View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11625_high_24 (Length: 378)

Name: NF11625_high_24
Description: NF11625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11625_high_24
NF11625_high_24
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (178-378)||(39784884-39785086)
chr8 (154-378)||(6311097-6311320)
chr8 (178-378)||(25328340-25328540)
chr8 (156-378)||(7289988-7290211)
chr8 (11-157)||(38613611-38613757)
chr8 (157-378)||(36979184-36979400)
chr8 (157-378)||(4760149-4760366)
chr8 (157-378)||(30655448-30655669)
chr8 (148-378)||(10689217-10689442)
chr8 (157-378)||(18853242-18853457)
chr8 (157-375)||(18870639-18870849)
chr8 (193-378)||(33037880-33038063)
chr8 (178-378)||(35745213-35745414)
chr8 (178-378)||(10684326-10684528)
chr8 (157-297)||(1262103-1262238)
chr8 (155-275)||(19752568-19752683)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (178-378)||(39812050-39812250)
chr2 (178-378)||(32246607-32246811)
chr2 (178-378)||(44312686-44312885)
chr2 (155-378)||(11099001-11099219)
chr2 (178-378)||(19344243-19344444)
chr2 (178-378)||(19349101-19349302)
chr2 (157-378)||(9296475-9296691)
chr2 (157-378)||(14291295-14291511)
chr2 (157-378)||(25398305-25398518)
chr2 (157-378)||(25403443-25403656)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (178-378)||(31109645-31109844)
chr7 (178-378)||(12396735-12396934)
chr7 (178-378)||(12406155-12406354)
chr7 (178-378)||(4866553-4866753)
chr7 (178-378)||(24024388-24024589)
chr7 (178-378)||(19992135-19992336)
chr7 (178-378)||(21812300-21812501)
chr7 (157-378)||(20357621-20357837)
chr7 (155-378)||(2057763-2057988)
chr7 (157-378)||(1533518-1533730)
chr7 (178-378)||(24266264-24266466)
chr7 (178-378)||(16879894-16880096)
chr7 (178-378)||(16884750-16884952)
chr7 (178-378)||(24261385-24261587)
chr7 (157-378)||(21645818-21646029)
chr7 (157-378)||(21639620-21639831)
chr7 (157-232)||(2479148-2479221)
chr7 (153-232)||(47263485-47263562)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (178-378)||(45347879-45348079)
chr4 (178-378)||(45357358-45357558)
chr4 (178-378)||(9224469-9224668)
chr4 (178-378)||(9229256-9229455)
chr4 (156-374)||(51520257-51520476)
chr4 (156-378)||(56146773-56146996)
chr4 (178-378)||(18855549-18855750)
chr4 (178-378)||(5732486-5732688)
chr4 (178-378)||(3813846-3814047)
chr4 (157-378)||(24741748-24741963)
chr4 (157-378)||(29760449-29760664)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (178-378)||(28184325-28184528)
chr6 (178-378)||(14737638-14737838)
chr6 (178-378)||(14742498-14742697)
chr6 (178-378)||(11856795-11856997)
chr6 (178-378)||(22010759-22010958)
chr6 (178-378)||(6438324-6438524)
chr6 (178-378)||(28155631-28155832)
chr6 (178-378)||(6005239-6005440)
chr6 (157-300)||(30125944-30126084)
chr6 (178-378)||(16838566-16838767)
chr6 (196-378)||(5343322-5343504)
chr6 (196-292)||(33330594-33330690)
chr6 (157-378)||(5674844-5675057)
chr6 (178-271)||(33336112-33336207)
chr6 (157-269)||(31936398-31936504)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (178-378)||(35124-35323)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (178-378)||(22173257-22173456)
chr3 (178-378)||(18656256-18656458)
chr3 (155-378)||(7167049-7167267)
chr3 (157-378)||(2671660-2671876)
chr3 (157-378)||(28503938-28504145)
chr3 (178-298)||(2677229-2677351)
chr3 (178-298)||(2673073-2673195)
chr3 (178-298)||(10207755-10207877)
chr3 (157-378)||(8739137-8739354)
chr3 (157-378)||(9091375-9091592)
chr3 (178-378)||(8512037-8512240)
chr3 (178-378)||(8516917-8517120)
chr3 (204-378)||(24967957-24968130)
chr3 (157-266)||(40372980-40373085)
chr3 (156-378)||(8477170-8477385)
chr3 (178-378)||(32475306-32475508)
chr3 (178-378)||(32480163-32480366)
chr3 (178-275)||(6794877-6794968)
chr3 (338-378)||(40372869-40372908)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (178-378)||(15044512-15044709)
chr5 (156-378)||(1457224-1457446)
chr5 (157-378)||(43592080-43592302)
chr5 (157-376)||(27444771-27444991)
chr5 (157-378)||(27449615-27449837)
chr5 (157-378)||(43598525-43598747)
chr5 (157-378)||(43604017-43604239)
chr5 (157-378)||(43609509-43609731)
chr5 (178-378)||(28807634-28807837)
chr5 (174-378)||(30631227-30631429)
chr5 (178-378)||(37556684-37556887)
chr5 (178-378)||(37561506-37561709)
chr5 (178-378)||(2785197-2785398)
chr5 (178-378)||(31401912-31402113)
chr5 (157-378)||(38191983-38192196)
chr5 (157-378)||(38219208-38219421)
chr5 (196-378)||(33791158-33791339)
chr5 (178-378)||(31397055-31397256)
chr5 (196-297)||(33768021-33768122)
chr5 (157-378)||(24135659-24135871)
chr5 (278-378)||(31180138-31180237)
chr5 (157-222)||(31180079-31180142)
chr5 (157-213)||(35387474-35387527)
chr5 (337-378)||(33768162-33768202)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (178-378)||(44023935-44024135)
chr1 (178-378)||(39445322-39445523)
chr1 (178-378)||(25445151-25445352)
chr1 (178-378)||(1055073-1055274)
chr1 (178-378)||(41398060-41398259)
chr1 (178-252)||(41386571-41386646)
chr1 (157-378)||(24202843-24203054)
chr1 (193-378)||(24787438-24787624)
chr1 (196-298)||(43988607-43988709)
chr1 (254-378)||(41390485-41390604)
chr1 (157-213)||(19359079-19359132)
chr1 (332-378)||(43988526-43988572)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (178-378)||(9704-9902)
scaffold0355 (178-298)||(28-143)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (178-378)||(185-386)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (156-378)||(310-528)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (178-378)||(149018-149219)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (178-378)||(2313-2514)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (178-378)||(19227-19428)
scaffold0197 (178-378)||(14371-14573)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (178-252)||(34136-34211)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (178-378)||(182026-182228)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (178-239)||(13171-13233)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (157-378)||(18026-18238)
scaffold0188 (157-297)||(24195-24331)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (157-297)||(44111-44247)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39785086 - 39784884
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39785086 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaag 39784987  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39784986 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 39784887  T
Q  376 gcc 378  Q
    |||    
T  39784886 gcc 39784884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 378
Target Start/End: Original strand, 6311097 - 6311320
Alignment:
Q  154 ttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcc 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6311097 ttctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 6311196  T
Q  254 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccg 352  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||    
T  6311197 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccg 6311295  T
Q  353 aacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  6311296 -agaagattgttgacccagttcagcc 6311320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25328540 - 25328340
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25328540 tcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa- 25328442  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaagg-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25328441 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttca 25328343  T
Q  376 gcc 378  Q
    |||    
T  25328342 gcc 25328340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7290211 - 7289988
Alignment:
Q  156 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7290211 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaa 7290112  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||     
T  7290111 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg- 7290013  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7290012 agaagattgttgacccagttcagcc 7289988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 38613611 - 38613757
Alignment:
Q  11 catcatcatcatctctggtcccaggtttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613611 catcatcatcttctctggtcccagctttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 38613710  T
Q  111 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatctgctgaattttgcttct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38613711 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatcagctcgattttgcttct 38613757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 36979184 - 36979400
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||    
T  36979184 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaag-caac 36979279  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||    
T  36979280 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aa 36979376  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  36979377 gaagattgttgacccagttcagcc 36979400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4760366 - 4760149
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  4760366 tgttgtgaatccggttgaaactcacatcaatgaaa--aacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaag-caac 4760271  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||| | ||    
T  4760270 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacatc-aa 4760173  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  4760172 gaagattgttgacccagttcagcc 4760149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 30655448 - 30655669
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc--ca 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||  ||    
T  30655448 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaaca 30655543  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaac----aaaaca 349  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||    ||||||    
T  30655544 acaacaa-aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaaaaaaca 30655641  T
Q  350 ccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  30655642 cc-aagaagattgttgacccagttcagcc 30655669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10689442 - 10689217
Alignment:
Q  148 ttttgcttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 247  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||| ||    
T  10689442 ttttgattgtgttgtgttttcggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tctaatggtttc 10689346  T
Q  248 caagccaacaacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaa 345  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||||| ||||||||    
T  10689345 caag-caacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaagg-aagaacaa 10689249  T
Q  346 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10689248 aacacc-aagaagattgttgacccagttcagcc 10689217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18853457 - 18853242
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  18853457 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaacgaaacaaa----gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaaac 18853363  T
Q  257 aacaacaaaaca-gccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    ||||| |||| | ||||||  || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||    
T  18853362 aacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aa 18853266  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18853265 gaagattgttgacccagttcagcc 18853242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18870849 - 18870639
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||    
T  18870849 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgag-ttaaatggtttccaagcaaac 18870754  T
Q  257 aacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaac 355  Q
    ||||| ||||| ||||||  || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||     
T  18870753 aacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aag 18870659  T
Q  356 aagattgttgacccagttca 375  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18870658 aagattgttgacccagttca 18870639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037880
Alignment:
Q  193 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaaca--aaacagccctaagctagtgtatagcaa 290  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaag-caacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaa 33037966  T
Q  291 aaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33037965 aaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaag-aagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagcc 33037880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 35745213 - 35745414
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35745213 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 35745311  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || ||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35745312 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 35745407  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  35745408 ttcagcc 35745414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10684528 - 10684326
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  10684528 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 10684430  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10684429 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 10684334  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  10684333 gttcagcc 10684326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1262238 - 1262103
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||  |  |||||||||| |||||   |||  ||||||||| ||||    
T  1262238 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgag--taaagtgtctccaag-caac 1262145  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccaca 297  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  1262144 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca 1262103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19752683 - 19752568
Alignment:
Q  155 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||    | |||  ||||||||| ||    
T  19752683 tctgttgtgaatccggtaaaaa-tcacaccaatgaaa-aaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaat--atataaagtgtctccaag-ca 19752589  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  19752588 acaacaacaaaacagacctaa 19752568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39812250 - 39812050
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812250 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 39812151  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  39812150 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgaaccagttcag 39812052  T
Q  377 cc 378  Q
    ||    
T  39812051 cc 39812050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 32246607 - 32246811
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  32246607 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctaga 32246706  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagc---ggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32246707 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgtt 32246806  T
Q  374 cagcc 378  Q
    |||||    
T  32246807 cagcc 32246811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44312885 - 44312686
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  |    
T  44312885 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 44312786  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44312785 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 44312688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11099219 - 11099001
Alignment:
Q  155 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||    
T  11099219 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaag-ca 11099124  T
Q  255 acaacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccg 352  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    ||||| ||||||||||||||     
T  11099123 acaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaagg-aagaacaaaacacc- 11099027  T
Q  353 aacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  11099026 aagaagattgttgacccagttcagcc 11099001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 19344243 - 19344444
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19344243 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaag 19344341  T
Q  277 -ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19344342 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 19344438  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  19344439 tcagcc 19344444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 19349101 - 19349302
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19349101 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaag 19349199  T
Q  277 -ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19349200 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 19349296  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  19349297 tcagcc 19349302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9296691 - 9296475
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  9296691 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaac 9296596  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||    
T  9296595 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aa 9296499  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9296498 gaagattgttgacccagttcagcc 9296475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 14291295 - 14291511
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||    
T  14291295 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 14291390  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||    
T  14291391 aacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aa 14291487  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  14291488 gaagattgttgacccagttcagcc 14291511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 25398305 - 25398518
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||| |||    
T  25398305 tgttgtgaatctggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagc-aac 25398398  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  25398399 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaacacacc-aa 25398494  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  25398495 aaagattgttgacccagttcagcc 25398518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 25403443 - 25403656
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||| |||    
T  25403443 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagc-aac 25403536  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  25403537 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaacacacc-aa 25403632  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  25403633 aaagattgttgactcagttcagcc 25403656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31109844 - 31109645
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31109844 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-c 31109746  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109745 tagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagc 31109646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 12396735 - 12396934
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  12396735 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12396834  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12396835 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 12396932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 12406155 - 12406354
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  12406155 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12406254  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12406255 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 12406352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 4866553 - 4866753
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  4866553 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagac 4866652  T
Q  278 tagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 375  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4866653 tagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttca 4866750  T
Q  376 gcc 378  Q
    |||    
T  4866751 gcc 4866753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24024589 - 24024388
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag- 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |     
T  24024589 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag-cctatga 24024491  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaac-aaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| ||||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024490 ctagtatatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 24024392  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  24024391 agcc 24024388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 19992135 - 19992336
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  19992135 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaac-aaacagccctaag 19992233  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19992234 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 19992332  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  19992333 agcc 19992336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21812501 - 21812300
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21812501 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaac-aaacagccctaag 21812403  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21812402 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagag-ttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 21812304  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  21812303 agcc 21812300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20357837 - 20357621
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||    
T  20357837 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-ccaaatggtctccaagctaac 20357742  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||| ||||   ||| | |||||||||| ||| ||    
T  20357741 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagc--aaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaatacc-aa 20357645  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20357644 gaagattgttgacccagttcagcc 20357621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 378
Target Start/End: Original strand, 2057763 - 2057988
Alignment:
Q  155 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |    
T  2057763 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaa 2057859  T
Q  255 acaacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagc----ataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaac 348  Q
    |||||||| ||||| ||||||  || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||    | |||||||| ||||  |||| | |||||||||||    
T  2057860 acaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaac 2057959  T
Q  349 accgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2057960 acc-aagaagattgttgacccagttcagcc 2057988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1533730 - 1533518
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  1533730 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaag-caac 1533637  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||  |||||| | ||||   ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  1533636 aacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaagc--aaacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aa 1533542  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  1533541 taagattgttgacccagttcagcc 1533518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24266466 - 24266264
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24266466 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 24266368  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24266367 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 24266272  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  24266271 gttcagcc 24266264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 16879894 - 16880096
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16879894 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 16879992  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16879993 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 16880088  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  16880089 gttcagcc 16880096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 16884750 - 16884952
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16884750 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 16884848  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16884849 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 16884944  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  16884945 gttcagcc 16884952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24261587 - 24261385
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24261587 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 24261489  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24261488 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 24261393  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  24261392 gttcagcc 24261385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 21645818 - 21646029
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||   |||  ||||||||| ||||    
T  21645818 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgag--taaagtgtctccaag-caac 21645911  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||  | |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  21645912 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacac--cacaagagaatacaaa--acaaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaacacacc-aa 21646005  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21646006 aaagattgttgacccagttcagcc 21646029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 21639620 - 21639831
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||| |||    
T  21639620 tgttgtgaatccgattaaaactcacatcaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagc-aac 21639713  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  21639714 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaa 21639808  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21639809 -aagattgttgacccagttcagcc 21639831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Original strand, 2479148 - 2479221
Alignment:
Q  157 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 232  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2479148 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 2479221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Original strand, 47263485 - 47263562
Alignment:
Q  153 cttctgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 232  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  47263485 cttctgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgcgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 47263562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45348079 - 45347879
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  45348079 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45347980  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45347979 tagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 45347881  T
Q  377 cc 378  Q
    ||    
T  45347880 cc 45347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45357558 - 45357358
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  45357558 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45357459  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45357458 tagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 45357360  T
Q  377 cc 378  Q
    ||    
T  45357359 cc 45357358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9224668 - 9224469
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  9224668 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9224569  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9224568 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 9224471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9229455 - 9229256
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  9229455 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9229356  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  9229355 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttaacccagttcag 9229258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 374
Target Start/End: Original strand, 51520257 - 51520476
Alignment:
Q  156 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51520257 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 51520356  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||     
T  51520357 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg- 51520455  T
Q  354 acaagattgttgacccagttc 374  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  51520456 agaagattgttgacccagttc 51520476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56146996 - 56146773
Alignment:
Q  156 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  56146996 ctgttgtgaatccggttccaaattcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaa 56146897  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||     
T  56146896 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg- 56146798  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | ||||||||||  |||||||||||    
T  56146797 agaagattgttggtccagttcagcc 56146773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 18855549 - 18855750
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18855549 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 18855647  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18855648 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 18855746  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  18855747 agcc 18855750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 5732486 - 5732688
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5732486 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 5732584  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaac----aaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5732585 tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagc--aaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagt 5732682  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  5732683 tcagcc 5732688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 3813846 - 3814047
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  3813846 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctaga 3813945  T
Q  277 ctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3813946 ctagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttc 3814043  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  3814044 agcc 3814047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 24741748 - 24741963
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||    
T  24741748 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaag-caac 24741842  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||    
T  24741843 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aa 24741939  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24741940 gaagattgttgacccagttcagcc 24741963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 29760449 - 29760664
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| |||    
T  29760449 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagc-aac 29760544  T
Q  257 aacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaac 355  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||     
T  29760545 aacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aag 29760641  T
Q  356 aagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29760642 aagattgttgacccagttcagcc 29760664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 28184325 - 28184528
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaa--tggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28184325 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 28184424  T
Q  275 agctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 373  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28184425 gactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagtt 28184523  T
Q  374 cagcc 378  Q
    |||||    
T  28184524 cagcc 28184528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14737838 - 14737638
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  14737838 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 14737739  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac--aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 375  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  14737738 tagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgatccagttca 14737641  T
Q  376 gcc 378  Q
    |||    
T  14737640 gcc 14737638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14742697 - 14742498
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |    
T  14742697 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagac 14742598  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14742597 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 14742500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 11856795 - 11856997
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  11856795 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 11856894  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaac---aaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11856895 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacacc-aagaagattgttgacccagtt 11856992  T
Q  374 cagcc 378  Q
    |||||    
T  11856993 cagcc 11856997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22010958 - 22010759
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  |    
T  22010958 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 22010859  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22010858 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 22010761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 6438324 - 6438524
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6438324 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 6438422  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6438423 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttca 6438521  T
Q  376 gcc 378  Q
    |||    
T  6438522 gcc 6438524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28155832 - 28155631
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag- 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |     
T  28155832 tcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacag-cctatga 28155734  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155733 cttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 28155635  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  28155634 agcc 28155631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 6005239 - 6005440
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6005239 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 6005337  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || ||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6005338 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 6005433  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  6005434 ttcagcc 6005440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30126084 - 30125944
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||    
T  30126084 tgttgtgaatccggttgaaaatcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgag-ccaaatggtctccaagctaac 30125989  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa 300  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  30125988 tacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 16838566 - 16838767
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16838566 tcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 16838664  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16838665 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 16838760  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  16838761 ttcagcc 16838767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 378
Target Start/End: Original strand, 5343322 - 5343504
Alignment:
Q  196 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagc-aaaac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||    
T  5343322 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaaagtatagcaaaaac 5343420  T
Q  294 cacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    ||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5343421 cacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 5343504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33330690 - 33330594
Alignment:
Q  196 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc-tagtgtatagcaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  33330690 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaa 33330594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5675057 - 5674844
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||  || ||| |  ||||    
T  5675057 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa--gtttcccaagcaac 5674963  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||  |||||| | ||||   ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5674962 aacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaagc--aaacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aa 5674868  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  5674867 agagattgttgacccagttcagcc 5674844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33336207 - 33336112
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcc 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  33336207 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcc 33336112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 269
Target Start/End: Original strand, 31936398 - 31936504
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |   |||  ||||||||| ||||    
T  31936398 tgttgtgaatccggttaaaa-tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtg--taaagtgtctccaag-caac 31936491  T
Q  257 aacaacaaaacag 269  Q
    |||||||||||||    
T  31936492 aacaacaaaacag 31936504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35323 - 35124
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  35323 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 35224  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  35223 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttaacccagttcag 35126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22173456 - 22173257
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  22173456 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 22173357  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22173356 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 22173259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 18656256 - 18656458
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18656256 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 18656354  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaac----aaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18656355 tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagc--aaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagt 18656452  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  18656453 tcagcc 18656458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 378
Target Start/End: Original strand, 7167049 - 7167267
Alignment:
Q  155 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |    
T  7167049 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-a 7167144  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| |    
T  7167145 acaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-a 7167242  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7167243 agaagattgttgacccagttcagcc 7167267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2671876 - 2671660
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||    
T  2671876 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-ccaaatggtctccaagcaaac 2671781  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| ||    
T  2671780 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-aa 2671684  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  2671683 gaagattgttgacccagttcagcc 2671660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28504145 - 28503938
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  28504145 tgttgtgaatccggtcttaactcacaccaatgaat--aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aac 28504050  T
Q  257 aacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaac 355  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||| |     
T  28504049 aacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag---------aaagg-aagaacaaaacaccg-ag 28503961  T
Q  356 aagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28503960 aagattgttgacccagttcagcc 28503938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2677351 - 2677229
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2677351 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2677253  T
Q  276 gc-tagtgtatagcaaaaccacac 298  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  2677252 gcctaatgtatagcaaaaccacac 2677229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2673195 - 2673073
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2673195 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2673097  T
Q  276 gc-tagtgtatagcaaaaccacac 298  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  2673096 gcctaatgtatagcaaaaccacac 2673073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Original strand, 10207755 - 10207877
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10207755 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 10207853  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac 298  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  10207854 gcctaatgtatagcaaaaccacac 10207877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8739354 - 8739137
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||     
T  8739354 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaaat 8739259  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    |||||| ||||| ||||||  || || || | | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| |    
T  8739258 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-a 8739162  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8739161 agaagattgttgacccagttcagcc 8739137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9091592 - 9091375
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||     
T  9091592 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaaat 9091497  T
Q  257 aacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    |||||| ||||| ||||||  || || || | | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| |    
T  9091496 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacacc-a 9091400  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9091399 agaagattgttgacccagttcagcc 9091375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 8512037 - 8512240
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8512037 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 8512135  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaaga-caagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    | ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||   ||||||  ||||||  || || |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8512136 gcctaatgtgtagcacaaccacactaagag-ttaacaagcat--acaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 8512232  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  8512233 gttcagcc 8512240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 8516917 - 8517120
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8516917 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 8517015  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaaga-caagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    | ||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||   ||||||  ||||||  || || |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8517016 gcctaatgtgtagcacaaccacactaagag-ttaacaagcat--acaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 8517112  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  8517113 gttcagcc 8517120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 378
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968130
Alignment:
Q  204 tgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aag 301  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  302 agattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    || |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24968056 agctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 24968130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40373085 - 40372980
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||    
T  40373085 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 40372990  T
Q  257 aacaacaaaa 266  Q
    |||| |||||    
T  40372989 aacatcaaaa 40372980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 378
Target Start/End: Original strand, 8477170 - 8477385
Alignment:
Q  156 ctgttgtgattccggt-tgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||  || ||| |  ||    
T  8477170 ctgttgtgaatccggtataaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa--gtttcccaagca 8477264  T
Q  255 acaacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccg 352  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||| |||||| |||| | | ||||||  |||||||| ||||   ||| ||||||||||| |||||     
T  8477265 acaacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca-aagataatacaaagc--aaacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc- 8477359  T
Q  353 aacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  8477360 aagaagattgttgacccagttcagcc 8477385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 32475306 - 32475508
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  32475306 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacag-ccta 32475404  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32475405 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 32475500  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  32475501 gttcagcc 32475508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 32480163 - 32480366
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa--caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagccct 273  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||    
T  32480163 tcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacag-cct 32480261  T
Q  274 aag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccc 369  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32480262 aagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgaccc 32480357  T
Q  370 agttcagcc 378  Q
    |||||||||    
T  32480358 agttcagcc 32480366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6794968 - 6794877
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6794968 tcacaccaatgaaa--aacaacgatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaat-agaaaaagtg-tctccaagc-aacaacaacaaaacagacctaa 6794877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372869
Alignment:
Q  338 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagcc 40372869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 15044512 - 15044709
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagc 277  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  15044512 tcacaccaatgaaata--caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagac 15044609  T
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15044610 tagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagc 15044708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1457446 - 1457224
Alignment:
Q  156 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcca 254  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1457446 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 1457347  T
Q  255 acaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccga 353  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||     
T  1457346 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagg-aagaacaaaacaccg- 1457249  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  1457248 agaagattgttgacccagttcagcc 1457224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 43592080 - 43592302
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43592080 tgttgtgaatccggttccaaagtcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa 43592179  T
Q  256 caacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |    
T  43592180 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-a 43592278  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  43592279 gaagattgttgacccagttcagcc 43592302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 157 - 376
Target Start/End: Original strand, 27444771 - 27444991
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27444771 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27444870  T
Q  256 caacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |    
T  27444871 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-a 27444969  T
Q  355 caagattgttgacccagttcag 376  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  27444970 gaagattgttgacccagttcag 27444991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27449837
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27449714  T
Q  256 caacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |    
T  27449715 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-a 27449813  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27449814 gaagattgttgacccagttcagcc 27449837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598747
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43598624  T
Q  256 caacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |    
T  43598625 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-a 43598723  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     ||||||||||  |||||||||||    
T  43598724 gaagattgttggtccagttcagcc 43598747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604239
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43604116  T
Q  256 caacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |    
T  43604117 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-a 43604215  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     ||||||||||  |||||||||||    
T  43604216 gaagattgttggtccagttcagcc 43604239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609731
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43609608  T
Q  256 caacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |    
T  43609609 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg-a 43609707  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     ||||||||||  |||||||||||    
T  43609708 gaagattgttggtccagttcagcc 43609731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28807837 - 28807634
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28807837 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 28807739  T
Q  277 ctagtgtatagc--aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28807738 ctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 28807640  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  28807639 tcagcc 28807634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 378
Target Start/End: Original strand, 30631227 - 30631429
Alignment:
Q  174 aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccct 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  30631227 aaactcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaag-caacaacaacaaaacagccct 30631325  T
Q  274 aagctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    |  |||||||||||||||| |||| | | ||||  |||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30631326 agactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaagg-aagaacaaaacacc-aagaagattgttgactcagt 30631423  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  30631424 tcagcc 30631429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37556887 - 37556684
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  37556887 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctat 37556789  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556788 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 37556690  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  37556689 tcagcc 37556684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37561709 - 37561506
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  37561709 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctat 37561611  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37561610 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 37561512  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  37561511 tcagcc 37561506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 2785197 - 2785398
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2785197 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaa 2785295  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || ||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2785296 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 2785391  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  2785392 ttcagcc 2785398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31402113 - 31401912
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  31402113 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 31402015  T
Q  276 gc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    || || |||| ||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31402014 gcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 31401919  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  31401918 ttcagcc 31401912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 38191983 - 38192196
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||| |||    
T  38191983 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagc-aac 38192076  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  38192077 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaacacacc-aa 38192172  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  38192173 aaagattgttgacccagttcagcc 38192196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 38219208 - 38219421
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||| |||    
T  38219208 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagc-aac 38219301  T
Q  257 aacaacaaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  38219302 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaacacacc-aa 38219397  T
Q  355 caagattgttgacccagttcagcc 378  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  38219398 aaagattgttgacccagttcagcc 38219421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 378
Target Start/End: Original strand, 33791158 - 33791339
Alignment:
Q  196 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaacc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  33791158 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaacc 33791256  T
Q  295 acaca-agagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    ||| | |||| |  | ||||||  |||||| || || ||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33791257 acatatagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 33791339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31397256 - 31397055
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  31397256 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca-tcctaa 31397158  T
Q  276 g-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 372  Q
    | ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || | |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31397157 gcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagt 31397061  T
Q  373 tcagcc 378  Q
    ||||||    
T  31397060 tcagcc 31397055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Original strand, 33768021 - 33768122
Alignment:
Q  196 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaacc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  33768021 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaacc 33768119  T
Q  295 aca 297  Q
    |||    
T  33768120 aca 33768122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 24135659 - 24135871
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| | | |  |||||||||| |||    
T  24135659 tgttgtgaatccggataaaactcacaccaatgaaa---ataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaaga--gtctccaagcaaac 24135753  T
Q  257 aacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaac 355  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||||| | | ||||||  |||||||| ||||   ||| | ||||||||| ||||| ||     
T  24135754 aacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacac--cacaagataatacaaagc--aaacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacacc-aag 24135848  T
Q  356 aagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24135849 aagattgttgacccagttcagcc 24135871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180237
Alignment:
Q  278 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 31180235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Original strand, 31180079 - 31180142
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31180079 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--taacaatgatgtgtggagcaagagatagtg 31180142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 35387474 - 35387527
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 213  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  35387474 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 35387527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 33768162 - 33768202
Alignment:
Q  337 aaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33768162 aaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagcc 33768202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44024135 - 44023935
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44024135 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 44024037  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44024036 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 44023938  T
Q  376 gcc 378  Q
    |||    
T  44023937 gcc 44023935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 39445322 - 39445523
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39445322 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 39445420  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39445421 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 39445519  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  39445520 agcc 39445523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25445352 - 25445151
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25445352 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 25445254  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25445253 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 25445155  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  25445154 agcc 25445151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1055274 - 1055073
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1055274 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaac-aaacagccctaag 1055176  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1055175 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 1055077  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  1055076 agcc 1055073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 41398060 - 41398259
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc---caacaacaacaaaacagccct 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  41398060 tcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccct 41398159  T
Q  274 aagctagtgtatagc--aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||     |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41398160 aa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aagg-aagaacaaaacaccg-agaagattgttgaccca 41398251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 252
Target Start/End: Original strand, 41386571 - 41386646
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386571 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24203054 - 24202843
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||| |||    
T  24203054 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaac 24202960  T
Q  257 aacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgaac 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||  |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||| ||     
T  24202959 aacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacac--cacaagagaatacaaagc--aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaacacacc-aaa 24202866  T
Q  356 aagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24202865 aagattgttgacccagttcagcc 24202843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787438
Alignment:
Q  193 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc--caacaacaac--aaaacagccctaagctagtgtatagc 288  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||  ||  |||| |||    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  289 aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||  |||||||| ||||   ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagc--aaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagcc 24787438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43988709 - 43988607
Alignment:
Q  196 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaacc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  43988709 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaacc 43988611  T
Q  295 acac 298  Q
    ||||    
T  43988610 acac 43988607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 378
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390604
Alignment:
Q  254 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagc--aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacac 350  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||     |||| ||||||||||||     
T  41390485 aacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aagg-aagaacaaaacat 41390577  T
Q  351 cgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||    
T  41390578 cg-agaagattgttgacccagatcagcc 41390604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19359132 - 19359079
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 213  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  19359132 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 19359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43988572 - 43988526
Alignment:
Q  332 aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  43988572 aaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagcc 43988526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9902 - 9704
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9902 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaag 9803  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9802 ctagtatatagcaaaaccacacaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 9706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 28
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  143 tcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaag 50  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49 ctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 185 - 386
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  185 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 283  T
Q  277 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  284 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 382  T
Q  375 agcc 378  Q
    ||||    
T  383 agcc 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 310
Alignment:
Q  156 ctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc--c 253  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||  |    
T  528 ctgttgtgaatccatttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaac 432  T
Q  254 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaaacaccg 352  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||     
T  431 aacaacaa-aaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaa-gaaagaacaaaacacc- 336  T
Q  353 aacaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  335 aagaagattgttgacctagttcagcc 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 149219 - 149018
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  149219 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 149121  T
Q  276 gc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  149120 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 149025  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  149024 ttcagcc 149018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2313
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2514 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2416  T
Q  276 gc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2415 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 2320  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  2319 ttcagcc 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19428 - 19227
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 275  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19428 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 19330  T
Q  276 gc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 371  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19329 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccag 19234  T
Q  372 ttcagcc 378  Q
    |||||||    
T  19233 ttcagcc 19227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14371
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14573 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 14475  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14474 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 14379  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  14378 gttcagcc 14371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34211 - 34136
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagc 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34211 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 182228 - 182026
Alignment:
Q  178 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa-caacaacaaaacagcccta 274  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  182228 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag-ccta 182130  T
Q  275 ag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 370  Q
    || ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  | ||||||  |||||| || || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  182129 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 182034  T
Q  371 gttcagcc 378  Q
    ||||||||    
T  182033 gttcagcc 182026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13233
Alignment:
Q  178 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaa 239  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13171 tcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18238 - 18026
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||| |||    
T  18238 tgttgtgaatccggttaaaactcaaaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagc-aac 18145  T
Q  257 aacaacaaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagacaagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccga 353  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||| |    
T  18144 aacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaa 18050  T
Q  354 acaagattgttgacccagttcagcc 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18049 a-aagattgttgacccagttcagcc 18026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24331 - 24195
Alignment:
Q  157 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaac 256  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |   |||  ||||||||| ||||    
T  24331 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtg--taaagtgtctccaag-caac 24238  T
Q  257 aacaacaaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccaca 297  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  24237 aacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca 24195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44247 - 44111
Alignment:
Q  157 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagccaa 255  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| |   |||  ||||||||| |||    
T  44247 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatgtg--taaagtgtctccaag-caa 44154  T
Q  256 caacaac-aaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccaca 297  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  44153 caacaacaaaaacagacctaatctagtgtagagcaacaccaca 44111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University