View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11711_low_1 (Length: 711)

Name: NF11711_low_1
Description: NF11711
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11711_low_1
NF11711_low_1
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (68-711)||(13878448-13879091)
chr7 (68-707)||(16311191-16311829)
chr7 (85-711)||(13028135-13028761)
chr7 (68-707)||(13680652-13681285)
chr7 (68-657)||(14171969-14172558)
chr7 (68-711)||(4413175-4413827)
chr7 (74-548)||(16547368-16547842)
chr7 (74-548)||(16617820-16618294)
chr7 (68-561)||(13173572-13174065)
chr7 (214-711)||(21211790-21212287)
chr7 (298-707)||(15466298-15466707)
chr7 (132-554)||(2706932-2707354)
chr7 (132-554)||(4221170-4221592)
chr7 (132-554)||(6868549-6868971)
chr7 (251-553)||(16408287-16408589)
chr7 (145-554)||(26391413-26391822)
chr7 (132-554)||(458305-458727)
chr7 (132-554)||(22098303-22098725)
chr7 (145-554)||(176065-176474)
chr7 (145-554)||(8626520-8626929)
chr7 (145-554)||(11003754-11004163)
chr7 (145-554)||(1996731-1997140)
chr7 (145-554)||(11014363-11014772)
chr7 (145-554)||(24743276-24743685)
chr7 (145-554)||(40043423-40043832)
chr7 (74-557)||(18439699-18440182)
chr7 (132-554)||(9442425-9442847)
chr7 (145-554)||(8003385-8003794)
chr7 (145-554)||(9093562-9093971)
chr7 (74-554)||(9168676-9169165)
chr7 (145-554)||(17951433-17951842)
chr7 (145-554)||(42875023-42875432)
chr7 (132-554)||(20988219-20988641)
chr7 (145-554)||(26654655-26655064)
chr7 (541-708)||(16546551-16546718)
chr7 (541-708)||(16618944-16619111)
chr7 (132-458)||(15879237-15879563)
chr7 (68-277)||(16669775-16669999)
chr7 (68-277)||(17644143-17644367)
chr7 (182-522)||(16309094-16309435)
chr7 (606-707)||(13173472-13173573)
chr7 (232-553)||(16106384-16106705)
chr7 (74-299)||(13176067-13176291)
chr7 (609-706)||(15705711-15705808)
chr7 (409-554)||(6879191-6879336)
chr7 (657-711)||(14186585-14186639)
chr7 (220-454)||(15087410-15087641)
chr7 (74-117)||(175985-176028)
chr7 (74-117)||(458751-458794)
chr7 (74-117)||(1996651-1996694)
chr7 (74-117)||(2707378-2707421)
chr7 (74-117)||(4221103-4221146)
chr7 (74-117)||(6868995-6869038)
chr7 (74-117)||(8003831-8003874)
chr7 (74-117)||(8626440-8626483)
chr7 (74-117)||(9093482-9093525)
chr7 (74-117)||(9442358-9442401)
chr7 (74-117)||(11003674-11003717)
chr7 (74-117)||(11014283-11014326)
chr7 (74-117)||(15879587-15879630)
chr7 (74-117)||(17951879-17951922)
chr7 (74-117)||(20988152-20988195)
chr7 (74-117)||(22098236-22098279)
chr7 (74-117)||(24743196-24743239)
chr7 (74-117)||(26391859-26391902)
chr7 (74-117)||(26655101-26655144)
chr7 (74-117)||(40043869-40043912)
chr7 (74-117)||(42874943-42874986)
chr7 (644-710)||(16408690-16408756)
chr7 (654-707)||(27870599-27870652)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (69-711)||(17014868-17015510)
chr8 (69-711)||(17541691-17542333)
chr8 (74-711)||(17287364-17288001)
chr8 (68-711)||(20256776-20257409)
chr8 (69-574)||(15976648-15977153)
chr8 (69-711)||(22672095-22672719)
chr8 (68-711)||(19941536-19942179)
chr8 (187-711)||(22462660-22463184)
chr8 (68-403)||(25164576-25164911)
chr8 (68-370)||(19940403-19940705)
chr8 (68-293)||(21603717-21603942)
chr8 (503-711)||(24834361-24834569)
chr8 (74-557)||(21297246-21297729)
chr8 (145-554)||(3349905-3350314)
chr8 (145-554)||(9366888-9367297)
chr8 (145-554)||(36302120-36302529)
chr8 (74-554)||(29085505-29085994)
chr8 (145-554)||(32078966-32079375)
chr8 (74-557)||(3842052-3842535)
chr8 (132-554)||(13689840-13690262)
chr8 (132-554)||(26119491-26119913)
chr8 (145-554)||(29075334-29075743)
chr8 (132-554)||(15781981-15782403)
chr8 (549-707)||(20375927-20376085)
chr8 (145-554)||(36087116-36087525)
chr8 (145-554)||(251002-251411)
chr8 (145-554)||(814103-814512)
chr8 (85-298)||(18152629-18152842)
chr8 (139-554)||(16745589-16746004)
chr8 (132-554)||(19137861-19138283)
chr8 (68-257)||(20260483-20260672)
chr8 (68-257)||(21047113-21047302)
chr8 (132-554)||(19233959-19234381)
chr8 (145-554)||(44490308-44490717)
chr8 (129-557)||(22148872-22149300)
chr8 (74-557)||(23791755-23792238)
chr8 (130-557)||(45569300-45569728)
chr8 (132-554)||(30315995-30316417)
chr8 (134-554)||(19427505-19427925)
chr8 (234-553)||(24666907-24667226)
chr8 (340-554)||(6159826-6160040)
chr8 (74-117)||(250922-250965)
chr8 (74-117)||(814023-814066)
chr8 (74-117)||(3350351-3350394)
chr8 (74-117)||(9366808-9366851)
chr8 (74-117)||(13690286-13690329)
chr8 (74-117)||(15782427-15782470)
chr8 (74-117)||(16745515-16745558)
chr8 (74-117)||(19137794-19137837)
chr8 (74-117)||(19233892-19233935)
chr8 (74-117)||(19427436-19427479)
chr8 (74-117)||(26119424-26119467)
chr8 (74-117)||(29075254-29075297)
chr8 (74-117)||(30316441-30316484)
chr8 (74-117)||(32079412-32079455)
chr8 (74-117)||(36087036-36087079)
chr8 (74-117)||(44490228-44490271)
chr8 (622-711)||(19427993-19428082)
chr8 (74-117)||(36302040-36302083)
chr8 (644-698)||(24679524-24679578)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (68-711)||(35742-36385)
scaffold0022 (68-711)||(133802-134445)
scaffold0022 (72-711)||(157451-158086)
scaffold0022 (132-554)||(45033-45455)
scaffold0022 (74-113)||(45518-45557)
[»] chr3 (104 HSPs)
chr3 (68-708)||(11188307-11188947)
chr3 (69-707)||(2559507-2560137)
chr3 (68-711)||(18122858-18123500)
chr3 (106-711)||(19886290-19886891)
chr3 (203-711)||(53057925-53058433)
chr3 (69-609)||(14907981-14908518)
chr3 (68-498)||(17244604-17245034)
chr3 (316-711)||(21639401-21639796)
chr3 (343-711)||(11221380-11221747)
chr3 (73-561)||(16029327-16029812)
chr3 (79-561)||(14078671-14079153)
chr3 (466-711)||(14954123-14954368)
chr3 (74-554)||(12288215-12288704)
chr3 (139-557)||(8997183-8997601)
chr3 (132-557)||(10628180-10628605)
chr3 (145-554)||(24669063-24669472)
chr3 (187-671)||(18696140-18696624)
chr3 (132-554)||(13373903-13374325)
chr3 (132-554)||(13384497-13384919)
chr3 (145-554)||(5866931-5867340)
chr3 (74-557)||(9983120-9983612)
chr3 (74-557)||(17016297-17016780)
chr3 (132-554)||(6183201-6183623)
chr3 (145-554)||(505405-505814)
chr3 (145-554)||(5538256-5538665)
chr3 (145-554)||(5580868-5581277)
chr3 (145-554)||(24384753-24385162)
chr3 (145-554)||(39381277-39381686)
chr3 (74-554)||(9381899-9382388)
chr3 (132-554)||(11273620-11274042)
chr3 (132-554)||(20674432-20674854)
chr3 (145-554)||(4752912-4753321)
chr3 (145-554)||(5519461-5519870)
chr3 (145-554)||(14474814-14475223)
chr3 (145-554)||(16392283-16392692)
chr3 (145-554)||(28315473-28315882)
chr3 (145-554)||(38203845-38204254)
chr3 (145-554)||(41692842-41693251)
chr3 (259-463)||(14952685-14952889)
chr3 (78-557)||(12754017-12754496)
chr3 (74-557)||(29934795-29935278)
chr3 (74-557)||(29983949-29984432)
chr3 (132-554)||(6491581-6492003)
chr3 (132-554)||(23766474-23766896)
chr3 (139-554)||(11207330-11207745)
chr3 (146-557)||(15847488-15847899)
chr3 (139-557)||(13262905-13263323)
chr3 (132-554)||(19787602-19788024)
chr3 (145-554)||(8783856-8784265)
chr3 (132-557)||(29462450-29462875)
chr3 (74-434)||(16397375-16397744)
chr3 (74-557)||(12238849-12239342)
chr3 (145-521)||(13130863-13131239)
chr3 (74-557)||(1062657-1063140)
chr3 (139-554)||(1785312-1785727)
chr3 (139-554)||(4432347-4432759)
chr3 (343-711)||(15960540-15960908)
chr3 (132-560)||(37884159-37884587)
chr3 (74-557)||(15652341-15652824)
chr3 (139-557)||(14312644-14313062)
chr3 (132-557)||(7795853-7796278)
chr3 (201-357)||(5211122-5211278)
chr3 (566-698)||(17244474-17244606)
chr3 (132-458)||(37875641-37875967)
chr3 (68-141)||(5211047-5211120)
chr3 (622-711)||(5211276-5211365)
chr3 (220-519)||(16306398-16306697)
chr3 (385-554)||(47541619-47541788)
chr3 (622-711)||(11222413-11222501)
chr3 (74-117)||(505851-505894)
chr3 (74-117)||(4432273-4432316)
chr3 (74-117)||(4752832-4752875)
chr3 (74-117)||(5519381-5519424)
chr3 (74-117)||(5538702-5538745)
chr3 (74-117)||(5581314-5581357)
chr3 (74-117)||(5867377-5867420)
chr3 (74-117)||(6183647-6183690)
chr3 (74-117)||(8783776-8783819)
chr3 (74-117)||(10628629-10628672)
chr3 (74-117)||(11274066-11274109)
chr3 (74-117)||(13130783-13130826)
chr3 (74-117)||(13374349-13374392)
chr3 (74-117)||(13384943-13384986)
chr3 (74-117)||(14474734-14474777)
chr3 (74-117)||(16392729-16392772)
chr3 (74-117)||(19787535-19787578)
chr3 (74-117)||(20674878-20674921)
chr3 (74-117)||(24385199-24385242)
chr3 (74-117)||(24668983-24669026)
chr3 (74-117)||(37875574-37875617)
chr3 (74-117)||(37884092-37884135)
chr3 (74-117)||(38203765-38203808)
chr3 (74-117)||(39381197-39381240)
chr3 (74-117)||(41692762-41692805)
chr3 (557-625)||(16031325-16031393)
chr3 (253-551)||(19658840-19659135)
chr3 (74-117)||(7796302-7796345)
chr3 (74-117)||(8997632-8997675)
chr3 (74-117)||(11207776-11207819)
chr3 (74-117)||(13263354-13263397)
chr3 (74-117)||(23766407-23766450)
chr3 (74-117)||(28315919-28315962)
chr3 (589-671)||(29462336-29462418)
chr3 (480-553)||(19631002-19631075)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (68-711)||(47623-48265)
[»] chr5 (91 HSPs)
chr5 (68-711)||(26763768-26764410)
chr5 (68-710)||(21200204-21200846)
chr5 (297-711)||(31144502-31144917)
chr5 (68-476)||(26782731-26783139)
chr5 (145-554)||(27461520-27461929)
chr5 (132-554)||(16002377-16002799)
chr5 (74-548)||(23486917-23487391)
chr5 (145-554)||(6977164-6977573)
chr5 (145-554)||(14567147-14567556)
chr5 (74-554)||(21704378-21704867)
chr5 (145-554)||(22677474-22677883)
chr5 (145-554)||(23297635-23298044)
chr5 (74-554)||(23393767-23394256)
chr5 (136-557)||(25113253-25113674)
chr5 (136-557)||(25172344-25172765)
chr5 (145-554)||(39499981-39500390)
chr5 (145-554)||(42044138-42044547)
chr5 (132-554)||(31834838-31835260)
chr5 (132-554)||(39353854-39354276)
chr5 (132-554)||(40391716-40392138)
chr5 (145-554)||(9337312-9337721)
chr5 (145-554)||(22147874-22148283)
chr5 (145-554)||(23698138-23698547)
chr5 (145-554)||(30236520-30236929)
chr5 (145-554)||(36591611-36592020)
chr5 (145-554)||(14031400-14031809)
chr5 (145-554)||(15741327-15741736)
chr5 (145-554)||(24568446-24568855)
chr5 (145-554)||(24809274-24809683)
chr5 (74-554)||(24981824-24982313)
chr5 (139-554)||(17455801-17456216)
chr5 (132-554)||(5299623-5300045)
chr5 (145-554)||(24825969-24826378)
chr5 (132-557)||(34773264-34773689)
chr5 (145-554)||(35216861-35217270)
chr5 (145-554)||(37739061-37739470)
chr5 (74-554)||(14456026-14456515)
chr5 (74-557)||(11209350-11209833)
chr5 (132-554)||(31420023-31420445)
chr5 (74-554)||(34053318-34053807)
chr5 (132-554)||(20553173-20553595)
chr5 (132-554)||(27621253-27621675)
chr5 (132-554)||(1120383-1120805)
chr5 (145-554)||(17608420-17608829)
chr5 (145-554)||(17720276-17720685)
chr5 (145-554)||(27051331-27051740)
chr5 (74-554)||(31349892-31350381)
chr5 (145-554)||(36689056-36689465)
chr5 (74-557)||(13532291-13532774)
chr5 (145-671)||(19465213-19465739)
chr5 (511-711)||(26783140-26783340)
chr5 (145-554)||(23363468-23363863)
chr5 (132-458)||(43620375-43620701)
chr5 (74-117)||(1120316-1120359)
chr5 (74-117)||(5299556-5299599)
chr5 (74-117)||(6977610-6977653)
chr5 (74-117)||(9337758-9337801)
chr5 (74-117)||(14031846-14031889)
chr5 (74-117)||(14567067-14567110)
chr5 (74-117)||(15741773-15741816)
chr5 (74-117)||(17455727-17455770)
chr5 (74-117)||(17608866-17608909)
chr5 (74-117)||(17720722-17720765)
chr5 (74-117)||(22148320-22148363)
chr5 (74-117)||(22677920-22677963)
chr5 (74-117)||(23298081-23298124)
chr5 (74-117)||(23363900-23363943)
chr5 (74-117)||(23698584-23698627)
chr5 (74-117)||(24568892-24568935)
chr5 (74-117)||(24809720-24809763)
chr5 (74-117)||(24825889-24825932)
chr5 (74-117)||(27051251-27051294)
chr5 (74-117)||(27461966-27462009)
chr5 (74-117)||(27621186-27621229)
chr5 (74-117)||(30236440-30236483)
chr5 (74-117)||(31420469-31420512)
chr5 (74-117)||(31835284-31835327)
chr5 (74-117)||(34773713-34773756)
chr5 (74-117)||(35217307-35217350)
chr5 (74-117)||(36689502-36689545)
chr5 (74-117)||(37738981-37739024)
chr5 (74-117)||(39499901-39499944)
chr5 (74-117)||(40392162-40392205)
chr5 (74-117)||(42044584-42044627)
chr5 (74-117)||(43620308-43620351)
chr5 (622-711)||(43620865-43620954)
chr5 (74-117)||(16002310-16002353)
chr5 (74-117)||(19465776-19465819)
chr5 (74-117)||(20553619-20553662)
chr5 (74-117)||(36591531-36591574)
chr5 (74-117)||(39354300-39354343)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (70-711)||(14905482-14906123)
chr4 (68-711)||(17245881-17246524)
chr4 (68-517)||(16852219-16852668)
chr4 (83-697)||(10662359-10662973)
chr4 (83-697)||(10876504-10877118)
chr4 (74-557)||(18065102-18065594)
chr4 (74-557)||(14712059-14712542)
chr4 (132-554)||(459757-460179)
chr4 (145-554)||(10741837-10742246)
chr4 (145-554)||(10955606-10956015)
chr4 (145-554)||(24649538-24649947)
chr4 (132-554)||(22005611-22006033)
chr4 (132-554)||(30927732-30928154)
chr4 (145-554)||(18131488-18131897)
chr4 (74-557)||(5021263-5021755)
chr4 (132-554)||(16265059-16265481)
chr4 (132-554)||(17927293-17927715)
chr4 (132-554)||(27665767-27666189)
chr4 (74-554)||(14837347-14837836)
chr4 (145-554)||(36027498-36027907)
chr4 (74-557)||(4989031-4989523)
chr4 (132-554)||(19945577-19945999)
chr4 (74-554)||(16315854-16316343)
chr4 (145-554)||(55746491-55746900)
chr4 (132-554)||(27816185-27816607)
chr4 (74-554)||(18753729-18754218)
chr4 (142-554)||(27175278-27175690)
chr4 (132-554)||(40455599-40456021)
chr4 (145-554)||(49516744-49517153)
chr4 (150-554)||(15195164-15195568)
chr4 (319-557)||(16820594-16820832)
chr4 (385-554)||(3389295-3389464)
chr4 (409-557)||(11470140-11470288)
chr4 (216-296)||(13694716-13694796)
chr4 (439-554)||(14844891-14845006)
chr4 (139-326)||(3380703-3380890)
chr4 (74-117)||(459690-459733)
chr4 (74-117)||(3380629-3380672)
chr4 (74-117)||(10742283-10742326)
chr4 (74-117)||(10956052-10956095)
chr4 (74-117)||(15198489-15198532)
chr4 (74-117)||(16264992-16265035)
chr4 (74-117)||(17927226-17927269)
chr4 (74-117)||(18131934-18131977)
chr4 (74-117)||(19946023-19946066)
chr4 (74-117)||(22005544-22005587)
chr4 (74-117)||(24649458-24649501)
chr4 (74-117)||(27175200-27175243)
chr4 (74-117)||(27665700-27665743)
chr4 (74-117)||(27816631-27816674)
chr4 (74-117)||(30928178-30928221)
chr4 (74-117)||(36027418-36027461)
chr4 (74-117)||(40456045-40456088)
chr4 (74-117)||(49516664-49516707)
chr4 (74-117)||(55746937-55746980)
chr4 (589-671)||(18753612-18753694)
chr4 (622-671)||(19945460-19945509)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (68-711)||(209712-210354)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (68-711)||(110757-111400)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (68-704)||(28702377-28703013)
chr2 (68-711)||(22782775-22783418)
chr2 (234-711)||(24574502-24574979)
chr2 (382-710)||(23185484-23185812)
chr2 (382-710)||(23596747-23597075)
chr2 (190-524)||(21137530-21137864)
chr2 (68-480)||(24723682-24724091)
chr2 (313-711)||(22256753-22257142)
chr2 (187-561)||(10899797-10900171)
chr2 (87-710)||(24842516-24843146)
chr2 (68-316)||(22253907-22254155)
chr2 (145-554)||(11396427-11396836)
chr2 (145-554)||(39171349-39171758)
chr2 (74-554)||(24329004-24329493)
chr2 (132-554)||(9764018-9764440)
chr2 (132-554)||(22916115-22916537)
chr2 (73-698)||(24303210-24303835)
chr2 (232-548)||(25119664-25119978)
chr2 (145-554)||(40249757-40250166)
chr2 (74-557)||(24802903-24803386)
chr2 (132-554)||(24416281-24416703)
chr2 (145-554)||(4219044-4219453)
chr2 (145-554)||(10276135-10276544)
chr2 (145-554)||(27230587-27230996)
chr2 (145-554)||(35262152-35262561)
chr2 (145-554)||(35272777-35273186)
chr2 (132-554)||(34791472-34791894)
chr2 (132-554)||(9898828-9899250)
chr2 (145-554)||(43353578-43353987)
chr2 (74-557)||(19303680-19304163)
chr2 (139-554)||(28722573-28722988)
chr2 (132-554)||(29253355-29253777)
chr2 (132-554)||(43091814-43092236)
chr2 (132-560)||(21163196-21163624)
chr2 (68-230)||(23185824-23185983)
chr2 (68-230)||(23597087-23597246)
chr2 (232-553)||(21919366-21919687)
chr2 (74-401)||(26876036-26876372)
chr2 (74-428)||(19301360-19301714)
chr2 (385-557)||(22773160-22773332)
chr2 (231-398)||(22682400-22682567)
chr2 (431-557)||(26878510-26878636)
chr2 (74-117)||(4218964-4219007)
chr2 (74-117)||(9764464-9764507)
chr2 (74-117)||(9899274-9899317)
chr2 (74-117)||(10276055-10276098)
chr2 (74-117)||(11396873-11396916)
chr2 (74-117)||(21163648-21163691)
chr2 (74-117)||(27230507-27230550)
chr2 (74-117)||(28723019-28723062)
chr2 (74-117)||(29253288-29253331)
chr2 (74-117)||(34791918-34791961)
chr2 (74-117)||(35262072-35262115)
chr2 (74-117)||(35272697-35272740)
chr2 (74-117)||(39171795-39171838)
chr2 (74-117)||(40249677-40249720)
chr2 (74-117)||(43353498-43353541)
chr2 (74-117)||(22916561-22916604)
chr2 (74-117)||(24416727-24416770)
chr2 (74-117)||(43091747-43091790)
chr2 (630-688)||(10899670-10899728)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (68-711)||(26806-27449)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (68-711)||(6978-7616)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (68-711)||(23023175-23023818)
chr1 (73-711)||(21125497-21126144)
chr1 (69-671)||(21195875-21196474)
chr1 (68-711)||(20943069-20943706)
chr1 (73-605)||(21207057-21207593)
chr1 (68-499)||(25449611-25450043)
chr1 (237-564)||(22431253-22431580)
chr1 (68-334)||(18613474-18613740)
chr1 (132-554)||(12739650-12740072)
chr1 (145-554)||(51630469-51630878)
chr1 (183-560)||(9345200-9345574)
chr1 (132-554)||(35639315-35639738)
chr1 (145-554)||(12615600-12616009)
chr1 (145-554)||(36237707-36238116)
chr1 (68-277)||(17720182-17720388)
chr1 (132-554)||(4176424-4176846)
chr1 (132-554)||(19186327-19186749)
chr1 (145-554)||(3180736-3181145)
chr1 (145-554)||(5842339-5842748)
chr1 (74-557)||(22017627-22018111)
chr1 (74-554)||(47609213-47609702)
chr1 (74-554)||(38104140-38104629)
chr1 (132-554)||(21876270-21876692)
chr1 (145-554)||(7516409-7516828)
chr1 (68-241)||(22444931-22445104)
chr1 (68-241)||(22450165-22450338)
chr1 (74-557)||(20874499-20874986)
chr1 (186-554)||(5640987-5641355)
chr1 (186-554)||(38093635-38094003)
chr1 (132-457)||(7690845-7691170)
chr1 (220-551)||(22958547-22958878)
chr1 (343-553)||(27857370-27857580)
chr1 (74-117)||(3180656-3180699)
chr1 (74-117)||(5641440-5641483)
chr1 (74-117)||(5842259-5842302)
chr1 (74-117)||(7516329-7516372)
chr1 (74-117)||(7691194-7691237)
chr1 (74-117)||(12616046-12616089)
chr1 (74-117)||(21876203-21876246)
chr1 (74-117)||(35639762-35639805)
chr1 (74-117)||(36238153-36238196)
chr1 (74-117)||(51630915-51630958)
chr1 (74-117)||(4176357-4176400)
chr1 (74-117)||(19186260-19186303)
chr1 (132-174)||(5641374-5641416)
chr1 (75-117)||(12739584-12739626)
chr1 (622-711)||(7690589-7690678)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (68-707)||(26940710-26941351)
chr6 (68-698)||(17926092-17926722)
chr6 (73-369)||(19450385-19450678)
chr6 (73-369)||(19448391-19448684)
chr6 (132-557)||(27502838-27503263)
chr6 (132-557)||(28252810-28253235)
chr6 (82-557)||(17062705-17063180)
chr6 (132-554)||(25984611-25985033)
chr6 (145-554)||(12864078-12864487)
chr6 (478-711)||(18434230-18434462)
chr6 (74-557)||(27383204-27383696)
chr6 (74-557)||(27473588-27474080)
chr6 (74-557)||(17609836-17610319)
chr6 (132-554)||(9113738-9114160)
chr6 (132-554)||(26873936-26874358)
chr6 (132-554)||(32963191-32963613)
chr6 (145-554)||(3670591-3671000)
chr6 (145-554)||(26034567-26034976)
chr6 (508-711)||(14054576-14054779)
chr6 (187-562)||(17446991-17447366)
chr6 (74-557)||(22307269-22307752)
chr6 (74-557)||(22385084-22385567)
chr6 (132-554)||(34808407-34808829)
chr6 (74-557)||(26042662-26043155)
chr6 (132-554)||(12718081-12718503)
chr6 (366-592)||(19469216-19469441)
chr6 (132-458)||(28331658-28331984)
chr6 (145-554)||(16958155-16958564)
chr6 (139-554)||(25804209-25804624)
chr6 (145-554)||(27411632-27412041)
chr6 (145-554)||(32302291-32302700)
chr6 (74-557)||(11204439-11204923)
chr6 (132-554)||(20031166-20031588)
chr6 (145-458)||(27350892-27351205)
chr6 (76-557)||(18553768-18554248)
chr6 (74-411)||(14054782-14055119)
chr6 (340-562)||(19874455-19874669)
chr6 (415-557)||(25725744-25725886)
chr6 (623-707)||(19469475-19469559)
chr6 (74-177)||(17056529-17056632)
chr6 (74-117)||(3670511-3670554)
chr6 (74-117)||(12863998-12864041)
chr6 (74-117)||(16958075-16958118)
chr6 (74-117)||(20031612-20031655)
chr6 (74-177)||(25723358-25723461)
chr6 (74-117)||(25984544-25984587)
chr6 (74-117)||(26034487-26034530)
chr6 (74-117)||(26873869-26873912)
chr6 (74-117)||(27350812-27350855)
chr6 (74-117)||(27411552-27411595)
chr6 (74-117)||(28253259-28253302)
chr6 (74-117)||(28332008-28332051)
chr6 (74-117)||(32302737-32302780)
chr6 (74-117)||(32963637-32963680)
chr6 (74-117)||(34808853-34808896)
chr6 (389-671)||(6156933-6157215)
chr6 (232-372)||(13137912-13138052)
chr6 (74-117)||(12718527-12718570)
chr6 (74-117)||(27502771-27502814)
chr6 (629-698)||(17446857-17446926)
chr6 (622-711)||(20031009-20031098)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (68-708)||(6966-7603)
scaffold0047 (74-554)||(34181-34670)
scaffold0047 (439-554)||(41726-41841)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (68-710)||(1349-1991)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (385-711)||(42983-43309)
scaffold0083 (68-260)||(43324-43516)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (368-711)||(17669-18014)
scaffold0217 (188-309)||(17546-17667)
scaffold0217 (68-130)||(14580-14642)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (388-711)||(11243-11565)
scaffold0317 (68-275)||(2545-2752)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (244-707)||(22098-22561)
scaffold0116 (68-247)||(25711-25889)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (283-711)||(1724-2144)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (402-711)||(6880-7189)
scaffold0359 (69-362)||(7191-7484)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (368-708)||(66577-66917)
scaffold0011 (76-328)||(66921-67173)
scaffold0011 (74-557)||(165977-166460)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (400-711)||(7859-8170)
scaffold0439 (400-709)||(1-310)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (398-707)||(98728-99037)
[»] scaffold0161 (4 HSPs)
scaffold0161 (68-500)||(11438-11870)
scaffold0161 (68-500)||(16111-16543)
scaffold0161 (538-711)||(11266-11439)
scaffold0161 (538-711)||(15939-16112)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (74-698)||(75576-76194)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (136-557)||(3-424)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (74-554)||(9043-9532)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (74-557)||(655-1138)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (74-557)||(3796-4279)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (74-554)||(2568-3049)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (145-554)||(38233-38642)
scaffold0105 (74-117)||(38679-38722)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (74-554)||(23737-24226)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (74-557)||(44462-44945)
scaffold0017 (74-557)||(54765-55248)
scaffold0017 (349-559)||(9448-9659)
scaffold0017 (625-698)||(9725-9798)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (70-277)||(12264-12468)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (186-557)||(53010-53381)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (235-523)||(2320-2609)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (74-504)||(31600-32030)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (226-557)||(821-1150)
scaffold0211 (65-364)||(1158-1457)
[»] scaffold0925 (1 HSPs)
scaffold0925 (74-461)||(3598-3985)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (220-551)||(2811-3142)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (74-169)||(3840-3935)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (74-284)||(3057-3267)
scaffold0012 (352-547)||(11615-11810)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (232-523)||(3058-3349)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (622-711)||(19810-19899)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (231-551)||(190317-190637)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (76-170)||(20161-20255)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (431-560)||(6728-6857)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (74-177)||(62-165)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 13878448 - 13879091
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878448 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 13878547  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13878548 tttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagatgacaagttcttcaacacttaatgtgtttaaatctttagct 13878647  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  13878648 tcctcaatagtagtcaccattggtctccatcttgcaagtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaggcttcatagcttttcttcagtatttgaa 13878747  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  13878748 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatacagatgaacaagcataagagcttt 13878847  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13878848 tgtttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagccaacattgacttagcagtagatttttcactcatcttcatatactctgcttta 13878947  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  13878948 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtaaaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacaacaactccttctt 13879047  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  13879048 catcaacgaccaagccacctatatcatcttctagcatgtcccat 13879091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 16311829 - 16311191
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16311829 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgaattccctttagatggtagagcaataga 16311730  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16311729 tttactcttcttagtaggctcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagaattgac-agatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 16311631  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16311630 tcctcaatggcagtaacctttggtctccatcttgcaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttgaa 16311531  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16311530 gtctagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttaatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagattt 16311431  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16311430 tgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagatagaagcaaatattgccttagcagtatatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 16311331  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16311330 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgtttccttctatcaacagcagctccttctt 16311231  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16311230 catcaacgaccaagttaccaataccatcttctagtatgtc 16311191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 13028761 - 13028135
Alignment:
Q  85 gaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaag 184  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||    
T  13028761 gaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagtgcaatagatttactcttcctagcag 13028662  T
Q  185 attcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcac 284  Q
      ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||    
T  13028661 gctcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcgatagcagtaac 13028562  T
Q  285 ctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtc 384  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||| || |||    
T  13028561 cttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcctgctcacatgatcagaggctacatagctcttattcagtatttgaagtccagaaactagagtc 13028462  T
Q  385 tgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttct 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  13028461 tgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaacccatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctctaattttct 13028362  T
Q  485 tattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaag 584  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13028361 tactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaag 13028262  T
Q  585 tgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtca 684  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13028261 tgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacaacagctccttcttcatcaacgaccaagtca 13028162  T
Q  685 ccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13028161 ccaataccatctactagtatgtcccat 13028135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 707
Target Start/End: Original strand, 13680652 - 13681285
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13680652 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatgga 13680751  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13680752 tttaatcttcctagaaggttcatgttcattaagacatatctcgtgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatatttagct 13680851  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||      || ||||||||||||||||||||| ||    
T  13680852 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggcaagcttcttagtatcctgctcacatgat------cagcatagcttttcttcagtatttgaa 13680945  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13680946 gtccagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaataactcatactgatgaacaagcataagagcttt 13681045  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  13681046 tgcttctcttactttcttactacctttatagtttgcacagagagaagcaaacattgacttagtagtagatttttcactcatctttatgtactctacttta 13681145  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
     ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||| | | ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13681146 cgtatagctttgtcaagtgctcctatgattttgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctatcaacagcagctccttctt 13681245  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13681246 catcaatgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtc 13681285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 657
Target Start/End: Original strand, 14171969 - 14172558
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14171969 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagactcaacaactttaagaacttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 14172068  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14172069 tttactcttcttagacgattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaagtgttaaaatctttagct 14172168  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14172169 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatctagcaggtaagcttttaagtatctttctcacatgatcataggctacatagcttttcttcagtatttgaa 14172268  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||| | |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  14172269 gtctagaaactagagtctgaaattttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatcttgaacaactcatactgatgaacgagcataagagcttt 14172368  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14172369 tgcttctctgaccttcttaatgccttcatagttatcacaaagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatattatgcttta 14172468  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagca 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14172469 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaagagtatgttttcttctatcaatagca 14172558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 4413827 - 4413175
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttc---------cctttagatggtag 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| || || || |  |||||||| |||||          || |||||||| ||    
T  4413827 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtaattcttcttcagattccacgaccttcaatgcttttgaagactttgaagactttcccttagatggaag 4413728  T
Q  159 agcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaa 258  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4413727 agcaatggatttgcttttcttgacagattcatgttcattgagactaatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaa 4413628  T
Q  259 tctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttca 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||     
T  4413627 tctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctggcaggtaggcttctgagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcg 4413528  T
Q  359 gtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4413527 gtatttgaagtccagaaaccagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatattttcatcatctttcattttgaacaactcatactaatgaacaagcat 4413428  T
Q  459 aagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatac 558  Q
    || || |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4413427 aaaagcttttgcttctctgactttcttgttgccttcgtagttagcacagagagaagcaaacatagatttagcagtggatttgtcactcatcttcatatac 4413328  T
Q  559 tctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcag 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  4413327 tctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatctcttttgatcaggagtatgcttcctcctatcaatagcag 4413228  T
Q  659 ctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4413227 ctccttcttcatcaacaaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 4413175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16547842 - 16547368
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16547842 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 16547743  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||  || ||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16547742 ctttttggaaggttcatgtccattaagacttagctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 16547643  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  16547642 atagcagtcacctttagtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccag 16547543  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16547542 aaacttgagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttc 16547443  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcat 548  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||||||||||    
T  16547442 tctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagaaaacattgatttagcaatgaatttgtcactcat 16547368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 548
Target Start/End: Original strand, 16617820 - 16618294
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16617820 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 16617919  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||  || ||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16617920 ctttttggaaggttcatgtccattaagacttagctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 16618019  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  16618020 atagcagtcacctttagtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccag 16618119  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16618120 aaacttgagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttc 16618219  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcat 548  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||||||||||    
T  16618220 tctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagaaaacattgatttagcaatgaatttgtcactcat 16618294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 68 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 13174065 - 13173572
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13174065 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagattgtagagcaataga 13173966  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
     ||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13173965 gttactcttcttagcaggctcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 13173866  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  13173865 tcctcaataacagtaaccttaggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaa 13173766  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||     
T  13173765 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaaaaactcatacagatgaacaagcttaagagcttc 13173666  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactct 561  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13173665 tgcttctatgactttcttactaccttcatagtttacacagagagaagcaaacattgccttaacagtagatttgtcactcatcttcatatactct 13173572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 214 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 21212287 - 21211790
Alignment:
Q  214 actttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttc 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||  |||    
T  21212287 actttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcatcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaaacttc 21212188  T
Q  314 ttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatact 413  Q
    |||||||||| ||||  |||| | | || |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21212187 ttagtatcttactcacttgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatact 21212088  T
Q  414 ttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21212087 ttcatcatctttcattttgaacaactcacactgatgaacatgcataagagtttttgcttctctaactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaa 21211988  T
Q  514 gcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttga 613  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||     
T  21211987 gcaaacaatgccttaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttttggtatagctttgacaaatgctcctctcatcgtgtgatgcttcttgt 21211888  T
Q  614 agaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  21211887 agagtttattctaagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaattcaccaacaccatcttcaagtatgtcccat 21211790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 298 - 707
Target Start/End: Original strand, 15466298 - 15466707
Alignment:
Q  298 cttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagt 397  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  15466298 cttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcttttctttagtatttgaagtccataaattagagtctgaaatcttgagt 15466397  T
Q  398 acatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcata 497  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15466398 acatgtgctaaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctctggctttcttactaccttcata 15466497  T
Q  498 gtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggatt 597  Q
    ||| |||||  ||||||||| | |  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15466498 gttagcacaaggagaagcaagcttgtacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactatgctttaggtatagctttgacaagtgctcctatgatt 15466597  T
Q  598 gtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttctt 697  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  15466598 gtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgaacaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatatt 15466697  T
Q  698 ctagtatgtc 707  Q
    ||||||||||    
T  15466698 ctagtatgtc 15466707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 2707354 - 2706932
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  2707354 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 2707255  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  2707254 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 2707155  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  2707154 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 2707055  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  2707054 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 2706955  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2706954 gtagatttgtcactcatcttcat 2706932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 4221170 - 4221592
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  4221170 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 4221269  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| || | ||    
T  4221270 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttcttaaaatcttactaacat 4221369  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  4221370 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 4221469  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  4221470 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 4221569  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  4221570 gtagatttgtcactcattttcat 4221592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6868971 - 6868549
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  6868971 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 6868872  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  6868871 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 6868772  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  6868771 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 6868672  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  6868671 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgttgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 6868572  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6868571 gtagatttgtcactcatcttcat 6868549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 251 - 553
Target Start/End: Original strand, 16408287 - 16408589
Alignment:
Q  251 tgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagct 350  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||| |    
T  16408287 tgtttaaatccctagcttcctcaaaagtagtaaccttaggtcaccatctagcaggtaagcttctcagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagat 16408386  T
Q  351 tttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatga 450  Q
    |||||| | ||||| ||||||| | || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  16408387 tttctttaatatttaaagtccagagactaaagtctaaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcatcttgaacaactcatattgatga 16408486  T
Q  451 acaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatct 550  Q
    |||||||||  || |||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |    
T  16408487 acaagcatagtaggttttgcttctttaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctttgcagtagatttgtcactcatat 16408586  T
Q  551 tca 553  Q
    |||    
T  16408587 tca 16408589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26391822 - 26391413
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  26391822 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 26391723  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  26391722 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 26391623  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  26391622 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 26391523  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  26391522 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 26391423  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  26391422 tcattttcat 26391413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 458727 - 458305
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  458727 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcgatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 458628  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  458627 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 458528  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  458527 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 458428  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  458427 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 458328  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  458327 gtagatttgtcactcatcttcat 458305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 22098303 - 22098725
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  22098303 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 22098402  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  22098403 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 22098502  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  22098503 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 22098602  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  22098603 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 22098702  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22098703 gtagatttgtcactcattttcat 22098725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 176065 - 176474
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  176065 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 176164  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  176165 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 176264  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  176265 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 176364  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  176365 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 176464  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  176465 tcattttcat 176474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 8626520 - 8626929
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  8626520 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 8626619  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  8626620 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 8626719  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  8626720 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 8626819  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  8626820 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 8626919  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  8626920 tcattttcat 8626929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 11003754 - 11004163
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  11003754 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 11003853  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  11003854 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 11003953  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  11003954 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 11004053  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  11004054 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 11004153  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  11004154 tcattttcat 11004163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 1996731 - 1997140
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  1996731 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 1996830  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  1996831 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 1996930  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  1996931 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 1997030  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  1997031 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 1997130  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  1997131 tcattttcat 1997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 11014363 - 11014772
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  11014363 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 11014462  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  11014463 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 11014562  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  11014563 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 11014662  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  11014663 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 11014762  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  11014763 tcattttcat 11014772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 24743276 - 24743685
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  24743276 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 24743375  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  24743376 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 24743475  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  24743476 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 24743575  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24743576 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 24743675  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24743676 tcattttcat 24743685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40043832 - 40043423
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  40043832 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 40043733  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  40043732 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 40043633  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  40043632 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 40043533  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  40043532 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 40043433  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  40043432 tcattttcat 40043423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 18439699 - 18440182
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||  | | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  18439699 gatcttcattagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 18439798  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18439799 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgataagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 18439898  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| |  |||| | | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  18439899 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcagtccag 18439998  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  18439999 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctatatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 18440098  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18440099 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 18440182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 9442425 - 9442847
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  9442425 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 9442524  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  9442525 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 9442624  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  9442625 gatcagaagcaacatagcttttcttcaatatttgcagtccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 9442724  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  9442725 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 9442824  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9442825 gtagatttgtcactcatcttcat 9442847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8003794 - 8003385
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  8003794 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 8003695  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  8003694 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 8003595  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  8003594 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 8003495  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  8003494 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 8003395  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  8003394 tcattttcat 8003385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 9093562 - 9093971
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  9093562 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 9093661  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  9093662 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 9093761  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  9093762 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 9093861  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  9093862 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 9093961  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  9093962 tcattttcat 9093971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 9168676 - 9169165
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9168676 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagatcaat 9168775  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  9168776 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcctta 9168875  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | | |  |||||||| |||||||||||||    
T  9168876 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtattt 9168975  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||  | || |  || |||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  9168976 gcagtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 9169075  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9169076 ctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 9169165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17951842 - 17951433
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  17951842 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 17951743  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  17951742 ttaaagtatttagatccttagctttctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 17951643  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  17951642 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 17951543  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  17951542 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgcctttaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 17951443  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  17951442 tcattttcat 17951433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 42875023 - 42875432
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  42875023 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 42875122  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  42875123 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 42875222  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  42875223 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 42875322  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| | ||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  42875323 tgatgaactaacatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 42875422  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  42875423 tcattttcat 42875432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 20988219 - 20988641
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  20988219 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 20988318  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  20988319 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 20988418  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  20988419 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 20988518  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||    
T  20988519 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgca 20988618  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20988619 gtagatttgtcactcatcttcat 20988641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26655064 - 26654655
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  26655064 cctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 26654965  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||  || | ||||| | | | |||    
T  26654964 ttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatctaactaacatgatcagaagaaac 26654865  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  26654864 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 26654765  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  26654764 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 26654665  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  26654664 tcattttcat 26654655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 541 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 16546718 - 16546551
Alignment:
Q  541 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgct 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||| |    
T  16546718 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttcttgtagaatatcttctgagcagaagtatgtt 16546619  T
Q  641 ttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcc 708  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16546618 ttcttctatcaataacagctccttcttcatcaacgacaaggtcaccaataccatctcctagtatgtcc 16546551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 541 - 708
Target Start/End: Original strand, 16618944 - 16619111
Alignment:
Q  541 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgct 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||| |    
T  16618944 tcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttcttgtagaatatcttctgagcagaagtatgtt 16619043  T
Q  641 ttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcc 708  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16619044 ttcttctatcaataacagctccttcttcatcaacgacaaggtcaccaataccatctcctagtatgtcc 16619111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15879563 - 15879237
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  15879563 ttttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 15879464  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  15879463 agatcttcaacacttaaaatgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 15879364  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  15879363 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 15879264  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
    ||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  15879263 gaaaagttcatactgatgaactagcat 15879237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16669999 - 16669775
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16669999 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggcagagcaataga 16669900  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcat---cc------------actttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtg 252  Q
    |||  ||||| |   ||  ||||||||||| |||||||||||||   ||            || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16669899 tttgttcttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcataaaccttgagagagttgaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtg 16669800  T
Q  253 tttaaatctttagcttcctcaatag 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  16669799 tttaaatctttaacttcctcaatag 16669775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17644367 - 17644143
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17644367 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggcagagcaataga 17644268  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcat---cc------------actttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtg 252  Q
    |||  ||||| |   ||  ||||||||||| |||||||||||||   ||            || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17644267 tttgttcttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcataaaccttgagagagttgaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtg 17644168  T
Q  253 tttaaatctttagcttcctcaatag 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  17644167 tttaaatctttaacttcctcaatag 17644143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16309435 - 16309094
Alignment:
Q  182 aagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagt 281  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||  || || |||||||| |  ||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16309435 aagattcatgttcatttagaccaatctcatgaaccttgagagagcttataagatcctcaacagttagagtttttaaatccttagcttcctcaatagcagt 16309336  T
Q  282 cacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagg 381  Q
     || || ||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| | | || |||||  ||||||| ||||| | ||||||| | || ||     
T  16309335 aactttaggtctccatctaggatgtaagcttcttagaatcttgttcacatgattagaagctacatattttttctttagtatctgaagtccagagactaga 16309236  T
Q  382 gtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcat-aagagtttttgcttctcttact 480  Q
    |||| ||| ||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    || |||||||||| | |||    
T  16309235 gtctaaaaccttaagtacatagcctcaatgctttcatcatctttcatcttgaacaattcatactgatgaacaagcgtggttagcttttgcttctatgact 16309136  T
Q  481 ttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacatt 522  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  16309135 ttcttgttaccttgataatttgcgcacaaggaagcaaacatt 16309094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 13173573 - 13173472
Alignment:
Q  606 cttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatg 705  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13173573 cttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacaacagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatg 13173474  T
Q  706 tc 707  Q
    ||    
T  13173473 tc 13173472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16106705 - 16106384
Alignment:
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| | | |  |||| | ||||||||| |  ||| ||    
T  16106705 agatcttcaacacttagagtgtttaaatcattagcttcctcaattgcattcaccttaggtctccatttagcatataagctccttagtatccttttcacat 16106606  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | || ||||| ||||||||||| || | ||||||| | || || |||||||| | |||||||||   ||||||    ||||| || |||||  |    
T  16106605 gatcagaagctacataacttttcttcagaatctgaagtccagagactagagtctgaaaccatgagtacatagtctcaatgtcctcatcctccttcatcct 16106506  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||| |  ||| |||||| |   ||||||    
T  16106505 gaacaactcatactgatgaacaagcatagtagctttggcttctatgaatttcttgttaccttcatagtttgaacacaaggaaacaaacactactttaaca 16106406  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttca 553  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  16106405 gttgatttatcactcatcttca 16106384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13176291 - 13176067
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  13176291 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagattgtagagcaatagatctact 13176192  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| | ||| || ||||  ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13176191 cttctttgaggattcatgctcattcaaactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaa-gtgtttagatccttagcttcctca 13176093  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatct 299  Q
    || | |||||| || ||||| |||||    
T  13176092 atggcagtcactttaggtcttcatct 13176067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 609 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 15705808 - 15705711
Alignment:
Q  609 cttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgt 706  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705808 cttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttttcctatcaatagctgctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgt 15705711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6879336 - 6879191
Alignment:
Q  409 atactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacaga 508  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || ||||| || |||||| |||||||||| |    
T  6879336 atactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgttgccttcaaagtttgcacata 6879237  T
Q  509 gagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6879236 gagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 6879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 657 - 711
Target Start/End: Original strand, 14186585 - 14186639
Alignment:
Q  657 agctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14186585 agctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatattctagtatgtcccat 14186639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 454
Target Start/End: Original strand, 15087410 - 15087641
Alignment:
Q  220 agagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagta 319  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| |||   ||  | | ||||||| | ||||| |    
T  15087410 agagagcttatgagatcttcaagactgagagtgtttagatctctaacttcctcaatagctgtcaccttaggt---cacttagcaggtaagctccttagaa 15087506  T
Q  320 tcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatc 419  Q
    ||||  ||| ||||| ||   | |||||||||||||| || |||| ||||||| | || || |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||     
T  15087507 tcttcttcacatgatcaacaactacatagcttttctttagaatttgaagtccagagactagagtctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatt 15087606  T
Q  420 atctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaa 454  Q
     ||||||||  ||||||  ||||  ||||||||||    
T  15087607 ctctttcatcatgaacatttcatattgatgaacaa 15087641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 175985 - 176028
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  175985 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 176028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 458794 - 458751
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  458794 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 458751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 1996651 - 1996694
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1996651 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 1996694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2707421 - 2707378
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2707421 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 2707378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 4221103 - 4221146
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4221103 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4221146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6869038 - 6868995
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6869038 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 6868995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8003874 - 8003831
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8003874 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 8003831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 8626440 - 8626483
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8626440 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 8626483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 9093482 - 9093525
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9093482 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9093525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 9442358 - 9442401
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9442358 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9442401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 11003674 - 11003717
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11003674 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 11003717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 11014283 - 11014326
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11014283 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 11014326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15879630 - 15879587
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15879630 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 15879587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17951922 - 17951879
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17951922 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17951879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 20988152 - 20988195
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20988152 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 20988195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 22098236 - 22098279
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22098236 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22098279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 24743196 - 24743239
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24743196 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24743239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26391902 - 26391859
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26391902 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26655144 - 26655101
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26655144 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26655101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40043912 - 40043869
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40043912 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 40043869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 42874943 - 42874986
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42874943 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 42874986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 644 - 710
Target Start/End: Original strand, 16408690 - 16408756
Alignment:
Q  644 ttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  16408690 ttctatcaacatcaactctttcttaatcaaggaccaagtcaccaacaccatcttcaagtatgtccca 16408756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 707
Target Start/End: Original strand, 27870599 - 27870652
Alignment:
Q  654 agcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27870599 agcatctccttcttcatcaacaaccaagtcattaataccatcttctagtatgtc 27870652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 711
Target Start/End: Original strand, 17014868 - 17015510
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17014868 agtaggatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatgatagagcaatagat 17014967  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17014968 ttactcttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagctt 17015067  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    |||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||    
T  17015068 cctcaatagcgttcatctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaaag 17015167  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  17015168 tccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactaatactgatgaacaagcataaaagctttt 17015267  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17015268 gcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacattgacttagcattagatttgtcactcatctttatatactctgctttag 17015367  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttc 668  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | | ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17015368 gtataactttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttctcgtaaagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctatcaacggcagctccttcttc 17015467  T
Q  669 atcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17015468 atcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 17015510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 17542333 - 17541691
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17542333 agtaggatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatgatagagcaatagat 17542234  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17542233 ttactcttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagctt 17542134  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    |||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||    
T  17542133 cctcaatagcgttcatctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaaag 17542034  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  17542033 tccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactaatactgatgaacaagcataaaagctttt 17541934  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17541933 gcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacattgacttagcattagatttgtcactcatctttatatactctgctttag 17541834  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttc 668  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | | ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17541833 gtataactttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttctcgtaaagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctatcaacggcagctccttcttc 17541734  T
Q  669 atcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17541733 atcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 17541691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 17288001 - 17287364
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17288001 gatcttcatcaggatcttcatcgggtgattcttcttcatattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 17287902  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287901 ctttttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 17287802  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  17287801 atagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttaaagttcag 17287702  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17287701 aaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcatcagagcttttgcttc 17287602  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtata 573  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287601 tttgactttcttactaccttcatagttagcacaaagagaaggaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtata 17287502  T
Q  574 gctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaa 673  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17287501 gctttgacaggtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagaagctccttcttcatcaa 17287402  T
Q  674 tgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17287401 cgactaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 17287364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20257409 - 20256776
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||    
T  20257409 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagtttttgatgaattccctttagatggtatatcaataga 20257310  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20257309 tttactcttcttaccagactcatgttcattaagacttatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 20257210  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| | | || ||| | |||||||||||||||| ||    
T  20257209 tcctcaatagcagtcacctttagtctccatcttgcaggaaagcttcttagtatctttctcacatgatcagaagctacacaacttttcttcagtatttgaa 20257110  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||| | |||| |  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||          |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  20257109 gtctagaaactaaagtctgaaatcatgagtacattttcacaatactttcat----------tttgaacaactcatactgataatcaagcataagagcttt 20257020  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20257019 tgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgacttagtagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 20256920  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |  || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20256919 ggtatagctttgacaggtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaaggttcttctgagtaggagtatgttttcttctatcaacaacagctccttctt 20256820  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20256819 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 20256776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 574
Target Start/End: Original strand, 15976648 - 15977153
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15976648 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatgtat 15976747  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15976748 ttactcttcctagaaggtttatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagctt 15976847  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15976848 cctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttgaag 15976947  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
    |||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  15976948 tccataaactagagtatgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaaccataagagctttt 15977047  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15977048 gcttctcttactttcttactaccttcacagtttgcacagggagaagcaatcattgacttagtagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttttg 15977147  T
Q  569 gtatag 574  Q
    ||||||    
T  15977148 gtatag 15977153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 69 - 711
Target Start/End: Original strand, 22672095 - 22672719
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  22672095 agtaggatcttcatcaaaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatggat 22672194  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    || || ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22672195 ttgcttttcttggaagattcatgttcattaatacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaagtgtttaaatctttagctt 22672294  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||| |||||||| |||||| |||    
T  22672295 cctcaatagcagtcacctttggtctccatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagattttcttcggtatttaaag 22672394  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
     ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||             
T  22672395 cccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatatttcattttaaacagctcatactgatgaacaagcata--------- 22672485  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
               ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||   ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672486 -----------tttcttactgcctacatagttagcacagagagaagcaaacgttggtctagtagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 22672574  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgc--tttcttctatcaacagcagctccttct 666  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22672575 gtatagctttgacaagtactcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttttctcctatcaatggcagctccttct 22672674  T
Q  667 tcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22672675 tcgtcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 22672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 19941536 - 19942179
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19941536 cagtaggatcttcatcagagtctccatcaggtgactcttcttcaaatttaataactttaagagattttgatgacttcccttttgatggtagagcaataga 19941635  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||  |   |   ||||||||||| |||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19941636 tttactcttgttagcatgctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgaaagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 19941735  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||| | ||||| | | |||||||| || || ||||||||||  |    
T  19941736 tcctcaatagtagtaaccttagatctccatctagcaggcaagctccttagtatcttgctaacatgatcagaagcaacataactctttttcagtatttgta 19941835  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19941836 gtccagagactagggtttgaaaccttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaataagcataagagcttt 19941935  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||   || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19941936 tgctatcctgactttcttgatgccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacattgccttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactatgcttta 19942035  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    |||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| || ||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  19942036 ggtatagtagtgacaagtgctcctctgatagtatgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtgtgtttctttctatcaatagcatctccttctt 19942135  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  19942136 catcaaggaccaagttaccaacaccctcttcaagtatgtcccat 19942179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 187 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22463184 - 22462660
Alignment:
Q  187 tcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacct 286  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22463184 tcatgttcatttaggcttatctcatgaaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagagtttaaatttttagcttcctcaatagcagtaacct 22463085  T
Q  287 ttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctg 386  Q
    |  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | | || ||||||||||||||||||| || ||||||| | |  || || ||    
T  22463084 taagtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttggtcacatgatcagatgctacatagcttttcttcagtacttgaagtccagatagtagagtttg 22462985  T
Q  387 aaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctta 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||     
T  22462984 aaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatcttgaataactcatactgatgaacaagcataagaacttttgcttctctgactttcttg 22462885  T
Q  487 ttaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtg 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  22462884 ctaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattacctttgtagtagatttgtcactcattttcatatactctgctttaggtatagcagtaacaagtg 22462785  T
Q  587 ctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcacc 686  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22462784 atcctttgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttttgagcaggagtatgtttcctcctatcaatagcagctccttcttcatcaaggaccaagtcacc 22462685  T
Q  687 aataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    || ||| ||||| || || ||||||    
T  22462684 aacaccatcttcaagaatatcccat 22462660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 25164576 - 25164911
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25164576 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagatcaataga 25164675  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||||||||   | | || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |    
T  25164676 tttactctctttaacaggttcatgttcattaagacttatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttcagcacttaaaatgtttaaatctttagtt 25164775  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| ||    
T  25164776 ttctcaatagcagtaacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaaactacatagcttttcttcagtatttaaa 25164875  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacattt 403  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25164876 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattt 25164911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 68 - 370
Target Start/End: Original strand, 19940403 - 19940705
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19940403 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgga 19940502  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||| || ||| |    || ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19940503 tttgcttttcttagtcgactcatgttcattaagactaatctcatgaactttgagaacgctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagct 19940602  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  19940603 tcctcaatatcagtcacctttggtctccatctaacaggtaagcttctgagtatcttgctcacatgattagaagctacatagcttttcttcagtatttgaa 19940702  T
Q  368 gtc 370  Q
    |||    
T  19940703 gtc 19940705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21603942 - 21603717
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21603942 cagtagaatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataga 21603843  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21603842 tttactcttcttagcagactcatgttcattaagacttatctcatggactttgagagagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 21603743  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtct 293  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  21603742 tcctcaatagcagtaaccttaggtct 21603717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 503 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 24834569 - 24834361
Alignment:
Q  503 cacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtg 602  Q
    |||||||||| |||||||| || |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24834569 cacagagagaggcaaacatagacttagtagtggatttatcactcatcttcatatactcttctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtg 24834470  T
Q  603 atgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagt 702  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24834469 atgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctttcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagt 24834370  T
Q  703 atgtcccat 711  Q
    |||||||||    
T  24834369 atgtcccat 24834361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 21297246 - 21297729
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21297246 gatcttgatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatttatt 21297345  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| || || || ||||  || || || || || || |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21297346 cttccttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactaacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 21297445  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  21297446 atggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 21297545  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  21297546 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcataagtgcttttgcttc 21297645  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21297646 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcatagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 21297729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3350314 - 3349905
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  3350314 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 3350215  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  3350214 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 3350115  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  3350114 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 3350015  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  3350014 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 3349915  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  3349914 tcattttcat 3349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 9366888 - 9367297
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  9366888 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 9366987  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  9366988 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 9367087  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  9367088 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 9367187  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  9367188 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 9367287  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  9367288 tcattttcat 9367297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 36302120 - 36302529
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  36302120 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 36302219  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  36302220 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 36302319  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  36302320 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 36302419  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  36302420 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 36302519  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  36302520 tcattttcat 36302529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 29085505 - 29085994
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta-ag--------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||  ||        || |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  29085505 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 29085604  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  29085605 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 29085704  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29085705 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 29085804  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  29085805 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 29085904  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29085905 tttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 29085994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32079375 - 32078966
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  32079375 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 32079276  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  32079275 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 32079176  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  32079175 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 32079076  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  32079075 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 32078976  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  32078975 tcattttcat 32078966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 3842052 - 3842535
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  3842052 gatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 3842151  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3842152 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 3842251  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  3842252 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 3842351  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  3842352 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 3842451  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3842452 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 3842535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13690262 - 13689840
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  13690262 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 13690163  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||    
T  13690162 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacat 13690063  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  13690062 gatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 13689963  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  13689962 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 13689863  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  13689862 gtagatttgtcactcattttcat 13689840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 26119491 - 26119913
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  26119491 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 26119590  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  26119591 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 26119690  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  26119691 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 26119790  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  26119791 gaaaatttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 26119890  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26119891 gtagatttgtcactcatcttcat 26119913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 29075334 - 29075743
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  29075334 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 29075433  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    || |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  29075434 ttcaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 29075533  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  29075534 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 29075633  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  29075634 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 29075733  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  29075734 tcattttcat 29075743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 15782403 - 15781981
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagatt-catgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgac 230  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||    
T  15782403 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttctt-agagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaac 15782305  T
Q  231 gagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcata 330  Q
     |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | |    
T  15782304 aagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaaca 15782205  T
Q  331 tgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattt 430  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||     
T  15782204 tgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattc 15782105  T
Q  431 tgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaac 530  Q
    |||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |    
T  15782104 tgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgc 15782005  T
Q  531 agtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15782004 agtagatttgtcactcatcttcat 15781981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 549 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 20376085 - 20375927
Alignment:
Q  549 cttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttcta 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  20376085 cttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtatagttttttctgagcaggagtatgttttcttcta 20375986  T
Q  649 tcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20375985 tcaacaacagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtc 20375927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 36087116 - 36087525
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  36087116 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 36087215  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  36087216 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 36087315  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  36087316 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 36087415  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| | ||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  36087416 tgatgaactaacatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 36087515  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  36087516 tcattttcat 36087525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 251002 - 251411
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | | |||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  251002 cctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggttccatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 251101  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  251102 ttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 251201  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  251202 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 251301  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  251302 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 251401  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  251402 tcattttcat 251411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 814103 - 814512
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | | |||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  814103 cctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggttccatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 814202  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  814203 ttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 814302  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  814303 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 814402  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  814403 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 814502  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  814503 tcattttcat 814512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18152842 - 18152629
Alignment:
Q  85 gaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaag 184  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||| || |||    
T  18152842 gaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatggatttgcttttcttggaag 18152743  T
Q  185 attcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcac 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18152742 attcatgttcattaagacttatctcatgaaatttgagagagctcaccagatcctcaacacttagagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 18152643  T
Q  285 ctttggtctccatc 298  Q
    ||||||||||||||    
T  18152642 ctttggtctccatc 18152629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Original strand, 16745589 - 16746004
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||    
T  16745589 gactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 16745688  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | |    
T  16745689 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcaga 16745788  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  16745789 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccaaatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagc 16745888  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||  | ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  16745889 tcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtaatttacacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 16745988  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  16745989 tatcactcatcttcat 16746004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 19137861 - 19138283
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  19137861 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 19137960  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  19137961 agatcttcaacacttaacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 19138060  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  19138061 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 19138160  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | ||  ||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  19138161 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccatcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 19138260  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19138261 gtagatttgtcactcatcttcat 19138283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20260672 - 20260483
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20260672 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaaaaactttaagagctttagatgacttccctttagatggtagagcaatagg 20260573  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaa 257  Q
    |||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||  || || ||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  20260572 tttactcttcttagcaggttcatgttcattaagacttatctcatgaacgttgagatagttgacaagatcttcaacacttaaagtgcttaa 20260483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21047302 - 21047113
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21047302 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaaaaactttaagagctttagatgacttccctttagatggtagagcaatagg 21047203  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaa 257  Q
    |||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||  || || ||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  21047202 tttactcttcttagcaggttcatgttcattaagacttatctcatgaacgttgagatagttgacaagatcttcaacacttaaagtgcttaa 21047113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 19233959 - 19234381
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  19233959 ttttgatgactttcctttagatggtaaagcaatggatctactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 19234058  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  19234059 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 19234158  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  19234159 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 19234258  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| |  ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||    
T  19234259 gaaaagttcatactgatgaactagcattaaagctttagtctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgaagcaaacatagccttcgca 19234358  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  19234359 gtggatttgtcactcatcttcat 19234381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 44490308 - 44490717
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  44490308 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 44490407  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  44490408 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 44490507  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  44490508 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 44490607  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  44490608 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 44490707  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  44490708 tcatcttcat 44490717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22149300 - 22148872
Alignment:
Q  129 agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctg 228  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || |||    
T  22149300 agctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatatattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactg 22149201  T
Q  229 acgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctca 328  Q
    || |||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| |    
T  22149200 acaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttccacaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctta 22149101  T
Q  329 tatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcat 428  Q
     ||||| | | |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  22149100 catgatcagaagcaacataactcttctttagtatttccagtccagacactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcat 22149001  T
Q  429 tttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaatta 528  Q
     ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  |||    
T  22149000 cttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgcctta 22148901  T
Q  529 acagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||    
T  22148900 gccgtggatttatcactcatcttcatata 22148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 23791755 - 23792238
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   ||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23791755 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagcattggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 23791854  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23791855 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcctcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 23791954  T
Q  274 at-agtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    || |  ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||| ||    
T  23791955 atgacaagt-actttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtaca 23792053  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     | || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  |||||||    
T  23792054 gatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcctttgctt 23792153  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    || | || |||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  23792154 ctttaaccttcttgctaccttcatagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 23792238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 45569728 - 45569300
Alignment:
Q  130 gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctga 229  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  | || ||||| ||||| || || || ||||  || || || || ||||    
T  45569728 gctttagatggctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactga 45569629  T
Q  230 cgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcat 329  Q
    | | |||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||      
T  45569628 caaaatcttcaacactcaatgtgtttagatccttagcttcttcaatggcagtaaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcgc 45569529  T
Q  330 atgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatt 429  Q
    ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||     
T  45569528 atgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatc 45569429  T
Q  430 ttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaa 529  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| | |  |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||     
T  45569428 ttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgcttctttaatcttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttag 45569329  T
Q  530 cagtaga-tttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  45569328 cagtggattttttcactcattttcatata 45569300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30316417 - 30315995
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | ||||||  |||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  30316417 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgcacatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 30316318  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  30316317 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 30316218  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  30316217 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 30316118  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| |||||   || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || ||||||||||| |  ||  ||    
T  30316117 gaaaagttcatactgatgaactagcatccaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgaagcaaacatagccttcgca 30316018  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30316017 gtagatttgtcactcatcttcat 30315995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 554
Target Start/End: Original strand, 19427505 - 19427925
Alignment:
Q  134 ttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgag 233  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || || ||    
T  19427505 ttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaag 19427604  T
Q  234 atcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatga 333  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| || | ||||    
T  19427605 atcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatga 19427704  T
Q  334 taaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttga 433  Q
    | | | |||||||| ||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||    
T  19427705 tcagaagcaacatatcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctga 19427804  T
Q  434 acaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagt 533  Q
    | |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| || || || || |||||||| |  ||  ||||    
T  19427805 aaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagctttcgcagt 19427904  T
Q  534 agatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19427905 ggatttgtcactcatcttcat 19427925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 553
Target Start/End: Original strand, 24666907 - 24667226
Alignment:
Q  234 atcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatga 333  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||    
T  24666907 atcttcaacacttagagtatttagatttttagcttcctcaatagatgtcaccttaggtctccacatagtaggtaagctccttagaatcttgttcaaatga 24667006  T
Q  334 taaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttga 433  Q
    | |   || ||||||||||||||||| || | || || ||| || ||  |||||||  ||||||||||   ||||||   |||||| |||||| ||||||    
T  24667007 ttaggagctacatagcttttcttcagaatctgaactcgaaagactagattctgaaacgttgagtacatagtctcaatgtcttcatcctctttccttttga 24667106  T
Q  434 acaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagt 533  Q
    | || ||||  |||||||| | ||||| || ||| |||| | | |||||||| || |||||||||||||  || | ||||||||||||||  ||| ||||    
T  24667107 aaaattcatattgatgaaccaacataatagctttagcttttttgactttcttgttgccttcatagtttgagcacaaagaagcaaacattgttttagcagt 24667206  T
Q  534 agatttgtcactcatcttca 553  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24667207 agatttatcactcatcttca 24667226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 340 - 554
Target Start/End: Original strand, 6159826 - 6160040
Alignment:
Q  340 gcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |    
T  6159826 gcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagtt 6159925  T
Q  440 catgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagattt 539  Q
    ||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||    
T  6159926 catactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagattt 6160025  T
Q  540 gtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||| |||||    
T  6160026 gtcactcattttcat 6160040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 250922 - 250965
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  250922 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 250965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 814023 - 814066
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  814023 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 814066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3350394 - 3350351
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3350394 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3350351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 9366808 - 9366851
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9366808 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9366851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13690329 - 13690286
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13690329 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13690286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15782470 - 15782427
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15782470 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 15782427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 16745515 - 16745558
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16745515 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16745558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 19137794 - 19137837
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19137794 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19137837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 19233892 - 19233935
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19233892 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19233935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 19427436 - 19427479
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19427436 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19427479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 26119424 - 26119467
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26119424 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26119467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 29075254 - 29075297
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29075254 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 29075297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30316484 - 30316441
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30316484 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 30316441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32079455 - 32079412
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32079455 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 32079412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 36087036 - 36087079
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36087036 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36087079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 44490228 - 44490271
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44490228 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 44490271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Original strand, 19427993 - 19428082
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |   |||||||| |||  || ||||| ||||||||||||    
T  19427993 ttctgagcaggagtatgtattcttctgtccacagcagctccttcttcatctaaatccaagtcatcaactccatcttccagtatgtcccat 19428082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 36302040 - 36302083
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  36302040 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttgttcagattca 36302083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24679578 - 24679524
Alignment:
Q  644 ttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||    
T  24679578 ttctatcaatagcagctccttcttcatcaagggccaagtcagcaacaccatcttc 24679524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 35742 - 36385
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35742 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttatatggtagagcaatgga 35841  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35842 tttactcttccaagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactctgagagagttgagtagatcttcaaaacttaaagtgtttaaatctttagct 35941  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  35942 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctcagtatcttgctcacaagatcagaggctgcatagcttttcttcagtatttgaa 36041  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  36042 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaaaaagcataagagcttt 36141  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36142 tgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgactaagtagttgatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 36241  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36242 ggtataactttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttgttgtagaatttcttctgagcagaagtatgttttcttcaatcaacaacagctccttctt 36341  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36342 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 36385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 133802 - 134445
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  133802 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttatatggtagagcaatgga 133901  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  133902 tttactcttccaagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactctgagagagttgagtagatcttcaaaacttaaagtgtttaaatctttagct 134001  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  134002 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctcagtatcttgctcacaagatcagaggctgcatagcttttcttcagtatttgaa 134101  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  134102 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaaaaagcataagagcttt 134201  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134202 tgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgactaagtagttgatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 134301  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  134302 ggtataactttgacaagtgctcatctgattgtgtgatgcttgttgtagaatttcttctgagcagaagtatgttttcttcaatcaacaacagctccttctt 134401  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  134402 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 134445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 711
Target Start/End: Original strand, 157451 - 158086
Alignment:
Q  72 aggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggattta 171  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  157451 aggaccttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---tttaaaagtttttgatgacttccctttagatggtagagcaattgattta 157547  T
Q  172 ctcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcct 271  Q
    |||||| |   ||  ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  157548 ctcttcttagcaggctcatgttcatttagatttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcct 157647  T
Q  272 caatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcc 371  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  157648 caatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcaaaagctacatagcttttctttagtatttcaagtcc 157747  T
Q  372 aaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgct 471  Q
    | |||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  157748 agaaactagagtgtgaaatcttgagtacatttcctcgatactttcattatctttcattttgaaaaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgct 157847  T
Q  472 tctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggta 571  Q
    ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  157848 tctctgactttctcgctaccttcatagtttgcacagagagaagcaaaccttg-cctagtagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggta 157946  T
Q  572 tagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  157947 tagcattgacaagtgctcctctgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttatgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttcatc 158046  T
Q  672 aatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  158047 aaggaccaagtcaccaacaccatcttcaagtatgtcccat 158086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 45455 - 45033
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  45455 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 45356  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  || || || | ||    
T  45355 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatgttactaacat 45256  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  45255 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 45156  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||    
T  45155 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgca 45056  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45055 gtagatttgtcactcatcttcat 45033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 45557 - 45518
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45557 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaga 45518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 104)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 708
Target Start/End: Original strand, 11188307 - 11188947
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11188307 cagtaggatcttcttcagaatcttcatcatgtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgaa 11188406  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  11188407 tttactcttcttagaaggttcatattcattaaaacttatctcataaactttgagagagctatcaagatcttcaacatttgaagtgtttaaatctttagct 11188506  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |     
T  11188507 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttaaaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgat 11188606  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11188607 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagaggttt 11188706  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11188707 tgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 11188806  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11188807 ggtatagctttcacaagttctcctctgattgtgtgatgtttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaataacagctccttctt 11188906  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcc 708  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11188907 catcaaggaccaagtcaccaatatcatcttctagtatgtcc 11188947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 707
Target Start/End: Original strand, 2559507 - 2560137
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2559507 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagtttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgaat 2559606  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2559607 ttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagttgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcattagctt 2559706  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  2559707 cctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttaaag 2559806  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
    |       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2559807 t-------ccagagtatgaaatcttgagtgcatttgctcaatac-ttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctttt 2559898  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2559899 gtttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 2559998  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||| || || |||| ||||||||||||| | || |||||| |||    
T  2559999 gtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgttgctttttgtagaatttcttatgagcaagaatatgttttcttctatcaataacatctccttattc 2560098  T
Q  669 atcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2560099 atcaacgactaagtcaccaataccatcttctagtatgtc 2560137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 18123500 - 18122858
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18123500 cagtaggatcttcatcagaatctccatcagatgattcttcttcagattcaataactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaataga 18123401  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18123400 tttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagttaacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 18123301  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||    
T  18123300 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcagatgatcagagactacataacttttcttcagtatttgaa 18123201  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18123200 gtccagaaactagagtttgaaatctttagtacatttgctcaatattttcatcgtctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttt 18123101  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18123100 tgcttctctgactttcttactaccttcacagttagcacaaagaaacgcaaacattgacatagcagtggatttgtcactcatcttcatacactcttcttta 18123001  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  18123000 ggtattgctttgactagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaa-ttcttctgagcaggaatatgttttcttctatcaatagcaaatccttctt 18122902  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18122901 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 18122858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 19886891 - 19886290
Alignment:
Q  106 tcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagactta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |   | | |||||||||||||||||||    
T  19886891 tcttaagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat--atttactcttcttagcatactcatgttcattaagactta 19886794  T
Q  206 tctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtagg 305  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||    
T  19886793 tctcatgaactttgagagagctgacaatatcttcaacacttgaagtgtttaaatctctaggttcctcaatagcagtaaccttcggtcgccgtcttgcagg 19886694  T
Q  306 taagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  19886693 taagtttcttagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttgaagtccaaaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgc 19886594  T
Q  406 tcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcac 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  19886593 tcaatactttcttcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttttggttctctaactttcttactaccttcatagtttgcat 19886494  T
Q  506 agagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatg 605  Q
    |||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||  ||    ||||||||||    
T  19886493 agagagaagcaaacatttccttagcaatagatttgtcactcatcttcatatactgtgctttagctataactttgacaa--gcatcttcatttgtgtgatg 19886396  T
Q  606 cttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatg 705  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19886395 cttcttgtagagtttcttctgatcaggaatatcttttcttctatcaacaacagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccatcttctagtatg 19886296  T
Q  706 tcccat 711  Q
    ||||||    
T  19886295 tcccat 19886290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 203 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 53058433 - 53057925
Alignment:
Q  203 ttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgt 302  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  53058433 ttatctcatgaactttgagagagctgacaagattttcaacactcaaagtttttaaatctttagcttcctcaatagcagttacctttggtctccatcttgc 53058334  T
Q  303 aggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatt 402  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  53058333 aggtaagcttctaagtatcttactcacatgatcagaggctacataacttttcttcagtatttgaagtccaaaaactagagtctgaaatctttagtacatt 53058234  T
Q  403 tgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  53058233 tgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaataagcataagagtttttgcttctctgactttcttactaccttcatagttag 53058134  T
Q  503 cacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtg 602  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53058133 cacagagagaggcagacattgacttaacagtggatttgttactcatcttcatatactcttctttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtg 53058034  T
Q  603 atgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagt 702  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  53058033 atgcttcttgtagaatttcttctgagcagaagtatgttttctcctatcaatagcagttccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagt 53057934  T
Q  703 atgtcccat 711  Q
    |||||||||    
T  53057933 atgtcccat 53057925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 69 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 14908518 - 14907981
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14908518 agtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaaca---ttaagagcttttgaagacttccctttagatggtagagcaattgat 14908422  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    ||||||||| |   ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14908421 ttactcttcttagcagaatcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttaaaatctttagctt 14908322  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  14908321 cctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttaagtatttgaag 14908222  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
    |||| |||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  14908221 tccagaaactagagtatgaaatcttgagtacatttcctcaatacttccatcatctttcattttgaacaactcacactgatgaacaagcataagagctttt 14908122  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14908121 gcttctttgactttcttgctaccttcatagtttgcacagatagaagcaaacatttccttagcattagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 14908022  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttc 609  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  14908021 gtatagctttgacaagtgatcctctgatcgtgtgatgcttc 14907981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 68 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17245034 - 17244604
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  17245034 cagtaggatcttcatcagaatctccattaggtgattcttctttagattcaacaactttaagagtttttgatgacttccctttagatggtagaacaataaa 17244935  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17244934 tttactcttcttagcaggctcatgttcattaagacttatctcatgaacttttagagagcttacaagatcttcaacacgtaaagtgtttaaatctttagct 17244835  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17244834 tcctcaataacagtaacctttgttctccatcttgcaggtaagcttcttactatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttgaa 17244735  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17244734 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttaattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttt 17244635  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatag 498  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17244634 tgcttctctgactttcttactaccttcatag 17244604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 316 - 711
Target Start/End: Original strand, 21639401 - 21639796
Alignment:
Q  316 agtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatacttt 415  Q
    ||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639401 agtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatacttt 21639500  T
Q  416 catcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagc 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21639501 catcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcctttgcttctctgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagc 21639600  T
Q  516 aaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaag 615  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  21639601 aaacattgatctagtagtagatttgtcactcatctttatatactatgctttaggtataactttgacaagtgctcctttgattatgtgatgcttcttgtag 21639700  T
Q  616 aatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21639701 agtttcttctgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctcattcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 21639796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 343 - 711
Target Start/End: Original strand, 11221380 - 11221747
Alignment:
Q  343 acatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcat 442  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11221380 acatagtttttctttagtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcat 11221479  T
Q  443 gctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtc 542  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  11221480 actgatgaacaagtataagagcttttgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcatagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtc 11221579  T
Q  543 actcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgcttt 642  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  11221580 attcatcttcatatactctgctttaggtatagctttaacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgtttt 11221679  T
Q  643 cttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  11221680 cttctatcaatagtagctccttcttcattaacgaccaagttacc-ataccatcttgtagtatatcccat 11221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 561
Target Start/End: Original strand, 16029327 - 16029812
Alignment:
Q  73 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16029327 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagattcaataactttaagcgcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 16029426  T
Q  173 tcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
    ||||| |   || |||||||||||| ||||||| |||||  |  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16029427 tcttcttagcaggttcatgttcatttagacttacctcatgaatcttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcatc 16029526  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| | | | ||| ||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||| | ||||||||||  |||| |    
T  16029527 aatagcagtaaccttaggtctccatctagcatgcaagcttcttagtatcttcctcacatgatcagaagcaacatagcttattttcagtatttgtagtcta 16029626  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     | || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||    
T  16029627 gagactaaggtttgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatca---ttcatcttcaacaactcatactgatgaacaagcacgagagcctttgctt 16029723  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactct 561  Q
    |||| | |||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16029724 ctctgaatttcttgttgccttcatagtatacacatagagaagcaaacattgccttagcattagatttgtcactcatcttcatatactct 16029812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 79 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 14079153 - 14078671
Alignment:
Q  79 tcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcc 178  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||  |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  14079153 tcatcagagtctccatctgggaattcttctttagactcaatgactttgagagcttttgagaactttcctttagatggtagagcaatagatttagtcttct 14079054  T
Q  179 tgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagt 278  Q
    |   ||| ||||| ||||||||||| |||| ||  || || |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14079053 tagcagaatcatgctcattaagactaatcttatgaaccttgagagagctcataagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaataac 14078954  T
Q  279 agtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaacc 378  Q
    ||| ||  | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  14078953 agtaactgtaggtctccatctagaaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttgaagtccaaagact 14078854  T
Q  379 agggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctctta 478  Q
    || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| ||||| |    
T  14078853 agagtttgaaatcttgagtacattacctcaatactttcatcttctttcatcttgaacaactcatactaatgaacaagcatgatagcgtttgcctctctaa 14078754  T
Q  479 ctttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactct 561  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14078753 ccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctatgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactct 14078671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 466 - 711
Target Start/End: Original strand, 14954123 - 14954368
Alignment:
Q  466 tttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctt 565  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954123 tttgcttctctgactttcttactactttcatagttagcacagagagaagcaaacattgacctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctt 14954222  T
Q  566 taggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14954223 taggtatagctttgacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttttagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaataggagctccttc 14954322  T
Q  666 ttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14954323 ttcatcaacaaccaagtcatcaataccatcttctagtatatcccat 14954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12288704 - 12288215
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta--------aga-gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||        ||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12288704 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 12288605  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| || || | ||| || |||| |||||| || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||    
T  12288604 ggatttactcttcttagaggattcatgctcgtttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatcctta 12288505  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12288504 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 12288405  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  12288404 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 12288305  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  12288304 tttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 12288215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 139 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 8997601 - 8997183
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  | |||||||| ||||||||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||    
T  8997601 gactttcctttagatggtagagcaatagatttattcttcttagaggattcatgctcattaagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 8997502  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | |    
T  8997501 caacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcaga 8997402  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     ||||||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  8997401 agcaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctgctctatactctcatcatccttcattttgaacagc 8997302  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| |  |  ||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  8997301 tcatactgatgaactagcattaatgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 8997202  T
Q  539 tgtcactcatcttcatata 557  Q
    | |||||||||||||||||    
T  8997201 tatcactcatcttcatata 8997183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 10628605 - 10628180
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  10628605 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 10628506  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  10628505 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacat 10628406  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  10628405 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattct 10628306  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||||||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  10628305 gaatagttcatactgatgaacaagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgca 10628206  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10628205 gtagatttgtcactcatcttcatata 10628180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 24669063 - 24669472
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  24669063 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 24669162  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  24669163 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 24669262  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  24669263 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 24669362  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24669363 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgttgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 24669462  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24669463 tcattttcat 24669472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 18696624 - 18696140
Alignment:
Q  187 tcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacct 286  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||||| | || || ||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |    
T  18696624 tcatgctcattaaaactaatctcatgaaccttgagagagcttatgaaatattcaacactcagagtgtttaaattcttagcttcctcaatagtagtaactt 18696525  T
Q  287 ttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctg 386  Q
    |  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| | | || ||||  |||||||||||||||| ||||||| | || |  |||||    
T  18696524 taagtctccatctagtaggtaagcttcttagaatcttgcttacatgatcagaagctacatcacttttcttcagtatttgaagtccatagactaaagtctg 18696425  T
Q  387 aaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctta 486  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||| || |||||     
T  18696424 aaatcttgagtacatagcctcaattctttcatcatctttcatcttaaacaactcatactgatgaacaagcattgtagcttttgcttctctgaccttcttg 18696325  T
Q  487 ttaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtg 586  Q
     ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||  | ||| | |||    |||||      
T  18696324 ctaccttcatagtttgcacaaagtgaagtaaacattgctttagcattagatttttcactcatctttagatactctgtgtgaggcaaagcagcaacaagaa 18696225  T
Q  587 ctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
     ||||| |||  ||||||| |||||| | || ||  ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18696224 ttcctctgatcttgtgatgtttcttgtacaactttgtctgagcaggactatgcttctttctatcaatagcagctccttcttcatc 18696140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13374325 - 13373903
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  13374325 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 13374226  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||  |||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  13374225 agatcttcaacacttaaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgagggtaagcttctcaaaatcttactaacat 13374126  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  13374125 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 13374026  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  13374025 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 13373926  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13373925 gtagatttgtcactcatcttcat 13373903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13384919 - 13384497
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  13384919 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 13384820  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||  |||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  13384819 agatcttcaacacttaaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgagggtaagcttctcaaaatcttactaacat 13384720  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  13384719 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 13384620  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  13384619 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 13384520  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13384519 gtagatttgtcactcatcttcat 13384497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5867340 - 5866931
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  5867340 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 5867241  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  5867240 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 5867141  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  5867140 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 5867041  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  5867040 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 5866941  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  5866940 tcattttcat 5866931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 9983612 - 9983120
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta--------aga-gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||        ||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9983612 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 9983513  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  9983512 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcatta 9983413  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  9983412 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 9983313  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  9983312 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagc 9983213  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9983212 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatata 9983120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 17016297 - 17016780
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17016297 gatcttcatcagaatctccatctggtgaatcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctact 17016396  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| | || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17016397 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgaactctgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctca 17016496  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  |||| ||||| ||||| | | |||||||| || ||||||| || ||  ||||||     
T  17016497 atggcagtcactttaggtctccatctagaaggaaagcttctcaaaatctagctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcaatagttgcagtccag 17016596  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  17016597 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgaatttgcttc 17016696  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| || | ||||| |||||||| ||||||||    
T  17016697 tttaaccttcttgctaccttcatagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagcaatggatttatcactcattttcatata 17016780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6183623 - 6183201
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  6183623 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 6183524  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  6183523 agatcttcaacacttaaagtatttaaatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 6183424  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  6183423 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 6183324  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  6183323 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 6183224  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6183223 gtagatttgtcactcatcttcat 6183201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 505814 - 505405
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  505814 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttaagtgagctaacaagatcttcaacac 505715  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  505714 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 505615  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  505614 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 505515  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  505514 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 505415  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  505414 tcattttcat 505405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5538665 - 5538256
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  5538665 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 5538566  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  5538565 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 5538466  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  5538465 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 5538366  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  5538365 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 5538266  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  5538265 tcattttcat 5538256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5581277 - 5580868
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  5581277 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 5581178  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  5581177 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 5581078  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  5581077 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatatcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 5580978  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  5580977 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 5580878  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  5580877 tcattttcat 5580868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24385162 - 24384753
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||| | ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  24385162 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcaagctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 24385063  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  24385062 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 24384963  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  24384962 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 24384863  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24384862 tgatgaactagcatcaaagatttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 24384763  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24384762 tcattttcat 24384753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 39381277 - 39381686
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  39381277 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 39381376  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  39381377 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 39381476  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  39381477 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 39381576  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  39381577 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 39381676  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  39381677 tcattttcat 39381686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9382388 - 9381899
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca--------acaa-ctttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||        | || |||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9382388 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttagaagatttggaggacttccctttagatggtagagcaat 9382289  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  9382288 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgaggaaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 9382189  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | | |  |||||||| |||||||||||||    
T  9382188 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtattt 9382089  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  9382088 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 9381989  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     |||||||||||  | |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  9381988 ctttgcttctctggccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcagtcatcttcat 9381899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11274042 - 11273620
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  11274042 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 11273943  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||    
T  11273942 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacat 11273843  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  11273842 gatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 11273743  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  11273742 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 11273643  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  11273642 gtagatttgtcactcattttcat 11273620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 20674854 - 20674432
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  20674854 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 20674755  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  20674754 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 20674655  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  20674654 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 20674555  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  20674554 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 20674455  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  20674454 gtagatttgtcactcattttcat 20674432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 4752912 - 4753321
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  4752912 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 4753011  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  4753012 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 4753111  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  4753112 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 4753211  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  4753212 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 4753311  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  4753312 tcattttcat 4753321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 5519461 - 5519870
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  5519461 cctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 5519560  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  5519561 ttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 5519660  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  5519661 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 5519760  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  5519761 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcacagtagatttgtcac 5519860  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  5519861 tcattttcat 5519870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 14474814 - 14475223
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  14474814 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 14474913  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  14474914 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 14475013  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| | |||| |||| |  |||| |    
T  14475014 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatcctccattctgaaaagttcatac 14475113  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14475114 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 14475213  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  14475214 tcattttcat 14475223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16392692 - 16392283
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  16392692 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 16392593  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  16392592 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 16392493  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  16392492 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 16392393  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    | |||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  16392392 taatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 16392293  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  16392292 tcattttcat 16392283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28315882 - 28315473
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  28315882 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 28315783  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  28315782 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 28315683  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  28315682 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 28315583  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  28315582 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 28315483  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  28315482 tcattttcat 28315473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 38203845 - 38204254
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  38203845 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 38203944  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  38203945 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 38204044  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  38204045 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 38204144  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  38204145 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 38204244  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  38204245 tcattttcat 38204254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 41692842 - 41693251
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  41692842 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 41692941  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  41692942 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 41693041  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  41693042 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 41693141  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  41693142 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 41693241  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  41693242 tcattttcat 41693251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 463
Target Start/End: Original strand, 14952685 - 14952889
Alignment:
Q  259 tctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttca 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||| || | |||||||||||| |    
T  14952685 tctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatctaacaggtaagcttctaagtatcttgttcacatgatcaaaagctaaatagcttttcttta 14952784  T
Q  359 gtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
     ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14952785 atatttaaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaatagctcatactgatgaacaagcat 14952884  T
Q  459 aagag 463  Q
    |||||    
T  14952885 aagag 14952889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 12754496 - 12754017
Alignment:
Q  78 ttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttc 177  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12754496 ttcatcagaatctccttctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttc 12754397  T
Q  178 ctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatag 277  Q
     |  | || ||||| ||||| || || || ||||  || || || ||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  12754396 tttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaattgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatgg 12754297  T
Q  278 tagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaac 377  Q
     |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||| ||||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  |||||| | ||    
T  12754296 cagtcactttaggtctccatctagaaggaaagcttctcaatatctggctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatac 12754197  T
Q  378 cagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctctt 477  Q
     |  || ||||||||| ||||||| |  || ||||| ||| |||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |     
T  12754196 taaagtttgaaatcttaagtacatctcttctatactctcaccatccttcatcttgaatagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgcttcttta 12754097  T
Q  478 actttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12754096 accttcttgctaccttcatagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcatcttcatata 12754017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 29935278 - 29934795
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  29935278 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 29935179  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29935178 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 29935079  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  29935078 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 29934979  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | ||    || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  29934978 atactcaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 29934879  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29934878 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 29934795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 29984432 - 29983949
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  29984432 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 29984333  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29984332 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 29984233  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  29984232 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 29984133  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | ||    || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  29984132 atactcaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttcaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 29984033  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29984032 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 29983949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6492003 - 6491581
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  6492003 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 6491904  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  6491903 agatcctcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 6491804  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  6491803 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattct 6491704  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  6491703 gaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgca 6491604  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6491603 gtagatttgtcactcatcttcat 6491581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 23766474 - 23766896
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  23766474 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcgatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 23766573  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  23766574 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 23766673  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  23766674 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 23766773  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  23766774 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagttttcacatagagaagcaaacatagccttcgca 23766873  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  23766874 gtagatttgtcactcattttcat 23766896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11207745 - 11207330
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  11207745 gactttcctttagatggtagaacaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatctt 11207646  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | |    
T  11207645 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgattaga 11207546  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     |  |||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  11207545 agtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagc 11207446  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||| | ||||| || | |||||||||||| || |||||  | ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  11207445 tcatactgatgacctagcattagggcttttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttgccacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 11207346  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  11207345 tatcactcatcttcat 11207330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 557
Target Start/End: Original strand, 15847488 - 15847899
Alignment:
Q  146 ctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagact 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||    | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || || || |||||||||| |||    
T  15847488 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctatgaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaacttacaagatcttcaacact 15847587  T
Q  246 taaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaaca 345  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | ||| ||  |||| |  |||||||||| ||||| | | ||||||    
T  15847588 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaaacttctcaaaatcttgctcacatgatcagaagcaaca 15847687  T
Q  346 tagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgct 445  Q
    || || |||||||||||||  | |||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  15847688 taactcttcttcagtatttgcattccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatact 15847787  T
Q  446 gatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcact 545  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||    
T  15847788 gatgaactagcataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcact 15847887  T
Q  546 catcttcatata 557  Q
    ||| ||||||||    
T  15847888 cattttcatata 15847899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13263323 - 13262905
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || ||  |||| |||||||    
T  13263323 gactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggatttgacaagatctt 13263224  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | |    
T  13263223 caacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcaga 13263124  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| ||||| |||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  13263123 agtaacatagctcttctttagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagc 13263024  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  13263023 tcatactgatgaactagcattagagcctttacttctctaaccttctttcttccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 13262924  T
Q  539 tgtcactcatcttcatata 557  Q
    | |||||||||||||||||    
T  13262923 tatcactcatcttcatata 13262905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 19787602 - 19788024
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  19787602 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 19787701  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  19787702 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 19787801  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  19787802 gatcagaaacaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 19787901  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| || || | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  19787902 gaaaagttcatactgatgaactagtatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 19788001  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19788002 gtagatttgtcactcatcttcat 19788024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 8783856 - 8784265
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  8783856 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 8783955  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  8783956 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 8784055  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  8784056 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 8784155  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| | ||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  8784156 tgatgaactaacatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 8784255  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  8784256 tcattttcat 8784265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 29462875 - 29462450
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  29462875 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 29462776  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||| | || | ||    
T  29462775 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcatactaacat 29462676  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| || || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  29462675 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 29462576  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  29462575 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgacgcaaacatagcctttgca 29462476  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29462475 gtagatttgtcactcatcttcatata 29462450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16397744 - 16397375
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaaca---------actttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||            ||||||  || |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  16397744 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtagactttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 16397645  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  16397644 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 16397545  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| || |||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  16397544 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaagttaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 16397445  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaa 434  Q
      | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  16397444 gcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaa 16397375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 12239342 - 12238849
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta--------aga-gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||        ||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12239342 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcatcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 12239243  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || ||||  ||||| ||  |||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  12239242 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatatactttgagtaagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 12239143  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  12239142 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttattcagtattt 12239043  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  12239042 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagc 12238943  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtaga-tttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12238942 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgtagtagattttgtcactcatcttcatata 12238849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 521
Target Start/End: Original strand, 13130863 - 13131239
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  13130863 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 13130962  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  13130963 ttaaagtatttagatccttagcttccttaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 13131062  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  13131063 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 13131162  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacat 521  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  13131163 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcagacat 13131239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 1062657 - 1063140
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  1062657 gatcttcatcagattctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 1062756  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| | ||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  1062757 cttcttagaggattcatgctcattcatactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttcctca 1062856  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| |  |||| | | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  1062857 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcagtccag 1062956  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  1062957 atactaaagtttgaaatcttaagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 1063056  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1063057 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagtagtggatttatcactcatcttcatata 1063140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1785727 - 1785312
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||    
T  1785727 gactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 1785628  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | |    
T  1785627 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcaga 1785528  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  1785527 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagc 1785428  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  | | |||| ||||    
T  1785427 tcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattgcctgagcagtggatt 1785328  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  1785327 tatcactcatcttcat 1785312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Original strand, 4432347 - 4432759
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||    
T  4432347 gactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 4432446  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||| |||| || || ||||| | ||||| | |    
T  4432447 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttctcagaattttgctaacatgatcaga 4432546  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  4432547 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacat---ctctatactctcatcatccttcatcttgaacagc 4432643  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  4432644 tcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctaactttcttgcttccttcgtagtaggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 4432743  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  4432744 tatcactcatcttcat 4432759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 15960908 - 15960540
Alignment:
Q  343 acatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcat 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| | |  || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15960908 acatagcttttcttcaatatttgaattccagagaatagagtctgaaatgttgagtacatatcctcaatactttcatcatatttcatcttaaacaactcat 15960809  T
Q  443 gctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtc 542  Q
      |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  |||| | ||||||    
T  15960808 attgatgaacaagcataataacttttgcttctctaaccttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctttgcagtgggtttgtc 15960709  T
Q  543 actcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgcttt 642  Q
    ||| |||||||| |||||||   |||||||||     |||||   ||||| |||  ||||||| |||||| | |  || || ||| |||||| ||||||     
T  15960708 actaatcttcatgtactctgtgctaggtatagaagcaacaaggattcctctgatcttgtgatgtttcttgtaaagcttcttatgaccaggagaatgcttc 15960609  T
Q  643 cttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||    
T  15960608 tttctatcaataacagctccttcttcatcaagggccaagtcaccaacaccatcttcaagaatatcccat 15960540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 560
Target Start/End: Original strand, 37884159 - 37884587
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| | |||| || ||||| ||     
T  37884159 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgccctttgagtgagctaaca 37884258  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||  |||| |  ||||| || | ||    
T  37884259 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggcaaacttctcaaaatcttactaacat 37884358  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||||| |    
T  37884359 gatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcccatcatccttcattct 37884458  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| |||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  37884459 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 37884558  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatatactc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37884559 gtagatttgtcactcatcttcatgtactc 37884587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15652824 - 15652341
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| |  ||||||||||||  | | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  15652824 gatcttcatcaggatctccatttggtgactcttcttcagattcactagccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 15652725  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15652724 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgataagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 15652625  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || ||||| || || ||||||||||| | ||| ||  |||| || ||||||||    |||| | | |||||||| || ||||| |||||||  ||||||     
T  15652624 atggtagttactttgggtctccatctagaaggaaaacttctcagaatcttgctttcgtgatcagaagcaacataactcttcttgagtatttgcagtccag 15652525  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |  || |||||    
T  15652524 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaactagcattagtgccttagcttc 15652425  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15652424 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgcattagcagtggatttatcactcatcttaatata 15652341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14313062 - 14312644
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  |  || || || ||||| |||||||    
T  14313062 gactttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgtatcttgagggaactgacaagatctt 14312963  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || || ||||| | ||||| | |    
T  14312962 caacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaattttgctaacatgatcaga 14312863  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| |||||||||||||  |||| | | || |  || ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || |||| |    
T  14312862 agtaacatagctattcttcagtatttgcagtctagatactaaagtttgaaatcttgattacatctcctctatactctcatcatccttcatcttcaacagc 14312763  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||| | || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  14312762 tcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttctttaaccttcttgcttccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 14312663  T
Q  539 tgtcactcatcttcatata 557  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14312662 tatcactcatcttcatata 14312644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7796278 - 7795853
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |  | |  ||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || |||||     
T  7796278 ttttgaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactcttgttagaggtctcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactgaca 7796179  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| ||||||  ||||| || | ||    
T  7796178 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttcttaaaatcttactaacat 7796079  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| | |||||| |||||| |    
T  7796078 gatcagaaccaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcttatcatccttcattct 7795979  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| || || || || |||||||| |  ||  ||    
T  7795978 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgatgcaaacatagccttcgca 7795879  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  7795878 gtggatttgtcactcatcttcatata 7795853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 5211122 - 5211278
Alignment:
Q  201 acttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatctt 300  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  5211122 acttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcagcacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctctatcta 5211221  T
Q  301 gtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttc 357  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||    
T  5211222 gcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttc 5211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 566 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17244606 - 17244474
Alignment:
Q  566 taggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttc 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  17244606 taggtatagctttgacaagtgctcctcttattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacatcaactccttc 17244507  T
Q  666 ttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  17244506 ttcatcaacgaccaagtcaataataccatcttc 17244474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 458
Target Start/End: Original strand, 37875641 - 37875967
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| | |||| || ||||| ||     
T  37875641 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgccctttgagtgagctaaca 37875740  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||  |||| |  ||||| || | ||    
T  37875741 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggcaaacttctcaaaatcttactaacat 37875840  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||||| |    
T  37875841 gatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactcccatcatccttcattct 37875940  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
    ||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  37875941 gaaaagttcatactgatgaactagcat 37875967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 141
Target Start/End: Original strand, 5211047 - 5211120
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5211047 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttaagagctttcgatgac 5211120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Original strand, 5211276 - 5211365
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5211276 ttctgatcaggagtatgctttttcttatcaatagcaactccttcttcatcaacgatcaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 5211365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 16306697 - 16306398
Alignment:
Q  220 agagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagta 319  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  | | | ||||| | ||||  |    
T  16306697 agagagctgataagatcttcaacacttatagtacttagatccttagcttcctcaatagcagtctccttaggtctccacttagcaagtaagctccttataa 16306598  T
Q  320 tcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatc 419  Q
    ||||| ||| ||||| | | || |||||| |||||||||| || | ||||||||| || || |||||||| |||||||||||   ||||||   ||||||    
T  16306597 tcttgttcacatgatcataagctacatagtttttcttcagaatctgaagtccaaagactagagtctgaaaccttgagtacatagtctcaatgtcttcatc 16306498  T
Q  420 atctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaac 519  Q
     || |||||  ||||||||||||  |||||||| | |||   || ||| |||||| | | |||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16306497 ctccttcatcatgaacaactcatattgatgaaccaacatggtagctttagcttctttgaatttcttgtttccttcatagttagagcacagagaagcaaac 16306398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 554
Target Start/End: Original strand, 47541619 - 47541788
Alignment:
Q  385 tgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttct 484  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || ||||    
T  47541619 tgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagcacaaactgatgaactagcattagggaatttgcttctctaacattct 47541718  T
Q  485 tattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |  | ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  47541719 tgcttccttcgtagttggaacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 47541788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Original strand, 11222413 - 11222501
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  11222413 ttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagtagctccttcttcattaacgaccaagttacc-ataccatcttgtagtatgtcccat 11222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 505894 - 505851
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  505894 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 505851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 4432273 - 4432316
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4432273 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4432316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 4752832 - 4752875
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4752832 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4752875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 5519381 - 5519424
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5519381 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5519424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5538745 - 5538702
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5538745 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5538702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5581357 - 5581314
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5581357 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5581314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5867420 - 5867377
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5867420 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5867377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6183690 - 6183647
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6183690 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 6183647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 8783776 - 8783819
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8783776 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 8783819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10628672 - 10628629
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10628672 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 10628629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11274109 - 11274066
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11274109 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 11274066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 13130783 - 13130826
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13130783 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13130826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13374392 - 13374349
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13374392 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13374349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13384986 - 13384943
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13384986 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13384943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 14474734 - 14474777
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14474734 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 14474777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16392772 - 16392729
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16392772 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16392729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 19787535 - 19787578
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19787535 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19787578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20674921 - 20674878
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20674921 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 20674878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24385242 - 24385199
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24385242 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24385199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 24668983 - 24669026
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24668983 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24669026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 37875574 - 37875617
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37875574 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 37875617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 37884092 - 37884135
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37884092 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 37884135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 38203765 - 38203808
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38203765 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 38203808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 39381197 - 39381240
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39381197 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39381240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 41692762 - 41692805
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41692762 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 41692805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 557 - 625
Target Start/End: Original strand, 16031325 - 16031393
Alignment:
Q  557 actctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattct 625  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  16031325 actctgctttaggtatagcagtgacaagtgatcctctgaatgtatgatgcttcttgtagagtttcttct 16031393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19659135 - 19658840
Alignment:
Q  253 tttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttt 352  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||  | | ||||||| | ||||| |||||  ||| ||||| |   || ||||||||||    
T  19659135 tttagatctctagcttcctcaatagttgtcatcttagttctccacttagcaggtaagctccttagaatcttcttcagatgatca---gctacatagcttt 19659039  T
Q  353 tcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaac 452  Q
    ||||||| || | ||||||| |    ||  ||||||| ||| |||||||   ||||||   |||||  |||||||| |||||||  ||||  || |||||    
T  19659038 tcttcagaatctgaagtccagatgttagattctgaaacctttagtacataatctcaatgtcttcattctctttcatcttgaacatttcatattgctgaac 19658939  T
Q  453 aagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatctt 551  Q
    |||||||  || |||  ||||| | |||||||| ||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |  |||  |||||||||||||||||||||    
T  19658938 aagcatagtagctttatcttctttgactttcttgttggcttcatagttggaacacagagatgcaaacatagctttagtagtagatttgtcactcatctt 19658840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7796345 - 7796302
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7796345 gatcttcatcagattctccatcaggtgattcttcttcagattca 7796302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8997675 - 8997632
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  8997675 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 8997632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11207819 - 11207776
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11207819 gatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcttcttcagattca 11207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13263397 - 13263354
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13263397 gatcttcatcataatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13263354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 23766407 - 23766450
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23766407 gatcttcattagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23766450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28315962 - 28315919
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  28315962 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttctacagattca 28315919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 29462418 - 29462336
Alignment:
Q  589 cctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| | |  || |||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29462418 cctctgattttgtggtgcttcttgtaaagctttttctgagcaggagtatgtattcttctgtctacagcagctccttcttcatc 29462336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19631075 - 19631002
Alignment:
Q  480 tttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttca 553  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19631075 tttcttgttaccttcatagttggaacacaaagatgcaaacataactttagcagtagatttgtcactcatcttca 19631002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 47623 - 48265
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47623 cagtaggatctccatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggcagagcaatgga 47722  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||  |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  47723 tttactcttcctaaaaggttcatgttcattaagacttctctcatgaactttgagagagctaacatgatcatcaacact-aatgtgtttaaatctttagct 47821  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||| ||||| ||    
T  47822 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcaatatttgaa 47921  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47922 gtccagaaactagagtcttaaatcttaagtacatttgctcaatacttttatcatctttcatattgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttt 48021  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48022 tgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacactaacttagtagtagatttctcactcatcttcatatactctggttta 48121  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48122 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgggcaggagtatgttttcttctatcaacagcagctccttctt 48221  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  48222 catcaacgaccaagtcaccaataccatattctagtatatcccat 48265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 26763768 - 26764410
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  26763768 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggaagagcaatgaa 26763867  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    || ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  26763868 tt-acttttcttagaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagttgacaagatccttaacacttaaagtgtttaaatctttagct 26763966  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  26763967 tcctcaatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttaaa 26764066  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26764067 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatgctttcatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagtctt 26764166  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26764167 tgcttctttgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctaacaatagatttatcactcatcttcatatactctgcttta 26764266  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  26764267 ggtatagctttaacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttttgatcaggagtatgctttttcctatcaatagcaactccttctt 26764366  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26764367 catcaaagaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 26764410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 21200846 - 21200204
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21200846 cagtagggtcttcattataatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgaattccctttagatggtagagcaattga 21200747  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  21200746 tttactcttcttagaaggctcatgttcatttagacttatctcatgaactttaagagagttgacaagatctttaacacttaaagtgtttagatgtttagct 21200647  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  21200646 tcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggtaagctttatagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaa 21200547  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  21200546 gtctagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgttcaatactttcatcatatttcattttgaacaactcatactgatcaacaagcataagagattt 21200447  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21200446 tgtttctctgactttcttactaccttcataatttgcacaaagagaagcaaacattgccttagtagtagatttgtcattcatcttcatatactctgctttt 21200347  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  21200346 ggtatagctttgaaaagcgctcctttgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcattagcaactccttctt 21200247  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  21200246 catcaacgaccaagtcaccaacaccatcttcaagtatgtccca 21200204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 297 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 31144917 - 31144502
Alignment:
Q  297 tcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgag 396  Q
    ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | | || ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  31144917 tcttgaaggtaggcttctgagtatcttgctcacatgatcagaagctacagaacttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtttgaaatcttgag 31144818  T
Q  397 tacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactca-tgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttca 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31144817 tacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcaatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgactttcttactaccttca 31144718  T
Q  496 tagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcgga 595  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  31144717 tagttagcatagagagaagcaaacattgatctagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgttcctttga 31144618  T
Q  596 ttgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttc 695  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31144617 ttatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttcttcatcaataaccaagtcaccaataccatc 31144518  T
Q  696 ttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||||||||||||    
T  31144517 ttctagtatgtcccat 31144502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 68 - 476
Target Start/End: Original strand, 26782731 - 26783139
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26782731 cagtatgatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 26782830  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||  ||  |||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26782831 tttactcttcttagcaggctccagttcattaagacttgtcttatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 26782930  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  26782931 tccaaaataacagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacttgatcagaggctacatagcttttcattagtatttgaa 26783030  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    |||||  |   || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26783031 gtccagtacttagagtttgaaatcttgagtaaatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttt 26783130  T
Q  468 tgcttctct 476  Q
    |||||||||    
T  26783131 tgcttctct 26783139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27461929 - 27461520
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  27461929 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttggaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 27461830  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  27461829 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 27461730  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  27461729 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 27461630  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  27461629 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 27461530  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  27461529 tcattttcat 27461520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 16002377 - 16002799
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  16002377 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 16002476  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || | ||    
T  16002477 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagtttctcaaaatcttactaacat 16002576  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  16002577 gatcagaagcaacatagtttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 16002676  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  16002677 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagccttcgca 16002776  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16002777 gtagatttgtcactcatcttcat 16002799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 548
Target Start/End: Original strand, 23486917 - 23487391
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  | | ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23486917 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 23487016  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||  || ||||  ||||| |  || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23487017 cttctttgaggattcatgctcattcagacccatttcatgaactttgatggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctca 23487116  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| |||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  23487117 atggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 23487216  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||| |  ||| ||||    
T  23487217 atactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgccttttcttc 23487316  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcat 548  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||    
T  23487317 tttaaccttcttcctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcat 23487391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6977573 - 6977164
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  6977573 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 6977474  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  6977473 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 6977374  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  6977373 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 6977274  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  6977273 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 6977174  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  6977173 tcattttcat 6977164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 14567147 - 14567556
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  14567147 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 14567246  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  14567247 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 14567346  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  14567347 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 14567446  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14567447 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 14567546  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  14567547 tcattttcat 14567556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 21704378 - 21704867
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21704378 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 21704477  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||    
T  21704478 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatcctta 21704577  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  21704578 gcttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtattt 21704677  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  21704678 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 21704777  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  21704778 ctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagtttgcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 21704867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22677883 - 22677474
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  22677883 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 22677784  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  22677783 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 22677684  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  22677683 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 22677584  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  22677583 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 22677484  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  22677483 tcattttcat 22677474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23298044 - 23297635
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  23298044 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 23297945  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  23297944 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 23297845  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  23297844 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 23297745  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  23297744 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 23297645  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  23297644 tcattttcat 23297635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23394256 - 23393767
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23394256 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagattttgaagactttcctttagatggtagagcaat 23394157  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | || ||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23394156 ggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcctta 23394057  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  23394056 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtattt 23393957  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  23393956 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 23393857  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| ||  ||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  |||  ||| || || ||||||||||||||    
T  23393856 ctttgcttctctgaccatcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattgtcttagtagtggacttatcactcatcttcat 23393767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25113674 - 25113253
Alignment:
Q  136 gatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagat 235  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  | |||||||| ||||| || || || ||||  || || || || ||||| ||||    
T  25113674 gatggctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagat 25113575  T
Q  236 cttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgata 335  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||| |||||     
T  25113574 attcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatc 25113475  T
Q  336 aaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaac 435  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25113474 agaagcaacataactcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcattttgaac 25113375  T
Q  436 aactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtag 535  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||    
T  25113374 agctcatactgatgaactagcataagtacctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtag 25113275  T
Q  536 atttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  25113274 atttatcactcatcttcatata 25113253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25172765 - 25172344
Alignment:
Q  136 gatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagat 235  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  | |||||||| ||||| || || || ||||  || || || || ||||| ||||    
T  25172765 gatggctttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagat 25172666  T
Q  236 cttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgata 335  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||| |||||     
T  25172665 attcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatc 25172566  T
Q  336 aaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaac 435  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25172565 agaagcaacataactcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcattttgaac 25172466  T
Q  436 aactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtag 535  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||    
T  25172465 agctcatactgatgaactagcataagtacctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtag 25172366  T
Q  536 atttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  25172365 atttatcactcatcttcatata 25172344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 39499981 - 39500390
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  39499981 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 39500080  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  39500081 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 39500180  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  39500181 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 39500280  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  39500281 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 39500380  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  39500381 tcattttcat 39500390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 42044547 - 42044138
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  42044547 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 42044448  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || ||||||| | | |||||    
T  42044447 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaatatgatcagaagcaac 42044348  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  42044347 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 42044248  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  42044247 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 42044148  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  42044147 tcattttcat 42044138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31835260 - 31834838
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  31835260 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 31835161  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  31835160 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 31835061  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  31835060 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 31834961  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  31834960 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 31834861  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  31834860 gtagatttgtcactcattttcat 31834838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39354276 - 39353854
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  39354276 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 39354177  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  39354176 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 39354077  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  39354076 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 39353977  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  39353976 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 39353877  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39353876 gtagatttgtcactcatcttcat 39353854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40392138 - 40391716
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  40392138 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 40392039  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  40392038 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 40391939  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  40391938 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 40391839  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | ||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  40391838 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 40391739  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40391738 gtagatttgtcactcatcttcat 40391716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9337721 - 9337312
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  9337721 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 9337622  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  9337621 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 9337522  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  9337521 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 9337422  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  9337421 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 9337322  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  9337321 tcattttcat 9337312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22148283 - 22147874
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  22148283 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 22148184  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  22148183 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 22148084  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  22148083 atagcttttcttcagtatttgcaatccaaaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 22147984  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||   ||||||||||||||    
T  22147983 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgtagtagatttgtcac 22147884  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  22147883 tcattttcat 22147874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23698547 - 23698138
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  23698547 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 23698448  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  23698447 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 23698348  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  23698347 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 23698248  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  23698247 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 23698148  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  23698147 tcattttcat 23698138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 30236520 - 30236929
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  30236520 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 30236619  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  30236620 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 30236719  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  30236720 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 30236819  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  30236820 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 30236919  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  30236920 tcattttcat 30236929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 36591611 - 36592020
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  36591611 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 36591710  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  36591711 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 36591810  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  36591811 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 36591910  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  36591911 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 36592010  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  36592011 tcattttcat 36592020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14031809 - 14031400
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  14031809 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 14031710  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  14031709 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 14031610  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  14031609 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 14031510  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    | |||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14031509 taatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 14031410  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  14031409 tcattttcat 14031400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 15741736 - 15741327
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  15741736 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 15741637  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  15741636 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 15741537  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  15741536 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 15741437  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  15741436 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 15741337  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  15741336 tcattttcat 15741327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24568855 - 24568446
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  24568855 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 24568756  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  24568755 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 24568656  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  24568655 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 24568556  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24568555 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 24568456  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24568455 tcattttcat 24568446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24809683 - 24809274
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  24809683 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttaagtgagctaacaagatcttcaacac 24809584  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  24809583 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 24809484  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  24809483 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 24809384  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24809383 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 24809284  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24809283 tcattttcat 24809274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 24981824 - 24982313
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24981824 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 24981923  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  24981924 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcctta 24982023  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | | |  |||||||| |||||||||||||    
T  24982024 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtattt 24982123  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||  | || |  || |||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  24982124 gcagtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcatcagggc 24982223  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  24982224 ctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 24982313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Original strand, 17455801 - 17456216
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |  | || ||||||||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||    
T  17455801 gactttcctttagatggtagagaaatagatttactccttttagaggactcatgttcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 17455900  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||| | |    
T  17455901 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttcttagaattttgctaacatgatcaga 17456000  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  17456001 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagc 17456100  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  17456101 tcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctaactttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 17456200  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  17456201 tatcactcatcttcat 17456216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 5299623 - 5300045
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  5299623 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 5299722  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  5299723 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 5299822  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  5299823 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 5299922  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  5299923 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 5300022  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5300023 gtagatttgtcactcatcttcat 5300045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 24825969 - 24826378
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||  || |||||||||| ||    
T  24825969 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagcgaacaagatcttcaacac 24826068  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  24826069 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 24826168  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  24826169 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttattctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 24826268  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24826269 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 24826368  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24826369 tcattttcat 24826378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 34773689 - 34773264
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  34773689 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 34773590  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  34773589 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 34773490  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  34773489 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 34773390  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||    
T  34773389 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgca 34773290  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34773289 gtagatttgtcactcatcttcatata 34773264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35217270 - 35216861
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  35217270 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 35217171  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  35217170 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 35217071  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  35217070 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 35216971  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| | ||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  35216970 tgatgaactaacatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 35216871  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  35216870 tcattttcat 35216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 37739061 - 37739470
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  37739061 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 37739160  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  37739161 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 37739260  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  37739261 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 37739360  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  37739361 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 37739460  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  37739461 tcattttcat 37739470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 14456026 - 14456515
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttt--aag-------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||  |||       || |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14456026 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 14456125  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  14456126 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 14456225  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  14456226 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtattt 14456325  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  14456326 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 14456425  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  14456426 tttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 14456515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11209833 - 11209350
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||  |   ||    ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11209833 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttctacagattcactagtcttgtatgctttagatggctttcctttatatggtagagcaatagatttact 11209734  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | || | ||| ||||| || || || ||||  || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11209733 cttctttgaggacttatgctcatttaggctcatttcatgaaccttgagagaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 11209634  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||  |||| |     
T  11209633 atggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatattttgctcacatgatcagaagcaacatagctcttctttagtatttgcagtctag 11209534  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || |||||||||||| |||| |  || ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  11209533 atactaaagtttgaaatcttgagcacatctcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttc 11209434  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11209433 tctaaccttctttctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacagtaccttagcagtggatttatcactcattttcatata 11209350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31420445 - 31420023
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  31420445 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagagaattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 31420346  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  31420345 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 31420246  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||||  | || | ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  31420245 gatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatcaagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattct 31420146  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  31420145 gaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgca 31420046  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31420045 gtagatttgtcactcatcttcat 31420023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34053807 - 34053318
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34053807 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 34053708  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||| |||    
T  34053707 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagagaactgacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatcctta 34053608  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||| ||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | | |  |||||||| |||||||||||||    
T  34053607 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccgtctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtattt 34053508  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || | ||| || |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  34053507 gcagtccagatactaaggtttggaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatttagaacagctcatactgatgaactagcattagggc 34053408  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| |  |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34053407 ctttgcttctctgaacttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 34053318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 20553595 - 20553173
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || || ||     
T  20553595 ttttgaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactctttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactaaca 20553496  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||    
T  20553495 agatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctgagaatcttgctaacat 20553396  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  20553395 gatcaaaagtaacatagctcttcttcagtatttgtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatctt 20553296  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||  ||| ||    
T  20553295 gaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctaaccttcttgcttccttcgtagttggaacagagtgatgcaaacattgccttagca 20553196  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  20553195 gtggatttatcactcatcttcat 20553173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 27621253 - 27621675
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  27621253 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 27621352  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||  ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  27621353 agatcttcaacacttaacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaagacaagcttctcaaaatcttactaacat 27621452  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  27621453 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 27621552  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  27621553 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 27621652  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27621653 gtagatttgtcactcatcttcat 27621675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 1120383 - 1120805
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  1120383 ttttgaagtctttcctttaaatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 1120482  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  1120483 agatcttcaacacttaaagtatttagacccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 1120582  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  1120583 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 1120682  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||    
T  1120683 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttcgca 1120782  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1120783 gtagatttgtcactcatcttcat 1120805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17608829 - 17608420
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  17608829 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 17608730  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  17608729 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 17608630  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  17608629 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 17608530  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  17608529 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 17608430  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  17608429 tcatcttcat 17608420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17720685 - 17720276
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  17720685 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 17720586  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  17720585 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 17720486  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  17720485 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 17720386  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  17720385 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 17720286  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  17720285 tcatcttcat 17720276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 27051331 - 27051740
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  27051331 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 27051430  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  27051431 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 27051530  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  27051531 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 27051630  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  27051631 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 27051730  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  27051731 tcatcttcat 27051740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31350381 - 31349892
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagct---------tttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    |||         ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31350381 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 31350282  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  31350281 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 31350182  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |    
T  31350181 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatct 31350082  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  31350081 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 31349982  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31349981 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 31349892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 36689465 - 36689056
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  36689465 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 36689366  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  36689365 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 36689266  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  36689265 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 36689166  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  36689165 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 36689066  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  36689065 tcatcttcat 36689056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 13532291 - 13532774
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  13532291 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 13532390  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| | ||| ||||  || ||||  |  || || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13532391 cttcttagaggattcatgcttattcagacccatttcatgtatcttgagggaactgacaagatcctcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 13532490  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    ||   ||| || || ||||||||| | | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  13532491 atgacagttactttgggtctccatttagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 13532590  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  13532591 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgcctttgcttc 13532690  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||||||| | |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13532691 tttaaccttcttgctaccttcatagatagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 13532774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 19465739 - 19465213
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||| ||    
T  19465739 cctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcaccttgagggaactaacaagatcttcaacac 19465640  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||| | ||||||  |||| || |||||||| | ||||| | | |||||    
T  19465639 ttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatctagaaggtaaacttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaac 19465540  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||| ||||||||||||||||  | || | |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  19465539 ataacttttcttcagtatttgcaatctagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 19465440  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| || ||||| || |||||||| |  ||  |||| ||||||||||    
T  19465439 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcagagtgacgcaaacatagccttcgcagtggatttgtcac 19465340  T
Q  545 tcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttct 644  Q
    ||||||||||||| || |    ||||||||     ||||    ||||| |||| |||| ||||||||| | |  || |||||| ||||||||||  ||||    
T  19465339 tcatcttcatatattcggtgcgaggtatagaagccacaatgattcctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtattct 19465240  T
Q  645 tctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  19465239 tctgtctacagcagctccttcttcatc 19465213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 511 - 711
Target Start/End: Original strand, 26783140 - 26783340
Alignment:
Q  511 gaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttct 610  Q
    |||| ||||||||  ||| |||| ||||| |||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  26783140 gaagaaaacattgccttagcagtggatttttcagccatcttcatatattatgctttagctatagctttaacaagttctcctctaactgtgtgatgcttct 26783239  T
Q  611 tgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  26783240 tgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacagcagctccatcttcatcaacgaccaagttaccaattccatcttctagtatgtccca 26783339  T
Q  711 t 711  Q
    |    
T  26783340 t 26783340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23363863 - 23363468
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  23363863 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 23363764  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  23363763 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 23363664  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |              |||| |    
T  23363663 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatcct--------------tcatac 23363578  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  23363577 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 23363478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 458
Target Start/End: Original strand, 43620375 - 43620701
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  43620375 ttttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 43620474  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  43620475 ggatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcgatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 43620574  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | || | |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  43620575 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatctagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 43620674  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
    ||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  43620675 gaaaagttcatactgatgaactagcat 43620701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 1120316 - 1120359
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1120316 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 1120359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 5299556 - 5299599
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5299556 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5299599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6977653 - 6977610
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6977653 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 6977610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9337801 - 9337758
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9337801 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9337758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14031889 - 14031846
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14031889 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 14031846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 14567067 - 14567110
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14567067 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 14567110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15741816 - 15741773
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15741816 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 15741773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 17455727 - 17455770
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17455727 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17455770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17608909 - 17608866
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17608909 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17608866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17720765 - 17720722
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17720765 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17720722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22148363 - 22148320
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22148363 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22148320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22677963 - 22677920
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22677963 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22677920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23298124 - 23298081
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23298124 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23298081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23363943 - 23363900
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23363943 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23363900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23698627 - 23698584
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23698627 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23698584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24568935 - 24568892
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24568935 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24568892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24809763 - 24809720
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24809763 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24809720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 24825889 - 24825932
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24825889 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24825932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27051251 - 27051294
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27051251 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27051294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27462009 - 27461966
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27462009 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27461966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27621186 - 27621229
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27621186 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27621229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 30236440 - 30236483
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30236440 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 30236483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31420512 - 31420469
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31420512 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 31420469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31835327 - 31835284
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31835327 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 31835284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34773756 - 34773713
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34773756 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 34773713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 35217350 - 35217307
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35217350 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 35217307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 36689545 - 36689502
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36689545 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36689502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 37738981 - 37739024
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37738981 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 37739024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 39499901 - 39499944
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39499901 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39499944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40392205 - 40392162
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40392205 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 40392162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 42044627 - 42044584
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42044627 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 42044584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 43620308 - 43620351
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43620308 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 43620351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Original strand, 43620865 - 43620954
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |   |||||||| |||  || ||||| ||||||||||||    
T  43620865 ttctgagcaggagtatgtattcttctgtccacagcagctccttcttcatctaaatccaagtcatcaactccatcttccagtatgtcccat 43620954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 16002310 - 16002353
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16002310 gatctttatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16002353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19465819 - 19465776
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19465819 gatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagattca 19465776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20553662 - 20553619
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20553662 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 20553619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 36591531 - 36591574
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36591531 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36591574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 39354343 - 39354300
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39354343 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39354300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 14906123 - 14905482
Alignment:
Q  70 gtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906123 gtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaacagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatt 14906024  T
Q  170 tactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttc 269  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14906023 tactcttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagaacttcaacacttaaagtgttcaaatctttaccttc 14905924  T
Q  270 ctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagt 369  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||| ||||| | | || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14905923 cgcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaaccttctaagtattttgctcacatgatcagaagctacatagcctttcttcagtatttgaagt 14905824  T
Q  370 ccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttg 469  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||    
T  14905823 ccataaactagattctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactaataaacaagcataagatcttttg 14905724  T
Q  470 cttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttagg 569  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14905723 cttctctgattttcttactacctttatagttagcacagagagaagcaaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatattttctgctttagg 14905624  T
Q  570 tatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttca 669  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14905623 tatagctttgacaagtgctccccagattgtgtgacgcttcttgtagaacttcttctgagtaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttca 14905524  T
Q  670 tcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  14905523 tcaacgaccaagtcaccatttccatcttctagtatatcccat 14905482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 17245881 - 17246524
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17245881 cagtaggatcttcatcagaatctccatcatgtgattcttcttcagattcaacaactttaagaaattttgatgacttccctttttatggtagagcaatgga 17245980  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17245981 tttactctttttggaaggttcatattcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagct 17246080  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  17246081 tcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcggtatttgaa 17246180  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  17246181 gtccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagaatt 17246280  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17246281 tgcttctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgaattagaagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 17246380  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  17246381 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgcgtgatgcttcttctataatttcttctgagaaggagtgtgttttcttctatcaatagcaactcctcctt 17246480  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  17246481 catcaacaaccaagtcaccagtaccatcttccagtatgttccat 17246524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 68 - 517
Target Start/End: Original strand, 16852219 - 16852668
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16852219 cagtaggatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttgagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 16852318  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||| || ||| |  | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16852319 tttgcttttcttagatgactcatgttcattaagactaatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagct 16852418  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| ||    
T  16852419 tcctcaatagcagtcacctttggtctccatctagtaggtaagcttctgagtatcttgctcacatgatcaaaagctacatagcttttcttcggtatttgaa 16852518  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  16852519 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcctt 16852618  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaa 517  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16852619 tgcttctctgactttcttgttgccttcatagttagcacaaagagaagcaa 16852668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 83 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10662973 - 10662359
Alignment:
Q  83 cagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaa 182  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |  |    
T  10662973 cagaatctccatcatgtgactcttcttcagattcaataactttaagagctttagatgactttcctttagatgggagcgcaatagatttattcttctttga 10662874  T
Q  183 agattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtc 282  Q
    ||| ||||| ||||| || || || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10662873 agactcatgctcatttaggctcatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctccatagcagta 10662774  T
Q  283 acctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccaggg 382  Q
    ||||  ||||||||||| | | | ||  |||| | ||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  10662773 acctaaggtctccatctagaatgaaaacttctcaatatcttgctcacatgattagaagcaacatagattttcttcagtatttgaagtccagagactaggg 10662674  T
Q  383 tctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttacttt 482  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||    
T  10662673 tttgaaatcttgagtacatttccacaatactttcatcatcatttatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcctttgcctctctaacctt 10662574  T
Q  483 cttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgaca 582  Q
    | || | |||||| |||||||||| || ||| ||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||| |   |||    
T  10662573 catactgccttcacagtttgcacaaagtgaaacaaacattacctttgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactctgtgcgaggtatagatgcaaca 10662474  T
Q  583 agtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagt 682  Q
    ||   |||||  ||  |||||||||||||| | | ||| |||||| |||| || || ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||    
T  10662473 aggattcctctcatcttgtgatgcttcttgtaaagttttttctgagcaggggtgtgtttctttctatcaatagcagctccatcttcatcaagagccaagt 10662374  T
Q  683 caccaataccttctt 697  Q
    |||||| ||||||||    
T  10662373 caccaacaccttctt 10662359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 83 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10877118 - 10876504
Alignment:
Q  83 cagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaa 182  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |  |    
T  10877118 cagaatctccatcatgtgactcttcttcagattcaataactttaagagctttagatgactttcctttagatgggagcgcaatagatttattcttctttga 10877019  T
Q  183 agattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtc 282  Q
    ||| ||||| ||||| || || || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10877018 agactcatgctcatttaggctcatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctccatagcagta 10876919  T
Q  283 acctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccaggg 382  Q
    ||||  ||||||||||| | | | ||  |||| | ||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  10876918 acctaaggtctccatctagaatgaaaacttctcaatatcttgctcacatgattagaagcaacatagattttcttcagtatttgaagtccagagactaggg 10876819  T
Q  383 tctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttacttt 482  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||    
T  10876818 tttgaaatcttgagtacatttccacaatactttcatcatcatttatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcctttgcctctctaacctt 10876719  T
Q  483 cttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgaca 582  Q
    | || | |||||| |||||||||| || ||| ||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||| |   |||    
T  10876718 catactgccttcacagtttgcacaaagtgaaacaaacattacctttgcagtagatttgtcactcatcttcatgtactctgtgcgaggtatagatgcaaca 10876619  T
Q  583 agtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagt 682  Q
    ||   |||||  ||  |||||||||||||| | | ||| |||||| |||| || || ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||    
T  10876618 aggattcctctcatcttgtgatgcttcttgtaaagttttttctgagcaggggtgtgtttctttctatcaatagcagctccatcttcatcaagagccaagt 10876519  T
Q  683 caccaataccttctt 697  Q
    |||||| ||||||||    
T  10876518 caccaacaccttctt 10876504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 18065102 - 18065594
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta-ag--------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||  ||        || |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  18065102 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcctttgaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 18065201  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  18065202 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 18065301  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  18065302 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagaattt 18065401  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||| | ||     
T  18065402 gcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcatcaaagc 18065501  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | || |||||| | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18065502 tttagcctctttcaccttcttactgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 18065594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14712542 - 14712059
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  14712542 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 14712443  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| | || |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || |||||  ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  14712442 cttctttaaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacatgatcttcaacacttaaagtgttaagatccttagcttcctca 14712343  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  14712342 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 14712243  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |  ||| ||||    
T  14712242 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcctttacttc 14712143  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14712142 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 14712059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 459757 - 460179
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  459757 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 459856  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  459857 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 459956  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  459957 gattagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 460056  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  460057 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 460156  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  460157 gtagatttgtcactcatcttcat 460179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10742246 - 10741837
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  10742246 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 10742147  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  10742146 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 10742047  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  10742046 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 10741947  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  10741946 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 10741847  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  10741846 tcattttcat 10741837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10956015 - 10955606
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  10956015 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 10955916  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  10955915 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 10955816  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  10955815 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 10955716  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  10955715 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 10955616  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  10955615 tcattttcat 10955606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 24649538 - 24649947
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  24649538 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 24649637  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  24649638 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 24649737  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  24649738 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 24649837  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  24649838 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 24649937  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  24649938 tcattttcat 24649947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 22005611 - 22006033
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  22005611 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 22005710  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  22005711 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 22005810  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  22005811 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 22005910  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| |||| |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  22005911 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttacattcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 22006010  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22006011 gtagatttgtcactcatcttcat 22006033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30928154 - 30927732
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  30928154 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 30928055  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||  |||| |  ||||| || | ||    
T  30928054 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaaacttctcaaaatcttactaacat 30927955  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  30927954 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 30927855  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  30927854 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 30927755  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30927754 gtagatttgtcactcatcttcat 30927732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18131897 - 18131488
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  18131897 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 18131798  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  18131797 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 18131698  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  18131697 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 18131598  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  18131597 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 18131498  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  18131497 tcattttcat 18131488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 5021263 - 5021755
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta--------aga-gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||        ||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  5021263 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 5021362  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  5021363 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 5021462  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  5021463 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 5021562  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | |      
T  5021563 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaaac 5021662  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5021663 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatata 5021755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 16265059 - 16265481
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||  |||||| || ||||| ||     
T  16265059 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcacgcactttgagtgagctaaca 16265158  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  16265159 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 16265258  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  16265259 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 16265358  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  16265359 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 16265458  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16265459 gtagatttgtcactcattttcat 16265481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 17927293 - 17927715
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  17927293 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 17927392  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  17927393 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccaccttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 17927492  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  17927493 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 17927592  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | ||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  17927593 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 17927692  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17927693 gtagatttgtcactcatcttcat 17927715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 27665767 - 27666189
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  27665767 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 27665866  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||    
T  27665867 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacat 27665966  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  27665967 gatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 27666066  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  27666067 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 27666166  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27666167 gtagatttgtcactcattttcat 27666189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14837836 - 14837347
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca---------acaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  14837836 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttataagattttgaaacctttcctttagatggtagagcaat 14837737  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | || ||||| ||||| | ||| || |||| ||| || || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  14837736 ggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 14837637  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||  || | ||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  14837636 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagtttctcagaatctaactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtattt 14837537  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  14837536 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 14837437  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  14837436 ctttgcttctctgacattcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattaccttagcagtggatttatcactcatcttcat 14837347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 36027498 - 36027907
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  36027498 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 36027597  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  36027598 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 36027697  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  36027698 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 36027797  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  36027798 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 36027897  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  36027898 tcattttcat 36027907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 4989523 - 4989031
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta--------aga-gcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||        ||| | |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4989523 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 4989424  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  4989423 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 4989324  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4989323 gcttccccaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 4989224  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | |      
T  4989223 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaaac 4989124  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989123 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatata 4989031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19945999 - 19945577
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || || | |||||| || ||||| ||     
T  19945999 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcgtgcactttgagtgagctaaca 19945900  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  19945899 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 19945800  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  19945799 gatcagaaacaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 19945700  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  19945699 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 19945600  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19945599 gtagatttgtcactcatcttcat 19945577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 16315854 - 16316343
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16315854 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 16315953  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16315954 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcctta 16316053  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | | ||| | | |  |||||||| |||||||||||||    
T  16316054 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacaagatcagaagtgacatagctcttcttcagtattt 16316153  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||  | || |  || |||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  16316154 gcagtccggatactaaagtttgaaatctagagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 16316253  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  16316254 ctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 16316343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 55746900 - 55746491
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  55746900 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 55746801  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  55746800 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 55746701  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  55746700 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 55746601  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  55746600 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 55746501  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  55746500 tcattttcat 55746491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27816607 - 27816185
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| |      
T  27816607 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttattcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaga 27816508  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  27816507 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 27816408  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  27816407 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcagtccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 27816308  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | |  |||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  27816307 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaacttcttgctaccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 27816208  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27816207 gtagatttgtcactcatcttcat 27816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18754218 - 18753729
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga---------cttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||  ||||| || ||         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  18754218 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcacttgctttaaaggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 18754119  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| || || | ||| || |||| |||||| || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||    
T  18754118 ggatttactcttcttagaggattcatgctcgtttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatcctta 18754019  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  18754018 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccaccttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 18753919  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  18753918 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaaagc 18753819  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || ||||| || |  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18753818 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaagatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 18753729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 554
Target Start/End: Original strand, 27175278 - 27175690
Alignment:
Q  142 ttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagatt-catgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttca 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||    
T  27175278 ttccttttagatggtaaagcaatggatttactcttctt-agagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttca 27175376  T
Q  241 agacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaagg 340  Q
    | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |    
T  27175377 acacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaag 27175476  T
Q  341 caacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  ||    
T  27175477 caacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttc 27175576  T
Q  441 atgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttg 540  Q
    || ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||   ||||||||||    
T  27175577 atactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgtagtagatttg 27175676  T
Q  541 tcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||    
T  27175677 tcactcatcttcat 27175690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40456021 - 40455599
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  40456021 ttttgaagactttcctttagatggcaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 40455922  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  40455921 agatcttcaacacttaacgtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 40455822  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||| |    
T  40455821 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttctttaatactctcatcatccttcattct 40455722  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | || ||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  40455721 gaatagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccctcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgca 40455622  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40455621 gtagatttgtcactcatcttcat 40455599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 49516744 - 49517153
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  49516744 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 49516843  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  49516844 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 49516943  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  49516944 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 49517043  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  49517044 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 49517143  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  49517144 tcatcttcat 49517153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 15195568 - 15195164
Alignment:
Q  150 agatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaa 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||    
T  15195568 agatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaa 15195469  T
Q  250 gtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagc 349  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | ||||||||    
T  15195468 gtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctcgaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagc 15195369  T
Q  350 ttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatg 449  Q
    | |||||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15195368 tcttcttcagtatttgcagttcagatactaaagtttgaaatcttaagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatg 15195269  T
Q  450 aacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatc 549  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||    
T  15195268 aactagcattagagcctttgcttctctaaccttcttgcttccttcgtagttggcacaaagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatc 15195169  T
Q  550 ttcat 554  Q
    |||||    
T  15195168 ttcat 15195164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 319 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16820832 - 16820594
Alignment:
Q  319 atcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcat 418  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  16820832 atcttgcttacatgatcaaaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcat 16820733  T
Q  419 catctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaa 518  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||| || ||||| |  ||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| ||| |||| || |||||    
T  16820732 catccttcatcttgaacagcacatactgatgaactagaataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcaaagagtgatgcaaa 16820633  T
Q  519 cattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16820632 cattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 16820594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 385 - 554
Target Start/End: Original strand, 3389295 - 3389464
Alignment:
Q  385 tgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttct 484  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||  ||||||||||| ||  |||    
T  3389295 tgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattaaagcctttgcttctctaaccgtct 3389394  T
Q  485 tattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  3389395 tgcttccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 3389464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 557
Target Start/End: Original strand, 11470140 - 11470288
Alignment:
Q  409 atactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacaga 508  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  |  ||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| ||||| |    
T  11470140 atactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattaatgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacaaa 11470239  T
Q  509 gagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | || ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11470240 gtgatgcaaacattgccttagcagtagatttatcactcatcttcatata 11470288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 13694716 - 13694796
Alignment:
Q  216 tttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctcca 296  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13694716 tttaagagagcttataagatcttcaagacttagagtacttagatctttagcttcctcaatagttgtcaccttaggtctcca 13694796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14845006 - 14844891
Alignment:
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||    
T  14845006 tcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatt 14844907  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||    
T  14844906 tgtcactcatcttcat 14844891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 326
Target Start/End: Original strand, 3380703 - 3380890
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |  | || || || ||||| ||||| || ||||  || || ||  | ||||| |||||||    
T  3380703 gactttcctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcgtgctcattcagactcatttcatgtaccttgaggaaactgacaagatctt 3380802  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgct 326  Q
    ||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||    
T  3380803 caacactcaaggtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgct 3380890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 459690 - 459733
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  459690 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 459733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 3380629 - 3380672
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3380629 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3380672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10742326 - 10742283
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10742326 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 10742283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10956095 - 10956052
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10956095 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 10956052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15198532 - 15198489
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15198532 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 15198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 16264992 - 16265035
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16264992 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16265035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 17927226 - 17927269
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17927226 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17927269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18131977 - 18131934
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18131977 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 18131934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19946066 - 19946023
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19946066 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19946023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 22005544 - 22005587
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22005544 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22005587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 24649458 - 24649501
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24649458 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24649501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27175200 - 27175243
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27175200 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27175243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27665700 - 27665743
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27665700 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27665743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27816674 - 27816631
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27816674 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27816631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30928221 - 30928178
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30928221 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 30928178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 36027418 - 36027461
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36027418 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36027461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40456088 - 40456045
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40456088 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 40456045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 49516664 - 49516707
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49516664 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 49516707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 55746980 - 55746937
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55746980 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 55746937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 18753694 - 18753612
Alignment:
Q  589 cctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | |  || |||||| ||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18753694 cctctgattttgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtatttttctatctatagcagctccttcttcatc 18753612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 19945509 - 19945460
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19945509 ttctgagcaggagtatgtattcttctatctatagcagctccttcttcatc 19945460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 209712 - 210354
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  209712 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttaatgactttcctcttgatggtagagcaatgga 209811  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  209812 tttgcttttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 209911  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||| |||||||| ||    
T  209912 taatcaatagcagtcacctttggtctccaactagcaggtaagcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttct-cagtatttgaa 210010  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  210011 gtccagaaactagagcctgaaatcttgagtacatttgctcaatgctttcatcatctttcattttgaacagctcataatgatgaacaagcataagagcctt 210110  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210111 tgcttctctgactttcttactgccttcatagtaagcacagagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 210210  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  210211 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgatcaggagtatgctttctcctatcaatagcagctccttctt 210310  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  210311 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 210354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 111400 - 110757
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |    
T  111400 cagtaggatcttcgtcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaaacttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatgta 111301  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  111300 tttacttttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatcctcaacacttaaagtgtttaaatctttaggt 111201  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| | | || |||||| ||||||||||||||| ||    
T  111200 tcctcaatagcagtcacctttggtcttcatctagcaggtaagcttctaagtatcttgttcacatgatcagaagctacatagattttcttcagtatttgaa 111101  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  111100 gtccataaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatattgtcatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcctt 111001  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111000 tgcttctctgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 110901  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  110900 ggtatagctttgacaagtgctcatctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttttgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttctt 110801  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  110800 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 110757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28703013 - 28702377
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28703013 cagtaggatcttcgtcagaatctccatcagataattcttcttcatacttaacagctttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgaa 28702914  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||  |  ||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  28702913 tttactctttttagaaggttcatgctcattaaggcttatctcatgaactttgagagagttgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttaact 28702814  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28702813 tcctcaatagcagtcacctttgatctccatcttgcaggtaagcttctaagtatctttctcacatgatcagaggctacatagcctttctttagtatttgaa 28702714  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  28702713 gtccagaaactagagtctgaaatcttaagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgataaacaagcataagagcttt 28702614  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28702613 tgcatctctgactttcttactaccttcatagttagcacagagagaagtaaacattgacttagcagtgaatttgtcactcatcttcatatactttgcttta 28702514  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28702513 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattgtgtgatgcttcttgtagaatttcttatgagcaggagtatgttttcttctatcaataccagctccttctt 28702414  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtat 704  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28702413 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtat 28702377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22783418 - 22782775
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || | ||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||    
T  22783418 cagttggatcttcatcaaaatccccatcgggtgattcttcttcagattccacgaccttcaaagcttttgatgactttcctcttaatggtagggcaatgga 22783319  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22783318 tttgcttttcttggaagattcatgttcattgagacttatcttatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgcttaaatctttagct 22783219  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||| | |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  22783218 tcctcaatagcagtcaccttaggtctccatctagcaagtaggcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaa 22783119  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
     |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  22783118 ctccagaaactagagtcagaaatcttgagtacatttgctcaatactttgatcatctttcattttgaacagctcatactgatgaacaagcataagagcctt 22783019  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783018 tgcttctctaactttcttacagccttcatagttagcacaaagagaagcaaacattgatctagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 22782919  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    | ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22782918 gatatagctttgagaagtactcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctaatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttctt 22782819  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22782818 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 22782775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 711
Target Start/End: Original strand, 24574502 - 24574979
Alignment:
Q  234 atcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatga 333  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24574502 atcttgaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatga 24574601  T
Q  334 taaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttga 433  Q
    | | | || ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24574602 tcagaagctacacagcttttcttcagtatttgaagtccagaaactagagtgtgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcaccatctttcattttga 24574701  T
Q  434 acaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagt 533  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24574702 acaactcatactgatgaacaagcataagagcttttgcttctcttactttcttactaccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacattgacttagcagt 24574801  T
Q  534 agatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacagga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | | ||| |||||| |||||    
T  24574802 agatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagggctcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgagcagga 24574901  T
Q  634 gtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24574902 gtatgttttcttctatcaacatctgctccttcttcatcaacgactaagtcaccaataccaccttctagtatgtcccat 24574979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 382 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23185812 - 23185484
Alignment:
Q  382 gtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactt 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23185812 gtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcagtttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgtttctctgactt 23185713  T
Q  482 tcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgac 581  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23185712 tcttgctaccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacatttccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagcagtgac 23185613  T
Q  582 aagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaag 681  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  23185612 aagtgctcctctaattgtgtgatgcttcgtgtagattttcttctgagcaggagtatgttttcttctctcaatagcagctccttcttcatctaggaccaag 23185513  T
Q  682 tcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  23185512 tcaccaacaccatctttaagtatgtccca 23185484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 382 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23597075 - 23596747
Alignment:
Q  382 gtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactt 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  23597075 gtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatctttcagtttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgtttctctgactt 23596976  T
Q  482 tcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgac 581  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23596975 tcttgctaccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacatttccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagcagtgac 23596876  T
Q  582 aagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaag 681  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  23596875 aagtgctcctctaattgtgtgatgcttcgtgtagattttcttctgagcaggagtatgttttcttctctcaatagcagctccttcttcatctaggaccaag 23596776  T
Q  682 tcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  23596775 tcaccaacaccatctttaagtatgtccca 23596747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 190 - 524
Target Start/End: Original strand, 21137530 - 21137864
Alignment:
Q  190 tgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttg 289  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21137530 tgttcattaaaacttatctcatgtacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttg 21137629  T
Q  290 gtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaa 389  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  21137630 gtctctatcttgcaggtgagcttcttagtatcttgctcacatgatcaaaagttacatagtttttcttcagtatttgaagtccataaactaaagtctgaaa 21137729  T
Q  390 tcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttatta 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||    
T  21137730 tcttgagtacatttgctcaatactttcatcacatgtcattttgaacaactcatactaatgaacaagcataaaagcttttgcttctcttacattcttacta 21137829  T
Q  490 ccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattga 524  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21137830 cctttatagtttgcacagagaaaagcaaatattga 21137864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 68 - 480
Target Start/End: Original strand, 24723682 - 24724091
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  24723682 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcactttagatagaagagcaataga 24723781  T
Q  168 tttactcttcct-gaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagc 266  Q
    |||||||||| | | |||  ||||||||||| ||||||||||    |||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24723782 tttactcttcttagcaag-ctcatgttcatttagacttatct----cactttaagaaagttgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagc 24723876  T
Q  267 ttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttca 366  Q
    || |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||||      
T  24723877 ttactcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggcaagcttcttaatatcttactcacatgatcagaagcaacctagcttttcttcagtatttgt 24723976  T
Q  367 agtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgct-gatgaacaagcataagagtt 465  Q
    |||| |    | | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| || ||||||||||||| ||||      
T  24723977 agtctaggggctatggtctgaaatcttcagtacatttcctcaatactttcatcatccttcatcttgaagaattcatactggatgaacaagcatgagagcc 24724076  T
Q  466 tttgcttctcttact 480  Q
    |||||||||| ||||    
T  24724077 tttgcttctcatact 24724091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 313 - 711
Target Start/End: Original strand, 22256753 - 22257142
Alignment:
Q  313 cttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatac 412  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |  | ||||| ||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22256753 cttattatcttgctcacatgatcagaaactacatatcttttcttcagtatttggcatccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgttcaatat 22256852  T
Q  413 tttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagaga 512  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22256853 tttcatcatctttcattttgaaaaactcatattgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgactttctgactaccttcatagtttgcacggagaga 22256952  T
Q  513 agcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttg 612  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22256953 agcaaacattgccttagcagtagatttttcacttttcttcatatactc---------tatagctttgacaagcgctcctctgattgtgtgatgtttcttg 22257043  T
Q  613 aagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
     ||| ||| || |||  ||||||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22257044 tagagtttcttatgagtaggagtatgtttccttttatcaacaacaactccttcttcatcaacgaccaactcaccaataccatcttctagtatgtcccat 22257142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 187 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 10900171 - 10899797
Alignment:
Q  187 tcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacct 286  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||  || || | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | || |    
T  10900171 tcatgctcattgagactgatctcatgaaccttgaaagagctcataagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctctagtttcctcaatagcaataactt 10900072  T
Q  287 ttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctg 386  Q
    | ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||| | |||||||| ||||| ||||||| | || || |||||    
T  10900071 taggtctccatctagcaggtaagcttcttagaatcttgctcacatgatcaaaagctacataacctttcttcaatatttgaagtccagagacaagagtctg 10899972  T
Q  387 aaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctta 486  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  10899971 aaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatatttcatcttgaacaactcatactgatgaaaaagcataataacttttgcttctctaaccttctta 10899872  T
Q  487 ttaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactct 561  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |  || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10899871 ctaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgccattgcaatagatttgtcactcatcttcatgtactct 10899797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 710
Target Start/End: Original strand, 24842516 - 24843146
Alignment:
Q  87 atctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagat 186  Q
    |||| ||||||| ||||  | |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| |   |||     
T  24842516 atctgcatcaggggattctttttcagattcaatgactttgagagctttagatgactttcctttagatggcagagcaatatattttgtcttcttagtagag 24842615  T
Q  187 tcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacct 286  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||   || || | ||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24842616 tcatgctcattgagactcatttcacgaaccttgatagaactcacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtaacct 24842715  T
Q  287 ttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctg 386  Q
    | |||||  |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| | | || || || |||||||||| ||||| ||||||| | || || |||||    
T  24842716 taggtctttatctagcaggtaaacttcttagtatcttgctcatatgattagaagctacgtaacttttcttcaatatttgaagtccagagactagagtctg 24842815  T
Q  387 aaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt-------gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttac 479  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  24842816 aaatcttgtgtacatttcctcaatactttcatcatctttcatctttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcatgagagcctttgcctctctaac 24842915  T
Q  480 tttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttg 579  Q
     |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||  ||  || || |||| || ||||||||||| |||||||    ||||| || |       
T  24842916 attcttactaccttcatagtttgcaaaaagtgaagcaaacattgcctttgcaataaatttttccctcatcttcatgtactctgtgcgaggtagagatgca 24843015  T
Q  580 acaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgacca 679  Q
    || ||   ||||  |||  |||||||||| ||| | |  || || ||| ||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||    
T  24843016 accaggattcctttgatcttgtgatgcttgttgtaaagcttcttttgagcaggagtgtgtttccttctatcaatagctgctccttcttcatcaaaagcca 24843115  T
Q  680 agtcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  24843116 agtcaccaacaccatcttctagaatatccca 24843146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 68 - 316
Target Start/End: Original strand, 22253907 - 22254155
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  22253907 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcctattcaacaactttaagagcttttgatgacttctctttagatggtagagtaataga 22254006  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||  |   ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22254007 tttactctttttagtagactcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaacaagatcatcaacacttaaagtgtttaaatctttggct 22254106  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttctta 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  22254107 tccccaatagcagtcacctttggtcttcatcttgcaagtaagcttctta 22254155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11396836 - 11396427
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  11396836 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 11396737  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | |||||||    
T  11396736 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaggcaac 11396637  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  11396636 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 11396537  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  11396536 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 11396437  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  11396436 tcattttcat 11396427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39171758 - 39171349
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  39171758 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 39171659  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  39171658 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 39171559  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  39171558 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 39171459  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  39171458 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 39171359  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  39171358 tcattttcat 39171349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24329493 - 24329004
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttta-ag--------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||  ||        || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24329493 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaccggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 24329394  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  24329393 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 24329294  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  24329293 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 24329194  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  24329193 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 24329094  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24329093 tttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 24329004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9764440 - 9764018
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| ||||||  | ||||| ||     
T  9764440 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgcgtgagctaaca 9764341  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  9764340 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 9764241  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  9764240 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 9764141  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| |||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  9764140 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcttcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 9764041  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  9764040 gtagatttgtcactcattttcat 9764018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22916537 - 22916115
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  22916537 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 22916438  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  22916437 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 22916338  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  22916337 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 22916238  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  22916237 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 22916138  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22916137 gtagatttgtcactcattttcat 22916115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24303835 - 24303210
Alignment:
Q  73 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  | ||      
T  24303835 ggatattcatcagaatctccatcaggggattcttctttagactcaatggctttgagagcttttgaggacttccatttagatgtcagagcaataaactttg 24303736  T
Q  173 tcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
     |||| |   ||||||||| ||||| ||||  |||||||  || || ||||| || |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24303735 gcttcttagtagattcatgctcatttagaccaatctcatgtaccttgagagaacttataagatcttcaacacttagagtgtttaaatctttagcttcatc 24303636  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||||  ||| || || |||||||| || | ||||||| |||| |  | |||||||| || || | | ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |    
T  24303635 aataacagtaactttaggtctccacctagcaggtaagcttctcataagcttgctcacataatcagaagcaacatagtttttcttcagtatttgaggtcta 24303536  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     | |  || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24303535 gagaaaagagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatactttcataatatttcatcttgaataattcatactgatgaacaagcataatagcttttgctt 24303436  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtat 572  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |  |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||   |||||     
T  24303435 ctctgactttcttgtttccttcatagttagcatacaatgaagcaaacattgctttagcagtagatttattactcatcttcaaatactcagcacgaggtaa 24303336  T
Q  573 agctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatca 672  Q
    |||    |||||   |||||  ||  ||||||| |||||| | | ||| || | | ||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24303335 agcagcaacaagaattcctctcatcttgtgatgtttcttgtacattttcttttaagcaggagtgtgtttctttctatcgatagcagctccttcttcatca 24303236  T
Q  673 atgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
    | | |||||||||||| ||| |||||    
T  24303235 agggccaagtcaccaacaccatcttc 24303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25119978 - 25119664
Alignment:
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  25119978 agatcttcaatactta--gtgtttaaatctttagattcctcaatagtagtaactttaggtctccacctagcaggtaagcttcttaggatcttgctcacat 25119881  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || || |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |    
T  25119880 gatcagaagctacatagcttttcttcagaatttgaagtccagagactagagtctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatcatctttcattct 25119781  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||   || ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||| ||    
T  25119780 gaacaattcatactaatgaacaagcatggtagctttagcttctctgactttcttgtttccttcatagtttgcacacaaggaagcaaacattgctttagca 25119681  T
Q  532 gtagatttgtcactcat 548  Q
    |||||||| ||||||||    
T  25119680 gtagatttatcactcat 25119664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 40249757 - 40250166
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  40249757 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 40249856  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  40249857 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 40249956  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  40249957 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactttcatcatccttcattctgaaaagttcatac 40250056  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  40250057 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgtcttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 40250156  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  40250157 tcattttcat 40250166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 24803386 - 24802903
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  24803386 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 24803287  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||| || ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  24803286 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttaagggaactgacaaaatcttcaacactcaaagtgtttaaatccttggcttcctca 24803187  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||| ||||||| | ||| ||  |||| |  |||||||||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  24803186 atggcagtcactttaggtttccatctagaaggcaaacttctcaaaatcttgctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 24803087  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || |||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  24803086 atactaaagtttgaaatctcgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttc 24802987  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  24802986 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgcctcagcagtggatttatcactcattttcatata 24802903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24416703 - 24416281
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| | ||| || |||| ||| || |  || |||||     
T  24416703 ttttgaagactttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaagactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgaaggaactgaca 24416604  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||    
T  24416603 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacat 24416504  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | | ||||||||| |||||||  ||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  24416503 gatcagaagtaacatagctcttcttcaaaatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatttt 24416404  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  ||| ||    
T  24416403 gaacagctcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattgccttagca 24416304  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  24416303 gtggatttatcactcatcttcat 24416281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 4219044 - 4219453
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  4219044 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 4219143  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  4219144 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtcttcatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 4219243  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  4219244 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 4219343  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  4219344 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 4219443  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  4219444 tcattttcat 4219453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 10276135 - 10276544
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  10276135 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 10276234  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  10276235 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 10276334  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  10276335 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 10276434  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  10276435 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 10276534  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  10276535 tcattttcat 10276544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 27230587 - 27230996
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  27230587 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 27230686  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  27230687 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 27230786  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  27230787 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 27230886  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  27230887 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 27230986  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  27230987 tcattttcat 27230996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 35262152 - 35262561
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  35262152 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 35262251  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  35262252 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 35262351  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  35262352 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 35262451  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  35262452 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 35262551  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  35262552 tcattttcat 35262561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 35272777 - 35273186
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  35272777 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 35272876  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  35272877 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 35272976  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  35272977 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 35273076  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  35273077 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 35273176  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  35273177 tcattttcat 35273186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34791894 - 34791472
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagatt-catgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgac 230  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||    
T  34791894 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttctt-agagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaac 34791796  T
Q  231 gagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcata 330  Q
     |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | |    
T  34791795 aagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaaca 34791696  T
Q  331 tgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattt 430  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||     
T  34791695 tgatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattc 34791596  T
Q  431 tgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaac 530  Q
    |||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |    
T  34791595 tgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgc 34791496  T
Q  531 agtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34791495 agtagatttgtcactcatcttcat 34791472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9899250 - 9898828
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  9899250 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 9899151  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  9899150 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 9899051  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||| | |||||||| |||||| |    
T  9899050 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatagtctcatcatccttcattct 9898951  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  9898950 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 9898851  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9898850 gtagatttgtcactcatcttcat 9898828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 43353578 - 43353987
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  43353578 cctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 43353677  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  43353678 ttagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 43353777  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  43353778 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 43353877  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  43353878 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 43353977  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  43353978 tcattttcat 43353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 19304163 - 19303680
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  19304163 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttactttagatggtagagcaatagatctatt 19304064  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19304063 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtacgttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 19303964  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  19303963 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 19303864  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| || || || |  ||||||||    
T  19303863 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagtatgagtgcctttgcttc 19303764  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  || |||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19303763 tttaaccttcttgctatcttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 19303680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28722988 - 28722573
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||    
T  28722988 gactttcctttacatggtagagcaatagatttactctttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 28722889  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | |    
T  28722888 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctgagaatcttgctaacatgatcaga 28722789  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     | ||||||||| |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  28722788 agtaacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagc 28722689  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||  | ||||  ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  28722688 tcatactgatgaactagcattagggcctttgcttctctaaccttcttgcttcctttgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 28722589  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  28722588 tatcactcatcttcat 28722573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 29253355 - 29253777
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  29253355 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 29253454  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||| ||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  29253455 agatcttcaacacttaacgtatttagatccttaacttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 29253554  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  29253555 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 29253654  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  29253655 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 29253754  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29253755 gtagatttgtcactcatcttcat 29253777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 43091814 - 43092236
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || | ||| ||     
T  43091814 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgtgctaaca 43091913  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  43091914 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 43092013  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  43092014 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 43092113  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  43092114 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 43092213  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  43092214 gtagatttgtcactcattttcat 43092236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21163624 - 21163196
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||||||     
T  21163624 ttttgaagattttcctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctgaca 21163525  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |   |||| || | ||    
T  21163524 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaactcttactaacat 21163425  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  21163424 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 21163325  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| || || || || |||||||| |  ||  ||    
T  21163324 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagctttcgca 21163225  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatatactc 560  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  21163224 gtggatttgtcactcatcttcatgtactc 21163196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23185983 - 23185824
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  23185983 cagtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttcccttaggatggtagagcaattga 23185887  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgac 230  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23185886 tttactcttcctagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgac 23185824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23597246 - 23597087
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  23597246 cagtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttcccttaggatggtagagcaattga 23597150  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgac 230  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23597149 tttactcttcctagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgac 23597087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 232 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21919687 - 21919366
Alignment:
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||  | |||| || ||||||||| | | ||||||  || | |  |||||| ||| ||    
T  21919687 agatcttcaacacttagagtgtttagatccgtagcttcctcaataacaatcactttaggtctccatttggcaggtaaacttgtcaaaatcttgttcacat 21919588  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    |||   | |  ||||||  ||||||||| || | ||||||| | || || ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |||      
T  21919587 gatcggaagttacataggctttcttcagaatctgaagtccagagactagagtctgaaatcttgagtacatagcctcaatgctttcatcctcttttattcc 21919488  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   |  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  ||| ||    
T  21919487 gaacaactcatactgatcaacaagcattgtatatttagcttctctgactttcttattgccttcatagtttgaacacaaggaagcaaacattgctttagca 21919388  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttca 553  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  21919387 gtagatttatcactcatcttca 21919366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 401
Target Start/End: Original strand, 26876036 - 26876372
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttt--aag-------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | ||  |||       || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26876036 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttggaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 26876135  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  26876136 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 26876235  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    |||||||| || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  26876236 gcttcctctatggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagatgtaacatagctcttcttcagtattt 26876335  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacat 401  Q
      |||||| | || |  || |||||||||||||||||    
T  26876336 gtagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacat 26876372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19301714 - 19301360
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  19301714 gatcttcatcagaatctccatcgggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttactttagatggtagagcaatagatctatt 19301615  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  19301614 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtacattgagggaactgacaagatattcaacactcaaagtgtttagatccttagattccaca 19301515  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  19301514 atggcagtaactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 19301415  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcat 428  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  19301414 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcat 19301360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 385 - 557
Target Start/End: Original strand, 22773160 - 22773332
Alignment:
Q  385 tgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttct 484  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| || |  ||||||||| | || ||||    
T  22773160 tgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactggcattagtgcctttgcttctttaaccttct 22773259  T
Q  485 tattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |  ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22773260 tgctaccttcgtagttagcatagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 22773332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 398
Target Start/End: Original strand, 22682400 - 22682567
Alignment:
Q  231 gagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcata 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||  ||| |    
T  22682400 gagatcttcaagacttacagtgtttatatccttagcttcctcaatggttatcaccttaggtctccacttagcaggtaagctccttagaatctttttcaga 22682499  T
Q  331 tgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagta 398  Q
    |||| | | || |||||| |||||||||| |  | ||||| ||| || || |||||||| ||||||||    
T  22682500 tgatcagatgctacatagtttttcttcagaaactgaagtctaaagactagagtctgaaaccttgagta 22682567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 557
Target Start/End: Original strand, 26878510 - 26878636
Alignment:
Q  431 tgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaac 530  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||  ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |    
T  26878510 tgaacagctcatactgatgaactagcattaaagcctttgcttctctaaccttcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagc 26878609  T
Q  531 agtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26878610 agtggatttatcactcatcttcatata 26878636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 4218964 - 4219007
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4218964 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4219007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9764507 - 9764464
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9764507 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9764464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9899317 - 9899274
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9899317 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9899274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 10276055 - 10276098
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10276055 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 10276098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11396916 - 11396873
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11396916 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 11396873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21163691 - 21163648
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21163691 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 21163648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27230507 - 27230550
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27230507 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27230550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28723062 - 28723019
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28723062 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 28723019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 29253288 - 29253331
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29253288 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 29253331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34791961 - 34791918
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34791961 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 34791918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 35262072 - 35262115
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35262072 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 35262115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 35272697 - 35272740
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35272697 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 35272740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 39171838 - 39171795
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39171838 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39171795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 40249677 - 40249720
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40249677 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 40249720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 43353498 - 43353541
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43353498 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 43353541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22916604 - 22916561
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22916604 gatcttcattagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22916561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24416770 - 24416727
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  24416770 gatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattca 24416727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 43091747 - 43091790
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43091747 gatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 43091790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 630 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 10899728 - 10899670
Alignment:
Q  630 aggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaa 688  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  10899728 aggagtatgtttctttctatcaatagcagctccttcttcgtcaaggatcaagtcaccaa 10899670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 27449 - 26806
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || || | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27449 cagttggatcttcatcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacgaccttcaaagcttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatgga 27350  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27349 tttgcttttcttggaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagccgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 27250  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | |  | ||||| |||||||||||||||| ||    
T  27249 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatctagcaggtaggcttctgagtatcttgctcacatgatcagaatctacataacttttcttcagtatttgaa 27150  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27149 gtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcttt 27050  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27049 tgcttctttgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagcaatagatttttcactcatcttcatatactctgcttta 26950  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  26949 ggtatagctttgacaagcgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcatctgatcaggagtatgctttctcctatcaatggcagctccttctt 26850  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26849 catcaacaacgaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 26806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 6978 - 7616
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||  | || ||    
T  6978 cagtaggatcttcatctgactctccatcaggtgattcttcttcagattcaac----ttaagagctcttgatgactttcctttagatgacagcacgattga 7073  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7074 tttactcttcttagtaggctcatgttcattgagactaatctcatgaactttgagagagctgacaagatcatcaacacttaaattgtttaaatctttagct 7173  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||| ||||||| |     
T  7174 tcctcaatagcagtaaccttaggtctccatcttgtaggtaaacttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttctttagtatttgac 7273  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7274 gtccagaaact-gagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcttt 7372  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 tgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaatattgtcttagtagtagatttatcactcatcttcatatactctgcttta 7472  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7473 ggtatagctttgacaagtgctcctctgatcgtgtgatgcttcttgaagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaacagcagctccttcgt 7572  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  7573 catcaatgacctagtcaccaacaccatcttcaagtatgtcccat 7616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 23023175 - 23023818
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||  ||||||  ||||||||    
T  23023175 cagtaggatcctcatcagaatctccattcggtgattcttcttcagactccacaactttgagagcctttgatgaccttcctttgaatggtaaggcaatgga 23023274  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||| || ||| || | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  23023275 ttttcttttcttggatgactcatgttcattaagactaatctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaacacttagagtgttcaaatctttagct 23023374  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  23023375 tcctcaatagcagtcaccttaggtctccatctagtaggtaagcttctgagtatcttgcttacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtatttgaa 23023474  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
     |||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  23023475 ttcctgaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagcctt 23023574  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023575 tgcttctctgactttcttgctgccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagtagtggatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 23023674  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23023675 ggtatagctttgacaagtgctcctctgattatgtgatgcttcttgtaaagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaatagcagctccttctt 23023774  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23023775 catcaccgaccaagtcaccaataccatcttcaagtatgtcccat 23023818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 21126144 - 21125497
Alignment:
Q  73 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| || || || |  |||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |    
T  21126144 ggatcctcatcagaatccccatcaggagattcttcttcagattccacgacctttaatgcttttgaagactttccttttgattgtatagcaatggatttgc 21126045  T
Q  173 tcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21126044 ttttcttgaaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctc 21125945  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | | || ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21125944 aatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaggcttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacataacttttcttcagtatttgaagtcca 21125845  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21125844 gaaactagagtctgaaatcttcagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactaatgaacaagcataagagcttttgctt 21125745  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtat 572  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21125744 ctctgactttcttactgccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtat 21125645  T
Q  573 agctttgacaagtgctcctcggattgtgtgat-----gcttcttgaagaatttattctgaacag----gagtatgctttcttctatcaacagcagctcct 663  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||     |||||||| ||| ||| || ||| |||    ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  21125644 agctttgacaagtgctcttctgattatgtgatgcttagcttcttgtagagtttcttttgatcaggatcgagtatgctttctcctatcaatggcagctcct 21125545  T
Q  664 tcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21125544 tcttcatcaacaaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 21125497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 21196474 - 21195875
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21196474 agtaggatcttcatctgaacctccatctggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttccctttagatggtagatcaattgat 21196378  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    ||||||||| |   ||  ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21196377 ttactcttcttagcaggctcatgttcatttagagttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagctt 21196278  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaag 368  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||    
T  21196277 cctcaatagcagtgaccttacgtctccatctagaaggtaagtttcttagtatcttgctcacgtgatcaaaagctacatagcatttcttcagtatttgaag 21196178  T
Q  369 tccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttttt 468  Q
    ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21196177 tccaggaactagagtctaaaatcttgagtacatttcctcaatactttcaacatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctttt 21196078  T
Q  469 gcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21196077 gcttctctaactttcttgctaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacatttcgttagcagtagatttgttactcatcttcatatactctactttag 21195978  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttc 668  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  21195977 gtatagctttgacaagtgctcatctgatcgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatatcagctacttcttc 21195878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 68 - 711
Target Start/End: Original strand, 20943069 - 20943706
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||   |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20943069 cagtaggattttcatctgaatctccattaggtgattcttcttcagattcaac---tttaagagctctttatgactttcctttagatggtagagcaattga 20943165  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaa---------gacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaa 258  Q
    |||||||||| |   ||| ||||||||||| |         |||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  20943166 tttactcttcttagcagactcatgttcatttactcttctttgactaatctcatgaactttgatagacctgacaagatcttcaacacctaaagtgtttaaa 20943265  T
Q  259 tctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttca 358  Q
    |||||||||||             ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |   | |||||||||||||    
T  20943266 tctttagcttca------------accttaggtctccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagtttcttagcttttcttca 20943353  T
Q  359 gtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20943354 gtatttgaagtccagaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttccttttgaacaactcatactaatgaacaagcat 20943453  T
Q  459 aagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatac 558  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20943454 aagagcttttgcttttctaactttcttactacctttatagtttgcacagagagaagcaaacattgccttagcattagatttttcactcatcttcatatac 20943553  T
Q  559 tctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcag 658  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20943554 tctgctttaggtataactttgacaagtgctcctctaattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttcttagtaggagtatgttttcttctatcaacaacag 20943653  T
Q  659 ctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  20943654 ctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaacatcatcttcaagtatgtcccat 20943706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 73 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 21207593 - 21207057
Alignment:
Q  73 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || ||| ||| |||||||||||| |    
T  21207593 ggatcctcatcagaatccccatcaggagattcttcttcagattccacgaccttaaatgcttttgaagactttccatttgatagtaaagcaatggatttgc 21207494  T
Q  173 tcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21207493 ttttcttgaaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctc 21207394  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| | || | ||||||||||||| ||||| | | || ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21207393 aatagcaatcacctttggtctccatctagcaggtaggcttatgagtatcttgctcacatgatcagaagctacatatcttttcttcagtatttgaagtcca 21207294  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  21207293 gaaactagagtctgaaatcttgaatacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatattgatgaacaagcataaaagcttttgctt 21207194  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaa----ttaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 568  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21207193 ctctgactttgttattgccttcaaagttagcacagagagaagcaaacattgtacgttctagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttag 21207094  T
Q  569 gtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatg 605  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21207093 gtataactttgacaagtgctcctctgattatgtgatg 21207057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 68 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 25450043 - 25449611
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25450043 cagtgggatcttcgtcagaatctccatcaggtgatttttcttcagactcggcaacttttagaacttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgga 25449944  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25449943 tttactctttttggaaggttcatgctcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgataagatcttcaacactgaaagtgtttaaatctttagct 25449844  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttg-taggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttca 366  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| |  ||| ||| |||| || |||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25449843 tcctcaatggcagtcacttttggtctccatctagaaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaggctacatagcttttcttcagtatttga 25449744  T
Q  367 agtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttt 466  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25449743 agtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagctt 25449644  T
Q  467 ttgcttctcttactttcttattaccttcatagt 499  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25449643 ttgcttctctgactttcttgctaccttcatagt 25449611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 237 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22431580 - 22431253
Alignment:
Q  237 ttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataa 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  22431580 ttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgcaggtaagcttctaagtctcttgctcacatgatca 22431481  T
Q  337 aaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaaca 436  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22431480 gaggctacatagcttttcttcagtatttaaagtccaggaactagagtctaaaatcttgagtacatttgctcaatactttgatcatctttcattttgaaca 22431381  T
Q  437 actcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtaga 536  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  22431380 actcatactgatgaacaagcataaaagcttttgcttctctaactttcttactgccttcatagttagcactgagagaagcaaacattgacttagcagtgga 22431281  T
Q  537 tttgtcactcatcttcatatactctgct 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22431280 tttgtcactcatcttcatatactctgct 22431253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 18613474 - 18613740
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18613474 cagtaggatcttcatcagaatctccatatggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgactcccctttagatggcagagcaatgga 18613573  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||  ||||||||||| | |||||||||||  || || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18613574 tttactcttcttagcaggctcatgttcatttaaacttatctcatgaacctttagagagcttacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 18613673  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgat 334  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  18613674 tcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagtaggtaagcttctcagtatcttgctcacatgat 18613740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 12739650 - 12740072
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  12739650 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 12739749  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  12739750 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 12739849  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  12739850 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 12739949  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  12739950 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 12740049  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12740050 gtagatttgtcactcatcttcat 12740072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 51630878 - 51630469
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  51630878 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 51630779  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  51630778 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 51630679  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| |    
T  51630678 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaaaagttcatac 51630579  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  51630578 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 51630479  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  51630478 tcattttcat 51630469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 560
Target Start/End: Original strand, 9345200 - 9345574
Alignment:
Q  183 agattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtc 282  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||||||    | ||||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  9345200 agattcatgttcattaagaccaatctcatgaaccttgagagagcttctaatatctttaacacttagaatgtttaaatccttaacttcctcaatagtagta 9345299  T
Q  283 acctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccaggg 382  Q
    || || ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||   || ||||| |||||||||||||| | ||||||| | || | ||    
T  9345300 actttaggtctccatcaagcaggtaagcttcttagaatcttgttcacatgagaa---gctacataacttttcttcagtatctgaagtccagagactatgg 9345396  T
Q  383 tctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttacttt 482  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||    
T  9345397 tctgaaaccttgagtacatagcctcaatgctttcatcatcattcatcttgaacaacttatactgatgagcaagcataatagcttttgcttctttgacttt 9345496  T
Q  483 cttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactc 560  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345497 cttgttaccttcatagttagcacacaaggaagcaaacattgctttagaagtagatttgtcactcatcttcatatactc 9345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35639738 - 35639315
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  35639738 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 35639639  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  35639638 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 35639539  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  35639538 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 35639439  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttg-cttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaac 530  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| | ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |    
T  35639438 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagccttcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgc 35639339  T
Q  531 agtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  35639338 agtagatttgtcactcattttcat 35639315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12616009 - 12615600
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  12616009 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 12615910  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  12615909 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 12615810  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  12615809 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 12615710  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  12615709 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 12615610  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  12615609 tcattttcat 12615600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 36238116 - 36237707
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  36238116 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 36238017  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  36238016 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 36237917  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  36237916 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 36237817  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  36237816 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 36237717  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  36237716 tcattttcat 36237707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 277
Target Start/End: Original strand, 17720182 - 17720388
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17720182 cagtaggattttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgatgactttcctttagatggtagagcaataga 17720278  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    ||||||| || |   || |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17720279 tttactcctcttagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagct 17720378  T
Q  268 tcctcaatag 277  Q
    ||||||||||    
T  17720379 tcctcaatag 17720388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 4176424 - 4176846
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || ||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  4176424 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggttttatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 4176523  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  4176524 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 4176623  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  4176624 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 4176723  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  4176724 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 4176823  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4176824 gtagatttgtcactcatcttcat 4176846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 19186327 - 19186749
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  19186327 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 19186426  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  19186427 agatcttcaacacttaacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 19186526  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  19186527 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 19186626  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  19186627 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagttttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 19186726  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19186727 gtagatttgtcactcatcttcat 19186749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 3180736 - 3181145
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  3180736 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 3180835  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  3180836 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 3180935  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  3180936 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 3181035  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| | ||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  3181036 tgatgaactaacatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 3181135  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  3181136 tcattttcat 3181145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 5842339 - 5842748
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  5842339 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 5842438  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  5842439 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 5842538  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  5842539 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 5842638  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| | ||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  5842639 tgatgaactaacatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatggccttcgcagtagatttgtcac 5842738  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  5842739 tcattttcat 5842748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 22017627 - 22018111
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22017627 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagatttatt 22017726  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| || || ||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22017727 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtactttgagggaactgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 22017826  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | || || | | |||||||| || ||||| |||||||  ||||||     
T  22017827 atggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacataatcagaagcaacataactcttcttaagtatttgcagtccag 22017926  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||  |  ||||||||    
T  22017927 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatattgaacagctcataatgatgaactagcataaatgcctttgcttc 22018026  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagag-agaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  22018027 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagttgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactctttttcatata 22018111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 47609702 - 47609213
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttt--aag-------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||  |||       || |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  47609702 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 47609603  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  47609602 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 47609503  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  47609502 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtattt 47609403  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  47609402 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 47609303  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  47609302 tttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcattttcat 47609213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 38104140 - 38104629
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaacttt--aag-------agcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||  |||       || |||||| | ||| ||||||||||||| | ||||    
T  38104140 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaaccaat 38104239  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  38104240 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 38104339  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  38104340 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtattt 38104439  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||     
T  38104440 gcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagc 38104539  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  38104540 tttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 38104629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 21876270 - 21876692
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  21876270 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 21876369  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  21876370 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 21876469  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  21876470 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 21876569  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  21876570 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgca 21876669  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21876670 gtagatttgtcactcatcttcat 21876692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 7516409 - 7516828
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  7516409 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 7516508  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgct--cat--------atgat 334  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| ||  |||        |||||    
T  7516509 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagacatgat 7516608  T
Q  335 aaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaa 434  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7516609 cagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatctttcattctgaa 7516708  T
Q  435 caactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagta 534  Q
     |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||    
T  7516709 aagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagta 7516808  T
Q  535 gatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  7516809 gatttgtcactcattttcat 7516828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22445104 - 22444931
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22445104 cagtagaatcttcatcaaaatctccattaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggttgagcaatgga 22445005  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaa 241  Q
    |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  22445004 tttactcttcttagaggattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaataagatcttcaa 22444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22450338 - 22450165
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22450338 cagtagaatcttcatcaaaatctccattaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggttgagcaatgga 22450239  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaa 241  Q
    |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  22450238 tttactcttcttagaggattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaataagatcttcaa 22450165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 20874986 - 20874499
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20874986 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 20874887  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||  ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  20874886 cttcttagaggattcattctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcatca 20874787  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtt----tcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagt 369  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |    ||| || |||||||| | ||||| | | |||||||  || |||||||||||||  |||    
T  20874786 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagatagattctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacatgactcttcttcagtatttgcagt 20874687  T
Q  370 ccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttg 469  Q
    ||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||    
T  20874686 ccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttg 20874587  T
Q  470 cttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||| | || |||||  |||| || ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20874586 cttctttaaccttcttgctaccctcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 20874499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5641355 - 5640987
Alignment:
Q  186 ttcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacc 285  Q
    |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  5641355 ttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttact 5641256  T
Q  286 tttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtct 385  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  || |    
T  5641255 ttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagttt 5641156  T
Q  386 gaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctt 485  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||    
T  5641155 gaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttctt 5641056  T
Q  486 attaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
      | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5641055 gctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcat 5640987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 554
Target Start/End: Original strand, 38093635 - 38094003
Alignment:
Q  186 ttcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacc 285  Q
    |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  38093635 ttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttact 38093734  T
Q  286 tttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtct 385  Q
    || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |    
T  38093735 ttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagttt 38093834  T
Q  386 gaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctt 485  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||    
T  38093835 gaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttctt 38093934  T
Q  486 attaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
      | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  38093935 gctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcactcattttcat 38094003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7691170 - 7690845
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  7691170 ttttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 7691071  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  7691070 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 7690971  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  7690970 ggtcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 7690871  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagca 457  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||    
T  7690870 gaaaagttcatactgatgaactagca 7690845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 551
Target Start/End: Original strand, 22958547 - 22958878
Alignment:
Q  220 agagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagta 319  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||  | ||||| |    
T  22958547 agagagcttatgagatcttcaagacttagagtgtttagatctctggcttcttcaatagttgtcaccttaggtctccacttaacaggtaaagtccttagaa 22958646  T
Q  320 tcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatc 419  Q
    ||||  ||| ||||| |    | ||||||||||||||  | || | |||| || |||| ||  ||| ||| |||||||||||    |||||   ||||||    
T  22958647 tcttcttcacatgatcagcaactacatagcttttcttttgaatctgaagttcagaaactagattcttaaaccttgagtacatagtttcaatgtcttcatc 22958746  T
Q  420 atctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaac 519  Q
    |||||||||| || |||  ||||  || |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22958747 atctttcattctggacagttcataatgctgaacaagcatggtagtttttgtttctctgactttcttgtcaccttcatagtttgaacacaaagaagcaaac 22958846  T
Q  520 attgaattaacagtagatttgtcactcatctt 551  Q
    ||||  | | |||||||||| |||||| ||||    
T  22958847 attgcttaagcagtagatttatcactcgtctt 22958878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 27857370 - 27857580
Alignment:
Q  343 acatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcat 442  Q
    ||||| ||||||||||| |  | ||||||| | || || |||||||| |||||||||||   ||||||   |||||| | ||||||| | || ||||| |    
T  27857370 acataacttttcttcagaacctgaagtccagagactagagtctgaaaccttgagtacatagactcaatgtcttcatcttatttcattctaaaaaactcgt 27857469  T
Q  443 gctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtc 542  Q
     ||||||||||||||||  || |||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  ||  |||||||||| ||    
T  27857470 actgatgaacaagcatagtagctttaccttatctgactttcttgttaccttcatagtttgaacacaaggaagcaaacattgcttttgcagtagatttatc 27857569  T
Q  543 actcatcttca 553  Q
    | | |||||||    
T  27857570 atttatcttca 27857580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 3180656 - 3180699
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3180656 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3180699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5641483 - 5641440
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5641483 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5641440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 5842259 - 5842302
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5842259 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5842302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 7516329 - 7516372
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7516329 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 7516372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7691237 - 7691194
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7691237 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 7691194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12616089 - 12616046
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12616089 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 12616046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 21876203 - 21876246
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21876203 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 21876246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 35639805 - 35639762
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35639805 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 35639762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 36238196 - 36238153
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36238196 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36238153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51630958 - 51630915
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51630958 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 51630915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 4176357 - 4176400
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4176357 gatcttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4176400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 19186260 - 19186303
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19186260 gatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19186303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5641416 - 5641374
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactc 174  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641416 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactc 5641374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 117
Target Start/End: Original strand, 12739584 - 12739626
Alignment:
Q  75 atcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  12739584 atcttcatcagaatctccatcgggtgattcttcttcagattca 12739626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 7690678 - 7690589
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||| |   |||||||| |||  || ||||| ||||||||||||    
T  7690678 ttctgagcaggagtatgtattcttctgtctaaagcagctccttcttcatctaaatccaagtcatcaactccatcttccagtatgtcccat 7690589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 707
Target Start/End: Original strand, 26940710 - 26941351
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26940710 cagtagggtcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaattga 26940809  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||||||| |   ||  || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26940810 tttactcttcttagtaggctcctgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagct 26940909  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacc--tttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttc 365  Q
    |||||||||||| | |||  || ||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||  || || |||||  | |||||||||||||     
T  26940910 tcctcaatagtaataaccaattaggtgtccatctagcaggtaagcttcttaatatcttgctcaaatgatctaaagctacatacttgttcttcagtatttg 26941009  T
Q  366 aagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtt 465  Q
    |||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26941010 aagttcataaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcctctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagct 26941109  T
Q  466 tttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctt 565  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  26941110 tttgcttctctgactttcttactaccttcatagtttgcacagggagaagcaaacattgccttagcaatagatttatcactcatcagcatatactctgctt 26941209  T
Q  566 taggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttc 665  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||    
T  26941210 taggtatagcagtgacaagtgcccctctgattgtgtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtgtgtttccttttatcaatagcagctccttc 26941309  T
Q  666 ttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  26941310 ttcatcaaggactaattcaccaacaccatctttaagtatgtc 26941351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 68 - 698
Target Start/End: Original strand, 17926092 - 17926722
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||   | |||||| ||    
T  17926092 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcatattcaataactttaagagctttatatgactttactttagatttcatagcaataga 17926191  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||    
T  17926192 tttattcttctttgaagattcatgctcatttagactcatttcatgaactttgagagagctaacaagatctttaacacttaaagtgtttacatctttcgct 17926291  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    | |||||||| ||| | ||| ||||||||||| | ||| ||  |||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17926292 ttctcaatagaagtaaacttaggtctccatctagcaggaaaacttctcaatatcttgctcaaatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgaa 17926391  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||  ||    
T  17926392 gtccagagactagggtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatccttcatcttgaataactcatactaatgaataagcataagagcctt 17926491  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||    |    
T  17926492 tgcctctctaaacttcttactaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattgcctttgcagtaaatttgtcactcatcttcacgtactctgtgcga 17926591  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    |||||||     ||||| | |||||  ||  |||||||||||||| | | ||| |||||| |||| || || ||  || |||||| ||||||||||||||    
T  17926592 ggtatagaagcaacaagggttcctctcatcttgtgatgcttcttgtaaagtttcttctgagcaggggtgtgtttctttttatcaatagcagctccttctt 17926691  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
     |||||   |||||||||||| |||||||||    
T  17926692 aatcaagagccaagtcaccaacaccttcttc 17926722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 369
Target Start/End: Original strand, 19450385 - 19450678
Alignment:
Q  73 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19450385 ggatcttcatctgaatctccatcaggtgattgttcttcagatttaac---tttaagagcttttgatgacttttctttagatggtagagcaatagatttac 19450481  T
Q  173 tcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
    ||||  |   || |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19450482 tcttattagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagggctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctg 19450581  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagt 369  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19450582 aatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagcgacatagcgtatcttcagtatttgaagt 19450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 369
Target Start/End: Original strand, 19448391 - 19448684
Alignment:
Q  73 ggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttac 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19448391 ggatcttcatctgaatctccatcaggtgattgttcttcagatttaac---tttaagagcttttgatgacttttctttagatggtagagcaatagatttac 19448487  T
Q  173 tcttcct-gaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcct 271  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19448488 tcttattagcaag-ttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagggctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcct 19448586  T
Q  272 caatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagt 369  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19448587 gaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagcgacatagcgtatcttcagtatttgaagt 19448684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Original strand, 27502838 - 27503263
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  27502838 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 27502937  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  27502938 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacat 27503037  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  27503038 gatcagaagcaacatagcttttcttcagaatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattct 27503137  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| || ||| | || |||||| | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  27503138 gaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttactgccttcaaagttggcacatagtgatgcaaacatagcctttgca 27503237  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27503238 gtagatttgtcactcatcttcatata 27503263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 28253235 - 28252810
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  28253235 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 28253136  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  28253135 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacat 28253036  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  28253035 gatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattct 28252936  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  ||    
T  28252935 gaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgca 28252836  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28252835 gtagatttgtcactcatcttcatata 28252810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 557
Target Start/End: Original strand, 17062705 - 17063180
Alignment:
Q  82 tcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctga 181  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||    ||||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |      
T  17062705 tcagaatctccatttggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttag 17062804  T
Q  182 aagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagt 281  Q
    | |||||||| | ||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||  || ||||||| ||| |||||||||||||| | |||    
T  17062805 aggattcatgctaattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacacaaggtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 17062904  T
Q  282 cacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagg 381  Q
     || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || | |    
T  17062905 tactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgaagtccagatactaag 17063004  T
Q  382 gtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactt 481  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |    
T  17063005 gtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgatcaagcataagagtttttgcttccttaacct 17063104  T
Q  482 tcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||||  ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||  ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  17063105 tcttgctaccttcgtagttagcacagattgatgcaaacattgctttctcagtggatttatcactcattttcatata 17063180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 25984611 - 25985033
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  25984611 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 25984710  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  25984711 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 25984810  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  25984811 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 25984910  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  25984911 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 25985010  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  25985011 gtagatttgtcactcattttcat 25985033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 12864078 - 12864487
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  12864078 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaaaac 12864177  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  12864178 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 12864277  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  12864278 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 12864377  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  12864378 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 12864477  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  12864478 tcattttcat 12864487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 478 - 711
Target Start/End: Original strand, 18434230 - 18434462
Alignment:
Q  478 actttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctt 577  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18434230 actttcttactgccttcatagttagcacagagagaagaaaacattgacctagcagtggatttgtcactcaacttcatatactctactttaggtatagatt 18434329  T
Q  578 tgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgac 677  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  18434330 tgacaagtgctcctctacttgtgtgatgcttcttgtagaatttcttatgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacggc 18434429  T
Q  678 caagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||| |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18434430 caactcactaata-catcttctagtatgtcccat 18434462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 27383204 - 27383696
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga---------cttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    |||||||| ||         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  27383204 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcttttgaggattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 27383303  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||  ||    
T  27383304 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcccta 27383403  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  27383404 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 27383503  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| | ||     
T  27383504 gcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcatcaaagc 27383603  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | |  |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27383604 tttagcctctttcaacttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttttcacccatcttcatata 27383696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 27473588 - 27474080
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga---------cttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    |||||||| ||         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  27473588 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcttttgaggattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 27473687  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||  ||    
T  27473688 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcccta 27473787  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  27473788 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 27473887  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| | ||     
T  27473888 gcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcatcaaagc 27473987  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | |  |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27473988 tttagcctctttcaacttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagcctttgcagtagatttttcacccatcttcatata 27474080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 17610319 - 17609836
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  17610319 gatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 17610220  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17610219 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 17610120  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  17610119 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 17610020  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  17610019 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 17609920  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  17609919 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 17609836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9114160 - 9113738
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  9114160 ttttgaagtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 9114061  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  9114060 agatcttcaacacttaaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 9113961  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  9113960 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 9113861  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||    
T  9113860 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagtttgcacatagtgaagcaaacatagccttagca 9113761  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9113760 gtagatttgtcactcatcttcat 9113738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Original strand, 26873936 - 26874358
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  26873936 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 26874035  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  26874036 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgagtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 26874135  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  26874136 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 26874235  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  26874236 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 26874335  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  26874336 gtagatttgtcactcattttcat 26874358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32963613 - 32963191
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  32963613 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 32963514  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  32963513 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 32963414  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  32963413 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 32963314  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  32963313 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 32963214  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  32963213 gtacatttgtcactcattttcat 32963191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 3670591 - 3671000
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  3670591 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 3670690  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  3670691 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 3670790  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  3670791 atagcttttctttagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 3670890  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  3670891 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 3670990  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  3670991 tcattttcat 3671000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 26034567 - 26034976
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  26034567 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 26034666  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  26034667 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 26034766  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  26034767 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 26034866  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  26034867 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 26034966  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  26034967 tcattttcat 26034976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 508 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 14054779 - 14054576
Alignment:
Q  508 agagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgct 607  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14054779 agagaagcaaacattgatttagcagtagatttgtcactcatcttcatgtactcagccttaggtataactttgacaagtgcacctctgattgtgtgatgct 14054680  T
Q  608 tcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    ||||| ||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14054679 tcttgtagagtttcttttgagcaggagtatgacttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaactatcaagtcaccaataccatcttccagtatgtc 14054580  T
Q  708 ccat 711  Q
    ||||    
T  14054579 ccat 14054576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17447366 - 17446991
Alignment:
Q  187 tcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacct 286  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |  || ||||| || |  |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| || |    
T  17447366 tcatgctcattaagactaatctcataaatcttgagagaactcataagatcttcaacacttagaatgtttaaatccttagcttcctcaatagcagtaactt 17447267  T
Q  287 ttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctg 386  Q
    | ||||||||||| | ||||||| || | |  ||||| |||| ||||||| | || ||||| |||||||||  ||||| ||||||| | || |  |||||    
T  17447266 taggtctccatctagcaggtaagcttatcataatcttactcacatgataagaagctacataacttttcttccatatttgaagtccagagactatagtctg 17447167  T
Q  387 aaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctta 486  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||||||    
T  17447166 aaatcttgagtacatagcctcaatactttcgtcatttttcttcttgaacaactcatactgatgaacaagcatagtagtctttggttctctaaccttctta 17447067  T
Q  487 ttaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctg 562  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17447066 ctaccttcatagtttgcacaaagtgaagcaaacattacctttggagtagatttgtcactcatcttcagatactctg 17446991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 22307269 - 22307752
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22307269 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 22307368  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22307369 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 22307468  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||| ||||||| | | | ||| |||| || ||| |||| |  |||| | | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  22307469 atggcagttactttgggtgtccatctagaatgcaagcttctcagaatcctgctaacgtgatcagaagcaacataacttttcttcagtatttgcagtccag 22307568  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || || ||||||||    
T  22307569 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaactagaattagtgtctttgcttc 22307668  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  || |||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22307669 tttaaccttcttgctatcttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 22307752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 22385084 - 22385567
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22385084 gatcttcatcagaatctccgtctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatgggtttcctttagatggtagagcaatagatttatt 22385183  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | || ||||| ||||| || || || ||||  || || || ||  |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22385184 cttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaaatgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 22385283  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  22385284 atggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 22385383  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  22385384 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcacccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttc 22385483  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22385484 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 22385567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34808829 - 34808407
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  34808829 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 34808730  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  34808729 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttaggttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttggaggtaagcttctcaaaatcttactaacat 34808630  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  34808629 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactgtcatcatccttcattct 34808530  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| |||| |||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  34808529 gaaaagttcatactgacgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 34808430  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  34808429 gtagatttgtcactcattttcat 34808407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 26042662 - 26043155
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatga---------cttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||    |||||||| ||         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  26042662 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttgtaggcttttgaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 26042761  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| || ||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  26042762 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcattttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 26042861  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  26042862 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcaacatagcttttcttcagtattt 26042961  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      | |||| ||||||  || ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| ||||     
T  26042962 gcaatccagaaaccaaagtttgaaatcctgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaacaagcattagagc 26043061  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattg-aattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    ||| || ||| | || |||||    |||||| |||| ||||| || ||  ||||||| |   ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043062 tttagcctctttcaccttcttgcggccttcaaagttggcacatagtgacacaaacatagcctttggcagtagatttgtcactcatcttcatata 26043155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12718503 - 12718081
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  12718503 ttttgaggtctttcctttagatggtaaagcaatagatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 12718404  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||    
T  12718403 agatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacat 12718304  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  12718303 gatcagaagaaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 12718204  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  ||    
T  12718203 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgca 12718104  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12718103 gtagatttgtcactcattttcat 12718081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 366 - 592
Target Start/End: Original strand, 19469216 - 19469441
Alignment:
Q  366 aagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtt 465  Q
    ||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  19469216 aagtccataaactagagtcttaaatcctgagtacatttgctcattactttcatcaacttttattttgaacaactcatactgataaactagcataagagct 19469315  T
Q  466 tttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctt 565  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19469316 tttgcttatctaactttcttactaccttcatagtttgcatagagagaagcaaacattgccttagaggtggatttgtcactcatcttcatatactatgctt 19469415  T
Q  566 taggtatagctttgacaagtgctcctc 592  Q
    || |||||||  |||||| ||||||||    
T  19469416 ta-gtatagcagtgacaaatgctcctc 19469441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 28331984 - 28331658
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| ||     
T  28331984 ttttgaagtctttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaaca 28331885  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||    
T  28331884 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacat 28331785  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  28331784 gatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgcaatccagaaaccaaagtttgaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattct 28331685  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcat 458  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||    
T  28331684 gaataattcatactgatgaacaagcat 28331658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 16958155 - 16958564
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| ||||| || |||| | |||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  16958155 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgccctttgagtgagctaacaagatcttcaacac 16958254  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  16958255 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 16958354  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  16958355 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 16958454  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  16958455 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacaaagagaagcaaacatagctttcgcagtagatttgtcac 16958554  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  16958555 tcattttcat 16958564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 554
Target Start/End: Original strand, 25804209 - 25804624
Alignment:
Q  139 gacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatctt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  25804209 gactttcctttagatggtagaacaataaatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatctt 25804308  T
Q  239 caagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaa 338  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | |    
T  25804309 caacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcaattactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcaga 25804408  T
Q  339 ggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaac 438  Q
     |  |||||||| |||||||||||||  |||||| | || | ||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  25804409 agtgacatagctcttcttcagtatttgcagtccagatactaaggtttgaaatcttgagtacatctcctatatactctcatcatccttcattttgaacagc 25804508  T
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  25804509 tcatactgataaactagcataagggcctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagttagcacaaagtgatgcaaacattgccttagcagtggatt 25804608  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  25804609 tatcactcatcttcat 25804624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Original strand, 27411632 - 27412041
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  27411632 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 27411731  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  27411732 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 27411831  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  27411832 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 27411931  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  27411932 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 27412031  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  27412032 tcatcttcat 27412041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32302700 - 32302291
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  32302700 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 32302601  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  32302600 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 32302501  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  32302500 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 32302401  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  32302400 tgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 32302301  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    ||||||||||    
T  32302300 tcatcttcat 32302291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 11204439 - 11204923
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| || |    
T  11204439 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcatattcactggccttgtaagctttggatgactttgctttagatagtagagcaatagatctatt 11204538  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcatta-agacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
    |||| |  | |||||||| |||||  ||||| || || |  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  11204539 cttctttgaggattcatgctcattcgagactcatttcgtgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgttcagatccttagcttcctc 11204638  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||    
T  11204639 aatggcagtcactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtcca 11204738  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     | |  |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||| |||    
T  11204739 gatattaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcatgagtgccttttctt 11204838  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    || | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11204839 ctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 11204923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 20031588 - 20031166
Alignment:
Q  132 ttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacg 231  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| | ||| | ||| || |||| |||||| || || || ||     
T  20031588 ttttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctaatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 20031489  T
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  ||||| || | ||    
T  20031488 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaatcttactaacat 20031389  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |    
T  20031388 gatcagaagcaacatagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattct 20031289  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaaca 531  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| | || |||||  | |||||| |||| || || || || |||||||| |  ||  ||    
T  20031288 gaaaagttcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctctttcaccttcttgctgccttcaaagttggcgcatagtgacgcaaacatagctttcgca 20031189  T
Q  532 gtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  20031188 gtggatttgtcactcatcttcat 20031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 145 - 458
Target Start/End: Original strand, 27350892 - 27351205
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  27350892 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 27350991  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | |||||    
T  27350992 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagcaac 27351091  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  27351092 atagcttttcttcagtatctgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 27351191  T
Q  445 tgatgaacaagcat 458  Q
    |||||||| |||||    
T  27351192 tgatgaactagcat 27351205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 557
Target Start/End: Original strand, 18553768 - 18554248
Alignment:
Q  76 tcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactct 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||     | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  18553768 tcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcgctggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatttt 18553867  T
Q  176 tcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaat 275  Q
    || |  | ||||| || ||||| ||||| || ||||  || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18553868 tctttgaggattc-tgctcattcagactcatttcatgtaccttgagagaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaat 18553966  T
Q  276 agtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaa 375  Q
     | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| |  |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  | |||| |     
T  18553967 ggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcataatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcattccagat 18554066  T
Q  376 accagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctc 475  Q
    || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||| ||||| || |  |||||||||     
T  18554067 actaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagcttatactgatgaactagcatgagtgcctttgcttctt 18554166  T
Q  476 ttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | ||  ||||  ||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18554167 taaccgtcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgtaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 18554248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14055119 - 14054782
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||  | | |||   ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14055119 gatcttcatcagaatccccatctggtgattcttcttcagattcactagccttatatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaatggatttact 14055020  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| || || |  ||||  || || ||||| || || |||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14055019 cttctttgaggattcatgctcatttaggctcaattcatgaaccttgagagaacttacaagatcttcaacactcaacgtgtttagatccttagcttcctca 14054920  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |  || ||||| | ||||| | | |||||||| || || ||||||||||  |||| |     
T  14054919 atagcagttacctttggtctccatctagaaggcaagcttctcaaaattttgctgacatgatcagaagcaacataactctttttcagtatttgtagtctag 14054820  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaata 411  Q
    | || | ||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  14054819 agactaaggtttaaaaccttgagtacatttcctcaata 14054782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 340 - 562
Target Start/End: Original strand, 19874455 - 19874669
Alignment:
Q  340 gcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaact 439  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19874455 gcaatataacttttcttcaatatttgaagtccatagactagagtctgaaatcttgagtacatagccttaatactttcatcatctttca-cttgaacaact 19874553  T
Q  440 catgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagattt 539  Q
    |||  | ||||| |||||||  ||  ||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||         |||||||    
T  19874554 catagtaatgaagaagcatagtagccttttcttctctaaccttcttactaccttcatagtttgcacatagagaggcaaacattg-------cttagattt 19874646  T
Q  540 gtcactcatcttcatatactctg 562  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  19874647 gtcactcatcttcagatactctg 19874669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25725886 - 25725744
Alignment:
Q  415 tcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaag 514  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || |    
T  25725886 tcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatg 25725787  T
Q  515 caaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  25725786 caaacattgccttagcagtgaatttatcactcatcttcatata 25725744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 707
Target Start/End: Original strand, 19469475 - 19469559
Alignment:
Q  623 tctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  19469475 tctgagcaggagtatgttttcttctatcaataacatctccttcttcatctaggaccaagtcaccaacaccatcttcaattatgtc 19469559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 17056529 - 17056632
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    ||||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  17056529 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 17056628  T
Q  174 cttc 177  Q
    ||||    
T  17056629 cttc 17056632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 3670511 - 3670554
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3670511 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3670554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 12863998 - 12864041
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12863998 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 12864041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 16958075 - 16958118
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16958075 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16958118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20031655 - 20031612
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20031655 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 20031612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25723461 - 25723358
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  25723461 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 25723362  T
Q  174 cttc 177  Q
    ||||    
T  25723361 cttc 25723358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 25984544 - 25984587
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25984544 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 25984587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 26034487 - 26034530
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26034487 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26034530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 26873869 - 26873912
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26873869 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26873912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27350812 - 27350855
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27350812 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27350855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27411552 - 27411595
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27411552 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27411595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28253302 - 28253259
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28253302 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 28253259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28332051 - 28332008
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28332051 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 28332008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32302780 - 32302737
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32302780 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 32302737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32963680 - 32963637
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32963680 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 32963637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34808896 - 34808853
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34808896 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 34808853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 671
Target Start/End: Original strand, 6156933 - 6157215
Alignment:
Q  389 atcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttatt 488  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| |   |||| || ||| | || |||||  |    
T  6156933 atcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaatagttcatactgatgaactagcatcaattttttagcctctttcaccttcttgct 6157032  T
Q  489 accttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgct 588  Q
     || ||| |||| ||||| || || |||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||     ||||         
T  6157033 gccctcaaagttggcacatagtgacgcaaacatagccttcgcagtagatttgtcactcatcttcatatattcggtgcgaggtatagaagccacaataatc 6157132  T
Q  589 cctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatc 671  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| | |  || |||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6157133 cctctgattttgtggtgcttcttgtaaagcttcttctgagcaggagtatgtattcttctgtctacagcagctccttcttcatc 6157215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13138052 - 13137912
Alignment:
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | | || || |||||  | || | ||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  13138052 agatcttcaacaattagagtgtttaaatctttagattcttcaatagcaataactttaggtcttaacctagcaggtaagcttcttagaatcttgctcacat 13137953  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||| | |  |  |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13137952 gatcagaaactgcataacttttcttcagtaattgaagtcca 13137912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12718570 - 12718527
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  12718570 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagactca 12718527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Original strand, 27502771 - 27502814
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  27502771 gatcttcatcagaatctcgatcaggtgattcttcttcagattca 27502814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 629 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17446926 - 17446857
Alignment:
Q  629 caggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||    
T  17446926 caggagtatacttctttctatcaatagcaactccttcttcatcaagggccaaatcaccaacaccatcttc 17446857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20031098 - 20031009
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| || |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |   |||||||| |||  || ||||| ||||||||||||    
T  20031098 ttctgagcaagagtatgtattcttctgtccacagcagctccttcttcatctaaatccaagtcatcaactccatcttccagtatgtcccat 20031009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 708
Target Start/End: Original strand, 6966 - 7603
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6966 cagtaggatcttcacctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttccctttagatggtagagtaattga 7062  T
Q  168 tttactcttcct-gaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagc 266  Q
    |||||||||| | | ||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  7063 tttactcttcttagcaagct-catgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatatttagc 7161  T
Q  267 ttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttca 366  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | || |||||||||||||||||||||| |    
T  7162 ttcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggtaagcttcttagtatcttgctcacaggatcagaagctacatagcttttcttcagtatttga 7261  T
Q  367 agtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagttt 466  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  7262 agtccaaaaactagagtctgaaatcttgagtacatttcctcaatactttcatcatcttttattttgaacaactcatactgatcaacaagcatgagagctt 7361  T
Q  467 ttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 566  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362 ttgcttctctaactttcttgctaccttcgtagtttgcacatagagaagcaaacatttccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttt 7461  T
Q  567 aggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttct 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  7462 aggtatagctttgacaagtgctcctctgatcgtgtgatgcttcttctagagtttcttctgagcagaagtatgttttcttctaccaataacagctccttct 7561  T
Q  667 tcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcc 708  Q
    ||||| | ||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  7562 tcatctaggaccaagtcaccaactccatcttcaagtatgtcc 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34670 - 34181
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca---------acaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  34670 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttataagattttgaaacctttcctttagatggtagagcaat 34571  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
    ||||||||||||| |  | || ||||| ||||| | ||| || |||| ||| || || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  34570 ggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 34471  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||  || | ||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  34470 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagtttctcagaatctaactaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtattt 34371  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  34370 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 34271  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34270 ctttgcttctctgacattcttgcttccttcgtaatttgcacagagtgatgcaaacattaccttagcagtggatttatcactcatcttcat 34181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41841 - 41726
Alignment:
Q  439 tcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatt 538  Q
    |||| ||||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||    
T  41841 tcatactgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatt 41742  T
Q  539 tgtcactcatcttcat 554  Q
    ||||||||||||||||    
T  41741 tgtcactcatcttcat 41726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 68 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 1991 - 1349
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  1991 cagtaggatctttatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagatttaataactttaagagttttagatgacttcactttagatggaagagcaataga 1892  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||  ||||| |   ||  ||||||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1891 ttttgtcttcttagtaggctcatgtttatttagacttatctcatgaaccttgagagagttgacaagatcttcaacacttaaaatgtttaaatctttagct 1792  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||| | | ||||| |||| |||||||| |||| ||||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||    
T  1791 tcctcaatagttgtatctttaggtctccatctagcaagtaagcttctcagtatcttactcacatgatcagaagctacatagctcttcttcagtatttgaa 1692  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  1691 gttcaaaaactagagtctgaaatcttgagtacatttgctcaatagtttcatcatctttcattttgaacaactcatacttatgaacaagcataagagcctt 1592  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||  ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||   |    
T  1591 tgactctctaattttcttactaccttcatagtttacacagagagaagcaaacattgcctttgcagtagatttgtcactcattatcatatactctgcacga 1492  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||    ||||||| ||||  |||  |||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1491 ggtatagcaagaacaagtgatcctttgatcttgtgatgcttcttgtagattttcttccgagcaggagtatttttctttctaccaacagcagctccttctt 1392  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtccca 710  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  1391 cataaaggaccaaatcaccaacaccttcttcaagaatgtccca 1349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 385 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 43309 - 42983
Alignment:
Q  385 tgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttct 484  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43309 tgaaaacttgagtacatttgctcaatactttcatcacctttcattttgaacaactcatactgatcaacaagcataagagcttttgcttctcttactttct 43210  T
Q  485 tattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaag 584  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43209 tactaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgatttagcagtagatttgttactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaag 43110  T
Q  585 tgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtca 684  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43109 tgttcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttattctgagtaggagtatgttttcttctatcaacaacaactccttcttcatcaacgaccaagtca 43010  T
Q  685 ccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43009 ccaataccatcttctagtatatcccat 42983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43516 - 43324
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43516 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttcaaagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataga 43417  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatc 260  Q
    ||||||| |  |   ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43416 tttactccttttagtagactcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttaaacacttaaagtgtttaaatc 43324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 711
Target Start/End: Original strand, 17669 - 18014
Alignment:
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17669 gtccagaaactagagtttgaaatcttgagtacatttactcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatactgatgaacaagcataagagtttt 17768  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17769 tgcttctctgactttcttactaccttcatagttcgcacagagagaagcaaacattgacttagcagaggatttttcactcatcttcatatactctgcttta 17868  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  17869 ggtatagctttgacaagtgctccactgattgtgtgatgtttcttgtagaacttcttcggagcaggagtatgttttcttctatcaatagaagctccttctt 17968  T
Q  668 ca--tcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17969 catttcaacgaccaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 18014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 17546 - 17667
Alignment:
Q  188 catgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctt 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17546 catgttcattgagacttatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagaagtcacctt 17645  T
Q  288 tggtctccatcttgtaggtaag 309  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  17646 tgatctccatcttgcaggtaag 17667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 130
Target Start/End: Original strand, 14580 - 14642
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagag 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  14580 cagtaggatcttcatcaaaatcttcatcaagtgattcttcttcagattcaacggctttaagag 14642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 388 - 711
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11565
Alignment:
Q  388 aatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttat 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11243 aatcttgagtacatttggtcaatattttcatcatctttcattttgaacaactcatattaatgaacaagcataagagcttttgcttctcttactttcttac 11342  T
Q  488 taccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgc 587  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11343 taccttcataatttgcacagagagaagcaaacattgacttagcaatagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgc 11442  T
Q  588 tcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcacca 687  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | | ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  11443 tcctctgattgtgtgatgtttcttgtaaagtttcttctgagca-gagtatgttttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaacgaccaactcaaca 11541  T
Q  688 ataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  11542 ataccatcttctagcatgtcccat 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 275
Target Start/End: Original strand, 2545 - 2752
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2545 cagtaggatcttcatcagaatatccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatgga 2644  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2645 tttaatcttcctagaaggttcatgttcattaagacatatctcgtgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatatttagct 2744  T
Q  268 tcctcaat 275  Q
    ||||||||    
T  2745 tcctcaat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 244 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 22561 - 22098
Alignment:
Q  244 cttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| | |  |||    
T  22561 cttaaagtgtttaaatttttagcttccttaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagcttcttagtatcttgctaagatgatcataaacaa 22462  T
Q  344 catagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatg 443  Q
    |||| |  |||||||||||||  |||||| | || ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  22461 cataacacttcttcagtatttgtagtccagagactaggatttgaaaccttgagtacatttcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcata 22362  T
Q  444 ctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtca 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  22361 ctgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgactttcttgttgccttcatagtttgcacaaagagaagcaaacattgccttagcagtggatttgtca 22262  T
Q  544 ctcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttc 643  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||  | |||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||| ||      
T  22261 ctcatcttcatatactttgctttaggcatagcagtgacaagtgctcctctgataatatgatgcttcttgtaaattttcttctgagcaggagtatgtttct 22162  T
Q  644 ttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtc 707  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22161 ttctatcaacaacagctccttcttcatcaaggaccaagtcaccaacaccatcttcaagtatgtc 22098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25889 - 25711
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25889 cagtaggatcttcatcaaagtctccatcaggtgact-cttttcagattcaataactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataga 25791  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagactta 247  Q
    |||||||||| |   ||   |||||||||| |||||||| ||||  || || |||||||| || |||||||||| |||||    
T  25790 tttactcttcttagcaggcgcatgttcatttagacttatttcatgaaccttgagagagctaacaagatcttcaacactta 25711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 283 - 711
Target Start/End: Original strand, 1724 - 2144
Alignment:
Q  283 acctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccaggg 382  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| || |    
T  1724 accttaggtttccatcttgcaggtaagcttcttagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagctcttcttcggtatttgaagtccagaaactagag 1823  T
Q  383 tctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttacttt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1824 tctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattgtgaacaacttatgctgatgaacaagcataagagcttttgcttctctgacttt 1923  T
Q  483 cttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgaca 582  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1924 cttactaccttcatagttttcatagagaaaagcaaacattgccttagcagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaagtataactttgaca 2023  T
Q  583 agtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagt 682  Q
    |||||||         ||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  2024 agtgctc--------ttgtgatgcttcttgtggagttttttctgagcaggagtatgtttctttctatcaatagcaactacttcttcatcaatgaccaagt 2115  T
Q  683 caccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||  | | ||||| ||||||||||||    
T  2116 caccagcatcatcttcaagtatgtcccat 2144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 402 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 7189 - 6880
Alignment:
Q  402 ttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagttt 501  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  7189 ttgctcattactttcatcatctttcattttgaacaactcatactaatgagcaagcataagagcttttgcttcccttactttcttactaccttcatagtta 7090  T
Q  502 gcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgt 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  7089 gcacatagagaagcaaacattgacttaacagtagatttgtcactaatctttatatactctactttaggtatagctttgacaagtgctcctctgattggat 6990  T
Q  602 gatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctag 701  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6989 gatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaagtcaacaataccatcttctag 6890  T
Q  702 tatgtcccat 711  Q
    ||||||||||    
T  6889 tatgtcccat 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 69 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7484 - 7191
Alignment:
Q  69 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7484 agtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggat 7385  T
Q  169 ttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagctt 268  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7384 ttactctttctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaagtttgagagagctgacaagattttcaacacttaaagtgtttaaatatttagctt 7285  T
Q  269 cctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtat 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||    
T  7284 cctcaatagcagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttctaagtatcttgctcacatgatcagaagctacatagcttttcttcagtat 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 66917 - 66577
Alignment:
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  66917 gtccagaaactagagtctgaaatcttgattacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagttcatactgatgaacaagcataagagcctt 66818  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgcttta 567  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  66817 tgcttctctgactttcttacttccttcatagttagcacagagagaagcaaacattgatctagcagtagatttgtcactcatcttcatataatctgcttta 66718  T
Q  568 ggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttctt 667  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  66717 ggtatagctttgacaattgctcctctgattatgtgatgcttcttgtagagtttcttctgattaggagtatgctttctcctatcaatgacagctccttctt 66618  T
Q  668 catcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcc 708  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  66617 catcaacgaccaagtcaccaataccatcttctaatatgtcc 66577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 67173 - 66921
Alignment:
Q  76 tcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactct 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || || | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  67173 tcttcatcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacgacctttaaaacttttgatgactttccttttgatggtagagcaatggattttcttt 67074  T
Q  176 tcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaat 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  67073 tcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaggtgtttaaatctctagcttcctcaat 66974  T
Q  276 agtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctca 328  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||    
T  66973 agcaatcacctttggtctccatctagtaggtcggcttctaagtatcttgctca 66921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 166460 - 165977
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  166460 gatcttcatcagaacctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaatagatttatt 166361  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| || || || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  166360 cttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcttca 166261  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||  ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  166260 atggcagtaaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctctcatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 166161  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  166160 atactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatattgatgaactagcataagtgcctttgcttc 166061  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  166060 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcattttcatata 165977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 8170 - 7859
Alignment:
Q  400 atttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  8170 atttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcctttgcttctctgactttcttgctgccttcatagt 8071  T
Q  500 ttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgt 599  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |    
T  8070 tagcacaaagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaaatgctcttctgattat 7971  T
Q  600 gtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttct 699  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7970 gtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttct 7871  T
Q  700 agtatgtcccat 711  Q
    ||||||||||||    
T  7870 agtatgtcccat 7859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 400 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 1
Alignment:
Q  400 atttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  310 atttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacagctcatactaatgaacaagcataagagcctttgcttctctgactttcttgctgccttcatagt 211  T
Q  500 ttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgt 599  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |    
T  210 tagcacaaagagaagcaaacattgatctagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaaatgctcttctgattat 111  T
Q  600 gtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttct 699  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  110 gtgatgcttcttgtagagtttcttctgagcaggagtatgctttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatcttct 11  T
Q  700 agtatgtccc 709  Q
    ||||||||||    
T  10 agtatgtccc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 398 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 99037 - 98728
Alignment:
Q  398 acatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcata 497  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  99037 acattttctcaatactttcatcatctttcattttgaacacctcatactgatgaacaagcataagtgcttttgcttctcagactttcttactaccttcata 98938  T
Q  498 gtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggatt 597  Q
    ||| ||||| || |||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  98937 gttagcacatagggaaataaacattgacttagcagtggatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtgtagctttgacaagtgctcctctgatt 98838  T
Q  598 gtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttctt 697  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  98837 gtgtgatgcttcttgtagaatttcttctgagcaggagtatgttttcttctatcaatagcagctccttcttcatcaacgaccaagtcaccaataccatatt 98738  T
Q  698 ctagtatgtc 707  Q
    ||||||||||    
T  98737 ctagtatgtc 98728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11870 - 11438
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  11870 cagtaggatcttcatcagagtctccatcaagtgactcttcttctgatttaataactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataaa 11771  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||| ||| |   ||  ||||||||||| |||||||||||||  || || ||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  11770 tttacttttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgagaaagctgacaagatcttcaacacttcaagtttttaaatctttagct 11671  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||| | | ||||| | | ||||  || || |||||| ||||||  |    
T  11670 tcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagatccttagtatcttgttaacatgatcataagcaaagtaactcttcttcggtatttgta 11571  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| | || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  11570 gtccagacactagggtttgaaacgttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataacaacttt 11471  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtt 500  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11470 tgcttccctgactttcttgttgccttcatagtt 11438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16543 - 16111
Alignment:
Q  68 cagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgga 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16543 cagtaggatcttcatcagagtctccatcaagtgactcttcttctgatttaataactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataaa 16444  T
Q  168 tttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagct 267  Q
    |||||| ||| |   ||  ||||||||||| |||||||||||||  || || ||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  16443 tttacttttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgagaaagctgacaagatcttcaacacttcaagtttttaaatctttagct 16344  T
Q  268 tcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaa 367  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||| | | ||||| | | ||||  || || |||||| ||||||  |    
T  16343 tcctcaatagcagtaaccttaggtctccatctagcaggcaagatccttagtatcttgttaacatgatcataagcaaagtaactcttcttcggtatttgta 16244  T
Q  368 gtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttt 467  Q
    ||||| | || ||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  16243 gtccagacactagggtttgaaacgttgagtacatctcctcaatagtttcatcatccttcatcttgaacaactcatactgatgaacaagcataacaacttt 16144  T
Q  468 tgcttctcttactttcttattaccttcatagtt 500  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  16143 tgcttccctgactttcttgttgccttcatagtt 16111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 538 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 11439 - 11266
Alignment:
Q  538 ttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtat 637  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| |    
T  11439 ttgtcacttatcttcatatattctgctttaggtataacagtgacaagtgctcctctgatagtatcatgcttcttgtagagtttcttctgagtaggagtgt 11340  T
Q  638 gctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    | ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  11339 gtttctttctatcaatagcagctcattcttcatcaaggaccaagtcacaaacaccctcttcaagtatgtcccat 11266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 538 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16112 - 15939
Alignment:
Q  538 ttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtatagctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtat 637  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| |    
T  16112 ttgtcacttatcttcatatattctgctttaggtataacagtgacaagtgctcctctgatagtatcatgcttcttgtagagtttcttctgagtaggagtgt 16013  T
Q  638 gctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    | ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  16012 gtttctttctatcaatagcagctcattcttcatcaaggaccaagtcacaaacaccctcttcaagtatgtcccat 15939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 698
Target Start/End: Original strand, 75576 - 76194
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  |    
T  75576 gatcttcatcagaatctccatcagaggattcttcttcagattcaacgactttgagatctttagataactttcctttagatggaagagcaatagatttttt 75675  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaa-gtgtttaaatctttagcttcctc 272  Q
    |||| |   | | ||||| ||||| |||||||| ||||  || || | | |||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |     
T  75676 cttcttagcaaactcatgctcattgagacttatttcatgaaccttgaaatagcttacaagatcttcaacactcaaaagtgtttaaatctttagcttcttt 75775  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||||| ||| || ||  |||||||||  | ||||||| || | || |||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  75776 aatagcagtaactttatgtctccatcaagcaggtaagcttatcagaatcttgttcacatgatcataagcaacatagattttcttcagtatttgaagtcaa 75875  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     | || || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||| |    
T  75876 gagactagagtctgaaatcatgagtacatttacttaatactttcatcatc-------ttgaacaactcatactgatgaacaagcgtaagatcctttgcct 75968  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatatactctgctttaggtat 572  Q
    |||  || |||||  |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||   ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  75969 ctccaaccttcttgctaccttcaaagtttgcacacaatgaagcaaacattacctttgcagtggatttgtcactcatcttcatatactatgtgcgaggtat 76068  T
Q  573 agctttgacaagtgctcctcggattgtgtgatgcttcttgaagaatttattctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatca 672  Q
    || |   |||||   ||||   ||  |||||||||||||| | |  || |||||| ||| |||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  76069 agatgcaacaaggattcctattatcctgtgatgcttcttgtaaagcttcttctgagcagaagtatgtttctttctatcaacagaagctacttcttcatca 76168  T
Q  673 atgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
    ||||||||||||  || |||||||||    
T  76169 atgaccaagtcaataacaccttcttc 76194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 557
Target Start/End: Original strand, 3 - 424
Alignment:
Q  136 gatgacttccctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagat 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  | |||||||| ||||| || || || ||||  || || || || ||||| ||||    
T  3 gatgactttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagat 102  T
Q  236 cttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgata 335  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||| |||||     
T  103 cttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttgctcacatgatc 202  T
Q  336 aaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaac 435  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || |||    
T  203 agaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcatccttcatcttcaac 302  T
Q  436 aactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtag 535  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| | || |||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |    
T  303 agctcatactgatgaactagcataagtgcttttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcatagagtgaagcaaacattgccttagcagtgg 402  T
Q  536 atttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  403 atttatcactcattttcatata 424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9532 - 9043
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaac---------aactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           | |||||  || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9532 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 9433  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||    
T  9432 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatcctta 9333  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  9332 gcttcctcaatggtagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagtaacatagctcttcttcagtattt 9233  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  9232 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 9133  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9132 ctttgcttctctgaccttcttgcttccttcgtagtttgcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcat 9043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 655
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  1138 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 1039  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| | ||| || ||||  ||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  1038 cttctttgaggattcatgctcattcaaactcatttcatgtactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttaacttcctca 939  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    |||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | |||||| || || ||||||||||  ||||||     
T  938 atagcagttactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagaaacataactcttattcagtatttgcagtccag 839  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  838 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgattaactagcataagtgtctttgcttc 739  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  738 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcatata 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Original strand, 3796 - 4279
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    | ||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  3796 gatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 3895  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3896 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 3995  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  3996 atggcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 4095  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  4096 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcattagtgcctttgcttc 4195  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4196 tttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcatcttcatata 4279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3049 - 2568
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3049 gatcttcatcagaatctccatctggcgattcttcttcagattcacaagccttgtatgctttagatggctttcctttatatggtagagcaatagatttact 2950  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaa-atctttagcttcctc 272  Q
    |||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  2949 cttctttgaggactcatgctcattcagactcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgttttagatccttagattcctc 2850  T
Q  273 aatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtcca 372  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||    
T  2849 aatggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatgattagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtcca 2750  T
Q  373 aaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgctt 472  Q
     | || |  || ||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  2749 gatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactcacatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtctttgctt 2650  T
Q  473 ctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
    || | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  2649 ctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcactcattttcat 2568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 38642 - 38233
Alignment:
Q  145 cctttagatggtagagcaatggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagac 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | | |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||    
T  38642 cctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacac 38543  T
Q  245 ttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaac 344  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| | |||| |  ||||| || | ||||| | | | |||    
T  38542 ttaaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagttactttgggtctccatcttgaaggtaggcttctcaaaatcttactaacatgatcagaagaaac 38443  T
Q  345 atagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgc 444  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |    
T  38442 atagcttttcttcagtatttgcaatccagaaactaaagtttgaaatcttgagtacatttcttctatactctcatcatccttcattctgaaaagttcatac 38343  T
Q  445 tgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcac 544  Q
    |||||||| ||||| | || ||| || ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  38342 tgatgaactagcatcaaagctttagcctcttttactttcttgctgccttcaaagtttgcacatagagaagcaaacatagccttcgcagtagatttgtcac 38243  T
Q  545 tcatcttcat 554  Q
    |||| |||||    
T  38242 tcattttcat 38233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 38722 - 38679
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38722 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 38679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 554
Target Start/End: Original strand, 23737 - 24226
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattca--------acaa-ctttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||        | || |||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23737 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttagaagatttggaggacttccctttagatggtagagcaat 23836  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||||||||| |  | || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||  | ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||    
T  23837 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgaggaaactgacaagatcttcaacactaaaagtatttagatcctta 23936  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||| || | ||||| | | |  |||||||| |||||||||||||    
T  23937 gcttcctcaatagcagttactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttactaacatgatcagaagtgacatagctcttcttcagtattt 24036  T
Q  365 caagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagt 464  Q
      |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |     
T  24037 gcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcattagggc 24136  T
Q  465 ttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcat 554  Q
     ||||||| ||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24137 ctttgcttatctaacattcttgcttccttcgtagttggcacagagtgatgcaaacattgccttagcagtggatttatcaatcatcttcat 24226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 44945 - 44462
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||    | ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  44945 gatcttcatcagaatctccatctggcgattcttgttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaataaacttact 44846  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | ||  |||| ||||| ||||| || ||||  ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  44845 cttctttgaggacgcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctta 44746  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| |  ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | |||||| || || |||| |||||  ||||||     
T  44745 atggcagtcacttaaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagtaacataactctttttcattatttgcagtccag 44646  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | |  |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  44645 atattaaagtttgaaatcttgagtacatttcctctatactctcatcatccttcattttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtcttttcttc 44546  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  44545 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcattttcatata 44462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 55248 - 54765
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||    | ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  55248 gatcttcatcagaatctccatctggcgattcttgttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaataaacttact 55149  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | ||  |||| ||||| ||||| || ||||  ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  55148 cttctttgaggacgcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctta 55049  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| |  ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | | |||||| || || |||| |||||  ||||||     
T  55048 atggcagtcacttaaggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgcttacatgatcagaagtaacataactctttttcattatttgcagtccag 54949  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | |  |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  54948 atattaaagtttgaaatcttgagtacatttcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgtcttttcttc 54849  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  54848 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgccttagtagtggatttatcactcattttcatata 54765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 559
Target Start/End: Original strand, 9448 - 9659
Alignment:
Q  349 cttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgat 448  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| | || || |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9448 cttttctttaatatttgaagtccagagactagagtctgatatcttgagtacatttcctcaatacattcatcatctttcatcttgaacaactcatactgat 9547  T
Q  449 gaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgca-cagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactca 547  Q
    ||||||| || | ||  ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||||  | || |||||||||| ||  ||  |||||||||||||| | |    
T  9548 gaacaagaatgatagccttgacctctctaacctttttactaccttcatagtttgcattaaagtgaagcaaacaatgtctttgcagtagatttgtcattta 9647  T
Q  548 tcttcatatact 559  Q
    ||||||||||||    
T  9648 tcttcatatact 9659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 625 - 698
Target Start/End: Original strand, 9725 - 9798
Alignment:
Q  625 tgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttc 698  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  9725 tgagcaggagtatgcttctttctatcagtagcagctccttcttcatcaagggccaattcaccaataccatcttc 9798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 277
Target Start/End: Original strand, 12264 - 12468
Alignment:
Q  70 gtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatt 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12264 gtaggatcttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---tttaagagctcttgatgactttcctttagatggtagagcaattgatt 12360  T
Q  170 tactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttc 269  Q
    |||||||| |   ||  ||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12361 tactcttcttagcaggctcatgttcattgagacttatctcatgaacattgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaagtctttagcttc 12460  T
Q  270 ctcaatag 277  Q
    ||| ||||    
T  12461 ctctatag 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 53381 - 53010
Alignment:
Q  186 ttcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacc 285  Q
    |||||| ||||| | ||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  53381 ttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagttact 53282  T
Q  286 tttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtct 385  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| || | ||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  | |||| ||||||  || |    
T  53281 ttgggtctccatcttgaaggtaagcttctcaaaatcttactgacatgatcagaagcagcatagcttttctttagaatttgcaatccagaaaccaaagttt 53182  T
Q  386 gaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttctt 485  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| || ||| | || |||||    
T  53181 gaaatcttgagtacatttcttcaatactctcatcatccttcattctgaataattcatactgatgaacaagcatcaaagctttagcctctttcaccttctt 53082  T
Q  486 attaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    | | |||||| |||| ||||| |  ||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53081 aatgccttcaaagttggcacataatgaagcaaacatagcctttgcagtagatttgtcactcatcttcatata 53010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 235 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 2609 - 2320
Alignment:
Q  235 tcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgta-ggtaagtttcttagtatcttgctcatatga 333  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | | || ||| |||| || |||||||||| ||||    
T  2609 tcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcacttttggtctccatctagaaaggcaagcttctcagaatcttgctcacatga 2510  T
Q  334 taaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttga 433  Q
    | | | |||||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| | ||||| ||||    
T  2509 tcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatctcctctatactctcatcacccttcatcttga 2410  T
Q  434 acaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattg 523  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| | || |||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2409 acagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagttagcacagagtgaagcaaacattg 2320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 504
Target Start/End: Original strand, 31600 - 32030
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    | ||   |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |    
T  31600 gatcttaatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttccattagatggtagagcaatagatctatt 31699  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | |||||||| ||||| ||||| || ||||  || || |  || ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  31700 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgaaggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgttaagatccttaacttcctca 31799  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||| | ||||| | | |||||||| || ||||||| || ||  ||||||     
T  31800 atggcagtcactttgggtctccatctagaaggcaagcttctcagaatcttgctaacatgatcagaagcaacataactcttcttcaataattgcagtccag 31899  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttc 473  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  31900 atactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttc 31999  T
Q  474 tcttactttcttattaccttcatagtttgca 504  Q
    | | || |||||  ||||||| |||||||||    
T  32000 tttaaccttcttgctaccttcgtagtttgca 32030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 821
Alignment:
Q  226 ctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgc 325  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | |||||| |    
T  1150 ctgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttac 1051  T
Q  326 tcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatcttt 425  Q
    ||| ||||| | | || ||||| || |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||  |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  1050 tcacatgatcagacgctacataactcttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttg--tacatttcttctatactctcatcatcctt 953  T
Q  426 cattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaa 525  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||      
T  952 catcttgaacagctcatactgatgaactagcataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtagtttgcacagagtgaagcaaacattgcc 853  T
Q  526 ttaacagtagatttgtcactcatcttcatata 557  Q
    |||  |||  |||| |||||||| ||||||||    
T  852 ttagtagtgtatttatcactcattttcatata 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1457 - 1158
Alignment:
Q  65 ttacagtaggatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat 164  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1457 ttacagaatgatcttcatcagaatcttcatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaat 1358  T
Q  165 ggatttactcttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatcttta 264  Q
     |||||| ||||| |  |||| ||||| ||||| || || || ||||  || || || || ||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||    
T  1357 agatttattcttctttgaagactcatgctcatttaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatcctta 1258  T
Q  265 gcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtattt 364  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| | | || ||||  || |||||||||||||    
T  1257 gcttcctcaatggcagtcaccttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatcttactcacatgatcagacgctacatgactcttcttcagtattt 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0925 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0925
Description:

Target: scaffold0925; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3985 - 3598
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  | | ||    ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3985 gatcttcatcagaatctccgtctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatgggtttcctttagatggtagagcaatagatttatt 3886  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | || ||||| ||||| || || || ||||  || || || ||  |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3885 cttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaaatgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 3786  T
Q  274 atagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaa 373  Q
    || | |||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| | | |||||||| || |||||||||||||  ||||||     
T  3785 atggcagtcactttaggtctccatctagaaggcaagcttctcaatatctttctcacatgatcagaagcaacataactcttcttcagtatttgcagtccag 3686  T
Q  374 aaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataag 461  Q
    | || |  || ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  3685 atactaaagtttgaaatcttgagtacatctcttctatactctcatcacccttcatcttgaacagctcatactgatgaactagcataag 3598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 551
Target Start/End: Original strand, 2811 - 3142
Alignment:
Q  220 agagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagta 319  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||| | | | ||||| | ||||| |    
T  2811 agagagcttatgagatcttcgacacttagagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagtcactttaggtcaccatttagcacgtaagctccttagaa 2910  T
Q  320 tcttgctcatatgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatc 419  Q
    ||||| ||| ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||| | || || |||| ||| ||| |||||||   ||||||    | |||    
T  2911 tcttgttcacatgatcaaaaactacataacttttcttcagtatttaaagtccagatactagagtctaaaaccttaagtacatagtctcaatgtcctgatc 3010  T
Q  420 atctttcattttgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaac 519  Q
     || |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |  |||||||||    
T  3011 ctccttcatcctgaacaactcataccgatgaacaagcataatagctttttcttctctgactttcttgttaccttcatagtttgttcacaaggaagcaaac 3110  T
Q  520 attgaattaacagtagatttgtcactcatctt 551  Q
    ||||  |||||| | ||||| |||||||||||    
T  3111 attgctttaacaattgatttatcactcatctt 3142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3935 - 3840
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatt 169  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3935 gatcttcaccagagtctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagattttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatt 3840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3267 - 3057
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  3267 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagacttact 3168  T
Q  174 cttcctgaaagattcatgttcattaagacttatctcatccactttaagagagctgacgagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 273  Q
    |||| |  | || ||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3167 cttctttgaggactcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctca 3068  T
Q  274 atagtagtcac 284  Q
    || | ||||||    
T  3067 atggcagtcac 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 352 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11615
Alignment:
Q  352 ttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattttgaacaactcatgctgatgaa 451  Q
    |||||||||||||  |||||| | || |  || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  11810 ttcttcagtatttgcagtccagatactaaagtttgaaatcttgagtacatatcctctatactctcatcatccttcatcttgaacagctcatactgatgaa 11711  T
Q  452 caagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaacagtagatttgtcactca 547  Q
    | |||||||| |  ||||||||| | || |||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||    
T  11710 ctagcataagtgcctttgcttctttaaccttcttgctaccttcgtaatttgcacagagtgaagcaaacattgccttagcagtggatttatcactca 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 3349 - 3058
Alignment:
Q  232 agatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcatat 331  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| ||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | | | ||||  ||||||| |||||| ||| ||    
T  3349 agatcttcaacacttagagtatttagatcatcaacttcctcaatagaagtcaccttaggtctccacttagcaagtaaacttcttagaatcttgttcacat 3250  T
Q  332 gataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcatttt 431  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||  || | ||||||||| || || || ||||| |||||||||||   ||||||   |||||| | ||||||  |    
T  3249 gatcataagctacatagcttttcttcaaaatctgaagtccaaagactagagtttgaaaccttgagtacatagactcaatgtcttcatcttttttcatcat 3150  T
Q  432 gaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattg 523  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   || ||| |||||| | |||||||| || ||||| ||||| |  || | ||||||||||||||    
T  3149 gaacaactcatactgatgaaccagcatggtagctttagcttctttgactttcttgtttccttcttagttagagcacaaagaagcaaacattg 3058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 622 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 19899 - 19810
Alignment:
Q  622 ttctgaacaggagtatgctttcttctatcaacagcagctccttcttcatcaatgaccaagtcaccaataccttcttctagtatgtcccat 711  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19899 ttctgagcagaagtatgttttcttctatcaataacaactccttcttcatcaacgactaagtcaccaataccatcttctagtatgtcccat 19810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 190637 - 190317
Alignment:
Q  231 gagatcttcaagacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagtagtcacctttggtctccatcttgtaggtaagtttcttagtatcttgctcata 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||  | ||||| |||||  ||| |    
T  190637 gagatcttcaagacttagagtgtttagatctctgacttcttcaatagttgtcaccttaggtctccacttaacaggtaaactccttagaatcttcttcaca 190538  T
Q  331 tgataaaaggcaacatagcttttcttcagtatttcaagtccaaaaaccagggtctgaaatcttgagtacatttgctcaatactttcatcatctttcattt 430  Q
    |||| |    | ||||||||||||||  | || | |||| || |||| ||  ||| ||| |||||||||||    |||||   ||||||||||||||||     
T  190537 tgatcagcaactacatagcttttcttttgaatctgaagttcagaaactagattcttaaaccttgagtacatagtttcaatgtcttcatcatctttcattc 190438  T
Q  431 tgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaac 530  Q
    || |||  ||||  || |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||| |    
T  190437 tggacagttcataatgctgaacaagcatggtagtttttgtttctctgactttcttgtcaccttcatagtttgaacacaaagaagcaaacattgctttagc 190338  T
Q  531 agtagatttgtcactcatctt 551  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  190337 agtagatttatcactcttctt 190317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20255 - 20161
Alignment:
Q  76 tcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggattt 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20255 tcttcattagaatctcgatcaggggattcttcttcagattcaatgactttgagagctttagatgactttcctttagatggcagagcaatagattt 20161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6728
Alignment:
Q  431 tgaacaactcatgctgatgaacaagcataagagtttttgcttctcttactttcttattaccttcatagtttgcacagagagaagcaaacattgaattaac 530  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||  || ||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||  ||| |    
T  6857 tgaacaactcatactgaagaacaaacatagtagctttagcttatctgattttcttgttaccttcatagtttgaactcaaggaagcaaacattgctttagc 6758  T
Q  531 agtagatttgtcactcatcttcatatactc 560  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6757 agttgatttatcactcatcttcaaatactc 6728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 62
Alignment:
Q  74 gatcttcatcagaatctccatcaggtgatttctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    | ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  165 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 66  T
Q  174 cttc 177  Q
    ||||    
T  65 cttc 62  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University