View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11682_high_6 (Length: 410)
Name: NF11682_high_6
Description: NF11682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11682_high_6 |
 | |
|
| [»] chr6 (1 HSPs) |
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| [»] chr4 (5 HSPs) |
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| [»] chr7 (7 HSPs) |
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| [»] chr2 (5 HSPs) |
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| [»] chr1 (3 HSPs) |
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| [»] chr8 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] chr5 (1 HSPs) |
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|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3590915 - 3590506
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
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| T |
3590915 |
tttgcaatgatcatacttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
3590816 |
T |
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| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
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| T |
3590815 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtca |
3590716 |
T |
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| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
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| T |
3590715 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
3590616 |
T |
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| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
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| T |
3590615 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
3590516 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
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| T |
3590515 |
aaccccgaat |
3590506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18201063 - 18200658
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18201063 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
18200964 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
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| T |
18200963 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtca |
18200864 |
T |
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| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
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| T |
18200863 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
18200764 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18200763 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctattcttattcc |
18200664 |
T |
|
| Q |
401 |
aacccc |
406 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18200663 |
aacccc |
18200658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26950834 - 26950425
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26950834 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaaacatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
26950735 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26950734 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacatagtca |
26950635 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26950634 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
26950535 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
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| T |
26950534 |
aaaagagatgataataaattagataacaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
26950435 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
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|||||||||| |
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|
| T |
26950434 |
aaccccgaat |
26950425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 36092213 - 36092622
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36092213 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
36092312 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36092313 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacagcttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacaatca |
36092412 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36092413 |
cattagtataatcaaccaccactgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
36092512 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36092513 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcagattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
36092612 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
36092613 |
aaccccgaat |
36092622 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 36091838 - 36091931
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36091838 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagtcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat |
36091931 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26951209 - 26951116
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26951209 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagtcatatggttagatagatccttattcagccaatagaat |
26951116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 41860283 - 41860692
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41860283 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagtcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
41860382 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41860383 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
41860482 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41860483 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
41860582 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41860583 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
41860682 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
41860683 |
aaccccgaat |
41860692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52682047 - 52681638
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52682047 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
52681948 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52681947 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
52681848 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
52681847 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaatctccttctagaatataacaaacaaa |
52681748 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
52681747 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatccaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcatactcttatttc |
52681648 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
52681647 |
aaccccgaat |
52681638 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 52682422 - 52682329
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52682422 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagtcatatgcttagatagatccttattcatccaatagaat |
52682329 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 404
Target Start/End: Original strand, 30576448 - 30576644
Alignment:
| Q |
207 |
tttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac-------aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccg |
299 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
30576448 |
tttattcaaccaccaccatataaatcatcagcgcaggggccttcttgcaagttacgaaaaccaccgccgcataaacctcgttctagaaaatat------- |
30576540 |
T |
|
| Q |
300 |
aaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattc |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
30576541 |
-aaaagagatggtaataaattagataacaatgaaattcaaaaactcgtcgaattacaaataacaaaaaatccaattaaacaaaagctcttgctcttattc |
30576639 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14991423 - 14991361
Alignment:
| Q |
321 |
agatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaat |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14991423 |
agatagcaatgcaattcagaatctcatcataatacaaataaccaaagatcaaattaaacaaat |
14991361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22006294 - 22005885
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22006294 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaaggcacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
22006195 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22006194 |
tgaagcattgggccaatgcttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
22006095 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22006094 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
22005995 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22005994 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttatttc |
22005895 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22005894 |
aaccccgaat |
22005885 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7893070 - 7892661
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7893070 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
7892971 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7892970 |
tgaagcattgggccaatccttattaaatcaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
7892871 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7892870 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
7892771 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
7892770 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatccaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcatactcttatttc |
7892671 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
7892670 |
aaccccgaat |
7892661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 190 - 410
Target Start/End: Original strand, 3598843 - 3599069
Alignment:
| Q |
190 |
agacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttcta----- |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3598843 |
agacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcatcgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagatct |
3598942 |
T |
|
| Q |
285 |
-gaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaat |
383 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3598943 |
agaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcgaaatacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaat |
3599042 |
T |
|
| Q |
384 |
gctcctactcttattccaaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3599043 |
gctcccactcttattccaaccccgaat |
3599069 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 3595741 - 3595936
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3595741 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacc |
3595840 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacaca |
196 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3595841 |
tgaagcattgggccaatccttattgaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcagaggacatctaagacaca |
3595936 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7893445 - 7893352
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7893445 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagtcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat |
7893352 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22006669 - 22006576
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22006669 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaacggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat |
22006576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 397
Target Start/End: Original strand, 13604144 - 13604217
Alignment:
| Q |
324 |
tagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttat |
397 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
13604144 |
tagcaatacaatttaaacactcaccagattacgaataaccaaaaatcaaattaaacaaatgttattactcttat |
13604217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13907576 - 13907167
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13907576 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaaggcacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
13907477 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |
|
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| T |
13907476 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacattca |
13907377 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
13907376 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
13907277 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13907276 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttatttc |
13907177 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
13907176 |
aaccccgaat |
13907167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26455221 - 26454812
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26455221 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatatcttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
26455122 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26455121 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttttagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
26455022 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26455021 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
26454922 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26454921 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcatactcttatttc |
26454822 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
26454821 |
aaccccgaat |
26454812 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40605058 - 40604649
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |
|
|
| T |
40605058 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcaaccaatagaatatcaaa |
40604959 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40604958 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
40604859 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40604858 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
40604759 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
40604758 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatccaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcatactcttatttc |
40604659 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
40604658 |
aaccccgaat |
40604649 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13907951 - 13907858
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13907951 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaacggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat |
13907858 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26455596 - 26455503
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaat |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26455596 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagtaatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat |
26455503 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 35595360 - 35595769
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35595360 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacaaaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
35595459 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35595460 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatataaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtca |
35595559 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35595560 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
35595659 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
35595660 |
aaaggagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcaacggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcccactcttattcc |
35595759 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
35595760 |
aaccccgaat |
35595769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 2045659 - 2046068
Alignment:
| Q |
1 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2045659 |
tttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcaca |
2045758 |
T |
|
| Q |
101 |
taaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2045759 |
tgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtca |
2045858 |
T |
|
| Q |
201 |
catcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccga |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2045859 |
catcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaa |
2045958 |
T |
|
| Q |
301 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaatgctcctactcttattcc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
2045959 |
aaaagagatgataataaattagatagcaatccaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaataaatgctcatactcttatttc |
2046058 |
T |
|
| Q |
401 |
aaccccgaat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
2046059 |
aaccccgaat |
2046068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 52589782 - 52589715
Alignment:
| Q |
316 |
aaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcggattacaaataaccaaaaatcaaactaaacaaat |
383 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52589782 |
aaattagatagcaatgcaattcaaaaactcgttacattacaaataacaaaaaatcaaatcaaacaaat |
52589715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32674586 - 32674177
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