View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11614_high_8 (Length: 619)

Name: NF11614_high_8
Description: NF11614
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11614_high_8
NF11614_high_8
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (1-455)||(51764229-51764683)
chr3 (1-458)||(13470521-13470980)
chr3 (11-385)||(51113580-51113954)
chr3 (507-602)||(51764735-51764830)
chr3 (6-396)||(514519-514912)
chr3 (146-395)||(51120827-51121076)
chr3 (216-396)||(1657166-1657346)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-458)||(6415819-6416276)
chr6 (8-386)||(6589119-6589497)
chr6 (1-394)||(7119074-7119467)
chr6 (1-394)||(7131552-7131945)
chr6 (1-394)||(6432078-6432471)
chr6 (61-384)||(7994031-7994354)
chr6 (8-388)||(10579532-10579913)
chr6 (1-388)||(6426434-6426821)
chr6 (42-396)||(6402775-6403129)
chr6 (53-397)||(6594447-6594791)
chr6 (1-388)||(19632362-19632746)
chr6 (1-396)||(6394779-6395174)
chr6 (2-396)||(6423132-6423526)
chr6 (1-371)||(6409946-6410316)
chr6 (125-399)||(6585150-6585424)
chr6 (1-305)||(6596717-6597021)
chr6 (1-396)||(14820608-14821000)
chr6 (10-240)||(8913783-8914012)
chr6 (191-396)||(11936254-11936459)
chr6 (191-396)||(11948234-11948439)
chr6 (206-397)||(14818296-14818487)
chr6 (266-394)||(6603256-6603384)
chr6 (3-112)||(6602996-6603105)
chr6 (44-110)||(9411556-9411622)
chr6 (208-316)||(14802331-14802439)
chr6 (211-372)||(9411294-9411455)
chr6 (214-388)||(6586112-6586284)
chr6 (521-586)||(19632133-19632200)
chr6 (407-458)||(16566735-16566786)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (1-430)||(10614474-10614903)
chr7 (1-396)||(15091940-15092335)
chr7 (1-222)||(10169919-10170140)
chr7 (1-222)||(10177444-10177665)
chr7 (507-602)||(10614332-10614429)
chr7 (274-393)||(10170143-10170262)
chr7 (274-393)||(10177668-10177787)
chr7 (1-72)||(10167463-10167534)
chr7 (144-219)||(7977670-7977745)
chr7 (424-458)||(10170290-10170324)
chr7 (424-458)||(10177815-10177849)
chr7 (507-540)||(10170370-10170403)
chr7 (507-540)||(10177895-10177928)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (44-388)||(53761597-53761945)
chr4 (7-385)||(546839-547220)
chr4 (54-397)||(55908567-55908913)
chr4 (5-256)||(21834171-21834422)
chr4 (191-396)||(644746-644950)
chr4 (38-393)||(570269-570621)
chr4 (48-396)||(640830-641178)
chr4 (213-388)||(8184031-8184206)
chr4 (47-397)||(1548258-1548609)
chr4 (44-397)||(8186920-8187276)
chr4 (62-286)||(1600444-1600671)
chr4 (146-388)||(553402-553644)
chr4 (200-397)||(566103-566300)
chr4 (144-396)||(7225815-7226067)
chr4 (146-396)||(1524420-1524667)
chr4 (202-369)||(1552757-1552927)
chr4 (1-122)||(570723-570847)
chr4 (212-396)||(1513407-1513588)
chr4 (202-384)||(1537757-1537939)
chr4 (40-388)||(12121282-12121633)
chr4 (174-388)||(55505070-55505281)
chr4 (193-304)||(532196-532307)
chr4 (8-388)||(370843-371226)
chr4 (219-381)||(1495926-1496088)
chr4 (290-381)||(1517574-1517665)
chr4 (53-331)||(3438404-3438684)
chr4 (43-93)||(532404-532454)
chr4 (308-388)||(1489457-1489537)
chr4 (214-393)||(7307778-7307957)
chr4 (509-538)||(21834598-21834627)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-399)||(19468288-19468686)
chr1 (7-106)||(9581276-9581375)
chr1 (43-106)||(9586844-9586907)
chr1 (266-384)||(7554415-7554533)
chr1 (251-384)||(29658935-29659068)
chr1 (251-383)||(29718962-29719094)
chr1 (424-458)||(19468709-19468743)
chr1 (61-110)||(29658811-29658860)
chr1 (69-110)||(29691334-29691375)
chr1 (69-110)||(29718846-29718887)
chr1 (53-110)||(30827311-30827368)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (1-396)||(20477871-20478266)
chr5 (36-372)||(41889375-41889714)
chr5 (52-394)||(41901375-41901717)
chr5 (8-224)||(28525098-28525314)
chr5 (72-384)||(32267402-32267714)
chr5 (146-372)||(37937826-37938052)
chr5 (310-396)||(17205514-17205600)
chr5 (218-385)||(38267562-38267729)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (54-397)||(1037503-1037849)
chr2 (146-388)||(45245019-45245261)
chr2 (44-110)||(32785604-32785670)
chr2 (507-540)||(1038297-1038330)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (86-393)||(34936034-34936344)
chr8 (42-388)||(18315100-18315449)
chr8 (191-396)||(28246274-28246477)
chr8 (1-393)||(17636183-17636581)
chr8 (144-394)||(27922425-27922672)
chr8 (61-370)||(32151242-32151551)
chr8 (7-108)||(17627851-17627952)
chr8 (265-387)||(17628067-17628189)
chr8 (211-393)||(21235476-21235658)
chr8 (510-560)||(17643925-17643975)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (140-388)||(552-800)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (144-388)||(1396-1643)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (255-396)||(39099-39240)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 51764229 - 51764683
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764229 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 51764328  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764329 cttgattttaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 51764428  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764429 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagacttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 51764528  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764529 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcaaggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaa 51764628  T
Q  401 gatcgccttctttactagtattttgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgt 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764629 gatcgccttctttactagtattttgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgt 51764683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 458
Target Start/End: Original strand, 13470521 - 13470980
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13470521 tgtataccctcaattaaagtctctctatttgggaaaaaatcaatggttaagtgatgaaggcatcataatgtttgcttccaatttccccaatttgcagctg 13470620  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | |||  || ||    
T  13470621 cttgatttgaattgttgcaatctcttatcaaaaggtatttgtcaagttttaaggatatgttgtaagattaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaag 13470720  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||  | ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13470721 tgaagctacttggaatgaactttgttgttcccaatctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaaggttaatgataaaacactctatatgatctcaaagaa 13470820  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaa 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||     
T  13470821 ttgttgtgggcttttgcaactattacttgaactttgtcataatgtcacagaagagggagtgaaacatgtggtagagaactgcacacagctaagagagcat 13470920  T
Q  401 gatcgccttctttactagtattttgaaagtgctgtgctgaaa--gtttgaactctgtaag 458  Q
    |     ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13470921 ggatatcttctttactagtatttcggaagtgttgtgctgaaagtgtttgaactctgtaag 13470980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 385
Target Start/End: Original strand, 51113580 - 51113954
Alignment:
Q  11 caattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    ||||||||||||||| |  ||| | | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  51113580 caattaaagtctctccagttggatcacaatccatggttaagagatgagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaa 51113679  T
Q  111 attcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctact 210  Q
     |  |||| ||   |||||  ||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  || |  | ||||||| | ||||||||||    
T  51113680 ctcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctact 51113779  T
Q  211 tggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcggg 310  Q
    |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||    
T  51113780 tggaatgaactttgaagctcccaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtggg 51113879  T
Q  311 cttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcaca 385  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  51113880 cttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatgtcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 51113954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 507 - 602
Target Start/End: Original strand, 51764735 - 51764830
Alignment:
Q  507 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatcagtctatggatgataattccccaagtaagtgtaatatttttatataatgtacagtgtaatgct 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764735 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatcagtctatggatgataattccccaagtaagtgtaatatttttatataatgtacagtgtaatgct 51764830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 396
Target Start/End: Original strand, 514519 - 514912
Alignment:
Q  6 accctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttga 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| |||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  514519 accctcaattaaaatctctctatttggctcacaattcatgcttaagagatgaaaaccttataatgtttgcttcaattttcccgaatttgcagctaattga 514618  T
Q  106 tttgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtg 202  Q
    |||||  | |||  ||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || | || |||||||||    
T  514619 tttgagctattgtgataacatatctgacaaaagtatctgtcaagttttaaagagatggtctaagattaggcatttgaacttagcccactgctcaagagtg 514718  T
Q  203 aagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgtt-agatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaat 301  Q
    ||| |    || |||||| ||  |||||  || || |||||||| || ||  | |  ||||| ||| || ||| || ||||  ||| |||||| |||| |    
T  514719 aagttgtacggtatgaacattagagttctcaaacttgaggtgttgagcttaat-agatacaagagtcgacgatgaagcacttcatgtgatctcgaagagt 514817  T
Q  302 tgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    || || ||||||||||||||||||||| || |||||||   | |||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  514818 tgctgtgggcttttgcaactattactgcaaaattgtgaaggtatcacagagacgggagtgaagcatgtggtgaaaaactgcacacgactgagaga 514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 395
Target Start/End: Original strand, 51120827 - 51121076
Alignment:
Q  146 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| |  |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||  ||  |||||||||    
T  51120827 gttttatggagatgttgtaacattagacacttgaacttcaccggttgttcaagagtgaaactgcatggaatgaactttgaagttctcaaattggaggtgt 51120926  T
Q  246 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 345  Q
    |  | |||||   ||||| |||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||| |||| | |||||||||||| | |  || |||   |||    ||||    
T  51120927 tgaacttgtcgcatacaagagttgatgatgaaaaactatatgtaatctcaaagagttgtcgtgggcttttgcaattgtctctagaaagctgtttgtatgt 51121026  T
Q  346 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagag 395  Q
    |||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51121027 cacacaaaaaggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagag 51121076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1657346 - 1657166
Alignment:
Q  216 tgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggctttt 315  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1657346 tgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacaatatatcactctattggatctcaaagagttgcagcgggctttt 1657247  T
Q  316 gcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    |||||| | |||  ||  ||||||   |||  | || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1657246 gcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgttgcagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaactgagaga 1657166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6416276 - 6415819
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  6416276 tgtataccctcaattaaagtctctctatttgggaaaaaataaatggttaagcgatgaaggtatcataatgttttcttccaacttccccaatttgcagctg 6416177  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| || ||   |||  || ||    
T  6416176 cttgatttgaatcgttgtaatctcttatctgaaggtatttgtcaagttttaaagatatgttgtaagattgggcatttgaacttagccttttgtaaaaaag 6416077  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||  | ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6416076 tgaagctacatggaatggactttgtagttcccaacctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaaggttaatgataaaactctctatgtgatctcaaagaa 6415977  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaa 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||     
T  6415976 ttgtagcgggcttttgcaactattacttgaattttgtgataatgtcacagaagtgggagtgaaacatgtggtagagaactgcacacaactaagagagcat 6415877  T
Q  401 gatcgccttctttactagtattttgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgtaag 458  Q
    |     |||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6415876 ggatatcttctttactagtattcttaaagggttgtgctgaaattttgaactctgtaag 6415819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 6589119 - 6589497
Alignment:
Q  8 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  6589119 cctcaattaaagtctctctatttgggtaaaaattcatggttaagtgatgcaaatatcataatgtttgcttccattttccccaatttagaggtgcttgatt 6589218  T
Q  108 tgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagct 207  Q
    | |||||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| || ||   |||   | |||||||||    
T  6589219 tcaattcttgtaataacatatctaaaggtatttgtcaagtattgagaagatgttgtaagattaggcatttgaacttagccttctgtaagaaagtgaagct 6589318  T
Q  208 acttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgc 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  | ||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||       
T  6589319 acttggaatgaactttgtagttcccatgctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaatgttaatgataaaacactatatctgatctcaaaaaattgtata 6589418  T
Q  308 gggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacac 386  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6589419 gggcttatgcaattatcacttcaactttgtaattatgtcacggaggagggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacac 6589497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7119467 - 7119074
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||  ||||  | |||||| ||||||||  ||  |||| || |||||| ||||||||||||| || ||     
T  7119467 tgtatatcctcagttaaagtctctctatttaggtagaaatttacggttaactgatgaaaaaattgtaatattagcttcctttttccccaatttacaactt 7119368  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | ||||||||||    
T  7119367 cttgatttgaatacttgcaataacatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaacatttgaacttagcccactgttcaagag 7119268  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||  | ||||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  7119267 tgaagctacttggaatgaactttgttgttcaccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactccatgtgatctcgaagaa 7119168  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||  | || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7119167 ttgttgcgggcttttggaactattactgaaagattgttattatgtcacaaaaaaagaagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaattgaga 7119074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7131945 - 7131552
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||  ||||  | |||||| ||||||||  ||  |||| || |||||| ||||||||||||| || ||     
T  7131945 tgtatatcctcagttaaagtctctctatttaggtagaaatttacggttaactgatgaaaaaattgtaatattagcttcctttttccccaatttacaactt 7131846  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | ||||||||||    
T  7131845 cttgatttgaatacttgcaataacatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaacatttgaacttagcccactgttcaagag 7131746  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||  | ||||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  7131745 tgaagctacttggaatgaactttgttgttcgccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactccatgtgatctcgaagaa 7131646  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||  | || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7131645 ttgttgcgggcttttggaactattactgaaagattgttattatgtcacaaacaaagcagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaattgaga 7131552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6432471 - 6432078
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  6432471 tgtataccctcagttaaagtctctctatttgggtcacaattcatggttaaggaatgaaaggatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcaacat 6432372  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    |||||||||  ||  ||  |||| |||  | ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| || || | |||  || ||    
T  6432371 cttgatttgcgttggtgtcatcgtataaatgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaaacttaaacatttgaacttagcctattgtataaaag 6432272  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||  |||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6432271 tgaagctacatggaatgaactttgaagttcccaagctgaaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaacactttatgtgatcttaaagaa 6432172  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 394  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6432171 ttgttgtgggcttctgcaactattcctgtacaattgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacttgtggtagaaaaatgcacacaattgaga 6432078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 61 - 384
Target Start/End: Original strand, 7994031 - 7994354
Alignment:
Q  61 catcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgt 160  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| | |||||||||| ||||    
T  7994031 catcatattgtttgctaccattttcccaaatttgcagatgctcgatttgaattcttgcaatggtatatctgaaggtatttgttacgttttaaggaaatgt 7994130  T
Q  161 tctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcattta 260  Q
    | |||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||  ||    
T  7994131 tgtaagatcaggcatttgaacatagccgattgtacaagagtgaagctactaggaatgaactttgtagttccgaagctagaggtgttgaacatgtcaaata 7994230  T
Q  261 caaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagt 360  Q
    |||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| || |||| || ||| |||||||    
T  7994231 caagggttaatgacgaaacactatatgtgatctcaaagaattgttctggacttttgcaactattacttgaactttgtaatgatgttaccgaggagggagt 7994330  T
Q  361 gaaacatgtggttgaaaactgcac 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  7994331 gaaacatgtggtagaaaactgcac 7994354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 388
Target Start/End: Original strand, 10579532 - 10579913
Alignment:
Q  8 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10579532 cctcaattaaaatctctctatttgggtagaaattcattgttacgtgatgaaatgattataatgttagcttcctttttccccaatttgcagctgcttgatt 10579631  T
Q  108 tgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagct 207  Q
    ||||| ||||| |   ||||||| ||||| | | | |||||| | | ||||||  |||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  10579632 tgaatacttgcgaatacatatctgaaggtatttttcaagtttcaggaagatgtggtaagattaagcatttgaacttagccaaatgtccaagagtgaagcg 10579731  T
Q  208 acttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgc 307  Q
    |||| |||| ||  ||| | ||||  |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10579732 acttagaataaagattgtaattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaaagttgatgataaaacactctattcgatctcaaagaattgttgt 10579831  T
Q  308 gggcttttgcaactatt-actggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
     |||||||| ||||||| |||| || | ||| | |  |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10579832 cggcttttggaactatttactgaaaaactgtaaaagggtcacaaagaagggagttaaacatgtggtagaaaactgcacacaa 10579913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6426821 - 6426434
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  6426821 tgtataccctcaattgaagtctctctatctgggtagaaattcatggttaagtgatgaaatcatcataatgtatgcttccattttccccaatttacagcta 6426722  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    |||||||||||   ||||  |   |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| || |    |||||||  |    
T  6426721 cttgatttgaaggtttgccgtgaaatatctgaaggtatttgtgaagttttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaaacg 6426622  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||   ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  6426621 tgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcaaacacaagcattgatgatgaaactttttatgcgatctcaaagaa 6426522  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    ||||||  || |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6426521 ttgttgtcggattttgcaattattacttgaaaattgtaaaggtgtcacaatgaagggtgtgaaacaagtggtagaaaactgcacacaa 6426434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6403129 - 6402775
Alignment:
Q  42 catggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||| |||  ||  ||| |||| |||||| ||||| | ||    
T  6403129 catggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgcgatcgtatatctgaaggtatttg 6403030  T
Q  142 tgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggag 241  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||     
T  6403029 tcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttgcagttccccaactagaa 6402930  T
Q  242 gtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgata 341  Q
    |||||  | ||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||    
T  6402929 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttata 6402830  T
Q  342 atgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  6402829 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 6402775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 397
Target Start/End: Original strand, 6594447 - 6594791
Alignment:
Q  53 gatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaa 152  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  | || | |||  |||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  6594447 gatgaaaacatcatattgtttgcttctattttccccactttggagctgcttgatttgaggttttccgatcaaatatctgaaggtatttgtcaagttttaa 6594546  T
Q  153 ggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagattt 252  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||||||  | ||    
T  6594547 ggagatgttataagattacacatttgtacttatccgggtgttcaagagtgaagctacatggaataaactttttagttcccaaactggaggtgttgtactt 6594646  T
Q  253 gtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggag 352  Q
    ||||  |||| | ||||||||| | |||||   || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| || |||| |||    
T  6594647 gtcaaatacagaggttgatgatgagacactacgtgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactaaaactagaaaattgtgatcatctcacagag 6594746  T
Q  353 aagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6594747 gagggagccaaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagagaa 6594791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19632746 - 19632362
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||||  || | |||||| |||||  |||| ||||||||| ||| |    
T  19632746 tgtataccctcaattaaagtctctctatttgggtcgaaatttacggttaagtgatgaaaagattacaatgttcgcttcgttttttcccaatttgtagcgg 19632647  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||||  |||| ||  ||||||||| | | | ||| ||||||||||   ||||| |||||| | |||||||||| || |   |||||||| ||    
T  19632646 cttgatttgaatcgttgctattacatatctaatgctatttgtcaagttttaag---atgttgtaagataacgcatttgaacttaactcgatgttcaatag 19632550  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    | || ||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||||||| |   ||| | || ||||||||||||    
T  19632549 ttaacctacttggaataaactttctagttcccaagctagaggtgttggacttgtcgtatacaaaggttgatgatgagcaactttttgtgatctcaaagaa 19632450  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19632449 ttgttgtgggcttttgcaactcttactgaaaaattgtgctaatatcacagagaagggagtgaaacacgtggtagaaaactgcaaacaa 19632362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6395174 - 6394779
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||   |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  6395174 tgtataccctcagttaaactctctctatttgggtacaaattactggttaatagatgaaataatcataatgtttacttccattttccccaatttacagcta 6395075  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||    ||||   |  |||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||| |||| |||  ||||||||| || |    ||||||| ||    
T  6395074 cttgatttgacacgttgctcacaaatatctgaaggtatttgtcaagttttaaagaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaaaag 6394975  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||  |||||  ||||||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  6394974 tgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaactctttctgtgatctcaaagaa 6394875  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||| ||  ||||| | |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6394874 ttgttgtgggcttttgcaattacaacttgataattgtaaaaatgtcacagaaaagggtgtggaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagaga 6394779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6423526 - 6423132
Alignment:
Q  2 gtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  6423526 gtataccctcaattaaagtctctctatttgggttacacttcgtggttaagtgatgaaatcatcataatgtttgcttccattttccctaatttaaaactac 6423427  T
Q  102 ttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagt 201  Q
    ||||||||||   |||| |||  |||| | | ||| | ||| | |||||| ||| ||||  | || |||  ||||||||| || || | |||  |  |||    
T  6423426 ttgatttgaagggttgccatcaaatatttgatggtatttgtcatgttttacggaaatgtcgtgagcttaaacatttgaacttagcctattgtgaacaagt 6423327  T
Q  202 gaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaat 301  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6423326 gaagctacgtgcaatgaacttttaagttcccaagctggaggtgttgaacttgtcaaatacaagagttagcgataaaacactctatgcgatctcaaagagt 6423227  T
Q  302 tgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  | || ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  6423226 tgttgtgggattttgcaactattacttgaagattgtgattatgtaacaaacaaaggactgaaacgtgtggtattaaactgcacacaattgagaga 6423132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6410316 - 6409946
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  6410316 tgtataccctcaattaaagtctctctatttggattacaatacatcgttaagtgatgaaataatcattttgtttgcttccatttttcccaatttacaacta 6410217  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||    |||| | |  |||||| ||||| | ||| ||||||||  || ||||| |||| ||| ||||||| || || || | ||   || ||    
T  6410216 cttgatttgacgggttgccagcaaatatctgaaggtatttgtcaagttttacagaaatgttgtaagcttaagcatttggacttagcctattgcaaaaaag 6410117  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | | ||||  |||||  ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  6410116 tgaagctacatggaatgaactttgaagttcccaagctgaaggtgttgaactagtcaaatacaagcgttgatgatgaaactctttatgtgatctcaaagaa 6410017  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtgg 371  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  || |  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6410016 ttgttgtcggcttttgcaactatttttgtacaactgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacatgtgg 6409946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 399
Target Start/End: Original strand, 6585150 - 6585424
Alignment:
Q  125 atatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttg 224  Q
    |||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6585150 atatctgaaggtatttgtcatgttttaaggagatgttttaatattaggcatttgaactttactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttt 6585249  T
Q  225 cagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactatt 324  Q
     |||| |  || ||||||| ||  | ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  6585250 tagttacccagttggaggtattgaacttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttctgcgcttttggaactatt 6585349  T
Q  325 actggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaaca 399  Q
    |||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  6585350 actgaaaggttgtgaaaatgtcacagagaagggactgaaacatgtggtagaaatttgcacacaactgagaaaaca 6585424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 6596717 - 6597021
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| ||||||  || ||||  || |||||| |||| || ||||||||||||    
T  6596717 tgtataccctcaattaaagtctctctatttgggtagaaatttttggttaagtaatgaaaatattataagattagcttccttttttcctaatttgcagctg 6596816  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||| ||  |||||   |||  ||| ||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  6596817 cttgacttatattctaataataacatttctgaaggtatttgtcaagttttcaggagatgtgataagattaagcatttgaactgagccgaatgttcaagtg 6596916  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||  | ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  6596917 tgaagcgacttgaaataaactttgaaattccccagctggaggtgttgaacttgtcaagtacaaatgttgatgatgaaacactctacgctatctcaaagaa 6597016  T
Q  301 ttgtt 305  Q
    |||||    
T  6597017 ttgtt 6597021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14821000 - 14820608
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||| |||||  ||||     
T  14821000 tgtataccctcaattgaagtctctctatttgggtcacaattcatggttaaatgatgaaataatcattttgtatgcttccattttcccaaatttaaagcta 14820901  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||  |   ||    ||  |||||| ||||| | ||| ||| |||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||      |||||| |||    
T  14820900 cttgatttacaagattc---tcctatatctgaaggtatttgtcaaggtttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagaattttgttcaggag 14820804  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | || |||  |||||| |||||| || ||||||| |||  |||||| |||||    
T  14820803 tgaaactacatggaattaactttgcagttcccaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaa 14820704  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| ||| | ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  14820703 ttgttgtgggcttttgcgattattacttgaaaaatgtaatgatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtggtaaaaaactgcacacagctgagaga 14820608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 8913783 - 8914012
Alignment:
Q  10 tcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttg 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||   |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||     
T  8913783 tcaattaaagtctctttatttgggtgacaatttgtggttaacggatgaaatcatcataatgtttgcttccattttttccaatttgcatatgcttgattt- 8913881  T
Q  110 aattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctac 209  Q
    |||| |||  ||   |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |    | ||| ||||||||||||||||    
T  8913882 aattattgagattatatatctaaaggtatttgtcaagttttaagaagatgttgtaagattaaacatttgaacttcgttggatgatcaagagtgaagctac 8913981  T
Q  210 ttggaatgaactttgcagttccgaagctgga 240  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  8913982 ttgcaataaactttgtagttcccaagttgga 8914012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 396
Target Start/End: Original strand, 11936254 - 11936459
Alignment:
Q  191 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 290  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||    
T  11936254 tgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattgga 11936353  T
Q  291 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 390  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| | |||  ||  ||||||   |||||| || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  11936354 tctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaaat 11936453  T
Q  391 gagaga 396  Q
    ||||||    
T  11936454 gagaga 11936459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 396
Target Start/End: Original strand, 11948234 - 11948439
Alignment:
Q  191 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 290  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||    
T  11948234 tgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattgga 11948333  T
Q  291 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 390  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| | |||  ||  ||||||   |||||| || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  11948334 tctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaaat 11948433  T
Q  391 gagaga 396  Q
    ||||||    
T  11948434 gagaga 11948439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14818487 - 14818296
Alignment:
Q  206 ctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgtt 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||  | || |||  |||||| |||||| || ||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  14818487 ctacatggaattaactttgcagttctcaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgtt 14818388  T
Q  306 gcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
      |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  14818387 ctgggcttttgcgattattacttgaaaattgtaataatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacagctgagagaa 14818296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 394
Target Start/End: Original strand, 6603256 - 6603384
Alignment:
Q  266 gttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaac 365  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  6603256 gttgatgatgaaacagtctatgcgatctcaaagagttgtcctgggcttttggaactattattgaaatattgttattatgtcacagagaaaggagtgaaac 6603355  T
Q  366 atgtggttgaaaactgcacacaattgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  6603356 atgtggtagaaaactgcaaacaactgaga 6603384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 6602996 - 6603105
Alignment:
Q  3 tataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||   | |||||| ||||||||| ||    
T  6602996 tataccctcaattaaagtctctctatttaggtgacaatttatggttaagtgttcaaaaaatcataatgtttgcttcttctatccccagtttgcagctact 6603095  T
Q  103 tgatttgaat 112  Q
    ||||||||||    
T  6603096 tgatttgaat 6603105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9411622 - 9411556
Alignment:
Q  44 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9411622 tggttaagagataaaaacatcaaaaggtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 9411556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14802439 - 14802331
Alignment:
Q  208 acttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgc 307  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| |||||  ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  14802439 acttggaactaactttgaagttcccaagatggaagtgttgaatttgtcaaatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatttcaaagaattgttgt 14802340  T
Q  308 gggcttttg 316  Q
    || ||||||    
T  14802339 ggtcttttg 14802331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9411455 - 9411294
Alignment:
Q  211 tggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcggg 310  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||   |||   ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||     
T  9411455 tggattgaactttgaggttcccaagctggaggtgttgaacttgtcatatacaggtgttttcgatgaaatactctatgagatctcaaagaattgtcgtgga 9411356  T
Q  311 cttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggt 372  Q
    ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  9411355 cttttgcaactgttactgcaatgctgtcataatgtcagagataagggagtgatgcatgtggt 9411294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 388
Target Start/End: Original strand, 6586112 - 6586284
Alignment:
Q  214 aatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggctt 313  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||   ||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    |||||    
T  6586112 aatgaactttgtacttcccaagctagaggtgttggatttgtcaaaaacagatgttcatgatgaaacactctgtgcgatctcaaagatttgtcctaggctt 6586211  T
Q  314 ttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    ||| |||||| ||||  |  |||||||   |||||  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  6586212 ttggaactatcactgataggttgtgattgggtcac--agaaaggagtgaaagatgtggtgcaaaactgcaaacaa 6586284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 521 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19632200 - 19632133
Alignment:
Q  521 aaatgtgcatttactcatcagtctatggatgataattccccaagtaa--gtgtaatatttttatataa 586  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  19632200 aaatgttcatttactcatcaatctatgcatgataattcctcaattaatggtgtaatatttgtatataa 19632133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16566786 - 16566735
Alignment:
Q  407 cttctttactagtattttgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgtaag 458  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16566786 cttctttactagtattctgaaaatgttgtgatgaaagtttgaactctataag 16566735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10614903 - 10614474
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10614903 tgtataccctcaattaaagtctctctatttgggaaaaaatcagtggttaagcgatgaaggcattataaagtttgcttccaatttccccaatttgcaactg 10614804  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||| | ||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | |||  || ||    
T  10614803 cttgatttgaatcgttgcaatctcttatatgaaggtatttgtcaagttttaaggatatgttgtaagattaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaag 10614704  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||  | ||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10614703 tgaagctacttggaatgaacgttgttgttcccaatctggaggtgttgaacttgtcaaatacgaaggttaatgataaaacactctatgtgatctcgaagaa 10614604  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaa 400  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||     
T  10614603 ctgtagtgggcttttgcaactattacttgaactttctcataatgtcacagaagaaggagtgaaacatgtggtagaaaactgcatgcaattgagagagcat 10614504  T
Q  401 gatcgccttctttactagtattttgaaagt 430  Q
    |     |||||||||||||||| |||||||    
T  10614503 gggtatcttctttactagtattctgaaagt 10614474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 15091940 - 15092335
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||    ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  15091940 tgtataccctcaattaaagtctctctatttggctcacaattaccggttaagtgatgaaatcatcagaatacttgcttccattttccccaacttagagcta 15092039  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    |||||||||  |  |||| ||  ||||||| ||||| | | | |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| || | | ||||| ||| |    
T  15092040 cttgatttgggtcattgctataacatatctcaaggtatttctcaagttttaaggaaatgttataagcttaaacatttgaacttaactggatgtttaagtg 15092139  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15092140 tgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcagaaacaaaggttaatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 15092239  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15092240 ttgttgtgggcttttgcaactattacttgaattttgttataatgtcacagaagtgggagtgaaacatgtgctagaaaactgcacacaattgagaga 15092335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10169919 - 10170140
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  10169919 tgtataccctcaattgaagtctctctatttggcttacaatacatgggtaagggatgaacacatcataatgttttcttccatttttcctaatttgaagctg 10170018  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || || | ||||||||||    
T  10170019 tttgatttgaactcttgcaatcacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcatttaaatttagcccactgttcaagag 10170118  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactt 222  Q
    |||| ||||||| | |||||||    
T  10170119 tgaatctacttgaagtgaactt 10170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10177444 - 10177665
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  10177444 tgtataccctcaattgaagtctctctatttggcttacaatacatgggtaagggatgaacacatcataatgttttcttccatttttcctaatttgaagctg 10177543  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || || | ||||||||||    
T  10177544 tttgatttgaactcttgcaatcacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcatttaaatttagcccactgttcaagag 10177643  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactt 222  Q
    |||| ||||||| | |||||||    
T  10177644 tgaatctacttgaagtgaactt 10177665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 507 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 10614429 - 10614332
Alignment:
Q  507 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatcagtctatggatgataattccccaagta--agtgtaatatttttatataatgtacagtgtaatgct 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10614429 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatcagtctatgcatgataattgcctaagtaatagtttaatatttttatataatgtacagtgtaatgct 10614332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 393
Target Start/End: Original strand, 10170143 - 10170262
Alignment:
Q  274 taaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggtt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  || |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  10170143 taaaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaa 10170242  T
Q  374 gaaaactgcacacaattgag 393  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  10170243 gaaaactgctcacaactgag 10170262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 393
Target Start/End: Original strand, 10177668 - 10177787
Alignment:
Q  274 taaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggtt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  || |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  10177668 taaaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaa 10177767  T
Q  374 gaaaactgcacacaattgag 393  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  10177768 gaaaactgctcacaactgag 10177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 10167463 - 10167534
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtt 72  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  10167463 tgtataccctcaattgaagtctctctatttggcttacaatacatgggtaagggatgaacacatcataatgtt 10167534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7977745 - 7977670
Alignment:
Q  144 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaa 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||   |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  7977745 aagttttaaggagatgttgtaacattagacatttaaacctagcctgttgttcaagggtgaatctacgtggaatgaa 7977670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 458
Target Start/End: Original strand, 10170290 - 10170324
Alignment:
Q  424 tgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgtaag 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10170290 tgaaagtgttgtgctgaaagtttgaactctgtaag 10170324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 458
Target Start/End: Original strand, 10177815 - 10177849
Alignment:
Q  424 tgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgtaag 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10177815 tgaaagtgttgtgctgaaagtttgaactctgtaag 10177849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 540
Target Start/End: Original strand, 10170370 - 10170403
Alignment:
Q  507 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatca 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10170370 aaatgtcaacttacgaatgtgcatttactcatca 10170403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 540
Target Start/End: Original strand, 10177895 - 10177928
Alignment:
Q  507 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatca 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10177895 aaatgtcaacttacgaatgtgcatttactcatca 10177928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 388
Target Start/End: Original strand, 53761597 - 53761945
Alignment:
Q  44 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcag-------ctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggt 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||        || |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  53761597 tggttaagtgatgaaaacatcataacgtttgcatcaattttccccaatttgcaagttgcaactacttgatttaagttcttgcgatcgaatatctaaaggt 53761696  T
Q  137 gtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagc 236  Q
     | ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53761697 atttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttagccgagtgttcaagagtgaagctaattggaatgaactttgtagttcccaagc 53761796  T
Q  237 tggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattg 336  Q
    | |||| |||  | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||  || |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53761797 tagaggcgttgaacttgtcatttacgaaagttaacgataaaacactc--tgtgatctcgaagaattgtcgtgggcttttgcaa-tattactgaaacattg 53761893  T
Q  337 tgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53761894 tgataatgtcacggacaagggagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaa 53761945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 547220 - 546839
Alignment:
Q  7 ccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgat 106  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  547220 ccctcaattgaagtctctccatttggctaaaaattcatgcataagagatgaaagcatcaaaatgtttccttccatgttccccaatttgcaactgcttgat 547121  T
Q  107 ttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtga 203  Q
    || | || |||   |  ||||||| |||   || | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||| |  |||||    
T  547120 ttaagttattgtcgtaacatatctgaagacagtatttgtgatgttttaaggagatgttgtaagataaggcatttgaacttatccaattgtttagtagtga 547021  T
Q  204 agctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattg 303  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |  | ||||||  |||||  ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  547020 acctatttggaatgaactttgaagttcctaaattggaggtggtgaacttgtcacgtacaattgtcaatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttg 546921  T
Q  304 ttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcaca 385  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||||| | |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  546920 ttgtgggcttttggaattgttactggaagaatgttttcatgtcacagagaagggagtgaaacatgtgctagaaaactgcaca 546839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 397
Target Start/End: Original strand, 55908567 - 55908913
Alignment:
Q  54 atgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagtttt 150  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  || ||| ||  ||||||| |||   || | ||||||||| |    
T  55908567 atgaaaacatcatattgtttgcttccattttccccaatttgcaatttcttgatttgagctcctgccataacatatctgaagaaggtatttgtgaagttct 55908666  T
Q  151 aaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagat 250  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||  || || | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |  | ||||||||  |     
T  55908667 aaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttcctgaattagaggtgtttaac 55908766  T
Q  251 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 350  Q
    ||||||  ||||   ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||||| |    
T  55908767 ttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctggaaaattgtgatgaagtcacag 55908866  T
Q  351 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  55908867 agaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaactcagagaa 55908913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Original strand, 21834171 - 21834422
Alignment:
Q  5 taccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21834171 taccctcaattaaagtctctctttttgggccgcaattcatggttaaatgatgaaagaatcataatgtttgcttcaattttccccaatttacagctgcttg 21834270  T
Q  105 atttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaa 204  Q
    |||||| ||||| ||  |  |||||  ||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| |  ||||  | ||||||    
T  21834271 atttgacttcttccacacagatatcagaaggtatttgcgaagttttaaggaaatgttgtaagattaagcatttgaacttatcaggttgttataaagtgaa 21834370  T
Q  205 gctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtca 256  Q
    ||||| | | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21834371 gctacatagtatcaactttgtagttcccaagctggaggtgttggacttgtca 21834422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 644950 - 644746
Alignment:
Q  191 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 290  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| || | |||  ||    
T  644950 tgttcaagactgaagctacttacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttagacttgtcatttacaagagtttacgataaatca-tttatttga 644852  T
Q  291 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 390  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||| | |||  ||  ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  644851 tctcaaagagttgcagcgggcttgtgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacggagaaaggagtgaaacatgtggttgaaaaatgcacacaact 644752  T
Q  391 gagaga 396  Q
    ||||||    
T  644751 gagaga 644746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 570621 - 570269
Alignment:
Q  38 aatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||  |||||  |  ||     
T  570621 aatacatggttaagtgatgaaaacattttaatgtttgcttctattttccccaatttgcagatacttgatttaagttattgcaatcagatatccgatagta 570522  T
Q  138 tctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagct 237  Q
    | ||| ||||||||   ||||||| |||  |||||||||||||| || |  | || |||| |||||| || | |||| ||||||||| |||||  || ||    
T  570521 tttgtcaagtttta---agatgttgtaaacttaggcatttgaacttagctcactgctcaaaagtgaaactgcgtggattgaactttgaagttctcaaact 570425  T
Q  238 ggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgt 337  Q
     ||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| |  ||  |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  570424 cgaggtgttgaacttgtcatatacaggagttgataacgaagaactctatctgatttcaaagagttgtcgcgggcttttgcaactgttacttgagcattgt 570325  T
Q  338 gataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 393  Q
     || |||| ||  | |  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  570324 tattatgttactaaaagaggcgtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaactgag 570269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 641178 - 640830
Alignment:
Q  48 taagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagt 147  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||| |  |||  ||| | ||||| ||||  | | | ||||    
T  641178 taagagatgaaaacataataatgtttgcttccatgttcccaaatttacggttgcttgatttgagtgattgtgatcacgtatctgaaggaatttttcaagt 641079  T
Q  148 tttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgtta 247  Q
    |||||||| ||||| |||  |||| ||||||||| || |||  |||    |||| || |||||||||||||| |||| | | || |   ||||||||||     
T  641078 tttaaggatatgttgtaatgttagacatttgaacttagccggttgtgatggagtaaacctacttggaatgaaatttgaactaccaatattggaggtgttg 640979  T
Q  248 gatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtca 347  Q
     | ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  | || |||||||| || ||||||||| ||||| || |||| |    
T  640978 aacttgtcagatacaaacgttgatgatgaaacactctacgtgacctcaaagaattgccgtggtcttttgcatctgttactggaagattgtcattatgtaa 640879  T
Q  348 cggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  640878 caaagaagggagtgaatcatgtggtagaaaactgcaaagaattaagaga 640830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 388
Target Start/End: Original strand, 8184031 - 8184206
Alignment:
Q  213 gaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggct 312  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  8184031 gaatgaactttgaagttccgaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgatatagcactctatgcaatctcaaagagttgttgtgggct 8184130  T
Q  313 tttgcaactattactggaacattgtgataatg-tcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  8184131 tttggaactgttactggaaaattgtga-aatgatcacagatgagggagtgaagcatgtgctagaaaattgcacacaa 8184206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 397
Target Start/End: Original strand, 1548258 - 1548609
Alignment:
Q  47 ttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaa---aggtgtctgtg 143  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| | |||||||  |   |||| | ||||    
T  1548258 ttaagagatgaaaccatcaaaatattttcttcgattttccccaatttgcaactgcttgatttgattaattgcagtggcatatcagacgaaggtatttgtg 1548357  T
Q  144 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatc-cgaatgttcaagagtgaagctactt-ggaatgaactttgcagttccgaagctggag 241  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||| || |||||| || | || | ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| || ||||||    
T  1548358 aagttttaag---atgttgtaagattagacagttgaacttagctcgta-gtttaaaagtgaagctactttggactgaactttgaaattcccaaactggag 1548453  T
Q  242 gtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgata 341  Q
    |||||  | ||||||  |||||   |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||   ||| |||| | |    
T  1548454 gtgttgaacttgtcacatacaagtattgatgatgaaacactcaatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttgcacttgttacaaaaacgttgtaaaa 1548553  T
Q  342 atgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
    || |||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||| | ||| ||||||||    
T  1548554 atatcacagagaagggagtgaaacatatagaagaaaactgctcgcaactgagagaa 1548609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 397
Target Start/End: Original strand, 8186920 - 8187276
Alignment:
Q  44 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtct 140  Q
    ||||||||| |||||| | ||  ||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||  ||||||| |||   || | |    
T  8186920 tggttaagtaatgaaaacctcgaaatgttatcttccttattccccaatttgcagttgcttgatttgagtcattgctatgacatatctgaagaaggtattt 8187019  T
Q  141 gtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctgga 240  Q
    || ||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||| || || | ||| |||||||   |||    ||||||||||||| | || | || |||||    
T  8187020 gtcaagttttgaagagatgttgtgagattagggatttgaacttagcctactgtccaagagttgggctctccggaatgaactttgaaatttccaaactgga 8187119  T
Q  241 ggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgat 340  Q
    ||||||  | ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||  |    
T  8187120 ggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgataaaacactttatgcaatttcaaagagttgttgtgggcttttgcagttgttactggaaaattgtcgt 8187219  T
Q  341 aatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
    || ||||| | |||||||||||   |||||||  |||||||||| ||| ||| ||||    
T  8187220 aacgtcacagggaagggagtgatggatgtggtaaaaaactgcacgcaactgacagaa 8187276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1600671 - 1600444
Alignment:
Q  62 atcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagttttaaggagat 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||| |  ||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||    
T  1600671 atcataatgtttgcttccaattttcccaatttgcaactgcttgatttgagcagttgcattaacatatctgaagaaggtatttgtcaagttttaaggagat 1600572  T
Q  159 gttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatt 258  Q
     |||||| ||||| ||||||||| || || | ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||  | |||||||     
T  1600571 tttctaaaattagacatttgaacttagcccagtgttcaataatgaagctgcgaggaatgaactttgaagttcttaaactggaggtgttgaacttgtcata 1600472  T
Q  259 tacaaaagttgatgataaaacactctat 286  Q
    |||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  1600471 tacaagggttgacgatgaagcactctat 1600444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 553644 - 553402
Alignment:
Q  146 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 245  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||  |||||  || ||||||||||    
T  553644 gttttaaggacatgttgtaacattagacatttgaacttaacccgctgttcaagagtgaagttacgtacattgaactttaaagttctcaaactggaggtgt 553545  T
Q  246 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 345  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||  ||    |||||  | ||||    
T  553544 tgaacttgtcatttacaagagttgatgatgaagcacttaatgtgatttcaaagagttgttctgggcttttgcaactgttgttgttttattgtagtgatgt 553445  T
Q  346 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  553444 cacagataaaggagtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaa 553402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 566300 - 566103
Alignment:
Q  200 gtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaaga 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  || || ||   ||| ||||| |||| | |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  566300 gtgaagctacgtggaatgaactttgaagttctaaaacttgaaacgttggatttatcatgttcaagcgttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagt 566201  T
Q  300 attgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
    | ||| | ||||||||||| || | |||| || ||  | | ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  566200 actgtcgtgggcttttgcagctgtcactgcaatataatcaaaatgttacagagaagggagtgaaacacctggtggaaaactgcacacaactgagagaa 566103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 7225815 - 7226067
Alignment:
Q  144 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttc-cgaagctggagg 242  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||     |||||||||| ||||| ||||  ||||||    
T  7225815 aagttttacggagatgttgtaagattagacatttgaacttatcctactgtccaagagtgaagctacgcaacatgaactttgaagttctcgaa-ttggagg 7225913  T
Q  243 tgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataa 342  Q
    | ||  | ||||||  ||||| ||||||||| |||  |||   || ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||  | |    
T  7225914 tcttgaacttgtcacatacaagagttgatgacaaaggacttcgtgtgatatcaaagagttgttgtggacttttgcaactattactggaaagttgttttga 7226013  T
Q  343 tgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
     ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  7226014 ggtcaccgagaagggattgaagcacgtggtagaaaactgcaagcaactgagaga 7226067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 1524420 - 1524667
Alignment:
Q  146 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 245  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || | ||||| | | |  | || | |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  1524420 gttttaaggagatgttgtaaacttaggcatttgaacttagccaactgttctaaaatagaacttcatggaatgaactttgaagttcccaatttggaggtgt 1524519  T
Q  246 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 345  Q
    |  ||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||| ||   | | ||  | ||||    
T  1524520 tgaatttgtcacgtacaagtgttgatgatgaaacactctatatgatctcacagagttgtcgtgggcttttgcaactgttattg---cgtagttgttatgt 1524616  T
Q  346 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  1524617 cacagagaggggagtgaattatgtgatagaaaactgcacacaactgagaga 1524667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 369
Target Start/End: Original strand, 1552757 - 1552927
Alignment:
Q  202 gaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaat 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||  ||||||  || ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  1552757 gaagctacttggactgaactttgaaattcccaaactggaagtgttgaatttgtcacatacaaatattaatgatgaaacactcaatgtgatatcaaagaat 1552856  T
Q  302 tgttgcgggcttttgcaactattactggaacattg---tgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgt 369  Q
    ||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||   | || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1552857 tgtcgtgggcttttgcagctgttactagaacaatgtaattattatgtcaccgagaagggagtgaagcatgt 1552927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 570847 - 570723
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat---aatgtttgcttccattttccccaatttgcag 97  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  570847 tgtatgccctcaattgaagtctctatccttggctcacaatacatggttaagtgatgaaaacattattataatgtttgcttccattttccccaatttgcaa 570748  T
Q  98 ctgcttgatttgaattcttgcaatc 122  Q
    || |||||||| | || ||||||||    
T  570747 ctacttgatttaagttattgcaatc 570723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 396
Target Start/End: Original strand, 1513407 - 1513588
Alignment:
Q  212 ggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggc 311  Q
    ||||||||||||| |||||| || || || |||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||  |||| | ||||    
T  1513407 ggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatttacaaatgttgatgatgaaacactctacgtaatctcaaagtgttgtcgtgggc 1513506  T
Q  312 ttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    ||||||||||  ||||| ||  |||   || |||||| |||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||| |||||||    
T  1513507 ttttgcaactcatactgaaaggttg---tattgtcacagagatgggagtgaagcttgtgctagaaaaatgcacacaactgagaga 1513588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 1537757 - 1537939
Alignment:
Q  202 gaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaat 301  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| || || || |||||  | ||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||  |    
T  1537757 gaagctgcatggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttaatgacaaaacactgtgtgtaatctcaaagtgt 1537856  T
Q  302 tgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcac 384  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||  |||||||||||||  ||||| | ||||| |||||    
T  1537857 tgtcgtgggcttttgcaacttttactggaactttgttatcttgtcacacagaagggagtgaagtatgtgctagaaaaatgcac 1537939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 388
Target Start/End: Original strand, 12121282 - 12121633
Alignment:
Q  40 tacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggt 136  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||  |||||||    |||||    
T  12121282 tacatggttacaagatgaaagcatcaaaaggattgcttccgttttccccaatttgcaattgcttgatttgagtttttgctataacatatctgaagaaggt 12121381  T
Q  137 gtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagc 236  Q
     | |   |||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||   |||| | ||  |||||| |   |||||||||||| |||||| || |    
T  12121382 attttccaagtcttaaggacatgttccgagattacgcatttgaacttaaccagttgtttaggaaggaagctgcgccgaatgaactttgaagttcccaaac 12121481  T
Q  237 tggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattg 336  Q
    | || |||||  | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |  |||||||||  |||  | |||||||||||||| | |||||||   ||    
T  12121482 tagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaaacactctccgtaatctcaaagtgttgccgtgggcttttgcaactctcactggaatggtg 12121581  T
Q  337 tgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
       |  |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12121582 cttttttgtcacagagatgggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacacaa 12121633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 388
Target Start/End: Original strand, 55505070 - 55505281
Alignment:
Q  174 atttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatga 273  Q
    ||||||||||| || | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||  | || ||||||||  | ||||||| |||||| ||||| ||    
T  55505070 atttgaacctagcctactgttcaacagtgaacctaattggaatgaactttagagtcccccaactagaggtgttgaacttgtcatatacaaaggttgacga 55505169  T
Q  274 taaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggtt 373  Q
    |  |||||| |||| || ||||||||||||| | || ||||||||  | ||| || || || | |   ||||||| ||||||||||||||||| ||| |     
T  55505170 tggaacactttatgtgacctcaaagaattgtcgtggacttttgcatttgttattgaaaaatagcg---atgtcacagagaagggagtgaaacacgtgtta 55505266  T
Q  374 gaaaactgcacacaa 388  Q
    |||||||||||||||    
T  55505267 gaaaactgcacacaa 55505281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 532307 - 532196
Alignment:
Q  193 ttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatc 292  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  | ||||||| ||||||  |||||||| |||  || |||| || |    
T  532307 ttcaagagtgaatctacttggaatgaactttgaagtccccaagctagaggtgttgaacttgtcatatacaaacattgatgatgaaaagctttatgtgacc 532208  T
Q  293 tcaaagaattgt 304  Q
    ||||||||||||    
T  532207 tcaaagaattgt 532196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 371226 - 370843
Alignment:
Q  8 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||  | | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||    
T  371226 cctcaattaaaatctctctatttggctcacaattcatggttaagagatgaataccttataatgtttgcttcaattttcctgaatttgcagctaattggtt 371127  T
Q  108 tgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaa 204  Q
    |||  | |||  ||  |||||||   ||  || |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || || | || |||||||||||    
T  371126 tgagctattgtgataacatatctgacaacagtatctgtcgagttttaaatagatggtctaagattaggcatttgaacttagcccactgctcaagagtgaa 371027  T
Q  205 gctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgtt-agatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattg 303  Q
    | |   ||| |||||| ||  |||||  || || |||||||| || ||  | |  ||||| |||  || || || ||||  ||| ||||||||||| |||    
T  371026 gttgtatggtatgaacattagagttctcaaacttgaggtgttgagcttaat-agatacaagagtctattatgaagcacttcatgtgatctcaaagagttg 370928  T
Q  304 ttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || |||||||   | ||||  ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  370927 ttgtcggcttttgcaactattactgcaaaattgtgaaggtatcacaaagatgggagtgaagcatgtggtgaaaaactgcacacaa 370843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 381
Target Start/End: Original strand, 1495926 - 1496088
Alignment:
Q  219 actttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgca 318  Q
    |||||| |||||| || ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||| |  |||||| ||  ||||||||||||||| | ||  |||||||    
T  1495926 actttgaagttcctaacctcaaggtgttggatttgtcaatgacaaaagttaacgatgacgcactctttgtaatctcaaagaattgtcgtggaattttgca 1496025  T
Q  319 actattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactg 381  Q
    || |||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  1496026 acaattactggaaaattgtcatgatatcacagagaagggagttaggcatgtggtagagaactg 1496088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 381
Target Start/End: Original strand, 1517574 - 1517665
Alignment:
Q  290 atctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactg 381  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  1517574 atctcaaagaattgtcgtggaattttgaaactattactggaaaattgtcatgatgtcacagagaagggagttaggcatgtggtagagaactg 1517665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Original strand, 3438404 - 3438684
Alignment:
Q  53 gatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggtgtctgtgaagttt 149  Q
    ||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||| |   |||||||    |||||||   | ||||||    
T  3438404 gatgaaagcctcttgatgttttcttctattttccccaatttgcagctgcttgatgtgagagaatgcgactacatatctgacgaaggtgttattcaagttt 3438503  T
Q  150 taaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttaga 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |  |||| | |||||||  |   || |||||||||||  ||| | ||  ||||||| ||       
T  3438504 taaggagatgttgtaagattagacatttgaacttagctggttgtttaggagtgaatttgtgtgcaatgaactttgatgtttcaaaattggaggtattgag 3438603  T
Q  250 tttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaa 331  Q
     ||||||  ||||| |||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3438604 cttgtcacatacaagagttgatgat-aaatactccatgtaatctcaaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactggaa 3438684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 532454 - 532404
Alignment:
Q  43 atggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaattt 93  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  532454 atggttgagagatgaaagcattataatgtttgcatccattttccccaattt 532404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 388
Target Start/End: Original strand, 1489457 - 1489537
Alignment:
Q  308 gggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  1489457 gggcttttgcaactcttactggaagggtgttttaatgtcacagagaagggagtgaagcatgtgctagaaaaatgcgcacaa 1489537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7307957 - 7307778
Alignment:
Q  214 aatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggctt 313  Q
    ||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||  | ||||||| |||| ||||||||||| || ||||   |  ||||||||||| ||||||  |||||    
T  7307957 aatgaactttaaagttcccaaattggaggtattgaacttgtcatatacagaagttgatgatgaagcactacgtatgatctcaaagagttgttgtaggctt 7307858  T
Q  314 ttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 393  Q
    ||||| || |||||||||  ||||  || |||||||  ||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  7307857 ttgcacctgttactggaaggttgttttattgtcacgatgactggattgaagcatgtggtagaaaactgcacgcaactgag 7307778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 538
Target Start/End: Original strand, 21834598 - 21834627
Alignment:
Q  509 atgtcaacttacaaatgtgcatttactcat 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21834598 atgtcaacttacaaatgtgcatttactcat 21834627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 19468288 - 19468686
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19468288 tgtattccctcaattaaagtatctctacttggctgagaattcatggttaagcgatgaaaacatcataatgtttgcttccatttttcccaatttgcagctg 19468387  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||  ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  19468388 cttgatttgaactcatgcaaccacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcatttaaacttagcccactgttcaagag 19468487  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19468488 tgaatctacttggagtgaactttgtagttcccaagctggaggtgttgaagttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactttatgtgatctcaaagaa 19468587  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaaca 399  Q
     ||||| || |||||| || ||||  ||||   |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  19468588 ctgttgtggacttttggaattatttgtggacggttgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaagaaaattgctcacaactgagagaaca 19468686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9581375 - 9581276
Alignment:
Q  7 ccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgat 106  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| | |||  ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9581375 ccctcaattaaagtctcttgatttgggtcacaatcaatgtttaagagataaaaacatcataatgtttgcttcaattttccccaatttgcagctgcttgat 9581276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9586907 - 9586844
Alignment:
Q  43 atggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgat 106  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9586907 atggttaagagataaaaacatcataatgtttgcttcaattttccccaatttgcagctgcttgat 9586844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7554533 - 7554415
Alignment:
Q  266 gttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaac 365  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| | || ||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  7554533 gttgatgatgaagcactctatatgatctcaaagagttgtggtggacttttacaactgttactgaaaggatgtgataatgtcacagaaaagggagtgaagc 7554434  T
Q  366 atgtggttgaaaactgcac 384  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  7554433 atgtggtagaaaactgcac 7554415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 384
Target Start/End: Original strand, 29658935 - 29659068
Alignment:
Q  251 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 350  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||   || |||| || |||||| || ||||||||| | |||||||||  ||||   |||||||| |    
T  29658935 ttgtcatataccaaagttgatgataaagcactccatatcatatcaacgagttgttgtggccttttgcaattgttactggaatgttgtacgaatgtcacag 29659034  T
Q  351 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcac 384  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29659035 agaatggagtaaaacatgtggttcaaaactgcac 29659068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 383
Target Start/End: Original strand, 29718962 - 29719094
Alignment:
Q  251 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 350  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||   || |||| || |||||| || ||||||||| | |||||||||  ||||   |||||||| |    
T  29718962 ttgtcatataccaacgttgatgataaatcactccatatcatatcaacgagttgttgtggccttttgcaattgttactggaaagttgtatgaatgtcacag 29719061  T
Q  351 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgca 383  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29719062 agaatggagtgaaacatgtggttcaaaactgca 29719094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 458
Target Start/End: Original strand, 19468709 - 19468743
Alignment:
Q  424 tgaaagtgctgtgctgaaagtttgaactctgtaag 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19468709 tgaaagtgttgtgctgaaagtttgaactctgtaag 19468743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Original strand, 29658811 - 29658860
Alignment:
Q  61 catcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  29658811 catcatattgtttgcttccattttccccaacttggaagtgcttgatttga 29658860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 29691334 - 29691375
Alignment:
Q  69 tgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  29691334 tgtttgcttccattttccccaacttggaggtgcttgatttga 29691375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 29718846 - 29718887
Alignment:
Q  69 tgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  29718846 tgtttgcttccattttccccaacttggaggtgcttgatttga 29718887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30827368 - 30827311
Alignment:
Q  53 gatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30827368 gatgaaaacatcctattgtttacttctattttccccaatttggaggtgcttgatttga 30827311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 20477871 - 20478266
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |      
T  20477871 tgtatatcctcgattgaagtctctctacttgggtcataatccatggttaagtgatgaaataataataatatttgcttctatgttccccaatttgcaacat 20477970  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 200  Q
    ||||||||   ||  |||||||| |||||| ||| | | ||| || | |||| |||||||| |||| | |||||||||||| || | | ||||  |||||    
T  20477971 cttgattttccttggtgcaatcgtatatctgaagatatttgtcaattcttaacgagatgttgtaagttaaggcatttgaacttagctggatgtcgaagag 20478070  T
Q  201 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 300  Q
     ||||||||||||||| ||| ||| | ||||  |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | | || |||||||| |||    
T  20478071 cgaagctacttggaataaacgttgtaattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgacgaaacattatctgtgatctcaaggaa 20478170  T
Q  301 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||   ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  20478171 ttgttgtgggcttttgcaaatactactgaaaaattgcgataatgtcacaatgaaaggagcgaaacatgtcgtagaaaactgcacacaactgagaga 20478266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 41889375 - 41889714
Alignment:
Q  36 aaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaa--- 132  Q
    ||||| ||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||   |||||||| | |       
T  41889375 aaaatccatggttatcagatgaagacatcataatgtttgcttccattttccctaatttgcagctacttgatttgagcaattgttgtcgcatatttgatga 41889474  T
Q  133 aggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccg 232  Q
    |||| |   | |||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  41889475 aggtattactcaagttttaaggatatgttgtaacattagatatttgaacttatccggatgttcaatagtgaagctacttgaaatgaactttaaagttccc 41889574  T
Q  233 aagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaac 332  Q
    ||  ||||||||||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||  ||     
T  41889575 aaattggaggtgttgaacttatcatatacaaaagttgatgatgaaacactttataagatctcaaagagttgttgcgggctttcgaaattgttacttaaaa 41889674  T
Q  333 attgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggt 372  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41889675 attgttatgatgtcacaaagaagggagtgaatcatgtggt 41889714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 394
Target Start/End: Original strand, 41901375 - 41901717
Alignment:
Q  52 tgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagtt 148  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||   |||||||| | |||   || |   | |||||    
T  41901375 tgatgaagacatcacaatgttcgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgagcaattgttgtcgcatatttgaagaaggtattgttcaagtt 41901474  T
Q  149 ttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttag 248  Q
    |||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |||||  |||   | |||  |||||| |||||| || |||||||||||      
T  41901475 ttaaggatgtgttgtaacattagacatttgaacttatccaagtgttccatagtgagacta---gaaatagactttgaagttcccaaactggaggtgttga 41901571  T
Q  249 atttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcac 348  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||||| || |||||| || | | |||  || ||||| || |||||||    
T  41901572 acttgtcatatacaaaagttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtggacttttgaaattgtcacttcaagattgtaatgatgtcac 41901671  T
Q  349 ggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 394  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  41901672 aaagaagggagtgaagcatgtggtagaaaactgtacgcaattgaga 41901717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28525314 - 28525098
Alignment:
Q  8 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 107  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||    
T  28525314 cctcaattaaagtctctcaatttgtgtgacaattcatggttaagggacgaaaatatcataaggtttgcttccattttccacaatttggaggtgcttaatt 28525215  T
Q  108 tgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagct 207  Q
    || |   ||| || | |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||  | | ||||||| | ||||||     
T  28525214 tggaccattgtaagcacatatctaaatgtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaagatgagggatttgaaattaagcaactgttcaataatgaagcc 28525115  T
Q  208 acttggaatgaactttg 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28525114 acttggaatcaactttg 28525098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32267714 - 32267402
Alignment:
Q  72 ttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagat 168  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||   |||||||||| |||   || ||  | || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  32267714 ttgcttccatcttctccaatttgcagctgcttgatttgagcaattgttgtcgcatatctgaagaaggtatcgttcaatttttaaggatatgttgtaacat 32267615  T
Q  169 taggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagtt 268  Q
    ||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||   | ||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||  | ||||||   |||| ||||    
T  32267614 tagacatttgaacttatcccagtgttcaacagtgaaacta---gaaatgaactttgaagttcccaaattggaggtattgaacttgtcacaaacaatagtt 32267518  T
Q  269 gatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatg 368  Q
    |||||| || |||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||| || | | |||  || ||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||    
T  32267517 gatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttaaaaattgtaatgatatcacaaagaagggagtgaagcatg 32267418  T
Q  369 tggttgaaaactgcac 384  Q
    | || |||||||||||    
T  32267417 tagtagaaaactgcac 32267402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37938052 - 37937826
Alignment:
Q  146 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||  | |||  ||||| |||  |||||| |||||| || || |||||||    
T  37938052 gttttaaggagatgtcctaagattaggcatttaaacctaaccaactgttcgagtcttaagtcacttgaaatcgactttgaagttcccaaccttgaggtgt 37937953  T
Q  246 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 345  Q
    | || ||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||| | ||||||||||||||    ||| ||| ||||   |||||    
T  37937952 tggacttgacacatacaagaattgatgatcaaacactctatgtaatctcaaagatgtgtcgtgggcttttgcaactcacgctgcaactttgtacgaatgt 37937853  T
Q  346 cacggagaagggagtgaaacatgtggt 372  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  37937852 caccgagaagggagtgatgcatgtggt 37937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17205600 - 17205514
Alignment:
Q  310 gcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  17205600 gcttttgcatctaatactggaacattgtaatgatgtcacagaaaaaggattgaaacatgtggtagaaaactgcataaatttgagaga 17205514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 385
Target Start/End: Original strand, 38267562 - 38267729
Alignment:
Q  218 aactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgc 317  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||| || ||| ||  ||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||  ||  | |||||||||     
T  38267562 aactttgaagttcccaaccttgaggtgttggacttgacacatacaagagttgatgatgacacactctatgtaatctcaaagacgtgccgtgggcttttga 38267661  T
Q  318 aactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcaca 385  Q
    |||| |  ||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  38267662 aactgtcgctgcaactttgtacgaatgtcaccgagaagggagtgatgcatgtggtcaaaaactgcaca 38267729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 397
Target Start/End: Original strand, 1037503 - 1037849
Alignment:
Q  54 atgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagtttt 150  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  || ||| ||  ||||||| |||   || | |||||||||||    
T  1037503 atgaaaacatcatattgtttgcttccattttccccaatttgcaatttcttgatttgagctcctgccataacatatctgaagaaggtatttgtgaagtttt 1037602  T
Q  151 aaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagat 250  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||  || || | | |||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |  | ||||||||  |     
T  1037603 aaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactattcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttcctgaattagaggtgtttaac 1037702  T
Q  251 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 350  Q
    ||||||  ||||   ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||||| |    
T  1037703 ttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctggaaaattgtgatgaagtcacag 1037802  T
Q  351 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 397  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  1037803 agaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaactcagagaa 1037849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Original strand, 45245019 - 45245261
Alignment:
Q  146 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 245  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||      ||||||||| || |  ||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||    
T  45245019 gttttaaggagatgttgtaacattaggcatttaaacttagtttgctgttcaagactggaattacgtggaataaactttgaagttccaaaacttgaggtgt 45245118  T
Q  246 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 345  Q
    |  ||||||||   ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || | ||| || ||||    
T  45245119 tgaatttgtcagagacaatggttgatgatgaaacactccatgtgatctcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattattgaaaaaatgttatcatgt 45245218  T
Q  346 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45245219 cacagataagggagtgaaacatgtggtagaaaattgcacacaa 45245261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Original strand, 32785604 - 32785670
Alignment:
Q  44 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 110  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  32785604 tggttaagagatgaaagcatcaggatgttttcttctattttttccaatttgcaactacttgatttga 32785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 540
Target Start/End: Original strand, 1038297 - 1038330
Alignment:
Q  507 aaatgtcaacttacaaatgtgcatttactcatca 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1038297 aaatgtcaacttacaaatgtgtatttactcatca 1038330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 393
Target Start/End: Original strand, 34936034 - 34936344
Alignment:
Q  86 cccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaa---aggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacc 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||| | ||||||||||   |||| | | | | |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||     
T  34936034 cccaatttgcatctgcttgatttgagcgattgcagtggcatatctaatcaaggtatttatcatgttttaaggagatgttgtgacattagacatttgtact 34936133  T
Q  183 tatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacact 282  Q
    |  |||| ||||||| |||||| || |   |||||| |||||  ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34936134 tggccgattgttcaaaagtgaaccttcacagaatgatctttgatgttccaaaactagaggtgttggacttgtcatatacaagagttgatgataaaacact 34936233  T
Q  283 ctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgc 382  Q
    |||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||    
T  34936234 ctatgccatcgcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattacttcaaaattgttgtgatgtcacggagaagggagttgagcgtgtggttgaaaattgc 34936333  T
Q  383 acacaattgag 393  Q
    |||||||||||    
T  34936334 acacaattgag 34936344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 388
Target Start/End: Original strand, 18315100 - 18315449
Alignment:
Q  42 catggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgt 138  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| ||  |||| || |||   || |    
T  18315100 catggttaagagaggaaagcatcaaaatattttcttccattttccccaatttgcagttgcttgatttgagctactgcgataacatacctgaagaaggtat 18315199  T
Q  139 ctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctg 238  Q
     ||| |||||||| | || |||||| ||||||| || |||||| || |      ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||    
T  18315200 ttgtcaagttttacgaagttgttctgagattagacagttgaacttagctcgtgattcaagaatgaagctacgtggaatgaactttaaagttcccaaactg 18315299  T
Q  239 gaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtg 338  Q
    ||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  |||     
T  18315300 gaggtgttgaacttgtcacatacaaaagttgatgatgaagcactctatgtgatctcaaagagttgtcgtaggcttttgcaactgttattggaacgctgtt 18315399  T
Q  339 ataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
     | ||||||| ||||| ||||  ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  18315400 gtgatgtcacagagaaaggagaaaagtatgtggtagaaaactgcacacaa 18315449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 396
Target Start/End: Original strand, 28246274 - 28246477
Alignment:
Q  191 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 290  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||    
T  28246274 tgttcaagactgaagctacatacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttga--ataaatcactctattgga 28246371  T
Q  291 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 390  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||  ||  ||||||   |||||| || ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  28246372 tctcaaagagttgtagcgggcttttgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacagacaaatgagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaact 28246471  T
Q  391 gagaga 396  Q
    ||||||    
T  28246472 gagaga 28246477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 17636183 - 17636581
Alignment:
Q  1 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || ||  | | ||| |||||||||| ||||||||| |||||| | | | | |||||||||||||||||||||||    
T  17636183 tgtaaaccctcaatttaagtctctccatttgccttacaattcatggttaagagatgaaagcctcataaagctcgataccattttccccaatttgcagctg 17636282  T
Q  101 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatc---taaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaa 197  Q
    ||||||||      |||||||   |||||    |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |  ||||||||    
T  17636283 cttgatttacgagattgcaataaaatatcagagaaaggtatttgtcaagttttaaggggatgttctaatattaggcatttgaacttaggccgatgttcaa 17636382  T
Q  198 gagtgaagctac----ttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatct 293  Q
    ||||||| ||||     | |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||  | ||||||   |||  |||||| ||| || || | |||| |||||    
T  17636383 gagtgaaactacatcgatcgaatgaactttgaagttcccaaattggaggtgttgaacttgtcacaaacaggagttgacgatgaagcattgtatgtgatct 17636482  T
Q  294 caaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 393  Q
    |||||| ||||    | ||||||||| | | ||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17636483 caaagagttgtcttagacttttgcaattgtcacttgaatattgtgttaatgtcac-gagaaaggagtgaggcatgtgctagaaaattgcacacaattgag 17636581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27922672 - 27922425
Alignment:
Q  144 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggt 243  Q
    |||||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||| |||   | ||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  27922672 aagttttagggatatgctgtaacattagacatttgaacttatccaagtgttcaatggtgaaacta---gaaatgaactttgaagttcccaaattggaggt 27922576  T
Q  244 gttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataat 343  Q
    |||  | ||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||| || | | ||| ||| ||||| || ||    
T  27922575 gttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttgaaaattgtaatgat 27922476  T
Q  344 gtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 394  Q
     ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  27922475 ttcacaaagaagggagtgaaccatgtggtagaaaactgcactcaactgaga 27922425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32151551 - 32151242
Alignment:
Q  61 catcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtg---tctgtgaagttttaaggaga 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||| ||  ||||||| |||  |   | ||| ||||||||||   |    
T  32151551 catcaaaatgtttgcttccattttccctaatttgcaactgcttgatttgaggtgttgccataacatatctgaagaaggaatttgtcaagttttaag---a 32151455  T
Q  158 tgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcat 257  Q
    || ||| ||||||||||||||||  |  |||  |||| |   |||||||| | |||||||||||| | |||| | || |||||||||||| | |||||||    
T  32151454 tgctctgagattaggcatttgaatttcaccggctgtttacatgtgaagctgcgtggaatgaacttcgaagtttccaatctggaggtgttaaacttgtcat 32151355  T
Q  258 ttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaaggg 357  Q
     |||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||    |||| |  ||||||| ||||||||    
T  32151354 gtacaaggtttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgttattggtgtcttgtaaatatgtcacagagaaggg 32151255  T
Q  358 agtgaaacatgtg 370  Q
     ||||| ||||||    
T  32151254 ggtgaagcatgtg 32151242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 17627851 - 17627952
Alignment:
Q  7 ccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgat 106  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |   ||| ||| | || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17627851 ccctcaattaaaatctctctatttggctttcaattcattgctatgcgatgaaaacatcaaaatgtttgcttccattttccccaatttgcaactgcttgat 17627950  T
Q  107 tt 108  Q
    ||    
T  17627951 tt 17627952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 387
Target Start/End: Original strand, 17628067 - 17628189
Alignment:
Q  265 agttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaa 364  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||  |||| |   |||||| || |||||||||||     
T  17628067 agttgatgataaagcactccgtgtgatctcaaagaattgttttgggctcttgaaactattactagaattttgtaaaggtgtcacagacaagggagtgaag 17628166  T
Q  365 catgtggttgaaaactgcacaca 387  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  17628167 catgtgttgaaaaactgcacaca 17628189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21235658 - 21235476
Alignment:
Q  211 tggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcggg 310  Q
    |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| |  ||  |||||||  ||| |||||||  ||| || ||    
T  21235658 tggagtgaactttgaagttcccaaactggaggtgttgaacttgtcatatacaggagttgataacgaagaactctatttgatttcaaagagctgtcgcagg 21235559  T
Q  311 cttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 393  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||  | |  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21235558 cttttgcaactgttacttgagcattgttattatgtcactaaaagaggcgtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaactgag 21235476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 560
Target Start/End: Original strand, 17643925 - 17643975
Alignment:
Q  510 tgtcaacttacaaatgtgcatttactcatcagtctatggatgataattccc 560  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17643925 tgtctacttacaaatgggtatttactcatcaatctatgcatgataattccc 17643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 388
Target Start/End: Original strand, 552 - 800
Alignment:
Q  140 tgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctgg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||  || || | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |  | |    
T  552 tgtgaagttctaaggagatgttgtaaggctagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttcctgaattag 651  T
Q  240 aggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtga 339  Q
    |||||||  | ||||||  |||||  || |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  652 aggtgtttaacttgtcacatacaagtgtcgatgatgaaacactctatatgatctcgaagaattgttgtgggctattacaactgttactggaaaattgtga 751  T
Q  340 taatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
    | | ||||  ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  752 tgaagtcatagagaatggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacaa 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 388
Target Start/End: Original strand, 1396 - 1643
Alignment:
Q  144 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggt 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||   ||||||   ||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1396 aagttttaaggagatgttataagattagacatttgaacttagcctggtgttcatctgtggacctatttgaaatgaactttgtagttcctaagctagaggt 1495  T
Q  244 gttagatttgtcatttacaaaagttgatgataa---aacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgat 340  Q
    ||| || ||||||  |||||| ||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||  ||||  | ||||||||    
T  1496 gttggacttgtcaaatacaaatgttgatgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgttcagggattttggaactaagactgataaattgtgat 1595  T
Q  341 aatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 388  Q
       ||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  1596 tgggtcatagagaaaggagtgaaagatgtcgtggaaaactgcaaacaa 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39240 - 39099
Alignment:
Q  255 catttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaa 354  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||| | |||  |  ||||||   |||    
T  39240 catttacaaaggttaatgatgaaacactttatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttgcacctgatactggaaaaatgttctcgtgtcacaatgaa 39141  T
Q  355 gggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 396  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  39140 gggagtgaaacatgtggtaaacaactgcacgcaactgagaga 39099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University