View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11614_low_9 (Length: 589)

Name: NF11614_low_9
Description: NF11614
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11614_low_9
NF11614_low_9
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (234-573)||(35178703-35179051)
chr1 (1-222)||(38046372-38046593)
chr1 (1-222)||(14173696-14173917)
chr1 (2-222)||(36909609-36909829)
chr1 (1-222)||(6435819-6436040)
chr1 (1-222)||(13972971-13973192)
chr1 (1-222)||(49926318-49926539)
chr1 (1-222)||(24270301-24270522)
chr1 (1-222)||(49396751-49396972)
chr1 (1-222)||(35586869-35587088)
chr1 (1-222)||(37778126-37778347)
chr1 (1-222)||(23342688-23342909)
chr1 (1-222)||(35185017-35185239)
chr1 (1-222)||(17686299-17686520)
chr1 (6-222)||(41780745-41780961)
chr1 (1-160)||(39856906-39857065)
chr1 (1-180)||(18170072-18170251)
chr1 (1-160)||(35576386-35576545)
chr1 (5-160)||(39224197-39224352)
chr1 (1-160)||(45689166-45689325)
chr1 (1-160)||(49427434-49427593)
chr1 (1-163)||(21484640-21484802)
chr1 (1-160)||(12791273-12791432)
chr1 (1-160)||(13635297-13635456)
chr1 (1-160)||(29436020-29436179)
chr1 (1-163)||(3658520-3658682)
chr1 (1-159)||(42571777-42571935)
chr1 (1-160)||(50068259-50068418)
chr1 (5-170)||(17697097-17697262)
chr1 (1-160)||(46180280-46180440)
chr1 (5-160)||(27035318-27035473)
chr1 (1-160)||(27486690-27486849)
chr1 (1-160)||(29762221-29762380)
chr1 (1-160)||(44597748-44597907)
chr1 (1-160)||(51269849-51270008)
chr1 (1-222)||(19160364-19160582)
chr1 (13-222)||(17372786-17372992)
chr1 (1-140)||(35526197-35526336)
chr1 (1-160)||(44337319-44337478)
chr1 (1-160)||(47488037-47488196)
chr1 (1-160)||(48215245-48215404)
chr1 (1-160)||(48568404-48568563)
chr1 (1-222)||(24363742-24363959)
chr1 (1-160)||(41874884-41875043)
chr1 (1-160)||(49262988-49263147)
chr1 (1-222)||(13283752-13283969)
chr1 (6-123)||(18842491-18842608)
chr1 (5-160)||(30309832-30309981)
chr1 (74-222)||(40533224-40533372)
chr1 (6-170)||(5765258-5765422)
chr1 (1-114)||(49598921-49599033)
chr1 (1-85)||(13148366-13148450)
chr1 (265-380)||(35182800-35182916)
chr1 (80-157)||(29707544-29707621)
chr1 (1-170)||(16532080-16532249)
chr1 (451-573)||(35182672-35182794)
chr1 (6-115)||(16081337-16081446)
chr1 (166-222)||(35526135-35526191)
chr1 (185-222)||(22527735-22527772)
chr1 (56-140)||(19262433-19262517)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (1-222)||(55206821-55207042)
chr3 (1-222)||(46414271-46414492)
chr3 (6-222)||(2428553-2428769)
chr3 (1-222)||(41803963-41804184)
chr3 (1-222)||(51013215-51013436)
chr3 (1-222)||(34472013-34472234)
chr3 (1-222)||(41577967-41578188)
chr3 (5-219)||(51015342-51015556)
chr3 (1-222)||(42323326-42323547)
chr3 (1-219)||(34647207-34647425)
chr3 (1-222)||(52569346-52569566)
chr3 (1-222)||(45100402-45100623)
chr3 (2-222)||(14631507-14631727)
chr3 (1-222)||(30192599-30192820)
chr3 (2-222)||(49273461-49273681)
chr3 (1-222)||(7246155-7246376)
chr3 (5-222)||(37281517-37281734)
chr3 (1-222)||(43569971-43570192)
chr3 (1-160)||(13895869-13896028)
chr3 (5-222)||(7954269-7954486)
chr3 (1-160)||(19453228-19453387)
chr3 (39-222)||(46346549-46346732)
chr3 (1-159)||(48087552-48087710)
chr3 (1-160)||(2646875-2647034)
chr3 (1-160)||(44927524-44927683)
chr3 (1-222)||(3494969-3495187)
chr3 (1-171)||(47759879-47760049)
chr3 (3-160)||(34693289-34693446)
chr3 (1-195)||(10053239-10053429)
chr3 (1-160)||(24702271-24702429)
chr3 (1-160)||(39416947-39417106)
chr3 (1-222)||(36721326-36721547)
chr3 (1-160)||(4004086-4004245)
chr3 (1-160)||(34049788-34049947)
chr3 (1-160)||(42382332-42382491)
chr3 (1-160)||(42383112-42383271)
chr3 (1-160)||(46403064-46403223)
chr3 (1-160)||(49140053-49140212)
chr3 (5-160)||(50997453-50997608)
chr3 (1-160)||(54390503-54390662)
chr3 (1-222)||(2268434-2268652)
chr3 (1-159)||(43477118-43477276)
chr3 (4-222)||(36135071-36135286)
chr3 (1-160)||(49218735-49218894)
chr3 (1-160)||(49610550-49610709)
chr3 (1-159)||(6464345-6464503)
chr3 (2-160)||(42950019-42950177)
chr3 (1-195)||(50458655-50458849)
chr3 (8-160)||(51695605-51695757)
chr3 (1-160)||(47065748-47065907)
chr3 (1-159)||(25576592-25576749)
chr3 (1-170)||(774327-774496)
chr3 (1-129)||(27187009-27187137)
chr3 (1-160)||(53826695-53826854)
chr3 (1-222)||(6754265-6754484)
chr3 (1-222)||(33449092-33449297)
chr3 (1-170)||(8633348-8633517)
chr3 (1-160)||(44835486-44835645)
chr3 (1-122)||(20375919-20376040)
chr3 (68-163)||(18440873-18440968)
chr3 (68-163)||(19485947-19486042)
chr3 (6-123)||(14265474-14265588)
chr3 (1-123)||(25887647-25887768)
chr3 (147-222)||(37282039-37282114)
chr3 (168-222)||(55268797-55268851)
chr3 (147-222)||(36720946-36721021)
chr3 (185-222)||(4004027-4004064)
chr3 (56-140)||(17267314-17267398)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-222)||(35491686-35491907)
chr2 (1-222)||(41499028-41499249)
chr2 (1-222)||(27130443-27130664)
chr2 (1-222)||(34521618-34521839)
chr2 (1-222)||(2919299-2919520)
chr2 (5-222)||(6976891-6977108)
chr2 (1-222)||(19471568-19471789)
chr2 (1-222)||(37312429-37312650)
chr2 (4-222)||(40677309-40677527)
chr2 (1-222)||(10364572-10364792)
chr2 (1-160)||(3941788-3941947)
chr2 (1-160)||(5420520-5420679)
chr2 (1-160)||(10360195-10360354)
chr2 (1-160)||(42120063-42120222)
chr2 (1-160)||(3937060-3937219)
chr2 (1-160)||(12968298-12968457)
chr2 (1-160)||(17424840-17424999)
chr2 (1-160)||(43982907-43983066)
chr2 (1-222)||(29067780-29067998)
chr2 (5-160)||(42241095-42241250)
chr2 (1-160)||(16581873-16582034)
chr2 (1-222)||(29111209-29111427)
chr2 (4-222)||(33404069-33404283)
chr2 (1-140)||(29906633-29906772)
chr2 (1-160)||(39393942-39394101)
chr2 (1-160)||(22001885-22002044)
chr2 (1-160)||(22493322-22493481)
chr2 (1-222)||(17796044-17796259)
chr2 (1-163)||(6902017-6902179)
chr2 (5-140)||(32734702-32734837)
chr2 (1-103)||(39799895-39799997)
chr2 (100-222)||(43491600-43491722)
chr2 (1-91)||(18392088-18392178)
chr2 (1-163)||(20148169-20148331)
chr2 (1-78)||(34639016-34639093)
chr2 (56-170)||(27650413-27650527)
chr2 (98-169)||(16253603-16253674)
chr2 (1-68)||(16253527-16253594)
chr2 (98-160)||(18393497-18393559)
chr2 (82-170)||(15891633-15891721)
chr2 (53-105)||(17112399-17112451)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-222)||(41856910-41857131)
chr8 (1-222)||(18440231-18440452)
chr8 (5-222)||(42603515-42603732)
chr8 (1-222)||(44943017-44943238)
chr8 (1-222)||(40702417-40702639)
chr8 (1-222)||(19242098-19242319)
chr8 (1-222)||(19315282-19315503)
chr8 (1-160)||(15032322-15032481)
chr8 (1-160)||(26452382-26452541)
chr8 (5-160)||(40414671-40414826)
chr8 (1-160)||(41363713-41363872)
chr8 (6-160)||(43693199-43693353)
chr8 (1-160)||(33799549-33799708)
chr8 (1-160)||(38033923-38034082)
chr8 (4-160)||(42168958-42169114)
chr8 (1-160)||(2416972-2417131)
chr8 (5-160)||(40415318-40415473)
chr8 (1-160)||(41275451-41275610)
chr8 (4-160)||(34615013-34615169)
chr8 (1-160)||(485256-485415)
chr8 (1-160)||(24861400-24861559)
chr8 (1-160)||(43638675-43638834)
chr8 (1-123)||(26484634-26484756)
chr8 (1-160)||(28706140-28706299)
chr8 (1-170)||(3589254-3589423)
chr8 (1-170)||(31171804-31171973)
chr8 (118-222)||(26486847-26486951)
chr8 (1-89)||(16575749-16575837)
chr8 (1-61)||(22548320-22548380)
chr8 (94-160)||(22549232-22549295)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (5-222)||(30354752-30354969)
chr7 (1-222)||(41048832-41049053)
chr7 (6-222)||(42735316-42735532)
chr7 (1-222)||(21187236-21187457)
chr7 (1-222)||(43351037-43351257)
chr7 (1-222)||(48315117-48315338)
chr7 (1-222)||(48270697-48270918)
chr7 (1-222)||(36393761-36393982)
chr7 (1-222)||(46862131-46862352)
chr7 (1-222)||(15337842-15338063)
chr7 (1-222)||(28114330-28114551)
chr7 (2-222)||(21614700-21614917)
chr7 (1-160)||(41217663-41217822)
chr7 (6-160)||(39477239-39477393)
chr7 (1-160)||(34140914-34141073)
chr7 (6-140)||(17183266-17183400)
chr7 (1-222)||(21650573-21650793)
chr7 (1-160)||(20564808-20564967)
chr7 (1-140)||(17839372-17839511)
chr7 (1-159)||(47268947-47269105)
chr7 (1-160)||(30360566-30360724)
chr7 (1-160)||(40588598-40588757)
chr7 (1-160)||(18237613-18237772)
chr7 (5-160)||(20378702-20378857)
chr7 (1-160)||(48220743-48220900)
chr7 (1-121)||(28979060-28979180)
chr7 (1-170)||(1642576-1642745)
chr7 (1-168)||(2356338-2356505)
chr7 (5-99)||(26603265-26603359)
chr7 (44-160)||(2206036-2206152)
chr7 (36-160)||(9367119-9367243)
chr7 (1-160)||(45363251-45363401)
chr7 (1-160)||(10523117-10523277)
chr7 (65-222)||(13920419-13920573)
chr7 (1-68)||(13916882-13916949)
chr7 (56-163)||(28066359-28066466)
chr7 (83-170)||(11824824-11824911)
chr7 (98-160)||(26601777-26601839)
chr7 (1-48)||(42683005-42683052)
chr7 (56-170)||(150192-150306)
chr7 (192-222)||(21186908-21186938)
chr7 (185-222)||(21651111-21651148)
chr7 (100-160)||(17320200-17320260)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (1-222)||(22436958-22437179)
chr4 (1-221)||(6282263-6282483)
chr4 (5-218)||(957398-957611)
chr4 (1-222)||(2773056-2773277)
chr4 (1-222)||(34153225-34153446)
chr4 (1-222)||(43889438-43889659)
chr4 (1-222)||(47657294-47657515)
chr4 (1-222)||(49791875-49792096)
chr4 (1-222)||(34529735-34529956)
chr4 (1-222)||(36776458-36776679)
chr4 (1-222)||(21169498-21169719)
chr4 (1-222)||(44560119-44560340)
chr4 (1-222)||(49423696-49423918)
chr4 (1-222)||(49817583-49817804)
chr4 (5-160)||(21711581-21711736)
chr4 (1-222)||(40353715-40353933)
chr4 (1-222)||(4785361-4785582)
chr4 (1-160)||(1042796-1042955)
chr4 (5-160)||(14330695-14330850)
chr4 (1-160)||(21017178-21017337)
chr4 (1-160)||(25762645-25762804)
chr4 (1-168)||(26591678-26591845)
chr4 (1-160)||(51027768-51027927)
chr4 (1-160)||(37866453-37866613)
chr4 (1-160)||(27759374-27759533)
chr4 (1-160)||(33163545-33163704)
chr4 (1-160)||(41794563-41794722)
chr4 (1-160)||(51428193-51428352)
chr4 (1-160)||(55796790-55796949)
chr4 (1-163)||(20778867-20779029)
chr4 (5-160)||(1226210-1226365)
chr4 (1-160)||(6177316-6177475)
chr4 (1-160)||(31824630-31824789)
chr4 (1-160)||(39588976-39589135)
chr4 (1-160)||(56138957-56139116)
chr4 (8-160)||(49064033-49064185)
chr4 (1-160)||(242417-242576)
chr4 (1-160)||(49094792-49094951)
chr4 (1-160)||(20901669-20901828)
chr4 (1-160)||(32937903-32938062)
chr4 (1-160)||(45939572-45939731)
chr4 (1-222)||(11288342-11288558)
chr4 (6-218)||(42886318-42886530)
chr4 (5-160)||(46816526-46816679)
chr4 (1-222)||(24606799-24607017)
chr4 (1-160)||(28082285-28082444)
chr4 (6-168)||(17211318-17211480)
chr4 (1-160)||(9489726-9489884)
chr4 (1-129)||(10312319-10312447)
chr4 (1-170)||(3393351-3393520)
chr4 (6-170)||(18412647-18412811)
chr4 (1-170)||(13850796-13850965)
chr4 (1-170)||(13866310-13866479)
chr4 (1-170)||(31324221-31324390)
chr4 (158-222)||(49064563-49064627)
chr4 (75-170)||(49817188-49817283)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-222)||(32027565-32027786)
chr6 (1-222)||(13402584-13402805)
chr6 (1-222)||(32037624-32037845)
chr6 (1-222)||(12396827-12397048)
chr6 (9-222)||(30257516-30257729)
chr6 (1-222)||(34802833-34803054)
chr6 (1-160)||(35058734-35058893)
chr6 (1-160)||(11692502-11692661)
chr6 (8-160)||(801223-801375)
chr6 (1-160)||(6205535-6205694)
chr6 (1-222)||(14115088-14115305)
chr6 (1-160)||(27640231-27640390)
chr6 (1-160)||(29108191-29108350)
chr6 (1-132)||(22305847-22305978)
chr6 (1-160)||(29066604-29066763)
chr6 (1-160)||(29075617-29075776)
chr6 (1-160)||(29110589-29110748)
chr6 (112-222)||(35021174-35021284)
chr6 (80-160)||(3765786-3765867)
chr6 (166-221)||(4495119-4495174)
chr6 (88-222)||(24021037-24021168)
chr6 (147-222)||(30257137-30257212)
chr6 (88-222)||(2192535-2192666)
chr6 (56-111)||(2402306-2402361)
chr6 (79-163)||(17465331-17465415)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (1-222)||(35565318-35565538)
chr5 (1-222)||(1400242-1400463)
chr5 (1-222)||(4724014-4724235)
chr5 (1-222)||(18308306-18308527)
chr5 (1-195)||(36350281-36350466)
chr5 (3-195)||(6793353-6793545)
chr5 (1-222)||(7172-7390)
chr5 (1-222)||(27661320-27661538)
chr5 (1-160)||(8538000-8538159)
chr5 (1-160)||(40009574-40009733)
chr5 (25-222)||(1694859-1695056)
chr5 (1-160)||(11346755-11346914)
chr5 (1-160)||(19036676-19036835)
chr5 (1-222)||(8576084-8576302)
chr5 (1-160)||(541637-541796)
chr5 (1-140)||(1971411-1971550)
chr5 (1-160)||(3601387-3601546)
chr5 (1-160)||(28881037-28881196)
chr5 (1-160)||(11027823-11027982)
chr5 (1-160)||(19400409-19400568)
chr5 (1-160)||(30709644-30709803)
chr5 (2-129)||(35927470-35927597)
chr5 (1-160)||(38854204-38854363)
chr5 (1-163)||(33370700-33370862)
chr5 (1-112)||(3169649-3169760)
chr5 (6-129)||(17366769-17366892)
chr5 (74-160)||(7082340-7082426)
chr5 (1-115)||(2599265-2599379)
chr5 (1-60)||(3458882-3458941)
chr5 (98-170)||(17195351-17195423)
chr5 (105-160)||(3458940-3458995)
chr5 (147-222)||(7082792-7082867)
chr5 (165-222)||(1171725-1171782)
chr5 (82-170)||(18920861-18920949)
chr5 (88-140)||(22283704-22283756)
chr5 (101-163)||(12742818-12742880)
chr5 (185-222)||(4723686-4723723)
chr5 (185-222)||(22283798-22283835)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-160)||(2316-2475)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-160)||(1839-1998)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-160)||(17916-18075)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-123)||(24954-25076)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-72)||(64024-64095)
scaffold0004 (101-163)||(64098-64160)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (88-222)||(85462-85593)
[»] scaffold0268 (2 HSPs)
scaffold0268 (185-222)||(14698-14735)
scaffold0268 (88-132)||(14604-14648)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 234 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 35179051 - 35178703
Alignment:
Q  234 tgtttaggtgtttatctaaacacggcctaaattgatccatgcttattagtacattaagatcaatcaaatttgtaagaaaattgtccttcaagactaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35179051 tgtttaggtgtttatctaaacacggcctaaattgatccatgcttattagtacattaagatcaatcaaatttgtaagaaaattgtccttcaagactaatgt 35178952  T
Q  334 gattgatgattttattctagagattacttcttagtcactaaattgactagt---------tcaataactaaatttggcgatttattctttaatttgttac 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178951 gattgatgattttattctagagattacttcttagtcactaaattgaccagtgctatagtttcaataactaaatttggcgatttattctttaatttgttac 35178852  T
Q  425 ctatatatttcaaattttcaatggtaattgaacaaaatctaatcgattcgaaaaattcaggttttctgaggtggctgaactcgtaagcgtgtgttggttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178851 ctatatatttcaaattttcaatggtaattgaacaaaatctaatcgattcaaaaaattcaggttttctgaggtggctgaactcgtaagcgtgtgttggttc 35178752  T
Q  525 ggaatccagggctggatcaacacgatcatgttatctccaaagactttgt 573  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178751 gaaatccggggctggatcaacacgatcatgttatctccaaagactttgt 35178703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38046593 - 38046372
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||    
T  38046593 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacg 38046494  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38046493 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 38046394  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38046393 cctttgaatggggtaattcaaa 38046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14173917 - 14173696
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14173917 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 14173818  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  14173817 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 14173718  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14173717 cctttgaatggggtaattcaaa 14173696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 36909609 - 36909829
Alignment:
Q  2 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgt 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36909609 agagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgt 36909708  T
Q  102 tgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttc 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | || |||||    
T  36909709 tgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtcttc 36909808  T
Q  202 ctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36909809 ctttgaatggggtaattcaaa 36909829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6435819 - 6436040
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6435819 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacg 6435918  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  6435919 ttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 6436018  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  6436019 cctttgaatgaggtaattcaaa 6436040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13972971 - 13973192
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||     
T  13972971 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgaca 13973070  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  13973071 ttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 13973170  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13973171 cctttgaatggggtaattcaaa 13973192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49926539 - 49926318
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  49926539 gagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacg 49926440  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  49926439 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaaccattgtctt 49926340  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49926339 cctttgaatggggtaattcaaa 49926318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24270522 - 24270301
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24270522 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 24270423  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  24270422 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatcaataggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 24270323  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  24270322 cctctgaatggggtaattcaaa 24270301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 49396751 - 49396972
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49396751 gagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacg 49396850  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  49396851 ttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 49396950  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49396951 cctttgaatggggtaattcaaa 49396972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35587088 - 35586869
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  35587088 gagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacc 35586989  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | || | ||    
T  35586988 ttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta-gtacggaatgaatgcacctttcaactacaacagttgt-tt 35586891  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35586890 cctttgaatggggtaattcaaa 35586869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 37778126 - 37778347
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37778126 gagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgacg 37778225  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||| ||||    
T  37778226 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccgcctacaacaattttctt 37778325  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  37778326 cctctgaatggggtaattcaaa 37778347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23342688 - 23342909
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23342688 gagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacg 23342787  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  23342788 ttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 23342887  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  23342888 cctttgaattgggtaattcaaa 23342909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 35185017 - 35185239
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggg-agcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgac 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  35185017 gagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgac 35185116  T
Q  100 gttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatct 199  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  35185117 gttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtct 35185216  T
Q  200 tcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  35185217 tcctttgaatgaggtaattcaaa 35185239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17686520 - 17686299
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17686520 gagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacg 17686421  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||| | ||    
T  17686420 tagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgtt 17686321  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  17686320 cctctggatagggtaattcaaa 17686299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 41780745 - 41780961
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  41780745 tatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgct 41780844  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttccttt 205  Q
     ||||||||| || ||||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  41780845 aagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagttcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttccttt 41780944  T
Q  206 gaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  41780945 gaatggggtaattcaaa 41780961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39857065 - 39856906
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39857065 gagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 39856966  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  39856965 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 39856906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 18170072 - 18170251
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||     
T  18170072 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaca 18170171  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacctt 180  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18170172 ttgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgcatgcacctt 18170251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 35576386 - 35576545
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35576386 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacg 35576485  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  35576486 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 35576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39224352 - 39224197
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39224352 gtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 39224253  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39224252 tgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 39224197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 45689166 - 45689325
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  45689166 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacg 45689265  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||    
T  45689266 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccataagatcgtcattag 45689325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 49427434 - 49427593
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  49427434 gagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 49427533  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  49427534 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 49427593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21484802 - 21484640
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21484802 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacg 21484703  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  21484702 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccagaagatcgtcattaggta 21484640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12791432 - 12791273
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12791432 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 12791333  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  12791332 tttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 12791273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13635456 - 13635297
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  13635456 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 13635357  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  13635356 ttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 13635297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29436020 - 29436179
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  29436020 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacg 29436119  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  29436120 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagccagaagatcgtcattag 29436179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 3658520 - 3658682
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   || |||    
T  3658520 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacg 3658619  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3658620 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 3658682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42571935 - 42571777
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  42571935 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 42571836  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcatta 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||    
T  42571835 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 42571777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 50068418 - 50068259
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  50068418 gagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 50068319  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  50068318 ttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 50068259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 17697097 - 17697262
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17697097 gtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 17697196  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17697197 tgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtaaggaatg 17697262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 46180440 - 46180280
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcact-tgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgac 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  46180440 gagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtaac 46180341  T
Q  100 gttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  46180340 gttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattag 46180280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27035473 - 27035318
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27035473 gtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgc 27035374  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27035373 tgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtcattag 27035318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27486849 - 27486690
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27486849 gagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacg 27486750  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  27486749 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcctgaagatcgtcattag 27486690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29762380 - 29762221
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  29762380 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacg 29762281  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  29762280 ttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcatcattag 29762221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 44597748 - 44597907
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44597748 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacg 44597847  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  44597848 ttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccggaagatcgtcattag 44597907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 51269849 - 51270008
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  51269849 gagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 51269948  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  51269949 ttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 51270008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19160364 - 19160582
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  19160364 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 19160463  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  19160464 ttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 19160560  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19160561 cctttgaatggggtaattcaaa 19160582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 17372786 - 17372992
Alignment:
Q  13 cacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatca 112  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||    
T  17372786 cacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtgaagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatca 17372885  T
Q  113 actaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggg 212  Q
    ||| ||||||||||| |||| || |||   | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  17372886 actgaagatatcatcgaaagtttaatttcgccagaagatcgtcattaggtatgga---aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgag 17372982  T
Q  213 gtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||    
T  17372983 gtaattcaaa 17372992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35526336 - 35526197
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  35526336 gagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgagacgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacg 35526237  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35526236 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 35526197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44337478 - 44337319
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  44337478 gagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacg 44337379  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||  | ||||||||||||||||    
T  44337378 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgccagaagatcgtcattag 44337319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 47488196 - 47488037
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||| |||    
T  47488196 gagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacg 47488097  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47488096 ttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagatcgtcattag 47488037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 48215245 - 48215404
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  48215245 gagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 48215344  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||    
T  48215345 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatagtcattag 48215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48568563 - 48568404
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  48568563 gagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 48568464  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||   | ||||||| ||||||||    
T  48568463 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagattgtcattag 48568404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24363959 - 24363742
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||| || | |||    
T  24363959 gagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacg 24363860  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||   ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  24363859 ttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 24363764  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  24363763 cctttgaatgaggtaattcaaa 24363742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41875043 - 41874884
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |    
T  41875043 gagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatg 41874944  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||| |||||    
T  41874943 ttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccagaagatcgttattag 41874884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49263147 - 49262988
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||    
T  49263147 gagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacg 49263048  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  49263047 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctctagaatatcttcattag 49262988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13283752 - 13283969
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  13283752 gagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatgacgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacg 13283851  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  13283852 ttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 13283947  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13283948 cctttgaatggggtaattcaaa 13283969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 18842491 - 18842608
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18842491 tatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgct 18842590  T
Q  106 gagatcaactaaagatat 123  Q
    |||||||||| |||||||    
T  18842591 gagatcaactgaagatat 18842608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30309981 - 30309832
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  || ||||||||||||||| |||||||         
T  30309981 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac----- 30309887  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  30309886 -gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 30309832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40533372 - 40533224
Alignment:
Q  74 ttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaat 173  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40533372 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaat 40533273  T
Q  174 gcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||  |||||||| |||| | ||||| | | ||||||||||||||    
T  40533272 gcaccttccagctacaacaattgttttcctctaactggggtaattcaaa 40533224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Original strand, 5765258 - 5765422
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5765258 tatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatgagcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgct 5765357  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    |||||||| | ||||||| |||||  |  ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5765358 gagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 5765422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 49599033 - 49598921
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  49599033 gagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacgaaa-cgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 49598935  T
Q  101 ttgctgagatcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  49598934 ttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 13148366 - 13148450
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatc 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13148366 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35182916 - 35182800
Alignment:
Q  265 ttgatccatgcttattagtacattaagatcaatcaaatttgtaagaaaattgtccttcaagactaatgtgattgatgattttattctagagattactt-c 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35182916 ttgatccatgcttattagtactttaagatcaatcaatttagtcaggaaattgtccttgatgactaatgtgtttgataattttattctagagattacttcc 35182817  T
Q  364 ttagtcactaaattgac 380  Q
    ||| |||||||||||||    
T  35182816 ttactcactaaattgac 35182800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707544
Alignment:
Q  80 tggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcat 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcat 29707544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16532249 - 16532080
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| || |||||||| | |||  || | ||||| |||||| | || |||    
T  16532249 gagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgatgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacg 16532150  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||   |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16532149 ttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgctagaagatcgtgattaggtatggaatg 16532080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 451 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 35182794 - 35182672
Alignment:
Q  451 attgaacaaaatctaatcgattcgaaaaattcaggttttctgaggtggctgaactcgtaagcgtgtgttggttcggaatccagggctggatcaacacgat 550  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| | || |  |||||||| || || ||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||    
T  35182794 attgaacaaaatctaagccattcaaaaaatgcaggtttcccgaagcagctgaacttgtgagtgtgtgttggtttgaaatcaggggctggatcagcactat 35182695  T
Q  551 catgttatctccaaagactttgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35182694 catgttatctccaaagactttgt 35182672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 16081337 - 16081446
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| | || ||||||||    
T  16081337 tatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttggagcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgct 16081436  T
Q  106 gagatcaact 115  Q
    |  |||||||    
T  16081437 gcaatcaact 16081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35526191 - 35526135
Alignment:
Q  166 gaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35526191 gaatgaatgcaccttatagctacaacaaaggtcttcttttgaatggggtaattcaaa 35526135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 22527735 - 22527772
Alignment:
Q  185 ctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22527735 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 22527772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262433
Alignment:
Q  56 ttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    |||||| |||||| ||| |||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattc 19262433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55207042 - 55206821
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  55207042 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 55206943  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55206942 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 55206843  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  55206842 cctttgaatggggtaatacaaa 55206821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46414492 - 46414271
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46414492 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacg 46414393  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  46414392 ttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtctt 46414293  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  46414292 cctttgaatgtggtagttcaaa 46414271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 2428553 - 2428769
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2428553 tatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgct 2428652  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttccttt 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  2428653 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacataatgaatgcacctttcagctacaacaattgtgttccttt 2428752  T
Q  206 gaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  2428753 gaatggggtaattcaaa 2428769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 41803963 - 41804184
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  41803963 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacg 41804062  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  41804063 ttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcactttttagctacaacaattgtctt 41804162  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41804163 cctttgaatggggtaattcaaa 41804184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51013436 - 51013215
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51013436 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacg 51013337  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  51013336 ttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 51013237  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51013236 cctttgaatggggtaattcaaa 51013215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34472234 - 34472013
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34472234 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 34472135  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||    
T  34472134 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgttccttccagctacaaaaattgtctt 34472035  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34472034 cctttgaatggggtaattcaaa 34472013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 41577967 - 41578188
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  41577967 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacg 41578066  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  41578067 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatcattaggtacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgtctt 41578166  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  41578167 cctttgaatgtggtaattcaaa 41578188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 51015342 - 51015556
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  51015342 gtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgc 51015441  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||    
T  51015442 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctttctt 51015541  T
Q  205 tgaatggggtaattc 219  Q
    |||||||||||||||    
T  51015542 tgaatggggtaattc 51015556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42323547 - 42323326
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||  |||||||    
T  42323547 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtggatcgatatgctggtgacg 42323448  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  42323447 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 42323348  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  42323347 cctctgaatggggtaattcaaa 42323326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34647425 - 34647207
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34647425 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacg 34647326  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  34647325 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttctagctgcaacaattgtctt 34647226  T
Q  201 cctttgaatggggtaattc 219  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  34647225 cctctgaatgtggtaattc 34647207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52569566 - 52569346
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||     
T  52569566 gagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa-gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgaca 52569468  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52569467 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 52569368  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52569367 cctttgaatggggtaattcaaa 52569346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45100623 - 45100402
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45100623 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 45100524  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||    
T  45100523 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataatatcgtcattaggtactgaatgaatgcactttttagctactacaattgtctt 45100424  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  45100423 tctttgaatggggtaattcaaa 45100402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 14631507 - 14631727
Alignment:
Q  2 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14631507 agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgt 14631606  T
Q  102 tgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttc 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| || | |||||    
T  14631607 tgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccatccagctacaacaactgtcttc 14631706  T
Q  202 ctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  14631707 ctttgaacggggtaattcaaa 14631727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 30192599 - 30192820
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30192599 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgtctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacg 30192698  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  30192699 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattttctt 30192798  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  30192799 cctttgaatgaggtatttcaaa 30192820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 49273461 - 49273681
Alignment:
Q  2 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49273461 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgt 49273560  T
Q  102 tgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttc 201  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| | |||| |||||    
T  49273561 tgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttccagaatatcgtcattaggtcctgaatgaacgcaccttccagctaccacaattgtcttc 49273660  T
Q  202 ctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  49273661 ctttgaatgtggtaattcaaa 49273681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7246155 - 7246376
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7246155 gagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggattataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacg 7246254  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||    
T  7246255 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtatggaataaatgcaccttccagctacaacgattgtctt 7246354  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7246355 cctttgaatggggtaattcaaa 7246376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 37281517 - 37281734
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37281517 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 37281616  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||| | |||||     
T  37281617 tgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtgttccta 37281716  T
Q  205 tgaatggggtaattcaaa 222  Q
    || ||| |||||||||||    
T  37281717 tggatgaggtaattcaaa 37281734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 43569971 - 43570192
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  43569971 gagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 43570070  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  43570071 ttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagatcgtctttatgtacggaatgactgcaccttccagctacaacaattgtctt 43570170  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  43570171 cctttgaatgaggtaattcaaa 43570192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13896028 - 13895869
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13896028 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 13895929  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13895928 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatcgtcattag 13895869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 7954269 - 7954486
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  7954269 gtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgc 7954368  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| |   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  7954369 taagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgtcttcctt 7954468  T
Q  205 tgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||||||||||    
T  7954469 tgaatgaggtaattcaaa 7954486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19453387 - 19453228
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19453387 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacg 19453288  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  19453287 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcatcattag 19453228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346549
Alignment:
Q  39 aaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgat 138  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  139 tcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaa 46346549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48087710 - 48087552
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48087710 gagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacg 48087611  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcatta 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  48087610 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcatta 48087552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2647034 - 2646875
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  2647034 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 2646935  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2646934 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattag 2646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 44927524 - 44927683
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44927524 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 44927623  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  44927624 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 44927683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3495187 - 3494969
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  3495187 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 3495088  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  3495087 ttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 3494991  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3494990 cctttgaatggggtaattcaaa 3494969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 47760049 - 47759879
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  47760049 gagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacg 47759950  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatga 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47759949 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatga 47759879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34693446 - 34693289
Alignment:
Q  3 gagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34693446 gagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtt 34693347  T
Q  103 gctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  34693346 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgccagaagatcgtcattag 34693289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10053429 - 10053239
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10053429 gagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 10053333  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataatt 195  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  10053332 ttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaatt 10053239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24702429 - 24702271
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24702429 gagaatatcattcacttgggtggaattac-gaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacg 24702331  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  24702330 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccagaagatcgtcattag 24702271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39417106 - 39416947
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  39417106 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 39417007  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  39417006 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccagaagatcgtcattag 39416947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36721547 - 36721326
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  36721547 gagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacg 36721448  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| | ||    
T  36721447 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatttggtatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtgtt 36721348  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| || ||| |||||||||||    
T  36721347 cctctggatgaggtaattcaaa 36721326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4004245 - 4004086
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  4004245 gagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 4004146  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  4004145 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 4004086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 34049788 - 34049947
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  34049788 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 34049887  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  34049888 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 34049947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 42382332 - 42382491
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  42382332 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 42382431  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  42382432 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtcattag 42382491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 42383112 - 42383271
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  42383112 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 42383211  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  42383212 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtcattag 42383271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 46403064 - 46403223
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  46403064 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 46403163  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  46403164 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 46403223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49140212 - 49140053
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  49140212 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 49140113  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  49140112 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 49140053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997608
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 50997608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 54390503 - 54390662
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  54390503 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 54390602  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  54390603 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 54390662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2268652 - 2268434
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |    
T  2268652 gagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaag 2268553  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  2268552 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 2268456  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2268455 cctttgaatggggtaattcaaa 2268434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 43477118 - 43477276
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  43477118 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacg 43477217  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcatta 159  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||    
T  43477218 ttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 43477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 36135071 - 36135286
Alignment:
Q  4 agtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  36135071 agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttg 36135170  T
Q  104 ctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcct 203  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| ||  | | | |||||  ||  | |||||| |||| |||||||    
T  36135171 cttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttagagtaag-atgca--ttccaactacaacaattgtcttcct 36135267  T
Q  204 ttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36135268 ttgaatggggtaattcaaa 36135286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49218894 - 49218735
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  49218894 gagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacg 49218795  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  49218794 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 49218735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 49610550 - 49610709
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  49610550 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacg 49610649  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  49610650 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 49610709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6464503 - 6464345
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6464503 gagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacaatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacg 6464404  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcatta 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||| ||||    
T  6464403 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaagaagatcgtgatta 6464345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42950177 - 42950019
Alignment:
Q  2 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||    
T  42950177 agagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgt 42950078  T
Q  102 tgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42950077 tgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 42950019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50458849 - 50458655
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||| || | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50458849 gagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaacttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacg 50458750  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataatt 195  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  50458749 ttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcctgaagatcgtcattaggtaccgaacgaatgcaccttccagctacaacaatt 50458655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51695757 - 51695605
Alignment:
Q  8 tcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51695757 tcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctga 51695658  T
Q  108 gatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  51695657 gatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcatcattag 51695605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 47065748 - 47065907
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  47065748 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacg 47065847  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  47065848 ttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 47065907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25576749 - 25576592
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||    
T  25576749 gagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacg 25576651  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcatta 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||    
T  25576650 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgtcagaagatcgtcatta 25576592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 774496 - 774327
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  774496 gagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggagcactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 774397  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  774396 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaatg 774327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 27187009 - 27187137
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||    
T  27187009 gagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacg 27187108  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27187109 ttgctgagatcaactaaagatattatcaa 27187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 53826854 - 53826695
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   || |||    
T  53826854 gagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacg 53826755  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  53826754 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 53826695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6754265 - 6754484
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||    
T  6754265 gagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacg 6754364  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||||||| |||| ||| |||   ||||||||||  | |||||| || | ||||    
T  6754365 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgctagaagatcgtgattatgtaggga---aatgcaccttccaactacaacaactgtctt 6754461  T
Q  201 cctttg-aatggggtaattcaaa 222  Q
     || || ||||||||||||||||    
T  6754462 actctgaaatggggtaattcaaa 6754484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33449297 - 33449092
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||               
T  33449297 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata----------- 33449209  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | |||||| |||| | ||    
T  33449208 -tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccagaagatcgtaattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtttt 33449114  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  33449113 cctctggatggggtaattcaaa 33449092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8633517 - 8633348
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||    
T  8633517 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 8633418  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||| || ||||| || ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  8633417 ttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatg 8633348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44835645 - 44835486
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||| |||| | |    
T  44835645 gagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaagg 44835546  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  44835545 ttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattag 44835486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20376040 - 20375919
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| | || |||    
T  20376040 gagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgaggagtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacg 20375941  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagata 122  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  20375940 ttgctgagatcaatttaagata 20375919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18440968
Alignment:
Q  68 aacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta 18440968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486042
Alignment:
Q  68 aacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta 19486042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 14265474 - 14265588
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||| || ||||| ||    
T  14265474 tatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---cgtgacgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttact 14265570  T
Q  106 gagatcaactaaagatat 123  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  14265571 gagattaactaaagatat 14265588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25887768 - 25887647
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |  |||    
T  25887768 gagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacatgttctcgtggatc-atatgtgtggaacg 25887670  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatat 123  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  25887669 ttgttgagatcaactgaagatat 25887647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Original strand, 37282039 - 37282114
Alignment:
Q  147 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37282039 aagatcgttagtaggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaa 37282114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55268851 - 55268797
Alignment:
Q  168 atgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  55268851 atgaatgcaccttttagctataacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaa 55268797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36721021 - 36720946
Alignment:
Q  147 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| | || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36721021 aagattgtcagtaggtacgaaatgaattcacctttcaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaa 36720946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4004064 - 4004027
Alignment:
Q  185 ctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4004064 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 4004027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17267398 - 17267314
Alignment:
Q  56 ttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||   ||||||||||  |||| || |||||||    
T  17267398 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatgtaagttacgttgctgagattgcctaaagatattctcaagagtttgattc 17267314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 35491686 - 35491907
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35491686 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 35491785  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  35491786 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 35491885  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35491886 cctttgaatggggtaattcaaa 35491907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41499249 - 41499028
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41499249 gagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacg 41499150  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41499149 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 41499050  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  41499049 cctttgaatgaggtaattcaaa 41499028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27130664 - 27130443
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27130664 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 27130565  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||| ||||    
T  27130564 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatagtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctaaaacaattgtctt 27130465  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27130464 cctttgaatggggtaattcaaa 27130443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34521839 - 34521618
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34521839 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 34521740  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  34521739 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccctcataagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 34521640  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34521639 cctttgaatggggtaattcaaa 34521618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2919520 - 2919299
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  2919520 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacg 2919421  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  2919420 ttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 2919321  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  2919320 cctttgaatgtggtaattcaaa 2919299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 6976891 - 6977108
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6976891 gtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 6976990  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||     
T  6976991 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctc 6977090  T
Q  205 tgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6977091 tgaatggggtaattcaaa 6977108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19471789 - 19471568
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19471789 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacg 19471690  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  19471689 ttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 19471590  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  19471589 cctctgaattgggtaattcaaa 19471568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37312650 - 37312429
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37312650 gagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 37312551  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||  |||    
T  37312550 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttacagctacaacaattgactt 37312451  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  37312450 cctatgaatggggtaattcaaa 37312429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677309
Alignment:
Q  4 agtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  104 ctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcct 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaccaattgtattcct 40677328  T
Q  204 ttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40677327 ttgaatggggtaattcaaa 40677309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10364792 - 10364572
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  10364792 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 10364693  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  10364692 ttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattacgta-ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 10364594  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  10364593 cctttaaatggggtaattcaaa 10364572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 3941788 - 3941947
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3941788 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 3941887  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3941888 ttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 3941947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 5420520 - 5420679
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5420520 gagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacg 5420619  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5420620 ttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacctgaagatcgtcattag 5420679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10360354 - 10360195
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |    
T  10360354 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatg 10360255  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10360254 ttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 10360195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 42120063 - 42120222
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42120063 gagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacg 42120162  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42120163 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 42120222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3937219 - 3937060
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  3937219 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 3937120  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  3937119 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 3937060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12968457 - 12968298
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||    
T  12968457 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacg 12968358  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  12968357 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtcattag 12968298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 17424840 - 17424999
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |    
T  17424840 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaag 17424939  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  17424940 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 17424999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 43982907 - 43983066
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  43982907 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 43983006  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  43983007 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 43983066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 29067780 - 29067998
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  29067780 gagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 29067879  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| || || | |  ||||  ||  |||||||| |||| ||||    
T  29067880 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccagctacaacaattgtctt 29067976  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29067977 cctttgaatggggtaattcaaa 29067998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42241250 - 42241095
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42241250 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgc 42241151  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  42241150 tgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgccataagatcgtcattag 42241095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 16581873 - 16582034
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatc--gatatgtgggtga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  16581873 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtgtcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtga 16581972  T
Q  99 cgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  16581973 cgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatcttcattag 16582034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 29111209 - 29111427
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  29111209 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 29111308  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||  | |||| | ||||| |||||| || |  | ||||  ||  | |||||| |||||||||    
T  29111309 ttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccagaataacgtcactaggtagggtaa-agtgca--ttccaactacaacaattatctt 29111405  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  29111406 cctttgaatgtggtaattcaaa 29111427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 33404069 - 33404283
Alignment:
Q  4 agtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttg 103  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33404069 agtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 33404168  T
Q  104 ctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcct 203  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||    | |||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | |||||| |||| |||||||    
T  33404169 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct 33404264  T
Q  204 ttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  33404265 ttgaatgaggtaattcaaa 33404283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 29906633 - 29906772
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  29906633 gagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 29906732  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  29906733 ttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattc 29906772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 39393942 - 39394101
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39393942 gagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacg 39394041  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||    ||||||||||||||||    
T  39394042 ttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgtcagaagatcgtcattag 39394101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 22001885 - 22002044
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  22001885 gagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaag 22001984  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||    
T  22001985 ttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 22002044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 22493322 - 22493481
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||| |||| |||    
T  22493322 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtgacgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacg 22493421  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22493422 ttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 22493481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17796259 - 17796044
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17796259 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacg 17796163  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    ||||| ||||||||||||| |||   ||||   |||  | |||||| |||| ||||    
T  17796162 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtcagaagctcgtcattaggtaggga---aatgtgtcttccaactacaacaattgtctt 17796066  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  17796065 cctttgaatgaggtaattcaaa 17796044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 6902017 - 6902179
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||    
T  6902017 gagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacg 6902116  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||| | ||||||||    
T  6902117 ttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcgagaagatcatgattaggta 6902179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Original strand, 32734702 - 32734837
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  32734702 gtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgt 32734801  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32734802 tgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattc 32734837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39799997 - 39799895
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  39799997 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 39799898  T
Q  101 ttg 103  Q
    |||    
T  39799897 ttg 39799895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 222
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491722
Alignment:
Q  100 gttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatct 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||  ||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattgcct 43491699  T
Q  200 tcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43491700 tcctttgaatggggtaattcaaa 43491722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 18392088 - 18392178
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatg 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18392088 gagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatg 18392178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20148169 - 20148331
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  20148169 gagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatgactagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacg 20148268  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    |||||||||| | || |||||||  |||| ||  ||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  20148269 ttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggta 20148331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 34639016 - 34639093
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattcca 78  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34639016 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650413
Alignment:
Q  56 ttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtc 155  Q
    |||||| | |||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||  | ||||||||||     
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  156 attaggtacggaatg 170  Q
    |||||||| ||||||    
T  27650427 attaggtagggaatg 27650413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Original strand, 16253603 - 16253674
Alignment:
Q  98 acgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  16253603 acgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaat 16253674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16253527 - 16253594
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcaca 68  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  16253527 gagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 18393497 - 18393559
Alignment:
Q  98 acgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18393497 acgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattag 18393559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15891721 - 15891633
Alignment:
Q  82 gatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    |||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15891721 gatcgatatgtttgtcacgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagggaatg 15891633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 105
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  53 atgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41857131 - 41856910
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41857131 gagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 41857032  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41857031 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 41856932  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41856931 cctttgaatggggtaattcaaa 41856910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18440452 - 18440231
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18440452 gagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacg 18440353  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18440352 ttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcgagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattatctt 18440253  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18440252 cctttgaatggggtaattcaaa 18440231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 42603515 - 42603732
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42603515 gtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 42603614  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    ||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  42603615 tgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctt 42603714  T
Q  205 tgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42603715 tgaatggggtaattcaaa 42603732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44943238 - 44943017
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44943238 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 44943139  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  44943138 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattaggtacggaatgtatgcaccttccagctacaacaattgtctt 44943039  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  44943038 cgtttgaatgagataattcaaa 44943017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 40702417 - 40702639
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  40702417 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacg 40702516  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatc-gtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatct 199  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  40702517 ttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcggtcattaggtacggaatgaatgcacattttagctacaacaattgtct 40702616  T
Q  200 tcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40702617 tcctttgaatggggtaattcaaa 40702639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19242319 - 19242098
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19242319 gagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 19242220  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  19242219 ttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgagaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 19242120  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  19242119 tctctgaatggggtagttcaaa 19242098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19315503 - 19315282
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19315503 gagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 19315404  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  19315403 ttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgagaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 19315304  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  19315303 tctctgaatggggtagttcaaa 19315282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15032481 - 15032322
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  15032481 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 15032382  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  15032381 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 15032322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 26452382 - 26452541
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26452382 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 26452481  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26452482 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctagaagatcgtcattag 26452541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 40414671 - 40414826
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  40414671 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgc 40414770  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40414771 tgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcattag 40414826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 41363713 - 41363872
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  41363713 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacg 41363812  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  41363813 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtcattag 41363872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 43693199 - 43693353
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43693199 tatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgct 43693298  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  43693299 gagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtcattag 43693353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33799708 - 33799549
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||    
T  33799708 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacg 33799609  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  33799608 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 33799549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38034082 - 38033923
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  38034082 gagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacg 38033983  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  38033982 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccggaagatcgtcattag 38033923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42169114 - 42168958
Alignment:
Q  4 agtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttg 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42169114 agtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 42169015  T
Q  104 ctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42169014 cagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 42168958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 2416972 - 2417131
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  2416972 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacg 2417071  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  2417072 ttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtcattag 2417131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 40415318 - 40415473
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||     
T  40415318 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgt 40415417  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  40415418 tgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattag 40415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 41275451 - 41275610
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41275451 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacg 41275550  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  41275551 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 41275610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 34615013 - 34615169
Alignment:
Q  4 agtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttg 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  34615013 agtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttg 34615112  T
Q  104 ctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||||||| || |||||    
T  34615113 ctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatagtaattag 34615169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 485415 - 485256
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |    
T  485415 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaag 485316  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  485315 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 485256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 24861400 - 24861559
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||| |    
T  24861400 gagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatg 24861499  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  24861500 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcgtcattag 24861559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43638834 - 43638675
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||    
T  43638834 gagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacg 43638735  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||||    
T  43638734 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtcattag 43638675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26484634 - 26484756
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  | ||     
T  26484634 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataaca 26484733  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatat 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  26484734 ttgctgagatcaactgaagatat 26484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28706299 - 28706140
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||    
T  28706299 gagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacg 28706200  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  28706199 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgccagaagattgtcattag 28706140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3589423 - 3589254
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||     
T  3589423 gagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgtgatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaaca 3589324  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||| ||||||||||| |||| || ||||| || |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3589323 ttgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 3589254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31171973 - 31171804
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||  | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  31171973 gagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatgacaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacg 31171874  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31171873 ttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtatggaatg 31171804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Original strand, 26486847 - 26486951
Alignment:
Q  118 agatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  26486847 agatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcatctcttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaat 26486946  T
Q  218 tcaaa 222  Q
    |||||    
T  26486947 tcaaa 26486951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16575749 - 16575837
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgata 89  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  16575749 gagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgggatgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgata 16575837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 22548320 - 22548380
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22548320 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Original strand, 22549232 - 22549295
Alignment:
Q  94 ggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22549232 ggtgacgttgctgacatcaactgaagatatcatcaa---cttgattccgccagaagatcgtcattag 22549295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30354969 - 30354752
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30354969 gtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgc 30354870  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30354869 tgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctt 30354770  T
Q  205 tgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||||||||||    
T  30354769 tgaatgaggtaattcaaa 30354752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 41048832 - 41049053
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41048832 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 41048931  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  41048932 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 41049031  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41049032 cctttgaatggggtaattcaaa 41049053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 42735316 - 42735532
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42735316 tatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgct 42735415  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttccttt 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42735416 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcaagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttccttt 42735515  T
Q  206 gaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||| |||||||||||    
T  42735516 gaatgtggtaattcaaa 42735532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21187457 - 21187236
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21187457 gagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacg 21187358  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21187357 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcacctttcagctacaataattgtctt 21187258  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  21187257 cctttgaatgaggtaattcaaa 21187236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43351257 - 43351037
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43351257 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacg 43351159  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  43351158 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccaccagaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 43351059  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  43351058 cctttgaatgaggtaattcaaa 43351037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48315338 - 48315117
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48315338 gagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacg 48315239  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||    
T  48315238 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacgattgtctt 48315139  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  48315138 catttgaatggggtaattcaaa 48315117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 48270697 - 48270918
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48270697 gagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 48270796  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||| ||||    
T  48270797 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcgttaggtacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgtctt 48270896  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  48270897 tcttttaatggggtaattcaaa 48270918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36393982 - 36393761
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36393982 gagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 36393883  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |||| ||||    
T  36393882 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcttcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacgacaattgtctt 36393783  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36393782 cctttgaatggggtaattcaaa 36393761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46862352 - 46862131
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  46862352 gagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacg 46862253  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||    
T  46862252 ttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcataaggtacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgtctt 46862153  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  46862152 cttttgaatggggtaattcaaa 46862131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15338063 - 15337842
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
T  15338063 gagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacg 15337964  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || ||  ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |||| ||||    
T  15337963 ttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgccagaagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtctt 15337864  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15337863 cctttgaatggggtaattcaaa 15337842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28114551 - 28114330
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28114551 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacg 28114452  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  28114451 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgtcaaaagattgtcattaggtaccgaataaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 28114352  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  28114351 cctttgaatgtggtaattcaaa 28114330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21614917 - 21614700
Alignment:
Q  2 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  21614917 agagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgt 21614818  T
Q  102 tgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttc 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | ||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  21614817 tgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgccagaagttcgtgattaggtaggga---aatgcacctttcaactacaacaattgtcttc 21614721  T
Q  202 ctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  21614720 ctttgaatgaggtaattcaaa 21614700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 41217663 - 41217822
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  41217663 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 41217762  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  41217763 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtcattag 41217822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39477393 - 39477239
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39477393 tatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgct 39477294  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39477293 gagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 39477239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 34140914 - 34141073
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34140914 gagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 34141013  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||||    
T  34141014 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccataagatcgtcattag 34141073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 17183266 - 17183400
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17183266 tatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgct 17183365  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17183366 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 17183400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21650573 - 21650793
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21650573 gagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacg 21650672  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | | |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||    
T  21650673 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccataagatcatcattagttaccgaatgaatgaacctaccagctacaacaattgtctt 21650772  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  21650773 cctttgaat-gggtaattcaaa 21650793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 20564808 - 20564967
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  20564808 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 20564907  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  20564908 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 20564967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 17839372 - 17839511
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  17839372 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 17839471  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  17839472 ttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattc 17839511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 47268947 - 47269105
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  47268947 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 47269046  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcatta 159  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||||  | | |||||||||||||    
T  47269047 ttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgccaaaagatcgtcatta 47269105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 30360566 - 30360724
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  30360566 gagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgtaacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtg-cg 30360664  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  30360665 ttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 30360724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 40588598 - 40588757
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  40588598 gagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 40588697  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  40588698 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggccagaagatcgtcattag 40588757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 18237613 - 18237772
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||    
T  18237613 gagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattttgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacg 18237712  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||    
T  18237713 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgccagaagatcgtcattag 18237772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20378857 - 20378702
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||||    
T  20378857 gtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgc 20378758  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| ||||||| || || | ||||||||  | |||||||| |||||||    
T  20378757 tgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgccagaagatcatcattag 20378702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48220900 - 48220743
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  48220900 gagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgtt--gggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacg 48220803  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  48220802 gtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagatcgtcattag 48220743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28979180 - 28979060
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28979180 gagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 28979081  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagat 121  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  28979080 ttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1642745 - 1642576
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||    
T  1642745 gagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacg 1642646  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  1642645 ttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 1642576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 2356338 - 2356505
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| | || |||    
T  2356338 gagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacg 2356437  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaa 168  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  2356438 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgctataagaccgtgattaggtagggaa 2356505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26603359 - 26603265
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26603359 gtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtgac 26603265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2206152 - 2206036
Alignment:
Q  44 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaac 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  2206152 gtgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 2206053  T
Q  144 tagaagatcgtcattag 160  Q
     ||||||||||||||||    
T  2206052 cagaagatcgtcattag 2206036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367119
Alignment:
Q  36 acgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagctt 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  136 gattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||  | | ||||||||||||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattag 9367119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45363401 - 45363251
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||         |||    
T  45363401 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acg 45363311  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  45363310 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 45363251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 10523117 - 10523277
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattcca-gtggatcgatatgtgggtgac 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||| ||||||     
T  10523117 gagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaa 10523216  T
Q  100 gttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |  ||| |||||||||||    
T  10523217 gtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgcctgaaaatcgtcattag 10523277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Original strand, 13920419 - 13920573
Alignment:
Q  65 cacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtac 164  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||   | | |||||||||||||| ||     
T  13920419 cacagcatattacagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttag 13920518  T
Q  165 ggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    || | | |||||  ||  | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13920519 ggtaag-atgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 13920573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 13916882 - 13916949
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcaca 68  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||||    
T  13916882 gagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaatgtgatgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066466
Alignment:
Q  56 ttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtc 155  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||  || |||||||  ||||||| |||||||  | |||| |||||     
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  156 attaggta 163  Q
    ||||||||    
T  28066459 attaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Original strand, 11824824 - 11824911
Alignment:
Q  83 atcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11824824 atcgatatgtatgtcacgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatg 11824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601777
Alignment:
Q  98 acgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattag 26601777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 42683005 - 42683052
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgac 48  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42683005 gagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgac 42683052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150306
Alignment:
Q  56 ttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtc 155  Q
    |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  || |||||| |||||||  || |||||||  |||| |  |||||||  ||||||||||||     
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  156 attaggtacggaatg 170  Q
    |||||||| ||||||    
T  150292 attaggtagggaatg 150306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21186938 - 21186908
Alignment:
Q  192 aattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21186938 aattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 21186908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 21651111 - 21651148
Alignment:
Q  185 ctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21651111 ctacaataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaa 21651148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17320260 - 17320200
Alignment:
Q  100 gttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | || |||||||||||    
T  17320260 gttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattag 17320200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22436958 - 22437179
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22436958 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 22437057  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22437058 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 22437157  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  22437158 ccttcaaatggggtaattcaaa 22437179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6282483 - 6282263
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  6282483 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 6282384  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6282383 ttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 6282284  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6282283 cctttgaatggggtaattcaa 6282263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 957611 - 957398
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  957611 gtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 957512  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  957511 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctt 957412  T
Q  205 tgaatggggtaatt 218  Q
    ||||||||||||||    
T  957411 tgaatggggtaatt 957398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 2773056 - 2773277
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  2773056 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 2773155  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2773156 ttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatcaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 2773255  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2773256 cctttgaatggggtaattcaaa 2773277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34153446 - 34153225
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  34153446 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacg 34153347  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||    
T  34153346 ttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt 34153247  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34153246 cctttgaatggggtaattcaaa 34153225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43889659 - 43889438
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43889659 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 43889560  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  43889559 ttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 43889460  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  43889459 cctctaaatggggtaattcaaa 43889438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47657515 - 47657294
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  47657515 gagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 47657416  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||    
T  47657415 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcacattccagctacaacaattgtctt 47657316  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  47657315 cctttgaatgaggtaattcaaa 47657294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49792096 - 49791875
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||    
T  49792096 gagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacg 49791997  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49791996 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcatcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 49791897  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  49791896 cctttaaatggggtaattcaaa 49791875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34529956 - 34529735
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  34529956 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacg 34529857  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| | ||    
T  34529856 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacattaaagctacaacaattgtatt 34529757  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34529756 cctttgaatggggtaattcaaa 34529735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36776679 - 36776458
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36776679 gagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 36776580  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  36776579 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctgaaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 36776480  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36776479 cctttgaatggggtaattcaaa 36776458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21169498 - 21169719
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  21169498 gagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcgacgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacg 21169597  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  21169598 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 21169697  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21169698 cctttgaatggggtaattcaaa 21169719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44560340 - 44560119
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  44560340 gagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacg 44560241  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  44560240 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctccttaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 44560141  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44560140 cctttgaatggggtaattcaaa 44560119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49423918 - 49423696
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49423918 gagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacg 49423819  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||    
T  49423818 ttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgtt 49423719  T
Q  201 -cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  49423718 acctttgaatggggtaattcaaa 49423696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49817804 - 49817583
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  49817804 gagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacg 49817705  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||    
T  49817704 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgtacctttcaactacaacaattgtctt 49817605  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  49817604 catttgaatggggtaattcaaa 49817583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 21711581 - 21711736
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21711581 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgc 21711680  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21711681 tgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 21711736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40353933 - 40353715
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  40353933 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 40353834  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  40353833 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 40353737  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40353736 cctttgaatggggtaattcaaa 40353715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4785582 - 4785361
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||    
T  4785582 gagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacg 4785483  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||    
T  4785482 ttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccacaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcatctttcagctacaacaattgtgtt 4785383  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| |  |||||||||||||||    
T  4785382 cctctagatggggtaattcaaa 4785361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 1042796 - 1042955
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1042796 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 1042895  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  1042896 ttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 1042955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14330850 - 14330695
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  14330850 gtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgc 14330751  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  14330750 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 14330695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21017337 - 21017178
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  21017337 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 21017238  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  21017237 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 21017178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 25762645 - 25762804
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||    
T  25762645 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacg 25762744  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  25762745 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 25762804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26591845 - 26591678
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  26591845 gagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 26591746  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaa 168  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  26591745 ttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51027927 - 51027768
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  51027927 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 51027828  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||||||    
T  51027827 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccataagatcgtcattag 51027768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 37866453 - 37866613
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgtttt-gggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37866453 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgatgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgac 37866552  T
Q  100 gttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37866553 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccgctagaagatcgtcattag 37866613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759533
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 27759533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33163704 - 33163545
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33163704 gagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacg 33163605  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  33163604 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 33163545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41794722 - 41794563
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  41794722 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 41794623  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  41794622 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 41794563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51428352 - 51428193
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  51428352 gagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 51428253  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  51428252 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcaagaagatcgtcattag 51428193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 55796790 - 55796949
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  55796790 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 55796889  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  55796890 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 55796949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20779029 - 20778867
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  20779029 gagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcg 20778930  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||    
T  20778929 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattaggta 20778867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 1226210 - 1226365
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  1226210 gtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgc 1226309  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  1226310 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 1226365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6177475 - 6177316
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  6177475 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 6177376  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  6177375 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 6177316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31824789 - 31824630
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  31824789 gagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacg 31824690  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31824689 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattag 31824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 39588976 - 39589135
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  39588976 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacg 39589075  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39589076 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctagaagatcgtcattag 39589135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 56138957 - 56139116
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  56138957 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 56139056  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  56139057 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 56139116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 49064033 - 49064185
Alignment:
Q  8 tcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctga 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49064033 tcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgctta 49064132  T
Q  108 gatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  49064133 gatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 49064185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 242576 - 242417
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  242576 gagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 242477  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  242476 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 242417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 49094792 - 49094951
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  49094792 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 49094891  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  49094892 ttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 49094951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20901828 - 20901669
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||     
T  20901828 gagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaaca 20901729  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20901728 ctgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctgaagatcgtcattag 20901669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32938062 - 32937903
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  32938062 gagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 32937963  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  32937962 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattag 32937903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 45939572 - 45939731
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  45939572 gagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 45939671  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | | ||||||||||||||    
T  45939672 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccataagatcgtcattag 45939731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 11288342 - 11288558
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  11288342 gagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 11288441  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||   ||||||||||| |||| ||| |    |||||||||||  | |||| |||||| ||||    
T  11288442 ttgctgagatcaactgaagatattatcacaa-tttgattctgttagaagatcgtgattaagtagg----gaatgcaccttccaactaccataattgtctt 11288536  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  11288537 cctttgaatgaggtaattcaaa 11288558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 42886318 - 42886530
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  42886318 tatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaacatgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgct 42886417  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttccttt 205  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||| ||||||||||| || | |||| |||||  |||||||| |||| | ||||| |    
T  42886418 gagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatcattaggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgtattcctct 42886517  T
Q  206 gaatggggtaatt 218  Q
    | |||||||||||    
T  42886518 ggatggggtaatt 42886530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 46816679 - 46816526
Alignment:
Q  5 gtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||     
T  46816679 gtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgt 46816580  T
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  46816579 tgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgccagaagatcgtcattag 46816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24606799 - 24607017
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  24606799 gagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacg 24606898  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||| |||||||| |   | |||| || ||  | |||||| |||| ||||    
T  24606899 ttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtagg---taaatgtacattccaactacaacaattgtctt 24606995  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  24606996 cctttgaatgaggtaattcaaa 24607017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 28082285 - 28082444
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||  ||||| |    
T  28082285 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaag 28082384  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  28082385 ttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattag 28082444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Original strand, 17211318 - 17211480
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17211318 tatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgct 17211417  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaa 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||    
T  17211418 gagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaa 17211480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 9489726 - 9489884
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9489726 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg-agcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacg 9489824  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  9489825 ttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 9489884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 10312319 - 10312447
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  10312319 gagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 10312418  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 129  Q
    ||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  10312419 ttgttaagatcaactgaagatattatcaa 10312447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 3393351 - 3393520
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   || |||    
T  3393351 gagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacg 3393450  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||| | |||||||| ||||||    
T  3393451 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatgattaggtagggaatg 3393520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Original strand, 18412647 - 18412811
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  18412647 tatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtgaggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgct 18412746  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    |||||||||| || |||| ||||| |  |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18412747 gagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 18412811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 13850796 - 13850965
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||     
T  13850796 gagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaaca 13850895  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||  | |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  13850896 ttgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtgattaggtagggaatg 13850965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 13866310 - 13866479
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||  || |||    
T  13866310 gagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacg 13866409  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||  | |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  13866410 ttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtgattaggtagggaatg 13866479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 31324221 - 31324390
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| || | |    
T  31324221 gagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtgacgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaag 31324320  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  |||| || |||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  31324321 ttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctagaagatcatgattaggtagggaatg 31324390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Original strand, 49064563 - 49064627
Alignment:
Q  158 taggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  49064563 taggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaa 49064627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817188
Alignment:
Q  75 tccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||  ||||||  | | |||||||| |||||||| ||||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagggaatg 49817188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32027786 - 32027565
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  32027786 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacg 32027687  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  32027686 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 32027587  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32027586 cctttgaatggggtaattcaaa 32027565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13402584 - 13402805
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13402584 gagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 13402683  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  13402684 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 13402783  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13402784 cctttgaatggggtaattcaaa 13402805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32037845 - 32037624
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  32037845 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacg 32037746  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||| ||||    
T  32037745 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaaggaataaatgcacattaaagctacaacaattgtctt 32037646  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32037645 cctttgaatggggtaattcaaa 32037624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12396827 - 12397048
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  12396827 gagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 12396926  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12396927 ttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 12397026  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  12397027 cctttgaatgaggtaattcaaa 12397048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257516
Alignment:
Q  9 cattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  109 atcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaa 208  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| | ||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctaaa 30257530  T
Q  209 tggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||    
T  30257529 tggggtaattcaaa 30257516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34803054 - 34802833
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  34803054 gagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacg 34802955  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||| |||| ||||    
T  34802954 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccaaaagatcgtcattaggtaaggaatgaatgcgctttcgagctacaaaaattgtctt 34802855  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  34802854 cctttgaatgtggtaattcaaa 34802833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35058893 - 35058734
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  35058893 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 35058794  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  35058793 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattag 35058734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 11692502 - 11692661
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  11692502 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 11692601  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  11692602 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 11692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 801223 - 801375
Alignment:
Q  8 tcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctga 107  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  801223 tcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctga 801322  T
Q  108 gatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  801323 gatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 801375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 6205535 - 6205694
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  6205535 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 6205634  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  6205635 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 6205694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14115088 - 14115305
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||    
T  14115088 gagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacg 14115187  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  | ||||||| || |||||||| |    |||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  14115188 ttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgccagaagatagtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 14115283  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  14115284 cctttaaatagggtaattcaaa 14115305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 27640231 - 27640390
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  27640231 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 27640330  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  27640331 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 27640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29108191 - 29108350
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29108191 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 29108290  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29108291 ttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 29108350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22305847 - 22305978
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  22305847 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 22305946  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaag 132  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22305947 ttggttagatcaactgaagatatcatcaaaag 22305978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29066604 - 29066763
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  29066604 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 29066703  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | || |||||||||||||    
T  29066704 ttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagtagatcgtcattag 29066763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29075617 - 29075776
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  29075617 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 29075716  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | || |||||||||||||    
T  29075717 ttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcattag 29075776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29110589 - 29110748
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  29110589 gagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 29110688  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | || |||||||||||||    
T  29110689 ttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcattag 29110748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021174
Alignment:
Q  112 aactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatgg 211  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgg 35021185  T
Q  212 ggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||||    
T  35021184 ggtaattcaaa 35021174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765786
Alignment:
Q  80 tggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagctt-gattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattag 3765786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 4495119 - 4495174
Alignment:
Q  166 gaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaa 221  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4495119 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaa 4495174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021037
Alignment:
Q  88 tatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagcta 187  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | || ||||||||||| || || | |  ||||  ||  | |||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacta 24021072  T
Q  188 caataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24021071 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 24021037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30257212 - 30257137
Alignment:
Q  147 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||    
T  30257212 aagatcgtcggtaggtacggaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtctttctttaaatgaggtaattcaaa 30257137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192666
Alignment:
Q  88 tatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagcta 187  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | | || ||||||||||| || || | |  ||||  ||  | |||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaacta 2192631  T
Q  188 caataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2192632 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 2192666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 111
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402361
Alignment:
Q  56 ttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatc 111  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatc 2402361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465331
Alignment:
Q  79 gtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||  | | |||||||| ||||||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggta 17465331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 35565318 - 35565538
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35565318 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-cgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacg 35565416  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35565417 ttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcacctttcagctacaacaattatctt 35565516  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35565517 cctttgaatggggtaattcaaa 35565538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1400463 - 1400242
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1400463 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacg 1400364  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  1400363 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 1400264  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  1400263 ccttttaatggggtaattcaaa 1400242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4724235 - 4724014
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4724235 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 4724136  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  4724135 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccaaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt 4724036  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4724035 cctctgaatggggtaattcaaa 4724014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18308306 - 18308527
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  18308306 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 18308405  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||    
T  18308406 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagtagattgacattaggtatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtctt 18308505  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18308506 cctttgaatggggtaattcaaa 18308527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36350466 - 36350281
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36350466 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatg---------cacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacg 36350376  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataatt 195  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  36350375 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaatt 36350281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6793545 - 6793353
Alignment:
Q  3 gagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgtt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||    
T  6793545 gagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggtt 6793446  T
Q  103 gctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataatt 195  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  6793445 gctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagccagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaatt 6793353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7390 - 7172
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  7390 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 7291  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  7290 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 7194  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7193 cctttgaatggggtaattcaaa 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27661538 - 27661320
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  27661538 gagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 27661439  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  27661438 ttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 27661342  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27661341 cctttgaatggggtaattcaaa 27661320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 8538000 - 8538159
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  8538000 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 8538099  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  8538100 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 8538159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 40009574 - 40009733
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40009574 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacg 40009673  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40009674 ttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccacaagaagatcgtcattag 40009733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1695056
Alignment:
Q  25 attaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatc 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  125 atcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaa 1695056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 11346755 - 11346914
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  11346755 gagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaag 11346854  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  11346855 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 11346914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19036835 - 19036676
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  19036835 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 19036736  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  19036735 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 19036676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8576302 - 8576084
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |    
T  8576302 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaag 8576203  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatctt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| || || | |  ||||  ||  | |||||| |||| ||||    
T  8576202 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 8576106  T
Q  201 cctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8576105 cctttgaatggggtaattcaaa 8576084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 541796 - 541637
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  541796 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgggacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 541697  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||||    
T  541696 ttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtcattag 541637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 1971411 - 1971550
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||    
T  1971411 gagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacg 1971510  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1971511 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattc 1971550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 3601387 - 3601546
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  3601387 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaagagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacg 3601486  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  3601487 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattag 3601546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 28881037 - 28881196
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  28881037 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 28881136  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||    
T  28881137 ttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 28881196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 11027823 - 11027982
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  11027823 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 11027922  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  11027923 ttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 11027982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 19400409 - 19400568
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19400409 gagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 19400508  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||    
T  19400509 ttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaatatcgtcattag 19400568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 30709644 - 30709803
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  30709644 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 30709743  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||    
T  30709744 ttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattag 30709803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35927597 - 35927470
Alignment:
Q  2 agagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgt 101  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  35927597 agagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgt 35927498  T
Q  102 tgctgagatcaactaaagatatcatcaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35927497 tgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 38854204 - 38854363
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  38854204 gagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaag 38854303  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||    
T  38854304 ttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagaccgtcattag 38854363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 33370700 - 33370862
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  33370700 gagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 33370799  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||  | |||||||| | ||||||||    
T  33370800 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatgattaggta 33370862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 3169649 - 3169760
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3169649 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacg 3169748  T
Q  101 ttgctgagatca 112  Q
    ||||||||||||    
T  3169749 ttgctgagatca 3169760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17366892 - 17366769
Alignment:
Q  6 tatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacgttgct 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||  ||||| |    
T  17366892 tatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgtt 17366793  T
Q  106 gagatcaactaaagatatcatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  17366792 gagatcaactaaagatattatcaa 17366769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 160
Target Start/End: Original strand, 7082340 - 7082426
Alignment:
Q  74 ttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7082340 ttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 7082426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 2599265 - 2599379
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||   || ||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||    
T  2599265 gagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatgaagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacg 2599364  T
Q  101 ttgctgagatcaact 115  Q
    |||||||||| ||||    
T  2599365 ttgctgagattaact 2599379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 3458882 - 3458941
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttg 60  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3458882 gagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195351
Alignment:
Q  98 acgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 17195351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3458995
Alignment:
Q  105 tgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattag 3458995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Original strand, 7082792 - 7082867
Alignment:
Q  147 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7082792 aagatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaacgtggtaattcaaa 7082867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Original strand, 1171725 - 1171782
Alignment:
Q  165 ggaatgaatgcaccttttagctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||||||||||||||||  | || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1171725 ggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 1171782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Original strand, 18920861 - 18920949
Alignment:
Q  82 gatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatg 170  Q
    |||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18920861 gatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 18920949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22283756
Alignment:
Q  88 tatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattc 140  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattc 22283756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742880
Alignment:
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggta 12742880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4723723 - 4723686
Alignment:
Q  185 ctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4723723 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 4723686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 22283798 - 22283835
Alignment:
Q  185 ctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22283798 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 22283835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 2316 - 2475
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  2316 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 2415  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||    
T  2416 ttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgccaaaagatcgtcattag 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1998
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1839 gagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacg 1938  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||||    
T  1939 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccataagatcgtcattag 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18075 - 17916
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||    
T  18075 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacg 17976  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattag 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  17975 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattag 17916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 24954 - 25076
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgtgggtgacg 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || || | ||     
T  24954 gagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataaca 25053  T
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatat 123  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  25054 ttgctaagatcaactgaagatat 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 64024 - 64095
Alignment:
Q  1 gagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacat 72  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  64024 gagagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64160
Alignment:
Q  101 ttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggta 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggta 64160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85593
Alignment:
Q  88 tatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagcttgattcaactagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagcta 187  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||| || || | |  ||||  ||  | |||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacta 85558  T
Q  188 caataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  85559 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 85593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 14698 - 14735
Alignment:
Q  185 ctacaataattatcttcctttgaatggggtaattcaaa 222  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14698 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 14735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 14604 - 14648
Alignment:
Q  88 tatgtgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaag 132  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14604 tatgtgggtgaagttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaag 14648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University