View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11734_low_2 (Length: 691)

Name: NF11734_low_2
Description: NF11734
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11734_low_2
NF11734_low_2
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (1-306)||(27944708-27945013)
chr7 (323-677)||(26873702-26874058)
chr7 (323-677)||(36358113-36358469)
chr7 (323-677)||(46027679-46028035)
chr7 (327-677)||(17166869-17167222)
chr7 (326-672)||(44467829-44468177)
chr7 (322-677)||(43859089-43859446)
chr7 (322-677)||(44723866-44724223)
chr7 (323-672)||(36675295-36675646)
chr7 (323-677)||(45350051-45350406)
chr7 (383-669)||(22723587-22723875)
chr7 (383-677)||(31428796-31429092)
chr7 (383-672)||(31065431-31065722)
chr7 (383-677)||(9624055-9624351)
chr7 (395-677)||(23469199-23469483)
chr7 (383-672)||(39976380-39976671)
chr7 (399-667)||(40055666-40055936)
chr7 (383-667)||(42241742-42242028)
chr7 (383-677)||(44142821-44143116)
chr7 (321-672)||(16834083-16834438)
chr7 (383-667)||(29075008-29075284)
chr7 (389-677)||(41367724-41368014)
chr7 (504-667)||(46828763-46828926)
chr7 (501-677)||(8461764-8461941)
chr7 (501-677)||(31931827-31932004)
chr7 (501-677)||(23562564-23562740)
chr7 (383-536)||(31931855-31932010)
chr7 (389-536)||(23469227-23469376)
chr7 (389-536)||(40055769-40055918)
chr7 (383-504)||(18104295-18104417)
chr7 (323-536)||(8461698-8461913)
chr7 (323-536)||(23562592-23562806)
chr7 (505-655)||(25174216-25174367)
chr7 (321-536)||(29502076-29502293)
chr7 (504-659)||(22499716-22499868)
chr7 (508-655)||(28754878-28755025)
chr7 (393-536)||(25174216-25174361)
chr7 (475-659)||(29502066-29502254)
chr7 (392-536)||(46828781-46828926)
chr7 (393-536)||(16649541-16649685)
chr7 (393-536)||(17623902-17624046)
chr7 (532-667)||(29663010-29663146)
chr7 (501-667)||(18104245-18104411)
chr7 (385-536)||(22499726-22499875)
chr7 (420-536)||(29663010-29663128)
chr7 (528-659)||(9021516-9021648)
chr7 (505-659)||(16649531-16649685)
chr7 (505-659)||(17623892-17624046)
chr7 (504-659)||(30781079-30781234)
chr7 (422-533)||(4248865-4248978)
chr7 (392-536)||(9013884-9014029)
chr7 (385-536)||(30781072-30781224)
chr7 (407-517)||(9014475-9014587)
chr7 (520-629)||(9014476-9014586)
chr7 (507-575)||(22566599-22566667)
chr7 (462-536)||(6961171-6961246)
chr7 (396-536)||(8727794-8727936)
chr7 (320-516)||(28754810-28754999)
chr7 (551-646)||(4248865-4248961)
chr7 (1-119)||(27994747-27994865)
chr7 (395-456)||(22566606-22566667)
chr7 (551-659)||(24779575-24779684)
chr7 (323-368)||(29662932-29662977)
chr7 (418-536)||(9021518-9021638)
chr7 (594-653)||(9013974-9014033)
chr7 (277-316)||(9778445-9778484)
chr7 (323-366)||(19692467-19692510)
chr7 (61-119)||(27959317-27959375)
chr7 (61-119)||(27985625-27985683)
chr7 (503-655)||(40883349-40883501)
chr7 (594-659)||(6961191-6961255)
chr7 (327-368)||(8727725-8727766)
chr7 (322-359)||(9014390-9014427)
chr7 (388-436)||(6961111-6961159)
chr7 (68-119)||(28013492-28013543)
chr7 (321-367)||(27949680-27949726)
chr7 (323-361)||(40054298-40054336)
chr7 (501-554)||(6961112-6961165)
chr7 (322-355)||(9013814-9013847)
chr7 (282-319)||(9408421-9408458)
chr7 (286-319)||(11061156-11061189)
chr7 (439-487)||(14629639-14629688)
chr7 (282-314)||(1433396-1433428)
chr7 (284-316)||(17851375-17851407)
chr7 (286-314)||(21141067-21141095)
chr7 (472-537)||(25303948-25304015)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (323-677)||(2660641-2660997)
chr6 (323-669)||(9078867-9079214)
chr6 (383-677)||(15469149-15469444)
chr6 (322-677)||(11450308-11450668)
chr6 (323-667)||(12698493-12698839)
chr6 (323-665)||(24635285-24635629)
chr6 (322-667)||(26468447-26468794)
chr6 (388-677)||(7021882-7022172)
chr6 (325-667)||(24130057-24130396)
chr6 (383-677)||(34023345-34023641)
chr6 (323-667)||(16461221-16461568)
chr6 (323-677)||(8560426-8560782)
chr6 (383-667)||(34127557-34127843)
chr6 (321-665)||(12996282-12996628)
chr6 (383-665)||(14882977-14883261)
chr6 (383-629)||(23258919-23259167)
chr6 (389-677)||(23258757-23259048)
chr6 (501-659)||(7536522-7536681)
chr6 (327-536)||(13405307-13405518)
chr6 (385-536)||(7536518-7536671)
chr6 (556-659)||(31968926-31969030)
chr6 (501-654)||(13405302-13405456)
chr6 (322-511)||(10290456-10290647)
chr6 (443-517)||(31968955-31969031)
chr6 (504-624)||(10290526-10290647)
chr6 (511-659)||(1398040-1398188)
chr6 (508-587)||(31489894-31489973)
chr6 (282-316)||(7938058-7938092)
chr6 (484-521)||(1398065-1398102)
chr6 (284-316)||(18367781-18367813)
chr6 (327-366)||(2399421-2399460)
chr6 (499-537)||(2399362-2399400)
chr6 (282-316)||(5970185-5970219)
chr6 (282-316)||(9107453-9107487)
chr6 (500-537)||(18234977-18235014)
chr6 (396-457)||(31489894-31489955)
chr6 (284-316)||(8777056-8777088)
chr6 (284-316)||(10294051-10294083)
chr6 (324-356)||(15469101-15469133)
chr6 (284-312)||(34225888-34225916)
chr6 (282-318)||(34290158-34290194)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (323-677)||(26525032-26525388)
chr5 (321-667)||(3631256-3631604)
chr5 (323-677)||(25701224-25701579)
chr5 (323-677)||(30772878-30773234)
chr5 (325-672)||(43348635-43348984)
chr5 (326-667)||(16823133-16823476)
chr5 (324-667)||(43358410-43358755)
chr5 (323-677)||(8074041-8074398)
chr5 (323-677)||(7440283-7440638)
chr5 (323-667)||(13013067-13013413)
chr5 (383-667)||(32304465-32304751)
chr5 (327-667)||(9595978-9596320)
chr5 (383-667)||(13084455-13084741)
chr5 (323-677)||(26296811-26297167)
chr5 (323-672)||(41084389-41084738)
chr5 (323-536)||(9737651-9737865)
chr5 (383-667)||(10925568-10925854)
chr5 (465-677)||(26784972-26785185)
chr5 (383-669)||(15374174-15374447)
chr5 (328-522)||(29390273-29390468)
chr5 (322-536)||(19577124-19577339)
chr5 (412-667)||(15374301-15374572)
chr5 (504-667)||(20487040-20487204)
chr5 (383-536)||(20656801-20656956)
chr5 (501-677)||(9737623-9737799)
chr5 (385-536)||(20487033-20487186)
chr5 (501-659)||(19577114-19577273)
chr5 (322-502)||(5844104-5844285)
chr5 (391-536)||(26785010-26785157)
chr5 (511-658)||(22578869-22579017)
chr5 (499-667)||(20656783-20656952)
chr5 (508-659)||(41817525-41817677)
chr5 (385-536)||(41817514-41817667)
chr5 (392-536)||(37042496-37042643)
chr5 (504-659)||(37042487-37042643)
chr5 (501-619)||(29390334-29390452)
chr5 (385-536)||(22578878-22579031)
chr5 (504-659)||(28662185-28662341)
chr5 (324-536)||(28662117-28662331)
chr5 (501-611)||(30050074-30050184)
chr5 (511-588)||(20071219-20071296)
chr5 (322-369)||(26784910-26784957)
chr5 (331-369)||(6229071-6229109)
chr5 (283-316)||(15382420-15382453)
chr5 (501-589)||(30062693-30062781)
chr5 (327-365)||(20071329-20071367)
chr5 (282-316)||(34276799-34276833)
chr5 (278-312)||(43001756-43001790)
chr5 (287-316)||(8419985-8420014)
chr5 (282-319)||(17177103-17177140)
chr5 (283-316)||(21522693-21522726)
chr5 (283-316)||(21533259-21533292)
chr5 (283-316)||(32426935-32426968)
chr5 (286-319)||(41995417-41995450)
chr5 (284-316)||(6401442-6401474)
chr5 (282-314)||(6770485-6770517)
chr5 (614-658)||(20071091-20071135)
chr5 (322-362)||(20656977-20657017)
chr5 (284-316)||(20683325-20683357)
chr5 (284-316)||(23016074-23016106)
chr5 (465-534)||(26683033-26683103)
chr5 (472-536)||(26683145-26683212)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (323-677)||(29125847-29126203)
chr3 (323-672)||(50527442-50527793)
chr3 (323-677)||(52201981-52202337)
chr3 (388-677)||(11231958-11232249)
chr3 (326-677)||(22729222-22729575)
chr3 (383-677)||(44254404-44254700)
chr3 (329-677)||(1092681-1093031)
chr3 (326-677)||(32270722-32271074)
chr3 (322-667)||(28952205-28952552)
chr3 (323-677)||(12251311-12251667)
chr3 (323-625)||(13594729-13595033)
chr3 (322-667)||(16908632-16908969)
chr3 (388-667)||(35083857-35084138)
chr3 (383-667)||(27742545-27742831)
chr3 (323-611)||(36633486-36633776)
chr3 (383-667)||(49657025-49657311)
chr3 (326-629)||(21259286-21259591)
chr3 (323-669)||(52571244-52571584)
chr3 (389-667)||(21259134-21259415)
chr3 (321-535)||(18163715-18163930)
chr3 (322-572)||(49169791-49170042)
chr3 (322-536)||(7160235-7160451)
chr3 (383-536)||(4618210-4618362)
chr3 (502-672)||(25246146-25246317)
chr3 (383-650)||(45045268-45045537)
chr3 (383-536)||(44205471-44205626)
chr3 (420-586)||(743958-744116)
chr3 (501-667)||(7160217-7160384)
chr3 (389-520)||(13594721-13594854)
chr3 (501-677)||(18163783-18163959)
chr3 (385-527)||(34660807-34660950)
chr3 (383-536)||(25246169-25246324)
chr3 (504-659)||(2618953-2619108)
chr3 (392-536)||(2618953-2619098)
chr3 (515-659)||(31174494-31174639)
chr3 (410-536)||(31174504-31174632)
chr3 (501-677)||(44205477-44205654)
chr3 (501-629)||(36633552-36633680)
chr3 (501-629)||(13594839-13594967)
chr3 (501-629)||(49169858-49169986)
chr3 (504-643)||(34660814-34660953)
chr3 (519-655)||(576403-576539)
chr3 (511-588)||(52499204-52499281)
chr3 (501-667)||(4618216-4618380)
chr3 (594-659)||(18657976-18658041)
chr3 (389-482)||(744032-744125)
chr3 (280-316)||(750702-750738)
chr3 (328-363)||(7441702-7441737)
chr3 (323-364)||(2618884-2618925)
chr3 (484-521)||(18657979-18658016)
chr3 (284-316)||(14027959-14027991)
chr3 (281-316)||(7171443-7171478)
chr3 (285-316)||(17568753-17568784)
chr3 (323-366)||(25246343-25246386)
chr3 (281-316)||(35994820-35994855)
chr3 (408-516)||(576428-576538)
chr3 (284-314)||(13845584-13845614)
chr3 (503-537)||(25894698-25894732)
chr3 (503-537)||(25911665-25911699)
chr3 (285-314)||(16000101-16000130)
chr3 (283-316)||(21479067-21479100)
chr3 (323-364)||(34660753-34660794)
chr3 (284-316)||(3164108-3164140)
chr3 (284-316)||(10318123-10318155)
chr3 (284-316)||(10335369-10335401)
chr3 (284-316)||(14747511-14747543)
chr3 (284-316)||(15796377-15796409)
chr3 (284-312)||(23870622-23870650)
chr3 (284-312)||(45451523-45451551)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (322-672)||(16692756-16693108)
chr1 (323-677)||(17285095-17285452)
chr1 (326-677)||(33011859-33012212)
chr1 (323-677)||(29981509-29981865)
chr1 (323-677)||(919512-919868)
chr1 (323-677)||(37125692-37126048)
chr1 (383-677)||(51139745-51140041)
chr1 (383-665)||(8086289-8086573)
chr1 (322-677)||(29169940-29170297)
chr1 (388-667)||(25298900-25299181)
chr1 (322-667)||(48708229-48708577)
chr1 (333-677)||(23177351-23177697)
chr1 (325-677)||(44052261-44052615)
chr1 (323-667)||(24790434-24790781)
chr1 (323-667)||(47561726-47562072)
chr1 (383-667)||(40428593-40428879)
chr1 (323-666)||(42371969-42372314)
chr1 (383-667)||(45836903-45837189)
chr1 (400-677)||(40567042-40567321)
chr1 (383-629)||(24544568-24544816)
chr1 (385-677)||(46224564-46224856)
chr1 (323-677)||(8530082-8530444)
chr1 (323-677)||(6849752-6850107)
chr1 (323-667)||(9042231-9042576)
chr1 (389-677)||(24542582-24542873)
chr1 (389-629)||(24542744-24542987)
chr1 (389-629)||(24542858-24543101)
chr1 (389-629)||(24542972-24543215)
chr1 (389-629)||(24543086-24543329)
chr1 (389-629)||(24543200-24543443)
chr1 (389-629)||(24543314-24543557)
chr1 (389-629)||(24543428-24543671)
chr1 (389-629)||(24543542-24543785)
chr1 (389-629)||(24543656-24543899)
chr1 (389-629)||(24543770-24544013)
chr1 (389-629)||(24543884-24544127)
chr1 (389-629)||(24543998-24544241)
chr1 (389-629)||(24544112-24544355)
chr1 (389-629)||(24544226-24544469)
chr1 (389-629)||(24544340-24544583)
chr1 (389-629)||(24544454-24544697)
chr1 (383-536)||(44317626-44317780)
chr1 (389-536)||(40567144-40567293)
chr1 (500-664)||(49001410-49001576)
chr1 (476-659)||(9246834-9247020)
chr1 (503-654)||(32540532-32540684)
chr1 (531-677)||(37343082-37343229)
chr1 (388-536)||(9246844-9246994)
chr1 (501-672)||(44317632-44317803)
chr1 (385-532)||(32540541-32540690)
chr1 (419-536)||(37343082-37343201)
chr1 (385-536)||(21852062-21852215)
chr1 (504-655)||(21852069-21852221)
chr1 (508-659)||(46601074-46601226)
chr1 (389-536)||(49001425-49001575)
chr1 (385-527)||(29055886-29056029)
chr1 (555-659)||(25030371-25030476)
chr1 (452-536)||(46601130-46601216)
chr1 (321-369)||(17879973-17880021)
chr1 (325-365)||(37343027-37343067)
chr1 (324-368)||(46224874-46224918)
chr1 (499-537)||(45807075-45807113)
chr1 (282-316)||(48548045-48548079)
chr1 (323-356)||(45836854-45836887)
chr1 (284-316)||(10577818-10577850)
chr1 (284-316)||(25934572-25934604)
chr1 (511-642)||(29055884-29056015)
chr1 (284-316)||(38078739-38078771)
chr1 (325-369)||(43532470-43532514)
chr1 (499-534)||(1243675-1243710)
chr1 (444-517)||(25030372-25030447)
chr1 (281-319)||(17831605-17831643)
chr1 (282-316)||(24334778-24334812)
chr1 (283-316)||(398848-398881)
chr1 (323-368)||(9247013-9247058)
chr1 (518-591)||(9773795-9773868)
chr1 (284-312)||(51409981-51410009)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (323-677)||(24796857-24797213)
chr8 (323-667)||(41837768-41838114)
chr8 (326-677)||(5589977-5590330)
chr8 (323-653)||(7012337-7012669)
chr8 (383-677)||(28564944-28565240)
chr8 (383-677)||(28572567-28572863)
chr8 (383-677)||(42555897-42556193)
chr8 (321-677)||(3886584-3886942)
chr8 (383-665)||(22658162-22658446)
chr8 (383-677)||(36060417-36060713)
chr8 (323-667)||(3659636-3659982)
chr8 (323-677)||(1098057-1098413)
chr8 (323-667)||(4231220-4231565)
chr8 (383-677)||(7242439-7242734)
chr8 (324-677)||(6316877-6317232)
chr8 (383-672)||(21434899-21435190)
chr8 (389-677)||(4697872-4698162)
chr8 (383-677)||(2317121-2317417)
chr8 (324-672)||(1183823-1184173)
chr8 (383-667)||(43117408-43117695)
chr8 (384-667)||(10092315-10092600)
chr8 (383-667)||(41388065-41388351)
chr8 (383-665)||(7413091-7413375)
chr8 (323-590)||(38567127-38567397)
chr8 (383-664)||(7421872-7422148)
chr8 (323-536)||(9830607-9830821)
chr8 (390-611)||(41169764-41169987)
chr8 (501-667)||(197268-197435)
chr8 (501-667)||(312105-312272)
chr8 (504-659)||(25642667-25642823)
chr8 (392-532)||(36108837-36108979)
chr8 (386-536)||(197265-197417)
chr8 (386-536)||(312102-312254)
chr8 (504-655)||(11635828-11635980)
chr8 (501-667)||(9830673-9830839)
chr8 (504-657)||(36108837-36108991)
chr8 (392-536)||(8996417-8996561)
chr8 (323-536)||(11635758-11635974)
chr8 (503-659)||(25382973-25383129)
chr8 (392-536)||(25642677-25642823)
chr8 (392-522)||(8995039-8995171)
chr8 (389-500)||(41169877-41169989)
chr8 (394-522)||(17836498-17836628)
chr8 (506-651)||(17836498-17836644)
chr8 (501-658)||(32017911-32018069)
chr8 (385-536)||(25382983-25383135)
chr8 (500-629)||(4697871-4698000)
chr8 (502-629)||(41169764-41169892)
chr8 (501-629)||(38567195-38567323)
chr8 (504-654)||(8995039-8995190)
chr8 (589-667)||(34934298-34934376)
chr8 (519-652)||(43073117-43073250)
chr8 (323-368)||(34934370-34934415)
chr8 (504-652)||(8996417-8996564)
chr8 (447-536)||(43073157-43073247)
chr8 (474-536)||(34934316-34934379)
chr8 (385-514)||(32017942-32018073)
chr8 (321-358)||(10092255-10092292)
chr8 (284-319)||(3951609-3951644)
chr8 (284-314)||(20785544-20785574)
chr8 (284-313)||(24413646-24413675)
chr8 (283-312)||(36450823-36450852)
chr8 (284-312)||(5137490-5137518)
chr8 (499-539)||(26149486-26149526)
chr8 (284-316)||(43737896-43737928)
[»] chr4 (79 HSPs)
chr4 (323-677)||(6755828-6756183)
chr4 (323-667)||(11650779-11651125)
chr4 (323-677)||(13233229-13233585)
chr4 (321-667)||(18491184-18491532)
chr4 (322-667)||(36584422-36584768)
chr4 (324-667)||(44745403-44745748)
chr4 (321-667)||(38141370-38141719)
chr4 (321-667)||(40228243-40228592)
chr4 (323-677)||(16925106-16925461)
chr4 (323-665)||(44134493-44134836)
chr4 (323-677)||(31663970-31664322)
chr4 (383-672)||(36954818-36955109)
chr4 (325-672)||(2654718-2655067)
chr4 (323-677)||(31581553-31581909)
chr4 (383-677)||(54795532-54795828)
chr4 (383-677)||(12700371-12700667)
chr4 (332-677)||(13612895-13613241)
chr4 (385-672)||(41832437-41832727)
chr4 (323-667)||(19653458-19653803)
chr4 (323-667)||(27270353-27270698)
chr4 (323-667)||(43564417-43564763)
chr4 (383-672)||(50767093-50767384)
chr4 (383-670)||(10096267-10096555)
chr4 (323-677)||(52581455-52581812)
chr4 (323-677)||(22647110-22647466)
chr4 (384-672)||(4632512-4632803)
chr4 (323-590)||(44817441-44817708)
chr4 (383-533)||(45670019-45670170)
chr4 (323-517)||(51001475-51001670)
chr4 (392-536)||(13857680-13857826)
chr4 (397-536)||(7638702-7638842)
chr4 (502-677)||(51001542-51001717)
chr4 (393-536)||(13869211-13869356)
chr4 (504-659)||(13857680-13857836)
chr4 (508-659)||(36801795-36801947)
chr4 (509-659)||(10393896-10394047)
chr4 (505-659)||(13869211-13869366)
chr4 (385-536)||(36801805-36801958)
chr4 (501-629)||(45670025-45670153)
chr4 (509-655)||(7638696-7638842)
chr4 (385-520)||(18707738-18707879)
chr4 (503-627)||(44817517-44817640)
chr4 (462-536)||(7776908-7776983)
chr4 (501-655)||(18735245-18735403)
chr4 (594-659)||(5734195-5734260)
chr4 (397-536)||(10393896-10394037)
chr4 (513-672)||(26653057-26653217)
chr4 (558-653)||(9046036-9046131)
chr4 (501-659)||(133416-133574)
chr4 (501-655)||(18668994-18669152)
chr4 (385-517)||(18735241-18735379)
chr4 (401-536)||(26653080-26653217)
chr4 (387-537)||(133414-133565)
chr4 (596-655)||(7776930-7776989)
chr4 (501-655)||(18707742-18707900)
chr4 (550-655)||(18715047-18715152)
chr4 (385-520)||(18668990-18669131)
chr4 (605-677)||(45670168-45670240)
chr4 (465-516)||(9046060-9046111)
chr4 (323-365)||(13857612-13857654)
chr4 (282-319)||(5111587-5111624)
chr4 (484-521)||(5734198-5734235)
chr4 (323-364)||(13869142-13869183)
chr4 (323-356)||(36955136-36955169)
chr4 (501-541)||(9046134-9046174)
chr4 (385-432)||(9046131-9046178)
chr4 (281-312)||(22234954-22234985)
chr4 (467-520)||(18715077-18715131)
chr4 (282-316)||(23293069-23293103)
chr4 (284-318)||(28470341-28470375)
chr4 (282-316)||(37203220-37203254)
chr4 (284-313)||(4157102-4157131)
chr4 (499-536)||(11975782-11975819)
chr4 (501-534)||(18714845-18714878)
chr4 (284-313)||(20633429-20633458)
chr4 (500-536)||(2763032-2763068)
chr4 (284-316)||(11110754-11110786)
chr4 (492-536)||(45670168-45670212)
chr4 (284-316)||(46084049-46084081)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (323-664)||(38527173-38527515)
chr2 (322-677)||(23869661-23870018)
chr2 (321-665)||(2249578-2249924)
chr2 (325-677)||(34983277-34983631)
chr2 (323-677)||(36435985-36436341)
chr2 (385-672)||(26293221-26293510)
chr2 (323-667)||(44545542-44545888)
chr2 (383-677)||(12995025-12995321)
chr2 (383-667)||(11764853-11765139)
chr2 (323-677)||(6749809-6750165)
chr2 (323-677)||(7366150-7366506)
chr2 (323-665)||(13615778-13616122)
chr2 (323-677)||(1020871-1021229)
chr2 (323-677)||(1114841-1115197)
chr2 (383-665)||(16194311-16194595)
chr2 (383-665)||(42016562-42016846)
chr2 (383-667)||(26860475-26860761)
chr2 (383-667)||(31392606-31392890)
chr2 (391-677)||(3836144-3836431)
chr2 (321-569)||(38763711-38763960)
chr2 (323-618)||(28745355-28745653)
chr2 (385-660)||(11935195-11935473)
chr2 (323-536)||(34494420-34494634)
chr2 (383-536)||(19283875-19284029)
chr2 (323-536)||(22674684-22674899)
chr2 (501-667)||(43471380-43471547)
chr2 (325-536)||(41699185-41699395)
chr2 (383-536)||(43471398-43471553)
chr2 (501-667)||(22674666-22674833)
chr2 (509-665)||(2077563-2077720)
chr2 (503-659)||(31643545-31643702)
chr2 (509-677)||(19283847-19284015)
chr2 (501-667)||(34494402-34494568)
chr2 (504-654)||(32099999-32100155)
chr2 (501-672)||(41699249-41699418)
chr2 (504-659)||(29035334-29035490)
chr2 (391-536)||(31643555-31643702)
chr2 (501-629)||(38763779-38763907)
chr2 (501-629)||(28745458-28745585)
chr2 (400-536)||(29141875-29142013)
chr2 (397-536)||(2077563-2077704)
chr2 (501-582)||(17526038-17526119)
chr2 (512-654)||(29141870-29142013)
chr2 (385-517)||(32099992-32100131)
chr2 (386-536)||(29035344-29035496)
chr2 (385-456)||(17526052-17526123)
chr2 (281-316)||(27447084-27447119)
chr2 (329-368)||(42473566-42473605)
chr2 (282-316)||(26769459-26769493)
chr2 (324-356)||(12994975-12995007)
chr2 (284-316)||(21374777-21374809)
chr2 (499-537)||(1538194-1538232)
chr2 (326-363)||(2076934-2076971)
chr2 (283-312)||(27084229-27084258)
chr2 (323-368)||(32099928-32099973)
chr2 (283-312)||(37558938-37558967)
chr2 (499-536)||(44788477-44788514)
chr2 (284-316)||(31283992-31284024)
chr2 (284-312)||(44770207-44770235)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (326-672)||(19048-19396)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (323-629)||(64933-65241)
scaffold0014 (389-672)||(65112-65398)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (383-677)||(1163-1459)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (383-611)||(331831-332061)
scaffold0002 (501-629)||(331837-331965)
scaffold0002 (389-501)||(331950-332064)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (383-590)||(11237-11445)
scaffold0131 (501-619)||(11243-11361)
scaffold0131 (323-367)||(11166-11210)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (511-588)||(303824-303901)
scaffold0003 (327-365)||(303934-303972)
scaffold0003 (614-658)||(303696-303740)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (282-322)||(63707-63747)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (282-316)||(9840-9874)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (503-655)||(82783-82935)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (282-316)||(8740-8774)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (283-316)||(46625-46658)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (286-314)||(547-575)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (284-312)||(23371-23399)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (284-316)||(130426-130458)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27944708 - 27945013
Alignment:
Q  1 gatgagagtgattggagtgatgttgatttgcttagaagtgttaaaccatttggttggaattatgctgtttctaagactttggctgagaaagctgttcttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27944708 gatgagagtgattggagtgatgttgatttgcttagaagtgttaaaccatttggttggaattatgctgtttctaagacattggctgagaaagctgttcttg 27944807  T
Q  101 aatttggtgaacaaaatggaattgatgttgttactttgattcttccttttattgttggtcgttttgtttgccctaagcttcctgattctattgagaaagc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27944808 aatttggtgaacaaaatggaattgatgttgttactttgattcttccttttattgttggtcgttttgtttgccctaagcttcctgattctatcgagaaagc 27944907  T
Q  201 tcttgttttggtattaggtatgaattttgcaccttattctactcatgtttctttcacttttttacttgttcgtaaattatgacctatgaagcacggatac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27944908 tcttgttttggtattaggtatgaattttgcaccttattctactcatgtttctttcacttttttacttgttcgtaaattatgacctatgaagcacggatac 27945007  T
Q  301 ggacac 306  Q
    ||||||    
T  27945008 ggacac 27945013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 26873702 - 26874058
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26873702 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgcgagattttatacaatt 26873801  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26873802 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgag 26873901  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |     
T  26873902 gttttatacaattttatgtcagttttagatttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaag 26874001  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  26874002 gtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtggcccaccct 26874058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36358469 - 36358113
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||             ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  36358469 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggtccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgacattttatgcaatt 36358370  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36358369 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgag 36358270  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  36358269 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 36358170  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  36358169 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 36358113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 46027679 - 46028035
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46027679 cagtggcggagcccttcgtgggctggggtgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 46027778  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46027779 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattaaattataggtctattttgcgag 46027878  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  46027879 attttatacaattttatgtcagttttagatttaggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 46027978  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || || |||  ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  46027979 gtataatttgcgagactttaaacgatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 46028035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 327 - 677
Target Start/End: Original strand, 17166869 - 17167222
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17166869 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccagaaaaattaaaaaatcaacaattatagttctattttgcgagattttatgcaattttgt 17166968  T
Q  427 atcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17166969 atcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 17167068  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17167069 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattgatgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 17167168  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  17167169 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 17167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 326 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 44468177 - 44467829
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44468177 tggcggagcccttcataggctggggtgggccacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttg 44468078  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44468077 tgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 44467978  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  44467977 ttatacaattttatgttggttttaggtttcaattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatagatc 44467878  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    || |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44467877 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 44467829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 322 - 677
Target Start/End: Original strand, 43859089 - 43859446
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||             |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  43859089 gcagtggcggagcccttcatgggctagggtgggccacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtcgaatttgcgagattttatgcaat 43859188  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43859189 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 43859288  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43859289 gattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 43859388  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  43859389 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 43859446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 322 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 44724223 - 44723866
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  44724223 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaaccaactattataggtttattttgagagattttatacaat 44724124  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724123 tttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagaggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 44724024  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  44724023 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccatccgaagaatttaaataatttaattata 44723924  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     ||||| |||  ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  44723923 ggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtagcccaccct 44723866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 323 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 36675646 - 36675295
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              | || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  36675646 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccgaaaaaattaaaaaattaatgattatagatctattttgtgagattttatgcaatt 36675547  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675546 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36675447  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  36675446 attttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 36675347  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||| |||   || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  36675346 gtctaatttgcaagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggccc 36675295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 45350051 - 45350406
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||             |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45350051 cagtggcggagcccttcatgggctggg-tgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 45350149  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350150 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 45350249  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  45350250 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtgtcccacccgaaaaatttaaataattcaattatat 45350349  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  45350350 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 45350406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 383 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22723875 - 22723587
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22723875 tcaacgattataggtctactttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 22723776  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  22723775 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaatttcccgcaaattggt 22723676  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtag 669  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22723675 gtagtggcccacccgcaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtag 22723587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 31428796 - 31429092
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31428796 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 31428895  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  31428896 cgaaaatttaaataatttaattatagatctattttgcgagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcagttgatctcaattcccgtaaattggt 31428995  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| || || |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  31428996 gtagtggtccacccgaaaaatgtaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttcagtagcccaccct 31429092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 383 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 31065722 - 31065431
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31065722 tcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 31065623  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31065622 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 31065523  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  31065522 gcagtggcccacccgaaaaatttaaataaatcaattacaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 31065431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 9624055 - 9624351
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  9624055 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacc 9624154  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9624155 caaaaatttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 9624254  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||    
T  9624255 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccct 9624351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 395 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23469483 - 23469199
Alignment:
Q  395 ggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaa 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23469483 ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccgaaaatttaaa 23469384  T
Q  494 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccact 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |    
T  23469383 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccat 23469284  T
Q  594 c-gaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  23469283 ctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 23469199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 383 - 672
Target Start/End: Original strand, 39976380 - 39976671
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  39976380 tcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacc 39976479  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||| | | ||| ||||    
T  39976480 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttagatttcaattgatccaaatttctgtaaattggt 39976579  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  39976580 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 39976671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 399 - 667
Target Start/End: Original strand, 40055666 - 40055936
Alignment:
Q  399 tattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 497  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40055666 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttgtatgttttggttgatccaaattcttgataagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 40055765  T
Q  498 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcga 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |    
T  40055766 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaa 40055865  T
Q  597 aaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  40055866 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagt 40055936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42242028 - 42241742
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  42242028 tcaacgattataggtttaatttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgactcacc 42241929  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  42241928 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccggaaattggt 42241829  T
Q  582 gtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42241828 gtagtcgtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 42241742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 44142821 - 44143116
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44142821 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcc-acc 44142919  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||   |||||| ||||||||||||| ||||    
T  44142920 tggaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaattggt 44143019  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  44143020 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 44143116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 321 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 16834438 - 16834083
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||             ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16834438 ggcactggcggagcccttcatgggctggggtgggccatggcccatccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtttattttgtaaaattttatgcaa 16834339  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtc--tattttg 517  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16834338 ttttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctatattatg 16834239  T
Q  518 cgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaatt 616  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||| | |||| ||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  16834238 agagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattctcacaaattggggtagtgtcccacccaaaaaatttaaataatttaatt 16834139  T
Q  617 ataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16834138 ataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 16834083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29075284 - 29075008
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29075284 tcaacgactataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 29075185  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          |||| ||||    
T  29075184 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatc----------caaattggt 29075095  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  29075094 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaattttttaatagttaattttagt 29075008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 389 - 677
Target Start/End: Original strand, 41367724 - 41368014
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  41367724 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggtccatccgaaaa 41367823  T
Q  488 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  41367824 tttaaataattcagttataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtg 41367923  T
Q  588 -gccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
      |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  41367924 atccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccct 41368014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 504 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828763
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcg-aaaatt 46828828  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |  ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46828827 taaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttttcaacggttaattttagt 46828763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 501 - 677
Target Start/End: Original strand, 8461764 - 8461941
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8461764 attataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 8461863  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  8461864 atttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 8461941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 501 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31932004 - 31931827
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||    
T  31932004 attataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 31931905  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  31931904 atttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 31931827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 501 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23562740 - 23562564
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  23562740 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtc-gaattaagttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 23562642  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23562641 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 23562564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 31932010 - 31931855
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  31932010 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacc 31931911  T
Q  482 c-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31931910 caaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttt 31931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 23469376 - 23469227
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaa 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | | |||    
T  23469376 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatctgaaaa 23469277  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23469276 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttt 23469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 536
Target Start/End: Original strand, 40055769 - 40055918
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccaccc-gaaa 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  40055769 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaaaaa 40055868  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40055869 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40055918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 383 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18104417 - 18104295
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  18104417 tcaacgattataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatc 18104319  T
Q  482 cg-aaaatttaaataattcaatta 504  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  18104318 cgaaaaatttaaataattcaatta 18104295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Original strand, 8461698 - 8461913
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||             | |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  8461698 cagtggcagagcccttcatgggctggggtgggtcacgacccacctggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgatattttatacaatt 8461797  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    || | || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  8461798 ttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtga 8461897  T
Q  521 gattttatacaatttt 536  Q
     | |||| ||||||||    
T  8461898 tactttaaacaatttt 8461913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 23562806 - 23562592
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||             ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23562806 cagtggcggagcccttcatgagctggggtgggccatggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatacaatt 23562707  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| |||  || | |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23562706 ttgtgtcgaattaa-gttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcga 23562608  T
Q  521 gattttatacaatttt 536  Q
    |  |||| ||||||||    
T  23562607 ggctttaaacaatttt 23562592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 505 - 655
Target Start/End: Original strand, 25174216 - 25174367
Alignment:
Q  505 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaattt 603  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25174216 taggtcaattttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaattt 25174315  T
Q  604 aaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25174316 aaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacg 25174367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 321 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 29502293 - 29502076
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||              | |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29502293 ggcagcggcggagcccttcatgggctagggtgggccacagcccacccgaaaaatttaaaaaattaacgataataggtatattttgcaagattttattcaa 29502194  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 518  Q
    |||||| | ||||||| |||| |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  29502193 ttttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattgaattataggtctattttgt 29502094  T
Q  519 gagattttatacaatttt 536  Q
    |||| |||| || |||||    
T  29502093 gagactttaaactatttt 29502076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 22499868 - 22499716
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaattt 603  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||       
T  22499868 ataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa--- 22499772  T
Q  604 aaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22499771 aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttttcaatggtta 22499716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 508 - 655
Target Start/End: Original strand, 28754878 - 28755025
Alignment:
Q  508 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaa 606  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  28754878 gtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaa 28754976  T
Q  607 taatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  28754977 taattcaattataagtctattttccaagtctttaaacaatttttcaacg 28755025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 536
Target Start/End: Original strand, 25174216 - 25174361
Alignment:
Q  393 taggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-ttt 490  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  |||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  25174216 taggtcaattttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaattt 25174315  T
Q  491 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25174316 aaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 25174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 475 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 29502254 - 29502066
Alignment:
Q  475 gcccacccgaaaa-tttaaataattca--attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattccc 571  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||    |||| ||||||||    
T  29502254 gcccacccgaaaaatttaaaaaattaacgataataggtatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattccc 29502155  T
Q  572 gcaaagtggtgtagtggccactc-gaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29502154 gcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttttcaacggtta 29502066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828781
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaattt 490  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcgaaaattt 46828827  T
Q  491 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  46828826 aaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttt 46828781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 16649685 - 16649541
Alignment:
Q  393 taggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaattta 491  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  16649685 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaattta 16649586  T
Q  492 aataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  16649585 aataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 16649541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 17624046 - 17623902
Alignment:
Q  393 taggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaattta 491  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  17624046 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaattta 17623947  T
Q  492 aataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17623946 aataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 17623902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 532 - 667
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663146
Alignment:
Q  532 attttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttta 630  Q
    ||||| |||| ||||||  |||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  631 agaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttttcaacggttaattttagt 29663146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 18104411 - 18104245
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  18104411 attataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaa 18104313  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||| ||||  |  ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  18104312 atttaaataattcaattaaagatctaatttactaaactttaaacaatttttcaataattaattttagt 18104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 22499875 - 22499726
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||      
T  22499875 aacgatcataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccaccta 22499776  T
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||   ||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22499775 aaaa---aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttt 22499726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 420 - 536
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663128
Alignment:
Q  420 attttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 517  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  518 cgagattttatacaatttt 536  Q
    | ||| |||| ||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttt 29663128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 528 - 659
Target Start/End: Original strand, 9021516 - 9021648
Alignment:
Q  528 tacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaattataagtctat 626  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | |||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  9021516 tacaattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctat 9021615  T
Q  627 tttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9021616 tttgcgagactttaaacaatttttcaatggtta 9021648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 505 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 16649685 - 16649531
Alignment:
Q  505 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaattt 603  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||| |||    
T  16649685 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaa-ttt 16649587  T
Q  604 aaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  16649586 aaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaacggtta 16649531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 505 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 17624046 - 17623892
Alignment:
Q  505 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaattt 603  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||| |||    
T  17624046 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaa-ttt 17623948  T
Q  604 aaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  17623947 aaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaacggtta 17623892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Original strand, 30781079 - 30781234
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatt 602  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||  |||||  ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||| | |||||||    
T  30781079 atagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggttttg-gtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatt 30781177  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30781178 taaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaacggtta 30781234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 422 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4248978 - 4248865
Alignment:
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||||||||||||  |||  | ||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4248978 tttgtatcggttttagttttcagctgatctaaatttttgcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgca 4248879  T
Q  520 agattttatacaat 533  Q
    ||| |||| |||||    
T  4248878 agactttaaacaat 4248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Original strand, 9013884 - 9014029
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatggtgtagtggcccacccgaaaa-ttt 490  Q
    ||||||||||||   |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||| |   ||||| |||| ||||||| ||||||| |||    
T  9013884 ataggtctatttcttaagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcccaaaatgttgtaatggcccatccgaaaaattt 9013983  T
Q  491 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  9013984 atataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Original strand, 30781072 - 30781224
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| | | ||| ||||| | ||| ||||||     
T  30781072 aacgatcatagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggttttg-gtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccaccca 30781170  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  30781171 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 30781224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 517
Target Start/End: Original strand, 9014475 - 9014587
Alignment:
Q  407 aagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaatta 504  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |  | |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  9014475 aagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaatta 9014574  T
Q  505 taggtctattttg 517  Q
    |||||||||||||    
T  9014575 taggtctattttg 9014587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 520 - 629
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014586
Alignment:
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||   | ||| |||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattat 9014575  T
Q  619 aagtctatttt 629  Q
    | |||||||||    
T  9014576 aggtctatttt 9014586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 507 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22566667 - 22566599
Alignment:
Q  507 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaa 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  22566667 ggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaattgccgcaa 22566599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 536
Target Start/End: Original strand, 6961171 - 6961246
Alignment:
Q  462 aaatggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6961171 aaatggtgcggtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 536
Target Start/End: Original strand, 8727794 - 8727936
Alignment:
Q  396 gtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggccca-cccgaaaatttaaa 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | |||||||||| || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  |  ||||||||||    
T  8727794 gtctattttacaagattttatgtcattttgtgttgattttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatttaaa 8727893  T
Q  494 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
     ||||| ||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  8727894 caattcgattgtaggtctattttacgaaactttaaacaatttt 8727936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 516
Target Start/End: Original strand, 28754810 - 28754999
Alignment:
Q  320 cggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgca 419  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||             | |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||    
T  28754810 cggcagtggcggagcctttcatgggctagggtgggccatggcccacctggaaaaa--------ttaacgatcatatgtctactttgcgagattttataca 28754901  T
Q  420 attttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaat-ttaaataattcaattataggtctatttt 516  Q
    ||||| | ||  ||||| ||||  |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28754902 attttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaattt-tgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataattcaattataagtctatttt 28754999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 551 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 4248961 - 4248865
Alignment:
Q  551 tttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcca-ctcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaat 646  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   || |||||||||||    
T  4248961 tttcagctgatctaaatttttgcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacaat 4248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 27994747 - 27994865
Alignment:
Q  1 gatgagagtgattggagtgatgttgatttgcttagaagtgttaaaccatttggttggaattatgctgtttctaagactttggctgagaaagctgttcttg 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  || | ||||||| | | || ||||||| ||||   |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  27994747 gatgaaagttattggagtgatgtgaatattcttagaactttgaagccatttgcttggtcatatggtgtttctaagacactagctgagaaagctgttcttg 27994846  T
Q  101 aatttggtgaacaaaatgg 119  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  27994847 aatttggagaacaacatgg 27994865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22566667 - 22566606
Alignment:
Q  395 ggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatt 456  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  22566667 ggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 551 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 24779684 - 24779575
Alignment:
Q  551 tttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttt 649  Q
    |||| ||||||  |||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  24779684 tttcggttgattcaaattcacgtaaagtggtctaatggtccacccgaaaaatttaaataattaaattatagatccattttgcgagtctttaaacattttt 24779585  T
Q  650 tcaacggtta 659  Q
    ||||||||||    
T  24779584 tcaacggtta 24779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Original strand, 29662932 - 29662977
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29662932 cagtggcggagcccttcatgggctagggtgggctacggcccacccg 29662977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 536
Target Start/End: Original strand, 9021518 - 9021638
Alignment:
Q  418 caattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattt 515  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| || ||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  9021518 caattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctattt 9021617  T
Q  516 tgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  9021618 tgcgagactttaaacaatttt 9021638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 653
Target Start/End: Original strand, 9013974 - 9014033
Alignment:
Q  594 cgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaa 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9013974 cgaaaaatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 9014033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 316
Target Start/End: Original strand, 9778445 - 9778484
Alignment:
Q  277 ttatgacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9778445 ttatgagctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 9778484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Original strand, 19692467 - 19692510
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19692467 cagtggcggagcccttcatgggctggggtggaccacggtccacc 19692510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 119
Target Start/End: Original strand, 27959317 - 27959375
Alignment:
Q  61 tatgctgtttctaagactttggctgagaaagctgttcttgaatttggtgaacaaaatgg 119  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27959317 tatgctgtttctaaaaccctagctgagaaagctgttcttgaatttggagaacaacatgg 27959375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 119
Target Start/End: Original strand, 27985625 - 27985683
Alignment:
Q  61 tatgctgtttctaagactttggctgagaaagctgttcttgaatttggtgaacaaaatgg 119  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27985625 tatgctgtttctaaaaccctagctgagaaagctgttcttgaatttggagaacaacatgg 27985683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 503 - 655
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883501
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcg--aaaa 599  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||| |  |||| ||||  || |||||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 40883448  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    | ||||| ||   || |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40883449 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacg 40883501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Original strand, 6961191 - 6961255
Alignment:
Q  594 cgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  6961191 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaa-ttttcaacggtta 6961255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 8727725 - 8727766
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8727725 ggcggagcccttcatgggctagggtgggccacgacccacccg 8727766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 359
Target Start/End: Original strand, 9014390 - 9014427
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9014390 gcagtggcggagcccttcatgggctgtggtgggccacg 9014427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 436
Target Start/End: Original strand, 6961111 - 6961159
Alignment:
Q  388 gattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggtttta 436  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6961111 gattatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggtttta 6961159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 28013492 - 28013543
Alignment:
Q  68 tttctaagactttggctgagaaagctgttcttgaatttggtgaacaaaatgg 119  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28013492 tttctaaaactatggcagagaaagctgttcttgaatttggagaacaacatgg 28013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 367
Target Start/End: Original strand, 27949680 - 27949726
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc 367  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27949680 ggcagtggcggagccactcatgggccagggtgggccacggcccaccc 27949726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 361
Target Start/End: Original strand, 40054298 - 40054336
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggc 361  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40054298 cagtggcggaaccctccatgggctggggtgggccacggc 40054336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Original strand, 6961112 - 6961165
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttc 554  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  6961112 attatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttc 6961165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 9013814 - 9013847
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggc 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013814 gcagcggcggagcccttcatgggctggggtgggc 9013847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9408458 - 9408421
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9408458 acctatgaaacacggatacggacacggacaccgaatac 9408421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11061189 - 11061156
Alignment:
Q  286 atgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11061189 atgaagcacggatacggacacggacatcggatac 11061156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14629688 - 14629639
Alignment:
Q  439 ttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14629688 ttttggtagatccaaatccctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa 14629639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 314
Target Start/End: Original strand, 1433396 - 1433428
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1433396 acctatgaagcacggatacgggcacggacaccg 1433428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 17851375 - 17851407
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17851375 ctatgaagcacggatacagacacggacaccgga 17851407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21141095 - 21141067
Alignment:
Q  286 atgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21141095 atgaagcacggatacggacacggacaccg 21141067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25304015 - 25303948
Alignment:
Q  472 gtggcccacccgaaaatttaaataatt--caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  25304015 gtggcctatccgaaaaattaaaaaattaacaattataggtctattatgtgagattttaaacaatttta 25303948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 2660997 - 2660641
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2660997 cagtggcggagcccttcatgggctgggatgggccacgacccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 2660898  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2660897 ttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 2660798  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2660797 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataa 2660698  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  2660697 gtctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 2660641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9079214 - 9078867
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||             |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9079214 cagtggcggagcccttcatggactggggtgggccacagcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaatt 9079115  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9079114 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 9079015  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9079014 a-tttaaacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggaccacccgaaaaatttaaataattcaattataa 9078916  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtag 669  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9078915 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtag 9078867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 15469149 - 15469444
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15469149 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 15469248  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||  |||||||||||| ||||    
T  15469249 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt-atcccaattcccgcaaattggt 15469347  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  15469348 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 15469444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 322 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11450668 - 11450308
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggg----gtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||             ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  11450668 gcagtggcggagcccttcatgggctgggtggggtgggccacggcccacccggaaaaatttaaatatcaacgattatatatctattttgcgagatcttatg 11450569  T
Q  418 caattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 516  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11450568 caattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattattggtctatttt 11450469  T
Q  517 gcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaat 615  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||    
T  11450468 acgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaat 11450370  T
Q  616 tataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  11450369 tataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 11450308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 12698493 - 12698839
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12698493 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccgacccggaaaaatttaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaat 12698592  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12698593 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattat-ggtctattttgtga 12698691  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  12698692 gattttatacaattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaa 12698791  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12698792 ggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 12698839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 24635629 - 24635285
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24635629 cagtggcgaagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaatt 24635530  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24635529 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 24635430  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  24635429 attttatacaaatttaaatcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattatag 24635330  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24635329 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 24635285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 322 - 667
Target Start/End: Original strand, 26468447 - 26468794
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||             ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26468447 gcagtggcggagcctttcatgggctgggatgggccacggtccacttggaaaaattaaaaaatcaactattataggtctattttgcgagattttatacaat 26468546  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26468547 tttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 26468646  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  26468647 gattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggacaaaccgaaaaatttaaataattcaattata 26468746  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
      |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26468747 gatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 26468794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 388 - 677
Target Start/End: Original strand, 7021882 - 7022172
Alignment:
Q  388 gattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaa 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7021882 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaa 7021981  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7021982 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagt 7022081  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  7022082 ggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccct 7022172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 325 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24130396 - 24130057
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             ||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||    
T  24130396 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccactgcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattata-----attttgcgagattttatgcaatttt 24130302  T
Q  425 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24130301 gtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagtt 24130202  T
Q  524 tttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagt 622  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24130201 tttatacgattttatgccggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcatattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgt 24130102  T
Q  623 ctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24130101 ttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 24130057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 34023641 - 34023345
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  34023641 tcaacgattataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttctgcaaagtggtgtagtgtcccacc 34023542  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34023541 caaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 34023442  T
Q  582 gtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  34023441 gtagtgaaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 34023345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16461568 - 16461221
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16461568 cagtggcggagtccttcatggactggggtgggtcacggcccacccggaaatattaaaaaatcaacgattataagcctattttgcgagattttatgcaatt 16461469  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16461468 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattccttcaaagttgtgtagtggtccactcgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgag 16461369  T
Q  522 attttatacaattttatgtc-agttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  16461368 attttatataattttatgtcgggttttaggtttcagttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtggcctatccgaaaaatttaaataattcaattata 16461269  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     || || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16461268 ggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 16461221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 8560426 - 8560782
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||              ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  8560426 cagtggcggagcccttcaagggttggggtgg-ccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaaattgcgagattttatgcaatt 8560524  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8560525 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 8560624  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  8560625 attttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtgcacctgaaaaatttaaataattcaattatag 8560724  T
Q  621 g-tctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | |||| |||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  8560725 gatctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 8560782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 34127557 - 34127843
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  34127557 tcaactattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatgccccacc 34127656  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34127657 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggt 34127756  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  34127757 gtagtggcccacccggaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttacaatagttaattttagt 34127843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 321 - 665
Target Start/End: Original strand, 12996282 - 12996628
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||             |||| ||| |||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  12996282 ggcagtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacagcctactcggaaaattaaaaaa-tcaatgataatagatatattttgcgagattttatacaa 12996380  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataa-ttcaattataggtctattttg 517  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12996381 ttttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaaatttaaataaattcaattatagatctattttg 12996480  T
Q  518 cgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaatttaaataatttaatta 617  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||| |||||    
T  12996481 cgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaatta 12996580  T
Q  618 taagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12996581 taggtctattttgcgagactttaaacaatttttaaacggataatttta 12996628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 14883261 - 14882977
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg-tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccac 480  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14883261 tcaacgattataagtctatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccac 14883162  T
Q  481 ccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||    
T  14883161 caaaaaatttaaataattcatttttaggtctattttttgagattttatacaaatttatgtcggctttagatttcggttgatccaaattcccgc-aagagg 14883063  T
Q  581 tgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14883062 tgtagtgatccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgctaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 14882977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 383 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23259167 - 23258919
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  23259167 tcaacaattataggtccaacttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggcccacc 23259068  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||  ||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23259067 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggt 23258968  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23258967 gtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 23258919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 389 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23259048 - 23258757
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23259048 attataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaa 23258949  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||  ||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  23258948 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagt 23258849  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  23258848 ggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 23258757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 659
Target Start/End: Original strand, 7536522 - 7536681
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaa 599  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||    
T  7536522 attatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaa 7536621  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7536622 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaacggtta 7536681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 327 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 13405518 - 13405307
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgt 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||              | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13405518 ggcggagcccttcatgggttggggtgggccacgacccacccgaaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgt 13405419  T
Q  427 atcggttttatgttttggttgatccaaattcc--tgcaaatggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
     ||||||||| |||| | ||||||||||||||  || || ||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13405418 gtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatg-aagtgaagtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagat 13405320  T
Q  524 tttatacaatttt 536  Q
    |||| ||||||||    
T  13405319 tttaaacaatttt 13405307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Original strand, 7536518 - 7536671
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||  ||||| |||| || ||||| ||||||  ||||| ||||||| || ||||||||    
T  7536518 aacgattatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccg 7536617  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  7536618 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttt 7536671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 556 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 31969030 - 31968926
Alignment:
Q  556 gttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaac 654  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||||||||||    
T  31969030 gttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgtaactctttaaacaatttttcaac 31968931  T
Q  655 ggtta 659  Q
    |||||    
T  31968930 ggtta 31968926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 13405456 - 13405302
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||   |||||  ||| ||| |||  ||||||    
T  13405456 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaa 13405357  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaac 654  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  13405356 atttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttttcaac 13405302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 322 - 511
Target Start/End: Original strand, 10290456 - 10290647
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |             | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  10290456 gcagtggcggagcccttcatgggctagggtgggccatggcccacccagagaaattaaaaaattaacgatcataggtctactttgcgagattttatacaat 10290555  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttg-gttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtct 511  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10290556 tt-gtgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31969031 - 31968955
Alignment:
Q  443 ggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 517  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31969031 ggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttg 31968955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 504 - 624
Target Start/End: Original strand, 10290526 - 10290647
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttc-agttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaat 601  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  10290526 ataggtctactttgcgagattttatacaa-tttgtgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaat 10290624  T
Q  602 ttaaataatttaattataagtct 624  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    
T  10290625 ttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 511 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 1398188 - 1398040
Alignment:
Q  511 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataa 609  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||  || || | | |||||||||||||||    
T  1398188 tattttacgagattttatccaattttgtgttggttttagattt-agttgatctaaattttcgtaaagtggtgttttgtcccatttgaaaaatttaaataa 1398090  T
Q  610 tttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||| |||||||||  |||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  1398089 tttaattataggtctattttgcgagtgtttaaataattttttaacggtta 1398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 508 - 587
Target Start/End: Original strand, 31489894 - 31489973
Alignment:
Q  508 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg 587  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||  |||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31489894 gtctattttgtgagattttatataattttgtatcgattttaagttttagttaatccaaattctcacaaagtggtgtagtg 31489973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Original strand, 7938058 - 7938092
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7938058 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 7938092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1398102 - 1398065
Alignment:
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1398102 aaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgag 1398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 18367781 - 18367813
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367781 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 18367813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2399460 - 2399421
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2399460 ggcggagcccttcatgggttggggtgggccacagcccacc 2399421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 499 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2399400 - 2399362
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2399400 caattataggtctattctgcgagattttaaacaatttta 2399362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5970219 - 5970185
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5970219 acctatgaagcacagatacggacacggacaccgga 5970185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9107487 - 9107453
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9107487 acctatgaagcacggatactgacacggacaccgga 9107453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 537
Target Start/End: Original strand, 18234977 - 18235014
Alignment:
Q  500 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18234977 aattataggtatattttgcgagattttaaacaatttta 18235014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 457
Target Start/End: Original strand, 31489894 - 31489955
Alignment:
Q  396 gtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattc 457  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  31489894 gtctattttgtgagattttatataattttgtatcgattttaagttttagttaatccaaattc 31489955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8777088 - 8777056
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8777088 ctatgaagcacggatacggacacggacaacgga 8777056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 10294051 - 10294083
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10294051 ctatgaagcacggatacggacacgaacaccgga 10294083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 356
Target Start/End: Original strand, 15469101 - 15469133
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15469101 agtggcggagcccttcatgggctggggagggcc 15469133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34225916 - 34225888
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34225916 ctatgaagcacggatacggacacggacac 34225888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34290194 - 34290158
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccggata 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34290194 acctatgaagcacagatacggacacagacaccggata 34290158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26525388 - 26525032
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26525388 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttttgcaatt 26525289  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26525288 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 26525189  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  26525188 attttatacaattttatgtcggtttaaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 26525089  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||    
T  26525088 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccct 26525032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 321 - 667
Target Start/End: Original strand, 3631256 - 3631604
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3631256 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 3631355  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631356 ttttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 3631455  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3631456 agattttatacaattttatgtcgattttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattat 3631555  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    | ||||| |||  | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3631556 atgtctaatttgcgggactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 3631604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 25701579 - 25701224
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25701579 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcaagattttatgtaatt 25701480  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701479 ttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 25701380  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  25701379 attttatacaa-tttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 25701281  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  25701280 gtctaattttttagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 25701224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 30772878 - 30773234
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30772878 cagtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacggctcacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 30772977  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30772978 ttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgag 30773077  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  30773078 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 30773177  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||    
T  30773178 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcagtagttaattttagtggcccaccct 30773234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 325 - 672
Target Start/End: Original strand, 43348635 - 43348984
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43348635 gtggcggagcccttcatgggctggggcgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaatttt 43348734  T
Q  425 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348735 gtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 43348834  T
Q  524 tttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagt 622  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43348835 tttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 43348934  T
Q  623 ctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  43348935 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 43348984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 326 - 667
Target Start/End: Original strand, 16823133 - 16823476
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16823133 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttg 16823232  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16823233 tgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagatt 16823332  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    |||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16823333 ttatatgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 16823432  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16823433 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 16823476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 324 - 667
Target Start/End: Original strand, 43358410 - 43358755
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43358410 agtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaatgaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattt 43358509  T
Q  424 tgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43358510 tgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtagtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcgaga 43358609  T
Q  523 ttttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataag 621  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |    
T  43358610 ttttatacaattttatgtctgttttaggttacggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatagg 43358709  T
Q  622 tctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||| |||  ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  43358710 tctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagt 43358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8074398 - 8074041
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8074398 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacctggaaaattttaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaat 8074299  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8074298 tttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagtggtccacccaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcga 8074199  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  8074198 gattttatacaatttaatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattata 8074099  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  8074098 ggtctattttgcgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtggcccaccct 8074041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 7440638 - 7440283
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||             ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7440638 cagtggcggagcccttcatgggttggg-tgggctacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatt 7440540  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7440539 ttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaactataggtctattttgcgag 7440440  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  7440439 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaattttaaataattcaattatag 7440340  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  7440339 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 7440283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13013413 - 13013067
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13013413 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttaagcaatt 13013314  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13013313 ttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgtagtgtcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 13013214  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  13013213 attttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 13013114  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13013113 gtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 13013067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32304751 - 32304465
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32304751 tcaacgattataagtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtattggcccacc 32304652  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  32304651 caaaaattgaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccggaaattggt 32304552  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  32304551 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacattttttcaatagttaattttagt 32304465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 327 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9596320 - 9595978
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgt 426  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||               |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9596320 ggcggagcccttcaaaggctggggtgggccacggcccacccaaaaaaattaaaaaatcaacgattatatgtctattttgcgagattttatgcaattttgt 9596221  T
Q  427 atcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattt 525  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9596220 gtcggttttatattttagttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattt 9596121  T
Q  526 tatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtct 624  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  9596120 tatacaattttatgtcggttttaggtttgtgttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatct 9596021  T
Q  625 attttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  9596020 aatttacgagactttaaacaattttttaatagttaattttagt 9595978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13084741 - 13084455
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||    
T  13084741 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgcagtgtcccacc 13084642  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13084641 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatccaaatttccgcaaattggt 13084542  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13084541 atagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 13084455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26297167 - 26296811
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  26297167 cagtggcggagcccttcatgagctgggatgggccacggtccacccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcaagatcttatataatt 26297068  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaa-atttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26297067 ttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaatatttaaataattcaattataggcctatttt-cga 26296969  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  26296968 gattttatacatttttatgtcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatgtaaacaattcaattata 26296869  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26296868 gatctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagcagcccaccct 26296811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 323 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 41084738 - 41084389
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  41084738 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc--ggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatagaatt 41084641  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41084640 ttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cga 41084542  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  41084541 gattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttaattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccggaaaaatttaaacaattcaattata 41084442  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41084441 ggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggccc 41084389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 9737865 - 9737651
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9737865 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 9737766  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9737765 ttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgag 9737666  T
Q  522 attttatacaatttt 536  Q
    | |||| ||||||||    
T  9737665 actttaaacaatttt 9737651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 10925568 - 10925854
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  10925568 tcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacc 10925667  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||   ||||| ||||    
T  10925668 tgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattttggcaaattggt 10925767  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||  ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10925768 gtagtggtctaccagaaaaatttaaataattcaattataggtctaacttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagt 10925854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 465 - 677
Target Start/End: Original strand, 26784972 - 26785185
Alignment:
Q  465 tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatcta 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  26784972 tggtgtagtggcccacccaaaaattgaaataattcaactataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcca 26785071  T
Q  565 aattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 663  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26785072 aattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagtttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattt 26785171  T
Q  664 tagtagccctccct 677  Q
    |||| |||| ||||    
T  26785172 tagtggcccaccct 26785185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 383 - 669
Target Start/End: Original strand, 15374174 - 15374447
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  15374174 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattcttgcaaagtggtgtaatggtccacc 15374273  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |               |||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15374274 cacaaatttaaataattcaattatatg---------------tttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 15374358  T
Q  582 gtagtggcc--actcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtag 669  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15374359 gtagtggcccaact-gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtag 15374447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 328 - 522
Target Start/End: Original strand, 29390273 - 29390468
Alignment:
Q  328 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgta 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||     
T  29390273 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtg 29390372  T
Q  428 tcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29390373 ttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgaga 29390468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 322 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 19577339 - 19577124
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||             | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  19577339 gcagtggcggagcccttcatgggctaaggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaatt-aacgattatagatctattttgcaacattttatacaat 19577241  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19577240 tttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataatttaattataggtctgttttgcg 19577141  T
Q  520 agattttatacaatttt 536  Q
    |||  ||| ||||||||    
T  19577140 agacattaaacaatttt 19577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 667
Target Start/End: Original strand, 15374301 - 15374572
Alignment:
Q  412 tttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggt 509  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15374301 tttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggt 15374400  T
Q  510 ctattttgcgagattttatacaatttt----------atgtcagt---tttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc--actc 594  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||          || | |||   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||     
T  15374401 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgacccaact- 15374499  T
Q  595 gaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15374500 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 15374572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 504 - 667
Target Start/End: Original strand, 20487040 - 20487204
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatt 602  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  20487040 ataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatt 20487139  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20487140 taaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaccgttaattttagt 20487204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 20656956 - 20656801
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |    
T  20656956 tcaacaattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatc 20656857  T
Q  482 cg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  20656856 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttt 20656801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 501 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 9737799 - 9737623
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  9737799 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 9737701  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  9737700 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 9737623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Original strand, 20487033 - 20487186
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  20487033 aacgatcataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccg 20487132  T
Q  484 -aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20487133 aaaaatttaaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttt 20487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 501 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 19577273 - 19577114
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaa 599  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19577273 attatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 19577174  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19577173 atttaaataatttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttttcaacggtta 19577114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 322 - 502
Target Start/End: Original strand, 5844104 - 5844285
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||             |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5844104 gcagtggcggagcccttaatgggttggggtgggctacggcacatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttactagattttatgcaat 5844203  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgc-aaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaat 502  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5844204 ttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacccgaaaatttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 536
Target Start/End: Original strand, 26785010 - 26785157
Alignment:
Q  391 tataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-t 488  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  26785010 tataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagt 26785109  T
Q  489 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  26785110 ttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttt 26785157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 511 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 22579017 - 22578869
Alignment:
Q  511 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataa 609  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  22579017 tattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataa 22578918  T
Q  610 tttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtt 658  Q
    || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22578917 ttcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttttcaacggtt 22578869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20656952 - 20656783
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaa 597  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||    
T  20656952 caattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaa 20656853  T
Q  598 aaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20656852 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 20656783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 508 - 659
Target Start/End: Original strand, 41817525 - 41817677
Alignment:
Q  508 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaa 606  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41817525 gtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaa 41817624  T
Q  607 taatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||| |||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41817625 taattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttttcaatggtta 41817677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Original strand, 41817514 - 41817667
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||| || || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41817514 aacgatcatatgtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 41817613  T
Q  484 -aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||    
T  41817614 aaaaatttaaataattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttt 41817667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 37042643 - 37042496
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg--aaaat 488  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||  ||||     
T  37042643 atagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaa 37042544  T
Q  489 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  37042543 ttaaataattcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 37042643 - 37042487
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcg-aaaaat 601  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||     
T  37042643 atagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaa 37042544  T
Q  602 ttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  37042543 ttaaataattcaactataggtctattttgtgagactttaaataa-ttttcaacggtta 37042487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 619
Target Start/End: Original strand, 29390334 - 29390452
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  29390334 attataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 29390432  T
Q  600 atttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  29390433 atttaaataattcaattata 29390452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 22579031 - 22578878
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| ||| || |||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||   ||| |||||||||||  || |||    
T  22579031 aacgatcataagtttattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccg 22578932  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22578931 aaaaatttaaataattcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttt 22578878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Original strand, 28662185 - 28662341
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccact-cgaaaaatt 602  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| | |||||   ||||| ||||||| |||   || |||||||||    
T  28662185 atagatctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatt 28662284  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||   || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  28662285 taaataattcaattataggtttattttgcaagactttaaacattttttcaacagtta 28662341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 536
Target Start/End: Original strand, 28662117 - 28662331
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             | ||| |  |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  28662117 agtggcggagccctttatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaattaaccaccatagatctattttacgagattttatacaattt 28662216  T
Q  424 tgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtgg-cccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||| |  |||||| |||| || ||| |||||||  |||||| ||||||| |||  || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28662217 tgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcaag 28662316  T
Q  522 attttatacaatttt 536  Q
    | |||| ||| ||||    
T  28662317 actttaaacattttt 28662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 30050184 - 30050074
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaa 600  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | ||||||  |||||  || ||||||||||||||||||  | |||||    
T  30050184 attataggtctattttacgatattttatacaattttgtgtcaatttttggttacggttgattcaaattttcgtaaagtggtgtagtggccaacctaaaaa 30050085  T
Q  601 tttaaataatt 611  Q
    |||||||||||    
T  30050084 tttaaataatt 30050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 20071296 - 20071219
Alignment:
Q  511 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg 588  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  20071296 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtgg 20071219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Original strand, 26784910 - 26784957
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26784910 gcagtggcggagcccttcatgggcttaggtgggccacggcccacccgg 26784957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6229109 - 6229071
Alignment:
Q  331 gagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6229109 gagcccttcatgggctggggtgggccacagcccacccgg 6229071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Original strand, 15382420 - 15382453
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15382420 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 15382453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 30062781 - 30062693
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc 589  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||||  || ||||||||| ||||||    
T  30062781 attataggtctattttatgatattttatacaactttgtgtcggtttttagttttagttgattcaaattttcgtaaagtggtggagtggc 30062693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20071367 - 20071329
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20071367 ggcggagcccttcatgggctagggtgggtcacggcccac 20071329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Original strand, 34276799 - 34276833
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34276799 acctatgaagcacggatacggacacggataccgga 34276833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 312
Target Start/End: Original strand, 43001756 - 43001790
Alignment:
Q  278 tatgacctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43001756 tatgatctatgaagcacggatacggacacggacac 43001790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 316
Target Start/End: Original strand, 8419985 - 8420014
Alignment:
Q  287 tgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419985 tgaagcacggatacggacacggacaccgga 8420014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17177140 - 17177103
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17177140 acctatgaagcacggatacggacacagacaccagatac 17177103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Original strand, 21522693 - 21522726
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21522693 cctatgaagcacggatacggacacggtcaccgga 21522726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Original strand, 21533259 - 21533292
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21533259 cctatgaagcacggatacggacacggtcaccgga 21533292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32426968 - 32426935
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32426968 cctatgaagcatggatacggacacggacaccgga 32426935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 319
Target Start/End: Original strand, 41995417 - 41995450
Alignment:
Q  286 atgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41995417 atgaagcacggatacggacacggacactggatac 41995450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 6401442 - 6401474
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6401442 ctatgaagcacggatacagacacggacaccgga 6401474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 314
Target Start/End: Original strand, 6770485 - 6770517
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6770485 acctatgaagcacggatacggatacggacaccg 6770517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 614 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 20071135 - 20071091
Alignment:
Q  614 attataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtt 658  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20071135 attataggtttattttacgagactttaaacaatttttcaacggtt 20071091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20657017 - 20656977
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcc 362  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20657017 gcagtggcggagcctttcataggctggggtgggccatggcc 20656977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 20683325 - 20683357
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20683325 ctataaagcacggatacggacacggacaccgga 20683357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23016106 - 23016074
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23016106 ctatgaagcacggatacggacacggactccgga 23016074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26683103 - 26683033
Alignment:
Q  465 tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaa--ttataggtctattttgcgagattttatacaatt 534  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26683103 tggtgcagtggcccacc-gaaaaattaaaaaattaaaaattataggtctattttgtgagattttaaacaatt 26683033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 26683212 - 26683145
Alignment:
Q  472 gtggcccacccg-aaaatttaaataatt--caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26683212 gtggcccacccggaaaaattaaaaaattaacaattataggtttattttgtgagattttaaacaatttt 26683145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29126203 - 29125847
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29126203 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 29126104  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29126103 ttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 29126004  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||     
T  29126003 attttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatag 29125904  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  29125903 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 29125847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 323 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 50527793 - 50527442
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50527793 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgtttatagttctattttgcgagattttatgcaatt 50527694  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50527693 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 50527594  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  50527593 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatat 50527494  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  50527493 gtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 50527442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 52201981 - 52202337
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52201981 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggtcacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaatt 52202080  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  52202081 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgacccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgag 52202180  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  52202181 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccactcaaaaaatttaaataattcaattatag 52202280  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  52202281 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 52202337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 388 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11232249 - 11231958
Alignment:
Q  388 gattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaa 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11232249 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaa 11232150  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11232149 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 11232050  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  11232049 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 11231958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 326 - 677
Target Start/End: Original strand, 22729222 - 22729575
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22729222 tggcggagcccttaatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttg 22729321  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22729322 tgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 22729421  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  22729422 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 22729521  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  22729522 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtggcccaccct 22729575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 44254700 - 44254404
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44254700 tcaatgattatatatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 44254601  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44254600 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 44254501  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  44254500 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 44254404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 329 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1093031 - 1092681
Alignment:
Q  329 cggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtat 428  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1093031 cggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgt 1092932  T
Q  429 cggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 527  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1092931 gggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagatttta 1092832  T
Q  528 tacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctat 626  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||      
T  1092831 tacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtctga 1092732  T
Q  627 tttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  1092731 tttgcgagacttaaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccct 1092681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 326 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 32271074 - 32270722
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32271074 tggcggagcctttcatgggctggggtgggccacagcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattat--gtctattttgcgagattttatgcaattttg 32270977  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270976 tgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 32270877  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc--actcgaaaaatttaaataatttaattataagt 622  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32270876 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggt 32270777  T
Q  623 ctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  32270776 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 32270722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 322 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28952552 - 28952205
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||             ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28952552 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacgatccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatgggtctattttgcgagattttatgcaat 28952453  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatgg-tgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28952452 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgcaaaggggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattacaggtctattttgcga 28952353  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||     
T  28952352 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatg 28952253  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28952252 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 28952205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12251667 - 12251311
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  12251667 cagtggcagagcccttcatgggctggggtggaccacggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatataatt 12251568  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12251567 ttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 12251468  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  12251467 aatttatacaattttatgtcgattttagatttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtaatggcccactcgaaaaatttaaataattcaactatag 12251368  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  12251367 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 12251311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 13595033 - 13594729
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13595033 cagtggcggagcccgtcatgggctggggtgggccacggcccacctgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatt 13594934  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594933 ttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 13594834  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||     
T  13594833 attttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaaaaatttaaataattcaattatat 13594734  T
Q  621 gtcta 625  Q
    |||||    
T  13594733 gtcta 13594729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 322 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16908969 - 16908632
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  16908969 gcagtggcagagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaattcaacgattataggtctattttgcgagattttatg---- 16908874  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16908873 ------tcggttttatgttttggttgatccaaattccagcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcta 16908780  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16908779 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattata 16908680  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     ||||| |||   || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16908679 ggtctaatttgctagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 16908632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 388 - 667
Target Start/End: Original strand, 35083857 - 35084138
Alignment:
Q  388 gattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaa 486  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35083857 gattataggtcaattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggtccacccgaaa 35083956  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  35083957 agttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgatgtagt 35084056  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35084057 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 35084138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 27742545 - 27742831
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  27742545 tcaacgcttataggtctattttgagagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcctatc 27742644  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| ||||    
T  27742645 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggttgatcccaattcccgtaaattggt 27742744  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27742745 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagt 27742831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 611
Target Start/End: Original strand, 36633486 - 36633776
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||             |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  36633486 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacgacccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatacaatt 36633585  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633586 ttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36633685  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatt 611  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  36633686 atattatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggtccaccagaaaaatttaaataatt 36633776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 49657311 - 49657025
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49657311 tcaacgactataggtctattttttgaaattttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 49657212  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49657211 tgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 49657112  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  49657111 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatgataaattttagt 49657025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 326 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21259591 - 21259286
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||             |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21259591 tggcggagcccttcatgggttggagtgggccacgacccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttg 21259492  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21259491 tgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagatt 21259392  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21259391 ttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 21259292  T
Q  624 tatttt 629  Q
    ||||||    
T  21259291 tatttt 21259286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 323 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 52571584 - 52571244
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  52571584 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaatt 52571485  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52571484 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccactcaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 52571385  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
            ||| |||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||| |||| |||||||     
T  52571384 --------caaatttatgtcggttttagatttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtctacccaaaaaatttaaacaattcaattatag 52571293  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtag 669  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  52571292 gtctaatttgtgagactttaaacaaattttcaatagttaattttagtag 52571244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 389 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21259415 - 21259134
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  21259415 attataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaa 21259316  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  21259315 atttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaat 21259216  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21259215 ggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 21259134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 321 - 535
Target Start/End: Original strand, 18163715 - 18163930
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18163715 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttattcaa 18163814  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18163815 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtg 18163914  T
Q  520 agattttatacaattt 535  Q
    ||| |||| |||||||    
T  18163915 agactttaaacaattt 18163930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 322 - 572
Target Start/End: Original strand, 49169791 - 49170042
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |             |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  49169791 gcagtggcggagccctttatgggctggggtgggccacaacccacccagaaaagtaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgaaattttatacaat 49169890  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  49169891 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccgaaaatttaaataattcaattatgggtctattttgcaa 49169990  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccg 572  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  49169991 gactttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccg 49170042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 322 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 7160451 - 7160235
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7160451 gcagtggcggagcctttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaat 7160352  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7160351 tttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcg 7160252  T
Q  520 agattttatacaatttt 536  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  7160251 agactttaaacaatttt 7160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Original strand, 4618210 - 4618362
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatggtgtagtggcccaccc 482  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||  ||||||||| ||||||    
T  4618210 tcaacgattatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttattttttg-ttgatccaaactctttcaaagtgtgtagtggtccaccc 4618308  T
Q  483 gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4618309 gaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttt 4618362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 502 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 25246317 - 25246146
Alignment:
Q  502 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  25246317 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaa 25246218  T
Q  601 tttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  25246217 tttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 25246146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 650
Target Start/End: Original strand, 45045268 - 45045537
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||||||   |||||| | | |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||    
T  45045268 tcaatgattatagatttattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacc 45045367  T
Q  482 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  || ||| ||||||| |||||||||    
T  45045368 cgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtgg 45045467  T
Q  581 tgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaattttt 650  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  45045468 tgtagtggtccac-ccaaaaattcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaattttt 45045537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Original strand, 44205471 - 44205626
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt-gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccac 480  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||    
T  44205471 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcac 44205570  T
Q  481 ccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44205571 ccgaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 44205626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 420 - 586
Target Start/End: Original strand, 743958 - 744116
Alignment:
Q  420 attttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  743958 attttgtgtcggttttatgttttggttgatcaaaattcctg-------tgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgga 744050  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  744051 agattttatacaattttacgtc-ggtttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 744116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7160384 - 7160217
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7160384 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 7160285  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  7160284 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagt 7160217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13594854 - 13594721
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13594854 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaaaa 13594755  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13594754 atttaaataattcaattatatgtctaatttgcga 13594721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 501 - 677
Target Start/End: Original strand, 18163783 - 18163959
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| || |||    
T  18163783 attataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccg-aaa 18163881  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||| ||||    
T  18163882 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttctcaatagttaattttcgtggcccaccct 18163959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 385 - 527
Target Start/End: Original strand, 34660807 - 34660950
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  34660807 aacgatcataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccg 34660906  T
Q  484 -aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 527  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34660907 aaaaatttaaat-attcaattataggtctattttgcgagacttta 34660950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 25246324 - 25246169
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  25246324 tcaacgtttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacc 25246225  T
Q  482 cg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  25246224 cgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttt 25246169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Original strand, 2618953 - 2619108
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaat- 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||      
T  2618953 ataggtctattttgcgagattttatacaattgt--gttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaa 2619050  T
Q  602 ttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2619051 ttaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttttcaacggtta 2619108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Original strand, 2618953 - 2619098
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaat-- 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   ||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  2618953 ataggtctattttgcgagattttatacaattgtgtt--ggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaa 2619050  T
Q  489 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2619051 ttaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttt 2619098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 31174639 - 31174494
Alignment:
Q  515 ttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataattta 613  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |    
T  31174639 ttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattca 31174540  T
Q  614 attataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31174539 attgtaggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaacggtta 31174494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 410 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 31174632 - 31174504
Alignment:
Q  410 attttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 507  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  31174632 attttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattgtag 31174533  T
Q  508 gtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31174532 gtctattttgcgagtctttaaacaatttt 31174504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 677
Target Start/End: Original strand, 44205477 - 44205654
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaatttta-tgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaa 598  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| || |  ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  44205477 attatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaa 44205576  T
Q  599 aatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | ||||||||||| ||||| | ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  44205577 a-tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 44205654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 36633552 - 36633680
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  36633552 attataggtctattttgtgagattttatacaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacccgaaaa 36633651  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36633652 -tttaaataattcaattataggtctatttt 36633680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 13594967 - 13594839
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaa 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  | ||||  |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  13594967 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 13594868  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13594867 -tttaaataattcaattataggtctatttt 13594839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 49169858 - 49169986
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||  |||| | ||||||||||||| ||| |||| || |||    
T  49169858 attataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccg-aaa 49169956  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  49169957 atttaaataattcaattatgggtctatttt 49169986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 504 - 643
Target Start/End: Original strand, 34660814 - 34660953
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatt 602  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  | ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34660814 ataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatt 34660913  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaac 643  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  34660914 taaat-attcaattataggtctattttgcgagactttaaac 34660953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 519 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 576539 - 576403
Alignment:
Q  519 gagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaatta 617  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||  |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||    
T  576539 gagattttatacaattttgtatcgattttagatttcggttgatctaagtacacgcaaagtggtgtagtggcctactaaaaaaatttaaattattcaatta 576440  T
Q  618 taagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    || || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  576439 taggtatatttt-cgagtctttaaacaatttttcaacg 576403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 511 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499204
Alignment:
Q  511 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtgg 52499204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Original strand, 4618216 - 4618380
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||| ||| ||   ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4618216 attatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatttttt-gttgatccaaactctttcaaagtg-tgtagtggtccacccgaaaa 4618313  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  4618314 -tttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttttcaataattaattttagt 4618380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Original strand, 18657976 - 18658041
Alignment:
Q  594 cgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18657976 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaacggtta 18658041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 482
Target Start/End: Original strand, 744032 - 744125
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccaccc 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  744032 attataggtctattttggaagattttatacaattttacgtcgg-tttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtcgtccaccc 744125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 750738 - 750702
Alignment:
Q  280 tgacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  750738 tgacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 750702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7441737 - 7441702
Alignment:
Q  328 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7441737 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc 7441702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Original strand, 2618884 - 2618925
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 364  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2618884 cagtggcggagcccttcatgggttgaggtgggccacggccca 2618925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 18657979 - 18658016
Alignment:
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18657979 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 18658016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 14027959 - 14027991
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14027959 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 14027991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 316
Target Start/End: Original strand, 7171443 - 7171478
Alignment:
Q  281 gacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7171443 gacctatgaagcacggatacggacacagacaccgga 7171478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17568784 - 17568753
Alignment:
Q  285 tatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17568784 tatgaagcacggatacggacacggacaccgga 17568753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25246386 - 25246343
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 366  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25246386 cagtggcggagcctttcatgagctggggtgggccacgacccacc 25246343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35994855 - 35994820
Alignment:
Q  281 gacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35994855 gacctatgaagcacggatacggacatggacaccgga 35994820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 576538 - 576428
Alignment:
Q  408 agattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccac-ccgaaaatttaaataattcaattat 505  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | |  ||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||    
T  576538 agattttatacaattttgtatcgattttagatttcggttgatctaagtacacgcaaagtggtgtagtggcctactaaaaaaatttaaattattcaattat 576439  T
Q  506 aggtctatttt 516  Q
    |||| ||||||    
T  576438 aggtatatttt 576428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13845614 - 13845584
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13845614 ctatgaagcacggatacggacacggacaccg 13845584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 503 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25894732 - 25894698
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25894732 tataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 25894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 503 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25911699 - 25911665
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25911699 tataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 25911665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16000130 - 16000101
Alignment:
Q  285 tatgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16000130 tatgaagcacggatacggacacggacaccg 16000101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Original strand, 21479067 - 21479100
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21479067 cctatgaagcatggatacggacacggacaccgga 21479100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Original strand, 34660753 - 34660794
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 364  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34660753 cagtggcggagctcttcatggattggggtgggccacggccca 34660794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3164140 - 3164108
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3164140 ctatgaagcacggatacagacacggacaccgga 3164108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10318155 - 10318123
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10318155 ctatgaagcacggatacgaacacggacaccgga 10318123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10335401 - 10335369
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10335401 ctatgaagcacggatacgaacacggacaccgga 10335369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 14747511 - 14747543
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14747511 ctatgaagcacggatacggatacggacaccgga 14747543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15796409 - 15796377
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15796409 ctatgaagcacggatatggacacggacaccgga 15796377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23870650 - 23870622
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23870650 ctatgaagcacggatacggacacggacac 23870622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Original strand, 45451523 - 45451551
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45451523 ctatgaagcacggatacggacacggacac 45451551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 322 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 16693108 - 16692756
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16693108 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaat 16693009  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16693008 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 16692909  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16692908 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattata 16692809  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  16692808 tgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatatttaattttagtggccc 16692756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 17285452 - 17285095
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17285452 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaatt 17285353  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17285352 ttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 17285253  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-cca-ctcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  17285252 attttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccaccccgaaaaatttaaataattcaattata 17285153  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  17285152 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 17285095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 326 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 33012212 - 33011859
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33012212 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttg 33012113  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33012112 tgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 33012013  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||   ||    
T  33012012 ttatgcaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatttttc 33011913  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  33011912 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 33011859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29981865 - 29981509
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  29981865 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctactttgtgatattttatgcaatt 29981766  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29981765 ttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 29981666  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||     
T  29981665 attttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaacaattcaattatat 29981566  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  29981565 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 29981509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 919868 - 919512
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  919868 cagtgacggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatt 919769  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  919768 ttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 919669  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  919668 attttatacaattttatgtcggttttaggtttccattgatccaaattccagcaaattggtgtagtagtccacccaaaaaatttaaataattcaattatag 919569  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  919568 gtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtcgcccaccct 919512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 37125692 - 37126048
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37125692 cagtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaattataaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaatt 37125791  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37125792 ttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtacagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 37125891  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  37125892 attttatacaattttatatcagttttaggtttcggttgatcaaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 37125991  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  37125992 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 37126048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 51139745 - 51140041
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51139745 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 51139844  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51139845 cgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttttacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 51139944  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  51139945 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 51140041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Original strand, 8086289 - 8086573
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8086289 tcaacgactatagatctattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 8086388  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8086389 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 8086488  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8086489 gtagtggcccacacgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacaattttttaatggttaatttta 8086573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 322 - 677
Target Start/End: Original strand, 29169940 - 29170297
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29169940 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacagcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaat 29170039  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29170040 tttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtagcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 29170139  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  29170140 gattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgcagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaactata 29170239  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  29170240 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 29170297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 388 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25299181 - 25298900
Alignment:
Q  388 gattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaa 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25299181 gattataggtctattttgcgagattttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccggaaa 25299082  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25299081 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 25298982  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25298981 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 25298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 322 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 48708577 - 48708229
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||               |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48708577 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgagccacggcccatccgaaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 48708478  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48708477 ttttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 48708378  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  48708377 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgtctcacccgaaaaatttaaataattcaattat 48708278  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    | ||||| |||   || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48708277 aggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 48708229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 333 - 677
Target Start/End: Original strand, 23177351 - 23177697
Alignment:
Q  333 gcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggt 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23177351 gcccttcgtgggctggggtgggccacggtccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgat 23177450  T
Q  433 tttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttataca 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23177451 tttatattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttataca 23177550  T
Q  532 attttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttta 630  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  23177551 attttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 23177650  T
Q  631 agaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  23177651 tgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 23177697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 325 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 44052615 - 44052261
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44052615 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggctcacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaatttt 44052516  T
Q  425 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44052515 gtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagat 44052416  T
Q  524 tttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagt 622  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44052415 tttatagaattttatgtcggttttaggttttggttgattcaaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 44052316  T
Q  623 ctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  44052315 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 44052261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 24790434 - 24790781
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |             ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  24790434 cagtggtggagcccttcatgggctggagtgggccacgacccacccagaaaaataaaaaaatcaacgactataagtctgttttgcgagattttatgcaatt 24790533  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790534 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 24790633  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaag-tttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  24790634 attttatacaattttatgtcggttttacgttttgggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcaagcgaaaaatttaaataattcaattata 24790733  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     ||| | |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24790734 ggtcaaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagt 24790781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 47561726 - 47562072
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47561726 cagtggcggagcccttcataggtttgggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaatt 47561825  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47561826 ttgtgtaggttttatgttttggttgatccaaattactgcaaagtgatgtagtgaaccaaccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaa 47561925  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  47561926 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 47562025  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47562026 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 47562072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40428879 - 40428593
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  40428879 tcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccact 40428780  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40428779 cgaaaatttaaataattcaattatagttctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 40428680  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| | || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40428679 gtagtggcccacccgaaaaattaaaataattcaattataaatttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 40428593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 323 - 666
Target Start/End: Original strand, 42371969 - 42372314
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |             |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42371969 cagtggcggagcccttcatggattggggtgggccacggcccacccagaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgtgagattttatgcaatt 42372068  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42372069 ttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 42372168  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||      
T  42372169 attttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattattg 42372268  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttag 666  Q
     |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42372269 atctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttag 42372314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 45836903 - 45837189
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45836903 tcaacgattataggtctatattgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 45837002  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  45837003 cgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcctgcaaattggt 45837102  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45837103 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttttgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 45837189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 400 - 677
Target Start/End: Original strand, 40567042 - 40567321
Alignment:
Q  400 attttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatt 498  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40567042 attttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatagtt 40567141  T
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  40567142 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 40567241  T
Q  598 aaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  40567242 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 40567321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 383 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544816 - 24544568
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24544816 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccact 24544717  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24544716 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 24544617  T
Q  582 gtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24544616 gtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 385 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 46224856 - 46224564
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46224856 aacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 46224757  T
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46224756 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgt 46224657  T
Q  584 agtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  46224656 agtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagac--taaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 46224564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 8530082 - 8530444
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8530082 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 8530181  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8530182 ttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 8530281  T
Q  522 ------attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaa 614  Q
          ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  8530282 attttaattttatacaattttctgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgcagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaa 8530381  T
Q  615 ttataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||  |||| |||  ||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  8530382 ttatagatctaatttgcgaaactttatacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 8530444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 6849752 - 6850107
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  6849752 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatacaatt 6849851  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6849852 ttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 6849951  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||| | || ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  6849952 attttatacaaatttatatcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattagtatagtggttcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 6850051  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || || |||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||    
T  6850052 gt-taatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccct 6850107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9042576 - 9042231
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||             ||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9042576 cagtggcggagcccttcatgggctgggctgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaataattataggtctaatttacgagattttatgcaatt 9042477  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9042476 t-gtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcacacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 9042378  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  9042377 attttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattatag 9042278  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  9042277 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagt 9042231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 389 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24542873 - 24542582
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24542873 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24542774  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24542773 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542674  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||   ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  24542673 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatagttctaattagcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 24542582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24542987 - 24542744
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24542987 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24542888  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24542887 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542788  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24542787 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24542744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543101 - 24542858
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543101 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543002  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543001 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542902  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24542901 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24542858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543215 - 24542972
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543215 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543116  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543115 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543016  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543015 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24542972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543329 - 24543086
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543329 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543230  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543229 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543130  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543129 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543443 - 24543200
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543443 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543344  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543343 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543244  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543243 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543557 - 24543314
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543557 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543458  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543457 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543358  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543357 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543671 - 24543428
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543671 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543572  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543571 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543472  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543471 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543785 - 24543542
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543785 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543686  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543685 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543586  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543585 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24543899 - 24543656
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24543899 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543800  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543799 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543700  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543699 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544013 - 24543770
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544013 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543914  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24543913 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543814  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543813 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544127 - 24543884
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544127 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544028  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24544027 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543928  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24543927 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544241 - 24543998
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544241 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544142  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24544141 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544042  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24544041 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544355 - 24544112
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544355 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544256  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24544255 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544156  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24544155 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544469 - 24544226
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544469 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544370  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24544369 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544270  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24544269 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544583 - 24544340
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544583 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544484  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24544483 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544384  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24544383 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 389 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24544697 - 24544454
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24544697 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544598  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24544597 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544498  T
Q  587 ggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24544497 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Original strand, 44317626 - 44317780
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44317626 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacc 44317725  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317726 cgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44317780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 389 - 536
Target Start/End: Original strand, 40567144 - 40567293
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaa 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40567144 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 40567243  T
Q  487 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40567244 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40567293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 500 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 49001576 - 49001410
Alignment:
Q  500 aattataggtctattttgcgaga--ttttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcga 596  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  49001576 aattataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggttt-agttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccga 49001478  T
Q  597 aaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttt 664  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49001477 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaatttt 49001410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 9247020 - 9246834
Alignment:
Q  476 cccacccgaaaatttaaataattca--attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgc 573  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | | ||| |||||| | |    
T  9247020 cccacccgaaaaattaaaaaattaaggattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcac 9246921  T
Q  574 aaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9246920 aaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttttcaacggtta 9246834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 503 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 32540684 - 32540532
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaat 601  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||| ||||  || |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32540684 tataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaat 32540585  T
Q  602 ttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaac 654  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  32540584 ttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaaattttcaac 32540532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 531 - 677
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343229
Alignment:
Q  531 aattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  630 aagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
      ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 37343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 388 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 9246994 - 9246844
Alignment:
Q  388 gattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aa 485  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||   |||| |||||||||||||||| || ||    
T  9246994 gattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcgaaa 9246895  T
Q  486 aatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  9246894 aatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttt 9246844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 501 - 672
Target Start/End: Original strand, 44317632 - 44317803
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||   ||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||    
T  44317632 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 44317730  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44317731 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttttcaatagttaattttagtggccc 44317803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 32540690 - 32540541
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaat-tcctgcaaatggtgtagtggcccacccg 483  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |||   || ||||||| |||||||||||    
T  32540690 aacgactataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccg 32540591  T
Q  484 -aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaa 532  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  32540590 aaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaa 32540541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 536
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343201
Alignment:
Q  419 aattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctatttt 516  Q
    |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  517 gcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttt 37343201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Original strand, 21852062 - 21852215
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||  ||| | ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||    
T  21852062 aacgatgataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccg 21852161  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  21852162 aaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 21852215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 504 - 655
Target Start/End: Original strand, 21852069 - 21852221
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactc-gaaaaatt 602  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||| |||||   | |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  21852069 ataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 21852168  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21852169 taaattattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaacg 21852221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 508 - 659
Target Start/End: Original strand, 46601074 - 46601226
Alignment:
Q  508 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactc-gaaaaatttaaa 606  Q
    |||||||||| || |  |||||||| ||| |||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  46601074 gtctattttgtgaaagattatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaa 46601173  T
Q  607 taatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  46601174 taattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaattttttaaccgtta 46601226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 389 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 49001575 - 49001425
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaaga--ttttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaa 485  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||| | |||||| || |||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  49001575 attataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccgaa 49001477  T
Q  486 aa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49001476 aaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttt 49001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 29056029 - 29055886
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||  | ||||||||| ||| |||||  ||| || | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||     
T  29056029 aacgattattgatttattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaacca 29055931  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 527  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29055930 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagacttta 29055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 555 - 659
Target Start/End: Original strand, 25030371 - 25030476
Alignment:
Q  555 agttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaa 653  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||   || ||||||| ||||||| ||    
T  25030371 agttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttggaagactttaaataattttttaa 25030470  T
Q  654 cggtta 659  Q
    ||||||    
T  25030471 cggtta 25030476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 452 - 536
Target Start/End: Original strand, 46601130 - 46601216
Alignment:
Q  452 aaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46601130 aaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaatttt 46601216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17880021 - 17879973
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgg 369  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17880021 ggcaggggcagagcccttcatgggctggggtgggtcacggcccacccgg 17879973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 365
Target Start/End: Original strand, 37343027 - 37343067
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37343027 gtggcggagcccttcatgggctggggtcggccacggcccac 37343067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 46224918 - 46224874
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46224918 agtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacggtccacccg 46224874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 537
Target Start/End: Original strand, 45807075 - 45807113
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45807075 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 45807113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48548079 - 48548045
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48548079 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 48548045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Original strand, 45836854 - 45836887
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836854 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 45836887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10577850 - 10577818
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10577850 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 10577818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 25934572 - 25934604
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25934572 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 25934604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 29056015 - 29055884
Alignment:
Q  511 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataa 609  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||  |||| | | ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||||    
T  29056015 tattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataa 29055917  T
Q  610 tttaattataagtctattttaagaggctttaaa 642  Q
    || ||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  29055916 ttcaattataggtctattttgcgagactttaaa 29055884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38078771 - 38078739
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38078771 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 38078739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43532514 - 43532470
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgg 369  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43532514 gtggcggagccctccatgggttggggtgggccacggcccatccgg 43532470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1243710 - 1243675
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1243710 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatt 1243675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Original strand, 25030372 - 25030447
Alignment:
Q  444 gttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 517  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25030372 gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttg 25030447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17831643 - 17831605
Alignment:
Q  281 gacctatgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17831643 gacctatgaagcacggatacagacacagacaccggatac 17831605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24334812 - 24334778
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24334812 acctatgaagcatggatacggacacggacaccgga 24334778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 398881 - 398848
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  398881 cctatgaagcacggatacggacgcggacaccgga 398848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9247058 - 9247013
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9247058 cagtggtggagcccttcatgggctgaggtgggccacaacccacccg 9247013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 9773868 - 9773795
Alignment:
Q  518 cgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcca 591  Q
    |||||||||| |||||| | ||  |||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  9773868 cgagattttaaacaattgtgtgatagttttaattttctgctgatctaaatcctcgcaaagtgatgtagtggcca 9773795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Original strand, 51409981 - 51410009
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51409981 ctatgaagcacggatacggacacggacac 51410009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24797213 - 24796857
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797213 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 24797114  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24797113 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatataatttgcgag 24797014  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  24797013 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattaccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24796914  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  24796913 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 24796857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 41838114 - 41837768
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41838114 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccgcccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 41838015  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41838014 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgggag 41837915  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  41837914 attttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 41837815  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41837814 gtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 41837768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 326 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5590330 - 5589977
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5590330 tggcggagcccttaatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttg 5590231  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590230 tgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 5590131  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  5590130 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 5590031  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || |||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  5590030 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtggcccaccct 5589977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 653
Target Start/End: Original strand, 7012337 - 7012669
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||             |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  7012337 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggctcactcggaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgcgatatcttatgcaatt 7012436  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7012437 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccctaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 7012536  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  7012537 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggagtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 7012636  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaa 653  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7012637 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaa 7012669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 28564944 - 28565240
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28564944 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 28565043  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28565044 cgaaaatttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 28565143  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  28565144 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 28565240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 28572567 - 28572863
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28572567 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 28572666  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28572667 cgaaaatttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 28572766  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  28572767 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 28572863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 42556193 - 42555897
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42556193 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccacc 42556094  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  42556093 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaatttggt 42555994  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||    
T  42555993 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttaatagcccaccct 42555897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 321 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3886942 - 3886584
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3886942 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtaggccacggttcacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 3886843  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886842 ttttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaaccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 3886743  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3886742 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatcccaattcccgcaaattggtgtactgacccacccgaaaaatttaaataatttaattat 3886643  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  3886642 aggtctaatttgtgagactttaaacaattttttaaaagttaattttagtggcccaccct 3886584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 22658446 - 22658162
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22658446 tcaacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 22658347  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||| |||| ||||    
T  22658346 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccacaaattggt 22658247  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22658246 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 22658162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 36060417 - 36060713
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  36060417 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattcctggaaagtggtgtagtggcacacc 36060516  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36060517 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 36060616  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  36060617 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccct 36060713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3659982 - 3659636
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||             |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3659982 cagtggcggagcccttcatgggctgggatgggccacagcccacccggaaaaattataaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 3659883  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3659882 ttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccggaaatttaaataattcaattataggtctgttttgcgag 3659783  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  3659782 attttatacaattttatatcggttttaggtttcggttgatcaaaatttccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 3659683  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3659682 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 3659636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 1098057 - 1098413
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  1098057 cagtggcggagcccttcatggcgtgaggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaatt 1098156  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1098157 ttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcctataaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 1098256  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||     
T  1098257 attttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatag 1098356  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  1098357 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 1098413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 4231220 - 4231565
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4231220 cagtggcggaccccttcatgggctagggtgggccacggcccacccg-aaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaatt 4231318  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4231319 ttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 4231418  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||     
T  4231419 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgccccatccgaaaaatttaaataattcaattatag 4231518  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  4231519 gtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagt 4231565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 7242734 - 7242439
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7242734 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtatagtggcccacc 7242635  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7242634 cgaaa-tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 7242536  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  7242535 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 7242439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 324 - 677
Target Start/End: Original strand, 6316877 - 6317232
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 423  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6316877 agtggcggagcctttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgtgagattttatgcaattt 6316976  T
Q  424 tgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6316977 tgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagttttattttgcgaga 6317076  T
Q  523 ttttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataag 621  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |    
T  6317077 atttatacaattttatgtcgattttaggtttcggatgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaagg 6317176  T
Q  622 tctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||    
T  6317177 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttacttttagtggcccaccct 6317232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 383 - 672
Target Start/End: Original strand, 21434899 - 21435190
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21434899 tcaacgattataggtttattttgcgaggttttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccact 21434998  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21434999 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 21435098  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  21435099 gtagtggcccacccaaaaagtttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 21435190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 389 - 677
Target Start/End: Original strand, 4697872 - 4698162
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4697872 attataggtttactttacaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaa 4697971  T
Q  488 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4697972 tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtg 4698071  T
Q  588 gc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  4698072 gctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 4698162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 2317121 - 2317417
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  2317121 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtaatggcccacc 2317220  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2317221 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 2317320  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  2317321 gtagtggttcacccgaaaaatttaaataattcagttatagatctagtttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 2317417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 324 - 672
Target Start/End: Original strand, 1183823 - 1184173
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1183823 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaacaaaaaaaattaaaaaataaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattt 1183922  T
Q  424 tgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1183923 tgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgtagtggaccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaga 1184022  T
Q  523 ttttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataag 621  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||      
T  1184023 ttttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataga 1184122  T
Q  622 tctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1184123 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 1184173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 43117408 - 43117695
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  43117408 tcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatc 43117507  T
Q  482 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  43117508 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 43117607  T
Q  581 tgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  43117608 tttagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagt 43117695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 384 - 667
Target Start/End: Original strand, 10092315 - 10092600
Alignment:
Q  384 caacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccaccc 482  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10092315 caacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccaccc 10092414  T
Q  483 gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||     
T  10092415 gaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggtagatccaaattcccgcaaattggta 10092514  T
Q  583 tagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10092515 tagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 10092600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 41388065 - 41388351
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  41388065 tcaactattataggtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc 41388164  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41388165 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggt 41388264  T
Q  582 gtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  41388265 gtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatagttaattttagt 41388351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Original strand, 7413091 - 7413375
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7413091 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc 7413190  T
Q  482 c-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  7413191 caaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattccctcaaagtgg 7413289  T
Q  581 tgtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7413290 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaatttta 7413375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 323 - 590
Target Start/End: Original strand, 38567127 - 38567397
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctgggg-tgggccacggcccaccc-ggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||             ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38567127 cagtggcggagcccttcatgggctgggggtgggccacggcccacccaggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaa 38567226  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38567227 ttttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcgattataggtctattttgcg 38567326  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc 590  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38567327 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcc 38567397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 7422148 - 7421872
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||    
T  7422148 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgtagtgacccacc 7422049  T
Q  482 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||      |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7422048 cgaaaaatttaaata-ttcaattataggtctattttgcgagattttataaaattttatatcagt------tttcggttaatctaaattcccgcaaagtgg 7421956  T
Q  581 tgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttt 664  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7421955 tgtagtgatccac-ccaaaaatttaaacaattcaattatatgtctattttgcaagactttaaacaatttttcaacggataatttt 7421872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Original strand, 9830607 - 9830821
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  9830607 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaact 9830706  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  9830707 ttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaatttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaa 9830806  T
Q  522 attttatacaatttt 536  Q
    | |||| ||||||||    
T  9830807 actttaaacaatttt 9830821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 611
Target Start/End: Original strand, 41169764 - 41169987
Alignment:
Q  390 ttataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa- 487  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||   |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||| || ||||     
T  41169764 ttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaa 41169863  T
Q  488 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41169864 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtg 41169963  T
Q  588 g-ccactcgaaaaatttaaataatt 611  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  41169964 gcccactcg-aaaatttaaataatt 41169987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Original strand, 197268 - 197435
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||| |||  | ||||    
T  197268 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 197367  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  197368 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 197435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Original strand, 312105 - 312272
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||| |||  | ||||    
T  312105 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 312204  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  312205 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 312272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642667
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatt 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaatttttaaacggtta 25642667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 532
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108979
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tt 489  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  490 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaa 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaa 36108979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 386 - 536
Target Start/End: Original strand, 197265 - 197417
Alignment:
Q  386 acgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggccca-cccg 483  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||      
T  197265 acgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaa 197364  T
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  197365 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 197417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 386 - 536
Target Start/End: Original strand, 312102 - 312254
Alignment:
Q  386 acgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggccca-cccg 483  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||      
T  312102 acgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaa 312201  T
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  312202 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 312254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 504 - 655
Target Start/End: Original strand, 11635828 - 11635980
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatt 602  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  11635828 ataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatt 11635927  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  11635928 taaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaacg 11635980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Original strand, 9830673 - 9830839
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  9830673 attataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaa 9830772  T
Q  601 tttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9830773 tttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaacagttaattttagt 9830839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 504 - 657
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108991
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatt 602  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggt 657  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaaattttcaacggt 36108991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Original strand, 8996417 - 8996561
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatggtgtagtggcccacccg-aaaattt 490  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||  | | | ||| |||||||    
T  8996417 ataggtttattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat-aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaattt 8996515  T
Q  491 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8996516 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 8996561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Original strand, 11635758 - 11635974
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||               |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  11635758 cagtggcggagcccttcatgggctagggtgggccacgacccacccgaaaaaattaaataaatcaatgatcataggtctattttgcgaaattttatataat 11635857  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11635858 tttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtg 11635957  T
Q  520 agattttatacaatttt 536  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  11635958 agactttaaacaatttt 11635974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 503 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25383129 - 25382973
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactc-gaaaaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||  || |||||||    
T  25383129 tataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaat 25383031  T
Q  602 ttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25383030 ttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttttcaacggtta 25382973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642677
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatt 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  490 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaatttt 25642677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 392 - 522
Target Start/End: Original strand, 8995039 - 8995171
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tt 489  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| |||| ||    
T  8995039 ataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatt 8995138  T
Q  490 taaataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995139 taaataattcaattataggtctattttgcgaga 8995171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 389 - 500
Target Start/End: Original strand, 41169877 - 41169989
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41169877 attataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 41169976  T
Q  488 tttaaataattca 500  Q
    |||||||||||||    
T  41169977 tttaaataattca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 522
Target Start/End: Original strand, 17836498 - 17836628
Alignment:
Q  394 aggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-ttta 491  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  17836498 aggtgtattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaattta 17836597  T
Q  492 aataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17836598 aataatttaattataggtctattttacgaga 17836628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 651
Target Start/End: Original strand, 17836498 - 17836644
Alignment:
Q  506 aggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactc-gaaaaattta 604  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| || || | |||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  17836498 aggtgtattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaattta 17836597  T
Q  605 aataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttc 651  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  17836598 aataatttaattataggtctattttacgagacaataaacaatttttc 17836644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 32018069 - 32017911
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||     
T  32018069 attataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcgaaat 32017970  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtt 658  Q
     ||| || |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32017969 tttttaacaattcaattataggtctattataaaagactttaaacaatttttcaacggtt 32017911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 25383135 - 25382983
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  25383135 aacgactataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccg 25383037  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25383036 aaaaatttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttt 25382983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 500 - 629
Target Start/End: Original strand, 4697871 - 4698000
Alignment:
Q  500 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||    
T  4697871 aattataggtttactttacaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaa 4697970  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  4697971 atttaaataattcaattatagatctatttt 4698000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 502 - 629
Target Start/End: Original strand, 41169764 - 41169892
Alignment:
Q  502 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaa-a 600  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |    
T  41169764 ttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaa 41169863  T
Q  601 tttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41169864 tttaaataattcaattataggtctatttt 41169892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 38567195 - 38567323
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaa 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  38567195 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccgaaaa 38567294  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
     |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  38567295 -tttaaataattcgattataggtctatttt 38567323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 504 - 654
Target Start/End: Original strand, 8995039 - 8995190
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatt 602  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||| | ||||    ||||| |||||| | ||||||| |||||||||| || | |||||||    
T  8995039 ataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatt 8995138  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaac 654  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||| | ||||||||||||    
T  8995139 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttgagcaatttttcaac 8995190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 589 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34934376 - 34934298
Alignment:
Q  589 ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34934376 ccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 34934298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 652
Target Start/End: Original strand, 43073117 - 43073250
Alignment:
Q  519 gagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaatta 617  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| | | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||| || |||||    
T  43073117 gagattttaaacaattttatttcagttttaagtttcaggcgatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccg-aaaatttaaatatttaaatta 43073215  T
Q  618 taagtctattttaagaggctttaaacaatttttca 652  Q
    || |||||||||   |  |||||||||||||||||    
T  43073216 taggtctattttgcaaaactttaaacaatttttca 43073250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34934415 - 34934370
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34934415 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 34934370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 652
Target Start/End: Original strand, 8996417 - 8996564
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggccactcgaaaaatt 602  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || |||    ||| ||||||||  ||| |  |||||||||    
T  8996417 ataggtttattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatt 8996514  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttca 652  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  8996515 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttttca 8996564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 536
Target Start/End: Original strand, 43073157 - 43073247
Alignment:
Q  447 gatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  43073157 gatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaatttaaatatttaaattataggtctattttgcaaaactttaaacaatttt 43073247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 34934379 - 34934316
Alignment:
Q  474 ggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  34934379 ggcccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 34934316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 32018073 - 32017942
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||| |||  ||    
T  32018073 aacgattataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcg 32017974  T
Q  484 aaa-atttaaataattcaattataggtctatt 514  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  32017973 aaattttttaacaattcaattataggtctatt 32017942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 358
Target Start/End: Original strand, 10092255 - 10092292
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccac 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10092255 ggcagtgacggagcccttcatgggctggggtgggccac 10092292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3951644 - 3951609
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3951644 ctatgaagcacggatacggacacggacaccagatac 3951609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20785574 - 20785544
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20785574 ctatgaagcacggatacggacacggacaccg 20785544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24413675 - 24413646
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacacc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24413675 ctatgaagcacggatacggacacggacacc 24413646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36450852 - 36450823
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36450852 cctatgaagcacggatacggacacggacac 36450823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5137518 - 5137490
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137518 ctatgaagcacggatacggacacggacac 5137490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26149526 - 26149486
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatg 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26149526 caattataggtttattttgcgagattttaaacaattatatg 26149486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43737928 - 43737896
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43737928 ctatgaagcacggatacagacacggacaccgga 43737896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 79)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 6755828 - 6756183
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6755828 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 6755927  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6755928 ttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 6756027  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaatttaaataatttaattataag 621  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  6756028 attttatactattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccacccgaaaaatttaaatgattcaattatagg 6756127  T
Q  622 tctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | || |||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  6756128 tttaatttgcgagactttaaacaattttttaattgttaattttagtggcccaccct 6756183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 11651125 - 11650779
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11651125 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccgcccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 11651026  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11651025 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgggag 11650926  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  11650925 attttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 11650826  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11650825 gtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 11650779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 13233229 - 13233585
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  13233229 cagtggcggagtccttcataggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgatattttatgcaatt 13233328  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233329 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 13233428  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  13233429 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatcggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 13233528  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     |||| |||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||    
T  13233529 atctaatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccct 13233585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 321 - 667
Target Start/End: Original strand, 18491184 - 18491532
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  18491184 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccactcggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgtaa 18491283  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18491284 ttttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgccccacccgaaaatttaaataatttaactataggtctattttgcg 18491383  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18491384 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattat 18491483  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  18491484 aagtctaatttgcgagactttaaacaatgtttcaatagttaattttagt 18491532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 322 - 667
Target Start/End: Original strand, 36584422 - 36584768
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36584422 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaa-tcaataattataggtatattttgcgagattttatgcaat 36584520  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36584521 tttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 36584620  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  36584621 gattttatacaattttatgtcggttttaagttttagttgatccaaattcccgctaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaatatttcaattata 36584720  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36584721 ggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 36584768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 324 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44745748 - 44745403
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 423  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44745748 agtggcggagcctttaatgggctggggtgggccacggcccatccagaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 44745649  T
Q  424 tgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaga 522  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44745648 tgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattgtaggtctattttgcgaga 44745549  T
Q  523 ttttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataag 621  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||      
T  44745548 ttttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccactcaaaaaatttaaataattcaattataga 44745449  T
Q  622 tctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  44745448 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttagt 44745403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 321 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 38141719 - 38141370
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgca 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38141719 ggcactggcggagcccttcatgggctggggagggccacggcccacccggaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgca 38141620  T
Q  420 attttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 518  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38141619 attttgtatcaattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgt 38141520  T
Q  519 gagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaatta 617  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  38141519 gagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaaccgaaaaatttaaataattcaatta 38141420  T
Q  618 taagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || ||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  38141419 taggtctaatttgcgatactttaaataatttttcaatagttaattttagt 38141370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 321 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40228592 - 40228243
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40228592 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaatttaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgca 40228493  T
Q  420 attttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 518  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40228492 attttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattgtaggtctatttggc 40228393  T
Q  519 gagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaatta 617  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40228392 gagattttatacgattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgttgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaatta 40228293  T
Q  618 taagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    || ||||| |||  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40228292 taggtctaatttgcgagtatttaaacaatttttcaatagttaattttagt 40228243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 16925106 - 16925461
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  16925106 cagtggcggagcccttcatgggc-ggggtgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagactttatgcaatt 16925204  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16925205 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 16925304  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  16925305 attttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 16925404  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  16925405 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 16925461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 323 - 665
Target Start/End: Original strand, 44134493 - 44134836
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44134493 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaatt 44134592  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44134593 tt-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 44134691  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  44134692 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattatag 44134791  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44134792 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 44134836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31664322 - 31663970
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||    
T  31664322 cagtggcggagcccttcatgggatggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattataggt----tttgcgagattttatgcaatt 31664227  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31664226 ttgagtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaag 31664127  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  31664126 attttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 31664027  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  31664026 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 31663970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 383 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 36955109 - 36954818
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36955109 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 36955010  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  36955009 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttacgtttcggttgatccaaatccccgcaaattggt 36954910  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  36954909 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagaatttaaacaatttttcaatagttaatattagtggccc 36954818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 325 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 2655067 - 2654718
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2655067 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctagtttgcgagattttatgcaatttt 2654968  T
Q  425 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  2654967 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccatccgaaaatttaaatagttcaattataggtctattttatgagat 2654868  T
Q  524 tttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagt 622  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2654867 tttatacaattttacgtcggttttagatttcggttgatcccaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 2654768  T
Q  623 ctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2654767 ctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 2654718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31581909 - 31581553
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |              ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31581909 cagtggcgaagcccttcatgggctggggtgggccacggtccaccccgaaaaattaaaaaaacaacgattataggtctattttgctagattttatgcaatt 31581810  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581809 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtagtgtaatggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 31581710  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||| | |||||||     
T  31581709 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtactggctcatccgaaaaatttaaataactcaattatag 31581610  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  31581609 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 31581553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 54795828 - 54795532
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54795828 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc 54795729  T
Q  482 c-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  54795728 caaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 54795630  T
Q  581 tgtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54795629 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 54795532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12700667 - 12700371
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12700667 tcaacgattataggtttattttgcgagactttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 12700568  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12700567 cgaaaatttaaatagttaaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 12700468  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  12700467 gtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 12700371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 332 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13613241 - 13612895
Alignment:
Q  332 agcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcgg 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  13613241 agcccttcatgggctggg-tgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgg 13613143  T
Q  432 ttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatac 530  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13613142 ttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacccaaaaatttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatac 13613043  T
Q  531 aattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||    
T  13613042 aattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaattt 13612943  T
Q  630 aagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||    
T  13612942 acgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccct 13612895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 385 - 672
Target Start/End: Original strand, 41832437 - 41832727
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  41832437 aacgattatatgtctattttgcaagattttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccca 41832536  T
Q  484 aaaattt-aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtg 582  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||| |||||    
T  41832537 aaacttttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattctcgcaaattggtg 41832636  T
Q  583 tagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  41832637 tagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggccc 41832727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19653803 - 19653458
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |             |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19653803 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacaccgaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgttagattttatgcaatt 19653704  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctg-caaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19653703 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaaatagtgtaatggcccacttgaaaatttaaataattcaattataggtcta-tttgtgag 19653605  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  19653604 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataactcaattataa 19653505  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19653504 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 19653458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 27270353 - 27270698
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27270353 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacagcccacccggaaaattaaaaaa-tcaatgattataagtctattttgcgagattttatacaatt 27270451  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27270452 ttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattcccgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatagatctatttt-cga 27270550  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  27270551 gattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattata 27270650  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27270651 ggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 27270698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Original strand, 43564417 - 43564763
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||             |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43564417 cagtggcggagctcttcattggctggggtgggccacagtccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaatt 43564516  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43564517 ttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtgccccatccaaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgag 43564616  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  43564617 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 43564716  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  43564717 gtctaatttgcgagagtttaaacaatttttcaatagttgattttagt 43564763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 383 - 672
Target Start/End: Original strand, 50767093 - 50767384
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  50767093 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccacc 50767192  T
Q  482 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtgg 580  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  50767193 caaaaaatttaattaattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 50767291  T
Q  581 tgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    |||||| | ||||   ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50767292 tgtagtagtccaccaaaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttacgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggccc 50767384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 383 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 10096555 - 10096267
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   |    
T  10096555 tcaacgattataggttcattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtgtccattc 10096456  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  10096455 aaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaaattcctgcaaaatggt 10096356  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagc 670  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10096355 gtagtggcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttctaaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagc 10096267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 52581455 - 52581812
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnn-tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||              |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  52581455 cagtggcggagcccttcatgggctggg-tgggccacggcccatccggaaaaataaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaatattttatggagt 52581553  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  52581554 tttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcgcccatccaaaaatttaaataattcaattatatgtttattttacga 52581653  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg--ccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||| || |||| |||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  52581654 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtagatccaaatttccacaaattggtgtagtggtcccacccaaaaaatttaaataattcaattat 52581753  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  52581754 aggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 52581812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 22647110 - 22647466
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctatttt-gcaagattttatgcaat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |             ||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  22647110 cagtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccatccagaaaaataaaaaaatcaacgactataggtttttttttgcgagattttatgcaat 22647209  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22647210 tttgtgtcg-ttttatatttttgttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 22647308  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  22647309 gattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataattcaattata 22647408  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     ||||| |||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||    
T  22647409 tgtctaatttgtgagactttaaacaattttttaatggttaatttcagtggcccaccct 22647466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 384 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 4632803 - 4632512
Alignment:
Q  384 caacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccaccc 482  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  4632803 caacgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacgc 4632704  T
Q  483 gaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  4632703 gaaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattatatacaattttgtgtcgattttaggattcggttgatctaaatttccgccaagtggt 4632604  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4632603 gtagtggaccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgagagaatttaaacaatttttcaacggttaattttagtggccc 4632512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 323 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 44817708 - 44817441
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  44817708 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgaaattttatgcaatt 44817609  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  44817608 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaata-ttcaattataggtctattctgcgag 44817510  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44817509 attttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcc 44817441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 383 - 533
Target Start/End: Original strand, 45670019 - 45670170
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45670019 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 45670118  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaat 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45670119 cgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaat 45670170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 323 - 517
Target Start/End: Original strand, 51001475 - 51001670
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51001475 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgtttataagtctattttgcaatattttatacaatt 51001574  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttg 517  Q
    || | ||  ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51001575 ttatgtcttttttaggtttcggttgatcc-aattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 51001670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 536
Target Start/End: Original strand, 13857680 - 13857826
Alignment:
Q  392 ataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tt 489  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13857680 ataggtgtattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 13857779  T
Q  490 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13857780 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13857826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 397 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638702
Alignment:
Q  397 tctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaata 495  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaattttaata 7638743  T
Q  496 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7638742 attccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7638702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 502 - 677
Target Start/End: Original strand, 51001542 - 51001717
Alignment:
Q  502 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaa 600  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  51001542 ttataagtctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatc-caattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaa 51001640  T
Q  601 tttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||   |  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  51001641 tttaaataattcaattataggtctaatttgtaaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 51001717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 536
Target Start/End: Original strand, 13869211 - 13869356
Alignment:
Q  393 taggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-ttt 490  Q
    |||||||||||||  |||||||||   ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  13869211 taggtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaattt 13869310  T
Q  491 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13869311 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13869356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Original strand, 13857680 - 13857836
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatt 602  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13857680 ataggtgtattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 13857779  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  13857780 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttcagcggtta 13857836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 508 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 36801947 - 36801795
Alignment:
Q  508 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaa 606  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  36801947 gtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttata 36801848  T
Q  607 taatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36801847 taattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttttcaatggtta 36801795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 509 - 659
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394047
Alignment:
Q  509 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaat 607  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  608 aatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    || | |||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  10393996 aactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttttcaacggtta 10394047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 505 - 659
Target Start/End: Original strand, 13869211 - 13869366
Alignment:
Q  505 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaattt 603  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||| | |||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  13869211 taggtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaattt 13869310  T
Q  604 aaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  13869311 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttcaacggtta 13869366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 385 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 36801958 - 36801805
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctg-caaatggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  36801958 aacgatcataagtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccg 36801859  T
Q  484 -aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  36801858 aaaaatttatataattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttt 36801805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 45670025 - 45670153
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| || |||    
T  45670025 attataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 45670123  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45670124 atttaaataattcaattatatgtctatttt 45670153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 509 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638696
Alignment:
Q  509 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaattttaat 7638744  T
Q  608 aatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    ||||  |||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  7638743 aattccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacg 7638696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 520
Target Start/End: Original strand, 18707738 - 18707879
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt----ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggccca 479  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||| |||||   | |||| || | ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  18707738 aacgattataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgccca 18707837  T
Q  480 cccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18707838 cccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga 18707879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 44817640 - 44817517
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaatt 602  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  44817640 tataggtctatttttcgaaattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatt 44817541  T
Q  603 taaataatttaattataagtctatt 627  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  44817540 taaat-attcaattataggtctatt 44817517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 462 - 536
Target Start/End: Original strand, 7776908 - 7776983
Alignment:
Q  462 aaatggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7776908 aaatggtgtagtgtcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 655
Target Start/End: Original strand, 18735245 - 18735403
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaatt----ttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggccactcg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||| ||   | ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||    
T  18735245 attataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtccacccg 18735344  T
Q  596 aaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||    
T  18735345 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgtga-tctttaaacaatgtttcaacg 18735403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Original strand, 5734195 - 5734260
Alignment:
Q  594 cgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5734195 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaacggtta 5734260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 536
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394037
Alignment:
Q  397 tctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaat 494  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |  |||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  495 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    || ||||||||| |||||| ||| |||| | || ||||||||    
T  10393996 aactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttt 10394037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 513 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653057
Alignment:
Q  513 ttttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaaatttaaataatt 611  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||  | | ||| ||||| |   |||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  612 taattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    |||||||| || ||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaattttttaatggtaaattttagtggccc 26653057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 9046131 - 9046036
Alignment:
Q  558 tgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaa 653  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  9046131 tgatccaaatttccacaaagtggtatagtggcccaccaaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttttcaa 9046036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 659
Target Start/End: Original strand, 133416 - 133574
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaa 600  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||   | |||||    
T  133416 attataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaaaa 133515  T
Q  601 tttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
     || ||||||| ||| |||  ||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||    
T  133516 atttaataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataattttacaatggtta 133574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 655
Target Start/End: Original strand, 18668994 - 18669152
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaatt----ttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcg 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||   | ||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||| | |||| ||    
T  18668994 attataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccg 18669093  T
Q  596 aaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  18669094 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaacg 18669152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 517
Target Start/End: Original strand, 18735241 - 18735379
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt----ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggccca 479  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||| |||||   | |||| |||| ||| ||||| |  |||| ||||||||| | |||    
T  18735241 aacgattataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtcca 18735340  T
Q  480 cccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttg 517  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18735341 cccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttg 18735379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653080
Alignment:
Q  401 ttttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataatt 498  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||| ||||  || ||||||| |||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
     |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaatttt 26653080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 537
Target Start/End: Original strand, 133414 - 133565
Alignment:
Q  387 cgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaa 485  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| | ||||||| |||| |  || || ||||||  ||||| |||| ||||||||||||  ||    
T  133414 cgattataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaa 133513  T
Q  486 aatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  133514 aaatttaataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttta 133565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 655
Target Start/End: Original strand, 7776930 - 7776989
Alignment:
Q  596 aaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  7776930 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacg 7776989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 655
Target Start/End: Original strand, 18707742 - 18707900
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaatt----ttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcg 595  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    || |||| ||   | ||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||    
T  18707742 attataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccg 18707841  T
Q  596 aaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  18707842 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaacg 18707900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 550 - 655
Target Start/End: Original strand, 18715047 - 18715152
Alignment:
Q  550 gtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaattt 648  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  18715047 gtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataagtctattttgcga-tctttaaacaattt 18715145  T
Q  649 ttcaacg 655  Q
    |||||||    
T  18715146 ttcaacg 18715152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 520
Target Start/End: Original strand, 18668990 - 18669131
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt----ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggccca 479  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    |||| |||||   | |||| |||| ||| ||||| |  |||| | ||||||| | |||    
T  18668990 aacgattataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtcca 18669089  T
Q  480 cccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18669090 cccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga 18669131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 677
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670240
Alignment:
Q  605 aataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 45670240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 465 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 9046111 - 9046060
Alignment:
Q  465 tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 516  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9046111 tggtatagtggcccaccaaaaaatttaaataattcaattatatgtctatttt 9046060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 365
Target Start/End: Original strand, 13857612 - 13857654
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13857612 cagtggcgaagcccttcatgggctagggtgggccacggcccac 13857654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 319
Target Start/End: Original strand, 5111587 - 5111624
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccggatac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5111587 acctatgaagcacggatacgggcacggacaccggatac 5111624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 5734198 - 5734235
Alignment:
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5734198 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 5734235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Original strand, 13869142 - 13869183
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13869142 cagtggcggagcccttcatgggttagggtgggccacggccca 13869183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36955169 - 36955136
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36955169 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 36955136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 9046174 - 9046134
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtc 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9046174 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtc 9046134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9046178 - 9046131
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggt 432  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  9046178 aacgattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggt 9046131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22234985 - 22234954
Alignment:
Q  281 gacctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234985 gacctatgaagcacggatacggacacggacac 22234954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 520
Target Start/End: Original strand, 18715077 - 18715131
Alignment:
Q  467 gtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18715077 gtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataagtctattttgcga 18715131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23293103 - 23293069
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23293103 acctatgaagcacagatacggacacggacaccgga 23293069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 318
Target Start/End: Original strand, 28470341 - 28470375
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccggata 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28470341 ctatgaagcacggatacggatacggacaccggata 28470375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Original strand, 37203220 - 37203254
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37203220 acctatgaagcacggatatggacacggacaccgga 37203254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Original strand, 4157102 - 4157131
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacacc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4157102 ctatgaagcacggatacggacacggacacc 4157131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 11975819 - 11975782
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11975819 caattataggtctattctgcgagattttaaacaatttt 11975782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 534
Target Start/End: Original strand, 18714845 - 18714878
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaatt 534  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18714845 attataggtctactttgcgagattttatacaatt 18714878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 313
Target Start/End: Original strand, 20633429 - 20633458
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacacc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20633429 ctatgaagcacggatacggacacggacacc 20633458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 536
Target Start/End: Original strand, 2763032 - 2763068
Alignment:
Q  500 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2763032 aattatatgtctattttgagagattttatacaatttt 2763068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11110786 - 11110754
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11110786 ctatgaagcacggataccgacacggacaccgga 11110754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 536
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670212
Alignment:
Q  492 aataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttt 45670212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46084081 - 46084049
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46084081 ctatgaagcatggatacggacacggacaccgga 46084049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 323 - 664
Target Start/End: Original strand, 38527173 - 38527515
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38527173 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaatt 38527272  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38527273 ttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagcccacccgaaaatttaaataattcaattataggt-tattttgcgag 38527371  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||     
T  38527372 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataatttatttatag 38527471  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttt 664  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38527472 gtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaatttt 38527515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 322 - 677
Target Start/End: Original strand, 23869661 - 23870018
Alignment:
Q  322 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaat 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23869661 gcagtggcggagccctccatgggctggggtgggccacggcccaccccgaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaat 23869760  T
Q  422 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23869761 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtagtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtatattttgcga 23869860  T
Q  521 gattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  23869861 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatg 23869960  T
Q  620 agtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  23869961 aatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 23870018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 321 - 665
Target Start/End: Original strand, 2249578 - 2249924
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2249578 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacgacccacccgaaaaaattaaaaaatcaatgattatagatctattttgcgagattttatgcaa 2249677  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2249678 ttttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 2249777  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2249778 agattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 2249877  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    | ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2249878 aggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 2249924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 325 - 677
Target Start/End: Original strand, 34983277 - 34983631
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34983277 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattgaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 34983376  T
Q  425 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34983377 gtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 34983476  T
Q  524 tttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaataatttaattataagt 622  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34983477 tttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtagtgacccacccaaaaaatttaaataattcaattataggt 34983576  T
Q  623 ctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||    
T  34983577 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttttgtggcccaccct 34983631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36436341 - 36435985
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  36436341 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccaaaaaaattaaaaaattaacgattataagtctattttgcgatattttatgcaatt 36436242  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436241 ttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36436142  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  36436141 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 36436042  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  36436041 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 36435985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 385 - 672
Target Start/End: Original strand, 26293221 - 26293510
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26293221 aacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 26293320  T
Q  484 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26293321 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgt 26293420  T
Q  584 agtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  26293421 agtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 26293510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 323 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44545888 - 44545542
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  44545888 cagtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacggtccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatacaatt 44545789  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44545788 ttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtaatggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 44545689  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  44545688 attttatacaattttatgttggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatag 44545589  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44545588 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 44545542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 12995025 - 12995321
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12995025 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgtagtggcccacc 12995124  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  12995125 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtaagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttccgcaaattggt 12995224  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  12995225 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 12995321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 11764853 - 11765139
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  11764853 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaca 11764952  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  11764953 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcagctgatccaaattcccgcaaattggt 11765052  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11765053 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 11765139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 6750165 - 6749809
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  6750165 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctatttattgagattttatgcaatt 6750066  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6750065 ttgtgttggttttatgttttgattgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgat 6749966  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  6749965 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 6749866  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  6749865 gtctaatttgcgagactttaaacagtttttcaatagttaattttagtggcccaccct 6749809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Original strand, 7366150 - 7366506
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||              ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7366150 cagtggcggagccttttatgggctgaggtgggccacggcccatccgaaaaaataaaaaaatcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaatt 7366249  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7366250 ttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatacatctattttgcgag 7366349  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  7366350 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattatag 7366449  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  7366450 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccct 7366506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 13616122 - 13615778
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13616122 cagtggcggagtctttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 13616023  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13616022 ttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgag 13615923  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  13615922 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattatag 13615823  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    ||||| ||   |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13615822 gtctaattcgcgagattttaaacaatttttcaatagttaatttta 13615778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1021229 - 1020871
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc-acccg-gnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |             ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1021229 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccccacccgagaaaaattaaaaaatcaattattataggtctattttgcgagattttatacaa 1021130  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1021129 ttttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgag 1021030  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  1021029 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccatccgaaaaatttaaataattcaattat 1020930  T
Q  619 aagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    | ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  1020929 aggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 1020871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1115197 - 1114841
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||             ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1115197 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggtccactcggaaaaattaaaaaatcaattattataggtctattttgcgagattttatacaatt 1115098  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1115097 ttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgag 1114998  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||     
T  1114997 attttatacaattttatgttgattttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcctacccgaaaaatttaaataattcaattatag 1114898  T
Q  621 gtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
     |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  1114897 atctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 1114841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Original strand, 16194311 - 16194595
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16194311 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtggcccacc 16194410  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16194411 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 16194510  T
Q  582 gtagt-ggccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||   || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16194511 gtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 16194595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Original strand, 42016562 - 42016846
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatgg-tgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  42016562 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaattgatgcagtggcccacc 42016661  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42016662 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 42016761  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    |||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42016762 gtagcggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 42016846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26860761 - 26860475
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  26860761 tcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacc 26860662  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| || |    
T  26860661 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaatttccgcaaattgat 26860562  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26860561 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagt 26860475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Original strand, 31392606 - 31392890
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31392606 tcaacgattataagtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 31392705  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  31392706 c-aaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatcccaattctcgcaaattggt 31392804  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31392805 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa-agttaattttagt 31392890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 391 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3836431 - 3836144
Alignment:
Q  391 tataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatt 489  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||  ||||||    
T  3836431 tatagatctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacctaaaaatt 3836332  T
Q  490 t-aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg 588  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3836331 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtctgttttaggtttcagttgatcaaaattcccgcaaagtgatgtagtgg 3836232  T
Q  589 ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3836231 ccacccg-aaaatttaaataattcaattatatatctattttacgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtagccctccct 3836144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 321 - 569
Target Start/End: Original strand, 38763711 - 38763960
Alignment:
Q  321 ggcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38763711 ggcagtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctatttagcgagattttatgcaa 38763810  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763811 ttttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 38763910  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattc 569  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  38763911 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattc 38763960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 323 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28745653 - 28745355
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc--ggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||             | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28745653 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccccgggaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 28745554  T
Q  421 ttttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 519  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28745553 ttttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 28745455  T
Q  520 agattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattat 618  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28745454 agattttatataattttatgccggttttagattttggttgatctaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattat 28745355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 385 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 11935473 - 11935195
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccg 483  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||     
T  11935473 aacgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgtagtggcccaccca 11935374  T
Q  484 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtg 582  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11935373 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggttttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 11935274  T
Q  583 tagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaa 660  Q
    || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11935273 tattggcccaccagaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagactttaaacaattttttaacgattaa 11935195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 34494634 - 34494420
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |             ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34494634 cagtggcggagcccatcatgggctagggtgggccacggtccatccagaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctcttttgcgagattttatgcaatt 34494535  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  34494534 ttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgag 34494435  T
Q  522 attttatacaatttt 536  Q
    | |||| ||||||||    
T  34494434 actttaaacaatttt 34494420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 19284029 - 19283875
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19284029 tcaacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacc 19283930  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||    
T  19283929 cgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttt 19283875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 323 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 22674899 - 22674684
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22674899 cagtggcggagcccttcatgggctggggtggaccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 22674800  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 520  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||    
T  22674799 ttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattgaaggtctaatttgaga 22674700  T
Q  521 gattttatacaatttt 536  Q
    || |||| ||||||||    
T  22674699 gactttaaacaatttt 22674684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 43471547 - 43471380
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||   |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  43471547 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 43471448  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471447 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 43471380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 325 - 536
Target Start/End: Original strand, 41699185 - 41699395
Alignment:
Q  325 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatttt 424  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||             ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41699185 gtggcggagccctccatgggctcgggtgggtcacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaatttt 41699284  T
Q  425 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaatggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 523  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41699285 gtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaat--tgtagaggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagac 41699382  T
Q  524 tttatacaatttt 536  Q
    |||| ||||||||    
T  41699383 tttaaacaatttt 41699395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 383 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 43471553 - 43471398
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||    
T  43471553 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacc 43471454  T
Q  482 cg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  43471453 cgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttt 43471398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22674833 - 22674666
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||    
T  22674833 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22674734  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22674733 atttaaataattcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 22674666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 509 - 665
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077720
Alignment:
Q  509 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaat 607  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||  | ||||||||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  608 aatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 665  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttttcaacggttaatttta 2077720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 503 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643545
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaat 601  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  602 ttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaaggtta 31643545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 509 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19284015 - 19283847
Alignment:
Q  509 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtg-gccactcgaaaaatttaaat 607  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  19284015 tctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacccg-aaaatttaaat 19283917  T
Q  608 aatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  19283916 aattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 19283847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34494568 - 34494402
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  34494568 attataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 34494470  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 667  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34494469 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 34494402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 504 - 654
Target Start/End: Original strand, 32099999 - 32100155
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg------ccactcgaa 597  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||| ||||    
T  32099999 ataggtatactttacgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaa 32100098  T
Q  598 aaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaac 654  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  32100099 aaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagtctttaaataatttttcaac 32100155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 501 - 672
Target Start/End: Original strand, 41699249 - 41699418
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||   ||| || |||| ||||||    
T  41699249 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaattg---tagaggtccacccgaaaa 41699345  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  41699346 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 41699418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 504 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 29035490 - 29035334
Alignment:
Q  504 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatt 602  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  29035490 ataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatt 29035391  T
Q  603 taaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtta 659  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||    
T  29035390 taaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttttcaactgtta 29035334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 391 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643555
Alignment:
Q  391 tataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-t 488  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |  |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| |    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  489 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 31643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 38763779 - 38763907
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  38763779 attataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 38763877  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38763878 atttaaataattcaattataggtctatttt 38763907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28745585 - 28745458
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggc-cactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28745585 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 28745487  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28745486 -tttaaataattcaattataggtctatttt 28745458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141875
Alignment:
Q  400 attttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattc-ctgcaaatggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataat 497  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  498 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 29141875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 536
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077704
Alignment:
Q  397 tctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaat 494  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||| |||||||  |||| ||| |||||||  || || |||| |||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  495 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttt 2077704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 501 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 17526119 - 17526038
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtg 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17526119 attatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaattttcacaaagtggtg 17526038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 512 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141870
Alignment:
Q  512 attttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcc-actcgaaaaatttaaataat 610  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||  |||| ||||||| |||||| |  ||| || |||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  611 ttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaac 654  Q
    | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaac 29141870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 517
Target Start/End: Original strand, 32099992 - 32100131
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtgg-----ccc 478  Q
    |||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||     |||    
T  32099992 aacgatcataggtatactttacgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgaccc 32100091  T
Q  479 acccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32100092 acccgaaaaatttaaataattcaattatagatctattttg 32100131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 29035496 - 29035344
Alignment:
Q  386 acgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccga 484  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||   ||||| |||||||||  ||||| |||    
T  29035496 acgatcataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcga 29035397  T
Q  485 aaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29035396 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttt 29035344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 385 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17526123 - 17526052
Alignment:
Q  385 aacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatt 456  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  17526123 aacgattatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaatt 17526052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27447119 - 27447084
Alignment:
Q  281 gacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27447119 gacctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 27447084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 368
Target Start/End: Original strand, 42473566 - 42473605
Alignment:
Q  329 cggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42473566 cggagcccttcatgggctggggtgggccacggctcacccg 42473605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Original strand, 26769459 - 26769493
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26769459 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 26769493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 356
Target Start/End: Original strand, 12994975 - 12995007
Alignment:
Q  324 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12994975 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 12995007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21374809 - 21374777
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374809 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 21374777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 499 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1538232 - 1538194
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 537  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1538232 caattataggtctattatgcgagattttaaacaatttta 1538194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 363
Target Start/End: Original strand, 2076934 - 2076971
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc 363  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2076934 tggcggagcccttcattggctagggtgggccacggccc 2076971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 312
Target Start/End: Original strand, 27084229 - 27084258
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27084229 cctatgaagcacggatacggacacggacac 27084258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Original strand, 32099928 - 32099973
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  32099928 cagtggtggagcccttcatgggctagggtgggccacaacccacccg 32099973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 312
Target Start/End: Original strand, 37558938 - 37558967
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37558938 cctatgaagcacggatacggacacggacac 37558967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 44788514 - 44788477
Alignment:
Q  499 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 536  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44788514 caattataggtctatttttcgagattttaaacaatttt 44788477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 31283992 - 31284024
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31283992 ctatgaagcacagatacggacacggacaccgga 31284024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44770235 - 44770207
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44770235 ctatgaagcacggatacggacacggacac 44770207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 326 - 672
Target Start/End: Original strand, 19048 - 19396
Alignment:
Q  326 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19048 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgatcataggtctattttgcgagattttatgcaattttg 19147  T
Q  426 tatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 524  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19148 tgtcggttttatgttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagatt 19247  T
Q  525 ttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtc 623  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19248 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccaaaaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 19347  T
Q  624 tattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  19348 taatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccc 19396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 629
Target Start/End: Original strand, 64933 - 65241
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggnnnnnnnnnnnnntcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  64933 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaaacaacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaatt 65032  T
Q  423 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  65033 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 65132  T
Q  522 attttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataa 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  65133 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 65232  T
Q  621 gtctatttt 629  Q
    |||||||||    
T  65233 gtctatttt 65241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 389 - 672
Target Start/End: Original strand, 65112 - 65398
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65112 attataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 65211  T
Q  488 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagt 586  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  65212 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagt 65311  T
Q  587 gg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccc 672  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  65312 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggccc 65398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 383 - 677
Target Start/End: Original strand, 1163 - 1459
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1163 tcaacgactataggtctacttttcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 1262  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  1263 cgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggt 1362  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtagccctccct 677  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  | || |||  ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  1363 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatttaatttgcgaaactttaaacagtttttcaatggtaaattttagtggcccaccct 1459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 383 - 611
Target Start/End: Original strand, 331831 - 332061
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  331831 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacc 331930  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  331931 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggt 332030  T
Q  582 gtagtgg-ccactcgaaaaatttaaataatt 611  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  332031 gtagtggtccacccaaaaaatttaaataatt 332061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 331837 - 331965
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcgaaaa 599  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  331837 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 331936  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctatttt 629  Q
     ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  331937 -tttaaataattcaattatagatctatttt 331965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 389 - 501
Target Start/End: Original strand, 331950 - 332064
Alignment:
Q  389 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaat-ggtgtagtggcccacccgaaaa 487  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  331950 attatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 332049  T
Q  488 -tttaaataattcaa 501  Q
     ||||||||||||||    
T  332050 atttaaataattcaa 332064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 383 - 590
Target Start/End: Original strand, 11237 - 11445
Alignment:
Q  383 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaa-tggtgtagtggcccacc 481  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |    
T  11237 tcaacgattatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatc 11336  T
Q  482 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggt 581  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||    
T  11337 caaaaatttaaataattcaattatagatcaattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattagt 11436  T
Q  582 gtagtggcc 590  Q
    |||||||||    
T  11437 gtagtggcc 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 619
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11361
Alignment:
Q  501 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccactcgaaaaa 600  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  || |||||    
T  11243 attatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaa 11342  T
Q  601 tttaaataatttaattata 619  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  11343 tttaaataattcaattata 11361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 367
Target Start/End: Original strand, 11166 - 11210
Alignment:
Q  323 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11166 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc 11210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 303901 - 303824
Alignment:
Q  511 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg 588  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  303901 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtgg 303824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 303972 - 303934
Alignment:
Q  327 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  303972 ggcggagcccttcatgggctagggtgggtcacggcccac 303934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 614 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 303740 - 303696
Alignment:
Q  614 attataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacggtt 658  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  303740 attataggtttattttacgagactttaaacaatttttcaacggtt 303696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 282 - 322
Target Start/End: Original strand, 63707 - 63747
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccggataccgg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63707 acctatgaagcacggatacggacacggacaccggataccgg 63747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Original strand, 9840 - 9874
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9840 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 9874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 503 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82783
Alignment:
Q  503 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaagtttcagttgatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-ccactcg--aaaa 599  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||| |  |||| ||||  || |||||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 82836  T
Q  600 atttaaataatttaattataagtctattttaagaggctttaaacaatttttcaacg 655  Q
    | ||||| ||   || |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  82835 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacg 82783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Original strand, 8740 - 8774
Alignment:
Q  282 acctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8740 acctatgaagcatggatacggacacggacaccgga 8774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Original strand, 46625 - 46658
Alignment:
Q  283 cctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46625 cctatgaagcacggatacggacacggacatcgga 46658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 575 - 547
Alignment:
Q  286 atgaagcacggatacggacacggacaccg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  575 atgaagcacggatacggacacggacaccg 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 312
Target Start/End: Original strand, 23371 - 23399
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371 ctatgaagcacggatacggacacggacac 23399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 130426 - 130458
Alignment:
Q  284 ctatgaagcacggatacggacacggacaccgga 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  130426 ctatgaagcatggatacggacacggacaccgga 130458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University