View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11643_low_12 (Length: 284)

Name: NF11643_low_12
Description: NF11643
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11643_low_12
NF11643_low_12
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (4-268)||(3700246-3700511)
chr4 (112-268)||(25483325-25483490)
chr4 (135-264)||(54343014-54343145)
chr4 (109-268)||(1731649-1731817)
chr4 (113-268)||(36608663-36608827)
chr4 (120-268)||(54017597-54017754)
chr4 (113-266)||(10245910-10246071)
chr4 (113-268)||(22183266-22183430)
chr4 (113-268)||(50002416-50002580)
chr4 (116-268)||(36629230-36629391)
chr4 (113-268)||(36572009-36572173)
chr4 (116-264)||(2740693-2740848)
chr4 (112-268)||(4390103-4390268)
chr4 (112-240)||(4955347-4955484)
chr4 (113-265)||(22027966-22028127)
chr4 (116-259)||(3244462-3244614)
chr4 (113-195)||(3341118-3341201)
chr4 (113-268)||(39404388-39404552)
chr4 (113-195)||(52884877-52884960)
chr4 (118-268)||(3340802-3340961)
chr4 (116-274)||(39792856-39793023)
chr4 (126-268)||(55933126-55933277)
chr4 (135-268)||(44620365-44620507)
chr4 (111-268)||(50459709-50459875)
chr4 (113-188)||(45489421-45489497)
chr4 (116-259)||(52884688-52884841)
chr4 (116-195)||(54741261-54741341)
chr4 (193-255)||(15841383-15841445)
chr4 (115-195)||(41707547-41707628)
chr4 (121-266)||(49302902-49303058)
chr4 (135-268)||(50630757-50630899)
chr4 (116-195)||(10246340-10246420)
chr4 (112-232)||(34646687-34646816)
chr4 (113-192)||(49076534-49076614)
chr4 (193-268)||(23817683-23817758)
chr4 (117-195)||(44620654-44620733)
chr4 (190-265)||(54936272-54936346)
chr4 (126-268)||(39404021-39404172)
chr4 (126-268)||(41370360-41370511)
chr4 (206-268)||(43174233-43174295)
chr4 (138-268)||(44621017-44621156)
chr4 (138-195)||(54108928-54108986)
chr4 (116-195)||(28034222-28034302)
chr4 (193-265)||(32941128-32941200)
chr4 (136-195)||(54017785-54017845)
chr4 (138-241)||(45496820-45496932)
chr4 (116-222)||(2741064-2741179)
chr4 (190-268)||(18932751-18932829)
chr4 (135-265)||(20825848-20825987)
chr4 (126-195)||(49880163-49880233)
chr4 (113-232)||(16888854-16888983)
chr4 (177-236)||(41707275-41707334)
chr4 (135-174)||(50788088-50788127)
chr4 (108-174)||(19504690-19504756)
chr4 (135-188)||(44620308-44620362)
chr4 (135-195)||(20826229-20826290)
chr4 (112-195)||(11348411-11348495)
chr4 (110-158)||(11706642-11706690)
chr4 (113-191)||(43174496-43174576)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (113-264)||(30244260-30244420)
chr7 (113-259)||(7517570-7517725)
chr7 (113-268)||(1085620-1085784)
chr7 (113-259)||(45434626-45434781)
chr7 (113-264)||(30245067-30245223)
chr7 (113-241)||(7554015-7554152)
chr7 (113-197)||(30255329-30255414)
chr7 (112-268)||(34218038-34218203)
chr7 (113-268)||(23381-23545)
chr7 (113-222)||(22566712-22566830)
chr7 (113-197)||(30245484-30245569)
chr7 (111-259)||(45754704-45754860)
chr7 (113-172)||(41910703-41910762)
chr7 (135-268)||(6054572-6054714)
chr7 (135-268)||(11845203-11845345)
chr7 (113-197)||(30244691-30244776)
chr7 (15-107)||(3946894-3946986)
chr7 (112-195)||(40094859-40094943)
chr7 (113-264)||(22567047-22567206)
chr7 (113-195)||(24177425-24177508)
chr7 (113-268)||(45433231-45433395)
chr7 (135-268)||(14681522-14681662)
chr7 (111-251)||(24838722-24838872)
chr7 (114-190)||(36109007-36109084)
chr7 (123-268)||(37533368-37533522)
chr7 (135-259)||(19122744-19122876)
chr7 (112-195)||(36534869-36534953)
chr7 (113-195)||(47129085-47129168)
chr7 (126-232)||(29157568-29157683)
chr7 (114-264)||(36939741-36939900)
chr7 (126-195)||(37533095-37533165)
chr7 (118-195)||(40230376-40230454)
chr7 (215-268)||(30244453-30244506)
chr7 (193-264)||(30253571-30253638)
chr7 (113-232)||(1085288-1085417)
chr7 (112-191)||(43241484-43241564)
chr7 (113-195)||(118386-118469)
chr7 (113-195)||(16569186-16569269)
chr7 (113-195)||(16596393-16596476)
chr7 (113-195)||(36622950-36623033)
chr7 (215-265)||(30253671-30253721)
chr7 (190-231)||(23569043-23569084)
chr7 (215-268)||(30245256-30245309)
chr7 (116-173)||(40094502-40094559)
chr7 (195-268)||(47129450-47129523)
chr7 (116-195)||(8128526-8128606)
chr7 (113-177)||(9901635-9901698)
chr7 (116-195)||(28301628-28301708)
chr7 (192-268)||(37167859-37167935)
chr7 (113-256)||(41854625-41854776)
chr7 (136-187)||(44361557-44361608)
chr7 (202-268)||(37532755-37532821)
chr7 (222-263)||(7517765-7517806)
chr7 (222-263)||(7518031-7518072)
chr7 (194-239)||(37345998-37346043)
chr7 (197-262)||(45755010-45755075)
chr7 (193-241)||(2512582-2512630)
chr7 (112-191)||(20599303-20599383)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (113-268)||(26661526-26661690)
chr1 (112-268)||(31767165-31767330)
chr1 (110-268)||(41156978-41157145)
chr1 (113-259)||(37556101-37556256)
chr1 (113-270)||(34364497-34364663)
chr1 (116-268)||(22077499-22077660)
chr1 (115-233)||(17294569-17294696)
chr1 (114-259)||(37555721-37555874)
chr1 (115-268)||(41157367-41157529)
chr1 (126-268)||(44290828-44290980)
chr1 (126-268)||(44290462-44290613)
chr1 (111-195)||(41184510-41184595)
chr1 (119-268)||(45084378-45084530)
chr1 (113-268)||(41142362-41142527)
chr1 (125-195)||(50052108-50052179)
chr1 (116-270)||(24600316-24600479)
chr1 (138-268)||(48588492-48588631)
chr1 (135-268)||(3537603-3537745)
chr1 (135-268)||(3875335-3875477)
chr1 (113-270)||(34364915-34365081)
chr1 (114-264)||(40082398-40082556)
chr1 (115-259)||(9955899-9956054)
chr1 (113-268)||(37850604-37850768)
chr1 (126-195)||(3537232-3537302)
chr1 (113-251)||(26661919-26662066)
chr1 (135-268)||(14318879-14319021)
chr1 (135-268)||(45493978-45494124)
chr1 (112-195)||(21378126-21378210)
chr1 (112-268)||(29798188-29798353)
chr1 (113-268)||(11977270-11977434)
chr1 (113-268)||(34649428-34649592)
chr1 (126-232)||(3550723-3550838)
chr1 (126-240)||(32594748-32594871)
chr1 (126-268)||(41759486-41759637)
chr1 (135-191)||(5528843-5528900)
chr1 (113-170)||(35154150-35154207)
chr1 (129-192)||(5575110-5575174)
chr1 (193-268)||(22077114-22077189)
chr1 (195-266)||(22793360-22793431)
chr1 (115-269)||(66475-66638)
chr1 (113-255)||(39066217-39066368)
chr1 (116-175)||(4878796-4878855)
chr1 (190-265)||(32168705-32168780)
chr1 (126-257)||(38804370-38804510)
chr1 (193-255)||(47380184-47380246)
chr1 (115-195)||(5320050-5320131)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (115-265)||(5420643-5420802)
chr8 (112-268)||(3038294-3038459)
chr8 (113-268)||(9309345-9309508)
chr8 (113-195)||(147441-147524)
chr8 (135-270)||(18371663-18371802)
chr8 (126-270)||(3670063-3670216)
chr8 (113-264)||(34834866-34835026)
chr8 (135-249)||(70297-70420)
chr8 (126-264)||(3669690-3669837)
chr8 (135-199)||(25561725-25561790)
chr8 (118-259)||(45122070-45122220)
chr8 (113-256)||(147819-147962)
chr8 (113-268)||(6876866-6877031)
chr8 (136-268)||(20870577-20870718)
chr8 (112-195)||(25561901-25561985)
chr8 (135-270)||(9482606-9482750)
chr8 (126-265)||(30441084-30441236)
chr8 (112-270)||(30359260-30359427)
chr8 (135-268)||(34835221-34835363)
chr8 (140-265)||(45121663-45121797)
chr8 (113-249)||(33113390-33113535)
chr8 (126-274)||(40518585-40518742)
chr8 (192-268)||(41129066-41129142)
chr8 (112-195)||(43274864-43274948)
chr8 (126-269)||(1013874-1014026)
chr8 (135-193)||(1514002-1514061)
chr8 (193-268)||(5915946-5916021)
chr8 (113-191)||(8794101-8794180)
chr8 (113-195)||(8918849-8918932)
chr8 (116-263)||(20995425-20995566)
chr8 (137-264)||(45122638-45122774)
chr8 (148-270)||(9483189-9483320)
chr8 (121-194)||(18372785-18372859)
chr8 (113-195)||(45122996-45123077)
chr8 (135-195)||(41416256-41416317)
chr8 (116-195)||(9608738-9608818)
chr8 (113-269)||(30359599-30359764)
chr8 (116-195)||(41972151-41972231)
chr8 (116-195)||(9308970-9309052)
chr8 (121-191)||(45121999-45122070)
chr8 (121-194)||(18372342-18372416)
chr8 (190-268)||(40518147-40518225)
chr8 (114-175)||(32640633-32640694)
chr8 (113-266)||(37544496-37544658)
chr8 (116-195)||(4154751-4154831)
chr8 (190-265)||(9507858-9507933)
chr8 (135-270)||(18371996-18372140)
chr8 (136-187)||(20130462-20130513)
chr8 (190-265)||(40579276-40579351)
chr8 (126-172)||(6731907-6731953)
chr8 (126-195)||(40579591-40579661)
chr8 (193-246)||(5274854-5274907)
chr8 (199-256)||(12283957-12284014)
chr8 (126-191)||(18372692-18372757)
chr8 (135-191)||(18373020-18373077)
chr8 (126-193)||(1014332-1014400)
chr8 (196-268)||(8919148-8919220)
chr8 (193-268)||(9620682-9620755)
chr8 (190-226)||(12156704-12156740)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (113-266)||(31190007-31190161)
chr3 (135-264)||(39934963-39935101)
chr3 (115-268)||(54017820-54017982)
chr3 (113-268)||(25739429-25739593)
chr3 (126-268)||(37726507-37726650)
chr3 (113-268)||(42342392-42342556)
chr3 (111-268)||(15772842-15773008)
chr3 (111-268)||(35946510-35946676)
chr3 (113-266)||(15773182-15773346)
chr3 (112-268)||(32589693-32589857)
chr3 (116-268)||(33803256-33803417)
chr3 (116-235)||(8327897-8328025)
chr3 (113-268)||(37990643-37990807)
chr3 (113-268)||(37990981-37991145)
chr3 (113-268)||(43346795-43346959)
chr3 (111-195)||(29644987-29645072)
chr3 (112-255)||(52634665-52634816)
chr3 (112-268)||(12114566-12114731)
chr3 (113-268)||(54018202-54018366)
chr3 (136-265)||(22304582-22304720)
chr3 (113-268)||(53117979-53118142)
chr3 (113-268)||(32462904-32463069)
chr3 (113-195)||(29644666-29644749)
chr3 (115-264)||(45395661-45395819)
chr3 (112-177)||(53577353-53577418)
chr3 (113-233)||(11661525-11661639)
chr3 (112-259)||(39914241-39914397)
chr3 (113-268)||(42342094-42342258)
chr3 (190-268)||(22303663-22303741)
chr3 (190-268)||(41359769-41359847)
chr3 (126-195)||(51886564-51886634)
chr3 (113-174)||(43346640-43346701)
chr3 (190-226)||(46546371-46546407)
chr3 (113-259)||(11661941-11662096)
chr3 (113-191)||(25755384-25755463)
chr3 (190-264)||(22303963-22304037)
chr3 (116-246)||(47964544-47964683)
chr3 (126-191)||(50612541-50612607)
chr3 (135-195)||(42584907-42584968)
chr3 (111-195)||(49336772-49336857)
chr3 (116-191)||(21832432-21832508)
chr3 (126-174)||(22304249-22304297)
chr3 (193-241)||(39336001-39336049)
chr3 (113-191)||(45901703-45901783)
chr3 (195-246)||(25317239-25317290)
chr3 (105-155)||(1634441-1634491)
chr3 (190-268)||(3135458-3135536)
chr3 (126-195)||(39389073-39389143)
chr3 (135-195)||(3135158-3135219)
chr3 (113-174)||(3135568-3135629)
chr3 (119-191)||(7767403-7767476)
chr3 (199-268)||(50612451-50612520)
chr3 (116-195)||(9240142-9240222)
chr3 (115-155)||(12747878-12747918)
chr3 (190-222)||(17731954-17731986)
chr3 (190-222)||(19033185-19033217)
chr3 (113-187)||(32462651-32462727)
chr3 (116-195)||(33175749-33175829)
chr3 (190-222)||(54017598-54017630)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (120-267)||(7598606-7598754)
chr2 (126-266)||(36178611-36178760)
chr2 (108-249)||(28254262-28254410)
chr2 (113-266)||(15880253-15880415)
chr2 (113-268)||(6421375-6421539)
chr2 (126-268)||(37106191-37106342)
chr2 (116-268)||(962591-962752)
chr2 (112-268)||(38796622-38796789)
chr2 (126-268)||(5542629-5542780)
chr2 (126-268)||(5543002-5543153)
chr2 (113-225)||(31468797-31468914)
chr2 (113-192)||(38796306-38796386)
chr2 (126-265)||(14745674-14745822)
chr2 (113-195)||(31899511-31899594)
chr2 (194-268)||(6421811-6421885)
chr2 (113-266)||(15511501-15511661)
chr2 (115-246)||(30313170-30313309)
chr2 (126-268)||(37105927-37106078)
chr2 (126-268)||(41283479-41283630)
chr2 (113-174)||(36785670-36785731)
chr2 (113-268)||(40733873-40734036)
chr2 (190-270)||(3672777-3672857)
chr2 (118-268)||(35580728-35580886)
chr2 (116-268)||(42514642-42514803)
chr2 (113-191)||(16542439-16542518)
chr2 (110-265)||(36005887-36006050)
chr2 (113-264)||(40733507-40733667)
chr2 (113-174)||(29676893-29676954)
chr2 (193-246)||(29873563-29873616)
chr2 (120-191)||(1769889-1769961)
chr2 (113-268)||(6712966-6713131)
chr2 (120-268)||(7598225-7598382)
chr2 (116-195)||(28531399-28531479)
chr2 (116-195)||(37632682-37632762)
chr2 (193-268)||(3673147-3673222)
chr2 (190-265)||(6422186-6422261)
chr2 (113-171)||(6421294-6421352)
chr2 (202-268)||(6421714-6421780)
chr2 (190-268)||(23346312-23346390)
chr2 (111-195)||(31259701-31259789)
chr2 (111-259)||(33731634-33731793)
chr2 (135-196)||(40163457-40163519)
chr2 (116-237)||(33561486-33561616)
chr2 (116-268)||(40679633-40679794)
chr2 (135-222)||(14745344-14745440)
chr2 (141-268)||(36178175-36178311)
chr2 (110-187)||(5367442-5367520)
chr2 (113-158)||(3673075-3673120)
chr2 (190-222)||(37895111-37895143)
chr2 (195-239)||(41678401-41678445)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (103-268)||(36492221-36492395)
chr5 (110-268)||(15370086-15370253)
chr5 (126-264)||(32487397-32487543)
chr5 (115-268)||(3295349-3295509)
chr5 (112-258)||(300948-301095)
chr5 (113-268)||(40296319-40296483)
chr5 (135-257)||(41170646-41170777)
chr5 (113-268)||(25327925-25328089)
chr5 (116-259)||(26074159-26074311)
chr5 (126-268)||(6500454-6500604)
chr5 (126-272)||(18603120-18603275)
chr5 (113-259)||(26074602-26074757)
chr5 (111-195)||(26075247-26075332)
chr5 (118-249)||(35150002-35150141)
chr5 (113-224)||(11417025-11417143)
chr5 (113-195)||(6224186-6224269)
chr5 (116-263)||(13415769-13415925)
chr5 (113-222)||(299479-299597)
chr5 (135-264)||(38427560-38427697)
chr5 (190-270)||(624272-624352)
chr5 (116-268)||(1028521-1028682)
chr5 (112-187)||(12662745-12662821)
chr5 (113-268)||(42405602-42405764)
chr5 (113-195)||(26074867-26074950)
chr5 (113-193)||(35914839-35914920)
chr5 (113-265)||(3295022-3295184)
chr5 (126-268)||(6500826-6500976)
chr5 (126-268)||(27502040-27502191)
chr5 (135-269)||(34753028-34753171)
chr5 (116-264)||(36568577-36568732)
chr5 (115-191)||(42508604-42508681)
chr5 (116-195)||(41632775-41632855)
chr5 (197-256)||(623901-623960)
chr5 (196-270)||(26590912-26590986)
chr5 (113-162)||(35150737-35150786)
chr5 (113-162)||(35151028-35151077)
chr5 (135-270)||(33747783-33747927)
chr5 (190-268)||(15370478-15370556)
chr5 (190-240)||(36522269-36522319)
chr5 (135-195)||(9498739-9498800)
chr5 (115-191)||(31509615-31509692)
chr5 (193-241)||(36527126-36527174)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (113-257)||(1950200-1950353)
chr6 (112-264)||(2579880-2580041)
chr6 (116-264)||(10074371-10074528)
chr6 (126-268)||(29518506-29518657)
chr6 (126-268)||(29518923-29519074)
chr6 (126-268)||(32741182-32741333)
chr6 (113-268)||(2578447-2578610)
chr6 (111-264)||(2377742-2377904)
chr6 (126-259)||(3409262-3409404)
chr6 (135-268)||(5832031-5832172)
chr6 (113-268)||(16454897-16455061)
chr6 (126-268)||(2378129-2378280)
chr6 (126-268)||(35210207-35210358)
chr6 (126-268)||(14748346-14748493)
chr6 (112-191)||(9062438-9062518)
chr6 (112-259)||(16107667-16107823)
chr6 (126-268)||(1846751-1846902)
chr6 (126-232)||(26544052-26544167)
chr6 (111-191)||(593798-593879)
chr6 (135-232)||(3058238-3058344)
chr6 (116-268)||(10073620-10073779)
chr6 (116-268)||(10911558-10911720)
chr6 (116-268)||(10073995-10074156)
chr6 (135-223)||(32460629-32460726)
chr6 (192-259)||(12085047-12085114)
chr6 (113-195)||(16108053-16108136)
chr6 (113-268)||(16454565-16454729)
chr6 (126-268)||(3409663-3409814)
chr6 (198-268)||(12071695-12071765)
chr6 (193-268)||(2843634-2843709)
chr6 (135-249)||(3415470-3415593)
chr6 (113-174)||(2579212-2579273)
chr6 (135-259)||(1127372-1127505)
chr6 (116-240)||(12092514-12092647)
chr6 (113-195)||(6999881-6999964)
chr6 (193-270)||(2579494-2579571)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (111-264)||(522-684)
scaffold0702 (126-192)||(230-297)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (113-270)||(1108-1274)
scaffold0391 (113-175)||(3091-3153)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (113-195)||(5767-5850)
scaffold0734 (111-195)||(5384-5469)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (115-195)||(5349-5430)
scaffold0078 (112-265)||(4971-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (113-195)||(17541-17624)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (113-195)||(10196-10279)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 3700246 - 3700511
Alignment:
Q  4 caacttaatttgtgtatgtttggtatagcatttacaaaacggagtttgatagaaatcacagcaagaaactatgttagtgaagaagctggtgttttaagct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3700246 caacttaatttgtgtatgtttggtatagcatttacaaaacggagtttgatagaaatcacagcaagaaactatgttagtgaagaagctggtgttttgagct 3700345  T
Q  104 tctgaaaattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattgcctta 202  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3700346 tctgaaaattattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaaggactcattgcctta 3700445  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3700446 aggttttggataagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggt 3700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 25483325 - 25483490
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||    
T  25483325 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 25483424  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25483425 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 25483490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54343145 - 54343014
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggaccc-attgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  54343145 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54343046  T
Q  233 cacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
      |||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  54343045 tgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 54343014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1731817 - 1731649
Alignment:
Q  109 aaattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgcc 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||        ||||||    
T  1731817 aaattgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgcc 1731718  T
Q  200 ttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  1731717 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggt 1731649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36608827 - 36608663
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||        || |||||    
T  36608827 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaa 36608728  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36608727 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 36608663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54017754 - 54017597
Alignment:
Q  120 gtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttg 210  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||     
T  54017754 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttta 54017655  T
Q  211 tgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     ||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54017654 ggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 54017597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 10245910 - 10246071
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg-------acccattgccttaag 204  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||       |||||  ||||||||    
T  10245910 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccataaacccaaagccttaag 10246009  T
Q  205 gttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||  ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  10246010 gttttgggtaagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacg 10246071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22183430 - 22183266
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaac-atctataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||        ||||||||||||||    
T  22183430 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaa 22183331  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||  ||||||||||  || ||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22183330 ggttttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggt 22183266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 50002416 - 50002580
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggac--------ccattgccttaa 203  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||        |||||| |||||    
T  50002416 tgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaa 50002515  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  50002516 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggt 50002580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 36629230 - 36629391
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  36629230 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 36629329  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36629330 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 36629391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 36572009 - 36572173
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||||| |||        ||||||||||||    
T  36572009 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaa 36572108  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| || ||||| || ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  36572109 ggttttgggttagagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggt 36572173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 264
Target Start/End: Original strand, 2740693 - 2740848
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||  ||||||||||    
T  2740693 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggt 2740792  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||  |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2740793 tttacgtaagagtgtggcgtctctctcacttgtg--gttgttctagcctcgatatgga 2740848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4390268 - 4390103
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagga--------cccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||        | |||||| |||    
T  4390268 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgtta 4390169  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||  ||||||| |||||||||  |||||||    
T  4390168 aggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggt 4390103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4955484 - 4955347
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||||||    
T  4955484 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgcctta 4955385  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtg 240  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||    
T  4955384 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtg 4955347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22028127 - 22027966
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||    
T  22028127 tgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaa 22028028  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||| ||||||  || |||||| |||||    
T  22028027 ggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggac 22027966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3244614 - 3244462
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||| ||||| ||    
T  3244614 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagt 3244515  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |||| |||||| ||||  || |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  3244514 tttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgat 3244462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 3341118 - 3341201
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  3341118 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccat 3341201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 39404388 - 39404552
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||        || |||||||    
T  39404388 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaa 39404487  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| | |||| |||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  39404488 ggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggt 39404552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 52884877 - 52884960
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  52884877 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccat 52884960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 268
Target Start/End: Original strand, 3340802 - 3340961
Alignment:
Q  118 ttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttt 208  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  3340802 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttt 3340901  T
Q  209 tgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    || ||||||||||| ||| | |||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3340902 tgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggt 3340961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39793023 - 39792856
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggaccc--------attgccttaaggt 206  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||| || ||||| ||||||| ||        |||||||||||||    
T  39793023 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggt 39792924  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttctctg 274  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  39792923 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctg 39792856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55933277 - 55933126
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||        |||||||| |||||| |||||    
T  55933277 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggtaag 55933178  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55933177 agtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggt 55933126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 44620365 - 44620507
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44620365 ttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatg 44620464  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | |||||  ||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  44620465 tttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggt 44620507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Original strand, 50459709 - 50459875
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctt 201  Q
    |||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||  |||    
T  50459709 attgttgtagtgcataagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatctt 50459808  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  50459809 aaggttttaggtaagagcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggt 50459875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45489497 - 45489421
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagag 188  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  45489497 tgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagag 45489421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 259
Target Start/End: Original strand, 52884688 - 52884841
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| |        |||||||||||||||||    
T  52884688 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggt 52884787  T
Q  207 ttt-gtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||| | ||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| || |||||||||    
T  52884788 tttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgat 52884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54741341 - 54741261
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54741341 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 54741261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15841445 - 15841383
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcct 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  15841445 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41707628 - 41707547
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  41707628 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccat 41707547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 266
Target Start/End: Original strand, 49302902 - 49303058
Alignment:
Q  121 tgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc---tataagtaagagg--------acccattgccttaaggtttt 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  49302902 tgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 49303001  T
Q  210 gtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||   |||||| | ||||||| ||||||    
T  49303002 gggtaagagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacg 49303058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50630899 - 50630757
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  50630899 ttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 50630800  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | |||||  ||||||  ||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  50630799 tctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggt 50630757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 10246340 - 10246420
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10246340 tgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccat 10246420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34646816 - 34646687
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||| |||||||        || ||||||||||    
T  34646816 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgcctta 34646717  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctct 232  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  34646716 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 34646687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49076614 - 49076534
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc 192  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49076614 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 49076534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23817758 - 23817683
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23817758 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Original strand, 44620654 - 44620733
Alignment:
Q  117 gttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44620654 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccat 44620733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Original strand, 54936272 - 54936346
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  54936272 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggac 54936346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 39404021 - 39404172
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccatt--------gccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||         || ||||||||||| |||||    
T  39404021 aagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaag 39404120  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||  || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39404121 agtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 39404172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 41370360 - 41370511
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggaccc--------attgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||        |||||||||| |||||| |||||    
T  41370360 aagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggtaag 41370459  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||  ||| |||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41370460 agtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggt 41370511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174295
Alignment:
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggt 43174295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 268
Target Start/End: Original strand, 44621017 - 44621156
Alignment:
Q  138 tatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgt 228  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||        || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  44621017 tatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgttt 44621116  T
Q  229 ctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||  ||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  44621117 ctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggt 44621156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 195
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54108986
Alignment:
Q  138 tatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 54108986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 28034222 - 28034302
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  28034222 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccat 28034302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32941200 - 32941128
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  32941200 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017785
Alignment:
Q  136 tatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 54017785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496932
Alignment:
Q  138 tatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  229 ctctcacttgtgt 241  Q
    ||||  |||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgt 45496932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Original strand, 2741064 - 2741179
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaaggt 206  Q
    |||| |||| |||||||  |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  2741064 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggt 2741163  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtg 222  Q
    |||| |||||||||||    
T  2741164 tttgggtaagagtgtg 2741179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18932829 - 18932751
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||  ||||||||| || |||||    
T  18932829 acccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggt 18932751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Original strand, 20825848 - 20825987
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccca--------ttgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20825848 ttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 20825947  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    | |||||  ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||    
T  20825948 tttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggac 20825987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 49880163 - 49880233
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49880163 aagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 49880233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16888983 - 16888854
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgt-aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgcctta 202  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||| |||        ||||| ||||    
T  16888983 tgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtctta 16888884  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctct 232  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16888883 cggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 16888854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41707334 - 41707275
Alignment:
Q  177 tataagtaagaggacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcact 236  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||    
T  41707334 tataagtaagatgacccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctctcact 41707275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50788127 - 50788088
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  50788127 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 50788088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Original strand, 19504690 - 19504756
Alignment:
Q  108 aaaattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  19504690 aaaattgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaaca 19504756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 44620308 - 44620362
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagag 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44620308 ttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Original strand, 20826229 - 20826290
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  20826229 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccat 20826290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11348495 - 11348411
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  11348495 ttgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccat 11348411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11706690 - 11706642
Alignment:
Q  110 aattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaa 158  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  11706690 aattgttgttgtgtgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaa 11706642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 43174496 - 43174576
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggat-aaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43174496 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 43174576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Original strand, 30244260 - 30244420
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||        ||||||||||||    
T  30244260 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 30244359  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30244360 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 30244420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 7517570 - 7517725
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  7517570 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 7517669  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7517670 ggttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 7517725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1085784 - 1085620
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  1085784 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 1085685  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1085684 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 1085620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 45434626 - 45434781
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||        ||||||||    
T  45434626 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaa 45434725  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  45434726 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgat 45434781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Original strand, 30245067 - 30245223
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||        |||||||||||    
T  30245067 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaa 30245166  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30245167 ggttttgggtaagagtgtg--gtgtctct--cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 30245223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 241
Target Start/End: Original strand, 7554015 - 7554152
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||| |||||||    
T  7554015 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaa 7554114  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgt 241  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  7554115 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgt 7554152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 30255329 - 30255414
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattg 197  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  30255329 tgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccattg 30255414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34218203 - 34218038
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||  || ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||| |||||||        |||||| ||||    
T  34218203 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtctta 34218104  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34218103 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 34218038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23545 - 23381
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaa 203  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||    
T  23545 tgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaa 23446  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23445 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggt 23381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22566830 - 22566712
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    ||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  22566830 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 22566731  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22566730 ggttttgggtaagagtgtg 22566712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 30245484 - 30245569
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattg 197  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  30245484 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccattg 30245569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 259
Target Start/End: Original strand, 45754704 - 45754860
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgcctt 201  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||| |||        |||| |||||    
T  45754704 attgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagcctt 45754802  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  45754803 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgat 45754860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41910762 - 41910703
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41910762 tgttgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaa 41910703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 6054572 - 6054714
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6054572 ttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 6054671  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | ||||  |||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  6054672 tctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggt 6054714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 11845203 - 11845345
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||        |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  11845203 ttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtg 11845302  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11845303 tctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggt 11845345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 30244691 - 30244776
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattg 197  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  30244691 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacctattg 30244776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 3946894 - 3946986
Alignment:
Q  15 gtgtatgtttggtatagcatttacaaaacggagtttgatagaaatcacagcaagaaactatgttagtgaagaagctggtgttttaagcttctg 107  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||| |||  ||||||||    
T  3946894 gtgtatgtttggtataacaattgcaaaacgaagtttgatagaaatcacggcaaaaaactatgtcagggtagaagctggtatttggagcttctg 3946986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40094943 - 40094859
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  40094943 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccat 40094859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22567206 - 22567047
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    ||||||||| || |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||    
T  22567206 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 22567108  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||  |||||||| ||||    
T  22567107 ggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtgga 22567047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 24177425 - 24177508
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  24177425 tgttgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccat 24177508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 45433231 - 45433395
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagag--------gacccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||         ||| ||||||||||    
T  45433231 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaa 45433330  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  45433331 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggt 45433395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 14681522 - 14681662
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatcta-taagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||        |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  14681522 ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg--g 14681619  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  14681620 tgtctctcacaagtgtggttgttctagccttgatgtggacggt 14681662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24838872 - 24838722
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg---------acccattgcct 200  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |         |||| ||| ||    
T  24838872 attgttgttgtgtataagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtct 24838773  T
Q  201 taaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaa 251  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||    
T  24838772 taaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttcaa 24838722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36109084 - 36109007
Alignment:
Q  114 gttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagga 190  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36109084 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37533522 - 37533368
Alignment:
Q  123 tgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgt 213  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||| | |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||    
T  37533522 tgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 37533423  T
Q  214 aagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||| ||| ||| |  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37533422 aagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 37533368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 259
Target Start/End: Original strand, 19122744 - 19122876
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19122744 ttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 19122842  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    | | |||  ||||||| ||||||| || ||||||    
T  19122843 tctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgat 19122876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36534953 - 36534869
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36534953 ttgttgttgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 36534869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 47129085 - 47129168
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||   |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47129085 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccat 47129168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 232
Target Start/End: Original strand, 29157568 - 29157683
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||        ||||||||||||||||||| |||||    
T  29157568 aagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggttttgggtaag 29157667  T
Q  217 agtgtgatgtgtctct 232  Q
    |||||| ||| |||||    
T  29157668 agtgtggtgtctctct 29157683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36939900 - 36939741
Alignment:
Q  114 gttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaag 204  Q
    |||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||        |||||||||||||    
T  36939900 gttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaag 36939801  T
Q  205 gttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||  ||| ||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  36939800 gttttgggtaaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37533165 - 37533095
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37533165 aagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 37533095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40230454 - 40230376
Alignment:
Q  118 ttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40230454 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccat 40230376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244506
Alignment:
Q  215 agagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggt 30244506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 264
Target Start/End: Original strand, 30253571 - 30253638
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30253571 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctct--cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 30253638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1085417 - 1085288
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtg-gattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacc--------cattgcctta 202  Q
    |||||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| |||        ||||||||||    
T  1085417 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgcctta 1085318  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctct 232  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  1085317 aggttttgggtaagagtgtggtgtttctct 1085288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 43241484 - 43241564
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  43241484 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggac 43241564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 118469 - 118386
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  118469 tgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccat 118386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 16569186 - 16569269
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  16569186 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccat 16569269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16596476 - 16596393
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  16596476 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccat 16596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 36622950 - 36623033
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| ||||| ||||    
T  36622950 tgttattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccat 36623033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253721
Alignment:
Q  215 agagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggac 30253721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23569084 - 23569043
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23569084 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245309
Alignment:
Q  215 agagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggt 30245309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40094559 - 40094502
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaac 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40094559 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129523
Alignment:
Q  195 ttgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| || ||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggt 47129523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8128606 - 8128526
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  8128606 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccat 8128526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Original strand, 9901635 - 9901698
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct 177  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9901635 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatct 9901698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28301708 - 28301628
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  28301708 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccat 28301628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Original strand, 37167859 - 37167935
Alignment:
Q  192 ccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37167859 ccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 37167935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Original strand, 41854625 - 41854776
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||        ||||||||    
T  41854625 tgtttttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaa 41854723  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctc 256  Q
    ||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  41854724 ggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctc 41854776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44361608 - 44361557
Alignment:
Q  136 tatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaaga 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  44361608 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctttaagtaaga 44361557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532755
Alignment:
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggt 37532755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 7517765 - 7517806
Alignment:
Q  222 gatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgg 263  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7517765 gatgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgg 7517806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 7518031 - 7518072
Alignment:
Q  222 gatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgg 263  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7518031 gatgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgg 7518072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 37345998 - 37346043
Alignment:
Q  194 attgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgt 239  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  37345998 attgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgt 37346043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755075
Alignment:
Q  197 gccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatg 262  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgatatg 45755075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Original strand, 2512582 - 2512630
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgt 241  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2512582 cattgtcttaatattttgtgtaagagtgtgatatatctctcacttgtgt 2512630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 20599303 - 20599383
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| | ||||| |||||||||    
T  20599303 ttgttgttgtctataagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggac 20599383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26661690 - 26661526
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||        ||||||||    
T  26661690 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa 26661591  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26661590 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggt 26661526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31767330 - 31767165
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||        |||||||    
T  31767330 ttgttgttgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgcctta 31767231  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |||  ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  31767230 aggttttgggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggt 31767165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 41156978 - 41157145
Alignment:
Q  110 aattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgcct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        |||||| |    
T  41156978 aattgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctt 41157077  T
Q  201 taaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  41157078 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggt 41157145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 37556101 - 37556256
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggat-aaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg-------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||       |||||| |||||||    
T  37556101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggaccataaacccatagccttaa 37556200  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  37556201 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgat 37556256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Original strand, 34364497 - 34364663
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||| |||||||    
T  34364497 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaa 34364596  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||| || ||||||||| |||| |||||    
T  34364597 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttc 34364663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22077660 - 22077499
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccca--------ttgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||        | ||||||||||    
T  22077660 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggt 22077561  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22077560 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggt 22077499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 17294569 - 17294696
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgccttaagg 205  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  17294569 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 17294668  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctc 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  17294669 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 17294696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Original strand, 37555721 - 37555874
Alignment:
Q  114 gttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaa--catctataagtaagaggacc-------cattgccttaag 204  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||       | | ||||||||    
T  37555721 gttgttgtgtaaaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacat-tataagtaagaggaccttaaatccttagccttaag 37555819  T
Q  205 gttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  37555820 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgat 37555874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 268
Target Start/End: Original strand, 41157367 - 41157529
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaagg 205  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  41157367 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttagg 41157466  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  41157467 ttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggt 41157529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44290980 - 44290828
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgt-aa 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| || ||    
T  44290980 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaa 44290881  T
Q  216 gagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44290880 gagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 44290828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44290613 - 44290462
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44290613 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 44290514  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||| || ||| | |||  |||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44290513 agtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggt 44290462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41184595 - 41184510
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41184595 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccat 41184510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 268
Target Start/End: Original strand, 45084378 - 45084530
Alignment:
Q  119 tgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--tgccttaaggttttgtgtaa 215  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||    
T  45084378 tgtgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataacgtcttaaggttttgggtaa 45084477  T
Q  216 gagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||| ||| ||| |||||  ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||    
T  45084478 gagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggt 45084530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 41142362 - 41142527
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||        ||||||||||||||    
T  41142362 tgttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaa 41142461  T
Q  204 ggttttgtgt-aagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||  || |||||||||  || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41142462 ggtttttggtaaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 41142527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50052179 - 50052108
Alignment:
Q  125 taagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50052179 taagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccat 50052108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24600479 - 24600316
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||        || ||||||||    
T  24600479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggt 24600380  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  24600379 tttgtgtaagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggacagttc 24600316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48588631 - 48588492
Alignment:
Q  138 tatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggaccc--------attgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||        ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  48588631 tatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtgtct 48588532  T
Q  229 ctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48588531 ctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 48588492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3537745 - 3537603
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||        ||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  3537745 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgtggcg 3537646  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3537645 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3537603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3875477 - 3875335
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||        ||||||||||||||||||  |||||| ||||  |    
T  3875477 ttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggtaagaatgtggag 3875378  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3875377 tctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 3875335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Original strand, 34364915 - 34365081
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||        |||||| |||||||    
T  34364915 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 34365014  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||  |||| || | ||||||| |||| |||||    
T  34365015 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttc 34365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Original strand, 40082398 - 40082556
Alignment:
Q  114 gttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc-------cattgccttaagg 205  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |       |||||||||||||    
T  40082398 gttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcataaattcattgccttaagg 40082497  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||| ||||||||||| | | |||||  ||||||   |||||| ||||||||| ||||    
T  40082498 ttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 259
Target Start/End: Original strand, 9955899 - 9956054
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggat-aaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggaccc---------attgccttaa 203  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||         ||||||||||    
T  9955899 ttgttgtgtgttagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaa 9955998  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||  |||| || |||||||||    
T  9955999 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgat 9956054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37850768 - 37850604
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||        ||  ||||    
T  37850768 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaa 37850669  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||    
T  37850668 ggtttcggataagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggt 37850604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3537302 - 3537232
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3537302 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 3537232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26662066 - 26661919
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||        ||||||||    
T  26662066 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaa 26661967  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaa 251  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  26661966 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaa 26661919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 14318879 - 14319021
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||        ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14318879 ttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 14318978  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | ||||| | |||||  ||||||| |||||| || ||||||||    
T  14318979 tctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 14319021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 45494124 - 45493978
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-----tataagtaagagga--------cccattgccttaaggttttgtgtaagagtgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |     ||||||||||| ||        ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  45494124 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgccttaaagttttggataagagtgt 45494025  T
Q  222 gatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45494024 ggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggt 45493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21378210 - 21378126
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21378210 ttgttgttgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccat 21378126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 29798188 - 29798353
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||||||    
T  29798188 ttgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgcctta 29798287  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| |||  |||||||||| ||| |||||  |  |||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  29798288 aggtcttggataagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggt 29798353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 11977270 - 11977434
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    ||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| || |||        ||||||||    
T  11977270 tgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaa 11977369  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11977370 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 11977434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 34649428 - 34649592
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || ||||||        ||||||||    
T  34649428 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaa 34649527  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||| |  || |||||  || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34649528 ggttttgggtaagagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 34649592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 232
Target Start/End: Original strand, 3550723 - 3550838
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||||||| |||||| |||||    
T  3550723 aagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaagttttgggtaag 3550822  T
Q  217 agtgtgatgtgtctct 232  Q
    |||||| ||| |||||    
T  3550823 agtgtggtgtctctct 3550838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32594871 - 32594748
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| |||||    
T  32594871 aagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 32594772  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtg 240  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||    
T  32594771 agtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 41759486 - 41759637
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||| || ||||        ||||||||||||||| |||||    
T  41759486 aagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaaggttttgggtaag 41759585  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  41759586 agtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggt 41759637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5528900 - 5528843
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5528900 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggac 5528843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35154207 - 35154150
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttg 170  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35154207 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 192
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575174
Alignment:
Q  129 tgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc 192  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 5575174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22077189 - 22077114
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22077189 cattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 22077114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 266
Target Start/End: Original strand, 22793360 - 22793431
Alignment:
Q  195 ttgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  22793360 ttgccttacggttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 66638 - 66475
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaagg 205  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||        || |||||||||    
T  66638 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaagg 66539  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggtt 269  Q
    ||||| |||||||| |   || |||||| ||||||  ||||||| |||||| || |||||||||    
T  66538 ttttgggtaagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtt 66475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39066368 - 39066217
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||        ||||| |||||    
T  39066368 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaa 39066269  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcct 255  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  39066268 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagcct 39066217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 175
Target Start/End: Original strand, 4878796 - 4878855
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacat 175  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4878796 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacat 4878855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32168780 - 32168705
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  32168780 acccattgccttgaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32168705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38804510 - 38804370
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  38804510 aagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttgggtaag 38804411  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcg 257  Q
    |||||  ||| |||||  ||||||  ||||||| |||||||    
T  38804410 agtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47380246 - 47380184
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcct 255  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  47380246 cattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcct 47380184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5320131 - 5320050
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || ||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5320131 ttgttgtatgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccat 5320050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Original strand, 5420643 - 5420802
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgccttaagg 205  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  5420643 ttgttgtatgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 5420742  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5420743 ttttttgtaagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggac 5420802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3038459 - 3038294
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||        |||||||||||||    
T  3038459 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgcctta 3038360  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| |||||||||||   | |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3038359 aggttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 3038294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 9309345 - 9309508
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||    
T  9309345 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaa 9309444  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||| | | ||||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9309445 ggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctctca-gtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 9309508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 147441 - 147524
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  147441 tgttgttgcgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccat 147524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18371802 - 18371663
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagaggacccat-------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18371802 ttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacat---taagtaagaagacccataaacccatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtg 18371706  T
Q  228 tctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||||||| |||||  |||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  18371705 tctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggttc 18371663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 270
Target Start/End: Original strand, 3670063 - 3670216
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||        | ||||||||||||| |||||    
T  3670063 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaag 3670162  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3670163 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttc 3670216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Original strand, 34834866 - 34835026
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||| ||| |||        ||||||||    
T  34834866 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaa 34834965  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  34834966 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 70420 - 70297
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  70420 ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtgtgacg 70321  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttc 249  Q
    | | |||  ||||||| |||||||    
T  70320 tctatcttgcttgtgtggttgttc 70297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 3669690 - 3669837
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||        ||||||||||||||| |||||    
T  3669690 aagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaag 3669789  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  3669790 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3669837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25561790 - 25561725
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattgcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  25561790 ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccattgcc 25561725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45122220 - 45122070
Alignment:
Q  118 ttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttt 208  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||        ||||  ||||||||||    
T  45122220 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttt 45122121  T
Q  209 tgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    || ||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  45122120 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgat 45122070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Original strand, 147819 - 147962
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattgccttaaggttttgt 211  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |||||   | |  ||| |||||||||||||||||     
T  147819 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataacccataa-acctattgccttaaggttttgg 147917  T
Q  212 gtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctc 256  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  147918 gtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctc 147962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6877031 - 6876866
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatat-gtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgcctta 202  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||        ||||| ||||    
T  6877031 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtctta 6876932  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| |||||   |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6876931 gggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 6876866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20870718 - 20870577
Alignment:
Q  136 tatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 226  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||| |||||  |||||||||| |||    
T  20870718 tatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagattttggataagagtgtggtgt 20870619  T
Q  227 gtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     |||||  ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  20870618 ctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggt 20870577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25561985 - 25561901
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25561985 ttgttgttgtctacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccat 25561901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9482750 - 9482606
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |     
T  9482750 ttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtgtggta 9482651  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    | |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9482650 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttc 9482606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 30441084 - 30441236
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-----ataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtg 212  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||     ||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |    
T  30441084 aagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaaggttttggg 30441183  T
Q  213 taagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  30441184 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 30441236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 270
Target Start/End: Original strand, 30359260 - 30359427
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||        |||||| ||||||    
T  30359260 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagcctta 30359359  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||  |||||| || |||| |||||    
T  30359360 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttc 30359427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 34835221 - 34835363
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  34835221 ttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtg 34835320  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |  ||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  34835321 tcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggt 34835363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45121797 - 45121663
Alignment:
Q  140 tgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccatt--------gccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||         |||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  45121797 tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctct 45121698  T
Q  231 ctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    || |||| ||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  45121697 cttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33113535 - 33113390
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||        |||||||||||    
T  33113535 tgttgttgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 33113436  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttc 249  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||||  || |||| |||||||    
T  33113435 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttc 33113390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 40518585 - 40518742
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||        || |||||||||||| |||||    
T  40518585 aagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaag 40518684  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttctctg 274  Q
    ||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  40518685 agtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcctctg 40518742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129142
Alignment:
Q  192 ccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggt 41129142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43274948 - 43274864
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacat-ctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  43274948 ttgttgttgtgtataagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccat 43274864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1014026 - 1013874
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||        ||||||||||  |||||| |||||    
T  1014026 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaag 1013927  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggtt 269  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  1013926 agtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtt 1013874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1514061 - 1514002
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1514061 ttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 1514002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Original strand, 5915946 - 5916021
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5915946 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 5916021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 8794101 - 8794180
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||    
T  8794101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggac 8794180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8918932 - 8918849
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8918932 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccat 8918849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20995566 - 20995425
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagaggacccattgccttaaggttttgtgtaa 215  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||  |     | |||||||||||||||||||| ||||    
T  20995566 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaaca-ctttattt-----gtcccattgccttaaggttttgggtaa 20995473  T
Q  216 gagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgg 263  Q
    || |||| ||| |||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||    
T  20995472 gaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgg 20995425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 264
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122774
Alignment:
Q  137 atatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtg 227  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||     
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  228 tctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 45122774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483189
Alignment:
Q  148 atcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttg 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||        || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  || |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  239 tgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttc 9483189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18372859 - 18372785
Alignment:
Q  121 tgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccca 194  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18372859 tgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 45122996 - 45123077
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  45122996 tgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct-taagtaagatgacccat 45123077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41416317 - 41416256
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  41416317 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccat 41416256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 9608738 - 9608818
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  9608738 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccat 9608818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 269
Target Start/End: Original strand, 30359599 - 30359764
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||        ||||||  ||||||    
T  30359599 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaa 30359698  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggtt 269  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||  ||||||| | | ||||| |||||||||    
T  30359699 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggtt 30359764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 41972151 - 41972231
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  41972151 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccat 41972231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 9308970 - 9309052
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcc--cacatcggataaaagagtgaaggttgaacat-ctataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9308970 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccat 9309052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45122070 - 45121999
Alignment:
Q  121 tgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggac 191  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45122070 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggac 45121999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18372416 - 18372342
Alignment:
Q  121 tgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccca 194  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  18372416 tgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Original strand, 40518147 - 40518225
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||  ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  40518147 acccaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggt 40518225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32640694 - 32640633
Alignment:
Q  114 gttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacat 175  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32640694 gttgttgcgtggaagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacat 32640633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37544658 - 37544496
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    ||||||||||   |||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||        | | ||||    
T  37544658 tgttgttgtgcacaagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaa 37544559  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  37544558 ggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 37544496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4154831 - 4154751
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  4154831 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccat 4154751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Original strand, 9507858 - 9507933
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||| || ||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  9507858 acccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18372140 - 18371996
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||        ||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18372140 ttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggtg 18372041  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    | |||||| ||||||  |||| || |||||| || || |||||||    
T  18372040 tttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttc 18371996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 20130462 - 20130513
Alignment:
Q  136 tatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaaga 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  20130462 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctttaagtaaga 20130513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40579351 - 40579276
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  40579351 acccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 40579276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 172
Target Start/End: Original strand, 6731907 - 6731953
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaa 172  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6731907 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 6731953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40579661 - 40579591
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||| |||||||||  || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40579661 aagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 40579591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 5274854 - 5274907
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttg 246  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  5274854 cattgccttaagattttgagtaagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Original strand, 12283957 - 12284014
Alignment:
Q  199 cttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctc 256  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12283957 cttaaggttttggataagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctc 12284014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18372757 - 18372692
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagaggac 191  Q
    |||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18372757 aagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaacacttataagtaagaggac 18372692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18373077 - 18373020
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  18373077 ttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggac 18373020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1014400 - 1014332
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc 193  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1014400 aagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 1014332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919148
Alignment:
Q  196 tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |  ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggt 8919148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9620755 - 9620682
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  9620755 cattgccttaagattttat--aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggt 9620682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12156740 - 12156704
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 226  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12156740 acccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgt 12156704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 31190007 - 31190161
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattgccttaaggttttgt 211  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  31190007 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccatagccttaaggttttgg 31190106  T
Q  212 gtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||   ||||||| ||||||||| ||||||    
T  31190107 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacg 31190161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39935101 - 39934963
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagagga--------cccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39935101 ttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtgatg 39935002  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    | |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  39935001 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54017982 - 54017820
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaagg 205  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||         |||||||||    
T  54017982 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaagg 54017883  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  54017882 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggt 54017820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25739593 - 25739429
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||        |||||| || |    
T  25739593 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgctttta 25739494  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||    
T  25739493 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggt 25739429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 37726507 - 37726650
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgat 224  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  37726507 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagaggatccattgcctttaggttttggataagagtgtgac 37726606  T
Q  225 gtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    || | ||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37726607 gtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggt 37726650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42342556 - 42342392
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||        |||||| |||||    
T  42342556 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaa 42342457  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||  ||||||| |||||| || ||||||||    
T  42342456 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 42342392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Original strand, 15772842 - 15773008
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgcctt 201  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||        |||||| ||    
T  15772842 attgttgtcgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcttt 15772941  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15772942 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggt 15773008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Original strand, 35946510 - 35946676
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccca--------ttgcctt 201  Q
    |||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||        |||||||    
T  35946510 attgctgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgcctt 35946609  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||  ||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  35946610 aaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggt 35946676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 15773182 - 15773346
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagga--------cccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||        | |||||||||||    
T  15773182 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaa 15773281  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtct--ctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  15773282 agttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 32589693 - 32589857
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggaccc--------attgcctta 202  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||        |||||||||    
T  32589693 ttgttgttgtgtgcaagtgtg-agtatatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 32589791  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  32589792 aggttttgggtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggt 32589857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33803417 - 33803256
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||| |||||||    
T  33803417 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggt 33803318  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     ||| |||||||||||  || || ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33803317 attgggtaagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 33803256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 8327897 - 8328025
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||        |||||||||||    
T  8327897 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggt 8327996  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcac 235  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8327997 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcac 8328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37990807 - 37990643
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||        ||||||||    
T  37990807 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaa 37990708  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  37990707 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggt 37990643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37991145 - 37990981
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        ||| |||||||    
T  37991145 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaa 37991046  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37991045 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 37990981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43346959 - 43346795
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||        |||||||||||    
T  43346959 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaa 43346860  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| |||||| || ||||||||    
T  43346859 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggt 43346795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29645072 - 29644987
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  29645072 attgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccat 29644987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Original strand, 52634665 - 52634816
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagag-------gacccattgccttaa 203  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||        ||||||||||||||    
T  52634665 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagagacccataaacccattgccttaa 52634764  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcct 255  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||  ||||||| |||||    
T  52634765 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcct 52634816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12114731 - 12114566
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||||| ||||    
T  12114731 ttgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtctta 12114632  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  12114631 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggt 12114566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54018366 - 54018202
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||         |||||||    
T  54018366 tgttgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaa 54018267  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  54018266 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggt 54018202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 265
Target Start/End: Original strand, 22304582 - 22304720
Alignment:
Q  136 tatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22304582 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 22304681  T
Q  227 gtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
     |||||  ||||||  ||||||| || |||||| |||||    
T  22304682 ctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggac 22304720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53118142 - 53117979
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg-------acccattgccttaag 204  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||       |||||||||||||||    
T  53118142 tgttgttgtgggcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattcaaaacccattgccttaag 53118043  T
Q  205 gttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     ||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  53118042 attttgggtaagagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggt 53117979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32463069 - 32462904
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaa-ggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgcctta 202  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | || |||||||||| |||        |||||||||||    
T  32463069 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgcctta 32462970  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| || |||||    
T  32462969 aggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggt 32462904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29644749 - 29644666
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29644749 tgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccat 29644666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45395819 - 45395661
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagagga--------cccattgccttaagg 205  Q
    |||||||||| ||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||        ||||||| ||||| |    
T  45395819 ttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatg 45395720  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  45395719 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtgga 45395661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 53577353 - 53577418
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct 177  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53577353 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatct 53577418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 233
Target Start/End: Original strand, 11661525 - 11661639
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccattgccttaaggttttgt 211  Q
    ||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||       ||||||||||||||     
T  11661525 tgttggtgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg-------gccttaaggttttgg 11661617  T
Q  212 gtaagagtgtgatgtgtctctc 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  11661618 gtaagagtgtggtgtctctctc 11661639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 259
Target Start/End: Original strand, 39914241 - 39914397
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||        |||||||    
T  39914241 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgcctta 39914340  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |  |||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  39914341 atattttggataagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgat 39914397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42342258 - 42342094
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||   || |||||||||||||| |||        ||||||||    
T  42342258 tgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaa 42342159  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42342158 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 42342094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22303741 - 22303663
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||   |||||| ||||||||| | ||||||    
T  22303741 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggt 22303663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41359847 - 41359769
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  41359847 acccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggt 41359769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 51886564 - 51886634
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51886564 aagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccat 51886634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Original strand, 43346640 - 43346701
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43346640 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 43346701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46546407 - 46546371
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46546407 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 46546371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 11661941 - 11662096
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||        ||| ||||||||||    
T  11661941 tgttgttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaa 11662040  T
Q  204 gg-ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    || ||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  11662041 ggtttttgggtaagagtgaggtgtctctctca-ttgtgtggttgttctagcctcgat 11662096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 25755384 - 25755463
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  25755384 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggac 25755463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22304037 - 22303963
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  22304037 acccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47964683 - 47964544
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||        |||||||||||    
T  47964683 tgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggt 47964584  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttg 246  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  47964583 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50612607 - 50612541
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  50612607 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggac 50612541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42584968 - 42584907
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  42584968 ttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccat 42584907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49336857 - 49336772
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  49336857 attgttgttgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccat 49336772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21832508 - 21832432
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21832508 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 21832432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Original strand, 22304249 - 22304297
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22304249 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 22304297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39336049 - 39336001
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgt 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  39336049 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgt 39336001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 45901703 - 45901783
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaag-agtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45901703 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 45901783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 246
Target Start/End: Original strand, 25317239 - 25317290
Alignment:
Q  195 ttgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttg 246  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  25317239 ttgccttaaggttttgggtaaaagtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1634491 - 1634441
Alignment:
Q  105 ctgaaaattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggata 155  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1634491 ctgaaagttgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 1634441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3135536 - 3135458
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||| |  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3135536 acccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3135458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 39389073 - 39389143
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  39389073 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccat 39389143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3135219 - 3135158
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  3135219 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccat 3135158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3135629 - 3135568
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  3135629 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaaca 3135568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7767476 - 7767403
Alignment:
Q  119 tgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggac 191  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  7767476 tgtgtgtaagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggac 7767403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50612520 - 50612451
Alignment:
Q  199 cttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||| | ||||||  ||||||||    
T  50612520 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggt 50612451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 9240142 - 9240222
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||| || | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9240142 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccat 9240222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12747918 - 12747878
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggata 155  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12747918 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17731986 - 17731954
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17731986 acccattgccttaaggttttgagtaagagtgtg 17731954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19033217 - 19033185
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19033217 acccattgccttaaggttttgagtaagagtgtg 19033185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32462727 - 32462651
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagt-gaaggttgaacatc-tataagtaaga 187  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  32462727 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaaga 32462651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33175829 - 33175749
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  33175829 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccat 33175749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 54017630 - 54017598
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54017630 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 54017598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Original strand, 7598606 - 7598754
Alignment:
Q  120 gtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccattgccttaaggttttgtgtaagag 218  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||    
T  7598606 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaccttaacgtttttggtaagag 7598705  T
Q  219 tgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacgg 267  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  7598706 tgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36178760 - 36178611
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36178760 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 36178661  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  36178660 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacg 36178611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28254410 - 28254262
Alignment:
Q  108 aaaattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgc 198  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||    
T  28254410 aaaaatgttgttgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgc 28254311  T
Q  199 cttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttc 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||    
T  28254310 cttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctctcttgtggggttgttc 28254262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 15880253 - 15880415
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  15880253 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 15880352  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||  ||||||||| ||||||    
T  15880353 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 6421375 - 6421539
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        || ||||||||| |    
T  6421375 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttga 6421474  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| || |||||| ||||||||    
T  6421475 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggt 6421539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 37106191 - 37106342
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37106191 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaaggttttgggtaag 37106290  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  37106291 agtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggt 37106342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 962591 - 962752
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||        || ||||||||    
T  962591 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggt 962690  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  962691 tttgggtaagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 962752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38796789 - 38796622
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||        |||||||    
T  38796789 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgcctta 38796690  T
Q  203 aggttttgtgtaagag--tgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||| |||||||  ||||  || ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  38796689 aggttttgggtaagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggt 38796622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5542780 - 5542629
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||  |||||    
T  5542780 aagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaag 5542681  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  5542680 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggt 5542629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5543153 - 5543002
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||        ||||||||| ||||| |||||    
T  5543153 aagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaagattttgggtaag 5543054  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5543053 agtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31468914 - 31468797
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagaggacc--------cattgccttaag 204  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||        ||||||||||||    
T  31468914 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatct-ta--taagaggacccataaactcattgccttaag 31468818  T
Q  205 gttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  31468817 gttttgggtaagagtgtgatg 31468797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38796386 - 38796306
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc 192  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  38796386 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacc 38796306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14745822 - 14745674
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14745822 aagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 14745723  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    ||||||  || |||||  |  |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  14745722 agtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggac 14745674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31899594 - 31899511
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31899594 tgttgttgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccat 31899511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 268
Target Start/End: Original strand, 6421811 - 6421885
Alignment:
Q  194 attgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  6421811 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggt 6421885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15511661 - 15511501
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||        |||||||| |||||    
T  15511661 tgttgttgtgtgcaagtgag--ttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaa 15511564  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacg 266  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  15511563 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacg 15511501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 30313170 - 30313309
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagaggacc--------cattgccttaaggt 206  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||||||||| |    
T  30313170 ttgttgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacacttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagat 30313269  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttg 246  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  30313270 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 30313309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 37105927 - 37106078
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||        |||||||||||| ||||| |||||    
T  37105927 aagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagattttgggtaag 37106026  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  |||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37106027 agtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggt 37106078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41283630 - 41283479
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||  |||||    
T  41283630 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttaggtaag 41283531  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||  || |||||   |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  41283530 agtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggt 41283479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36785731 - 36785670
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36785731 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 36785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 40733873 - 40734036
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccatt-------gccttaag 204  Q
    |||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| || |||||||||||| | |||        |||||||     
T  40733873 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataacctacagccttaaa 40733972  T
Q  205 gttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  40733973 gttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggt 40734036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 270
Target Start/End: Original strand, 3672777 - 3672857
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  3672777 acccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttc 3672857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35580886 - 35580728
Alignment:
Q  118 ttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg-------acccattgccttaaggtttt 209  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| | ||||||| |||||       ||||||||||||||||||||    
T  35580886 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggaccataaacccattgccttaaggtttt 35580787  T
Q  210 gtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | ||||||||| |  || |||||   |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35580786 gggtaagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggt 35580728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 42514642 - 42514803
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccatt--------gccttaaggt 206  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||         |||||||| |    
T  42514642 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagat 42514741  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| |||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42514742 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggt 42514803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 16542439 - 16542518
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16542439 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggac 16542518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36006050 - 36005887
Alignment:
Q  110 aattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgcct 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||| | ||||||||||||||||        ||||||||    
T  36006050 aattgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcct 36005952  T
Q  201 taaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||||||||| |||| ||||||  || |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  36005951 taaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Original strand, 40733507 - 40733667
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||          ||||||    
T  40733507 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaa 40733606  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
     |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  40733607 agttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtgga 40733667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Original strand, 29676893 - 29676954
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29676893 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaaca 29676954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29873616 - 29873563
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttg 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  29873616 cattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Original strand, 1769889 - 1769961
Alignment:
Q  120 gtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||    
T  1769889 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggac 1769961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 6712966 - 6713131
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaa 203  Q
    ||||||||| |  |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||        ||||| ||||    
T  6712966 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaa 6713065  T
Q  204 gg-ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  6713066 ggtttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggt 6713131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 7598225 - 7598382
Alignment:
Q  120 gtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccatt--------gccttaaggttttg 210  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||| || ||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||         ||||||||||||||    
T  7598225 gtgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttg 7598324  T
Q  211 tgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     |||||| | || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  7598325 ggtaagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggt 7598382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28531479 - 28531399
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  28531479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccat 28531399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37632762 - 37632682
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  37632762 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccat 37632682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Original strand, 3673147 - 3673222
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3673147 cattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 3673222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Original strand, 6422186 - 6422261
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  6422186 acccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 6422261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 171
Target Start/End: Original strand, 6421294 - 6421352
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttga 171  Q
    |||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6421294 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Original strand, 6421714 - 6421780
Alignment:
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  6421714 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Original strand, 23346312 - 23346390
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23346312 acccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggt 23346390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31259789 - 31259701
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtccca---catcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  31259789 attgttgttgtgtgtaagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccat 31259701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 259
Target Start/End: Original strand, 33731634 - 33731793
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtg-ga-ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcc 199  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||        ||| ||||||    
T  33731634 attgttgttgtgttcaagtgtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgcc 33731733  T
Q  200 ttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||  ||| ||  ||||||| |||||||||    
T  33731734 ttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgat 33731793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40163519 - 40163457
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccatt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  40163519 ttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccatt 40163457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33561616 - 33561486
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||| || |||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||        || ||||||||    
T  33561616 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggt 33561517  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcactt 237  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  33561516 tttgggtaagagtgtgatatctctctcactt 33561486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40679794 - 40679633
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccatt--------gccttaaggt 206  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||         |||||||| |    
T  40679794 tgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagat 40679695  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| |||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||| || |||||| ||||||||    
T  40679694 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggt 40679633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14745440 - 14745344
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||| ||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14745440 ttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 14745344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178175
Alignment:
Q  141 gtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctc 231  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||        ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  232 tcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |  ||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggt 36178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 187
Target Start/End: Original strand, 5367442 - 5367520
Alignment:
Q  110 aattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaaga 187  Q
    ||||| ||||||||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  5367442 aattgatgttgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaaga 5367520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 158
Target Start/End: Original strand, 3673075 - 3673120
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaa 158  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  3673075 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaa 3673120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37895143 - 37895111
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37895143 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37895111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41678445 - 41678401
Alignment:
Q  195 ttgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgt 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  41678445 ttgccttaaggttttgagtaagagtgtaacgtctctctcacttgt 41678401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36492395 - 36492221
Alignment:
Q  103 ttctgaaaattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------c 193  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        |    
T  36492395 ttctaaaaattgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacac 36492296  T
Q  194 attgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36492295 attacctttaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 36492221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 15370086 - 15370253
Alignment:
Q  110 aattgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgcct 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||    
T  15370086 aattgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagcct 15370185  T
Q  201 taaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15370186 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggt 15370253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 32487397 - 32487543
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatctataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaaga 217  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32487397 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 32487496  T
Q  218 gtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||| || |||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  32487497 gtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtgga 32487543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3295509 - 3295349
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaagg 205  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  3295509 ttgttgtgtggaagtgtg-agtatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaagg 3295411  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3295410 ttttg-gtaagagtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 3295349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Original strand, 300948 - 301095
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccattgccttaaggttttg 210  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  300948 ttgtttttgtgtacaagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagagaatccattgccttaagattttt 301047  T
Q  211 tgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcga 258  Q
     ||||||||||| ||| |||||  ||||||| | |||||||| |||||    
T  301048 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcga 301095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40296483 - 40296319
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||||| |    
T  40296483 tgttggtgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttga 40296384  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40296383 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 40296319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 257
Target Start/End: Original strand, 41170646 - 41170777
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41170646 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 41170745  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcg 257  Q
    | | |||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  41170746 tttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 41170777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 25327925 - 25328089
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||        ||||||||    
T  25327925 tgttgttgtgtctaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaa 25328024  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  |  |||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  25328025 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggt 25328089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26074311 - 26074159
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagagg--------acccattgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||        |||||||||||||||||    
T  26074311 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggt 26074212  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| || | |||||||    
T  26074211 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgat 26074159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 6500454 - 6500604
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||    
T  6500454 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttttgggtaag 6500552  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6500553 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 6500604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18603275 - 18603120
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||    
T  18603275 aagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 18603176  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttctc 272  Q
    ||||||   | |||||  ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18603175 agtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggttctc 18603120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 26074602 - 26074757
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||| ||||||  |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  26074602 tgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 26074701  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| || | |||||||    
T  26074702 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgat 26074757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26075332 - 26075247
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26075332 attgttgttgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 26075247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Original strand, 35150002 - 35150141
Alignment:
Q  118 ttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagag-------gacccattgccttaaggtttt 209  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||        | |||||| |||||||||||    
T  35150002 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaagagacccataaatccattgtcttaaggtttt 35150101  T
Q  210 gtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttc 249  Q
    | |||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  35150102 gggtaaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttc 35150141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11417143 - 11417025
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  11417143 tgttgttgtgtgcaagtgag--ttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 11417046  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgat 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11417045 ggttttgtgtaagagtgtgat 11417025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 6224186 - 6224269
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6224186 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 6224269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13415925 - 13415769
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||        ||| |||||||||    
T  13415925 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggt 13415826  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgg 263  Q
    |||| |||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  13415825 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg 13415769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 299479 - 299597
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaa 203  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||        ||| |||||||    
T  299479 tgttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaa 299578  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  299579 ggttttgtgtaagagtgtg 299597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 264
Target Start/End: Original strand, 38427560 - 38427697
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccatt--------gccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  38427560 ttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacg 38427658  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    | |||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||    
T  38427659 tctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 270
Target Start/End: Original strand, 624272 - 624352
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  624272 acccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttc 624352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1028682 - 1028521
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggaccc--------attgccttaaggt 206  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||        ||  |||||||||    
T  1028682 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggt 1028583  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||  |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1028582 ttttggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 1028521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12662821 - 12662745
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaaga 187  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  12662821 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaaga 12662745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42405764 - 42405602
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||| |||        ||||||||    
T  42405764 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaa 42405665  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42405664 ggttttgggtaagagtgtg--gtgtctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 42405602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26074950 - 26074867
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  26074950 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccat 26074867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 35914839 - 35914920
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggaccc 193  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  35914839 tgttgttgtgtataagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagaccc 35914920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3295184 - 3295022
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgt--aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctt 201  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| |        ||||||||||||    
T  3295184 tgttgttgtgtgtgcaagtgtg-agtatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgcctt 3295086  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||| |||||   |||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  3295085 gaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggac 3295022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 6500826 - 6500976
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||        |||||||||||||||  ||||    
T  6500826 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataag 6500924  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  6500925 agtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggt 6500976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27502040
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||        ||||||||||| ||||  ||||     
T  27502191 aagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagatttttggtaaa 27502092  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  27502091 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggt 27502040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34753171 - 34753028
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||| || |||||||||| |||||||        ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  34753171 ttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcg 34753072  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggtt 269  Q
    | |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34753071 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtt 34753028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36568732 - 36568577
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggaccc--------attgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| || |||||| ||| |||||        |||||||||||||    
T  36568732 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggt 36568633  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||  |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  36568632 ttttggtaagagtgtg--gcgtctctctcttgtgtggttgttctatcctcgatgtgga 36568577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 42508604 - 42508681
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42508604 ttgttgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggac 42508681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 41632775 - 41632855
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41632775 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 41632855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Original strand, 623901 - 623960
Alignment:
Q  197 gccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  623901 gccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctc 623960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26590986 - 26590912
Alignment:
Q  196 tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  26590986 tgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttc 26590912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 162
Target Start/End: Original strand, 35150737 - 35150786
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagt 162  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35150737 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagt 35150786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 162
Target Start/End: Original strand, 35151028 - 35151077
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagt 162  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35151028 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagt 35151077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 270
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747927
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | | |||||||||||||        || |||||||||||| |||||  |||||||||| ||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    | |||||  ||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggttc 33747927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Original strand, 15370478 - 15370556
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||   |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15370478 acccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggt 15370556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36522319 - 36522269
Alignment:
Q  190 acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtg 240  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36522319 acccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtg 36522269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9498800 - 9498739
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9498800 ttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 9498739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 31509615 - 31509692
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggac 191  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| || | ||||||| |||||||    
T  31509615 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggac 31509692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36527174 - 36527126
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgt 241  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36527174 cattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgt 36527126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1950353 - 1950200
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat--------tgccttaa 203  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||||        ||||||||    
T  1950353 tgttgttgcgtataagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaa 1950254  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcg 257  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  1950253 ggttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2580041 - 2579880
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat--------tgcctta 202  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||         ||||||    
T  2580041 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagcctta 2579942  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  2579941 aggttttgggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 2579880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10074528 - 10074371
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  10074528 tgttgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 10074429  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  10074428 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 10074371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 29518506 - 29518657
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29518506 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 29518605  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29518606 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 29518657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 29518923 - 29519074
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29518923 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 29519022  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29519023 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 29519074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 32741182 - 32741333
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32741182 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 32741281  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32741282 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 32741333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2578610 - 2578447
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        |||||| |||||||    
T  2578610 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 2578512  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2578511 ggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 2578447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 264
Target Start/End: Original strand, 2377742 - 2377904
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctt 201  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||    
T  2377742 attgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 2377841  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| || ||| ||| ||||||||| ||||    
T  2377842 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtgga 2377904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 259
Target Start/End: Original strand, 3409262 - 3409404
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||    
T  3409262 aagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaag 3409361  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| |||||||||    
T  3409362 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 3409404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5832172 - 5832031
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat-------tgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||         ||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  5832172 ttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagccaccccttaagattttgggtaaaagtgtggtgt 5832073  T
Q  227 gtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
     ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  5832072 ctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggt 5832031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 16454897 - 16455061
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggaccc--------attgccttaa 203  Q
    |||||||||||  || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  16454897 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaa 16454996  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16454997 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 16455061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 2378129 - 2378280
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||  |||||    
T  2378129 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaag 2378228  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | |||| ||| |||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2378229 aatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggt 2378280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 35210207 - 35210358
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||    
T  35210207 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttttgggtaag 35210306  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| ||| |  ||||||  |||| || ||||||||| ||||||||    
T  35210307 agtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggt 35210358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14748493 - 14748346
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||        |||||| ||||||||||| |||||    
T  14748493 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgggtaag 14748394  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||    ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14748393 agtgtg----gtctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 14748346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9062518 - 9062438
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    ||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9062518 ttgttattgtgtataaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggac 9062438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 259
Target Start/End: Original strand, 16107667 - 16107823
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggac--------ccattgcctta 202  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||        |||||||||||    
T  16107667 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgcctta 16107766  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| || |||||||||    
T  16107767 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgat 16107823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 1846751 - 1846902
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac--------ccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||        |||||||||||||||||||  ||||    
T  1846751 aagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttggataag 1846850  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| ||| |  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1846851 agtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 1846902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 232
Target Start/End: Original strand, 26544052 - 26544167
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat--------tgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||    
T  26544052 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttttgagtaag 26544151  T
Q  217 agtgtgatgtgtctct 232  Q
    |||||||||| |||||    
T  26544152 agtgtgatgtctctct 26544167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 593879 - 593798
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggac 191  Q
    ||||||| || ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  593879 attgttgctgagtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 593798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Original strand, 3058238 - 3058344
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3058238 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 3058337  T
Q  226 tgtctct 232  Q
    | |||||    
T  3058338 tctctct 3058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10073779 - 10073620
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||        || |||||| |    
T  10073779 tgttgtgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagat 10073682  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10073681 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggt 10073620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Original strand, 10911558 - 10911720
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaaga-gtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaagg 205  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||        |||||||| |    
T  10911558 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaag 10911657  T
Q  206 ttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10911658 ttttgaataagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10074156 - 10073995
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatct-ataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||| || ||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  10074156 tgttgtgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 10074057  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||| |||| |||||| ||| |||||| ||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  10074056 tttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggt 10073995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32460726 - 32460629
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtga 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32460726 ttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtga 32460629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12085114 - 12085047
Alignment:
Q  192 ccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12085114 ccatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 12085047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 16108053 - 16108136
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16108053 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccat 16108136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 16454565 - 16454729
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  16454565 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16454664  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    | |||||  ||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16454665 gattttggataagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 16454729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 3409663 - 3409814
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaag 216  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||        |||||||||||| |  ||||| |||||    
T  3409663 aagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaag 3409762  T
Q  217 agtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3409763 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3409814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12071765 - 12071695
Alignment:
Q  198 ccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  12071765 ccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggt 12071695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Original strand, 2843634 - 2843709
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggt 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2843634 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggt 2843709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Original strand, 3415470 - 3415593
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  3415470 ttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtg 3415569  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttc 249  Q
    | |||||  ||||||  |||||||    
T  3415570 tctctcttgcttgtgcggttgttc 3415593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2579273 - 2579212
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca 174  Q
    |||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2579273 tgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaaca 2579212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 259
Target Start/End: Original strand, 1127372 - 1127505
Alignment:
Q  135 ttatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatg 225  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |    
T  1127372 ttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcg 1127471  T
Q  226 tgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgat 259  Q
    | ||||| |||| ||| |||| || | |||||||    
T  1127472 tctctcttacttatgtggttgctctaacctcgat 1127505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12092647 - 12092514
Alignment:
Q  116 tgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaaca-tctataagtaagaggacccat--------tgccttaaggt 206  Q
    ||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| || | ||||||| |||||| ||||        |||||||||||    
T  12092647 tgttgtgtgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggt 12092548  T
Q  207 tttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtg 240  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  12092547 tttgagtaagactgtggtgtctctctcacttgtg 12092514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6999964 - 6999881
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  6999964 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccat 6999881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2579571 - 2579494
Alignment:
Q  193 cattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||  ||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  2579571 cattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttc 2579494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 684 - 522
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgcctt 201  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||        ||||||||||||    
T  684 attgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 585  T
Q  202 aaggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatgga 264  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||| || ||| ||| ||||||||| ||||    
T  584 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtgga 522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 297 - 230
Alignment:
Q  126 aagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc 192  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  297 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1274 - 1108
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagagg--------acccattgccttaa 203  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||        ||||||||||||||    
T  1274 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaa 1175  T
Q  204 ggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggacggttc 270  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||||   || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1174 ggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttc 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3153 - 3091
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacat 175  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3153 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacat 3091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 5767 - 5850
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5767 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 5850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 5384 - 5469
Alignment:
Q  111 attgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  5384 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 5469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Original strand, 5349 - 5430
Alignment:
Q  115 ttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5349 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 5430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 265
Target Start/End: Original strand, 4971 - 5133
Alignment:
Q  112 ttgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacc--------cattgcctta 202  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||| |||||| || ||| ||||||||| | ||||        ||||||||||    
T  4971 ttgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgcctta 5070  T
Q  203 aggttttgtgtaagagtgtgatgtgtctctcacttgtgtcgttgttcaagcctcgatatggac 265  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||  |||| || ||||||||| |||||    
T  5071 tggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17624 - 17541
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17624 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccat 17541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10279 - 10196
Alignment:
Q  113 tgttgttgtgtgtaagtgtggattatatgtcccacatcggataaaagagtgaaggttgaacatc-tataagtaagaggacccat 195  Q
    ||||||||||   |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  || || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10279 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccat 10196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University