View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11652_high_3 (Length: 493)

Name: NF11652_high_3
Description: NF11652
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11652_high_3
NF11652_high_3
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (3-470)||(16744040-16744508)
chr3 (101-493)||(2049777-2050171)
chr3 (101-493)||(12030049-12030443)
chr3 (91-493)||(13838852-13839256)
chr3 (101-481)||(14842475-14842856)
chr3 (107-395)||(17912483-17912771)
chr3 (90-421)||(15858996-15859331)
chr3 (90-405)||(51158008-51158325)
chr3 (230-395)||(2449238-2449404)
chr3 (101-388)||(15936634-15936922)
chr3 (101-388)||(15938476-15938764)
chr3 (349-492)||(19260726-19260869)
chr3 (108-480)||(15614808-15615180)
chr3 (333-470)||(19231982-19232122)
chr3 (14-175)||(15468555-15468717)
chr3 (263-395)||(13975722-13975853)
chr3 (263-395)||(45860937-45861068)
chr3 (101-395)||(13954890-13955185)
chr3 (14-175)||(22275088-22275250)
chr3 (108-243)||(47984624-47984759)
chr3 (108-243)||(48003198-48003333)
chr3 (108-243)||(47993911-47994046)
chr3 (108-243)||(48012484-48012619)
chr3 (93-361)||(16821099-16821369)
chr3 (101-383)||(55316187-55316471)
chr3 (3-75)||(2449391-2449463)
chr3 (437-493)||(38168237-38168293)
chr3 (101-383)||(41270043-41270327)
chr3 (437-493)||(33342204-33342260)
chr3 (437-493)||(53771365-53771421)
chr3 (437-492)||(30153265-30153320)
chr3 (437-493)||(16261777-16261833)
chr3 (101-153)||(19231945-19231997)
chr3 (437-480)||(13954793-13954836)
chr3 (437-480)||(45861122-45861165)
chr3 (437-486)||(17912381-17912430)
chr3 (437-481)||(23492696-23492740)
chr3 (437-493)||(28558494-28558550)
chr3 (437-480)||(2449141-2449184)
chr3 (437-492)||(54685178-54685233)
chr3 (101-175)||(13975944-13976017)
chr3 (101-163)||(45860773-45860834)
chr3 (338-379)||(14080715-14080756)
chr3 (437-493)||(11986056-11986112)
chr3 (14-94)||(18969968-18970048)
chr3 (90-122)||(22144532-22144564)
chr3 (437-492)||(51961008-51961063)
chr3 (133-251)||(12264932-12265050)
chr3 (437-491)||(14285289-14285343)
chr3 (437-470)||(17955883-17955916)
chr3 (434-470)||(15857162-15857198)
chr3 (437-469)||(16933869-16933901)
chr3 (437-493)||(19947026-19947082)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (3-395)||(22907214-22907607)
chr8 (108-493)||(16193619-16194005)
chr8 (101-493)||(43373368-43373761)
chr8 (91-492)||(24928693-24929096)
chr8 (101-470)||(16404899-16405268)
chr8 (230-395)||(5238184-5238350)
chr8 (230-395)||(24661248-24661414)
chr8 (230-395)||(43685643-43685809)
chr8 (104-395)||(17345540-17345832)
chr8 (108-383)||(24548956-24549233)
chr8 (108-383)||(6774258-6774535)
chr8 (101-361)||(21844594-21844856)
chr8 (101-361)||(21851987-21852249)
chr8 (3-75)||(43685584-43685656)
chr8 (101-383)||(30120690-30120974)
chr8 (3-75)||(5238125-5238197)
chr8 (3-75)||(24661401-24661473)
chr8 (437-493)||(24385628-24385684)
chr8 (101-320)||(222754-222975)
chr8 (101-320)||(736377-736598)
chr8 (101-320)||(860272-860493)
chr8 (91-245)||(23837154-23837308)
chr8 (263-383)||(16674392-16674512)
chr8 (437-480)||(5238404-5238447)
chr8 (437-480)||(22907117-22907160)
chr8 (437-480)||(24661151-24661194)
chr8 (437-480)||(43685863-43685906)
chr8 (93-174)||(13662481-13662561)
chr8 (105-154)||(16674624-16674672)
chr8 (14-71)||(22321597-22321654)
chr8 (338-379)||(23226076-23226117)
chr8 (90-127)||(41246613-41246650)
chr8 (437-470)||(24716761-24716794)
chr8 (449-493)||(21494332-21494376)
chr8 (14-94)||(23217924-23218004)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (3-395)||(26680070-26680463)
chr4 (90-493)||(13246386-13246793)
chr4 (90-470)||(54118167-54118551)
chr4 (105-493)||(15674985-15675381)
chr4 (263-492)||(122020-122249)
chr4 (105-493)||(10104146-10104523)
chr4 (108-368)||(31115603-31115865)
chr4 (230-395)||(10488659-10488825)
chr4 (230-395)||(16327926-16328092)
chr4 (101-361)||(10644187-10644449)
chr4 (333-493)||(33240901-33241067)
chr4 (263-395)||(13048221-13048353)
chr4 (101-232)||(111362-111493)
chr4 (101-383)||(47357622-47357906)
chr4 (3-75)||(10488600-10488672)
chr4 (437-493)||(15135883-15135939)
chr4 (437-493)||(15272187-15272243)
chr4 (20-75)||(16328079-16328134)
chr4 (363-493)||(31132545-31132681)
chr4 (104-179)||(7849970-7850044)
chr4 (198-379)||(40885570-40885753)
chr4 (437-480)||(16327829-16327872)
chr4 (437-480)||(16609002-16609045)
chr4 (437-480)||(26680517-26680560)
chr4 (151-245)||(41166083-41166177)
chr4 (101-245)||(15044794-15044938)
chr4 (437-481)||(14952085-14952129)
chr4 (90-122)||(44055870-44055902)
chr4 (130-245)||(8374504-8374619)
chr4 (101-245)||(15109486-15109630)
chr4 (404-481)||(17145562-17145639)
chr4 (130-251)||(17145796-17145917)
chr4 (14-75)||(19559410-19559471)
chr4 (437-489)||(7131962-7132014)
chr4 (437-469)||(7850314-7850346)
chr4 (181-245)||(13809647-13809711)
chr4 (437-481)||(14996445-14996489)
chr4 (449-493)||(32460579-32460623)
chr4 (134-245)||(52265645-52265757)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (3-395)||(7292886-7293279)
chr7 (89-493)||(13036914-13037322)
chr7 (101-493)||(16211733-16212127)
chr7 (101-493)||(36052634-36053027)
chr7 (101-493)||(11580637-11581035)
chr7 (101-468)||(3059933-3060302)
chr7 (108-395)||(47481031-47481320)
chr7 (230-395)||(11516324-11516490)
chr7 (230-395)||(15441564-15441730)
chr7 (230-395)||(30262129-30262295)
chr7 (101-388)||(18253842-18254130)
chr7 (108-394)||(13320988-13321278)
chr7 (104-360)||(16478985-16479244)
chr7 (263-395)||(25292338-25292470)
chr7 (104-490)||(295870-296257)
chr7 (101-361)||(13572644-13572906)
chr7 (101-361)||(2437425-2437687)
chr7 (101-383)||(10989378-10989661)
chr7 (3-75)||(11516265-11516337)
chr7 (3-75)||(15441717-15441789)
chr7 (3-75)||(30262282-30262354)
chr7 (119-361)||(13911046-13911292)
chr7 (437-493)||(42056164-42056220)
chr7 (437-493)||(2029244-2029300)
chr7 (437-493)||(3049905-3049961)
chr7 (437-493)||(2190061-2190117)
chr7 (437-480)||(7293333-7293376)
chr7 (437-480)||(11516544-11516587)
chr7 (437-480)||(14113892-14113935)
chr7 (437-480)||(15441467-15441510)
chr7 (437-480)||(30262032-30262075)
chr7 (353-395)||(14113989-14114031)
chr7 (353-395)||(14423639-14423681)
chr7 (90-122)||(15822691-15822723)
chr7 (437-493)||(47480920-47480976)
chr7 (438-480)||(25292241-25292283)
chr7 (101-175)||(25292560-25292633)
chr7 (429-493)||(13321326-13321390)
chr7 (14-94)||(13351999-13352079)
chr7 (400-493)||(15709428-15709525)
chr7 (90-245)||(17224075-17224230)
chr7 (437-493)||(25124450-25124506)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (3-395)||(37066-37459)
scaffold0078 (437-480)||(36969-37012)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (101-493)||(36813-37209)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (101-493)||(1091-1486)
scaffold0266 (101-493)||(3484-3877)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (101-493)||(36982340-36982737)
chr2 (101-493)||(462706-463099)
chr2 (101-493)||(8891209-8891605)
chr2 (90-470)||(19794628-19795011)
chr2 (105-493)||(24341285-24341681)
chr2 (101-470)||(43642880-43643250)
chr2 (101-470)||(20627237-20627609)
chr2 (230-395)||(19689401-19689567)
chr2 (230-395)||(23820168-23820334)
chr2 (230-395)||(14906440-14906606)
chr2 (108-395)||(25265390-25265679)
chr2 (230-395)||(20015108-20015274)
chr2 (104-345)||(7507894-7508138)
chr2 (375-493)||(22863171-22863291)
chr2 (263-395)||(17396653-17396784)
chr2 (101-383)||(19886661-19886945)
chr2 (437-493)||(9652772-9652828)
chr2 (3-75)||(14906593-14906665)
chr2 (3-75)||(20015049-20015121)
chr2 (3-75)||(23820109-23820181)
chr2 (30-75)||(19689554-19689599)
chr2 (437-480)||(17396556-17396599)
chr2 (437-480)||(19689304-19689347)
chr2 (437-493)||(21273925-21273980)
chr2 (437-480)||(14906343-14906386)
chr2 (437-480)||(23820388-23820431)
chr2 (101-163)||(17396887-17396948)
chr2 (130-212)||(19669279-19669362)
chr2 (437-480)||(20015328-20015371)
chr2 (404-481)||(12641547-12641624)
chr2 (437-470)||(22284278-22284311)
chr2 (151-211)||(9636761-9636821)
chr2 (133-212)||(19666525-19666605)
chr2 (167-211)||(24884718-24884762)
chr2 (90-122)||(32465813-32465845)
chr2 (437-493)||(33128372-33128428)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (90-493)||(23153403-23153810)
chr6 (108-468)||(14626045-14626407)
chr6 (101-395)||(35009439-35009735)
chr6 (104-395)||(1657748-1658040)
chr6 (104-395)||(15862443-15862734)
chr6 (108-480)||(1650010-1650382)
chr6 (400-493)||(23148266-23148359)
chr6 (104-237)||(27740808-27740941)
chr6 (101-355)||(25175531-25175787)
chr6 (101-383)||(27653983-27654267)
chr6 (437-493)||(23995247-23995303)
chr6 (90-244)||(18381821-18381975)
chr6 (101-154)||(16825986-16826038)
chr6 (312-395)||(27751605-27751688)
chr6 (437-493)||(27751742-27751798)
chr6 (115-221)||(22361926-22362032)
chr6 (439-493)||(15742096-15742150)
chr6 (198-395)||(29665937-29666137)
chr6 (437-491)||(32276637-32276691)
chr6 (14-75)||(15889853-15889914)
chr6 (90-119)||(32898745-32898774)
chr6 (437-481)||(1657649-1657693)
chr6 (429-481)||(15862781-15862833)
chr6 (437-469)||(18002395-18002427)
chr6 (90-245)||(21623123-21623278)
chr6 (14-94)||(22585674-22585754)
chr6 (14-94)||(22590505-22590585)
chr6 (181-245)||(25367374-25367438)
chr6 (437-469)||(26090059-26090091)
chr6 (133-212)||(33324690-33324770)
chr6 (133-212)||(35136182-35136262)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (101-469)||(48565-48935)
scaffold0023 (105-361)||(36065-36323)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (104-470)||(41394191-41394560)
chr1 (101-493)||(20445646-20446043)
chr1 (101-493)||(20931312-20931706)
chr1 (101-493)||(20531411-20531807)
chr1 (90-493)||(20893527-20893933)
chr1 (101-493)||(20913004-20913391)
chr1 (101-493)||(37844350-37844746)
chr1 (230-395)||(51452589-51452755)
chr1 (101-345)||(22227777-22228022)
chr1 (101-345)||(22232474-22232719)
chr1 (108-361)||(2116228-2116484)
chr1 (263-480)||(45051554-45051769)
chr1 (3-75)||(51452530-51452602)
chr1 (101-361)||(18601140-18601402)
chr1 (108-188)||(45051416-45051496)
chr1 (101-383)||(5072388-5072672)
chr1 (91-122)||(49967607-49967638)
chr1 (437-480)||(51452809-51452852)
chr1 (130-211)||(20254308-20254389)
chr1 (133-212)||(22143531-22143611)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (101-491)||(23506932-23507324)
chr5 (90-493)||(27182447-27182854)
chr5 (109-493)||(18530964-18531355)
chr5 (105-492)||(22053730-22054125)
chr5 (230-395)||(20623066-20623232)
chr5 (230-395)||(21233528-21233694)
chr5 (233-395)||(37052844-37053007)
chr5 (230-395)||(16536294-16536460)
chr5 (104-395)||(34939248-34939540)
chr5 (230-393)||(25900408-25900571)
chr5 (101-383)||(22366481-22366765)
chr5 (101-383)||(25426596-25426880)
chr5 (101-361)||(18778014-18778276)
chr5 (101-383)||(12342-12626)
chr5 (101-383)||(19499867-19500151)
chr5 (101-383)||(21073595-21073879)
chr5 (120-361)||(4200007-4200251)
chr5 (91-175)||(17471803-17471887)
chr5 (3-75)||(20623007-20623079)
chr5 (3-75)||(21233681-21233753)
chr5 (101-361)||(27009809-27010071)
chr5 (263-383)||(29188284-29188404)
chr5 (101-361)||(43443417-43443679)
chr5 (108-181)||(29190479-29190552)
chr5 (3-75)||(25900558-25900630)
chr5 (3-75)||(37052782-37052854)
chr5 (3-75)||(16536235-16536307)
chr5 (437-493)||(108704-108760)
chr5 (437-492)||(21651018-21651073)
chr5 (437-480)||(20623286-20623329)
chr5 (437-480)||(21233431-21233474)
chr5 (437-480)||(25900309-25900352)
chr5 (437-480)||(37053061-37053104)
chr5 (133-245)||(23493916-23494029)
chr5 (432-493)||(23981381-23981442)
chr5 (437-481)||(16105967-16106011)
chr5 (437-480)||(16536514-16536557)
chr5 (449-493)||(7529240-7529284)
chr5 (181-245)||(7728466-7728530)
chr5 (437-493)||(21205249-21205304)
chr5 (437-493)||(25005137-25005193)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (90-492)||(41686-42089)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (101-466)||(19173-19543)
scaffold0195 (101-395)||(21257-21553)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (101-493)||(128071-128464)
scaffold0008 (120-361)||(31697-31942)
scaffold0008 (94-122)||(22650-22678)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (101-489)||(862-1250)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (101-493)||(247342-247738)
scaffold0012 (437-481)||(34063-34107)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (91-493)||(171863-172266)
scaffold0001 (91-493)||(177566-177969)
scaffold0001 (90-122)||(70882-70914)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (101-493)||(123063-123460)
scaffold0011 (90-122)||(255074-255106)
scaffold0011 (90-122)||(261680-261712)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (101-493)||(8846-9239)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (101-489)||(5970-6358)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (101-493)||(12083-12474)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (101-493)||(26316-26710)
scaffold0162 (108-395)||(8180-8466)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (91-493)||(271983-272386)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (105-493)||(8820-9216)
scaffold0025 (101-427)||(148688-149018)
scaffold0025 (375-493)||(146844-146962)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (263-493)||(51084-51314)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (101-459)||(4996-5356)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (263-493)||(89354-89586)
scaffold0028 (344-493)||(107684-107835)
[»] scaffold0141 (6 HSPs)
scaffold0141 (230-395)||(26892-27058)
scaffold0141 (230-388)||(22637-22796)
scaffold0141 (3-75)||(22578-22650)
scaffold0141 (3-75)||(26833-26905)
scaffold0141 (437-480)||(22857-22900)
scaffold0141 (437-480)||(27112-27155)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (230-395)||(1582-1748)
scaffold0124 (3-75)||(1735-1807)
scaffold0124 (437-480)||(1485-1528)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (101-388)||(48155-48443)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (101-388)||(107715-108003)
scaffold0026 (101-326)||(64585-64812)
scaffold0026 (338-380)||(89863-89905)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (108-395)||(13480-13769)
scaffold0132 (437-493)||(13824-13880)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (108-395)||(41622-41911)
scaffold0125 (429-493)||(41957-42021)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (103-395)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (104-395)||(34460-34755)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (108-361)||(9371-9626)
scaffold0215 (108-361)||(16269-16524)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (108-384)||(2936-3215)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (90-232)||(9338-9480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (101-345)||(5254-5498)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (263-388)||(5660-5785)
scaffold0772 (437-480)||(5846-5889)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (101-345)||(3690-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (101-360)||(42965-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (101-361)||(14083-14344)
scaffold0139 (101-361)||(21138-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (101-361)||(3-265)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (263-361)||(13347-13445)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (101-223)||(48482-48603)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (437-493)||(193373-193429)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (101-223)||(26-147)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (437-493)||(854-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (437-493)||(9858-9914)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (133-345)||(54415-54630)
scaffold0066 (437-493)||(45338-45394)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (263-383)||(1304-1424)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (437-493)||(13261-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (437-493)||(57368-57424)
scaffold0058 (338-379)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (437-493)||(108051-108107)
scaffold0032 (437-493)||(55904-55960)
scaffold0032 (133-211)||(104793-104872)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (109-188)||(3183-3262)
scaffold0361 (312-395)||(3370-3453)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (101-154)||(1815-1867)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (437-493)||(17280-17336)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (270-493)||(10232-10458)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (437-493)||(6419-6475)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (90-245)||(76984-77139)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (426-493)||(18015-18082)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (437-492)||(12395-12450)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (90-127)||(132505-132542)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (437-493)||(34284-34340)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (110-245)||(197390-197525)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (438-493)||(339-394)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (115-212)||(10642-10739)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (151-212)||(2471-2532)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (404-481)||(1480-1557)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (14-75)||(1028-1089)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (338-379)||(1546-1587)
scaffold0456 (338-379)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (90-119)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (338-379)||(8216-8257)
scaffold0123 (133-212)||(8007-8087)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (14-75)||(45815-45876)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (270-388)||(56106-56226)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (90-119)||(38253-38282)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (437-470)||(80187-80220)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (158-222)||(2548-2612)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (89-208)||(116687-116806)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16744508 - 16744040
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt 102  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16744508 aatgagatcaacatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 16744409  T
Q  103 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16744408 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaaca 16744309  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  16744308 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaa 16744209  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaa 401  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16744208 atgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaa 16744109  T
Q  402 aattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16744108 aattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaa 16744040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050171
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
T  2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 2050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030049
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
T  12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 12030049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 493
Target Start/End: Original strand, 13838852 - 13839256
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 190  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  13838852 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 13838950  T
Q  191 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 288  Q
    ||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  13838951 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13839050  T
Q  289 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13839051 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13839150  T
Q  389 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaa 487  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  13839151 tattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagagtaatcccta 13839250  T
Q  488 cttagg 493  Q
    ||||||    
T  13839251 cttagg 13839256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842475
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 14842475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 107 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
Q  107 caaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacat 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||    
T  17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
Q  207 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858996
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
Q  388 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 421  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
T  15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 286  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
Q  287 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 386  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
Q  387 atcatccataatcaaaatt 405  Q
    || |||||||| |||||||    
T  51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||    
T  15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 349 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260726
Alignment:
Q  349 aaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta 448  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  449 aagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttag 19260726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 480
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615180
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
T  15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 404  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 15615107  T
Q  405 tcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    |||||||||||  ||||||   |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615108 tcatacaacatgagaaaat--gcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 15615180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 333 - 470
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232122
Alignment:
Q  333 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaa 429  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
Q  430 aatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaa 19232122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468555
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaac 112  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
Q  113 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 175  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975722
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13975755  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13975754 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 395
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861068
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 45861035  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45861036 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
T  13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275250
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaac 112  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||    
T  22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
Q  113 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 243
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 243  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 243
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 243  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 243
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||    
T  47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 243  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 243
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||    
T  48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 243  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 361
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
Q  93 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctatt 192  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | |    
T  16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
Q  193 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 289  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
Q  290 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
T  55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2449463 - 2449391
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2449463 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168293
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 38168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
T  41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342260
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 33342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771421
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 53771421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 492
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153320
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttag 30153320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261833
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttagg 16261833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231997
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaatat 19231997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954793
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagatta 13954793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861165
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagatta 45861165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912381
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatccca 486  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatccca 17912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 481
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492740
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 23492740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 28558494 - 28558550
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28558494 atgattatgataaaaactaaccctcttaccttagataaagattaatcccaacttagg 28558550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449141
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 2449141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 54685233 - 54685178
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54685233 atgattatcataaagactaacccacttaccttggatgaagattaatcccaacttag 54685178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975944
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||    
T  13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcat 13975944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45860834
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaa 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaa 45860834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986056
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 11986056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt 94  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961008
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttag 51961008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12265050 - 12264932
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 232  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |    
T  12265050 tcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatt 12264951  T
Q  233 tcaactacaacatgtcaaa 251  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  12264950 tcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285343
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaactta 491  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaactta 14285343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955883
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 17955883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857162
Alignment:
Q  434 atgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaa 15857162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 469  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947082
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttagg 19947082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22907607 - 22907214
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt 102  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907607 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 22907508  T
Q  103 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907507 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 22907408  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22907407 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 22907308  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22907307 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193619
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||    
T  16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 405  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
Q  406 catacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagatgaatcccaacttagg 16193619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373368
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||    
T  43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
Q  399 c--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 43373368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24929096 - 24928693
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 190  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |    
T  24929096 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaa 24928998  T
Q  191 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 288  Q
    ||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  24928997 ttaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 24928898  T
Q  289 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24928897 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 24928798  T
Q  389 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaa 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  24928797 tatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattaccttagataaagattaatcccaa 24928698  T
Q  488 cttag 492  Q
    |||||    
T  24928697 cttag 24928693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404899
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaa 16404899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 395
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
T  17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
Q  204 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 383
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
T  24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
T  6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 43685584 - 43685656
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685584 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 5238125 - 5238197
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238125 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24661473 - 24661401
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661473 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385628
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 24385628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaat 320  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaat 320  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaat 320  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||     
T  23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674392
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||     
T  16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcac 16674413  T
Q  363 agttggagcacaaatttagca 383  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  16674412 agaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238447
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 5238447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907117
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 22907117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661151
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 24661151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685906
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 43685906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662481
Alignment:
Q  93 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattca 174  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattca 13662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674624
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 16674624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 71  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246650
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttca 41246650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716761
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 24716761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21494376 - 21494332
Alignment:
Q  449 aagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  21494376 aagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 21494332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt 94  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  23217924 catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 23218004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Original strand, 26680070 - 26680463
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt 102  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  26680070 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatt 26680169  T
Q  103 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680170 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 26680269  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26680270 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac 26680369  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26680370 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 493
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246793
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
Q  388 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatccc 485  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatccc 13246785  T
Q  486 aacttagg 493  Q
    ||||||||    
T  13246786 aacttagg 13246793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 90 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118167
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
Q  388 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaa 54118167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 105 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15674985
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||    
T  15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
Q  205 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 302  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
Q  303 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 400  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
Q  401 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagg 15674985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 263 - 492
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122249
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccct 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
Q  463 taccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  122220 taccttagataaagattaatcccaacttag 122249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104146
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||                   ||||||    
T  10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
Q  205 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 302  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
Q  303 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 400  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||   |    
T  10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
Q  401 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   |||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagg 10104146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
T  31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 368  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644449
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 333 - 493
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241067
Alignment:
Q  333 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
Q  431 ----atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
        ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagg 33241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13048353 - 13048221
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  13048353 gcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattga 13048254  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13048253 agttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 232  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 10488600 - 10488672
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10488600 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135883
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 15135883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272187
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 15272187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 16328134 - 16328079
Alignment:
Q  20 caatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16328134 caatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 363 - 493
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132681
Alignment:
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa 456  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    |||||||| |||||| | ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  457 cccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  31132645 cccccttaccttagattatgattaacctcaacttagg 31132681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaac 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
Q  198 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 294  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  295 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327829
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttaccttatatgaagatta 16327829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609002
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 16609002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680560
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 26680560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41166177 - 41166083
Alignment:
Q  151 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
T  41166177 tatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatca 199  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
Q  200 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 481
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952129
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 14952129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Original strand, 8374504 - 8374619
Alignment:
Q  130 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 229  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| | || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  8374504 ttttcatcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 8374603  T
Q  230 aattcaactacaacat 245  Q
    | |||||| |||||||    
T  8374604 atttcaacaacaacat 8374619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15109630 - 15109486
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatca 199  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||| | |||| |||||| | |||||||   |||||| ||    
T  15109630 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaaca 15109532  T
Q  200 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15109531 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15109486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17145639 - 17145562
Alignment:
Q  404 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||| |||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17145639 ttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 17145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17145917 - 17145796
Alignment:
Q  130 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 229  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  17145917 ttttcatcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 17145818  T
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaa 251  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  17145817 atttcaacaacaacatatcaaa 17145796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 19559410 - 19559471
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19559410 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaac 19559471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 7132014 - 7131962
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaact 489  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  7132014 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaact 7131962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 469
Target Start/End: Original strand, 7850314 - 7850346
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 469  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7850314 atgattatggtgaagactaacccccttacctta 7850346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13809711 - 13809647
Alignment:
Q  181 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  13809711 acaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 13809647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 481
Target Start/End: Original strand, 14996445 - 14996489
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14996445 atgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaa 14996489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32460623 - 32460579
Alignment:
Q  449 aagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  32460623 aagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 32460579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52265757 - 52265645
Alignment:
Q  134 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 232  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| ||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||    
T  52265757 catcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaat 52265658  T
Q  233 tcaactacaacat 245  Q
    ||||| |||||||    
T  52265657 tcaacaacaacat 52265645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Original strand, 7292886 - 7293279
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt 102  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7292886 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 7292985  T
Q  103 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292986 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 7293085  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  7293086 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 7293185  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7293186 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 89 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036914
Alignment:
Q  89 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 286  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
Q  287 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 386  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
Q  387 atcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcc 484  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcc 13036923  T
Q  485 caacttagg 493  Q
    |||||||||    
T  13036922 caacttagg 13036914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212127
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | |    
T  16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 16212127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053027
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
Q  399 c--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 36053027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580637
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
Q  399 ---caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
        ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttagg 11580637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 468
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060302
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   |    
T  3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
T  3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 397  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
Q  398 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttacctt 468  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttacctt 3060302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
T  47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 304  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
Q  305 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 394
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
T  13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca 302  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | |  ||||||| | |||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  || |||||    
T  13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
Q  303 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 394  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
T  16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 300  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
Q  301 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 360  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 263 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292338
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25292370 agttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295870
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |  | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
T  296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
Q  204 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 299  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
Q  300 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat- 398  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || ||| |||||||||||||| || ||| ||     
T  296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
Q  399 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaactt 490  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||  |   |||||||||||||||||    
T  295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacctctagcaaagattaatcccaactt 295870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
T  13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 296  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
T  2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
Q  297 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 11516265 - 11516337
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516265 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15441789 - 15441717
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441789 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 30262354 - 30262282
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262354 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
Alignment:
Q  119 aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
T  13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
Q  219 aatcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 314  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
T  13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
Q  315 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056164
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 42056164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029300
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttagg 2029300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049961
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 3049961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2190117 - 2190061
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2190117 atgattatgataaaaactaaccgccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 2190061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293376
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 7293376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516587
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 11516587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113892
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 14113892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441467
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 15441467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262032
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 30262032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  353 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  353 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480920
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 47480920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25292283 - 25292241
Alignment:
Q  438 tgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25292283 tgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagatta 25292241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292560
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||    
T  25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcat 25292560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 493
Target Start/End: Original strand, 13321326 - 13321390
Alignment:
Q  429 aaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||    
T  13321326 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctagg 13321390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 13351999 - 13352079
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt 94  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  13351999 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 13352079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 493
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709525
Alignment:
Q  400 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttaccttagattatgattaacctcaacttagg 15709525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||   ||||||||    
T  17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
T  17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124506
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttagg 25124506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37459 - 37066
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatt 102  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37459 aatgagatcaacattaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 37360  T
Q  103 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37359 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 37260  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  37259 acatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaac 37160  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37159 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36969
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 36969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36813
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
Q  399 c--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaaataaagattaatcccaacttagg 36813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1486
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | |    
T  1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttagg 1486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3484
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||| |||| |    
T  3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982340
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagactaataccaacttagg 36982340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463099
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  || ||||| |||| || | |    
T  462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 397  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
Q  398 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 463099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891605
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | |    
T  8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
Q  399 c--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctttaccttagataaagattaatcccaacttagg 8891605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 90 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794628
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 286  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
Q  287 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 386  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||    
T  19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
Q  387 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaa 19794628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341285
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
T  24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
Q  205 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 302  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
Q  303 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 400  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
Q  401 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagg 24341285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642880
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaa 43642880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 101 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627237
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| || | |    
T  20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
T  20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaa 20627237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
T  7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
Q  203 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 345  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 375 - 493
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863291
Alignment:
Q  375 aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaat 472  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22863171 aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 22863270  T
Q  473 gaagattaatcccaacttagg 493  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  22863271 aaagattaatcccaacttagg 22863291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396653
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17396685 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652772
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 9652772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14906665 - 14906593
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14906665 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 20015049 - 20015121
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015049 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 23820109 - 23820181
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23820109 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19689599 - 19689554
Alignment:
Q  30 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689599 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396556
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagatta 17396556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689304
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 19689304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21273980 - 21273925
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21273980 atgattatgataaagactaacccc-ttaccttagataaagattaatcccaacttagg 21273925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906343
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 14906343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820431
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 23820431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396887
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaa 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaa 17396887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19669362 - 19669279
Alignment:
Q  130 ttttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19669362 ttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015371
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 20015371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12641624 - 12641547
Alignment:
Q  404 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||| ||   ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12641624 ttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaa 12641547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 470
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284311
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 22284311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636821
Alignment:
Q  151 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 211  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  9636761 tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 9636821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 19666525 - 19666605
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  19666525 tcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 19666605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 211
Target Start/End: Original strand, 24884718 - 24884762
Alignment:
Q  167 atgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 211  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24884718 atgaatcatcaacaacaatatctattagcaacaacaacatcaatt 24884762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128428
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttagg 33128428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 90 - 493
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153810
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||     
T  23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
Q  388 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatccc 485  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatccc 23153802  T
Q  486 aacttagg 493  Q
    ||||||||    
T  23153803 aacttagg 23153810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626045
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
T  14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 304  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
Q  305 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 404  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
Q  405 tcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttacctt 468  Q
    ||| ||||||||||| ||||   ||| ||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  14626108 tcaaacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
T  35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
T  1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
Q  204 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 395
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
T  15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
Q  204 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650010
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
T  1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
T  1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 404  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 1650083  T
Q  405 tcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    |||||||||||  ||||||   |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650082 tcatacaacatgagaaaat--gcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 1650010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 400 - 493
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148359
Alignment:
Q  400 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttagg 23148359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 237
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||   ||  | |||| |    
T  27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
Q  204 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 237  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 355
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 355  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995303
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 23995303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||    
T  18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 244  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
T  18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825986
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 16825986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 395
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
Q  312 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751798
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttagg 27751798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
Q  115 caacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgc 213  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||     
T  22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
Q  214 acaagaat 221  Q
    ||| ||||    
T  22361933 acatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742096
Alignment:
Q  439 gattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttagg 15742096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 395
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
Q  198 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 295  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
T  29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
Q  296 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 393  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
Q  394 at 395  Q
    ||    
T  29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276637
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaactta 491  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaactta 32276637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889853
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  15889914 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac 15889853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 119
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657649
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 1657649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 481
Target Start/End: Original strand, 15862781 - 15862833
Alignment:
Q  429 aaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15862781 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 15862833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 469  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Original strand, 21623123 - 21623278
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||||||||  |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||| |||  |||||||    
T  21623123 caattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcat-ttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatc 21623221  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  21623222 acttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacat 21623278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22585754 - 22585674
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt 94  Q
    ||||||||||||||   || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22585754 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt 22585674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590505
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt 94  Q
    ||||||||||||||   || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22590585 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt 22590505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25367438 - 25367374
Alignment:
Q  181 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  25367438 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 469
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 469  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 33324690 - 33324770
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  33324690 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 33324770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35136262 - 35136182
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  35136262 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 35136182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 101 - 469
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | |    
T  48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttacctta 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 361
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |  ||| | || |||  | |||    
T  36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
Q  205 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
T  36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 470
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394560
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
T  41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 300  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
Q  301 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatca 400  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
Q  401 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 41394560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446043
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
T  20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 20446043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931706
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 20931706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531807
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
T  20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
Q  399 c--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaatttccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 20531807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 90 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893527
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
Q  388 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatccc 485  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt-acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatccc 20893535  T
Q  486 aacttagg 493  Q
    ||||||||    
T  20893534 aacttagg 20893527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913391
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | |    
T  20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 20913391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844350
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | |    
T  37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
T  37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 397  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |    
T  37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
Q  398 tc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttagg 37844350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 345
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
T  22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 345  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 345
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
T  22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 345  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116484
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
T  2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
Q  208 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 304  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
Q  305 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 480
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051769
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccc 461  Q
    |||  || ||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||   |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  45051654 agtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat--gcaaaatca-catgattatgataaagactaaccccc 45051750  T
Q  462 ttaccttaaatgaagatta 480  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45051751 ttaccttaaatgaagatta 45051769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 51452530 - 51452602
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452530 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
T  18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | ||||||    
T  45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
T  5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 122
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452852
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 51452852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 20254308 - 20254389
Alignment:
Q  130 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 211  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  20254308 ttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatt 20254389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22143611 - 22143531
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  22143611 tcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattg 22143531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 101 - 491
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507324
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaactta 491  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaactta 23507324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 90 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182447
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
Q  388 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatccc 485  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatccc 27182455  T
Q  486 aacttagg 493  Q
    ||||||||    
T  27182454 aacttagg 27182447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 109 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530964
Alignment:
Q  109 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||    
T  18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
Q  209 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 403  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |    
T  18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
Q  404 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat---gattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagg 18530964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053730
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||    
T  22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
Q  205 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 302  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
Q  303 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 400  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
Q  401 aaattcatacaacatttgaaaa--ttcacaaa--atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||    
T  22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttag 22053730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
Q  233 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  332 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 395
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
T  34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
Q  204 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 301  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || |  || | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
Q  302 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | ||  ||  |    
T  18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||| |||||  | || ||| | || |||  |    
T  19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 383  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
Q  120 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 219  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
Q  220 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 316  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
T  4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
Q  317 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17471887 - 17471803
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  17471887 aattcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 20623007 - 20623079
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623007 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21233753 - 21233681
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233753 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
T  27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
Q  363 agttggagcacaaatttagca 383  Q
    |||  |||||| ||| |||||    
T  29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |   |  |||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190479
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaacta 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacta 29190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25900630 - 25900558
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25900630 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 37052782 - 37052854
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37052782 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 16536235 - 16536307
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16536235 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108704
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 108704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 492
Target Start/End: Original strand, 21651018 - 21651073
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21651018 atgattatgataaatattaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttag 21651073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623329
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 20623329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233431
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 21233431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900309
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 25900309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053104
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 37053104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Original strand, 23493916 - 23494029
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaa 231  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |||    
T  23493916 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaa 23494015  T
Q  232 ttcaactacaacat 245  Q
    |||||| |||||||    
T  23494016 ttcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23981442 - 23981381
Alignment:
Q  432 tgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  23981442 tgattatgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttagg 23981381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 481
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106011
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 16106011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536557
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagatta 16536557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 493
Target Start/End: Original strand, 7529240 - 7529284
Alignment:
Q  449 aagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  7529240 aagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 7529284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 7728466 - 7728530
Alignment:
Q  181 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  7728466 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 7728530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 21205249 - 21205304
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21205249 atgattatgataaagactaatccc-ttatcttagatgaagattaattccaacttagg 21205304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 25005137 - 25005193
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||    
T  25005137 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttagg 25005193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 90 - 492
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42089
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| |     
T  41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 287  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
T  41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
Q  288 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 387  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
Q  388 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaa 487  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttaccttagataaatattaatcccaa 42084  T
Q  488 cttag 492  Q
    |||||    
T  42085 cttag 42089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 466
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19543
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttacc 466  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 101 - 395
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128071
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
T  128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 128071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
Q  120 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 219  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
Q  220 atcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 315  Q
    |||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
T  31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
Q  316 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 122
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
Q  94 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 862
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | |||||  |||| |||| |    
T  1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
T  1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaact 489  Q
    || |||||||||||||||||| ||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaact 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247342
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   |    
T  247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
Q  399 c--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 247342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34063
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 34063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 493
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172266
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 190  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | || | || |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
T  171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaa-caacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
Q  191 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 288  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
Q  289 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 172161  T
Q  389 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaac 488  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  172162 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaac 172261  T
Q  489 ttagg 493  Q
    |||||    
T  172262 ttagg 172266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 493
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177969
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 190  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | || | || |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
T  177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaa-caacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
Q  191 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 288  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
Q  289 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 177864  T
Q  389 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaac 488  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  177865 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaac 177964  T
Q  489 ttagg 493  Q
    |||||    
T  177965 ttagg 177969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123063
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttagg 123063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9239
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
T  8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 9239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5970
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | ||||   |||| |||| |    
T  6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
T  6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
Q  399 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaact 489  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaact 5970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12474
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
T  12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
Q  399 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  12380 caaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttagg 12474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 101 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26316
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | |    
T  26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
Q  399 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttagg 26316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
T  8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 493
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272386
Alignment:
Q  91 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 190  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |  || | |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |    
T  271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctctataa-caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
Q  191 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 288  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
Q  289 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||| | |    
T  272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatt 272281  T
Q  389 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaac 488  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  272282 tatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaac 272381  T
Q  489 ttagg 493  Q
    |||||    
T  272382 ttagg 272386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 105 - 493
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9216
Alignment:
Q  105 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||| |||    
T  8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
Q  205 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 302  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
Q  303 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 400  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
Q  401 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttaccttagattatgattaacctcaacttagg 9216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 101 - 427
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149018
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| || | |    
T  148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
Q  399 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac 427  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||    
T  148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcac 149018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 375 - 493
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146962
Alignment:
Q  375 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatga 474  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataa 146943  T
Q  475 agattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||||||||||||||    
T  146944 agattaatcccaacttagg 146962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 263 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51084
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccct 462  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatctcct 51115  T
Q  463 taccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  51114 tacctaagataaagattaatcccaacttagg 51084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | |    
T  5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 398  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||    
T  5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
Q  399 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccc 459  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 263 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89354
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 460  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
Q  461 cttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  89386 cttaccttagataaagattaatcccaacttagg 89354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 344 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107684
Alignment:
Q  344 catacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 441  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  442 tatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 107684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 6)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 388
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 22578 - 22650
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22578 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 26833 - 26905
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26833 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22900
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 22900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27155
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 27155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
Q  230 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  329 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1735
Alignment:
Q  3 aatgagatggacatcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1807 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1485
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 388
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 388
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
T  107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
T  64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcataca 326  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13880
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 13880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||    
T  41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 304  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
Q  305 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 493
Target Start/End: Original strand, 41957 - 42021
Alignment:
Q  429 aaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttagg 42021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
Q  103 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |    
T  828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
Q  203 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 300  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
T  728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
Q  301 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
Q  104 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
T  34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
Q  203 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 299  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
T  34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
Q  300 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
T  9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
T  16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
Q  208 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 305  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
Q  306 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
Q  108 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
T  2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
Q  208 aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 304  Q
    ||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
Q  305 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa 384  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||    
T  3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 189  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
Q  190 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 232  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
T  5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 345  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 263 - 388
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
Q  363 agttggagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5889
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagatta 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagatta 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 345
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
T  3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 297  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 345  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 360
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
T  42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 360  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | |||||| |  | |||  |    
T  14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | |||||| | || |||  |    
T  21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 298  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
Q  299 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 361
Target Start/End: Original strand, 3 - 265
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
T  3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 297  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
Q  298 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 361  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatca 223  Q
     |||||||| || ||||||||||    
T  48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193373
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 193373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
T  147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
Q  201 caacatcaattgcacaagaatca 223  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
T  48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 854
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9858
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagg 9858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 345
Target Start/End: Original strand, 54415 - 54630
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |    
T  54415 tcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatt 54514  T
Q  233 tcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 328  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |    
T  54515 tcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaat 54613  T
Q  329 tattatcaattcatgca 345  Q
    ||| |||||||||||||    
T  54614 tatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45394
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttagg 45394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
Q  263 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 362  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
Q  363 agttggagcacaaatttagca 383  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13261
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 13261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57368
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 57368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108051
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttagg 108051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55960
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttagg 55960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 104872 - 104793
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 211  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  104872 tcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 188
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3262
Alignment:
Q  109 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatc 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 395
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
Q  312 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 395  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1867
Alignment:
Q  101 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 1867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17280
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttaccttagatggagattaatcccaacttagg 17280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10458 - 10232
Alignment:
Q  270 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 367  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | ||| |||| |||||  | || ||||||||||||| |  || ||||||||| ||       
T  10458 tttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaa 10359  T
Q  368 gagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttacc 466  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| || | |  ||||||||||||  |||||| || ||| |||  |||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  10358 gagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttacc 10259  T
Q  467 ttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  10258 ttagatgatgattaaccccaacttagg 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6419
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttagg 6419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 188  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||    
T  77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
Q  189 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 493
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18082
Alignment:
Q  426 acaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 18082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12395
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttag 492  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattcatcccaacttag 12395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132505
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttca 132505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34284
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagg 34284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 197525 - 197390
Alignment:
Q  110 aacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatca 208  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||    
T  197525 aacaacaacaacaactcaa-ttctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatca 197427  T
Q  209 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 245  Q
    |||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  197426 attgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 493
Target Start/End: Original strand, 339 - 394
Alignment:
Q  438 tgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttagg 493  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttagg 394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10739
Alignment:
Q  115 caacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| | |||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  10642 caacaacaattcat-ttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattg 10739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2532
Alignment:
Q  151 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1557 - 1480
Alignment:
Q  404 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccccttaccttaaatgaagattaa 481  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||| |||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1557 ttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1028
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  1089 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 119
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
Q  338 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 8007 - 8087
Alignment:
Q  133 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 212  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  8007 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattg 8087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45815
Alignment:
Q  14 catcaacaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 75  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  45876 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 45815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
Q  270 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 367  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
T  56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
Q  368 gagcacaaatttagcaacaat 388  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 119
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
Q  90 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 470
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80220
Alignment:
Q  437 atgattatggtaaagactaacccccttaccttaa 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 80220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Original strand, 2548 - 2612
Alignment:
Q  158 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatc 222  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  2548 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 116806 - 116687
Alignment:
Q  89 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaa-tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacat 187  Q
    ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||| |||  |||||| |||| | |||||| | |||| |||||||| |||| ||    
T  116806 tcaattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaa-tccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatat 116708  T
Q  188 ctattagcatcaacaacatca 208  Q
    |  |||||| |||||||||||    
T  116707 cacttagcaacaacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University