View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_208 (Length: 299)

Name: NF11737A_low_208
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_208
NF11737A_low_208
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (23-268)||(22244726-22244971)
chr5 (30-299)||(27412166-27412435)
chr5 (30-299)||(18209423-18209692)
chr5 (30-299)||(18218761-18219030)
chr5 (30-299)||(18361295-18361564)
chr5 (30-299)||(26202379-26202648)
chr5 (30-299)||(32070458-32070727)
chr5 (47-299)||(8765139-8765391)
chr5 (47-299)||(33939352-33939604)
chr5 (47-299)||(33949752-33950004)
chr5 (30-299)||(18390252-18390521)
chr5 (30-299)||(21682016-21682285)
chr5 (30-299)||(11410883-11411152)
chr5 (47-299)||(21753478-21753730)
chr5 (47-299)||(21762765-21763017)
chr5 (54-299)||(30943433-30943678)
chr5 (54-299)||(30952855-30953100)
chr5 (26-268)||(37647662-37647904)
chr5 (138-268)||(27580230-27580360)
chr5 (30-268)||(26191806-26192044)
chr5 (30-268)||(19888014-19888252)
chr5 (125-268)||(37538551-37538694)
chr5 (26-91)||(37548445-37548510)
chr5 (30-106)||(23378551-23378628)
chr5 (23-96)||(31105423-31105497)
chr5 (259-299)||(19888005-19888045)
chr5 (259-299)||(26191797-26191837)
chr5 (259-299)||(27580221-27580261)
chr5 (259-299)||(37538542-37538582)
chr5 (259-299)||(37647653-37647693)
chr5 (133-261)||(31105544-31105673)
chr5 (263-299)||(19548244-19548280)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (23-268)||(13402848-13403093)
chr4 (26-299)||(15670103-15670376)
chr4 (25-268)||(52499139-52499379)
chr4 (30-299)||(17984646-17984915)
chr4 (30-299)||(40921861-40922130)
chr4 (30-299)||(18105196-18105466)
chr4 (30-299)||(5292870-5293139)
chr4 (30-299)||(5302529-5302798)
chr4 (25-299)||(9835841-9836115)
chr4 (30-299)||(21846121-21846390)
chr4 (30-299)||(21855713-21855982)
chr4 (30-299)||(21901984-21902253)
chr4 (30-299)||(21911576-21911845)
chr4 (30-299)||(27680533-27680802)
chr4 (30-299)||(27690188-27690457)
chr4 (30-299)||(16249464-16249733)
chr4 (30-299)||(6692236-6692505)
chr4 (30-299)||(6702642-6702911)
chr4 (30-299)||(3487409-3487678)
chr4 (30-299)||(3496732-3497001)
chr4 (54-299)||(17827947-17828192)
chr4 (54-299)||(17837338-17837583)
chr4 (30-268)||(17161255-17161479)
chr4 (26-196)||(16242076-16242246)
chr4 (29-167)||(16253430-16253568)
chr4 (26-110)||(19918184-19918267)
chr4 (222-299)||(13792833-13792910)
chr4 (209-268)||(16253578-16253637)
chr4 (229-299)||(19918396-19918466)
chr4 (42-110)||(13793032-13793101)
chr4 (42-106)||(6405817-6405882)
chr4 (259-299)||(13402839-13402879)
chr4 (259-299)||(16253606-16253646)
chr4 (26-96)||(11476937-11477007)
chr4 (259-297)||(17161448-17161486)
chr4 (263-299)||(30651813-30651849)
chr4 (182-247)||(14600515-14600580)
chr4 (263-296)||(26458583-26458616)
chr4 (69-110)||(41525909-41525949)
chr4 (259-299)||(6405632-6405672)
chr4 (259-299)||(11477157-11477197)
chr4 (263-299)||(17421103-17421139)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (29-299)||(44638713-44638982)
chr2 (26-299)||(16902269-16902542)
chr2 (26-299)||(16995660-16995933)
chr2 (26-299)||(24696277-24696550)
chr2 (26-268)||(29423378-29423620)
chr2 (30-299)||(2998389-2998658)
chr2 (30-299)||(4467838-4468107)
chr2 (30-299)||(5346680-5346949)
chr2 (30-299)||(17488708-17488977)
chr2 (47-299)||(4458230-4458482)
chr2 (47-299)||(18651253-18651505)
chr2 (47-299)||(18663371-18663623)
chr2 (30-299)||(5336827-5337096)
chr2 (47-299)||(9502452-9502704)
chr2 (47-299)||(9513818-9514070)
chr2 (26-268)||(38957552-38957793)
chr2 (30-299)||(45024827-45025096)
chr2 (26-268)||(38930204-38930446)
chr2 (30-268)||(45014750-45014988)
chr2 (259-299)||(38957543-38957583)
chr2 (259-299)||(45014957-45014997)
chr2 (263-299)||(19342539-19342575)
chr2 (56-110)||(70068-70121)
chr2 (263-299)||(22902334-22902370)
chr2 (263-299)||(29423593-29423629)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (25-299)||(8540263-8540537)
chr1 (25-299)||(8605502-8605776)
chr1 (25-291)||(18383371-18383636)
chr1 (30-299)||(2370180-2370448)
chr1 (25-268)||(13964897-13965139)
chr1 (26-268)||(42034208-42034450)
chr1 (23-299)||(18058853-18059128)
chr1 (26-266)||(30549412-30549652)
chr1 (30-299)||(16154901-16155170)
chr1 (30-299)||(21458646-21458915)
chr1 (30-299)||(25019486-25019755)
chr1 (26-91)||(2116014-2116079)
chr1 (44-110)||(34822977-34823042)
chr1 (259-299)||(13965108-13965148)
chr1 (259-299)||(42034419-42034459)
chr1 (261-299)||(19748354-19748392)
chr1 (259-299)||(30549401-30549441)
chr1 (261-297)||(41543907-41543943)
chr1 (263-299)||(1974486-1974522)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (26-299)||(11767-12040)
chr3 (23-261)||(20492058-20492295)
chr3 (26-299)||(13119395-13119668)
chr3 (26-299)||(4782398-4782671)
chr3 (47-299)||(16335225-16335475)
chr3 (30-299)||(1685032-1685301)
chr3 (30-299)||(10012009-10012278)
chr3 (47-299)||(6432763-6433015)
chr3 (47-296)||(6422336-6422585)
chr3 (30-299)||(8972864-8973133)
chr3 (30-299)||(8983419-8983688)
chr3 (47-299)||(4381131-4381383)
chr3 (47-299)||(5655407-5655659)
chr3 (47-299)||(9537170-9537422)
chr3 (47-299)||(9547496-9547748)
chr3 (26-268)||(2489016-2489258)
chr3 (26-268)||(25432873-25433113)
chr3 (137-268)||(4023921-4024052)
chr3 (47-268)||(4371412-4371633)
chr3 (23-135)||(4024349-4024460)
chr3 (259-299)||(4023912-4023952)
chr3 (259-299)||(4371602-4371642)
chr3 (259-299)||(25433082-25433122)
chr3 (260-299)||(2489007-2489046)
chr3 (263-299)||(17734363-17734399)
chr3 (263-299)||(19035632-19035668)
chr3 (263-299)||(49387155-49387191)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (26-299)||(42621193-42621466)
chr7 (31-268)||(7034561-7034797)
chr7 (25-268)||(14944292-14944533)
chr7 (25-268)||(15371885-15372126)
chr7 (30-299)||(5927153-5927422)
chr7 (30-299)||(16142238-16142507)
chr7 (47-299)||(8501084-8501336)
chr7 (47-299)||(8511554-8511806)
chr7 (47-299)||(44907755-44908007)
chr7 (30-299)||(16131689-16131958)
chr7 (26-268)||(27988879-27989119)
chr7 (30-299)||(32098398-32098667)
chr7 (30-299)||(32108835-32109104)
chr7 (30-299)||(46497132-46497401)
chr7 (30-299)||(46507744-46508013)
chr7 (30-299)||(5381590-5381859)
chr7 (30-299)||(5391228-5391497)
chr7 (30-299)||(26347924-26348193)
chr7 (47-299)||(6544840-6545092)
chr7 (30-299)||(11626139-11626408)
chr7 (30-299)||(26362976-26363245)
chr7 (30-299)||(43983495-43983764)
chr7 (30-299)||(9535015-9535284)
chr7 (30-299)||(9545298-9545567)
chr7 (47-268)||(44897352-44897573)
chr7 (42-290)||(14248339-14248587)
chr7 (47-268)||(6534541-6534762)
chr7 (191-268)||(7019199-7019276)
chr7 (26-110)||(2991876-2991959)
chr7 (259-299)||(6534731-6534771)
chr7 (259-299)||(7019190-7019230)
chr7 (259-299)||(7034552-7034592)
chr7 (259-299)||(27989088-27989128)
chr7 (259-299)||(44897542-44897582)
chr7 (260-299)||(14944503-14944542)
chr7 (260-299)||(15372096-15372135)
chr7 (257-299)||(14248308-14248350)
chr7 (263-299)||(15988452-15988488)
chr7 (263-299)||(5615277-5615313)
chr7 (263-295)||(12827145-12827177)
chr7 (263-299)||(31824973-31825009)
chr7 (263-299)||(42595607-42595643)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (26-299)||(20939-21211)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (25-299)||(14045327-14045599)
chr6 (26-299)||(1596820-1597093)
chr6 (30-299)||(29540469-29540727)
chr6 (30-299)||(3285864-3286133)
chr6 (30-299)||(12455071-12455340)
chr6 (30-299)||(14791620-14791889)
chr6 (30-299)||(20912300-20912569)
chr6 (30-299)||(31357578-31357847)
chr6 (30-299)||(31367307-31367576)
chr6 (30-299)||(18160079-18160348)
chr6 (30-299)||(18169891-18170160)
chr6 (26-299)||(26020538-26020811)
chr6 (47-299)||(24930811-24931063)
chr6 (30-299)||(24921775-24922044)
chr6 (30-299)||(16897964-16898233)
chr6 (30-299)||(16908617-16908886)
chr6 (26-268)||(18201229-18201469)
chr6 (182-299)||(27787333-27787447)
chr6 (263-299)||(8563035-8563071)
chr6 (63-110)||(28092638-28092684)
chr6 (42-96)||(27787543-27787597)
chr6 (263-299)||(24361473-24361509)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (25-261)||(17268854-17269089)
chr8 (26-268)||(791751-791993)
chr8 (30-299)||(9324808-9325077)
chr8 (30-299)||(21987712-21987981)
chr8 (30-299)||(21997246-21997515)
chr8 (47-299)||(21334333-21334585)
chr8 (54-299)||(13674628-13674873)
chr8 (47-268)||(21202617-21202838)
chr8 (47-268)||(21213033-21213254)
chr8 (23-152)||(22817610-22817738)
chr8 (259-299)||(791962-792002)
chr8 (259-299)||(21202608-21202648)
chr8 (259-299)||(21213024-21213064)
chr8 (259-299)||(17269065-17269105)
chr8 (263-299)||(14437626-14437662)
chr8 (263-299)||(26362141-26362177)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (26-268)||(92664-92906)
scaffold0043 (259-299)||(92655-92695)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (103-299)||(17175-17370)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (30-299)||(309801-310070)
scaffold0005 (182-247)||(216798-216863)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (26-268)||(55631-55873)
scaffold0086 (259-299)||(55622-55662)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (26-299)||(74511-74784)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (30-299)||(233770-234039)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (26-268)||(15862-16103)
scaffold0065 (259-299)||(16072-16112)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (30-299)||(7624-7893)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (52-299)||(19146-19393)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (30-106)||(65708-65783)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (30-106)||(13837-13914)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (263-299)||(3315-3351)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (263-299)||(14243-14279)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 268
Target Start/End: Original strand, 22244726 - 22244971
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22244726 cacatgggagttggtagaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctttctcctgcaccagtccctaggc 22244825  T
Q  123 agatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattca 222  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22244826 aaacctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccataatttgattattgcccagaaactcatatgaaaagcatatcacacgcccagaaattca 22244925  T
Q  223 tgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22244926 tgtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 22244971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 27412166 - 27412435
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  27412166 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccattaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 27412264  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27412265 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 27412363  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412364 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 27412435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18209692 - 18209423
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18209692 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccacaaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18209594  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  18209593 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 18209495  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18209494 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18209423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18219030 - 18218761
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18219030 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccacaaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18218932  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  18218931 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 18218833  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218832 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18218761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 18361295 - 18361564
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18361295 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18361393  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  18361394 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 18361492  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18361493 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18361564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26202648 - 26202379
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  26202648 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 26202550  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  26202549 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 26202451  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26202450 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 26202379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 32070458 - 32070727
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  32070458 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctcttaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 32070556  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32070557 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 32070655  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32070656 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 32070727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8765391 - 8765139
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||||||||| ||| |||||    
T  8765391 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattctgggaaaggaacattctg 8765293  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8765292 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 8765194  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8765193 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8765139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 33939352 - 33939604
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  33939352 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 33939450  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33939451 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-cataacccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 33939549  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33939550 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 33939604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 33949752 - 33950004
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  33949752 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 33949850  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33949851 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-cataacccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 33949949  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33949950 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 33950004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 18390252 - 18390521
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18390252 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18390350  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  18390351 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 18390449  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18390450 tcattcttacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18390521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 21682016 - 21682285
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  21682016 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccacaaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 21682114  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21682115 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21682213  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21682214 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatggacacaacaaca 21682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11411152 - 11410883
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  11411152 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctaaaagcatgggcataaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 11411054  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  11411053 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 11410955  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11410954 tcattcatacacgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 11410883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 21753478 - 21753730
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||||||||| ||| |||||    
T  21753478 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattctgggaaaggaacattctg 21753576  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21753577 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatatgttcattcatacatgatga 21753675  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21753676 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 21762765 - 21763017
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||||||||| ||| |||||    
T  21762765 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattctgggaaaggaacattctg 21762863  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21762864 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatatgttcattcatacatgatga 21762962  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21762963 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21763017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30943678 - 30943433
Alignment:
Q  54 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctgatgtatg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30943678 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagaaaaaatctgggaaaggaacattctgatgtatg 30943580  T
Q  153 tggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctaga 251  Q
      |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30943579 aagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccgga 30943481  T
Q  252 tgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943480 tgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 30943433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30953100 - 30952855
Alignment:
Q  54 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctgatgtatg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30953100 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagaaaaaatctgggaaaggaacattctgatgtatg 30953002  T
Q  153 tggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctaga 251  Q
      |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30953001 aagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccgga 30952903  T
Q  252 tgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30952902 tgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 30952855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37647904 - 37647662
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| ||| |     
T  37647904 atgggagttggtatagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactata-tct-tcctgcaccggtcccaaggcaa 37647807  T
Q  125 a-tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattca 222  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  37647806 aatctgggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catatcccagaacttca 37647708  T
Q  223 tgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37647707 tgtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 37647662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27580360 - 27580230
Alignment:
Q  138 actttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatac 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27580360 actttatgatgtatgtggaaaagcccatactttaattattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccataaattcatgtgtacattcatac 27580261  T
Q  238 atgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27580260 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 27580230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26192044 - 26191806
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  26192044 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 26191946  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  26191945 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 26191847  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26191846 tcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 26191806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19888252 - 19888014
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  19888252 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 19888154  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  19888153 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatgtgt 19888055  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19888054 tcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 19888014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37538694 - 37538551
Alignment:
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcat 223  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  37538694 atctgggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcat 37538596  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37538595 gtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 37538551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37548510 - 37548445
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc 91  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37548510 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc 37548445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23378628 - 23378551
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaag-atgcagaatccactttcctctctcct 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23378628 gagttgatactatacatggaccgcacaatctctcaaagcatgggcgtgaagaaagcagaatccactttcctctctcct 23378551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 31105423 - 31105497
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaa-tctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccacttt 96  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31105423 cacatgagagttagtacagtacatgaaccacaaaaatctctcaaagcatgggcatgaagatgtagaatccacttt 31105497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19888045 - 19888005
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888045 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 19888005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26191837 - 26191797
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191837 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 26191797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27580261 - 27580221
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27580261 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 27580221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37538582 - 37538542
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37538582 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 37538542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37647693 - 37647653
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37647693 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 37647653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 261
Target Start/End: Original strand, 31105544 - 31105673
Alignment:
Q  133 aagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgt-ggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcat 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  | || |||||| |||||| ||| ||||||  |||||||   ||||| ||| ||||| ||||||    
T  31105544 aagcaacattctgatgtatgtggaaaagccactgcccttggatattgcctagaaaatcaaatgaaacacatatgatgagcccataaactcatgcgttcat 31105643  T
Q  232 tcatacatgatgaacctagatgaagatcat 261  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||    
T  31105644 ttatacatgatgaacccatatgaagatcat 31105673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19548280 - 19548244
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19548280 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 19548244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13403093 - 13402848
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 122  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403093 cacatgggagttggtgcaggagatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 13402994  T
Q  123 agatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattca 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  13402993 agatctggaaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagtccatactttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccaaaaactca 13402894  T
Q  223 tgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13402893 tgtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 13402848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 15670103 - 15670376
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  15670103 atgggagttggtacagtagaaggaccacacaatccctcaaagcatggacatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaa 15670202  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15670203 tctggggaagtaacattctgatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccataaattcatgt 15670302  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670303 gttcattcatacatgatgaatccagatgaagatcatgatgaacctagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 15670376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 52499139 - 52499379
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |     
T  52499139 catgggagttgatacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccacttta-tctctcctgcaccagtccctaggcaa 52499237  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  52499238 atttgggaaagtaactttctgatgtatgtgaaaaagccaatactttggttattgcctagaaactc--atgaaaagcacatgacacgcccagaacttcatg 52499335  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  52499336 tgttcattcatacattatgaacccatatgaaaatcatcatgaac 52499379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17984915 - 17984646
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  17984915 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 17984817  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  17984816 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 17984718  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984717 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 17984646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 40921861 - 40922130
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  40921861 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 40921959  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  40921960 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 40922058  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922059 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 40922130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18105466 - 18105196
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18105466 gagttggtactaaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18105368  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagc-ccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtg 226  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18105367 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtaccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtg 18105269  T
Q  227 ttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18105268 ttcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18105196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5293139 - 5292870
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5293139 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5293041  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5293040 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5292942  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5292941 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 5292870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5302798 - 5302529
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5302798 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5302700  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5302699 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5302601  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5302600 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 5302529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9836115 - 9835841
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |     
T  9836115 catgagagttgatacagtacatggaccgcataatctctcaaagcacgggcatgaagatgcagaatccaccttacg-tctcctacaccagtccctaggcaa 9836017  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgt-ggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcat 223  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| | || ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||    
T  9836016 atttggaaaaacaactttctgatgtatgtggaaaaaccattactcttggatattgcccagaaaatcatatgaaacgcatatgatgagcccataaattcat 9835917  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
     |||||||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9835916 atgttcattcatacatgatcaactcggataaatatcatgatgaacccaaatgaagattatcatgaacacaacaaca 9835841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 21846121 - 21846390
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||    
T  21846121 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattct 21846219  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21846220 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21846318  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846319 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21846390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 21855713 - 21855982
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||    
T  21855713 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattct 21855811  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21855812 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21855910  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21855911 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21855982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 21901984 - 21902253
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||    
T  21901984 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattct 21902082  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21902083 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21902181  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21902182 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21902253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 21911576 - 21911845
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | || ||    
T  21911576 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaattct 21911674  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21911675 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21911773  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21911774 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21911845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27680802 - 27680533
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  27680802 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 27680704  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27680703 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 27680605  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680604 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 27680533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27690457 - 27690188
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  27690457 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 27690359  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27690358 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 27690260  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27690259 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 27690188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 16249464 - 16249733
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatc-t 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | | |    
T  16249464 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaacct 16249562  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  16249563 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccaaaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 16249661  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16249662 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16249733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 6692236 - 6692505
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  6692236 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 6692334  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  6692335 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatatgt 6692433  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6692434 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 6692505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 6702642 - 6702911
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  6702642 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 6702740  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  6702741 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatatgt 6702839  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6702840 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 6702911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3487678 - 3487409
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatc-t 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | | |    
T  3487678 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaacct 3487580  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgtt 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  3487579 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatggatagcccagaacttcatgtgtt 3487480  T
Q  229 cattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3487479 cattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 3487409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3497001 - 3496732
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatc-t 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | | |    
T  3497001 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaacct 3496903  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgtt 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  3496902 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatggatagcccagaacttcatgtgtt 3496803  T
Q  229 cattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3496802 cattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 3496732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17828192 - 17827947
Alignment:
Q  54 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctag-gtagatctgggaaagcaactttctgatgtatg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || ||||||||||  | || ||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17828192 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccgattccaagaaaaaatctgggaaaggaacattctgatgtatg 17828094  T
Q  153 tggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctaga 251  Q
      |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17828093 aagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccgga 17827995  T
Q  252 tgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17827994 tgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 17827947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17837583 - 17837338
Alignment:
Q  54 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctag-gtagatctgggaaagcaactttctgatgtatg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || ||||||||||  | || ||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17837583 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccgattccaagaaaaaatctgggaaaggaacattctgatgtatg 17837485  T
Q  153 tggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctaga 251  Q
      |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17837484 aagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccgga 17837386  T
Q  252 tgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837385 tgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 17837338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 17161255 - 17161479
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatctg 129  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  17161255 gagttggtacagt-caaggaccacacaatccctcaaaacatgggcatgaagatgcagaatcccattatatctttcctgcaccggtcccaaggcagatctg 17161353  T
Q  130 ggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttc 229  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||           ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  17161354 ggaaagtaactttcttatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcccagaaact-----------catatgacacgcccagaaattc--gtgttc 17161440  T
Q  230 attcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17161441 attcatacatgaagaacccagatgaagatcatcatgaac 17161479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Original strand, 16242076 - 16242246
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  16242076 atgggagttggtacagtacaaggaccacagaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaa 16242175  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaa 196  Q
    |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  ||||| |||||||||    
T  16242176 tctggggaaggaagattctgatgtatgtggaaaagcccataccttgattgttgcccagaaattcatatgaa 16242246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Original strand, 16253430 - 16253568
Alignment:
Q  29 ggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatct 128  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  16253430 ggagttggtacagtacaaggaccacagaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaatct 16253529  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatac 167  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16253530 ggggaaggaacattctgatgtatgtggaaaatcccatac 16253568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 19918184 - 19918267
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  19918184 atgggagttggtacagtacatggaccatacaatccctcaaagcatggggatgaagatggag-atccactttcctctctcatgcac 19918267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13792910 - 13792833
Alignment:
Q  222 atgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13792910 atgtcttcattcatacatggtgaacccagatgaatatcatgatgaatccagatgaagatcatcaagaacgcaacaaca 13792833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Original strand, 16253578 - 16253637
Alignment:
Q  209 tgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16253578 tgcccagaaattcatgcgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 16253637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 299
Target Start/End: Original strand, 19918396 - 19918466
Alignment:
Q  229 cattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19918396 cattcatacatgaagaacccaaataaagatcatgatgaacctagatgaagatcatcaagaacacaacaaca 19918466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 13793101 - 13793032
Alignment:
Q  42 tacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaag-atgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13793101 tacatggaccacacaatctctcaaagaattggcatgaagaaagcagaatccaatttcctctctcctgcac 13793032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6405882 - 6405817
Alignment:
Q  42 tacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaag-atgcagaatccactttcctctctcct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  6405882 tacatggaccacacaatctctcaaagcatggacatgaagaaagcagaatctacttccctctctcct 6405817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13402879 - 13402839
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402879 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 13402839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 16253606 - 16253646
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16253606 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 11476937 - 11477007
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccacttt 96  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  11476937 atgggatttggtactgtacatggaccacaaaatccctcaaagcatgggcataaagatgcaaaagccacttt 11477007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Original strand, 17161448 - 17161486
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaa 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17161448 catgaagaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaa 17161486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 30651813 - 30651849
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30651813 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 30651849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14600580 - 14600515
Alignment:
Q  182 agaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacc 247  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14600580 agaaaatcatatgaaacacatatgacaagcccaaaagcacatgtgttcattcatacatgataaacc 14600515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 296
Target Start/End: Original strand, 26458583 - 26458616
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26458583 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaaca 26458616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 41525909 - 41525949
Alignment:
Q  69 atgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41525909 atgggcatgaagattca-aatccactttcctctctcctgcac 41525949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6405672 - 6405632
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6405672 catgatgaacccaaatgaagatcatcaagaacgcaacaaca 6405632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 11477157 - 11477197
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11477157 catgatgaactcagatgaagatcatcaagaacgcaacaaca 11477197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17421139 - 17421103
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17421139 atgaacccagatgaagatcataaagaacacaacaaca 17421103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44638982 - 44638713
Alignment:
Q  29 ggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatct 128  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  | ||||    
T  44638982 ggagttggtatagtacatggaccacacaatctctcaaagcattagcatgaagatgcagaatccacttta-tctcttctgcaccagtccctagaaaaatct 44638884  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgtt 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44638883 gggaaagtaactttatgatgtatgtggaaaagcccatacgttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatataacacgcccagaaattcatgtgtt 44638784  T
Q  229 cattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44638783 cattcatacatgatgaacccagatgaagatcatgataaacctagatgaagataatcatgaacacaacaaca 44638713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16902542 - 16902269
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| || |||||||||||| ||| | |    
T  16902542 atgggagttggtacagtacaacgaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcatgcaccagtcccaaggcaaa 16902443  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16902442 tctgggaaaggaacattctgatgtatgtggaaaagcccatactttggttgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 16902343  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16902342 gttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacgcaacaaca 16902269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16995933 - 16995660
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| || |||||||||||| ||| | |    
T  16995933 atgggagttggtacagtacaacgaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcatgcaccagtcccaaggcaaa 16995834  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16995833 tctgggaaaggaacattctgatgtatgtggaaaagcccatactttggttgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 16995734  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16995733 gttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacgcaacaaca 16995660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24696550 - 24696277
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggca-tgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggta 123  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  24696550 atgggagttggtactgtacaaggacaacacaatccctcaaagcatgggcaatgaagatgcagaatcccactata-tct-tcctgcaccggtcccaaggta 24696453  T
Q  124 gatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattca 222  Q
     ||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  24696452 aatctggggaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttca 24696354  T
Q  223 tgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24696353 tgtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 24696277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 29423378 - 29423620
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| ||| ||    
T  29423378 atgggagttggtacagtacaagtaccacacaatccctcaaagcatggacatgaagatgcagaatcccactata-tctttcctgcaccggtcccaaggcag 29423476  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29423477 atatgggaaagtaactttctgatgtatgtggaaaagtccatactttggttattgtccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccataaattcatg 29423576  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  29423577 tgttcattcatatattatgaacccagatgaaaatcatcatgaac 29423620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2998658 - 2998389
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  2998658 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 2998560  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  2998559 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 2998461  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2998460 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 2998389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 4467838 - 4468107
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  4467838 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 4467936  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  4467937 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 4468035  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4468036 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 4468107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5346949 - 5346680
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5346949 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5346851  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5346850 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5346752  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346751 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 5346680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 17488708 - 17488977
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  17488708 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 17488806  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  17488807 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 17488905  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17488906 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcataaacacaacaaca 17488977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 4458230 - 4458482
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  4458230 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 4458328  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4458329 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 4458427  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4458428 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 4458482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 18651253 - 18651505
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  18651253 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 18651351  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18651352 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 18651450  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18651451 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18651505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 18663371 - 18663623
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  18663371 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 18663469  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18663470 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 18663568  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663569 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18663623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5337096 - 5336827
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5337096 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5336998  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5336997 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5336899  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5336898 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacaccacaaca 5336827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9502704 - 9502452
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || ||||| |||| || || ||  | || ||||||||| ||| |||||    
T  9502704 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctacaccggttccaagacaaattctgggaaaggaacattctg 9502606  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9502605 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 9502507  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9502506 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9502452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9514070 - 9513818
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagat-ctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || ||||| |||| || || ||  | || ||||||||| ||| |||||    
T  9514070 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctacaccggttccaagacaaattctgggaaaggaacattctg 9513972  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9513971 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 9513873  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513872 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9513818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38957793 - 38957552
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |   ||| |||||||||  | || ||| | |    
T  38957793 atgggagttggtacagtacatgcaccacacaatccctcaaagca-gggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccgattccaaggcaaa 38957695  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38957694 tctggggaaggaacattctgatgtatgtggaaaagctcataccttgattgttgctcagaaattcatatggaaagcatatgacaggcccataaattcatgt 38957595  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38957594 gtttattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 38957552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 45024827 - 45025096
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  45024827 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 45024925  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  45024926 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgaccagaaattcatatgtaaaacatatg-catagcccagaacttcatgtgt 45025024  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45025025 tcgttcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 45025096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38930446 - 38930204
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| |||   |    
T  38930446 atgggagttggtacagtacatggaccacacaatctctcaaagcgtaggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcgaa 38930347  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||  |  ||   ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| |    
T  38930346 tctggggaaggaacattctgatgtatgtggaaaagtccataccttgagtgctgtccagaaattcataagaaaagcatatggcacgcccagaaatgcatat 38930247  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  38930246 gttcattcatacatgatgaacccaaatgaagatcatcatgaac 38930204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 45014750 - 45014988
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || ||||||||||  | || ||  | | |||    
T  45014750 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccgctaaatc-ctcctgcaccgattccaagacaaaatct 45014848  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  45014849 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgaccagaaattcatatgtaaaacatatg-catagcccagaacttcatgtgt 45014947  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45014948 tcgttcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 45014988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38957583 - 38957543
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38957583 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 38957543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 45014957 - 45014997
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014957 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 45014997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 19342539 - 19342575
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19342539 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 19342575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 70121 - 70068
Alignment:
Q  56 aatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  70121 aatctcttaaagcatgggcctgaagatgcag-atccactattctctctcctgcac 70068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 22902334 - 22902370
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22902334 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacatcaaca 22902370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 29423593 - 29423629
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29423593 atgaacccagatgaaaatcatcatgaacataacaaca 29423629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 8540263 - 8540537
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| || |||||| ||||| ||| ||    
T  8540263 catgtgagttgctacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccaatatatctttcttgcaccggtcccaaggcag 8540362  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8540363 atctgggaaagtaactttatgatgtatgtggaaaaacccatattttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatg 8540462  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8540463 tgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccaaatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8540537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 8605502 - 8605776
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| || |||||| ||||| ||| ||    
T  8605502 catgtgagttgctacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccaatatatctttcttgcaccggtcccaaggcag 8605601  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8605602 atctgggaaagtaactttatgatgtatgtggaaaaacccatattttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatg 8605701  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8605702 tgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccaaatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8605776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Original strand, 18383371 - 18383636
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||    
T  18383371 catgggagttggtacagtacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcaaaatccacttta-tctctcctgcaccagtccttaggcag 18383469  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||    
T  18383470 atctgagaaagtaactttctaatgtgtgtggaaaagcccatactttgattattgcccagaaattcatatgtaaagcatatgaaacgcctataaattcatg 18383569  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaaca 291  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  18383570 tgttcattcatacatgatgaactcagatgaatatcatgatgaacccaagtgaagatcatcaagaaca 18383636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2370448 - 2370180
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatctg 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  2370448 gagttggtacagtacatggaccacacaatctctcaaagcatggacatgaagatgtagaatccacttta-tctctcatgcaccagtccctaggcatatctg 2370350  T
Q  130 ggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttc 229  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  2370349 ggaaagcatctttctgatgtatgcggaaaagccactactttggataatgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacaaacctagaaattcacgtgttc 2370250  T
Q  230 attcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2370249 attcatacatgatgaacccagataaatatcatgatgaacccatatgaagatcatcaagaacacaacaaca 2370180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 13964897 - 13965139
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  13964897 catgggaattggtacagtacaaggaccgcacaatccctcaaaacatgggcatgaagatacataatccactttc-tctctcctgcaccagtccctaggcaa 13964995  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  13964996 atctgggaaagtaactttttgatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgctcataaattcatg 13965095  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13965096 tgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 13965139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 42034208 - 42034450
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  42034208 atgggagttggtccagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatggacatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggaaaa 42034307  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42034308 tctgggaaagtaactttctgatgtatgtggaaaagctcatactttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 42034407  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42034408 gtttattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 42034450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18059128 - 18058853
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| |     
T  18059128 cacatgggagttggtacagtacatggaccacacaatccctcaaagtatgggcatgaagatgcataattcacttt-atctctcctgcatcagtccctatgc 18059030  T
Q  123 agatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatac-tgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattc 221  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||||  | ||| ||||||||||  |||||||  |||||| ||||||    
T  18059029 aaatttgggaaaacaactttctgatgtatgtggaaaagccactacttttagatattgcccataaaatcatatgaaacacatatgatgtgcccaaaaattc 18058930  T
Q  222 atgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18058929 atgtgttcgttcatacatgatgaacc-agatgaatatcatgatgaacccatatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30549652 - 30549412
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   | | |||| |||| ||||| ||| | |    
T  30549652 atgggagttggtacagtacattgaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatttttccttcaccggtcccaaggcaaa 30549553  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30549552 tttggggaaggaactttctgatgtatgtggaaaagctcataccttgattgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgtcacgcccagaaattcatgt 30549453  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatga 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30549452 gttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatga 30549412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 16154901 - 16155170
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  16154901 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 16154999  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  16155000 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 16155098  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155099 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16155170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 21458646 - 21458915
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  21458646 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 21458744  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  21458745 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatatgt 21458843  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458844 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21458915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 25019486 - 25019755
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || || || | |||    
T  25019486 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctttcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagataaaatct 25019584  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  25019585 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccataaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 25019683  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25019684 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacctagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 25019755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 2116014 - 2116079
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc 91  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116014 atgggagttggtacagtacatggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc 2116079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Original strand, 34822977 - 34823042
Alignment:
Q  44 catggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34822977 catggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcag-atccactttcctctctcctgcac 34823042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 13965108 - 13965148
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965108 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 13965148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 42034419 - 42034459
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42034419 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 42034459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19748392 - 19748354
Alignment:
Q  261 tgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19748392 tgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 19748354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30549441 - 30549401
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30549441 catgatgaacccagatgaagatcatcatgatcacaacaaca 30549401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41543943 - 41543907
Alignment:
Q  261 tgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41543943 tgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaa 41543907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1974522 - 1974486
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1974522 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 1974486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12040 - 11767
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  12040 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaa 11941  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11940 tctggggaaggaacattctgatgtatgtggaaaagcccataccttgattgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 11841  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840 gttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 11767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 20492058 - 20492295
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |     
T  20492058 cacatgggagttggtacaatacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcaaaatccacttta-tctctcctgcaccagtcccaatgc 20492156  T
Q  123 agatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattca 222  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20492157 aaatctgggaaagtaactttctgatgtatgtggaaaagtccatactttggttattgcccataaactcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattca 20492256  T
Q  223 tgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20492257 tgtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcat 20492295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13119668 - 13119395
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| || |||||||||||| ||| | |    
T  13119668 atgggagttggtacagtacaaggaccatacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcatgcaccagtcccaaggcaaa 13119569  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13119568 tctgggaaaggaacattctaatgtatgtggaaaagcccatactttggttgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 13119469  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13119468 gttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacctagaggaagatcatcatgaacgcaacaaca 13119395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4782671 - 4782398
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | |    
T  4782671 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaa 4782573  T
Q  126 -tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcat 223  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||    
T  4782572 atctgggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaatttcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcat 4782474  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4782473 gtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 4782398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16335475 - 16335225
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatctgggaaagcaactttctga 146  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | ||||||||||| ||| ||||||    
T  16335475 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaatctgggaaaggaacattctga 16335377  T
Q  147 tgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaac 246  Q
    ||||||  ||||||  ||| |  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335376 tgtatgaagaaaagttcatgcattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatgccc-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaac 16335278  T
Q  247 ctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335277 ccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16335225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1685301 - 1685032
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  1685301 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 1685203  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  1685202 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 1685104  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685103 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 1685032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10012278 - 10012009
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tc 127  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| ||| | | ||    
T  10012278 gagttggtactgtacaaggacaacacaatccctcaaagcatgggcatgaagaagcagaatcccactata-tct-tcctgcaccggtcccaaggcaaaatc 10012181  T
Q  128 tgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgt 227  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||  |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  10012180 tgggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaagttcatatgaaaagcatatggcccgcccagaacttcatgtgt 10012081  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10012080 tcattcatacatgatgaactcagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 10012009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 6432763 - 6433015
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  6432763 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaagtctgggaaaggaacattctg 6432861  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6432862 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 6432960  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432961 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 6433015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 296
Target Start/End: Original strand, 6422336 - 6422585
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  6422336 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaagtctgggaaaggaacattctg 6422434  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6422435 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 6422533  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaaca 296  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6422534 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaaca 6422585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 8972864 - 8973133
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  8972864 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 8972962  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  8972963 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 8973061  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8973062 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8973133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 8983419 - 8983688
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  8983419 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 8983517  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  8983518 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 8983616  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8983617 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8983688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 4381131 - 4381383
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  4381131 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 4381229  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4381230 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaatacatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 4381328  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381329 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 4381383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5655659 - 5655407
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  5655659 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 5655561  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5655560 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-cataacccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 5655462  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5655461 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 5655407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 9537170 - 9537422
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  9537170 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 9537268  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9537269 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 9537367  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9537368 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9537422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 9547496 - 9547748
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  9547496 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 9547594  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9547595 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 9547693  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547694 acccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9547748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2489258 - 2489016
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  2489258 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaa 2489159  T
Q  126 -tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||   ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  2489158 atctgggaaaggaacattctgatgtatgtg-aaaagctcatacattggtcattgtccagaaattcatatgaaaagtatatggcacgcccagaacttcatg 2489060  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2489059 tgttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 2489016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 25432873 - 25433113
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaat-ccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||| ||| |     
T  25432873 atgggagttggtatagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagaggcagaattccactata-tct-tcctgcaccagtcccaaggcaa 25432970  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||   ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  25432971 atctgggaaaggaacattctgatgtatgtg-aaaagctcatacattagtcattgtccagaaattcatatgaaaagcatatgtaacgcccagaacttcatg 25433069  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25433070 tgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 25433113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4024052 - 4023921
Alignment:
Q  137 aactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  4024052 aactttttgatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacacgctcataaattcatgtgttcattcata 4023953  T
Q  237 catgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4023952 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 4023921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Original strand, 4371412 - 4371633
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  4371412 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 4371510  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4371511 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaatacatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 4371609  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4371610 acccagatgaagatcatcatgaac 4371633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4024460 - 4024349
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 122  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  4024460 cacatgggaattggtacagtacaaggaccgcacaatccctcaaaacatgggcatgaagatacaaaatccacttt-atctctcctgcaccagtccctaggc 4024362  T
Q  123 agatctgggaaag 135  Q
    | || ||||||||    
T  4024361 aaatatgggaaag 4024349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4023952 - 4023912
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4023952 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 4023912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 4371602 - 4371642
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4371602 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 4371642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 25433082 - 25433122
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25433082 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 25433122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2489046 - 2489007
Alignment:
Q  260 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2489046 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 2489007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 17734363 - 17734399
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17734363 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 17734399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 19035632 - 19035668
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19035632 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 19035668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49387191 - 49387155
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49387191 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 49387155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 42621193 - 42621466
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   | | ||||||||| ||||| ||| | |    
T  42621193 atgggagttggtacagtacatggacaacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatatttcctgcaccggtcccaaggcaaa 42621292  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42621293 tctggggaaggaacgttctgatgtatgtggaaaagcccataccttgattgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatggcacgcccagaaattcatgt 42621392  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42621393 gttcattcatacatgatgaacccaaatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 42621466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7034797 - 7034561
Alignment:
Q  31 agttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatctgg 130  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  7034797 agttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcattgacatgaagatgcataatccacttta-tctctcctgcaccagtcccaaggcaaatctgg 7034699  T
Q  131 gaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttca 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7034698 gaaagtaactttctgatgtatgtggaaaaacccatactttggttattgcccagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccataacttcatgtgttca 7034599  T
Q  231 ttcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7034598 ttcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 7034561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 14944292 - 14944533
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||     
T  14944292 catggcagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaa-gcatgggcatgaagatgcagaatacacttta-tctctccagaaccaggcccaaggtaa 14944389  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14944390 acctgggaaagtaactttttgatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcctagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccaaaaattcatg 14944489  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14944490 tgttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 14944533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 15371885 - 15372126
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||     
T  15371885 catggcagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaa-gcatgggcatgaagatgcagaatacacttta-tctctccagaaccaggcccaaggtaa 15371982  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15371983 acctgggaaagtaactttttgatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcctagaaactcatatgaaaagcatatgacacgcccaaaaattcatg 15372082  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15372083 tgttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 15372126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 5927153 - 5927422
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5927153 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5927251  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5927252 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5927350  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927351 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 5927422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16142507 - 16142238
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  16142507 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 16142409  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  16142408 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 16142310  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16142309 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16142238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 8501084 - 8501336
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  8501084 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 8501182  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8501183 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 8501281  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8501282 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8501336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 8511554 - 8511806
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  8511554 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 8511652  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8511653 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 8511751  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8511752 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 8511806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 44907755 - 44908007
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  44907755 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 44907853  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44907854 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 44907952  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44907953 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 44908007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16131958 - 16131689
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  16131958 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 16131860  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  16131859 gggaaaggaacattctgatgtttgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 16131761  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16131760 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16131689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 27988879 - 27989119
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| |      
T  27988879 atgggagttggtacagtacaaggaccacacattccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggca-- 27988976  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27988977 tctggggaaggaacattctgatgtatgtgaaaaagcccataccttgattgttgcccagaaattcatatgaacagcatatgacacgcctagaaattcatgt 27989076  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27989077 gttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 27989119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 32098398 - 32098667
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  32098398 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 32098496  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32098497 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 32098595  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32098596 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 32098667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 32108835 - 32109104
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  32108835 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 32108933  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32108934 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 32109032  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32109033 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 32109104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 46497132 - 46497401
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  46497132 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 46497230  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  46497231 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 46497329  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46497330 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 46497401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 46507744 - 46508013
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  46507744 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 46507842  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  46507843 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 46507941  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46507942 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 46508013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5381859 - 5381590
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5381859 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5381761  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5381760 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5381662  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5381661 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcataaacacaacaaca 5381590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5391497 - 5391228
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  5391497 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 5391399  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  5391398 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 5391300  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5391299 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcataaacacaacaaca 5391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26348193 - 26347924
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  26348193 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatggacatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 26348095  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  26348094 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 26347996  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26347995 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 26347924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 6544840 - 6545092
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | ||||||| || ||| |||||    
T  6544840 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggagaggaacattctg 6544938  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6544939 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-cataacccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 6545037  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6545038 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 6545092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11626408 - 11626139
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  11626408 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcataatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 11626310  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  11626309 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 11626211  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11626210 ttattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 11626139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26363245 - 26362976
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  26363245 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatggacatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 26363147  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  26363146 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatt-catagcccagaacttcatgtgt 26363048  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363047 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 26362976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 43983495 - 43983764
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatc-t 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | | |    
T  43983495 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaacct 43983593  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgtt 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  43983594 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatggatagcccagaacttcatgtgtt 43983693  T
Q  229 cattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43983694 cattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 43983764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9535284 - 9535015
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || ||||||||||  | || ||  | | |||    
T  9535284 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccgcttccaagacaaaatct 9535186  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9535185 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatgtgt 9535087  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535086 tcattcatacgtgatgaacccagatgaagaacatgataaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9535015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9545567 - 9545298
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || ||||||||||  | || ||  | | |||    
T  9545567 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccgcttccaagacaaaatct 9545469  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9545468 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatgtgt 9545370  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545369 tcattcatacgtgatgaacccagatgaagaacatgataaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9545298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Original strand, 44897352 - 44897573
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  44897352 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 44897450  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44897451 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 44897549  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  44897550 acccagatgaagatcatcatgaac 44897573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14248587 - 14248339
Alignment:
Q  42 tacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatctgggaaagcaactt 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | | || ||  | ||||||||||||||| |    
T  14248587 tacatggaccacacaatccctcaaagcaagggcatgaagatgcagaatccgcttt-atctctcctgcactatttccaagacaaatctgggaaagcaacat 14248489  T
Q  142 tctgatgtatgtggaaaagcccatac-tgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatg 240  Q
    ||| |||| | ||||||||||  | | | ||| || |||  ||||| ||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  14248488 tctaatgtttatggaaaagccactgcttatggataatgcccagaaaatcatatgaaacacatatgatgagcccataaactcatgttttcattcatacatg 14248389  T
Q  241 atgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 290  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  14248388 atgaacccagatgaatattatgatgaaccctgatgaatatcatgatgaac 14248339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Original strand, 6534541 - 6534762
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | ||||||| || ||| |||||    
T  6534541 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggagaggaacattctg 6534639  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6534640 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-cataacccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 6534738  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  6534739 acccagatgaagatcatcatgaac 6534762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7019276 - 7019199
Alignment:
Q  191 tatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7019276 tatgaaaagcatatgacatgcccataacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 7019199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2991959 - 2991876
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2991959 atgggatttggtactgtacatggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccacttt-atctctcctgcac 2991876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 6534731 - 6534771
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6534731 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 6534771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7019230 - 7019190
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7019230 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 7019190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7034592 - 7034552
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7034592 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 7034552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 27989088 - 27989128
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989088 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 27989128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 44897542 - 44897582
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44897542 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 44897582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 299
Target Start/End: Original strand, 14944503 - 14944542
Alignment:
Q  260 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14944503 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 14944542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 299
Target Start/End: Original strand, 15372096 - 15372135
Alignment:
Q  260 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15372096 atgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 15372135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14248350 - 14248308
Alignment:
Q  257 atcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14248350 atcatgatgaacccagatgaagatcatcaagaacgcaacaaca 14248308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15988488 - 15988452
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15988488 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 15988452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5615313 - 5615277
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5615313 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 5615277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12827177 - 12827145
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12827177 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaac 12827145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 31824973 - 31825009
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31824973 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 31825009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 42595607 - 42595643
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42595607 atgaacccagatgaagatcttgatgaacacaacaaca 42595643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21211 - 20939
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||  ||| | |    
T  21211 atgggagttggtatagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtccgaaggaaaa 21112  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21111 tctgggaaagtaacattatgatgtttatggaaaagcccatactttggttattgccaagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 21012  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21011 gttcattcat-catgatgaaccctgatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 20939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 14045327 - 14045599
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggta 123  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| ||| |    
T  14045327 catgggagttggtacagtacaaggacaacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgtagaatcccactata-tctttcctgcaccggtcccaaggca 14045425  T
Q  124 gatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcat 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  14045426 gatctgggaaagtaactttctgatatatgtggaaaagcccatactttagttattgcccagaaattcat--gaaaagcatatgacacgttcagaaattcat 14045523  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14045524 gtgttcatttatatatgatgaacccagatgaagatcatgatgaactcagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 14045599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 1596820 - 1597093
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggca-tgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggta 123  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| | ||||| ||| |    
T  1596820 atgggagttggtactgtacaaggacaacacaatccctcaaagcatgggcaatgaagatgcagaatcccactata-tct-tcctgcatcggtcccaaggca 1596917  T
Q  124 gatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcat 223  Q
     ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1596918 aatctggggaaggaacattctgatgtatgaggaaaagtccatactttgtttgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcat 1597017  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1597018 gtgttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacgcaacaaca 1597093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 29540469 - 29540727
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatctg 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   |   ||| || |||||| ||||| ||| | |||||    
T  29540469 gagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagaatgggcatgaagatgaagaatcccactagatctttcatgcaccggtcccaaggcaaatctg 29540568  T
Q  130 ggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttc 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||           || |||||||| |||||||||||    
T  29540569 gaaaagcaacattctgatgtatgtggaaaagcccatactttggttattgcccagaaactcatatga-----------cacgcccagaacttcatgtgttc 29540657  T
Q  230 attcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29540658 atttatacatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 29540727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 3285864 - 3286133
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  3285864 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 3285962  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  3285963 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 3286061  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3286062 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 3286133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 12455071 - 12455340
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  12455071 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 12455169  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  12455170 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 12455268  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12455269 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 12455340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 14791620 - 14791889
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  14791620 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 14791718  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  14791719 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcatgtgt 14791817  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791818 tcattcatacatgatgaacctagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 14791889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 20912300 - 20912569
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  20912300 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 20912398  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20912399 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 20912497  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20912498 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 20912569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 31357578 - 31357847
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  31357578 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 31357676  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31357677 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 31357775  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357776 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 31357847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 31367307 - 31367576
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  31367307 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 31367405  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31367406 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 31367504  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31367505 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 31367576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 18160079 - 18160348
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18160079 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18160177  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  18160178 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccataacttcatgtgt 18160276  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18160277 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18160348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 18169891 - 18170160
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  18169891 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 18169989  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  18169990 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccataacttcatgtgt 18170088  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170089 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 18170160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26020811 - 26020538
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | |    
T  26020811 atgggagttggtacagtaaaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaa 26020713  T
Q  126 -tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcat 223  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||    
T  26020712 atctgggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaatttcatatgaaaaacatatg-catagcccagaacttcat 26020614  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020613 gtgttcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacctagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 26020538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24931063 - 24930811
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  24931063 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 24930965  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24930964 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccataaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 24930866  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930865 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 24930811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24922044 - 24921775
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  24922044 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 24921946  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   | ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  24921945 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccataaattcatatgaaaatcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 24921847  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24921846 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 24921775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 16897964 - 16898233
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatc-t 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | | |    
T  16897964 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaacct 16898062  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||||| ||||||  || ||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  16898063 gggaaaggaacattatgatgtatgaagaaaagtccatacattgattattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 16898161  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898162 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16898233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 16908617 - 16908886
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtagatc-t 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | | |    
T  16908617 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaacct 16908715  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||||| ||||||  || ||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  16908716 gggaaaggaacattatgatgtatgaagaaaagtccatacattgattattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 16908814  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908815 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16908886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 18201229 - 18201469
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| ||| |     
T  18201229 atgggagttggtactgtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactgta-tct-tcctgcaccggtcccaaggcaa 18201326  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||  |||| ||||  |||||| ||||| |||||| ||||| || ||| | || ||||||    
T  18201327 atttgggaaaggaacattctgatgtatgta-aaaagctcatacattggtcattgtctagaaattcataggaaaaggatatggcacgccgataacttcatg 18201425  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18201426 tgttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 18201469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27787447 - 27787333
Alignment:
Q  182 agaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatc 281  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||   || || |||||||||||||    
T  27787447 agaaaatcatatgaaacgcatatgataagcctagaaattcatgtcttcattcatacatcatgaacccatatgaatatc---ataaagccagatgaagatc 27787351  T
Q  282 atcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  27787350 atcaagaacggaacaaca 27787333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8563071 - 8563035
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8563071 atgaacccagatgaagatcatgatgaacacaacaaca 8563035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 110
Target Start/End: Original strand, 28092638 - 28092684
Alignment:
Q  63 caaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28092638 caaagcataagcatgaagatgcaga-tccactttcctctctcctgcac 28092684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 27787597 - 27787543
Alignment:
Q  42 tacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccacttt 96  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  27787597 tacatgaaccaaacaatccctcaaagcatgggaatgaagatgcaaaatctacttt 27787543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24361509 - 24361473
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24361509 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 24361473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 261
Target Start/End: Original strand, 17268854 - 17269089
Alignment:
Q  25 catgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtag 124  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |     
T  17268854 catgagagttgctacagtacatggaccacacaatctctcaaagtatgagcatgaagatgcagaatccacttta-tctctcctgcgccagtcccaaggcaa 17268952  T
Q  125 atctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatg 224  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17268953 atctgggaaaataactttctgatgtatgtggaaaagcccatactttgattactgcccaggaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatg 17269052  T
Q  225 tgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcat 261  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  17269053 tgttcattcacacatgatgaacccatatgaagatcat 17269089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 791751 - 791993
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  791751 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaa 791850  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  791851 tctggggaaggaacattctgatgtatgtggaaaagcccataccttgattgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccataaattcatgt 791950  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  791951 gttcattaatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 791993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9325077 - 9324808
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  9325077 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 9324979  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9324978 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 9324880  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324879 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 9324808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21987981 - 21987712
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  21987981 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 21987883  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21987882 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21987784  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21987783 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21987712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21997515 - 21997246
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  21997515 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 21997417  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21997416 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 21997318  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997317 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21997246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Original strand, 21334333 - 21334585
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  21334333 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 21334431  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatg-cccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21334432 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-cataacccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 21334530  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21334531 acccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21334585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Original strand, 13674628 - 13674873
Alignment:
Q  54 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctgatgtatg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13674628 acaatctctcaaagcatgggcatgaagatacagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctgatgtatg 13674726  T
Q  153 tggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctaga 251  Q
      |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13674727 aagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccaga 13674825  T
Q  252 tgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13674826 tgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 13674873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21202838 - 21202617
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  21202838 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 21202740  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21202739 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 21202641  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  21202640 acccagatgaagatcatcatgaac 21202617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21213254 - 21213033
Alignment:
Q  47 ggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||||||||| ||| |||||    
T  21213254 ggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatctgggaaaggaacattctg 21213156  T
Q  146 atgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatga 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21213155 atgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatga 21213057  T
Q  245 acctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  21213056 acccagatgaagatcatcatgaac 21213033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Original strand, 22817610 - 22817738
Alignment:
Q  23 cacatgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||     
T  22817610 cacatgggagttggtacagtacaaggaccacacaatcccccaaagcatgggaatgaagatgcagaatctacttt-atctctcctgcaccagtccctaggc 22817708  T
Q  123 agatctgggaaagcaactttctgatgtatg 152  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||||    
T  22817709 aaatatgggaaattaactttctgatgtatg 22817738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 791962 - 792002
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791962 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 792002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21202648 - 21202608
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202648 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21202608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21213064 - 21213024
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21213064 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 21213024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 17269065 - 17269105
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17269065 catgatgaacccatatgaagatcatcaagaacacaacaaca 17269105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 14437626 - 14437662
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14437626 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 14437662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26362177 - 26362141
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26362177 atgaacccagatgaagatcatgaagaacacaacaaca 26362141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 92906 - 92664
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  92906 atgggagttggtacaatacaaggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactagatctttcctgcaccggtcccaaggcaaa 92807  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  92806 tctgaggaaggaacattctgatgtatgtggaaaagcccataccttgattgttgcccataaattcatatgaaaagcatatgacgcgcccagaaattcatgt 92707  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  92706 gttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 92664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 92695 - 92655
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  92695 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacataacaaca 92655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17370 - 17175
Alignment:
Q  103 tcctgcaccagtccctaggtagatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcat 202  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  17370 tcctgcaccggtcccaaggaaaatctgggaaaggaacattctgatgtatgtgaaaaa-cccatactttggttgttgcccagaaattcatatgaaaagcat 17272  T
Q  203 atgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17271 atgacacgcccagaaattcatgtgttcattcatatatgatgaacccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 17175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 310070 - 309801
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  310070 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 309972  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  309971 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaactcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 309873  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  309872 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 309801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 216798 - 216863
Alignment:
Q  182 agaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacc 247  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  216798 agaaaatcatatgaaacacatatgacaagcccaaaagcacatgtgttcattcatacatgataaacc 216863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55873 - 55631
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||   |   ||| |||||||||  |||| ||| | |    
T  55873 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctaaaagcatgggcatgaagatgcataatcccactagatctttcctgcaccgatcccaaggcaaa 55774  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55773 tctggggaaggaacattctgatgtatgaggaaaagcccataccttgattgttgcccagaaattcatatgaaaagcatatgacacgcccagaaattcatgt 55674  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  55673 gttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 55631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55662 - 55622
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55662 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 55622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 74784 - 74511
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggca-tgaagatgcagaatcc-actttcctctctcctgcaccagtccctaggta 123  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| ||  |    
T  74784 atgggagttggtactgtacaaggacaacacaatccctcaaagcatgggcaatgacgatgcagaatcccactata-tct-tcctgcaccggtcccaagcca 74687  T
Q  124 gatctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcat 223  Q
     ||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  74686 aatctggggaaggaacattttgatgtatgaggaaaagtccatactttggttgttgcccagaaattcatatggaaagcatatggcacgcccagaacttcat 74587  T
Q  224 gtgttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74586 gtgttcatccatatatgatgaaaccagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 74511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 234039 - 233770
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  234039 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 233941  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacat-gcccagaaattcatgtgt 227  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  233940 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatgaaaagcatatg-catagcccagaacttcatgtgt 233842  T
Q  228 tcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233841 tcattcatacatgatgaacccagatgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 233770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 15862 - 16103
Alignment:
Q  26 atgggagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  15862 atgggagttggtacagtacaaggaccacacaatccctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatct-tcctgcaccggtcccaaggcaaa 15960  T
Q  126 tctgggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgt 225  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || |||   ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  15961 tctggggaaggaacattctgatgtatgtggaaaagcccataccttgattgttgtccagaaattcatatggaaagcatatggcaagcccagaacttcatgt 16060  T
Q  226 gttcattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaac 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16061 gttcattcatacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaac 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 16072 - 16112
Alignment:
Q  259 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16072 catgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 16112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7893 - 7624
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tct 128  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |||||||||| || || ||  | | |||    
T  7893 gagttggtactgaacaaggacaacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccactaaatc-ctcctgcaccggttccaagacaaaatct 7795  T
Q  129 gggaaagcaactttctgatgtatgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgtt 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||    |||||||| ||||| ||||    
T  7794 gggaaaggaacattctgatgtatgaagaaaagtccatacattggttattgtccagaaattcatatggaaagcatatggatagcccagaacttcatatgtt 7695  T
Q  229 cattcatacatgatgaacctagatgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7694 cattcatacatgatgaacccagatgaagaacgtgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 7624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19393 - 19146
Alignment:
Q  52 acacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcctgcaccagtccctaggtaga-tctgggaaagcaactttctgatgta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||| ||  | ||  | | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  19393 acacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatcccacaaaatc-ctcctgcaccggtttcaagacaaaatctgggaaaggaacattctgatgta 19295  T
Q  151 tgtggaaaagcccatactgtggttattgcttagaaactcatatgaaaagcatatgacatgcccagaaattcatgtgttcattcatacatgatgaacctag 250  Q
    ||  |||||| ||||||  | ||| |||   ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19294 tgaagaaaagtccatacattagttgttgtccagaaattcatatgaaaagcatatgcattgcccagaacttcatgtgttcattcatacatgatgaacccag 19195  T
Q  251 atgaagatcatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19194 atgaagaacatgatgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 19146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Original strand, 65708 - 65783
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaagatgcagaatccactttcctctctcct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  65708 gagttggtacaatacatggaccacacaatccctcaaagcatgagcatgaagatgca-tatccactatcctctctcct 65783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Original strand, 13837 - 13914
Alignment:
Q  30 gagttggtacaatacatggaccacacaatctctcaaagcatgggcatgaag-atgcagaatccactttcctctctcct 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13837 gagttgatactatacatggaccgcacaatctctcaaagcatgggcgtgaagaaagcagaatccactttcctctctcct 13914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3351 - 3315
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3351 atgaacccaaatgaagatcatgatgaacacaacaaca 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 14243 - 14279
Alignment:
Q  263 atgaacccagatgaagatcatcatgaacacaacaaca 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14243 atgaacccagatgaagatcatgatgaaaacaacaaca 14279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University