View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11605_low_1 (Length: 1050)

Name: NF11605_low_1
Description: NF11605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11605_low_1
NF11605_low_1
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (284-1029)||(12257855-12258603)
chr2 (546-1019)||(12234845-12235317)
chr2 (575-1029)||(12244974-12245428)
chr2 (575-1028)||(11999541-11999994)
chr2 (572-1027)||(7542374-7542829)
chr2 (576-1027)||(14703556-14704007)
chr2 (581-1013)||(16661566-16661998)
chr2 (575-1007)||(16657085-16657517)
chr2 (575-1028)||(43625559-43626010)
chr2 (284-480)||(7543242-7543438)
chr2 (269-476)||(14705432-14705639)
chr2 (281-477)||(12244341-12244537)
chr2 (317-478)||(12000300-12000461)
chr2 (280-480)||(12235763-12235963)
chr2 (347-476)||(16656604-16656733)
chr2 (342-473)||(16661065-16661196)
chr2 (276-477)||(43626288-43626489)
chr2 (266-321)||(12000786-12000841)
chr2 (575-618)||(39373417-39373460)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (574-1029)||(35132594-35133047)
chr4 (574-1007)||(9335458-9335891)
chr4 (575-1013)||(30775414-30775852)
chr4 (284-485)||(35133414-35133615)
chr4 (342-477)||(9323063-9323198)
chr4 (342-477)||(9377542-9377677)
chr4 (342-477)||(9335035-9335169)
chr4 (366-477)||(30776085-30776196)
chr4 (979-1028)||(23587705-23587754)
chr4 (799-873)||(54396725-54396799)
chr4 (979-1028)||(23596557-23596606)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (575-1007)||(13333024-13333456)
chr7 (582-1007)||(10493949-10494374)
chr7 (575-1013)||(8585274-8585712)
chr7 (574-1007)||(8667587-8668020)
chr7 (581-1013)||(17268101-17268533)
chr7 (574-1007)||(6789680-6790113)
chr7 (581-1013)||(8628694-8629126)
chr7 (582-1027)||(8654598-8655043)
chr7 (581-1007)||(8659531-8659957)
chr7 (594-945)||(8671217-8671568)
chr7 (581-1013)||(17260403-17260835)
chr7 (575-1029)||(8647023-8647474)
chr7 (582-956)||(3147491-3147865)
chr7 (575-887)||(1301752-1302064)
chr7 (582-1013)||(27830450-27830881)
chr7 (254-476)||(27829256-27829478)
chr7 (284-478)||(17261359-17261553)
chr7 (575-830)||(8545977-8546232)
chr7 (342-477)||(3148339-3148474)
chr7 (260-477)||(6790378-6790595)
chr7 (571-1007)||(8581868-8582304)
chr7 (694-1026)||(8602123-8602455)
chr7 (694-867)||(8590946-8591119)
chr7 (353-441)||(7876844-7876932)
chr7 (571-1026)||(8559482-8559937)
chr7 (284-444)||(8582664-8582824)
chr7 (674-998)||(8636010-8636334)
chr7 (262-441)||(8660248-8660427)
chr7 (342-477)||(8668433-8668568)
chr7 (284-444)||(8572591-8572751)
chr7 (579-1013)||(8538198-8538632)
chr7 (342-476)||(13332149-13332283)
chr7 (346-435)||(8635502-8635591)
chr7 (253-441)||(1302315-1302503)
chr7 (350-441)||(8546679-8546770)
chr7 (342-477)||(8647669-8647804)
chr7 (347-481)||(8591362-8591496)
chr7 (342-476)||(8630197-8630331)
chr7 (284-478)||(17269067-17269261)
chr7 (379-444)||(8568839-8568904)
chr7 (622-832)||(8640164-8640372)
chr7 (694-1026)||(8382563-8382895)
chr7 (727-1007)||(8570479-8570759)
chr7 (342-476)||(8584535-8584669)
chr7 (342-476)||(10493000-10493134)
chr7 (694-867)||(7877420-7877593)
chr7 (284-444)||(8538805-8538965)
chr7 (342-477)||(8655317-8655452)
chr7 (726-1007)||(8576494-8576775)
chr7 (347-441)||(8602738-8602832)
chr7 (901-1007)||(8610085-8610191)
chr7 (694-866)||(29581528-29581700)
chr7 (356-444)||(8577290-8577378)
chr7 (896-1007)||(8545801-8545911)
chr7 (571-618)||(8570868-8570915)
chr7 (346-444)||(8610665-8610763)
chr7 (344-441)||(8104069-8104166)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (576-1029)||(34466362-34466815)
chr1 (574-1028)||(15595181-15595638)
chr1 (575-1007)||(4678126-4678558)
chr1 (253-480)||(34465158-34465385)
chr1 (262-477)||(4677459-4677674)
chr1 (342-444)||(15596060-15596162)
chr1 (585-670)||(52549098-52549183)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (575-932)||(28220194-28220551)
chr5 (342-476)||(42554186-42554320)
chr5 (593-821)||(42555530-42555758)
chr5 (270-477)||(28220915-28221122)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (581-945)||(43745079-43745441)
chr8 (254-444)||(12529869-12530059)
chr8 (281-476)||(43745793-43745985)
chr8 (576-832)||(12528847-12529103)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (581-1013)||(28910744-28911176)
chr6 (407-441)||(28911318-28911352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 284 - 1029
Target Start/End: Original strand, 12257855 - 12258603
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || || |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || ||| |    
T  12257855 ggaattgaccttggcacaacgtattcatgcgttgctgtttggcaggaacaatattgtcgagctgagatcattcacaacgatcaaggaaacagaacaacgc 12257954  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatttaaa 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |     
T  12257955 cttcttgtgttgcttttactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaaccctcaacacactgtctttggtatttctat 12258054  T
Q  484 t-ttttcacttccttttatatacttaatat---tgttttgatatgattaat---gctgaagtgctgaataattgaatgttgagaattacaaatgttaatt 576  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||  |||   ||||||  ||||||||||   |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  12258055 tctttttacttccttt-atatacttgttataattgttttactatgattaataatgctgaagtactgaataatttaat--tgagaattacaaatgttaaat 12258151  T
Q  577 tttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatg 676  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12258152 ttc-cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagtagttcaagatgatataatgttgtggccatttaaagtcactgctggtgtcaatg 12258250  T
Q  677 acaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctga 776  Q
     |||||| |||||||| || |||||||||  ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  12258251 gcaaacccatgattacggtaaagtacaagaatcaagagaagcagctttgtgccgaggaagtatcatctgtggtattgacaaagatgcgagaaattgctga 12258350  T
Q  777 ggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgct 876  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||  |||  ||||| |    
T  12258351 ggcatatttagaatcacccgttaagaatgcagttgttactgtgcctgcatattttagtgattcacaaaggaaagccactatagatgtgggtaatattgtt 12258450  T
Q  877 gggattaatgttgt-aagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattttt 975  Q
    ||  | |||||| | |||| || | |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||  || | || |||||||||    
T  12258451 ggcctgaatgttatgaaga-tattaaatgaacctactgctgcagcttttgcatatggccttgacaaaagaattaattgtgtcgaaaaacggaatattttt 12258549  T
Q  976 gtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaaggat 1029  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12258550 gtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctctactaaccattaaggat 12258603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 546 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12235317 - 12234845
Alignment:
Q  546 aattgaatgttgagaattacaaatgttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttg 645  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12235317 aattgaatgatgaaagttactaatgttaattttt-cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatgtgatgttg 12235219  T
Q  646 tggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatcta 745  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  12235218 tggccattcaaggtcgctgctggtgtcaatgacaaacccatgattattgtcaagtacaagggtcgagagaagcagctatgtcccgaagaagtatcatcta 12235119  T
Q  746 tgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagag 845  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||  |    
T  12235118 tggtactcacaaagatgcgagaaatcgctgaggcatatttacaatttccagttaagaatgcagttgttaccgtgcctgcttatttcaatgattctcaacg 12235019  T
Q  846 aaaagctacgatagatgctggttctattgctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagaga 945  Q
    |||||| || ||||||||||||   ||||||||  | |||||| | || |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12235018 aaaagcaactatagatgctggtgtcattgctggcctcaatgttatgagggtaatgaacgaacccatggcagccgctgttgcatatggtcttgacaagaga 12234919  T
Q  946 gctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaac 1019  Q
     |||||||||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12234918 actgattgtgttggagaacgaaatatttttgtttttgatctcggcggtggcacttttgatgtgtctctcctaac 12234845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 575 - 1029
Target Start/End: Original strand, 12244974 - 12245428
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||  | | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12244974 ttttttcagatgctaagagattaattggtaggaagtttagtgatcctattgttctggatgatgcattattatggccgttcaaggtcactgctggtgtcaa 12245073  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12245074 tgacaaaccaataattactgttaactacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatggtactaacaaagatgcgagaaattgct 12245173  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  12245174 gaggcatatttagaatcaccggtaaagaatgctgttgttactgtacctgcttattttagtgattctcagcgaaaagcaacgatagatgctggctcaattg 12245273  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    ||||  | |||||| | || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  | || |||||    
T  12245274 ctggtctcaatgttatgagggtaatgaatgaacccactgctgcagctgttgcatatggccttgaaaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatttt 12245373  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaaggat 1029  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12245374 tgtgtttgatcttggtggtggcacttttgacgtttctatcctaactattaaggat 12245428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 575 - 1028
Target Start/End: Complemental strand, 11999994 - 11999541
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11999994 ttttttcagatgctaagaggttaattggttggaagtttagtgatcttgttgttcaagatgatggattgttatggccattcaaggtcactgctgatgtcaa 11999895  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  11999894 tgacaaaccaataattactgttaagtacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatggtactaacgaagatgcgagaaattgct 11999795  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||| || || |||||  ||||||| || |||||||| ||| | ||||    
T  11999794 gaggcatatttagaatcaccggtaaagaatgttgttgttactgtaccagcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgccggtgcaattg 11999695  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    |||| || |||||| |||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  | || |||||    
T  11999694 ctggcatcaatgttataagggtaatgaatgaacccactgctgcaactgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatttt 11999595  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagga 1028  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  11999594 agtctttgatcttggcggtggcacttttgatttgtctatactaacaattaagga 11999541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 572 - 1027
Target Start/End: Complemental strand, 7542829 - 7542374
Alignment:
Q  572 taatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgt 671  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  7542829 taatttttgtagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaagatgatatactgttatggccattcaaggtgactgcgggtga 7542730  T
Q  672 caatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaatt 771  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7542729 caatgacagacccatgattaccgttaagtacaaggatcaggagaaacaactccatgctgaagaggtatcatctatggtactcacaaagatgcgagaaatt 7542630  T
Q  772 gctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttcta 871  Q
    |||||| | ||||||||| || | || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||  ||||||| || |||||||| ||| | |    
T  7542629 gctgagtcgtatttagaaacaactgtgacgaatgcagttgttactgtacctgcttattttaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcgggtgcca 7542530  T
Q  872 ttgctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatat 971  Q
    |||||||  | |||||| | || | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||    
T  7542529 ttgctggcctcaatgttatgagggcaatgaatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagcgaaatat 7542430  T
Q  972 ttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagg 1027  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  7542429 ttttgtttttgatcttggcggtggcacttttgatgtgtctttactaacgattaagg 7542374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 576 - 1027
Target Start/End: Complemental strand, 14704007 - 14703556
Alignment:
Q  576 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaat 675  Q
    |||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  14704007 tttttcagatgctaagaggttgttgggaaggaagtttagcgatcctattgttcaagatgatatacttttatggccatttaaggtcactgctggagtcgat 14703908  T
Q  676 gacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctg 775  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  14703907 gacaaacccatgattacggttaagtacaaggatcaggagaagaagctctatgccgaagaagtatcatctatggtactggtgaagatgcgagaaattgctg 14703808  T
Q  776 aggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgc 875  Q
    || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||||  ||||||    
T  14703807 agacatatttagagtcaactgttaagaatgcagttgttacggtgcctgcttattttagtgattctcaaagaaaagccactatggatgctggtgttattgc 14703708  T
Q  876 tgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattttt 975  Q
     ||  | |||||| | || |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || ||||| |||    
T  14703707 cggcctcaatgttatgagggtaatgaatgaacctacagctgcagctattgcatatggccttgacaagagaactgattatggtggagaacgtaatatattt 14703608  T
Q  976 gtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagg 1027  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  14703607 gtctttgatcttggtggtggtacttttgacgtgtctctcctaacaattaagg 14703556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 581 - 1013
Target Start/End: Original strand, 16661566 - 16661998
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16661566 cagatgctaagaggttaattggtaggaaatttagtgaccccgttgttcaaaaagatatactgttgtggccgttcaaggttattgctggtgttaatgacaa 16661665  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 780  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||  | |||||||| |||   ||  |||| |||||     
T  16661666 acctacgattagtgttaagtacaagggtcaggagaagctcctttgtgccgaggaaatctcatctattgtcctcacaaacatgaaggaggttgcagaggct 16661765  T
Q  781 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggga 880  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| || || ||||||||| | ||||||||      
T  16661766 tatttggaatcaccggttaaaaatgcagttgtcactgttcctgcttattttaacgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggcc 16661865  T
Q  881 ttaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtctt 980  Q
    |||| ||||| ||  |||| |||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||| |   ||  | ||||||||||||||    
T  16661866 ttaacgttgtgaggataatcaatgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaaaagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttgtctt 16661965  T
Q  981 cgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16661966 tgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 16661998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 575 - 1007
Target Start/End: Original strand, 16657085 - 16657517
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || ||    
T  16657085 ttttttcagatgctaaaaggttaatcggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaaaatgatatcatcttgtggccattcaaggtcattgccggagtgaa 16657184  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16657185 tgacaaaccaatgattactcttcagtataagggtcaagagagccaattttgtgctgaggaaatatcatctatgatccttacaaagatgcgagaagttgct 16657284  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||||||| | | || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||| ||||||| || |||||||||||| | || |    
T  16657285 gaggcatttatggagtcgcctgtcaagaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccatcg 16657384  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    ||||  |||||||  |  || | || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |    | || ||||||||    
T  16657385 ctggccttaatgtcattcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtcttgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttt 16657484  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16657485 tgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 16657517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 575 - 1028
Target Start/End: Complemental strand, 43626010 - 43625559
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||   | ||  |    
T  43626010 tttttccagatgctaagaggttaatcggtaggaagtttagtgattctgttgttcaaaatgatatcatgttgtggccattcagggtcattg---gggtgga 43625914  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||||||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||     
T  43625913 tgacaaaccaatgattattgtaaaatacaagggtcaagagaagcgtttttgtcctgaggaaatatcgtctatgatcctcacaaagatgcgagaggttgca 43625814  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccg-gttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
    |||  || ||||   || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||| || ||||||| ||||   |||    
T  43625813 gagaaatttttaatgtccccccgtaaagaatgcagttgttaccgtgcctgcttacttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgttggtgtcatt 43625714  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    |  ||  |||||||| || ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||    
T  43625713 gtcggccttaatgttttacgagtaatcaatgaaccaacagctgctgctctagcatacggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattt 43625614  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagga 1028  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  43625613 tcatctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatacttacaattaagga 43625559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 284 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7543438 - 7543242
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7543438 ggaatagaccttggcacaacgtactcttgtgttgcagtatggcaggatcaacactatcgagttgaaatcattcacaacgaccaaggcaacagaacaacac 7543339  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaattt 480  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7543338 cttcttttgttgctttcaccgaaaatcagaggttgatcggtgataatgctaagaatcaagctgcttccaaccctcaaaacactgtctttggtaattt 7543242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14705639 - 14705432
Alignment:
Q  269 gaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaag 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  14705639 gaaggatgtgctgtgggaatagaccttggtacaacgtactcatgtgttgcagtatggcaggaacaacattatcgagttgaaatcattcacaacgatcaag 14705540  T
Q  369 gcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgt 468  Q
    |||| | || ||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  14705539 gcaatagaacaactccttcttttgttgctttcaccgaaaatcagcggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaaccctcgaaacactgt 14705440  T
Q  469 ctttggta 476  Q
    ||||||||    
T  14705439 ctttggta 14705432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 477
Target Start/End: Original strand, 12244341 - 12244537
Alignment:
Q  281 gtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataa 380  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||    
T  12244341 gtgggaatagaccttggtacaacgtattcatgtgttgcagtatggcaggaacaacactctcgtgttgaaatcattcacaacgatcagggcaacagaacaa 12244440  T
Q  381 caccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12244441 caccttcttgtgttgctttcactgaagatcaaaggtttattggtgatgctgctaaaaatcaagctgctgctaactctcaaaacactgtctttggtaa 12244537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 317 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12000461 - 12000300
Alignment:
Q  317 gcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggt 416  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12000461 gcagtgtggctggaacaacactctcgagttgaaatcattcacaacgatcaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactgaaaatcaaaggt 12000362  T
Q  417 tgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 478  Q
    |  ||||||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12000361 ttgttggtgatgctgctaaaaaccaagccgctgccaactctcaaaacactgtttttggtaat 12000300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 280 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12235963 - 12235763
Alignment:
Q  280 tgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaata 379  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||| | || |    
T  12235963 tgtggggatagaccttggtacaacatattcatgtgttgcagtatggcaggaacagcactctcgagttgagatcattcacaacgatcaaggcaatagaaca 12235864  T
Q  380 acaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatt 479  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12235863 accccttcttttgttgctttcaccgaaaatcagaggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgcttccaacccgcaaaacaccgtctttggtaatt 12235764  T
Q  480 t 480  Q
    |    
T  12235763 t 12235763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Original strand, 16656604 - 16656733
Alignment:
Q  347 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcag 446  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  16656604 gagatcatacacaatgaccagggaaacagaacaacaccttcttttgttgctttcactcatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatcaagttg 16656703  T
Q  447 ctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
    | |  ||||| ||||||||  |||||||||    
T  16656704 ccgctaacccacaaaacaccatctttggta 16656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 473
Target Start/End: Original strand, 16661065 - 16661196
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||    
T  16661065 gagttgagattatccacaacgatgaaggcaacaaaattacaccttcttttgttgcttttactgatgctcaaaggttggtcggtggtgctgctaaggatca 16661164  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttg 473  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16661165 agctgctatcaacccacaaaacaccgtctttg 16661196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 43626489 - 43626288
Alignment:
Q  276 gtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaa 375  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||||  ||  || |  |  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  43626489 gtgttgtgggaatagaccttggaacaacgtattcttgtattgctgtgtggcttgatgaaaacagaagagtagagattatccacaatgaccaaggaaacag 43626390  T
Q  376 aataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggt 475  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |   | ||||  |||||||||||||||||    
T  43626389 aactacaccttcttttgtttctttcactaaggaccaaaggttgattggtgatgctgctaagggtcaagctacctccgaccccgaaaacactgtctttggt 43626290  T
Q  476 aa 477  Q
    ||    
T  43626289 aa 43626288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12000841 - 12000786
Alignment:
Q  266 tatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagt 321  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12000841 tatgaaggacttgctgtgggagtagacctcggcacaacatactcttgtgttgcagt 12000786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 39373460 - 39373417
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgat 618  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39373460 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttaatgat 39373417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 574 - 1029
Target Start/End: Complemental strand, 35133047 - 35132594
Alignment:
Q  574 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 673  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  35133047 attttttcagatgctaaaaggttaattggtaggaagtttagtgatcctattgttcaagatgatatactgctatggccattcaaggtcactgccggtgtaa 35132948  T
Q  674 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35132947 atgacaaacccatgattacggttaagtacaaggatgaggaaaagcaactctatgcggaagaagtatcatccatggtactcacaaagatgcgagaaattgc 35132848  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
      ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  35132847 --aggcatatttagaatcaactgttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgctggtgctatt 35132750  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    |||||    |||||| | ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |  |||||||    
T  35132749 gctggtcccaatgttatgagagtaatgaatgaacctactgccgcagcggttgcatatggccttgacaagagatctgattgtgctggagaacaaaatattt 35132650  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaaggat 1029  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35132649 ttgtcttcgatcttggtggtggcacttttgatgtttcaatacttactattaaggat 35132594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 574 - 1007
Target Start/End: Original strand, 9335458 - 9335891
Alignment:
Q  574 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  9335458 atttttgcagatgctaagagattaactggtaggaagtttagtgatctggttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgtta 9335557  T
Q  674 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||| ||||  ||||    
T  9335558 atgacaaacctatgattactgttaactacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatcttctatgttgcttacaaagatgagagaggttgc 9335657  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
     ||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||| || || |||||||||||| |||||    
T  9335658 ggaggcatatttggggtcgccggtcaagaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactatt 9335757  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    |||||  |||||||  |  |  |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |    | || |||||||    
T  9335758 gctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgataagagaaatgactgtgatggtaaccgaaatattt 9335857  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9335858 ttgtctttgatctgggtggcggtacttttgatgt 9335891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 575 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 30775852 - 30775414
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||| ||    
T  30775852 ttttttcagatgctaaaaggttaattggtaggaaatttagcgaccctgttgttcaaaaagatattttgttgtggccattcaaggttgtttctggtgttaa 30775753  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||||||| |  || ||||| || ||| | ||||| ||  | |||||||| ||| |||| |||||     
T  30775752 tgacaaacccatgatttcccttaagttcaagggccaggagaaactcctctgtgccgaggaaatttcatcaatagtcctcacaaatatgagagagattgca 30775653  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    |||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||  | ||| ||||||| || || ||||||||| | ||||    
T  30775652 gagatgtatttggaatccccagttaaaaatgcagttatcactgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattg 30775553  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    ||||  |||||||| | ||| |||| ||||| || || || || ||| |||||||||| ||||| ||||||| |   |||| |   ||| | ||||||||    
T  30775552 ctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttt 30775453  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30775452 tgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 30775414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 284 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35133615 - 35133414
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||    
T  35133615 ggaatagacctcggaacaacgtattcatgtgttgcagtatggcaagaacaacactatcgagtcgaaatcattcacaacgatcaaagcaacaaaacaacac 35133516  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatttaaa 483  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||   | |||||||||| ||||||||||| ||    
T  35133515 cttcttgtattgctttcactaaggatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaattttgaaaacactgtatttggtaatttcaa 35133416  T
Q  484 tt 485  Q
    ||    
T  35133415 tt 35133414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Original strand, 9323063 - 9323198
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9323063 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 9323162  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9323163 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9323198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Original strand, 9377542 - 9377677
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9377542 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 9377641  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9377642 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9377677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Original strand, 9335035 - 9335169
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9335035 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttga-tggtgatgctgctaagaatca 9335133  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9335134 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9335169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 366 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 30776196 - 30776085
Alignment:
Q  366 aaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacac 465  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| | |||| |||||| ||| | || || ||| ||||||||||||||||    
T  30776196 aaggcagcaaaatcacaccttcttttgttgctttcactgatggtcaaaggttggtcggtgctgctgctaaggaccaggctgctatcaaccctcaaaacac 30776097  T
Q  466 tgtctttggtaa 477  Q
    ||||||||||||    
T  30776096 tgtctttggtaa 30776085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 979 - 1028
Target Start/End: Original strand, 23587705 - 23587754
Alignment:
Q  979 ttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagga 1028  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23587705 ttcgatcttggtggtggaacttttgatgtttccctacttactattgagga 23587754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 799 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 54396799 - 54396725
Alignment:
Q  799 aagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  54396799 aagaatgctgttgttactgttcctgcttatttcaatgattctcaacgtcaagctacgaaagatgctggtgctatt 54396725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 979 - 1028
Target Start/End: Original strand, 23596557 - 23596606
Alignment:
Q  979 ttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagga 1028  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  23596557 ttcgatcttggtggtggaacttttgatgtttcacttcttactattgagga 23596606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 575 - 1007
Target Start/End: Original strand, 13333024 - 13333456
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13333024 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatccggttgttcaaaatgatataatgttgtggccattcaaggttacttctggtgtcaa 13333123  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||     
T  13333124 cgacaagcctatgattaccgctaagtgcaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatggtccttacaaagatgcgagaggttgca 13333223  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||||||||| | |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || |||||| |||| || || |||||||||||| ||||||    
T  13333224 gaggcatatatggggtcaccagtcaagaatgccgttgttactgtgccggcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtgctattg 13333323  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    ||||  ||||| |  |  || |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |    |||| ||||||||    
T  13333324 ctggccttaatatcattcgaataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaagcgaaatatttt 13333423  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13333424 tgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgt 13333456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 582 - 1007
Target Start/End: Original strand, 10493949 - 10494374
Alignment:
Q  582 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 681  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10493949 agatgctaagaggttaattggcaggaagtttagtgatccggttgttcaaaacgatataatgttgtggccattcaaggttacttcaggtgtcaatgacaaa 10494048  T
Q  682 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 781  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| | || | ||||||||||||  |||| |||||||    
T  10494049 cctatgattaccgctaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatggtccttataaagatgcgagaggttgcagaggcat 10494148  T
Q  782 atttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggat 881  Q
    |||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  |    
T  10494149 atttggggtcaccagtcaagaatgctgttgttactgtgccggcttacttcaacgattctcaacgaaaggctactattgatgctggtgctattgctggcct 10494248  T
Q  882 taatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttc 981  Q
    ||||||  |  |  |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||      | || ||||||||||||||     
T  10494249 taatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaagtgattgtgagggtaaccgaaatatttttgtcttt 10494348  T
Q  982 gatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10494349 gatctgggtggtggtacttttgatgt 10494374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 575 - 1013
Target Start/End: Original strand, 8585274 - 8585712
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||    
T  8585274 ttttttcagatgccaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcccgttgttcaaaatgatataatgttgtggccattcaaggttatctctggtgttaa 8585373  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaa-attgc 773  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||  |||| |||||    
T  8585374 tgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagaaaagaacctatgtgctgaggaaatatcatctatcatcctcacaaacatg-aagaagattgc 8585472  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
     ||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || || ||||||||| | |||    
T  8585473 agagacatatttgaaatcacctgttcaaaatgcagttgtgactgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccatt 8585572  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    |||||  |||||||| | ||  |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| | || | | |||| |   || || |||||||    
T  8585573 gctggccttaatgttatgaggataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaacgaaatattt 8585672  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8585673 ttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 8585712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 574 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8668020 - 8667587
Alignment:
Q  574 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  8668020 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgaccccgttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgtta 8667921  T
Q  674 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||||||||  ||||    
T  8667920 atgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatcttctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgc 8667821  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
     ||||||||| | |  || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || |||||| |||| || || |||||||||||| |||||    
T  8667820 ggaggcatatctggggtcgccggtcaagaatgccgttgttactgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactatt 8667721  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    |||||  |||||||  |  |  |||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |      || |||||||    
T  8667720 gctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgcggcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgactgtgatggtagccgaaatattt 8667621  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  8667620 ttgtctttgatctgggtggcgggacttttgatgt 8667587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 581 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 17268533 - 17268101
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  17268533 cagatgctaagagactaattggtaggaagtttagtgatcctgtggtccaaaaagatataatgtcgtggccattcaaggtcattgcggatatgaatgacaa 17268434  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 780  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| | |||||| ||  ||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  17268433 accaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaaacacttttgtgcagaggaaatttcgtctatggtactcacaaagatgcgggagattgctgaggaa 17268334  T
Q  781 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggga 880  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| || ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||   ||||||||      
T  17268333 tatctagaatcatcggttatgaatgctgtcattactgtcccggcttacttcaacgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgtcattgctggcc 17268234  T
Q  881 ttaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtctt 980  Q
    |||||||  | |  ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||| || ||||||||||||||    
T  17268233 ttaatgtattgaaggtaatcaatgaaccaactgctgcagctattgcatatggccttggcaagagaactaactgtgttgaagaacggaatatttttgtctt 17268134  T
Q  981 cgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17268133 tgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctct 17268101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 574 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 6790113 - 6789680
Alignment:
Q  574 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 673  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6790113 attttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgattctgttgttcaaaatgatatgatgttttggccattcaaggtcattgctggcgtca 6790014  T
Q  674 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    ||||||| || ||||||   ||| |||| |||||| |||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  6790013 atgacaagcccatgattgttgttgagtataagggtgaggagaagcaactatgtgttgaggaagtttcgtctatgatcctcaccaagatgcgggagattgc 6789914  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
    ||||  ||||||  | |||  | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||| ||  ||||||||||| | |||    
T  6789913 tgagaaatatttgcagtcagagataaaaaatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattctcaacggaaagccactttagatgctggtgccatt 6789814  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    |||||  |||||||| || || |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||  | |  |||    |||||||    
T  6789813 gctggtcttaatgttatacgaataatcaatgaaccaacagctgctgctcttgcatatggccttgataagagaactaattacggtggagaaaaaaatattt 6789714  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  6789713 tcgtcttcgaccttggtggtggcactttcgatgt 6789680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 581 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 8629126 - 8628694
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | ||||||||    
T  8629126 cagatgccaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaaaaggatatcatgttctggccattcaaggttatttctggtcttaatgacaa 8629027  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaa-attgctgaggc 779  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||| |||||||||| || ||  |||| |||  |||| ||||| |||||    
T  8629026 gcctatgattgctgttaagtacaagggtcaagagaagaacctatgtgctgaggaaatatcatctattatccttgcaaatatg-aagaagattgcagaggc 8628928  T
Q  780 atatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggg 879  Q
     |||||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||  |||||||| | ||||||||     
T  8628927 ttatttgaaatcacctgtaaaaaatgcagttgtcaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatgaatgctggtgccattgctggc 8628828  T
Q  880 attaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtct 979  Q
     |||||||| | ||  |||| ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |   |||| |   || || ||||||||||| |    
T  8628827 cttaatgttatgaggataatcaatgaccccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaggtgtgatggtgaacgaaatatttttgtgt 8628728  T
Q  980 tcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8628727 ttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 8628694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 582 - 1027
Target Start/End: Complemental strand, 8655043 - 8654598
Alignment:
Q  582 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  8655043 agatgctaagaggttaattggtaggaagtatagtgatcctattgttcaaaaggatatcatgttgtggccattcatggttacttctggtgttaatgacaaa 8654944  T
Q  682 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 781  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||  | | || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8654943 cccatgattactgttaagtacaaaggtcaagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcatctgcggttcttacaaagatgcgagagattgcagaggcat 8654844  T
Q  782 atttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggat 881  Q
    |  | | |||||| || || ||||  |||||||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||  |    
T  8654843 accttggatcacccgtcaaaaatgtcgttgttactgtgccggcatacttcaatgactctcagcgaaaagcaaccatagatgctggtgccattgctggact 8654744  T
Q  882 taatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttc 981  Q
    ||| ||  |  |  || | |||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||| ||  | | | || |    | || |||||||| || ||     
T  8654743 taacgtcattcggatactcaatgaacctactgccgcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaacggaatattttggtattt 8654644  T
Q  982 gatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagg 1027  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  8654643 gatcttggtggtggtacttttgatgtgtctatactcacaattaagg 8654598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 581 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8659957 - 8659531
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  8659957 cagatgcaaagagattaattggtaggaagtttagtgattcagttgttcaaaaagacatgatgttgtggccattcaaggttatcgctggtgtgaacgacaa 8659858  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 780  Q
    ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  8659857 actcatgattaatgttcagtacaagggtcaggagaagcacttttgtgcggaggaaatatcatctatggtacttacaaaaatgcgagaagttgcagagaca 8659758  T
Q  781 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggga 880  Q
    ||| ||   ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||  || |||||| ||||||| || |||||| | ||| | ||||||||      
T  8659757 tatctaatgtcacctgtgaagaatgctgttgttacagtgcctgcatagttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagattccggtgccattgctggcc 8659658  T
Q  881 ttaatgt-tgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtct 979  Q
    |||||||   | ||| |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |    | |  |||||||| ||||    
T  8659657 ttaatgtcattcaga-taattaatgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaggtgactgtgatggtaaacaaaatattttggtct 8659559  T
Q  980 tcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8659558 ttgatcttggtggtggtacttttgatgt 8659531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 594 - 945
Target Start/End: Original strand, 8671217 - 8671568
Alignment:
Q  594 gttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattacc 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8671217 gttaattggtaggaagtttagtgatccggttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgttaatgacaaacctatgattact 8671316  T
Q  694 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 793  Q
    || |||||| | ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||||||||  |||| ||||||||| | || ||||    
T  8671317 gtcaagtacgaaggtctagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcttctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgcggaggcatatctggagtcac 8671416  T
Q  794 cggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggattaatgttgtaag 893  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||| |||  || || || ||||||||| ||||||||||  |||||||  |  |    
T  8671417 cggtcaagaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaacggccaccattgatgctggtactattgctggacttaatgtcattcg 8671516  T
Q  894 agtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagaga 945  Q
      |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8671517 gataatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagaga 8671568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 581 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 17260835 - 17260403
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  17260835 cagatgctaagagactagttggtaggaagtttagtgatcctgtggtccaaaaagatataatgtcgtggccattcaaggtcattgcggatatgaatgacaa 17260736  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 780  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| | |||||| ||  ||||||| || ||| | || |||||| ||||    |||||||| || |||||||||| |    
T  17260735 accaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaaacacttttgtgcagaggaaatctcgtctatggtacttgtgaagatgcgggagattgctgaggta 17260636  T
Q  781 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggga 880  Q
    ||| | |||||| ||||||  ||||  ||| ||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||      
T  17260635 tatcttgaatcatcggttattaatgttgttattactgttcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgttattgctggcc 17260536  T
Q  881 ttaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtctt 980  Q
    || ||||| | |   |||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  17260535 tttatgttttgaagttaattaatgaacctattgctgcagctattgcatatggccttgtcaagagaactaattgtgtttaagtacggaatatttttgtctt 17260436  T
Q  981 cgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
     || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  17260435 tgaccttggtggggggacttttgatgtgtctct 17260403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 575 - 1029
Target Start/End: Complemental strand, 8647474 - 8647023
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||| ||   | || ||    
T  8647474 tttttccagatgctaagaggttaatcggtaggaagttttttgattctgttgttcagaatgataagaagttgtggccattcaaggtcattg---gggtgaa 8647378  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||     
T  8647377 tgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgttattgtgctgaggaaatatcatcgatgatcctcacaaagatgcgagaggttgca 8647278  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    |||  |||||||   || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  || | |||| ||||||| || |||||||| ||  | ||||    
T  8647277 gagaaatatttaatgtcccctgtaaagaatgcagttgttactgtgcctgcatacttcaatgattatcagcgaaaagccactatagatgccggggccattg 8647178  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    ||||  ||||| |  |  |  |||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||| || ||||| ||    
T  8647177 ctggccttaatatcatccggataatcaatgaaccaacagctgctgctctcgcatatggccttgacaagagaacaaattgtgctgaagaacgaaatatatt 8647078  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaaggat 1029  Q
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  8647077 catcttcgaccttggtggtggaacttttgatgtgtctctccttacaattaaggat 8647023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 582 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 3147865 - 3147491
Alignment:
Q  582 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 681  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |   || || |||||||||    
T  3147865 agatgcaaagaggttaattggtaggaagtttggtgattctgttgttcaaaatgatatgatgttgtggccattcaaggtcatttgcggagtgaatgacaaa 3147766  T
Q  682 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 781  Q
    || |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||  | | ||| ||||  |    
T  3147765 cccatgatttcggttaagtgcaagggacaggagaagcacctatgtgctgaagaaatctcatctatggttctaacaaagatgcgcaagactgcagaggagt 3147666  T
Q  782 atttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggat 881  Q
     ||||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||  |||||||||  |    
T  3147665 ttttagaattgcctgtcaagaatgcagttgttaccgtacctgcttatttcaatgatgctcagcggaaagcgacaatagatgctggtgttattgctggcct 3147566  T
Q  882 taatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgt 956  Q
    |||| || |  |  |||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||| || |||||||    
T  3147565 taatattatgcggataatcaatgaacctactgctgcagctattgcgtatggactggacaagagaactaattgtgt 3147491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 575 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 1302064 - 1301752
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  1302064 ttttttcagatgctaagagattaattggtaggaagtttagtgattcagttgttcaaaaagacatgatgttgtggccattcaaggtcatcgccggtgtgaa 1301965  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    |||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |  || ||| ||||||||||| | || || |||||||||||||||||     
T  1301964 tgacaaacccgtgattgttgttaagtacaagggtcaggagaagcacttttgcgtggaggaaatatcatctatggtccttacgaagatgcgagaaattgca 1301865  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||| ||||| ||   ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||  || |||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||    
T  1301864 gagacatatctaatgtcaccagtgacaaatgctgttgttactgtgcctgcacatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgccggtgcaattg 1301765  T
Q  875 ctgggattaatgt 887  Q
    ||||  |||||||    
T  1301764 ctggccttaatgt 1301752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 582 - 1013
Target Start/End: Original strand, 27830450 - 27830881
Alignment:
Q  582 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | |||||||  ||||||| |||||| |||| | ||| ||| ||  |||||    
T  27830450 agatgctaagaggttaattggtaggaagttcagcgatgatgttgttcaaaaagatataaacttgtggctattcaaagtcattactgatgtaaacaacaaa 27830549  T
Q  682 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 781  Q
    || ||| ||   |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||| | ||||| ||| | || |||||||||||||| || || |||||||    
T  27830550 cccatgtttgttgttaagtacaagagtcaggagaaacacttatgtgcggaggaaatttcatcaatggtccttacaaagatgcgagagatcgcggaggcat 27830649  T
Q  782 atttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggat 881  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||| ||  ||||| | ||| | ||||||||  |    
T  27830650 atttgcaatcaccggttaagaatgcagtaataaccgtgccagcttatttcaatgactctcaacgaaaagccactgtagattccggtgccattgctggcct 27830749  T
Q  882 taatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttc 981  Q
    ||||||| |  |  |||| |  || || || ||||| ||| |||||||||||||||||| | || |  | | |  |  ||| || ||||||||||| ||     
T  27830750 taatgttatgcggataataagcgagcctactgctgcagctattgcatatggccttgacacgggaacaaaatatactggagaacggaatatttttgtgttt 27830849  T
Q  982 gatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27830850 gaccttggtggtgggacttttgatgtgtctct 27830881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 254 - 476
Target Start/End: Original strand, 27829256 - 27829478
Alignment:
Q  254 atggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatca 353  Q
    ||||| ||||||||||||||   |  ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||   | |||| ||||| |    
T  27829256 atggcgaaaaagtatgaagggctttctgtgggaattgacctaggtacaacgtactcgtgcgttgcagcgtggcaggatcaacacaacagagtggagatta 27829355  T
Q  354 ttcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaa 453  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  27829356 ttcacaatgaacaaggcaacaagacaacaccttcttgtgttgctttcacggacaaacagaggttgattggtgatgctgctaagaaccaagctgcttccaa 27829455  T
Q  454 ccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  27829456 ccctcaaaacactatctttggta 27829478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 284 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17261553 - 17261359
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17261553 ggaatagaccttgggacgacatactcttgtgttgccgtatggcatgaagaacatggtagagttgagatcattcacaatgatcaaggaaacaaaattactc 17261454  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 478  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17261453 cttcttttgttgcttttgctaaagatgaaaggttgatcggtgatgccgctaagaatcaagctgccataaacccagaaaacaccgtctttggtaat 17261359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 8546232 - 8545977
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    |||||||  ||||| || |||||||||| || ||||||| | | ||||| ||    
T  8546232 tttttgcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatatagtgattcctttgttcagaatgatctactgttgtggccctttaaggtcatttccggtgttaa 8546133  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgt-gctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    ||||||||| |  |||   || || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||    
T  8546132 tgacaaaccgacaattcttgtgaactacaagggtgaggaaaagca-ctttgttgctgaagaaatatcatctgtgatcctctcacagatgcgagagattgc 8546034  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttattt 830  Q
     ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  8546033 agaggcatttttggagtcacctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttattt 8545977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 3148474 - 3148339
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3148474 gagttgagattattcacaatgaccaaggcaacaaaaccacaccttcttttgttgctttcactgatgatcaaaggttggttggtgatgctgctaagaatca 3148375  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    |||  |    |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3148374 agctcccacaaaccctgaaaacactgtttttggtaa 3148339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6790595 - 6790378
Alignment:
Q  260 aaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcaca 359  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||  ||  ||||     |||||||||| |||||||    
T  6790595 aaaaaatacgaaggatgtgctgtgggaatagacctgggaacaacatattcttgtgttggtgtgtggcttgatgaacacaatagagttgagattattcaca 6790496  T
Q  360 atgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctca 459  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||| ||    
T  6790495 atgaccaaggtaacaaaaccacaccttcttttgttgctttcaccgatgaccaaaggttgatcggtgatgctgctaagtatcaagctgccaccaacccgca 6790396  T
Q  460 aaacactgtctttggtaa 477  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  6790395 aaacactatcttcggtaa 6790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 571 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8582304 - 8581868
Alignment:
Q  571 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 670  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    |||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  8582304 ttaattttttcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatatagtgattccattgttcaaaaggatatcaagttgtggcccttcaaggtcaccgcaggtg 8582205  T
Q  671 tcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaat 770  Q
      ||||||||||| |  ||    || || ||||||||| |||| || ||  ||  |||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||| ||    
T  8582204 ctaatgacaaaccgacaatcgttgtgaactacaagggtaaggaaaaacactttcttgctgaagaaatatcatctgttattctgacacagatgcgagagat 8582105  T
Q  771 tgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttct 870  Q
    ||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  || || ||  ||| ||| || | |||||| |||       
T  8582104 tgcagaggcatttttggagtcacctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaa 8582005  T
Q  871 attgctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaata 970  Q
    ||||| ||  | |||||  |  |  |||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  || | ||||    
T  8582004 attgcaggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaata 8581905  T
Q  971 tttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8581904 tttttatctttgaccttggaggtggaacttttgatgt 8581868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 694 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 8602455 - 8602123
Alignment:
Q  694 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 793  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||  | |||||||| ||| | ||||| ||| | || ||||||||||| |||||||| |||   | | | || ||||    
T  8602455 gttaagtataagggtggggaaaagcacttctgtgctgaggaaatctcatcaatggtccttacaaagatgcgtgaaattgcagagaagtttctggagtcac 8602356  T
Q  794 cggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggattaatgttgtaag 893  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||| ||||||| || | |||||||||| | ||||||||  | |||||  |  |    
T  8602355 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttattttaatgattctcagcgaaaagccacaaaagatgctggtgccattgctggtctcaatgtaatgcg 8602256  T
Q  894 agtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggt 993  Q
      |||| ||||| || || || || ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  | || ||||||||||||    
T  8602255 gataatcaatgagccaactgcagctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaatattttcatatttgatcttggtggt 8602156  T
Q  994 ggtacttttgatgtttctctactaactattaag 1026  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8602155 ggaacttttgatgtttctcttctcacaattaag 8602123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 694 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 8591119 - 8590946
Alignment:
Q  694 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 793  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    | ||| || ||||    
T  8591119 gttaagtacaagggtgaggaaaagcgtctttgtgcggaggaaatctcatccatggttctcacaaagatgcgagagattgctgaaaagtttttggagtcac 8591020  T
Q  794 cggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggt 867  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  8591019 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccagcttattttaatgattctcagaggaaagctaccaaagatgctggt 8590946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 441
Target Start/End: Original strand, 7876844 - 7876932
Alignment:
Q  353 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7876844 attcacaatgaacaaggcaacagaacaacaccttcttttgttgctttcacgaatgatcaaaggttgattggtgatgctgccaaaaatca 7876932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 571 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 8559937 - 8559482
Alignment:
Q  571 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 670  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||    | || |||  |||| || |||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  8559937 ttaatttttgcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatacagtgattccatagtccaaagtgatgtactgttgtggccctttaaggtcatcgctggcg 8559838  T
Q  671 tcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaat 770  Q
      ||||||||||| | | |    || || |||| |||  |||| |||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  8559837 ataatgacaaaccaacggtccttgtgaaatacaggggcaaggaaaagcatcttgttgccgaagaaatatcagctatgattctcacacagatgcgagagat 8559738  T
Q  771 tgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttct 870  Q
    ||| || |||| ||| || ||  ||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| |  || ||||| |||| ||| || | |||||| |||       
T  8559737 tgcagaagcatttttggagtcgacggttgagaatgctgtgattaccgtacctgcttattttaatgattctcaaagaagagccaccaaagatgcaggtgaa 8559638  T
Q  871 attgctgggattaatgttgta-agagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaat 969  Q
    ||||||||  |||||||  |  ||| |||| |||||||| || || || ||| |||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||| | |||    
T  8559637 attgctggtcttaatgtaatgcaga-taatcaatgaaccaactgcagctgctcttgcatatggacttcaaaagagatctaattgtgttaaagagagaaat 8559539  T
Q  970 atttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaag 1026  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8559538 attttcatctttgatctcggtggtggaacttttgatgtttctcttctcacaattaag 8559482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 284 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8582824 - 8582664
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |    || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  8582824 ggaattgaccttggtacaacctactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaacgatcgtgtggaaatcatacacaatgatcaaggaaacaaaacaacac 8582725  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8582724 cttcttgtgttgcttttactaattctcaaagattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 674 - 998
Target Start/End: Original strand, 8636010 - 8636334
Alignment:
Q  674 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    |||||||||| ||||||   || || ||||||||| |  | ||||| |||| | |||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  8636010 atgacaaacccatgattgttgtgaaatacaagggtgaacaaaagcaactttttcctgaggaaatatcgtctatggtcctgacaaagatgcgagagattgc 8636109  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctatt 873  Q
    |||||||||| | |||||| | || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||  || |||||| | ||| | || | |||||||||| | |||    
T  8636110 tgaggcatatctggaatcatctgtcaagaatgcagtcattactgtgcccgcttatttcaatgattctcagcgtaaatccaccaaagatgctggtgccatt 8636209  T
Q  874 gctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattt 973  Q
    || ||  |||||||  |  |  |||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||| | ||||||| | | |||||||||||| | || ||||    
T  8636210 gccggccttaatgtaattcggataatcaatgaaccaactgctgcagcttttgcgtatggacttcaaaagagaggtaactgtgttaaagagagaaacattt 8636309  T
Q  974 ttgtcttcgatcttggtggtggtac 998  Q
    | || || |||||||||||||||||    
T  8636310 tcgtatttgatcttggtggtggtac 8636334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8660427 - 8660248
Alignment:
Q  262 aaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaat 361  Q
    |||||| |||||| ||| | | ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||| |||| | ||    ||||| ||||||||  ||||     
T  8660427 aaagtacgaaggacgtgctattggaatagaccttggaacaacctattcgtgtgttgctgtgtggctggagaatcacaatcgagtcgagatcatctacaac 8660328  T
Q  362 gaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8660327 gaccaaggaaacaaaacaacaccttcatttgttgctttcactgacgatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 8660248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 8668568 - 8668433
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8668568 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaataacaccttcttttgttgctttcaacaatgaacaaaggttgattggcgatgctgctaagaatca 8668469  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8668468 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 8668433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8572751 - 8572591
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||| |    
T  8572751 ggaattgaccttggcacgacttactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaatgatcgtgttgaaatcatacacaatgaccaaggaaacagaacaactc 8572652  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    | |||||||||||||| |||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8572651 cctcttgtgttgcttttactaattctcaaagattgatcggtgatgctgccaaaaatcaagc 8572591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 579 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 8538632 - 8538198
Alignment:
Q  579 tgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgac 678  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || || | |||||||   ||| ||||  ||||| || |||||||||| |||||||| | ||||| ||  |||||     
T  8538632 tgcagatgctaagaggttggttggaagaaaatatagtgattctgttattcagaatgatttactgttgtggcccttcaaggtaaatgctgatgctaatgat 8538533  T
Q  679 aaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgagg 778  Q
    ||||| ||||||  ||| | ||  |||||  | ||||| ||  ||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||  | ||||| |    
T  8538532 aaacccatgattgtcgtgacgtgtaagggggaagagaaacacttttttgctgaagaaatatcagctatggtcctcacaaagatgcgggagttcgctgaag 8538433  T
Q  779 catatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgg 878  Q
     || ||| || ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||  || || ||| ||| ||| || | ||||||||||   ||||||||    
T  8538432 tatttttggagtcacctgtcaaaaatgcagtgattacagtacctgcttatttcaatgattcacagcgaagagccaccaaagatgctggtgtcattgctgg 8538333  T
Q  879 gattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtc 978  Q
      | |||||  |  |  |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | ||  ||||  ||    
T  8538332 cctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctgctcttgcatacggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaaagttttcatc 8538233  T
Q  979 ttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8538232 tttgatcttggtggtggaacttttgatgtatctct 8538198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Original strand, 13332149 - 13332283
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13332149 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaatagaactacaccttcttttgttgctttcaacaatgatcaaagattgattggtgatgctgccaagaatca 13332248  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
    | | ||    |||||| |||||||| |||||||||    
T  13332249 atctgccactaaccctgaaaacactatctttggta 13332283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Original strand, 8635502 - 8635591
Alignment:
Q  346 tgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaa 435  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8635502 tgagatcatccacaatgagcaagggaacagaatcacaccttcttgtgttgctttcactgacgcacaaaggttgattggtgatgctgccaa 8635591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1302503 - 1302315
Alignment:
Q  253 catggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatc 352  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||| |||| | ||     |||| ||||||    
T  1302503 catggcgataaagtacgaaggacgtgctgttggaatagaccttggaactacttattcgtgtgttgctgtgtggctggagaatcacaatagagtagagatc 1302404  T
Q  353 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    ||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1302403 atctacaacgaccaaggcaacaaaacaacaccgtcttttgttgctttcaccgatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 1302315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8546770 - 8546679
Alignment:
Q  350 atcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8546770 atcattcacaatgatcaaggaaacaaaacaacaccttcttgtgttgctttcacaaattcccaaaggctgattggtgatgctgccaaaaatca 8546679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 8647804 - 8647669
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8647804 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaacagaactacaccttcttttgttgctttcaccgatgatcaaaggttgattggtgatgccgctaaaaatca 8647705  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
     || |||   ||||||   |||||||||||||||||    
T  8647704 ggctgcttctaaccctaccaacactgtctttggtaa 8647669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8591496 - 8591362
Alignment:
Q  347 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcag 446  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |    
T  8591496 gagattattcacaatgatcaaggaaatagaattacaccttcttttgttgcttttactaatgatcaaaggttgattggtgatgctgcaaaaaaccaggctg 8591397  T
Q  447 ctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaattta 481  Q
    ||   |||||   |||||||||||| |||||||||    
T  8591396 cttctaacccagcaaacactgtcttcggtaattta 8591362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8630331 - 8630197
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  8630331 gagttgagattattcacaatgatgaaggcaataaaatcacaccttccttcgttgcttttaccgatgatcaaaggttggttggtggtgctgctaaggatca 8630232  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
     || ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8630231 ggctgccatcaacccacaaaacactgtctttggta 8630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17269261 - 17269067
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||  |  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || |    
T  17269261 ggaatagaccttgggacgacatactcatgtgttgctgtgtggcatgaagaacacggtagagttgagattatacacaatgatcaaggcaacaaaactactc 17269162  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 478  Q
    | |||| |||||||||  |||||||| ||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17269161 cgtcttttgttgcttttgctaaagatgaaaggtttatcggtgattccgctaagaatcaagctgccatgaacccagaaaacaccgtctttggtaat 17269067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 379 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8568904 - 8568839
Alignment:
Q  379 aacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8568904 aacaccttcttgtgttgctttcactaaatctcaaagattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8568839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 622 - 832
Target Start/End: Original strand, 8640164 - 8640372
Alignment:
Q  622 gttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatc 721  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||   | || ||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |     
T  8640164 gttgttcaaaatgatatgaagttgtggccattcaaggtcattg---gggtgaatgacaaacccacgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgtt 8640260  T
Q  722 tttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaat-caccggttaagaatgcagttgttactgtgc 820  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||  |||| |||  |||||||   | | || || |||||||||||||||||| |||    
T  8640261 tttgtgccgaggaaatatcatctatgatcctttcgaagatgcgagaggttgcagagaaatatttaatgtccccccgtaaagaatgcagttgttactatgc 8640360  T
Q  821 ctgcttatttca 832  Q
    ||||||| ||||    
T  8640361 ctgcttacttca 8640372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 694 - 1026
Target Start/End: Original strand, 8382563 - 8382895
Alignment:
Q  694 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 793  Q
    |||||||| |||||| |||| || || |||||||| || ||| | || |||||| | |||| ||||||||| || ||||| |||   | ||| || ||||    
T  8382563 gttaagtataagggtgaggaaaaacacctttgtgccgaggaaatctcctctatggtcctcaaaaagatgcgtgagattgcagagaattttttggagtcac 8382662  T
Q  794 cggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggattaatgttgtaag 893  Q
    |  |  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  || |||||  | ||||| || | |||||||||| | ||||||||  | |||||  |  |    
T  8382663 ctatcgagaatgtagttgttaccgtgcctgcatatttcaatgattctcaacggaaagccacaaaagatgctggtgcgattgctggcctcaatgtaatgcg 8382762  T
Q  894 agtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggt 993  Q
      |||| ||||| || || || || ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  8382763 gataatcaatgagccaactgccgctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagagagaaatattttcatctttgatcttggtggt 8382862  T
Q  994 ggtacttttgatgtttctctactaactattaag 1026  Q
    || ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  8382863 ggaacttttgatgtgtctctcctcacaattaag 8382895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 727 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8570759 - 8570479
Alignment:
Q  727 gctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgctt 826  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||| || || || ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8570759 gctgaagaaatatcatctgtgattctctcaaagatgcgagagattgcagaagcatttttggagtctcctgttaagaatgcagtgattactgtacctgctt 8570660  T
Q  827 atttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgc 926  Q
    |||| |  || || ||  ||| ||| || | |||||| |||   ||||||||  | |||||  |  |  |||| ||||||||||| || || ||| ||||    
T  8570659 attttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgc 8570560  T
Q  927 atatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||| |||| |  || | ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8570559 atatggccttcaaaagagagctaattttgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgt 8570479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Original strand, 8584535 - 8584669
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  8584535 gagttgagattattcacaacgatgaaggcaataaaatcacaccttcctttgttgcttttaccgatgatcaaaggttggttggtggtgctgctaaggatca 8584634  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
     || ||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  8584635 ggctgctatcaacccagagaacactgtctttggta 8584669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Original strand, 10493000 - 10493134
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10493000 gagttgaaattattcacaatgatcaaggaaatagaactacaccttcttttgttgctttcaacaatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 10493099  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
    | | ||    |||||| ||||||| ||||||||||    
T  10493100 atctgccactaaccctgaaaacaccgtctttggta 10493134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 694 - 867
Target Start/End: Original strand, 7877420 - 7877593
Alignment:
Q  694 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 793  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||   | ||| || ||||    
T  7877420 gttaagtataagggcgaggaaaagcacttttgtgccgaggaaatatcatccatgatccttacaaagatgcgcgagattgcagagaagtttttggagtcac 7877519  T
Q  794 cggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggt 867  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||| || | ||||||||||    
T  7877520 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattctcaacgaaaagccacaaaagatgctggt 7877593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8538965 - 8538805
Alignment:
Q  284 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 383  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |    || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  8538965 ggaattgaccttggcacgacctactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaacgatcgtgtggagatcatacacaacgatcaaggaaacaaaaccacac 8538866  T
Q  384 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    |||||||||||| ||| | |||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8538865 cttcttgtgttggttttagtaattctcaacgattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8538805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 8655452 - 8655317
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||  ||  |||||||    
T  8655452 gagttgagattattcacaatgatcaaggcaatagaactacaccttctgttgttgctttcactgattatcaaaggttgattggcaatggagctgagaatca 8655353  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 477  Q
    | | |||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8655352 atctgctaccaaccccgaaaacactgtatttggtaa 8655317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 726 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8576775 - 8576494
Alignment:
Q  726 tgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgct 825  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| | | |  |  |||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  8576775 tgctgaagaaatatcatctgtgattctctcaaagatgcgagagattgcagaggcttttctgcagacacctgttaagaatgcagtgatttctgtgcctgct 8576676  T
Q  826 tatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctgggattaatgttgta-agagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgtt 924  Q
    ||||| |  || || ||  ||| ||| || | |||||| ||| | ||||||||  | |||||  |  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||    
T  8576675 tattttaatgattcccaacgaagagccactaaagatgcaggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcaga-taatcaatgaaccgactgcggcagctctt 8576577  T
Q  925 gcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    || ||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |  | ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8576576 gcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaaagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgt 8576494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8602832 - 8602738
Alignment:
Q  347 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8602832 gagattattcacaatgatcaaggaaacagaactactccttcttttgttgcttttactgatgataaaaggttgatcggtgatgctgccaaaaatca 8602738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8610191 - 8610085
Alignment:
Q  901 aatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggtggtactt 1000  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||  || |  | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8610191 aatgaaccaacggctgcggctcttgcatatggtcttcagaagagagctaattgtgtggaaaatagaaatatttttatctttgatcttggtggtgggactt 8610092  T
Q  1001 ttgatgt 1007  Q
    | |||||    
T  8610091 tcgatgt 8610085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 694 - 866
Target Start/End: Original strand, 29581528 - 29581700
Alignment:
Q  694 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgt-gctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatca 792  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |  ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||| |||  || ||| ||||      
T  29581528 gttaagtacaagggtgaagagaag-aggtttgttgctgaggaaatatcatctatgatcctctcaaagatgcatgatattgcagagaaatttttggaattg 29581626  T
Q  793 ccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctgg 866  Q
    || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || | |||||||||    
T  29581627 cctgtaaagaatgcagtgattaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgctgg 29581700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8577378 - 8577290
Alignment:
Q  356 cacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8577378 cacaatgatcaaggaaacagaaccactccttcttgtgttgcttttaccaattctcaaagattgattggcgatgctgccaaaaatcaagc 8577290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 8545911 - 8545801
Alignment:
Q  896 taatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtcttcgatcttggtggtgg 995  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |  || | ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  8545911 taatcaatgaaccgactgcggcggctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattg-gttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtgg 8545813  T
Q  996 tacttttgatgt 1007  Q
     |||||||||||    
T  8545812 aacttttgatgt 8545801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 8570915 - 8570868
Alignment:
Q  571 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgat 618  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8570915 ttaatttttgcagatgtaaagaggttaattggaaggaagtatagtgat 8570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8610763 - 8610665
Alignment:
Q  346 tgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8610763 tgagataatccataatgagcaaggaaacagaaccactccttcttttgttgctttctctggtgatcaaaggttgataggtgatgctgctaaaaatcaagc 8610665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8104166 - 8104069
Alignment:
Q  344 gttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| |   | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8104166 gttgagatcattgctaatgatcaagggaacagaacgacaccgtcttatgttgctttcactgatagtgaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 8104069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 576 - 1029
Target Start/End: Original strand, 34466362 - 34466815
Alignment:
Q  576 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaat 675  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | |||||||   ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  34466362 tttttcagatgctaagaggttaattggcagaaaatttagtgatcctgatgttcaaacagatatgatgttatggccattcaaagttattgctggtgttaat 34466461  T
Q  676 gacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctg 775  Q
    ||||| || |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||  |||||||||| || | ||| |    
T  34466462 gacaagccaatgatttcccttaagtataagggtcaggagaagcacctatgtgctgaggaaatctcatctatgatcctttcaaagatgcgggatactgcag 34466561  T
Q  776 aggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgc 875  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  34466562 aggaatatttggaatcaccaattaagaatgcagttatcaccgtgcctgcttattttaatgattctcagcgaaaagctactgtggatgctggtactattgc 34466661  T
Q  876 tgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatattttt 975  Q
    |||  |||||||| |   | |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||  | ||||||||     
T  34466662 tggccttaatgttttgcaaataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttgtggaagaaggaaatattttc 34466761  T
Q  976 gtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaaggat 1029  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  34466762 gtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctctccttacaattaaggat 34466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 574 - 1028
Target Start/End: Complemental strand, 15595638 - 15595181
Alignment:
Q  574 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagtt-gttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtc 672  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  15595638 attttttcagatgctaagagattaatcagtaggaagtttagtgattctgtttgttcaaaatgatataaagttgtggccattcaaggtcattg---gtgtg 15595542  T
Q  673 aatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattg 772  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  15595541 aatgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtcaagaaaagcgcttttgtgctgaggaaatatcgtctatgattctcaaaaagatgcgagaggttg 15595442  T
Q  773 ctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctat 872  Q
    | |||  || |||||  || || || || |||||||||||||| |||||||||||| |||  || |||||  ||||||| || |||||||| ||| | ||    
T  15595441 cagagaaatttttag--tctcccgtaaacaatgcagttgttaccgtgcctgcttatctcaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcaggtgccat 15595344  T
Q  873 tgctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaacc-------gacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcg 965  Q
    ||||||  |||||||| || | ||||| ||||||||       ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||   | | ||||||  |||  |    
T  15595343 tgctggccttaatgttatacgggtaatcaatgaaccgacagctgacagctgcagctattgcatatggccttgacaagaggattaactgtgttggagaaag 15595244  T
Q  966 caatatttttgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgtttctctactaactattaagga 1028  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  15595243 aaatatttttgtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctatcctaacaattaagga 15595181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 575 - 1007
Target Start/End: Original strand, 4678126 - 4678558
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||| | || || |||||||||||||| | |||||   ||||||  ||    
T  4678126 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaggtatagtgattctgttgttcaaaaagacatcatgttgtggccatttagggtcatcactggtgagaa 4678225  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||     
T  4678226 tgataaaccgatgattagtgttaagtacaagggtcaagagaagcaagttagtgttgaggaaatatcatcgatgatccttacaaagatgagagaagttgcc 4678325  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||  ||||| ||   ||  | || |||||||  ||||||||||||||||| || ||||  || |||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  4678326 gaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgtcgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcaacgaaaagctaccatagatgctggtgccattg 4678425  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttt 974  Q
    ||||  |||||||  |   | |||| || ||||| || | ||| ||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |    | || ||||| ||    
T  4678426 ctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgttgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgattgtaaacgaaatatatt 4678525  T
Q  975 tgtcttcgatcttggtggtggtacttttgatgt 1007  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4678526 tgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 4678558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 253 - 480
Target Start/End: Original strand, 34465158 - 34465385
Alignment:
Q  253 catggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatc 352  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |  |||| |||||     
T  34465158 catggcgaaaaaatgtgaaggacgtgctgtgggaatagaccttggcacaacctactcatgtgttgcagtatggcaggaacaacacagtagagtagagatt 34465257  T
Q  353 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtca 452  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||  ||    
T  34465258 attgacaatgaccaaggtaacacaaccacaccttcttttgttgcttttactcatgatcaaagattgatcggtaatgctgctaagaatcaaactgctacca 34465357  T
Q  453 accctcaaaacactgtctttggtaattt 480  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||    
T  34465358 acccacagaacactgtttttggtaattt 34465385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 477
Target Start/End: Original strand, 4677459 - 4677674
Alignment:
Q  262 aaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaat 361  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||| |||| | ||   | |||| ||||| ||| |||||    
T  4677459 aaagtatgaaggacgtgctgtgggaatagatcttggaactacttattcatgtgttgctgtgtggctggagaatcacaacagagtggagattatttacaat 4677558  T
Q  362 gaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaa 461  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |||| || |||    
T  4677559 gaacaaggcaacaaaacaacaccttcttttgttgcttttactgatgatcaaaggttgattggtaatgctgctaagaatcaatctgccaccaactctgaaa 4677658  T
Q  462 acactgtctttggtaa 477  Q
    ||||||||||||||||    
T  4677659 acactgtctttggtaa 4677674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15596162 - 15596060
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15596162 gagtcgagattatccacaatgaccaaggaaacagaattacaccttcttttgtttctttcactaatgatcaaaggttgattggtgatgctgctaagagtca 15596063  T
Q  442 agc 444  Q
    |||    
T  15596062 agc 15596060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Original strand, 52549098 - 52549183
Alignment:
Q  585 tgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 670  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  52549098 tgctaagaggttaattggtaagaagtttagtgatcctgttgttcaagatgatatattgttatggtcattcaaggtcactgccggtg 52549183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 575 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 28220551 - 28220194
Alignment:
Q  575 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    ||    
T  28220551 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgactctgttgttcaagatgatataaagttgtggccattcaaggtcatttccggaacgaa 28220452  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 774  Q
     |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||| || |||||     
T  28220451 cgacaaacccatgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatctcatctatggttctaacaaagatgcgtgagattgca 28220352  T
Q  775 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattg 874  Q
    ||||| | ||| ||||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |||| | ||||| || |||||||| ||| | ||||    
T  28220351 gaggcctttttggaatttcctgtcaagaatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattatcagcggaaagccaccatagatgcaggtaccattg 28220252  T
Q  875 ctgggattaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatgg 932  Q
    ||||  | |||||| ||||  || | |||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  28220251 ctggtctaaatgttctaaggatagtcaatgaacccactgctgctgctattgcatatgg 28220194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Original strand, 42554186 - 42554320
Alignment:
Q  342 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42554186 gagttgagattattcacaatgatcaaggcaacaaaacaacaccttcttttgttgcttttactcatcatgaaaggttgattggtgatgctgctaaggatca 42554285  T
Q  442 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
    | | ||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  42554286 aaccgccaccaacccccaaaacactgtctttggta 42554320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 593 - 821
Target Start/End: Original strand, 42555530 - 42555758
Alignment:
Q  593 ggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattac 692  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| | | ||  | |||| ||| || ||||||      
T  42555530 ggttaattggtaggaagtttaatgattatgttgttcaaaatgacatgaagttgtggccattcaaggtcatttccggaataaatggcaagcccatgattta 42555629  T
Q  693 cgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatca 792  Q
     || | |||| |||| |||||||| || || || || |||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||| ||| |||       
T  42555630 tgtaacgtacgagggacaggagaaacacctatgcgccgaagaaatctcatctatgattctaacaaagatgcgcaagattgcagaggcatttttggaaatg 42555729  T
Q  793 ccggttaagaatgcagttgttactgtgcc 821  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  42555730 cctgtcaagaatgcagttgttactgtgcc 42555758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 28221122 - 28220915
Alignment:
Q  270 aaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaagg 369  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||| || || ||||| || |||||||| ||  ||||     | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28221122 aaggatgtgctgtgggaatagatcttggaacaacgtattcatgtgttgctgtgtggcaagatgaacacaatagggttgagattattcacaatgatcaagg 28221023  T
Q  370 caacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtc 469  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||   |||||| ||||| || |||    
T  28221022 caacaaaacaactccttcttttgttgctttcaccgatgatgaaaggttgattggcgatgctgctaaaaatcaaacggccaacaacccccaaaataccgtc 28220923  T
Q  470 tttggtaa 477  Q
    ||||||||    
T  28220922 tttggtaa 28220915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 103; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 581 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 43745441 - 43745079
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| | | ||  | ||||||||    
T  43745441 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttaatgattctgatgttcaaaatgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaa 43745342  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 780  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||    
T  43745341 acccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatctcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagaca 43745242  T
Q  781 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggga 880  Q
    | |||  |||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | |||| | ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||     
T  43745241 tttttgcaattgcctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccac--tagatgctggtgccattgctgggc 43745144  T
Q  881 ttaatgttgt-aagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagaga 945  Q
    || ||||| | |||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| || || ||||||    
T  43745143 ttgatgttatgaaga-taatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagaga 43745079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12530059 - 12529869
Alignment:
Q  254 atggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatca 353  Q
    ||||| |||||||||||||||  || | | ||||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||  |   || || || || |    
T  12530059 atggcaaaaaagtatgaaggagttgctataggaattgatcttggcacaacttactcatgtgttggagtatggcaagagcaaactgatcgtgtggaaataa 12529960  T
Q  354 ttcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 444  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12529959 ttcacaatgatcaaggaaacaaaacaacaccttcttgtgttgcttttactaattctcagagattgattggtcatgctgccaaaaatcaagc 12529869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 43745985 - 43745793
Alignment:
Q  281 gtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataa 380  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||  ||||     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||    
T  43745985 gtgggaatagaccttggaacaacgtattcgtgtgttgctgtgtggcaagatgaacaaaatagagttgagattattcacaatgatcaaggcaacaa---aa 43745889  T
Q  381 caccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 476  Q
    || |||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||   |||||||||||||||  |||||||||    
T  43745888 caacttcttttgttgcttttactgatcatgaaaggttgataggtgacgctgctaagaatcaaaccgccaccaaccctcaaaacaccatctttggta 43745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 12529103 - 12528847
Alignment:
Q  576 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtga-tcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 674  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || | | |||||  | |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12529103 ttttgcagatgcaaagaggttaattggaagaaagtatagtgactcca-tagttcagaaggatcaactgttgtggccatttaaggtcactgctggtgctaa 12529005  T
Q  675 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgt-gctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 773  Q
    ||||||||| | |||    || || ||||| ||  ||||  | || |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  || |||||||||| |||||    
T  12529004 tgacaaaccgaagatccttgtgaactacaatgggaaggaacatca-ctttgttgctgaagaaatatcctctatgattctatcacagatgcgagagattgc 12528906  T
Q  774 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttca 832  Q
     || |||| | | || ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  12528905 agatgcatttcttgagtcacctgttaagaatgcagtgattacggtgccagcgtatttca 12528847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 85; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 581 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 28911176 - 28910744
Alignment:
Q  581 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 680  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28911176 cagatgctaagaggataattgataggaagtttagtgatcccgttgttcaaaacgattcaatgttgtcgccgttcaaggtcattgccggtgtcaatgacaa 28911077  T
Q  681 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 780  Q
     || |||||  | || |||||||||| |||||||||| |  | |||||||| ||| | |||||| || | ||| ||||||| || || ||||| | | ||    
T  28911076 ccccatgatatctgtcaagtacaaggatcaggagaagaaattatgtgctgaggaaatctcatctgtggttctctcaaagattcgcgagattgcagtgaca 28910977  T
Q  781 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttatttcagcgactctcagagaaaagctacgatagatgctggttctattgctggga 880  Q
    | ||| ||||  || || ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  || ||| |||| ||||| || |||||||||||| | ||||   ||     
T  28910976 tttttggaattgcccgtcaagaatgcaattgttactttgactggttatttcaatgattcttagaggaaagccaccatagatgctggtgccattgtcaggc 28910877  T
Q  881 ttaatgttgtaagagtaatgaatgaaccgacggctgccgctgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttaaagagcgcaatatttttgtctt 980  Q
    |||||||| |  |  |||| ||||| |  || ||||  ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||| || |||| |||  ||||    
T  28910876 ttaatgttatgcggataatcaatgagctcactgctgtagctatttcatatggcctcgacaagagagctgagtgtgctggagaacgaaatactttcatctt 28910777  T
Q  981 cgatcttggtggtggtacttttgatgtttctct 1013  Q
    ||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28910776 cgacctgggtagtgggacttttgatgtttctct 28910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28911352 - 28911318
Alignment:
Q  407 gatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28911352 gatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 28911318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University