View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11622_low_5 (Length: 617)

Name: NF11622_low_5
Description: NF11622
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11622_low_5
NF11622_low_5
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (10-617)||(80572-81181)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (12-389)||(6996292-6996669)
chr1 (10-387)||(29003167-29003544)
chr1 (10-360)||(31736699-31737049)
chr1 (10-387)||(28997451-28997828)
chr1 (14-389)||(50077988-50078363)
chr1 (70-389)||(31424228-31424547)
chr1 (14-389)||(16429658-16430032)
chr1 (10-298)||(25250566-25250854)
chr1 (202-389)||(28202555-28202742)
chr1 (202-360)||(51751271-51751429)
chr1 (202-360)||(16227402-16227560)
chr1 (202-360)||(27338017-27338175)
chr1 (202-360)||(47178596-47178754)
chr1 (202-360)||(20301365-20301523)
chr1 (10-209)||(51750743-51750942)
chr1 (10-209)||(28841128-28841327)
chr1 (10-209)||(51758240-51758439)
chr1 (12-209)||(16226876-16227073)
chr1 (202-339)||(28841623-28841760)
chr1 (10-209)||(20300837-20301036)
chr1 (10-209)||(28203073-28203272)
chr1 (14-208)||(3805513-3805707)
chr1 (10-207)||(47178068-47178265)
chr1 (10-209)||(27338507-27338706)
chr1 (32-209)||(8348439-8348616)
chr1 (202-388)||(13126596-13126779)
chr1 (22-209)||(13127109-13127296)
chr1 (14-207)||(50168683-50168875)
chr1 (410-535)||(23909745-23909872)
chr1 (319-389)||(14099119-14099189)
chr1 (14-196)||(31657846-31658028)
chr1 (300-389)||(25249846-25249935)
chr1 (230-355)||(50168193-50168318)
chr1 (202-338)||(28222284-28222414)
chr1 (231-326)||(31658342-31658437)
chr1 (14-196)||(28222765-28222947)
chr1 (34-133)||(16456380-16456479)
chr1 (470-535)||(12714920-12714984)
chr1 (470-535)||(28631759-28631823)
chr1 (14-133)||(3157305-3157424)
chr1 (448-535)||(34265905-34265991)
chr1 (470-535)||(15317594-15317658)
chr1 (470-535)||(28565459-28565523)
chr1 (229-281)||(8348036-8348088)
chr1 (472-535)||(13662148-13662211)
chr1 (231-353)||(776274-776396)
chr1 (23-121)||(41397654-41397752)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (10-389)||(658724-659103)
chr5 (10-389)||(27911138-27911517)
chr5 (38-389)||(18510608-18510959)
chr5 (30-389)||(20043710-20044057)
chr5 (138-389)||(31467087-31467340)
chr5 (10-190)||(25806167-25806347)
chr5 (224-389)||(25806350-25806515)
chr5 (212-384)||(18467931-18468103)
chr5 (202-389)||(20505061-20505248)
chr5 (202-360)||(15355736-15355894)
chr5 (202-360)||(34478306-34478464)
chr5 (202-360)||(31543967-31544125)
chr5 (202-339)||(10750932-10751069)
chr5 (202-360)||(23666280-23666439)
chr5 (10-209)||(31543439-31543638)
chr5 (10-209)||(34478793-34478992)
chr5 (202-360)||(6746305-6746463)
chr5 (13-207)||(10750407-10750601)
chr5 (10-207)||(15356225-15356422)
chr5 (10-207)||(23665752-23665949)
chr5 (10-209)||(6745774-6745973)
chr5 (10-197)||(18467390-18467577)
chr5 (14-207)||(29721017-29721210)
chr5 (14-207)||(9788554-9788747)
chr5 (14-197)||(26171409-26171592)
chr5 (14-207)||(16407977-16408170)
chr5 (410-535)||(38041520-38041647)
chr5 (34-209)||(534421-534596)
chr5 (298-389)||(16545710-16545801)
chr5 (298-389)||(26174048-26174139)
chr5 (298-389)||(29721641-29721732)
chr5 (14-207)||(40380758-40380951)
chr5 (14-197)||(13694484-13694667)
chr5 (14-207)||(16545079-16545275)
chr5 (439-535)||(19365862-19365957)
chr5 (298-361)||(16408603-16408666)
chr5 (298-389)||(40381386-40381477)
chr5 (34-209)||(42427762-42427937)
chr5 (260-356)||(42427276-42427372)
chr5 (470-535)||(9702657-9702721)
chr5 (446-500)||(18037294-18037348)
chr5 (302-375)||(535007-535080)
chr5 (23-123)||(33790728-33790828)
chr5 (23-123)||(37557198-37557298)
chr5 (470-521)||(290878-290929)
chr5 (452-535)||(32977131-32977213)
chr5 (446-501)||(39169409-39169464)
chr5 (446-535)||(2366869-2366957)
chr5 (231-375)||(13487226-13487370)
chr5 (23-123)||(27449235-27449335)
chr5 (59-123)||(31397602-31397666)
chr5 (446-498)||(37464503-37464555)
chr5 (410-438)||(2366979-2367007)
chr5 (254-326)||(13694160-13694232)
chr5 (23-123)||(43598145-43598245)
chr5 (23-123)||(43603637-43603737)
chr5 (23-123)||(43609129-43609229)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (12-389)||(53916868-53917245)
chr3 (10-389)||(3315367-3315746)
chr3 (10-389)||(42990984-42991363)
chr3 (10-386)||(28101205-28101581)
chr3 (10-389)||(43422664-43423041)
chr3 (202-389)||(18098026-18098213)
chr3 (182-389)||(891101-891308)
chr3 (202-360)||(457120-457278)
chr3 (202-360)||(11169314-11169472)
chr3 (202-354)||(6064686-6064838)
chr3 (213-360)||(5898636-5898783)
chr3 (202-360)||(10957210-10957368)
chr3 (202-360)||(43227293-43227451)
chr3 (10-207)||(456592-456789)
chr3 (204-360)||(4309394-4309550)
chr3 (10-207)||(6065169-6065366)
chr3 (229-389)||(23634667-23634827)
chr3 (10-209)||(5192335-5192534)
chr3 (10-209)||(10957697-10957896)
chr3 (10-209)||(43226762-43226961)
chr3 (10-209)||(5898094-5898293)
chr3 (10-209)||(11168786-11168985)
chr3 (10-209)||(18098545-18098744)
chr3 (13-209)||(7769243-7769439)
chr3 (10-209)||(4309884-4310083)
chr3 (30-209)||(23634150-23634329)
chr3 (14-207)||(23199471-23199664)
chr3 (14-203)||(27421327-27421516)
chr3 (229-389)||(25634738-25634895)
chr3 (14-207)||(5259655-5259848)
chr3 (14-207)||(37407331-37407524)
chr3 (14-207)||(10209843-10210036)
chr3 (231-389)||(23198947-23199105)
chr3 (233-375)||(7763473-7763615)
chr3 (14-207)||(4600052-4600245)
chr3 (14-207)||(9635456-9635649)
chr3 (14-207)||(10056887-10057080)
chr3 (14-207)||(10061331-10061524)
chr3 (14-207)||(10063553-10063746)
chr3 (14-207)||(10065775-10065968)
chr3 (298-389)||(4599526-4599617)
chr3 (298-389)||(10210468-10210559)
chr3 (37-144)||(25634589-25634696)
chr3 (14-207)||(6717155-6717348)
chr3 (22-207)||(7762921-7763106)
chr3 (35-207)||(29811532-29811704)
chr3 (30-121)||(1619936-1620027)
chr3 (290-389)||(5259131-5259230)
chr3 (298-389)||(10057515-10057606)
chr3 (298-389)||(10059737-10059828)
chr3 (298-389)||(10061959-10062050)
chr3 (298-389)||(10064181-10064272)
chr3 (298-389)||(10066403-10066494)
chr3 (14-133)||(15830648-15830767)
chr3 (420-535)||(22759086-22759201)
chr3 (14-207)||(10059109-10059302)
chr3 (242-375)||(32892301-32892434)
chr3 (298-389)||(6717779-6717870)
chr3 (14-197)||(22834351-22834534)
chr3 (242-389)||(27421889-27422036)
chr3 (238-388)||(1619701-1619851)
chr3 (242-372)||(7769763-7769893)
chr3 (231-375)||(29812071-29812215)
chr3 (34-133)||(32891752-32891851)
chr3 (56-209)||(15822016-15822169)
chr3 (14-110)||(53597915-53598011)
chr3 (14-123)||(23409748-23409857)
chr3 (446-535)||(30766430-30766518)
chr3 (30-123)||(32479753-32479846)
chr3 (23-123)||(8516507-8516607)
chr3 (472-535)||(16496326-16496389)
chr3 (470-533)||(54792723-54792785)
chr3 (155-208)||(15830573-15830626)
chr3 (95-132)||(24933175-24933212)
chr3 (292-333)||(31116505-31116546)
chr3 (470-535)||(35437203-35437267)
chr3 (446-497)||(918821-918872)
chr3 (471-510)||(12157762-12157801)
chr3 (446-497)||(44072774-44072825)
chr3 (303-389)||(27900224-27900310)
chr3 (157-207)||(32891875-32891925)
chr3 (242-355)||(15824698-15824811)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (10-389)||(28486280-28486659)
chr7 (12-360)||(7471204-7471552)
chr7 (30-389)||(24749322-24749681)
chr7 (21-389)||(21678785-21679153)
chr7 (28-360)||(20298048-20298380)
chr7 (119-389)||(4293911-4294181)
chr7 (135-389)||(9679498-9679752)
chr7 (202-360)||(1048176-1048334)
chr7 (202-381)||(44725826-44726005)
chr7 (202-360)||(7350538-7350696)
chr7 (202-360)||(31157172-31157330)
chr7 (202-360)||(22136046-22136205)
chr7 (10-209)||(38394701-38394900)
chr7 (202-360)||(40551073-40551232)
chr7 (202-360)||(7093348-7093506)
chr7 (202-360)||(38395227-38395385)
chr7 (10-209)||(7093835-7094034)
chr7 (10-207)||(7351027-7351224)
chr7 (10-209)||(1048663-1048862)
chr7 (10-207)||(22135518-22135715)
chr7 (10-207)||(40550545-40550742)
chr7 (10-209)||(36165-36364)
chr7 (10-209)||(44725290-44725489)
chr7 (10-209)||(13289873-13290072)
chr7 (229-387)||(24816223-24816381)
chr7 (58-207)||(31159078-31159227)
chr7 (12-123)||(4295401-4295512)
chr7 (298-389)||(44011706-44011797)
chr7 (410-535)||(23476616-23476743)
chr7 (242-388)||(6047761-6047907)
chr7 (14-207)||(6593866-6594059)
chr7 (14-207)||(18391504-18391697)
chr7 (14-209)||(24816744-24816933)
chr7 (32-196)||(48490065-48490229)
chr7 (202-272)||(36693-36763)
chr7 (11-197)||(47675480-47675666)
chr7 (231-373)||(48490606-48490748)
chr7 (275-360)||(43555-43640)
chr7 (298-389)||(6593340-6593431)
chr7 (298-389)||(18390978-18391069)
chr7 (35-208)||(26213460-26213632)
chr7 (231-375)||(47674960-47675104)
chr7 (298-389)||(1560773-1560864)
chr7 (410-535)||(42298837-42298963)
chr7 (470-535)||(9226050-9226114)
chr7 (470-535)||(38434307-38434371)
chr7 (470-535)||(42996889-42996953)
chr7 (446-510)||(8998428-8998492)
chr7 (23-123)||(16884340-16884440)
chr7 (56-141)||(6047245-6047330)
chr7 (23-123)||(12405750-12405850)
chr7 (446-498)||(19033712-19033764)
chr7 (446-498)||(20720872-20720924)
chr7 (446-498)||(20765534-20765586)
chr7 (23-123)||(24261897-24261997)
chr7 (446-498)||(29491112-29491164)
chr7 (446-498)||(34282160-34282212)
chr7 (446-509)||(45121954-45122017)
chr7 (32-133)||(6570647-6570748)
chr7 (446-498)||(33230018-33230070)
chr7 (154-209)||(3903814-3903869)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (12-389)||(41383416-41383792)
chr8 (21-389)||(21481268-21481636)
chr8 (202-360)||(43080891-43081049)
chr8 (202-360)||(18811997-18812155)
chr8 (202-360)||(27828274-27828432)
chr8 (10-209)||(18811469-18811668)
chr8 (10-209)||(27827746-27827945)
chr8 (10-209)||(15069328-15069527)
chr8 (10-209)||(43080363-43080562)
chr8 (14-207)||(34255839-34256032)
chr8 (30-209)||(31577668-31577846)
chr8 (202-314)||(15069859-15069971)
chr8 (232-378)||(31577171-31577317)
chr8 (310-389)||(15071820-15071899)
chr8 (32-207)||(4732318-4732493)
chr8 (231-375)||(34255328-34255472)
chr8 (31-209)||(17848308-17848486)
chr8 (229-375)||(41365835-41365981)
chr8 (253-389)||(17848866-17849002)
chr8 (231-373)||(4732831-4732973)
chr8 (422-535)||(27272584-27272698)
chr8 (14-197)||(5591527-5591710)
chr8 (470-535)||(12249941-12250005)
chr8 (470-535)||(23626085-23626149)
chr8 (470-535)||(39445202-39445266)
chr8 (23-123)||(10684838-10684938)
chr8 (446-498)||(20662984-20663036)
chr8 (23-123)||(35744803-35744903)
chr8 (446-498)||(44213101-44213153)
chr8 (92-132)||(7099960-7100000)
chr8 (446-498)||(30548347-30548399)
chr8 (470-508)||(4634842-4634880)
chr8 (470-535)||(21543183-21543246)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-389)||(50724-51103)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (10-389)||(14788627-14789006)
chr4 (10-389)||(47563515-47563894)
chr4 (12-360)||(22801960-22802308)
chr4 (10-389)||(16454063-16454444)
chr4 (10-360)||(36920721-36921071)
chr4 (202-389)||(22133475-22133662)
chr4 (168-389)||(36379144-36379365)
chr4 (202-389)||(5099771-5099958)
chr4 (202-360)||(22781624-22781782)
chr4 (202-389)||(12399676-12399863)
chr4 (202-389)||(12401951-12402138)
chr4 (202-360)||(9175360-9175518)
chr4 (202-360)||(22045601-22045760)
chr4 (202-360)||(11007455-11007613)
chr4 (202-360)||(16933035-16933193)
chr4 (10-209)||(22133991-22134190)
chr4 (10-207)||(22782113-22782310)
chr4 (10-209)||(11007942-11008141)
chr4 (10-209)||(16933522-16933721)
chr4 (14-169)||(18536918-18537073)
chr4 (10-209)||(22046089-22046288)
chr4 (11-197)||(12402482-12402668)
chr4 (31-375)||(10113639-10113968)
chr4 (10-207)||(9175848-9176045)
chr4 (14-114)||(36379048-36379148)
chr4 (14-207)||(5872457-5872650)
chr4 (10-194)||(12395249-12395432)
chr4 (10-194)||(12400211-12400394)
chr4 (298-389)||(36770499-36770590)
chr4 (14-207)||(52094695-52094888)
chr4 (14-357)||(3577934-3578263)
chr4 (14-207)||(5136734-5136927)
chr4 (14-207)||(12743261-12743454)
chr4 (14-207)||(8394060-8394253)
chr4 (298-375)||(8394688-8394765)
chr4 (14-207)||(7123350-7123543)
chr4 (298-389)||(5137362-5137453)
chr4 (231-389)||(12740541-12740699)
chr4 (231-389)||(12748747-12748905)
chr4 (297-375)||(47565620-47565698)
chr4 (298-389)||(7123978-7124069)
chr4 (445-532)||(19591003-19591090)
chr4 (298-360)||(18536029-18536091)
chr4 (446-535)||(1975318-1975406)
chr4 (42-209)||(5206994-5207161)
chr4 (231-337)||(34571459-34571565)
chr4 (446-498)||(21565013-21565065)
chr4 (446-509)||(23992374-23992437)
chr4 (242-361)||(26558915-26559034)
chr4 (446-509)||(49711678-49711741)
chr4 (448-510)||(28120238-28120300)
chr4 (470-535)||(26870058-26870122)
chr4 (446-498)||(10259390-10259442)
chr4 (446-498)||(24077459-24077511)
chr4 (446-498)||(26924329-26924381)
chr4 (446-498)||(43332534-43332586)
chr4 (446-498)||(51452601-51452653)
chr4 (56-133)||(4588636-4588713)
chr4 (23-123)||(9224978-9225078)
chr4 (229-269)||(18536819-18536859)
chr4 (358-389)||(22801966-22801997)
chr4 (93-190)||(5350584-5350681)
chr4 (358-386)||(36920730-36920758)
chr4 (447-535)||(56541691-56541778)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (10-360)||(675-1025)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (10-360)||(15533825-15534175)
chr6 (30-389)||(3631137-3631496)
chr6 (202-360)||(26067282-26067440)
chr6 (202-360)||(33310123-33310281)
chr6 (237-389)||(3395245-3395397)
chr6 (10-186)||(17012769-17012944)
chr6 (10-207)||(33309595-33309792)
chr6 (10-207)||(26931939-26932136)
chr6 (25-209)||(25462839-25463023)
chr6 (10-207)||(26067771-26067968)
chr6 (14-141)||(26944234-26944361)
chr6 (11-157)||(3395103-3395249)
chr6 (22-207)||(5408402-5408587)
chr6 (22-207)||(5412727-5412912)
chr6 (14-209)||(12157961-12158156)
chr6 (21-208)||(12936624-12936811)
chr6 (231-389)||(16568167-16568325)
chr6 (229-339)||(26944449-26944559)
chr6 (14-207)||(16553318-16553511)
chr6 (14-207)||(16629874-16630067)
chr6 (231-375)||(5407899-5408043)
chr6 (231-375)||(5412224-5412368)
chr6 (14-207)||(34165526-34165719)
chr6 (14-209)||(16651578-16651774)
chr6 (286-389)||(30444606-30444709)
chr6 (298-389)||(16553946-16554037)
chr6 (298-389)||(16630502-16630593)
chr6 (298-389)||(16652208-16652299)
chr6 (14-205)||(30444003-30444194)
chr6 (298-389)||(34166154-34166245)
chr6 (63-208)||(12910948-12911093)
chr6 (229-389)||(11137333-11137493)
chr6 (446-532)||(33979108-33979194)
chr6 (448-535)||(33300594-33300680)
chr6 (446-535)||(2624751-2624839)
chr6 (446-535)||(22975747-22975835)
chr6 (446-535)||(23812566-23812654)
chr6 (154-207)||(16567768-16567821)
chr6 (446-498)||(250047-250099)
chr6 (446-498)||(12579843-12579895)
chr6 (446-497)||(3052072-3052123)
chr6 (470-535)||(1932288-1932352)
chr6 (298-335)||(10456514-10456551)
chr6 (30-123)||(33331027-33331120)
chr6 (410-438)||(33300540-33300568)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (14-389)||(6263348-6263723)
chr2 (150-389)||(31734073-31734312)
chr2 (202-389)||(21519552-21519739)
chr2 (202-360)||(19503223-19503381)
chr2 (202-360)||(35216857-35217015)
chr2 (202-360)||(36560031-36560189)
chr2 (10-207)||(35217346-35217543)
chr2 (10-207)||(36560517-36560714)
chr2 (10-209)||(19503710-19503909)
chr2 (10-197)||(21520080-21520267)
chr2 (14-196)||(22405317-22405499)
chr2 (262-389)||(22402266-22402393)
chr2 (230-375)||(14634821-14634966)
chr2 (10-121)||(34574620-34574731)
chr2 (242-389)||(28569281-28569428)
chr2 (410-535)||(1691456-1691583)
chr2 (14-169)||(28569839-28569994)
chr2 (410-535)||(7984014-7984141)
chr2 (23-123)||(19348690-19348790)
chr2 (446-510)||(24278977-24279041)
chr2 (470-535)||(25124073-25124137)
chr2 (286-355)||(41304109-41304178)
chr2 (446-498)||(3711081-3711133)
chr2 (446-498)||(11866283-11866335)
chr2 (470-535)||(17026065-17026129)
chr2 (61-208)||(42019221-42019368)
chr2 (470-535)||(17092250-17092314)
chr2 (446-506)||(7768739-7768798)
chr2 (446-497)||(35357677-35357728)
chr2 (295-355)||(42018734-42018794)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (202-389)||(34792-34979)
scaffold0011 (10-209)||(34256-34455)
[»] scaffold1899 (2 HSPs)
scaffold1899 (202-360)||(858-1016)
scaffold1899 (10-209)||(330-529)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (202-360)||(23360-23519)
scaffold0140 (10-207)||(22832-23029)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (10-186)||(26288-26463)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (10-209)||(72891-73090)
scaffold0025 (213-295)||(72466-72548)
scaffold0025 (290-360)||(70415-70485)
[»] scaffold1908 (2 HSPs)
scaffold1908 (202-389)||(541-722)
scaffold1908 (154-207)||(148-201)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (14-196)||(115245-115427)
scaffold0016 (231-338)||(115801-115908)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (456-535)||(8343-8421)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (26-123)||(454-551)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (470-535)||(52722-52786)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (446-509)||(10700-10763)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (36-209)||(26747-26920)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (446-535)||(12947-13035)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (23-123)||(14883-14983)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (23-123)||(149529-149629)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (446-509)||(33442-33505)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (472-535)||(151910-151973)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (470-535)||(61661-61725)


Alignment Details
Target: scaffold0004 (Bit Score: 531; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 617
Target Start/End: Original strand, 80572 - 81181
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  80572 agcaaaggaaacaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaacggaaagtcctaaagcaacaactttac 80671  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  80672 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 80771  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  80772 cgggtgttctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacg 80871  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactctttaatttgctcatttcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80872 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactctttaatttgctcatttcatg 80971  T
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc--gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  80972 aatatatgctcttttcatgaatcaagaccttgtaagactttgataaatatttataatgttcgtgcaatattccttaatttgctcatttttcctttgaaac 81071  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaaagataagtttatataagaaagagaagttttggtgtaacatttattcttccaaatttacttttcacttaaact 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81072 aataatttttacaacatatgttattcaaagataagtttatataagaaagagaagttttggtgtaacatttattcttccaaatttacttttcacttaaact 81171  T
Q  608 tttttacaat 617  Q
    ||||||||||    
T  81172 tttttacaat 81181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 389
Target Start/End: Original strand, 6996292 - 6996669
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996292 caaaggatccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 6996391  T
Q  112 atttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6996392 atttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcg 6996491  T
Q  212 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6996492 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacatttggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtt 6996591  T
Q  312 aaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6996592 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggaggcaacagtactc 6996669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29003544 - 29003167
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29003544 agcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 29003445  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29003444 tcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 29003345  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29003344 tgagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacg 29003245  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatac 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003244 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatac 29003167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31737049 - 31736699
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31737049 agcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 31736950  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31736949 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 31736850  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  31736849 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtgaagcggtggtcgtttggagagacg 31736750  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31736749 ttaaacactcaacattagcctggagaggcggttgtaagaatactcatgatc 31736699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28997828 - 28997451
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28997828 agcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 28997729  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  28997728 tcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgttgatg 28997629  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28997628 tttgtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacg 28997529  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatac 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28997528 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatac 28997451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 50078363 - 50077988
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078363 aaggaaacaactgcggcatcaatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaaatcttgggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 50078264  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggg 213  Q
    | |||||  || ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    
T  50078263 tcaagattatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggagatgcagg 50078164  T
Q  214 tgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  50078163 tgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctattggagtggttgtcttctggagagacgttaa 50078064  T
Q  314 acactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078063 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 50077988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 70 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31424547 - 31424228
Alignment:
Q  70 gtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatc 169  Q
    |||||||||||| |  ||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31424547 gtctttggctcatcaacaatttctaaagcaacatatttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatctacttgtggagttcaacaaaatc 31424448  T
Q  170 attggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31424447 attggtgatttggagaacattgaggtgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtattgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcatcttg 31424348  T
Q  270 ggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggag 369  Q
    ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424347 ggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacacttaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtctggag 31424248  T
Q  370 aggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31424247 aggcggaggcaacaatactc 31424228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Original strand, 16429658 - 16430032
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||    
T  16429658 aaggaatctaccgcggcgtcgatgtggttaaagttcaagtgtttgtatatgacaaagtctttggctcatcagaaattcctaaagtaacaactttactcat 16429757  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggg 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||     
T  16429758 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaacaaaacccttgatgatttggagattattgaggtgcatcttgaggatgcgg- 16429856  T
Q  214 tgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaa 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  16429857 tgctctggtggtgtggtgttgtttggaggatgaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcttctggagagaagttaa 16429956  T
Q  314 acactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16429957 acactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggatgtaacaatactc 16430032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25250854 - 25250566
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||    
T  25250854 agcaaaggaaacaaccgcggtatcgatgtggttaaagttcaaatatttgtatatggcaaagtctttggctcttcggtaattcctaaagcaacaactctac 25250755  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  25250754 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttacggagttcaacaaaatcattgatgatttggacaacattaagctgcaccttgaggatg 25250655  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcat 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  25250654 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagggtgaagaatgtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcat 25250566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28202742 - 28202555
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||    
T  28202742 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaataagttgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgatcttctg 28202643  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28202642 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 28202555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 51751271 - 51751429
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51751271 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 51751370  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51751371 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 51751429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 16227402 - 16227560
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16227402 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16227501  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16227502 gagagacgttaaacacttaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 16227560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27338175 - 27338017
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27338175 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctagtggagcggtggtcgtctg 27338076  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27338075 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 27338017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 47178596 - 47178754
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47178596 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 47178695  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47178696 gagagacgttaaacactcaacatcaacctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 47178754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 20301365 - 20301523
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20301365 tgaggatgcgggtgctctgatgatgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 20301464  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20301465 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 20301523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 51750743 - 51750942
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  51750743 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 51750842  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  51750843 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51750942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 28841128 - 28841327
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  28841128 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 28841227  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  28841228 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 28841327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 51758240 - 51758439
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  51758240 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaaattggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 51758339  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  51758340 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagtaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51758439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 16226876 - 16227073
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  16226876 caaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactc 16226975  T
Q  112 atttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||| | ||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16226976 attcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16227073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 339
Target Start/End: Original strand, 28841623 - 28841760
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  28841623 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcgtagtggagcgatggtcgtctg 28841722  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcg 339  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28841723 gcgagacgttaaacacccaacatcagcctggagaggcg 28841760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 20300837 - 20301036
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  20300837 agcaaaggaacaaaccgtggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgtcaattcctaaagcaacaactctac 20300936  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  20300937 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgaagacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 20301036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28203272 - 28203073
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  28203272 agcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtataagacaaagtctttgactcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 28203173  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||   |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28203172 tcattcaagatggtggagtcaaaagccatcatggagcaactgacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 28203073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3805707 - 3805513
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||| |||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  3805707 aaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaacgttagagttgttgtttatgaccaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactgtaatcat 3805608  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggat 208  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3805607 tcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagaacattgaggtgcatcttgaggat 3805513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 47178068 - 47178265
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  47178068 agcaaaggaagcaatcgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcattggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctac 47178167  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  47178168 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 47178265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27338706 - 27338507
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  27338706 agcaaaggaatgaatcgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgactcattggcaattcctaaagcaacaactctac 27338607  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  27338606 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggataatattgaggtgcaacttgaggatg 27338507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8348616 - 8348439
Alignment:
Q  32 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  8348616 tcgatgtggtcaaagttagagtctttgtatatgacaaagtctttgggacatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 8348517  T
Q  132 aggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||||||||| | |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  8348516 aggccatcatgtagcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttggaaaataatgaggtgcatcttgaggatg 8348439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13126779 - 13126596
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||   ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| ||||    
T  13126779 tgaggatgcgggtgctttggtggtgtgttgttg---ggaggatgaagaaggcgatgtttctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctg 13126683  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatact 388  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  13126682 gagagatgataaacactcaacatcaacttggagaggcggtggtaagaatacttatggttagtctgaagaggcggaggtaagaatact 13126596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13127296 - 13127109
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatg 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||| ||||||| |||||||| || |||    
T  13127296 aaccgcgacatcgatgtcttcaaagttggagtctttgtatatgacaaattctttggctcatcgacaattcttaaagaaacaactatactcattcaatatg 13127197  T
Q  122 gtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |   ||||||||  ||||||| | |  ||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13127196 gcggagtcaaagatcatcatgtagcaacttatggagtttaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 13127109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50168875 - 50168683
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| || | || ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  50168875 aaggaaccaaccacgacgtcgatatggtcaaagttggagtctt-gtatatgaccaagtttttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 50168777  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50168776 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 50168683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23909872 - 23909745
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagaccg--taagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   |||  |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23909872 aatatatgctctttttatgaatcaagacccgataaagctttgagaaatatttctaatgtttgtgcaatattccttaatttgctcattttttctttgaaac 23909773  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||  ||||||||| ||||||| |||||    
T  23909772 aattttttttacaaaatatgttcttcaa 23909745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14099189 - 14099119
Alignment:
Q  319 caacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14099189 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctgaagaggcggaggcaacaatactc 14099119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 31657846 - 31658028
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||||||| |  || || |||| |||||||||||||||||||    
T  31657846 aaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggcttataggaaattccttaagcaacaactttactcat 31657945  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtg 196  Q
    | ||||||||  |||||||| || | |  || |   |   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31657946 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtg 31658028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25249935 - 25249846
Alignment:
Q  300 tggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249935 tggagagacgttaaatactaaacatcattctggagaggtggtggtaagaatactaatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 25249846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50168318 - 50168193
Alignment:
Q  230 tgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 329  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168318 tgttgttgggaggataaagaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcc 50168219  T
Q  330 tagagaggcgagggtaagaatactca 355  Q
    | || |||||   | |||||||||||    
T  50168218 tggaaaggcggtaggaagaatactca 50168193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28222414 - 28222284
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||    ||| || ||||||||||| | | ||| || || ||| ||||||| | ||    
T  28222414 tgaggatgtgggtgctttggtggtgtgttgttg---ggaggatgaagg---tgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagtggtggtcgtttg 28222321  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28222320 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggc 28222284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Original strand, 31658342 - 31658437
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatca 326  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31658342 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatca 31658437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28222947 - 28222765
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  28222947 aaggaaccaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttggtgtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 28222848  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtg 196  Q
    | ||||||||  |||||||| || | |  || |   |    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28222847 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattgacagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtg 28222765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Original strand, 16456380 - 16456479
Alignment:
Q  34 gatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    |||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  16456380 gatgtgatcaaagttggagtcattgtatatgaccaagactttggctcataggcaaatcctaaagcaacaactctactcattcaagatgatagagtcaaag 16456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 12714920 - 12714984
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  12714920 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-atttttacaagatacgttattcaa 12714984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 28631759 - 28631823
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28631759 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 28631823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 3157305 - 3157424
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |  || |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  3157305 aaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattctatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctattcat 3157404  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    | ||||||||  ||||||||    
T  3157405 tcaagatggtggagtcaaag 3157424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 34265991 - 34265905
Alignment:
Q  448 tgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||    
T  34265991 tgataaatatttctaatgtttgtgaaatattccttaatttgctcattttttctttgaaacaat-ttttttacaatatacgatattcaa 34265905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 15317594 - 15317658
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  15317594 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 15317658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 28565523 - 28565459
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  28565523 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 28565459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8348088 - 8348036
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  8348088 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgatgtct 8348036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 472 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13662211 - 13662148
Alignment:
Q  472 caatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  13662211 caatattcattaatttgatcatttttcctttggaataattttttttacaagatatgttattcaa 13662148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 353
Target Start/End: Original strand, 776274 - 776396
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||  ||| ||| || || ||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  776274 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgatattgatgccttgtagagtggtgttcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagctt 776373  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatact 353  Q
     | ||||||  || |||||||||    
T  776374 ggggaggcggtgggaagaatact 776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41397752 - 41397654
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatg 121  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  41397752 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatg 41397654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 658724 - 659103
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  658724 agcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 658823  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  658824 tcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggacctacttgtagagttcaacaaaatcattggtgatttggagaatattgaggcgcgtcttggggatg 658923  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  658924 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacg 659023  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  659024 ttaaacactcaccatcagcctagagaggcggtcgtaagaataatcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 659103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 27911138 - 27911517
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27911138 agcaaaggaatcaactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 27911237  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27911238 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 27911337  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27911338 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgacgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacg 27911437  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27911438 ttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggagacaacaatactc 27911517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 38 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18510959 - 18510608
Alignment:
Q  38 tggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggcca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18510959 tggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggcta 18510860  T
Q  138 tcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgttt 237  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510859 tcatggagctacttgtgcagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgttt 18510760  T
Q  238 ggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagagg 337  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18510759 ggacgatgaataagatgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagagg 18510660  T
Q  338 cgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18510659 cggtggtaagaacactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactc 18510608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 389
Target Start/End: Original strand, 20043710 - 20044057
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtc 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  20043710 catcgatgtagtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggcagagtc 20043809  T
Q  130 aaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtgg 229  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||||            |||  ||||||||||||||||||    
T  20043810 aaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaaaacaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaggtgctctgatggtgtgg 20043897  T
Q  230 tgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20043898 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatct 20043997  T
Q  330 tagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20043998 tggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgaagacaacaatactc 20044057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 138 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31467340 - 31467087
Alignment:
Q  138 tcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgt--cttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgt 235  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31467340 tcatggagctacttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgt 31467241  T
Q  236 ttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagaga 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31467240 ttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacatcatcctggaga 31467141  T
Q  336 ggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31467140 ggcggtggtaagaatactcatgataagtctggacaggcggaggcaacaatactc 31467087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 25806167 - 25806347
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  25806167 agcaatggaaacaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatattacaaagtctttggctcattggaaagtcctaaagcaacaactttac 25806266  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806267 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 25806347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 25806350 - 25806515
Alignment:
Q  224 gtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaaca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25806350 gtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaaca 25806449  T
Q  324 tcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25806450 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggaggcaacaatactc 25806515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 18467931 - 18468103
Alignment:
Q  212 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtt 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18467931 ggtgctatgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtt 18468030  T
Q  312 aaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaa 384  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468031 aaaaactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatacccatgatcagtctggagaggcggaggcaacaa 18468103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 20505248 - 20505061
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||| |||     
T  20505248 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgaggttgatgcctagtggagtggtggtcgtcta 20505149  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20505148 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctcgagaggcggaggcaacaatactc 20505061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15355894 - 15355736
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15355894 tgaggatgcgggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 15355795  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15355794 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 15355736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34478464 - 34478306
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  34478464 tgaggatgctggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 34478365  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34478364 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 34478306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 31543967 - 31544125
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  31543967 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 31544066  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31544067 tagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 31544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 202 - 339
Target Start/End: Original strand, 10750932 - 10751069
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10750932 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 10751031  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10751032 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcg 10751069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 23666280 - 23666439
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggt-ggtcatct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  23666280 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 23666379  T
Q  301 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  23666380 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatc 23666439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 31543439 - 31543638
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  31543439 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttagaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 31543538  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31543539 tcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 31543638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34478992 - 34478793
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  34478992 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 34478893  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  34478892 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggaaaatattgaggtgcaacttgaggatg 34478793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 6746305 - 6746463
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||     
T  6746305 tgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttaggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctt 6746404  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6746405 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 6746463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 10750407 - 10750601
Alignment:
Q  13 aaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactca 112  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10750407 aaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactca 10750506  T
Q  113 tttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10750507 ttcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 10750601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15356422 - 15356225
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  15356422 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 15356323  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15356322 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 15356225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 23665752 - 23665949
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  23665752 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 23665851  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  23665852 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 23665949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 6745774 - 6745973
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  6745774 agcaaaggaacgaaccgcggcatcaatgtgggcaaagttgtaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 6745873  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  6745874 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 6745973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Original strand, 18467390 - 18467577
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  18467390 agcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 18467489  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    ||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| |   ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  18467490 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaatttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgc 18467577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 29721017 - 29721210
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  29721017 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 29721116  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29721117 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 29721210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9788747 - 9788554
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  9788747 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 9788648  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9788647 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 9788554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 26171409 - 26171592
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  26171409 aaggaaccaaccgtggcatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 26171508  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26171509 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattaaggtgc 26171592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 16407977 - 16408170
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||||||||  |||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16407977 aaggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 16408076  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  ||| |||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16408077 tcaagatggtggagtaaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 38041647 - 38041520
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc--gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38041647 aatatatgctctttttatgaatcaagacccggtaaagctttgataaatatttctaatatttgtgcaatattccttaatttgctcattttttctttgaaac 38041548  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    ||   ||||||||| ||||||| |||||    
T  38041547 aactttttttacaaaatatgttcttcaa 38041520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 534421 - 534596
Alignment:
Q  34 gatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    ||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||| | |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  534421 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggttgataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaag 534520  T
Q  134 gccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
     || | ||||| |   |   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  534521 accgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatacttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggatg 534596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 16545710 - 16545801
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16545710 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 16545801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 26174048 - 26174139
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||    
T  26174048 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggtgagaatactcatggttagtctggagaggaggtgtgaacaatactc 26174139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 29721641 - 29721732
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  29721641 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgataacaatactc 29721732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 40380758 - 40380951
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  40380758 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 40380857  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40380858 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacggtttggagaacattgaggtgcaacttgagga 40380951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13694667 - 13694484
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | ||||||| || |||||||||||| || || |  ||||||||||| || |||||||||||   |||| ||||| | |||||||| |||| ||    
T  13694667 aaggaacctaccgcgatattgatgtggtcaaatttggagtcgttgtatatgaccaaatctttggctcatatgcaattcctatatcaacaactctacttat 13694568  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||||| |  ||   |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  13694567 ttaagatggtggagtcaaatgtcatcatggagcaactaacggagttcaacaaaatccttgatgagttggaaaacattgaggtgc 13694484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 16545079 - 16545275
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaa---gtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttact 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||   ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16545079 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaacaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctact 16545178  T
Q  111 catttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    |||| ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16545179 cattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16545275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 535
Target Start/End: Original strand, 19365862 - 19365957
Alignment:
Q  439 gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  19365862 gtaaggctttgataaatatttataatgtttgtgcaatattccttaatttgctcattttttctttaaaac-attttttttacaagatacgttattcaa 19365957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 361
Target Start/End: Original strand, 16408603 - 16408666
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16408603 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatca 16408666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 40381386 - 40381477
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  40381386 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtttggagaggcggtgataacaatactc 40381477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42427937 - 42427762
Alignment:
Q  34 gatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    |||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  42427937 gatgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaag 42427838  T
Q  134 gccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
     || | | ||| |   |    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42427837 accgtgacggaacaattaacagagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgaggtgcaacttgaggatg 42427762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42427372 - 42427276
Alignment:
Q  260 tctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcat 356  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  42427372 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcgatgggaagaatattcat 42427276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 9702657 - 9702721
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  9702657 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 9702721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18037348 - 18037294
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcct 500  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18037348 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttcct 18037294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 535007 - 535080
Alignment:
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || |||||||||| | || ||||| ||||||    
T  535007 gagagacgttaaacactcaacatcagcctcgagaggcgctgggaataatactcatggttagcctggataggcgg 535080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33790828 - 33790728
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  | ||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33790828 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatgg 33790729  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  33790728 t 33790728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 37557198 - 37557298
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37557198 accgcgacatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 37557297  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  37557298 t 37557298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 521
Target Start/End: Original strand, 290878 - 290929
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaa 521  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  290878 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaattttttttacaa 290929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 452 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 32977213 - 32977131
Alignment:
Q  452 aaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  32977213 aaatatttctaatgtttgtgcaatatttcttaatttactcattttttctttgaaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 32977131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 39169464 - 39169409
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctt 501  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  39169464 tttgataaatatttataatgtttgtgcaatattcagtaattttctcatttttcctt 39169409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 2366957 - 2366869
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  2366957 tttgataaatctttctaatatttgtgcaatattccttaatttgctcatttttcctttagaataat-ttttttacaagatacgttattcaa 2366869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Original strand, 13487226 - 13487370
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||   || ||| || || ||| |||| || | | ||||||||||||||||| || |||||| |    
T  13487226 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgcttttgatgccttgtagagtggtgttcgtatagagagacgttaaacacttaatatcagctt 13487325  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
      ||| |||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13487326 gcagaagcggtgggaagaatactcatggttagtctggagaggcgg 13487370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27449335 - 27449235
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  27449335 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacaaaatctttagctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 27449236  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  27449235 t 27449235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Original strand, 31397602 - 31397666
Alignment:
Q  59 tatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31397602 tatatgacaaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggt 31397666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 37464503 - 37464555
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37464503 tttgataaagatttataatttttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 37464555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2367007 - 2366979
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2367007 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc 2366979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13694232 - 13694160
Alignment:
Q  254 gatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatca 326  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||  | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13694232 gatgtgtctcaccttgaaagttatgtcttattgagtggtcgtcatctagagagacgttaaacactaaacatca 13694160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43598245 - 43598145
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  43598245 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 43598146  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  43598145 t 43598145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43603737 - 43603637
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  43603737 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 43603638  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  43603637 t 43603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43609229 - 43609129
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  43609229 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 43609130  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  43609129 t 43609129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 53917245 - 53916868
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917245 caaaggaaacaactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 53917146  T
Q  112 atttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  53917145 atttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcg 53917046  T
Q  212 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtt 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53917045 agtgctctgatggtgtggtgttgtttgtaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtt 53916946  T
Q  312 aaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53916945 aaacactctacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactc 53916868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 3315367 - 3315746
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  3315367 agcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtgtgcaaagttggaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttat 3315466  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3315467 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttagagaacattgaggtgcatcttgaggatg 3315566  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3315567 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggaatgatgcttagtggagaggtggtcgtctggagagacg 3315666  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3315667 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaagaatactc 3315746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 42990984 - 42991363
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42990984 agcaaaggaacgaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 42991083  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  42991084 tcattcaatatggtaaagtcaaaggccttcttggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattgctgatttggagaacattaagttgcgacttgaggatg 42991183  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  42991184 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttggaagtgatgcctaatggagcggtgatcatctagagagacg 42991283  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991284 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcagtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 42991363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28101581 - 28101205
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||    
T  28101581 agcaaaagaaccaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagtaacaactctac 28101482  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28101481 tcattcaagatggtaaagttaaaggccatcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 28101382  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  28101381 cgggttctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgaaaatgatgcctagtggagcggtggtcatctagagggaag 28101282  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaata 386  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28101281 ttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggatgcaataata 28101205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 43423041 - 43422664
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43423041 agcaaaggttacaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcccaaatcaacaactttac 43422942  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43422941 tcattg--gattgtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtcgagttcaacaaaatcattggtgatttgaagaacattgaggtgcatcttgaggatg 43422844  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  43422843 caggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatctgtctcaccttgagagtgatgcctagtggaacggtggtcgtatggagagacg 43422744  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43422743 ataaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagatgcggaggtaacaatactc 43422664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18098213 - 18098026
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  18098213 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgtctagtggagcggtggtcgtcta 18098114  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18098113 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtagtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactc 18098026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 891308 - 891101
Alignment:
Q  182 gagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||| ||    
T  891308 gagaacattgaggtgcgtcttgaggatgagggtgctctggtggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcgcctttggagtgatgcct 891209  T
Q  282 agtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaa 381  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  891208 agtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcgacatcatcttggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctggagaggcggagacaa 891109  T
Q  382 caatactc 389  Q
    ||||||||    
T  891108 caatactc 891101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 457120 - 457278
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  457120 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 457219  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  457220 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 457278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 11169314 - 11169472
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11169314 tgaggatgcgggagctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 11169413  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11169414 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 11169472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 202 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6064838 - 6064686
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  6064838 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 6064739  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  6064738 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 6064686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 213 - 360
Target Start/End: Original strand, 5898636 - 5898783
Alignment:
Q  213 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5898636 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtagtcgtctggagagacgtta 5898735  T
Q  313 aacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5898736 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 5898783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10957368 - 10957210
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| || ||||    
T  10957368 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtgatcgtctg 10957269  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10957268 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 10957210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 43227293 - 43227451
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||    
T  43227293 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 43227392  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43227393 gagggacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43227451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 456592 - 456789
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  456592 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 456691  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  456692 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 456789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 204 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4309550 - 4309394
Alignment:
Q  204 aggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctgga 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||  |||||| |||| |    
T  4309550 aggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggagtgatgcctagtggagtagtggtcgtctgaa 4309451  T
Q  304 gagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4309450 gagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 4309394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6065366 - 6065169
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  6065366 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 6065267  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6065266 tcattcaagatcgtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 6065169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 389
Target Start/End: Original strand, 23634667 - 23634827
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23634667 gtgttttttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgtatggtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagc 23634766  T
Q  329 ctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
     | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23634767 atggagaagaggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaatactc 23634827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 5192335 - 5192534
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||    
T  5192335 agcaaaggaagcaactgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctac 5192434  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  5192435 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5192534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10957896 - 10957697
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  10957896 agcaaaggaaccaaccgtggcatcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 10957797  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  10957796 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 10957697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 43226762 - 43226961
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  43226762 agcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 43226861  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |  |||  | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  43226862 tcattcaagatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43226961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 5898094 - 5898293
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||    
T  5898094 agcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcttaaagcaacaactctac 5898193  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  5898194 tcatttaagatggtggagtcgaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5898293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 11168786 - 11168985
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  11168786 agcagaggaagcaaccgcagcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaactactctac 11168885  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  11168886 tcattctggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 11168985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18098744 - 18098545
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  18098744 agcaaaggaaccaaccgcggcatcaatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcctaaagcaacaactctac 18098645  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  18098644 ttattcaggatggttgagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18098545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 7769243 - 7769439
Alignment:
Q  13 aaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactca 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  7769243 aaaggaaccaattgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactca 7769342  T
Q  113 tttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    || ||||||||  |||||||||| |||||||| |  |||  ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7769343 ttcaagatggtggagtcaaaggctatcatggagcaacttacggagttctaaaaaatccttgatgacgtggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 7769439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4310083 - 4309884
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| || ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  4310083 agcaaaggaacgaaccgcggcatcaatatgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 4309984  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  4309983 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 4309884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 23634150 - 23634329
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtc 129  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  23634150 catcgatgaggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatttctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtc 23634249  T
Q  130 aaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||||||||||||| |   || | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23634250 aaaggccatcatggagcaatttatagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 23634329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23199664 - 23199471
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  23199664 aaggaaccaaccgcgacatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcat 23199565  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| |||| ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  23199564 tcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgaggtgcaacttgagga 23199471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 27421327 - 27421516
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||   ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27421327 aaggaaccaaccgcgacattgatgtggtcaaagttggagtcgttgttattgacaaaatctttggctcatcggcaattcctaaaacaacaactttactcat 27421426  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttg 203  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  27421427 tcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaagatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttg 27421516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 229 - 389
Target Start/End: Original strand, 25634738 - 25634895
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||| ||||||   |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  25634738 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgcctagtg---cggtggtcgtctagagagttgttaaatactcaacatcagc 25634834  T
Q  329 ctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25634835 ctagagaggcggtgctaagaatactcatggtcagtctggagagacggaggtaacaatactc 25634895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5259848 - 5259655
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5259848 aaggaaccaaccgcggcatctatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 5259749  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5259748 tcaagatggtggagtcaaagaccttgatggagcaattggcagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5259655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 37407331 - 37407524
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  37407331 aaggaaccaaccgcggcatcaatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 37407430  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  ||| |||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  37407431 tcaagatggtggagttaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgaggtgcaacttgagga 37407524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 10209843 - 10210036
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10209843 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcattgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10209942  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10209943 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10210036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23199105 - 23198947
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| |||||| || |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23199105 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 23199006  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  23199005 ggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggtggtggtaacaatactc 23198947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 375
Target Start/End: Original strand, 7763473 - 7763615
Alignment:
Q  233 tgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctag 332  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7763473 tgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagccagg 7763572  T
Q  333 agaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7763573 agaggcggtggtaacaatactcatggttagtctggagaggcgg 7763615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4600245 - 4600052
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  4600245 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 4600146  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | || || |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4600145 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 4600052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9635649 - 9635456
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  9635649 aaggaaccaaccgcggcatctacgtggtcaaagttggagccgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcat 9635550  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  | |||||| || | ||||| |   | | | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9635549 tcaagatggtgcattcaaagaccgtgatggagcaattggcgtagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 9635456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 10056887 - 10057080
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10056887 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10056986  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10056987 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10057080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 10061331 - 10061524
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10061331 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10061430  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10061431 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10061524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 10063553 - 10063746
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10063553 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10063652  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10063653 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10063746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 10065775 - 10065968
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10065775 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10065874  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10065875 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10065968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4599617 - 4599526
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4599617 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgataatactcatggtcagtctggagaggcggtggtaacaatactc 4599526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 10210468 - 10210559
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10210468 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 10210559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 25634589 - 25634696
Alignment:
Q  37 gtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggcc 136  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  25634589 gtggtcaaagttagagtctttatatatgacaaagtctttgactcatcagcaattcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggcc 25634688  T
Q  137 atcatgga 144  Q
    ||||||||    
T  25634689 atcatgga 25634696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 6717155 - 6717348
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||  |||| |||| |||||| |||||||    
T  6717155 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacatttccttaagcgacaactctactcat 6717254  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | || || |   | | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6717255 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 6717348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Original strand, 7762921 - 7763106
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatg 121  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |  || |||||||| ||||||||||||||   |||| || | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  7762921 aaccgcggaatcgatgtggtcaaagttggagtcattatatatgaccaagtctttggctcataagcaattctttaagcaacaactctattcatttaagatg 7763020  T
Q  122 gtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||  |||||||| || | ||||| |   |   |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  7763021 gtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgaggtgcaacttgagga 7763106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Original strand, 29811532 - 29811704
Alignment:
Q  35 atgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagg 134  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || | ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||     
T  29811532 atgtggtcaaagttggagtcattgtatataaccaggtctttggctcataagcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaga 29811631  T
Q  135 ccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    || | ||||| |   |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29811632 ccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 29811704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1620027 - 1619936
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatg 121  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1620027 catcgatgtggtcaaagttggagtctttgcatatgacaaagtctttggctcattggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 1619936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5259230 - 5259131
Alignment:
Q  290 ggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || || ||||||||| |  ||||||||||    
T  5259230 ggtgttcatctggagagacattaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggttagcctagagaggcggtgtgaacaatactc 5259131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 10057515 - 10057606
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10057515 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 10057606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 10059737 - 10059828
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10059737 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 10059828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 10061959 - 10062050
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10061959 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 10062050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 10064181 - 10064272
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10064181 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 10064272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 10066403 - 10066494
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10066403 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 10066494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15830767 - 15830648
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15830767 aaggaacctaccacgacatcgaggtggtcaaagttggagttattgtatatgactaagtctatggttcataggcaattcctaaagcaagaactttactcat 15830668  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  15830667 ttaagatggtggagtcaaag 15830648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22759201 - 22759086
Alignment:
Q  420 cttttcatgaatcaagacc--gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataattttt 517  Q
    |||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  22759201 cttttcatgaatcaagacccggtaaagttttgataaatatttctaatgtttgtgcaatattccttaatttgct-atttttcctttgaaacaat-tttttt 22759104  T
Q  518 acaacatatgttattcaa 535  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  22759103 acaaaatatgttcttcaa 22759086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 10059109 - 10059302
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10059109 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 10059208  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  | | |||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10059209 tcaagatggtggatttaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10059302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Original strand, 32892301 - 32892434
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||      
T  32892301 gatgaagaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagcggtgctcatctggagagacgttaaacactcaacatcagtcaggagaagcggt 32892400  T
Q  342 ggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    || ||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  32892401 gggaagaatactcaaggtcagcatggagaggcgg 32892434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 6717779 - 6717870
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6717779 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcagtggtgagaatacttatggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 6717870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22834534 - 22834351
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  22834534 aaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 22834435  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    | ||||||||  ||| |||| || | |  || |   |   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22834434 tcaagatggtggagttaaagaccgtgacagagcaattgacggagttcaacaaaattcttgatgatttggagaacattgaggtgc 22834351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 389
Target Start/End: Original strand, 27421889 - 27422036
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| || | ||| || || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||      
T  27421889 gatgaagaaggtgttgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggcggtcgtctggagagactttaaacactcaacatcagcatgaaaaggcggt 27421988  T
Q  342 ggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |  ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  27421989 gagaagaatactcatggttagtctgaagaggcagaggcaagaatactc 27422036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1619851 - 1619701
Alignment:
Q  238 ggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagagg 337  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||  || ||  || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1619851 ggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgattccttgtaaagtggtagttttctagagagacgttaaacactcaacatcagcccagagagg 1619752  T
Q  338 cgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatact 388  Q
    |    |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1619751 cagttgtaagaatactcgtggttagtctgaagaggcggaggtaagaatact 1619701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 372
Target Start/End: Original strand, 7769763 - 7769893
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || | ||| || || ||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |       
T  7769763 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggtgtctatctggagagacgttaaacagtcaagatcatcctagagagtctgt 7769862  T
Q  342 ggtaagaatactcatgatcagtctggagagg 372  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7769863 gggaagaatactcatggtcagtctgaagagg 7769893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Original strand, 29812071 - 29812215
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29812071 gttgttgggaggctgaggaaggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtacagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagttt 29812170  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
     ||||||||   | ||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  29812171 ggagaggcggtcggaagaatactcatggttagcctggagaggcgg 29812215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Original strand, 32891752 - 32891851
Alignment:
Q  34 gatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    ||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  32891752 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcatttaaggtggtggagtcaaag 32891851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15822169 - 15822016
Alignment:
Q  56 ttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtgg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||   | || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| || | |  || |  ||   |     
T  15822169 ttgtatatgactaagtctttagctcatatgtaattcctaaagcaacaactctactcgtttaaaatggtggagtcaaagaccttaacagagcaactaacga 15822070  T
Q  156 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15822069 agttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 15822016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Original strand, 53597915 - 53598011
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttact 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  53597915 aaggaatcaaccgcggcatcgatgtggtcaaaattgaagtctttgtatatgacaaagtctttacctcatcggcaatttctaaagcaagaactctact 53598011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23409857 - 23409748
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | ||||| |||||||| || || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  23409857 aaggaacctaccgcggcgtcgatatggtcaaattttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaactccttaagcaacaactctacttat 23409758  T
Q  114 ttaagatggt 123  Q
    ||||||||||    
T  23409757 ttaagatggt 23409748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Original strand, 30766430 - 30766518
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||||||    
T  30766430 tttgataaatatttctaatgtttatgtaatattccttaatttacttatttttcctttggaacaat-tgttttacaagatacgttattcaa 30766518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32479846 - 32479753
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32479846 catcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggt 32479753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8516607 - 8516507
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  || |||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8516607 accgcggcatcgatgtgggcaaagttagagtcattatatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatgg 8516508  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  8516507 t 8516507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 472 - 535
Target Start/End: Original strand, 16496326 - 16496389
Alignment:
Q  472 caatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  16496326 caatattcattaatttgatcatttttcctttggaataattttttttacaagatatgttattcaa 16496389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 54792785 - 54792723
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattc 533  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  54792785 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatacgttattc 54792723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15830626 - 15830573
Alignment:
Q  155 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggat 208  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  15830626 gagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgaggcgcatcttgaggat 15830573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 132
Target Start/End: Original strand, 24933175 - 24933212
Alignment:
Q  95 aagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaa 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24933175 aagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaa 24933212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 333
Target Start/End: Original strand, 31116505 - 31116546
Alignment:
Q  292 tggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctaga 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31116505 tggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctaga 31116546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 35437203 - 35437267
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  35437203 tgcaatattcattaatttgctcattttttctttggaacaa-attttttacaatatacgttattcaa 35437267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Original strand, 918821 - 918872
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcattttt 497  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  918821 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctctttttt 918872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12157801 - 12157762
Alignment:
Q  471 gcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaat 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12157801 gcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat 12157762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44072825 - 44072774
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcattttt 497  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44072825 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctaattttt 44072774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 389
Target Start/End: Original strand, 27900224 - 27900310
Alignment:
Q  303 agagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  |  ||||||||||| |  |||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  27900224 agagacgttaaacacccaacatcagtctggagaggcggtgcaaagaatactcagggccagtttggagtggcggaggtaagaatactc 27900310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Original strand, 32891875 - 32891925
Alignment:
Q  157 gttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32891875 gttcaacaaaatccatgatgatttggagaacattgaggtggatcttgagga 32891925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15824811 - 15824698
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| ||| | ||| || || ||| | | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||| |||||     
T  15824811 gatgaagaaggtgatatttctcacctttggagtgatgccttgtagagagatagtcgtctagagagacattaaacactcaacatcatcttggaggggcgat 15824712  T
Q  342 ggtaagaatactca 355  Q
    || |||||||||||    
T  15824711 gggaagaatactca 15824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 28486280 - 28486659
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28486280 agcaacggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 28486379  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28486380 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatg 28486479  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28486480 caggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagaatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgccttgtggagcggtggtcgtctggagagacg 28486579  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28486580 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactc 28486659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7471552 - 7471204
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471552 caaaggatacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 7471453  T
Q  112 atttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtg 211  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7471452 attcaagatggtaaagtaaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcg 7471353  T
Q  212 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7471352 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgtt 7471253  T
Q  312 aaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7471252 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 7471204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 389
Target Start/End: Original strand, 24749322 - 24749681
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtc 129  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||  ||||    
T  24749322 catcgatgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtc 24749421  T
Q  130 aaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtgg 229  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24749422 aaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtgg 24749521  T
Q  230 tgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24749522 tgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggttgtcatctggagagacattaaacactcaacatcagcc 24749621  T
Q  330 tagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24749622 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggatgcaacaatactc 24749681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 389
Target Start/End: Original strand, 21678785 - 21679153
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21678785 caaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatctttgtattttacaaagtctttggctcatcggcagttcctaaagcaacaactttactcattcaagat 21678884  T
Q  121 ggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctg 220  Q
    |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21678885 ggtaaaataaaaggcaatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtactctg 21678984  T
Q  221 atggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactca 320  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21678985 atggcgtagtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcatctggagagacgctaaacactca 21679084  T
Q  321 acatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  21679085 acatcatccaggagacgcggtggtaagaatactcatgatcagttcggagaggcggaggaaccaatactc 21679153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 20298048 - 20298380
Alignment:
Q  28 gacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaag 127  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20298048 gacatcgatgtgggcaaagtcggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaag 20298147  T
Q  128 tcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgt 227  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20298148 tcaaaggccttcatggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgt 20298247  T
Q  228 ggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298248 ggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 20298347  T
Q  328 cctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  20298348 cctggagaggcggtggtaacaatactcatgatc 20298380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 119 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4294181 - 4293911
Alignment:
Q  119 atggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctc 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4294181 atggtaaagtcaaaggccttcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggggatgcgggtgctc 4294082  T
Q  219 tgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacact 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4294081 tgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaacttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacattaaacact 4293982  T
Q  319 caacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||||| |||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4293981 caacatcagcctggagaggtggtgacaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 4293911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 389
Target Start/End: Original strand, 9679498 - 9679752
Alignment:
Q  135 ccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttg 234  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  9679498 ccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgagtgttcttatggtgtggtgttg 9679597  T
Q  235 tttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  9679598 tttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttaggagtgatacctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaaaactcaacatcatcctgaag 9679697  T
Q  335 aggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9679698 aggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggtggaggcaacaatactc 9679752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1048334 - 1048176
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1048334 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 1048235  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1048234 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 1048176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 381
Target Start/End: Original strand, 44725826 - 44726005
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||    
T  44725826 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 44725925  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaa 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44725926 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaagcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaa 44726005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7350696 - 7350538
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7350696 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7350597  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7350596 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 7350538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31157330 - 31157172
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31157330 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 31157231  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31157230 gagagatgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 31157172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 22136046 - 22136205
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggt-ggtcatct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22136046 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 22136145  T
Q  301 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22136146 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22136205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 38394701 - 38394900
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  38394701 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 38394800  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  38394801 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 38394900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 40551073 - 40551232
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggt-ggtcatct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  40551073 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 40551172  T
Q  301 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40551173 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 40551232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7093506 - 7093348
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7093506 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7093407  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7093406 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 7093348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 38395227 - 38395385
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||     
T  38395227 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 38395326  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  38395327 gagagaagttaaacactcaacatcagcctggagagacggtggtaagaatactcatgatc 38395385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7094034 - 7093835
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  7094034 agcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 7093935  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  7093934 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 7093835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7351224 - 7351027
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  7351224 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 7351125  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7351124 tcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 7351027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1048862 - 1048663
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||    
T  1048862 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcgcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 1048763  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1048762 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 1048663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 22135518 - 22135715
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  22135518 agcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 22135617  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22135618 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 22135715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 40550545 - 40550742
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  40550545 agcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 40550644  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  40550645 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 40550742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 36165 - 36364
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  36165 agcaaaggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttagctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 36264  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  36265 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtacaacttgaggatg 36364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 44725290 - 44725489
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||    
T  44725290 agcaaaggaaccaaccgcggcatcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagtaacaactctac 44725389  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    | ||| | ||||||  |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  44725390 ttattcaggatggtggagtcaaaggccatcatagagcaacttatggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 44725489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13290072 - 13289873
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||    
T  13290072 agcaaaggaaccaaccgggacattgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagcaacaactctac 13289973  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  13289972 tcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaacaaattccttgatgacttggagaatatggaggtgcatcttgacgatg 13289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24816381 - 24816223
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816381 gtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 24816282  T
Q  329 ctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatac 387  Q
    ||  |||| ||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  24816281 ctgaagagacggtggtaagaatactcatggtcactttggagaggcggaggtaacaatac 24816223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31159227 - 31159078
Alignment:
Q  58 gtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggag 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  ||||    
T  31159227 gtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggag 31159128  T
Q  158 ttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  31159127 ttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 31159078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4295512 - 4295401
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4295512 caaaggataaaaccgcggcatcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 4295413  T
Q  112 atttaagatggt 123  Q
    ||| ||||||||    
T  4295412 attcaagatggt 4295401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 44011797 - 44011706
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44011797 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggaggtaacagtactc 44011706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 410 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23476743 - 23476616
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc--gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  23476743 aatatatgttattttcatgaatcaagacttggtaagactttgataaatatttctaatgtttgtgcaatatttcttaatttgctcatttttcctttagaac 23476644  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  23476643 aattatttttataagatatgttattcaa 23476616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 6047761 - 6047907
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||| || | |||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  6047761 gatgaagtaggtgatgtttctcgccttgtgaatgatgtcttgtagagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggt 6047860  T
Q  342 ggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatact 388  Q
    || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  6047861 ggaaagaatactcaaggtcagtctgaagaggcggaggtaagaatact 6047907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6594059 - 6593866
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  6594059 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 6593960  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6593959 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 6593866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18391697 - 18391504
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  18391697 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 18391598  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18391597 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 18391504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24816933 - 24816744
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||      ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24816933 aaggaaccaaccgcgacatcgatgcggtcaaagttggaatttttg------acaaagtctttggctcatctacaattcctaaagcaacaactctactcat 24816840  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    | ||||||||  | ||||||| ||||||||| |  |||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||||  ||| |||||| |||||| ||||    
T  24816839 tcaagatggtggattcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagatgattaaggtgcatcttgaagatg 24816744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 196
Target Start/End: Original strand, 48490065 - 48490229
Alignment:
Q  32 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  48490065 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatattacaaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 48490164  T
Q  132 aggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtg 196  Q
    || || | ||||| | | |   |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48490165 agaccgtgatggagcatttaacggagttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgaggtg 48490229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Original strand, 36693 - 36763
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttggga 272  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36693 tgaggatgtaggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttggga 36763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47675666 - 47675480
Alignment:
Q  11 gcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttact 110  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || |    
T  47675666 gcaaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagtttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaat 47675567  T
Q  111 catttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |  | ||||| |   |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47675566 cattcaagatggtggagtcaaagactgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgc 47675480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 373
Target Start/End: Original strand, 48490606 - 48490748
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||| || ||||||||| | ||| ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48490606 gttgttggcaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttagtattgatgccttgtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtct 48490705  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggc 373  Q
     ||||||||  || ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  48490706 ggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggagaggc 48490748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 360
Target Start/End: Original strand, 43555 - 43640
Alignment:
Q  275 aatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  43555 aatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctgcagaggcggtggtaagaataatcatgatc 43640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6593431 - 6593340
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  6593431 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 6593340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18391069 - 18390978
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  18391069 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 18390978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 26213460 - 26213632
Alignment:
Q  35 atgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagg 134  Q
    ||||||||||| || || |  ||||||| ||| || |||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  26213460 atgtggtcaaatttggagtcattgtataggaccaaatctttggctcatttgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagg 26213559  T
Q  135 ccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggat 208  Q
    || |||||||    |||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  26213560 cc-tcatggagaaacttacagagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcctattgaggat 26213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47675104 - 47674960
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| ||  || || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47675104 gttgttgggaggatgaagaaggtgaggtctctcaacttggtattgattccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcat 47675005  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
     ||||||||  || ||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  47675004 ggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggataggcgg 47674960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1560864 - 1560773
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1560864 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtgataacaatactc 1560773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 42298963 - 42298837
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc--gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||  |||  |||    
T  42298963 aatatatgctcttttcaagaatcaagacctggtaatgttttgataaatatttataatgtttgtgcaatattccttaattagttcattttttgtttagaac 42298864  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  42298863 aat-ttttttacaagatacgttattcaa 42298837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9226114 - 9226050
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  9226114 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatatgttattcaa 9226050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 38434371 - 38434307
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  38434371 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatatgttattcaa 38434307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 42996889 - 42996953
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  42996889 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 42996953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Original strand, 8998428 - 8998492
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaat 510  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8998428 tttgataaatatttctaatgtttttgcactattccttaatttgctcatttttcctttggaacaat 8998492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16884440 - 16884340
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  16884440 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatgg 16884341  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  16884340 t 16884340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 6047245 - 6047330
Alignment:
Q  56 ttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcat 141  Q
    ||||||||||  || |||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  6047245 ttgtatatgaacaaatctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagtccatcat 6047330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12405850 - 12405750
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  12405850 accgcgacatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 12405751  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  12405750 t 12405750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19033764 - 19033712
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19033764 tttgataaaaatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 19033712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 20720872 - 20720924
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20720872 tttgataaaaatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 20720924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 20765534 - 20765586
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20765534 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 20765586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 24261897 - 24261997
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24261897 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 24261996  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  24261997 t 24261997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 29491112 - 29491164
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29491112 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 29491164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34282212 - 34282160
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34282212 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 34282160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Original strand, 45121954 - 45122017
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaa 509  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45121954 tttgataaatatttctaatgtttgtgcactattccttaatttgctcattttttctttggaacaa 45122017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Original strand, 6570647 - 6570748
Alignment:
Q  32 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaa 131  Q
    |||||||||||||||||  | |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||    
T  6570647 tcgatgtggtcaaagttgcagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctcctcattcaagattgtggagtcaa 6570746  T
Q  132 ag 133  Q
    ||    
T  6570747 ag 6570748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33230070 - 33230018
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33230070 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgcttatttttc 33230018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3903869 - 3903814
Alignment:
Q  154 ggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3903869 ggagttcaacaaaattcttgataatttggagaacattgaggtgcatcttgaagatg 3903814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 389
Target Start/End: Original strand, 41383416 - 41383792
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383416 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaagtctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 41383515  T
Q  112 atttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtg 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41383516 atttgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtg 41383615  T
Q  212 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtt 311  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41383616 actgctctgatggtgtggt-ttgtttggaggatgatgaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgtt 41383714  T
Q  312 aaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41383715 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtttggagaggcggaggcaacaatactc 41383792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 389
Target Start/End: Original strand, 21481268 - 21481636
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  21481268 caaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcgccaattcctaaagaaacaattttactcattcaagat 21481367  T
Q  121 ggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgag---gtgcgtcttgaggatgtgggtgct 217  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | ||||     | | ||  ||||||||   ||| |    
T  21481368 ggtagagtcaaagaccatcatggagaaccttgcggagttcaacagaatccttgatgacttggagtatattgtctctgagggttatgaggatgcatgtgtt 21481467  T
Q  218 ctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacac 317  Q
     || ||||| |   |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  || ||  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21481468 ttggtggtgcg---ttgtatggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgttgcctgatagagcggtggtcgtcaagagagacgttaaacac 21481564  T
Q  318 tcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21481565 tcaacatcagcctggagaggcgatggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaatactc 21481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 43080891 - 43081049
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43080891 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 43080990  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43080991 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43081049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 18811997 - 18812155
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  18811997 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctg 18812096  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  18812097 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatc 18812155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 27828274 - 27828432
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27828274 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 27828373  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||||    
T  27828374 gagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggtggtagtaagaatactcatgatc 27828432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 18811469 - 18811668
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  18811469 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 18811568  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  18811569 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18811668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 27827746 - 27827945
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  27827746 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 27827845  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  27827846 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 27827945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 15069328 - 15069527
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  15069328 agcaaatgaaccaactgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 15069427  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15069428 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 15069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 43080363 - 43080562
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  43080363 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctac 43080462  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  43080463 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43080562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34256032 - 34255839
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  34256032 aaggaaccaaccgcaacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 34255933  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34255932 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 34255839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31577846 - 31577668
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtc 129  Q
    ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||    
T  31577846 catcgatgtggtcaaagttggagtctgtgtatatgacaaagtctttggctcttcggcaattcctaaagcaacaactctact-attcaagatggtggagtc 31577748  T
Q  130 aaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    || |||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31577747 aatggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccatgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 31577668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Original strand, 15069859 - 15069971
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15069859 tgaggatgcaggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatggatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcatctg 15069958  T
Q  302 gagagacgttaaa 314  Q
     ||||||||||||    
T  15069959 aagagacgttaaa 15069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 232 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31577317 - 31577171
Alignment:
Q  232 ttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagccta 331  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| || | ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31577317 ttgttgggaggatgaagaatgtgatgtttctcaccttgtgaattatgccttgtagagcggtgttcttctggagagacgttaaacactcaacctcagcctg 31577218  T
Q  332 gagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggagg 378  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31577217 gagaggcggttgtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggagg 31577171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 15071820 - 15071899
Alignment:
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071820 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 15071899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 207
Target Start/End: Original strand, 4732318 - 4732493
Alignment:
Q  32 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  4732318 tcgatgtggtcaaagttggagacattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 4732417  T
Q  132 aggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    || || | ||||| |   |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4732418 agaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 4732493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34255472 - 34255328
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| |||||| || |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255472 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtggagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 34255373  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
     |||||| |  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  34255372 ggagaggtggtggtaagaatactcatggttagtccggagaggcgg 34255328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 209
Target Start/End: Original strand, 17848308 - 17848486
Alignment:
Q  31 atcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtca 130  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||    
T  17848308 atcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaatctctttggctcatcggaaattcctaaagcaacaactctactcattgaagatgttggagtca 17848407  T
Q  131 aaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    |||  |||||||||    |||  | ||||||| | |||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17848408 aagttcatcatggagtaacttacgaagttcaatacaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttaaggatg 17848486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41365981 - 41365835
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 328  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| | | || || ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365981 gtgttgatgggaggatgaagaaggtgaagtctctcaccttggtattgaggccttgtagagtggtgattgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 41365882  T
Q  329 ctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    || ||||||||  || ||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  41365881 ctggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggagaggcgg 41365835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 389
Target Start/End: Original strand, 17848866 - 17849002
Alignment:
Q  253 tgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatac 352  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||   | |||||||     
T  17848866 tgatgtttctcaccttgggaattatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacattcaacatcaccctggagaggcggtcgaaagaatag 17848965  T
Q  353 tcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  17848966 tcatggtcagtctgaagaggcggaggtaagaatactc 17849002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 373
Target Start/End: Original strand, 4732831 - 4732973
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4732831 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtttagagagacgttaaacactcatcatcagcct 4732930  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggc 373  Q
     ||||||||  || ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  4732931 ggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggagaggc 4732973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 535
Target Start/End: Original strand, 27272584 - 27272698
Alignment:
Q  422 tttcatgaatcaagac--cgtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttac 519  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | || ||||    
T  27272584 tttcatgaatcaagacttcgtaaggctttgagaaatatttctaatgtttgtgcaatattctttaatttgctcatttttcgtttagaacaa-atttattac 27272682  T
Q  520 aacatatgttattcaa 535  Q
    || ||| |||||||||    
T  27272683 aagatacgttattcaa 27272698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 5591527 - 5591710
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  5591527 aaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcat 5591626  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    | ||||||||  ||| |||| || | |  || |   |   |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5591627 tcaagatggtggagttaaagaccgtgacagagcaattgacggagttcaacaaaattcttgatgatttggagaacattgaggtgc 5591710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12250005 - 12249941
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  12250005 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 12249941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23626149 - 23626085
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  23626149 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 23626085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 39445202 - 39445266
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  39445202 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 39445266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 10684838 - 10684938
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  10684838 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 10684937  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  10684938 t 10684938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20663036 - 20662984
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20663036 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 20662984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35744903 - 35744803
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  | ||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35744903 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatgg 35744804  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  35744803 t 35744803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44213153 - 44213101
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44213153 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 44213101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7100000 - 7099960
Alignment:
Q  92 ctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7100000 ctaaaacaacaactttactcatttaagatggtagagtcaaa 7099960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30548399 - 30548347
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30548399 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgatcatttttc 30548347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 4634880 - 4634842
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaaca 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4634880 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaaca 4634842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 21543183 - 21543246
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||    
T  21543183 tgcaatatccattaatttgctcatttttcttttgaaacaat--tttttataagatacgttattcaa 21543246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 50724 - 51103
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50724 agcaaaagatactaccgcggcatcgatgtggtcaaagatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 50823  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50824 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 50923  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50924 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacg 51023  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51024 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctagagaggcggagacaacaatactc 51103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14789006 - 14788627
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14789006 agcaaaagatactaccgcggcatcgatgtggtcaaagatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttac 14788907  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14788906 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 14788807  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14788806 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacg 14788707  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14788706 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctagagaggcggagacaacaatactc 14788627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 47563515 - 47563894
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  47563515 agcaaaggatacaaccgcgacatcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcgttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactttac 47563614  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  47563615 tcattcaagatggtaaatttaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagagcattgaggtgtgtcttggggatg 47563714  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47563715 caggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggattgatacatagtagagcggtggtcgtctggagagacg 47563814  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47563815 ttaaacactcaacatcagtctagagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 47563894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22802308 - 22801960
Alignment:
Q  12 caaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactc 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802308 caaaggaaacaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactc 22802209  T
Q  112 atttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtg 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  22802208 attcaagatggtaaagtcaaaggtcgtcgtggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgattttgagaacattaagttgcatcttgaggatgcg 22802109  T
Q  212 ggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtt 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22802108 ggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgtt 22802009  T
Q  312 aaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||||    
T  22802008 aaacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatc 22801960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 16454063 - 16454444
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16454063 agcaaagtatacaaccgcgacatcgatgtggtcaaattttgaatatttgtatacgacaaagactttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttac 16454162  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454163 taattcaagatggtaaagtcaaaggccaccatagagctaattgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 16454262  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  16454263 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctgttagagcggtggttgtctagagagacg 16454362  T
Q  310 ttaaacactcaac--atcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||| |||||||||  |||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16454363 ttagacactcaacagatcagcctggagaggcggtggcaagaatactcatgatcagactggagaggtggaagcaacaatactc 16454444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36921071 - 36920721
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  36921071 agcaaaggatccaatcgcggcatcgatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcttaaagcaacaactttac 36920972  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  36920971 tcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttagggatg 36920872  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36920871 cgggtgctctgatggtgtggtgatgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacg 36920772  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  || || |||| ||||||||    
T  36920771 ttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatattcatgatc 36920721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22133662 - 22133475
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  22133662 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 22133563  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133562 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 22133475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 168 - 389
Target Start/End: Original strand, 36379144 - 36379365
Alignment:
Q  168 tcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcacct 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36379144 tcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttaaggatgtgggtggtctgacggtgtaatgttgtttggaggatgaagaagacgatttttctcacct 36379243  T
Q  268 tgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctgg 367  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36379244 tgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaataatactcatgatcagtctgg 36379343  T
Q  368 agaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36379344 agaggcggaggcaacaatactc 36379365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 5099771 - 5099958
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5099771 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 5099870  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5099871 gagagacattaaacactcaacattagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggtggaggcaaaaatactc 5099958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22781782 - 22781624
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22781782 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 22781683  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22781682 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22781624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12399863 - 12399676
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  12399863 tgaggatgcaggtgcactgatggtgtggtgttttttgctggatgaagaaggtgatgcgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 12399764  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12399763 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgattagtctggagaggcggagggaacaatactc 12399676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12402138 - 12401951
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||     
T  12402138 tgaggatgcaggtgcactgatggtgtagtgttttttgctggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcta 12402039  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12402038 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaagcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 12401951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9175518 - 9175360
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9175518 tgaggatgcgggttctctaatggtgtggtgttgcttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 9175419  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9175418 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 9175360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22045760 - 22045601
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtgg-tcatct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||    
T  22045760 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggttcgtct 22045661  T
Q  301 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22045660 ggagacacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22045601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11007613 - 11007455
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  11007613 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttgaaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 11007514  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11007513 gagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 11007455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16933193 - 16933035
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16933193 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16933094  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16933093 gagagacgttaaacactcaacattagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 16933035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22134190 - 22133991
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  22134190 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttttatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 22134091  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22134090 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22782310 - 22782113
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  22782310 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctac 22782211  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22782210 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 22782113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11008141 - 11007942
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||    
T  11008141 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggaaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgaatctac 11008042  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11008041 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcgacttgaggatg 11007942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16933721 - 16933522
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  16933721 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctac 16933622  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16933621 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16933522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18537073 - 18536918
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18537073 aaggaaccaatcgcggcatcgatgtggtcaaagttcgtatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcat 18536974  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatc 169  Q
    | ||||||| | |||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||    
T  18536973 tcaagatggaagagtcgaaggccatcatggagcaacttgcggagttcaacagaatc 18536918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22046288 - 22046089
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22046288 agcaaagtaagcaacctcggcatcgatgtgggcaaatttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 22046189  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22046188 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22046089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12402668 - 12402482
Alignment:
Q  11 gcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttact 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12402668 gcaaaggaaccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 12402569  T
Q  111 catttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    |||| | ||||||  |||| |||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||    
T  12402568 cattcaggatggtggagtcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgaggtgc 12402482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 375
Target Start/End: Original strand, 10113639 - 10113968
Alignment:
Q  31 atcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtca 130  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||    
T  10113639 atcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgactaagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtca 10113738  T
Q  131 aaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggt 230  Q
    |||||||||||||| |  ||    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||            |||   ||||| || ||| ||| |    
T  10113739 aaggccatcatggagcgactaacagagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgagg------------atgcatgtgctttggtggcgtgtt 10113826  T
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    ||||   |||| ||||||||| | |||| ||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10113827 gttg---ggagaatgaagaaggtaatgtttccaaccttgtgaatgatgcctagtagagcggtgatcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 10113923  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
     |||||| |  || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  10113924 ggagaggtggtgggaagaatacttatggtcagtctgaagaggcgg 10113968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9176045 - 9175848
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  9176045 agcaaaggaagcaaccacgacatcgatgtgggaaaagtgggaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaacgactctac 9175946  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||| | | ||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9175945 tcattcaggatggaagactcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 9175848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 36379048 - 36379148
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36379048 aaggaaccaaccgtggcatcgatgtagtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 36379147  T
Q  114 t 114  Q
    |    
T  36379148 t 36379148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 5872457 - 5872650
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  5872457 aaggaaccaaccgcgccgtcgatgtggtcaaagttggagtcgttgcatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcat 5872556  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| |||| ||||| |   |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5872557 tcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5872650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12395432 - 12395249
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  12395432 agcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 12395334  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgagg 194  Q
    ||||| | ||||||  | || |||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||    
T  12395333 tcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgagg 12395249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12400394 - 12400211
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  12400394 agcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 12400296  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgagg 194  Q
    ||||| | ||||||  | || |||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||    
T  12400295 tcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgagg 12400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 36770499 - 36770590
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36770499 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcagaggcaacaatactc 36770590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52094888 - 52094695
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  52094888 aaggaacctaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 52094789  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  | |||||| || | ||||| |   |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52094788 tcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 52094695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3578263 - 3577934
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  3578263 aaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttatatatgacaaagtctttggatcatcgccaacttttaaagcaacaactctactcat 3578164  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggg 213  Q
    | ||||||||  || ||||| |||||||||| |  |||   |||||||| || ||   || | ||||||||||||            |||||||||  ||    
T  3578163 tcaagatggtggagacaaagtccatcatggagcaacttacagagttcaaaaatattcctgattatttggagaaca------------ttgaggatgcagg 3578076  T
Q  214 tgctctgatggtgtggtgttgttt-ggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgtta 312  Q
    ||||    ||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||      |||||| || |||| ||||||||||    
T  3578075 tgct---ttggtggggtcttgtttgggagaatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaataatgccttacaacgcggtgatcgtctgaagagacgtta 3577979  T
Q  313 aacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatg 357  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||    
T  3577978 aacactcaacatcagcatggagaggcggtagtaagaatactcatg 3577934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 5136734 - 5136927
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5136734 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 5136833  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5136834 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5136927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12743454 - 12743261
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  12743454 aaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttgaaatcattgtatatgaccaagtctttggcttataggcaattccttaagaaacaactatactcat 12743355  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12743354 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatctttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 12743261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 8394060 - 8394253
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  8394060 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcctcaagcaacaactctactcat 8394159  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8394160 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 8394253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 8394688 - 8394765
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8394688 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 8394765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 7123350 - 7123543
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  7123350 aaggaaccaaacgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 7123449  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7123450 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 7123543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 5137362 - 5137453
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5137362 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 5137453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12740699 - 12740541
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12740699 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcct 12740600  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
     || |||||  |  ||||||||||||| | || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  12740599 ggataggcggtgagaagaatactcatggttagcctggagaggcggtgtgaacaatactc 12740541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12748905 - 12748747
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12748905 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcct 12748806  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
     || |||||  |  ||||||||||||| | || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  12748805 ggataggcggtgagaagaatactcatggttagcctggagaggcggtgtgaacaatactc 12748747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 47565620 - 47565698
Alignment:
Q  297 atctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47565620 atctggagagacgttaaacactcaacatcaacctgaagaggcagtggtaagaatactcatgatcagcctggagaggcgg 47565698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 7123978 - 7124069
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7123978 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatagttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 7124069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 532
Target Start/End: Original strand, 19591003 - 19591090
Alignment:
Q  445 ctttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttatt 532  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||| ||||||    
T  19591003 ctttcataaatatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttcctttgaaatatttttttttacaagatacgttatt 19591090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18536091 - 18536029
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18536091 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatgatc 18536029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Original strand, 1975318 - 1975406
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||    
T  1975318 tttgataaatatttctaatatttgtgcaatattccttaatttgctcatttttcctttgaaacaat-ttttttgcaagatatgtaattcaa 1975406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5207161 - 5206994
Alignment:
Q  42 caaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcat 141  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| || | || |||| || | ||    
T  5207161 caaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatagacaaatcctaaatcaacaaatctactcatttaagatagtgaggttaaagaccgtaat 5207062  T
Q  142 ggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||| |  ||   |  ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5207061 ggagcaactaacgacgttcaacaaaatcctttatgatttagagaacattgaggtgcatcttaaggatg 5206994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34571565 - 34571459
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571565 gttgttgggaggatgatgaaggtggggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcct 34571466  T
Q  331 agagagg 337  Q
     ||||||    
T  34571465 ggagagg 34571459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 21565013 - 21565065
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21565013 tttgataaagatttataatgtttatgcaatattcattaatttgctcatttttc 21565065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23992437 - 23992374
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaa 509  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23992437 tttgataaatatttaaaatgtttgtgcaatattcagtaatttgctcatttttcctttggaacaa 23992374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 361
Target Start/End: Original strand, 26558915 - 26559034
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| ||  | |||||| |||| | || | |||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||     
T  26558915 gatgaagaaggtgatgtctctcacctttggactgatgccttatagagcggcggtcgtttgtacagacattaaacactcaacatcagcctgaagagttgac 26559014  T
Q  342 ggtaagaatactcatgatca 361  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26559015 ggtaagaatactcatgatca 26559034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49711741 - 49711678
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaa 509  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49711741 tttgataaatatttctaatgtttgtgcactattccttaatttgctcatttttcctttggaacaa 49711678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 28120300 - 28120238
Alignment:
Q  448 tgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaat 510  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28120300 tgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttactcatttttcctttggaacaat 28120238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 26870122 - 26870058
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  26870122 tgcaatattcattaatttgctcatttttccttttgaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 26870058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10259442 - 10259390
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10259442 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 10259390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24077511 - 24077459
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24077511 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 24077459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26924381 - 26924329
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26924381 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 26924329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 43332534 - 43332586
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43332534 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 43332586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 51452601 - 51452653
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51452601 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 51452653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Original strand, 4588636 - 4588713
Alignment:
Q  56 ttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaag 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4588636 ttgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaattctactcattcaagatggtggagtcaaag 4588713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 9224978 - 9225078
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  9224978 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 9225077  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  9225078 t 9225078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18536859 - 18536819
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18536859 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttg 18536819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22801997 - 22801966
Alignment:
Q  358 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801997 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 22801966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 5350584 - 5350681
Alignment:
Q  93 taaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 190  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||| |  ||| | |||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  5350584 taaaacaacaactctactcatttaagaaggtggagtcaaatgccgtcatggaccaacttatagagttcaacaaattttttgatgattgggagaacatt 5350681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 358 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36920758 - 36920730
Alignment:
Q  358 atcagtctggagaggcggaggcaacaata 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36920758 atcagtctggagaggcggaggcaacaata 36920730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 447 - 535
Target Start/End: Original strand, 56541691 - 56541778
Alignment:
Q  447 ttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  56541691 ttgataaatatttctaatgtttgtgcaacttttcttaatttgcttatttttcctttgaaataat-ttttttacgagatacgttattcaa 56541778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1025 - 675
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1025 agcaaaggaaacaaccgcgtcatcgatgtggtcaaattttgaatttttgtatatgacaaagtctttggcttatcggaaagtcctaaagcaacaactttac 926  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  925 tcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggtgctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatg 826  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  825 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacg 726  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  725 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15534175 - 15533825
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15534175 agcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaactttac 15534076  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534075 tcattcaagatggtagagtcaaaaaccatcatggagctacttgtggagttcgacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 15533976  T
Q  210 tgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacg 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15533975 cgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccatgagagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacg 15533876  T
Q  310 ttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  15533875 ttatacactcaacatcagcctagagaggcggaggcaacaatactcatgatc 15533825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 3631496 - 3631137
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtc 129  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3631496 catcgatgtggccaaagttggaagctttgtatatgacaaagtctttgactcatcaacaattcctaaagcaataactttactcattcaagatggtaaagtc 3631397  T
Q  130 aaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtgg 229  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3631396 aaaggccatcatggagctacttgtagagttcaataaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggatgctctgatggtgtgg 3631297  T
Q  230 tgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3631296 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggggtgatgcctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacc 3631197  T
Q  330 tagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  3631196 tggagaggcggtggtaagaatagtcatgatcagtctcaagaggtggagacaacaatactc 3631137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26067440 - 26067282
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26067440 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctactggagcggtggtcgtctg 26067341  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26067340 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 26067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 33310123 - 33310281
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33310123 tgaggatacgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagtggtggtcgtctg 33310222  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33310223 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 33310281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 389
Target Start/End: Original strand, 3395245 - 3395397
Alignment:
Q  237 tggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagag 336  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3395245 tggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagag 3395344  T
Q  337 gcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3395345 gcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggagacaagaatactc 3395397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 17012769 - 17012944
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17012769 agcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttac 17012868  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 186  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  17012869 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaa 17012944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 33309595 - 33309792
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  33309595 agcaaaggaagcaaccgcagcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 33309694  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  33309695 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 33309792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26932136 - 26931939
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  26932136 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgttgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 26932037  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  26932036 tcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 26931939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25463023 - 25462839
Alignment:
Q  25 cgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggta 124  Q
    |||| ||||||||| || ||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  25463023 cgcggcatcgatgtagttaaagttatagtctttgtatatgacaaagtcttaggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtg 25462924  T
Q  125 aagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
     ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25462923 gagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 25462839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26067968 - 26067771
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||    
T  26067968 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctac 26067869  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||| | |||||||||||||||| || |  |||  ||||||||| |||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  26067868 tcattcaggatggaagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaaaaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 26067771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 26944234 - 26944361
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  26944234 aaggaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcgacaattcctaaagcgacaactttaataat 26944333  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcat 141  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26944334 tcaagatggtagagtcaaaggccatcat 26944361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 3395103 - 3395249
Alignment:
Q  11 gcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttact 110  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3395103 gcaaaggaaccaaccgccgcatcgatgtgtgcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactttact 3395202  T
Q  111 catttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggag 157  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  3395203 cattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctactcgtggag 3395249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5408587 - 5408402
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5408587 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatg 5408488  T
Q  122 gtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5408487 gtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgagga 5408402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5412912 - 5412727
Alignment:
Q  22 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5412912 aaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatg 5412813  T
Q  122 gtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5412812 gtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgagga 5412727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 12157961 - 12158156
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  12157961 aaggaaccaaacgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaagcactctactcat 12158060  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    | ||||||||  |||||||| ||| ||||||    |||   ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12158061 tcaagatggtggagtcaaagaccaccatggagaaacttacagagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgaggtgcatcttgtggatg 12158156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12936811 - 12936624
Alignment:
Q  21 caaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12936811 caaccgcgccatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaagat 12936712  T
Q  121 ggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggat 208  Q
    |||  ||| ||||||||||||||| |  |||  |||||| ||||||||| ||| ||| ||  |||  |||||||||| | ||||||||    
T  12936711 ggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttgatgacttaaagactattgaggtgcatattgaggat 12936624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Original strand, 16568167 - 16568325
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| |||||| || |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16568167 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgttcatctggaaagacgttaaacactcaacatcagcct 16568266  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
     ||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16568267 ggagaggcggtggtaacaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 16568325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 339
Target Start/End: Original strand, 26944449 - 26944559
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 328  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26944449 gtgttgtttaaaggatgaagaaggtgatgtttttcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 26944548  T
Q  329 ctagagaggcg 339  Q
    |||||||||||    
T  26944549 ctagagaggcg 26944559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 16553318 - 16553511
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16553318 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 16553417  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16553418 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16553511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 16629874 - 16630067
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16629874 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 16629973  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16629974 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16630067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5408043 - 5407899
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| |||||| || |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5408043 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 5407944  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  5407943 ggagaggcggtggtaagaatactcatggttagtctggggaggcgg 5407899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5412368 - 5412224
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| |||||| || |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5412368 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 5412269  T
Q  331 agagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  5412268 ggagaggcggtggtaagaatactcatggttagtctggggaggcgg 5412224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 34165526 - 34165719
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  34165526 aaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcat 34165625  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34165626 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 34165719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 16651578 - 16651774
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16651578 aaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 16651677  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggaga-acattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    | ||||||||  |||||||| || | ||||| |   | | |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16651678 tcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagacacattgaggtgcaacttgaggatg 16651774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 389
Target Start/End: Original strand, 30444606 - 30444709
Alignment:
Q  286 gagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaat 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  30444606 gagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcatggagaggcggtgggaagaatattcatggtcagtctgaagaggcggaggtaagaat 30444705  T
Q  386 actc 389  Q
    ||||    
T  30444706 actc 30444709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 16553946 - 16554037
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16553946 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 16554037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 16630502 - 16630593
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16630502 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 16630593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 16652208 - 16652299
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16652208 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactc 16652299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 30444003 - 30444194
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  30444003 aaggaaccaaccacggcatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcatagacaatttctaaagccacaactctactcat 30444102  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgag 205  Q
    |||||||| |  | | | |  |||||||||| |  |||  | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30444103 ttaagatgatggatttatacaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatcctttataatttggagaacattgaggtgtatcttgag 30444194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 389
Target Start/End: Original strand, 34166154 - 34166245
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34166154 tctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactc 34166245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12911093 - 12910948
Alignment:
Q  63 tgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaa 162  Q
    |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||  |||||| ||    
T  12911093 tgacaaagtctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaa 12910994  T
Q  163 caaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggat 208  Q
    ||||||| ||| ||| ||  |||  |||||||||| | ||||||||    
T  12910993 caaaatccttgatgacttaaagactattgaggtgcatattgaggat 12910948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 389
Target Start/End: Original strand, 11137333 - 11137493
Alignment:
Q  229 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 328  Q
    |||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||      
T  11137333 gtgttgttggtacgatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgccttatagagcggtgatcgtctatagagacgttaaacactcaacatcatt 11137432  T
Q  329 ctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    || || |||||  || ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || |||||||    
T  11137433 ctggaaaggcggtgggaagaatactcatggttagtctgaagaggcggatgtaagaatactc 11137493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 532
Target Start/End: Original strand, 33979108 - 33979194
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttatt 532  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||    
T  33979108 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttcttttgaaataattttttttacaaaatacgttatt 33979194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 535
Target Start/End: Original strand, 33300594 - 33300680
Alignment:
Q  448 tgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  33300594 tgataaatatttctaatgtttgtgaaatattccttaatttactcatttttcctttgaaacaat-atttttacaatatacgatattcaa 33300680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 2624839 - 2624751
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  2624839 tttgataaatatttttaatgtttgtgcaatttttcttaattttctcatttttcctttgaaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 2624751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 22975835 - 22975747
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  22975835 tttgataaatatttttaatgtttgtgcaatttttcttaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 22975747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Original strand, 23812566 - 23812654
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  23812566 tttgataaatatttttaatgtttgtgcaatttttcttaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 23812654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 16567768 - 16567821
Alignment:
Q  154 ggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16567768 ggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16567821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 250047 - 250099
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  250047 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 250099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12579895 - 12579843
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12579895 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 12579843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3052123 - 3052072
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcattttt 497  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3052123 tttgataaagatttataatatttgtgcaatattcattaatttgctcattttt 3052072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 1932288 - 1932352
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||||    
T  1932288 tgcaatattcattaatttgctcattttttctttggaacaa-attttttacaagatacgatattcaa 1932352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10456551 - 10456514
Alignment:
Q  298 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagaga 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10456551 tctggagagacattaaacactcaacatcatcctagaga 10456514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 33331027 - 33331120
Alignment:
Q  30 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  33331027 catcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgatgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 33331120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 438
Target Start/End: Original strand, 33300540 - 33300568
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300540 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc 33300568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6263723 - 6263348
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263723 aaggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcagatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 6263624  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggg 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6263623 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaacaaaacagttggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcggg 6263524  T
Q  214 tgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaa 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||  || |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  6263523 tgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtccctcaccttgggattgatacctggtggagtggtggtcgtctggagaaacgttaa 6263424  T
Q  314 acactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263423 acactcaacatcaacctgaagagacgatggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 6263348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 150 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31734312 - 31734073
Alignment:
Q  150 ttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31734312 ttgtggagttcaacaaaatcattgatgatttgaagaacattaagttgcgtcttgagaatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggataaaga 31734213  T
Q  250 agatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaa 349  Q
    || |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |  | ||||||    
T  31734212 aggtgatgtttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacctggagatgtggtgataagaa 31734113  T
Q  350 tactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31734112 tactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaatactc 31734073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21519739 - 21519552
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||    
T  21519739 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctg 21519640  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21519639 gagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcattctggagagccggaggcaaaaatactc 21519552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19503381 - 19503223
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  19503381 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcagtggtcgtctg 19503282  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  19503281 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 19503223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35217015 - 35216857
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  35217015 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctg 35216916  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35216915 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 35216857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36560189 - 36560031
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36560189 tgagcatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcgccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 36560090  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36560089 gagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 36560031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35217543 - 35217346
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  35217543 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 35217444  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  35217443 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 35217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36560714 - 36560517
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  36560714 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 36560615  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  36560614 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 36560517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19503909 - 19503710
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||| |||    
T  19503909 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcaattcctaaagcaatgactctac 19503810  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19503809 tcattcaggatgatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 19503710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21520267 - 21520080
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  21520267 agcaaaggaaccaaccgcagcatcgatgtggccaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 21520168  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgc 197  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  21520167 tcatttaggatggtggagttaaatgccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattaaggtgc 21520080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22405499 - 22405317
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  22405499 aaggaaccaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcttatcagcaattcctaaagcaacgattctactcat 22405400  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtg 196  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||    
T  22405399 tcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttagagaatattaaggtg 22405317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 389
Target Start/End: Original strand, 22402266 - 22402393
Alignment:
Q  262 tcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatca 361  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  22402266 tcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatattcatgatca 22402365  T
Q  362 gtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22402366 gtctggagaggtggaggcaataatactc 22402393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14634966 - 14634821
Alignment:
Q  230 tgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 329  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |  ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634966 tgttgttgggaggatgaagagggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 14634867  T
Q  330 tagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgg 375  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| | | || ||||||||||||    
T  14634866 tagagaggcggtgggaagaatactcacggttagcctggagaggcgg 14634821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34574731 - 34574620
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||| |||    
T  34574731 agcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagcctttggctcataggcaattccaaatgcaacaactctac 34574632  T
Q  110 tcatttaagatg 121  Q
    ||||||||||||    
T  34574631 tcatttaagatg 34574620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28569428 - 28569281
Alignment:
Q  242 gatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgag 341  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || | ||| || || ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||      
T  28569428 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgacttgtagagtggtggtcgtctagagagatgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggt 28569329  T
Q  342 ggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  28569328 gggaaaaatactcatgatcagtctgaagaggtggaggtaagaatactc 28569281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 410 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 1691583 - 1691456
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagaccg--taagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   |||  |||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  1691583 aatatatgctctttttatgaatcaagacccgataaagctttgagaaatatttctaatgtttgtgcaatattccttaatttgctcattttttctttgaaat 1691484  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||  ||||||||| ||||||| |||||    
T  1691483 aattttttttacaaaatatgttcttcaa 1691456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28569994 - 28569839
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| ||||||||  |||||| || |||||||| || |  | ||||||||| || ||||| ||||| || ||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  28569994 aaggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggagtcgtggtatatgaccaaatctttagctcatcgacagatcctaaaacaaaaactttactcat 28569895  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatc 169  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  28569894 tcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatcaacttacggagttcaacaaaatc 28569839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 410 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7984141 - 7984014
Alignment:
Q  410 aatatatgctcttttcatgaatcaagacc--gtaagactttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaac 507  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7984141 aatatatgccatttttatgaatcaagacttggtacgactttgataaatatttctaatgtttgtgcaatgttccttaatttgctcatttttcctttgaaat 7984042  T
Q  508 aataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    | |  ||||||||| ||| |||||||||    
T  7984041 atttttttttacaatatacgttattcaa 7984014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19348790 - 19348690
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  | ||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19348790 accgcgacatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatgg 19348691  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  19348690 t 19348690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 510
Target Start/End: Original strand, 24278977 - 24279041
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaat 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24278977 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttccttcggaacaat 24279041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25124137 - 25124073
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  25124137 tgcaatattccttaatttactcatttttcctttgaaacaat-ttttttacaagatatgtaattcaa 25124073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41304178 - 41304109
Alignment:
Q  286 gagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactca 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||  || |||||||||||    
T  41304178 gagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaaaatcagcttggagatgcggtgggaagaatactca 41304109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 3711081 - 3711133
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3711081 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 3711133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11866335 - 11866283
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttc 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11866335 tttgataaagatttataatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttc 11866283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 17026065 - 17026129
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17026065 tgcaatattcattaatttgctnatttctcctttgnaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 17026129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42019368 - 42019221
Alignment:
Q  61 tatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttc 160  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||    ||     |||||    
T  42019368 tatgaccaagtctttggcttataggcaattcctaaaacaccaactttatacatttaagatggtggagtcaaaggtcatcgtggagtaactaacaaagttc 42019269  T
Q  161 aacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggat 208  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42019268 aacaaaatccatgatgacttggagaacattgaggtgcatcttaaggat 42019221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 17092250 - 17092314
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17092250 tgcaatattcattaaattgctcatttctcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 17092314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7768798 - 7768739
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  7768798 tttgataaatatttataatgtttgtgcaatatttaataatttgctca-ttttcctttgaaa 7768739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 35357728 - 35357677
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcattttt 497  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  35357728 tttgataaagatttataatgtttgtacaatattcattaatttgctcattttt 35357677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42018794 - 42018734
Alignment:
Q  295 tcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactca 355  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||    
T  42018794 tcatcttgaaagacattaaacactcaacatcatcctggagaggcggtgggaagaatactca 42018734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 34792 - 34979
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34792 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacgttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 34891  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34892 gaaagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 34979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 34256 - 34455
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  34256 agcaaaggaaacaacaacggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactccac 34355  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |  ||   |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  34356 tcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactcacggagttaaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 34455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 858 - 1016
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  858 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 957  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  958 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 1016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 330 - 529
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  330 agcaaaggaagcaaccgtggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagcctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctac 429  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  430 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 23360 - 23519
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggt-ggtcatct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  23360 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 23459  T
Q  301 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  23460 ggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatc 23519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 22832 - 23029
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  22832 agcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 22931  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22932 tcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 23029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26463 - 26288
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26463 agcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttac 26364  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 186  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  26363 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaa 26288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 73090 - 72891
Alignment:
Q  10 agcaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttac 109  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  73090 agcaaaggaacgaactgcggcatctatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaattcctaaagcaacaactctac 72991  T
Q  110 tcatttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
    ||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| |  |||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  72990 tcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 72891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 72548 - 72466
Alignment:
Q  213 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggt 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  72548 gtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggatggatgcctagtggagcggtggt 72466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 70485 - 70415
Alignment:
Q  290 ggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatc 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||    
T  70485 ggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagttgcggtggtaataatactcatgatc 70415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 389
Target Start/End: Original strand, 541 - 722
Alignment:
Q  202 tgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctg 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||    ||| || ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| || ||||    
T  541 tgaggatgtgggtgctttgatggtgtgttgttg---ggaggatgaagg---tgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctg 634  T
Q  302 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| | ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  635 gagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcttggagaggcggtggtaacaatactc 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 148 - 201
Alignment:
Q  154 ggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgagga 207  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  148 ggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 115245 - 115427
Alignment:
Q  14 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 113  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  115245 aaggaaccaaccgcggcatcgacgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcat 115344  T
Q  114 ttaagatggtaaagtcaaaggccatcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtg 196  Q
    | ||||||||  | |||||| || | ||||| |   |    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  115345 tcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtg 115427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Original strand, 115801 - 115908
Alignment:
Q  231 gttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattaatgtctagtggagcggtggtcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 330  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||| ||| || ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  115801 gttgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 115900  T
Q  331 agagaggc 338  Q
     |||||||    
T  115901 ggagaggc 115908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 8421 - 8343
Alignment:
Q  456 atttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  8421 atttctaatgtttgtgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatatgttattcaa 8343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 454 - 551
Alignment:
Q  26 gcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  454 gcgacatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactttattcattcaagatggt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 52786 - 52722
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  52786 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatatgttattcaa 52722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10763 - 10700
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaa 509  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10763 tttgataaatatttctaatgtttgtgcactattccttaatttgctcatttttcctttggaacaa 10700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26920 - 26747
Alignment:
Q  36 tgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaaggc 135  Q
    ||||||||||||| || |  |||||| ||||||| |||||||||||    ||| ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||  |||||||||     
T  26920 tgtggtcaaagttggagtcgttgtatgtgacaaattctttggctcatacacaattcctaaaactacatctctactcgtttaagatggtggagtcaaaggt 26821  T
Q  136 catcatggatcttcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatg 209  Q
      || |||| |  ||  ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26820 tgtcttggagcaactaatggagttcaaacaaattcttgatgatttggagaacattgatgtgcatcttgaggatg 26747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 535
Target Start/End: Original strand, 12947 - 13035
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  12947 tttgataaatatttttaatgtttgtgcaatttttcttaatttcctcatttttcctttggaacaat-ttttttacaagatacgttattcaa 13035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 14883 - 14983
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  14883 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 14982  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  14983 t 14983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 149529 - 149629
Alignment:
Q  23 accgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaccggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatgg 122  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  149529 accgcggcatcaatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatgg 149628  T
Q  123 t 123  Q
    |    
T  149629 t 149629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33505 - 33442
Alignment:
Q  446 tttgataaatatttataatgttcatgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaa 509  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33505 tttgataaatatttctaatgtttgtgcacgattccttaatttgctcatttttcctttggaacaa 33442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 472 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 151973 - 151910
Alignment:
Q  472 caatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  151973 caatattcattaatttgatcatttttcctttggaataattttttttacaagatatgttattcaa 151910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 470 - 535
Target Start/End: Original strand, 61661 - 61725
Alignment:
Q  470 tgcaatattctttaatttgctcatttttcctttgaaacaataatttttacaacatatgttattcaa 535  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||||    
T  61661 tgcaatattcattaatttgctcatttttcctttggaacaa-attttttacaagatacgatattcaa 61725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University