View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_138 (Length: 349)

Name: NF11737A_low_138
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_138
NF11737A_low_138
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (16-326)||(3532104-3532414)
chr4 (16-326)||(16173815-16174125)
chr4 (16-326)||(3617249-3617559)
chr4 (16-326)||(8992750-8993060)
chr4 (16-326)||(13111528-13111838)
chr4 (17-326)||(2214084-2214393)
chr4 (17-326)||(46916311-46916620)
chr4 (17-326)||(53182906-53183215)
chr4 (17-326)||(34436939-34437245)
chr4 (16-326)||(33605097-33605407)
chr4 (16-262)||(28900296-28900541)
chr4 (17-250)||(28445936-28446170)
chr4 (17-72)||(36657469-36657524)
chr4 (19-58)||(12159090-12159129)
chr4 (271-326)||(28446182-28446237)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (16-326)||(1957018-1957328)
chr8 (16-326)||(15054597-15054907)
chr8 (17-326)||(35100396-35100705)
chr8 (17-326)||(30531345-30531654)
chr8 (17-326)||(38205791-38206100)
chr8 (17-326)||(13815900-13816209)
chr8 (17-326)||(17742668-17742959)
chr8 (17-110)||(5213244-5213337)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (16-326)||(22657638-22657948)
chr7 (16-326)||(36519470-36519780)
chr7 (17-326)||(22192172-22192481)
chr7 (16-301)||(40301312-40301597)
chr7 (17-326)||(26813100-26813409)
chr7 (17-326)||(32129042-32129351)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (16-326)||(17960059-17960369)
chr6 (16-326)||(34839546-34839855)
chr6 (17-326)||(6379298-6379607)
chr6 (17-326)||(632479-632788)
chr6 (17-326)||(24932059-24932368)
chr6 (16-326)||(8219907-8220218)
chr6 (17-262)||(7539941-7540183)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (16-326)||(32975365-32975675)
chr5 (16-326)||(40889861-40890171)
chr5 (16-326)||(27943457-27943766)
chr5 (17-326)||(31012655-31012964)
chr5 (17-326)||(4577958-4578267)
chr5 (72-326)||(29618397-29618650)
chr5 (97-326)||(9274069-9274298)
chr5 (286-326)||(30647215-30647255)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (16-326)||(30417225-30417535)
chr3 (17-326)||(17467479-17467788)
chr3 (16-326)||(6047491-6047801)
chr3 (17-326)||(42561866-42562175)
chr3 (17-326)||(25831533-25831842)
chr3 (17-326)||(47145130-47145439)
chr3 (17-326)||(25789576-25789885)
chr3 (17-326)||(33749645-33749954)
chr3 (17-326)||(21226252-21226561)
chr3 (17-326)||(42600314-42600623)
chr3 (18-326)||(50017957-50018263)
chr3 (19-326)||(51428057-51428364)
chr3 (97-326)||(33189641-33189870)
chr3 (20-326)||(21231215-21231517)
chr3 (16-221)||(30691178-30691384)
chr3 (231-326)||(51974086-51974181)
chr3 (218-326)||(30689916-30690023)
chr3 (19-65)||(49027655-49027701)
chr3 (16-58)||(43474852-43474894)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (16-326)||(7587298-7587608)
chr2 (16-326)||(30821378-30821688)
chr2 (16-326)||(22350409-22350719)
chr2 (17-326)||(12855982-12856291)
chr2 (17-326)||(8853020-8853329)
chr2 (19-326)||(31206706-31207011)
chr2 (17-326)||(40880534-40880848)
chr2 (28-326)||(2779597-2779895)
chr2 (20-326)||(39432794-39433098)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (16-326)||(2477124-2477434)
chr1 (16-326)||(45240102-45240412)
chr1 (16-326)||(48386903-48387213)
chr1 (17-326)||(31469090-31469399)
chr1 (16-326)||(48405292-48405596)
chr1 (16-326)||(47299296-47299607)
chr1 (16-326)||(17680061-17680371)
chr1 (17-326)||(33165334-33165642)
chr1 (16-326)||(8469283-8469592)
chr1 (17-326)||(17784326-17784635)
chr1 (17-326)||(51521157-51521464)
chr1 (16-97)||(10265986-10266067)
[»] scaffold1240 (1 HSPs)
scaffold1240 (17-327)||(1567-1877)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (17-326)||(29344-29654)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (149-326)||(168038-168215)
scaffold0007 (19-153)||(169499-169633)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3532414 - 3532104
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532414 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 3532315  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532314 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 3532215  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532214 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 3532115  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  3532114 tattttgatgt 3532104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16174125 - 16173815
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174125 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 16174026  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174025 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 16173926  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16173925 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 16173826  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  16173825 tattttgatgt 16173815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3617559 - 3617249
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617559 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 3617460  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617459 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 3617360  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3617359 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 3617260  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  3617259 tattttgatgt 3617249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 8992750 - 8993060
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992750 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 8992849  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992850 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 8992949  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8992950 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 8993049  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  8993050 tattttgatgt 8993060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 13111528 - 13111838
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111528 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 13111627  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111628 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 13111727  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13111728 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 13111827  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  13111828 tattttgatgt 13111838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2214393 - 2214084
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214393 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 2214294  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214293 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 2214194  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2214193 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 2214094  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  2214093 atttttatgt 2214084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46916620 - 46916311
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46916620 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagaggcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 46916521  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46916520 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 46916421  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46916420 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 46916321  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  46916320 attttgatgt 46916311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 53183215 - 53182906
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53183215 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttccagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 53183116  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53183115 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactgccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtattctttg 53183016  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  53183015 caggtcatcttgggttggtgctctcaaatacacttcctcatagagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcattccaatgttgtactacttcct 53182916  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  53182915 attttaatgt 53182906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34437245 - 34436939
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34437245 ggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactacttcaagaataactgtggtggttcccttatctcccctggtgaattgacctt 34437146  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||     
T  34437145 cacatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaata---ccgatcatccctcggaactcttgcatttcacttacatgtagtattctttc 34437049  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  34437048 caggtcatcttgggttggtgctctagagtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgatgtactacttcct 34436949  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  34436948 attttgatgt 34436939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 33605097 - 33605407
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33605097 tggacatccaaaaaaggcatgtcaaatccatagatcatgagatgcaacttctttaagaataactgttgtgtttcccttatcccccccggtgaattgacct 33605196  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33605197 tcacatgctgtaggataatttttccacttccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccacatttcactaacatgtaatattcttt 33605296  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  33605297 gcaggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacagtcatatgattcctttgcataatctaagtaagcactccaatgatgtactacttcc 33605396  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  33605397 tattttgatgt 33605407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Original strand, 28900296 - 28900541
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaa-ggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28900296 tggacatccaaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggttgttcccttatcccc--tggtaaattgacc 28900393  T
Q  115 ttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28900394 ttcccatgctttaggacaatttttccactctcagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctaggaacccctgcatttcactaacatgtagtattctt 28900493  T
Q  215 tgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaat 262  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28900494 tgaagatcatcttgggttggtgctcttaggtacacttgcttatacaat 28900541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 28445936 - 28446170
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccc-tggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28445936 ggacatccaaaaaaggcatgctagatccatagatcatgagatgcaattgcttcaagaataattgtagtggttcccttatccccccctggtaaattgacct 28446035  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28446036 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcattcatgggaacccgcgcatttcactaacatgtagtatccttt 28446135  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacact 250  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28446136 gcaggtcatcttgggttggtactctcaagtacact 28446170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 36657469 - 36657524
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36657469 ggacatccaaaaaaggcatgccaaatccatagatcatgagatgcaactgcttcaag 36657524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 12159090 - 12159129
Alignment:
Q  19 acatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12159090 acatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagat 12159129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Original strand, 28446182 - 28446237
Alignment:
Q  271 tcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  28446182 tcctttacaaaatccaagtaagcactccaatgttgtaccacttcctattttgatgt 28446237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1957328 - 1957018
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957328 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 1957229  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957228 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 1957129  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1957128 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 1957029  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  1957028 tattttgatgt 1957018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 15054597 - 15054907
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15054597 tggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccttggtgaattgacct 15054696  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15054697 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcaatcaatactcccgatcatccctgggaacccctgcatttcactaacatgtagtattcttt 15054796  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15054797 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 15054896  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  15054897 tattttgatgt 15054907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 35100396 - 35100705
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100396 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 35100495  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100496 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 35100595  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35100596 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtaatacctcct 35100695  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  35100696 atttttatgt 35100705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30531654 - 30531345
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30531654 ggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 30531555  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30531554 cccatgctttaggataatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 30531455  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30531454 caggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacagtcgtatgattcatctgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtactacttcct 30531355  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  30531354 attttgatgt 30531345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 38206100 - 38205791
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38206100 ggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgttgtggttcccttatcccccctgttgaattgacctt 38206001  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38206000 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactccggatcatccctggaaacccccgcatttcactaacatgtagtattttttg 38205901  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38205900 caggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgctgtactacttcct 38205801  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  38205800 attttgatgt 38205791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 13815900 - 13816209
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13815900 ggacatccaaaaaatgcatgctagatccatagatcatgagatgcaactgcttccagaataactgtggtggttcccttatcccccttggtaaattgacctt 13815999  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816000 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactgccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 13816099  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  13816100 caggtcatcttgggttggtgctcgcaaatacacttcctcatagagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtatgcattccaatgatgtactacttcct 13816199  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  13816200 attttgatgt 13816209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 17742668 - 17742959
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17742668 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataattgtggtggttcccttatccccc-tggtaaattgacctt 17742766  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742767 cccatgctttaggaaaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 17742866  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||                  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  17742867 caggtcatcttgggttgg-----------------gctcatacaatcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgctgtactacttcct 17742949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 5213244 - 5213337
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5213244 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagacgcaactgcttccagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaatt 5213337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 22657638 - 22657948
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22657638 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 22657737  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22657738 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 22657837  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22657838 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgatgtagtacctcc 22657937  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  22657938 tattttgatgt 22657948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 36519470 - 36519780
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36519470 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 36519569  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36519570 tcccatgctttaggacaatatttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 36519669  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36519670 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 36519769  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  36519770 tattttgatgt 36519780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 22192172 - 22192481
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22192172 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 22192271  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22192272 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 22192371  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22192372 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 22192471  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  22192472 atttttatgt 22192481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40301597 - 40301312
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301597 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 40301498  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40301497 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactctcgatcatccctgagaacccccacatttcactaacatgtggtattcttt 40301398  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301397 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaat 40301312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 26813100 - 26813409
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26813100 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactggtgtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 26813199  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26813200 cccatcctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattttttg 26813299  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26813300 caggtcatcttgggttggtgctctcaattacacttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtaatacttcct 26813399  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  26813400 attttgatgt 26813409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32129351 - 32129042
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32129351 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgttgtggttcccttatccccccaggtgaattgacatt 32129252  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32129251 cccatcctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctaggaacccctgcatttcactaacatgtagtattttttg 32129152  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  32129151 caggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgctgtactacttcct 32129052  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  32129051 attttgatgt 32129042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17960369 - 17960059
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960369 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 17960270  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960269 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 17960170  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17960169 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 17960070  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  17960069 tattttgatgt 17960059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 34839546 - 34839855
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34839546 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaact-cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 34839644  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34839645 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 34839744  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34839745 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 34839844  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  34839845 tattttgatgt 34839855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6379607 - 6379298
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6379607 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 6379508  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6379507 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 6379408  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6379407 aaggtcatcttgggttggtgctctcaggtacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 6379308  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  6379307 attttgatgt 6379298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 632479 - 632788
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  632479 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctgatgaattgacctt 632578  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  632579 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaaccctcgcatttcactaacatgtagtattctttg 632678  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  632679 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 632778  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  632779 atttttatgt 632788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24932368 - 24932059
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932368 ggacatccaaaaaaggcatgctagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgttgtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 24932269  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24932268 cccatcctttaggacaatttttccactcccaatgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaatccccgcatttcactaacatgtagtattttttg 24932169  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24932168 caggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacattcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtactacttcct 24932069  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  24932068 attttgatgt 24932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 8219907 - 8220218
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatccccc-ctggtgaattgacc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8219907 tggacatccaaaaaaagcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgaggtggttcccttatccccctctggtaaattgacc 8220006  T
Q  115 ttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8220007 ttcccatgttttaggacaatttttccactcccaatgcatgcaatcaatactcccgatcatccttaggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 8220106  T
Q  215 tgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctc 314  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8220107 tgaaggtaatcttgggttggtgctctcaggtacactcgctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctc 8220206  T
Q  315 ctattttgatgt 326  Q
     |||||||||||    
T  8220207 atattttgatgt 8220218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 7539941 - 7540183
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  7539941 ggacatctaaaaaaggcatgccagatctatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataaccgtggtggttccctta-cccccctattaaattgacctt 7540039  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||| |||    
T  7540040 cccatgctttaggacaaattttccactcacaatgcatgtagttaatactcccgatcatccctgggaatccccgcatttcactagcaagta--attcattg 7540137  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaat 262  Q
     |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  7540138 caggtcatcttgggttgatgccctcaggtacagttgctcatacaat 7540183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32975675 - 32975365
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32975675 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 32975576  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32975575 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 32975476  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32975475 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 32975376  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  32975375 tattttgatgt 32975365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 40889861 - 40890171
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889861 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 40889960  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889961 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 40890060  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40890061 gaaggtcatcttggtttggtgctctaaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 40890160  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  40890161 tattttgatgt 40890171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 27943457 - 27943766
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27943457 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccc-ctggtgaattgacct 27943555  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27943556 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccctgcatttcactaacatgtagtattcttt 27943655  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27943656 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttgcagaatctacgtaagcactcaaatgctgtagtacctcc 27943755  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  27943756 tattttgatgt 27943766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31012964 - 31012655
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012964 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 31012865  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012864 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 31012765  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31012764 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 31012665  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  31012664 atttttatgt 31012655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 4577958 - 4578267
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4577958 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttctagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 4578057  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4578058 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactgccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcaatattctttg 4578157  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  4578158 caggtcatcttgggttggtgctctcaaatacacttcctcatagagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcattccaatgttgtactacttcct 4578257  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  4578258 attttgatgt 4578267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 72 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29618650 - 29618397
Alignment:
Q  72 gaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29618650 gaataactgtggtggttcccttatccccc-tggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgat 29618552  T
Q  172 catccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgatt 271  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29618551 cattcctgggaacccccacatttcactaacatgtagtattctttgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgatt 29618452  T
Q  272 cctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29618451 cctttacagaatctacgtaagcactccaatgatgtagtacctcctattttgatgt 29618397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9274298 - 9274069
Alignment:
Q  97 ccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttca 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9274298 ccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcctgatcatccctgggaacccccgcatttca 9274199  T
Q  197 ctaacatgtagtattctttgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcact 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9274198 ctaacatgtagtattctttgcaggtcatcttgcgttggtgctctcaagtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcact 9274099  T
Q  297 ccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9274098 ccaatgttgtaccacttcctattttgatgt 9274069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30647255 - 30647215
Alignment:
Q  286 acgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647255 acgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 30647215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30417535 - 30417225
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30417535 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 30417436  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30417435 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 30417336  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30417335 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 30417236  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  30417235 tattttgatgt 30417225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 17467479 - 17467788
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467479 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 17467578  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467579 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 17467678  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17467679 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 17467778  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  17467779 attttgatgt 17467788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6047801 - 6047491
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6047801 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 6047702  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6047701 tcccatgctttaggacaatttttccactcccaatgcatgcagtcaatgctcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtattcttt 6047602  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6047601 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 6047502  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  6047501 tattttgatgt 6047491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 42561866 - 42562175
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561866 ggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcataagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 42561965  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561966 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatgctcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 42562065  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42562066 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtcgtacctcct 42562165  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  42562166 attttgatgt 42562175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25831842 - 25831533
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25831842 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 25831743  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831742 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 25831643  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25831642 aaggtcatcttgggttggtgctctcaggtacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 25831543  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  25831542 attttgatgt 25831533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 47145130 - 47145439
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47145130 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 47145229  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47145230 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 47145329  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47145330 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacactttctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 47145429  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  47145430 atttttatgt 47145439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25789885 - 25789576
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789885 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 25789786  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789785 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 25789686  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25789685 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 25789586  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  25789585 atttttatgt 25789576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 33749645 - 33749954
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33749645 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 33749744  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749745 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagttaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 33749844  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33749845 caggtcatcttgggttggtgctctcaattacacttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtactacttcct 33749944  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  33749945 attttgatgt 33749954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 21226252 - 21226561
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  21226252 ggacatccaaaaaaggcatgccaaatccatagatcatgagatgaaactgcttcaagaataactgtgatggttcccttatcccccttagtaaattgacctt 21226351  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21226352 cccatgctttaggacaatttttccactctcagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtattatttg 21226451  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21226452 caggtcatcttgggttggtgctctcaggtacacttgttcatacaatcgtatgatttctttacaaaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 21226551  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  21226552 attttgatgt 21226561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42600623 - 42600314
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42600623 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttctagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 42600524  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42600523 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactgccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcaatattctttg 42600424  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  42600423 caggtcatcttgggttggtgctctcaaatacacttcctcatagagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcattccaatgctgtactacttcct 42600324  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  42600323 attttgatgt 42600314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Original strand, 50017957 - 50018263
Alignment:
Q  18 gacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  50017957 gacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggcggttccctta--ccccctgataaattgaccttc 50018054  T
Q  118 ccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttga 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  50018055 ccatgctttaggacaatttttctactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaatatgtagtattctttgc 50018154  T
Q  218 aggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctccta 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  50018155 aggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcgtacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtactacttccta 50018254  T
Q  318 ttttgatgt 326  Q
    |||||||||    
T  50018255 ttttgatgt 50018263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 51428057 - 51428364
Alignment:
Q  19 acatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcc 118  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51428057 acatccgaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagacgcaactgcttccagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcc 51428156  T
Q  119 catgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaa 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51428157 catgctttgggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatattgccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgca 51428256  T
Q  219 ggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctat 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  51428257 ggtcatcttgggttggtgctctcaattacactttctcatatagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcattccaatgttgtactacttcctat 51428356  T
Q  319 tttgatgt 326  Q
    ||||||||    
T  51428357 tttgatgt 51428364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33189870 - 33189641
Alignment:
Q  97 ccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttca 196  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33189870 ccccctggtaaattgactttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatacagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttca 33189771  T
Q  197 ctaacatgtagtattctttgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcact 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33189770 ctaacatgtagtattttttgaaggtcatcttggattggtgctctcaggtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcact 33189671  T
Q  297 ccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33189670 ccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 33189641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21231517 - 21231215
Alignment:
Q  20 catccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttccc 119  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||  |||||    
T  21231517 catccaaaaaaggcatgtcaaatacatagatcatgagatgcaaccgcttcaaga-taattgtggtggttcc-ttatccccc-tagtaaattgagattccc 21231421  T
Q  120 atgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  21231420 atgctttaggacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactctcgatcatccctgggaacccc-gcatttcactaacatgtagtattatatgcag 21231322  T
Q  220 gtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctatt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21231321 gtcatcttgggttggtgctctcaggtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttacataatctacgtaagcatttcaatgttgtagtacctcctatt 21231222  T
Q  320 ttgatgt 326  Q
    |||||||    
T  21231221 ttgatgt 21231215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30691384 - 30691178
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccc-tggtgaattgacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30691384 tggacatccaaaaaaggcatgccagatctatagatcatgagatgcaactgcttcaacaataactgtggtggttcccttatccccccctggtaaattgacc 30691285  T
Q  115 ttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30691284 ttcccatgctttatgacaatttttctactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtattctt 30691185  T
Q  215 tgaaggt 221  Q
    || ||||    
T  30691184 tgcaggt 30691178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Original strand, 51974086 - 51974181
Alignment:
Q  231 ttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  51974086 ttggtgctctcaggtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttacataatttacgtaagcactccaaagttgtagtacatcctattttgatgt 51974181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30690023 - 30689916
Alignment:
Q  218 aggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctccta 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  30690023 aggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacaatcatatgattcctttgcagaatctaagtaggcactccaat-ttgtactacttccta 30689925  T
Q  318 ttttgatgt 326  Q
    |||||||||    
T  30689924 ttttgatgt 30689916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 49027701 - 49027655
Alignment:
Q  19 acatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 65  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49027701 acatccaagaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 49027655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 43474852 - 43474894
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43474852 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcgtgagat 43474894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7587608 - 7587298
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7587608 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 7587509  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7587508 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 7587409  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7587408 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 7587309  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  7587308 tattttgatgt 7587298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30821688 - 30821378
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821688 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 30821589  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821588 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 30821489  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30821488 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 30821389  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  30821388 tattttgatgt 30821378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22350719 - 22350409
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350719 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 22350620  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22350619 tcccatgctttaggacaatttttccactcccaatgcatgcagtcaatgctcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtattcttt 22350520  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22350519 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 22350420  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  22350419 tattttgatgt 22350409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 12855982 - 12856291
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855982 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 12856081  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856082 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaaccctcgcatttcactaacatgtagtattctttg 12856181  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12856182 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 12856281  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  12856282 atttttatgt 12856291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 8853020 - 8853329
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8853020 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcatctgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 8853119  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8853120 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctaggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 8853219  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8853220 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 8853319  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  8853320 atttttatgt 8853329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31207011 - 31206706
Alignment:
Q  19 acatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  31207011 acatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataattgtggtggttcccttatcccct-tgataaattgaccttcc 31206913  T
Q  119 catgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31206912 catgctttaggacaatttt-ccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgtgaatccccgcatttcactaacatgtagtattctttgca 31206814  T
Q  219 ggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctat 318  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  31206813 ggtcatcttggattgttgctctcaagtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactcaaatgttgtactaattcctat 31206714  T
Q  319 tttgatgt 326  Q
    ||||||||    
T  31206713 tttgatgt 31206706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40880848 - 40880534
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40880848 ggacatccgaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactacttcaagaataactgtggtggttccctcatcccctctggtgaattgacctt 40880749  T
Q  117 ccc-----atgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtatt 211  Q
    |||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  40880748 cccttcccatgctttaggataatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccatgggaaccctcgcgtttcactaacatgttgtatt 40880649  T
Q  212 ctttgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtac 311  Q
    || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40880648 ctatgcgggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtactac 40880549  T
Q  312 ctcctattttgatgt 326  Q
     ||||||||||||||    
T  40880548 ttcctattttgatgt 40880534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2779895 - 2779597
Alignment:
Q  28 aaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgcttta 127  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2779895 aaagacatgccagatccataaatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccttggtaaattgaccttcccatgcttta 2779796  T
Q  128 ggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaaggtcatctt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2779795 ggacaatttttccacttccagtgcatgcagtcaatactcctgatcatccctaggaatccccgcatttcactaacatgtagtattatttgcaggtcatctt 2779696  T
Q  228 ggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
    || || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||| || |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2779695 ggattagtgctctcaagtacacttgctcatacaatcgtatgtctcctttgcataatctaagtgagcactccaatgttgtactacttcctattttgatgt 2779597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39433098 - 39432794
Alignment:
Q  20 catccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39433098 catccaaaaaaggcatgccagatccatagatcaagagatgcaactacttctaaaataattgtggtggt-cccttatccccc-tggtaaattgaccttccc 39433001  T
Q  120 atgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaag 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39433000 atgctttaggaaaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactgccgatcatccccgggaacccccacatttcactaacatgtagtattctttgcag 39432901  T
Q  220 gtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctatt 319  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  39432900 gtcatcttgggttggtgttctcaaatacacttcctcatagagttgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcattccaatgctgtactacttcctatt 39432801  T
Q  320 ttgatgt 326  Q
    |||||||    
T  39432800 ttgatgt 39432794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2477434 - 2477124
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477434 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 2477335  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477334 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 2477235  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2477234 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 2477135  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  2477134 tattttgatgt 2477124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 45240102 - 45240412
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45240102 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 45240201  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45240202 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 45240301  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45240302 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 45240401  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  45240402 tattttgatgt 45240412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48387213 - 48386903
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387213 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 48387114  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387113 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 48387014  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48387013 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 48386914  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  48386913 tattttgatgt 48386903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 31469090 - 31469399
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31469090 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 31469189  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31469190 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 31469289  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31469290 aaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcct 31469389  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||| ||||    
T  31469390 atttttatgt 31469399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 48405292 - 48405596
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48405292 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 48405391  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48405392 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccacgcatttcactaacatgtagtattcttt 48405491  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    ||||||| ||||||||||      |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48405492 gaaggtcgtcttggtttg------tcaggtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgctgtagtacctcc 48405585  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  48405586 tattttgatgt 48405596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 47299607 - 47299296
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccc-tggtgaattgacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47299607 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagattatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatccccccctggtaaattgacc 47299508  T
Q  115 ttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47299507 ttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatggaatcaatactcccgatcatccctgtgaaaccccgcatttcactaacatgtagtattctt 47299408  T
Q  215 tgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctc 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47299407 tgaaggtcatcttgggttggtgctctcaggtacacttgctcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcacttcaatgttgtagtacctc 47299308  T
Q  315 ctattttgatgt 326  Q
    ||||||||||||    
T  47299307 ctattttgatgt 47299296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17680371 - 17680061
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacct 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17680371 tggacatccaaaaaaggcatgttagagccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctagtaaattgacct 17680272  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680271 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgtagtcaatactcccgatcatccctgggaaccctcgcatttcactaacatgtagtattcttt 17680172  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680171 gaaggtcatcttgggttggtgctctcagatacacttgctcatacagtcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 17680072  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  17680071 tattttgatgt 17680061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 33165334 - 33165642
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33165334 ggacatccaaaaaaggcatgccaaatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggctcccttatcccc-ctggtgaattgacctt 33165432  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33165433 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctaggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 33165532  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33165533 caggtcatcttgggttagtgctctcaagtacacttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatgttgtactacttcct 33165632  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  33165633 attttgatgt 33165642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Original strand, 8469283 - 8469592
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaa-ggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  8469283 tggacatccaaaaaaaggcatgtcagattcatagatcatgagatgcagctgcttcaagaataactgtggtggttcccctatccccc-tggtaaattgacc 8469381  T
Q  115 ttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469382 ttcccatgttttaggacaatttt-ccactcccagtgcatgcagtcaatacttccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctt 8469480  T
Q  215 tgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctc 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8469481 tgaaggtcatcttggattggtgctctcaggtacacttactcatacaatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgatgtagtacctc 8469580  T
Q  315 ctattttgatgt 326  Q
    ||||||||||||    
T  8469581 ctattttgatgt 8469592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 17784326 - 17784635
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17784326 ggacatccaaaaaagacatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgacctt 17784425  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17784426 cccatgctttaggataatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcagtaacatgtagtattctttg 17784525  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     | |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17784526 catgtcatcttgggttggtgctctcaagtacatttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatttaagtaagcactccaatgttgtactacttcct 17784625  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    ||||||||||    
T  17784626 attttgatgt 17784635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 51521157 - 51521464
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  51521157 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagttgcaactgcttcaagaataactgtggtggttctcttattcccc-tggtaaattgacctt 51521255  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51521256 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 51521355  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  51521356 caggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcgtacaatcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagcactccaatg-tgtactacatcct 51521454  T
Q  317 attttgatgt 326  Q
    |||| |||||    
T  51521455 atttcgatgt 51521464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10266067 - 10265986
Alignment:
Q  16 tggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266067 tggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactactttaagaataactgtggtggttcccttatcc 10265986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1877 - 1567
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgacctt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1877 ggacatccaaaaaatgcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggttaattgacctt 1778  T
Q  117 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1777 cccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccacatttcattaacatgtagtattctttg 1678  T
Q  217 aaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcct 316  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1677 caggtcatcttgggttggtgctctcaagtacatttgctcatacagtcgtatgattcctttgtagaatctaagtaagcactccaatgttgtactacttcct 1578  T
Q  317 attttgatgtc 327  Q
    |||||||||||    
T  1577 attttgatgtc 1567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29654 - 29344
Alignment:
Q  17 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccc-tggtgaattgacct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29654 ggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcataagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttccatcatccccccctggtaaattgacct 29555  T
Q  116 tcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattcttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29554 tcccatgctttaggacaatttttccactccaagtgcatgcagttaatactcccgatcatccctgggaacccctgcatttcactaacatgtagtattcttt 29455  T
Q  216 gaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtacacttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcc 315  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  29454 tcaggtcatcttgggttggtgctctcaagtacacttgctcatacagtcgtatgattcctttgcagaatctaagtaagtactccaatgctgtactacttcc 29355  T
Q  316 tattttgatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  29354 tattttgatgt 29344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 149 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 168215 - 168038
Alignment:
Q  149 tgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtattctttgaaggtcatcttggtttggtgctctcaggtaca 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168215 tgcatgcagtgaatactcccgatcatccctatgaacccttgcatttcactaacatgcagtattctttgcaggtcatcttgggttggtgctctcaggtaca 168116  T
Q  249 cttcctcatacaattgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctattttgatgt 326  Q
     || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  168115 tttgctcatataatcgtatgattcctttacagaatctacgtaagcactccaatgttgtagtacctcctatttttatgt 168038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 169633 - 169499
Alignment:
Q  19 acatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcc 118  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||     
T  169633 acatccaaaaaatgcatgtcaaatccatagatcatgagatgcaactgtttcaagaataactgtggtgcttcccttatcccccctagtaaattgaccttct 169534  T
Q  119 catgctttaggacaatttttccactcccagtgcat 153  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  169533 catgctctaggacaattttttcactcccagtgcat 169499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University