||| |||||||| |||||| ||    
T  43744567 acttttggaatcctagaggagccaccaacaagaacaacatcatgtatagcgctcttgtccatcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaac 43744666  T
Q  126 actcattgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctctacagtggt 225  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || | | || ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  43744667 actcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaagaaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggt 43744766  T
Q  226 gacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttt 325  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||     
T  43744767 gacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttc 43744866  T
Q  326 tgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttcc 393  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43744867 ttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttcc 43744934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 268 - 651
Target Start/End: Original strand, 12528497 - 12528880
Alignment:
Q  268 agttctcaacctcctcaaggctcttggattcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaag 367  Q
    ||||||||| ||||| | |||| |||  |||||| | ||||| || || |||||| | | |||||| |  |||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  12528497 agttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaactttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaag 12528596  T
Q  368 tcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggt 467  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || || || |||| |  ||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12528597 tcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattattctttactgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggt 12528696  T
Q  468 caaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacatt 567  Q
    |||| | ||||||  | |  |   ||  ||||| |  |||||| | ||| |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||    
T  12528697 caaaaataaaaatccttctctcttcaagacaattagctctcttttgaatgccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacatt 12528796  T
Q  568 aaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
     |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  12528797 gaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatcattgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattctt 12528880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 423 - 651
Target Start/End: Original strand, 43744997 - 43745223
Alignment:
Q  423 ccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccata 522  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| | |   |   || | | | ||||||| || | ||||||    
T  43744997 ccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttccagaccata 43745096  T
Q  523 tgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaag 622  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||     
T  43745097 tgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatcta--gtggctttccgctgataatcattgaaa 43745194  T
Q  623 taagctggcacagtaacaacagcattctt 651  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43745195 taagccggcacagtaacaactgcattctt 43745223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 651
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910958
Alignment:
Q  343 gtagttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagac 442  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| || ||||| || || |  || || | | ||| ||||||||||| |||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  443 acatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtag 542  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| ||||  ||| |||| ||||  ||| |||| |||  ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||      
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  543 gttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaac 642  Q
    | |||||||| || || |  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| | | || ||||||||     
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataaccagtcaaagtaacaat 28910949  T
Q  643 agcattctt 651  Q
     ||||||||    
T  28910950 tgcattctt 28910958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 592
Target Start/End: Original strand, 11200123 - 11200205
Alignment:
Q  510 tgtcaataccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatct 592  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11200123 tgtcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11200205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 405
Target Start/End: Original strand, 11133065 - 11133124
Alignment:
Q  346 gttcaccattctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttt 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  11133065 gttcaccattgtgttatcaaagtcttgtcccccgaggtgagtatctccagcagtggcttt 11133124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 518 - 592
Target Start/End: Original strand, 11170813 - 11170887
Alignment:
Q  518 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatct 592  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11170813 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11170887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 518 - 592
Target Start/End: Original strand, 11209635 - 11209709
Alignment:
Q  518 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaaagacattaaggccagcaatggcaccagcatct 592  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11209635 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11209709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University