View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11727_low_5 (Length: 460)

Name: NF11727_low_5
Description: NF11727
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11727_low_5
NF11727_low_5
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (10-440)||(29964966-29965396)
chr5 (10-440)||(30009402-30009832)
chr5 (10-440)||(30007246-30007676)
chr5 (10-440)||(30043322-30043752)
chr5 (10-440)||(29946737-29947167)
chr5 (10-440)||(29995457-29995886)
chr5 (11-440)||(29953699-29954128)
chr5 (10-440)||(30001130-30001560)
chr5 (10-439)||(30067840-30068269)
chr5 (10-440)||(29944765-29945195)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (201-292)||(31890612-31890703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 29964966 - 29965396
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29964966 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 29965065  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29965066 gatgagacattaagactttaccctgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 29965165  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29965166 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatatttggttagaaaacgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 29965265  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29965266 ttatcaaggacagcaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttacggttagatttgttgtagct 29965365  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29965366 caattggtgcattgctttaattgggaacttc 29965396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30009832 - 30009402
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009832 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 30009733  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009732 gatgagacattaagactttaccctgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 30009633  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009632 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatatttggttagaaaacgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 30009533  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30009532 ttatcaaggacagcaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttacggttagatttgttgtagct 30009433  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30009432 caattggtgcattgctttaattgggaacttc 30009402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 30007246 - 30007676
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30007246 gatgaaaattcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggttgaagagaaggatctgaagaagtttaattacttagatatggttgtt 30007345  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  30007346 gatgaaaccttaagactttatcctgttggacccttattaatccctcgtgaatgtagagagagcataacaattgatggatattttataacgaaaaagactc 30007445  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30007446 gagttatagtaaatgcatgggctattgggagagattgtaacgtttggtcagaaaatgctgatgaattttacccagagagatttattgacaagaaaatgaa 30007545  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||||  || ||| |||||    
T  30007546 ttatcaaggacatgagtttgaatctataccatttggttctggtcgtaggcgttgtcctggaattcaattgggtttaattatcgttaagttggttatagct 30007645  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  30007646 caatttgtgcattgctttaactgggaacttc 30007676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30043752 - 30043322
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30043752 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggttaacgagaaggatctaaagaagttgaattatttagatatggtggtt 30043653  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| || | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30043652 gatgagaccttaagactttaccccgtagcaccgttactagtccctcgtgaatctagagagagcacaacaattgatggttattttataaaggaaaagacac 30043553  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||   || || ||||||||    
T  30043552 gacttatagtaaatgcatgggcaatagggagagatcctaatgtttggtcagaaaatgctaaagaattttacccagagagatttgtagagaaaaaaatgaa 30043453  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||    
T  30043452 ttatcttggacaagagtttgaatctataccatttggttctggtcgtaggcgttgtcctggaattcaattgggtttaattactgttaaattggttatagct 30043353  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    |||||  | ||||  ||||| ||||||||||    
T  30043352 caatttatccattgttttaactgggaacttc 30043322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 29946737 - 29947167
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29946737 gatgaaaacccttcaagatgatatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaaagatttagagaagttaagttacttagatatggtggtt 29946836  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
     |||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29946837 catgaaactttaagactttaccctgttgcacccttgttactccctcgtgaatgtagagagagtataacaattgatggatattttataatggaaaagacac 29946936  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  29946937 gagttatagtaaatgcatgggctatagagagagattctagtgtttggtcagaaaattatgaagaatttcatccagaaagatttattgacatgaaaatgaa 29947036  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    |||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||  ||| | | ||| |||||    
T  29947037 ttatgaaggacataagtttaaatctataccatttggttctggtcgtagacgttgtcctggaattgaaatgggtttgatcacaattaaaatggttatagct 29947136  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29947137 caattggtacattgctttaattgggaacttc 29947167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 29995457 - 29995886
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29995457 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaaagattgaggagaaagatatgaagaagttgaattatttagatatggtggtt 29995556  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| || | |||||||| | |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29995557 gatgagaccttaagactttaccctgttgcaccattactagtccctcgtgagtctagagagagcacaataattgatggttattttataaaggaaaagacac 29995656  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  29995657 gacttatagtaaatgcatgggcaatagggagagatcctaatgtttggtcagaaaatgccgaagaattttatccagagagatttattgagaa-aaactgaa 29995755  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||  || ||| |||||    
T  29995756 ttatctcggacaagagtttgaatctataccatttggttctagtcgtaggcgttgtcctggaattcaattgggtttaattacgattaagttggttatagct 29995855  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29995856 caatttgtgcattgctttaattgggaacttc 29995886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 29953699 - 29954128
Alignment:
Q  11 atgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttg 110  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||  |||| || | ||||||||| |||||||||     
T  29953699 atgaaaatccttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaatgaaagaatgattgaagagaaagatttagagaacttaagttacttagagatggtggttc 29953798  T
Q  111 atgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacg 210  Q
    |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29953799 atgaaactttaagactttaccctgttgcacccttattactccctcgtgaatgtagagagagtgtaacaattgatggatattttataaaggaaaagactcg 29953898  T
Q  211 agttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  29953899 agttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgccgaagaattttacccagagagattcattggcaagaaaatgaat 29953998  T
Q  311 tatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagctc 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||  || ||| | || |    
T  29953999 tatcaaggacaagagtttgaatctctaccatttggttctggccgcagacgttgtcctggaattcaatcgggtttagtgaccgttaagttggttattgccc 29954098  T
Q  411 aattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  29954099 aattggtgcattgttttgattgggaacttc 29954128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 30001130 - 30001560
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  30001130 gatgaaaattcttcaagatgaaatacaaaatgaagtaggaaataagagaatggttgaagaaaaggatttgaagaattttaattacctagatatggtggtt 30001229  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  30001230 gatgaaaccttaagactttatcctgttgcacctttattaatccctcgtgaatgtagagagaacataacaattgatgattattctataaaagaaaagacac 30001329  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  30001330 gagttatagtaaatgcatgggcaattgggagagatcctgatgtttggtcagaaaatgctgaagaattttacccagagagatttattgagaaaaaaatgaa 30001429  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||  || ||| |||||    
T  30001430 ttatctcggacaagagtttgaatctataccatttggttctggtcgtagacgttgtcctggaattcaattgggtatgattacggttaagttggttatagct 30001529  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  30001530 caattcgtgcattgctttaactgggaacttc 30001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30068269 - 30067840
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30068269 gatgaaaattcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggttgaagagaaggatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 30068170  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    ||||| || |||||||| || || |||| ||||||| || | |||| | |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  30068169 gatgaaaccttaagactgtatcctgttgcacccttactagtccctcctaaatgtagagagaacataacaattgatgattattttataaaggaaaagacga 30068070  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  30068069 gaattatggtaaatgcatgggcaatagggagagatcctaatgtttggtcagaaaatgctgaagaattttatccaaagagatttattgaaaagaaaatgaa 30067970  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||  || ||| |||||    
T  30067969 ttatcaaagacaagagtttgaaagtttaccatttgattatggtcgtagacgttgccctggaattcaattgggtttaactactgttaagttggttatagct 30067870  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaactt 439  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30067869 caatttgtgcattgctttaattgggaactt 30067840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 440
Target Start/End: Original strand, 29944765 - 29945195
Alignment:
Q  10 gatgaaaaagcttcaagatgagatacaaaatgaagtaggaaataaaagaatggtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggtt 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29944765 gatgaaaaatcttcaagatgaaatacaaaatgaagtaggaaataagagaatggttgaagaaaaggatttgaagaattttaattacttagatatggtggtt 29944864  T
Q  110 gatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacac 209  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  29944865 gatgaaactttaagacttcatccagtttcacccttcttactccctcgtgaatgtagagagaacataacaattgatggttattttgtaaaggaaaagacac 29944964  T
Q  210 gagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||   | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  29944965 gagttatagtaaatgcatttacaatagcgagagatcctaatgtttggtcagaaaatgctgaagaattttgtccagagaggtttattaataagaaattgaa 29945064  T
Q  310 ttatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagct 409  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||||| ||     |||||    
T  29945065 ttatgaaggacaagagtttgaaagtataccatttggatttggtcgtaggcgttgccctggaattcaattggctttgaggactgttaggttaagcatagct 29945164  T
Q  410 caattggtgcattcctttaattgggaacttc 440  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29945165 caattggtgcattgctttaattggaaacttc 29945195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Original strand, 31890612 - 31890703
Alignment:
Q  201 aaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagattt 292  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31890612 aaaagacaagaattttaataaatgcatggacaatagggagagacactaatgtttggtcggataatgctgagacgttttatccagagagattt 31890703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University