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Alignment Overview

Query: NF1172_low_50 (Length: 429)

Name: NF1172_low_50
Description: NF1172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1172_low_50
NF1172_low_50
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (144-396)||(33489792-33490044)
chr6 (144-396)||(4169664-4169916)
chr6 (144-391)||(17595749-17595996)
chr6 (144-396)||(4210393-4210645)
chr6 (147-396)||(742731-742980)
chr6 (144-391)||(8658987-8659237)
chr6 (144-396)||(10790491-10790743)
chr6 (146-396)||(32938281-32938531)
chr6 (145-396)||(8062790-8063041)
chr6 (146-396)||(8933685-8933935)
chr6 (145-396)||(34475144-34475395)
chr6 (148-396)||(33131013-33131261)
chr6 (144-396)||(28914009-28914257)
chr6 (144-396)||(18676583-18676835)
chr6 (144-396)||(29516665-29516917)
chr6 (207-396)||(29863808-29863997)
chr6 (146-313)||(5545373-5545541)
chr6 (146-396)||(12712976-12713216)
chr6 (146-391)||(11590248-11590499)
chr6 (156-396)||(9224609-9224855)
chr6 (146-396)||(8313631-8313887)
chr6 (146-360)||(9576031-9576251)
chr6 (146-287)||(2559732-2559872)
chr6 (146-355)||(25143999-25144205)
chr6 (146-241)||(20554819-20554914)
chr6 (149-191)||(13889149-13889191)
chr6 (146-190)||(24418700-24418743)
chr6 (154-190)||(26947090-26947126)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (144-396)||(21866858-21867110)
chr2 (144-396)||(11124208-11124460)
chr2 (144-396)||(30787018-30787270)
chr2 (113-396)||(20115029-20115313)
chr2 (146-396)||(19390446-19390696)
chr2 (144-396)||(17977621-17977874)
chr2 (148-396)||(2357341-2357589)
chr2 (145-396)||(26479727-26479978)
chr2 (144-396)||(6034411-6034664)
chr2 (144-396)||(25336524-25336776)
chr2 (144-396)||(8113687-8113943)
chr2 (146-396)||(12242744-12242996)
chr2 (144-396)||(33965320-33965572)
chr2 (144-396)||(41568581-41568833)
chr2 (144-396)||(14287335-14287578)
chr2 (148-396)||(39430134-39430382)
chr2 (145-396)||(2371976-2372218)
chr2 (144-396)||(31547156-31547401)
chr2 (146-396)||(2380175-2380416)
chr2 (145-396)||(4049460-4049688)
chr2 (144-313)||(11978762-11978931)
chr2 (148-256)||(1222638-1222746)
chr2 (296-396)||(1222313-1222413)
chr2 (355-396)||(11978930-11978971)
chr2 (147-190)||(43652933-43652976)
chr2 (146-190)||(17435356-17435400)
chr2 (147-195)||(35006460-35006508)
chr2 (146-191)||(932076-932121)
chr2 (146-191)||(9141719-9141764)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (144-396)||(35393394-35393646)
chr8 (144-396)||(8352379-8352631)
chr8 (148-396)||(30655004-30655252)
chr8 (144-396)||(11020402-11020654)
chr8 (145-396)||(29997494-29997745)
chr8 (144-396)||(39780311-39780564)
chr8 (144-396)||(33411044-33411297)
chr8 (144-396)||(483030-483282)
chr8 (144-396)||(36781651-36781903)
chr8 (146-396)||(38098657-38098907)
chr8 (145-396)||(24757641-24757891)
chr8 (144-396)||(20187471-20187723)
chr8 (144-396)||(20206540-20206792)
chr8 (144-396)||(25487097-25487349)
chr8 (144-391)||(26416177-26416424)
chr8 (145-396)||(31097515-31097757)
chr8 (145-388)||(30699895-30700140)
chr8 (147-396)||(1104818-1105066)
chr8 (146-373)||(45084246-45084464)
chr8 (144-396)||(12986670-12986911)
chr8 (115-300)||(27719212-27719397)
chr8 (146-314)||(5458261-5458428)
chr8 (144-253)||(20818954-20819063)
chr8 (148-261)||(32834592-32834705)
chr8 (296-396)||(20819064-20819164)
chr8 (170-285)||(18574818-18574934)
chr8 (146-241)||(13174239-13174334)
chr8 (170-290)||(20524967-20525086)
chr8 (343-396)||(5458438-5458491)
chr8 (147-190)||(16584425-16584468)
chr8 (157-191)||(29225979-29226013)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (144-396)||(1546062-1546314)
chr3 (144-396)||(24348802-24349054)
chr3 (144-396)||(51754422-51754674)
chr3 (144-396)||(43973109-43973361)
chr3 (144-396)||(51167055-51167307)
chr3 (145-396)||(44377782-44378033)
chr3 (144-396)||(5273458-5273710)
chr3 (144-396)||(10471232-10471484)
chr3 (144-396)||(38252518-38252770)
chr3 (144-391)||(10048998-10049245)
chr3 (144-396)||(13286929-13287181)
chr3 (144-396)||(55274025-55274277)
chr3 (145-396)||(8828494-8828745)
chr3 (145-396)||(9745944-9746194)
chr3 (148-391)||(23150742-23150985)
chr3 (144-396)||(10659525-10659777)
chr3 (144-396)||(37821061-37821312)
chr3 (146-396)||(22497241-22497491)
chr3 (146-396)||(53018982-53019232)
chr3 (144-396)||(12227628-12227881)
chr3 (144-396)||(8068400-8068652)
chr3 (145-396)||(2445961-2446212)
chr3 (148-396)||(24405774-24406030)
chr3 (145-396)||(27449491-27449742)
chr3 (144-396)||(46528089-46528349)
chr3 (149-396)||(49804739-49804986)
chr3 (144-396)||(31655044-31655294)
chr3 (146-396)||(43218757-43219007)
chr3 (146-396)||(17338357-17338607)
chr3 (144-352)||(35846746-35846954)
chr3 (144-396)||(37126518-37126761)
chr3 (144-396)||(20607578-20607821)
chr3 (145-396)||(28555048-28555296)
chr3 (144-396)||(47697767-47698015)
chr3 (144-396)||(3019201-3019452)
chr3 (157-396)||(41113982-41114221)
chr3 (144-396)||(26229371-26229624)
chr3 (146-396)||(41454247-41454497)
chr3 (145-347)||(30357251-30357453)
chr3 (146-315)||(48458387-48458556)
chr3 (144-396)||(26975362-26975596)
chr3 (145-300)||(998292-998447)
chr3 (146-268)||(26717973-26718095)
chr3 (146-396)||(35512941-35513188)
chr3 (266-396)||(501837-501967)
chr3 (146-243)||(501740-501837)
chr3 (179-249)||(33591124-33591194)
chr3 (320-396)||(48477883-48477959)
chr3 (146-240)||(5218974-5219068)
chr3 (146-218)||(9126348-9126419)
chr3 (146-218)||(9134455-9134526)
chr3 (148-218)||(9116462-9116531)
chr3 (147-189)||(50507665-50507707)
chr3 (155-192)||(31608390-31608427)
chr3 (146-206)||(50744394-50744454)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (144-396)||(31587798-31588050)
chr7 (145-396)||(5544184-5544435)
chr7 (144-396)||(3887670-3887922)
chr7 (144-396)||(12726098-12726350)
chr7 (144-396)||(12848440-12848692)
chr7 (144-396)||(18676636-18676888)
chr7 (144-396)||(47455050-47455302)
chr7 (116-396)||(41118657-41118937)
chr7 (144-396)||(40186586-40186838)
chr7 (145-396)||(47020349-47020600)
chr7 (148-391)||(31621940-31622183)
chr7 (146-396)||(40431155-40431405)
chr7 (144-396)||(9741115-9741358)
chr7 (154-396)||(44061818-44062060)
chr7 (144-396)||(44291052-44291304)
chr7 (146-396)||(42076336-42076586)
chr7 (144-391)||(38743114-38743355)
chr7 (145-396)||(9870282-9870533)
chr7 (144-359)||(44508503-44508719)
chr7 (146-396)||(42697408-42697649)
chr7 (146-396)||(3111962-3112205)
chr7 (212-396)||(25105043-25105227)
chr7 (145-267)||(30888401-30888523)
chr7 (7-103)||(8762350-8762446)
chr7 (7-103)||(8788881-8788977)
chr7 (156-225)||(40190120-40190188)
chr7 (148-385)||(27418930-27419161)
chr7 (146-285)||(38168048-38168177)
chr7 (355-396)||(44509059-44509100)
chr7 (146-186)||(39494886-39494926)
chr7 (155-206)||(10242424-10242475)
chr7 (147-191)||(37544997-37545041)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (144-396)||(3390707-3390959)
chr5 (145-396)||(42675534-42675785)
chr5 (145-398)||(35065915-35066170)
chr5 (145-396)||(8836407-8836657)
chr5 (145-396)||(25031424-25031675)
chr5 (145-396)||(41743236-41743487)
chr5 (145-396)||(8335319-8335570)
chr5 (145-379)||(18185762-18185995)
chr5 (146-396)||(36484476-36484726)
chr5 (146-396)||(29296188-29296439)
chr5 (144-374)||(23191782-23192011)
chr5 (144-390)||(33591585-33591822)
chr5 (115-396)||(27771137-27771416)
chr5 (154-398)||(1420978-1421213)
chr5 (145-396)||(10691795-10692037)
chr5 (115-396)||(28349003-28349283)
chr5 (146-347)||(42221727-42221928)
chr5 (144-396)||(6230223-6230466)
chr5 (145-396)||(15472546-15472793)
chr5 (146-396)||(8782569-8782809)
chr5 (146-396)||(33569964-33570195)
chr5 (299-396)||(18617559-18617656)
chr5 (146-244)||(8935914-8936012)
chr5 (146-356)||(25472199-25472415)
chr5 (147-195)||(24912764-24912812)
chr5 (347-379)||(42221919-42221951)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (146-396)||(11005488-11005738)
chr4 (148-396)||(50621666-50621914)
chr4 (144-396)||(22169109-22169361)
chr4 (144-396)||(39677541-39677793)
chr4 (146-396)||(2491833-2492083)
chr4 (146-396)||(56162475-56162725)
chr4 (148-396)||(29923605-29923853)
chr4 (148-396)||(36308839-36309087)
chr4 (145-396)||(36224969-36225220)
chr4 (146-396)||(27767472-27767721)
chr4 (144-397)||(24744825-24745078)
chr4 (144-396)||(28867550-28867803)
chr4 (144-396)||(3875501-3875753)
chr4 (145-396)||(7327532-7327783)
chr4 (146-396)||(54202332-54202582)
chr4 (144-396)||(7554276-7554528)
chr4 (156-396)||(45884570-45884810)
chr4 (144-396)||(3931824-3932077)
chr4 (146-396)||(26488353-26488604)
chr4 (144-396)||(3874406-3874658)
chr4 (144-396)||(33961637-33961889)
chr4 (145-396)||(55282309-55282559)
chr4 (145-396)||(20492504-20492755)
chr4 (145-396)||(36432323-36432573)
chr4 (146-396)||(49331968-49332218)
chr4 (146-398)||(43957702-43957945)
chr4 (144-396)||(17445505-17445748)
chr4 (156-396)||(41764526-41764765)
chr4 (146-396)||(29933378-29933619)
chr4 (147-396)||(35949347-35949587)
chr4 (144-396)||(28573617-28573856)
chr4 (146-396)||(44878044-44878294)
chr4 (146-331)||(11308768-11308953)
chr4 (148-268)||(55541828-55541948)
chr4 (154-331)||(11381821-11381997)
chr4 (146-347)||(7326317-7326525)
chr4 (147-195)||(15506585-15506633)
chr4 (151-287)||(41476627-41476763)
chr4 (146-210)||(7795306-7795368)
chr4 (349-396)||(11308952-11308999)
chr4 (146-188)||(7818464-7818506)
chr4 (146-183)||(1536980-1537017)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (146-396)||(25828677-25828927)
chr1 (144-396)||(15475855-15476107)
chr1 (145-396)||(28226218-28226469)
chr1 (145-396)||(37094027-37094278)
chr1 (145-396)||(48542427-48542678)
chr1 (144-396)||(6978901-6979153)
chr1 (115-396)||(45502228-45502508)
chr1 (144-391)||(28068709-28068956)
chr1 (146-396)||(40359667-40359917)
chr1 (156-396)||(15907250-15907490)
chr1 (144-396)||(42885266-42885518)
chr1 (144-396)||(52469308-52469560)
chr1 (145-396)||(3770504-3770755)
chr1 (144-396)||(44233901-44234155)
chr1 (146-396)||(13556077-13556327)
chr1 (146-396)||(46674745-46674995)
chr1 (146-396)||(47534001-47534251)
chr1 (144-396)||(24180435-24180688)
chr1 (144-396)||(35719709-35719962)
chr1 (144-396)||(30159012-30159264)
chr1 (144-396)||(44054692-44054944)
chr1 (147-396)||(18604860-18605109)
chr1 (144-396)||(30361154-30361406)
chr1 (144-396)||(3994742-3994996)
chr1 (144-396)||(3046761-3047013)
chr1 (146-396)||(25729805-25730045)
chr1 (145-396)||(4490018-4490267)
chr1 (154-396)||(3416314-3416547)
chr1 (156-396)||(49456849-49457089)
chr1 (145-396)||(8895622-8895863)
chr1 (144-396)||(31760586-31760829)
chr1 (144-315)||(50490801-50490972)
chr1 (145-396)||(17580767-17581009)
chr1 (196-396)||(29033540-29033740)
chr1 (144-299)||(26770097-26770252)
chr1 (149-396)||(43106414-43106659)
chr1 (156-307)||(46234296-46234447)
chr1 (146-396)||(17926076-17926315)
chr1 (144-272)||(20599594-20599722)
chr1 (251-396)||(11493521-11493657)
chr1 (156-315)||(49740096-49740255)
chr1 (251-396)||(11335501-11335637)
chr1 (144-225)||(11335634-11335715)
chr1 (144-225)||(11493654-11493735)
chr1 (146-287)||(7042840-7042982)
chr1 (146-287)||(8969466-8969607)
chr1 (335-396)||(46234231-46234292)
chr1 (156-347)||(17136907-17137104)
chr1 (146-215)||(12320252-12320321)
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[»] scaffold0562 (2 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 33489792 - 33490044
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33489792 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 33489891  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33489892 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctatactatattcataaaggttagtgaatt 33489991  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33489992 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 33490044  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 4169664 - 4169916
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4169664 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 4169763  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  4169764 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaatgttagtgaatt 4169863  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4169864 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttgttgtttgttttagtat 4169916  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 144 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17595996 - 17595749
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595996 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 17595897  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17595896 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatttttgtcattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 17595797  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595796 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 17595749  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 4210393 - 4210645
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210393 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 4210492  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  4210493 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaatgttagtgaatt 4210592  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4210593 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttgttgtttgttttggtat 4210645  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 147 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 742980 - 742731
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctta 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  742980 gttacactcaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctctcttcgtgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctta 742881  T
Q  247 ccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttca 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  742880 ccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttca 742781  T
Q  347 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  742780 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 742731  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 391
Target Start/End: Original strand, 8658987 - 8659237
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttt---tatgatcattctgaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  8658987 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatctttaattatgatcattttgaa 8659086  T
Q  241 cccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtga 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8659087 cccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtga 8659186  T
Q  341 atttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659187 atttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 8659237  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 10790491 - 10790743
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10790491 caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaaccc 10790590  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10790591 ttacaccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaaatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 10790690  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10790691 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 10790743  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32938531 - 32938281
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938531 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 32938432  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32938431 atcccctttcatcgacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatatgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 32938332  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32938331 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 32938281  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 8062790 - 8063041
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8062790 aagttacacccaaatttatttaaaattttataataataccaaaattgtcctcttcatgtaattttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 8062889  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8062890 taccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaatgttagtgaattt 8062989  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8062990 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8063041  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8933935 - 8933685
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8933935 agttacacccaaatttatttaaaattttactataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 8933836  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  8933835 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 8933736  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8933735 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 8933685  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 34475144 - 34475395
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34475144 aagttacatctaaatttatttacaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccct 34475243  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34475244 taccccctttcatccacaaatgaccatagatgtgcaaccaatatctaaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 34475343  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34475344 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 34475395  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33131261 - 33131013
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33131261 ttacacccaaatttatttaaatttttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttac 33131162  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33131161 cccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttcat 33131062  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33131061 gaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 33131013  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28914257 - 28914009
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28914257 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattactctcttcatgtaaatttttaaaaaccaatcttttatgatcattctgaaccc 28914158  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28914157 ttaccccctttcatccacaaatcac----gatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 28914062  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28914061 tcatgaatttaattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 28914009  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18676835 - 18676583
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaatttt-acaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18676835 caagttacacctaaatttatttaaaatttttataataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacc 18676736  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |  |||||    
T  18676735 cttacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatatttataaatgtttttgaat 18676637  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18676636 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 18676583  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 29516665 - 29516917
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  29516665 caagttacatctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaattcatcttttatgatcattttggactc 29516764  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29516765 ttacctcctttcatctacaaatcaccatagatgcgcaactaagatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 29516864  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29516865 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 29516917  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 207 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29863997 - 29863808
Alignment:
Q  207 tttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29863997 tttttaaaaacccattttttacgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgt 29863898  T
Q  307 tattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29863897 tattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 29863808  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Original strand, 5545373 - 5545541
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5545373 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 5545472  T
Q  246 accccctttcatccaccaa-tcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgat 313  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5545473 accccctttcatccacaaattcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgat 5545541  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12713216 - 12712976
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12713216 agttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaccccatcttttatgatcattctgaaccctc 12713117  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
     |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |          ||||||    
T  12713116 gccccttttcatccacaactcaccatagatgtgcaaccaaaatctgaataaacttctttgtcattgatctatactctattcaca----------aatttc 12713027  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12713026 atgaattgtattttctaagagtttctatttgtttattgtttattttggtat 12712976  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 11590248 - 11590499
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| |     
T  11590248 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattacactcttcatgtaaatttctaaaaatccttctttcattatcattctgaaccatc 11590347  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
     |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| ||| | |||||| | ||||  ||||||||| |  ||||    
T  11590348 gccccatttcgtccataaatcaccatagatgtgcaaccaagatcaaagattgaatcaacatctttttcattgatatgtactccattcataaaagtcagtg 11590447  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11590448 aatttcataaatttaattttttaagagtttctatttgtttattgtttttttt 11590499  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Original strand, 9224609 - 9224855
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9224609 aaatttatttaaaattttacaacaatatcaaaattgtcctcttcatgtaaattttttaaaacccttctttcattatcattttgaaccctcaccccctttc 9224708  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatga 349  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||      ||| ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||  |||    
T  9224709 atctagaaatcaccatagatgtgctaccaagatcaaagattgagtcaacatctttttcattgatatgtactctattcataaaggttagtgaacttattga 9224808  T
Q  350 atttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9224809 atttcattttctaaaagtttctatttgtatattgtttgttttggtat 9224855  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8313887 - 8313631
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| || ||||||| |||||||     
T  8313887 agttacactcgaatttatataaaattttacaataatatcataattgtcctcttcatgtaaatttgtaaaaacctttatttcattatcattccgaaccctc 8313788  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||| |||      ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  8313787 accccctttcatcaataaatcaccatatatgtgtaaccaaaatcaaagattgaatcaacatctttttcattgatctgtactatattcataaaagtcagtg 8313688  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8313687 aatttcataaatttcattttctaagagtttctatttgtttattatttattttggtat 8313631  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 360
Target Start/End: Original strand, 9576031 - 9576251
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||     
T  9576031 agttacacacaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgctctcatcatgtaaatttctaaaaacccttctttcattatcattctgaaccctc 9576130  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||||| |||| | ||| |||      | |||||| || ||| | |||||||| |||| |||| ||||||| | |||    
T  9576131 accccacttcatccacaaatcatcatagacgtgctatcaagatcaaagattaaatcaatatctttttcattgatctttactctattaataaaggttggtg 9576230  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttc 360  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9576231 aatttcatgaatttcattttc 9576251  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Original strand, 2559732 - 2559872
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||| ||||||||     
T  2559732 agttacaccaaaatttatttaaaattttataataataccaaaattgccctcttcatgtcaatttctaaaaa-tcttctttcattatcattttgaaccctc 2559830  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaata 287  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||| ||| ||||| |||||    
T  2559831 accccttttcacccacaaaccaccatggatatgcaatcaata 2559872  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25144205 - 25143999
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          | ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||   ||     
T  25144205 agttacactcaaatttacttaaaattttacaataataccaaaattgc---------attaatttctaaaaaccccttttttattatcattatgagttctc 25144115  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  ||||    
T  25144114 accccctttcatccacagaccaccatagatgtgcaaccaagatcaaagattgaatcaacattttttttattgatatgtactctattcataaaggtcagtg 25144015  T
Q  340 aatttcatgaatttca 355  Q
    ||||| ||||||||||    
T  25144014 aattttatgaatttca 25143999  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20554914 - 20554819
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaac 241  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  20554914 agttacatctaaatttatttaaaactgtacaataatactaaaattaccctcttcatgtaaatttctaaaaactcttctttcattatcattctgaac 20554819  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13889191 - 13889149
Alignment:
Q  149 tacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattg 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13889191 tacacctaaatttacttaaaattttacaataataccaaaattg 13889149  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 190
Target Start/End: Original strand, 24418700 - 24418743
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatt 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24418700 agttacaccccaatttatttaaaattttagaat-ataccaaaatt 24418743  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 190
Target Start/End: Original strand, 26947090 - 26947126
Alignment:
Q  154 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatt 190  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26947090 ccaaatttacttaaaagtttacaataataccaaaatt 26947126  T

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Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21867110 - 21866858
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21867110 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 21867011  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21867010 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 21866911  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21866910 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 21866858  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11124460 - 11124208
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11124460 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaaccc 11124361  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11124360 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 11124261  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11124260 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11124208  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30787270 - 30787018
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787270 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctattcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 30787171  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30787170 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaattaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 30787071  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30787070 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 30787018  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 113 - 396
Target Start/End: Original strand, 20115029 - 20115313
Alignment:
Q  113 atagaccggtgctagtcacaccccnnnnnnn-caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaattttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20115029 atagaccggtgctagtcacaccccaaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattttcctcttcatgtaaattttt 20115128  T
Q  212 aaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattg 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20115129 taaaacccatcttttatgatcattctgaacctttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattg 20115228  T
Q  312 atctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20115229 atctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 20115313  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19390696 - 19390446
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19390696 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 19390597  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19390596 accccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 19390497  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19390496 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 19390446  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17977874 - 17977621
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccc-atcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17977874 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacc 17977775  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17977774 cttaccccctttcatccacaaatcacaatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacaactttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaat 17977675  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17977674 ttcatgaatttcattttcgacgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 17977621  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Original strand, 2357341 - 2357589
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357341 ttacactcaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 2357440  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2357441 cccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 2357540  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2357541 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattggttgttttggtat 2357589  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26479978 - 26479727
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26479978 aagttacaccccaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaaccaatcttttatgatcattctgaaccct 26479879  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26479878 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtaaattt 26479779  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26479778 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 26479727  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 6034411 - 6034664
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccc-atcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6034411 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataatactaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacc 6034510  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6034511 cttacaccctttcatccacaaatcactatagatgtgcaactaatatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaat 6034610  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6034611 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 6034664  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 25336524 - 25336776
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||     
T  25336524 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtccttttcatgtaaatttttaaaaatctatcttttatgattattctgaacct 25336623  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25336624 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 25336723  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25336724 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25336776  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 8113687 - 8113943
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8113687 caagttacacccaaatttatttaaaattttactataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 8113786  T
Q  244 tta----ccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    |||    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  8113787 ttacttaccccctttcatccacaagtcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatatttataaaggttagtg 8113886  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8113887 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8113943  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 12242744 - 12242996
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12242744 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 12242843  T
Q  246 accccc--tttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  12242844 accccccatttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaagttagtgaatt 12242943  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12242944 tcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 12242996  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33965572 - 33965320
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33965572 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 33965473  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||    
T  33965472 ttgccctctttcatccacaaatcaccataaatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctctgttattgatttgtattatattcataaaggtcagtgaatt 33965373  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33965372 tcatgaatttcatttttgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 33965320  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41568833 - 41568581
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41568833 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattatcctcttcatgtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattttgaaccc 41568734  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41568733 ttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaagatctgaatcatcatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 41568634  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41568633 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 41568581  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14287578 - 14287335
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14287578 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacct 14287479  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14287478 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaattaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 14287379  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14287378 ---------tcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 14287335  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39430382 - 39430134
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39430382 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgttctcttcatgtaaatttctaaaaactcatattttatgatcattctgaacccttac 39430283  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  39430282 cccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatttaaatcaatatatttgttattgatctgtactatatttataaaggttagtgaatttaat 39430183  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39430182 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 39430134  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2372218 - 2371976
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2372218 aagttacatctaaatttatttaaacttttacaataatactaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccct 2372119  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  2372118 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt- 2372020  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2372019 --------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 2371976  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31547401 - 31547156
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31547401 caagttagacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaaccc 31547302  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  31547301 ttacctcctttcatccacaaatcaccatatatgtg-------tatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcttaaaggttagtgaatt 31547209  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31547208 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattatttgttttggtat 31547156  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2380416 - 2380175
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2380416 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatcaatcttttatgatcattctgaaccctt 2380317  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||          ||     
T  2380316 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaag---------atta 2380226  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2380225 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 2380175  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 4049460 - 4049688
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4049460 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcttcttcatgtaaatttttaaaaacc-atcttttatgattattctgaaccct 4049558  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |||||||||||| ||||||||||    
T  4049559 taccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaca----------------------tattcataaaggttagtgaattt 4049636  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4049637 catgaatttcattttcgatgagtttttatttgtttattgtttgttttggtat 4049688  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 144 - 313
Target Start/End: Original strand, 11978762 - 11978931
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11978762 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcatctttctgtaaatttttaaaaacccattttttatgatcattctgaactc 11978861  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgat 313  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11978862 ttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatttgaatcaacatctttattattgat 11978931  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1222746 - 1222638
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1222746 ttacacccaaatttatttagaattttacaataatactaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttat 1222647  T
Q  248 cccctttca 256  Q
    |||||||||    
T  1222646 cccctttca 1222638  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1222413 - 1222313
Alignment:
Q  296 aacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagta 395  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1222413 aacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttaatgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggta 1222314  T
Q  396 t 396  Q
    |    
T  1222313 t 1222313  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 396
Target Start/End: Original strand, 11978930 - 11978971
Alignment:
Q  355 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11978930 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11978971  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 190
Target Start/End: Original strand, 43652933 - 43652976
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatt 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43652933 gttatacccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaatt 43652976  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 190
Target Start/End: Original strand, 17435356 - 17435400
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatt 190  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17435356 agttacacttaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaatt 17435400  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35006508 - 35006460
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccct 195  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35006508 gttacacctaaatttacttaaaagtttacaataatatcaaaattgccct 35006460  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Original strand, 932076 - 932121
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattg 191  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  932076 agttacacccatatttactttaaattttataataataccaaaattg 932121  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Original strand, 9141719 - 9141764
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattg 191  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  9141719 agttacacccaaattaacttaaaattttgcattaataccaaaattg 9141764  T

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Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35393646 - 35393394
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393646 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 35393547  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35393546 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaaatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 35393447  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35393446 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 35393394  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 8352379 - 8352631
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8352379 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 8352478  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8352479 ttcccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatt 8352578  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8352579 tcatgaatttcatttttgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8352631  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Original strand, 30655004 - 30655252
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30655004 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacctattttttatgatcattctgaacccttac 30655103  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655104 cccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggctagtgaatttcat 30655203  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30655204 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 30655252  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 11020402 - 11020654
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020402 caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatataaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 11020501  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11020502 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 11020601  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11020602 tcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11020654  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 29997494 - 29997745
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29997494 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaaccct 29997593  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29997594 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacaaatatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 29997693  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29997694 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattatttgttttggtat 29997745  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 39780311 - 39780564
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccc-atcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39780311 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacc 39780410  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39780411 cttacaccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaat 39780510  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39780511 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 39780564  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 33411044 - 33411297
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttt-taaaaacccatcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33411044 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaattttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacc 33411143  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33411144 cttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagggaat 33411243  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33411244 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 33411297  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 483282 - 483030
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  483282 caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaaccc 483183  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  483182 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaactaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 483083  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  483082 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 483030  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 36781651 - 36781903
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36781651 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattttgaaccc 36781750  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36781751 ttaccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 36781850  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36781851 ttatgaatttcattttcgatgaatttctatttgtttattgtttgttttggtat 36781903  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38098907 - 38098657
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38098907 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 38098808  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  38098807 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 38098708  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38098707 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 38098657  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24757891 - 24757641
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24757891 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccat-ttttatgatcattctgaactct 24757793  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24757792 taccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 24757693  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24757692 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 24757641  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 20187471 - 20187723
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20187471 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactc 20187570  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  20187571 ttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgttctgtactatattcataaaggtttgtgaatt 20187670  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20187671 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 20187723  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 20206540 - 20206792
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20206540 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactc 20206639  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  20206640 ttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgttctgtactatattcataaaggtttgtgaatt 20206739  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20206740 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 20206792  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25487349 - 25487097
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25487349 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 25487250  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25487249 ttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcagccaagatctgaatcaacatcttttttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 25487150  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25487149 tcatgaacttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25487097  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 144 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26416424 - 26416177
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26416424 caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaatggtcctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgattattctgaaccc 26416325  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  26416324 ttaccccctttcatccacaaatcacaatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggtcagtgaatt 26416225  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26416224 tcaagaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 26416177  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 31097515 - 31097757
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  31097515 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatga---------accct 31097605  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31097606 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 31097705  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31097706 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgttttttgtttgttttggtat 31097757  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 145 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30700140 - 30699895
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30700140 aagttacactcaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctctttgtgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaaccct 30700041  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat--ttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||    
T  30700040 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttttgttattaatttgtactatattcataaaggttaatgaat 30699941  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgt 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699940 ttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgt 30699895  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 147 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1105066 - 1104818
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctta 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  1105066 gttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctttcttcatgtaaattactaaaaacccatcttttatgataattctgaactctca 1104967  T
Q  247 ccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttca 346  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1104966 cccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttta 1104868  T
Q  347 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1104867 tgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 1104818  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 373
Target Start/End: Original strand, 45084246 - 45084464
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084246 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 45084345  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45084346 accccctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 45084436  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctat 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45084437 atgaatttcattttcaatgagtttctat 45084464  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 12986670 - 12986911
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12986670 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcgtgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 12986769  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||  || |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||          
T  12986770 tta--ccatttcatccacaaattatcatagatgtgaaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttag------ 12986861  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12986862 ---tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 12986911  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 115 - 300
Target Start/End: Original strand, 27719212 - 27719397
Alignment:
Q  115 agaccggtgctagtcacaccccnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27719212 agactggtgctagtcacaccccaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaa 27719311  T
Q  215 aacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27719312 aacccatcttttatgatcattctgaacccttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacat 27719397  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 314
Target Start/End: Original strand, 5458261 - 5458428
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  5458261 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaa-tttc 5458359  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatc 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5458360 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatc 5458428  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 253
Target Start/End: Original strand, 20818954 - 20819063
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20818954 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 20819053  T
Q  244 ttaccccctt 253  Q
    ||||||||||    
T  20819054 ttaccccctt 20819063  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 261
Target Start/End: Original strand, 32834592 - 32834705
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  32834592 ttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaatccattttttatgattattctgaacccttat 32834691  T
Q  248 cccctttcatccac 261  Q
    ||||||||||||||    
T  32834692 cccctttcatccac 32834705  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 396
Target Start/End: Original strand, 20819064 - 20819164
Alignment:
Q  296 aacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagta 395  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20819064 aacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggta 20819163  T
Q  396 t 396  Q
    |    
T  20819164 t 20819164  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 285
Target Start/End: Original strand, 18574818 - 18574934
Alignment:
Q  170 ttttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc-catcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcac 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | ||||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18574818 ttttacaataataccaaaattaccctcttcatgtaaatttgtaaaaaactcttcttccattatcattttgaaccctcaccccctttcatccacaaatcac 18574917  T
Q  269 catagatgtgcaaccaa 285  Q
    |||||||||||||||||    
T  18574918 catagatgtgcaaccaa 18574934  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 13174239 - 13174334
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaac 241  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  13174239 agttacactcaaatttacttaaaattttacaataataccgaaattagcctcttcaagtaaatttttaaaaacccttttttcatgatcattatgaac 13174334  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Original strand, 20524967 - 20525086
Alignment:
Q  170 ttttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcacc 269  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||| | |||||| ||| ||| ||||| |||  ||||| |    
T  20524967 ttttacaataataccgaaattgtcttcttcatgtaaattttttaaaa-ccttctttcattatcactttgaacctttatcccttttcacccaaaaatcatc 20525065  T
Q  270 atagatgtgcaaccaatatct 290  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  20525066 atggatgtgcaatcaatatct 20525086  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 396
Target Start/End: Original strand, 5458438 - 5458491
Alignment:
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5458438 ttcatgaatttcattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtat 5458491  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 190
Target Start/End: Original strand, 16584425 - 16584468
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatt 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16584425 gttacacccaaatttacttaaaattttataataataccaaaatt 16584468  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29226013 - 29225979
Alignment:
Q  157 aatttatttaaaattttacaataataccaaaattg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29226013 aatttatttaaaattttacaataatatcaaaattg 29225979  T

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Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1546314 - 1546062
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1546314 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 1546215  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1546214 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 1546115  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1546114 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 1546062  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 24348802 - 24349054
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348802 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 24348901  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24348902 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 24349001  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24349002 tcatgaatttcattttcgatgattttctatttgtttattgtttgttttggtat 24349054  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 51754422 - 51754674
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51754422 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 51754521  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  51754522 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttattgaatt 51754621  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51754622 ttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 51754674  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 43973361 - 43973109
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43973361 caagttatacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 43973262  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43973261 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 43973162  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43973161 tcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 43973109  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 51167307 - 51167055
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51167307 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaaccc 51167208  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  51167207 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtcagtgaatt 51167108  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51167107 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 51167055  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 44377782 - 44378033
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44377782 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccct 44377881  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44377882 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 44377981  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44377982 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 44378033  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5273710 - 5273458
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5273710 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccgaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 5273611  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5273610 ttaccccctttcatccacaaatcaccgtagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtggatt 5273511  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5273510 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 5273458  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10471484 - 10471232
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10471484 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacct 10471385  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10471384 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaactaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 10471285  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10471284 tcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 10471232  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 38252518 - 38252770
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38252518 caagttacatctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 38252617  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38252618 ttaccccctttcattcacaaatcaccgtagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 38252717  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38252718 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 38252770  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 144 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10049245 - 10048998
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10049245 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattatgaaccc 10049146  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10049145 ttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 10049046  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049045 ttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 10048998  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 13286929 - 13287181
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13286929 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgataattttgaaccc 13287028  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13287029 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatattagaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 13287128  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13287129 ttatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 13287181  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 55274277 - 55274025
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  55274277 caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattatgaactc 55274178  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55274177 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 55274078  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55274077 tcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 55274025  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8828745 - 8828494
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8828745 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcgtcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaactct 8828646  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  8828645 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtcggtgaattt 8828546  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8828545 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8828494  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 9745944 - 9746194
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9745944 aagttacacccgaatttatttaaa-ttttacaataatactaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 9746042  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9746043 tacccccttttatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 9746142  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9746143 catgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 9746194  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 148 - 391
Target Start/End: Original strand, 23150742 - 23150985
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23150742 ttacacccatatttatttaaaattttataataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctaaacccttat 23150841  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23150842 cccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 23150941  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23150942 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 23150985  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 10659525 - 10659777
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  10659525 caagttaaacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcgtttacgatcattctgaaccc 10659624  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  10659625 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatcttaatcaacatctttgttattgatttgtaatatattcataaaggttagtgaatt 10659724  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10659725 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 10659777  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 37821061 - 37821312
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37821061 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 37821160  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
     |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37821161 gtacctc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 37821259  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37821260 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 37821312  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 22497241 - 22497491
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22497241 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 22497340  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22497341 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttc 22497440  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22497441 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 22497491  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 53018982 - 53019232
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53018982 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatgtttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 53019081  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  53019082 accccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtaatatattcataaaggttagtgaatttc 53019181  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53019182 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 53019232  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12227881 - 12227628
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12227881 caagttacacttaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcacgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaaccc 12227782  T
Q  244 ttaccccc-tttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12227781 ttacccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaat 12227682  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12227681 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 12227628  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8068652 - 8068400
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  8068652 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaagattgccctcttcatgtaaatttcttaaaactcatattttatgattattctgaaccc 8068553  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8068552 ttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 8068453  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8068452 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8068400  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 2445961 - 2446212
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2445961 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtgaatttttaaaaacccatattttatgatcattctgaaccct 2446060  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2446061 taccccatttcatccacaaatcacaatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcaaaaagcttagtgaattt 2446160  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2446161 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 2446212  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Original strand, 24405774 - 24406030
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24405774 ttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 24405873  T
Q  248 cccctt--------tcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    ||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24405874 ccccttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtg 24405973  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24405974 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 24406030  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 27449491 - 27449742
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449491 aagttacatctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatttccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 27449590  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27449591 tatcccctttcatccacaaattaccatagatgtgcaacaaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 27449690  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27449691 cataaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 27449742  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 46528089 - 46528349
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46528089 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 46528188  T
Q  244 ttaccccctt--------tcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggct 335  Q
    ||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  46528189 ttacccccttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtt 46528288  T
Q  336 agtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46528289 agtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 46528349  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 149 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 49804986 - 49804739
Alignment:
Q  149 tacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacc 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49804986 tacatccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttacc 49804887  T
Q  249 ccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatg 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49804886 ccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatg 49804787  T
Q  349 aatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49804786 aatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 49804739  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 31655044 - 31655294
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655044 caagttacacccaaatttatttaaaatttaacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 31655143  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31655144 ttacctcatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 31655243  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  31655244 tcatgaatttcattttcgatgagtttcta--tgtttattgtttgttttggtat 31655294  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 43218757 - 43219007
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43218757 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 43218856  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  43218857 accccctttcatccacaaatcaccgtagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattggtgaatttc 43218956  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43218957 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 43219007  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17338607 - 17338357
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17338607 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 17338508  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||     
T  17338507 actccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtattatattcataaagattagtgaatttt 17338408  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17338407 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 17338357  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 144 - 352
Target Start/End: Original strand, 35846746 - 35846954
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35846746 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 35846845  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35846846 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 35846945  T
Q  344 tcatgaatt 352  Q
    |||| ||||    
T  35846946 tcatnaatt 35846954  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37126761 - 37126518
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126761 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 37126662  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37126661 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatatacaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 37126562  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37126561 ---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 37126518  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20607821 - 20607578
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20607821 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 20607722  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20607721 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 20607622  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20607621 ---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 20607578  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28555296 - 28555048
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28555296 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcttcttcatgtaaatttctaaaaacttatcttttatgatcattctgaaccct 28555197  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28555196 ta-cctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaattt 28555098  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28555097 c--gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 28555048  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 47697767 - 47698015
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47697767 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcaatctgaaccc 47697866  T
Q  244 ttacc-----ccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagt 338  Q
    |||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  47697867 ttacccccttccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttag- 47697965  T
Q  339 gaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47697966 --------tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 47698015  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 3019201 - 3019452
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3019201 caagttacatctaaatttatttaaaattttacaataatattaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttataatcattctgaaccc 3019300  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3019301 ttatccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaagattagtgaatt 3019399  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3019400 ttatgaatttcattttcgatgagtttctatctgtttattgtttgttttggtat 3019452  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 157 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41114221 - 41113982
Alignment:
Q  157 aatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41114221 aatttatttaaaattttacaataatatcaaaattatcctcttcatgtaaatttttaaaaatttatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttca 41114122  T
Q  257 tccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  41114121 tccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatctaaatcaacatctttgttattgttctgtactatatttataaaggttggtgaatttcatgaattttat 41114022  T
Q  357 tttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41114021 tttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 41113982  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 26229371 - 26229624
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||    
T  26229371 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatgtttaaaaacccatcttttatga--------aaccc 26229462  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctag------ 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||          
T  26229463 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatcttagttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 26229562  T
Q  338 ---tgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26229563 tcatgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 26229624  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 41454247 - 41454497
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  41454247 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtctttttcatgtaaattactaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccttc 41454346  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  41454347 accccctttcatccaaaaatcaccataaatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattaatttgtactatattcataaagattagtgaatttt 41454446  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41454447 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 41454497  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 30357251 - 30357453
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30357251 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattttgaaccct 30357350  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30357351 taccccctttcatccacaaatcaccatagatatgtaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 30357450  T
Q  345 cat 347  Q
    |||    
T  30357451 cat 30357453  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Original strand, 48458387 - 48458556
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48458387 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 48458486  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatct 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48458487 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatct 48458556  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26975596 - 26975362
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26975596 caagttacacctaaatttatttaaaattttactataatatcaaaattg---------tgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 26975506  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26975505 ttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 26975406  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26975405 ---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 26975362  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 998447 - 998292
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  998447 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgccatcttcatgtaaatttctaaaaacccatgttttatgatcattctgaaccct 998348  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  998347 taccccctttcattcacaaatcaccatagatgtacaaccaagatctgaatcaacat 998292  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26718095 - 26717973
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26718095 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 26717996  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcac 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  26717995 accccctttcatccacaaatcac 26717973  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35513188 - 35512941
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |     
T  35513188 agttacatctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtagatttttaaaaacccttctttcattatcattctgaaccttc 35513089  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||      ||||||||||| ||| | |||||| | || | |||||||||||| |||      
T  35513088 accccctttcatccaaaaatcatcatagatgtgctaccaagatcaaagattgaatcaacatatttttcattgatatgtattctattcataaaggttag-- 35512991  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
           |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35512990 -------tgaatttcattttccaagagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 35512941  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 266 - 396
Target Start/End: Original strand, 501837 - 501967
Alignment:
Q  266 caccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatga 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  501837 caccatagatgcgcaaccaatatcagaatcaacatttttgccattgatttgtactctattcattaaggttagtgaatttcatgaatttcattttttaaga 501936  T
Q  366 gtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  501937 gtttctatttgtttattgtttgttttggtat 501967  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Original strand, 501740 - 501837
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  501740 agttacatccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgttctcttcatgtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 501837  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 249
Target Start/End: Original strand, 33591124 - 33591194
Alignment:
Q  179 aataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591124 aataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccc 33591194  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 396
Target Start/End: Original strand, 48477883 - 48477959
Alignment:
Q  320 tatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48477883 tatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 48477959  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 240
Target Start/End: Original strand, 5218974 - 5219068
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| || | ||| | || |||||||||||    
T  5218974 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccccctccatctaaatttctaaagacacttctctcattatcattctgaa 5219068  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9126419 - 9126348
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9126419 agttacacctaaatttacttaaaattttacaataataccgaaatt-acctcttcatgtaaattttttaaaacc 9126348  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9134526 - 9134455
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9134526 agttacacctaaatttacttaaaattttacaataataccgaaatt-acctcttcatgtaaattttttaaaacc 9134455  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9116531 - 9116462
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9116531 ttacacccaaatttacttaaaattttacaataataccgaaa-ccacctcttaatgtaaattttttaaaacc 9116462  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 189
Target Start/End: Original strand, 50507665 - 50507707
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaat 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  50507665 gttacacccaaatttacttaatattttacaatagtaccaaaat 50507707  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31608427 - 31608390
Alignment:
Q  155 caaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgc 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31608427 caaatttacttaaaattttataataataccaaaattgc 31608390  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50744454 - 50744394
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaa 206  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  50744454 agttacacccaattttttaaaaaattttacaataatatcgaaaatgccctctccatgtaaa 50744394  T

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Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31588050 - 31587798
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31588050 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 31587951  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31587950 ttaccccctttcatccacaaatcaccatatatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 31587851  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31587850 tcatgaatttcattttcgatgagtttttatttgtttattgtttgttttggtat 31587798  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5544435 - 5544184
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544435 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatattaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 5544336  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5544335 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 5544236  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5544235 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 5544184  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 3887670 - 3887922
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887670 caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 3887769  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3887770 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 3887869  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3887870 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 3887922  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12726350 - 12726098
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726350 caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataataccaaaattaccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 12726251  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12726250 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagcgaatt 12726151  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12726150 tcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 12726098  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 12848440 - 12848692
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12848440 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattaccctcttcatataaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 12848539  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12848540 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatatttataaaggttagtgaatt 12848639  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12848640 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 12848692  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18676888 - 18676636
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18676888 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 18676789  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18676788 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 18676689  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18676688 taatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 18676636  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 47455050 - 47455302
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47455050 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 47455149  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  47455150 ttaccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttggtgaatt 47455249  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47455250 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatctgtttattgtttgttttggtat 47455302  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 116 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41118937 - 41118657
Alignment:
Q  116 gaccggtgctagtcacaccccnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41118937 gaccggtgctagtcacaccccaaaaaaacaagttacacctaaatttatttaaaatttaacaataataccaaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaa 41118838  T
Q  216 acccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatct 315  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41118837 atccatcttttatgataattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatgt 41118738  T
Q  316 atactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41118737 gtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 41118657  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40186838 - 40186586
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40186838 caagttacatccaaatttatttaaaattttataataataccaaaagtgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactc 40186739  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40186738 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaacatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 40186639  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40186638 ttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 40186586  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 47020600 - 47020349
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47020600 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccct 47020501  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47020500 taccccctttcatccacaaaccatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacacctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 47020401  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47020400 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 47020349  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 148 - 391
Target Start/End: Original strand, 31621940 - 31622183
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621940 ttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttac 31622039  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31622040 tccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 31622139  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31622140 aaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 31622183  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40431405 - 40431155
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40431405 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 40431306  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40431305 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttc 40431206  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40431205 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 40431155  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9741358 - 9741115
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9741358 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 9741259  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9741258 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 9741159  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9741158 ---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 9741115  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 154 - 396
Target Start/End: Original strand, 44061818 - 44062060
Alignment:
Q  154 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44061818 ccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 44061917  T
Q  254 tcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaattt 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44061918 tcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattt 44062017  T
Q  354 cattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44062018 cattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 44062060  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 44291052 - 44291304
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44291052 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactc 44291151  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  44291152 ttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgttctgtactatattcataaaggtttgtgaatt 44291251  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44291252 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 44291304  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 42076336 - 42076586
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42076336 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccgtt 42076435  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  42076436 accccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattggtgaatttc 42076535  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42076536 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 42076586  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38743355 - 38743114
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38743355 caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctct------aaaattttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 38743262  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38743261 ttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 38743162  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38743161 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattatttgtttt 38743114  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9870533 - 9870282
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9870533 aagttacatccaaattaattaaaaagtttacaataataacaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttattatcattctgaacact 9870434  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9870433 tatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcatccaatatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaattt 9870334  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9870333 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 9870282  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 144 - 359
Target Start/End: Original strand, 44508503 - 44508719
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttt-taaaaacccatcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44508503 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaattttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacc 44508602  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  44508603 cttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgagt 44508702  T
Q  343 ttcatgaatttcatttt 359  Q
    ||||||||||| |||||    
T  44508703 ttcatgaattttatttt 44508719  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 42697408 - 42697649
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42697408 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctctttatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaaccctt 42697507  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  42697508 accccctttcatccacaaatcac---------gcaacaaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtaatatattcataaaagttagtgaatttc 42697598  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42697599 atgaatttcattttcaatgagtttatatttgtttattgtttgttttggtat 42697649  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3112205 - 3111962
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |     
T  3112205 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattaccatcttcatgtaaattactaaaaacctatcttttatgatcattatgaaccttc 3112106  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||       ||||||||||     
T  3112105 accccctttcatccacaaattaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtactatattca-------tagtgaatttt 3112013  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3112012 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttcttttggtat 3111962  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 396
Target Start/End: Original strand, 25105043 - 25105227
Alignment:
Q  212 aaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattg 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25105043 aaaaacccatcttttatgattattctgaacctttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgaaatcaatatctgaatcaacatctttgttattg 25105142  T
Q  312 atctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25105143 atctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25105227  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30888523 - 30888401
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30888523 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatattttatgatcattctgaaccct 30888424  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatca 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  30888423 taccccctttcatccacaaatca 30888401  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 8762350 - 8762446
Alignment:
Q  7 ccttgttcacctctatatgatgaaaagctagaggaagcaccatcattgaatgagttttttgcttgaaaaaatggaaggtttgaagggcttattccaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8762350 ccttgttcacctctatatgatgaaaagctagtggaagcaccatcattgaatgagttttttgcttgaaaaaatggaaggtttgaagagcttattccaa 8762446  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 8788881 - 8788977
Alignment:
Q  7 ccttgttcacctctatatgatgaaaagctagaggaagcaccatcattgaatgagttttttgcttgaaaaaatggaaggtttgaagggcttattccaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8788881 ccttgttcacctctatatgatgaaaagctagtggaagcaccatcatggaatgaggtttttgcttgaaaaaatggaaggtttgaagagtttattccaa 8788977  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40190188 - 40190120
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40190188 aaatttatttaaaattt-acaataatatcaaaattgccctcttcatataaatttctaaaaacccatcttt 40190120  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27419161 - 27418930
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| | || ||||||||  | ||| || ||||||||||||| | ||    
T  27419161 ttacacctaaatttacttaaaattttataataataccaaaattgctctctccacgtagaattctaaaaacctctttttcataatcattctgaaccatcac 27419062  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaa 341  Q
    |            |||| ||||||||||||  |||||| |||      ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||  | ||||    
T  27419061 c------------ccaaccaccatagatgtaaaaccaagatcaaagtttgaattaacatctttttcattgatcgatactctatccataaaggtcaatgaa 27418974  T
Q  342 tttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtt 385  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  27418973 tttcatgaattttattatcgaagagtttctatttatttcttgtt 27418930  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38168177 - 38168048
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||         ||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||     
T  38168177 agttacatccaaaattacttaaaattttacaaaaataccaaaattgtcct---------aatttctaaaaaccccttttttgtgatcattttgaaccctc 38168087  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaa 285  Q
    ||| | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  38168086 acctc-tttcatccgcaaatcaccataggtgtgcaaccaa 38168048  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 396
Target Start/End: Original strand, 44509059 - 44509100
Alignment:
Q  355 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44509059 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 44509100  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 39494886 - 39494926
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaa 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39494886 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaa 39494926  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10242475 - 10242424
Alignment:
Q  155 caaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10242475 caaatttacttaaaatttgacaataataccaaaattatcatcttcatgtaaa 10242424  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37545041 - 37544997
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattg 191  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37545041 gttacacccaattttacttaaaatttaacaataatatcaaaattg 37544997  T

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Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3390959 - 3390707
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390959 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 3390860  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3390859 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctttactatattcataaaggttagtgaatt 3390760  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3390759 tcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgatttggtat 3390707  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 42675785 - 42675534
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42675785 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaaccct 42675686  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42675685 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 42675586  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42675585 cataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 42675534  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 145 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35066170 - 35065915
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35066170 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaacccat-ttttatgatcattctgaaccct 35066072  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35066071 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 35065972  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtt---tattgtttgttttagtataa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  35065971 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattattgtttgttttggtataa 35065915  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8836657 - 8836407
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8836657 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 8836558  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  8836557 taccccctt-catccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaattt 8836459  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8836458 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8836407  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 25031424 - 25031675
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25031424 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgcactcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaatcct 25031523  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25031524 taccccctttcatccacaaatcaccgtagatatgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaattt 25031623  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25031624 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25031675  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41743487 - 41743236
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41743487 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattttgaaccct 41743388  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41743387 tatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaattt 41743288  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41743287 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 41743236  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 8335319 - 8335570
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8335319 aagttacacttaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 8335418  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  8335419 ttccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctatgttattgatctgtaatatattcataaaagttagtgaattt 8335518  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8335519 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8335570  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 145 - 379
Target Start/End: Original strand, 18185762 - 18185995
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18185762 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaactct 18185861  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18185862 tacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaattt 18185960  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18185961 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 18185995  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 36484726 - 36484476
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36484726 agttacacctaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtccttttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 36484627  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36484626 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttc 36484527  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36484526 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 36484476  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 29296188 - 29296439
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29296188 agttacatctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactctt 29296287  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaa-tatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29296288 accctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaattatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaattt 29296387  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29296388 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 29296439  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 144 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23192011 - 23191782
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23192011 caagttacacccaaatttgtttaaaattttataataatactaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 23191912  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23191911 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaagatctgaatcaacatctttgtta-tgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 23191813  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23191812 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatt 23191782  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33591822 - 33591585
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33591822 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaatcc 33591723  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||         |    
T  33591722 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatcagtactatattcataaagg---------t 33591632  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttt 390  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591631 tattgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttt 33591585  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27771416 - 27771137
Alignment:
Q  115 agaccggtgctagtcacaccccnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  27771416 agaccggtgctagtcacacccaaaaaaaacaagttacatccaaatttatttaaaatttaacaataataccaaaattgtcatcttcatgtaaatttctaaa 27771317  T
Q  215 aacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  27771316 aacccatcttttatgatcattctgaactcttacctcatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgata 27771217  T
Q  315 tatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27771216 tgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtt--tatatgtttattgtttgttttggtat 27771137  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 154 - 398
Target Start/End: Original strand, 1420978 - 1421213
Alignment:
Q  154 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1420978 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgcccttttcatgtaaaattttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 1421077  T
Q  254 tcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaattt 353  Q
    |||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1421078 tcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattt 1421168  T
Q  354 cattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtataa 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1421169 cattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtataa 1421213  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10692037 - 10691795
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692037 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 10691938  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||         ||    
T  10691937 tacccgatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaagg---------tt 10691847  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10691846 aatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 10691795  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 396
Target Start/End: Original strand, 28349003 - 28349283
Alignment:
Q  115 agaccggtgctagtcacaccccnnnnnnn-caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  28349003 agaccggtgctagtcacaccccaaaaaaaacaagttacacctaaatttatttaaaatttaacaataataccaaaattgtcatcttcatgtaaatttctaa 28349102  T
Q  214 aaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgat 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  28349103 aaacccatcttttatgatgattctgaacccttacctcatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattggt 28349202  T
Q  314 ctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  28349203 atgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttcta--tgtttattgtttgttttggtat 28349283  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 42221727 - 42221928
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42221727 agttacactcaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgcactcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 42221826  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42221827 accccctttcatccacaaatcaccataggtgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 42221926  T
Q  346 at 347  Q
    ||    
T  42221927 at 42221928  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 6230223 - 6230466
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6230223 caagttacacttaaatttatttaaaattttacaataatattaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatattttatgatcattctgaaccc 6230322  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||          
T  6230323 ttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttag------ 6230416  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6230417 ---tgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 6230466  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15472793 - 15472546
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15472793 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcaatctgaaccct 15472694  T
Q  245 taccc-----cctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    |||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  15472693 tacccccttccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttag-- 15472596  T
Q  340 aatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15472595 -------tgaatttcattttcgatgagtttctatctgtttattgtttgttttggtat 15472546  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8782809 - 8782569
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  8782809 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcttgttcatgtaaatttctaaaaacccatctttcatgatcattctgaattctc 8782710  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| || | ||||||||          ||||||    
T  8782709 accccctttcatccacaaattaccatagatgtgcaaccaagatttgaatcaacatctttgccattgatctgtaatctattcata----------aatttc 8782620  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8782619 atgaattttattttctaagagtttctatttgtttatggttttttttggtat 8782569  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33570195 - 33569964
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  33570195 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcatgttcatgtaaatttctaaaaacccaccttttatgatcattctgaattctc 33570096  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    ||||||||| |||||| |||         ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||          ||||||    
T  33570095 acccccttttatccacaaat---------tgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtaatctattcata----------aatttc 33570015  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33570014 atgaattttattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtat 33569964  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 299 - 396
Target Start/End: Original strand, 18617559 - 18617656
Alignment:
Q  299 atttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18617559 atttttgttattgatctgtactgtattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 18617656  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8936012 - 8935914
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  8936012 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaaccattctttcattatcattctgaaccct 8935914  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25472415 - 25472199
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||   |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |     
T  25472415 agttacacccaaatttatttaaaattttataataatactgaaaccaccctcttcatttaaaattctaaaaacccatttttcatgatcattctgaactttc 25472316  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtg 339  Q
    | ||||||||| | || || || |||| ||||| |||||| |||      |||||||| |||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || |     
T  25472315 atcccctttcacctacaaaccatcataaatgtgaaaccaaaatcaaagattgaatcaatatttttttcattgatcggtactctattcataaaggttacta 25472216  T
Q  340 aatttcatgaatttcat 356  Q
    |||||||| ||||||||    
T  25472215 aatttcataaatttcat 25472199  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24912812 - 24912764
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccct 195  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  24912812 gttacatccaaatttacttaaaagtttacattaatactaaaattgccct 24912764  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 379
Target Start/End: Original strand, 42221919 - 42221951
Alignment:
Q  347 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42221919 tgaatttcattttcaatgagtttctatttgttt 42221951  T

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Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11005738 - 11005488
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005738 agttacacccaaatttatttaaaatttaacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 11005639  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11005638 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 11005539  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11005538 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11005488  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Original strand, 50621666 - 50621914
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621666 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 50621765  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50621766 cccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaaatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 50621865  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50621866 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 50621914  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 22169109 - 22169361
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22169109 caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 22169208  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22169209 ttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 22169308  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22169309 tcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 22169361  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39677793 - 39677541
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39677793 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattaccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 39677694  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39677693 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttattattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatt 39677594  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39677593 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 39677541  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 2491833 - 2492083
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2491833 agttacacccaaatttatttaaaatttaacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 2491932  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2491933 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 2492032  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2492033 atgaattttattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 2492083  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 56162475 - 56162725
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56162475 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 56162574  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  56162575 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatatgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 56162674  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56162675 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 56162725  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Original strand, 29923605 - 29923853
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29923605 ttacacctaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacctatcttttatgatcattttgaacccttac 29923704  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29923705 cccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 29923804  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29923805 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 29923853  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 36309087 - 36308839
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36309087 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 36308988  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36308987 tccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 36308888  T
Q  348 gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36308887 gaatttcattttcgatgaatttctatttgtttattgtttgttttggtat 36308839  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 36225220 - 36224969
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36225220 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaactct 36225121  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36225120 tactccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttattattgatctgtactatattcataaaggatagtgaattt 36225021  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36225020 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 36224969  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27767721 - 27767472
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27767721 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 27767622  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  27767621 acccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 27767523  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27767522 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 27767472  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 144 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24745078 - 24744825
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24745078 caagttacacccaaatttatttacaattttacaataataccaaaattgccctcttcatataaatttttaaaaatccatcttttataatcattctgaaccc 24744979  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24744978 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatcaacatctttgttattaatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 24744879  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtata 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24744878 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtata 24744825  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28867803 - 28867550
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28867803 caagttacacttaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 28867704  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28867703 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 28867604  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttg-tttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28867603 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttttattgtttgttttggtat 28867550  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3875753 - 3875501
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3875753 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatattttatgatcattctgaaccc 3875654  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  3875653 ttatcccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttggtgaatt 3875554  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3875553 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 3875501  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7327783 - 7327532
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  7327783 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaatctt 7327684  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7327683 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacaaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 7327584  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7327583 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 7327532  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 54202332 - 54202582
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54202332 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 54202431  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  54202432 accccctttcatccacaaatcaccatagatttgcaaccaatatctgaatcaacatatttattattgatctgtactatattcataaagattaatgaatttc 54202531  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54202532 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 54202582  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7554528 - 7554276
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554528 caagttacacccaaatttatttcaaattttacaataataccaaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaaccc 7554429  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  7554428 ttaccccctttcattcataaaccaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaagattagtgaatt 7554329  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7554328 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 7554276  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Original strand, 45884570 - 45884810
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45884570 aaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 45884669  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttca 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45884670 atccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctctactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttca 45884769  T
Q  356 ttttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45884770 ttttcgatgagtttctatttgtttattgttggttttggtat 45884810  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3932077 - 3931824
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc-catcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3932077 caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacctcatcttttatgatcattctgaacc 3931978  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  3931977 cttacccccttttatccacaaatcaccatagatgtgtaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaat 3931878  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3931877 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 3931824  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 26488353 - 26488604
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26488353 agttacacccaaatttatttcaaattt-acaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 26488451  T
Q  246 acccc--ctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26488452 accccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 26488551  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26488552 tcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 26488604  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3874658 - 3874406
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874658 caagttacatccaaatttatttaaaattgtactataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 3874559  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  3874558 ttaccccctttcatccacaaatcaccaaagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatt 3874459  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3874458 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 3874406  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33961889 - 33961637
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33961889 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttctgatcattctgaaccc 33961790  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33961789 ttactccctttcatccacaaatcaccataggtgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 33961690  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33961689 ttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 33961637  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 55282559 - 55282309
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55282559 aagttacatctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaattttttaaaaacccatattttatgatcattctgaaccct 55282460  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55282459 tacctc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 55282361  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55282360 catgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 55282309  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 20492504 - 20492755
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  20492504 aagttacatcgaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctaaaacat 20492603  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20492604 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaactaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 20492703  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20492704 catgaatttcattttcgatgactttctatttgtttattgtttgttttggtat 20492755  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 36432573 - 36432323
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36432573 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataacgtcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc-atcttttatgatcattctgaaccct 36432475  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||    
T  36432474 tactccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggtcagtgaattt 36432375  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36432374 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 36432323  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 49332218 - 49331968
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49332218 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctt 49332119  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||   ||||||||||    
T  49332118 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatcaacatctttgttattgatttgtactgtattcataaagatcagtgaatttc 49332019  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49332018 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 49331968  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43957945 - 43957702
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43957945 agttacccccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgcccttttcatgtaaaattttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 43957846  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43957845 accccctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 43957755  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtataa 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43957754 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtataa 43957702  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17445748 - 17445505
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445748 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattatcctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 17445649  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17445648 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgacatgtactatattcataaaggttagtgaatt 17445549  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17445548 ---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 17445505  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41764765 - 41764526
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  41764765 aaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtc-tcttcatgtaaatttttaaaaacttatcttttatgatcattctgaactcttacctcctttt 41764667  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttca 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41764666 atccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagcgaatttcatgaatttca 41764567  T
Q  356 ttttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41764566 ttttcgatgaatttctatttgtttattgtttgttttggtat 41764526  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29933619 - 29933378
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29933619 agttacatctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaaccctt 29933520  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||| ||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29933519 accctctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatcaacatctctgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 29933429  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29933428 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 29933378  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 147 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35949587 - 35949347
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35949587 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctctttatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccctta 35949488  T
Q  247 ccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttca 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35949487 ccccctttcatccacaaatcac---------gcaacaaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttca 35949397  T
Q  347 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35949396 tgaatttcattttcaatgagtttatatttgtttattgtttgttttggtat 35949347  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28573856 - 28573617
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             ||||||    
T  28573856 caagttacacccaaatttatttaaaattttacagtaatatcaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatctt-------------gaaccc 28573770  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28573769 ttaccccctttcatccacaaatcactatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattaatttgtacgatattcataaaggttagtgaatt 28573670  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28573669 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 28573617  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 44878044 - 44878294
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  44878044 agttacattcaaatttatttaaaaatttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttctagaaactcatcttttatgatcgttctgaaccttc 44878143  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||     
T  44878144 accccctttcatccataaatcaccatagatgtgcaactaagatctgaatcaacatctttgtcattgatttgtactatattcataaatgttagtgaatttt 44878243  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44878244 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttttgtat 44878294  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Original strand, 11308768 - 11308953
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  11308768 agttacactcaaatttatttaaaattttacaattataccaaaattgccctgttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaattctc 11308867  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaa 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  11308868 accccctttcatccacaaatcaccatatatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa 11308953  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Original strand, 55541828 - 55541948
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55541828 ttacactcaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgctctcttcatgtaaaattttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttac 55541927  T
Q  248 cccctttcatccaccaatcac 268  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  55541928 cccctttcatccacaaatcac 55541948  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11381997 - 11381821
Alignment:
Q  154 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  || | ||||||    
T  11381997 ccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgctctgttcaagtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattctaaattctca-cccctt 11381899  T
Q  254 tcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaa 331  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  11381898 tcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa 11381821  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7326525 - 7326317
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaa-cccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |    
T  7326525 agttacacccaaatttatttaaaattttagaataatactgaaattgccctctccatgtaaaattctaaaaaccccatttttcatgatcattttgaacctt 7326426  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagt 338  Q
    || || |||||| |||| || ||||||||||||  ||| || |||      ||||||||||| ||| | | ||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  7326425 taacctctttcacccacaaaccaccatagatgttaaacaaagatcaaagattgaatcaacatctttttcactgatcgatacactattcataaaggttagt 7326326  T
Q  339 gaatttcat 347  Q
    |||||||||    
T  7326325 gaatttcat 7326317  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15506633 - 15506585
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccct 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15506633 gttacacccaaatttacttaaaattttataataatacaaaaattgccct 15506585  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41476763 - 41476627
Alignment:
Q  151 cacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacccc 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||  | ||| || |||| | |||||| | || ||    
T  41476763 cacccaaatttacttaaaattttacaacgatgccaaaattgtcctctctatgtaaatttcttaaaacctttttttcattatcactttgaaccttcactcc 41476664  T
Q  251 ctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaata 287  Q
     ||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  41476663 ttttcacccacaaaccaccatgaatgtgcaaccaata 41476627  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7795368 - 7795306
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttt 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  7795368 agttacacccaaatttatt-aaaattttataataataccaaaactg-ccttttcatataaatttt 7795306  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 11308952 - 11308999
Alignment:
Q  349 aatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11308952 aatttcattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtat 11308999  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7818506 - 7818464
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  7818506 agttacacccaaatttacttaaaaatttataataataccaaaa 7818464  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1537017 - 1536980
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataatac 183  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1537017 agttacacccaaatttactaaaaattttacaataatac 1536980  T

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Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 25828677 - 25828927
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25828677 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccctt 25828776  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25828777 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 25828876  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25828877 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25828927  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15476107 - 15475855
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15476107 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatacaaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttattatcattctgaaccc 15476008  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  15476007 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaagttagtgaatt 15475908  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15475907 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 15475855  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28226469 - 28226218
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28226469 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaaccct 28226370  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28226369 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaattt 28226270  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28226269 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 28226218  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37094278 - 37094027
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37094278 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccctcttttacgatcattctgaaccct 37094179  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37094178 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 37094079  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37094078 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 37094027  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 48542678 - 48542427
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48542678 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacacatcttttatgatcattctgaaccct 48542579  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48542578 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacaaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactgtattcataaaggttagtgaattt 48542479  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48542478 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 48542427  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 6978901 - 6979153
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6978901 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactc 6979000  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6979001 ttaccccctttcatccacaaatcaacatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 6979100  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6979101 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 6979153  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 115 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 45502508 - 45502228
Alignment:
Q  115 agaccggtgctagtcacaccccnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45502508 agactggtgctagtcacaccccaaaaaaacaagttacacccaaatttaattaaa-ttttataataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaa 45502410  T
Q  215 aacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45502409 aacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatc 45502310  T
Q  315 tatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45502309 tgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 45502228  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 144 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28068956 - 28068709
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28068956 caagttacacataaatttatttaaaattttacaataataccaaacttgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 28068857  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28068856 ttaccccctttcatccataaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 28068757  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28068756 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 28068709  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 40359667 - 40359917
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40359667 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 40359766  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  40359767 acctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 40359866  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40359867 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 40359917  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Original strand, 15907250 - 15907490
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15907250 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttc 15907349  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttca 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15907350 atccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttca 15907449  T
Q  356 ttttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15907450 ttttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 15907490  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 42885266 - 42885518
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885266 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatacaaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 42885365  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||    
T  42885366 ttaccccctttcatacacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcttaaaggttagtgaatt 42885465  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42885466 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 42885518  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 52469560 - 52469308
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  52469560 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattatgaacca 52469461  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52469460 ttaccccctttcttccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 52469361  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52469360 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 52469308  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 3770504 - 3770755
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770504 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 3770603  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3770604 taccccctttcatccacaaatcaccatagatgcgcaaccaatatataaatcaatatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 3770703  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3770704 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 3770755  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44234155 - 44233901
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataata--ccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44234155 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaac 44234056  T
Q  242 ccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaa 341  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  44234055 ccttaccccctttcatcaacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaa 44233956  T
Q  342 tttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44233955 tttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 44233901  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 13556077 - 13556327
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556077 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtcaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 13556176  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13556177 accccctttcgtccacaaatcaccatagttgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 13556276  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13556277 atgaatttcatttccaatgagtttctatttgtttattgtttgctttggtat 13556327  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 46674745 - 46674995
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46674745 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaatcccatcttttatgatcattctgaaccctt 46674844  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46674845 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgtaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttc 46674944  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46674945 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 46674995  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 47534001 - 47534251
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47534001 agttacactcaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaaccctt 47534100  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  47534101 accccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttc 47534200  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47534201 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 47534251  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24180688 - 24180435
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccc-atcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24180688 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataataccaaaattgcccttttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacc 24180589  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24180588 cttacaccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaat 24180489  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24180488 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 24180435  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 35719709 - 35719962
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccc-atcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35719709 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacc 35719808  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35719809 cttacaccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattaatttgtactatattcataaaggttagtgaat 35719908  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35719909 tttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 35719962  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 30159012 - 30159264
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  30159012 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcatcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactc 30159111  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30159112 ttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 30159211  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30159212 tcatgaatttcatttttgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 30159264  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44054944 - 44054692
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44054944 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattttgaaccc 44054845  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44054844 ttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaagatttaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt 44054745  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44054744 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttttttgtttgttttggtat 44054692  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 147 - 396
Target Start/End: Original strand, 18604860 - 18605109
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctta 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18604860 gttacacctaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaattactaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctca 18604959  T
Q  247 ccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttca 346  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18604960 ccccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttta 18605059  T
Q  347 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18605060 tgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 18605109  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 30361154 - 30361406
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30361154 caagttacattcaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgctctcttcatgtaaatttctaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccc 30361253  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30361254 ttaccccccttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt 30361353  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30361354 tcatgagtttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 30361406  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3994996 - 3994742
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3994996 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaa-ttgtcatcttcatgaaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacac 3994898  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaca---tttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtga 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  3994897 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaatatctgaatcaacatctttgttgttattgatctgtactatattcataaaggttaatga 3994798  T
Q  341 atttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3994797 atttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 3994742  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Original strand, 3046761 - 3047013
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3046761 caagttacatctaaatttatttaaaattttacaataatattaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 3046860  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  3046861 ttatatcctttcatccacaaattaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttaatgaatt 3046960  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3046961 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggtat 3047013  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25730045 - 25729805
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||    
T  25730045 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatga---------aacctt 25729955  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  25729954 acccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctatactatattcataaaggttagtgaatttt 25729856  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25729855 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25729805  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4490267 - 4490018
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4490267 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccct 4490168  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4490167 tactctctttcatccataaatcaccatagatgtgcaaccaagatttgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaattt 4490068  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4490067 catgaatttcattttcgatgagtttcta--tgtttattgtttgttttggtat 4490018  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 154 - 396
Target Start/End: Original strand, 3416314 - 3416547
Alignment:
Q  154 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3416314 ccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatcgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaacccttaccccctt 3416413  T
Q  254 tcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaattt 353  Q
    |||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3416414 tcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtcagtgaatttcatgaattt 3416504  T
Q  354 cattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3416505 cattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 3416547  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Original strand, 49456849 - 49457089
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  49456849 aaatttatttaaaattttacaataatactaaaattatcctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttaccatctttc 49456948  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttca 355  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49456949 atccacaaatcactatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttattattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttca 49457048  T
Q  356 ttttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49457049 ttttcgataagtttctatttatttattgtttgttttggtat 49457089  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Original strand, 8895622 - 8895863
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8895622 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactct 8895721  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||           
T  8895722 taccccctttcatccacaaatca-catagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttag------- 8895813  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8895814 --tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 8895863  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31760829 - 31760586
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31760829 caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataatataaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 31760730  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  31760729 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtattatattcataaaggttagtgaatt 31760630  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31760629 ---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 31760586  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 144 - 315
Target Start/End: Original strand, 50490801 - 50490972
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50490801 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 50490900  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatct 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50490901 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatct 50490972  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17581009 - 17580767
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17581009 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgttctcttcatgtaattttctaaaaacctatcttttatgatcattctgaactct 17580910  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||     
T  17580909 taccccctttcatccacaaatcaccatagatatgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt- 17580811  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17580810 --------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 17580767  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 196 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29033740 - 29033540
Alignment:
Q  196 cttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29033740 cttcatgtaaatttttaaaaacttattttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccataaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatc 29033641  T
Q  296 aacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagta 395  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  29033640 aacatctttcttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttatatttgtttattgtttattttggta 29033541  T
Q  396 t 396  Q
    |    
T  29033540 t 29033540  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26770252 - 26770097
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26770252 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 26770153  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaca 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26770152 ttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaaca 26770097  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 149 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 43106659 - 43106414
Alignment:
Q  149 tacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaa-------aacccatcttttatgatcattctgaac 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43106659 tacactcaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaagtgtcctcttcatgtaaatttttaaattttaaaaacctatcttttatgatcattctgaac 43106560  T
Q  242 ccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaa 341  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  43106559 ccttaccccctttcatcaaaaaatcaccatagatatacaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtaatatattcataaaggttagtgaa 43106460  T
Q  342 tttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43106459 tt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 43106414  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46234447 - 46234296
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46234447 aaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 46234348  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgtt 307  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46234347 attcacaaatcaccatagatgtacaaccaatatctgaatcaacatctttgtt 46234296  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17926315 - 17926076
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  17926315 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcatgttcgtgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaa-tttt 17926217  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
      ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||          ||||||    
T  17926216 ttcccttttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtaatctattcata----------aatttc 17926127  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17926126 atgaattttattttctaatagtttctatttgtttatggtttgttttggtat 17926076  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20599722 - 20599594
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20599722 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatactaaaattgttctcttcatgtaaatttttaaaaacttatattttatgatcattctgaaccc 20599623  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccata 272  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20599622 ttaccccctttcatacacaaatcaccata 20599594  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11493657 - 11493521
Alignment:
Q  251 ctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaa 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||           
T  11493657 ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt------- 11493565  T
Q  351 tttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11493564 --tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11493521  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 315
Target Start/End: Original strand, 49740096 - 49740255
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||| ||||||    
T  49740096 aaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgtcatgttcatgtaaatttctaaaaacccatcttatataatcattctgaattttcacctcctttc 49740195  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatct 315  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49740196 atccacaaatcactatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatct 49740255  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 251 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11335637 - 11335501
Alignment:
Q  251 ctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaa 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||           
T  11335637 ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt------- 11335545  T
Q  351 tttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11335544 --tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11335501  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11335715 - 11335634
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11335715 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttt 11335634  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11493735 - 11493654
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11493735 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttt 11493654  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7042982 - 7042840
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||| ||||||||     
T  7042982 agttacacctaaatttatttaaaatcttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaaccattctttcattatcattttgaaccctc 7042883  T
Q  246 acccc-ctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaata 287  Q
    |||||  ||||| |||| || |||||| ||| ||||| |||||    
T  7042882 acccctttttcacccacaaaccaccatggatatgcaatcaata 7042840  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Original strand, 8969466 - 8969607
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||     
T  8969466 agttatactcaaatttatttaaaattttacaataatactaaaatttccctcttcatgtaaatttctaaaaatccttctttcattatcattctgaaccctc 8969565  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaata 287  Q
    ||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  8969566 accccttttctcgcacaaaccaccatagatatgcaatcaata 8969607  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 46234292 - 46234231
Alignment:
Q  335 tagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46234292 tagtgaatttcatgaatttcaatttcgatgaggttctatttgtttattgtttgttttggtat 46234231  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Original strand, 17136907 - 17137104
Alignment:
Q  156 aaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttc 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | | ||| |||| || |||||||||   ||| ||||| ||| |||||| ||   |||||||    
T  17136907 aaatttatttaaaattttataataataccgaaattgtcgtatccatataaaattctaaaaacccccttttcatgataattttgaacctttgatccctttc 17137006  T
Q  256 atccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    |||||| |||||||||||||||  || ||| |||      ||||||||||| ||| | |||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||    
T  17137007 atccacaaatcaccatagatgtaaaatcaagatcaaagattgaatcaacatctttttcattgatcggtgctttattcataaaggttagtgaatttcat 17137104  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12320321 - 12320252
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaa 215  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||    
T  12320321 agttacacttaaatttacttaaaattttacaataatatcaaaattgtcttctcaatgtaaatttttaaaa 12320252  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45926300 - 45926252
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccct 195  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45926300 gttacacctaaatttacttaaaagtttacaataataccaaaattaccct 45926252  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 176
Target Start/End: Original strand, 641458 - 641488
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttaca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641458 agttacacccaaatttatttaaaattttaca 641488  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 23545621 - 23545663
Alignment:
Q  148 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaatt 190  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23545621 ttacacccaaatttcattaaaattttacaataatactaaaatt 23545663  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 44107201 - 44107257
Alignment:
Q  290 tgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcat 347  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44107201 tgaatgaacattttt-tcattgatcgatactctattcataaaggttagtgaatttcat 44107257  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15941633 - 15941585
Alignment:
Q  147 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccct 195  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15941633 gttacacccaaattttcttaaaatttttttataataccaaaattgccct 15941585  T

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Target: scaffold0562 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6572 - 6320
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6572 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttttaaaaacccatattttatgatcattctgaaccc 6473  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  6472 ttatcccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttggtgaatt 6373  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6372 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 6320  T

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Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5225
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5477 caagttacatccaaatttatttaaaattgtactataataccaaaattgtcctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccc 5378  T
Q  244 ttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  5377 ttaccccctttcatccacaaatcaccaaagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatt 5278  T
Q  344 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5277 tcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 5225  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 116 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 105861 - 105581
Alignment:
Q  116 gaccggtgctagtcacaccccnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  105861 gaccggtgctagtcacaccccaaaaaaacaagttacacctaaatttatttaaaatttaacaataataccaaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaa 105762  T
Q  216 acccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatct 315  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  105761 atccatcttttatgataattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatgt 105662  T
Q  316 atactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  105661 gtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaaattcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 105581  T

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Target: scaffold1360 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 144 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 819
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacc-catcttttatgatcattctgaacc 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1072 caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacctcatcttttatgatcattctgaacc 973  T
Q  243 cttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaat 342  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  972 cttacccccttttatccacaaatcaccatagatgtgtaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtttgtgaat 873  T
Q  343 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  872 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 819  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27937 - 27696
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27937 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 27838  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27837 accccctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttc 27747  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27746 atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 27696  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 145 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 42805 - 42557
Alignment:
Q  145 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccct 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42805 aagttacactcaaatttatttaaaattttacaata---ccaaaattgccctcttcatgtaaattttaaaaactccatcttttatgatcattttgaaccct 42709  T
Q  245 taccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaattt 344  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42708 taccccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaattaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattt 42609  T
Q  345 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42608 catgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 42557  T

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Target: scaffold0081 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 146 - 396
Target Start/End: Original strand, 11112 - 11362
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11112 agttacatctaaatttatttaaaattttacaataataacaaaattgccctcttcatgtatattactaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctc 11211  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttc 345  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  11212 atcccctttcatccaaaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttt 11311  T
Q  346 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11312 atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 11362  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 207 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19694 - 19505
Alignment:
Q  207 tttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19694 tttttaaaaacccattttttacgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgt 19595  T
Q  307 tattgatctatactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19594 tattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 19505  T

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Target: scaffold0548 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 331
Target Start/End: Original strand, 5258 - 5443
Alignment:
Q  146 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  5258 agttacactcaaatttatttaaaattttacaattataccaaaattgccctgttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaattctc 5357  T
Q  246 accccctttcatccaccaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatttttgttattgatctatactatattcataaa 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  5358 accccctttcatccacaaatcaccatatatgtgcaaccaagatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa 5443  T

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Target: scaffold0548; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 5442 - 5489
Alignment:
Q  349 aatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttagtat 396  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5442 aatttcattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtat 5489  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20468 - 20396
Alignment:
Q  144 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataataccaaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20468 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataatatcaaaattgccctcttaatgtaaatttttaaaaa 20396  T

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Target: scaffold0896 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:

Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 53
Alignment:
Q  267 accatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86 accatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 53  T

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Target: scaffold0450 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9554 - 9504
Alignment:
Q  40 gaagcaccatcattgaatgagttttttgcttgaaaaaatggaaggtttgaa 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  9554 gaagcaccatcattgaaggagtttttcgcctgaaaaactgaaaggtttgaa 9504  T

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