View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11625_high_32 (Length: 320)

Name: NF11625_high_32
Description: NF11625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11625_high_32
NF11625_high_32
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (1-302)||(35491642-35491947)
chr2 (1-300)||(33404022-33404321)
chr2 (1-301)||(10364532-10364836)
chr2 (1-302)||(19471528-19471833)
chr2 (1-302)||(41498988-41499293)
chr2 (1-273)||(2919288-2919564)
chr2 (1-302)||(27130403-27130708)
chr2 (1-302)||(34521578-34521883)
chr2 (1-302)||(6976845-6977148)
chr2 (1-275)||(10360122-10360398)
chr2 (1-273)||(12968226-12968501)
chr2 (5-302)||(37312389-37312690)
chr2 (1-273)||(42120019-42120294)
chr2 (1-273)||(29111165-29111438)
chr2 (1-275)||(29906589-29906866)
chr2 (1-273)||(17796033-17796303)
chr2 (1-275)||(22493278-22493555)
chr2 (3-272)||(3936991-3937261)
chr2 (3-272)||(17424798-17425068)
chr2 (3-272)||(29067738-29068008)
chr2 (3-272)||(43982865-43983135)
chr2 (1-211)||(6901973-6902183)
chr2 (1-275)||(42241021-42241298)
chr2 (1-240)||(3941744-3941984)
chr2 (1-292)||(5420476-5420768)
chr2 (48-302)||(40677269-40677527)
chr2 (1-211)||(20148125-20148335)
chr2 (1-275)||(32734654-32734931)
chr2 (11-272)||(22001851-22002113)
chr2 (1-275)||(16581829-16582108)
chr2 (1-209)||(39393898-39394106)
chr2 (3-140)||(39799902-39800039)
chr2 (12-136)||(18392055-18392179)
chr2 (100-236)||(27650391-27650527)
chr2 (144-302)||(43491600-43491762)
chr2 (139-266)||(16253600-16253728)
chr2 (142-240)||(31991896-31991994)
chr2 (142-238)||(15891609-15891705)
chr2 (3-122)||(34638974-34639093)
chr2 (142-240)||(18036122-18036220)
chr2 (1-112)||(16253483-16253594)
chr2 (193-240)||(20148334-20148381)
chr2 (131-240)||(18393486-18393596)
chr2 (198-239)||(6902187-6902228)
chr2 (8-58)||(31770377-31770427)
chr2 (209-289)||(22493816-22493896)
chr2 (216-302)||(35492096-35492184)
chr2 (216-302)||(43491912-43492000)
chr2 (109-204)||(11679084-11679179)
chr2 (109-184)||(11718870-11718945)
chr2 (220-292)||(6977394-6977466)
chr2 (216-302)||(10364293-10364381)
chr2 (97-149)||(17112399-17112451)
chr2 (183-250)||(39799818-39799886)
chr2 (209-292)||(18393894-18393977)
chr2 (223-300)||(19471297-19471376)
chr2 (109-192)||(26617485-26617568)
chr2 (1-52)||(40678763-40678814)
chr2 (221-275)||(2918963-2919017)
chr2 (142-208)||(18878652-18878718)
chr2 (223-292)||(10364213-10364282)
chr2 (220-292)||(19471205-19471277)
chr2 (212-240)||(32736853-32736881)
chr2 (220-284)||(34521330-34521394)
chr2 (220-284)||(41498678-41498742)
chr2 (212-240)||(42120779-42120807)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (1-273)||(17697049-17697322)
chr1 (1-300)||(14173658-14173961)
chr1 (1-302)||(13972927-13973232)
chr1 (1-302)||(36909564-36909869)
chr1 (1-295)||(6435775-6436073)
chr1 (1-266)||(13283708-13283973)
chr1 (1-266)||(24363738-24364003)
chr1 (1-275)||(42571702-42571979)
chr1 (1-240)||(5765209-5765448)
chr1 (1-301)||(38046333-38046637)
chr1 (2-302)||(49926278-49926582)
chr1 (1-302)||(17686259-17686564)
chr1 (11-302)||(23342654-23342949)
chr1 (1-273)||(35586858-35587132)
chr1 (1-302)||(49396707-49397012)
chr1 (1-271)||(24270292-24270566)
chr1 (13-273)||(21484573-21484834)
chr1 (1-294)||(35184973-35185271)
chr1 (1-275)||(35576342-35576619)
chr1 (1-275)||(47487963-47488240)
chr1 (1-300)||(17372730-17373030)
chr1 (1-273)||(3658476-3658751)
chr1 (28-303)||(37778109-37778388)
chr1 (1-292)||(39856817-39857109)
chr1 (1-302)||(41780696-41781001)
chr1 (1-273)||(12791201-12791476)
chr1 (1-273)||(18170028-18170304)
chr1 (1-240)||(48568367-48568607)
chr1 (11-250)||(49427400-49427640)
chr1 (3-272)||(19160322-19160592)
chr1 (1-275)||(39224123-39224400)
chr1 (3-250)||(13635250-13635498)
chr1 (20-275)||(46180206-46180465)
chr1 (1-240)||(50068222-50068462)
chr1 (1-211)||(18842442-18842652)
chr1 (1-272)||(27035247-27035521)
chr1 (3-210)||(44337313-44337520)
chr1 (1-275)||(41874810-41875087)
chr1 (1-240)||(29762184-29762424)
chr1 (14-240)||(27486653-27486880)
chr1 (23-275)||(45689144-45689399)
chr1 (1-210)||(29435976-29436185)
chr1 (1-240)||(44597704-44597944)
chr1 (1-240)||(51269805-51270045)
chr1 (3-209)||(48215203-48215409)
chr1 (1-275)||(49262914-49263191)
chr1 (5-240)||(16532054-16532289)
chr1 (7-240)||(16081294-16081527)
chr1 (1-158)||(49598921-49599077)
chr1 (1-302)||(35526095-35526380)
chr1 (1-271)||(30309762-30310029)
chr1 (114-301)||(40533185-40533376)
chr1 (44-129)||(13148365-13148450)
chr1 (144-237)||(14772499-14772592)
chr1 (100-208)||(19262409-19262517)
chr1 (124-274)||(29707465-29707621)
chr1 (1-58)||(16098078-16098135)
chr1 (223-292)||(35185540-35185609)
chr1 (220-292)||(12790853-12790925)
chr1 (211-275)||(18842670-18842734)
chr1 (220-292)||(40532866-40532938)
chr1 (179-272)||(22527688-22527782)
chr1 (220-292)||(6436326-6436398)
chr1 (220-292)||(14173338-14173410)
chr1 (210-266)||(18170611-18170667)
chr1 (220-292)||(35586499-35586571)
chr1 (209-292)||(50067841-50067924)
chr1 (210-292)||(18170770-18170852)
chr1 (223-292)||(24269945-24270014)
chr1 (209-290)||(48567990-48568071)
chr1 (216-302)||(13973382-13973470)
chr1 (216-302)||(14173418-14173506)
chr1 (220-292)||(23343194-23343266)
chr1 (216-302)||(24270025-24270113)
chr1 (208-240)||(27034784-27034816)
chr1 (216-302)||(37778537-37778625)
chr1 (209-289)||(45689660-45689740)
chr1 (220-292)||(49397198-49397270)
chr1 (213-300)||(49926038-49926126)
chr1 (209-292)||(29436512-29436595)
chr1 (209-288)||(29761735-29761814)
chr1 (179-275)||(49598817-49598916)
chr1 (223-289)||(13973481-13973547)
chr1 (209-288)||(12790683-12790764)
chr1 (107-192)||(15471636-15471721)
chr1 (212-240)||(3659321-3659349)
chr1 (209-289)||(22528046-22528126)
chr1 (212-240)||(39223614-39223642)
chr1 (220-292)||(42571356-42571428)
chr1 (212-240)||(46924689-46924717)
chr1 (100-184)||(48706929-48707013)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (1-281)||(14115044-14115324)
chr6 (1-302)||(32027525-32027830)
chr6 (1-302)||(13402540-13402845)
chr6 (1-302)||(32037584-32037889)
chr6 (1-275)||(801173-801447)
chr6 (1-300)||(34802795-34803098)
chr6 (1-302)||(12396783-12397088)
chr6 (6-275)||(35058660-35058932)
chr6 (3-272)||(11692460-11692730)
chr6 (3-272)||(27640189-27640459)
chr6 (3-272)||(6205493-6205763)
chr6 (53-302)||(30257476-30257729)
chr6 (1-210)||(29066560-29066769)
chr6 (1-210)||(29075573-29075782)
chr6 (17-210)||(29108163-29108356)
chr6 (2-210)||(29110546-29110754)
chr6 (3-173)||(22305805-22305975)
chr6 (123-240)||(17465298-17465415)
chr6 (156-302)||(35021134-35021284)
chr6 (144-240)||(34134801-34134897)
chr6 (142-238)||(20192466-20192562)
chr6 (142-238)||(20242092-20242188)
chr6 (142-238)||(22136076-22136172)
chr6 (142-238)||(22143429-22143525)
chr6 (132-272)||(24021027-24021168)
chr6 (124-275)||(3765712-3765867)
chr6 (151-240)||(14482785-14482874)
chr6 (132-266)||(2192535-2192670)
chr6 (210-300)||(4495123-4495213)
chr6 (142-240)||(28051515-28051614)
chr6 (216-302)||(12397238-12397326)
chr6 (210-266)||(30257133-30257189)
chr6 (100-177)||(2402306-2402383)
chr6 (216-301)||(13403278-13403365)
chr6 (208-240)||(14123449-14123481)
chr6 (107-195)||(18743985-18744073)
chr6 (216-302)||(35020896-35020984)
chr6 (228-292)||(32027207-32027271)
chr6 (228-292)||(32037266-32037330)
chr6 (212-240)||(34132140-34132168)
[»] chr3 (101 HSPs)
chr3 (1-302)||(51015294-51015599)
chr3 (1-303)||(51013174-51013480)
chr3 (1-294)||(41577923-41578220)
chr3 (1-300)||(8633264-8633561)
chr3 (1-302)||(46414231-46414536)
chr3 (1-302)||(2428504-2428809)
chr3 (1-302)||(34471973-34472278)
chr3 (1-302)||(43569927-43570232)
chr3 (1-285)||(30192555-30192843)
chr3 (1-301)||(55206782-55207086)
chr3 (1-275)||(39416873-39417150)
chr3 (1-302)||(41803919-41804224)
chr3 (1-266)||(6754221-6754488)
chr3 (4-302)||(7246114-7246416)
chr3 (1-302)||(45100362-45100667)
chr3 (1-266)||(6464280-6464547)
chr3 (1-292)||(7954220-7954516)
chr3 (3-275)||(48087477-48087752)
chr3 (3-302)||(52569306-52569608)
chr3 (1-291)||(33449063-33449341)
chr3 (1-275)||(47065704-47065981)
chr3 (1-275)||(25576517-25576793)
chr3 (1-275)||(42383068-42383345)
chr3 (1-274)||(44927480-44927756)
chr3 (1-275)||(53826621-53826898)
chr3 (1-240)||(42382288-42382528)
chr3 (1-273)||(42949947-42950222)
chr3 (19-240)||(774301-774522)
chr3 (1-259)||(34647207-34647469)
chr3 (3-261)||(2646817-2647076)
chr3 (3-261)||(3494970-3495229)
chr3 (5-273)||(37281473-37281745)
chr3 (3-272)||(2268424-2268694)
chr3 (1-275)||(13895795-13896072)
chr3 (1-275)||(24702197-24702473)
chr3 (1-275)||(34693215-34693492)
chr3 (1-302)||(14631462-14631767)
chr3 (3-272)||(49139984-49140254)
chr3 (3-272)||(54390461-54390731)
chr3 (1-275)||(19453154-19453431)
chr3 (3-272)||(4004017-4004287)
chr3 (3-272)||(34049746-34050016)
chr3 (3-272)||(46403022-46403292)
chr3 (1-275)||(44835412-44835689)
chr3 (1-240)||(49218698-49218938)
chr3 (1-302)||(49273416-49273721)
chr3 (3-272)||(36135027-36135296)
chr3 (1-238)||(10053236-10053473)
chr3 (27-302)||(42323286-42323565)
chr3 (5-240)||(20375845-20376080)
chr3 (1-207)||(47759887-47760093)
chr3 (1-214)||(27186965-27187178)
chr3 (1-240)||(43477074-43477314)
chr3 (1-240)||(49610506-49610746)
chr3 (1-273)||(36721315-36721591)
chr3 (83-301)||(46346510-46346732)
chr3 (1-210)||(51695599-51695808)
chr3 (49-272)||(50997453-50997677)
chr3 (112-275)||(18440873-18441037)
chr3 (112-275)||(19485947-19486111)
chr3 (1-238)||(50458652-50458893)
chr3 (3-240)||(14265427-14265661)
chr3 (17-240)||(25887571-25887796)
chr3 (148-261)||(15637155-15637269)
chr3 (1-78)||(15637041-15637118)
chr3 (119-211)||(7954774-7954866)
chr3 (210-302)||(55268757-55268849)
chr3 (210-300)||(27187543-27187633)
chr3 (210-292)||(36720916-36720998)
chr3 (210-292)||(34646794-34646877)
chr3 (210-288)||(37282062-37282140)
chr3 (216-302)||(7246566-7246654)
chr3 (193-237)||(7954865-7954909)
chr3 (216-300)||(41578379-41578465)
chr3 (1-41)||(11378906-11378946)
chr3 (220-292)||(45100054-45100126)
chr3 (220-292)||(46413900-46413972)
chr3 (220-288)||(51015845-51015913)
chr3 (215-300)||(8633023-8633110)
chr3 (216-302)||(2428959-2429047)
chr3 (100-192)||(17267306-17267398)
chr3 (220-292)||(42322969-42323041)
chr3 (220-292)||(49273971-49274043)
chr3 (209-292)||(34692872-34692955)
chr3 (209-292)||(42383605-42383688)
chr3 (220-275)||(43570478-43570533)
chr3 (209-292)||(44835069-44835152)
chr3 (209-292)||(47066240-47066323)
chr3 (216-301)||(49273876-49273963)
chr3 (220-290)||(10052967-10053037)
chr3 (227-292)||(14632020-14632085)
chr3 (1-38)||(46346745-46346782)
chr3 (200-240)||(773986-774026)
chr3 (219-289)||(13895532-13895604)
chr3 (208-240)||(27187849-27187881)
chr3 (228-292)||(34471655-34471719)
chr3 (216-302)||(41804374-41804462)
chr3 (212-240)||(42949656-42949684)
chr3 (212-240)||(44834902-44834930)
chr3 (212-240)||(47066462-47066490)
chr3 (216-302)||(52569068-52569156)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (1-302)||(22436914-22437219)
chr4 (1-302)||(43889398-43889703)
chr4 (1-302)||(957354-957659)
chr4 (1-302)||(34153185-34153490)
chr4 (1-302)||(49791835-49792140)
chr4 (1-302)||(21169454-21169759)
chr4 (3-302)||(2773014-2773317)
chr4 (1-284)||(49817561-49817848)
chr4 (1-275)||(33163471-33163748)
chr4 (1-293)||(6282231-6282527)
chr4 (1-266)||(17211269-17211536)
chr4 (1-275)||(18412598-18412873)
chr4 (2-302)||(47657254-47657558)
chr4 (1-237)||(3393307-3393543)
chr4 (1-302)||(34529695-34530000)
chr4 (3-272)||(21017109-21017379)
chr4 (1-275)||(31824556-31824833)
chr4 (1-266)||(11288298-11288562)
chr4 (1-273)||(24606755-24607028)
chr4 (1-273)||(1226162-1226437)
chr4 (1-302)||(4785321-4785626)
chr4 (3-261)||(40353716-40353975)
chr4 (1-275)||(25762601-25762878)
chr4 (1-275)||(51428119-51428396)
chr4 (1-302)||(44560079-44560384)
chr4 (3-272)||(55796748-55797018)
chr4 (1-272)||(20778800-20779073)
chr4 (1-273)||(32937833-32938106)
chr4 (1-240)||(14330658-14330898)
chr4 (1-302)||(36776418-36776723)
chr4 (4-275)||(51027694-51027968)
chr4 (4-275)||(49063985-49064259)
chr4 (1-274)||(242344-242620)
chr4 (4-240)||(10312278-10312514)
chr4 (1-212)||(26591678-26591889)
chr4 (3-272)||(41794494-41794764)
chr4 (1-275)||(46816452-46816727)
chr4 (17-275)||(21711549-21711810)
chr4 (18-240)||(1042769-1042992)
chr4 (3-272)||(6177247-6177517)
chr4 (3-272)||(56138915-56139185)
chr4 (45-275)||(27759374-27759607)
chr4 (1-302)||(49423656-49423962)
chr4 (3-272)||(49094750-49095020)
chr4 (1-240)||(13850752-13850991)
chr4 (1-284)||(42886266-42886556)
chr4 (5-273)||(31324181-31324451)
chr4 (1-275)||(37866409-37866687)
chr4 (1-238)||(13866266-13866503)
chr4 (1-275)||(20901595-20901872)
chr4 (3-250)||(28082243-28082491)
chr4 (1-273)||(45939528-45939804)
chr4 (1-240)||(39588932-39589172)
chr4 (1-240)||(9489682-9489921)
chr4 (119-240)||(49817162-49817283)
chr4 (142-237)||(17292106-17292201)
chr4 (100-240)||(23124490-23124630)
chr4 (100-208)||(20759132-20759240)
chr4 (100-208)||(20765523-20765631)
chr4 (216-302)||(26591576-26591664)
chr4 (210-266)||(49064575-49064631)
chr4 (1-83)||(21412647-21412729)
chr4 (211-292)||(14330224-14330305)
chr4 (216-302)||(22437369-22437457)
chr4 (220-292)||(36776100-36776172)
chr4 (216-302)||(49423418-49423506)
chr4 (217-300)||(24607276-24607359)
chr4 (210-288)||(20901120-20901199)
chr4 (220-275)||(49791534-49791589)
chr4 (209-292)||(56139449-56139532)
chr4 (220-266)||(44559893-44559939)
chr4 (220-266)||(49423364-49423410)
chr4 (220-289)||(957039-957108)
chr4 (220-261)||(51427804-51427845)
chr4 (212-240)||(1226898-1226926)
chr4 (216-302)||(21169909-21169997)
chr4 (216-302)||(34529457-34529545)
chr4 (220-292)||(42886833-42886905)
chr4 (216-302)||(49571567-49571655)
chr4 (216-302)||(49791597-49791685)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (1-302)||(41856870-41857175)
chr8 (1-275)||(33799475-33799752)
chr8 (11-290)||(44942989-44943272)
chr8 (1-301)||(18440192-18440496)
chr8 (3-272)||(15032253-15032523)
chr8 (1-271)||(43638605-43638878)
chr8 (1-275)||(28706066-28706343)
chr8 (1-275)||(42168884-42169161)
chr8 (1-302)||(42603467-42603769)
chr8 (1-273)||(34614966-34615241)
chr8 (1-275)||(43693150-43693427)
chr8 (1-302)||(19242058-19242363)
chr8 (1-302)||(19315242-19315547)
chr8 (1-240)||(3589228-3589467)
chr8 (4-302)||(40702376-40702679)
chr8 (1-288)||(41363669-41363958)
chr8 (1-240)||(38033886-38034126)
chr8 (1-275)||(40415270-40415547)
chr8 (1-240)||(31171778-31172017)
chr8 (1-210)||(26452338-26452547)
chr8 (3-272)||(485187-485457)
chr8 (3-204)||(40414625-40414826)
chr8 (1-210)||(41275407-41275616)
chr8 (1-240)||(2416928-2417168)
chr8 (1-168)||(26484590-26484757)
chr8 (1-210)||(24861356-24861565)
chr8 (1-273)||(16575705-16575966)
chr8 (1-105)||(22548276-22548380)
chr8 (162-302)||(26486847-26486991)
chr8 (217-291)||(16576214-16576288)
chr8 (142-210)||(22549236-22549301)
chr8 (219-289)||(22549559-22549631)
chr8 (216-302)||(28167306-28167394)
chr8 (209-288)||(2417522-2417601)
chr8 (214-293)||(28705721-28705800)
chr8 (209-292)||(33799332-33799415)
chr8 (217-301)||(18439954-18440040)
chr8 (209-272)||(16576154-16576219)
chr8 (212-240)||(28705555-28705583)
chr8 (212-240)||(33776051-33776079)
chr8 (212-240)||(40416028-40416056)
chr8 (216-302)||(41856630-41856718)
chr8 (212-240)||(43637179-43637207)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (1-302)||(1400202-1400507)
chr5 (4-301)||(4723975-4724276)
chr5 (1-301)||(18308262-18308566)
chr5 (3-261)||(7173-7432)
chr5 (1-211)||(33370656-33370866)
chr5 (1-302)||(35565274-35565578)
chr5 (3-272)||(8576074-8576344)
chr5 (3-250)||(8537958-8538206)
chr5 (1-271)||(1971367-1971640)
chr5 (1-210)||(40009530-40009739)
chr5 (3-250)||(11346713-11346961)
chr5 (3-272)||(19036607-19036877)
chr5 (3-272)||(28880995-28881265)
chr5 (3-273)||(19400367-19400640)
chr5 (3-250)||(30709602-30709850)
chr5 (3-272)||(27661310-27661580)
chr5 (1-240)||(541600-541840)
chr5 (14-271)||(3601356-3601616)
chr5 (3-250)||(38854162-38854409)
chr5 (3-240)||(11027781-11028019)
chr5 (1-237)||(36350279-36350510)
chr5 (5-237)||(6793351-6793587)
chr5 (1-204)||(17366738-17366940)
chr5 (1-173)||(35927470-35927642)
chr5 (70-302)||(1694860-1695096)
chr5 (1-162)||(3169606-3169766)
chr5 (100-240)||(18920835-18920975)
chr5 (1-176)||(2599221-2599396)
chr5 (142-240)||(17195325-17195423)
chr5 (1-104)||(3458838-3458941)
chr5 (100-240)||(25360549-25360690)
chr5 (114-274)||(7082336-7082499)
chr5 (142-240)||(36311911-36312009)
chr5 (142-240)||(13131044-13131142)
chr5 (145-211)||(12742818-12742884)
chr5 (1-73)||(1693383-1693455)
chr5 (210-292)||(7082815-7082897)
chr5 (145-211)||(12805636-12805702)
chr5 (149-273)||(3458940-3459067)
chr5 (210-292)||(1171730-1171812)
chr5 (209-291)||(33371168-33371250)
chr5 (132-272)||(22283704-22283845)
chr5 (170-230)||(2599426-2599486)
chr5 (100-208)||(19748169-19748276)
chr5 (1-104)||(12742717-12742820)
chr5 (193-240)||(12742883-12742930)
chr5 (1-104)||(12805535-12805638)
chr5 (193-245)||(17366679-17366732)
chr5 (220-292)||(4723656-4723728)
chr5 (100-208)||(15798078-15798186)
chr5 (220-292)||(25498635-25498707)
chr5 (220-292)||(35565824-35565896)
chr5 (193-240)||(12805701-12805748)
chr5 (193-266)||(10397987-10398061)
chr5 (1-42)||(7082294-7082335)
chr5 (209-292)||(40012156-40012239)
chr5 (220-292)||(6793058-6793130)
chr5 (100-208)||(23228668-23228776)
chr5 (209-292)||(6815-6898)
chr5 (209-292)||(8538491-8538574)
chr5 (222-289)||(34683510-34683577)
chr5 (210-292)||(3459331-3459413)
chr5 (220-292)||(1399887-1399959)
chr5 (107-195)||(16418111-16418199)
chr5 (216-302)||(36349987-36350075)
chr5 (212-240)||(40012378-40012406)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (5-302)||(41048792-41049093)
chr7 (1-302)||(48315077-48315382)
chr7 (1-292)||(48270653-48270948)
chr7 (1-273)||(15337831-15338107)
chr7 (1-301)||(46862092-46862396)
chr7 (1-300)||(43350999-43351301)
chr7 (1-240)||(1642550-1642789)
chr7 (1-261)||(21614701-21614962)
chr7 (6-300)||(30354714-30355012)
chr7 (1-302)||(21187196-21187501)
chr7 (1-302)||(36393721-36394026)
chr7 (3-275)||(18237571-18237846)
chr7 (1-285)||(42735268-42735555)
chr7 (1-302)||(21650529-21650833)
chr7 (1-302)||(28114290-28114595)
chr7 (1-240)||(41217619-41217859)
chr7 (1-292)||(20378613-20378905)
chr7 (1-273)||(47268904-47269178)
chr7 (1-275)||(39477165-39477442)
chr7 (3-272)||(20564766-20565036)
chr7 (1-240)||(48220706-48220944)
chr7 (1-240)||(2356294-2356534)
chr7 (1-240)||(30360522-30360761)
chr7 (1-240)||(40588554-40588794)
chr7 (3-250)||(17839330-17839579)
chr7 (1-210)||(34140870-34141079)
chr7 (1-275)||(17183217-17183497)
chr7 (3-272)||(10523075-10523346)
chr7 (1-165)||(28979060-28979224)
chr7 (1-140)||(26603268-26603407)
chr7 (80-272)||(9367050-9367243)
chr7 (1-240)||(45363214-45363445)
chr7 (96-273)||(2205964-2206144)
chr7 (100-236)||(150192-150328)
chr7 (150-240)||(3380637-3380727)
chr7 (3-112)||(13916840-13916949)
chr7 (121-272)||(13920431-13920583)
chr7 (107-230)||(18149638-18149761)
chr7 (100-207)||(28066359-28066466)
chr7 (142-215)||(11824839-11824912)
chr7 (1-91)||(42682961-42683051)
chr7 (144-266)||(17320137-17320260)
chr7 (142-273)||(26601705-26601839)
chr7 (100-208)||(7414196-7414304)
chr7 (218-302)||(21186960-21187046)
chr7 (107-208)||(12083042-12083143)
chr7 (217-290)||(21614369-21614442)
chr7 (162-250)||(34139332-34139421)
chr7 (220-292)||(36393404-36393476)
chr7 (225-284)||(20877967-20878026)
chr7 (107-206)||(31267188-31267286)
chr7 (220-261)||(10224623-10224664)
chr7 (209-288)||(20877461-20877542)
chr7 (216-302)||(46861853-46861941)
chr7 (209-292)||(39476823-39476906)
chr7 (220-266)||(28113998-28114044)
chr7 (209-288)||(28113803-28113884)
chr7 (216-295)||(48271115-48271196)
chr7 (220-292)||(20877631-20877703)
chr7 (208-302)||(21614111-21614207)
chr7 (212-240)||(26500410-26500438)
chr7 (212-240)||(26592275-26592303)
chr7 (212-240)||(30361280-30361308)
chr7 (212-240)||(39476656-39476684)
chr7 (209-245)||(48220373-48220409)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-274)||(17843-18118)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-275)||(2272-2549)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-210)||(1795-2004)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (1-211)||(24910-25119)
scaffold0181 (208-240)||(25131-25163)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (145-273)||(64098-64227)
scaffold0004 (1-116)||(63981-64095)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (132-272)||(85462-85603)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (144-272)||(14616-14745)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (100-208)||(5453-5561)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (107-192)||(36775-36860)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (208-250)||(108001-108044)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (209-291)||(2496-2578)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 35491642 - 35491947
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  35491642 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 35491741  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  35491742 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 35491841  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  35491842 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgg 35491941  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  35491942 cattcc 35491947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 33404022 - 33404321
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  33404022 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 33404121  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33404122 tttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccagaagatcgtga 33404221  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  33404222 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactttttaaacggcaggactcaaacatttgtccggcatt 33404321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10364836 - 10364532
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10364836 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 10364737  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10364736 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 10364637  T
Q  201 ttaggtagg---gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac-ggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  10364636 ttacgtaggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttgccaaacgggcaggtctccaatattcgaccgg 10364537  T
Q  297 cattc 301  Q
    |||||    
T  10364536 cattc 10364532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19471833 - 19471528
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  19471833 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 19471734  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  19471733 tttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 19471634  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||| |||| ||| || |||||| |||||||| |    
T  19471633 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaacttgtcaaatggcagggctccaatattcgaccag 19471534  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  19471533 cattcc 19471528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41499293 - 41498988
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  41499293 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 41499194  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  41499193 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 41499094  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||     
T  41499093 ttaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccga 41498994  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  41498993 cattcc 41498988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2919564 - 2919288
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2919564 agggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 2919465  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  2919464 tttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgccaaaagatcgtca 2919365  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2919364 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacg 2919288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27130708 - 27130403
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27130708 agggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 27130609  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  27130608 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatagtca 27130509  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| | |  ||||||||  |||||||||    
T  27130508 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctaaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaatttgccaaatgacatgactccaatgttcgaccgg 27130409  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  27130408 cattcc 27130403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34521883 - 34521578
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34521883 agggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 34521784  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||||||| |    
T  34521783 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccctcataagatcgtca 34521684  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||    
T  34521683 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggtaggactccaatattcgattgg 34521584  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  34521583 cattcc 34521578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 6976845 - 6977148
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  6976845 agggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 6976942  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  6976943 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 6977042  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  6977043 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatgttcgactgg 6977142  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  6977143 cattcc 6977148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10360398 - 10360122
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  10360398 agggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgt 10360299  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  10360298 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 10360199  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10360198 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 10360122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12968501 - 12968226
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  12968501 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgt 12968402  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  12968401 tttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtca 12968302  T
Q  201 ttaggtagggaa---tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| |   |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12968301 ttagttagggtaaggtgcac--tccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 12968226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37312690 - 37312389
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37312690 tggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttg 37312591  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  37312590 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 37312491  T
Q  205 gt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||    |  ||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||    
T  37312490 gtaccgaatgaatgcaccttacagctacaacaattgacttcctatgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaatgttcgaccgacatt 37312391  T
Q  301 cc 302  Q
    ||    
T  37312390 cc 37312389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 42120019 - 42120294
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  42120019 agggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 42120118  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  42120119 tttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 42120218  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  42120219 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacgattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacg 42120294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 29111165 - 29111438
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  29111165 agggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 29111264  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | | |||||||||||| | ||| |    
T  29111265 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccagaataacgtca 29111364  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
     ||||||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29111365 ctaggtagggtaaagtgcattccaactacaacaattatcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgtcaaacg 29111438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 29906589 - 29906866
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29906589 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatgt 29906688  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| |||||||||||   |    
T  29906689 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcagca 29906788  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29906789 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaactgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 29906866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17796303 - 17796033
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17796303 agggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgt 17796204  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||| |||| |    
T  17796203 tttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtcagaagctcgtca 17796107  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  17796106 ttaggtagggaaatgtgtcttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacg 17796033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 22493278 - 22493555
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22493278 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtgacgagcatgt 22493377  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  22493378 tttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 22493477  T
Q  201 ttaggtaggg---aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct--ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| |||||    |||||  ||||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22493478 ttagttagggtaagatgca--ttccaactacaacaactgtcttacttctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 22493555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3937261 - 3936991
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3937261 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 3937162  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  3937161 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 3937062  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  3937061 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 3936991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 17424798 - 17425068
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  17424798 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 17424897  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  17424898 tgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 17424997  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  17424998 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 17425068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 29067738 - 29068008
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29067738 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtgacgaccatgttt 29067837  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29067838 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 29067937  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  29067938 agttagggtaaggtgcattccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 29068008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 43982865 - 43983135
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  43982865 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 43982964  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  43982965 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 43983064  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  43983065 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 43983135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 6901973 - 6902183
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  6901973 agggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 6902072  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  6902073 tttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcgagaagatcatga 6902172  T
Q  201 ttaggtaggga 211  Q
    |||||||||||    
T  6902173 ttaggtaggga 6902183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42241298 - 42241021
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  42241298 agggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgt 42241199  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||||||| |    
T  42241198 tttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgccataagatcgtca 42241099  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  42241098 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggc 42241021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3941744 - 3941984
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  3941744 agggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 3941843  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  3941844 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 3941943  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  3941944 ttagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 3941984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 5420476 - 5420768
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5420476 agggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 5420575  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||| |    
T  5420576 tttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacctgaagatcgtca 5420675  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| ||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  5420676 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaataggcaggactccaacattcga 5420768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677269
Alignment:
Q  48 agtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 147  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  148 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |    ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaccaattgtattcct 40677328  T
Q  244 ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  40677327 ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatgttcgaccgacattcc 40677269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 20148125 - 20148335
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | |||||    
T  20148125 agggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatgactagcatgt 20148224  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20148225 tttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgccagaagatcgtga 20148324  T
Q  201 ttaggtaggga 211  Q
    |||||||||||    
T  20148325 ttaggtaggga 20148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 32734654 - 32734931
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||    
T  32734654 agggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtgacaagcatgt 32734753  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  32734754 tttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccaaaagatagtca 32734853  T
Q  201 ttaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| | ||| || |  | |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  32734854 ttagttaaggtaaggtgcattccaactacaacaacagtcttacctctaaaatgggataattcaaacttgccaaacggc 32734931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 22001851 - 22002113
Alignment:
Q  11 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  22001851 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagct 22001950  T
Q  111 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg 210  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |    
T  22001951 cagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttattg 22002050  T
Q  211 aa---tgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
     |   ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  22002051 taagttgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 22002113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 16581829 - 16582108
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||  || |||||    
T  16581829 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtgtcgagcatgt 16581928  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatc--gatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| |    
T  16581929 tttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatctt 16582028  T
Q  199 gattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
     ||||| ||||| || |  | |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16582029 cattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattggcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 16582108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 39393898 - 39394106
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || |||||    
T  39393898 agggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 39393997  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||| |    
T  39393998 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgtcagaagatcgtca 39394097  T
Q  201 ttaggtagg 209  Q
    |||| ||||    
T  39394098 ttagttagg 39394106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39800039 - 39799902
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  39800039 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttt 39799940  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggt 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39799939 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggt 39799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 18392055 - 18392179
Alignment:
Q  12 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18392055 cgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 18392154  T
Q  112 aacatgttccagtggatcgatatgc 136  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18392155 atcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650391
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  200 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27650427 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 27650391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 302
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491762
Alignment:
Q  144 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaa----tgcaccttccaactacaacaattgtct 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| ||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattgcct 43491699  T
Q  240 tcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||| |||||| |||||    
T  43491700 tcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcagatctccaatatttgaccggaattcc 43491762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 16253600 - 16253728
Alignment:
Q  139 gtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16253600 gtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaatacaccttccaactacaacaattgtc 16253699  T
Q  239 ttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    || || | ||||| |||||||||| ||||    
T  16253700 ttactctgaaatgaggtaattcaaacttg 16253728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31991994 - 31991896
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991994 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 31991896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15891705 - 15891609
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891705 acgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 15891609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 34638974 - 34639093
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  34638974 ggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 34639073  T
Q  103 tgggagcacaacatgttcca 122  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  34639074 tgggagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18036220 - 18036122
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18036220 acgttgcagagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtaggaaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 18036122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 16253483 - 16253594
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  16253483 agggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagcagcatgt 16253582  T
Q  101 tttgggagcaca 112  Q
    ||||||||||||    
T  16253583 tttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 240
Target Start/End: Original strand, 20148334 - 20148381
Alignment:
Q  193 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20148334 gatcgtgattaggtagggaatgctccttccaactacaacaattgtctt 20148381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393596
Alignment:
Q  131 atatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactaca 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||| |||||  |||| || |  | |||||||||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattagtgagggtaaggtgcattccaactaca 18393585  T
Q  230 acaattgtctt 240  Q
    | |||||||||    
T  18393586 aaaattgtctt 18393596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 239
Target Start/End: Original strand, 6902187 - 6902228
Alignment:
Q  198 tgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902187 tgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtct 6902228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Original strand, 31770377 - 31770427
Alignment:
Q  8 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31770377 aatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 289
Target Start/End: Original strand, 22493816 - 22493896
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||    
T  22493816 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacatt 22493896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35492184 - 35492096
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| | || |||||| || |||||| |||||||||    
T  35492184 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgatcggcattcc 35492096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43492000 - 43491912
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43492000 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 43491912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11679179 - 11679084
Alignment:
Q  109 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||  |||||||    
T  11679179 cacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttacttagatcaactgaagatattctcaacagtttgattctgccataagattatgattag 11679084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 11718870 - 11718945
Alignment:
Q  109 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattc 184  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11718870 cacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttactgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattc 11718945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 6977394 - 6977466
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||  ||| | ||||||||||    
T  6977394 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggtaggaattcaacattcga 6977466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 10364293 - 10364381
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtgg-taattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||||| | ||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  10364293 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgactggcattcc 10364381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  97 atgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgct 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39799886 - 39799818
Alignment:
Q  183 tccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39799886 tccgccagaagatcgtcattagttagggtaatgtgcattccaaccacaacaattgtcttcctttgaatg 39799818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 18393894 - 18393977
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  18393894 ggaattcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 18393977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 19471297 - 19471376
Alignment:
Q  223 aactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19471297 aactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcatt 19471376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26617568 - 26617485
Alignment:
Q  109 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 192  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||    
T  26617568 cacaacatgtccccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattcttaagagtttgattccgctagaa 26617485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 40678814 - 40678763
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtat 52  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  40678814 agggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2919017 - 2918963
Alignment:
Q  221 ccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  2919017 ccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggc 2918963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 18878652 - 18878718
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  18878652 acgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccgacagaagattatcattaggtag 18878718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10364282 - 10364213
Alignment:
Q  223 aactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  10364282 aactgcaacaattgtctttctctaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 10364213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19471277 - 19471205
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  19471277 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggagtaattcaaacttgttaaacggcaggattccagcattcga 19471205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32736881 - 32736853
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32736881 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 32736853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34521394 - 34521330
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactcca 284  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||    
T  34521394 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatcca 34521330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41498742 - 41498678
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactcca 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||  ||||||| ||| ||||    
T  41498742 tccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaacggcaggaatcca 41498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42120807 - 42120779
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42120807 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42120779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17697049 - 17697322
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  17697049 agggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtgacgagcatgt 17697148  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17697149 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtga 17697248  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaat-gtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||    
T  17697249 ttaggtaaggaatgcaccttccaactacaacagttgtcttcctttaaatgggggtaattcaaacttgtcaaacg 17697322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14173961 - 14173658
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  14173961 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 14173862  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  14173861 tttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 14173762  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||    
T  14173761 ttaggtacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactctaatgttcaaccgg 14173662  T
Q  297 catt 300  Q
    ||||    
T  14173661 catt 14173658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 13972927 - 13973232
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  13972927 agggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 13973026  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  13973027 tttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtca 13973126  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  13973127 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccga 13973226  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  13973227 cattcc 13973232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 36909564 - 36909869
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  36909564 agggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 36909663  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  36909664 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 36909763  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||     
T  36909764 ttaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattccaaggttcgaccga 36909863  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  36909864 cattcc 36909869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 6435775 - 6436073
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  6435775 agggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaagt 6435874  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  6435875 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 6435974  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccg 295  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  6435975 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccg 6436073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 13283708 - 13283973
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||||| |||||| ||| || |||||    
T  13283708 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatgacgagcatgt 13283807  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13283808 tttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtga 13283907  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13283908 ttaggtagagaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 13283973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363738
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  24363803 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 24363738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42571979 - 42571702
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42571979 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagagcatgt 42571880  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  42571879 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 42571780  T
Q  201 ttaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||  | ||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42571779 ttacttaaggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 42571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5765209 - 5765448
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5765209 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatgagcatgt 5765308  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5765309 tttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgccagaagatcgtga 5765408  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765409 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 5765448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38046637 - 38046333
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  38046637 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgt 38046538  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |    
T  38046537 tttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtca 38046438  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||     
T  38046437 ttaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccga 38046338  T
Q  297 cattc 301  Q
    |||||    
T  38046337 cattc 38046333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49926582 - 49926278
Alignment:
Q  2 gggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  49926582 gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgtt 49926483  T
Q  102 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  49926482 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcat 49926383  T
Q  202 taggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggc 297  Q
    |||||| |    |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||    
T  49926382 taggtacggaatgaatgcaccttttagctacaaccattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctccaatattcgaccagc 49926283  T
Q  298 attcc 302  Q
    |||||    
T  49926282 attcc 49926278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17686564 - 17686259
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  17686564 agggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaacgtgaagagcatgt 17686465  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17686464 tttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 17686365  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  17686364 ttaggtatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttcctctggatagggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccagcatacgtccgg 17686265  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  17686264 cattcc 17686259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Original strand, 23342654 - 23342949
Alignment:
Q  11 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  23342654 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttggagca 23342753  T
Q  111 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt---- 206  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||        
T  23342754 cattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccagaagatcgtcattaggtaccg 23342853  T
Q  207 agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23342854 aatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaatattcgaccggcattcc 23342949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35587132 - 35586858
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35587132 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 35587033  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  35587032 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 35586933  T
Q  201 ttag---gtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||||   | |  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  35586932 ttagtacggaatgaatgcacctttcaactacaacagttgt-ttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 35586858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 49396707 - 49397012
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  49396707 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgt 49396806  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  49396807 tttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 49396906  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||  ||||| ||     
T  49396907 ttaggtatggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactccaatgttcgatcga 49397006  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  49397007 cattcc 49397012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24270566 - 24270292
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24270566 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 24270467  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |    
T  24270466 tttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatca 24270367  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaa 271  Q
     |||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  24270366 ataggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaa 24270292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21484834 - 21484573
Alignment:
Q  13 gttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  21484834 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttttggagcaca 21484735  T
Q  113 acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-a 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  21484734 acatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccagaagatcgtcattaggtagggta 21484635  T
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    | |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21484634 aggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatatggtaattcaaacttgccaaacg 21484573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35184973 - 35185271
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35184973 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 35185072  T
Q  101 ttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  35185073 tttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 35185172  T
Q  200 attaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgacc 294  Q
    |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||||    
T  35185173 attaggtgcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactccaatgttcgacc 35185271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 35576342 - 35576619
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  35576342 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 35576441  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  35576442 tttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 35576541  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35576542 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacggc 35576619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47488240 - 47487963
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47488240 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 47488141  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||| |    
T  47488140 tttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagatcgtca 47488041  T
Q  201 ttaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| || || || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47488040 ttagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 47487963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 17372730 - 17373030
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17372730 agggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtgaagaacatgt 17372829  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| |||||||||||||| |    
T  17372830 tttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgccagaagatcgtca 17372929  T
Q  201 ttaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcat 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| |||    
T  17372930 ttaggtatggaaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcgcccgacat 17373029  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  17373030 t 17373030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 3658476 - 3658751
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||    
T  3658476 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtgt 3658575  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  3658576 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 3658675  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||||||||| || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3658676 ttaggtagggtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 3658751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778388
Alignment:
Q  28 ccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtgga 127  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  128 tcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttcca 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||     
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccg 37778308  T
Q  224 actacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcct 303  Q
     ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  37778309 cctacaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattccaatattcgaccgacattcct 37778388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39857109 - 39856817
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  39857109 agggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgt 39857010  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  39857009 tttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtca 39856910  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  39856909 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 39856817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 41780696 - 41781001
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  41780696 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatatat 41780795  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  41780796 tttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagttcgtca 41780895  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  41780896 ttaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatattcaaccag 41780995  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  41780996 cattcc 41781001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12791476 - 12791201
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |    
T  12791476 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcattt 12791377  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12791376 ttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 12791277  T
Q  201 ttaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||  || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12791276 ttagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 12791201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18170028 - 18170304
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18170028 agggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 18170127  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |    
T  18170128 tttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgccagaagatcgtca 18170227  T
Q  201 ttaggtaggga----atgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||||||  ||    |||||||||||||||| |||  |||| ||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  18170228 ttaggtaccgaatgcatgcaccttccaactaaaacttttgtgttcctctggatgaggtaattcaaacttgccaaacg 18170304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48568607 - 48568367
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||    
T  48568607 agggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtgacgagcatgt 48568508  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||| || |    
T  48568507 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagattgtca 48568408  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  48568407 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 48568367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 49427400 - 49427640
Alignment:
Q  11 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagca 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49427400 acgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 49427499  T
Q  111 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49427500 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 49427599  T
Q  211 -aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
     || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49427600 taaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 49427640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 19160322 - 19160592
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  19160322 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttt 19160421  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  19160422 tgggaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcatt 19160521  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  19160522 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 19160592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39224400 - 39224123
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  39224400 agggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 39224301  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  39224300 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 39224201  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39224200 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 39224123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13635498 - 13635250
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  13635498 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttt 13635399  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13635398 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 13635299  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    || ||||| || |  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13635298 agttagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtcttcctttgaatg 13635250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180206
Alignment:
Q  20 ataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcact-tgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  119 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcac 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |  |    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgc 46180266  T
Q  218 cttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46180265 attccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 46180206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50068462 - 50068222
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  50068462 agggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtgacgaacatgt 50068363  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  50068362 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 50068263  T
Q  201 ttaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  50068262 ttagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 50068222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 18842442 - 18842652
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  18842442 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 18842541  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  18842542 tttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgccagaagatcggga 18842641  T
Q  201 ttaggtaggga 211  Q
    |||||||||||    
T  18842642 ttaggtaggga 18842652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27035521 - 27035247
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||    
T  27035521 agggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagtatgt 27035422  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  27035421 tttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtca 27035322  T
Q  201 ttaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    |||| ||||  || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27035321 ttagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaac 27035247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44337520 - 44337313
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| || |||||||    
T  44337520 ggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 44337421  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  44337420 tgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgccagaagatcgtcatt 44337321  T
Q  203 aggtaggg 210  Q
    || |||||    
T  44337320 agttaggg 44337313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41875087 - 41874810
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  41875087 agggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtgacgagcatgt 41874988  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||   |||||||||||||||||||| |    
T  41874987 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccagaagatcgtta 41874888  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41874887 ttagttagggtaaggtgcattcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 41874810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29762424 - 29762184
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  29762424 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 29762325  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||| | |    
T  29762324 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcatca 29762225  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  29762224 ttagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 29762184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27486880 - 27486653
Alignment:
Q  14 ttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27486880 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 27486781  T
Q  114 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aa 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  27486780 catgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcctgaagatcgtcattagttagggtaa 27486681  T
Q  213 tgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
     |  | ||||||||||||||||||||||    
T  27486680 ggtgcattccaactacaacaattgtctt 27486653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 45689144 - 45689399
Alignment:
Q  23 aacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttcca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45689144 aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcca 45689243  T
Q  123 gtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttc 221  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |  | |||    
T  45689244 gtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccataagatcgtcattagttagggtaaggtgcattc 45689343  T
Q  222 caactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  45689344 caactacaacaattgtcttacctctgaaattggataattcaaacttgccaaacggc 45689399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 29435976 - 29436185
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  29435976 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 29436075  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||| |    
T  29436076 tttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagccagaagatcgtca 29436175  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  29436176 ttagttaggg 29436185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 44597704 - 44597944
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  44597704 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagtatgt 44597803  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| |    
T  44597804 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccggaagatcgtca 44597903  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  44597904 ttagttagggtaaagtgcattccaacttcaacaattgtctt 44597944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 51269805 - 51270045
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  51269805 agggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 51269904  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  51269905 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 51270004  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  51270005 ttagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 51270045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 48215203 - 48215409
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  48215203 ggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatattt 48215302  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  48215303 ttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatagtcatt 48215402  T
Q  203 aggtagg 209  Q
    || ||||    
T  48215403 agttagg 48215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49263191 - 49262914
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| || |||||    
T  49263191 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtgacgagcatgt 49263092  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| ||| | |    
T  49263091 tttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctctagaatatcttca 49262992  T
Q  201 ttaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| || || || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  49262991 ttagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtgattcaaacttgccaaacggc 49262914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16532289 - 16532054
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||| || ||    
T  16532289 tggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgatgagcatattatg 16532190  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    |||||| | |||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16532189 ggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgctagaagatcgtgattag 16532090  T
Q  205 gtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16532089 gtatggaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 16532054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 16081294 - 16081527
Alignment:
Q  7 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttggg 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||    
T  16081294 gaatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgg 16081393  T
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||  | || ||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16081394 agcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggt 16081493  T
Q  207 agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16081494 agggaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 16081527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 49599077 - 49598921
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||    
T  49599077 agggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaacgtgacaagcatgt 49598979  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49598978 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35526380 - 35526095
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  35526380 agggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgagacgaccatgt 35526281  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||            
T  35526280 tttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaa-------- 35526189  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
             |||||||||||  | |||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  35526188 --------tgaatgcaccttatagctacaacaaaggtcttcttttgaatggggtaattcaaactttccaaacggcaggactccaatatttgaccggcatt 35526097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30310029 - 30309762
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30310029 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 30309930  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  30309929 tttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac------gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 30309836  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt--taaatgtggtaattcaagcttgccaaa 271  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| |||| | |   ||||| |||||||||| |||||||||    
T  30309835 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatcttacctccgaaatggggtaattcaaacttgccaaa 30309762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533185
Alignment:
Q  114 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    |      
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaat 40533277  T
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattc 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  40533276 gaatgcaccttccagctacaacaattgttttcctctaactggggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattc 40533185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  44 ggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14772592 - 14772499
Alignment:
Q  144 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 237  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14772592 gttgcagagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaagaattgt 14772499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262409
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgcctgaagattatg 19262418  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  19262417 attaggtag 19262409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707465
Alignment:
Q  124 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttcc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || |  | || |    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcataagttagggcaaggtgcattac 29707522  T
Q  223 aactacaacaattgtcttcct-----ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacgg 274  Q
    |||| |||||||||||||| |     | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29707521 aactgcaacaattgtcttcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 29707465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16098135 - 16098078
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16098135 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 35185540 - 35185609
Alignment:
Q  223 aactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  35185540 aactgcaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 35185609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12790925 - 12790853
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  12790925 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 12790853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 18842670 - 18842734
Alignment:
Q  211 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  18842670 aatgcaccttccaactacaataattgtcttcctttggatgtggtaattcaatcttgttaaacggc 18842734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40532938 - 40532866
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  40532938 tccaactacaacaattgtcttcctctaaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 40532866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 272
Target Start/End: Original strand, 22527688 - 22527782
Alignment:
Q  179 tgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  22527688 tgatttcgccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 22527782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 6436326 - 6436398
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  6436326 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 6436398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14173410 - 14173338
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  14173410 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgcggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 14173338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 266
Target Start/End: Original strand, 18170611 - 18170667
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  18170611 gaatgcaccttccaacaacaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttg 18170667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35586571 - 35586499
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  35586571 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 35586499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50067924 - 50067841
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  50067924 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaaccggcaggactccaacattcga 50067841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Original strand, 18170770 - 18170852
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||| ||  |||||||| |||||||    
T  18170770 gaatgcaccttccaacagcaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaatggaaggactccagcattcga 18170852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24270014 - 24269945
Alignment:
Q  223 aactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  24270014 aactgcaacaattgtcttcttttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 24269945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48568071 - 48567990
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattc 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  || ||||  |||||||||||||    
T  48568071 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcatgactccaacattc 48567990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13973470 - 13973382
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||| |||||||| | ||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13973470 accttccaactacaacaattgttttacctttgaatgtagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcc 13973382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 14173418 - 14173506
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||| ||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  14173418 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgcagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccggcattcc 14173506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 23343194 - 23343266
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||||    
T  23343194 tccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacgacaggaatccaacattcga 23343266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 24270025 - 24270113
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||    
T  24270025 accttccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcc 24270113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Original strand, 27034784 - 27034816
Alignment:
Q  208 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27034784 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 27034816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37778625 - 37778537
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||||    
T  37778625 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgacattcc 37778537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 289
Target Start/End: Original strand, 45689660 - 45689740
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  45689660 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaagactccaacatt 45689740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 49397198 - 49397270
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||  ||| |||| |||||||    
T  49397198 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggtaggaatccagcattcga 49397270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 49926038 - 49926126
Alignment:
Q  213 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |  ||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  49926038 tgcacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacatt 49926126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 29436512 - 29436595
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  29436512 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 29436595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29761814 - 29761735
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  29761814 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcgggactccaacat 29761735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49598916 - 49598817
Alignment:
Q  179 tgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  49598916 tgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatcgggtaattcaaacttgccaaacggc 49598817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 13973481 - 13973547
Alignment:
Q  223 aactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||    
T  13973481 aactacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatt 13973547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 12790683 - 12790764
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  12790683 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacat 12790764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Original strand, 15471636 - 15471721
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||    
T  15471636 agcacaacatgttcccgtggattgatgtgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattctcaagagtttgattatgccagaa 15471721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3659349 - 3659321
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3659349 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 3659321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 289
Target Start/End: Original strand, 22528046 - 22528126
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  || |||| |||||||| ||||    
T  22528046 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcatt 22528126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 39223614 - 39223642
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223614 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 39223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42571428 - 42571356
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||  ||||||| |||  ||| |||||||    
T  42571428 tccaactgcaacaattgtcttcctttgagtggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaaaccagcattcga 42571356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 46924689 - 46924717
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46924689 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 46924717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 48707013 - 48706929
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattc 184  Q
    |||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  48707013 ttttggcagcaccacttgttcccatggatcgatatgtatgttacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaagagtttgattc 48706929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 14115044 - 14115324
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14115044 agggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 14115143  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  14115144 tctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgccagaagatagtga 14115243  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggact 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14115244 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatagggtaattcaaacttgccaagcggcgggact 14115324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32027830 - 32027525
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  32027830 agggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 32027731  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  32027730 tttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 32027631  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32027630 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactccaatgttcgaccgg 32027531  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  32027530 cattcc 32027525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 13402540 - 13402845
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  13402540 agggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 13402639  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  13402640 tttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtca 13402739  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  13402740 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaattttcgaccgg 13402839  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  13402840 cattcc 13402845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32037889 - 32037584
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  32037889 agggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 32037790  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  32037789 tttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 32037690  T
Q  201 ttaggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| ||    ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32037689 ttaggtaaggaataaatgcacattaaagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactccaatgttcgaccgg 32037590  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  32037589 cattcc 32037584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 801173 - 801447
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  801173 agggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaccatgt 801271  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  801272 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 801371  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  801372 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgcgaaacggc 801447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34803098 - 34802795
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34803098 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgt 34802999  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  34802998 tcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccaaaagatcgtca 34802899  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||| | ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  34802898 ttaggtaaggaatgaatgcgctttcgagctacaaaaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggactctaatgttcgaccgg 34802799  T
Q  297 catt 300  Q
    ||||    
T  34802798 catt 34802795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 12396783 - 12397088
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  12396783 agggtggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgt 12396882  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||| |    
T  12396883 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcgtca 12396982  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||     
T  12396983 ttaggtacagaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccga 12397082  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  12397083 cattcc 12397088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058660
Alignment:
Q  6 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  106 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| | |||||||||| |||||     
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagt 35058733  T
Q  206 taggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  35058732 tagggtaaggtacattccaactacaacaattgtcttacctctcaaattgggtaattcaaacttgccaaacggc 35058660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 11692460 - 11692730
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11692460 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttt 11692559  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  11692560 tggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 11692659  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  11692660 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 11692730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 27640189 - 27640459
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27640189 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 27640288  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  27640289 tggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 27640388  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  27640389 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 27640459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 6205493 - 6205763
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6205493 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 6205592  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  6205593 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 6205692  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  6205693 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 6205763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257476
Alignment:
Q  53 cattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgag 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  153 atcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaa 248  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctaaa 30257530  T
Q  249 tgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  30257529 tggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattcc 30257476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 29066560 - 29066769
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29066560 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgt 29066659  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||| |    
T  29066660 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagtagatcgtca 29066759  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  29066760 ttagttaggg 29066769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 29075573 - 29075782
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29075573 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgt 29075672  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||| |    
T  29075673 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtca 29075772  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  29075773 ttagttaggg 29075782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 29108163 - 29108356
Alignment:
Q  17 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  29108163 ggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcat 29108262  T
Q  117 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29108263 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 29108356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 29110546 - 29110754
Alignment:
Q  2 gggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtt 101  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29110546 gggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 29110645  T
Q  102 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||| ||    
T  29110646 ttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcat 29110745  T
Q  202 taggtaggg 210  Q
    ||| |||||    
T  29110746 tagttaggg 29110754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 22305805 - 22305975
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  22305805 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttt 22305904  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22305905 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaa 22305975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465298
Alignment:
Q  123 gtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttcc 222  Q
    |||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggtagagaatacaccttcc 17465316  T
Q  223 aactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17465315 aactacaacaattgtctt 17465298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021134
Alignment:
Q  156 aactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgt 251  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||     
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgg 35021185  T
Q  252 ggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  35021184 ggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcc 35021134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Original strand, 34134801 - 34134897
Alignment:
Q  144 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34134801 gttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtagggaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 34134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 20192466 - 20192562
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20192466 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 20192562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20242188 - 20242092
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242188 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 20242092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22136172 - 22136076
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136172 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 22136076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22143525 - 22143429
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143525 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 22143429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021027
Alignment:
Q  132 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 230  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 24021069  T
Q  231 caattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  24021068 caattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 24021027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765712
Alignment:
Q  124 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat-gattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttc 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||| |||||||||| | ||||| ||||| || |  | |||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattc 3765768  T
Q  222 caactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3765767 caactgcaacaattgtcttacctctcaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 3765712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14482874 - 14482785
Alignment:
Q  151 agatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14482874 agatcaactagacatattgtcaacagtttgattccgctagaagataatgattaggtagggaatgcaccttcccactacaacaattgtctt 14482785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 266
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192670
Alignment:
Q  132 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 230  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 2192634  T
Q  231 caattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2192635 caattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 2192670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 300
Target Start/End: Original strand, 4495123 - 4495213
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||  |||||||| ||||    
T  4495123 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaatctggccaaacggttggactccaatgttcgaccgacatt 4495213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 28051515 - 28051614
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatatta-tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  28051515 acgttgcagagatcaactggagatatttctcaatagtttgattccgctagaagatcgtgattacgtagagaatgcacctttcaactacaaccattttctt 28051614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12397326 - 12397238
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12397326 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 12397238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30257189 - 30257133
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  30257189 gaatgcaccttcaaactacaacaattgtctttctttaaatgaggtaattcaaacttg 30257133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402383
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagataatctcaacagt 2402383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13403365 - 13403278
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13403365 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccagcattc 13403278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14123481 - 14123449
Alignment:
Q  208 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14123481 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 14123449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18744073 - 18743985
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 195  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  18744073 agcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcatgttgctgagatcgtctgaagatattctcgacagtttgattcctccataagat 18743985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 35020896 - 35020984
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35020896 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgacaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 35020984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32027271 - 32027207
Alignment:
Q  228 caacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  32027271 caacaactgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 32027207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32037330 - 32037266
Alignment:
Q  228 caacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  32037330 caacaactgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 32037266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34132168 - 34132140
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132168 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 34132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 101)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 51015294 - 51015599
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51015294 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 51015393  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  51015394 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 51015493  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  51015494 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctttctttgaatggggtaattcgaacttgccaaacggcaggactccaatattcgacccg 51015593  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  51015594 cattcc 51015599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51013480 - 51013174
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  51013480 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 51013381  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  51013380 tttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 51013281  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  51013280 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgg 51013181  T
Q  297 cattcct 303  Q
    |||||||    
T  51013180 cattcct 51013174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 41577923 - 41578220
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  41577923 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 41578022  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |    
T  41578023 tttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatca 41578122  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgacc 294  Q
    ||||||| |    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41578123 ttaggtacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgacc 41578220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8633561 - 8633264
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  8633561 agggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatattt 8633462  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8633461 tttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtca 8633362  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  8633361 ttaggtaccgaatgcacc--ccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccagcattcgatcggcatt 8633264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 46414536 - 46414231
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  46414536 agggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 46414437  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  46414436 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 46414337  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||     
T  46414336 ttaggtacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtagttcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccga 46414237  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  46414236 cattcc 46414231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 2428504 - 2428809
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2428504 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 2428603  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  2428604 tttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtca 2428703  T
Q  201 ttagg----tagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    |||||    ||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  2428704 ttaggtacataatgaatgcacctttcagctacaacaattgtgttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccga 2428803  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  2428804 cattcc 2428809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34472278 - 34471973
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34472278 agggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 34472179  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  34472178 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccagaagatcgtca 34472079  T
Q  201 ttaggtagggaatgca----ccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    |||||||  ||||| |    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||     
T  34472078 ttaggtaccgaatgaatgttccttccagctacaaaaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccga 34471979  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  34471978 cattcc 34471973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 43569927 - 43570232
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  43569927 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 43570026  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||      
T  43570027 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagatcgtct 43570126  T
Q  201 ttaggtagggaa----tgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||| ||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| ||    
T  43570127 ttatgtacggaatgactgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcacgtctccaatattcgactgg 43570226  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  43570227 cattcc 43570232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 30192555 - 30192843
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   | |||||    
T  30192555 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgtctagcatgt 30192654  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  30192655 tttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 30192754  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaa 285  Q
    ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  30192755 ttaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattttcttcctttgaatgaggtatttcaaacttgccaaacggcaggagtccaa 30192843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 55207086 - 55206782
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  55207086 agggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 55206987  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  55206986 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 55206887  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||||    
T  55206886 ttaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaatacaaacttgtcaaacggcaggtctctaatattcgaccgg 55206787  T
Q  297 cattc 301  Q
    |||||    
T  55206786 cattc 55206782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39417150 - 39416873
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39417150 agggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgt 39417051  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| |    
T  39417050 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccagaagatcgtca 39416951  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  39416950 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatgggataattcaaacttgccaaacggc 39416873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 41803919 - 41804224
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  41803919 agggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 41804018  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  41804019 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 41804118  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||     
T  41804119 ttaggtacggaatgaatgcactttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggaaggtctccaatattcgaccga 41804218  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  41804219 cattcc 41804224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 6754221 - 6754488
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  6754221 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgt 6754320  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  6754321 tttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgctagaagatcgtga 6754420  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||| ||||    
T  6754421 ttatgtagggaaatgcaccttccaactacaacaactgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttg 6754488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 7246114 - 7246416
Alignment:
Q  4 gtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtttt 103  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7246114 gtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttt 7246213  T
Q  104 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 203  Q
    ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7246214 gggattataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 7246313  T
Q  204 ggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcat 299  Q
    |||| ||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||    
T  7246314 ggtatggaataaatgcaccttccagctacaacgattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctccaatattcgaccggcat 7246413  T
Q  300 tcc 302  Q
    |||    
T  7246414 tcc 7246416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45100667 - 45100362
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  45100667 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtgacgagcatgt 45100568  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |    
T  45100567 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataatatcgtca 45100468  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||     
T  45100467 ttaggtactgaatgaatgcactttttagctactacaattgtctttctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggaatccaatgttcgaccga 45100368  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  45100367 cattcc 45100362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6464547 - 6464280
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  6464547 agggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacaatcatgt 6464448  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  6464447 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaagaagatcgtga 6464348  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || | ||||| |||||||||| ||||    
T  6464347 ttatatagggaaatgcaccttccaactacaacaactctcttactctgaaatggggtaattcaaacttg 6464280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 7954220 - 7954516
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaagggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatg 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || ||||    
T  7954220 agggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatg 7954319  T
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  7954320 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgctagaagatcgtc 7954419  T
Q  200 attaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7954420 attaggtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaagactccaacattcga 7954516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48087752 - 48087477
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  48087752 ggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 48087653  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  48087652 tgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcatt 48087553  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |  ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48087552 aattagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 48087477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 52569608 - 52569306
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||    
T  52569608 ggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa-gtgacgagcatgttt 52569510  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52569509 tgggagcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgccagaagatcgtcatt 52569410  T
Q  203 aggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggca 298  Q
    ||||    |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  52569409 aggtgcggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgatcggca 52569310  T
Q  299 ttcc 302  Q
    ||||    
T  52569309 ttcc 52569306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33449341 - 33449063
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33449341 agggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 33449242  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  33449241 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccagaagatcgtaa 33449154  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  33449153 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgttttcctctggatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcaaacattcg 33449063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 47065704 - 47065981
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  47065704 agggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtgacgagcatgt 47065803  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| |    
T  47065804 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtca 47065903  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47065904 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacggc 47065981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25576793 - 25576517
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25576793 agggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 25576694  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||| |    
T  25576693 tttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgtcagaagatcgtca 25576595  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||  ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25576594 ttatttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 25576517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 42383068 - 42383345
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42383068 agggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 42383167  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  42383168 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtca 42383267  T
Q  201 ttaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| | ||  || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42383268 ttagttgggacaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 42383345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 44927480 - 44927756
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  44927480 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 44927579  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  44927580 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 44927679  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt--taaatgtggtaattcaagcttgccaaacgg 274  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| ||||||||||||| | |   ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44927680 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctaaaaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 44927756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53826898 - 53826621
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  53826898 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtgatgagcatgt 53826799  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  53826798 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 53826699  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  53826698 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggc 53826621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 42382288 - 42382528
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42382288 agggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 42382387  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  42382388 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtca 42382487  T
Q  201 ttaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| | ||  ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  42382488 ttagttgggacaatgtgcattccaactacaacaattgtctt 42382528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42950222 - 42949947
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  42950222 agggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 42950123  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  42950122 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 42950023  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  42950022 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacg 42949947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 774522 - 774301
Alignment:
Q  19 tataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  774522 tataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggagcactgcatgt 774423  T
Q  119 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  774422 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 774323  T
Q  219 ttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  774322 ttccaactgcaacaattgtctt 774301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34647469 - 34647207
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34647469 agggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 34647370  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  34647369 ttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgctagaagatcgtca 34647270  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattc 259  Q
    ||||||    |  |||||||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34647269 ttaggtaccgaatgaatgcaccttctagctgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattc 34647207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2647076 - 2646817
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  2647076 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 2646977  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2646976 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcatt 2646877  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  2646876 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaa 2646817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3495229 - 3494970
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3495229 ggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 3495130  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  3495129 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatt 3495030  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3495029 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaa 3494970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 37281473 - 37281745
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37281473 tggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttg 37281572  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  37281573 ggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattag 37281672  T
Q  205 gt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||    |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  37281673 gtaccgaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtgttcctatggatgaggtaattcaaacttgtcaaacg 37281745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2268694 - 2268424
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  2268694 ggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgggcatgttt 2268595  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  2268594 tgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 2268495  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  2268494 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 2268424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13896072 - 13895795
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||    
T  13896072 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgacgagcatgt 13895973  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||| |    
T  13895972 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatcgtca 13895873  T
Q  201 ttaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| | ||| || |  | |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13895872 ttagttaaggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggc 13895795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24702473 - 24702197
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24702473 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattac-gaacgacgaaaacgtgacggacatgt 24702375  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |    
T  24702374 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccagaagatcgtca 24702275  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24702274 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 24702197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34693492 - 34693215
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  34693492 agggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 34693393  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  34693392 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgccagaagatcgtca 34693293  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34693292 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 34693215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 14631462 - 14631767
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  14631462 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgt 14631561  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  14631562 tttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtca 14631661  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||  ||| |||||    
T  14631662 ttaggtaccgaatgaatgcaccatccagctacaacaactgtcttcctttgaacggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactccaatgttctaccgg 14631761  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  14631762 cattcc 14631767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49140254 - 49139984
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  49140254 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 49140155  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  49140154 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 49140055  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  49140054 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 49139984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 54390461 - 54390731
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  54390461 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 54390560  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  54390561 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 54390660  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  54390661 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 54390731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19453431 - 19453154
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  19453431 agggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 19453332  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| | |    
T  19453331 tatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcatca 19453232  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19453231 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggc 19453154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4004287 - 4004017
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  4004287 ggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttt 4004188  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  4004187 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatt 4004088  T
Q  203 aggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  4004087 agttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 4004017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 34049746 - 34050016
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  34049746 ggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 34049845  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  34049846 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 34049945  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  34049946 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 34050016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 46403022 - 46403292
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  46403022 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 46403121  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  46403122 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 46403221  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  46403222 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 46403292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44835689 - 44835412
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44835689 agggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 44835590  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  44835589 tttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtca 44835490  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-ccttt-aaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  44835489 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggc 44835412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49218938 - 49218698
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  49218938 agggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtgacgaacatgt 49218839  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  49218838 tttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 49218739  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  49218738 ttagttagggtaaagtgcattccaactgcaacaattgtctt 49218698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 49273416 - 49273721
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  49273416 agggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 49273515  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||||| |    
T  49273516 tctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttccagaatatcgtca 49273615  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||  ||||||||  |||||| |     
T  49273616 ttaggtcctgaatgaacgcaccttccagctaccacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacatgccatatggcatgactccaatgttcgactga 49273715  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  49273716 cattcc 49273721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 36135027 - 36135296
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  36135027 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 36135125  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  36135126 tgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcatt 36135225  T
Q  203 aggtaggg---aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||| |    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  36135226 agttagagtaagatgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 36135296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10053473 - 10053236
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10053473 agggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgt 10053374  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10053373 tttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 10053278  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10053277 ttaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 10053236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323286
Alignment:
Q  27 tccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtgg 126  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  127 atcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttcc 222  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||| |||||||    |  |||||||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttcc 42323366  T
Q  223 aactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||| |  ||||||||  |||||||||||||||    
T  42323365 agctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttggcaaacgacatgactccaatgttcgaccggcattcc 42323286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20376080 - 20375845
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  20376080 tggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgaggagtatgttttg 20375981  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  20375980 agagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaatatcgtgattag 20375881  T
Q  205 gtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20375880 gtagggaatgcaccttccaactacaaaaattgtctt 20375845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47760093 - 47759887
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  47760093 agggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaaacatgt 47759994  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  47759993 tttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 47759894  T
Q  201 ttaggta 207  Q
    |||||||    
T  47759893 ttaggta 47759887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27186965 - 27187178
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27186965 agggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgaacatgt 27187064  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  27187065 tttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgccataatatcgtga 27187164  T
Q  201 ttaggtagggaatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  27187165 ttaggtagggaatg 27187178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 43477074 - 43477314
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43477074 agggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 43477173  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  43477174 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 43477273  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||  ||||| ||||  | |||||||| |||||| ||||||    
T  43477274 ttaattagggtaatgtgcattccaacttcaacaactgtctt 43477314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 49610506 - 49610746
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  49610506 agggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 49610605  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  49610606 tttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 49610705  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  49610706 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 49610746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36721591 - 36721315
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||| || ||       
T  36721591 agggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaatg 36721492  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  36721491 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 36721392  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    || |||    |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||| || ||||||||    
T  36721391 tttggtatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtgttcctctggatgaggtaattcaaactagccaaacg 36721315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346510
Alignment:
Q  83 aaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgat 182  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  183 tccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcggg 278  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcagg 46346533  T
Q  279 actccaacattcgaccggcattc 301  Q
     |||||| |||||||||||||||    
T  46346532 tctccaatattcgaccggcattc 46346510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51695808 - 51695599
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| || |||||    
T  51695808 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtgacgagcatgt 51695709  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| | |    
T  51695708 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcatca 51695609  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  51695608 ttagttaggg 51695599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997677
Alignment:
Q  49 gtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgc 148  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  149 tgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaa 247  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcttttga 50997652  T
Q  248 atgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||    
T  50997653 atggggtaattcaaacttgtcaaac 50997677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 275
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18441037
Alignment:
Q  112 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagaga 18440972  T
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  18440973 atgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaaacggc 18441037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 275
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486111
Alignment:
Q  112 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagaga 19486046  T
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  19486047 atgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaaacggc 19486111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50458893 - 50458652
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |  | ||||||||||||| ||| || |||||    
T  50458893 agggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaacttgacgagcatgt 50458794  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  50458793 tttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcctgaagatcgtca 50458694  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50458693 ttaggtaccgaacgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 50458652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 14265427 - 14265661
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||| || | |||| |||||||||   ||||| ||||||||||    
T  14265427 ggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---cgtgacgaacatgttt 14265523  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||| |||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14265524 tgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgcctgaagatcgtgatt 14265623  T
Q  203 aggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14265624 aggtagggattgcactttccaactacatcaattgtctt 14265661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887571
Alignment:
Q  17 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  117 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg---attaggtagggaat 213  Q
    ||||  ||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgattattaggtagggaat 25887598  T
Q  214 gcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25887597 gcaccttccaactacaacaattgtctt 25887571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 261
Target Start/End: Original strand, 15637155 - 15637269
Alignment:
Q  148 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-tta 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  15637155 ctgagatcaactgaagatattatcaatattttgattttgctggaagatcgtaattcggtagggaattcaccttccaactacaacaattgtcttactctga 15637254  T
Q  247 aatgtggtaattcaa 261  Q
    |||| ||||||||||    
T  15637255 aatgaggtaattcaa 15637269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 15637041 - 15637118
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaac 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  15637041 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 211
Target Start/End: Original strand, 7954774 - 7954866
Alignment:
Q  119 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 211  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7954774 tccagttgatcgatatacgtgtaactttgatgagatcaactaaagattttatcaacagtcttatttcgccagaagatcgtgattaagtaggga 7954866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 55268849 - 55268757
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  55268849 gaatgcaccttttagctataacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccggcattcc 55268757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 300
Target Start/End: Original strand, 27187543 - 27187633
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  27187543 gaatgcacattgcaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcgcccgacatt 27187633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36720998 - 36720916
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  36720998 gaattcacctttcaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaacattcga 36720916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34646877 - 34646794
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaat-gtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  34646877 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 34646794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Original strand, 37282062 - 37282140
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||    
T  37282062 gaatgcaccttccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcatgactccaacat 37282140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7246654 - 7246566
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7246654 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcgaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 7246566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Original strand, 7954865 - 7954909
Alignment:
Q  193 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7954865 gatcgtgatcaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 7954909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41578465 - 41578379
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||    
T  41578465 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcggcatt 41578379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 11378946 - 11378906
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 41  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378946 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45100126 - 45100054
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  45100126 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 45100054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 46413972 - 46413900
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  46413972 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 46413900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 288
Target Start/End: Original strand, 51015845 - 51015913
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  51015845 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaacat 51015913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 300
Target Start/End: Original strand, 8633023 - 8633110
Alignment:
Q  215 caccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  8633023 caccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacattcgatcggcatt 8633110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2429047 - 2428959
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||  || |||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2429047 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcc 2428959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17267398 - 17267306
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 192  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||   || |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  17267398 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatgtaagttacgttgctgagattgcctaaagatattctcaagagtttgattctgccagaa 17267306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42323041 - 42322969
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| || | |||||||    
T  42323041 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatctagcattcga 42322969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 49273971 - 49274043
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || || | ||| ||||||||||||    
T  49273971 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaatcgacaggaatccaacattcga 49274043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34692955 - 34692872
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  34692955 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccaacattcga 34692872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 42383605 - 42383688
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  42383605 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccaacattcga 42383688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 275
Target Start/End: Original strand, 43570478 - 43570533
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  43570478 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggc 43570533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44835152 - 44835069
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||| || |  || | || ||||||||||||||||    
T  44835152 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaactcgttaatccgcaggactccaacattcga 44835069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 47066240 - 47066323
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  47066240 ggaatgcacattccgactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 47066323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49273963 - 49273876
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattc 301  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||||    
T  49273963 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattc 49273876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10053037 - 10052967
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  10053037 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattc 10052967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 14632020 - 14632085
Alignment:
Q  227 acaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||  ||| |||| |||||||    
T  14632020 acaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggaaggaatccagcattcga 14632085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 46346782 - 46346745
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcga 38  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46346782 agggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 773986 - 774026
Alignment:
Q  200 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  773986 attaggtacggaatgcaccttcaaactacaacaattttctt 774026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 13895532 - 13895604
Alignment:
Q  219 ttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||    
T  13895532 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaggactcaaacatt 13895604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27187881 - 27187849
Alignment:
Q  208 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27187881 gggaatgtaccttccaactacaacaattgtctt 27187849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34471719 - 34471655
Alignment:
Q  228 caacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  34471719 caacaattgtcttcctttgaatggggtgattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 34471655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41804462 - 41804374
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41804462 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcc 41804374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 42949656 - 42949684
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949656 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42949684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 44834902 - 44834930
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44834902 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 44834930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47066490 - 47066462
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066490 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 47066462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 52569068 - 52569156
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||  |||||||||    
T  52569068 acctcccaactacaacaattgtcttacctgtgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgttcggcattcc 52569156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 22436914 - 22437219
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  22436914 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgt 22437013  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  22437014 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtca 22437113  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22437114 ttaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttccttcaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgg 22437213  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  22437214 cattcc 22437219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43889703 - 43889398
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43889703 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 43889604  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  43889603 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 43889504  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||| ||     
T  43889503 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggactccaatgttcgaacga 43889404  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  43889403 cattcc 43889398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 957659 - 957354
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  957659 agggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 957560  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  957559 tttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 957460  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  957459 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattgaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgg 957360  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  957359 cattcc 957354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34153490 - 34153185
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34153490 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgt 34153391  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  34153390 tttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtca 34153291  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||| ||| |    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||     
T  34153290 ttatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctccaatattcgaccga 34153191  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  34153190 cattcc 34153185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49792140 - 49791835
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  49792140 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 49792041  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||| | |    
T  49792040 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcatca 49791941  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  49791940 ttaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccgg 49791841  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  49791840 cattcc 49791835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21169454 - 21169759
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||| ||| || || |||||    
T  21169454 agggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcgacgagcatgt 21169553  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  21169554 tttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtca 21169653  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21169654 ttaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatattcgaccgg 21169753  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  21169754 cattcc 21169759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Original strand, 2773014 - 2773317
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2773014 ggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttt 2773113  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||| ||     
T  2773114 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatc 2773213  T
Q  203 aggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggca 298  Q
    ||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  2773214 aggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcagttctccaatattcgaccggca 2773313  T
Q  299 ttcc 302  Q
    ||||    
T  2773314 ttcc 2773317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49817848 - 49817561
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||    
T  49817848 agggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgttacgagcatgt 49817749  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49817748 tttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtca 49817649  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactcca 284  Q
    ||||||| |    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  49817648 ttaggtacggaatgaatgtacctttcaactacaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgccaaacagcaggactcca 49817561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33163748 - 33163471
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  33163748 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 33163649  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  33163648 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 33163549  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  33163548 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttgcctcttaaatggggtatttcaaacttgccaaacggc 33163471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6282527 - 6282231
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  6282527 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 6282428  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  6282427 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtca 6282328  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgac 293  Q
    |||| || |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  6282327 ttagttacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaagcttgccaaacggcaggtcttcaatattcgac 6282231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 17211269 - 17211536
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| || || |||| ||||||  ||||||||| || |||||    
T  17211269 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtgacgagcatgt 17211368  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17211369 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtga 17211468  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||    
T  17211469 ttaggtagggaaatgcatcttccaactacaacaattgtcttactctgaaatgaggtaattcaaacttg 17211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 18412598 - 18412873
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18412598 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtgaggagcatgt 18412697  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  18412698 tttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgccagaagatcgtga 18412797  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  18412798 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacggc 18412873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 47657558 - 47657254
Alignment:
Q  2 gggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| || ||| ||    
T  47657558 gggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtgacgagcatatt 47657459  T
Q  102 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  47657458 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcat 47657359  T
Q  202 taggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggc 297  Q
    |||||    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  47657358 taggtatcgaatgaatgcacattccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccaatgttcgaccgac 47657259  T
Q  298 attcc 302  Q
    |||||    
T  47657258 attcc 47657254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 3393307 - 3393543
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  3393307 agggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgt 3393406  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  3393407 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatga 3393506  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3393507 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacatttgt 3393543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34530000 - 34529695
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || ||| |    
T  34530000 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcattt 34529901  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  34529900 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 34529801  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| | |    
T  34529800 ttaggtacggaatgaatgcacattaaagctacaacaattgtattcctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactccaatattcgaacag 34529701  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  34529700 cattcc 34529695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21017379 - 21017109
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21017379 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 21017280  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21017279 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 21017180  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  21017179 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 21017109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31824833 - 31824556
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31824833 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 31824734  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  31824733 tttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtca 31824634  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcc--tttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| |  || ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  31824633 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacatttgaaatagggtaatttaaacttgccaaacggc 31824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 11288298 - 11288562
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11288298 agggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 11288397  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11288398 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatc-acaatttgattctgttagaagatcgtga 11288496  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11288497 ttaagtagggaatgcaccttccaactaccataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 11288562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24606755 - 24607028
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24606755 agggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 24606854  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24606855 attgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtga 24606954  T
Q  201 ttaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  24606955 ttaggtaggtaaatgtacattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactttccaaacg 24607028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1226162 - 1226437
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  1226162 agggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 1226261  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  1226262 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 1226361  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt--taaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1226362 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcataaatggggtaattcaaacttgccaaacg 1226437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4785626 - 4785321
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4785626 agggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgaagaacatgt 4785527  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  4785526 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccacaagatcgtca 4785427  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||     
T  4785426 ttaggtaccgaatgaatgcatctttcagctacaacaattgtgttcctctagatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccagcatacgtccga 4785327  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  4785326 cattcc 4785321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40353975 - 40353716
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  40353975 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 40353876  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  40353875 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcatt 40353776  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40353775 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaa 40353716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 25762601 - 25762878
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25762601 agggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 25762700  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  25762701 tttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 25762800  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  25762801 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggc 25762878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51428396 - 51428119
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  51428396 agggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 51428297  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  51428296 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcaagaagatcgtca 51428197  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  51428196 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttggcaaacggc 51428119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44560384 - 44560079
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  44560384 agggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgt 44560285  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||  |||||||| |    
T  44560284 tttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctccttaagatcgtca 44560185  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  44560184 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccga 44560085  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  44560084 cattcc 44560079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 55796748 - 55797018
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  55796748 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 55796847  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  55796848 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 55796947  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||    
T  55796948 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggctaattcaaacttgtcaaac 55797018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20779073 - 20778800
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20779073 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 20778974  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  20778973 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtca 20778874  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtgg-taattcaagcttgccaaac 272  Q
    |||||||||| || |  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  20778873 ttaggtagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtcttcctttgaatgaggcaaattcaaacttgccaaac 20778800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32938106 - 32937833
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  32938106 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 32938007  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  32938006 ttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtca 32937907  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  32937906 ttagatagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacg 32937833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14330898 - 14330658
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14330898 agggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 14330799  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  14330798 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 14330699  T
Q  201 ttaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| | ||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  14330698 ttagttaaggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 14330658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36776723 - 36776418
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  36776723 agggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgg 36776624  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   |||||||| |    
T  36776623 tttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctgaaagatcgtca 36776524  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||     
T  36776523 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccga 36776424  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  36776423 cattcc 36776418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51027968 - 51027694
Alignment:
Q  4 gtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtttt 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51027968 gtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttt 51027869  T
Q  104 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  51027868 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccataagatcgtcatta 51027769  T
Q  204 ggtagggaa---tgcaccttccaactacaacaattgtc-ttcct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    | ||||| |   |||||  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51027768 gttagggtaaggtgcac--tccaactacaacaattgtcgtacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaagcggc 51027694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 49063985 - 49064259
Alignment:
Q  4 gtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtttt 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49063985 gtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttt 49064084  T
Q  104 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 203  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49064085 tggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 49064184  T
Q  204 ggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    | ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49064185 gttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 49064259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 242620 - 242344
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  242620 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtgacgagcatgt 242521  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  242520 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 242421  T
Q  201 ttaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacgg 274  Q
    |||| | | | || |  | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  242420 ttagttaaagtaaggtgcattccaactataacaattgtcttacctctgaaatagggtaattcaaacttgccaaacgg 242344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 10312278 - 10312514
Alignment:
Q  4 gtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtttt 103  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10312278 gtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttt 10312377  T
Q  104 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||    
T  10312378 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctggaagatcgtgatta 10312477  T
Q  204 ggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10312478 ggtagggaattcaccttccaactacaacaattgtctt 10312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26591889 - 26591678
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |    
T  26591889 agggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacatat 26591790  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  26591789 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 26591690  T
Q  201 ttaggtagggaa 212  Q
    ||||||| ||||    
T  26591689 ttaggtacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41794764 - 41794494
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41794764 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 41794665  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  41794664 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 41794565  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  41794564 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 41794494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46816727 - 46816452
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  46816727 agggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtgacgagcatgt 46816628  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |    
T  46816627 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgccagaagatcgtca 46816530  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46816529 ttagttagggcaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgagatggggtaattcaaacttgccaaacggc 46816452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711810
Alignment:
Q  17 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 116  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  117 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |     
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggt 21711748  T
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
     | ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21711749 gcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 21711810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 1042769 - 1042992
Alignment:
Q  18 gtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatg 117  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1042769 gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatg 1042868  T
Q  118 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |    
T  1042869 ttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggta 1042968  T
Q  217 ccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  1042969 cattccaactgcaacaattgtctt 1042992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6177517 - 6177247
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6177517 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 6177418  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  6177417 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 6177318  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  6177317 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 6177247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 56138915 - 56139185
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  56138915 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 56139014  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  56139015 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 56139114  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  56139115 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 56139185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 275
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759607
Alignment:
Q  45 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  145 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | || ||||||||||||||||||| ||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattgtcttacc 27759573  T
Q  243 t-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27759574 tctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 27759607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49423962 - 49423656
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  49423962 agggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 49423863  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| |||||||| |    
T  49423862 tctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccataagatcgtca 49423763  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccg 295  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||  ||||||||    
T  49423762 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttacctttgaatggggtaattcaaatttgtcaaacggcaggactccaatcttcgaccg 49423663  T
Q  296 gcattcc 302  Q
     ||||||    
T  49423662 acattcc 49423656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 49094750 - 49095020
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  49094750 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaccatgttt 49094849  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  49094850 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 49094949  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  49094950 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 49095020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 13850752 - 13850991
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||| || | ||||  ||||||||  |||||| ||||||||    
T  13850752 agggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgt 13850851  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13850852 tttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtga 13850951  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13850952 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattatctt 13850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 42886266 - 42886556
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagta---tcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaaca 97  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| || ||    
T  42886266 agggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaacatgacgagca 42886365  T
Q  98 tgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcg 197  Q
    || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42886366 tgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatca 42886465  T
Q  198 tgattaggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactcca 284  Q
    | ||||||||  |    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||    
T  42886466 tcattaggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgtattcctctggatggggtaatttaaacttaccaaacggcaggactcca 42886556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 31324181 - 31324451
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||| || ||||||||     
T  31324181 tggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtgacgagcatgttttt 31324280  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  31324281 ggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctagaagatcatgattag 31324380  T
Q  205 gtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-ccttt-aaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  31324381 gtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatgagataattcaaacttgctaaacg 31324451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 37866409 - 37866687
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||    
T  37866409 agggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgatgagcatgt 37866508  T
Q  101 ttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||| ||||||||||     
T  37866509 tttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccgctagaagatcgtc 37866608  T
Q  200 attaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||| ||||| || |  | |||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37866609 attagttagggtaaggtgcattccaactgcaacagtcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 37866687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 13866266 - 13866503
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| | |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||  |||||| ||||||||    
T  13866266 agggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgt 13866365  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13866366 tttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtga 13866465  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13866466 ttaggtagggaatgcacctttcaactacaacaattgtc 13866503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20901872 - 20901595
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20901872 agggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 20901773  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| || ||||||||| |    
T  20901772 tttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctgaagatcgtca 20901673  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  20901672 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaactttccaaacggc 20901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 28082243 - 28082491
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  28082243 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttt 28082342  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||    
T  28082343 tgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcatt 28082442  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28082443 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 28082491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 45939528 - 45939804
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| || |||||    
T  45939528 agggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtgacgagcatgt 45939627  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  ||| |||||||| |    
T  45939628 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccataagatcgtca 45939727  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaac-aattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45939728 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaactaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 45939804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39588932 - 39589172
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || |||||    
T  39588932 agggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 39589031  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| |    
T  39589032 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctagaagatcgtca 39589131  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| | ||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  39589132 ttagttggggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 39589172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9489682 - 9489921
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || |||||    
T  9489682 agggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 9489781  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  9489782 tttgg-agcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 9489880  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  9489881 ttagttagggtaaagtgcattccaactgcaacaattgtctt 9489921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817162
Alignment:
Q  119 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 49817184  T
Q  219 ttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  49817183 ttccaactacaataattgtctt 49817162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 237
Target Start/End: Original strand, 17292106 - 17292201
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17292106 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattatgtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 17292201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23124630 - 23124490
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||   | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  23124630 ttttggtagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtg 23124531  T
Q  200 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23124530 attaggtagggaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 23124490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20759240 - 20759132
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||   || |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||    
T  20759240 ttttggcagcataacatgttcgcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgatatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatg 20759141  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  20759140 attaggtag 20759132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20765631 - 20765523
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||   || |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||    
T  20765631 ttttggcagcataacatgttcgcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgatatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatg 20765532  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  20765531 attaggtag 20765523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 26591576 - 26591664
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26591576 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 26591664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 266
Target Start/End: Original strand, 49064575 - 49064631
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  49064575 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 49064631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21412729 - 21412647
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 83  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||| | |||| |||| |||| |||||||||    
T  21412729 agggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14330305 - 14330224
Alignment:
Q  211 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||   ||||||| |||||||    
T  14330305 aatgcaccttccaactgtaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggtaagactccagcattcga 14330224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22437457 - 22437369
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22437457 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 22437369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36776172 - 36776100
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  36776172 tccaactgaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 36776100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 49423418 - 49423506
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||    
T  49423418 accttcaaactacaacaattgtgttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaaacggcacgactccaatgttcgaccgacattcc 49423506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 24607276 - 24607359
Alignment:
Q  217 ccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||  ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24607276 ccttccaactacaacaattgtcctcctctggatggagtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaacattcgtccgacatt 24607359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Original strand, 20901120 - 20901199
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtgg-taattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  20901120 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacat 20901199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49791589 - 49791534
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  49791589 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggc 49791534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 56139449 - 56139532
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  56139449 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 56139532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44559939 - 44559893
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  44559939 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 44559893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49423410 - 49423364
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  49423410 tccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 49423364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 957108 - 957039
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||    
T  957108 tccaactgcaacaattgtcatcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatt 957039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51427845 - 51427804
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51427845 tccaactgcaacaattgtcttccttttaatggggtaattcaa 51427804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1226926 - 1226898
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226926 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 1226898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21169997 - 21169909
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||| || ||| |||| | || ||||||||| || |||||||||||||    
T  21169997 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaatttaaactttccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcc 21169909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 34529457 - 34529545
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||| || ||||||    
T  34529457 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcgacattcc 34529545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 42886833 - 42886905
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||| |||   |||||||  |||||||||||||||    
T  42886833 tccaactgcaacggttgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttattaaacggcatgactccaacattcga 42886905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49571655 - 49571567
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | ||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  49571655 acctcccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcc 49571567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 49791597 - 49791685
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | ||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  49791597 acctcccaactacaacaattggcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgatcggcattcc 49791685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41857175 - 41856870
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||| |    
T  41857175 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatat 41857076  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  41857075 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 41856976  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  41856975 ttaggtacgaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccga 41856876  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  41856875 cattcc 41856870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33799752 - 33799475
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33799752 agggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 33799653  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  33799652 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 33799553  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33799552 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 33799475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44943272 - 44942989
Alignment:
Q  11 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagca 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44943272 acgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 44943173  T
Q  111 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  44943172 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattaggtacgg 44943073  T
Q  211 a----atgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattc 290  Q
    |    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||    
T  44943072 aatgtatgcaccttccagctacaacaattgtcttcgtttgaatgagataattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattc 44942989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18440496 - 18440192
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  18440496 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgt 18440397  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  18440396 tttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcgagaagatcgtca 18440297  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| || |||||| |||||||||     
T  18440296 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaattttccaaacggcaggtctccaatattcgaccga 18440197  T
Q  297 cattc 301  Q
    |||||    
T  18440196 cattc 18440192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15032523 - 15032253
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15032523 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 15032424  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15032423 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 15032324  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  15032323 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 15032253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43638878 - 43638605
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  43638878 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 43638779  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||| |    
T  43638778 tttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtca 43638679  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaa 271  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  43638678 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaataattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaa 43638605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28706343 - 28706066
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  28706343 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgt 28706244  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  28706243 tttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgccagaagattgtca 28706144  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct--ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28706143 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacttgtgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 28706066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42169161 - 42168884
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  42169161 agggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgt 42169062  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  42169061 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 42168962  T
Q  201 ttaggtagg---gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-ccttt-aaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||     |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42168961 ttagttaggataagatgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 42168884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 42603467 - 42603769
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  42603467 agggcggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 42603566  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  42603567 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtca 42603666  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||   | || |||||| ||||||||||    
T  42603667 ttaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaa---caggtctccaatattcgaccgg 42603763  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  42603764 cattcc 42603769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 34614966 - 34615241
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34614966 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 34615065  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||| || |    
T  34615066 tttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatagtaa 34615165  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  34615166 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaacttgacaaacg 34615241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 43693150 - 43693427
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43693150 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 43693249  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  43693250 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtca 43693349  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43693350 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattttcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 43693427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19242363 - 19242058
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  19242363 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgt 19242264  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  | ||||||| || |    
T  19242263 tttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgagaagattgtca 19242164  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||     
T  19242163 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactccaatgttcgaccga 19242064  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  19242063 cattcc 19242058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19315547 - 19315242
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  19315547 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgt 19315448  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  | ||||||| || |    
T  19315447 tttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgagaagattgtca 19315348  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||     
T  19315347 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactccaatgttcgaccga 19315248  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  19315247 cattcc 19315242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3589467 - 3589228
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |  |||||    
T  3589467 agggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgtgatgggcatgt 3589368  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3589367 tttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtga 3589268  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3589267 ttaggtagggaatgcaccttcaaactacaacaattgtctt 3589228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 40702376 - 40702679
Alignment:
Q  4 gtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtttt 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40702376 gtggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttt 40702475  T
Q  104 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatc-gtgatt 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||    
T  40702476 gggaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcggtcatt 40702575  T
Q  203 aggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggca 298  Q
    ||||| |    |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  40702576 aggtacggaatgaatgcacattttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgaca 40702675  T
Q  299 ttcc 302  Q
    ||||    
T  40702676 ttcc 40702679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 41363669 - 41363958
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  41363669 agggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 41363768  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  41363769 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtca 41363868  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtgg-taattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| || |  ||| ||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  41363869 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctttctctggatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacat 41363958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38034126 - 38033886
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  38034126 agggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 38034027  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||| |    
T  38034026 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccggaagatcgtca 38033927  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  38033926 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 38033886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 40415270 - 40415547
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40415270 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 40415369  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  40415370 tttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtca 40415469  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | || |||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40415470 ttagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattctcttacctatgaaatggggtaattcaaacttaccaaacggc 40415547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31172017 - 31171778
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  || |||  ||||| |    
T  31172017 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatgacaaacattt 31171918  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||  | |||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31171917 ttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtga 31171818  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31171817 ttaggtatggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 31171778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 26452338 - 26452547
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  26452338 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 26452437  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| |    
T  26452438 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctagaagatcgtca 26452537  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  26452538 ttagttaggg 26452547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 485457 - 485187
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  485457 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 485358  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  485357 tgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 485258  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  485257 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 485187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 40414625 - 40414826
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40414625 ggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 40414724  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  40414725 tgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcatt 40414824  T
Q  203 ag 204  Q
    ||    
T  40414825 ag 40414826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 41275407 - 41275616
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  41275407 agggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 41275506  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  41275507 tttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 41275606  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  41275607 ttagttaggg 41275616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2416928 - 2417168
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2416928 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 2417027  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  2417028 tttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtca 2417127  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  2417128 ttagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 2417168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 26484590 - 26484757
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26484590 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 26484689  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484690 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatatt 26484757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24861356 - 24861565
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || |||||    
T  24861356 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 24861455  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  24861456 tttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcgtca 24861555  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  24861556 ttagttaggg 24861565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16575705 - 16575966
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| || || |||||    
T  16575705 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgggatgagcatgt 16575804  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||            || |   ||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16575805 tttgggaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttgttga------------atttcgccagaagtttgattccgccagaagttcgtga 16575892  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  16575893 ttaggcagggaaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcatacttgccaaacg 16575966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22548276 - 22548380
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| || |||||    
T  22548276 agggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 22548375  T
Q  101 tttgg 105  Q
    |||||    
T  22548376 tttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 302
Target Start/End: Original strand, 26486847 - 26486991
Alignment:
Q  162 agatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaat 257  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    || ||   | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26486847 agatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcatctcttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaat 26486946  T
Q  258 tcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||    
T  26486947 tcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggtattcc 26486991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 291
Target Start/End: Original strand, 16576214 - 16576288
Alignment:
Q  217 ccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  16576214 ccttccaactacaacaattgtcttcctctggatggggtaatccaaacttgctaaacggcaggactcaaacattcg 16576288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Original strand, 22549236 - 22549301
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22549236 acgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 22549301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22549631 - 22549559
Alignment:
Q  219 ttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  22549631 ttccaactgcaacaattgtcttacctttaaatggggtcaattcaaacttgccaaacagcaggactcaaacatt 22549559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28167394 - 28167306
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  28167394 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccagcattcc 28167306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 2417522 - 2417601
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||  |||||||  || ||||||||    
T  2417522 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaacggcatgaatccaacat 2417601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28705800 - 28705721
Alignment:
Q  214 gcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgac 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  28705800 gcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtaaatcggcaggactccaacattcgac 28705721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33799415 - 33799332
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  33799415 ggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 33799332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 301
Target Start/End: Original strand, 18439954 - 18440040
Alignment:
Q  217 ccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||| |||||||| | || |||||| || ||||||||| |||||    
T  18439954 ccttccaactacaacaattgtcttatctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactctaatattcgaccgacattc 18440040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16576219 - 16576154
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaac 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  16576219 ggaaggcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaac 16576154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 28705555 - 28705583
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28705555 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 28705583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 33776051 - 33776079
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776051 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 33776079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40416056 - 40416028
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40416056 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 40416028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 41856630 - 41856718
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| |||| | || |||||| || |||| |||||||||||    
T  41856630 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaagcagcaggactctaatattcaaccggcattcc 41856718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 43637179 - 43637207
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637179 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 43637207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1400507 - 1400202
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  1400507 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgt 1400408  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  1400407 tttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 1400308  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||   || ||| || |||||||||     
T  1400307 ttaggtacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttccttttaatggggtaattcaaacttgccaaacgataggtctctaatattcgaccga 1400208  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  1400207 cattcc 1400202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4724276 - 4723975
Alignment:
Q  4 gtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgtttt 103  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  4724276 gtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgtttt 4724177  T
Q  104 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4724176 gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 4724077  T
Q  204 ggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcat 299  Q
    |||    |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  4724076 ggtaccaaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatattcgaccgacat 4723977  T
Q  300 tc 301  Q
    ||    
T  4723976 tc 4723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18308262 - 18308566
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  18308262 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgt 18308361  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||| |  |    
T  18308362 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagtagattgaca 18308461  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||     
T  18308462 ttaggtatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccga 18308561  T
Q  297 cattc 301  Q
    |||||    
T  18308562 cattc 18308566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7432 - 7173
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7432 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 7333  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7332 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 7233  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7232 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaa 7173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 33370656 - 33370866
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  33370656 agggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 33370755  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  33370756 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatga 33370855  T
Q  201 ttaggtaggga 211  Q
    |||||||||||    
T  33370856 ttaggtaggga 33370866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 35565274 - 35565578
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||||    
T  35565274 agggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-cgtgacgagcatgt 35565372  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  35565373 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgccagaagatcgtca 35565472  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||  |||||||||    
T  35565473 ttaggtgcggaatgaatgcacctttcagctacaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgacttcaatgttcgaccgg 35565572  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  35565573 cattcc 35565578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8576344 - 8576074
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||    
T  8576344 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgaccatgttt 8576245  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  8576244 tgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcatt 8576145  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  8576144 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 8576074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 8537958 - 8538206
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  8537958 ggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttt 8538057  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8538058 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 8538157  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8538158 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 8538206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 1971367 - 1971640
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  1971367 agggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 1971466  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| | |    
T  1971467 tttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaaaatcatca 1971566  T
Q  201 ttaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaa 271  Q
    |||| || || || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  1971567 ttagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttgcctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaa 1971640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 40009530 - 40009739
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40009530 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 40009629  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| | |||||||||| |    
T  40009630 tttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccacaagaagatcgtca 40009729  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  40009730 ttagttaggg 40009739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 11346713 - 11346961
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11346713 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 11346812  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11346813 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 11346912  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11346913 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 11346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19036877 - 19036607
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  19036877 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 19036778  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19036777 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 19036678  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  19036677 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 19036607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 28880995 - 28881265
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  28880995 ggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 28881094  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  28881095 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 28881194  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  28881195 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctttctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 28881265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 19400367 - 19400640
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||    
T  19400367 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttt 19400466  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| |||    
T  19400467 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaatatcgtcatt 19400566  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19400567 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaatttgccaaacg 19400640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 30709602 - 30709850
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  30709602 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttt 30709701  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  30709702 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcatt 30709801  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30709802 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 30709850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27661580 - 27661310
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27661580 ggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 27661481  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  27661480 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcatt 27661381  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  27661380 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 27661310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 541840 - 541600
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||    
T  541840 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgggacgagcatgt 541741  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||||||| |    
T  541740 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtca 541641  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  541640 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 541600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Original strand, 3601356 - 3601616
Alignment:
Q  14 ttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  3601356 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaagagcacaa 3601455  T
Q  114 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag-ggaa 212  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  3601456 catgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattagttagagtaa 3601555  T
Q  213 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaa 271  Q
     |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  3601556 ggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaa 3601616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 38854162 - 38854409
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  38854162 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttt 38854261  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  38854262 tgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagaccgtcatt 38854361  T
Q  203 aggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    || |||| || |  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38854362 agttaggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtcttcctttgaatg 38854409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 11027781 - 11028019
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  11027781 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttt 11027880  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11027881 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 11027980  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    || ||||| || |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  11027981 agttagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt 11028019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36350510 - 36350279
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  36350510 agggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatg- 36350412  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
            |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |    
T  36350411 --------cacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtca 36350320  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 237  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36350319 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 36350279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6793587 - 6793351
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||| || ||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  6793587 tggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttg 6793488  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  6793487 ggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagccagaagatcgtcattag 6793388  T
Q  205 gt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 237  Q
    ||    |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6793387 gtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 6793351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17366940 - 17366738
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  17366940 agggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacaaacatgt 17366842  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  17366841 tttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccagaatatcgtga 17366742  T
Q  201 ttag 204  Q
    ||||    
T  17366741 ttag 17366738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35927642 - 35927470
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35927642 agggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 35927543  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 173  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35927542 tttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 302
Target Start/End: Original strand, 1694860 - 1695096
Alignment:
Q  70 ttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatta 169  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1694860 ttaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatca 1694959  T
Q  170 tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagctt 265  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||    
T  1694960 tcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaactt 1695059  T
Q  266 gccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
     |||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||    
T  1695060 tccaaacggcatgacaccaatgttcgatcggcattcc 1695096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 3169606 - 3169766
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |    
T  3169606 agggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatat 3169704  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaa 162  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3169705 tttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Original strand, 18920835 - 18920975
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18920835 ttttggcagcacaacatggttccgatgatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 18920934  T
Q  200 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18920935 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 18920975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 2599221 - 2599396
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| |||   || |||||| |||||    
T  2599221 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatgaagagcatgt 2599320  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 176  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  2599321 tttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatattctcaacag 2599396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195325
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 17195325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 3458838 - 3458941
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  3458838 agggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagtatgt 3458937  T
Q  101 tttg 104  Q
    ||||    
T  3458938 tttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360549
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtt-gctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  199 gattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25360590 gattaggtagagaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 25360549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 274
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082499
Alignment:
Q  114 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta-gggaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  213 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacgg 274  Q
     |  | ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  7082436 ggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaaaggggtaattcaaacttgccaaacgg 7082499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36312009 - 36311911
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36312009 acgttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 36311911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13131142 - 13131044
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131142 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagctagagaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 13131044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 211
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742884
Alignment:
Q  145 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 12742884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 1693383 - 1693455
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaa 73  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1693383 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaa 1693455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Original strand, 7082815 - 7082897
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  7082815 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaacgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccagcattcga 7082897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 211
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805702
Alignment:
Q  145 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggtaggga 12805702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459067
Alignment:
Q  149 tgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-tt 245  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| |     
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctg 3459039  T
Q  246 aaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3459040 aaatgaggtaattcaaacttgccaaacg 3459067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Original strand, 1171730 - 1171812
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| | |||||| |||||||    
T  1171730 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagaactccagcattcga 1171812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 291
Target Start/End: Original strand, 33371168 - 33371250
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcg 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  33371168 ggaatgcacctttcaactacaacaattgtcttcctttaaattaggtaattcaaacttgttaaacggcacgactcaaacattcg 33371250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22283845
Alignment:
Q  132 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 230  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||  || |  | ||||||||||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccaccataaaatcgtccttagttaggataaggtgcattccaactacaa 22283803  T
Q  231 caattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  22283804 caattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 22283845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Original strand, 2599426 - 2599486
Alignment:
Q  170 tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaa 230  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2599426 tcaacagtttgattccgtcagaagatcgtgattaggtagagaatgcacctttcaactacaa 2599486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 19748169 - 19748276
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||  ||    
T  19748169 ttttggcagcacaacatgtttccgtggatcgatatgtttgta-cgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccgccataagattatg 19748267  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  19748268 attaggtag 19748276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 12742717 - 12742820
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||  |  ||||||||    
T  12742717 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacaggtggaacatgt 12742816  T
Q  101 tttg 104  Q
    ||||    
T  12742817 tttg 12742820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 240
Target Start/End: Original strand, 12742883 - 12742930
Alignment:
Q  193 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742883 gatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 12742930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 12805535 - 12805638
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||| |  ||||||||    
T  12805535 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacgggtggaacatgt 12805634  T
Q  101 tttg 104  Q
    ||||    
T  12805635 tttg 12805638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17366732 - 17366679
Alignment:
Q  193 gatcgtgattaggtagggaa-tgcaccttccaactacaacaattgtcttccttt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17366732 gatcgtgattaggtagggaaatgcaccttccaactataacaattgtcttccttt 17366679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4723728 - 4723656
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  4723728 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 4723656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15798186 - 15798078
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||   || |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  15798186 ttttggcagcacaacatgtttccgtggattgatatgtttgtcacgttgatgagattgcctgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagattatg 15798087  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  15798086 attaggtag 15798078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 25498635 - 25498707
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  25498635 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 25498707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 35565824 - 35565896
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  35565824 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 35565896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 240
Target Start/End: Original strand, 12805701 - 12805748
Alignment:
Q  193 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12805701 gatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactgcaacaattgtctt 12805748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 10397987 - 10398061
Alignment:
Q  193 gatcgtgattaggtagggaa-tgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  10397987 gatcgtgattaggtagtgaaatgcaccttccaactacacaaattgtcttcctttggatggggtaattcaaacttg 10398061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 7082294 - 7082335
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 42  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082294 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 40012156 - 40012239
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  40012156 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccaacattcga 40012239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6793130 - 6793058
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||    
T  6793130 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgagataattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcga 6793058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23228776 - 23228668
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||   || |||||| ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||  ||    
T  23228776 ttttggcagcaccgcatgttcccgtgaatcgatatgtttgtcacgttgttgagatcacttgaagatattctgaacagtttgattccgctagaaaattatg 23228677  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  23228676 attaggtag 23228668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6898 - 6815
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||| || ||||||| ||||  || |||| |||||||| |||||||    
T  6898 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcattcga 6815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 8538491 - 8538574
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  8538491 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 8538574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34683577 - 34683510
Alignment:
Q  222 caactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacatt 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| | | |||||||||    
T  34683577 caactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagaaatccaacatt 34683510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Original strand, 3459331 - 3459413
Alignment:
Q  210 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || || | ||||||||||||||||    
T  3459331 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgacaggactccaacattcga 3459413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1399959 - 1399887
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||  |||||||||||    
T  1399959 tccaactgcaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaagccaacattcga 1399887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16418199 - 16418111
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 195  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||   || || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||    
T  16418199 agcacaacatgttcccgaggattgagatggatgttacattgctgagatcacctgaagatattctcaagagtttgactctgccagaagat 16418111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 36349987 - 36350075
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||||  |||||||| ||||||    
T  36349987 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcc 36350075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40012406 - 40012378
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012406 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 40012378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 41048792 - 41049093
Alignment:
Q  5 tggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  41048792 tggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttg 41048891  T
Q  105 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41048892 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 41048991  T
Q  205 gtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    ||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||  | ||| || ||||||||| ||||    
T  41048992 gtacgaaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgcaaaacggcaagtctctaatattcgaccgacatt 41049091  T
Q  301 cc 302  Q
    ||    
T  41049092 cc 41049093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48315382 - 48315077
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  48315382 agggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 48315283  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  48315282 tttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtca 48315183  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  48315182 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacgattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgg 48315083  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  48315082 cattcc 48315077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 48270653 - 48270948
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  48270653 agggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 48270752  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  48270753 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcg 48270852  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| || ||||||    
T  48270853 ttaggtacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgtctttcttttaatggggtaattcaaacttgccagacggcaggtctcaaatattcga 48270948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15338107 - 15337831
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  15338107 agggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgatgagcatgt 15338008  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15338007 tttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgccagaagatcgtca 15337908  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||||||| |    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  15337907 ttaggtatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 15337831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46862396 - 46862092
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || | |||    
T  46862396 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcttgt 46862297  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  46862296 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 46862197  T
Q  201 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    | ||||| |    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  46862196 taaggtacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgtcttcttttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctccaatattcgaccgg 46862097  T
Q  297 cattc 301  Q
    |||||    
T  46862096 cattc 46862092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43351301 - 43350999
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  43351301 agggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgt 43351202  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||| |    
T  43351201 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccaccagaagatcgtca 43351103  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  43351102 ttaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccga 43351003  T
Q  297 catt 300  Q
    ||||    
T  43351002 catt 43350999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1642789 - 1642550
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  1642789 agggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgaggagcatgt 1642690  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1642689 tttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtga 1642590  T
Q  201 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642589 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 1642550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21614962 - 21614701
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||    
T  21614962 agggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgt 21614863  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  21614862 tttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgccagaagttcgtga 21614763  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21614762 ttaggtagggaaatgcacctttcaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaa 21614701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30355012 - 30354714
Alignment:
Q  6 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30355012 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 30354913  T
Q  106 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  30354912 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattagg 30354813  T
Q  206 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcatt 300  Q
    || |    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  30354812 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcatt 30354714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21187501 - 21187196
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  21187501 agggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtgacgagcatgt 21187402  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  21187401 tttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtca 21187302  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||||    
T  21187301 ttaggtactgaatgaatgcacctttcagctacaataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctcaaatattcgaccgg 21187202  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  21187201 cattcc 21187196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36394026 - 36393721
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  36394026 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 36393927  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  36393926 tttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcttca 36393827  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||  ||||| ||| ||||||    
T  36393826 ttaggtactgaatgaatgcaccttccagctacgacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtttccaatatttgaccgg 36393727  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  36393726 cattcc 36393721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 275
Target Start/End: Original strand, 18237571 - 18237846
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  18237571 ggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattt 18237670  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18237671 tgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgccagaagatcgtcatt 18237770  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| |||| |||||||||||||    
T  18237771 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaattggggtaactcaaacttgccaaacggc 18237846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 42735268 - 42735555
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  42735268 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 42735366  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  42735367 tttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcaagaagatcgtca 42735466  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaa 285  Q
    ||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  42735467 ttaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggaaggactccaa 42735555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21650529 - 21650833
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  21650529 agggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgt 21650628  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  21650629 tatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccataagatcatca 21650728  T
Q  201 ttaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    |||| |    |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||     
T  21650729 ttagttaccgaatgaatgaacctaccagctacaacaattgtcttcctttgaatg-ggtaattcaaacttgccaaacagcaggactccaatattcaaccga 21650827  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  21650828 cattcc 21650833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28114595 - 28114290
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  28114595 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgt 28114496  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | || ||||| || |    
T  28114495 tttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgtcaaaagattgtca 28114396  T
Q  201 ttaggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccgg 296  Q
    |||||||  |    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  28114395 ttaggtaccgaataaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaactttccaaacggcacgactccaatgttcgaccgg 28114296  T
Q  297 cattcc 302  Q
    ||||||    
T  28114295 cattcc 28114290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 41217619 - 41217859
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41217619 agggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtgaagaacatgt 41217718  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  41217719 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtca 41217818  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  41217819 ttagttagggtaaggtgcattccaactacagcaattgtctt 41217859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20378905 - 20378613
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20378905 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 20378806  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||| | |    
T  20378805 tttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgccagaagatcatca 20378706  T
Q  201 ttaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    |||| ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  20378705 ttagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 20378613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 47268904 - 47269178
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47268904 agggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 47269002  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |    
T  47269003 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgccaaaagatcgtca 47269102  T
Q  201 ttaggtaggg---aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    |||  |||||    |||||  |||||||||||||||||  ||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47269103 ttaattagggtaagatgca--ttccaactacaacaattagcttacctgtgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 47269178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39477442 - 39477165
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  39477442 agggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgacgagcatgt 39477343  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| |    
T  39477342 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtca 39477243  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt--cctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||  |  | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39477242 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatcttaccgctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 39477165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 20564766 - 20565036
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20564766 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttt 20564865  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgatt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  20564866 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcatt 20564965  T
Q  203 aggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    || ||||| || |  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  20564966 agttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 20565036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48220944 - 48220706
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  48220944 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg- 48220846  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||| |    
T  48220845 -ttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagatcgtca 48220747  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  48220746 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 48220706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2356294 - 2356534
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||| || |||||    
T  2356294 agggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatgtgacgagcatgt 2356393  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| | |||| |||||    
T  2356394 tttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgctataagaccgtga 2356493  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2356494 ttaggtagggaaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 2356534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 30360522 - 30360761
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||    
T  30360522 agggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgtaacgagcatgt 30360621  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  30360622 tttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggt-gcgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 30360720  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| ||||  | ||||||||| ||| ||||||||    
T  30360721 ttagttagggtaatgtgcattccaactataactattgtctt 30360761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 40588554 - 40588794
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  40588554 agggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgatgagcatgt 40588653  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  40588654 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggccagaagatcgtca 40588753  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||  |||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  40588754 ttagtcagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 40588794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 17839330 - 17839579
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  17839330 ggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 17839429  T
Q  103 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc-agaagatcgtgat 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||    
T  17839430 tgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaaagatcgtcat 17839529  T
Q  202 taggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    ||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17839530 tagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 17839579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 34140870 - 34141079
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  34140870 agggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgt 34140969  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  34140970 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccataagatcgtca 34141069  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  34141070 ttagttaggg 34141079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 17183217 - 17183497
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17183217 agggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgt 17183316  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaag---atcg 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||   ||||    
T  17183317 tttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcatcg 17183416  T
Q  198 tgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    | ||||| |||||  | |  | |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17183417 tcattagttagggtgaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggc 17183497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 10523075 - 10523346
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  10523075 ggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 10523174  T
Q  103 tgggagcacaacatg-ttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgat 201  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  10523175 tgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgcctgaaaatcgtcat 10523274  T
Q  202 taggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||| ||||| || |    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  10523275 tagttagggtaaggtgtattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgtcaaac 10523346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28979224 - 28979060
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  28979224 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtgacgagcatgt 28979125  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28979124 tttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26603407 - 26603268
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  26603407 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtgacgagcatgt 26603308  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26603307 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggt 26603268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367050
Alignment:
Q  80 acgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 179  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  180 gattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 9367050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45363445 - 45363214
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| || |||||    
T  45363445 agggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 45363346  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |    
T  45363345 tttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 45363255  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  45363254 ttagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 45363214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2206144 - 2205964
Alignment:
Q  96 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  2206144 catgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 2206045  T
Q  196 cgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    ||| ||||| ||||  || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  2206044 cgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacg 2205964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150328
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||    
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  200 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150292 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 150328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3380727 - 3380637
Alignment:
Q  150 gagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3380727 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaacgacaacaattgtctt 3380637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 13916840 - 13916949
Alignment:
Q  3 ggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttt 102  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  13916840 ggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaatgtgatgaccatgttt 13916939  T
Q  103 tgggagcaca 112  Q
    ||||||||||    
T  13916940 tgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 272
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920583
Alignment:
Q  121 cagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg---aatgcac 217  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    |||||     
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaagatgca- 13920529  T
Q  218 cttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  13920530 -ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 13920583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149761
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggt 18149737  T
Q  207 agggaatgcaccttccaactacaa 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  18149738 agggaatgcacttttcaactacaa 18149761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 207
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066466
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  200 attaggta 207  Q
    ||||||||    
T  28066459 attaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 215
Target Start/End: Original strand, 11824839 - 11824912
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11824839 acgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatgc 11824912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 42682961 - 42683051
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtga 91  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  42682961 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtga 42683051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17320260 - 17320137
Alignment:
Q  144 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcc 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  17320260 gttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcc 17320161  T
Q  243 tttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    |||||||| |||||||||| ||||    
T  17320160 tttaaatggggtaattcaaacttg 17320137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601705
Alignment:
Q  142 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 26601740  T
Q  241 -cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
     ||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  26601739 acctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacg 26601705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7414304 - 7414196
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||   || ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  7414304 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatctatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaaaatattctcaacagtttgatttcgccagaagattatg 7414205  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  7414204 attaggtag 7414196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Original strand, 21186960 - 21187046
Alignment:
Q  218 cttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggtaa-ttcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21186960 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttcccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcc 21187046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 12083042 - 12083143
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 206  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||   || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||    
T  12083042 agcacaacatgttcccatggatggatatgtttgtcacattgctgagatcgcctgaagatattctcaacagtttggttccgcctgaagattatgattaggt 12083141  T
Q  207 ag 208  Q
    ||    
T  12083142 ag 12083143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21614442 - 21614369
Alignment:
Q  217 ccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||| |||||||    
T  21614442 ccttccaactacaacaattgtcttcctctagatggggtaattcaaacttgttaaacggcaagactcaaacattc 21614369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 250
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139421
Alignment:
Q  162 agatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatg 250  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 34139421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36393476 - 36393404
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  36393476 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagaaatccaacattcga 36393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20878026 - 20877967
Alignment:
Q  225 ctacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactcca 284  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20878026 ctacaacaattgtgttcctttggatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcca 20877967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 31267188 - 31267286
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||  ||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||  |||||||||    
T  31267188 agcacaacatgttcccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctaagatcgcctgaagatattct-aacagtttgattcagctagaagattatgattaggt 31267286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Original strand, 10224623 - 10224664
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaa 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10224623 tccaactgcaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaa 10224664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 20877461 - 20877542
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  20877461 ggaatgtaccttccaactacaacaattatcttacctctaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacat 20877542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 46861853 - 46861941
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| |||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  46861853 accttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcc 46861941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39476906 - 39476823
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||  ||||||||||||||||    
T  39476906 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggtaggactccaacattcga 39476823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28114044 - 28113998
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttg 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  28114044 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 28113998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 28113803 - 28113884
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacat 288  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  28113803 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacat 28113884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48271196 - 48271115
Alignment:
Q  216 accttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | ||  ||||| || |||||||||    
T  48271196 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactctaatattcgaccg 48271115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20877703 - 20877631
Alignment:
Q  220 tccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||  || |||| |||||||    
T  20877703 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttgttaaacggcatgaatccagcattcga 20877631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 21614111 - 21614207
Alignment:
Q  208 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtc-ttcctttaaatgtggt-aattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcgaccggcattcc 302  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  21614111 gggaatgtaccttccacctacaacaattatcatacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatgcgtccgacattcc 21614207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26500438 - 26500410
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26500438 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 26500410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 26592275 - 26592303
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26592275 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 26592303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30361308 - 30361280
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361308 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 30361280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Original strand, 39476656 - 39476684
Alignment:
Q  212 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39476656 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 39476684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48220409 - 48220373
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttccttt 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48220409 ggaatgcacattccaactacaacaattgtcttacttt 48220373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18118 - 17843
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18118 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgt 18020  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  18019 tttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtca 17920  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacgg 274  Q
    |||| ||||| || |  | || ||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17919 ttagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacgg 17843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2549
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2272 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 2371  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| |    
T  2372 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgccaaaagatcgtca 2471  T
Q  201 ttaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggc 275  Q
    |||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  2472 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaaattaccaaacggc 2549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1795 - 2004
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  1795 agggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgt 1894  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  1895 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccataagatcgtca 1994  T
Q  201 ttaggtaggg 210  Q
    |||| |||||    
T  1995 ttagttaggg 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 24910 - 25119
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| || |||||    
T  24910 agggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtgacgagcatgt 25009  T
Q  101 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  |||||||||    
T  25010 tttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgccaatagatcgtga 25108  T
Q  201 ttaggtaggga 211  Q
    |||||||||||    
T  25109 ttaggtaggga 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Original strand, 25131 - 25163
Alignment:
Q  208 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25131 gggaatgcaccttccaactacatcaattgtctt 25163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 273
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64227
Alignment:
Q  145 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtagggtaaggtacattccaactacaacaattgtcttcct 64197  T
Q  244 ttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacg 273  Q
    || ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  64198 ttgaatgaagtaattcaaacttgccaaacg 64227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 63981 - 64095
Alignment:
Q  1 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||    
T  63981 agggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 64079  T
Q  101 tttgggagcacaacat 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  64080 tttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85603
Alignment:
Q  132 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 230  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 85561  T
Q  231 caattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  85562 caattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 85603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 14616 - 14745
Alignment:
Q  144 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcc 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  14616 gttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttagttagggtaacgtgcattccaactacaacaattgtcttcc 14715  T
Q  243 tttaaatgtggtaattcaagcttgccaaac 272  Q
    ||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  14716 tttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 14745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5561
Alignment:
Q  100 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||   || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcgag 5552  T
Q  200 attaggtag 208  Q
    |||||||||    
T  5553 attaggtag 5561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36860
Alignment:
Q  107 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 192  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgctagaa 36860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 250
Target Start/End: Original strand, 108001 - 108044
Alignment:
Q  208 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  108001 gggaatgcaccttccaactacaacaattatcttacctttaaatg 108044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 291
Target Start/End: Original strand, 2496 - 2578
Alignment:
Q  209 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaagcttgccaaacggcgggactccaacattcg 291  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  ||| || ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||    
T  2496 ggaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactcttgatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcg 2578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University