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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11658_high_15 (Length: 404)
Name: NF11658_high_15
Description: NF11658
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11658_high_15 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14179055 - 14178693
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaacac |
131 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14179055 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaatgaacac |
14178956 |
T |
|
| Q |
132 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14178955 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
14178856 |
T |
|
| Q |
232 |
cactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178855 |
cactctctc--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
14178758 |
T |
|
| Q |
332 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14178757 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
14178693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14174301 - 14173939
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaacac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14174301 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagtgataaaaaaaatgaacac |
14174202 |
T |
|
| Q |
132 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174201 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
14174102 |
T |
|
| Q |
232 |
cactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174101 |
cactctctc--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
14174004 |
T |
|
| Q |
332 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14174003 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
14173939 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Original strand, 28611569 - 28611931
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaacac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28611569 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacac |
28611668 |
T |
|
| Q |
132 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611669 |
caatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
28611768 |
T |
|
| Q |
232 |
cactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611769 |
cactct--ctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
28611866 |
T |
|
| Q |
332 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28611867 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
28611931 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Original strand, 28606807 - 28607169
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaacac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
28606807 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaattaacac |
28606906 |
T |
|
| Q |
132 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606907 |
caatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
28607006 |
T |
|
| Q |
232 |
cactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607007 |
cactct--ctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
28607104 |
T |
|
| Q |
332 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28607105 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
28607169 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44161948 - 44161588
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaacac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44161948 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacac |
44161849 |
T |
|
| Q |
132 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44161848 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctctc |
44161751 |
T |
|
| Q |
232 |
cactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161750 |
cactctctt--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
44161653 |
T |
|
| Q |
332 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
44161652 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctc |
44161588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 36 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11104828 - 11104477
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn-tgaacaccaa |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11104828 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagctgtagcgataaaaatgaacaccaa |
11104729 |
T |
|
| Q |
135 |
tatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104728 |
tatttaacatagaaaatcctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattctctccac |
11104630 |
T |
|
| Q |
235 |
tctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatga |
334 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104629 |
tctcttacacaca---aagagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagagatga |
11104533 |
T |
|
| Q |
335 |
tacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattttt |
390 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104532 |
tatccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacactctattttt |
11104477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Original strand, 48826703 - 48827000
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnnt--gaacacca |
133 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48826703 |
gttgggatcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaattcaa--gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaagaacacca |
48826800 |
T |
|
| Q |
134 |
atatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
48826801 |
atatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctcttcg |
48826899 |
T |
|
| Q |
234 |
ctctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatg |
333 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826900 |
ctctctt--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
48826997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
| Q |
130 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48708155 |
accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc |
48708254 |
T |
|
| Q |
230 |
tc |
231 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
48708255 |
tc |
48708256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 305
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726442
Alignment:
| Q |
146 |
gaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctctcaca |
245 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
24726288 |
gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctct----ta |
24726383 |
T |
|
| Q |
246 |
cacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattat |
305 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
24726384 |
ccgacacgagatacactatattgttttccgtgagacc-actcctattcaaatgttattat |
24726442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12931039 - 12930678
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn---tgaacacc |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12931039 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacacc |
12930940 |
T |
|
| Q |
133 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930939 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
12930840 |
T |
|
| Q |
233 |
actctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930839 |
actctctc--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
12930742 |
T |
|
| Q |
333 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12930741 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
12930678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12935785 - 12935424
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn---tgaacacc |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12935785 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacacc |
12935686 |
T |
|
| Q |
133 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935685 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
12935586 |
T |
|
| Q |
233 |
actctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935585 |
actctctc--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
12935488 |
T |
|
| Q |
333 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12935487 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
12935424 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 247
Target Start/End: Original strand, 26504985 - 26505063
Alignment:
| Q |
169 |
aaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctctcacaca |
247 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26504985 |
aaaaccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatattctttcaactctctttcacaca |
26505063 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15589060 - 15588948
Alignment:
| Q |
125 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata |
224 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
15589060 |
tgaacatcaatatttattttgaaaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaaca |
15588961 |
T |
|
| Q |
225 |
ttctctccactct |
237 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
15588960 |
ttttctccactct |
15588948 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 26504850 - 26504895
Alignment:
| Q |
43 |
tcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaa |
88 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26504850 |
tcgacgagtttaatggaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaa |
26504895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34907502 - 34907141
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn---tgaacacc |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34907502 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacacc |
34907403 |
T |
|
| Q |
133 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907402 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
34907303 |
T |
|
| Q |
233 |
actctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagat |
332 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907302 |
actctctc--acacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
34907205 |
T |
|
| Q |
333 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34907204 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
34907141 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Original strand, 37040427 - 37040789
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaacac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37040427 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacac |
37040526 |
T |
|
| Q |
132 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37040527 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttctc |
37040626 |
T |
|
| Q |
232 |
cactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga |
331 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040627 |
cactct--ctcacacacacaagagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
37040724 |
T |
|
| Q |
332 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37040725 |
tgatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctc |
37040789 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15290593 - 15290243
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaa-gagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn----tgaaca |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
15290593 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaatccaaaaagagattggatcttgcagcgcagccttagcgataaaaaaaatgaaca |
15290494 |
T |
|
| Q |
131 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290493 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattctct |
15290394 |
T |
|
| Q |
231 |
ccactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagag |
330 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290393 |
ccact--ctcttacacacacaagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctat--tatttcagcacctagaagttatagag |
15290299 |
T |
|
| Q |
331 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15290298 |
atgatacccacccggtgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactctatt |
15290243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12099360 - 12099060
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn-tgaacaccaa |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||| | ||| |
|
|
| T |
12099360 |
gttgggctcgacgagtttaacgcgagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagatatgatcttgcagctcaccgatagcgataaaaatgaaaagcaa |
12099261 |
T |
|
| Q |
135 |
tatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccac |
234 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099260 |
tattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctccac |
12099161 |
T |
|
| Q |
235 |
tctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatga |
334 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099160 |
t--ctcttacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagatga |
12099063 |
T |
|
| Q |
335 |
tac |
337 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
12099062 |
tac |
12099060 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12082021
Alignment:
| Q |
182 |
aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagac |
281 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctctt--acacggaaaagagatacaatatagtgtttctaatgagac |
12082131 |
T |
|
| Q |
282 |
ctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacac |
381 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082130 |
tcgctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacac |
12082032 |
T |
|
| Q |
382 |
tctatttttct |
392 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
12082031 |
tctaattttct |
12082021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 271
Target Start/End: Original strand, 2757307 - 2757448
Alignment:
| Q |
127 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||| |||| || | |||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||| || |||| |
|
|
| T |
2757307 |
aacaccaatatttaatatgaaaacccctttaatgcttaaggaaaaaccatgagacaaattttgaaaa-tattccactatatttaaaaatattgcactatt |
2757405 |
T |
|
| Q |
227 |
ctctccactctctctcacacacacaagagatacaatatagtgttt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757406 |
ctctccactctcttt--cacactcaagagatacaatatagtgttt |
2757448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12084750 - 12084669
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagc |
117 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
12084750 |
gttgggctcaacgagcttaacacgagggtaaattaaaatttcaaaatccaatagacattggatcttgtagcgcaacggtagc |
12084669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 95
Target Start/End: Original strand, 2757236 - 2757273
Alignment:
| Q |
58 |
caagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattg |
95 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
2757236 |
caagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaattg |
2757273 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 382
Target Start/End: Original strand, 29106879 - 29107224
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn-tgaacaccaa |
134 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29106879 |
gttgggatcgaggagcttaatgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaatgaacaccaa |
29106978 |
T |
|
| Q |
135 |
tatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106979 |
tatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca- |
29107077 |
T |
|
| Q |
235 |
tctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatga |
334 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29107078 |
-ctctcttacacacacaagagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatga |
29107175 |
T |
|
| Q |
335 |
ta-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacact |
382 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29107176 |
taccccacccaatgtatttttcccacactctctggatttactcaacact |
29107224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 36 - 390
Target Start/End: Original strand, 42910994 - 42911346
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn-tgaacaccaa |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
42910994 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtggaaattaaaattttaaaatccaaaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaatgaacaccaa |
42911093 |
T |
|
| Q |
135 |
tatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911094 |
tatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctccac |
42911192 |
T |
|
| Q |
235 |
tctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatga |
334 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911193 |
tct--ctcacacacacaaaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatga |
42911290 |
T |
|
| Q |
335 |
tacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattttt |
390 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911291 |
tacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttt |
42911346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Original strand, 38997230 - 38997320
Alignment:
| Q |
126 |
gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
216 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38997230 |
gaacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 38994700 - 38994779
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggta |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38994700 |
gttgggcttgacgatcttaatgctagtgtaaattaaaattccaaaacccaaacaaaattggatcttgcagtgcagcggta |
38994779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 36 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8539547 - 8539185
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagcnnnnnnn--tgaacacca |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |
|
|
| T |
8539547 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaattctaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtaacaataaaaaatgaacatca |
8539448 |
T |
|
| Q |
134 |
atatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8539447 |
atatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctcca |
8539348 |
T |
|
| Q |
234 |
ctctctctcacacacacaagagatacaa---tatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagag |
330 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
8539347 |
ct--ctcttacacacacaagagatacaatattatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagag |
8539251 |
T |
|
| Q |
331 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctc |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
8539250 |
atgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctc |
8539185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302168
Alignment:
| Q |
253 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
|
| Q |
353 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttc |
391 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttc |
51302168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51303018 - 51302937
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcacagcggtagc |
117 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51303018 |
gttgggatcgacgagcttaatgcaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaacagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
51302937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51302344 - 51302308
Alignment:
| Q |
125 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302344 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac |
51302308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 2100200 - 2100379
Alignment:
| Q |
36 |
gttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattgga-tcttgcagcacagcggtagcnnnnnnnt-gaacacca |
133 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| || || | ||||| || |
|
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| T |
2100200 |
gttgggctcgacgagcttaacacaagtgtaaattaaaattccaaaattcataagagatttgaattttgcagcacaacgataatgataaaattgaacatca |
2100299 |
T |
|
| Q |
134 |
atatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
216 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
2100300 |
atatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaac---ggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100771
Alignment:
| Q |
209 |
aaagaatattacaatattctctccactctctctcacacacacaagagatac |
259 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |
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| T |
2100723 |
aaagaatattacaatattctctcca--ctctcttacatacacaagagatac |
2100771 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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