View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11685_low_3 (Length: 564)

Name: NF11685_low_3
Description: NF11685
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11685_low_3
NF11685_low_3
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (1-290)||(21914952-21915241)
chr5 (1-232)||(18239557-18239788)
chr5 (1-200)||(22937030-22937229)
chr5 (1-188)||(42062752-42062939)
chr5 (1-186)||(2837134-2837319)
chr5 (1-232)||(17664383-17664613)
chr5 (1-180)||(26752814-26752993)
chr5 (28-278)||(18765657-18765907)
chr5 (1-180)||(41876877-41877056)
chr5 (1-232)||(34831595-34831825)
chr5 (52-189)||(563363-563500)
chr5 (1-186)||(20055605-20055789)
chr5 (1-217)||(26292622-26292837)
chr5 (1-232)||(4099578-4099808)
chr5 (1-180)||(14375921-14376099)
chr5 (1-180)||(21335811-21335989)
chr5 (6-180)||(7270852-7271025)
chr5 (1-232)||(12087789-12088019)
chr5 (1-160)||(32837849-32838007)
chr5 (1-180)||(43491586-43491765)
chr5 (1-178)||(7624933-7625110)
chr5 (1-178)||(26895719-26895895)
chr5 (1-232)||(14016199-14016430)
chr5 (1-136)||(17748271-17748406)
chr5 (1-180)||(18952524-18952702)
chr5 (1-180)||(34133096-34133274)
chr5 (1-180)||(34143327-34143505)
chr5 (1-232)||(40583080-40583310)
chr5 (6-180)||(12058605-12058778)
chr5 (22-180)||(21332793-21332950)
chr5 (1-177)||(26907571-26907746)
chr5 (1-177)||(30066173-30066348)
chr5 (1-180)||(41306640-41306818)
chr5 (1-129)||(23043995-23044123)
chr5 (1-232)||(39192159-39192389)
chr5 (6-232)||(33551958-33552182)
chr5 (1-284)||(31575248-31575529)
chr5 (1-136)||(28787478-28787614)
chr5 (1-180)||(31863531-31863724)
chr5 (1-180)||(11959287-11959462)
chr5 (1-103)||(22130095-22130197)
chr5 (100-179)||(22131159-22131238)
chr5 (294-347)||(31575555-31575609)
chr5 (442-500)||(7271329-7271385)
chr5 (442-500)||(21332440-21332496)
chr5 (442-500)||(4099291-4099347)
chr5 (452-501)||(21335458-21335506)
chr5 (335-371)||(2453469-2453505)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (1-275)||(18542467-18542740)
chr3 (1-290)||(22993688-22993977)
chr3 (6-250)||(3292990-3293234)
chr3 (50-250)||(17545820-17546020)
chr3 (1-232)||(11784681-11784912)
chr3 (5-232)||(32287371-32287598)
chr3 (1-232)||(30220053-30220287)
chr3 (1-180)||(2775397-2775576)
chr3 (1-180)||(16184787-16184966)
chr3 (1-180)||(43809495-43809674)
chr3 (1-180)||(2778640-2778819)
chr3 (1-180)||(7486486-7486665)
chr3 (22-232)||(18644816-18645026)
chr3 (1-180)||(45896296-45896475)
chr3 (1-232)||(49742967-49743198)
chr3 (1-180)||(6434878-6435056)
chr3 (1-180)||(8461587-8461765)
chr3 (1-232)||(10884773-10885003)
chr3 (1-180)||(29343974-29344153)
chr3 (1-180)||(43926751-43926929)
chr3 (1-186)||(3840432-3840617)
chr3 (1-186)||(41976931-41977115)
chr3 (1-232)||(35412431-35412656)
chr3 (1-180)||(538742-538921)
chr3 (1-180)||(2873480-2873658)
chr3 (1-180)||(48064135-48064313)
chr3 (1-232)||(50461596-50461827)
chr3 (1-180)||(52199829-52200007)
chr3 (1-180)||(53815744-53815922)
chr3 (1-232)||(54719887-54720117)
chr3 (1-180)||(54723657-54723836)
chr3 (1-222)||(19301563-19301783)
chr3 (1-222)||(30690652-30690872)
chr3 (1-180)||(12561334-12561512)
chr3 (1-180)||(17040122-17040300)
chr3 (1-232)||(20728695-20728925)
chr3 (1-180)||(24125415-24125593)
chr3 (1-180)||(24128692-24128870)
chr3 (1-180)||(27091810-27091989)
chr3 (29-232)||(31549115-31549318)
chr3 (1-180)||(32367229-32367407)
chr3 (30-200)||(282271-282441)
chr3 (46-232)||(35751401-35751587)
chr3 (6-180)||(46884862-46885035)
chr3 (9-232)||(16243797-16244019)
chr3 (1-180)||(22416934-22417112)
chr3 (1-232)||(23298663-23298894)
chr3 (1-180)||(55034960-55035139)
chr3 (1-222)||(10881396-10881616)
chr3 (1-186)||(11190442-11190627)
chr3 (460-549)||(38386949-38387038)
chr3 (6-178)||(15195404-15195575)
chr3 (1-180)||(28008171-28008348)
chr3 (1-180)||(9392650-9392828)
chr3 (1-232)||(10106647-10106877)
chr3 (1-179)||(52988321-52988498)
chr3 (1-180)||(28265796-28265971)
chr3 (1-136)||(25443003-25443138)
chr3 (37-180)||(25584628-25584771)
chr3 (1-180)||(34983953-34984131)
chr3 (1-222)||(22783508-22783739)
chr3 (1-222)||(22787872-22788103)
chr3 (6-180)||(47051416-47051590)
chr3 (6-180)||(47054846-47055020)
chr3 (1-186)||(19304783-19304967)
chr3 (1-136)||(17141324-17141459)
chr3 (1-232)||(17531704-17531928)
chr3 (81-188)||(54461010-54461117)
chr3 (119-232)||(18641820-18641933)
chr3 (37-148)||(27298594-27298705)
chr3 (63-145)||(27308157-27308239)
chr3 (46-148)||(27308717-27308818)
chr3 (1-233)||(17528808-17529035)
chr3 (1-82)||(52309754-52309835)
chr3 (304-371)||(18542787-18542854)
chr3 (1-73)||(31857732-31857804)
chr3 (44-114)||(6030770-6030840)
chr3 (7-44)||(38386908-38386945)
chr3 (99-180)||(55032100-55032181)
chr3 (1-40)||(17544531-17544570)
chr3 (442-497)||(52309377-52309430)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-370)||(5796369-5796755)
chr7 (6-297)||(18562534-18562825)
chr7 (1-232)||(16165566-16165797)
chr7 (6-217)||(5242232-5242444)
chr7 (1-232)||(2441344-2441575)
chr7 (1-180)||(23225023-23225202)
chr7 (1-186)||(11398137-11398322)
chr7 (1-180)||(8276803-8276982)
chr7 (1-178)||(7227345-7227522)
chr7 (1-177)||(13449897-13450072)
chr7 (1-232)||(10468962-10469192)
chr7 (1-250)||(13809566-13809809)
chr7 (1-250)||(48645292-48645539)
chr7 (1-180)||(13842458-13842636)
chr7 (1-232)||(26557317-26557547)
chr7 (1-180)||(45287187-45287365)
chr7 (1-232)||(4596075-4596305)
chr7 (1-180)||(9132878-9133056)
chr7 (1-232)||(9864792-9865023)
chr7 (1-232)||(20594081-20594311)
chr7 (1-180)||(26136246-26136424)
chr7 (1-222)||(4546687-4546907)
chr7 (1-232)||(3068043-3068273)
chr7 (1-232)||(6603276-6603507)
chr7 (1-180)||(17730632-17730810)
chr7 (1-180)||(26144626-26144804)
chr7 (1-187)||(37166258-37166443)
chr7 (1-170)||(37415553-37415721)
chr7 (1-170)||(37423085-37423253)
chr7 (1-217)||(10345032-10345247)
chr7 (11-190)||(24918022-24918201)
chr7 (11-199)||(2090433-2090621)
chr7 (1-232)||(14683510-14683740)
chr7 (1-180)||(20080836-20081014)
chr7 (1-154)||(4695342-4695494)
chr7 (1-133)||(22611771-22611903)
chr7 (50-222)||(9271541-9271705)
chr7 (442-500)||(11397820-11397877)
chr7 (452-500)||(33844380-33844427)
chr7 (119-180)||(45290598-45290658)
chr7 (452-504)||(4595765-4595816)
chr7 (302-357)||(48645607-48645663)
chr7 (442-500)||(10345474-10345530)
chr7 (120-180)||(4542734-4542793)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (6-290)||(21434479-21434763)
chr1 (46-297)||(27355684-27355935)
chr1 (1-297)||(27331774-27332062)
chr1 (1-290)||(7635477-7635766)
chr1 (6-250)||(34732405-34732647)
chr1 (1-232)||(23021984-23022215)
chr1 (6-232)||(673133-673359)
chr1 (1-180)||(6071066-6071245)
chr1 (1-180)||(45941248-45941427)
chr1 (1-232)||(20398685-20398916)
chr1 (1-232)||(21018528-21018758)
chr1 (1-180)||(31204670-31204849)
chr1 (1-180)||(2794060-2794238)
chr1 (1-232)||(21107352-21107582)
chr1 (1-180)||(28110888-28111067)
chr1 (1-180)||(45960857-45961036)
chr1 (1-180)||(49853191-49853369)
chr1 (1-232)||(905746-905980)
chr1 (1-232)||(1950516-1950746)
chr1 (1-180)||(3796939-3797117)
chr1 (1-232)||(29643282-29643512)
chr1 (1-147)||(11668171-11668317)
chr1 (1-180)||(49498610-49498789)
chr1 (1-232)||(37183924-37184155)
chr1 (118-238)||(16055623-16055743)
chr1 (1-180)||(41058415-41058593)
chr1 (1-177)||(2405342-2405517)
chr1 (118-238)||(16056858-16056978)
chr1 (111-240)||(13431012-13431141)
chr1 (118-297)||(16060965-16061144)
chr1 (70-217)||(27355020-27355165)
chr1 (141-232)||(11667062-11667153)
chr1 (155-238)||(16062270-16062353)
chr1 (174-277)||(30938578-30938681)
chr1 (29-135)||(34066599-34066705)
chr1 (302-365)||(7635795-7635857)
chr1 (302-365)||(16056712-16056777)
chr1 (304-371)||(30938467-30938535)
chr1 (309-371)||(34065064-34065128)
chr1 (78-128)||(16062347-16062397)
chr1 (142-232)||(21111219-21111309)
chr1 (119-169)||(42022589-42022639)
chr1 (452-501)||(21110912-21110960)
chr1 (334-371)||(29643125-29643162)
chr1 (309-365)||(16055477-16055533)
chr1 (335-371)||(50196853-50196889)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (1-239)||(22172428-22172665)
chr4 (1-290)||(37739762-37740054)
chr4 (1-250)||(8877545-8877793)
chr4 (1-178)||(48014167-48014344)
chr4 (1-232)||(12238095-12238326)
chr4 (1-232)||(8874822-8875053)
chr4 (5-232)||(53094341-53094568)
chr4 (1-232)||(34017842-34018073)
chr4 (1-232)||(44809016-44809247)
chr4 (1-232)||(56195357-56195588)
chr4 (1-180)||(15812250-15812429)
chr4 (1-232)||(24150502-24150733)
chr4 (1-180)||(34320030-34320209)
chr4 (1-180)||(39501478-39501657)
chr4 (1-186)||(56198683-56198868)
chr4 (1-250)||(33408361-33408609)
chr4 (1-232)||(15164022-15164254)
chr4 (1-232)||(3797869-3798099)
chr4 (1-232)||(44164613-44164843)
chr4 (1-232)||(52006592-52006822)
chr4 (14-180)||(40616921-40617087)
chr4 (30-239)||(33493749-33493958)
chr4 (1-213)||(40794832-40795044)
chr4 (1-177)||(40903199-40903375)
chr4 (1-232)||(3718954-3719184)
chr4 (1-180)||(46955591-46955770)
chr4 (22-180)||(5672746-5672904)
chr4 (1-187)||(40493474-40493659)
chr4 (1-179)||(48415643-48415821)
chr4 (1-180)||(48637335-48637514)
chr4 (1-232)||(12782735-12782965)
chr4 (1-180)||(18673195-18673373)
chr4 (1-180)||(24044254-24044432)
chr4 (1-180)||(27014093-27014272)
chr4 (1-180)||(27679338-27679516)
chr4 (1-180)||(29324655-29324834)
chr4 (1-180)||(52531048-52531227)
chr4 (1-222)||(15446807-15447027)
chr4 (5-233)||(19859582-19859809)
chr4 (25-180)||(5670431-5670586)
chr4 (1-180)||(15431909-15432087)
chr4 (1-232)||(19820558-19820788)
chr4 (1-232)||(27677116-27677346)
chr4 (1-187)||(30392399-30392584)
chr4 (6-186)||(49270518-49270695)
chr4 (6-180)||(37103329-37103501)
chr4 (1-170)||(19827320-19827488)
chr4 (1-180)||(11195506-11195684)
chr4 (1-232)||(29544935-29545165)
chr4 (1-180)||(53009671-53009849)
chr4 (46-180)||(18911374-18911507)
chr4 (1-179)||(21419619-21419796)
chr4 (35-250)||(5677452-5677657)
chr4 (1-180)||(15405194-15405376)
chr4 (1-180)||(5681258-5681436)
chr4 (1-180)||(15429969-15430147)
chr4 (5-180)||(19864626-19864800)
chr4 (1-180)||(38283602-38283780)
chr4 (6-180)||(35509800-35509973)
chr4 (1-180)||(15436583-15436761)
chr4 (1-136)||(25961888-25962023)
chr4 (35-232)||(33926836-33927033)
chr4 (442-501)||(26060803-26060861)
chr4 (442-500)||(3797579-3797636)
chr4 (442-501)||(15404845-15404903)
chr4 (442-501)||(15811899-15811957)
chr4 (442-501)||(56195827-56195885)
chr4 (442-500)||(56199154-56199211)
chr4 (105-169)||(8448680-8448744)
chr4 (335-371)||(10386120-10386156)
chr4 (501-545)||(29442165-29442209)
chr4 (442-501)||(19821015-19821072)
chr4 (336-371)||(33927154-33927189)
chr4 (304-369)||(5677318-5677383)
chr4 (1-86)||(8448748-8448834)
chr4 (442-500)||(19827722-19827778)
chr4 (450-500)||(40795320-40795369)
chr4 (294-357)||(5681564-5681629)
chr4 (335-370)||(10248001-10248037)
chr4 (335-371)||(19929069-19929105)
chr4 (55-95)||(24410206-24410246)
chr4 (501-545)||(29439520-29439564)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (1-232)||(11247594-11247824)
chr6 (15-240)||(28848687-28848912)
chr6 (6-250)||(2846139-2846383)
chr6 (1-222)||(12988196-12988417)
chr6 (1-238)||(13021309-13021546)
chr6 (1-199)||(24371106-24371305)
chr6 (6-180)||(6513093-6513267)
chr6 (5-250)||(5259773-5260014)
chr6 (1-232)||(1125796-1126027)
chr6 (1-228)||(9839459-9839686)
chr6 (1-232)||(22561224-22561455)
chr6 (49-232)||(23007941-23008124)
chr6 (49-232)||(23780240-23780423)
chr6 (1-180)||(5738197-5738376)
chr6 (5-186)||(14281627-14281808)
chr6 (1-177)||(2379062-2379238)
chr6 (1-214)||(11192657-11192871)
chr6 (1-232)||(9953796-9954026)
chr6 (1-180)||(11402089-11402268)
chr6 (1-232)||(20185577-20185807)
chr6 (1-232)||(22150184-22150414)
chr6 (1-180)||(30655276-30655455)
chr6 (1-180)||(3596894-3597073)
chr6 (1-180)||(10289805-10289983)
chr6 (5-232)||(13005025-13005252)
chr6 (1-232)||(28230427-28230657)
chr6 (1-232)||(26942496-26942726)
chr6 (1-180)||(23384865-23385045)
chr6 (1-187)||(24400012-24400197)
chr6 (6-180)||(28111879-28112051)
chr6 (5-142)||(2372162-2372295)
chr6 (1-136)||(24410131-24410266)
chr6 (1-187)||(19475835-19476020)
chr6 (35-232)||(17106671-17106867)
chr6 (1-153)||(18856165-18856316)
chr6 (1-180)||(4512305-4512483)
chr6 (1-187)||(13946851-13947036)
chr6 (1-170)||(11125819-11125987)
chr6 (1-114)||(31072137-31072250)
chr6 (6-160)||(28107923-28108075)
chr6 (63-180)||(7128194-7128310)
chr6 (308-367)||(11192493-11192551)
chr6 (321-369)||(9839304-9839352)
chr6 (302-357)||(24371366-24371422)
chr6 (1-77)||(11188131-11188207)
chr6 (1-61)||(23388328-23388388)
chr6 (451-506)||(16731648-16731702)
chr6 (442-500)||(20186045-20186102)
chr6 (442-500)||(22149889-22149946)
chr6 (451-500)||(20527156-20527204)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-177)||(118561-118737)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (1-278)||(4868085-4868356)
chr8 (1-232)||(12516514-12516745)
chr8 (1-232)||(22173984-22174215)
chr8 (1-180)||(14421572-14421751)
chr8 (5-232)||(45155330-45155557)
chr8 (1-232)||(18825948-18826179)
chr8 (1-232)||(43681931-43682162)
chr8 (1-180)||(8911475-8911654)
chr8 (1-232)||(12582836-12583066)
chr8 (1-180)||(18721394-18721573)
chr8 (1-232)||(18824455-18824686)
chr8 (8-200)||(23643654-23643846)
chr8 (1-180)||(25591592-25591770)
chr8 (1-232)||(36710697-36710928)
chr8 (1-177)||(10663727-10663902)
chr8 (1-232)||(21279830-21280060)
chr8 (5-180)||(38248512-38248686)
chr8 (7-177)||(25594773-25594943)
chr8 (14-178)||(25230921-25231085)
chr8 (1-232)||(17930809-17931039)
chr8 (1-180)||(23619477-23619655)
chr8 (1-180)||(31284502-31284680)
chr8 (1-187)||(33419484-33419669)
chr8 (1-232)||(5980374-5980604)
chr8 (1-222)||(5613788-5614019)
chr8 (1-180)||(10498327-10498505)
chr8 (1-189)||(30784757-30784934)
chr8 (1-154)||(5538912-5539065)
chr8 (1-186)||(13196685-13196869)
chr8 (1-177)||(2560380-2560556)
chr8 (1-180)||(16953604-16953783)
chr8 (55-232)||(44027154-44027330)
chr8 (442-500)||(33883114-33883171)
chr8 (302-357)||(5538693-5538749)
chr8 (451-502)||(12820638-12820688)
chr8 (336-371)||(14589526-14589561)
chr8 (442-500)||(5538535-5538591)
chr8 (142-232)||(33883411-33883501)
chr8 (452-501)||(12583328-12583376)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (5-232)||(22020884-22021111)
chr2 (9-232)||(25138993-25139216)
chr2 (1-232)||(25959750-25959981)
chr2 (1-232)||(30274830-30275061)
chr2 (1-180)||(43208003-43208182)
chr2 (11-200)||(35521455-35521648)
chr2 (1-232)||(9185486-9185717)
chr2 (1-232)||(31427603-31427834)
chr2 (1-177)||(9966486-9966662)
chr2 (1-180)||(11348009-11348188)
chr2 (1-222)||(36808514-36808734)
chr2 (1-232)||(9188714-9188945)
chr2 (1-180)||(24234908-24235087)
chr2 (1-232)||(25820908-25821138)
chr2 (1-232)||(27266601-27266832)
chr2 (1-180)||(31586054-31586233)
chr2 (1-232)||(42368773-42369003)
chr2 (1-180)||(5105539-5105718)
chr2 (1-180)||(8888449-8888627)
chr2 (1-180)||(24238180-24238359)
chr2 (1-180)||(37279790-37279969)
chr2 (6-232)||(45456979-45457205)
chr2 (1-180)||(5666331-5666509)
chr2 (1-180)||(6826585-6826763)
chr2 (1-180)||(13972008-13972186)
chr2 (1-232)||(16178940-16179170)
chr2 (1-180)||(26365746-26365925)
chr2 (1-180)||(45493270-45493448)
chr2 (1-180)||(45501012-45501190)
chr2 (11-232)||(45453696-45453917)
chr2 (1-181)||(43723513-43723692)
chr2 (1-232)||(1386484-1386714)
chr2 (1-180)||(25870597-25870775)
chr2 (1-297)||(30926360-30926648)
chr2 (1-232)||(33310479-33310710)
chr2 (1-232)||(38015331-38015562)
chr2 (1-232)||(40259201-40259431)
chr2 (110-297)||(34682622-34682807)
chr2 (1-180)||(3875099-3875277)
chr2 (1-187)||(17874694-17874874)
chr2 (1-180)||(25873988-25874166)
chr2 (1-176)||(37937337-37937511)
chr2 (1-180)||(40781285-40781463)
chr2 (6-136)||(17876924-17877054)
chr2 (1-180)||(22630654-22630832)
chr2 (1-177)||(12219608-12219784)
chr2 (1-180)||(16790871-16791051)
chr2 (68-180)||(29440375-29440486)
chr2 (28-198)||(11187925-11188095)
chr2 (1-96)||(10600759-10600854)
chr2 (1-93)||(17876211-17876303)
chr2 (442-501)||(31427305-31427363)
chr2 (442-503)||(45457445-45457505)
chr2 (302-357)||(25820767-25820823)
chr2 (302-357)||(34682829-34682883)
chr2 (446-501)||(45454161-45454215)
chr2 (442-502)||(5666810-5666868)
chr2 (118-154)||(6298395-6298431)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (29-278)||(48418-48667)
scaffold0034 (302-339)||(48343-48380)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (1-371)||(9768-10156)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-180)||(3901-4080)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (1-232)||(3343-3574)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-180)||(19226-19405)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-170)||(57712-57881)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (1-232)||(124-355)
[»] scaffold0520 (4 HSPs)
scaffold0520 (1-180)||(8332-8510)
scaffold0520 (65-232)||(1609-1775)
scaffold0520 (1-85)||(4187-4271)
scaffold0520 (443-500)||(1304-1359)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-180)||(62348-62526)
scaffold0035 (1-180)||(63691-63868)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (1-232)||(5183-5413)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (1-180)||(5511-5690)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-232)||(30925-31155)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-180)||(292854-293032)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-232)||(67586-67816)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (22-180)||(14091-14248)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (46-180)||(6-140)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-178)||(197978-198154)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (35-187)||(3111-3262)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (88-232)||(102-246)
scaffold1208 (1-53)||(39-91)
[»] scaffold1063 (2 HSPs)
scaffold1063 (63-232)||(2385-2556)
scaffold1063 (442-500)||(2798-2854)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-136)||(10240-10375)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (1-232)||(29196-29426)
scaffold0084 (1-86)||(19126-19211)
scaffold0084 (119-187)||(19229-19296)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (1-180)||(89600-89779)
scaffold0045 (452-501)||(90080-90128)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (65-232)||(248413-248579)
[»] scaffold1785 (1 HSPs)
scaffold1785 (1-180)||(1081-1258)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (1-170)||(2196-2364)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-162)||(58812-58974)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (11-180)||(19196-19358)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (55-181)||(6-131)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (66-232)||(27005-27170)
scaffold0080 (442-500)||(27422-27478)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (321-371)||(7616-7666)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 21914952 - 21915241
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21914952 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctagga 21915051  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21915052 atgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttcaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagaggg 21915151  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 290  Q
       |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||| | ||||||||  |||||||||  ||||| |||||    
T  21915152 tcataagtcaagggattgattagggctattttagttaaccatcgtgaaattagagaaatattcataagaaataggtgtagtgtaccaatt 21915241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18239788 - 18239557
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18239788 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttgaacttagacctaattgaattgttcaaataaacaaggctagtctagga 18239689  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| || || ||| | ||| |||    
T  18239688 atggataatcgtttatatgtaatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaattaggggttttactctgacaaggggg 18239589  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18239588 tcctaagtcaagggattgattagggctatttt 18239557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22937229 - 22937030
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22937229 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 22937130  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22937129 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagaggg 22937030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 42062752 - 42062939
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  42062752 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 42062851  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaat 188  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  42062852 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagttcacctaaggaattagggactgtaat 42062939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2837134 - 2837319
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  2837134 atcaaatataaacatgatttagtcagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttatga 2837233  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  2837234 atggataatcgtttattagtgataataggttaacgttcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 2837319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17664383 - 17664613
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  17664383 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 17664482  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  17664483 atcgataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatcttagaagaggg 17664581  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  17664582 tcctaactcaagggattgattatgactatttt 17664613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26752993 - 26752814
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  26752993 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 26752894  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26752893 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 26752814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18765907 - 18765657
Alignment:
Q  28 atgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatatta 127  Q
    |||||| |||||| | | |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18765907 atgaatgactactaatcctagcttacgacttagacctatttgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaataaataatcatttatttgtgatatta 18765808  T
Q  128 ggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggct 227  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||   ||    
T  18765807 ggttaacgctcttaaaaccttcgaagaatgttagaccacttaaggaattaggagttgtaagctaacaagagggatctaactcaagggattgattataact 18765708  T
Q  228 attttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgc 278  Q
    ||||||||||||| |||  ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  18765707 attttagttaaccatcgtaaaactagagaagtatgcataggaaataggtgc 18765657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41877056 - 41876877
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  41877056 atcaaatataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 41876957  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  41876956 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 41876877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 34831595 - 34831825
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  34831595 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 34831694  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  34831695 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 34831793  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  34831794 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 34831825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 563500 - 563363
Alignment:
Q  52 tcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaa 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||  |    
T  563500 tcaacttagacctaattgaattgttcaactaaacaaggttagtctaggaatgaataatcgtttaattgtgatattatgttaatgctttgaaaacctttga 563401  T
Q  152 agaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatc 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  563400 agaatattagatcacctaaagaattaggggttgtaatc 563363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 20055605 - 20055789
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  20055605 atcaaatataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 20055704  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  20055705 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-taaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 20055789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26292622 - 26292837
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  26292622 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 26292721  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  26292722 atgtataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctataagaggg 26292820  T
Q  201 agttaagtcaagggatt 217  Q
       ||| ||||||||||    
T  26292821 tcgtaactcaagggatt 26292837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4099808 - 4099578
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4099808 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttatacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 4099709  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  4099708 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaatcttcaaatattattagaccacctaaagaattaggggctgtagtttgagaagaggg 4099610  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  4099609 tcttaagtcaagggattgattatgactatttt 4099578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14376099 - 14375921
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  14376099 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 14376000  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||||||||    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  14375999 atggataatcgtttgctagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 14375921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21335989 - 21335811
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  21335989 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctataa 21335890  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21335889 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattaggg 21335811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 7270852 - 7271025
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |    
T  7270852 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaacatggttagtctatgaatgga 7270951  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||||||| |  |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  7270952 taatcgtttgttagtgatattgggctaacgtgttt-aaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattaggg 7271025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12087789 - 12088019
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12087789 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 12087888  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  12087889 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagaggg 12087987  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  12087988 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 12088019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 32837849 - 32838007
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  32837849 atcaaatataaacatgattt-gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 32837947  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatatta 160  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  32837948 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattatta 32838007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 43491586 - 43491765
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  43491586 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 43491685  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  43491686 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaatcttcaaagattattaaaccacctaaggaattaggg 43491765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 7624933 - 7625110
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  7624933 atcaaatataaacatgatttagtgagaacaaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 7625032  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||    
T  7625033 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 7625110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26895895 - 26895719
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| || | |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  26895895 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgattgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 26895796  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  26895795 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 26895719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14016430 - 14016199
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  14016430 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 14016331  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || |||||||| |  | ||||| | |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||    
T  14016330 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaaagtgctttaaaccttcgagaattattaaaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaagaggg 14016231  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  14016230 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 14016199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17748271 - 17748406
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  17748271 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagaactaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 17748370  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17748371 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgt 17748406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 18952524 - 18952702
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  18952524 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaatgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtttagga 18952623  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18952624 atggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 18952702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34133274 - 34133096
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  34133274 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 34133175  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34133174 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 34133096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34143505 - 34143327
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  34143505 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 34143406  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34143405 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 34143327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40583080 - 40583310
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  40583080 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaagatggttagtctagga 40583179  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  40583180 atagataatcgtttcttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagaggg 40583278  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  40583279 tcataactcaagggattgattaggactatttt 40583310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12058778 - 12058605
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  12058778 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 12058679  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12058678 taatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 12058605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21332950 - 21332793
Alignment:
Q  22 gtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtg 121  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||    
T  21332950 gtgagaataaatgactactgactatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatggataatcgtttgttagtg 21332851  T
Q  122 atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21332850 atattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcatctaaggaattaggg 21332793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26907746 - 26907571
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  26907746 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacttaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 26907647  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||    
T  26907646 atggataatcctttattggtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaatta 26907571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 30066173 - 30066348
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||    
T  30066173 atcaaatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaaatgaattgttctaacaaacatggttagtctagga 30066272  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
     || |||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  30066273 gtggataatcgtttgttagagatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41306818 - 41306640
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||  | ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  41306818 atcaaatataaacatgatttaataagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggt 41306719  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  41306718 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 41306640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 23043995 - 23044123
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23043995 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 23044094  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattagg 129  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23044095 atgaataatcctttattagtgatattagg 23044123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39192159 - 39192389
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| ||  ||||||  ||| |||| | ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  39192159 atcaaatataaatatgatttaatgagaacaaatgactattgaccatagctttcgacctagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 39192258  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  |||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  39192259 atagataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttgaaagattattataccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagaggg 39192357  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  39192358 tcttaactcaagggattgattatgactatttt 39192389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 33551958 - 33552182
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||| |    
T  33551958 atataaacatgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaatatggtcagtctaggaatgga 33552057  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||    
T  33552058 taatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagatta-tagaccacttaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtccta 33552155  T
Q  206 agtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    | |||||||||| |||| | |||||||    
T  33552156 actcaagggattgattatgactatttt 33552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31575248 - 31575529
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaa--ctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctat 98  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| | |   ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||      
T  31575248 atcacatataa-cataaattcgagagaatgaattactaatta---tagctttcaacttagacacctaattgaattgttcaaataaacagggttattctga 31575343  T
Q  99 gaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagag 198  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||   | |||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| | | |||||    
T  31575344 gaatggatattcgtttatttgtgatattaggttaactttcttttta-cttcaaagaatattagattacctagggaattagagactgtaatttgagaagag 31575442  T
Q  199 ggagttaagtc-aagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgta 284  Q
     |    ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||  ||| | ||||||||  |||||| ||| |||||    
T  31575443 agtcccaagtcaaagggattgattagagctattttagttaaccatcgtgaaactagagaaatattcatatgaaatagctgcagtgta 31575529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28787614 - 28787478
Alignment:
Q  1 atcacatataaac-atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg 99  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28787614 atcaaatataaactatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttggacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctagg 28787515  T
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  28787514 aatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgt 28787478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31863531 - 31863724
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||    
T  31863531 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataaacatggttagtctagga 31863630  T
Q  101 atgaata--------------atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||              ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31863631 atggataatcatttgttagtgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 31863724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11959462 - 11959287
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaact-aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg 99  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||      
T  11959462 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagcgttcgacttagaccttaattgaattgttctaataaacatggttagtcta-- 11959365  T
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||   |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11959364 aa--gataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattacaccacctaaggaattaggg 11959287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 22130095 - 22130197
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  22130095 atcaaatataaacatgattttgtgagattgaatgactacggaccctagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttagga 22130194  T
Q  101 atg 103  Q
    |||    
T  22130195 atg 22130197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 179
Target Start/End: Original strand, 22131159 - 22131238
Alignment:
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagg 179  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||    
T  22131159 aatggataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaggattattaaaccacctaaggaattagg 22131238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 31575555 - 31575609
Alignment:
Q  294 gaaagacc-agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgtt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31575555 gaaagacctagtctcatctctccatatcttttccaaacaaactttattttttgtt 31575609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 7271329 - 7271385
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7271329 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 7271385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21332496 - 21332440
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21332496 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4099347 - 4099291
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  4099347 tacgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 4099291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21335506 - 21335458
Alignment:
Q  452 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  21335506 attttattacttcgatacattt-ttagtacacttgttaaaagtctatcaa 21335458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 371
Target Start/End: Original strand, 2453469 - 2453505
Alignment:
Q  335 tttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2453469 tttattttctgttatttactttttatgcacataaacc 2453505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 18542467 - 18542740
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18542467 atcacatataa-catgaatttgtgagaatgaatgactaatgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctagga 18542565  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  18542566 atggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaattagggactgtaatctgagaagaagg 18542665  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaatagg 275  Q
      ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  18542666 tcttaagtcaagggattgattaggactattttagttaaccatcgtgaagctagaggagtattcataggaaatagg 18542740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22993977 - 22993688
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  22993977 atcagatataaacatgaattcgtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggtaagtttagga 22993878  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||    
T  22993877 atggataatcgtttatttgtgatactaggttaacgttctaaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatttgagaagaggg 22993778  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 290  Q
       |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22993777 tcctaagtcaagggattgattagggatattttagttaaccatcgtaaaactagagaagtattcatagtaaataggtgcagtgtaccaatt 22993688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3293234 - 3292990
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3293234 atataaacatgatttcgtgagaacgaatgactactaaccctagccttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaa 3293135  T
Q  106 taatcgttta-tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||  ||    
T  3293134 taatcgtttatttttttatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggttgtaatcggagaagtgggtctt 3293035  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3293034 aagtcaagggattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 3292990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Original strand, 17545820 - 17546020
Alignment:
Q  50 tttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  17545820 tttcaacttagacctaattgaattattcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttatgatactaggttaacgtgcttaaaaccttc 17545919  T
Q  150 aaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaa 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17545920 aaagaatattagctcacctaaggaattagggattgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagttaaccatcgtgaaa 17546019  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  17546020 c 17546020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11784681 - 11784912
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  11784681 atcacatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 11784780  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11784781 atggataatcctttattagtgatattagattaacgtgcttaaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatccgataagaggg 11784880  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11784881 tcctaactcaagggatttattagggctatttt 11784912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32287598 - 32287371
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  32287598 catataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 32287499  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || | | | |||||||   |    
T  32287498 ataatcgtttattagtgatattaggttaacatacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggattatagtttgagaagagggccct 32287399  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    || |||||||||| |||| | |||||||    
T  32287398 aactcaagggattgattatgactatttt 32287371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30220287 - 30220053
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30220287 atcaaatataaagatgatttggtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctatga 30220188  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtt---tttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataaga 197  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||  ||||    
T  30220187 atggataatcgtttatttgtgatattaagttaactatcaacttaaaagcttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggttacaatctatgaaga 30220088  T
Q  198 gggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    |||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30220087 gggtcctaagtcaagggattgattagggctatttt 30220053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2775397 - 2775576
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2775397 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 2775496  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2775497 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2775576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16184966 - 16184787
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  16184966 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 16184867  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  16184866 atggataatcttttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 16184787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 43809495 - 43809674
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  43809495 atcaaatataaacatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 43809594  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43809595 atgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggg 43809674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2778640 - 2778819
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2778640 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 2778739  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2778740 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2778819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 7486486 - 7486665
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  7486486 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 7486585  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  7486586 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 7486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18645026 - 18644816
Alignment:
Q  22 gtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtg 121  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| |  |||    
T  18645026 gtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggacaatcgtttgttagtg 18644927  T
Q  122 atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttatt 221  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |   ||| |||||||||| |||    
T  18644926 atattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattgatt 18644827  T
Q  222 aaggctatttt 232  Q
    | | |||||||    
T  18644826 aggactatttt 18644816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 45896296 - 45896475
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45896296 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgagttgttctaataaacagggttagtctagga 45896395  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45896396 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49743198 - 49742967
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  49743198 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtttagga 49743099  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  49743098 atggataatcgtctgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 49742999  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  49742998 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 49742967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6435056 - 6434878
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  6435056 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 6434957  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6434956 atgaataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 6434878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8461765 - 8461587
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  8461765 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 8461666  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8461665 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttttt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8461587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10884773 - 10885003
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  10884773 atcatatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 10884872  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  10884873 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 10884971  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  10884972 ttctaagtcaagggattgattaggactatttt 10885003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29344153 - 29343974
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||    
T  29344153 atcaaatataaacatgatttagttagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctagga 29344054  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  29344053 atgaataatcttttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 29343974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 43926751 - 43926929
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43926751 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaaggttagtctagga 43926850  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  43926851 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 43926929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 3840432 - 3840617
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||    
T  3840432 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctagga 3840531  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  3840532 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggttgta 3840617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 41976931 - 41977115
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  41976931 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctatga 41977030  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  41977031 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 41977115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35412431 - 35412656
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||        
T  35412431 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct---- 35412526  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
      | |||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  35412527 --ggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctaacctaaggaattagggactgtaatctgagaagaggg 35412624  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  35412625 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 35412656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 538742 - 538921
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |    
T  538742 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgtttaaataaacaggtttagtctagca 538841  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  538842 atggatattcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaacattcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 538921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2873480 - 2873658
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2873480 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaaga 2873579  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2873580 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2873658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48064313 - 48064135
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48064313 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatga 48064214  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  48064213 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 48064135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50461827 - 50461596
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  50461827 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 50461728  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  50461727 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 50461628  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  50461627 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 50461596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 52199829 - 52200007
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  52199829 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 52199928  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  52199929 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 52200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 53815744 - 53815922
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  53815744 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 53815843  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  53815844 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 53815922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 54719887 - 54720117
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  54719887 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 54719986  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  54719987 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagaggg 54720085  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  54720086 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 54720117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 54723657 - 54723836
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  54723657 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 54723756  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |   |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  54723757 atggataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaaataggg 54723836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19301783 - 19301563
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19301783 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactacagaccctagctttcaacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 19301684  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||    
T  19301683 atggataatcttttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattaaaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaagaggg 19301585  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
       ||| |||||||||||||||    
T  19301584 tcctaactcaagggatttatta 19301563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 30690652 - 30690872
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  30690652 atcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctagga 30690751  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||    
T  30690752 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatttgagaagaggg 30690850  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
       ||| |||||||||| ||||    
T  30690851 tcctaactcaagggattgatta 30690872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12561512 - 12561334
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12561512 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 12561413  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12561412 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 12561334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17040300 - 17040122
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  17040300 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 17040201  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  17040200 atggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcatctaaggaattaggg 17040122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20728925 - 20728695
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  20728925 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 20728826  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  |||| | | | |||||||    
T  20728825 atggataatcttttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtagtttgagaagaggg 20728727  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20728726 tcctaagtcaagggattgattagggctatttt 20728695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 24125415 - 24125593
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24125415 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 24125514  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24125515 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24125593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 24128692 - 24128870
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24128692 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 24128791  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24128792 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24128870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27091810 - 27091989
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  27091810 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaataactactgaccatagctttcgacttagacctaattaacttgttctaataaacatggttagtctagga 27091909  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||    
T  27091910 atggataatcgtttattagtgataaaaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccgcctaagaaattaggg 27091989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 31549115 - 31549318
Alignment:
Q  29 tgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattag 128  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  31549115 tgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatcgtttattagtgataatag 31549214  T
Q  129 gttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggcta 228  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||  |||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||    
T  31549215 gttaacattcataaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattagggtctgtagttttagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgacta 31549314  T
Q  229 tttt 232  Q
    ||||    
T  31549315 tttt 31549318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32367407 - 32367229
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  32367407 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 32367308  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  32367307 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 32367229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 282441 - 282271
Alignment:
Q  30 gaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattagg 129  Q
    |||| |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| |    
T  282441 gaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttcgaataaacatggttagtctaggaatggataattgtttattggtgatattatg 282342  T
Q  130 ttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||    
T  282341 tcaacgttcttaaaaccttcgaagaatattagatcacctaaggaattagtaattgtaatctgagaagaggg 282271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 35751401 - 35751587
Alignment:
Q  46 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||||     
T  35751401 tagctttcaacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgcttaaaat 35751500  T
Q  146 cttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  35751501 cttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 35751587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 46884862 - 46885035
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||| |    
T  46884862 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctagaaatgga 46884961  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  46884962 taatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaacacctaaggaattaggg 46885035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Original strand, 16243797 - 16244019
Alignment:
Q  9 taaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataa 108  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||  ||||    
T  16243797 taaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatagataa 16243896  T
Q  109 tcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagt 208  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  ||||||    
T  16243897 tcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagt 16243995  T
Q  209 caagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  16243996 caagggattgattaggactatttt 16244019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22417112 - 22416934
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22417112 atcaaatataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 22417013  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22417012 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 22416934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23298894 - 23298663
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  23298894 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatcgttagtctagga 23298795  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||  |||| | | | |||||||    
T  23298794 atggataatcgtttgttggtgatattaggttaatgttcttaaaaccttgaaagattcttagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagaggg 23298695  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  23298694 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 23298663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 55035139 - 55034960
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  55035139 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctagga 55035040  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||    
T  55035039 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattactaaaccacctaaggaattaggg 55034960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10881396 - 10881616
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  10881396 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttatacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttaatctagga 10881495  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  10881496 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 10881594  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
      ||||||||| ||||| ||||    
T  10881595 tcttaagtcaaaggattgatta 10881616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11190442 - 11190627
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  11190442 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcgagga 11190541  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| ||||||  || |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  11190542 atggataatcacttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaagaattattagaccacctaaggaattaggggttgta 11190627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 460 - 549
Target Start/End: Original strand, 38386949 - 38387038
Alignment:
Q  460 acttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaatatctacacctctaatgttttgtagccaaaagagaggtaagttagtat 549  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38386949 acttcgatacatttgttagcacacttgctaaaagtctatcaatatctactcctctaatgtcttgtagccaaaagagagttaagttagtat 38387038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15195575 - 15195404
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  15195575 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgtgctaataaacatggttagtctaggaatgga 15195476  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  15195475 taatcttttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 15195404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28008348 - 28008171
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  28008348 atcaaatataaacatgatttagtgagaacaaataactactaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaatatggttagtctagga 28008249  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| ||| |  ||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28008248 atggataatcgtttattagtgataatagat--acgtacttacaacattcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28008171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 9392650 - 9392828
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  9392650 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagatctaattgatttgttctaataaacatggttagtctagga 9392749  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  9392750 atggataatcgtttgttagtgatattagtttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggg 9392828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10106877 - 10106647
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  10106877 atcaaatataagcatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 10106778  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||  || | ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  10106777 atggataatcatttgttagtgatattaggttaacgtgctt-acaccttcaaatattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 10106679  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  10106678 ttctaagtcaagggattgattaggactatttt 10106647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 52988321 - 52988498
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  52988321 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 52988420  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagg 179  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  52988421 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaactttcaacggttattagaccacctaaggaattagg 52988498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 28265796 - 28265971
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||||   |||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  28265796 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaat---tactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatgattagtctagga 28265892  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28265893 atggataatcttttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28265971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25443138 - 25443003
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  25443138 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 25443039  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  25443038 atggataatcctttattagtgatattagcttaacgt 25443003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 25584628 - 25584771
Alignment:
Q  37 tactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25584628 tactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgt 25584727  T
Q  137 ttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  25584728 tcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 25584771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34984131 - 34983953
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  34984131 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgactctaactttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaaga 34984032  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34984031 atggataatcatttattagtgatattaggttaaagtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 34983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22783508 - 22783739
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttca-------aataaacaaggttag 93  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||| |||||     
T  22783508 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttat 22783607  T
Q  94 tctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc-aaagaatattagatcacctaacgaattaggg--attgtaatct 190  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||    | ||||||    
T  22783608 tctaggtatgcataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatct 22783707  T
Q  191 aataagagggagttaagtcaagggatttatta 222  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  22783708 gagaagagggtcctaagtcaagggatttatta 22783739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22787872 - 22788103
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttca-------aataaacaaggttag 93  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||| |||||     
T  22787872 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttat 22787971  T
Q  94 tctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc-aaagaatattagatcacctaacgaattaggg--attgtaatct 190  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||    | ||||||    
T  22787972 tctaggtatgcataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatct 22788071  T
Q  191 aataagagggagttaagtcaagggatttatta 222  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  22788072 gagaagagggtcctaagtcaagggatttatta 22788103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 47051416 - 47051590
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |    
T  47051416 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaagga 47051515  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |   |||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||  |||||||||    
T  47051516 taaccgtttgttactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggg 47051590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 47054846 - 47055020
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |    
T  47054846 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaagga 47054945  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |   |||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||  |||||||||    
T  47054946 taaccgtttgttactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggg 47055020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19304967 - 19304783
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| || ||    
T  19304967 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccctagctttcaacttagacataaatgaattgttctaatgaacatggttagtatagga 19304868  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  19304867 atggataatcatttgttaatgatgttaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 19304783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17141324 - 17141459
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  17141324 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 17141423  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17141424 atggatgatcctttattagtgatattaggttaacgt 17141459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17531928 - 17531704
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||     |||||||| |||||||||| ||    
T  17531928 atcaaatataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatt-----aataaacatggttagtctagga 17531834  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  17531833 atggataatc-tttattagtgatattaggttaacgtgttt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagaggg 17531736  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  17531735 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 17531704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Original strand, 54461010 - 54461117
Alignment:
Q  81 taaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  54461010 taaacatggttagtctaggaatgtataatcctttactagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattaggg 54461109  T
Q  181 attgtaat 188  Q
    | ||||||    
T  54461110 actgtaat 54461117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18641933 - 18641820
Alignment:
Q  119 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggattt 218  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |   ||| ||||||||||     
T  18641933 gtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattg 18641834  T
Q  219 attaaggctatttt 232  Q
    |||| | |||||||    
T  18641833 attaggactatttt 18641820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27298705 - 27298594
Alignment:
Q  37 tactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  27298705 tactgaccctagcttacaacttagacataattgaattgttcaaataaatacggttagtttatgaatagataatcatatacctgtgatattatgttaacgt 27298606  T
Q  137 ttttaaaacctt 148  Q
    | ||||||||||    
T  27298605 tcttaaaacctt 27298594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27308239 - 27308157
Alignment:
Q  63 ctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27308239 ctaattgaattgttcaaataaacaaggttaatcaaggaatagataatcgtttatttgtgttattaggttaacgttcttaaaac 27308157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27308818 - 27308717
Alignment:
Q  46 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 145  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27308818 tagcttacgacttagacctaattgagttgttcaaataaacatggt-agtctaggaatagataatcgcttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaac 27308720  T
Q  146 ctt 148  Q
    |||    
T  27308719 ctt 27308717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17529035 - 17528808
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||| || |||| |||| | ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||        
T  17529035 atcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactattgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct---- 17528940  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    | |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||| | |||||| |  | |||||||    
T  17528939 aggaataatcctttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaacggttattaaaccacctaaggaattagtggttgtaaccctagaagaggg 17528841  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttta 233  Q
       ||| |||||||||| |||| | ||||||||    
T  17528840 tcctaactcaagggattgattaggactatttta 17528808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 52309835 - 52309754
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaata 82  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52309835 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgacaatagttttctacttagacctaattgaattgttcaaata 52309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 371
Target Start/End: Original strand, 18542787 - 18542854
Alignment:
Q  304 tctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18542787 tctcatctctctttatattttctaaagaaactttaacttctgttatttactttttatgcacacaaacc 18542854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 31857732 - 31857804
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaatt 73  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31857732 atcaaatataaagatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaatt 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 6030770 - 6030840
Alignment:
Q  44 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  6030770 cttagctttcaacttggatctaatttaactgttcaattaaacatggtcagtctaggaatgaataattgttt 6030840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Original strand, 38386908 - 38386945
Alignment:
Q  7 tataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcacc 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38386908 tataaacatgaattcgtgagaatgaatgactactcacc 38386945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 55032181 - 55032100
Alignment:
Q  99 gaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||    
T  55032181 gaatggataatcgtttgtcagtgatattaggttaacgtgcataaaagcttcaaagattactagaccacctaaggaatcaggg 55032100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 17544531 - 17544570
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactact 40  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17544531 atcaaatataaacatgaattcgtgagaatgaatgactact 17544570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 52309430 - 52309377
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtcta 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  52309430 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtcta 52309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 5796369 - 5796755
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  5796369 atcaaatataaacatgattttgtgagaatgaatacctgctgaccatagctttcaacttagacctaattgagtttttcaaataaaaagggttagtctatga 5796468  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  5796469 atgaataatcgtttatttgtgatataatgttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagagattgtaatatgataagaggg 5796568  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgg------- 293  Q
       |||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  |||||  ||| | ||||| ||  |||||||||  ||||| ||||| ||           
T  5796569 tcctaagtcaagggattgattagagctattttagttagtcatcatgaaactagagaattattcttaagaaataggtgttgtgtaccaattaggggaaccc 5796668  T
Q  294 ---------gaaagac-cagtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacaaac 370  Q
             |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5796669 aaaggactcgaaagacttagtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttctgttatttactttttatgcacacaaac 5796755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18562825 - 18562534
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |    
T  18562825 atataaacatgttttattgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaattaaacagggttagtctaggaatgga 18562726  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| |   ||    
T  18562725 taatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaataatattagctcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagagagtccta 18562626  T
Q  206 agtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 297  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||  ||||  ||| ||||||||||  || |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18562625 agtcaaaggattaatcagggctattttagttaactatcgtaaaactagagaagtattcataagaagtaggtgcaatgtatcaattagggaaa 18562534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16165566 - 16165797
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  16165566 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattattctaataaacatggttaatctagga 16165665  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||    
T  16165666 atgggtaatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagaggg 16165765  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  16165766 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 16165797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5242444 - 5242232
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  5242444 atataaacatgatttcgtgataatgaatgactgctgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtccaagaatgga 5242345  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtt-tttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||| | || ||||   |    
T  5242344 tactcatttatttgtgatattaagttaacgttctttaaaatcttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtagtctgagaatagggtcct 5242245  T
Q  205 aagtcaagggatt 217  Q
    |||||||||||||    
T  5242244 aagtcaagggatt 5242232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2441575 - 2441344
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2441575 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaaagactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 2441476  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||    
T  2441475 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattaaaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagaggg 2441376  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  2441375 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 2441344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23225202 - 23225023
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23225202 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 23225103  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23225102 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 23225023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11398322 - 11398137
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  11398322 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaaga 11398223  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
     || |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  11398222 gtggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 11398137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 8276803 - 8276982
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  8276803 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 8276902  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8276903 attgataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8276982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 7227345 - 7227522
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  |    
T  7227345 atcaaatataaacattatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgagttgttcaaataaacatggctagcctagca 7227444  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  7227445 atggataatcgtttatttgagatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagatcatataaggaattag 7227522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13450072 - 13449897
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  13450072 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccc-agctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 13449974  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  13449973 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 13449897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10468962 - 10469192
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  10468962 atcaaatataaacatgatttcgtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 10469061  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  10469062 atagataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagaggg 10469160  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  10469161 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 10469192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13809809 - 13809566
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |  || |||||||||||| ||| ||     ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13809809 atcaaatataaacatgatttcatgagaatgaatgactattggccatagctttcaactcagacct-----aattgttcaaataaacatggttagtctagga 13809715  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  13809714 atggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattaggccacataaggaattagaggttgtaatatgagaagaggg 13809615  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
       |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  13809614 tcctaagtcaagggattgatcagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 13809566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 48645292 - 48645539
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||| || |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  48645292 atcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 48645391  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |   |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  48645392 atggataatcgtttgttactgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 48645490  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
       ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  48645491 tcctaactcaagggattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 48645539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 13842458 - 13842636
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  13842458 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 13842557  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  13842558 atagataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 13842636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 26557317 - 26557547
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  26557317 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtttagga 26557416  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||    
T  26557417 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagaggg 26557515  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       || ||||||||||| |||| | |||||||    
T  26557516 ttctatgtcaagggattgattaggactatttt 26557547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45287365 - 45287187
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45287365 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 45287266  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45287265 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45287187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4596305 - 4596075
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4596305 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagttttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 4596206  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  4596205 atgaataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaactaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 4596107  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  4596106 tcttaagtcaagggattgattatgactatttt 4596075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9133056 - 9132878
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  9133056 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaatggaattgttctaataaacatggttagtctagga 9132957  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  9132956 atggataatcatttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 9132878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9865023 - 9864792
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  9865023 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 9864924  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||| || ||||| | | | |||||||    
T  9864923 atggataatcgtttgttagtgatattaagttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattatgggttgtagtttgagaagaggg 9864824  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9864823 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 9864792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20594081 - 20594311
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  20594081 atcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtgtaaga 20594180  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  20594181 atggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 20594279  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20594280 tcctaagtcaagggattgattaggactatttt 20594311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26136424 - 26136246
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  26136424 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 26136325  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26136324 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 26136246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 4546687 - 4546907
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4546687 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 4546786  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  4546787 atggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 4546885  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
       |||||||||||||| ||||    
T  4546886 tcctaagtcaagggattgatta 4546907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3068273 - 3068043
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  3068273 atcaaatataatcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaatatacatggttagtctagga 3068174  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  3068173 atggataatcttttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagaggg 3068075  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  3068074 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 3068043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6603276 - 6603507
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  6603276 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactattgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 6603375  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| |||||||  ||||||||  |||| | | | |||||||    
T  6603376 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagaggg 6603475  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  6603476 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 6603507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 17730632 - 17730810
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  17730632 atcaaatataaacatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 17730731  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |   |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17730732 atggataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 17730810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26144804 - 26144626
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  26144804 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 26144705  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||    
T  26144704 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttactagaccacctaaggaattaggg 26144626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37166443 - 37166258
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  37166443 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 37166344  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  37166343 atggataatcatttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaacattcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 37166258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37415721 - 37415553
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  37415721 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 37415622  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaa 170  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37415621 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaa 37415553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37423253 - 37423085
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  37423253 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 37423154  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaa 170  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37423153 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaa 37423085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 10345032 - 10345247
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| || | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  10345032 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaaga 10345131  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||  || |||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10345132 atggataatcctttattagtgatattaagttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccatctaaggaattaggggttgtaaccctataagaggg 10345230  T
Q  201 agttaagtcaagggatt 217  Q
       ||| ||||||||||    
T  10345231 tcctaactcaagggatt 10345247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Original strand, 24918022 - 24918201
Alignment:
Q  11 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 110  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  24918022 aacatgaattcgtaagtatgaatgactactgaccaaagctttcaacttagacataattggattgttcaattaaacagggcttgtctatgaatggataatc 24918121  T
Q  111 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatct 190  Q
    |||||  ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  24918122 gtttaattgtaatattaggttaacactttgaaaactttcagggaatattagaccacataaggaattagggagtgtaatct 24918201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 2090433 - 2090621
Alignment:
Q  11 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||  ||  || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||  || |||    
T  2090433 aacatgaatttgtgagtatgaatgcctaccgacaataactttcaacttaaatctaattggattgttcaaataaacaggggtagtctaggaatagatgatc 2090532  T
Q  111 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 199  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  2090533 gtttaattgtgatactaggttaacggtttgaaaacctttgaggaatattagatcacctaatgaattagagattgtaatccaagaagagg 2090621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14683740 - 14683510
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  14683740 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactagtgaccataacttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 14683641  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||  | ||||||| ||||||  |||||||||  |||||||  | |||||||    
T  14683640 atgcataatcatttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaataactattagaccacctatggaattaggggctgtaatcctagaagaggg 14683542  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  14683541 tcctaactcaagggattgattatgactatttt 14683510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20081014 - 20080836
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  20081014 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatggctactgaccctagctttcgacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctagga 20080915  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||  || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  20080914 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcagcgattattagaccacctaagaaattaggg 20080836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 4695342 - 4695494
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4695342 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacacatttgaattgttctaataaacatggttagtctagga 4695441  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaaga 154  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  4695442 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaga 4695494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22611903 - 22611771
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22611903 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttacacctaattgaattattctaataaacatggttagtctagga 22611804  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaa 133  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  22611803 atgaataatcctttattagtgatattaggttaa 22611771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9271705 - 9271541
Alignment:
Q  50 tttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||       ||| ||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  9271705 tttctacttagacctaattgaattgttctaataaacaa-------ctaggaatggataatcgtttgttagtgatatttggttaacgtgcttaaa-ccttc 9271614  T
Q  150 aaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttatta 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | ||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  9271613 aaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggacctaactcaagggattgatta 9271541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11397877 - 11397820
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11397877 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 11397820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33844427 - 33844380
Alignment:
Q  452 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33844427 attttattacttcgatacattt-ttagcacacttgctaaaagtctatca 33844380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45290658 - 45290598
Alignment:
Q  119 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45290658 gtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45290598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 4595816 - 4595765
Alignment:
Q  452 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaatat 504  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4595816 attttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaatat 4595765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Original strand, 48645607 - 48645663
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaaca-aactttattttatgttatttactttt 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  48645607 agtctcatctctccatatattttccaaacatatctttattttctgttatttactttt 48645663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 10345474 - 10345530
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  10345474 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaattctatca 10345530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Original strand, 4542734 - 4542793
Alignment:
Q  120 tgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  4542734 tgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccaactaaggaattaggg 4542793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21434763 - 21434479
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21434763 atataaacatgttttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttatacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaa 21434664  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 205  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |  |||    
T  21434663 taatcgtttatttgttatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtctta 21434564  T
Q  206 agtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 290  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||   ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  21434563 agtcaatggattgattatggctattttagttaactgtcgtgaaagtagagaagtattcataggaaataggtgtagtgtaccaatt 21434479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27355935 - 27355684
Alignment:
Q  46 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27355935 tagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaac 27355836  T
Q  146 cttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgg 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||   |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||     
T  27355835 cttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggcctattttagttaaccatcgt 27355736  T
Q  246 gaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 297  Q
    |||||  ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27355735 gaaactagagaaatattcataggaaataggtgcagtgtaccaattagggaaa 27355684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27332062 - 27331774
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27332062 atcacatataaacatgaattcatgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 27331963  T
Q  101 a-tgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||         || | ||||||    
T  27331962 attgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttgttaaaaccttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagg---------ctgagaagagg 27331872  T
Q  200 gagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 297  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||| | ||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  27331871 ttcctaagtcaagggatttattagggctattttagttaaccatcgtgaaactagagaaatattcataggaaataggtgcattgtaccaattagggaaa 27331774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 7635477 - 7635766
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  7635477 atcacatatatacatgaattcgtgagaatgaatgactattgatcataactttcaacttagacctgattgaattgttcaaataaacagggtcagtctagga 7635576  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  |||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  7635577 atagataatcgtttatttgtaataagaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattatggactgtaatctgagaagaggg 7635676  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 290  Q
       |||||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||| |||||  ||| | ||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  7635677 tcctaagtcaaggtattgattagggttattttagttaatcatcgtgaaactagagaaatattcataggaagtaggtgcagtgtaccaatt 7635766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34732647 - 34732405
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  34732647 atataaacatgatttcctgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatagttagtctaggaatgaa 34732548  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||| | | | |||||||   ||    
T  34732547 taatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaacaaattaggggatgtactttgagaagagggtccta 34732448  T
Q  206 agtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  34732447 agtcaagggattga-tagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 34732405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23022215 - 23021984
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23022215 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 23022116  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| |||||||    
T  23022115 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatttgatcacctaaggaattaggggctgtggtctaagaagaggg 23022016  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  23022015 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 23021984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 673359 - 673133
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  673359 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 673260  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 205  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||  |||    
T  673259 taatcgtttattagtgatattatgttaacgtacttaaacccttcaaagattattagaccacctaaaaaattaggggttgtagtttgagaagagggtatta 673160  T
Q  206 agtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    | |||||||||| ||| || |||||||    
T  673159 actcaagggattgattgagactatttt 673133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6071245 - 6071066
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  6071245 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 6071146  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  6071145 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 6071066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 45941248 - 45941427
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45941248 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 45941347  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45941348 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45941427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20398685 - 20398916
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  20398685 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatcactactgaccatagctttctactttgacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 20398784  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  20398785 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtctgagaagaggg 20398884  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  20398885 ttctaactcaagggattgattaggactatttt 20398916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21018758 - 21018528
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  21018758 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttaataaacagggttagtctagga 21018659  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  21018658 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 21018560  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21018559 tcataagtcaagggattgattaggactatttt 21018528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31204670 - 31204849
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  31204670 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 31204769  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31204770 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 31204849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2794060 - 2794238
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2794060 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 2794159  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2794160 atggataatcctttattagtgatactagcttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2794238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21107582 - 21107352
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  21107582 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 21107483  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  21107482 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 21107384  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21107383 tcctaagtcaagggattgattaggactatttt 21107352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 28110888 - 28111067
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||    
T  28110888 atcaaatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtatagga 28110987  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28110988 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28111067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45961036 - 45960857
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45961036 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 45960937  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45960936 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 45960857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49853369 - 49853191
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  49853369 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 49853270  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |   |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  49853269 atggataatcgtttgttattgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 49853191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 905980 - 905746
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  905980 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 905881  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtg----atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataag 196  Q
    ||| |||||| |||||  |||    |||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||    
T  905880 atggataatcctttattagtgatatatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccatagaag 905782  T
Q  197 agggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||   ||| |||||||||| |||||  |||||||    
T  905781 agggtcctaactcaagggattgattaaaactatttt 905746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1950746 - 1950516
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  1950746 atcatatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgtattgttctaataaacagggttagtctagga 1950647  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  1950646 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 1950548  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  1950547 ttctaagtcaagggattgattaggactatttt 1950516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3797117 - 3796939
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  3797117 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttagga 3797018  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3797017 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 3796939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29643512 - 29643282
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  29643512 atcaaatataaacatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctagga 29643413  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  | |||||||    
T  29643412 atggataatcctttattagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattagaggttgtaatcctagaagaggg 29643314  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29643313 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 29643282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11668317 - 11668171
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||    
T  11668317 atcaaatataaacatgattttgtgagaattaatgactactgaccatagctttcaacttagaccgaattgaatttttcaaataaatatggttactctagga 11668218  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaacct 147  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11668217 atggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaacct 11668171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49498789 - 49498610
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaact-aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg 99  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  49498789 atcaaatataaacatgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttaagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagg 49498690  T
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  49498689 aatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 49498610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37184155 - 37183924
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  37184155 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctagga 37184056  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  37184055 atggataaccgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 37183956  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  37183955 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 37183924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16055743 - 16055623
Alignment:
Q  118 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 217  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  16055743 tgtgatattaggttaacattcttcaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggatttaggggttgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagggatt 16055644  T
Q  218 tattaaggctattttagttaa 238  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  16055643 gattagggctattttagttaa 16055623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41058593 - 41058415
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  41058593 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctagga 41058494  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||    
T  41058493 atggataattgtttgttagtgataataggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagactacctaaggaattaggg 41058415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 2405342 - 2405517
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2405342 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataacgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 2405441  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| |   |||||||| ||||||| ||||||    
T  2405442 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacagatattagaccacctaaggaatta 2405517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16056978 - 16056858
Alignment:
Q  118 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  16056978 tgtgatattaggttaacgttattcaaacctttaaagtatattagatcacctaaggaattagggatcgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagggatt 16056879  T
Q  218 tattaaggctattttagttaa 238  Q
     ||||  ||||||||||||||    
T  16056878 gattagagctattttagttaa 16056858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13431141 - 13431012
Alignment:
Q  111 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 210  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| | | ||||| |   |||||||    
T  13431141 gtttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagagactgtaatatgagaagagagtcctaagtca 13431042  T
Q  211 agggatttattaaggctattttagttaacc 240  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  13431041 agggattgattagggctatttaagttaacc 13431012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16061144 - 16060965
Alignment:
Q  118 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 217  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||     |||||||| |||||    
T  16061144 tgtgatattaggttaatgttcttcaaacctataaagtatattagatcacctaaggaattagggattgtaatatgagaagagaatcctaagtcaatggatt 16061045  T
Q  218 tattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 297  Q
     |||| ||||||||||||||| | |||  ||||  ||| | |||||||   |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16061044 gattagggctattttagttaatcatcgtaaaactagagaaatattcatgagaaataggtgcagtgtaccaattagggaaa 16060965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27355165 - 27355020
Alignment:
Q  70 aattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcaccta 169  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || ||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||| ||||||    
T  27355165 aattgttctaataaacatggttagtgtaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaaccttcgaagattaatagaccaccta 27355067  T
Q  170 acgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 217  Q
    | ||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||| ||||||||||    
T  27355066 aggaattaggg-ttgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggatt 27355020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11667153 - 11667062
Alignment:
Q  141 aaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||    |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11667153 aaaaccttcaaataatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagaggatcctaagtcaagggattgattagggctatttt 11667062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16062353 - 16062270
Alignment:
Q  155 atattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaa 238  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||   ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16062353 atattagatcatttaaggaattagggattgtaatctgagaagagggttctaagttaagggattaattatggctattttagttaa 16062270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30938681 - 30938578
Alignment:
Q  174 attagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaata 273  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||  ||  | |||||||||||||||    
T  30938681 attaggggttgtaatcttataagaggatcctaagtcaagggattgattatgactattttagttaaccatcgtgaaactagataaatattcatagaaaata 30938582  T
Q  274 ggtg 277  Q
    ||||    
T  30938581 ggtg 30938578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34066705 - 34066599
Alignment:
Q  29 tgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattag 128  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  | |||| |||||||| |     
T  34066705 tgaatgactactaaccatagcttacaacttatacctaatttgattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataactgcttatttgtgatatcaa 34066606  T
Q  129 gttaacg 135  Q
    |||||||    
T  34066605 gttaacg 34066599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 365
Target Start/End: Original strand, 7635795 - 7635857
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcaca 365  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7635795 agtctaatctctctctatcttttctaaacaa-ctttattttctgatatttactttttatgcaca 7635857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16056777 - 16056712
Alignment:
Q  302 agtctcatctctc--catatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcaca 365  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16056777 agtctcatctctctccataacttttccaaacaatctttattttctgttatttaatttttatgcaca 16056712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30938535 - 30938467
Alignment:
Q  304 tctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatg-ttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  | |||||||  |||||||||||||||||    
T  30938535 tctcatctctccatatattttctaaacaagctttatattccgtttatttaacttttatgcacacaaacc 30938467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34065128 - 34065064
Alignment:
Q  309 tctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgt-tatttactttttatgca-cacaaacc 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  34065128 tctctccatatcttttccaaacaatctttattttttgtctatttactgtttatgcagcacaaacc 34065064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16062397 - 16062347
Alignment:
Q  78 aaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattag 128  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16062397 aaataagcagggttagtctacgaataaataatcgtttatttgtgatattag 16062347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21111309 - 21111219
Alignment:
Q  142 aaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  21111309 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagttaagggattgattaagactatttt 21111219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 169
Target Start/End: Original strand, 42022589 - 42022639
Alignment:
Q  119 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcaccta 169  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42022589 gtgatattaggataacgtaattaaaaccttcaaaaattattagatcaccta 42022639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21110960 - 21110912
Alignment:
Q  452 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21110960 attttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 21110912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29643162 - 29643125
Alignment:
Q  334 ctttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29643162 ctttattttctgttatttactttttaagcacacaaacc 29643125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16055533 - 16055477
Alignment:
Q  309 tctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcaca 365  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  16055533 tctctccataacttttccaaacaatatttatttactgttatttaatttttatgcaca 16055477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50196889 - 50196853
Alignment:
Q  335 tttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50196889 tttattttctgttatttattttttatgcacacaaacc 50196853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22172665 - 22172428
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22172665 atcacatataa-catgaattcgtgagaatgaatgattactgaccatagctttcaacttagaccttattgaattgttcaaataaacagggttagtctatga 22172567  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22172566 atggataatcgtttatttgcgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaagaatattagttcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagaggg 22172467  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaac 239  Q
       |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22172466 tcctaagtcaagggattgattatggctattttagttaac 22172428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37740054 - 37739762
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  37740054 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagctttcaacttagacctaatcgaatttttcaaataaactgggttaatctatga 37739955  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtga---tattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataaga 197  Q
    ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  37739954 atggataatcgtttatttgtgatattattaggttaatgtttgtaaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattagggacagtaatctgataaga 37739855  T
Q  198 gggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 290  Q
    |||   |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  37739854 gggtcctaagtcaagggattgattagggctattttagctaaccatcgtgaaactagagaaatattcataagacataggtgcagtgtaccaatt 37739762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8877793 - 8877545
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8877793 atcaaatataaacatgatttagtgggaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagatttaattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 8877694  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||  | ||||| |    
T  8877693 atggataatcgtttatttgtgatattaagttaacattcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaagaaattaggggttgtgatcggagaagagag 8877594  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
       |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  8877593 tcctaagtcaagggattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 8877545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48014344 - 48014167
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  48014344 atcaaatataaatatgaattcgtgagaatgaataactactgaccataactttcaactttgacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtttagga 48014245  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48014244 atggataatcgtttatttgtgacattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattag 48014167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12238095 - 12238326
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12238095 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 12238194  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||    
T  12238195 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgtttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagagactgtaatctgagaagaggg 12238294  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  12238295 ttctaactcaagggattgattatgactatttt 12238326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8875053 - 8874822
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8875053 atcaaatataaacataatttagtgagaatgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 8874954  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||    
T  8874953 atggatagtcgtttatttgttatattaagttaatgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatcggagaagaggg 8874854  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  8874853 ttctaagtcaatcgattgattatggctatttt 8874822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 53094341 - 53094568
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  53094341 catataaacatgatttcgtgagaacgaattactactgaccatagttttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgg 53094440  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||||| | | | |||||||   |    
T  53094441 ataatcgtttatttctgatattaagttaacgttcataaaacattcaaagagtattagaccacctaaggagttaggggttgtactatgagaagagggtcct 53094540  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  53094541 aagtcaagggattgattaggcctatttt 53094568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34018073 - 34017842
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  34018073 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 34017974  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  34017973 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 34017874  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  34017873 ttctaactcaagggattgattaagactatttt 34017842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44809247 - 44809016
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  44809247 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 44809148  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  44809147 atggatgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 44809048  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  44809047 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 44809016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 56195357 - 56195588
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  56195357 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 56195456  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  56195457 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 56195556  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  56195557 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 56195588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15812429 - 15812250
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  15812429 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 15812330  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15812329 atggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 15812250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24150502 - 24150733
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  24150502 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccagga 24150601  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  24150602 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 24150701  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  24150702 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 24150733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34320209 - 34320030
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  34320209 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 34320110  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34320109 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 34320030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 39501478 - 39501657
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  39501478 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 39501577  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  39501578 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 39501657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 56198683 - 56198868
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  56198683 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 56198782  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  56198783 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggggttgta 56198868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33408609 - 33408361
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  33408609 atcagatataaacatgatttagtgagaatgaatgattactgaccatagctgtctacttagacctaattgagttgttcaaataaacattgttagtctagga 33408510  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  ||||||  |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || || | | | |||||||    
T  33408509 atagataatcagttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttatagtttgagaagaggg 33408410  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
       |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  33408409 tcctaagtcaagggattgattagggctatttta-ttaaccatcgtgaaac 33408361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 15164022 - 15164254
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg- 99  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  15164022 atcaaatataatcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 15164121  T
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 199  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  15164122 aatggataatcgtttgttagtgatattaggttaatctgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagg 15164221  T
Q  200 gagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    |   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  15164222 gtcctaactcaagggattgattatgactatttt 15164254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3798099 - 3797869
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  3798099 atcacatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctatttagacagaattgaattgttctaataaacagggttaatctagga 3798000  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  3797999 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtgtgagaagaggg 3797901  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  3797900 tcttaactcaagggattgattaggactatttt 3797869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44164613 - 44164843
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  44164613 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 44164712  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||    
T  44164713 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacctgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggattgtagtttgagaagaggg 44164811  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  44164812 tcctaagtcaagggattgattatgactatttt 44164843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52006822 - 52006592
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  52006822 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaggtttagtctagga 52006723  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  52006722 atggataatcgtttgttagtgatattaggttgacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 52006624  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  52006623 tcttaagtcaagggattgattatgactatttt 52006592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40617087 - 40616921
Alignment:
Q  14 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 113  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  40617087 atgaattagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagagagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtt 40616988  T
Q  114 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    | |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  40616987 tgttagtgattttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 40616921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33493958 - 33493749
Alignment:
Q  30 gaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattagg 129  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| || |    
T  33493958 gaatgactactgaccatagcttacaatttagacctaattgaattgttcaaataaacagagttagtctaggaatagataatcgtttatttgtgataatatg 33493859  T
Q  130 ttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctat 229  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||   ||||| |||| ||| | || | ||||    
T  33493858 ttaacgttctttaaacattcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaagttaaggaattaaataggactat 33493759  T
Q  230 tttagttaac 239  Q
    ||||||||||    
T  33493758 tttagttaac 33493749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 40794832 - 40795044
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  40794832 atcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttaaacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 40794931  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  40794932 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 40795031  T
Q  201 agttaagtcaagg 213  Q
      |||||||||||    
T  40795032 tcttaagtcaagg 40795044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40903375 - 40903199
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  40903375 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 40903276  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  40903275 attgataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 40903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3718954 - 3719184
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  3718954 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgattactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 3719053  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  3719054 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 3719152  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  3719153 tcctaagccaagggattgattaggactatttt 3719184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 46955770 - 46955591
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  46955770 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgatttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctagga 46955671  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  46955670 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtttttaaaacattcaaagattattagtccacctaaggaattaggg 46955591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Original strand, 5672746 - 5672904
Alignment:
Q  22 gtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtg 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||    
T  5672746 gtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtg 5672845  T
Q  122 atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5672846 atattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5672904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40493659 - 40493474
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  40493659 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 40493560  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  40493559 atgtataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 40493474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48415821 - 48415643
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||  | |||||||||| ||    
T  48415821 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaatttttctaataataatggttagtctagga 48415722  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagg 179  Q
    ||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  48415721 atggataatcatttattattgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagg 48415643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 48637335 - 48637514
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  48637335 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 48637434  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaaga-atattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  48637435 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagatttattagaccacctaaggaattaggg 48637514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12782735 - 12782965
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || || | ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12782735 atcaaatataaacatgatttagtaaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacggaattgaattgttctaataaacagggttagtctatga 12782834  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  12782835 atggataatcgtttgttagggatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaaaaggg 12782933  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  12782934 tcctaagtcaagggattgattaggactatttt 12782965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18673373 - 18673195
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  18673373 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 18673274  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18673273 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 18673195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24044432 - 24044254
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24044432 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 24044333  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  24044332 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaacctttaaagattattagaccacctaagaaattaggg 24044254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27014093 - 27014272
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  27014093 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 27014192  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  27014193 atggataatcctttattagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggg 27014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27679516 - 27679338
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27679516 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaacatagctttctacttatacagaattgaattgttctaataaacaaggttagtctagga 27679417  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27679416 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 27679338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 29324655 - 29324834
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  29324655 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 29324754  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  29324755 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 29324834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52531227 - 52531048
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| |||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  52531227 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttttacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 52531128  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  52531127 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacactcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 52531048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15447027 - 15446807
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15447027 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccataactttctacttagactgaattgaattgttctaataaacagggttagtctatga 15446928  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| || ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  15446927 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttctaagattattggaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 15446829  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
       |||||||||||||| ||||    
T  15446828 tcctaagtcaagggattgatta 15446807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19859809 - 19859582
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||||| | |||||  |||||||| |||||||||| |||||     
T  19859809 catataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatgg 19859710  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   |    
T  19859709 ataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcct 19859611  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctatttta 233  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  19859610 aactcaagggattgattaagactatttta 19859582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 5670431 - 5670586
Alignment:
Q  25 agaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgata 124  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||   |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||    
T  5670431 agaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattaaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 5670530  T
Q  125 ttaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5670531 ttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5670586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 15431909 - 15432087
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  15431909 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgatcatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 15432008  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15432009 atggataatcgtttgttagtgatattagattaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 15432087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19820558 - 19820788
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19820558 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 19820657  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  19820658 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaa-gatgcttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 19820756  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  19820757 tcctaagtcaagggattgattaggactatttt 19820788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27677346 - 27677116
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27677346 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattaaattattctaataaacaaggttagtctagga 27677247  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  27677246 atggataatcgtttgttagcgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 27677148  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  27677147 ttctaagtcaagggattgattaggactatttt 27677116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30392399 - 30392584
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  30392399 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgaattagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 30392498  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  30392499 atgaataatactttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaccttaggaattaggggttgtaa 30392584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 49270518 - 49270695
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49270518 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctcataaacatggttagtatatgaatgaa 49270617  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||   | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  49270618 taatcgtttgttagtgatattaggttaacattcttaaaaccttca---attattagaccacctagggaattagggactgta 49270695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37103501 - 37103329
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  37103501 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaac-aggttagtctaggaatgga 37103403  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  37103402 taatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccaccaaaggaattaggg 37103329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 19827320 - 19827488
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19827320 atcaaatacaaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagactgaatggaattgttctaataaacagggttagtctagga 19827419  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaa 170  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19827420 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaa 19827488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 11195506 - 11195684
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  11195506 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctacttgaattgttctaataaacatggttagtttagga 11195605  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||   | ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||    
T  11195606 atgaataatcatttattagtgataataggttaacgtgcct-aaaccttcaaaggttattagaccacctaagaaattaggg 11195684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29545165 - 29544935
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||  || || ||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  29545165 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggccctaacttttgacttacacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 29545066  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |  ||||||| |    
T  29545065 atggataatcctttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaaggttattagacctcctaaggaattaggggttgtaaccctataagagag 29544967  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29544966 tcataactcaagggattgattagggctatttt 29544935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 53009849 - 53009671
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  53009849 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 53009750  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||  |||| | |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||    
T  53009749 atttataaccatttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaagaaattaggg 53009671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 180
Target Start/End: Original strand, 18911374 - 18911507
Alignment:
Q  46 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 145  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||  || ||||    
T  18911374 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgataataggttaacgtgctt-aaac 18911472  T
Q  146 cttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18911473 cttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 18911507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 21419619 - 21419796
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||   |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  21419619 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgagcgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtctagga 21419718  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagg 179  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21419719 atggataatcttttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattagg 21419796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5677657 - 5677452
Alignment:
Q  35 actactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaac 134  Q
    |||||| ||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||          | |||| ||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  5677657 actactaaccataacttacaacttagacttaattgaattgttcaaataaacaaggt----------aggaatgatcgtatatttgtgatacaaggttaac 5677568  T
Q  135 gtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttag 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| ||   |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  5677567 gtccttaaaaccttcaaagaatattagatcacttaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaagtcaagggattgattaggactattttag 5677468  T
Q  235 ttaaccgtcgggaaac 250  Q
    ||| || ||| |||||    
T  5677467 ttagccatcgtgaaac 5677452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15405376 - 15405194
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg- 99  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  15405376 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 15405277  T
Q  100 --aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
      |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15405276 ataatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 15405194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5681258 - 5681436
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |  | || |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||    
T  5681258 atcaaatataaacatgatttagccataacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtgtagga 5681357  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5681358 atggataatcgtttgttagtgatactaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5681436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15430147 - 15429969
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| ||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  15430147 atcaaatataaacatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 15430048  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  15430047 atggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagataattagaccacctaaggaattaggg 15429969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19864800 - 19864626
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||||| | |||||  |||||||| |||||||||| |||||     
T  19864800 catataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatgg 19864701  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||    
T  19864700 ataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccatctaagaaattaggg 19864626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38283780 - 38283602
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| | |    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  38283780 atcaaatataaacctgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctactgatagaatattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 38283681  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38283680 atggataatcctttgttagtgatattaggttaacg-tgctaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 38283602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 35509800 - 35509973
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || || |||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  35509800 atataaacatgatttagtaagaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattgaattgttctaataaacatcgttagtctaggaatgga 35509899  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  35509900 taatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaacctttaatggttattagaccacctaaggaattaggg 35509973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15436761 - 15436583
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| ||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  15436761 atcaaatataaacatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 15436662  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |   |||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  15436661 atgtataatcgttttttattgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagataattagaccacctaaggaattaggg 15436583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 25961888 - 25962023
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| ||  |||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  25961888 atcaaatataaaaatgatttaatgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 25961987  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  25961988 atggataatcctttattagtgatattagcttaacgt 25962023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Original strand, 33926836 - 33927033
Alignment:
Q  35 actactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaac 134  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  33926836 actactgaccctagctttcgacttagatctaattgaactgttctaataaacatgattagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaac 33926935  T
Q  135 gtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||  || |||||||  |  | ||||||| ||||| | |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  33926936 gtgctttaaacctttgagaattattagaccacctgaggaattaggggctgtagttttagaagagggtcctaactcaagggattgattatggctatttt 33927033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Original strand, 26060803 - 26060861
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  26060803 tacgaacttatttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 26060861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3797636 - 3797579
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  3797636 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 3797579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15404903 - 15404845
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15404903 tacgaacttaattttattacttcgatgcatat-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 15404845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15811957 - 15811899
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15811957 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaggtctatcaa 15811899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Original strand, 56195827 - 56195885
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  56195827 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaaatctatcaa 56195885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 56199154 - 56199211
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  56199154 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaaatctatca 56199211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8448744 - 8448680
Alignment:
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcaccta 169  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8448744 ataatcctttgtttgtgatattagcttaacgtttgtaatacctttaaagattattagatcaccta 8448680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 371
Target Start/End: Original strand, 10386120 - 10386156
Alignment:
Q  335 tttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10386120 tttattttctgttatttactttttatgcacacaaacc 10386156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 545
Target Start/End: Original strand, 29442165 - 29442209
Alignment:
Q  501 atatctacacctctaatgttttgtagccaaaagagaggtaagtta 545  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29442165 atatctactcctctaatgttttgtagacaaaagagaggtgagtta 29442209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Original strand, 19821015 - 19821072
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19821015 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtatatcaa 19821072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 371
Target Start/End: Original strand, 33927154 - 33927189
Alignment:
Q  336 ttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33927154 ttattttatgttatttactttttatgcacaccaacc 33927189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5677383 - 5677318
Alignment:
Q  304 tctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatg-ttatttactttttatgcacacaaa 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  5677383 tctcatctctccatatattttctaaacaacctttatattccgtttattta-tttttatgcacacaaa 5677318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8448834 - 8448748
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaa-ttgaattgttcaaataaaca 86  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  8448834 atcaaatataaacatcatttcgtaagaatgaatgactactggtcatagctttctacttagacctaaattgaattgctcaaataaaca 8448748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 19827722 - 19827778
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19827722 tacgaactta-ttttattacttcgagacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 19827778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Original strand, 40795320 - 40795369
Alignment:
Q  450 taattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  40795320 taattttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtttatca 40795369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 357
Target Start/End: Original strand, 5681564 - 5681629
Alignment:
Q  294 gaaagacc-agtctcatctctccatatctttt-ctaaacaaactttattttatgttatttactttt 357  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  5681564 gaaagacctagtctcatctctccttatcttttccaaaactatctttattttatgttatttaatttt 5681629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 370
Target Start/End: Original strand, 10248001 - 10248037
Alignment:
Q  335 tttattttatgttatttacttttta-tgcacacaaac 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10248001 tttattttatgttatttactttttattgcacacaaac 10248037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 371
Target Start/End: Original strand, 19929069 - 19929105
Alignment:
Q  335 tttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19929069 tttattttctgttatttaatttttatgcacacaaacc 19929105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24410246 - 24410206
Alignment:
Q  55 acttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtc 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24410246 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 24410206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 545
Target Start/End: Original strand, 29439520 - 29439564
Alignment:
Q  501 atatctacacctctaatgttttgtagccaaaagagaggtaagtta 545  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  29439520 atatctactcctctaatgttttgtagacaaaagagcggttagtta 29439564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11247594 - 11247824
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11247594 atcaaatataaacatgattacgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 11247693  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  11247694 atgaataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggg-ctgtaatctgataagagag 11247792  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11247793 ttctaagtcaagggattgattaaggatatttt 11247824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 28848687 - 28848912
Alignment:
Q  15 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28848687 tgaattcgtgagaatgaatgactgctgaacatagctttcaactcagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctaggaatagataatcgttt 28848786  T
Q  115 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 214  Q
    || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||   |||||||||||    
T  28848787 atttgtgataataggttaacgttctcaaaaccttcaaagaatatcagatcacctaaggaattagggactgtaatttgagaagagggccctaagtcaaggg 28848886  T
Q  215 atttattaaggctattttagttaacc 240  Q
    |||||| | | |||||||||||||||    
T  28848887 atttatcaggactattttagttaacc 28848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 2846139 - 2846383
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  2846139 atataaacatgatttcgtgataatgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgga 2846238  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtt-tttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   |    
T  2846239 taatcttttatttgtgatattaagttaacgttctttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcct 2846338  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  2846339 atgtcaagggattgattatggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 2846383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12988417 - 12988196
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12988417 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 12988318  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||||||    
T  12988317 atggataatcgtttatttgtgatattaggttagcgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatatgcgaagaggg 12988218  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
       |||||||||||||| ||||    
T  12988217 tcctaagtcaagggattgatta 12988196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13021546 - 13021309
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  13021546 atcaaatataaacatgatttcgtaagaatgaatgactactgatcataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatcgttagtctagga 13021447  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||| | |||||||    
T  13021446 atggataatcgtttatttgtgatattaggttaatgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacttaaggagttagggactataatctgagaagaggg 13021347  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaa 238  Q
       |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13021346 tcctaagtcaagggattgattagggctattttagttaa 13021309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 24371106 - 24371305
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaatt-gttcaaataaacaaggttagtctatg 99  Q
    |||| ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |    
T  24371106 atcaaatataaacatgatataatgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaatttgttcaaataaaccgggttagtctagg 24371205  T
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 199  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24371206 aatggataatcgtttatttgtgataataggttaatgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgataagagg 24371305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 6513093 - 6513267
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  6513093 atataaacatgatttcatgagaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatgaa 6513192  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6513193 taatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 6513267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 5259773 - 5260014
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  5259773 catataaacatgattctgtaagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgg 5259872  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||   ||| | ||| |||||||   |    
T  5259873 gtaatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaaataggg---gtattttaagaagagggtcct 5259969  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 250  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5259970 aagtcaagggattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 5260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1126027 - 1125796
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  1126027 atcaaatataaacatgatttagtgagaaggaataactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 1125928  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  1125927 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 1125828  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  1125827 tcttaactcaagggattgattaggactatttt 1125796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9839686 - 9839459
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  9839686 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaatatggttagtctagga 9839587  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||    
T  9839586 atggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaactttcgaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagaggg 9839487  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggcta 228  Q
       |||||||||||||| |||| |||||    
T  9839486 tcctaagtcaagggattgattagggcta 9839459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22561455 - 22561224
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22561455 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaacaatagctttctacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctagga 22561356  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  22561355 atggataatcgtttatttctgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattatgagatcacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 22561256  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  22561255 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 22561224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 23007941 - 23008124
Alignment:
Q  49 ctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaacctt 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23007941 ctttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacctt 23008040  T
Q  149 caaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23008041 taaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctatttt 23008124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23780423 - 23780240
Alignment:
Q  49 ctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaacctt 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23780423 ctttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacctt 23780324  T
Q  149 caaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23780323 taaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctatttt 23780240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5738376 - 5738197
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  5738376 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 5738277  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5738276 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5738197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14281808 - 14281627
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||      
T  14281808 catataaacatgatttcgttagaatgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattcaattgttctaataaacatggttagtctaggaattg 14281709  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  14281708 ataatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 14281627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 2379062 - 2379238
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  2379062 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 2379161  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  2379162 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 2379238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11192871 - 11192657
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttca-acttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggtta----gtc 95  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    |||    
T  11192871 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatga----ctactgaccataggtttcacacttagacctaattgaaatgttcaaataaacagggttaattagtc 11192776  T
Q  96 tatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataa 195  Q
    || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||    
T  11192775 taggattggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtagtctgagaa 11192676  T
Q  196 gagggagttaagtcaaggg 214  Q
    ||| |  ||||||||||||    
T  11192675 gagagtcttaagtcaaggg 11192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9953796 - 9954026
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  9953796 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 9953895  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  9953896 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 9953994  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9953995 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 9954026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 11402089 - 11402268
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  11402089 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacagggttaatctagga 11402188  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  11402189 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattaggg 11402268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20185577 - 20185807
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  20185577 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 20185676  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  20185677 atggataatcgtttattagtgatattaggttaacattctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 20185775  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20185776 tcctaagtcaagggattgattatgactatttt 20185807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22150414 - 22150184
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22150414 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 22150315  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  22150314 atggataatcgtttattagtgatattaggttaacattctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 22150216  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22150215 tcctaagtcaagggattgattatgactatttt 22150184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 30655276 - 30655455
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  30655276 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 30655375  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30655376 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 30655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3597073 - 3596894
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  3597073 atcaaatataaacatgatttagtgagaataaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 3596974  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3596973 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 3596894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 10289805 - 10289983
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10289805 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctagga 10289904  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10289905 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 10289983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 13005025 - 13005252
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||      
T  13005025 catataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactggccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatag 13005124  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   |    
T  13005125 ataatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaaattcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcat 13005224  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    || |||||||||| |||| | |||||||    
T  13005225 aactcaagggattgattaggactatttt 13005252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28230427 - 28230657
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  28230427 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctagga 28230526  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  | |||||||    
T  28230527 atgaataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagaggg 28230625  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  28230626 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 28230657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26942726 - 26942496
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||    
T  26942726 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttgataaacaaggttagtctagga 26942627  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  |||||| | | |||||||    
T  26942626 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattaggggctgtaatttgagaagaggg 26942528  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  26942527 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 26942496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23385045 - 23384865
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23385045 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 23384946  T
Q  101 atg--aataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  23384945 atggatataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaacaactaaggaattaggg 23384865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24400012 - 24400197
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24400012 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 24400111  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| | |  ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  24400112 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacggttattagaccacctgaggaattaggggttgtaa 24400197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28112051 - 28111879
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  28112051 atataaacatgatttagtgagattgaatgactactaaccatagctt-cgacttagaccaaattgaattgatctaataaacatggttagtctaggaatgaa 28111953  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28111952 gaatcgtttattagtgatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28111879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Original strand, 2372162 - 2372295
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  || |||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2372162 catataaacgtgatttcgtgagaattgatgactactgac----gctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatga 2372257  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaa 142  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  2372258 ataatcgtttattagtgatattaggttaacgtatttaa 2372295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 24410131 - 24410266
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24410131 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 24410230  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24410231 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgt 24410266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 19475835 - 19476020
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||  |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  19475835 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcctagga 19475934  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19475935 atggataatcctttattagtgatagtaggttaacg-tgttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 19476020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17106867 - 17106671
Alignment:
Q  35 actactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaac 134  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17106867 actactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgttttttagtgatattaggttaac 17106768  T
Q  135 gtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  17106767 gtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactatttt 17106671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18856316 - 18856165
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  18856316 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 18856217  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaag 153  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  18856216 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaag 18856165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 4512305 - 4512483
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4512305 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagactgaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 4512404  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |  || |||||||||||   || |||| ||||||| |||||||||    
T  4512405 atgaataatcatttattagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaaagttagtagaccacctaaggaattaggg 4512483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 13946851 - 13947036
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||  ||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  13946851 atcaaatataaatatgatttagtgagaacaaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 13946950  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||  || ||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  13946951 atggataatcctttattagtgatattagattaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattaaaccacctaaggaattaggggttgtaa 13947036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11125987 - 11125819
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||| || |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  11125987 atcaaatataaacatgatttagtgaaaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctagga 11125888  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaa 170  Q
    ||| |||||||||| |   ||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11125887 atggataatcgtttgttactgatatttggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaa 11125819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 31072137 - 31072250
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||    
T  31072137 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggctggtctagga 31072236  T
Q  101 atgaataatcgttt 114  Q
    ||| ||||||||||    
T  31072237 atggataatcgttt 31072250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28108075 - 28107923
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| |||| | | | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||| |    
T  28108075 atataaacatgatttagagagaatgaatgactaatgatcatagctttga-cttagacctaattgaattgttctaataaacacggttagtcatggaatgga 28107977  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatatta 160  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  28107976 taatcgattattagtcatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagaatatta 28107923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Original strand, 7128194 - 7128310
Alignment:
Q  63 ctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattaga 162  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||||||    
T  7128194 ctaactgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaatgttattaga 7128292  T
Q  163 tcacctaacgaattaggg 180  Q
     ||||||| |||||||||    
T  7128293 ccacctaaggaattaggg 7128310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11192551 - 11192493
Alignment:
Q  308 atctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacaca 367  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192551 atctctctctatcttttctaaacaa-ctttattttatgttatttactttttatgcacaca 11192493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9839352 - 9839304
Alignment:
Q  321 ttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacaaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  9839352 ttttctaaacaaactttattttcttttatttaatttttatgcacacaaa 9839304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Original strand, 24371366 - 24371422
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaa-ctttattttatgttatttactttt 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24371366 agtctcatctctccatatattttccaaacaaatctttattttctgttatttactttt 24371422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11188207 - 11188131
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttc 77  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
T  11188207 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaaacagaattgaattgttc 11188131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23388388 - 23388328
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 61  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23388388 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaga 23388328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 506
Target Start/End: Original strand, 16731648 - 16731702
Alignment:
Q  451 aattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaatatct 506  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  16731648 aattttattacttcgatatattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcattatct 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 20186045 - 20186102
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgct-aaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20186045 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtgcacttgctaaaaagtctatca 20186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22149946 - 22149889
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgct-aaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22149946 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtgcacttgctaaaaagtctatca 22149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20527204 - 20527156
Alignment:
Q  451 aattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  20527204 aattttattacttcgatatatttg-tagtacacttgctaaaagtctatca 20527156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 118737 - 118561
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  118737 atcaaatataaacatgaattcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 118638  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  118637 atggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgcatgtaaaaccttcaaagaatattagatcatctaaggaatta 118561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 4868085 - 4868356
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     |||||||| ||    
T  4868085 atcaaatataaagatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccataactttcaacttaggcctaattgaattgttcaaataaa-----ttagtctagga 4868179  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||  | |||||||    
T  4868180 atggataattttttatttgtgatattaggtgaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattatgaactgtaatccgagaagaggg 4868279  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgc 278  Q
       |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  4868280 tcctaagtcaagggattgattagggcta-tttagttaaccatcgtgaaactataggagtattaataggaaataggtgc 4868356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12516745 - 12516514
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12516745 atcaaatataaacataatttagtgagaacgaatggctactgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 12516646  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12516645 atggataatcgtttgttagtgatattatgttaaagtgcataaaaccttcaaagaatattagatcaactaaggaattagggattgtaatctaagaagaggg 12516546  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  12516545 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 12516514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22174215 - 22173984
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  22174215 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaacatggttaatctagga 22174116  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  22174115 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 22174016  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  22174015 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 22173984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 14421572 - 14421751
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14421572 atcaaatataaagatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatga 14421671  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14421672 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattaggg 14421751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45155557 - 45155330
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||     
T  45155557 catataaacatgatttcgtggaaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctattaaacatggttagtctaggaatgg 45155458  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || || | | | |||||||  ||    
T  45155457 ataatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttttagtttgagaagagggtctt 45155358  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    || |||||||||| |||| | |||||||    
T  45155357 aactcaagggattgattaggactatttt 45155330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18826179 - 18825948
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  18826179 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 18826080  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  18826079 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 18825980  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  18825979 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 18825948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43682162 - 43681931
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  43682162 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaaatgttctaataaacatggttagtctagga 43682063  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| | | |||||||    
T  43682062 atggataatcctttattagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctacggaattagggactgtaatatgagaagaggg 43681963  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  43681962 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 43681931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 8911475 - 8911654
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  8911475 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 8911574  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8911575 atgcataatcctttattagtgatattatgttaacgtgcttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 8911654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12582836 - 12583066
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12582836 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 12582935  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  ||||| |||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  12582936 atagataattgtttgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattacaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 12583034  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  12583035 tcctaagtcaagggattgattaggactatttt 12583066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18721573 - 18721394
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||    
T  18721573 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattattctaataaacatggttagtctagga 18721474  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||    
T  18721473 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccaactaagaaattaggg 18721394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18824686 - 18824455
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  18824686 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 18824587  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  18824586 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 18824487  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  18824486 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 18824455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 200
Target Start/End: Original strand, 23643654 - 23643846
Alignment:
Q  8 ataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaata 107  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  23643654 ataaacatgacttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgtttagtctaggaatggata 23643753  T
Q  108 atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| | |||||||    
T  23643754 atcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgagaagaggg 23643846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25591770 - 25591592
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  25591770 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttta-cttagacaaaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 25591672  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  25591671 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggg 25591592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36710928 - 36710697
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  36710928 atcaaatataagcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttggacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 36710829  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  36710828 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 36710729  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36710728 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 36710697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 10663727 - 10663902
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  10663727 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 10663826  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  10663827 atggataatcctttattagtgatactaggttaatgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 10663902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21280060 - 21279830
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  21280060 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctagga 21279961  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||| |    
T  21279960 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttaagaagagag 21279862  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  21279861 tcttaactcaagggattgattaggactatttt 21279830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38248686 - 38248512
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |  ||     
T  38248686 catataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttacgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagatagtctaggtttgg 38248587  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38248586 ataatcgtttattagtgatattaggttaacg-tactaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 38248512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25594943 - 25594773
Alignment:
Q  7 tataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaat 106  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  25594943 tataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgatttgttctaataatcatggttagtctaggaatggat 25594844  T
Q  107 aatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  25594843 aatcctttattactgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaatta 25594773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 25230921 - 25231085
Alignment:
Q  14 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 113  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||||||||    
T  25230921 atgatttcgtgagaatgaatgactactgaccgtaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcttaggaatggataatcgtt 25231020  T
Q  114 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    |||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||    
T  25231021 tattagtgatattaggttaacatacttaaaaccttcaaatattattagaacacccaaggaattag 25231085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17930809 - 17931039
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||    
T  17930809 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctagtaaacatggttagtatagga 17930908  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||| || | |||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  17930909 atggataatcgtttgttagtgatataagatcaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 17931007  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17931008 tcgtaactcaagggattgattaagactatttt 17931039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23619655 - 23619477
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23619655 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 23619556  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||| |||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23619555 atggataatcatttattagtgaaattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 23619477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31284502 - 31284680
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  31284502 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagccttcgacttagacctaattgaattgttgtaataaacatggttagtctagga 31284601  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31284602 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 31284680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33419484 - 33419669
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  33419484 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 33419583  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||| | ||| |  || ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  33419584 atgtataatcctttattagtgatattagataaacatgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacataaggaattaggggttgtaa 33419669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5980604 - 5980374
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||       
T  5980604 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgacttgttctaataaacaagtttagtctagat 5980505  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||| |||| | | | |||||||    
T  5980504 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattacggactgtagtttgagaagaggg 5980406  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  5980405 tcctaactcaagggattgattatgactatttt 5980374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5614019 - 5613788
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaa-------taaacaaggttag 93  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||       |||||| |||||     
T  5614019 atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttat 5613920  T
Q  94 tctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc-aaagaatattagatcacctaacgaattaggg--attgtaatct 190  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||    | ||||||    
T  5613919 tctaggtatgcataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatct 5613820  T
Q  191 aataagagggagttaagtcaagggatttatta 222  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  5613819 gagaagagggtcctaagtcaagggatttatta 5613788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10498505 - 10498327
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| || | || ||||||| |||  |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  10498505 atcaaatataaatataatttagtgagaacgaacgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcttgga 10498406  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10498405 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 10498327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30784757 - 30784934
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||    
T  30784757 atcaaatataaacatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatgaataatctagga 30784856  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatc 189  Q
    ||| ||           ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  30784857 atggat-----------tgtgatattaggttaacgttcgtaaaaccttcagagaactttaaatcacctaaggaattagagactgtaatc 30784934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5539065 - 5538912
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  5539065 atcaaatataaaaatgattaagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatgattagtctagga 5538966  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaaga 154  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  5538965 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgcataaaaccttcaaaga 5538912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13196685 - 13196869
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||| |||| |||||  ||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  13196685 atcaaataaaaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccataactttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 13196784  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgta 186  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||| |||||    
T  13196785 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacg-tgctcaaaccttcaaagattattagactacctaagaaattaggggttgta 13196869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 2560380 - 2560556
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||| || |||| |||||| ||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||||||||| ||    
T  2560380 atcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgaccatggttttcgacttagacctaactgaattgttctaatacagatggttagtctagga 2560479  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||| |||||   ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  2560480 atggataatcctttattaatgatattagtttaacgtgcttaaagccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 2560556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16953604 - 16953783
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  16953604 atcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttcttataaacagggttagtctagga 16953703  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |   |||||||||||||| ||  || |||||||| |  | ||||||| | ||||| |||||||||    
T  16953704 atggataatcgtttgttaatgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccgcctaaggaattaggg 16953783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44027330 - 44027154
Alignment:
Q  55 acttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaaga 154  Q
    |||||||  |||||||||| ||| |||||||| | ||||  || |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  44027330 acttagacttaattgaatttttctaataaacatgattaggttaggaatgaataatcatttattagtgacattaggttaacgtgttt-aaaccttcaacga 44027232  T
Q  155 atattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  44027231 ttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 44027154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33883171 - 33883114
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33883171 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 33883114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5538749 - 5538693
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaaca-aactttattttatgttatttactttt 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  5538749 agtctcatctctccatatattttccaaacatatctttattttctgttatttactttt 5538693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12820688 - 12820638
Alignment:
Q  451 aattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaat 502  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12820688 aattttattacttcgatatattt-ttagcacacttgctaaaagtttatcaat 12820638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14589561 - 14589526
Alignment:
Q  336 ttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14589561 ttattttatgttatttactttttatgcacaccaacc 14589526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5538591 - 5538535
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  5538591 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaaatctatca 5538535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33883501 - 33883411
Alignment:
Q  142 aaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  33883501 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactatttt 33883411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 501
Target Start/End: Original strand, 12583328 - 12583376
Alignment:
Q  452 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  12583328 attttattatttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 12583376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 22020884 - 22021111
Alignment:
Q  5 catataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  22020884 catataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 22020983  T
Q  105 ataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   |    
T  22020984 ataatcgtttattagtgatattaggttaacgtacttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttct 22021083  T
Q  205 aagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    || |||||||||| |||| | |||||||    
T  22021084 aactcaagggattgattaggactatttt 22021111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25139216 - 25138993
Alignment:
Q  9 taaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataa 108  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  25139216 taaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctcataatcatggttagtctaggaatggataa 25139117  T
Q  109 tcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagt 208  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |    
T  25139116 tcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaact 25139017  T
Q  209 caagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  25139016 caagggattgattatgactatttt 25138993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25959981 - 25959750
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  25959981 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 25959882  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  25959881 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtctgagaagaggg 25959782  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  25959781 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 25959750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30275061 - 30274830
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  30275061 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 30274962  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  30274961 atggataatcctttatcagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 30274862  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
      |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  30274861 tcttaactcaagggattgattatgactatttt 30274830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43208182 - 43208003
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  43208182 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 43208083  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  43208082 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttacaaccttcaaagactattagaccacctaaggaattaggg 43208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35521648 - 35521455
Alignment:
Q  11 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaat----gaat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    | ||    
T  35521648 aacatgaattcgtgagaatgaaagactactgatcctagctttcaacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaatatatggat 35521549  T
Q  107 aatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35521548 aattgtttatttgtgatataaggttagcgctcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaattagggattgtaatctgagaagaggg 35521455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9185717 - 9185486
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  9185717 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 9185618  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||| | | | |||||||    
T  9185617 atgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagagactgtagtttgagaagaggg 9185518  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  9185517 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 9185486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31427834 - 31427603
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  31427834 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctagga 31427735  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  31427734 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 31427635  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31427634 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 31427603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9966662 - 9966486
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9966662 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagcttcctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctagga 9966563  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  9966562 atggataatcatttatttgtgatgttaagttaacgttcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 9966486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11348188 - 11348009
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  11348188 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 11348089  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  11348088 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 11348009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36808734 - 36808514
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  36808734 atcaaatataaacatgatttagtaagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 36808635  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||    
T  36808634 atgtataatcgtttattagtaatattaggttaacgtgctt-aaactttcaaagattattagaccacctaaagaattagggtctgtagtttaagaagaggg 36808536  T
Q  201 agttaagtcaagggatttatta 222  Q
      |||| |||||||||| ||||    
T  36808535 tcttaactcaagggattgatta 36808514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9188945 - 9188714
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  9188945 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagatttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 9188846  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||    
T  9188845 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagtaattaggggttgtagtttgagaagaggg 9188746  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  9188745 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 9188714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 24234908 - 24235087
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  24234908 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctagga 24235007  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24235008 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24235087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25821138 - 25820908
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  25821138 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 25821039  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  25821038 atggataatcgtttgttagtgatactaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 25820940  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  25820939 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 25820908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 27266601 - 27266832
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  27266601 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaaga 27266700  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  27266701 atggataatcgtttattagtgataataggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 27266800  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  27266801 tcctaactcaaggaatttattaggactatttt 27266832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31586233 - 31586054
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  31586233 atcaaatataatcatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 31586134  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31586133 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 31586054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42369003 - 42368773
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  42369003 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 42368904  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  42368903 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagaggg 42368805  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  42368804 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 42368773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5105539 - 5105718
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||    
T  5105539 atcaaatataaacataatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtatagga 5105638  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5105639 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5105718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 8888449 - 8888627
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  8888449 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 8888548  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8888549 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8888627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 24238180 - 24238359
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24238180 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatggctactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 24238279  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24238280 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24238359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37279969 - 37279790
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  37279969 atcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 37279870  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  37279869 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacattcttaaaaccttcaaagattattagaccacgtaaggaattaggg 37279790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 45456979 - 45457205
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || || |||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  45456979 atataaacatgatttagttagaacgaatgactactgaccctagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 45457078  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 205  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||    
T  45457079 taatctttttttagtgatattaggttaacgttctttaaaccttctattattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtctta 45457178  T
Q  206 agtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||    
T  45457179 actcaagggattgattagggctatttt 45457205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5666331 - 5666509
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||    
T  5666331 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatagttctaataaacatggttagtctagga 5666430  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5666431 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5666509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 6826585 - 6826763
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  6826585 atcaaatataaacatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagaaagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 6826684  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6826685 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaaattattagaccacctaaggaattaggg 6826763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13972186 - 13972008
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||| ||    
T  13972186 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattggatttttctaaaaaacatggttagtctagga 13972087  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  13972086 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 13972008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16178940 - 16179170
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  16178940 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 16179039  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||    
T  16179040 atggataatccattattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtaatcctagaagaggg 16179138  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  16179139 tcctaactcaagggattgattagagctatttt 16179170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 26365746 - 26365925
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||    
T  26365746 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaattactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaatttttctaataaacatggttagtttagga 26365845  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26365846 atgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 26365925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45493448 - 45493270
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45493448 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 45493349  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45493348 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45493270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45501190 - 45501012
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45501190 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 45501091  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45501090 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45501012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 45453696 - 45453917
Alignment:
Q  11 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 110  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  45453696 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 45453795  T
Q  111 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 210  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||    
T  45453796 gtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactca 45453895  T
Q  211 agggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||||| ||||  ||||||||    
T  45453896 agggattgattagtgctatttt 45453917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 43723513 - 43723692
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  43723513 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttctaataaacagggttagtctagga 43723612  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggga 181  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43723613 atggataatcgtttgttagtgatattaggttagcgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggga 43723692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1386714 - 1386484
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |    
T  1386714 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaa 1386615  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  | |||||||    
T  1386614 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagaggg 1386516  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  1386515 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 1386484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 25870597 - 25870775
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  25870597 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctagga 25870696  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  25870697 atggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 25870775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 30926360 - 30926648
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||              
T  30926360 atcaaatataaacatgattttgtgagaatgaatgactgctaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggt---------- 30926449  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacc----taacgaattagggattgtaatctaataag 196  Q
     || |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| ||||||||| |||| |||| | |||    
T  30926450 -tggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcataaaaccttcaaagagtattagaccacctaattaaggaattaggggttgtcatctgagaag 30926548  T
Q  197 agggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaa 296  Q
    ||||   |||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||||| ||| |||||  ||  |  |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  30926549 agggtcctaagtcaatggattgattaggactatttt-gctaaccatcgtgaaactagaaaatcattcgtagaaaataggtgcagtatatcaattagggaa 30926647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 33310479 - 33310710
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  33310479 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttggacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctagga 33310578  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  33310579 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacttgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 33310678  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  33310679 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 33310710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38015331 - 38015562
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  38015331 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgactttgacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 38015430  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||| ||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  38015431 atggataatcatttgttagtgatattaggttaaggtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 38015530  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  38015531 tcctaactcaagggattgattagggctatttt 38015562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40259431 - 40259201
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  40259431 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttagga 40259332  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||   ||||| |  |||||| ||    
T  40259331 atggataatcatttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacgattattataccacctaaggaattaggcgctgtaaccctataagaagg 40259233  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40259232 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 40259201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 34682622 - 34682807
Alignment:
Q  110 cgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtc 209  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | ||||| |   ||||||    
T  34682622 cgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacc--caaagaatattagatcaccttaggaattagggactgtaatctgagaagagagtcctaagtc 34682719  T
Q  210 aagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 297  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| | || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  34682720 aagggattgattagggctattttggttaaccatcgtgaaactagagaaatactcataggaaatacgtgcagtgtaccaattagggaaa 34682807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 3875099 - 3875277
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||    
T  3875099 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaattactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaatttttctaataaacatggttagtatagga 3875198  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3875199 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgatt-aaaccttcaatggttattagaccacctaaggaattaggg 3875277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17874874 - 17874694
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  17874874 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttagtctagga 17874775  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||      |||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  17874774 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgt------aaccttcaacagatattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 17874694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 25873988 - 25874166
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  25873988 atcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctagga 25874087  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  25874088 atggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 25874166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37937511 - 37937337
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||    
T  37937511 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattattctaataaacatggttagtttagga 37937412  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatt 176  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  37937411 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaatt 37937337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 40781285 - 40781463
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  40781285 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccacagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 40781384  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  || ||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  40781385 atggataatcgtttgttagtaatattaggtcaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 40781463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Original strand, 17876924 - 17877054
Alignment:
Q  6 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 105  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  17876924 atataaacatgatttagtgagaacgaattactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 17877023  T
Q  106 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  17877024 taatcctttattagtgatattaggataacgt 17877054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 22630654 - 22630832
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  22630654 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacattgttagtctaaga 22630753  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||  |||||   ||||||||||||||| |  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22630754 atggataatattttattattgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 22630832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 12219608 - 12219784
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaat-aactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg 99  Q
    |||| ||||||| || | || ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  12219608 atcaaatataaatatcatttagtgagaacgaatgaactactgaccctagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagg 12219707  T
Q  100 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaatta 177  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||    
T  12219708 aatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacataaggaatta 12219784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16791051 - 16790871
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| ||  |||||| |||| |||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  16791051 atcaaatataaatatgatttaatgagaacgaatgactactgaccatagctttcggcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 16790952  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggtta--acgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  16790951 atggataatcatttgttagtgatattaggttaacacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 16790871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 180
Target Start/End: Original strand, 29440375 - 29440486
Alignment:
Q  68 tgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacc 167  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  29440375 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactagcttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacc 29440473  T
Q  168 taacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||    
T  29440474 taaggaattaggg 29440486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Original strand, 11187925 - 11188095
Alignment:
Q  28 atgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatatta 127  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| | ||    
T  11187925 atgaatgactactgacattaactttcaacttatacctaattgaattgtttaattaaacatggttagtctaggaatggataaccgtttaattgtgagaata 11188024  T
Q  128 ggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagag 198  Q
      ||||| || | ||||||||| || ||||| ||| |||||||  |||| |||  |||||||||| |||||    
T  11188025 tattaacattctaaaaaccttcgaacaatatgagagcacctaagaaattgggggatgtaatctaagaagag 11188095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 10600759 - 10600854
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtct 96  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  10600759 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtct 10600854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17876303 - 17876211
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttag 93  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17876303 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttag 17876211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 31427363 - 31427305
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  31427363 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 31427305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 503
Target Start/End: Original strand, 45457445 - 45457505
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaata 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  45457445 tacgaacttaattttattacttcgatgcatat-ttagtacacttgctaaaaatctatcaata 45457505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25820823 - 25820767
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaaca-aactttattttatgttatttactttt 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25820823 agtctcatctctccatatattttccaaacatatctttattttctgttatttactttt 25820767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 357
Target Start/End: Original strand, 34682829 - 34682883
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttt 357  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34682829 agtctcatttctctctatcttttctaaacaa-ctttaatttatgttatttactttt 34682883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 501
Target Start/End: Original strand, 45454161 - 45454215
Alignment:
Q  446 aacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  45454161 aacttaattttattacttcgatgcatat-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 45454215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 502
Target Start/End: Original strand, 5666810 - 5666868
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaat 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  5666810 tacgaactta-ttttattacttcgatatattt-ttaatacacttgctaaaagtctatcaat 5666868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 154
Target Start/End: Original strand, 6298395 - 6298431
Alignment:
Q  118 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaaga 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6298395 tgtgatattagattaacgtttttaaaaccttcgaaga 6298431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48667 - 48418
Alignment:
Q  29 tgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattag 128  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  48667 tgaatgactactgaccctagcttacaactttgacctaattgaattgttcaagtaaacaaggttagcctaggaatggataatcgtttatttgtgatattat 48568  T
Q  129 gttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggcta 228  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||   || ||||||||||| |||| | |||    
T  48567 gttaacattcataaaaccttcaaagaatattggatcacctaaggaattagggaccgtaatctgagaagagggtcctacgtcaagggattgattatgacta 48468  T
Q  229 ttttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgc 278  Q
    |||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||| |||| ||||||||||    
T  48467 ttttagttgaccatcgtgaaactagagaaatatttataggaaataggtgc 48418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48380 - 48343
Alignment:
Q  302 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttat 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48380 agtctcatctctccatatattttctaaacaacctttat 48343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 9768 - 10156
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||    
T  9768 atcacataaaaacatgaattcgtgagaatgaatgattattgaccataactttcaacttagacctaattgaattgatcgaataaacagagttagtctagga 9867  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatatt-aggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 199  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||| | ||||||    
T  9868 attggtaattgtttatttgtgatattaaggttaactttcttaaaaccttcaaataatattataacacataaggaattagggactctaatctgagaagagg 9967  T
Q  200 gagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttggg----- 294  Q
    |   |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||   ||| | |||||  || |||||||||| ||||| ||||| |||         
T  9968 gtcctaagtcaagggattgattagggctattttggttaaccatcgtgaaattagagaaatattcgaaggaaataggtgcagtgtaccaattaggggaact 10067  T
Q  295 -----------aaagac-cagtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
               ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10068 cagaggattcaaaagacatagtctcatctctccttatcttttccaaacaatatttaatttatgttatttactttttatgcaaacaaacc 10156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4080 - 3901
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4080 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 3981  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3980 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 3901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3343
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||    
T  3574 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaacctagga 3475  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||    
T  3474 atggataatcgtttgttagtgatattaggtaaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagaggg 3375  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  3374 ttctaactcaagggattgattaggactatttt 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 19226 - 19405
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19226 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 19325  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  19326 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattaggg 19405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 57881 - 57712
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |    
T  57881 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaaaatggttagtctagaa 57782  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaa 170  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  57781 atggataatcgtttattagtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagagtattagaccacctaa 57712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 355 - 124
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  355 atcaaatataaacatgaattagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagatataattgaattgttctgataaacatggttagtctagga 256  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||  |||| | | | |||||||    
T  255 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctaaaaaccttgaaagattattagaccgcctaagaaattaggggctgtagtttgagaagaggg 156  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  155 tcctaactcaagggatttattagggctatttt 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8332
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  8510 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacttggttagtctagga 8411  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8410 atggataatcgtttgtttgtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1609
Alignment:
Q  65 aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatc 164  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||| || ||||| ||||||| |    
T  1775 aattgaattattctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaacttttaaagattattagacc 1677  T
Q  165 acctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | | | |||| ||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  1676 acctaaggaattaggggttgtagtttgagaagacggtcctaagtcaagggattgattatgactatttt 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4271 - 4187
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaac 85  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  4271 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaac 4187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1304
Alignment:
Q  443 acgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1359 acgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 62348 - 62526
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  62348 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 62447  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  62448 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 62526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 63691 - 63868
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  63691 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctagga 63789  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  63790 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaaggttattataccacctaaggaattaggg 63868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5413
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  5183 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattaaattgttctaataaatagggttagtctagga 5282  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||    
T  5283 atggatgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggg 5381  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  5382 tcctaagtcaagggattgattaggactatttt 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5690 - 5511
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  5690 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctagga 5591  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5590 atggataatcctttattagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggg 5511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 30925 - 31155
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  30925 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctagga 31024  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  | |||||||    
T  31025 atgtataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagaggg 31123  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  31124 tcctaactcaagggattgattaagactatttt 31155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 292854 - 293032
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  292854 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgacgatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtatagga 292953  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  292954 atggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 293032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 67816 - 67586
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  67816 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 67717  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||  |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||| |||||||    
T  67716 atatataatcgtttgttagtgatattaagttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggagttgtagtttaagaagaggg 67618  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  67617 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 67586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Original strand, 14091 - 14248
Alignment:
Q  22 gtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtg 121  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||    
T  14091 gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtg 14190  T
Q  122 atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  14191 atattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacggttattagatcacctaaggaattaggg 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 180
Target Start/End: Original strand, 6 - 140
Alignment:
Q  46 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 145  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6 tagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaac 105  T
Q  146 cttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  106 cttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 197978 - 198154
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||    
T  197978 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaggaatagtctagga 198077  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattag 178  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  198078 atggataatcatttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 198154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3111
Alignment:
Q  35 actactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaac 134  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  3262 actactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatggataatcctttattagtgatattaggttaac 3163  T
Q  135 gtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
     |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  3162 atgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 232
Target Start/End: Original strand, 102 - 246
Alignment:
Q  88 ggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  102 ggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtag 201  T
Q  188 tctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    | | | ||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  202 tttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaagactatttt 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 39 - 91
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttc 53  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  39 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttc 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Original strand, 2385 - 2556
Alignment:
Q  63 ctaattgaattgttcaaataaacaaggtta--gtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatatta 160  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2385 ctaactgaattgttctaataaacatggttatagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaacgttcaaagaatatta 2484  T
Q  161 gatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  2485 gctcacctaaggaattagggactgtagtatgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactatttt 2556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 2798 - 2854
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  2798 tacgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 2854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10375
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  10240 atcaaatataaacaggatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcaagga 10339  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 136  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  10340 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgt 10375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29426
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||  |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  29196 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaaagactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 29295  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 200  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||   ||||||| ||| | | ||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  29296 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaagttattagaccacgtgaggaattaggggttgtaaccctagaagaggg 29394  T
Q  201 agttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
       ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  29395 tcctaactcaagggattgattaggactatttt 29426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19211
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaaca 86  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  19126 atcaaatataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaaca 19211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Original strand, 19229 - 19296
Alignment:
Q  119 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 187  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  19229 gtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaaggttattagaccatctaaggaattaggggttgtaa 19296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 89600 - 89779
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  89600 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctagga 89699  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||  || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  89700 atggataatcgtttgttagtgatattaagttaacgtgcttcaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 89779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 501
Target Start/End: Original strand, 90080 - 90128
Alignment:
Q  452 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 501  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  90080 attttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 90128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Original strand, 248413 - 248579
Alignment:
Q  65 aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatc 164  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  248413 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgatt-aaaccttcaaagattattagacc 248511  T
Q  165 acctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |   |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  248512 acctaaggaattaggggttgtagtttgtgaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactatttt 248579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 1081 - 1258
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  1081 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctagga 1179  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  1180 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaaggttattataccacctaaggaattaggg 1258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2364 - 2196
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 100  Q
    |||| ||||||| |||| ||  |||||| |||| ||||||  || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  2364 atcaaatataaatatgatttattgagaacgaattactactggccctagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctagga 2265  T
Q  101 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaa 170  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  2264 atggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaa 2196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 58974 - 58812
Alignment:
Q  1 atcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgtt--caaataaacaaggttagtctat 98  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||     
T  58974 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttagacctaattgaatttttttctaataaacatggttagtctag 58875  T
Q  99 gaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattaga 162  Q
    ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||    
T  58874 gaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattaga 58812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 19196 - 19358
Alignment:
Q  11 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 110  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |        |||||||||| ||||| ||||||    
T  19196 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgactgagacctaattgaattgttctat-------ggttagtctaggaatggataatc 19288  T
Q  111 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaacgaattaggg 180  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19289 gtttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattaggg 19358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Original strand, 6 - 131
Alignment:
Q  55 acttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaaga 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  6 acttagacctaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcctttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaga 104  T
Q  155 atattagatcacctaacgaattaggga 181  Q
     ||||||| |||||||  |||||||||    
T  105 ttattagaccacctaagcaattaggga 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Original strand, 27005 - 27170
Alignment:
Q  66 attgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaagaatattagatca 165  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| | ||    
T  27005 attgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcgtttgttcgtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattacacca 27103  T
Q  166 cctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 232  Q
    ||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  27104 cctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaatggattgattaggactatttt 27170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Original strand, 27422 - 27478
Alignment:
Q  442 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27422 tacgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 27478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7666 - 7616
Alignment:
Q  321 ttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacaaacc 371  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7666 ttttcaaaactatctttattttctgttatttactttttatgcacaccaacc 7616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University