View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_129 (Length: 358)

Name: NF11737A_low_129
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_129
NF11737A_low_129
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (18-358)||(41628042-41628382)
chr8 (18-358)||(14079326-14079677)
chr8 (18-358)||(33424754-33425105)
chr8 (18-356)||(30825593-30825942)
chr8 (18-358)||(38961315-38961666)
chr8 (18-358)||(6477988-6478339)
chr8 (18-358)||(38991660-38992010)
chr8 (18-358)||(41976609-41976950)
chr8 (18-358)||(39203782-39204122)
chr8 (18-358)||(20663440-20663791)
chr8 (18-358)||(30548803-30549154)
chr8 (18-358)||(41906999-41907349)
chr8 (18-358)||(19247253-19247603)
chr8 (18-358)||(19320437-19320787)
chr8 (18-358)||(44213557-44213907)
chr8 (18-358)||(44383436-44383787)
chr8 (18-355)||(29433199-29433530)
chr8 (18-324)||(23626840-23627157)
chr8 (18-358)||(12759614-12759967)
chr8 (18-358)||(41155779-41156130)
chr8 (13-208)||(42811426-42811621)
chr8 (139-358)||(6301103-6301321)
chr8 (139-358)||(23967006-23967235)
chr8 (139-358)||(37029110-37029339)
chr8 (139-358)||(42061280-42061509)
chr8 (139-358)||(44939714-44939943)
chr8 (18-181)||(36598035-36598198)
chr8 (204-358)||(42811643-42811797)
chr8 (176-358)||(36602722-36602915)
chr8 (18-206)||(12250690-12250878)
chr8 (120-291)||(22343102-22343271)
chr8 (120-291)||(22354762-22354931)
chr8 (18-206)||(39444329-39444517)
chr8 (172-355)||(19396015-19396209)
chr8 (217-358)||(45294758-45294899)
chr8 (18-124)||(22342308-22342414)
chr8 (70-176)||(45294646-45294752)
chr8 (285-358)||(22345559-22345632)
chr8 (285-358)||(22357219-22357292)
chr8 (18-77)||(45294073-45294132)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (18-358)||(51247768-51248107)
chr3 (18-358)||(21700078-21700418)
chr3 (19-358)||(6104635-6104974)
chr3 (18-358)||(35088346-35088694)
chr3 (18-358)||(52841041-52841382)
chr3 (18-358)||(50771755-50772095)
chr3 (18-358)||(50740759-50741099)
chr3 (18-358)||(11326150-11326501)
chr3 (18-358)||(31369525-31369876)
chr3 (18-358)||(48976080-48976431)
chr3 (18-358)||(23192857-23193208)
chr3 (18-358)||(52853950-52854301)
chr3 (18-358)||(918077-918417)
chr3 (18-353)||(49112475-49112821)
chr3 (18-358)||(36167959-36168310)
chr3 (18-358)||(19893877-19894217)
chr3 (18-357)||(44073229-44073574)
chr3 (18-358)||(8242101-8242446)
chr3 (18-358)||(55295287-55295638)
chr3 (18-358)||(11951483-11951834)
chr3 (18-358)||(22477103-22477454)
chr3 (18-342)||(40827543-40827878)
chr3 (30-358)||(11382569-11382903)
chr3 (18-358)||(11598472-11598823)
chr3 (18-355)||(16495292-16495637)
chr3 (95-358)||(35436377-35436651)
chr3 (139-358)||(39796971-39797189)
chr3 (18-358)||(54793473-54793813)
chr3 (136-358)||(9879550-9879772)
chr3 (18-223)||(48521530-48521736)
chr3 (139-358)||(5252872-5253101)
chr3 (18-211)||(2845365-2845558)
chr3 (222-358)||(28164809-28164945)
chr3 (246-358)||(54512354-54512466)
chr3 (270-358)||(2845554-2845642)
chr3 (274-358)||(11952053-11952137)
chr3 (18-80)||(54512465-54512527)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (18-358)||(36633596-36633936)
chr2 (18-357)||(30567375-30567714)
chr2 (18-358)||(33664305-33664645)
chr2 (18-358)||(26821051-26821402)
chr2 (22-358)||(21097130-21097477)
chr2 (18-358)||(16724859-16725210)
chr2 (18-308)||(30571060-30571350)
chr2 (22-358)||(9544132-9544468)
chr2 (18-358)||(42884822-42885173)
chr2 (18-358)||(4810980-4811331)
chr2 (21-358)||(10048508-10048845)
chr2 (22-358)||(4291166-4291496)
chr2 (19-358)||(16883367-16883705)
chr2 (19-358)||(17041057-17041395)
chr2 (18-317)||(19168153-19168449)
chr2 (18-355)||(10822436-10822780)
chr2 (18-358)||(3710326-3710677)
chr2 (18-358)||(11866739-11867090)
chr2 (18-358)||(14752604-14752955)
chr2 (18-358)||(18093223-18093573)
chr2 (18-358)||(35358132-35358483)
chr2 (18-358)||(45205528-45205884)
chr2 (18-358)||(1515500-1515851)
chr2 (18-324)||(17036734-17037051)
chr2 (18-324)||(17091242-17091559)
chr2 (18-358)||(9917199-9917553)
chr2 (18-324)||(17025057-17025374)
chr2 (18-211)||(11447955-11448148)
chr2 (139-358)||(6343343-6343572)
chr2 (139-358)||(14323827-14324056)
chr2 (139-358)||(28501714-28501943)
chr2 (139-358)||(1993555-1993784)
chr2 (226-358)||(11447080-11447212)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (18-358)||(18813623-18813974)
chr1 (18-358)||(34686991-34687342)
chr1 (18-358)||(41830544-41830895)
chr1 (18-355)||(52522063-52522411)
chr1 (18-358)||(15314665-15315005)
chr1 (18-358)||(38845719-38846070)
chr1 (18-358)||(31619093-31619444)
chr1 (22-358)||(4891533-4891869)
chr1 (22-358)||(29186618-29186954)
chr1 (19-358)||(41963426-41963776)
chr1 (22-358)||(33361142-33361472)
chr1 (18-358)||(34691529-34691870)
chr1 (18-358)||(51966228-51966568)
chr1 (36-358)||(50560457-50560779)
chr1 (18-358)||(48339728-48340084)
chr1 (18-358)||(28566214-28566563)
chr1 (18-358)||(52309238-52309589)
chr1 (18-358)||(12713881-12714232)
chr1 (18-358)||(42681794-42682145)
chr1 (18-358)||(29841182-29841533)
chr1 (23-358)||(10694689-10695035)
chr1 (18-355)||(13662900-13663245)
chr1 (139-358)||(18111122-18111351)
chr1 (139-358)||(43255170-43255399)
chr1 (139-358)||(50395584-50395813)
chr1 (18-125)||(10763030-10763137)
chr1 (293-358)||(10762958-10763023)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (18-358)||(19831920-19832260)
chr4 (18-358)||(28135589-28135929)
chr4 (18-358)||(33503521-33503861)
chr4 (18-355)||(36856519-36856854)
chr4 (18-358)||(14830034-14830385)
chr4 (19-358)||(34057087-34057438)
chr4 (18-358)||(54332166-54332516)
chr4 (18-358)||(19590261-19590601)
chr4 (13-358)||(53341825-53342181)
chr4 (18-358)||(28120744-28121083)
chr4 (18-358)||(23478323-23478676)
chr4 (22-358)||(39715037-39715373)
chr4 (22-358)||(52800458-52800794)
chr4 (22-358)||(13627467-13627814)
chr4 (18-358)||(55999220-55999571)
chr4 (18-358)||(10259846-10260197)
chr4 (18-358)||(21564258-21564609)
chr4 (18-358)||(24077915-24078266)
chr4 (18-358)||(26924785-26925136)
chr4 (18-358)||(43331779-43332130)
chr4 (18-358)||(51451846-51452197)
chr4 (18-358)||(17739455-17739806)
chr4 (18-349)||(1943920-1944257)
chr4 (18-358)||(40621561-40621914)
chr4 (18-358)||(35496066-35496386)
chr4 (18-358)||(47720592-47720933)
chr4 (18-237)||(17698723-17698942)
chr4 (135-358)||(39745486-39745720)
chr4 (18-342)||(574669-575001)
chr4 (139-358)||(15520263-15520492)
chr4 (160-357)||(5274409-5274617)
chr4 (139-358)||(740923-741152)
chr4 (18-206)||(26870807-26870995)
chr4 (18-165)||(5272778-5272925)
chr4 (18-167)||(7644307-7644456)
chr4 (159-355)||(7644773-7644980)
chr4 (22-163)||(37702126-37702267)
chr4 (231-358)||(17698421-17698548)
chr4 (18-141)||(39743269-39743392)
chr4 (18-136)||(38007492-38007610)
chr4 (18-125)||(35708151-35708258)
chr4 (19-93)||(3839895-3839969)
chr4 (296-358)||(35712922-35712984)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (18-358)||(1073779-1074130)
chr6 (29-358)||(4423764-4424092)
chr6 (18-358)||(18599502-18599853)
chr6 (18-358)||(14888453-14888804)
chr6 (18-358)||(11945985-11946336)
chr6 (18-358)||(34855335-34855686)
chr6 (18-358)||(7222124-7222475)
chr6 (18-358)||(15275038-15275389)
chr6 (18-358)||(2520543-2520894)
chr6 (22-358)||(9979579-9979915)
chr6 (22-358)||(24445360-24445696)
chr6 (18-358)||(33978353-33978693)
chr6 (22-358)||(25532645-25532980)
chr6 (18-326)||(11935196-11935515)
chr6 (22-358)||(1219957-1220287)
chr6 (18-358)||(7219380-7219731)
chr6 (18-358)||(17938902-17939253)
chr6 (18-358)||(33321969-33322320)
chr6 (18-358)||(249292-249643)
chr6 (18-358)||(12580312-12580663)
chr6 (18-358)||(34320472-34320823)
chr6 (21-358)||(1931423-1931761)
chr6 (18-358)||(22374357-22374719)
chr6 (139-358)||(13457350-13457579)
chr6 (18-149)||(4424087-4424218)
chr6 (274-358)||(1080374-1080458)
chr6 (18-101)||(14831133-14831216)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (18-358)||(9324-9675)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (18-358)||(19520574-19520917)
chr7 (18-358)||(23766951-23767302)
chr7 (18-358)||(5962099-5962450)
chr7 (19-358)||(33030208-33030546)
chr7 (18-358)||(8926403-8926754)
chr7 (18-355)||(42245368-42245705)
chr7 (18-358)||(17477300-17477640)
chr7 (18-358)||(17575574-17575914)
chr7 (18-358)||(14308330-14308681)
chr7 (18-358)||(17481746-17482087)
chr7 (18-358)||(17571127-17571468)
chr7 (22-358)||(17170459-17170795)
chr7 (22-358)||(31898306-31898642)
chr7 (21-358)||(39649464-39649803)
chr7 (18-358)||(42686969-42687303)
chr7 (18-351)||(47173894-47174227)
chr7 (22-358)||(48528275-48528612)
chr7 (18-358)||(9226733-9227084)
chr7 (18-358)||(23300232-23300572)
chr7 (18-358)||(19034168-19034519)
chr7 (18-358)||(20720117-20720468)
chr7 (18-358)||(29490357-29490708)
chr7 (18-358)||(42917250-42917601)
chr7 (18-358)||(33230474-33230825)
chr7 (18-358)||(34282617-34282968)
chr7 (18-358)||(20764779-20765129)
chr7 (18-358)||(27735561-27735912)
chr7 (18-358)||(33639187-33639538)
chr7 (18-358)||(9148761-9149112)
chr7 (18-355)||(47164064-47164419)
chr7 (18-358)||(3794910-3795261)
chr7 (89-358)||(4481783-4482063)
chr7 (139-358)||(6911977-6912206)
chr7 (139-358)||(47573955-47574184)
chr7 (18-206)||(38435062-38435250)
chr7 (18-206)||(42996016-42996204)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (20-357)||(4881648-4881984)
chr5 (18-358)||(1852436-1852774)
chr5 (18-358)||(20996450-20996801)
chr5 (18-358)||(21029470-21029821)
chr5 (18-358)||(26321581-26321932)
chr5 (18-358)||(2194527-2194878)
chr5 (18-358)||(20349302-20349636)
chr5 (22-355)||(25697033-25697366)
chr5 (21-358)||(30141936-30142273)
chr5 (18-358)||(33611646-33611997)
chr5 (18-358)||(7285039-7285390)
chr5 (18-358)||(27065264-27065613)
chr5 (22-358)||(34717023-34717359)
chr5 (18-358)||(3151110-3151460)
chr5 (22-358)||(41690709-41691045)
chr5 (18-358)||(30688677-30689022)
chr5 (18-358)||(3397644-3397998)
chr5 (18-358)||(37463746-37464097)
chr5 (18-358)||(3210704-3211054)
chr5 (18-324)||(9701648-9701965)
chr5 (18-355)||(289973-290321)
chr5 (18-358)||(12588786-12589137)
chr5 (166-358)||(3027822-3028014)
chr5 (139-355)||(31296170-31296385)
chr5 (139-358)||(19394851-19395079)
chr5 (18-186)||(19447546-19447716)
chr5 (21-167)||(3028312-3028458)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (18-358)||(26868-27219)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (22-358)||(18898-19234)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (22-351)||(119443-119783)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (18-349)||(65143-65480)
scaffold0006 (18-355)||(152662-153010)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (18-287)||(4597-4877)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (18-358)||(49464-49798)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (163-358)||(13200-13395)
scaffold0069 (22-130)||(13394-13502)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (18-182)||(1-165)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (121-354)||(4866-5110)
scaffold0032 (121-354)||(11315-11559)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (18-206)||(898-1086)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (157-358)||(13493-13705)
scaffold0045 (18-72)||(13439-13493)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (74-206)||(54664-54796)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (172-358)||(10991-11188)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (18-125)||(30505-30612)
[»] scaffold1555 (1 HSPs)
scaffold1555 (176-292)||(1521-1648)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41628382 - 41628042
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41628382 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataaatgcaatattagtctaa 41628283  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  41628282 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatgtagcagga 41628183  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41628182 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaag 41628083  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628082 catcacttacgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 41628042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 14079326 - 14079677
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079326 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 14079425  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14079426 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 14079525  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079526 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 14079625  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079626 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 14079677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33424754 - 33425105
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424754 catcaatgagagtgattgttttacgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 33424853  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33424854 tgcatatttacacggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataacggattttaagctaaagaaaatgtaacatga 33424953  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424954 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 33425053  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33425054 tggaaattaaacatcacttctgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 33425105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30825942 - 30825593
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825942 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgaaaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 30825843  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  30825842 tgcatatttacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 30825743  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825742 cttctaatttatcatcctattatcctcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 30825643  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30825642 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccaacaccatttg 30825593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38961666 - 38961315
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38961666 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcaaaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtctaa 38961567  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  38961566 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatatagcatga 38961467  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961466 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtagattatatgtaccccgttgatcaattaacattgttgaaacaaa 38961367  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38961366 tgaaaattaaacatcactttcgcatatgcatatatagctagcaccatttgac 38961315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 6477988 - 6478339
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6477988 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcatttgggaaatgttaaacaagaaaataactgcaatattagtctaa 6478087  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6478088 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 6478187  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6478188 cttctaatttattttcctattatcttcccataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgatcaattaatattgttaaaacaaa 6478287  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6478288 tggaagttaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctgccaccatttgac 6478339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38992010 - 38991660
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38992010 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcaaaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtctaa 38991911  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  38991910 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttat-aaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatatagcatga 38991812  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38991811 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtagattatatgtaccccgttgatcaattaacattgttgaaacaaa 38991712  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38991711 tgaaaattaaacatcactttcgcatatgcatatatagctagcaccatttgac 38991660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41976950 - 41976609
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  41976950 catcaatgagagcgattgttttgcgctttacttttagaattgttcttgacacctcttttgggaaatgctaaacaaggaaataacaacaatattagtctaa 41976851  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  41976850 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtacaatga 41976751  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagat-aaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41976750 cttctaatttatcttcctaaaaaggctaaataaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacaatgttgaaacaaatggaaattaa 41976651  T
Q  317 gcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41976650 gcatcgctcccgcatgtgcatctatagccagcaccatttgac 41976609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39204122 - 39203782
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  39204122 catcaatgagagttattgttttgcgcttttctttcaaaaaatttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataacgacaatattagtctaa 39204023  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  39204022 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacataaaatttataaaatgaatgtagcataattgattttaagctaaagaaaatgtaccacga 39203923  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203922 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgaatgtggattatatgtaccccgttcgccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 39203823  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  39203822 cttcactcccgcatgcgcatttatagctagaaccatttgac 39203782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 20663440 - 20663791
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20663440 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 20663539  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20663540 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 20663639  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20663640 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 20663739  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20663740 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 20663791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 30548803 - 30549154
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  30548803 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 30548902  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  30548903 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 30549002  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30549003 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 30549102  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30549103 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 30549154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41907349 - 41906999
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41907349 catcaatgagagtgaatgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 41907250  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41907249 tgcatattaacatggataagatgtatacaaatataattacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 41907150  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41907149 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaa-taacattgttgaaacaaa 41907051  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41907050 cgaaaattaagcatcgcttccgcatgtgcatctatagcgagcaccatttgac 41906999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19247603 - 19247253
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19247603 catcaatgagagtgattgttttgtgctttccttttagaattgttcttgacacctcgttcgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 19247504  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  19247503 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattcat-aaataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtattatga 19247405  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||| ||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19247404 cttttaatttatcttcctgttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgcattatatgaatcccgtttaccaattaacattgttgaaacaaa 19247305  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19247304 tggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctatcaccatttgac 19247253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19320787 - 19320437
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19320787 catcaatgagagtgattgttttgtgctttccttttagaattgttcttgacacctcgttcgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 19320688  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  19320687 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattcat-aaataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtattatga 19320589  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||| ||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19320588 cttttaatttatcttcctgttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgcattatatgaatcccgtttaccaattaacattgttgaaacaaa 19320489  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19320488 tggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctatcaccatttgac 19320437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 44213557 - 44213907
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  44213557 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 44213656  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44213657 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 44213756  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44213757 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 44213856  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44213857 tgaaaattaagcatcac-tctccatgtgcatctatagctaacaccatttgac 44213907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 44383436 - 44383787
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  44383436 catcaatgaaagtgattgtcttacgctttccttttagaattgttcttgacatctcgtttgggaaatgctatacagggaaataacaacaatattagtctaa 44383535  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |    
T  44383536 tgcatatcaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaagaacatgtatcatga 44383635  T
Q  218 cttctaatttatc-----------ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||           ||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383636 cttctaatttatcttcttttttttttcttaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 44383735  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44383736 tggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 44383787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29433530 - 29433199
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29433530 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcataattgttcttgacacctcctttgggaaatgctaaacatggaaataactgcaatattagtctaa 29433431  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29433430 tgcatattaacatg---------tatgcgaataaagttacatataatttataaaatgaaggtagcataacagattttaagctaaagaaaatgtaacatga 29433340  T
Q  218 cttctaat---ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaatt 314  Q
    |||||      |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29433339 cttctttcctattatcttcctataaagttaagataaatgcatgcatgtggattacatgtaccctgttggccaattaacattgttgaaacaaatggaaatt 29433240  T
Q  315 aagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29433239 aagcatcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccattt 29433199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Original strand, 23626840 - 23627157
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23626840 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 23626939  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23626940 tgcatattattatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaagaaaatgtaccatga 23627039  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23627040 cttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgttgattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 23627139  T
Q  307 tggaaattaagcatcact 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23627140 tggaaattaagcatcact 23627157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12759967 - 12759614
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12759967 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataacaacaatattagtctaa 12759868  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  12759867 ttcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataattgattttaagctaaaaaaattgtatcatga 12759768  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaa- 305  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  12759767 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatg-aacccgttaaccaattaaaattgttgaaacaaa 12759669  T
Q  306 --atggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12759668 ttatggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 12759614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41156130 - 41155779
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  41156130 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacaccgcgtttgggaaatgttaaatagggaaataacaacaacattagtctaa 41156031  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  41156030 tgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtaacataactgaatttaagctaaagaaaatgtatcatga 41155931  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41155930 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaacaccattgaccaaataaaattgttgaaacaaa 41155831  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41155830 tagaaattaagcatcactcaagcatatgcatctatagctagcaccatttgac 41155779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 42811426 - 42811621
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattag 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42811426 atggtcatcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaagaaaataactgcaatattag 42811525  T
Q  113 tctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811526 tctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaat 42811621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 6301103 - 6301321
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6301103 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctata 6301201  T
Q  239 aagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcata 338  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  6301202 aagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatc 6301301  T
Q  339 tatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6301302 tatagctagcaccatttgac 6301321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 23967006 - 23967235
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  23967006 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 23967104  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23967105 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 23967204  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23967205 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 23967235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37029339 - 37029110
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat- 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  37029339 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 37029241  T
Q  238 ----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
              ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37029240 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 37029141  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37029140 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 37029110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 42061280 - 42061509
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  42061280 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 42061378  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42061379 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 42061478  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42061479 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 42061509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44939943 - 44939714
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat- 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  44939943 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 44939845  T
Q  238 ----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
              ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44939844 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 44939745  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44939744 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 44939714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 36598035 - 36598198
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36598035 catcaatgagagtgatagttttgcactttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaataggaaaataactgcaatattagtctaa 36598134  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36598135 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatataattacatataatttataaaataaaggtag 36598198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 204 - 358
Target Start/End: Original strand, 42811643 - 42811797
Alignment:
Q  204 aaaatgtagcataacttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaac 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42811643 aaaatgtagcatgacttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacgttgttgaaac 42811742  T
Q  304 aaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811743 aaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 42811797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 176 - 358
Target Start/End: Original strand, 36602722 - 36602915
Alignment:
Q  176 aggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcct-----------ataaagtctagataaatgcatgcatgtcc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36602722 aggtagcataactgattttaagctacagaaaatgtaacatgacttctaatttatcttcctattatcatcctataaagtctagataaatgcatgcatgtac 36602821  T
Q  265 attatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36602822 attatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 36602915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 12250690 - 12250878
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12250690 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 12250789  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12250790 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 12250878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 291
Target Start/End: Original strand, 22343102 - 22343271
Alignment:
Q  120 catatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataact 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22343102 catatttacatggataagatgtatgcgaata--gttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgact 22343199  T
Q  220 tctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22343200 tctaatttatcttcctataaaatctagataaatgcatgtatgcacattatatgtaccccgttgaccaattaa 22343271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 291
Target Start/End: Original strand, 22354762 - 22354931
Alignment:
Q  120 catatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataact 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22354762 catatttacatggataagatgtatgcgaata--gttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgact 22354859  T
Q  220 tctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354860 tctaatttatcttcctataaaatctagataaatgcatgtatgcacattatatgtaccccgttgaccaattaa 22354931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39444517 - 39444329
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39444517 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 39444418  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  39444417 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 39444329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 355
Target Start/End: Original strand, 19396015 - 19396209
Alignment:
Q  172 ataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcat 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19396015 ataaaggtagcttaactgattttaagctaaagaaaatgtagcatgacgtctaatttatcttccaattatcttcgtataaagtctagataaatgtatgcat 19396114  T
Q  261 gtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19396115 gtacattatatgtactccattgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 19396209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 217 - 358
Target Start/End: Original strand, 45294758 - 45294899
Alignment:
Q  217 acttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45294758 acttctaatttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgcattatatgaaccccattgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 45294857  T
Q  317 gcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45294858 gcatcactcccgcatttgcatctatagctaacaccatttgac 45294899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 22342308 - 22342414
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22342308 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccattcagaattcttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 22342407  T
Q  118 tgcatat 124  Q
    |||||||    
T  22342408 tgcatat 22342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Original strand, 45294646 - 45294752
Alignment:
Q  70 ctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttata 169  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  45294646 ctcgtttgggaaatgctaaacggggaaataacaacaatattagtctaatgcatattaacatggataaaatgtatgtgaatatagttacatataattcata 45294745  T
Q  170 aaataaa 176  Q
    |||||||    
T  45294746 aaataaa 45294752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 358
Target Start/End: Original strand, 22345559 - 22345632
Alignment:
Q  285 caattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22345559 caattaacattgttcagacaaatggaaattaagcatcacttccgtatgtgtatatatagctagcaccatttgac 22345632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 358
Target Start/End: Original strand, 22357219 - 22357292
Alignment:
Q  285 caattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22357219 caattaacattgttcagacaaatggaaattaagcatcacttccgtatgtgtatatatagctagcaccatttgac 22357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Original strand, 45294073 - 45294132
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttg 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45294073 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttg 45294132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51248107 - 51247768
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51248107 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttctcg-cacctcgtttgggaaatgctaaataggaaaataactgcaatattagtctaa 51248009  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51248008 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 51247909  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51247908 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcacgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 51247809  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51247808 catcacttccgcacgtgcatatatagctagcaccatttgac 51247768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 21700078 - 21700418
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21700078 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcaaaattgttcttgacacgtcgtttgagaaatgctaaacatgaaaataactggaatatcagtctaa 21700177  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21700178 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatattatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 21700277  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700278 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatttaccctgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 21700377  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21700378 catcacttctgcatgtgcatatatagttagcaccatttgac 21700418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 6104635 - 6104974
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6104635 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacaactcgtttgggaaatgttaaacgggaaaataactgcaatattagtctaat 6104734  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6104735 gcatatttacatggataagatgcatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgac 6104834  T
Q  219 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6104835 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgtagaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagt 6104934  T
Q  319 atcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6104935 atcacttccgcatgtccatatatagccagcaccatttgac 6104974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 35088346 - 35088694
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088346 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttggaaaaggctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 35088445  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35088446 tgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 35088545  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat--------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 309  Q
    ||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088546 cttctaatttatcatcctattatcttcaaaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 35088645  T
Q  310 aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35088646 aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccaattgac 35088694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 52841041 - 52841382
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgcttt-cctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtcta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52841041 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacagggaaataactgcaatataagtcta 52841140  T
Q  117 atgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  52841141 atgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttatgaaataaaggtggcataaccgattttaagctaaagaaaatgtagcatg 52841240  T
Q  217 acttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52841241 acttctaatttatcttcctacaaagtccagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 52841340  T
Q  317 gcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52841341 gcatcactttcgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 52841382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 50771755 - 50772095
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771755 catcaatgagagtgattgttttacgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 50771854  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50771855 tgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaatgtagcatga 50771954  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50771955 cttataatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccattgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaag 50772054  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50772055 catcacttccgcatgtgcatatatagctaccaccatttgac 50772095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50741099 - 50740759
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50741099 catcaatgagagtgattgttttacgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaaaaggaaaataactgcaatattagtctaa 50741000  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50740999 tgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaatgtagcatga 50740900  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50740899 cttataatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgaaccccattgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaag 50740800  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50740799 catcacttccgcatgtgcatatatagctaccaccatttgac 50740759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 11326150 - 11326501
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11326150 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcaaaattgttcttgacacctcgtttgggaaacgccaaacaggaaaataactacaatattactctaa 11326249  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11326250 tgcatatttacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 11326349  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326350 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 11326449  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326450 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 11326501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 31369525 - 31369876
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369525 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 31369624  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31369625 tgcatatttacatggataagatgtatatgaatatagttacgtataatttataaaataaaggtagcataacttattttaagctaaagaaaatgtaacatga 31369724  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369725 cttctaatttatcatcctattatcttcctctaaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 31369824  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31369825 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccagcaccatttgac 31369876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48976431 - 48976080
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48976431 catcaatgagagtgattgttttccgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtctaa 48976332  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  48976331 tgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcttga 48976232  T
Q  218 cttctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48976231 cttctaatttatcttcatattatcttcctataaagtatagataaatgcatacatgtacattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 48976132  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48976131 tgaaaattatgcatcactttcgcatgtgcatatatagccagcaccatttgac 48976080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23193208 - 23192857
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23193208 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 23193109  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  23193108 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatttaatttttataataaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtaccatga 23193009  T
Q  218 cttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193008 cttctaatttatcttcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtatcccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 23192909  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23192908 tggaaattaagcatcactttcgcatgggcatatatagctagcacaatttgac 23192857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 52853950 - 52854301
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52853950 catcaaagagagtgattgttttgcgctttcctttcaaaattgttcttgacacgtcgtttggcaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtataa 52854049  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  52854050 tgaatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaagatatcataactaattttaagctaaagaaaatgtagcatga 52854149  T
Q  218 cttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52854150 cttctaatttatcttcctatcatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccacgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 52854249  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52854250 tggaaattaagcatcacttctgcatgtggatatatagctagcaccatttgac 52854301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 918417 - 918077
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  918417 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacatagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 918318  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  918317 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 918218  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  918217 cttctaatttatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaacatttttgaaacaaatgaaaattaag 918118  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  918117 catcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 918077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 49112821 - 49112475
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112821 catcaatgagagtgattgttttgcacttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgaaaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 49112722  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49112721 tgcatatttacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 49112622  T
Q  218 cttctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
     |||||||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49112621 attctaatttatcttcttattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaaacaacattgttgaaacaaa 49112522  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccat 353  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49112521 tggaaattatgcatcactttcgcatgtgcatatatagccagcaccat 49112475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 36167959 - 36168310
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36167959 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgttaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 36168058  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36168059 tgcgtattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatcaaggtatcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 36168158  T
Q  218 cttctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36168159 cttctaatttatcttcttattagcttcctataaagtctagaaaaatgcatgcatgtggattatatgcaccctgttggccaattaacattgttgaaacaaa 36168258  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36168259 cggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 36168310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 19893877 - 19894217
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  19893877 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaatcgttcttgacatctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattactctaa 19893976  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19893977 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataacttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 19894076  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19894077 cttctaatttatcttcctaaataggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgtagaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaag 19894176  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  19894177 catcgctcccgcatgtgcatctttagctaagaccatttgac 19894217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 44073229 - 44073574
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  44073229 catcaatgagagtaattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 44073328  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44073329 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 44073428  T
Q  218 cttctaatttatcttccta------taaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||      | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44073429 cttctaatttatctttctattatcttcaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtacctcgttgaccaattaacatttttgaaacaaatgaaa 44073528  T
Q  312 attaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttga 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44073529 attaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttga 44073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8242446 - 8242101
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8242446 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttaacacctcgtttgagaaatgctaaacagagaaataactgcaatattagtctaa 8242347  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  8242346 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatgtagttacatataatttataaaataaaggtag-----ctgattttaagctaaag-aaatgtatcatga 8242253  T
Q  218 cttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8242252 cttctaatttatcttcctcttatcttcttatagagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttaaccaattaacattgttgaaacaaa 8242153  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8242152 tggaaattaagcatcactctcgcatgtgcatctattgctagcaccatttgac 8242101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 55295287 - 55295638
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  55295287 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgtgaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 55295386  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  55295387 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaagaaaggtagcataacttattttaagctaaagaaaatgtatcatga 55295486  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55295487 cttctaatttatcttcctattatcttcctgaaaaggctagaaaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgacaaattaacattgttgaaacaga 55295586  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  55295587 tggaaattaagcatcgctcccgcatgtgaatttatagctagcaccatttgac 55295638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 11951483 - 11951834
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||    
T  11951483 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcatttgtgaaatgctaaacagggaaataagaacagtattagtctaa 11951582  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  11951583 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttcaagctaaagaaaatgtatcatga 11951682  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11951683 cttctaatttatcttcctattatcttcttaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaatattgttgaaacaaa 11951782  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11951783 tggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 11951834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22477454 - 22477103
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  22477454 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttctttttgaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 22477355  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  22477354 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatga 22477255  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||| |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22477254 cttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaactccgttgaccaactaatattgttgaaacaaa 22477155  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22477154 tggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 22477103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 40827543 - 40827878
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||    
T  40827543 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcatgacacctcgtttggaaaatgctaaacaaggaaataacaacaatattaatctaa 40827642  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40827643 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagtataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatca 40827742  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40827743 cttctaatttatcttcctattatcttccaaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaactcgttgaccaactaacattgttgaaacaaa 40827842  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatata 342  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  40827843 tggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctata 40827878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11382903 - 11382569
Alignment:
Q  30 tgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgcatatttaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11382903 tgattgttttgcgctttcctttcagattttttcttcacacctcgttttcaaaatgctaaaaagggaaatgactgcaatattagtctaatgcacattaaca 11382804  T
Q  130 tggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat 229  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  11382803 tggataaaatgtctgcgaatatagttatatataatttataaaatgaaggtaacgtaactgattttaagctaaagaaaatgtaccatgacttgtaatttat 11382704  T
Q  230 ------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcac 323  Q
          |||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382703 cctcagcttcctataaagtccatataaatccatgcatgtggattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcac 11382604  T
Q  324 ttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11382603 tcccgcatgtacatctatagctagcaccatttgac 11382569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 11598472 - 11598823
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  11598472 catcaatgagggtaattgttttgcactttccttttagatttgttcttgacacctcgtttggaaaatgttaaacagagaaataacaacaatattagtctaa 11598571  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11598572 tgcatattaacatggataagacgtatgctaatatagttacatataatttataaaataaaggtatcttaattgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 11598671  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11598672 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcactcatatgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 11598771  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11598772 tggaaattaagcatcgctcctgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 11598823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16495637 - 16495292
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  16495637 catcaatgagagtgatt-ttttgcgcttttctttcagaattgttcttaataccttgtttgggaaatgctaaa--gggagataactgcaatattagtctaa 16495541  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  16495540 tgcatattaacatggataagatgtatgttaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtaccatga 16495441  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16495440 cttctaatgtatcgtcctattatattcctataaaatctagataaatgcatgcatgtggattatatgtacctcgttggccaattaacattgttgaaacaaa 16495341  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  16495340 tggaaattaagcatcactcctgcatgcgcatttatagctaacaccattt 16495292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 95 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35436651 - 35436377
Alignment:
Q  95 aaataactgcaatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35436651 aaataactgcaatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgatttt 35436552  T
Q  195 aagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttga 283  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  35436551 aagctaaagaaaatgtaccatgacttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttgg 35436452  T
Q  284 ccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35436451 ccaattaacattgttgaaacaaacaaaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccagttgac 35436377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 39796971 - 39797189
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39796971 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctata 39797069  T
Q  239 aagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcata 338  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39797070 aagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatc 39797169  T
Q  339 tatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39797170 tatagctagcaccatttgac 39797189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 54793473 - 54793813
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  54793473 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttaacacctcgtttgggaaatgctaaacagggatataactgcaatattagtctga 54793572  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttta-agctaaaga-aaatgtagcat 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    | | | ||||| |  | | ||   |    
T  54793573 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatataattacatataatttataaaatgaaggtagcacaactctcataatacctaaatattagtctaattt 54793672  T
Q  216 aacttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaatta 315  Q
    | ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54793673 atcttccta-ttatattcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgta-cccgttggccaattaacattgttgaaacaaatggaaatta 54793770  T
Q  316 agcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54793771 agcatcactcccgcatgtgcatttatagctaacaccatttgac 54793813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 358
Target Start/End: Original strand, 9879550 - 9879772
Alignment:
Q  136 agatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcct 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  9879550 agatgtatgcgaatataattacatataatttataaaatgaaggtagcataattgattttaaactaaagaaaatgtatcatcacttttaatttatcttcct 9879649  T
Q  236 ataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9879650 ataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtactccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactcccgcatgtgc 9879749  T
Q  336 atatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  9879750 atctatagctagcatcatttgac 9879772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 48521530 - 48521736
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  48521530 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattcttcttgacacctcgtttgggaaatgcttaacagggaaataacaacaatattagtctaa 48521629  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactga-ttttaagctaaagaaaatgtagcata 216  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  48521630 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttttaagctaaagaaaatgtatcatg 48521729  T
Q  217 acttcta 223  Q
    |||||||    
T  48521730 acttcta 48521736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 5252872 - 5253101
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  5252872 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 5252970  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5252971 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 5253070  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5253071 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 5253101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 2845365 - 2845558
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2845365 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcggaattgttattgacacctcgtttaggaaatgctaaataggaaaataactgcaatattagtctaa 2845464  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgta 211  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2845465 tgcatattaacatgtgtaaggtgtatgtaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataattgattttaagctaaagcaaatgta 2845558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 358
Target Start/End: Original strand, 28164809 - 28164945
Alignment:
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28164809 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgcacattatatgaacctcgttgatcaattaacatttttgaaacgaatggaaattaagcatc 28164908  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28164909 actccctcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 28164945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 54512466 - 54512354
Alignment:
Q  246 gataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagct 345  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54512466 gataaatgcatgcatgtacattttatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaattagaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagct 54512367  T
Q  346 agcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||    
T  54512366 agcaccatttgac 54512354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 2845554 - 2845642
Alignment:
Q  270 atgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2845554 atgtacccggttgaccaattaacattgatgaaacaaatggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 2845642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 358
Target Start/End: Original strand, 11952053 - 11952137
Alignment:
Q  274 accccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11952053 accccgttgaccaattaatattgttgaaacaaatggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 11952137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54512527 - 54512465
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttggga 80  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54512527 catcaatgagaatgattgttttacgctttcctttcagaattgttcttgacaccttgtttggga 54512465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 36633596 - 36633936
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633596 catcaataagagtgatagttttgcgctttcctttcagaatcgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 36633695  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36633696 tgcatatttacatggataagatgtaatcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 36633795  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633796 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 36633895  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633896 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 36633936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 30567375 - 30567714
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567375 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttcatgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 30567474  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30567475 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 30567574  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567575 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccctgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 30567674  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttga 357  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30567675 catcactaccacatgtgcatatatagctagaaccatttga 30567714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33664305 - 33664645
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33664305 catcaatgaaagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctag 33664404  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33664405 tacatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaaactaaagaaaatgtagcatga 33664504  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664505 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtactccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 33664604  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664605 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 33664645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26821402 - 26821051
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821402 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaaggctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 26821303  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  26821302 tgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgg 26821203  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821202 cttctaatttatcatcttattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 26821103  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26821102 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccaattgac 26821051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21097477 - 21097130
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097477 aatgagagtgattgttttgtgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 21097378  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21097377 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtaacatgacttc 21097278  T
Q  222 taatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 310  Q
    |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097277 taatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 21097178  T
Q  311 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21097177 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccagcaccatttgac 21097130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 16724859 - 16725210
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16724859 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaagaggaaaataactgcaatattagtctaa 16724958  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16724959 tgcatatttacatggctaagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 16725058  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16725059 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcatcccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 16725158  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16725159 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatataactagcatcatttgac 16725210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Original strand, 30571060 - 30571350
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571060 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttcatgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 30571159  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30571160 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 30571259  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571260 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccctgttgaccaattaacattgttgaaacaaatg 30571350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 9544132 - 9544468
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  9544132 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 9544231  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9544232 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 9544331  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9544332 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 9544431  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9544432 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 9544468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42885173 - 42884822
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42885173 catcaatgagagttattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttaacacctcgttcgggaaatgataaacaggaaaataactacaatattagtttaa 42885074  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42885073 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtaacattactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 42884974  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42884973 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 42884874  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42884873 tgtaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctgacaccatttgac 42884822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4811331 - 4810980
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4811331 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcatttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatatcagtctaa 4811232  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  4811231 tgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcgtaactgattttaagctaaaaaaaatgtatcatga 4811132  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811131 cttctaatttatattcctattatcttcatataaagtctagatatatgcatgcatgttcattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 4811032  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4811031 tggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 4810980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Original strand, 10048508 - 10048845
Alignment:
Q  21 caatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  10048508 caattagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctggtttgggaaatgctaaacagggaaataacaataatattagtctaatgc 10048607  T
Q  121 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||    
T  10048608 atattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatatatcatgactt 10048707  T
Q  221 ctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcat 320  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048708 ctaatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcat 10048807  T
Q  321 cacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10048808 cgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 10048845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 4291166 - 4291496
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4291166 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 4291265  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4291266 tattaacatggataa------tgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 4291359  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4291360 taatttatctttctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 4291459  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4291460 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 4291496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16883705 - 16883367
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16883705 atcaatgagagtgattgttttgcactttcctttcaaaattgttcttgacacctcgtttgggaa-tgctaaatagggaaataactgcaatattagtctaat 16883607  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16883606 gcatattaacatggataagatgtatgaatatatagttacatataagttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatgac 16883507  T
Q  219 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagc 318  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16883506 ttataatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtactccgttggccaagtaaaattgttgaaacaaatgaaaattaagc 16883407  T
Q  319 atcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16883406 atcaatcccgcatgtgcatttatagctagcaccatttgac 16883367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17041395 - 17041057
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17041395 atcaatgagagtgattgttttgcactttcctttcaaaattgttcttgacacctcgtttgggaa-tgctaaatagggaaataactgcaatattagtctaat 17041297  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  17041296 gcatattaacatggataagatgtatgaatatatagttacatataagttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatgac 17041197  T
Q  219 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagc 318  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17041196 ttataatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtactccgttggccaagtaaaattgttgaaacaaatgaaaattaagc 17041097  T
Q  319 atcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17041096 atcaatcccgcatgtgcatttatagctagcaccatttgac 17041057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 317
Target Start/End: Original strand, 19168153 - 19168449
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19168153 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcttttcagaattattcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacaggaaaataactacaatattagt-taa 19168251  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19168252 tgcatatttacatggataagatgtctgcgaatatagttacatataatttttaaaataaaggtagtataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 19168351  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168352 cttctaatttatcttcctat--agtctagataactgcatgcatgtacaatatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 19168449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 10822436 - 10822780
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10822436 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaatttttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaacagagaaataactgcaatattagtctaa 10822535  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10822536 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatatgatttataaaatgaaggtagcaaaactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 10822635  T
Q  218 ctt-------ctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 310  Q
      |       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10822636 agtagcataactaatttatcttcctatatagtatagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccacgttggccaattaacattgttgaaacaaatgga 10822735  T
Q  311 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10822736 aattaagcatcactcccgcatgtgcatttatagctagcaccattt 10822780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3710677 - 3710326
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3710677 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 3710578  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3710577 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 3710478  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3710477 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 3710378  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3710377 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 3710326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 11866739 - 11867090
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  11866739 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 11866838  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11866839 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 11866938  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11866939 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 11867038  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11867039 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 11867090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14752955 - 14752604
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14752955 catcaatgagagtgattgttttacgcttttctttcagaattgttcttgacacctcatttgggaaatgctaaacatggaaataactgcaatattagtctaa 14752856  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14752855 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 14752756  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14752755 cttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 14752656  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     | |||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14752655 cgaaaattatgcatcgctcccacatgtgcatctatagctagcaccatttgac 14752604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 18093223 - 18093573
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18093223 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacatctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 18093322  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18093323 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcat-actgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 18093421  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18093422 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgctgaaacaga 18093521  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18093522 tgaaaattaagcatcgcttccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 18093573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 35358132 - 35358483
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  35358132 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 35358231  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35358232 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 35358331  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35358332 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 35358431  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35358432 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 35358483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 45205528 - 45205884
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45205528 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttctttacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactacaatattagtctaa 45205627  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacata-----taatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtag 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  45205628 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttaatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgcac 45205727  T
Q  213 cataacttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaa 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45205728 catgacttctaatttatcttcctattatcttaatataaagtctagataaatgcatgcatctacattatatgtacctcgttgaccaattaacatttttgaa 45205827  T
Q  302 acaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  45205828 acaaatagaaattaagcatcacttccgcatgggcatatatagcttgcacaatttgac 45205884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 1515500 - 1515851
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||    
T  1515500 catcaatgagagtgaatgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacatctcgtttgggaaatgctaaacagataaataaaaacaatattagtctaa 1515599  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1515600 tgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 1515699  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515700 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 1515799  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1515800 tgaaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 1515851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17037051 - 17036734
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17037051 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 17036952  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17036951 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaagaaaatgtaccatga 17036852  T
Q  218 cttctaatttatctt-----------cctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17036851 cttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 17036752  T
Q  307 tggaaattaagcatcact 324  Q
    |||||||||| |||||||    
T  17036751 tggaaattaaacatcact 17036734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17091559 - 17091242
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17091559 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 17091460  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17091459 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaagaaaatgtaccatga 17091360  T
Q  218 cttctaatttatctt-----------cctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17091359 cttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 17091260  T
Q  307 tggaaattaagcatcact 324  Q
    |||||||||| |||||||    
T  17091259 tggaaattaaacatcact 17091242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 9917199 - 9917553
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9917199 catcaatgagagtgattgctttaagcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatactaaacaggaaaataagaacaatattagtctaa 9917298  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattt---taagctaaagaaaatgtagca 214  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |    
T  9917299 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaataagctaaagaaaatgtatta 9917398  T
Q  215 taacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaac 303  Q
    | |||||||||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9917399 tgacttctaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaatattgttgaaac 9917498  T
Q  304 aaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9917499 aaatggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 9917553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17025374 - 17025057
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17025374 catcaataagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 17025275  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17025274 tgcatattattatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaagaaaatgtaccatga 17025175  T
Q  218 cttctaatttatctt-----------cctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17025174 cttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaatattgttgaaacaaa 17025075  T
Q  307 tggaaattaagcatcact 324  Q
    ||||||| || |||||||    
T  17025074 tggaaatgaaacatcact 17025057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11448148 - 11447955
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11448148 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaagagggaaataacttcaatattagtctaa 11448049  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgta 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448048 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatatattttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgta 11447955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 6343343 - 6343572
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  6343343 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 6343441  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6343442 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 6343541  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6343542 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 6343572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 14323827 - 14324056
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  14323827 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 14323925  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14323926 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 14324025  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14324026 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 14324056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28501943 - 28501714
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat- 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  28501943 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcttatt 28501845  T
Q  238 ----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
              ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28501844 atcttcctagaaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 28501745  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28501744 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 28501714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 1993555 - 1993784
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  1993555 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 1993653  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1993654 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaagcatcactccc 1993753  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1993754 acatgtgcatctatagctagcaccatttgac 1993784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11447212 - 11447080
Alignment:
Q  226 ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11447212 ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaacccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaagcatcactt 11447113  T
Q  326 ccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447112 ccgcatgtgcatatatagctagcaccatctgac 11447080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18813974 - 18813623
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813974 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 18813875  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18813874 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 18813775  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813774 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 18813675  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813674 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 18813623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34687342 - 34686991
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687342 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 34687243  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34687242 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 34687143  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687142 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 34687043  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687042 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 34686991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 41830544 - 41830895
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830544 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 41830643  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41830644 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 41830743  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830744 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 41830843  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830844 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 41830895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 52522063 - 52522411
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  52522063 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaataggaaaataactgcagtattagtctaa 52522162  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  52522163 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataattgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 52522262  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52522263 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaactaacattgttgaaacaaa 52522362  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52522363 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 52522411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15315005 - 15314665
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15315005 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 15314906  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15314905 tgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 15314806  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314805 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 15314706  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15314705 catcactccttcatttgcatttatagctatcaccatttgac 15314665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 38845719 - 38846070
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845719 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattattcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 38845818  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38845819 tgcatatttacatggataagatgtatttgaatatatttacatataatttataaaataaaggtagcatgactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 38845918  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845919 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaacgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 38846018  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38846019 tgaaaattaagcatcacttccgcacgtgcatatatagctagcaccatttgac 38846070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31619444 - 31619093
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31619444 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgccaaacagaaaaataactgcaatattagtttaa 31619345  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31619344 tgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 31619245  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619244 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 31619145  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31619144 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctggcatcatttgac 31619093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4891869 - 4891533
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4891869 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 4891770  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  4891769 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 4891670  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4891669 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 4891570  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4891569 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 4891533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 29186618 - 29186954
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  29186618 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 29186717  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  29186718 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 29186817  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29186818 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 29186917  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29186918 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 29186954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 41963426 - 41963776
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41963426 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttcacaccccgtttgagaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtataat 41963525  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41963526 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcgtaactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgac 41963625  T
Q  219 ttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaat 307  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41963626 ttctaatttatcatcctcttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccattgaccaattaacattgttgaaacaaat 41963725  T
Q  308 ggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  41963726 ggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccggtaccatttgac 41963776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33361472 - 33361142
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  33361472 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcatttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 33361373  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33361372 tattaacatggataa------tgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 33361279  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361278 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 33361179  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33361178 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 33361142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34691870 - 34691529
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34691870 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaatatgaaaataactgcaatattagtctaa 34691771  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  34691770 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatag----------tttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacacga 34691681  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691680 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcgtgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 34691581  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691580 tggaaattaagcttcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 34691529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 51966228 - 51966568
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||    
T  51966228 catcaatgagagtgattgttttgcgtattccttttagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtttaa 51966327  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51966328 tacatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatataggtagcataattgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 51966427  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51966428 cttctaatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaactccgttgaccaattaacattgttgatacaaatggaaattaag 51966527  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51966528 catctctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 51966568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50560779 - 50560457
Alignment:
Q  36 ttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgcatatttacatggata 135  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50560779 ttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctagtgcatattaacatggata 50560680  T
Q  136 agatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcct 235  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  50560679 agacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaagatagcataactgattttaagctaaataaaatgtatcatgacttctaatttatcttcct 50560580  T
Q  236 ataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgc 335  Q
    | |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  50560579 aaaaaggctagataaattcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaagcatcgctcccgcatgtgc 50560480  T
Q  336 atatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  50560479 atctatagctagcaccatttgac 50560457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48340084 - 48339728
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48340084 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcataattgttcttgacacctcatttgagaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 48339985  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataa-----tttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtag 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  48339984 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttaatttataaaataaaggtatcataactgattttaagttaaagaaaatgcac 48339885  T
Q  213 cataacttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaa 301  Q
    ||| | ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48339884 catgatttctaatttatcttcctattatcttaatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtacctcgttgaccaattaacatttttgaa 48339785  T
Q  302 acaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  48339784 acaaatagaaattaagcatcacttccgcatgggcatatatagctagcataatttgac 48339728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 28566214 - 28566563
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  28566214 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttaacacatcgtttgggaaatgctaaa--gggagataactgcaatattagtctaa 28566311  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  28566312 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtaccatga 28566411  T
Q  218 cttctaatttatc-----------ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28566412 cttctaatttatcttcctattatattcctataaagtctagatatatgcatgcatgtggattatatgtaccctgttggccaattaacattgttgaaacaaa 28566511  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28566512 tggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatttatagctaacaccatttgac 28566563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52309589 - 52309238
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  52309589 catcaacgagagtgattgttttgtgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgagaaatgctacacagggaaataacaacaatattagtctaa 52309490  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  52309489 tgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcatgactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 52309390  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||            ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52309389 cttctaatttatcttcctattatcttcttaagaaggctaggtaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaga 52309290  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52309289 tgcaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 52309238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12714232 - 12713881
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12714232 catcaatgagagtgattgttttgcgattttctttcagaattgtttttaacacatcgtttggaaaatgctaaacagggagataactgcaatattagtctaa 12714133  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  12714132 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtatcataactgattttaagttaaaaaaaatgtaccatga 12714033  T
Q  218 cttctaatttatc-----------ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||           |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12714032 cttctaatttatctttctattatattcctataaagtctagattaatgcatgcatgtggattatatgcaccttgttggccaattaacattgttgaaacaaa 12713933  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12713932 tggaaattaagcatcactcctgcatgtgcatttatagctaacaccatttgac 12713881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42682145 - 42681794
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  42682145 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 42682046  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  42682045 tggatattaacatggataaaatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatga 42681946  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||| |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  42681945 cttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaatcccgttgaccaactaatattattgaaacaaa 42681846  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42681845 tggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 42681794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 29841182 - 29841533
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  29841182 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 29841281  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  29841282 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagataaagaaaatgtattatga 29841381  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||| |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  29841382 cttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaactaatatcgttgaaacaaa 29841481  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29841482 tggaaattaagcaccgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 29841533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 10694689 - 10695035
Alignment:
Q  23 atgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgcat 122  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  10694689 atgagtgtgattgttttgcaccttccttttagaattgttcttgacaccttgtttgagaaatgctaaacagtgaaataacaacaatattagtctaatgcat 10694788  T
Q  123 atttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttct 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  10694789 attaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataacttactttaagctaaagaaaatgtatcatgacctct 10694888  T
Q  223 aat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaa 311  Q
    |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694889 aattgatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaacctcgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaa 10694988  T
Q  312 attaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10694989 actaagcattactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 10695035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 13662900 - 13663245
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  13662900 catcaatgagagtgatt-ttttgcgcttttctttcagaattgttcttaataccttgtttgggaaatgctaaa--gggagataactgcaatattagtctaa 13662996  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  13662997 tgcatattaacatggataagatgtatgttaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtaccatga 13663096  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13663097 cttctaatgtatcgtcctattatattcctataaaatctagataaatgcatgcatgtggattatatgtacctcgttggccaattaacattgttgaaacaaa 13663196  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  13663197 tggaaattaagcatcactcctgcatgcgcatttatagctaacaccattt 13663245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18111351 - 18111122
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat- 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  18111351 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 18111253  T
Q  238 ----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
              ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18111252 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 18111153  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18111152 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 18111122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 43255170 - 43255399
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  43255170 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 43255268  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43255269 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 43255368  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43255369 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 43255399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 50395584 - 50395813
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  50395584 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 50395682  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50395683 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 50395782  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50395783 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 50395813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10763137 - 10763030
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  10763137 catcaattagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 10763038  T
Q  118 tgcatatt 125  Q
    ||||||||    
T  10763037 tgcatatt 10763030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10763023 - 10762958
Alignment:
Q  293 attgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10763023 attgttgaaacaaatggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 10762958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 19831920 - 19832260
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19831920 catcaatgatagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgttaaacaagaaaataactgcaatattagtctaa 19832019  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19832020 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttgagctaaagaaaatgtagcatga 19832119  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19832120 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatctacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaag 19832219  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19832220 catcacttccgcatgtgtatatatagctagcaccatttgac 19832260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 28135589 - 28135929
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28135589 catcattgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactacaatattagtctaa 28135688  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  28135689 tgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatttttatctaaagaaaatgtagcatga 28135788  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135789 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtactccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 28135888  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135889 catcactttcgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 28135929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33503521 - 33503861
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33503521 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcaaaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaataggaaaataactgcaatattagtctaa 33503620  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33503621 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 33503720  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33503721 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtatctcgttaatcaattaacattgttgaaacaaatggagattaag 33503820  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33503821 catcacttccgcatctgcataaatagctagcaccatttgac 33503861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36856854 - 36856519
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36856854 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 36856755  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36856754 tacatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaagtatcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 36856655  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36856654 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacatt-ttgaaacaaattgaaattaag 36856556  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36856555 catcacttccgcat-tgcatatatagctagcatcattt 36856519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 14830034 - 14830385
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830034 catcaatgagagtgattgttttacgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgccaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 14830133  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14830134 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 14830233  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830234 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 14830333  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14830334 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcatcatttgac 14830385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 34057087 - 34057438
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057087 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacgtcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 34057186  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34057187 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgac 34057286  T
Q  219 ttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaat 307  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057287 ttctaatttatcatcatattatcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaat 34057386  T
Q  308 gg-aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057387 ggaaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 34057438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 54332166 - 54332516
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54332166 catcaatgagagtgattgttttgcgctt-cctttcacaattgttcttgacacctcgtttgggaaaggctaaataggaaaataactgcaatattagtctaa 54332264  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  54332265 tgcatatttacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 54332364  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332365 cttctaatttatcatcatattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 54332464  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54332465 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccaattgac 54332516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19590601 - 19590261
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  19590601 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgttaaacagggaaataactgtaatattagtataa 19590502  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  19590501 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaataaaatgtaccatga 19590402  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19590401 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgtatcccattgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaag 19590302  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19590301 catcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 19590261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53342181 - 53341825
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattag 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  53342181 atggtcatcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataattgcactattag 53342082  T
Q  113 tctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53342081 tctaatgcatatttacatggataagatatatgcgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtag 53341982  T
Q  213 cataacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaa 301  Q
    ||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53341981 catgacttctaatttgtcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgaatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgag 53341882  T
Q  302 acaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53341881 acaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccagcaccatttgac 53341825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 28120744 - 28121083
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28120744 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacgcctcgttttggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctga 28120843  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  28120844 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagt-acatataatttataaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 28120942  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28120943 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatccatgtgcattatatgtaccctattgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 28121042  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28121043 catcactcctgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 28121083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23478676 - 23478323
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23478676 catcaatgagaatgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtctaa 23478577  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaag-ctaaag-aaaatgtagcat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  23478576 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagactaaagtaaaatgtaacat 23478477  T
Q  216 aacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaaca 304  Q
     |||||||||           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478476 gacttctaatttattatcctattatcttcctataaagtctagataaacgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaaca 23478377  T
Q  305 aatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23478376 aatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccagcaccatttgac 23478323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 39715037 - 39715373
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  39715037 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 39715136  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39715137 tattaacatagataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 39715236  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39715237 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 39715336  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715337 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 39715373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52800794 - 52800458
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  52800794 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 52800695  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  52800694 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 52800595  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52800594 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 52800495  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52800494 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 52800458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13627814 - 13627467
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13627814 aatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattaatctaatcca 13627715  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  13627714 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaaactaaaaaaaatgtagcatgacttc 13627615  T
Q  222 taatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 310  Q
    ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13627614 taatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcattcatgtacattacatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 13627515  T
Q  311 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13627514 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagaaccatttgac 13627467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 55999220 - 55999571
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55999220 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 55999319  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55999320 tgcatatttacatgtataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 55999419  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||| ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55999420 cttataatttatcttgatattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgaacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaataaa 55999519  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  55999520 tgaaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatacaactagaacaatttgac 55999571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 10259846 - 10260197
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  10259846 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 10259945  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10259946 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 10260045  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10260046 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 10260145  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10260146 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 10260197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21564609 - 21564258
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  21564609 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 21564510  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21564509 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 21564410  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21564409 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 21564310  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21564309 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 21564258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 24077915 - 24078266
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24077915 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 24078014  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24078015 tgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 24078114  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24078115 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 24078214  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24078215 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 24078266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 26924785 - 26925136
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  26924785 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 26924884  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26924885 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 26924984  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924985 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 26925084  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26925085 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 26925136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43332130 - 43331779
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  43332130 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 43332031  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43332030 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 43331931  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43331930 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 43331831  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43331830 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 43331779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51452197 - 51451846
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  51452197 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 51452098  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51452097 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 51451998  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51451997 cttctaatttatttttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 51451898  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51451897 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 51451846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17739806 - 17739455
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  17739806 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaacatggaaataacaacaatattagtctaa 17739707  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17739706 tgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 17739607  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||  || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739606 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaagctggataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 17739507  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17739506 tggaaattaagcatcgcttcctcatttgcatctatagttagtaccatttgac 17739455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1944257 - 1943920
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944257 catcaatgagagtgattgttttacgcctttctttcagaatttttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 1944158  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1944157 tgcatattaacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 1944058  T
Q  218 ctt-------ctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 310  Q
      |       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  1944057 agtagcataactaatttatcttcctatagagtatagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccctgttggccaattaacattgttgaaacagatgg- 1943959  T
Q  311 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagca 349  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  1943958 aattaagcatccctcccgcatgtgcatttatagctagca 1943920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40621914 - 40621561
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40621914 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgttaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 40621815  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40621814 tacatattaacatggataagacgtatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 40621715  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621714 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaatgctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccctgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 40621615  T
Q  307 tgg--aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40621614 tggaaaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccgtttgac 40621561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 35496066 - 35496386
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||                     
T  35496066 catcaatgagagtgataattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaacatgaaaataa----------------- 35496148  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35496149 ---atatttacatgggtaagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 35496245  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35496246 cttctaatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaactgatggaaattaag 35496345  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35496346 catcactctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 35496386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 47720592 - 47720933
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47720592 catcaatgatagtgattgttttgcgcatttctttcagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatactaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 47720691  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||||| ||| |    
T  47720692 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtggca----------taagctaaagaaaatgtaccatga 47720781  T
Q  218 cttctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47720782 cttctaatttatcttcatattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtgaattatatgtacctcgttggctaattaacattgttgaaacaaa 47720881  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47720882 cggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcatcatttgac 47720933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17698942 - 17698723
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698942 catcaatgagattgattgttttgcgctttcctttcagaattgtttttgacacttcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 17698843  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17698842 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatatttacatataatttataaaataaaggtaccataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 17698743  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat 237  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  17698742 cttctaatttatctttctat 17698723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 135 - 358
Target Start/End: Original strand, 39745486 - 39745720
Alignment:
Q  135 aagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat----- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||         
T  39745486 aagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaaaaaaatgtagcatgacttctaatttatcttcc 39745585  T
Q  230 ------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcac 323  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39745586 tattatcttcctatagagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcac 39745685  T
Q  324 ttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39745686 ttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 39745720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 574669 - 575001
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  574669 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgttcgggaaatgctaaacagggaaattagaacaatattagtctaa 574768  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  || |    
T  574769 tgcatattaacatagataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactga---taagctaaagaaaatgtattatga 574865  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  574866 cttctaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaatattgttgaaacaaa 574965  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatata 342  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  574966 tggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctata 575001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15520492 - 15520263
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat- 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  15520492 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 15520394  T
Q  238 ----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
              ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520393 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 15520294  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15520293 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 15520263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 160 - 357
Target Start/End: Original strand, 5274409 - 5274617
Alignment:
Q  160 ataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatc-----------ttcctataaagtctagat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  5274409 ataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatgacttctaatttatcatcatatcatcttcctataaagtctagat 5274508  T
Q  249 aaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5274509 aaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccaac 5274608  T
Q  349 accatttga 357  Q
    |||||||||    
T  5274609 accatttga 5274617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 740923 - 741152
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  740923 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 741021  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  741022 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgatgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 741121  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  741122 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 741152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 26870807 - 26870995
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26870807 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 26870906  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26870907 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 26870995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 5272778 - 5272925
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5272778 catcgatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatactaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 5272877  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5272878 tgcatatttacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatt 5272925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 7644307 - 7644456
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7644307 catcaatgagagtgactgttttgcgctttcctttcagaattgttcttaacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataattgcaatatcagtctaa 7644406  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7644407 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 7644456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 159 - 355
Target Start/End: Original strand, 7644773 - 7644980
Alignment:
Q  159 tataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat-----------cttcctataaagtctaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  7644773 tataatttataaaataaaggtagcataactgattttacgctaaagaaaatgtagcatgacgtctaatttatcttcatattatcttcctataaagtctaga 7644872  T
Q  248 taaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctag 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7644873 taaatgcatgcatgtacattatatgtagcccgttgaccaattaacattgttaaaacaaatgggaattaatcatcacttctgcatatgcatatatagctag 7644972  T
Q  348 caccattt 355  Q
    ||||||||    
T  7644973 caccattt 7644980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 37702126 - 37702267
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702126 aatgagagtgattgaattgcgctttcctttcagaattgtttttgacaccttgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 37702225  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702226 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataa 37702267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 231 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17698548 - 17698421
Alignment:
Q  231 ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698548 ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaacccgttgaccgattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgca 17698449  T
Q  331 tgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698448 tgtgcatatatagctagcaccatttgac 17698421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 39743269 - 39743392
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39743269 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacgggaaaataactgtaatattagtctaa 39743368  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgt 141  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  39743369 tgtatatttacatggataagatgt 39743392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38007610 - 38007492
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38007610 catcaatgagagtgatttttttgcactttccgttcagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgttatacaggaaaataactgcaatatcagtctaa 38007511  T
Q  118 tgcatatttacatggataa 136  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38007510 tgcatatttacatggataa 38007492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Original strand, 35708151 - 35708258
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  35708151 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 35708250  T
Q  118 tgcatatt 125  Q
    ||||||||    
T  35708251 tgcatatt 35708258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 3839895 - 3839969
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  3839895 atcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctccttcggtaaatgctaaacagg 3839969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 358
Target Start/End: Original strand, 35712922 - 35712984
Alignment:
Q  296 gttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35712922 gttgaaacaaatggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 35712984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 1073779 - 1074130
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073779 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 1073878  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1073879 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 1073978  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073979 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 1074078  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074079 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 1074130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4424092 - 4423764
Alignment:
Q  29 gtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgcatatttac 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4424092 gtgaatgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtctaatgc-tatttac 4423994  T
Q  129 atggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaattta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4423993 atggataaaatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatgacttctaattta 4423894  T
Q  229 tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423893 tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttaaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccg 4423794  T
Q  329 catgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423793 catgtgcatatatagctagcaccatttgac 4423764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 18599502 - 18599853
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599502 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 18599601  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18599602 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 18599701  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599702 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 18599801  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599802 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 18599853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 14888453 - 14888804
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888453 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 14888552  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14888553 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 14888652  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14888653 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaatgaacattgttgaaacaaa 14888752  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888753 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 14888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 11945985 - 11946336
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11945985 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 11946084  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11946085 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 11946184  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946185 cttctaatttatcatcctattatcttactataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 11946284  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946285 tggaaattaagcatcacttctgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 11946336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34855686 - 34855335
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855686 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 34855587  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34855586 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 34855487  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855486 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccctgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 34855387  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34855386 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcatcatttgac 34855335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7222475 - 7222124
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222475 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 7222376  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  7222375 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatacagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgcagcatga 7222276  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222275 cttctaatttctcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 7222176  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222175 tggaaattacgcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 7222124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15275389 - 15275038
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||    
T  15275389 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagttcaatattagtataa 15275290  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15275289 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtagcatga 15275190  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275189 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgaatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 15275090  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15275089 tggaaattaagcatcactttcgcatgtgaatatatagctagcaccatttgac 15275038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2520894 - 2520543
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520894 catcaatgagagtgattgttttgcactttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgttaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 2520795  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2520794 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtatcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 2520695  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520694 cttctaatttatcatcctattatctacctataaagtctagataaatgcatgcaagtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 2520595  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2520594 tggaaattaagcatctcttccgcatgtgcatatatagccaacaccatttgac 2520543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 9979579 - 9979915
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  9979579 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 9979678  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  9979679 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 9979778  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9979779 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 9979878  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9979879 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 9979915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24445696 - 24445360
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  24445696 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 24445597  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  24445596 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 24445497  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24445496 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 24445397  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24445396 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 24445360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33978693 - 33978353
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |    
T  33978693 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattattcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataattgtaatattagtatga 33978594  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  33978593 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaataaaatgtaccatga 33978494  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33978493 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaacattattgaaacaaatgaaaattaag 33978394  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33978393 catcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 33978353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25532980 - 25532645
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25532980 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 25532881  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25532880 tattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 25532781  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532780 taatttatcttccta-aaatgctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 25532682  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25532681 actcccgcatgtgcatgtatagatagcaccatttgac 25532645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Original strand, 11935196 - 11935515
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935196 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 11935295  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11935296 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaatgtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 11935395  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935396 cttctaatttatcatcctattatcttactataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 11935495  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttc 326  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11935496 tggaaattaagcatcacttc 11935515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1220287 - 1219957
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  1220287 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 1220188  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1220187 tattaacatggataa------tgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 1220094  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220093 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 1219994  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1219993 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 1219957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 7219380 - 7219731
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7219380 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttcttgacacctcatttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaataatagtctaa 7219479  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  7219480 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatctaatttataaaataaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtaccatga 7219579  T
Q  218 cttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7219580 cttctaatttatcttcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgatcaattaacattgttgaaacaaa 7219679  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  7219680 tggaaattaagcatcacttccgcattggcatatatagctagcacaatttgac 7219731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17939253 - 17938902
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17939253 catcaatgatagtgattgctttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacatcatttgagaaatgctaaatagggaaataactgcaatattagtctaa 17939154  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17939153 tgcatatttacatggataagatgtattcgaatatagttacaaataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaagaacatgtagcataa 17939054  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939053 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattaaatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 17938954  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938953 tggaaattaaacatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 17938902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33321969 - 33322320
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  33321969 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgcgaaacagagaaataacaacaatattagtctaa 33322068  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33322069 tgcatattaacatggataagacgtatgcagatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 33322168  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322169 cttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 33322268  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33322269 tggaaattaagcatcgcttccacatttgcatctatagctagcaccatttgac 33322320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 249643 - 249292
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  249643 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 249544  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  249543 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 249444  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  249443 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 249344  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  249343 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 249292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 12580312 - 12580663
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  12580312 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 12580411  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12580412 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 12580511  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12580512 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaacatttttgaaacaaa 12580611  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12580612 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 12580663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34320823 - 34320472
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  34320823 catcaatgagagtgatagttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgtgaaatgctaaacagggaaataacaacaacattagtctaa 34320724  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  34320723 tacatattaacatggatgagatttatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagataaagaaaatgtattatga 34320624  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34320623 cttctaatatatgttcctattatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtgaattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 34320524  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34320523 tgaaaattaaacatcactcccgcttgtgcatctatatctagcaccatttgac 34320472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1931761 - 1931423
Alignment:
Q  21 caatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1931761 caatgagagtgattgttttgcacttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaacagagaaataactgcaatattagtctaatgc 1931662  T
Q  121 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataactt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1931661 atattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagca----------taagctaaagaaaatgtatcatgactt 1931572  T
Q  221 ctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 309  Q
    |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||    
T  1931571 ctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggctaattaacattgttgaagcaaacgg 1931472  T
Q  310 aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||| |||| || | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  1931471 aaattaaacatcgctcctgcatgggcatctatagctagcatcatttgac 1931423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 22374357 - 22374719
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22374357 catcaatgagaatgactgttttgcactttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagaaaaataactgcaatattagtctaa 22374456  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatata-----atttataaaataa-----aggtagcataactg---attttaagctaaaga 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     |  ||||||||||     || || ||||  ||   || |||  |||||||    
T  22374457 tgcatatttacatggataagatatatgcgaatatagttacatatatatgtaactataaaataatttatagtta-catatatgcgaatattagtctaaaga 22374555  T
Q  205 aaatgtagcataacttctaatttatcttcctat----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacat 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22374556 aaatgtagcatgacttctaatttatcttcttattatcttcttaaaagtctagataaatgcatgcatgtatattatatgttccccgttgaccaattaacat 22374655  T
Q  295 tgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374656 tgttgaaacaaatggaaattaaacatcacttctgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 22374719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 13457350 - 13457579
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  13457350 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 13457448  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13457449 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 13457548  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13457549 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 13457579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4424218 - 4424087
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4424218 catcattgagaatgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaagaaaataactgcaatattagtctaa 4424119  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4424118 tgcatatttacatggataagatgtatgtgaat 4424087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 358
Target Start/End: Original strand, 1080374 - 1080458
Alignment:
Q  274 accccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1080374 accccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagccaacaccatttgac 1080458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14831216 - 14831133
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14831216 catcaatgagagtgattgttttgcgctttctttttagaattgttcttaacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataac 14831133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9675 - 9324
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9675 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 9576  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9575 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 9476  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9475 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 9376  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9375 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 9324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19520917 - 19520574
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19520917 catcaatgagagtgattgttttgcgcttccctttcaaaattgtttttgacacctcgtttgggaaatgctaaagaggaaaataactgcaatattagtctaa 19520818  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19520817 tgcatatttacattgataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 19520718  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtcc---attatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaatt 314  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520717 tttctagtttatcttcctataaagtctagataaattcatgcatgtgcatgattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaatt 19520618  T
Q  315 aagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520617 aagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 19520574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 23766951 - 23767302
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766951 catcaatgagagtgattgttttgcgttttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 23767050  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23767051 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcatgactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 23767150  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767151 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 23767250  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767251 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 23767302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5962450 - 5962099
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962450 catcaatgagaatgattgttttgcgctttcctttcagaaatgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 5962351  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5962350 tgcatatttacatggataaaatgtatgcgaatataattacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 5962251  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  5962250 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattaataaaacaaa 5962151  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962150 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 5962099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33030546 - 33030208
Alignment:
Q  19 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||    
T  33030546 atcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaatagaaaaataactgcaatattagcataat 33030447  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33030446 gcatatttacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaa-taaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcgtgac 33030348  T
Q  219 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33030347 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgtatgtatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattcttgaaacaaatgaaaattaagc 33030248  T
Q  319 atcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33030247 accacttccgcatgtgcatatatagctagtaccatttgac 33030208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 8926403 - 8926754
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8926403 catcaatgagagtgatttttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaataggaaaataactgcaatattagtctaa 8926502  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8926503 tgcatatttacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 8926602  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||| ||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926603 cttttaatttatcatcctattatcttcctgtaaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 8926702  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8926703 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatttatagccagcaccatttgac 8926754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 42245368 - 42245705
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245368 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcctttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 42245467  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  42245468 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaactgtaccatga 42245567  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245568 cttctaatttatcttcctataaagtttggataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgtttgccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 42245667  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245668 catcactctcgcatgtgcatctatagctagcaccattt 42245705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17477640 - 17477300
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17477640 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataattgcaatattagtctaa 17477541  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17477540 tgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaatatagcatga 17477441  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17477440 cttaaaatttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaag 17477341  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477340 aatcacttccacatgtgcatatatagctagcaccatttgac 17477300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 17575574 - 17575914
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17575574 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataattgcaatattagtctaa 17575673  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17575674 tgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaatatagcatga 17575773  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17575774 cttaaaatttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaag 17575873  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575874 aatcacttccacatgtgcatatatagctagcaccatttgac 17575914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14308681 - 14308330
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14308681 catcaatgagagtgattgttttgcgctttactttcagaattgttcttgacacatcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataacaacaatattagtctaa 14308582  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14308581 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 14308482  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308481 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaacccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 14308382  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14308381 tggaaattaaacatcacttccgcatgtgtatatatagccagcaccatttgac 14308330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17482087 - 17481746
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17482087 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataattgcaatattagtctaa 17481988  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagct-aaagaaaatgtagcata 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||     
T  17481987 tgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaaatatagcatg 17481888  T
Q  217 acttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 316  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17481887 acttaaaatttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaa 17481788  T
Q  317 gcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17481787 gaatcacttccacatgtgcatatatagctagcaccatttgac 17481746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 17571127 - 17571468
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17571127 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataattgcaatattagtctaa 17571226  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagct-aaagaaaatgtagcata 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||     
T  17571227 tgcatatttacatggataaaatgtatgcaaatatagttacatatagtttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaaatatagcatg 17571326  T
Q  217 acttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaa 316  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17571327 acttaaaatttatcttcctataaaggctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaa 17571426  T
Q  317 gcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571427 gaatcacttccacatgtgcatatatagctagcaccatttgac 17571468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17170795 - 17170459
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  17170795 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 17170696  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  17170695 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 17170596  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17170595 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 17170496  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17170495 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 17170459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 31898306 - 31898642
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  31898306 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggcaataacaacaatattagtctaatgca 31898405  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31898406 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 31898505  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31898506 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 31898605  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31898606 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 31898642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Original strand, 39649464 - 39649803
Alignment:
Q  21 caatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatat--tagtctaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||    
T  39649464 caatgagagtgattgttttgcgatttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatatattagtctaat 39649563  T
Q  119 gcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataac 218  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39649564 gcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgac 39649663  T
Q  219 ttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagc 318  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649664 ttctaatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagc 39649763  T
Q  319 atcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39649764 atcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 39649803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42687303 - 42686969
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687303 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacttcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 42687204  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42687203 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagatacatgtaatttataaaataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtagcatga 42687104  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    | ||||||||||||||||||      ||  |   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42687103 cctctaatttatcttcctat------tatcttcctgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaataaatggaaattaag 42687010  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687009 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 42686969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47174227 - 47173894
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47174227 catcaattagagcgactgttttgcgctttcctttcagaattattcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtttaa 47174128  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  47174127 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatataattatatataatttataaagtaaaggtagcataaccgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 47174028  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47174027 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcacgcatgtgcattatatgtacctcgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaacttaag 47173928  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcacc 351  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47173927 catcactcccgcatgtgcatctatagctagcacc 47173894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 48528275 - 48528612
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  48528275 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 48528374  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48528375 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 48528474  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaa-acaaatggaaattaagcat 320  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48528475 taatttatcttcgtaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaacacagatggaaattaagcat 48528574  T
Q  321 cacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48528575 cgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 48528612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 9226733 - 9227084
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9226733 catcaatgagagtgattgttttacgcttttctttcaaaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaatagggaaataactgcaatattagtctaa 9226832  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9226833 tgcatattaacatggataagatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 9226932  T
Q  218 cttctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9226933 cttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 9227032  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9227033 cggaaattaagcatcgctcccgcatatgcatctatagctagcaccatttgac 9227084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 23300232 - 23300572
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  23300232 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgttcggaaaatgctaaacatggaaataacaacaatattagtctaa 23300331  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23300332 tgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatgtaatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 23300431  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23300432 cttttaatatatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattataggatccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 23300531  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23300532 cattactcccgcatgtgcatttatagctagcaccatttgac 23300572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 19034168 - 19034519
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  19034168 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 19034267  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19034268 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 19034367  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19034368 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 19034467  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19034468 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 19034519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20720468 - 20720117
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20720468 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 20720369  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20720368 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 20720269  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20720268 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 20720169  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20720168 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 20720117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29490708 - 29490357
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29490708 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgtaatattaatctaa 29490609  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29490608 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 29490509  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29490508 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 29490409  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29490408 tgaaaattaagcatcactcccgaatgtgcatctatagctaacaccatttgac 29490357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42917601 - 42917250
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  42917601 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 42917502  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  42917501 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattcataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatga 42917402  T
Q  218 cttctaatttatcttcc-----------tataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||||           ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42917401 cttctaatttatcttcctattatcttcatatgaaggttagataaatgcatgcatgtgcattatatgaacttcgttaaccaattaacattgttgaaacaaa 42917302  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  42917301 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcgtctataggtagcaccatttgac 42917250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33230474 - 33230825
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  33230474 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 33230573  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33230574 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 33230673  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33230674 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtacccctttgaccaattaacatttttgaaacaaa 33230773  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33230774 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctacagctagcaccatttgac 33230825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 34282617 - 34282968
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  34282617 catcaatgagagtgattattttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 34282716  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34282717 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 34282816  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34282817 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 34282916  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34282917 tgaaaattaagcatcattcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 34282968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20765129 - 20764779
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20765129 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacatggaaataactgtaatattaatctaa 20765030  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20765029 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 20764930  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20764929 cttctaatttatctttctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccgttgaccaattaacatttttgaaacaaa 20764830  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20764829 tgaaaattaagcatcac-tccccatgtgcatctatagctaacaccatttgac 20764779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 27735561 - 27735912
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  27735561 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcatttgtgaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaa 27735660  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  27735661 tgcatattaacatggataagacgtatgtgaatatagttacatataatttataaaagaaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtatcatga 27735760  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||           |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27735761 cttctaatttatcttcctattatcttcctgaaaaggctagaaaaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgacaaattaacattgttgaaacaga 27735860  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27735861 tggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatttatagctagcaccatttgac 27735912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33639187 - 33639538
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||     
T  33639187 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcatttgggaaatgctaaatagggaaataaaaacaatattagtctat 33639286  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33639287 tacatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 33639386  T
Q  218 cttctaatttatc-----------ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
     ||||||||||||           |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639387 attctaatttatcttcatattattttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 33639486  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33639487 tgaaaattaaacatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 33639538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9149112 - 9148761
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  9149112 catcaatgagagtgattgtttttcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaaggaaataacaacaatattagtctaa 9149013  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9149012 tgcatattaacatggataagacatatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagaataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatga 9148913  T
Q  218 cttctaattta-----------tcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||           |||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9148912 cttctaatttatctttctattatcttcctaaaaagggtagataaatacattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaga 9148813  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9148812 tgaaaattaagtatcgctcccgcatgtgcatctatagctaacaccatttgac 9148761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 47164064 - 47164419
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  47164064 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaatttttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatatgactctaa 47164163  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaat--------- 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  47164164 tgcatattaacatggataagatgtatgcaaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccagga 47164263  T
Q  209 -gtagcataact------tct--aatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttg 299  Q
     |||||||||||      |||  |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47164264 agtagcataactaatttatcttcatattatcttcctatagagtatagataaatgcatgcatgtgaactatatgtatcccgttggccaattaacattgttg 47164363  T
Q  300 aaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47164364 aaacaaatggaaattaagcatcactctcgcatgtgcatttatagctagcaccattt 47164419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3795261 - 3794910
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  3795261 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattattcttgacacctcgtttgagaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 3795162  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  3795161 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagataaagaaaatgtattatga 3795062  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||| |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  3795061 cttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaactaatatcgttgaaacaaa 3794962  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3794961 tggaaattaagcaccgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 3794910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 358
Target Start/End: Original strand, 4481783 - 4482063
Alignment:
Q  89 acaggaaaataactgcaatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataact 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4481783 acagggaaataactgcaatattagtttaatgcatattaacatagataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataatt 4481882  T
Q  189 gattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccc 277  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  4481883 gattttaaactaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgtatatggattatatgtaccc 4481982  T
Q  278 cgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4481983 cgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 4482063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 6911977 - 6912206
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  6911977 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 6912075  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6912076 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 6912175  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6912176 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 6912206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Original strand, 47573955 - 47574184
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat--------- 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||             
T  47573955 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 47574053  T
Q  230 --cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47574054 atcttcctataaagtctagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 47574153  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47574154 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 47574184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 38435062 - 38435250
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38435062 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 38435161  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  38435162 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 38435250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42996204 - 42996016
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42996204 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 42996105  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  42996104 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 42996016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4881984 - 4881648
Alignment:
Q  20 tcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4881984 tcaatgagagtgattgttttgtgctttcctttcagaattgttcttgacgcctcgtttgggaaatgttaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatg 4881885  T
Q  120 catatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataact 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4881884 catatttacatggataagatgtat-cgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgatcttaagctaaagaaaatgtagcatgact 4881786  T
Q  220 tctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4881785 tctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtatattatatgtaccctgttgaccaattaacattgttgaaataaatgaaaattaagca 4881686  T
Q  320 tcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttga 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4881685 tcacttctgcatgtgcatatatagctagcaccatttga 4881648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 1852436 - 1852774
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852436 catcaatgagagtgattgttttgtgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 1852535  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1852536 tgcatatttacatggataagatatacacgaatataa--acatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcatga 1852633  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852634 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgtatgcatgtacattatatgtaccctgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 1852733  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1852734 tatcactttcgcatgtgcatatatagctagcacgatttgac 1852774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 20996450 - 20996801
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20996450 catcaatgagagtgatagttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 20996549  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20996550 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataacatattttaagctaaagaaaacgtaacatga 20996649  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20996650 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 20996749  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20996750 tggaaattaagcatcacttctgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 20996801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21029821 - 21029470
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21029821 catcaatgagagtgattgatttgcgctttcctttaagaattgttcttgacacctcgtttggaaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtgtaa 21029722  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  21029721 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagtttga 21029622  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029621 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 21029522  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029521 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 21029470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 26321581 - 26321932
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321581 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 26321680  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26321681 tgaatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 26321780  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321781 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcactccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 26321880  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26321881 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcatcatttgac 26321932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2194878 - 2194527
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194878 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacttcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 2194779  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2194778 tgcatatttacatggataagatgtatgtgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 2194679  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194678 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 2194579  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2194578 tgaaaattaagcattacttccgcatgtgcatatatagccagcaccatttgac 2194527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20349636 - 20349302
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20349636 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 20349537  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20349536 tgcatatttacatggataaaatgtatcc------agttacatataatttattaaataaaggtaccataactgattttaagctaaaaaaaatgtagcatga 20349443  T
Q  218 cttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaag 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20349442 cttataatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttcaaacaaatggaaattaag 20349343  T
Q  318 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349342 catcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 20349302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 25697033 - 25697366
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25697033 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataacaacaatattagtctaatgca 25697132  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25697133 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 25697232  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25697233 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 25697332  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25697333 actcccgcatgtgcatctatagctagcaccattt 25697366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30142273 - 30141936
Alignment:
Q  21 caatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  30142273 caatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgaaacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgc 30142174  T
Q  121 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataactt 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30142173 atattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgactt 30142074  T
Q  221 ctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcat 320  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142073 ctaatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcat 30141974  T
Q  321 cacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30141973 cactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 30141936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 33611646 - 33611997
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  33611646 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgtttttgacacctcgtttgggaaatgctaaatatgaaaataactgcaatattagtataa 33611745  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  33611746 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacacga 33611845  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611846 cttctaatttatcatcctattatcttcctataaagtctagataaatgcaagcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 33611945  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611946 tagaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 33611997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7285390 - 7285039
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7285390 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacatatcgtttgggaaatgttaaacaggaaaataattgcaatattagtctaa 7285291  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7285290 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatctataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 7285191  T
Q  218 cttctaatt-----------tatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7285190 cttctaatttatcatcttattatcttccaataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccattgaccaattaacattgttgaaacaaa 7285091  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7285090 tggaaattaagcatcacttccacatgtgcatatatagttagcaccatttgac 7285039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27065613 - 27065264
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27065613 catcaatgagag--attgctttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaataggagaataactgcaatattagtctaa 27065516  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  27065515 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagtataactgattttaaactaaagaaaatgtagcatga 27065416  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27065415 cttctaaattatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattattgaaacaaa 27065316  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27065315 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatacagctagcaccatttgac 27065264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34717359 - 34717023
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  34717359 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttaacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 34717260  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  34717259 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 34717160  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34717159 taatttatcttcctaaaaaggttagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 34717060  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34717059 actcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 34717023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 3151110 - 3151460
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3151110 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttaacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataacttcaatattagtctaa 3151209  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3151210 tgcatatttacatggataagatatatgcgaatataattacatataatttataaaataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtagcatta 3151309  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3151310 cttctaatttatcttcatattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtacattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaac 3151409  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3151410 t-aaaattaagcatcacttctgcatgtgcacatatagctagctccatttgac 3151460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41691045 - 41690709
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  41691045 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 41690946  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  41690945 tattaacatggataagacatatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttt 41690846  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41690845 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 41690746  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41690745 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 41690709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30689022 - 30688677
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689022 catcaataagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 30688923  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  30688922 tgcatat------ggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacttga 30688829  T
Q  218 cttctaatttatc-----------ttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||| ||||||           |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688828 cttctactttatcatcctattatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtacattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 30688729  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30688728 tggaaattaagcatcacttccacatgtgcatatatagccagcaccatctgac 30688677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 3397644 - 3397998
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397644 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcaaaattgttcttgacacctcttttgggaaatgataaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 3397743  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatg----tatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagc 213  Q
    | ||||||||||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397744 tacatatttacatagataagatgatcttatgcaaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagc 3397843  T
Q  214 ataacttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaa 302  Q
    || |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397844 atgacttctaatttatcttcccattatcttcctataaagtctagataaatgtatacatgtaca-tatatttaccccgttgaccaattaacattgttgaaa 3397942  T
Q  303 caaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397943 caaatggaaattaagcatcacttttgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 3397998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37464097 - 37463746
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  37464097 catcaatgagagtgattattttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctagtttgggaaatgctaaacagggaaataactgtaatattaatctaa 37463998  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37463997 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttatatataacttatgaaatgaaggtaacataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 37463898  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37463897 cttctaatttatcttcctattatcttcctataaagtctagagaaatgcatgcatgtgcattatatgtaccccattgaccaattaacatttttgaaacaaa 37463798  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37463797 tgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 37463746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 3210704 - 3211054
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  3210704 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcataatttttcttaacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacgacaatattagtctaa 3210803  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3210804 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatgtaatttataaaatgaatgtagcataattcattttaagctaaagaaaatgtatcatga 3210903  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3210904 cttctaatttatcttcccattatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtggattatatgta-cccgttggccaattaatattgttgaaacaaa 3211002  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3211003 tggaaattaagcttcactcccgcatgcgcatttatagctagcaccatttgac 3211054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9701965 - 9701648
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9701965 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacaccttgtttgggaaatgctaaacacggaaataactgcaatattagtctaa 9701866  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9701865 tgcatattaacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgatagattttaagctaaagaaaatgtaccatga 9701766  T
Q  218 cttctaatttatctt-----------cctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9701765 cttctaatttatcttcctactatcttcctataaattctagataaatgcatgcatgtagattatatgtaccccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 9701666  T
Q  307 tggaaattaagcatcact 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9701665 tggaaattaagcatcact 9701648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 290321 - 289973
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  290321 catcaatgagagtgcttgttttacgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagagaaataactacaatattagtctaa 290222  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || |    
T  290221 tgcatattaacatggataagatatatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaaactaaagaaaatatacaatga 290122  T
Q  218 cttctaatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  290121 cttctaatttatcttcctattagcttcctataaagtctaggtaaatgcatgcatgtagattatatgtatcccgttggccaattaacattgttgaaacaaa 290022  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
       |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  290021 caaaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccattt 289973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 12588786 - 12589137
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||    
T  12588786 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagaacaatattaatctaa 12588885  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  12588886 tggatattaacatggataaaatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatga 12588985  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||| |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12588986 cttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaactaatattattgaaacaaa 12589085  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12589086 tggaaattaagcatcgctctcgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 12589137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 166 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3028014 - 3027822
Alignment:
Q  166 tataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtcca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3028014 tataaaataaaggtagcataactgattttaagctatagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtaca 3027915  T
Q  266 ttatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3027914 ttatatgtaccacgttgaccaattaacattgttgaaataaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 3027822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 139 - 355
Target Start/End: Original strand, 31296170 - 31296385
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31296170 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctata 31296268  T
Q  239 aagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcata 338  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31296269 aagtttagataaatacatgtatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactcccgcatgtgcatc 31296368  T
Q  339 tatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||||||    
T  31296369 tatagctagcaccattt 31296385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19395079 - 19394851
Alignment:
Q  139 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat- 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  19395079 tgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcttaactgattt-aagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctatt 19394981  T
Q  238 ----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttcc 327  Q
              ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19394980 atcttcttataaagtctagataaatacatgtat-tgcattatatgaacctcgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcactccc 19394882  T
Q  328 gcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19394881 gcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 19394851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19447716 - 19447546
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgt--tttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtct 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19447716 catcaatgagagtgattgtgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacatctcatttgagaaatgctaaacaggaaaataactacaatattagtct 19447617  T
Q  116 aatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19447616 aatgcatatttacatggataagatgtatacgaatatagttatatataatttataaaataaaggtagcataa 19447546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3028458 - 3028312
Alignment:
Q  21 caatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3028458 caatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgtttttgacacctcatttgagaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtccaatac 3028359  T
Q  121 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028358 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataattta 3028312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 26868 - 27219
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26868 catcaatgagagtgattgttttacgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgccaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 26967  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26968 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaacatga 27067  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27068 cttctaatttatcatcctattatcttcatataaagtctagataaatgcatgcatgtgcattatatgcaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 27167  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27168 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcatcatttgac 27219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 18898 - 19234
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18898 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 18997  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18998 tattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttc 19097  T
Q  222 taatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatc 321  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19098 taatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacagatggaaattaagcatc 19197  T
Q  322 acttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19198 gctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 19234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 119783 - 119443
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  119783 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattattcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataaccacaatattagtctaatgca 119684  T
Q  122 tatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttc 221  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  119683 tattaacatggataagatgtaagtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatgacttc 119584  T
Q  222 taatttatcttc-----------ctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 310  Q
    ||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  119583 taatttatcttcctattatcttcctataaagtctagataaatgaatgcatgtgcattatatgtaccccgttgagcaattaacattgttgaaacaaatgaa 119484  T
Q  311 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcacc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  119483 aattaagcatcacttccgcatgtgcatctatagccagcacc 119443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Original strand, 65143 - 65480
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65143 catcaatgagagtgattgttttgcgcctttctttcagaatttttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 65242  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  65243 tgcatattaacatggataagatgtattcgaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtaccatga 65342  T
Q  218 ctt-------ctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgga 310  Q
      |       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  65343 agtagcataactaatttatcttcctatagagtatagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccctgttggccaattaacattgttgaaacagatgg- 65441  T
Q  311 aattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagca 349  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  65442 aattaagcatccctcccgcatgtgcatttatagctagca 65480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 152662 - 153010
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  152662 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttccttcagaattgttcttgacaccttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 152761  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  152762 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcataactgattttaagttaaagaaaatgtaccatga 152861  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    ||||||||           |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  152862 cttctaatgtatcgtcctattatattcctataaaatctagataaatgcatgcatgtggattatatgtacctcgttggccaattaacattgttgaaacaaa 152961  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccattt 355  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  152962 tggaaattaagcatcactcctgcatgcgcatttatagctaacaccattt 153010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 4597 - 4877
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  4597 catcaatgagagtgattgctttgcgcttttcttttagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacagggaaataagaacaatattagtctaa 4696  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  4697 tgcatattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtattatga 4796  T
Q  218 cttctaat-----------ttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaa 287  Q
    |||| |||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4797 cttcaaatttattttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaa 4877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49798 - 49464
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  49798 catcaatgagagtgattgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacacctcgtttaggaaatgctaaatagagaaataattgcaacattagtctaa 49699  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataa 217  Q
    |||||||| |||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||| ||| |    
T  49698 tgcatattaaca-------gatgtatgtgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataa----------gctaaataaaatgtaccatga 49616  T
Q  218 cttctaatttatcttcctat-----------aaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||           |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49615 cttctaatttatattcctattagcttcttataaagcctagataaatgcatgcatgtggattatatgtaccccgttggctaattaacattgttgaaacaaa 49516  T
Q  307 tggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49515 tagaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcatcatttgac 49464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13395 - 13200
Alignment:
Q  163 atttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctataaagtctagataaatgcatgcatgt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  13395 atttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctaaaaaggctagataaatgcattcatgt 13296  T
Q  263 ccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13295 gcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 13200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13502 - 13394
Alignment:
Q  22 aatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13502 aatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctcgttttggaaatgctaaacagggaaataacaacaatattagtctaatgca 13403  T
Q  122 tatttacat 130  Q
    |||| ||||    
T  13402 tattaacat 13394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 1
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  165 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaatagctgcaatattagtctaa 66  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagc 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65 tgcatatttacatggataggatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 354
Target Start/End: Original strand, 4866 - 5110
Alignment:
Q  121 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataactt 220  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||    
T  4866 atattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatatataatgactt 4965  T
Q  221 ctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 309  Q
    || ||||||           ||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4966 ctgatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatccactcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 5065  T
Q  310 aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatt 354  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5066 aaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatt 5110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 354
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11559
Alignment:
Q  121 atatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataactt 220  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||    
T  11315 atattaacatggataagacgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaataaaatatataatgactt 11414  T
Q  221 ctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 309  Q
    || ||||||           ||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11415 ctgatttatcttcctattatcttcctaaaaaggctagataaatccactcatgtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatgg 11514  T
Q  310 aaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatt 354  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11515 aaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatt 11559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1086 - 898
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1086 catcaatgagaatgtttgttttgcgcttttctttcagaattgttcttgacactttttttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaa 987  T
Q  118 tgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  986 tgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaatgaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 358
Target Start/End: Original strand, 13493 - 13705
Alignment:
Q  157 catataatttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcctat-----------aaagtcta 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||           |||| |||    
T  13493 catataagttataaaataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatctttctattatcttcataaaaaggcta 13592  T
Q  246 gataaatgcatgcatgtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagct 345  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13593 gataaaagcattcatgtgcattatatgagcccaattgaccaattaacattgttgaaacaaatgaaaattaagcatcactcccgcatgtgcatctatagct 13692  T
Q  346 agcaccatttgac 358  Q
    ||||| |||||||    
T  13693 agcactatttgac 13705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Original strand, 13439 - 13493
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctc 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13439 catcaatgagagtgattgttttgcgctttccttttagaattgttcttgacacctc 13493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 54664 - 54796
Alignment:
Q  74 tttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaatgcatatttacatggataagatgtatgcgaatatagttacatataatttataaaat 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54664 tttgggaaatgctaaacagggaaataactgcaatattagtctaatgcatattaacatggataagatgtatgggaatatagttacatataatttataaaat 54763  T
Q  174 aaaggtagcataactgattttaagctaaagaaa 206  Q
     |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54764 gaaggtagcatgacaaattttaagctaaagaaa 54796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 358
Target Start/End: Original strand, 10991 - 11188
Alignment:
Q  172 ataaaggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttat-----------cttcctataaagtctagataaatgcatgcat 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||           ||||||| ||||  |||||||||||||  ||    
T  10991 ataaaggtagcataactaattttaagctaaagaaaatgtatcatgacttctaatttatcttcctattatcttcctaaaaaggttagataaatgcattgat 11090  T
Q  261 gtccattatatgtaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaatggaaattaagcatcacttccgcatgtgcatatatagctagcaccatttgac 358  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11091 gtgcattatatgaaccccgttgaccaattaacattgttgaaacaaataaaaattaagcatcgctcccgcatgtgcatctatagctagcaccatttgac 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Original strand, 30505 - 30612
Alignment:
Q  18 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttcataattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaacaggaaaataactgcaatattagtctaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  30505 catcaatgagagtgattgttttgcgctttcctttaagaattgttcttgacacctcgtttgggaaatgctaaatagggaaataacaacaatattagtctaa 30604  T
Q  118 tgcatatt 125  Q
    ||||||||    
T  30605 tgcatatt 30612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1555 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1555
Description:

Target: scaffold1555; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Original strand, 1521 - 1648
Alignment:
Q  176 aggtagcataactgattttaagctaaagaaaatgtagcataacttctaatttatcttcct-----------ataaagtctagataaatgcatgcatgtcc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1521 aggtagcataactgattttaagctacagaaaatgtaacatgacttctaatttatcttcctattatcatcctataaagtctagataaatgcatgcatgtac 1620  T
Q  265 attatatgtaccccgttgaccaattaac 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1621 attatatgtaccccgttgaccaattaac 1648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University