View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11651_low_7 (Length: 715)

Name: NF11651_low_7
Description: NF11651
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11651_low_7
NF11651_low_7
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (20-348)||(19456333-19456661)
chr2 (388-709)||(19456701-19457022)
chr2 (17-348)||(21703073-21703404)
chr2 (388-709)||(21703444-21703765)
chr2 (15-348)||(34303210-34303543)
chr2 (25-348)||(3784655-3784978)
chr2 (24-348)||(27118689-27119013)
chr2 (25-348)||(16163600-16163923)
chr2 (25-348)||(34157012-34157334)
chr2 (25-348)||(31891245-31891568)
chr2 (20-345)||(27392973-27393298)
chr2 (407-697)||(27434746-27435036)
chr2 (388-709)||(27392630-27392951)
chr2 (15-348)||(23128473-23128806)
chr2 (15-348)||(27434351-27434684)
chr2 (15-348)||(28882215-28882548)
chr2 (15-348)||(12655543-12655876)
chr2 (407-708)||(23128868-23129169)
chr2 (15-345)||(40233515-40233845)
chr2 (15-348)||(20837919-20838252)
chr2 (407-708)||(28881852-28882153)
chr2 (15-348)||(22925935-22926268)
chr2 (15-345)||(9349889-9350219)
chr2 (407-708)||(20837556-20837857)
chr2 (407-708)||(12655180-12655481)
chr2 (15-348)||(11635093-11635426)
chr2 (15-348)||(21677089-21677422)
chr2 (15-345)||(13936451-13936781)
chr2 (15-348)||(11641282-11641615)
chr2 (15-345)||(12586814-12587144)
chr2 (15-348)||(34861681-34862014)
chr2 (15-348)||(37685816-37686149)
chr2 (15-348)||(37701081-37701414)
chr2 (15-348)||(37925494-37925827)
chr2 (15-347)||(37375163-37375495)
chr2 (15-345)||(27777226-27777556)
chr2 (15-345)||(27816984-27817314)
chr2 (388-522)||(31891608-31891742)
chr2 (50-348)||(34286355-34286653)
chr2 (50-348)||(34291415-34291713)
chr2 (15-345)||(12716509-12716839)
chr2 (388-522)||(27118515-27118649)
chr2 (15-345)||(39051729-39052059)
chr2 (15-348)||(16829245-16829578)
chr2 (15-348)||(16891903-16892236)
chr2 (15-348)||(31876282-31876615)
chr2 (15-348)||(32049799-32050132)
chr2 (398-522)||(3784481-3784605)
chr2 (398-522)||(34156838-34156962)
chr2 (18-345)||(27803711-27804038)
chr2 (407-522)||(34303602-34303717)
chr2 (134-348)||(34279450-34279664)
chr2 (15-339)||(260660-260984)
chr2 (398-522)||(16163426-16163550)
chr2 (410-708)||(34279087-34279385)
chr2 (410-657)||(13936849-13937096)
chr2 (410-624)||(21677487-21677701)
chr2 (15-348)||(39890075-39890408)
chr2 (524-708)||(37374799-37374983)
chr2 (410-657)||(261070-261317)
chr2 (410-708)||(11635494-11635792)
chr2 (410-708)||(11641683-11641981)
chr2 (410-657)||(34286043-34286290)
chr2 (410-657)||(34291103-34291350)
chr2 (443-625)||(12716943-12717125)
chr2 (410-657)||(37925182-37925429)
chr2 (518-657)||(12586490-12586629)
chr2 (518-625)||(31876002-31876109)
chr2 (518-625)||(34861401-34861508)
chr2 (518-625)||(37686322-37686429)
chr2 (518-625)||(37701587-37701694)
chr2 (518-625)||(39889783-39889890)
chr2 (410-657)||(40233188-40233435)
chr2 (15-273)||(19416406-19416664)
chr2 (410-618)||(32049526-32049734)
chr2 (518-657)||(9350407-9350546)
chr2 (530-625)||(16829763-16829858)
chr2 (530-625)||(16891623-16891718)
chr2 (518-657)||(27776896-27777035)
chr2 (518-657)||(27803381-27803520)
chr2 (518-657)||(27816663-27816802)
chr2 (518-648)||(19416912-19417042)
chr2 (518-624)||(22926441-22926547)
chr2 (404-657)||(39052127-39052380)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (20-348)||(15284851-15285179)
chr4 (17-348)||(15227890-15228221)
chr4 (388-707)||(15285219-15285538)
chr4 (388-709)||(15227529-15227850)
chr4 (2-348)||(1900277-1900623)
chr4 (388-709)||(1899916-1900237)
chr4 (25-348)||(24460533-24460856)
chr4 (20-348)||(14235448-14235776)
chr4 (50-345)||(15391291-15391586)
chr4 (388-709)||(14235819-14236140)
chr4 (15-348)||(17014020-17014353)
chr4 (407-708)||(14664675-14664976)
chr4 (15-348)||(24592232-24592565)
chr4 (15-348)||(14665038-14665371)
chr4 (407-708)||(17013657-17013958)
chr4 (412-709)||(15391650-15391948)
chr4 (15-348)||(5005893-5006226)
chr4 (15-348)||(14763222-14763555)
chr4 (407-708)||(24592624-24592925)
chr4 (15-348)||(6569873-6570206)
chr4 (15-347)||(18800531-18800863)
chr4 (15-347)||(36344433-36344765)
chr4 (15-348)||(14098561-14098894)
chr4 (15-348)||(31126436-31126769)
chr4 (15-348)||(40105556-40105889)
chr4 (15-345)||(33673716-33674046)
chr4 (15-348)||(27163235-27163568)
chr4 (15-345)||(30753777-30754107)
chr4 (46-348)||(34188909-34189211)
chr4 (46-348)||(24112682-24112984)
chr4 (407-708)||(6569510-6569811)
chr4 (398-522)||(24460906-24461030)
chr4 (15-347)||(54833408-54833740)
chr4 (15-345)||(39850661-39850991)
chr4 (399-708)||(14763609-14763918)
chr4 (399-708)||(36344817-36345126)
chr4 (426-708)||(19372918-19373200)
chr4 (410-708)||(27163633-27163931)
chr4 (416-657)||(54833098-54833339)
chr4 (410-708)||(5005527-5005825)
chr4 (443-708)||(14098198-14098463)
chr4 (15-348)||(21969721-21970054)
chr4 (410-625)||(30753482-30753697)
chr4 (443-625)||(31126867-31127049)
chr4 (443-648)||(18800971-18801176)
chr4 (518-648)||(33674234-33674364)
chr4 (518-696)||(40106062-40106240)
chr4 (410-625)||(21969441-21969656)
chr4 (518-657)||(39850331-39850470)
chr4 (399-547)||(24112483-24112631)
chr4 (399-547)||(34189262-34189410)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (20-348)||(16626470-16626798)
chr3 (17-348)||(18530354-18530685)
chr3 (388-709)||(16626838-16627158)
chr3 (388-709)||(18529999-18530320)
chr3 (15-348)||(31034076-31034409)
chr3 (15-348)||(32292718-32293051)
chr3 (25-348)||(4625910-4626233)
chr3 (25-348)||(17993753-17994076)
chr3 (24-348)||(5652353-5652677)
chr3 (407-697)||(15893060-15893350)
chr3 (15-348)||(8295938-8296271)
chr3 (15-348)||(15892665-15892998)
chr3 (15-348)||(18330635-18330968)
chr3 (25-345)||(5713196-5713516)
chr3 (25-345)||(5724106-5724426)
chr3 (25-345)||(5757051-5757371)
chr3 (25-345)||(5767942-5768262)
chr3 (407-708)||(8301618-8301919)
chr3 (15-348)||(15741053-15741386)
chr3 (15-348)||(18051228-18051561)
chr3 (15-348)||(22387537-22387870)
chr3 (15-348)||(4796612-4796945)
chr3 (15-348)||(8301226-8301559)
chr3 (15-348)||(6192282-6192615)
chr3 (407-708)||(8295578-8295879)
chr3 (407-708)||(18050865-18051166)
chr3 (15-348)||(29148714-29149047)
chr3 (15-348)||(4721597-4721930)
chr3 (407-708)||(4797007-4797308)
chr3 (407-708)||(15741436-15741737)
chr3 (15-348)||(7073178-7073511)
chr3 (15-348)||(35880732-35881065)
chr3 (15-348)||(4416885-4417218)
chr3 (15-348)||(10396099-10396432)
chr3 (15-348)||(28115913-28116246)
chr3 (407-708)||(35880369-35880670)
chr3 (15-348)||(18277011-18277344)
chr3 (15-348)||(18292312-18292645)
chr3 (15-348)||(18307613-18307946)
chr3 (410-708)||(4721234-4721532)
chr3 (15-345)||(11110308-11110638)
chr3 (15-345)||(29664929-29665259)
chr3 (15-345)||(36997036-36997366)
chr3 (15-348)||(17984915-17985248)
chr3 (407-708)||(29149109-29149410)
chr3 (15-348)||(31964432-31964765)
chr3 (15-348)||(50134030-50134363)
chr3 (15-347)||(6542421-6542753)
chr3 (15-346)||(5466953-5467284)
chr3 (15-345)||(48465896-48466226)
chr3 (15-348)||(4346646-4346979)
chr3 (15-348)||(5609281-5609614)
chr3 (407-708)||(18330277-18330573)
chr3 (15-348)||(21674659-21674992)
chr3 (15-348)||(28021241-28021574)
chr3 (15-348)||(28339268-28339601)
chr3 (410-708)||(6191919-6192217)
chr3 (15-345)||(20576806-20577136)
chr3 (15-339)||(8211713-8212037)
chr3 (15-285)||(51782052-51782322)
chr3 (399-708)||(8211344-8211653)
chr3 (15-348)||(22870815-22871148)
chr3 (15-348)||(22885874-22886207)
chr3 (15-348)||(47023419-47023752)
chr3 (398-522)||(17994126-17994250)
chr3 (410-708)||(28116314-28116612)
chr3 (407-522)||(4625736-4625851)
chr3 (15-285)||(51797141-51797412)
chr3 (410-708)||(7072815-7073113)
chr3 (46-348)||(32439120-32439422)
chr3 (15-348)||(7996528-7996861)
chr3 (15-348)||(10643036-10643369)
chr3 (399-708)||(18277398-18277707)
chr3 (399-708)||(18292699-18293008)
chr3 (399-708)||(18308000-18308309)
chr3 (46-347)||(20066010-20066311)
chr3 (15-347)||(5596316-5596648)
chr3 (398-522)||(5652179-5652303)
chr3 (15-347)||(18242706-18243038)
chr3 (399-618)||(20065739-20065958)
chr3 (399-697)||(10395750-10396048)
chr3 (410-708)||(47023056-47023354)
chr3 (15-339)||(5013687-5014011)
chr3 (443-657)||(22871264-22871478)
chr3 (443-657)||(22886323-22886537)
chr3 (443-624)||(5466672-5466853)
chr3 (443-648)||(5596756-5596961)
chr3 (410-522)||(5713016-5713128)
chr3 (410-522)||(5723926-5724038)
chr3 (410-522)||(5757439-5757551)
chr3 (410-522)||(5768330-5768442)
chr3 (410-660)||(7996213-7996463)
chr3 (410-660)||(10642721-10642971)
chr3 (443-625)||(18224877-18225059)
chr3 (15-348)||(18225157-18225490)
chr3 (419-708)||(21674296-21674585)
chr3 (530-708)||(5013315-5013493)
chr3 (518-696)||(6542939-6543117)
chr3 (443-625)||(17985346-17985528)
chr3 (15-273)||(24328200-24328458)
chr3 (443-625)||(28020964-28021146)
chr3 (410-648)||(36997446-36997684)
chr3 (524-625)||(4347155-4347256)
chr3 (149-348)||(4893176-4893375)
chr3 (410-657)||(11110718-11110965)
chr3 (518-657)||(18242381-18242520)
chr3 (518-657)||(20577327-20577466)
chr3 (518-648)||(51781674-51781804)
chr3 (518-624)||(4416603-4416709)
chr3 (518-648)||(24327822-24327952)
chr3 (518-624)||(28338989-28339095)
chr3 (518-624)||(31964938-31965044)
chr3 (518-624)||(50134536-50134642)
chr3 (410-594)||(29665342-29665526)
chr3 (518-621)||(5609787-5609890)
chr3 (518-648)||(51796762-51796893)
chr3 (399-547)||(22387921-22388069)
chr3 (518-657)||(48465569-48465708)
chr3 (399-697)||(32438771-32439069)
chr3 (399-547)||(4892977-4893125)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (15-348)||(2576-2909)
scaffold0260 (388-522)||(2949-3083)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (15-348)||(20340253-20340586)
chr1 (17-348)||(20461085-20461416)
chr1 (388-709)||(20460748-20461069)
chr1 (17-348)||(16207951-16208282)
chr1 (15-348)||(28151866-28152199)
chr1 (388-709)||(16208319-16208640)
chr1 (15-348)||(10962674-10963007)
chr1 (15-348)||(41793226-41793559)
chr1 (15-348)||(28584985-28585318)
chr1 (15-348)||(51638222-51638555)
chr1 (388-522)||(20340626-20340760)
chr1 (410-708)||(41793624-41793922)
chr1 (518-657)||(10962362-10962501)
chr1 (518-657)||(51637910-51638049)
chr1 (443-648)||(28584682-28584887)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (23-348)||(16449810-16450135)
chr7 (17-348)||(16041329-16041660)
chr7 (388-697)||(16040980-16041289)
chr7 (15-348)||(26484700-26485033)
chr7 (25-348)||(31088278-31088601)
chr7 (391-709)||(16450178-16450496)
chr7 (23-348)||(2108817-2109142)
chr7 (15-348)||(2775365-2775698)
chr7 (15-348)||(39210827-39211160)
chr7 (25-348)||(45733466-45733789)
chr7 (407-708)||(16518615-16518916)
chr7 (407-708)||(16503579-16503880)
chr7 (15-219)||(26682804-26683008)
chr7 (15-219)||(4200682-4200886)
chr7 (13-348)||(5127998-5128333)
chr7 (15-348)||(11424580-11424913)
chr7 (16-348)||(16518221-16518553)
chr7 (46-348)||(18540805-18541107)
chr7 (15-348)||(10916672-10917005)
chr7 (16-348)||(16503185-16503517)
chr7 (15-348)||(2154579-2154912)
chr7 (407-708)||(2154216-2154517)
chr7 (407-708)||(5127635-5127936)
chr7 (15-348)||(5147144-5147477)
chr7 (15-348)||(26274898-26275231)
chr7 (407-708)||(10917064-10917365)
chr7 (15-345)||(3445315-3445645)
chr7 (15-348)||(4144927-4145260)
chr7 (407-708)||(11424975-11425276)
chr7 (15-348)||(26435263-26435596)
chr7 (15-348)||(26319673-26320006)
chr7 (15-347)||(31564194-31564526)
chr7 (15-348)||(9618657-9618990)
chr7 (15-348)||(26669718-26670051)
chr7 (15-348)||(45387349-45387682)
chr7 (15-339)||(11441587-11441911)
chr7 (15-345)||(26537674-26538004)
chr7 (15-348)||(16736264-16736597)
chr7 (15-348)||(16751318-16751651)
chr7 (15-348)||(17523538-17523871)
chr7 (15-348)||(17529344-17529677)
chr7 (398-522)||(31088651-31088775)
chr7 (398-522)||(45733292-45733416)
chr7 (15-273)||(24592345-24592603)
chr7 (410-660)||(45387034-45387284)
chr7 (410-708)||(5147542-5147840)
chr7 (410-708)||(16736662-16736960)
chr7 (410-708)||(16751716-16752014)
chr7 (410-708)||(17523175-17523473)
chr7 (410-708)||(17529742-17530040)
chr7 (15-347)||(31124927-31125259)
chr7 (46-348)||(5159525-5159827)
chr7 (518-708)||(31124554-31124744)
chr7 (410-648)||(11441263-11441501)
chr7 (518-708)||(24592851-24593041)
chr7 (399-624)||(4145314-4145539)
chr7 (518-657)||(9618345-9618484)
chr7 (518-625)||(26275404-26275511)
chr7 (410-708)||(26434900-26435198)
chr7 (518-623)||(26320179-26320284)
chr7 (518-625)||(3445020-3445127)
chr7 (410-625)||(26485946-26486161)
chr7 (410-657)||(26538075-26538322)
chr7 (518-657)||(26670224-26670363)
chr7 (518-625)||(31564709-31564816)
chr7 (399-547)||(5159326-5159474)
[»] chr6 (90 HSPs)
chr6 (15-348)||(22456795-22457128)
chr6 (15-348)||(14143146-14143479)
chr6 (15-348)||(26787946-26788279)
chr6 (15-348)||(27196319-27196652)
chr6 (15-348)||(27252588-27252921)
chr6 (25-348)||(33374127-33374450)
chr6 (20-348)||(13521939-13522267)
chr6 (25-348)||(8892182-8892504)
chr6 (25-348)||(8903417-8903739)
chr6 (25-348)||(28162659-28162982)
chr6 (15-348)||(27290231-27290564)
chr6 (122-348)||(22477241-22477467)
chr6 (20-347)||(20160704-20161031)
chr6 (20-347)||(22171800-22172127)
chr6 (15-348)||(22934741-22935074)
chr6 (15-348)||(23857186-23857519)
chr6 (15-345)||(27272441-27272771)
chr6 (15-348)||(26918382-26918715)
chr6 (15-348)||(26989003-26989336)
chr6 (18-348)||(16749856-16750186)
chr6 (401-709)||(20160345-20160650)
chr6 (401-709)||(22172181-22172486)
chr6 (15-348)||(13298812-13299145)
chr6 (407-708)||(13299207-13299508)
chr6 (15-348)||(24304479-24304812)
chr6 (407-708)||(24863356-24863657)
chr6 (407-708)||(15424573-15424874)
chr6 (15-348)||(24863719-24864052)
chr6 (410-708)||(22935136-22935434)
chr6 (410-708)||(23857581-23857879)
chr6 (407-708)||(26988640-26988941)
chr6 (407-708)||(26999712-27000013)
chr6 (29-348)||(27000075-27000394)
chr6 (15-348)||(15424178-15424511)
chr6 (15-348)||(29549477-29549810)
chr6 (407-657)||(24304874-24305124)
chr6 (407-708)||(16749493-16749794)
chr6 (407-551)||(22477529-22477673)
chr6 (410-657)||(26918070-26918317)
chr6 (15-347)||(4773009-4773341)
chr6 (15-348)||(29573015-29573348)
chr6 (15-347)||(4525289-4525621)
chr6 (15-347)||(4757767-4758099)
chr6 (15-345)||(16674144-16674474)
chr6 (15-339)||(4545636-4545960)
chr6 (15-347)||(27007730-27008062)
chr6 (15-345)||(3696086-3696416)
chr6 (15-345)||(34463207-34463537)
chr6 (14-347)||(27359852-27360185)
chr6 (14-347)||(27450195-27450528)
chr6 (15-339)||(4723995-4724319)
chr6 (15-339)||(28207465-28207789)
chr6 (388-522)||(28162485-28162619)
chr6 (15-348)||(30557877-30558210)
chr6 (398-522)||(13522317-13522441)
chr6 (398-522)||(33374500-33374624)
chr6 (15-347)||(17025280-17025612)
chr6 (388-522)||(8892544-8892678)
chr6 (388-522)||(8903779-8903913)
chr6 (15-347)||(27044390-27044723)
chr6 (399-708)||(29549117-29549426)
chr6 (15-347)||(26116271-26116603)
chr6 (15-347)||(29501418-29501750)
chr6 (14-348)||(26777475-26777809)
chr6 (15-273)||(16943888-16944146)
chr6 (399-708)||(27044029-27044338)
chr6 (15-347)||(27485132-27485464)
chr6 (410-708)||(3695702-3696000)
chr6 (439-625)||(4525011-4525197)
chr6 (15-141)||(17092301-17092427)
chr6 (443-708)||(17024901-17025166)
chr6 (518-625)||(4757483-4757590)
chr6 (518-657)||(4772687-4772826)
chr6 (518-657)||(27007402-27007541)
chr6 (518-657)||(27484807-27484946)
chr6 (518-625)||(29572735-29572842)
chr6 (443-657)||(29501096-29501310)
chr6 (443-625)||(30558308-30558490)
chr6 (518-657)||(34463728-34463867)
chr6 (518-708)||(4546151-4546341)
chr6 (518-648)||(16944394-16944524)
chr6 (518-708)||(28207081-28207271)
chr6 (443-624)||(26777919-26778100)
chr6 (518-625)||(27360377-27360484)
chr6 (518-625)||(27450720-27450827)
chr6 (518-657)||(16673817-16673956)
chr6 (518-696)||(4724510-4724688)
chr6 (524-625)||(26116792-26116893)
chr6 (410-696)||(27629968-27630254)
chr6 (515-696)||(27272947-27273128)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (388-709)||(20053-20374)
scaffold0124 (17-348)||(20393-20723)
scaffold0124 (407-708)||(30095-30396)
scaffold0124 (15-273)||(30532-30790)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (17-348)||(22888484-22888815)
chr5 (17-348)||(25199043-25199374)
chr5 (25-348)||(13184473-13184796)
chr5 (15-348)||(23892220-23892553)
chr5 (15-348)||(29888897-29889230)
chr5 (20-348)||(33877261-33877589)
chr5 (25-348)||(13440319-13440642)
chr5 (25-348)||(11325808-11326131)
chr5 (388-710)||(23891855-23892177)
chr5 (388-709)||(25198682-25199003)
chr5 (407-708)||(24688367-24688668)
chr5 (15-348)||(24687972-24688305)
chr5 (15-348)||(23752265-23752598)
chr5 (15-348)||(33777501-33777834)
chr5 (15-348)||(11549368-11549701)
chr5 (15-348)||(23717803-23718136)
chr5 (15-348)||(30934647-30934980)
chr5 (15-348)||(9548358-9548691)
chr5 (15-348)||(24970032-24970365)
chr5 (15-348)||(22998929-22999262)
chr5 (407-708)||(23752660-23752961)
chr5 (407-708)||(30934287-30934588)
chr5 (514-708)||(24951761-24951955)
chr5 (407-708)||(23718198-23718500)
chr5 (407-708)||(11549005-11549306)
chr5 (15-348)||(15658575-15658908)
chr5 (388-545)||(22888287-22888444)
chr5 (15-347)||(37671298-37671630)
chr5 (407-708)||(33777138-33777439)
chr5 (407-707)||(22999324-22999624)
chr5 (15-347)||(28649250-28649582)
chr5 (15-348)||(8665290-8665623)
chr5 (15-348)||(9317465-9317798)
chr5 (15-348)||(12132169-12132502)
chr5 (15-348)||(15758672-15759005)
chr5 (15-348)||(30152032-30152365)
chr5 (15-339)||(31431463-31431787)
chr5 (15-345)||(31826222-31826552)
chr5 (15-348)||(2511065-2511398)
chr5 (15-348)||(26480406-26480739)
chr5 (23-347)||(18500553-18500877)
chr5 (15-348)||(6874319-6874652)
chr5 (15-348)||(18375227-18375560)
chr5 (15-347)||(37358458-37358790)
chr5 (14-348)||(32599286-32599620)
chr5 (15-348)||(30168483-30168816)
chr5 (15-345)||(24681457-24681787)
chr5 (15-345)||(24723984-24724314)
chr5 (15-345)||(40473364-40473694)
chr5 (46-348)||(41674723-41675025)
chr5 (15-345)||(43078269-43078599)
chr5 (15-348)||(5637924-5638257)
chr5 (15-348)||(33516370-33516703)
chr5 (15-348)||(34616532-34616865)
chr5 (398-522)||(13184846-13184970)
chr5 (15-347)||(13324644-13324976)
chr5 (398-522)||(13440692-13440816)
chr5 (398-522)||(33877087-33877211)
chr5 (15-347)||(37770802-37771134)
chr5 (15-347)||(3789556-3789888)
chr5 (15-347)||(37754995-37755327)
chr5 (410-657)||(9548756-9549003)
chr5 (388-522)||(11325634-11325768)
chr5 (410-708)||(15658973-15659271)
chr5 (46-348)||(33292539-33292841)
chr5 (410-648)||(41674420-41674658)
chr5 (14-348)||(28959600-28959934)
chr5 (15-273)||(29966881-29967139)
chr5 (15-273)||(30029504-30029762)
chr5 (410-657)||(31431130-31431377)
chr5 (443-657)||(2510753-2510967)
chr5 (410-624)||(8665688-8665902)
chr5 (518-696)||(40473873-40474051)
chr5 (518-657)||(9317153-9317292)
chr5 (410-657)||(30168171-30168418)
chr5 (443-625)||(24681171-24681353)
chr5 (443-625)||(24723698-24723880)
chr5 (410-708)||(43077900-43078198)
chr5 (443-708)||(18375658-18375923)
chr5 (518-657)||(6874004-6874143)
chr5 (518-625)||(12131889-12131996)
chr5 (410-657)||(18500961-18501208)
chr5 (518-625)||(37771320-37771427)
chr5 (410-708)||(3789177-3789475)
chr5 (518-708)||(5637561-5637751)
chr5 (518-660)||(15759178-15759320)
chr5 (407-505)||(24969878-24969976)
chr5 (530-708)||(30151669-30151847)
chr5 (518-696)||(37358976-37359154)
chr5 (518-657)||(26480094-26480233)
chr5 (518-625)||(31826740-31826847)
chr5 (518-625)||(37671813-37671920)
chr5 (518-657)||(37754670-37754809)
chr5 (443-625)||(33516090-33516272)
chr5 (443-657)||(34616223-34616437)
chr5 (443-625)||(32599715-32599897)
chr5 (518-657)||(13325165-13325304)
chr5 (530-648)||(28648937-28649055)
chr5 (519-625)||(28960120-28960226)
chr5 (518-648)||(29967387-29967517)
chr5 (518-648)||(30029126-30029256)
chr5 (399-547)||(33292340-33292488)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (24-348)||(19658926-19659249)
chr8 (25-348)||(44563106-44563427)
chr8 (24-348)||(33244670-33244994)
chr8 (50-345)||(22080790-22081085)
chr8 (15-348)||(9354627-9354961)
chr8 (407-708)||(16283091-16283392)
chr8 (15-348)||(16283454-16283787)
chr8 (15-348)||(19688103-19688436)
chr8 (15-348)||(27608782-27609115)
chr8 (407-708)||(16277196-16277497)
chr8 (15-348)||(16277559-16277892)
chr8 (15-348)||(18710591-18710924)
chr8 (407-708)||(19687740-19688041)
chr8 (388-709)||(22081125-22081446)
chr8 (15-348)||(2137136-2137469)
chr8 (407-708)||(2137531-2137832)
chr8 (15-348)||(14557629-14557962)
chr8 (407-708)||(14557269-14557570)
chr8 (407-708)||(27609177-27609478)
chr8 (15-348)||(31354529-31354862)
chr8 (15-348)||(31489627-31489960)
chr8 (15-348)||(19208237-19208570)
chr8 (15-348)||(19674446-19674779)
chr8 (15-347)||(3329384-3329716)
chr8 (15-348)||(28361832-28362165)
chr8 (15-347)||(12092601-12092933)
chr8 (398-522)||(19659299-19659423)
chr8 (15-347)||(29829328-29829660)
chr8 (407-522)||(44562932-44563047)
chr8 (398-522)||(9354453-9354577)
chr8 (15-347)||(19286468-19286800)
chr8 (410-708)||(18710228-18710526)
chr8 (410-708)||(19674080-19674378)
chr8 (416-657)||(19286158-19286399)
chr8 (15-191)||(189256-189432)
chr8 (410-648)||(31490025-31490263)
chr8 (15-273)||(33258803-33259061)
chr8 (399-624)||(31354250-31354475)
chr8 (518-625)||(19208743-19208850)
chr8 (530-657)||(28362350-28362477)
chr8 (518-696)||(3329902-3330080)
chr8 (518-696)||(29828967-29829145)
chr8 (518-657)||(19518526-19518665)
chr8 (518-648)||(33258425-33258555)
chr8 (518-708)||(12093116-12093306)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (70-348)||(1-279)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (17-283)||(1838-2103)
scaffold0415 (23-285)||(6080-6344)
scaffold0415 (518-657)||(5682-5821)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (50-345)||(21569-21864)
scaffold0109 (388-709)||(21208-21529)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (407-708)||(29405-29706)
scaffold0089 (410-708)||(40385-40683)
scaffold0089 (15-348)||(39987-40320)
scaffold0089 (15-348)||(46903-47236)
scaffold0089 (15-348)||(29768-30101)
scaffold0089 (407-708)||(47298-47599)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (407-708)||(26934-27235)
scaffold0143 (16-348)||(27297-27629)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (15-348)||(47-381)
scaffold0029 (407-708)||(443-744)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (15-207)||(536-728)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (15-348)||(9571-9904)
scaffold0336 (439-708)||(7874-8143)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (15-348)||(7157-7490)
scaffold0350 (518-625)||(7663-7770)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (15-348)||(8984-9317)
scaffold0159 (15-348)||(20020-20353)
scaffold0159 (518-621)||(9490-9593)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (15-348)||(26119-26453)
scaffold0144 (518-708)||(26626-26816)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (15-348)||(14848-15181)
scaffold0237 (443-708)||(15279-15544)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (15-339)||(7963-8287)
scaffold0038 (518-708)||(7579-7769)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (514-708)||(48568-48769)
scaffold0099 (59-267)||(46764-46981)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456661
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 19456632  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456633 attggtatcggaggaaaggtaggtctagc 19456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Original strand, 19456701 - 19457022
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456701 catttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgc 19456800  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456801 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 19456900  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19456901 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 19457000  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  19457001 agtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703404
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 21703372  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21703373 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Original strand, 21703444 - 21703765
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  21703444 catttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 21703543  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703544 gcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 21703643  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703644 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 21703743  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  21703744 agtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303543
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcat 34303509  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34303510 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34303543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784655
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  3784778 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 3784679  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  3784678 tatcagaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 24 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118689
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcg 27118714  T
Q  324 gtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  27118713 gtatcggagggaaggtaggtctagc 27118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163600
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  16163723 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 16163624  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  16163623 tatcagaggaaaggtaggtctagc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34157012
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34157135 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 34157036  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  34157035 tatcagaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891568
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||      
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacc 31891444  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  31891445 tgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 31891544  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  31891545 tatcagaggaaaggtaggtctagc 31891568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27392973
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| | |    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatc 27392999  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27392998 attggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 407 - 697
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 697  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 27392951 - 27392630
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27392951 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 27392852  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
       ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392851 atgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 27392752  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  27392751 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcg 27392652  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  27392651 ggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128806
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23128772  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128773 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23128806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434684
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcat 27434650  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434651 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27434684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882215
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 28882249  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28882248 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28882215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655543
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 12655577  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655576 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 12655543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 23128868 - 23129169
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  23128868 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 23128967  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  23128968 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 23129067  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  23129068 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 23129167  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  23129168 tc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233515
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcat 40233546  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40233545 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20837919
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 20837953  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20837952 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 20837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 28882153 - 28881852
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  28882153 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 28882054  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  28882053 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 28881954  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  28881953 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 28881854  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  28881853 tc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926268
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 22926234  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22926235 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350219
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 9350088  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9350089 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9350188  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9350189 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 20837857 - 20837556
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  20837857 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggat 20837758  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20837757 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 20837658  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  20837657 accatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 20837558  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  20837557 tc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 12655481 - 12655180
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  12655481 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 12655382  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12655381 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 12655282  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  12655281 accatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 12655182  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  12655181 tc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635426
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11635392  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635393 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677422
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 21677388  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21677389 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 21677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936781
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 13936750  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13936751 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641615
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11641581  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11641582 ataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagc 11641615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586814
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcat 12586845  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12586844 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861681
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34861715  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34861714 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 34861681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686149
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37686115  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37686116 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 37686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701414
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37701380  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37701381 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 37701414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925494
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37925528  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37925527 ataacattggtatcggagggaaagtaggcctagc 37925494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375163
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 37375196  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  37375195 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777226
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27777257  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27777256 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27816984
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27817015  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27817014 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Original strand, 31891608 - 31891742
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31891608 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 31891707  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891708 gcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286355
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34286355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291415
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716839
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12716808  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12716809 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 27118649 - 27118515
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27118649 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 27118550  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118549 gcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39052059
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39052028  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39052029 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829578
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16829544  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829545 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 16829578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891903
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16891937  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16891936 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 16891903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876282
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 31876316  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31876315 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 31876282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049799
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 32049833  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32049832 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 32049799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3784605 - 3784481
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 34156962 - 34156838
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803711
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  218 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatata 317  Q
    |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatata 27803739  T
Q  318 gcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
     ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27803738 acatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 407 - 522
Target Start/End: Original strand, 34303602 - 34303717
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  34303602 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 34303701  T
Q  507 ataactgggcagcatt 522  Q
     || ||| ||||||||    
T  34303702 gtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279450
Alignment:
Q  134 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 233  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  234 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 333  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  334 aaaagtaggtctagc 348  Q
     ||||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagc 34279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260984
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 260959  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  260960 acaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16163550 - 16163426
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 410 - 624
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  610 gtacctctttgatgc 624  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890075
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 39890109  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39890108 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 524 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 37374983 - 37374799
Alignment:
Q  524 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 623  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  37374983 ataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 37374884  T
Q  624 catttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374883 cattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 31876109 - 31876002
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  31876109 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 31876010  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  31876009 tcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 34861508 - 34861401
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  34861508 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 34861409  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  34861408 tcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 37686322 - 37686429
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  37686322 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 37686421  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  37686422 tcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 37701587 - 37701694
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  37701587 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 37701686  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  37701687 tcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 39889890 - 39889783
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  39889890 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 39889791  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  39889790 tcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416664
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  610 gtacctctt 618  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 530 - 625
Target Start/End: Original strand, 16829763 - 16829858
Alignment:
Q  530 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829763 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 530 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 16891718 - 16891623
Alignment:
Q  530 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891718 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Original strand, 19416912 - 19417042
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19416912 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19417011  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  19417012 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 624
Target Start/End: Original strand, 22926441 - 22926547
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22926441 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 22926540  T
Q  618 ttgatgc 624  Q
    | |||||    
T  22926541 tcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 657
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  404 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacg 503  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  504 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 603  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  604 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285179
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagc 15285150  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15285151 attggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15285179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227890
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 15227922  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15227921 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 388 - 707
Target Start/End: Original strand, 15285219 - 15285538
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15285219 catttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 15285318  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285319 gcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctt 15285418  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285419 tcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 15285518  T
Q  688 agtccccatgatgtccatct 707  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  15285519 agtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 15227850 - 15227529
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15227850 catttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 15227751  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227750 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 15227651  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227650 tcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 15227551  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  15227550 agtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1900623 - 1900277
Alignment:
Q  2 gttgcaatgagatggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgaggga 101  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1900623 gttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataaggga 1900524  T
Q  102 agttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 201  Q
      || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900523 cattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg 1900424  T
Q  202 gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggg 301  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900423 gaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggg 1900324  T
Q  302 agtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1900323 agtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 1900237 - 1899916
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  1900237 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 1900138  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900137 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 1900038  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1900037 tcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacg 1899938  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  1899937 agtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460856
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  24460733 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 24460832  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  24460833 tatcagaggaaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235776
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  14235648 gaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaac 14235747  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14235748 attggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14235776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391586
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Original strand, 14235819 - 14236140
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14235819 catttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 14235918  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
      |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235919 atatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 14236018  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||    
T  14236019 tcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcg 14236118  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  14236119 ggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014020
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcat 17014054  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17014053 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 17014020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 14664976 - 14664675
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  | ||||| ||||| ||||||     
T  14664976 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggag 14664877  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14664876 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14664777  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  14664776 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 14664677  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  14664676 tc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592565
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24592531  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24592532 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24592565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665038
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14665072  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14665071 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 412 - 709
Target Start/End: Original strand, 15391650 - 15391948
Alignment:
Q  412 gggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataac 511  Q
    ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||| ||||  || |    
T  15391650 gggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagc 15391749  T
Q  512 tgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 610  Q
    || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  15391750 tgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgcca 15391849  T
Q  611 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 709  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391850 tacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005893
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5005927  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5005926 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5005893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763555
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 14763521  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14763522 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14763555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 24592624 - 24592925
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24592624 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24592723  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24592724 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24592823  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24592824 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 24592923  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  24592924 tc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569873
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 6569907  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6569906 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 6569873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800863
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 18800830  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18800831 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344765
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 36344732  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  36344733 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098561
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 14098595  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098594 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 14098561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126769
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 31126735  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31126736 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 31126769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105889
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcat 40105855  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  40105856 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 40105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33674046
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 33674015  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33674016 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163568
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27163534  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27163535 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 27163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753777
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 30753808  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30753807 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189211
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34189208  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  34189209 agc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112682
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 24112685  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  24112684 agc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 24460906 - 24461030
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833408
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 54833441  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  54833440 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850661
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39850692  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39850691 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Original strand, 36344817 - 36345126
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  36344817 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 36344916  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36344917 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 36345016  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  36345017 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 36345116  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  36345117 tgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 426 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  426 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 525  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  526 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  626 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 416 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  416 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 515  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  516 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 615  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  616 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 443 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  643 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969721
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 21969755  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21969754 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 21969721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 410 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  610 gtacctctttgatgca 625  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 443 - 648
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  643 tttctc 648  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Original strand, 33674234 - 33674364
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  33674234 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 33674333  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674334 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Original strand, 40106062 - 40106240
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| |    
T  40106062 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttt 40106161  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106162 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  610 gtacctctttgatgca 625  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 399 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24112631 - 24112483
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  24112631 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 24112532  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 547  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112531 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 399 - 547
Target Start/End: Original strand, 34189262 - 34189410
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  34189262 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 34189361  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 547  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189362 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626798
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatc 16626769  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626770 attggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16626798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530354
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatac 18530386  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18530385 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 18530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Original strand, 16626838 - 16627158
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  16626838 catttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgt 16626937  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626938 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-t 16627036  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16627037 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcg 16627136  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16627137 agtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 18530320 - 18529999
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18530320 catttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 18530221  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530220 gcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctt 18530121  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18530120 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 18530021  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18530020 agtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034409
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 31034375  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31034376 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292718
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 32292752  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32292751 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4625910
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  4626033 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 4625934  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  4625933 tatcagaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17994076
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  17993953 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 17994052  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  17994053 tatcagaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652353
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 5652378  T
Q  324 gtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    
T  5652377 gtatcagaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 407 - 697
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 697  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8295938
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8295972  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8295971 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8295938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892998
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15892964  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892965 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 15892998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330635
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcat 18330669  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18330668 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18330635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713196
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5713317  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5713316 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5713217  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5713216 tatcggagggaaagtaggtct 5713196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724106
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5724227  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5724226 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5724127  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5724126 tatcggagggaaagtaggtct 5724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 345
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757371
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5757250  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5757251 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5757350  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5757351 tatcggagggaaagtaggtct 5757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 345
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768262
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||      
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5768141  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||    
T  5768142 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcgg 5768241  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5768242 tatcggagggaaagtaggtct 5768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 8301618 - 8301919
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| | ||||||||||     
T  8301618 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggag 8301717  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8301718 gcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8301817  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8301818 accatacctctttgacgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8301917  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  8301918 tc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741386
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 15741352  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15741353 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15741386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051228
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 18051262  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18051261 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387870
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcat 22387836  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22387837 acaacattggtataggaggaaaagtcggtctagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796945
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4796911  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4796912 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4796945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301559
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8301525  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8301526 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192282
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 6192316  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6192315 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 6192282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 8295879 - 8295578
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  8295879 ttaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 8295780  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8295779 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8295680  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8295679 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8295580  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  8295579 tc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 18051166 - 18050865
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  18051166 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 18051067  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18051066 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18050967  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18050966 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18050867  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  18050866 tc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29149047
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 29149013  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29149014 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 29149047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721597
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4721631  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4721630 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4721597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073178
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 7073212  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7073211 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 7073178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880732
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 35880766  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35880765 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 35880732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416885
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4416919  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4416918 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 4416885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396099
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 10396133  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10396132 acaacataggtatcggagggaaagtaggtctagc 10396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116246
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcat 28116212  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28116213 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28116246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 35880670 - 35880369
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  35880670 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 35880571  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  35880570 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 35880471  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  35880470 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 35880371  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  35880370 tc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277344
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18277310  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18277311 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18277344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292645
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18292611  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18292612 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18292645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307946
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18307912  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18307913 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18307946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110638
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 11110607  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11110608 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665259
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29665228  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29665229 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997366
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 36997335  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997336 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985248
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 17985214  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985215 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 17985248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964765
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31964731  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31964732 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134363
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 50134329  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50134330 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 50134363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542753
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 6542720  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542721 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5466953
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcat 5466985  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtcta 346  Q
    | | ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  5466984 acaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465896
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcat 48465927  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48465926 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346979
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 4346945  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4346946 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609614
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5609580  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5609581 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5609614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 18330573 - 18330277
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  18330573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 18330479  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18330478 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18330379  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18330378 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18330279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674659
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcat 21674693  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21674692 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 21674659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021241
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcat 28021275  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28021274 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339268
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28339302  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28339301 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28339268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577136
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20577105  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20577106 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211713
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 8211738  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  8211737 acaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782052
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871148
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22871114  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22871115 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886207
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22886173  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22886174 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023419
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 47023453  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  47023452 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 47023419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 17994126 - 17994250
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 4625851 - 4625736
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  4625851 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 4625752  T
Q  507 ataactgggcagcatt 522  Q
     || ||| ||||||||    
T  4625751 gtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797141
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  215 aggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    || |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439120
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32439123  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  32439122 agc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996528
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7996562  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7996561 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 7996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10643036
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 10643070  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10643069 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 10643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066010
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||      
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggc 20066112  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20066111 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 20066012  T
Q  346 ag 347  Q
    ||    
T  20066011 ag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596648
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 5596615  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  5596616 acaacattggtataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5652303 - 5652179
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242706
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 18242739  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18242738 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 399 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctt 618  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 399 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 697  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013687
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 5013712  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  5013711 acaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 443 - 657
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  643 tttctcgaatacaat 657  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 443 - 657
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  643 tttctcgaatacaat 657  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 443 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 624  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 443 - 648
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  643 tttctc 648  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  510 actgggcagcatt 522  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  510 actgggcagcatt 522  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 522
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  510 actgggcagcatt 522  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 522
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  510 actgggcagcatt 522  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 660  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 660  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225157
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 18225191  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  18225190 acaacattggtataggagggaaggtaggcctagc 18225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  419 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 518  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  519 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 618  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  619 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5013493 - 5013315
Alignment:
Q  530 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 629  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |    
T  5013493 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcg 5013394  T
Q  630 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
      || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013393 tagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Original strand, 6542939 - 6543117
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6542939 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6543038  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543039 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328200
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 28021146 - 28020964
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28021146 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcca 28021047  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021046 tggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 648
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 524 - 625
Target Start/End: Original strand, 4347155 - 4347256
Alignment:
Q  524 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 623  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  4347155 ataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 4347254  T
Q  624 ca 625  Q
    ||    
T  4347255 ca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893176
Alignment:
Q  149 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 248  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  249 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 18242520 - 18242381
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  18242520 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 18242421  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18242420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  618 ttgatgc 624  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24327952 - 24327822
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  24327952 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 24327853  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  24327852 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 28339095 - 28338989
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28339095 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 28338996  T
Q  618 ttgatgc 624  Q
    | |||||    
T  28338995 tcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 624
Target Start/End: Original strand, 31964938 - 31965044
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31964938 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 31965037  T
Q  618 ttgatgc 624  Q
    | |||||    
T  31965038 tcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 624
Target Start/End: Original strand, 50134536 - 50134642
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  50134536 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 50134635  T
Q  618 ttgatgc 624  Q
    | |||||    
T  50134636 tcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 594
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 594  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 621
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  618 ttga 621  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 616  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  617 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 547
Target Start/End: Original strand, 22387921 - 22388069
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  22387921 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggta 22388020  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 547  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388021 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 48465708 - 48465569
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  48465708 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 48465609  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465608 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 32439069 - 32438771
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  32439069 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 32438970  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| |||    
T  32438969 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtga 32438870  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 697  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438869 tgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4893125 - 4892977
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  4893125 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 4893026  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 547  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893025 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2909
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 2875  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2876 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3083
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2949 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 3048  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3049 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340586
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 20340552  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20340553 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461085
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 20461117  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20461116 agcattagtatcggaggaaaggtaggtctagc 20461085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 20461069 - 20460748
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctt 20460870  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20460869 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20460770  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20460769 agtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208282
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatac 16208250  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16208251 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151866
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 28151900  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28151899 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Original strand, 16208319 - 16208640
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16208319 catttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
       ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208419 atgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctt 16208518  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208519 tcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16208618  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16208619 agtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962674
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcat 10962708  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10962707 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 10962674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793559
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 41793525  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  41793526 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 41793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28584985
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || |||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28585019  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28585018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28584985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638222
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 51638256  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  51638255 acaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagc 51638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Original strand, 20340626 - 20340760
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20340626 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 20340725  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340726 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 10962501 - 10962362
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10962501 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 10962402  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  10962401 tcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 51638049 - 51637910
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  51638049 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 51637950  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  51637949 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 443 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  643 tttctc 648  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450135
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 322  Q
    | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 16450109  T
Q  323 ggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  16450110 ggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041329
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 16041361  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16041360 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 388 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16041289 - 16040980
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  16041289 catttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 16041190  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041189 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16041090  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041089 tcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16040990  T
Q  688 agtccccatg 697  Q
    ||| ||||||    
T  16040989 agttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484700
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26484734  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26484733 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088601
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  31088478 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 31088577  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  31088578 tatcagaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 391 - 709
Target Start/End: Original strand, 16450178 - 16450496
Alignment:
Q  391 ttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgca 490  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||     
T  16450178 ttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcg 16450277  T
Q  491 tacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttct 590  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450278 tacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttct 16450377  T
Q  591 tcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagt 690  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450378 tcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagt 16450477  T
Q  691 ccccatgatgtccatctca 709  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16450478 ccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109142
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 322  Q
      ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcatt 2109116  T
Q  323 ggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  2109117 ggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2109142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775365
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcat 2775399  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2775398 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211160
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 39211126  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39211127 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733466
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||| ||||||    
T  45733589 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattgg 45733490  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  45733489 tatcagaggaaaggtaggtctagc 45733466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5127998
Alignment:
Q  13 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctca 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  113 aaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacact 212  Q
    || || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  213 tgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggc 312  Q
    |||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagc 5128034  T
Q  313 atatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5128033 atacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5127998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424913
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 11424879  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11424880 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518553
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16518520  T
Q  316 tagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
     | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16518521 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16518553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540805
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtct 18540808  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  18540807 agc 18540805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10917005
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 10916971  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10916972 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 10917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503517
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16503484  T
Q  316 tagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
     | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16503485 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16503517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154579
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 2154613  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  2154612 acaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagc 2154579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147477
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 5147443  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5147444 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5147477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275231
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26275197  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26275198 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 10917064 - 10917365
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| |||| |     
T  10917064 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaag 10917163  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  10917164 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 10917263  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  10917264 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 10917363  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  10917364 tc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445315
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 3445346  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3445345 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145260
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4145226  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4145227 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 4145260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 11424975 - 11425276
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  11424975 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 11425074  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11425075 gcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11425174  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11425175 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11425274  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  11425275 tc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435263
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 26435297  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26435296 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 26435263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26320006
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26319972  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26319973 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564526
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31564493  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31564494 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618657
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9618691  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9618690 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9618657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26670051
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26670017  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26670018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26670051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387349
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 45387383  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  45387382 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 45387349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441587
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || |    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcgt 11441612  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  11441611 acaacattggtataggaggaaaagt 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26538004
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26537973  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26537974 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736597
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16736563  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16736564 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16736597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751651
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16751617  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16751618 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16751651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523538
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17523572  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17523571 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529677
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17529643  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17529644 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17529677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 31088651 - 31088775
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 45733416 - 45733292
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592603
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 410 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 660  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31124927
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 31124960  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31124959 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159525
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 5159528  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  5159527 agc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 31124744 - 31124554
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31124744 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31124645  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124644 tcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Original strand, 24592851 - 24593041
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  24592851 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 24592950  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | || |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592951 tcgacgcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 399 - 624
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 624  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 9618484 - 9618345
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9618484 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9618385  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9618384 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 26275404 - 26275511
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  26275404 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 26275503  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  26275504 tcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 518 - 623
Target Start/End: Original strand, 26320179 - 26320284
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  26320179 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 26320278  T
Q  618 ttgatg 623  Q
    | ||||    
T  26320279 tcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 625
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  610 gtacctctttgatgca 625  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Original strand, 26670224 - 26670363
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26670224 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26670323  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26670324 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 5159474 - 5159326
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  5159474 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 5159375  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 547  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159374 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 90)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457128
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 22457094  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22457095 acatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143479
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 14143445  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14143446 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26787946
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26787980  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26787979 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196319
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27196353  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27196352 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252921
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27252887  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27252888 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374450
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  33374327 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 33374426  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  33374427 tatcagaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522267
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 13522238  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13522239 attggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892504
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8892381 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 8892480  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  8892481 tatcagaggaaaggtaggtctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903739
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8903616 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 8903715  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  8903716 tatcagaggaaaggtaggtctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162659
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  28162782 ggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 28162683  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  28162682 tatcagaggaaaggtaggtctagc 28162659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290564
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27290530  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27290531 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27290564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 348
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477467
Alignment:
Q  122 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 221  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  222 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcat 321  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  322 tggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160704
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 20160732  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20160731 atcggtatcggaggaaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172127
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 22172099  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22172100 atcggtatcggaggaaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22935074
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 22935040  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22935041 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22935074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857519
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23857485  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23857486 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272771
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcat 27272740  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27272741 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918382
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26918416  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26918415 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989003
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26989037  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26989036 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26989003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749856
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  218 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatata 317  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatata 16749887  T
Q  318 gcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16749886 acatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16749856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 401 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 20160650 - 20160345
Alignment:
Q  401 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacg 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |    
T  20160650 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 20160551  T
Q  501 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 600  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20160550 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T
Q  601 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 700  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  20160453 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 20160354  T
Q  701 tccatctca 709  Q
     ||||||||    
T  20160353 accatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 401 - 709
Target Start/End: Original strand, 22172181 - 22172486
Alignment:
Q  401 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacg 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |    
T  22172181 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 22172280  T
Q  501 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 600  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172281 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T
Q  601 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 700  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  22172378 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 22172477  T
Q  701 tccatctca 709  Q
     ||||||||    
T  22172478 accatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299145
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 13299111  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13299112 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 13299145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 13299207 - 13299508
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  13299207 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 13299306  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  13299307 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 13299406  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  13299407 accatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 13299506  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  13299507 tc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304812
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24304778  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24304779 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24304812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863719
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24863753  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24863752 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24863719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 26988941 - 26988640
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  26988941 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26988842  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26988841 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26988742  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  26988741 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26988642  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  26988641 tc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000075
Alignment:
Q  29 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 128  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  129 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  229 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 328  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  329 ggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagc 27000075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424511
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15424477  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424478 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15424511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549477
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 29549511  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29549510 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 407 - 657
Target Start/End: Original strand, 24304874 - 24305124
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24304874 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24304973  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24304974 gcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24305073  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305074 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 407 - 551
Target Start/End: Original strand, 22477529 - 22477673
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  22477529 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagag 22477628  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 551  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477629 gtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773009
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4773042  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4773041 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573015
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29573049  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29573048 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29573015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525289
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
     | |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4525322  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4525321 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757767
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4757800  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4757799 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674144
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 16674175  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16674174 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545960
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4545935  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  4545936 acaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007730
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 27007763  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27007762 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696086
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3696117  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3696116 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463537
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34463506  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  34463507 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360185
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgca 27360151  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27360152 tacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450528
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgca 27450494  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27450495 tacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724319
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4724294  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  4724295 acaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207465
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 28207490  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  28207489 acaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 28162619 - 28162485
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28162619 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 28162520  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162519 gcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558210
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 30558176  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558177 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 30558210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 13522317 - 13522441
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 33374500 - 33374624
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025280
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 17025313  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17025312 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Original strand, 8892544 - 8892678
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8892544 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 8892643  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892644 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Original strand, 8903779 - 8903913
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  8903779 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgc 8903878  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903879 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044390
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc-atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || | | || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| |||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgca 27044424  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27044423 tacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 29549426 - 29549117
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  29549426 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 29549327  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29549326 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  29549226 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 29549127  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  29549126 tgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116603
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcat 26116570  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26116571 acaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501418
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 29501451  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  29501450 acaacattggtataggagggaaggttggtctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777809
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  ||||||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggca 26777774  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    || | ||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  26777775 tacaacatcggtataggagggaaggttggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944146
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 399 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 698  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  699 tgtccatctc 708  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485132
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 27485165  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27485164 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  439 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 538  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  539 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092427
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctt 141  Q
     || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 443 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  643 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 27484946 - 27484807
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  27484946 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 27484847  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27484846 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 29572842 - 29572735
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  29572842 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 29572743  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  29572742 tcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  643 tttctcgaatacaat 657  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Original strand, 34463728 - 34463867
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  34463728 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 34463827  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463828 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Original strand, 4546151 - 4546341
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4546151 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4546250  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546251 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Original strand, 16944394 - 16944524
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  16944394 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 16944493  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  16944494 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 28207271 - 28207081
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28207271 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 28207172  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207171 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 443 - 624
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 624  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16673956 - 16673817
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  16673956 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 16673857  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673856 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Original strand, 4724510 - 4724688
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |    
T  4724510 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttt 4724609  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724610 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 625
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  524 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 623  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  624 ca 625  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 696
Target Start/End: Original strand, 27629968 - 27630254
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||| | ||| | | | | ||||| |  |||  ||    
T  27629968 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggta 27630067  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
     ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27630068 gctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgcc 27630167  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
     |||||||| ||  || |||  || || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630168 atacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 696
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  515 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 614  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  615 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 20374 - 20053
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  20374 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggc 20275  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 20175  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20174 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20075  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20074 agtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20393
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 20425  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20424 aacattggtatcgggggaaaggtaggtctagc 20393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 30396 - 30095
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  30396 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 30297  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30296 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30197  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30196 accatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30097  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  30096 tc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30532
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888484
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  22888615 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatac 22888516  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22888515 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199043
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 316  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 25199075  T
Q  317 agcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25199074 aacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184796
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  13184673 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 13184772  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  13184773 tatcagaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892220
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcat 23892254  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23892253 acatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 23892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889230
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcat 29889196  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29889197 acaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 29889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877261
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  220 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 319  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 33877290  T
Q  320 attggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33877289 attggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440642
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  13440519 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattgg 13440618  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  13440619 tatcagaggaaaggtaggtctagc 13440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325808
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11325931 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattgg 11325832  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  11325831 tatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 388 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23892177 - 23891855
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  23892177 catttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggc 23892078  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892077 gcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 23891978  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23891977 tcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacg 23891878  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctcat 710  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  23891877 agtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 25199003 - 25198682
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  25199003 catttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggc 25198904  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25198903 gcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttcct 25198804  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  25198803 tcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatg 25198704  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  25198703 agtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688305
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24688271  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24688272 acaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24688305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752598
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23752564  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23752565 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777501
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 33777535  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33777534 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 33777501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549368
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 11549402  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549401 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718136
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23718102  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23718103 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23718136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934647
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 30934681  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30934680 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 30934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548691
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcat 9548657  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9548658 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 9548691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970032
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||    |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24970066  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24970065 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999262
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 22999228  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22999229 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22999262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 23752660 - 23752961
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23752660 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23752759  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23752760 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23752859  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23752860 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 23752959  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  23752960 tc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 30934588 - 30934287
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  30934588 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 30934489  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30934488 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30934389  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30934388 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30934289  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  30934288 tc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 514 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  514 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 613  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  614 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 23718198 - 23718500
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23718198 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23718297  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23718298 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23718397  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccat 705  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  23718398 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccat 23718497  T
Q  706 ctc 708  Q
    |||    
T  23718498 ctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 11549306 - 11549005
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  11549306 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggag 11549207  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11549206 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11549107  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11549106 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11549007  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  11549006 tc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658908
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 15658874  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15658875 ataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 15658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 388 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22888444 - 22888287
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  22888444 catttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 22888345  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 545  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888344 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671630
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37671597  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37671598 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 407 - 707
Target Start/End: Original strand, 22999324 - 22999624
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  22999324 ttaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 22999423  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  22999424 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 22999523  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  22999524 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 22999623  T
Q  707 t 707  Q
    |    
T  22999624 t 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649250
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28649283  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28649282 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665623
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 8665589  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8665590 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 8665623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317465
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9317499  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9317498 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132169
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12132203  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12132202 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 12132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15759005
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 15758971  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15758972 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 15759005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152032
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30152066  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30152065 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431463
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 31431488  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  31431487 acaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826552
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 31826521  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31826522 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511065
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 2511099  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2511098 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 2511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480406
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26480440  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26480439 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26480406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500877
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  223 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 322  Q
       |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| |||     
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatc 18500852  T
Q  323 ggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18500853 ggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874319
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcat 6874353  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6874352 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 6874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375560
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 18375526  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375527 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 18375560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358790
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 37358757  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37358758 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599620
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgca 32599585  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32599586 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168483
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30168517  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30168516 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681457
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24681488  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24681487 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24723984
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24724015  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24724014 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473694
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 40473663  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40473664 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674723
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41674825 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 41674726  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  41674725 agc 41674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078269
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 43078300  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43078299 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5637924
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5637958  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5637957 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5637924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516370
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 33516404  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516403 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 33516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616532
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 34616566  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34616565 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 13184846 - 13184970
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324976
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 13324943  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13324944 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 13440692 - 13440816
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 33877211 - 33877087
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771134
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37771101  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37771102 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789556
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 3789589  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3789588 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37754995
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37755028  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37755027 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11325768 - 11325634
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11325768 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 11325669  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325668 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||| | ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292539
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 245  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  246 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33292542  T
Q  346 agc 348  Q
    |||    
T  33292541 agc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959934
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgca 28959899  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28959900 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967139
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029504
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 443 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  643 tttctcgaatacaat 657  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 624
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  610 gtacctctttgatgc 624  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 9317292 - 9317153
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  9317292 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 9317193  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9317192 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 708
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  643 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 12131996 - 12131889
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  12131996 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 12131897  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  12131896 tcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 410 - 657
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 37771320 - 37771427
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37771320 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37771419  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  37771420 tcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5637751 - 5637561
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5637751 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5637652  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637651 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 518 - 660
Target Start/End: Original strand, 15759178 - 15759320
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  15759178 gcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 15759277  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 660  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15759278 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 407 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacgga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 30151847 - 30151669
Alignment:
Q  530 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 629  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |    
T  30151847 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcg 30151748  T
Q  630 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
      || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151747 tagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Original strand, 37358976 - 37359154
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37358976 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37359075  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359076 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 26480233 - 26480094
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26480233 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26480134  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26480133 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 31826740 - 31826847
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31826740 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 31826839  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  31826840 tcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 37671813 - 37671920
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37671813 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37671912  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  37671913 tcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  643 tttctcgaatacaat 657  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 443 - 625
Target Start/End: Original strand, 32599715 - 32599897
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32599715 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtca 32599814  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 625  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599815 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28649055 - 28648937
Alignment:
Q  530 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 629  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||      
T  28649055 gcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattca 28648956  T
Q  630 cggaggattcaactttctc 648  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  28648955 cagaggattcagctttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 519 - 625
Target Start/End: Original strand, 28960120 - 28960226
Alignment:
Q  519 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 618  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  28960120 cattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctt 28960219  T
Q  619 tgatgca 625  Q
     ||||||    
T  28960220 cgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Original strand, 29967387 - 29967517
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||    
T  29967387 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctct 29967486  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  29967487 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 30029256 - 30029126
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||    
T  30029256 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctct 30029157  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  30029156 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 33292488 - 33292340
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  33292488 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 33292389  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 547  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292388 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 348
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659249
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 19659224  T
Q  324 gtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    
T  19659225 gtatcagaggaaaggtaggtctagc 19659249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563106
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  225 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattgg 324  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44563229 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattgg 44563130  T
Q  325 tatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  44563129 tatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244670
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  224 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattg 323  Q
     ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  33244794 cggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattg 33244695  T
Q  324 gtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    
T  33244694 gtatcagaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081085
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 22081085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354627
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  214 gaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagca 9354662  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9354661 tataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283454
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcat 16283488  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16283487 acaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 16283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688103
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 19688137  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688136 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 19688103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609115
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 27609081  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27609082 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27609115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 16277497 - 16277196
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16277497 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 16277398  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16277397 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16277298  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16277297 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16277198  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  16277197 tc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277559
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 16277593  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277592 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16277559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710591
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18710625  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18710624 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Original strand, 22081125 - 22081446
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22081125 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 22081224  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
       ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081225 atgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 22081324  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  22081325 tcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcg 22081424  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  22081425 ggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137469
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 2137435  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137436 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 2137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 2137531 - 2137832
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  2137531 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 2137630  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2137631 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2137730  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  2137731 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 2137830  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  2137831 tc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557629
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14557663  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14557662 ataacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 14557629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 14557570 - 14557269
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  14557570 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 14557471  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14557470 gcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14557371  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  14557370 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 14557271  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  14557270 tc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 27609177 - 27609478
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||   | |||| ||||| ||||||     
T  27609177 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggag 27609276  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27609277 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27609376  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  27609377 accatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 27609476  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  27609477 tc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354529
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcat 31354563  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31354562 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489960
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31489926  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31489927 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31489960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208570
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19208536  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19208537 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674446
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19674480  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19674479 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19674446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329716
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3329683  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3329684 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362165
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28362131  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28362132 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092933
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 12092900  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12092901 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Original strand, 19659299 - 19659423
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829328
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || |    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgt 29829361  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29829360 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 407 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 44563047 - 44562932
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  44563047 ttaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 44562948  T
Q  507 ataactgggcagcatt 522  Q
     || ||| ||||||||    
T  44562947 gtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 398 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 9354577 - 9354453
Alignment:
Q  398 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  498 acgacggaaataactgggcagcatt 522  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286468
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 19286501  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 347  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19286500 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 416 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  416 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 515  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  516 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 615  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  616 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 191  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 410 - 648
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258803
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 273  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 399 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  399 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 498  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  499 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 598  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  599 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 624  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 19208743 - 19208850
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||    
T  19208743 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttct 19208842  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  19208843 tcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 530 - 657
Target Start/End: Original strand, 28362350 - 28362477
Alignment:
Q  530 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 629  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |      
T  28362350 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactca 28362449  T
Q  630 cggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  28362450 cagaggattcagctttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Original strand, 3329902 - 3330080
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  3329902 gcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 3330001  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330002 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 518 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 29829145 - 29828967
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  29829145 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 29829046  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 696  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829045 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Original strand, 19518526 - 19518665
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19518526 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19518625  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  19518626 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33258555 - 33258425
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  33258555 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctct 33258456  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 648  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  33258455 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Original strand, 12093116 - 12093306
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12093116 gcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12093215  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093216 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Original strand, 1 - 279
Alignment:
Q  70 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  170 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  270 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2103
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  217 gtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6080
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtca 220  Q
    |||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  221 gaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 285  Q
    ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 518 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5682
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctc 616  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||    
T  5821 gcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctc 5723  T
Q  617 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 657  Q
    || || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5722 ttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21569
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 249  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  250 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 21569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 388 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 21529 - 21208
Alignment:
Q  388 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 487  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21529 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 21430  T
Q  488 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 587  Q
       ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21429 atgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 21330  T
Q  588 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 687  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||    
T  21329 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcg 21230  T
Q  688 agtccccatgatgtccatctca 709  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  21229 ggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  410 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 509  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  510 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 609  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  610 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40320
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 40286  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40287 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 40320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47236
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 47202  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47203 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 47236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29768
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 29802  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29801 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 29768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47599
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| || |||     
T  47298 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggag 47397  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  47398 gcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 47497  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  47498 accatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 47597  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  47598 tc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 27235 - 26934
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  27235 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 27136  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27135 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27036  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  27035 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26936  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  26935 tc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27297
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  216 ggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcata 315  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 27330  T
Q  316 tagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27329 taacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 47 - 381
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaact-cggca 313  Q
    || || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   |||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagca 346  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  347 tataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 407 - 708
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  407 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 506  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  507 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 606  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  607 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 207  Q
     ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9571
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 9605  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9604 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 439 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  439 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 538  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  539 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 638  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  639 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7490
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7456  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7457 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 518 - 625
Target Start/End: Original strand, 7663 - 7770
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  7663 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 7762  T
Q  618 ttgatgca 625  Q
    | ||||||    
T  7763 tcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9317
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9283  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9284 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20020
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20054  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20053 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 20020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 621
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9593
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9490 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9589  T
Q  618 ttga 621  Q
    ||||    
T  9590 ttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26453
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  215 aggtcagaatggaacctg-ggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggca 313  Q
    || |||||   ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgca 26418  T
Q  314 tatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26419 tacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Original strand, 26626 - 26816
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26626 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26725  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | || |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26726 tcgacgcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15181
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 15147  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 348  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15148 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 708
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  443 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 542  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  543 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 642  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  643 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 7963
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  215 aggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 314  Q
    || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 7988  T
Q  315 atagcattggtatcggaggaaaagt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||||    
T  7987 acaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 7769 - 7579
Alignment:
Q  518 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 617  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  7769 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 7670  T
Q  618 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 708  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7669 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 514 - 708
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  514 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 607  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  608 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 706  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  707 tc 708  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 267
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46981
Alignment:
Q  59 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtactt 156  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || |||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatactt 46863  T
Q  157 caaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtg 251  Q
    |||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  46864 caaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtg 46963  T
Q  252 gaggc--ttgccctgtct 267  Q
    | |||  |||||||||||    
T  46964 ggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University