View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_368 (Length: 248)

Name: NF11737A_low_368
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_368
NF11737A_low_368
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (14-235)||(23957025-23957246)
chr4 (14-235)||(12524954-12525175)
chr4 (14-235)||(29037917-29038138)
chr4 (14-235)||(8052136-8052357)
chr4 (14-235)||(27712614-27712835)
chr4 (14-235)||(14302491-14302712)
chr4 (14-235)||(40474318-40474539)
chr4 (14-235)||(8387690-8387911)
chr4 (14-235)||(12477878-12478099)
chr4 (14-235)||(19777306-19777527)
chr4 (14-235)||(16353958-16354179)
chr4 (14-235)||(18298483-18298704)
chr4 (14-224)||(14681856-14682066)
chr4 (14-235)||(18614337-18614558)
chr4 (14-235)||(15146398-15146619)
chr4 (17-224)||(18225962-18226169)
chr4 (14-235)||(14160748-14160969)
chr4 (13-235)||(8707198-8707419)
chr4 (17-236)||(14695390-14695609)
chr4 (17-235)||(14849882-14850100)
chr4 (14-235)||(15002137-15002358)
chr4 (30-235)||(15247202-15247407)
chr4 (14-235)||(15071637-15071858)
chr4 (14-235)||(51605565-51605786)
chr4 (14-224)||(16149000-16149210)
chr4 (14-224)||(16153146-16153356)
chr4 (14-224)||(27901675-27901885)
chr4 (50-224)||(15320425-15320599)
chr4 (14-224)||(1648050-1648260)
chr4 (14-224)||(33224212-33224422)
chr4 (14-235)||(15357893-15358114)
chr4 (13-224)||(9292124-9292335)
chr4 (14-224)||(3263567-3263777)
chr4 (14-224)||(29452310-29452520)
chr4 (64-235)||(15413849-15414020)
chr4 (14-224)||(11206004-11206214)
chr4 (14-224)||(15291931-15292141)
chr4 (14-78)||(56566304-56566368)
chr4 (29-224)||(44660654-44660849)
chr4 (14-224)||(14998605-14998814)
chr4 (21-224)||(18548839-18549042)
chr4 (15-118)||(12341639-12341742)
chr4 (104-224)||(20892271-20892391)
chr4 (179-224)||(13248934-13248979)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (14-235)||(33389874-33390095)
chr1 (14-235)||(16349441-16349662)
chr1 (14-235)||(21831596-21831817)
chr1 (11-235)||(41352504-41352728)
chr1 (14-235)||(51332338-51332559)
chr1 (14-235)||(21838243-21838465)
chr1 (14-235)||(19107661-19107882)
chr1 (14-235)||(17043860-17044081)
chr1 (14-235)||(21234576-21234797)
chr1 (17-235)||(21025466-21025684)
chr1 (14-235)||(430961-431182)
chr1 (14-210)||(24793462-24793658)
chr1 (14-224)||(21750244-21750454)
chr1 (17-235)||(22361092-22361310)
chr1 (20-235)||(22110315-22110530)
chr1 (20-235)||(22114164-22114379)
chr1 (14-235)||(21744397-21744618)
chr1 (7-224)||(19661975-19662192)
chr1 (78-235)||(16373823-16373980)
chr1 (14-224)||(20834745-20834955)
chr1 (14-224)||(20855605-20855815)
chr1 (29-235)||(23197106-23197312)
chr1 (23-224)||(24098457-24098658)
chr1 (14-224)||(19855609-19855819)
chr1 (14-224)||(21952213-21952423)
chr1 (14-224)||(20938908-20939118)
chr1 (14-224)||(20830237-20830447)
chr1 (49-235)||(19759753-19759939)
chr1 (143-235)||(16077630-16077722)
chr1 (23-224)||(20295716-20295917)
chr1 (14-219)||(31538842-31539047)
chr1 (17-213)||(20060800-20060996)
chr1 (14-224)||(22134402-22134612)
chr1 (14-224)||(37678384-37678594)
chr1 (24-83)||(16377587-16377646)
chr1 (14-127)||(41216702-41216815)
chr1 (20-81)||(50619235-50619296)
chr1 (14-224)||(20914905-20915115)
chr1 (14-87)||(52987212-52987285)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (11-235)||(41772052-41772276)
chr5 (14-235)||(19771170-19771391)
chr5 (14-235)||(22135878-22136099)
chr5 (14-235)||(22331842-22332063)
chr5 (14-235)||(34567704-34567925)
chr5 (14-235)||(37290451-37290672)
chr5 (14-235)||(16357712-16357933)
chr5 (14-235)||(27611564-27611785)
chr5 (14-235)||(27684355-27684576)
chr5 (14-235)||(14998694-14998915)
chr5 (14-235)||(27667445-27667666)
chr5 (14-235)||(29475028-29475249)
chr5 (14-235)||(27519616-27519837)
chr5 (14-235)||(40709990-40710211)
chr5 (14-224)||(18777017-18777227)
chr5 (14-235)||(23574939-23575160)
chr5 (14-235)||(23441420-23441641)
chr5 (14-235)||(25427643-25427864)
chr5 (14-183)||(20800659-20800828)
chr5 (17-235)||(23472438-23472655)
chr5 (14-235)||(21562928-21563149)
chr5 (20-235)||(26737688-26737903)
chr5 (17-235)||(20467056-20467274)
chr5 (17-235)||(21338255-21338473)
chr5 (14-224)||(28893897-28894107)
chr5 (14-224)||(28915368-28915578)
chr5 (14-224)||(28922723-28922933)
chr5 (14-224)||(28930636-28930846)
chr5 (14-224)||(20822656-20822866)
chr5 (101-235)||(21882159-21882293)
chr5 (14-224)||(22463154-22463364)
chr5 (14-235)||(17268289-17268510)
chr5 (14-224)||(22503882-22504092)
chr5 (29-235)||(24619265-24619471)
chr5 (29-235)||(24715496-24715702)
chr5 (29-235)||(24748524-24748730)
chr5 (14-235)||(21872006-21872226)
chr5 (14-235)||(21876286-21876506)
chr5 (17-213)||(21679736-21679932)
chr5 (14-224)||(21936143-21936353)
chr5 (14-224)||(14885946-14886156)
chr5 (14-224)||(24797352-24797562)
chr5 (23-224)||(23079053-23079254)
chr5 (36-224)||(24582413-24582601)
chr5 (14-224)||(20343485-20343695)
chr5 (14-224)||(22234875-22235085)
chr5 (35-224)||(25849278-25849467)
chr5 (14-150)||(20777190-20777326)
chr5 (23-235)||(21408348-21408560)
chr5 (14-224)||(27012287-27012497)
chr5 (14-219)||(37542336-37542541)
chr5 (92-193)||(822-923)
chr5 (106-222)||(21497147-21497263)
chr5 (178-235)||(21830880-21830937)
chr5 (14-127)||(23504544-23504657)
chr5 (152-224)||(20774962-20775034)
chr5 (203-235)||(23517736-23517768)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (11-224)||(28262112-28262325)
chr6 (11-224)||(28340861-28341074)
chr6 (11-235)||(27188578-27188802)
chr6 (11-235)||(27260438-27260662)
chr6 (14-235)||(1542002-1542223)
chr6 (14-235)||(2873721-2873942)
chr6 (14-235)||(25113694-25113915)
chr6 (14-235)||(29590838-29591059)
chr6 (14-235)||(27564739-27564960)
chr6 (14-234)||(24312086-24312306)
chr6 (14-234)||(22435012-22435232)
chr6 (14-234)||(22443410-22443630)
chr6 (14-235)||(16962363-16962584)
chr6 (14-235)||(19865829-19866050)
chr6 (14-235)||(25608779-25609000)
chr6 (11-235)||(5838134-5838358)
chr6 (30-235)||(20636235-20636440)
chr6 (14-235)||(16926556-16926779)
chr6 (14-224)||(22761373-22761583)
chr6 (17-225)||(18196654-18196862)
chr6 (20-235)||(18406868-18407083)
chr6 (14-235)||(23079611-23079832)
chr6 (14-224)||(15460489-15460699)
chr6 (14-122)||(16621998-16622106)
chr6 (16-235)||(15897236-15897454)
chr6 (14-235)||(21472743-21472964)
chr6 (14-235)||(28281731-28281952)
chr6 (14-235)||(21563050-21563271)
chr6 (14-235)||(21568909-21569130)
chr6 (14-213)||(18795854-18796053)
chr6 (11-235)||(19488187-19488411)
chr6 (14-224)||(19454573-19454783)
chr6 (14-235)||(5296124-5296345)
chr6 (116-235)||(16625737-16625856)
chr6 (14-224)||(16381291-16381501)
chr6 (14-224)||(24365565-24365775)
chr6 (23-224)||(10467776-10467977)
chr6 (17-189)||(18966216-18966388)
chr6 (17-213)||(34644507-34644703)
chr6 (14-224)||(14378835-14379045)
chr6 (14-224)||(14380385-14380595)
chr6 (14-114)||(21754481-21754581)
chr6 (39-224)||(16648912-16649097)
chr6 (36-235)||(18449652-18449851)
chr6 (17-224)||(19880451-19880658)
chr6 (14-224)||(23997401-23997611)
chr6 (14-127)||(14624275-14624388)
chr6 (14-220)||(1647732-1647938)
chr6 (14-224)||(16234181-16234391)
chr6 (14-224)||(18836826-18837036)
chr6 (14-127)||(16099259-16099372)
chr6 (23-224)||(19436155-19436356)
chr6 (97-224)||(8761934-8762061)
chr6 (14-224)||(14129622-14129832)
chr6 (14-235)||(35275004-35275225)
chr6 (15-235)||(23026635-23026855)
chr6 (14-224)||(21928358-21928568)
chr6 (14-127)||(18574439-18574552)
chr6 (14-63)||(25764146-25764195)
chr6 (178-231)||(22077772-22077825)
chr6 (62-118)||(19986388-19986444)
chr6 (179-224)||(18572806-18572851)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (14-235)||(8675-8896)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (14-235)||(13253587-13253808)
chr3 (14-235)||(16636670-16636891)
chr3 (14-235)||(20061066-20061287)
chr3 (14-235)||(43163994-43164215)
chr3 (11-235)||(6601633-6601857)
chr3 (11-235)||(53384027-53384251)
chr3 (16-235)||(15347259-15347478)
chr3 (14-235)||(15588404-15588625)
chr3 (14-235)||(48426344-48426565)
chr3 (14-235)||(5423942-5424163)
chr3 (14-235)||(15340166-15340387)
chr3 (14-235)||(15401529-15401750)
chr3 (14-235)||(15723946-15724167)
chr3 (14-235)||(10006497-10006718)
chr3 (14-235)||(10907107-10907328)
chr3 (14-235)||(16411294-16411515)
chr3 (14-234)||(14875511-14875731)
chr3 (14-235)||(14125606-14125827)
chr3 (14-235)||(16805959-16806180)
chr3 (14-235)||(12499145-12499366)
chr3 (14-235)||(14579954-14580175)
chr3 (14-235)||(16491193-16491414)
chr3 (14-224)||(16693072-16693282)
chr3 (14-235)||(15062615-15062836)
chr3 (14-176)||(3686899-3687061)
chr3 (14-235)||(17490747-17490968)
chr3 (17-235)||(15260527-15260745)
chr3 (40-235)||(14574830-14575025)
chr3 (11-114)||(5109620-5109723)
chr3 (14-224)||(10419046-10419256)
chr3 (14-224)||(12359528-12359738)
chr3 (14-235)||(16379929-16380150)
chr3 (14-235)||(44778154-44778375)
chr3 (14-224)||(31939821-31940031)
chr3 (14-235)||(13942931-13943152)
chr3 (14-235)||(16827204-16827425)
chr3 (14-235)||(41178429-41178650)
chr3 (11-234)||(15228557-15228780)
chr3 (11-234)||(15234425-15234648)
chr3 (14-224)||(16835511-16835721)
chr3 (14-235)||(17187281-17187502)
chr3 (14-224)||(31694187-31694397)
chr3 (17-213)||(13971124-13971320)
chr3 (23-224)||(11960179-11960380)
chr3 (14-235)||(12179245-12179466)
chr3 (23-224)||(16337522-16337723)
chr3 (14-224)||(30138724-30138934)
chr3 (14-224)||(30148275-30148485)
chr3 (36-224)||(13319525-13319713)
chr3 (14-224)||(16328661-16328871)
chr3 (14-224)||(8273411-8273621)
chr3 (14-224)||(13966356-13966566)
chr3 (14-224)||(16741715-16741925)
chr3 (14-224)||(28755236-28755446)
chr3 (14-224)||(47124862-47125072)
chr3 (17-216)||(14087599-14087798)
chr3 (38-235)||(15014792-15014989)
chr3 (11-219)||(55514727-55514935)
chr3 (14-224)||(16258062-16258272)
chr3 (14-224)||(18133347-18133557)
chr3 (14-224)||(6151865-6152075)
chr3 (50-224)||(18750862-18751036)
chr3 (14-224)||(25767236-25767446)
chr3 (14-224)||(15611021-15611231)
chr3 (109-235)||(17493537-17493663)
chr3 (182-235)||(16755765-16755818)
chr3 (36-224)||(12793059-12793247)
chr3 (11-118)||(15096030-15096137)
chr3 (14-224)||(17194012-17194222)
chr3 (11-59)||(16755710-16755758)
chr3 (11-115)||(6711421-6711525)
chr3 (14-83)||(10384730-10384799)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (14-235)||(21144354-21144575)
chr2 (14-235)||(24263279-24263500)
chr2 (14-235)||(16926269-16926490)
chr2 (14-235)||(16999909-17000130)
chr2 (14-235)||(16923798-16924019)
chr2 (14-235)||(16983061-16983282)
chr2 (14-235)||(41607698-41607919)
chr2 (14-235)||(44384882-44385103)
chr2 (14-235)||(10869759-10869980)
chr2 (14-235)||(24710943-24711164)
chr2 (14-235)||(24876062-24876283)
chr2 (14-235)||(27218925-27219146)
chr2 (14-235)||(27372178-27372399)
chr2 (14-235)||(22324169-22324390)
chr2 (14-235)||(21324579-21324800)
chr2 (14-235)||(24676398-24676619)
chr2 (46-235)||(17064626-17064815)
chr2 (14-224)||(24706795-24707005)
chr2 (14-235)||(23107043-23107264)
chr2 (11-235)||(23111645-23111869)
chr2 (17-123)||(23072884-23072990)
chr2 (14-235)||(12575262-12575483)
chr2 (14-235)||(23277685-23277906)
chr2 (14-235)||(23099331-23099552)
chr2 (14-235)||(27788650-27788870)
chr2 (23-235)||(45533254-45533466)
chr2 (14-224)||(20829179-20829389)
chr2 (14-165)||(25264033-25264184)
chr2 (14-224)||(1064671-1064881)
chr2 (14-224)||(12639546-12639756)
chr2 (14-224)||(23294855-23295065)
chr2 (14-224)||(24949510-24949720)
chr2 (14-224)||(27209485-27209695)
chr2 (23-215)||(30210240-30210432)
chr2 (14-224)||(19651363-19651573)
chr2 (23-216)||(30011506-30011699)
chr2 (14-210)||(31831592-31831788)
chr2 (14-224)||(24830501-24830711)
chr2 (14-224)||(22279025-22279235)
chr2 (14-225)||(22760882-22761093)
chr2 (14-123)||(25129630-25129739)
chr2 (14-224)||(24568981-24569191)
chr2 (134-235)||(23067300-23067400)
chr2 (71-155)||(17967134-17967218)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (14-235)||(8248-8469)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (14-235)||(44790133-44790354)
chr7 (14-235)||(8199895-8200116)
chr7 (14-235)||(11235995-11236216)
chr7 (14-235)||(14333663-14333884)
chr7 (14-235)||(8708872-8709093)
chr7 (14-235)||(15159839-15160060)
chr7 (14-235)||(18179009-18179230)
chr7 (14-235)||(10872262-10872483)
chr7 (14-235)||(13687331-13687552)
chr7 (14-235)||(11551884-11552105)
chr7 (14-235)||(14955821-14956042)
chr7 (14-235)||(18550540-18550761)
chr7 (14-235)||(23202395-23202616)
chr7 (14-235)||(23508522-23508743)
chr7 (14-235)||(12688767-12688989)
chr7 (14-235)||(16100-16321)
chr7 (14-235)||(14212941-14213162)
chr7 (14-235)||(320819-321040)
chr7 (14-235)||(9597324-9597545)
chr7 (14-235)||(15147667-15147888)
chr7 (20-235)||(11771029-11771244)
chr7 (20-235)||(14040962-14041177)
chr7 (20-235)||(14350992-14351207)
chr7 (17-235)||(15204886-15205104)
chr7 (14-235)||(19148479-19148700)
chr7 (14-235)||(20747878-20748099)
chr7 (23-235)||(15101372-15101584)
chr7 (23-235)||(12205569-12205781)
chr7 (14-235)||(11387188-11387409)
chr7 (14-235)||(15341699-15341920)
chr7 (14-235)||(16071055-16071276)
chr7 (14-235)||(18052713-18052934)
chr7 (14-235)||(23504630-23504851)
chr7 (14-235)||(14285136-14285357)
chr7 (14-213)||(14263004-14263203)
chr7 (14-224)||(7825178-7825388)
chr7 (14-224)||(27106556-27106766)
chr7 (14-224)||(27171559-27171769)
chr7 (23-224)||(12457919-12458120)
chr7 (23-224)||(13022636-13022837)
chr7 (17-213)||(19613965-19614161)
chr7 (29-224)||(16949247-16949442)
chr7 (14-224)||(166-377)
chr7 (14-224)||(13666816-13667026)
chr7 (14-224)||(11305023-11305233)
chr7 (47-224)||(26117398-26117575)
chr7 (14-222)||(4441208-4441416)
chr7 (21-224)||(39935-40138)
chr7 (14-198)||(13967428-13967612)
chr7 (17-129)||(15625898-15626010)
chr7 (14-224)||(49153580-49153790)
chr7 (11-115)||(15717682-15717786)
chr7 (14-118)||(17925035-17925139)
chr7 (11-125)||(23642820-23642934)
chr7 (69-222)||(13354429-13354582)
chr7 (50-224)||(14937625-14937799)
chr7 (50-224)||(15365218-15365392)
chr7 (158-235)||(15625821-15625898)
chr7 (14-118)||(21673316-21673420)
chr7 (62-114)||(17144092-17144144)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (14-235)||(108587-108808)
scaffold0029 (17-213)||(113890-114086)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (14-235)||(9783-10004)
scaffold0028 (14-224)||(16256-16466)
scaffold0028 (14-235)||(44460-44681)
scaffold0028 (17-213)||(49293-49489)
scaffold0028 (14-114)||(105349-105449)
scaffold0028 (179-224)||(105514-105559)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (14-235)||(19114034-19114255)
chr8 (14-235)||(20017479-20017700)
chr8 (11-235)||(19483277-19483501)
chr8 (14-235)||(17673239-17673460)
chr8 (14-235)||(18857921-18858142)
chr8 (14-235)||(22119390-22119611)
chr8 (14-235)||(22128174-22128395)
chr8 (14-235)||(30312360-30312581)
chr8 (14-235)||(21165754-21165975)
chr8 (14-235)||(22041203-22041424)
chr8 (14-229)||(22132257-22132472)
chr8 (14-235)||(32601488-32601709)
chr8 (14-235)||(15534727-15534948)
chr8 (14-235)||(19979311-19979532)
chr8 (14-235)||(21043789-21044010)
chr8 (17-235)||(21393084-21393302)
chr8 (17-235)||(21787578-21787796)
chr8 (14-235)||(23651385-23651606)
chr8 (14-235)||(21252288-21252509)
chr8 (18-224)||(20395352-20395558)
chr8 (14-213)||(21920952-21921151)
chr8 (17-233)||(22247652-22247868)
chr8 (11-235)||(20389443-20389667)
chr8 (14-235)||(23656271-23656492)
chr8 (14-235)||(31570058-31570279)
chr8 (23-235)||(20984772-20984984)
chr8 (14-220)||(21324485-21324691)
chr8 (14-129)||(16407333-16407448)
chr8 (14-235)||(20009137-20009357)
chr8 (23-224)||(29302651-29302852)
chr8 (14-213)||(21841783-21841982)
chr8 (14-224)||(6605013-6605223)
chr8 (14-224)||(20974872-20975082)
chr8 (23-235)||(22052207-22052419)
chr8 (14-224)||(16270440-16270650)
chr8 (35-224)||(12306113-12306302)
chr8 (14-235)||(22372275-22372496)
chr8 (17-210)||(23886393-23886586)
chr8 (14-224)||(16876311-16876521)
chr8 (23-224)||(31415696-31415897)
chr8 (17-235)||(22376672-22376891)
chr8 (17-235)||(22382847-22383066)
chr8 (14-224)||(14566497-14566707)
chr8 (14-224)||(22435658-22435868)
chr8 (110-235)||(19852755-19852880)
chr8 (110-235)||(19858791-19858916)
chr8 (21-224)||(19869048-19869251)
chr8 (14-165)||(27355950-27356101)
chr8 (14-224)||(20651549-20651759)
chr8 (50-224)||(21849589-21849763)
chr8 (14-222)||(23901544-23901752)
chr8 (14-117)||(23156256-23156359)
chr8 (14-118)||(22316652-22316756)
chr8 (14-225)||(21195718-21195929)
chr8 (14-114)||(19860900-19861000)
chr8 (23-234)||(22623268-22623472)
chr8 (179-224)||(23156393-23156438)
chr8 (143-235)||(1267582-1267674)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (14-235)||(8706-8927)
scaffold0080 (14-150)||(49484-49620)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (14-235)||(19911-20132)
scaffold0081 (14-235)||(35335-35556)
scaffold0081 (14-235)||(50741-50962)
scaffold0081 (104-235)||(315-446)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (14-235)||(4129-4350)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (14-235)||(28144-28365)
scaffold0023 (23-235)||(60062-60274)
scaffold0023 (14-220)||(54717-54923)
scaffold0023 (143-224)||(3361-3442)
scaffold0023 (167-224)||(131426-131483)
scaffold0023 (11-81)||(3278-3348)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (14-222)||(12768-12976)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (14-235)||(277606-277827)
scaffold0005 (14-235)||(261617-261838)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (14-224)||(32349-32559)
scaffold0109 (14-235)||(9905-10126)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (14-235)||(29347-29568)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (14-235)||(1727-1948)
scaffold0044 (14-235)||(15467-15688)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (14-235)||(66714-66935)
scaffold0042 (14-235)||(38596-38817)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (14-235)||(79270-79491)
scaffold0022 (20-83)||(55230-55293)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (11-235)||(3503-3727)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (14-235)||(30254-30475)
scaffold0026 (25-235)||(29366-29576)
scaffold0026 (23-186)||(50168-50331)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (14-223)||(23849-24058)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (14-229)||(57332-57547)
scaffold0017 (14-224)||(18843-19053)
scaffold0017 (14-235)||(196263-196475)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (14-235)||(7323-7544)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (14-235)||(3181-3402)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (14-235)||(19117-19338)
scaffold0114 (14-224)||(21207-21417)
scaffold0114 (14-213)||(45848-46047)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (14-235)||(7358-7579)
scaffold0358 (164-235)||(3535-3606)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (14-235)||(13987-14208)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (11-224)||(16974-17187)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (11-235)||(31526-31750)
scaffold0180 (14-224)||(12303-12513)
scaffold0180 (11-123)||(34524-34636)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (11-223)||(102554-102766)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (14-221)||(13381-13588)
scaffold0120 (17-235)||(7329-7547)
scaffold0120 (14-235)||(328-549)
scaffold0120 (14-224)||(23496-23706)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (14-235)||(75-296)
scaffold0319 (14-235)||(2578-2799)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (14-224)||(7429-7639)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (37-235)||(39688-39886)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (14-235)||(7107-7328)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (14-235)||(7681-7902)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (11-224)||(25718-25930)
scaffold0243 (62-224)||(802-964)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-224)||(7860-8073)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (11-235)||(2745-2969)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-235)||(10278-10485)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (17-235)||(38727-38945)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (14-235)||(6530-6751)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (11-235)||(202241-202465)
scaffold0004 (14-224)||(324024-324234)
scaffold0004 (17-235)||(118535-118753)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (17-224)||(112267-112474)
scaffold0040 (17-235)||(16186-16404)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (14-235)||(41007-41228)
scaffold0102 (14-115)||(47189-47289)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (24-210)||(22971-23157)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (14-235)||(48413-48634)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (14-210)||(8435-8631)
scaffold0647 (17-235)||(2217-2428)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (23-235)||(2270-2482)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-235)||(177036-177259)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (14-235)||(39866-40087)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (23-235)||(16762-16974)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (17-235)||(6670-6888)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (17-235)||(13777-13995)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (14-216)||(18677-18879)
scaffold0244 (14-224)||(25553-25763)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (11-235)||(23852-24069)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (14-219)||(5101-5306)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (14-235)||(6059-6280)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (14-235)||(15421-15642)
scaffold0266 (14-224)||(8637-8847)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (14-235)||(5739-5960)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (11-235)||(11102-11326)
scaffold0309 (14-81)||(16103-16170)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (25-224)||(2213-2412)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (14-224)||(3496-3706)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (23-213)||(1200-1390)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (17-235)||(17994-18212)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (17-235)||(5180-5398)
scaffold0270 (17-235)||(12310-12528)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (14-235)||(47810-48031)
scaffold0053 (14-235)||(56623-56844)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (14-235)||(108939-109160)
scaffold0031 (11-123)||(55764-55876)
scaffold0031 (143-235)||(62936-63028)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (17-224)||(3234-3441)
scaffold0010 (14-224)||(46175-46385)
scaffold0010 (14-224)||(41109-41319)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (17-235)||(4421-4639)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (17-235)||(25312-25530)
scaffold0011 (14-224)||(149890-150099)
scaffold0011 (14-224)||(194480-194690)
scaffold0011 (14-224)||(181244-181454)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (30-235)||(11578-11783)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (14-235)||(27934-28154)
scaffold0067 (14-165)||(59990-60141)
scaffold0067 (14-165)||(50956-51107)
scaffold0067 (14-165)||(66378-66529)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (23-224)||(44103-44304)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (23-235)||(310-522)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (11-123)||(473-585)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (23-235)||(4058-4270)
scaffold0035 (41-224)||(42910-43093)
scaffold0035 (21-224)||(11979-12182)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (14-224)||(55676-55886)
scaffold0076 (14-224)||(41578-41788)
scaffold0076 (17-213)||(32456-32652)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (14-224)||(20440-20650)
scaffold0058 (23-193)||(57976-58146)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (14-224)||(68690-68900)
scaffold0034 (14-224)||(3729-3939)
scaffold0034 (14-224)||(12684-12894)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (23-224)||(6930-7131)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (14-235)||(80608-80829)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-235)||(218202-218414)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (23-235)||(287-499)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (14-235)||(5865-6088)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (14-222)||(34792-35000)
scaffold0139 (101-222)||(28539-28660)
scaffold0139 (178-235)||(98-155)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-235)||(39533-39756)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (17-235)||(15260-15479)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (14-224)||(1630-1840)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (14-224)||(3048-3258)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (14-224)||(1203-1413)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (14-224)||(6014-6224)
scaffold0367 (30-117)||(1-88)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (14-224)||(30061-30271)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (14-224)||(13520-13730)
scaffold0124 (14-223)||(6584-6793)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (14-235)||(6522-6743)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (23-222)||(284-483)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (17-224)||(846-1053)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (14-224)||(2131-2341)
scaffold0222 (35-224)||(8380-8569)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (14-224)||(42237-42447)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (14-224)||(15489-15699)
scaffold0089 (152-235)||(10746-10829)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (17-235)||(115684-115902)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (42-235)||(32720-32913)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (23-235)||(9593-9805)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (143-235)||(26283-26375)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (14-165)||(25-176)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (14-225)||(13075-13286)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (14-224)||(2651-2861)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (17-235)||(13860-14078)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (14-224)||(24714-24924)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (14-224)||(14228-14438)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (23-224)||(1619-1820)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (14-235)||(2897-3118)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (14-155)||(2970-3111)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (14-219)||(749-954)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-224)||(249933-250134)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (14-213)||(10665-10864)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (29-224)||(10848-11043)
scaffold0298 (29-224)||(14618-14813)
scaffold0298 (14-165)||(21362-21513)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (29-236)||(35421-35628)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (14-224)||(644-854)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (14-224)||(5112-5322)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (14-235)||(464-684)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (14-235)||(20158-20379)
scaffold0090 (14-235)||(24320-24541)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (14-229)||(10233-10448)
scaffold0235 (14-229)||(20447-20662)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (104-235)||(89311-89442)
scaffold0001 (104-235)||(89989-90120)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (14-96)||(1-83)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (81-235)||(9859-10013)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (14-224)||(16340-16550)
scaffold0077 (14-235)||(25658-25879)
scaffold0077 (14-224)||(27042-27252)
scaffold0077 (14-118)||(20353-20457)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (14-235)||(27833-28054)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (23-224)||(32104-32305)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (23-224)||(23534-23735)
scaffold0104 (47-224)||(20714-20891)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-235)||(50651-50872)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (15-224)||(72509-72718)
scaffold0021 (14-224)||(15751-15961)
scaffold0021 (14-224)||(25282-25492)
scaffold0021 (14-127)||(6628-6741)
scaffold0021 (14-224)||(32189-32399)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (56-224)||(2148-2316)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (14-224)||(6494-6704)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (61-235)||(24699-24873)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (14-224)||(28253-28463)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (14-224)||(25146-25356)
scaffold0008 (14-224)||(133265-133475)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (14-235)||(19356-19577)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (17-198)||(343-524)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (17-213)||(6464-6660)
scaffold0117 (62-235)||(248-421)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (29-224)||(8585-8780)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (14-224)||(782-992)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (14-224)||(100338-100548)
scaffold0020 (188-235)||(181508-181555)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (86-235)||(96473-96622)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (17-224)||(7669-7876)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (14-117)||(2728-2831)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (97-224)||(4311-4438)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (14-224)||(10614-10824)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (95-224)||(14157-14285)
scaffold0261 (95-224)||(22336-22464)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (41-150)||(6151-6260)
scaffold0149 (41-150)||(10582-10691)
scaffold0149 (173-235)||(6265-6327)
scaffold0149 (173-235)||(10696-10758)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (143-235)||(24776-24868)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (23-235)||(85304-85516)
scaffold0007 (36-127)||(92834-92925)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (69-224)||(64-219)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (23-136)||(1608-1721)
scaffold0509 (23-136)||(8036-8149)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (158-235)||(5340-5417)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (15-83)||(34675-34743)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (35-129)||(1-95)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (14-235)||(3853-4074)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (14-127)||(11486-11599)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (14-235)||(13590-13811)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (14-58)||(1552-1596)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (14-58)||(8469-8513)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (14-124)||(15478-15588)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (68-118)||(8897-8947)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (14-114)||(1578-1678)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (158-224)||(12053-12119)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (178-235)||(2-59)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (179-224)||(8492-8537)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (186-235)||(1005-1054)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23957246 - 23957025
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957246 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 23957147  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957146 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 23957047  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  23957046 attgcatatgtccgctatgatg 23957025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12525175 - 12524954
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12525175 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgcagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 12525076  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12525075 ggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12524976  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12524975 attgcatatgttcgctatgatg 12524954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29037917 - 29038138
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29037917 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 29038016  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038017 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 29038116  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  29038117 attgcatatgtccgccatgatg 29038138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 8052136 - 8052357
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052136 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8052235  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052236 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8052335  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  8052336 attgcatatgtccgccatgatg 8052357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27712835 - 27712614
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27712835 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 27712736  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27712735 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagac 27712636  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  27712635 attgcatatgtccgccatgatg 27712614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14302491 - 14302712
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14302491 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 14302590  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14302591 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagat 14302690  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  14302691 attgcatatgtccgctatgatg 14302712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40474539 - 40474318
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40474539 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 40474440  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40474439 ggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagac 40474340  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  40474339 attgcatatgtccgctatgatg 40474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8387911 - 8387690
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387911 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8387812  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387811 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8387712  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  8387711 attgcatatgtccgccatgatg 8387690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12478099 - 12477878
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478099 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 12478000  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477999 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12477900  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  12477899 attgcatatgtccgccatgatg 12477878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 19777306 - 19777527
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777306 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 19777405  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777406 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 19777505  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  19777506 attgcatatgtccgccatgatg 19777527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16353958 - 16354179
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16353958 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 16354057  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354058 ggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16354157  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  16354158 attgcatatgtccgctatgatg 16354179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18298704 - 18298483
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298704 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18298605  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298604 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 18298505  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  18298504 attgcatatgtccgccatgatg 18298483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14682066 - 14681856
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14682066 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 14681967  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |  ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681966 ggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  14681866 attgcatatgt 14681856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18614337 - 18614558
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18614337 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcataagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18614436  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  18614437 gacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagac 18614536  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  18614537 attgcatatgtccgctttgatg 18614558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15146398 - 15146619
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15146398 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacgagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15146497  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||||||  |||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15146498 ggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagac 15146597  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  15146598 gttgcatatgtccgctatgatg 15146619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 18225962 - 18226169
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18225962 aagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcaaaaggaattaaatatgaggc 18226061  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18226062 agcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacatt 18226161  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
    ||||||||    
T  18226162 gcatatgt 18226169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14160969 - 14160748
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14160969 ttgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaacatga 14160870  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  14160869 ggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagac 14160770  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  14160769 cttgcatatgtccgctatgatg 14160748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8707419 - 8707198
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  8707419 gttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttatcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatg 8707320  T
Q  113 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8707319 ag-cagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 8707221  T
Q  213 cattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||  |||||||||    
T  8707220 cgttgcatatgtctgctatgatg 8707198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14695609 - 14695390
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  14695609 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagac 14695510  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  14695509 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagtt 14695410  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatgt 236  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14695409 gcatatgtccgctatgatgt 14695390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 14849882 - 14850100
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |    
T  14849882 aagatatggagacattatttgtacgattctagatttgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagac 14849981  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||  | || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  14849982 agcgaaggtggcttgaatttgtgaaagactatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgtt 14850081  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  14850082 gcatatgtccgctgtgatg 14850100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15002137 - 15002358
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||||||||    
T  15002137 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatga 15002236  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15002237 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 15002336  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  15002337 gttgcacatgtcggctatgatg 15002358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15247407 - 15247202
Alignment:
Q  30 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 129  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15247407 attatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggct 15247308  T
Q  130 agagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgct 229  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||  |||    
T  15247307 tgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgct 15247208  T
Q  230 atgatg 235  Q
    ||||||    
T  15247207 atgatg 15247202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15071858 - 15071637
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  15071858 ttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttttttgaccaaaaggaattgaatatga 15071759  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15071758 ggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagac 15071659  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  15071658 gttgcacatgtctgctatgatg 15071637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 51605565 - 51605786
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51605565 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 51605664  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  51605665 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagac 51605764  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  51605765 actccatatgtctgctatgatg 51605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16149210 - 16149000
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16149210 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 16149111  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16149110 ggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagac 16149011  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  16149010 attgcatatgt 16149000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16153356 - 16153146
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16153356 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 16153257  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16153256 ggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagac 16153157  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  16153156 attgcatatgt 16153146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27901885 - 27901675
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  27901885 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatatgtttgaacaaaaagaattgaacatga 27901786  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27901785 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 27901686  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  27901685 attgcacatgt 27901675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15320599 - 15320425
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  15320599 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatg 15320500  T
Q  150 actttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15320499 attttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 15320425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 1648050 - 1648260
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  1648050 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagtatttagtgaccacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggagctgaacatga 1648149  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||| ||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1648150 ggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagac 1648249  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  1648250 attgcacatgt 1648260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33224422 - 33224212
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  33224422 ttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 33224323  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || | || |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  33224322 ggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagac 33224223  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    ||| |||||||    
T  33224222 attacatatgt 33224212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15357893 - 15358114
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  15357893 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 15357992  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| ||||||||  |||| || | || |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15357993 ggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 15358092  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  15358093 gttgcatatgtctgctatgatg 15358114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9292335 - 9292124
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 112  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  9292335 gttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 9292236  T
Q  113 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9292235 aggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcacttgagttatcatcctgggagggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaaga 9292136  T
Q  213 cattgcatatgt 224  Q
    | ||||||||||    
T  9292135 ctttgcatatgt 9292124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 3263567 - 3263777
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  3263567 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 3263666  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  3263667 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 3263766  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  3263767 tttgcacatgt 3263777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 29452310 - 29452520
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  29452310 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 29452409  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29452410 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 29452509  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  29452510 gttgcacatgt 29452520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Original strand, 15413849 - 15414020
Alignment:
Q  64 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaat 163  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||    
T  15413849 tgatcacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaat 15413948  T
Q  164 tatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatg 15414020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 11206004 - 11206214
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  11206004 ttgaaaatttggaggcattctttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 11206103  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  11206104 ggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaac 11206203  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  11206204 tttgcacatgt 11206214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 15291931 - 15292141
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  15291931 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 15292030  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15292031 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 15292130  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  15292131 tttgcatatgt 15292141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 56566304 - 56566368
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 78  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56566304 ttgaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 56566368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 44660654 - 44660849
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||| ||| | || |||     
T  44660654 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggt 44660753  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  44660754 tagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgt 44660849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14998814 - 14998605
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  14998814 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 14998716  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14998715 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 14998616  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  14998615 tttgcatatgt 14998605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 18548839 - 18549042
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18548839 tatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgagacagcg 18548938  T
Q  121 aagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 220  Q
     |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||   | | |||||| | ||| |  || ||||| || || |||||||||||||||||| | |||||     
T  18548939 gagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaaataagttatcatctagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcac 18549038  T
Q  221 atgt 224  Q
    ||||    
T  18549039 atgt 18549042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 12341639 - 12341742
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 114  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |  ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12341639 tgaagatttggaggcattatttgtatcattctaagtttgaagtgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgag 12341738  T
Q  115 gcag 118  Q
    ||||    
T  12341739 gcag 12341742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20892391 - 20892271
Alignment:
Q  104 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttga 203  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  20892391 ttgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattga 20892292  T
Q  204 gtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  20892291 gcaggaaaacattgcatatgt 20892271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13248979 - 13248934
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13248979 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 13248934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 33389874 - 33390095
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389874 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 33389973  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389974 ggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 33390073  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  33390074 attgcatatgtccgctatgatg 33390095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16349441 - 16349662
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349441 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16349540  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349541 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16349640  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16349641 attgcatatgtccgccatgatg 16349662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21831817 - 21831596
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831817 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 21831718  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831717 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 21831618  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  21831617 attgcatatgtccgctatgatg 21831596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 41352504 - 41352728
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41352504 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 41352603  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41352604 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 41352703  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  41352704 gacattgcatatgtccgccatgatg 41352728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 51332338 - 51332559
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51332338 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 51332437  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51332438 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagac 51332537  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  51332538 attgcatatgtccgctatgatg 51332559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21838465 - 21838243
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatca-caagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838465 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcagcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 21838366  T
Q  113 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838365 agacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 21838266  T
Q  213 cattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  21838265 cattgcatatgtccgccatgatg 21838243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19107882 - 19107661
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19107882 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 19107783  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107782 ggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 19107683  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  19107682 attgtatatgtccgctatgatg 19107661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 17043860 - 17044081
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17043860 ttgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttggatcagaaggaattgaatatga 17043959  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17043960 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  17044060 attgcatatgtccgctttgatg 17044081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21234576 - 21234797
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21234576 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatattagttcgatcaaaaggaattgaatatga 21234675  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21234676 gacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 21234775  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| |||| |||||    
T  21234776 gttgcatatgtccgctttgatg 21234797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21025684 - 21025466
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21025684 aagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggc 21025585  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025584 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 21025485  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  21025484 gcatatgtccgctatgatg 21025466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 430961 - 431182
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  430961 ttgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 431060  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  431061 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 431160  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  431161 cttgcatatgtctgctatgatg 431182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 24793462 - 24793658
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24793462 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaacgaattgaacatga 24793561  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    | || ||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793562 gacaacgaaggtggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaa 24793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21750454 - 21750244
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21750454 ttgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatga 21750355  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21750354 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 21750255  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  21750254 attgcatatgt 21750244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 22361092 - 22361310
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22361092 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaagtaattgaatatgaggc 22361191  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  || |  |||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22361192 agcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacctt 22361291  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||| |  |||||||||    
T  22361292 gcatatatctgctatgatg 22361310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22110530 - 22110315
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22110530 atatggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22110431  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22110430 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22110331  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| | ||||||||    
T  22110330 tatgtcctctatgatg 22110315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22114379 - 22114164
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22114379 atatggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22114280  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22114279 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22114180  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| | ||||||||    
T  22114179 tatgtcctctatgatg 22114164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21744397 - 21744618
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || | ||||| || |||||||||||||    
T  21744397 ttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgattgatcaaaaagaattgaatatga 21744496  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21744497 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagac 21744596  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  21744597 gttgcacatgtctgctatgatg 21744618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Original strand, 19661975 - 19662192
Alignment:
Q  7 tttggtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattg 106  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||| |||||||||    
T  19661975 tttggttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattg 19662074  T
Q  107 aatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagta 206  Q
    || ||||||||| | || ||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19662075 aacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagta 19662174  T
Q  207 ggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19662175 ggaagacattgcatatgt 19662192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16373980 - 16373823
Alignment:
Q  78 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtat 177  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  16373980 tgaagcatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaa 16373881  T
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  16373880 agctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatg 16373823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 20834745 - 20834955
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20834745 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaggaattgaacatga 20834844  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20834845 ggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 20834944  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  20834945 gctgcatatgt 20834955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 20855605 - 20855815
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  20855605 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 20855704  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20855705 ggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 20855804  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  20855805 gttgcacatgt 20855815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 23197106 - 23197312
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  23197106 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 23197205  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgc 228  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||    
T  23197206 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgc 23197305  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  23197306 tatgatg 23197312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 24098457 - 24098658
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24098457 tggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 24098556  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  |  | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24098557 gatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatat 24098656  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  24098657 gt 24098658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19855819 - 19855609
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  19855819 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatga 19855720  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19855719 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 19855620  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  19855619 attgcatatgt 19855609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21952423 - 21952213
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21952423 ttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctgtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatga 21952324  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21952323 ggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagac 21952224  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  21952223 attgcatatgt 21952213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 20938908 - 20939118
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  20938908 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggtattcagtgattacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 20939007  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  20939008 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaat 20939107  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  20939108 gttgcatatgt 20939118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 20830237 - 20830447
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  20830237 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 20830336  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20830337 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 20830436  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  20830437 tttgcatatgt 20830447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 19759753 - 19759939
Alignment:
Q  49 atttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattat 148  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||| | || ||||||    
T  19759753 atttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattat 19759852  T
Q  149 gactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||    
T  19759853 gattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 19759939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077722
Alignment:
Q  143 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatg 16077722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20295917 - 20295716
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| || || |||||||   |||| ||||||||| |||    
T  20295917 tggagacattatttgtacggttccagatctgaggtgttcaatgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggttctgaacatgaggcagagaa 20295818  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20295817 gatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacat 20295718  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  20295717 gt 20295716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 31538842 - 31539047
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||    
T  31538842 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaggaactgaacatga 31538941  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  31538942 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 31539041  T
Q  214 attgca 219  Q
     |||||    
T  31539042 gttgca 31539047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 20060800 - 20060996
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| || || || |||||||| |||||||    
T  20060800 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggc 20060899  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | ||||| || || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20060900 agaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 20060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 22134402 - 22134612
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  22134402 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 22134501  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||| |||  |||||  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22134502 ggcaaagaaggtggtcagagtaccttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 22134601  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  22134602 tttgcatatgt 22134612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37678594 - 37678384
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  37678594 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaagaactgaacatga 37678495  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||  || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  37678494 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtaggaaaac 37678395  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  37678394 gttgcacatgt 37678384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16377646 - 16377587
Alignment:
Q  24 ggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16377646 ggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttaagtgatcacaagagtttgaagt 16377587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 41216702 - 41216815
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  41216702 ttgaagatttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41216801  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||| ||||||||    
T  41216802 ggcagagaagatgg 41216815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 50619235 - 50619296
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  50619235 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtctgaa 50619296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20915115 - 20914905
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  20915115 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 20915016  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca-cccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| |||||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  20915015 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccagg-aaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaaga 20914917  T
Q  213 cattgcatatgt 224  Q
    | ||||||||||    
T  20914916 ctttgcatatgt 20914905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 52987285 - 52987212
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 87  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  52987285 ttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 52987212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41772276 - 41772052
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41772276 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaata 41772177  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41772176 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 41772077  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  41772076 gacattgcatatgtccgccatgatg 41772052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19771391 - 19771170
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19771391 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 19771292  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19771291 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagac 19771192  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  19771191 attgcatatgtccgccatgatg 19771170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22136099 - 22135878
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136099 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22136000  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135999 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22135900  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  22135899 attgcatatgtccgctatgatg 22135878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22331842 - 22332063
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331842 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22331941  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331942 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22332041  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  22332042 attgcatatgtccgctatgatg 22332063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34567925 - 34567704
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567925 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 34567826  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567825 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 34567726  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  34567725 attgcatatgtccgccatgatg 34567704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 37290451 - 37290672
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37290451 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 37290550  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290551 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 37290650  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  37290651 attgcatatgtccgctatgatg 37290672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16357933 - 16357712
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16357933 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggagttgaatatga 16357834  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357833 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16357734  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16357733 attgcatatgtccgccatgatg 16357712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27611785 - 27611564
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611785 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27611686  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611685 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27611586  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  27611585 attgcatatgtccgccatgatg 27611564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27684355 - 27684576
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684355 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27684454  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684455 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27684554  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  27684555 attgcatatgtccgctatgatg 27684576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14998694 - 14998915
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14998694 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 14998793  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998794 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14998893  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  14998894 attgcatatgtccgctatgatg 14998915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27667445 - 27667666
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667445 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27667544  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667545 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27667644  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  27667645 attgcatatgtccgccatgatg 27667666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29475028 - 29475249
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475028 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 29475127  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475128 gacagcgaagatgacttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 29475227  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  29475228 attgcatatgtccgctatgatg 29475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27519837 - 27519616
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519837 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27519738  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519737 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27519638  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  27519637 attgcatatgtccgccatgatg 27519616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40710211 - 40709990
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710211 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 40710112  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710111 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 40710012  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  40710011 attgcatatgtccgccatgatg 40709990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18777227 - 18777017
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777227 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18777128  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18777127 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 18777028  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  18777027 attgcatatgt 18777017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23575160 - 23574939
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23575160 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcaatcagaaagaattgaatatga 23575061  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23575060 ggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggc 23574961  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  23574960 attgcatatgtccgctatgatg 23574939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23441641 - 23441420
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23441641 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatga 23441542  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23441541 ggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 23441442  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  23441441 attgcatatgtccgctatgatg 23441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25427864 - 25427643
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25427864 ttgaagatatggagactttacttttatggttccagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatga 25427765  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25427764 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 25427665  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  25427664 cttgcatatgtctgctatgatg 25427643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20800828 - 20800659
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20800828 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 20800729  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaa 183  Q
    |||| ||||| ||||| || ||  | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20800728 ggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaa 20800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23472655 - 23472438
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23472655 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataa-agtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 23472557  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23472556 agcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 23472457  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23472456 gcatatgtccgctatgatg 23472438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21562928 - 21563149
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21562928 ttgaaaatttggaggcattatttgtacgactccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 21563027  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| ||  || | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21563028 ggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 21563127  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  21563128 gttgcatatgtatgctatgatg 21563149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 26737688 - 26737903
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||||     
T  26737688 atatggagacactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccataagagtttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagg 26737787  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| |||||| | || || ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26737788 gaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 26737887  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||||||||    
T  26737888 tatgtccgctatgatg 26737903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 20467056 - 20467274
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20467056 aagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagac 20467155  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||  |    
T  20467156 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactct 20467255  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  20467256 acatatgtccgctatgatg 20467274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21338255 - 21338473
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  21338255 aagatatagagacattacttgtattgttcgagatttgaagtgttcagcgaacacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagac 21338354  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |    
T  21338355 agcgaatgtggcttgaattgctgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgct 21338454  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  21338455 gcatatgtcagctatgatg 21338473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 28893897 - 28894107
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  28893897 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28893996  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28893997 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28894096  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  28894097 attgcacatgt 28894107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 28915368 - 28915578
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  28915368 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28915467  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28915468 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28915567  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  28915568 attgcacatgt 28915578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 28922723 - 28922933
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  28922723 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28922822  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28922823 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28922922  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  28922923 attgcacatgt 28922933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 28930636 - 28930846
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  28930636 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28930735  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28930736 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28930835  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  28930836 attgcacatgt 28930846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20822866 - 20822656
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||    
T  20822866 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatga 20822767  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20822766 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 20822667  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  20822666 attgcacatgt 20822656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21882293 - 21882159
Alignment:
Q  101 gaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgcct 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  21882293 gaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgcct 21882194  T
Q  201 tgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21882193 tgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatg 21882159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22463364 - 22463154
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  22463364 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 22463265  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22463264 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 22463165  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  22463164 gttgcacatgt 22463154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 17268289 - 17268510
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17268289 ttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagacggaattgaatatga 17268388  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  17268389 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 17268488  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  17268489 actgcatatgtctgctatgatg 17268510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22504092 - 22503882
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  22504092 ttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 22503993  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  22503992 ggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaac 22503893  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  22503892 attgcatatgt 22503882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 24619265 - 24619471
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24619265 cattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 24619364  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgc 228  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||  |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||  ||    
T  24619365 tagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 24619464  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  24619465 tatgatg 24619471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 24715496 - 24715702
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24715496 cattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 24715595  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgc 228  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||  |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||  ||    
T  24715596 tagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 24715695  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  24715696 tatgatg 24715702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 24748524 - 24748730
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24748524 cattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 24748623  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgc 228  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||  |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||  ||    
T  24748624 tagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 24748723  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  24748724 tatgatg 24748730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21872006 - 21872226
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  21872006 ttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaag-aattgaatatga 21872104  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||    
T  21872105 ggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagac 21872204  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  21872205 gttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21876286 - 21876506
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  21876286 ttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaag-aattgaatatga 21876384  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||    
T  21876385 ggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagac 21876484  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  21876485 gttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 21679736 - 21679932
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21679736 aagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 21679835  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21679836 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 21679932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 21936143 - 21936353
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21936143 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 21936242  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21936243 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 21936342  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  21936343 tttgcatatgt 21936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 14885946 - 14886156
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  14885946 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 14886045  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14886046 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 14886145  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  14886146 gttgcacatgt 14886156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 24797352 - 24797562
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  24797352 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 24797451  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  24797452 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagac 24797551  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  24797552 tttgcacatgt 24797562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 23079053 - 23079254
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |    
T  23079053 tggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagagga 23079152  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| || | || |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23079153 gatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacattacatat 23079252  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  23079253 gt 23079254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24582601 - 24582413
Alignment:
Q  36 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagtt 135  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |     
T  24582601 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaata 24582502  T
Q  136 gctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
     || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24582501 tcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 24582413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20343695 - 20343485
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  20343695 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 20343596  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  20343595 ggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaac 20343496  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  20343495 tttgcacatgt 20343485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 22234875 - 22235085
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  22234875 ttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 22234974  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22234975 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 22235074  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  22235075 gttgcatatgt 22235085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25849467 - 25849278
Alignment:
Q  35 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagt 134  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||    
T  25849467 ttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagt 25849368  T
Q  135 tgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  25849367 tactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgt 25849278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20777326 - 20777190
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||    
T  20777326 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatga 20777227  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 150  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  20777226 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatga 20777190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21408560 - 21408348
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| |||||  |||||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||||  |    
T  21408560 tggaggcattatctgtatggttctaaatttgacgtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggcagcata 21408461  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  21408460 ggtggcttgaattgctaaaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatat 21408361  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  21408360 gtctgctatgatg 21408348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27012497 - 27012287
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27012497 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagttcgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27012398  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27012397 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27012298  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  27012297 tttgcatatgt 27012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 37542336 - 37542541
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  37542336 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatga 37542435  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| || || || |||||||| ||    
T  37542436 ggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaac 37542535  T
Q  214 attgca 219  Q
     |||||    
T  37542536 tttgca 37542541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 193
Target Start/End: Original strand, 822 - 923
Alignment:
Q  92 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttg 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||    
T  822 gatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttg 921  T
Q  192 ca 193  Q
    ||    
T  922 ca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21497263 - 21497147
Alignment:
Q  106 gaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagt 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||     
T  21497263 gaatatgaggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagc 21497164  T
Q  206 aggaagacattgcatat 222  Q
    |||||||| || |||||    
T  21497163 aggaagacgttacatat 21497147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Original strand, 21830880 - 21830937
Alignment:
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21830880 agctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatg 21830937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23504657 - 23504544
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||    
T  23504657 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatga 23504558  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
     |||  ||||||||    
T  23504557 agcaaagaagatgg 23504544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20775034 - 20774962
Alignment:
Q  152 tttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| ||||| || || |||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20775034 tttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 20774962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23517768 - 23517736
Alignment:
Q  203 agtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23517768 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 23517736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 28262112 - 28262325
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262112 gtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 28262211  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262212 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 28262311  T
Q  211 gacattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||||    
T  28262312 gacattgcatatgt 28262325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 28340861 - 28341074
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340861 gtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 28340960  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340961 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 28341060  T
Q  211 gacattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||||    
T  28341061 gacattgcatatgt 28341074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27188802 - 27188578
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188802 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 27188703  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188702 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 27188603  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  27188602 gacgttgcatatgtccgccatgatg 27188578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27260438 - 27260662
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260438 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 27260537  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260538 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 27260637  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  27260638 gacgttgcatatgtccgccatgatg 27260662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 1542002 - 1542223
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542002 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 1542101  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1542102 ggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagac 1542201  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  1542202 attgcatatgtccgctatgatg 1542223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 2873721 - 2873942
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873721 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 2873820  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2873821 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 2873920  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  2873921 attgcatatgtccgctatgatg 2873942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25113915 - 25113694
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25113915 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 25113816  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25113815 ggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 25113716  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  25113715 attgcatatgtccgctatgatg 25113694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29590838 - 29591059
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29590838 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 29590937  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29590938 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 29591037  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  29591038 attgcatatgtccgccatgatg 29591059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27564739 - 27564960
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564739 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27564838  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27564839 ggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 27564938  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  27564939 attgcatatgtccgctttgatg 27564960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 24312086 - 24312306
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24312086 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24312185  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24312186 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagac 24312285  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgat 234  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  24312286 attgcatatgtccgccatgat 24312306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22435232 - 22435012
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22435232 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatga 22435133  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435132 ggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22435033  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgat 234  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  22435032 gttgcatatgtccgctatgat 22435012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22443630 - 22443410
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22443630 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatga 22443531  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22443530 ggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22443431  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgat 234  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  22443430 gttgcatatgtccgctatgat 22443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16962363 - 16962584
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16962363 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 16962462  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  16962463 ggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtc 16962562  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  16962563 attgcacatgtccgctatgatg 16962584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19866050 - 19865829
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19866050 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttcaggtgtttagtgatcacaagagcctaaaatatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 19865951  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19865950 ggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaac 19865851  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  19865850 gttgcatatgtctgctatgatg 19865829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 25608779 - 25609000
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25608779 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtctgaagtatctgttcgattagaaggaattgaatatga 25608878  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25608879 gacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagac 25608978  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  25608979 tttgcatatgtctgctatgatg 25609000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5838134 - 5838358
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5838134 gtgttgaagatttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaagaattgaata 5838233  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5838234 tgagacagagaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 5838333  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5838334 gactttgcatatgtccgctatgatg 5838358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636440
Alignment:
Q  30 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  130 agagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgct 229  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgct 20636434  T
Q  230 atgatg 235  Q
    ||||||    
T  20636435 atgatg 20636440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16926556 - 16926779
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcga-gatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16926556 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatgtg 16926655  T
Q  113 aggcagcgaagatggctagagttgct-aaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 211  Q
    ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16926656 agggagcgtagatggcttgaattgctaaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaag 16926755  T
Q  212 acattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| |||| ||||||||||    
T  16926756 tcattgcacatgtccgctatgatg 16926779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 22761373 - 22761583
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22761373 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatatttagtgatcataagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatga 22761472  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | |||||| || ||| | ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22761473 ggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 22761572  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  22761573 cttgcatatgt 22761583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 18196654 - 18196862
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18196654 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 18196753  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18196754 agcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagacttt 18196853  T
Q  217 gcatatgtt 225  Q
     ||||||||    
T  18196854 acatatgtt 18196862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 18406868 - 18407083
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  18406868 atatggagacgttacttgtatggttcgagatttgatgtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaatggaacatgagacagc 18406967  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||    
T  18406968 gaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgca 18407067  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||  |||||||||    
T  18407068 tatgtctgctatgatg 18407083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23079832 - 23079611
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23079832 ttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgttttatcataaggaattgaatatga 23079733  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
      |||||||| |||||  | ||| | ||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23079732 aacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 23079633  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  23079632 gttgcatatgtctgctatgatg 23079611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15460699 - 15460489
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  15460699 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 15460600  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15460599 ggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 15460500  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  15460499 attgcacatgt 15460489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 16621998 - 16622106
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621998 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16622097  T
Q  114 ggcagcgaa 122  Q
    | |||||||    
T  16622098 gacagcgaa 16622106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15897454 - 15897236
Alignment:
Q  16 gaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  15897454 gaagatttggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgaga 15897356  T
Q  116 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    || ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||      
T  15897355 caacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactc 15897256  T
Q  216 tgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | ||||||| ||| ||||||    
T  15897255 tacatatgtccgcgatgatg 15897236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21472964 - 21472743
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  21472964 ttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcataagagattgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatga 21472865  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21472864 ggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 21472765  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  21472764 gttgcacatgtctgctatgatg 21472743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 28281731 - 28281952
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28281731 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 28281830  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || || || | ||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  28281831 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagac 28281930  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  28281931 actccatatgtctgctatgatg 28281952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21563050 - 21563271
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21563050 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 21563149  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21563150 gacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 21563249  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  21563250 gttgcacatgtcggctatgatg 21563271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21568909 - 21569130
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21568909 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcaaaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 21569008  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21569009 gacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 21569108  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  21569109 gttgcacatgtcggctatgatg 21569130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18796053 - 18795854
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18796053 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaaatattcatttgatcaaaaggagttgaacatga 18795954  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18795953 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 18795854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19488187 - 19488411
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||    
T  19488187 gtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggccccatatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttctttgataaaaaagaattgaata 19488286  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19488287 tgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaa 19488386  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||||    
T  19488387 gacgttgaatatgtctgctatgatg 19488411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19454783 - 19454573
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  19454783 ttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatga 19454684  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19454683 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 19454584  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  19454583 attgcatatgt 19454573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 5296124 - 5296345
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  5296124 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 5296223  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  5296224 ggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagac 5296323  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  5296324 gttgcacatgtctgctatgatg 5296345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 16625737 - 16625856
Alignment:
Q  116 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625737 cagcgaagatgactcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 16625836  T
Q  216 tgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  16625837 tgcatatgtccgccatgatg 16625856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16381291 - 16381501
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  16381291 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16381390  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16381391 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16381490  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  16381491 tttgcatatgt 16381501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24365775 - 24365565
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  24365775 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatga 24365676  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  24365675 ggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaac 24365576  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  24365575 cttgcacatgt 24365565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 10467776 - 10467977
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |    
T  10467776 tggaggcattatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagga 10467875  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  10467876 gatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatat 10467975  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  10467976 gt 10467977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 18966216 - 18966388
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18966216 aagatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggc 18966315  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgt 189  Q
    ||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  18966316 agcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt 18966388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 34644507 - 34644703
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |    
T  34644507 aagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagac 34644606  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34644607 agaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 34644703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 14378835 - 14379045
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  14378835 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 14378934  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14378935 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaac 14379034  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  14379035 gctgcatatgt 14379045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 14380385 - 14380595
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  14380385 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 14380484  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14380485 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaac 14380584  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  14380585 gctgcatatgt 14380595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21754581 - 21754481
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21754581 ttgaatatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatga 21754482  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  21754481 g 21754481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Original strand, 16648912 - 16649097
Alignment:
Q  39 atggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgct 138  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | || |  ||    
T  16648912 atggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatct 16649011  T
Q  139 aaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
     ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16649012 taaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 16649097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18449851 - 18449652
Alignment:
Q  36 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagtt 135  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| || |||| ||||| || ||    
T  18449851 tgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggtagtgaaggtggcttgaatt 18449752  T
Q  136 gctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||| || || ||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||    
T  18449751 gctaaaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatg 18449652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19880658 - 19880451
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |    
T  19880658 aagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagac 19880559  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19880558 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaagacgtt 19880459  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
    ||| ||||    
T  19880458 gcacatgt 19880451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23997611 - 23997401
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| || || |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  23997611 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 23997512  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || | ||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23997511 ggcagaggagatggttggaatatcttacggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 23997412  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  23997411 tttgcatatgt 23997401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 14624275 - 14624388
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14624275 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14624374  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  14624375 ggcagaggagatgg 14624388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 1647732 - 1647938
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  1647732 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 1647831  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |  | |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  1647832 ggcagaggaggtggttgaaatatcttaaggactttgattttcaattgagttatcatccaggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 1647931  T
Q  214 attgcat 220  Q
     ||||||    
T  1647932 tttgcat 1647938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16234391 - 16234181
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  16234391 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16234292  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| |||| |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||    
T  16234291 ggcaaagaagatggttagaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgtggatgctttgtgtagaaagac 16234192  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  16234191 tttgcatatgt 16234181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 18836826 - 18837036
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || | || ||||||||||    
T  18836826 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatga 18836925  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18836926 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 18837025  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  18837026 tttgcatatgt 18837036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16099372 - 16099259
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  16099372 ttgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16099273  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||| ||||||||    
T  16099272 ggcagagaagatgg 16099259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19436356 - 19436155
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| || | |    
T  19436356 tggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcggtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggtagagga 19436257  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
     |||| ||||| || | ||||| || || |||||||||||||| || ||  ||| ||| ||||| |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19436256 tatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatat 19436157  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  19436156 gt 19436155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Original strand, 8761934 - 8762061
Alignment:
Q  97 gaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagat 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||||    
T  8761934 gaaggatttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagat 8762033  T
Q  197 gccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8762034 gccttgagtaggaaaacgctgcatatgt 8762061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14129832 - 14129622
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| |||||| |  ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14129832 ttgaagatttggaggcattatatgtttggttctaagttttaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14129733  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||    
T  14129732 ggcaaagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgtgtagaaagac 14129633  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  14129632 tttgcatatgt 14129622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 35275004 - 35275225
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  35275004 ttgaagatttggagtcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatga 35275103  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  ||| |||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| ||  | |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  35275104 ggcaaagaacatggttggaatatcttaaggactttgattttaagttgagttatcatcctaggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 35275203  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||| |||||| ||| |||||    
T  35275204 tttgcttatgtttgctttgatg 35275225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 23026635 - 23026855
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 114  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||     
T  23026635 tgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaa 23026734  T
Q  115 gcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaca 214  Q
    |||  |||||||| |  |||  || ||||||| ||| |||   |||| |||| | || || | ||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||     
T  23026735 gcaaagaagatggttgaagtatcttaaggattttgattttcagttgagttattatcccgggaaagctaatgttgttgttgatgctttgagtataaagact 23026834  T
Q  215 ttgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  23026835 ttgcatatgtttgctttgatg 23026855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21928568 - 21928358
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||    
T  21928568 ttgaagatttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatga 21928469  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||| ||| | ||||  || |||||||  || |||   |||| |||||| || || |  || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  21928468 ggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaagac 21928369  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  21928368 tttgcatatgt 21928358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18574552 - 18574439
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18574552 ttgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttaaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 18574453  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  18574452 ggcagaggagatgg 18574439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 25764146 - 25764195
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25764146 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttag 25764195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Original strand, 22077772 - 22077825
Alignment:
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctat 231  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22077772 agctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctat 22077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Original strand, 19986388 - 19986444
Alignment:
Q  62 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19986388 agtgaccacaagagtttgaagtacttcttcgatcagaaagagttgaatatgaggcag 19986444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18572851 - 18572806
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18572851 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagaccttgcatatgt 18572806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8896 - 8675
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8896 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatga 8797  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8697  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  8696 attgcatatgtccgctatgatg 8675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13253808 - 13253587
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253808 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 13253709  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253708 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 13253609  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  13253608 attgcatatgtccgccatgatg 13253587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16636891 - 16636670
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636891 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16636792  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636791 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16636692  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16636691 attgcatatgtccgccatgatg 16636670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20061066 - 20061287
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061066 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 20061165  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061166 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 20061265  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  20061266 attgcatatgtccgccatgatg 20061287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43164215 - 43163994
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164215 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 43164116  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164115 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 43164016  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  43164015 attgcatatgtccgccatgatg 43163994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6601857 - 6601633
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6601857 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaata 6601758  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601757 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 6601658  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  6601657 gacattgcatatgtccgccatgatg 6601633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 53384027 - 53384251
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384027 gtgttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 53384126  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53384127 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaa 53384226  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  53384227 gacattgcatatgtccgccatgatg 53384251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 15347259 - 15347478
Alignment:
Q  16 gaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15347259 gaagatatggagacattacttgtttggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 15347358  T
Q  116 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15347359 cagcgaagatggcttgagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaat 15347458  T
Q  216 tgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  15347459 tgcatatgtccgccatgatg 15347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15588404 - 15588625
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588404 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 15588503  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588504 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15588603  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  15588604 attgcatatgtccgccatgatg 15588625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48426565 - 48426344
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48426565 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 48426466  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48426465 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 48426366  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  48426365 attgcatatgtccgccatgatg 48426344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 5423942 - 5424163
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423942 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 5424041  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424042 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 5424141  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  5424142 attgcatatgtccgccatgatg 5424163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15340387 - 15340166
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15340387 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 15340288  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15340287 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagac 15340188  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  15340187 attgcatatgtccgctatgatg 15340166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15401529 - 15401750
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15401529 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggagtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 15401628  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15401629 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15401728  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  15401729 attgcatatgtccgctatgatg 15401750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15723946 - 15724167
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723946 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 15724045  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||| ||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15724046 gacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagac 15724145  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  15724146 attgcatatgtccgctatgatg 15724167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10006718 - 10006497
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10006718 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10006619  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10006618 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10006519  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  10006518 attgcatatgtccgccatgatg 10006497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10907328 - 10907107
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10907328 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtattttttcgatcagaaggaattgaatatga 10907229  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10907228 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10907129  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  10907128 attgcatatgtccgccatgatg 10907107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16411294 - 16411515
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16411294 ttgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtctttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatta 16411393  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16411394 ggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 16411493  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  16411494 attgcatatgtccgctatgatg 16411515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 14875511 - 14875731
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14875511 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaatgaattgaatatga 14875610  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14875611 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 14875710  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgat 234  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  14875711 attgcatatgtccactatgat 14875731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14125606 - 14125827
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14125606 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 14125705  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14125706 ggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 14125805  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  14125806 attgcatatgtccgctatgatg 14125827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16805959 - 16806180
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16805959 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 16806058  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16806059 ggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 16806158  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  16806159 attgcatatgtccgctttgatg 16806180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12499366 - 12499145
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499366 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 12499267  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  |||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  12499266 gtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagac 12499167  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  12499166 attgcatatgtccgctatgatg 12499145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14579954 - 14580175
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14579954 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 14580053  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14580054 gacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaa 14580153  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     || || |||| ||||||||||    
T  14580154 tttacacatgtccgctatgatg 14580175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16491193 - 16491414
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16491193 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 16491292  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16491293 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagac 16491392  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  16491393 cttgcatatgtctgctatgatg 16491414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16693282 - 16693072
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  16693282 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttattgatcataagagtttgaagtatctgtttgaccagaaggaattgaatatga 16693183  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16693182 gacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagac 16693083  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  16693082 attgcatatgt 16693072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15062836 - 15062615
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15062836 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15062737  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15062736 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagac 15062637  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  15062636 attgcatatgtccgctatgatg 15062615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3687061 - 3686899
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687061 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 3686962  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggta 176  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3686961 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 3686899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17490968 - 17490747
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17490968 ttgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 17490869  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||| || |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17490868 ggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 17490769  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  17490768 cttgcatatgtctgctatgatg 17490747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15260745 - 15260527
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  15260745 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaagtgttcagcgaccacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagac 15260646  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||  |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15260645 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacttt 15260546  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15260545 gcatatgtccgctatgatg 15260527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14575025 - 14574830
Alignment:
Q  40 tggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgcta 139  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  14575025 tggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgtta 14574926  T
Q  140 aaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 14574830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 5109620 - 5109723
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5109620 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaata 5109719  T
Q  111 tgag 114  Q
    ||||    
T  5109720 tgag 5109723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 10419046 - 10419256
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  10419046 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccagaaagaattgaacatga 10419145  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10419146 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 10419245  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  10419246 attgcacatgt 10419256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 12359528 - 12359738
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  12359528 ttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagtatttagtaatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 12359627  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  12359628 ggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagac 12359727  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  12359728 gttgcatatgt 12359738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16379929 - 16380150
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16379929 ttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 16380028  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||  | | |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16380029 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagac 16380128  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  16380129 actgcatatgtctgctatgatg 16380150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44778375 - 44778154
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44778375 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 44778276  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  44778275 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 44778176  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  44778175 actgcatatgtctgctatgatg 44778154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31940031 - 31939821
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  31940031 ttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 31939932  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31939931 ggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaac 31939832  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  31939831 gctgcatatgt 31939821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13943152 - 13942931
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13943152 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatacttgtttgatcagaaggaattgaatatga 13943053  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  13943052 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagac 13942953  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  13942952 actgcatatgtctgctatgatg 13942931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16827204 - 16827425
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  16827204 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagagttgaatatga 16827303  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || || |||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16827304 ggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagac 16827403  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  16827404 gttgcacatgtctgctatgatg 16827425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41178650 - 41178429
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41178650 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 41178551  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  41178550 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagac 41178451  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  41178450 actccatatgtctgctatgatg 41178429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15228780 - 15228557
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||    
T  15228780 gtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaata 15228681  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  15228680 tgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaa 15228581  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgat 234  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||    
T  15228580 gactttgcatatgtcagctatgat 15228557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15234648 - 15234425
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||    
T  15234648 gtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaata 15234549  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  15234548 tgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaa 15234449  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgat 234  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||    
T  15234448 gactttgcatatgtcagctatgat 15234425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16835511 - 16835721
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16835511 ttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 16835610  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || | || ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16835611 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagac 16835710  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  16835711 tttgcacatgt 16835721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17187502 - 17187281
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  17187502 ttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatga 17187403  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17187402 ggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggc 17187303  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  17187302 attgcatatgtcggctatgatg 17187281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 31694187 - 31694397
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  31694187 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 31694286  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31694287 ggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaac 31694386  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  31694387 gctgcatatgt 31694397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 13971124 - 13971320
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13971124 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 13971223  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13971224 agaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagac 13971320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 11960179 - 11960380
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  11960179 tggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 11960278  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||| | ||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11960279 gattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacattgcatat 11960378  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  11960379 gt 11960380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12179466 - 12179245
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  12179466 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 12179367  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12179366 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaac 12179267  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  12179266 gttgcatatgtctgctatgatg 12179245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 16337522 - 16337723
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  16337522 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 16337621  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16337622 gatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatat 16337721  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  16337722 gt 16337723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30138934 - 30138724
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  30138934 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 30138835  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30138834 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 30138735  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  30138734 tttgcatatgt 30138724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30148485 - 30148275
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  30148485 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 30148386  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30148385 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 30148286  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  30148285 tttgcatatgt 30148275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 13319525 - 13319713
Alignment:
Q  36 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagtt 135  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |    
T  13319525 tgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaggtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagct 13319624  T
Q  136 gctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  13319625 gttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagaccttacatatgt 13319713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16328661 - 16328871
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16328661 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgataataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatga 16328760  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16328761 ggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaac 16328860  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    ||| |||||||    
T  16328861 attacatatgt 16328871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 8273411 - 8273621
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  8273411 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 8273510  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8273511 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 8273610  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  8273611 tttgcatatgt 8273621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 13966356 - 13966566
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13966356 ttgacgatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 13966455  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13966456 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgatttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 13966555  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  13966556 tttgcatatgt 13966566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16741715 - 16741925
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  16741715 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16741814  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16741815 ggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16741914  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  16741915 tttgcatatgt 16741925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28755446 - 28755236
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||    
T  28755446 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatga 28755347  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28755346 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtaggaaaac 28755247  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  28755246 gttgcacatgt 28755236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47125072 - 47124862
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  47125072 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 47124973  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  47124972 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 47124873  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  47124872 gttgcacatgt 47124862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14087798 - 14087599
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  14087798 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatctgattagaaggagttgaacatgaggc 14087699  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14087698 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacatt 14087599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 15014792 - 15014989
Alignment:
Q  38 tatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgc 137  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  15014792 tatgtttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgactagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgc 15014891  T
Q  138 taaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||||| ||  | |||||||| || || ||||  |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||    
T  15014892 taaagaattatgatttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatg 15014989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 55514727 - 55514935
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  55514727 gtgttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtatatgtttgatcagaaagagttgaata 55514826  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||  |||||||| | ||||  || |||||||   |||||   |||| |||||| ||| | |  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  55514827 tgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggatttcaactttcagttgagttatcatccaagaaaggctaacgttgttgctgataccttgagtaggaa 55514926  T
Q  211 gacattgca 219  Q
    ||| |||||    
T  55514927 gactttgca 55514935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16258272 - 16258062
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  16258272 ttgaagatctggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16258173  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| |  | |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| ||  | |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16258172 ggcagaggagatggttgaaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccagaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16258073  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  16258072 tttgcatatgt 16258062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 18133347 - 18133557
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  18133347 ttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 18133446  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | || ||| ||||| || | ||||||||||| |||||  ||||||| || || |||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||    
T  18133447 ggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaac 18133546  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  18133547 gttgcatatgt 18133557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 6151865 - 6152075
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||  |||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  6151865 ttgaagattcggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataa 6151964  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6151965 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 6152064  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  6152065 tttgcatatgt 6152075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18751036 - 18750862
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 149  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| | ||||  || |||||||       
T  18751036 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttca 18750937  T
Q  150 actttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||   |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18750936 attttcagttgagttatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 18750862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25767446 - 25767236
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25767446 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25767347  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  |||||||| | || |  || |||||||  || |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25767346 gacaaagaagatggtttgaatatcttaaggatttcgattttcaattgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 25767247  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  25767246 tttgcatatgt 25767236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15611231 - 15611021
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  15611231 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 15611132  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  15611131 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagat 15611032  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  15611031 tttgcatatgt 15611021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17493663 - 17493537
Alignment:
Q  109 tatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtagg 208  Q
    |||||||||| |||||||| || || || | ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  17493663 tatgaggcagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggagg 17493564  T
Q  209 aagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17493563 aagacgttgcatatgtctgctatgatg 17493537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Original strand, 16755765 - 16755818
Alignment:
Q  182 aatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16755765 aatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatg 16755818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12793247 - 12793059
Alignment:
Q  36 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagtt 135  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||| | |||||| | || |     
T  12793247 tgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatacgaggcagaggagatggttggaata 12793148  T
Q  136 gctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
     || ||||| | ||| |||   |||| |||||| |  || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  12793147 tcttaaggactttgattttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagtaagattttgcatatgt 12793059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15096137 - 15096030
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||| |||||| |  |||||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15096137 gtgttgaagatctgaaggcattatatgtttggttctatgtttgaattgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaata 15096038  T
Q  111 tgaggcag 118  Q
    ||||||||    
T  15096037 tgaggcag 15096030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17194222 - 17194012
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||    
T  17194222 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatga 17194123  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||| ||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  17194122 ggcagagaagatggttggaatatcttaagaattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctattgttgttgatgatgctttgagtagaaagac 17194023  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  17194022 tttgcatatgt 17194012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 16755710 - 16755758
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16755710 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgt 16755758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Original strand, 6711421 - 6711525
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  6711421 gtgttgaagatttggagccattatctgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagattgaagtacttgtttgaccagaaagagttgaata 6711520  T
Q  111 tgagg 115  Q
    |||||    
T  6711521 tgagg 6711525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10384799 - 10384730
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10384799 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagt 10384730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21144354 - 21144575
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144354 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 21144453  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144454 gacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 21144553  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  21144554 attgcatatgtccgctatgatg 21144575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24263500 - 24263279
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263500 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24263401  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263400 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24263301  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  24263300 attgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16926490 - 16926269
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926490 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16926391  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926390 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16926291  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16926290 attgcatatgtccgccatgatg 16926269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17000130 - 16999909
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000130 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 17000031  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000030 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16999931  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16999930 attgcatatgtccgccatgatg 16999909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16924019 - 16923798
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16924019 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16923920  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923919 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16923820  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16923819 attgcatatgtccgccatgatg 16923798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16983282 - 16983061
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983282 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16983183  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983182 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16983083  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  16983082 attgcatatgtccgccatgatg 16983061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 41607698 - 41607919
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607698 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcgcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 41607797  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607798 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 41607897  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  41607898 attgcatatgtccgctatgatg 41607919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 44384882 - 44385103
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384882 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 44384981  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384982 ggcagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 44385081  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  44385082 attgcatatgtccgccatgatg 44385103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10869980 - 10869759
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869980 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10869881  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869880 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10869781  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  10869780 attgcatatgtccgccatgatg 10869759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24711164 - 24710943
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711164 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24711065  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711064 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24710965  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  24710964 attgcatatgtccgccatgatg 24710943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 24876062 - 24876283
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24876062 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgagatttgaggtgtttagtgatcacaggagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 24876161  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24876162 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24876261  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  24876262 attgcatatgtccgctatgatg 24876283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27219146 - 27218925
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219146 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27219047  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219046 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27218947  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  27218946 attgcatatgtccgccatgatg 27218925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27372399 - 27372178
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372399 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27372300  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372299 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27372200  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  27372199 attgcatatgtccgccatgatg 27372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22324169 - 22324390
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324169 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22324268  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324269 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22324368  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  22324369 attgcatatgtccgccatgatg 22324390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21324579 - 21324800
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21324579 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 21324678  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21324679 ggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagac 21324778  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  21324779 tttgcatatgtccgctatgatg 21324800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24676619 - 24676398
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24676619 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaaaagcttgaaatatttgttcgatcagaaagagttgaatatga 24676520  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676519 ggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24676420  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  24676419 attgcatatgtccgctatgatg 24676398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17064815 - 17064626
Alignment:
Q  46 gagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggat 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||    
T  17064815 gagattggaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggat 17064716  T
Q  146 tatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17064715 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatg 17064626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 24706795 - 24707005
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24706795 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagacagaattgaatatga 24706894  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||| ||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24706895 ggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagac 24706994  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  24706995 attgcatatgt 24707005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23107043 - 23107264
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23107043 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctattcgatcagaaggaattgaatatga 23107142  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||| ||||  ||||  ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23107143 ggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagac 23107242  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  23107243 cttgcatatgtctgctatgatg 23107264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23111869 - 23111645
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23111869 gtgttgaaaattttgaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaata 23111770  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23111769 tgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaa 23111670  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||    
T  23111669 gacgttgcatatgtctgctatgatg 23111645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23072990 - 23072884
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23072990 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagac 23072891  T
Q  117 agcgaag 123  Q
    |||||||    
T  23072890 agcgaag 23072884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12575483 - 12575262
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12575483 ttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 12575384  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  12575383 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagac 12575284  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  12575283 actgcatatgtctgctatgatg 12575262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23277906 - 23277685
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23277906 ttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagttatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 23277807  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23277806 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 23277707  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  23277706 gttgcacatgtctgctatgatg 23277685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23099331 - 23099552
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  23099331 ttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgattaaaaggaattgaatatga 23099430  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23099431 gacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 23099530  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  23099531 gttgcacatgtcggctatgatg 23099552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27788870 - 27788650
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27788870 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 27788771  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  27788770 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 27788671  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  27788670 act-catatgtctgctatgatg 27788650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45533466 - 45533254
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45533466 tggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttatttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 45533367  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||    
T  45533366 ggtggtttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatat 45533267  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  45533266 gtctgctatgatg 45533254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20829389 - 20829179
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  20829389 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatga 20829290  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||   || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20829289 ggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 20829190  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  20829189 gttgcacatgt 20829179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25264184 - 25264033
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25264184 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 25264085  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  25264084 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaatta 25264033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1064881 - 1064671
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  1064881 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 1064782  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  1064781 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 1064682  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  1064681 gttgcacatgt 1064671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 12639546 - 12639756
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12639546 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 12639645  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12639646 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcaattgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagac 12639745  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  12639746 tttgcatatgt 12639756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23295065 - 23294855
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23295065 ttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 23294966  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  23294965 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagac 23294866  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  23294865 gttgcatatgt 23294855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24949720 - 24949510
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  24949720 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 24949621  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24949620 ggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 24949521  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  24949520 gttgcacatgt 24949510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 27209485 - 27209695
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  27209485 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 27209584  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  27209585 ggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagac 27209684  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  27209685 attgcacatgt 27209695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 30210240 - 30210432
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  30210240 tggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatacgaggcatcgaa 30210339  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  30210340 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaacat 30210432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 19651363 - 19651573
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  19651363 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 19651462  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | || || ||||| |||||||||||||| || ||  | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  19651463 ggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaac 19651562  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  19651563 gctgcatatgt 19651573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 30011506 - 30011699
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30011506 tggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaattttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 30011605  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||  |||  |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  30011606 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaaaacatt 30011699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31831788 - 31831592
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  31831788 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 31831689  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  31831688 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaa 31831592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 24830501 - 24830711
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  24830501 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 24830600  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| |  || |  |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  24830601 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttacggatgctttgagtagaaagac 24830700  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  24830701 tttgcatatgt 24830711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22279235 - 22279025
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  22279235 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaaagaattgaatatga 22279136  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| |  | |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22279135 ggcagagaagatggttgaaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 22279036  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  22279035 tttgcatatgt 22279025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 22760882 - 22761093
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  22760882 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaagagttgaatatga 22760981  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||  ||||||| |  | |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  22760982 ggcagaaaagatggttgaaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagac 22761081  T
Q  214 attgcatatgtt 225  Q
     |||||||||||    
T  22761082 tttgcatatgtt 22761093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25129739 - 25129630
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  25129739 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatga 25129640  T
Q  114 ggcagcgaag 123  Q
    ||||| ||||    
T  25129639 ggcagagaag 25129630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 24568981 - 24569191
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| || || |||||  |||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |  |||||||||    
T  24568981 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtattaagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaaaagatgaatatga 24569080  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24569081 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaagacaaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 24569180  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  24569181 tttgcatatgt 24569191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23067400 - 23067300
Alignment:
Q  134 ttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatga 233  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||| | |||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  23067400 ttgctaaaagattatgattttgagttgact-atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatga 23067302  T
Q  234 tg 235  Q
    ||    
T  23067301 tg 23067300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 17967134 - 17967218
Alignment:
Q  71 aagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 155  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||| | |||||  | |||||  ||||||||||||| ||||    
T  17967134 aagagtctgaagtatctctttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgtttggagtttttaaaggattatgattttg 17967218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8469 - 8248
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8370  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8369 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8270  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  8269 attgcatatgtccgctatgatg 8248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 44790133 - 44790354
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790133 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 44790232  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790233 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 44790332  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  44790333 attgcatatgtccgccatgatg 44790354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8200116 - 8199895
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200116 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8200017  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200016 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8199917  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  8199916 attgcatatgtccgccatgatg 8199895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 11235995 - 11236216
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235995 ttgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 11236094  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236095 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 11236194  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  11236195 attgcatatgtccgctatgatg 11236216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14333884 - 14333663
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333884 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 14333785  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333784 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14333685  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  14333684 attgcatatgtccgccatgatg 14333663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8709093 - 8708872
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709093 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8708994  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8708993 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8708894  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  8708893 gttgcatatgtccgccatgatg 8708872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15159839 - 15160060
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15159839 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttattcgatcagaaggaattgaatatga 15159938  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159939 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15160038  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  15160039 attgcatatgtccgccatgatg 15160060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18179230 - 18179009
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18179230 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgattacaagagtttgaagtatttgttctatcagaaggaattgaacatga 18179131  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18179130 ggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 18179031  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  18179030 attgcatatgtccgccatgatg 18179009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10872483 - 10872262
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872483 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10872384  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872383 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10872284  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  10872283 attgcatatgtccgccatgatg 10872262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13687552 - 13687331
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687552 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 13687453  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13687452 gacaacgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagac 13687353  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  13687352 attgcatatgtccgccatgatg 13687331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 11551884 - 11552105
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551884 ttgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 11551983  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11551984 ggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagac 11552083  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  11552084 attgcatatgtccgctatgatg 11552105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14956042 - 14955821
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14956042 ttgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 14955943  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955942 ggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14955843  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  14955842 attgcatatgtccgctatgatg 14955821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18550540 - 18550761
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18550540 ttgaagataaggagacattacttgtatgattcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18550639  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18550640 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 18550739  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  18550740 gttgcatatgtccgccatgatg 18550761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23202395 - 23202616
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23202395 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 23202494  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23202495 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagac 23202594  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  23202595 attgcatatgtccgccatgatg 23202616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23508522 - 23508743
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23508522 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 23508621  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23508622 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagac 23508721  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  23508722 attgcatatgtccgccatgatg 23508743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12688989 - 12688767
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12688989 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcaatcagaaggaattgaatatga 12688890  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaagga-ttatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12688889 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 12688790  T
Q  213 cattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  12688789 cattgcatatgtccgctatgatg 12688767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16100 - 16321
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16100 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaacagtttgaagtatttgtttgatcagaagaaattgaatatga 16199  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16200 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 16299  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  16300 attgcatatgtccgctttgatg 16321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14213162 - 14212941
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14213162 ttgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaaaatga 14213063  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14213062 ggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagac 14212963  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  14212962 attgcatatgtccgctttgatg 14212941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 320819 - 321040
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  320819 ttgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 320918  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  320919 ggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 321018  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  321019 tttgcatatgtccgctatgatg 321040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9597545 - 9597324
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9597545 ttgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaggtatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 9597446  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9597445 ggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagac 9597346  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  9597345 attgcatatgtccgctttgatg 9597324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15147667 - 15147888
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15147667 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 15147766  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || || | ||| ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147767 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15147866  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  15147867 tttgcatatgtctgctatgatg 15147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 11771029 - 11771244
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11771029 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatctatttgatcagaaggaattgaatatgagacaac 11771128  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || ||  | || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  11771129 gaaggtggctcgaatttttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgca 11771228  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11771229 tatgtccgctatgatg 11771244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14041177 - 14040962
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14041177 atatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagc 14041078  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||  || |  | |||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14041077 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgca 14040978  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||  ||||||||||    
T  14040977 tatgcccgctatgatg 14040962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14351207 - 14350992
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14351207 atatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagc 14351108  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||  || |  | |||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14351107 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgca 14351008  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||  ||||||||||    
T  14351007 tatgcccgctatgatg 14350992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15205104 - 15204886
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  15205104 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgctcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagac 15205005  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15205004 aacgaaggtggctcgaattgctgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacttt 15204905  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||  |||||||||    
T  15204904 acatatgtctgctatgatg 15204886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19148700 - 19148479
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19148700 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatga 19148601  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19148600 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 19148501  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  19148500 gttgcacatgtctgctatgatg 19148479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20748099 - 20747878
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  20748099 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatga 20748000  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20747999 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 20747900  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  20747899 gttgcacatgtctgctatgatg 20747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 15101372 - 15101584
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15101372 tggaggcattatttgtacgattccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaa 15101471  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  15101472 gatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatat 15101571  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  15101572 gtctgctatgatg 15101584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 12205569 - 12205781
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  12205569 tggagaccttatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgta 12205668  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12205669 ggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 12205768  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
     |  |||||||||    
T  12205769 atcagctatgatg 12205781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 11387188 - 11387409
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11387188 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 11387287  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  11387288 ggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagac 11387387  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  11387388 gttgcacatgtcggctatgatg 11387409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15341920 - 15341699
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  15341920 ttgaaaatttggaggcattatctgtatggttccaaatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 15341821  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15341820 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagac 15341721  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
      |||||||||  |||||||||    
T  15341720 gctgcatatgtctgctatgatg 15341699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16071055 - 16071276
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||    
T  16071055 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgatcaaaaagagttgaatatga 16071154  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16071155 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagac 16071254  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||| ||||  |||||||||    
T  16071255 attgcacatgtctgctatgatg 16071276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18052713 - 18052934
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18052713 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 18052812  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  18052813 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagac 18052912  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  18052913 actccatatgtctgctatgatg 18052934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23504630 - 23504851
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  23504630 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattaaacatga 23504729  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  23504730 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 23504829  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
      |||||||||  |||||||||    
T  23504830 gctgcatatgtctgctatgatg 23504851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14285136 - 14285357
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  14285136 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagtattcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 14285235  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14285236 ggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagac 14285335  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  14285336 actgcatatgtctgctatgatg 14285357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 14263004 - 14263203
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||| |||| ||| | || || ||||||||||    
T  14263004 ttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgtaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatga 14263103  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14263104 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 14263203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7825388 - 7825178
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  7825388 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 7825289  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7825288 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 7825189  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  7825188 tttgcatatgt 7825178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 27106556 - 27106766
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27106556 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27106655  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27106656 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27106755  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  27106756 tttgcatatgt 27106766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27171769 - 27171559
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27171769 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27171670  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27171669 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27171570  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  27171569 tttgcatatgt 27171559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12458120 - 12457919
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  12458120 tggaggcattatttgtacggttccagatttaaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaagga 12458021  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  12458020 gatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatat 12457921  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  12457920 gt 12457919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13022837 - 13022636
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  13022837 tggaggcattatttgtacgtttccagatttgatgtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 13022738  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13022737 gatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatat 13022638  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  13022637 gt 13022636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19614161 - 19613965
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19614161 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 19614062  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19614061 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 19613965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 16949247 - 16949442
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||     
T  16949247 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattttatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggt 16949346  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| | | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16949347 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgt 16949442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 166 - 377
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  166 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttcctgattcgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggaattgaatatga 265  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgc-agatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||||| |||||||| ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||||||||| | |||| ||| | |||||||    
T  266 ggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaaga 365  T
Q  213 cattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||    
T  366 cattgcatatgt 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13667026 - 13666816
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  13667026 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 13666927  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||  ||| ||| || || |||||| |||||||||||||||| ||    
T  13666926 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaac 13666827  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  13666826 gttgcatatgt 13666816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 11305023 - 11305233
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||    
T  11305023 ttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatga 11305122  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11305123 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 11305222  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  11305223 tttgcacatgt 11305233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Original strand, 26117398 - 26117575
Alignment:
Q  47 agatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggatt 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||    
T  26117398 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggatt 26117497  T
Q  147 atgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||  ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  26117498 atgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgt 26117575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4441416 - 4441208
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  4441416 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 4441317  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||   |||||||| |||| |  |  | |||||  ||||||   |||| ||||||||| || |  || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4441316 ggccaagaagatggttagaatatcctacggatttcgactttcagttgagttatcaccccgggaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagac 4441217  T
Q  214 attgcatat 222  Q
     ||||||||    
T  4441216 tttgcatat 4441208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 39935 - 40138
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39935 tatggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcg 40034  T
Q  121 aagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 220  Q
     |||||| | || ||  ||||||| ||||| ||||   ||| |||||| ||||| |  || ||||| || || |||||||||||||||||| | |||||     
T  40035 gagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcac 40134  T
Q  221 atgt 224  Q
    ||||    
T  40135 atgt 40138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 13967428 - 13967612
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  13967428 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagatgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 13967527  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgc 198  Q
    ||||| | || ||| |||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||  || ||||||||||| |||||    
T  13967528 ggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgc 13967612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15626010 - 15625898
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15626010 aagatttggagacattatttatatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggc 15625911  T
Q  117 agcgaagatggct 129  Q
    || |||| |||||    
T  15625910 agggaaggtggct 15625898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49153790 - 49153580
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  49153790 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactgaacatga 49153691  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  49153690 ggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaac 49153591  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  49153590 tttgcacatgt 49153580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Original strand, 15717682 - 15717786
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15717682 gtgttgaagatttggaggcactacttgtatggttctaagtttgaagtgttcgatgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaata 15717781  T
Q  111 tgagg 115  Q
     ||||    
T  15717782 agagg 15717786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17925139 - 17925035
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  17925139 ttgaagatttggaggcattatctgtttggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 17925040  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  17925039 ggcag 17925035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23642934 - 23642820
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  23642934 gtgttgaagatttgacggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgatcacacaagtttgaagtatttgtttgactagaaggagttgaata 23642835  T
Q  111 tgaggcagcgaagat 125  Q
    |||| ||| ||||||    
T  23642834 tgagacagagaagat 23642820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13354582 - 13354429
Alignment:
Q  69 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||  |||||||  ||||||  || | |||||  ||||||   |||| ||||||    
T  13354582 acaagagtttgaagtatttgtttgatcataaatagttgaatatgaggcaaagaagatgaatagagtatcttagggatttcgactttcagttgagttatca 13354483  T
Q  169 cccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
     |  || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13354482 tcacgggaaggctaatgttgttgccgatgccttgagtaggaagacgtggcatat 13354429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14937799 - 14937625
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||  || |||||||  |    
T  14937799 tttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggatttcg 14937700  T
Q  150 actttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||   |||| |||||| || || |  || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  14937699 attttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgt 14937625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15365392 - 15365218
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||  || |||||||  |    
T  15365392 tttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggatttcg 15365293  T
Q  150 actttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||   |||| |||||| || || |  || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15365292 attttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgt 15365218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625821
Alignment:
Q  158 ttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||  |||||||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatg 15625821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 21673316 - 21673420
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||  |||||||||| |  ||| | ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  21673316 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagttttaagtgttcagtgactacaagagtttgaagtacttgtttgataagaaagagttgaatatga 21673415  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  21673416 ggcag 21673420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 17144092 - 17144144
Alignment:
Q  62 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  17144092 agtgatcataagagtttgaagtatctgtttgactagaaggagttgaatatgag 17144144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 108587 - 108808
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  108587 ttgaagatagggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 108686  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108687 ggcagcgtagatgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 108786  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  108787 attgcatatgtctgctatgatg 108808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 114086 - 113890
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  114086 aagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgatcagaaggagttgaacatgaggc 113987  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  113986 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 113890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10004 - 9783
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10004 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgattatga 9905  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9904 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 9805  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  9804 attgcatatgtccgctatgatg 9783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16466 - 16256
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16466 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16367  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16366 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagac 16267  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  16266 attgcatatgt 16256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44681 - 44460
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44681 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 44582  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44581 ggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagac 44482  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  44481 attgcatatgtccgctatgatg 44460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 49293 - 49489
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  49293 aagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 49392  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49393 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 49489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 105349 - 105449
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  105349 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatga 105448  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  105449 g 105449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Original strand, 105514 - 105559
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  105514 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 105559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19114255 - 19114034
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114255 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 19114156  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114155 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 19114056  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  19114055 attgcatatgtccgccatgatg 19114034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20017479 - 20017700
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017479 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 20017578  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017579 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 20017678  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  20017679 attgcatatgtccgccatgatg 20017700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19483277 - 19483501
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483277 gtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 19483376  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483377 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 19483476  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19483477 gacattgcatatgtccgccatgatg 19483501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 17673239 - 17673460
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673239 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 17673338  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673339 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 17673438  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  17673439 attgcatatgtccgccatgatg 17673460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18858142 - 18857921
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858142 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18858043  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18858042 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagac 18857943  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  18857942 tttgcatatgtccgctatgatg 18857921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22119390 - 22119611
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119390 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22119489  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22119490 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagac 22119589  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  22119590 gttgcatatgtccgctatgatg 22119611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22128174 - 22128395
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128174 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22128273  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22128274 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagac 22128373  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  22128374 gttgcatatgtccgctatgatg 22128395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 30312360 - 30312581
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30312360 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 30312459  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30312460 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 30312559  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  30312560 attgcatatgtccgctttgatg 30312581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21165754 - 21165975
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||    
T  21165754 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgatcaaaaagagttgaatatga 21165853  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165854 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 21165953  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  21165954 attgcatatgtccgctttgatg 21165975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22041424 - 22041203
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041424 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttggaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22041325  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22041324 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagac 22041225  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  22041224 attgcatatgtccgctttgatg 22041203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 22132257 - 22132472
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22132257 ttgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 22132356  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  22132357 ggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagac 22132456  T
Q  214 attgcatatgttcgct 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22132457 attgcatatgtccgct 22132472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32601709 - 32601488
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32601709 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatga 32601610  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32601609 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 32601510  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  32601509 attgcatatgtccgctttgatg 32601488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15534948 - 15534727
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534948 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15534849  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15534848 gacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 15534749  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||| |||| |||| |||||    
T  15534748 attgcacatgtccgctttgatg 15534727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19979532 - 19979311
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19979532 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataaaagcttgaaatatatgttcgatcagaaagaattgaatatga 19979433  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19979432 ggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagac 19979333  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  19979332 attgcatatgtccgctatgatg 19979311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21044010 - 21043789
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21044010 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 21043911  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21043910 ggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagac 21043811  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  21043810 cttgcatatgtctgctatgatg 21043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21393084 - 21393302
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21393084 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 21393183  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  21393184 agcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagacctt 21393283  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  21393284 gcatatgtctgctatgatg 21393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21787578 - 21787796
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21787578 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 21787677  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  21787678 agcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagacctt 21787777  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  21787778 gcatatgtctgctatgatg 21787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23651606 - 23651385
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23651606 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttactgatcacaagagtctgaagtatctgttcgatctgaaggaattgaatatga 23651507  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23651506 ggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 23651407  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  23651406 tttgcatatgtctgctatgatg 23651385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21252509 - 21252288
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21252509 ttgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcaatcagaaggaattgaatatga 21252410  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21252409 ggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 21252310  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  21252309 cttgcatatgtctgctatgatg 21252288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 20395352 - 20395558
Alignment:
Q  18 agatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 117  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20395352 agatttggagacgttatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 20395451  T
Q  118 gcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattg 217  Q
    |||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||     
T  20395452 gcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacttta 20395551  T
Q  218 catatgt 224  Q
    |||||||    
T  20395552 catatgt 20395558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 21920952 - 21921151
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  21920952 ttgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagattttgaagtatctgctcgatcagaaggaattgaacatga 21921051  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21921052 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 21921151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 22247652 - 22247868
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  22247652 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagac 22247751  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22247752 agcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 22247851  T
Q  217 gcatatgttcgctatga 233  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22247852 gcatatgtccgctatga 22247868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20389667 - 20389443
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  20389667 gtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaata 20389568  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  20389567 tgaggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaa 20389468  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||    
T  20389467 gacgttgcatatgtctgctatgatg 20389443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23656492 - 23656271
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  23656492 ttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtattcagtgatcacaaaagcttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 23656393  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23656392 ggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 23656293  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  23656292 gttgcatatgtctgctatgatg 23656271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 31570058 - 31570279
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31570058 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 31570157  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  31570158 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagac 31570257  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  31570258 acttcatatgtctgctatgatg 31570279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 20984772 - 20984984
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |||| || || || |||||||||||||||||| |||    
T  20984772 tggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaa 20984871  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20984872 gatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacat 20984971  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  20984972 gtctgctatgatg 20984984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 21324485 - 21324691
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21324485 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 21324584  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21324585 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 21324684  T
Q  214 attgcat 220  Q
     ||||||    
T  21324685 gttgcat 21324691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 16407333 - 16407448
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16407333 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatga 16407432  T
Q  114 ggcagcgaagatggct 129  Q
    |||| ||||| |||||    
T  16407433 ggcaacgaaggtggct 16407448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20009137 - 20009357
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  20009137 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaacatga 20009236  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20009237 ggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggta-aactaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 20009335  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  20009336 gttgcacatgtctgctatgatg 20009357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 29302651 - 29302852
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |    
T  29302651 tggaggcattatttgtacggttccagattcgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagga 29302750  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  29302751 gatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacattgcatat 29302850  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  29302851 gt 29302852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21841982 - 21841783
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  21841982 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatga 21841883  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||||| ||| || | ||||||||||| ||  |||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21841882 ggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 21841783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6605223 - 6605013
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  6605223 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatga 6605124  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  6605123 ggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 6605024  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  6605023 tttgcacatgt 6605013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 20974872 - 20975082
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  20974872 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatga 20974971  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||| || || |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20974972 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 20975071  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  20975072 gctgcatatgt 20975082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22052419 - 22052207
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || || ||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  22052419 tggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcacaggagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagagga 22052320  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22052319 gatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatat 22052220  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  22052219 gtctgctatgatg 22052207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16270440 - 16270650
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16270440 ttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatga 16270539  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16270540 ggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaac 16270639  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  16270640 attgcacatgt 16270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12306302 - 12306113
Alignment:
Q  35 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagt 134  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||    
T  12306302 ttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagt 12306203  T
Q  135 tgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||    
T  12306202 tactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgcatatgt 12306113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22372496 - 22372275
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || || || ||  ||||||||||||    
T  22372496 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatctatttgaccaaaaataattgaatatga 22372397  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22372396 ggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagac 22372297  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  22372296 gttgcacatgtctgctatgatg 22372275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23886586 - 23886393
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  23886586 aagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcggtgatcataaaagtcagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagac 23886487  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    | ||||| |||||  | ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23886486 aacgaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaa 23886393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16876311 - 16876521
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  16876311 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16876410  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16876411 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16876510  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  16876511 tttgcatatgt 16876521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 31415696 - 31415897
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31415696 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtccagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 31415795  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||  | |||| ||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  31415796 gatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacattgcatat 31415895  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  31415896 gt 31415897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 22376672 - 22376891
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||     
T  22376672 aagatatggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgaga 22376771  T
Q  116 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||||| ||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  22376772 cagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgt 22376871  T
Q  216 tgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22376872 tgcatatgtccgctatgatg 22376891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 22382847 - 22383066
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||     
T  22382847 aagatatggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgaga 22382946  T
Q  116 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||||| ||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  22382947 cagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgt 22383046  T
Q  216 tgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22383047 tgcatatgtccgctatgatg 22383066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14566707 - 14566497
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||    
T  14566707 ttgaaaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaacagaaagaactgaacatga 14566608  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14566607 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 14566508  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  14566507 tttgcacatgt 14566497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22435868 - 22435658
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22435868 ttgaagatttggaggcattatatgtatagttctaactttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatga 22435769  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || || |||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  22435768 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaagattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaac 22435669  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  22435668 tttgcatatgt 22435658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19852880 - 19852755
Alignment:
Q  110 atgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtagga 209  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19852880 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19852781  T
Q  210 agacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||    
T  19852780 agacgttgcacatgtctgctatgatg 19852755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19858916 - 19858791
Alignment:
Q  110 atgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtagga 209  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19858916 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19858817  T
Q  210 agacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||    
T  19858816 agacgttgcacatgtctgctatgatg 19858791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19869251 - 19869048
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19869251 tatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatacttgtttgatcaaaatgagttgaatatgagacagcg 19869152  T
Q  121 aagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 220  Q
     |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||   ||| |||||| ||||| |  || ||||| || || |||||||||||||||||| | |||||     
T  19869151 gagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcac 19869052  T
Q  221 atgt 224  Q
    ||||    
T  19869051 atgt 19869048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27356101 - 27355950
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || ||||    
T  27356101 ttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactaaacatga 27356002  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27356001 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaatta 27355950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 20651549 - 20651759
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  20651549 ttgaagatttggaggcattacctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatga 20651648  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||| | |  |  |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20651649 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttataatctcgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 20651748  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  20651749 tttgcatatgt 20651759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 21849589 - 21849763
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatg 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||  || ||||| |  |    
T  21849589 tttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggttggagtatcttaaggacttcg 21849688  T
Q  150 actttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21849689 attttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgt 21849763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23901752 - 23901544
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23901752 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23901653  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  |||||||| |||| |  || ||||| |  ||||||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  23901652 gacaaagaagatggttagaatatcttaaggacttcgactttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgacgacgccttgagtaagaagac 23901553  T
Q  214 attgcatat 222  Q
     ||||||||    
T  23901552 tttgcatat 23901544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 23156256 - 23156359
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23156256 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23156355  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  23156356 ggca 23156359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22316756 - 22316652
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  22316756 ttgaagatttggaggcattatctgtatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 22316657  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  22316656 ggcag 22316652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 21195718 - 21195929
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||    
T  21195718 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaaatttgaagttttcagtgaccataagagtttgaagtacttatttgatcagaaaaagttgaatatga 21195817  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21195818 ggcaaagaagatgggtggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 21195917  T
Q  214 attgcatatgtt 225  Q
     |||||||||||    
T  21195918 tttgcatatgtt 21195929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19861000 - 19860900
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19861000 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 19860901  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  19860900 g 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 22623268 - 22623472
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || ||| |||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||          
T  22623268 tggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgattataaaagtatgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggc------ 22623361  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
     | |||||  |||| ||||||||||||| |   | || ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  22623362 -aaggctaatgttgttaaaggattatgattacaggttaaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatat 22623460  T
Q  223 gttcgctatgat 234  Q
    ||  ||||||||    
T  22623461 gtctgctatgat 22623472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Original strand, 23156393 - 23156438
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23156393 gctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagactttgcatatgt 23156438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267582
Alignment:
Q  143 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatg 1267582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8927 - 8706
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8927 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgattagaaggaattgaatatga 8828  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8827 gacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8728  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  8727 attgcatatgtccgctatgatg 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 49620 - 49484
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  49620 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagatggaattgaatatga 49521  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatga 150  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  49520 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatga 49484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20132 - 19911
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20132 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatga 20033  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20032 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagac 19933  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  19932 attgcatatgtccgctatgatg 19911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35556 - 35335
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35556 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatga 35457  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35456 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagac 35357  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  35356 attgcatatgtccgctatgatg 35335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50962 - 50741
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  50962 ttgaagatatggagaaattacttgtatgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgtttgattagaaggaattgcatatga 50863  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50862 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 50763  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| |||| ||||||||||    
T  50762 tttgcacatgtccgctatgatg 50741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 315
Alignment:
Q  104 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttga 203  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  446 ttgaatatgaggcaaagaagatggttagaatatcttaaggattttgattttcagttgatttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttga 347  T
Q  204 gtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  346 gtagaaagactttgcatttgtttgctttgatg 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4350
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4129 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcaatcagaaagaattgaatatga 4228  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4229 ggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 4328  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| |||||| |||| |||||    
T  4329 attgaatatgtccgctttgatg 4350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 28144 - 28365
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28144 ttgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgaccagaaagaattgaatatga 28243  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28244 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagac 28343  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  28344 attgcatatgtccgctatgatg 28365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 60274 - 60062
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| || || |||| ||| || ||| | |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  60274 tggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagtggtcataaaagtataaagtatttatttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaa 60175  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||  | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||    
T  60174 ggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgttgttgcagatgctttaaataggaaaacattacatat 60075  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||| | |||||||    
T  60074 gtttgatatgatg 60062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 54717 - 54923
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  54717 ttgaagatttggagtcattatctttatggttctatttttgaggtgttcattgaccataagtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 54816  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  54817 ggcagcgaagatggttggaatatcttaaggactttgatttttagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtataaagac 54916  T
Q  214 attgcat 220  Q
     ||||||    
T  54917 tttgcat 54923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 224
Target Start/End: Original strand, 3361 - 3442
Alignment:
Q  143 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| || ||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3361 gattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 131483 - 131426
Alignment:
Q  167 cacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  131483 caccaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgt 131426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 3278 - 3348
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 81  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  3278 gtgttgaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataagagtctgaa 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 12768 - 12976
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12768 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 12867  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12868 ggcagcgtagatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T
Q  214 attgcatat 222  Q
    |||||||||    
T  12968 attgcatat 12976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 277606 - 277827
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  277606 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaagaattgaatatga 277705  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  277706 ggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 277805  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  277806 attgcatatgtccgctatgatg 277827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 261838 - 261617
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  261838 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtacttatttgaccaaaaggaattgaacatga 261739  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  261738 ggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagac 261639  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  261638 actgcatatgtctgctatgatg 261617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 32349 - 32559
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32349 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgagcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 32448  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  32449 ggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagac 32548  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  32549 gttgcatatgt 32559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10126 - 9905
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10126 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatga 10027  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10026 gacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagac 9927  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  9926 attgcatatgtccgctttgatg 9905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29347 - 29568
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29347 ttgaacatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaaacatga 29446  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || ||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29447 ggtagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 29546  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  29547 gttgcatatgtccgctatgatg 29568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1948 - 1727
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1948 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 1849  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1848 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagac 1749  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  1748 attgcatatgtccgctttgatg 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15688 - 15467
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15688 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 15589  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15588 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagac 15489  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  15488 attgcatatgtccgctttgatg 15467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 66935 - 66714
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66935 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttcgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatta 66836  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  66835 gacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaagac 66736  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  66735 attgcatatgtccgctttgatg 66714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 38596 - 38817
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38596 ttgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcagaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 38695  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38696 ggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagac 38795  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  38796 attgcatatgtccgctttgatg 38817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 79270 - 79491
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79270 ttgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 79369  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  79370 ggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagac 79469  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  79470 attgcatatgtccgccatgatg 79491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 55293 - 55230
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  55293 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaagt 55230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3727 - 3503
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3727 gtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaata 3628  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3627 tgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaa 3528  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  3527 gacgttgcatatgtccgctatgatg 3503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30475 - 30254
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30475 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 30376  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30375 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagac 30276  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  30275 attgcatatgtctgctatgatg 30254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29576 - 29366
Alignment:
Q  25 gagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaga 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  29576 gagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaaga 29477  T
Q  125 tggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  29476 tggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 29377  T
Q  225 tcgctatgatg 235  Q
      |||||||||    
T  29376 ctgctatgatg 29366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50331 - 50168
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  50331 tggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaa 50232  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgt 186  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  50231 gatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 23849 - 24058
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23849 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatga 23948  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||| |||||  | ||| | || |||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23949 ggcagagaaggtggcttaaattgttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T
Q  214 attgcatatg 223  Q
    ||||||||||    
T  24049 attgcatatg 24058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 57547 - 57332
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  57547 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagttcgaagtatttgttcgaccagaaggaattaaatatga 57448  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | || || ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  57447 gacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagac 57348  T
Q  214 attgcatatgttcgct 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  57347 attgcatatgtccgct 57332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 18843 - 19053
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18843 ttgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttcaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatga 18942  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18943 ggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaatac 19042  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  19043 attgcatatgt 19053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 196263 - 196475
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  196263 ttgaagatatggagacattacttgtatggt---------gaggtgtttagtgatcataagagtttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatga 196353  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  196354 ggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  196454 attgcatatgtccgctttgatg 196475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7544 - 7323
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7544 ttgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatga 7445  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7444 ggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagac 7345  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  7344 attgcatatgtcctctatgatg 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 3181 - 3402
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3181 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatga 3280  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3281 gacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagac 3380  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  3381 attgcatatgtccgctttgatg 3402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 19117 - 19338
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19117 ttgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatatgttcgatcagaaggaattgaatatga 19216  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19217 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 19316  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  19317 cttgcatatgtctgctatgatg 19338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21417 - 21207
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21417 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 21318  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21317 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagac 21218  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     || |||||||    
T  21217 cttacatatgt 21207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46047 - 45848
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  46047 ttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaacatttatttgatcagaaggaattgaacatga 45948  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  45947 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 45848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7579 - 7358
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7579 ttgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaagaattgaatatga 7480  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7479 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 7380  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  7379 cttgcatatgtctgctatgatg 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 235
Target Start/End: Original strand, 3535 - 3606
Alignment:
Q  164 tatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3535 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatg 3606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 13987 - 14208
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13987 ttgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatga 14086  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14087 ggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 14186  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
      |||||||||  |||||||||    
T  14187 catgcatatgtctgctatgatg 14208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17187 - 16974
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17187 gtgttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaata 17088  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17087 tgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaa 16988  T
Q  211 gacattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||||    
T  16987 gacattgcatatgt 16974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 31526 - 31750
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31526 gtgttgaaaatatggaaacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttagatcagaaggaattgaata 31625  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31626 tgagccagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaa 31725  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  31726 gacgttgcatatgtccgctatgatg 31750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 12303 - 12513
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||    
T  12303 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagttttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggagttgaacatga 12402  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  || | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12403 ggcagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagac 12502  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  12503 gctgcatatgt 12513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 34524 - 34636
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  34524 gtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaata 34623  T
Q  111 tgaggcagcgaag 123  Q
    |||||||||||||    
T  34624 tgaggcagcgaag 34636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 102766 - 102554
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  102766 gtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaata 102667  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  102666 tgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaa 102567  T
Q  211 gacattgcatatg 223  Q
    ||| |||||||||    
T  102566 gactttgcatatg 102554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13588 - 13381
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13588 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatga 13489  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 13389  T
Q  214 attgcata 221  Q
     |||||||    
T  13388 tttgcata 13381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7329
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7547 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagcttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggc 7448  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||  |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  7447 agcatagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagacttt 7348  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7347 gcatatgtccgctatgatg 7329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 328 - 549
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  328 ttgaaaatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatga 427  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||  ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  428 ggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 527  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  528 gttgcacatgtctgctatgatg 549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23706 - 23496
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| || || |||||  |||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23706 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23607  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| || ||| |  || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23606 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttttcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 23507  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  23506 tttgcatatgt 23496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 75
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  296 ttgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 197  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  196 ggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 97  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  96 cttgcatatgtctgctatgatg 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2578
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2799 ttgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 2700  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2699 ggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 2600  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  2599 cttgcatatgtctgctatgatg 2578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 7429 - 7639
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7429 ttgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatga 7528  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7529 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 7628  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  7629 attgcatatgt 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39886 - 39688
Alignment:
Q  37 gtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttg 136  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39886 gtatggttcaaggtttgaggtgtttaacgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattg 39787  T
Q  137 ctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39786 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtccgctttgatg 39688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7328
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7107 ttgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttaaggtgtttagtgaccattagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 7206  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7207 ggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagac 7306  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||| |||  |||||||||    
T  7307 cttgcatttgtctgctatgatg 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7902 - 7681
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7902 ttgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttgagctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgttcgatcaaaaggaattgaatatga 7803  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7802 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 7703  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  7702 cttgcatatgtctgctatgatg 7681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 25718 - 25930
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  25718 gtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttaatgatcacaagagtttgaaatatttgtttgattagagggaattgaata 25817  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    | |||||||| || ||||| || || || |||||||| || ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25818 ttaggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaa 25916  T
Q  211 gacattgcatatgt 224  Q
    ||||||||||||||    
T  25917 gacattgcatatgt 25930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 964 - 802
Alignment:
Q  62 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   ||||    
T  964 agtgaccacaagagtttgaagtacttgcttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggaatttgattttcagttga 865  T
Q  162 attatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
     |||||| || || |  |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  864 gttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 7860 - 8073
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7860 gtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcgaggtgtttaatgatcacaagagtctgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaata 7959  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7960 tgaggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaa 8059  T
Q  211 gacattgcatatgt 224  Q
     |||||||||||||    
T  8060 aacattgcatatgt 8073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2969 - 2745
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2969 gtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgattagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaata 2870  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2869 tgaggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaa 2770  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| || |||||||  |||||||||    
T  2769 gactttacatatgtctgctatgatg 2745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10278
Alignment:
Q  28 acattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10485 acattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttgg 10386  T
Q  128 ctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcg 227  Q
    || || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |    
T  10385 ctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctg 10286  T
Q  228 ctatgatg 235  Q
    ||||||||    
T  10285 ctatgatg 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 38727 - 38945
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38727 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgagcataacagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgagac 38826  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  38827 atcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagacctt 38926  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  38927 ggatatgtctgctatgatg 38945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6751 - 6530
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6751 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgataatacgagtttgaagtatctattcgatcagaaggaatggaatatga 6652  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||  || |  |||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6651 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagac 6552  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  6551 tttgcatatgtccgctatgatg 6530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 202241 - 202465
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  202241 gtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagattttaggtgtttagtgatcacaggagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaata 202340  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  202341 tgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaa 202440  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  202441 gacattgcatatgtcagctatgatg 202465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 324234 - 324024
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| || || ||||    
T  324234 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtctcaaatatttatttgatcagaaggagttaaacatga 324135  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  324134 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagac 324035  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  324034 gttgcacatgt 324024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 118753 - 118535
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  118753 aagatttggagacattatttgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 118654  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  118653 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 118554  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| || |||||||    
T  118553 acatatgtccgttatgatg 118535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 112267 - 112474
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  112267 aagataaggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtatttagtgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggc 112366  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| |  ||||| || ||||| || || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  112367 agcgtaagtggcttgaattgctgaacgactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacatt 112466  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
    ||||||||    
T  112467 gcatatgt 112474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16404 - 16186
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  16404 aagatttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaagcaattgaatatgagac 16305  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||| |  | ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16304 agcgaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacttt 16205  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  16204 gcatatgtctgctatgatg 16186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41228 - 41007
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41228 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 41129  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41128 gacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 41029  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  41028 gttgcacatgtctgctatgatg 41007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 47189 - 47289
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  47189 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtt-gaagtatttgtttgatcagaaatagttgaatatga 47287  T
Q  114 gg 115  Q
    ||    
T  47288 gg 47289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 22971 - 23157
Alignment:
Q  24 ggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 123  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22971 ggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 23070  T
Q  124 atggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
     ||||| || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23071 gtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaa 23157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48634 - 48413
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  48634 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgagatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatga 48535  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48534 gctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 48435  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  48434 gttgcatatgtctgctatgatg 48413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 8435 - 8631
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8435 ttgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatga 8534  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||  ||||  |||||  | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8535 gacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgattttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2428 - 2217
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||       || || ||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  2428 aagatttggagacattatttctatggttctagatttgaagtgtt-------cataaaagtctgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggc 2336  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| || ||    
T  2335 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaacttt 2236  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||  |||||||||    
T  2235 acatatgtctgctatgatg 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 2270 - 2482
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2270 tggaggcattatttgtacggctccagatttgaagtgtttagtgatcccaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaa 2369  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  2370 gatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatat 2469  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  2470 gtctgctatgatg 2482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 177036 - 177259
Alignment:
Q  12 tgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 111  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  177036 tgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaagaaattgaatat 177135  T
Q  112 gaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 211  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || || || ||||||    
T  177136 gaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaag 177235  T
Q  212 acattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    || || |||||||  |||||||||    
T  177236 acgttacatatgtctgctatgatg 177259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40087 - 39866
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  40087 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctatttgatcagaaggaatggaatatga 39988  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | |||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||  ||||| || | || ||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||    
T  39987 gacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagac 39888  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  39887 cttgcatatgtctgctatgatg 39866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 16762 - 16974
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  16762 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaa 16861  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| || ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  16862 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatat 16961  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    || ||||||||||    
T  16962 gtccgctatgatg 16974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 6670 - 6888
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6670 aagatttggagacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 6769  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |  |||| ||||| || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |    
T  6770 aaggaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactct 6869  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  6870 acatatgtccgctatgatg 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13995 - 13777
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  13995 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagac 13896  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  13895 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaacttt 13796  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  13795 gcatatgtccgccatgatg 13777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18879 - 18677
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18879 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttattcgatctgaaagaattgaatatga 18780  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  18779 ggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagac 18680  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  18679 att 18677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25763
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25553 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatga 25652  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  ||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  25653 ggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaacgttgttgttgatgctttgagtagaaagac 25752  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  25753 attgcatatgt 25763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 23852 - 24069
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23852 gtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttattagatcaaaaggaattgaata 23951  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||    
T  23952 tgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaa 24044  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||    
T  24045 gacgttgcatatgtctgctatgatg 24069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5306 - 5101
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  5306 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 5207  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  5206 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagac 5107  T
Q  214 attgca 219  Q
     |||||    
T  5106 gttgca 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6280 - 6059
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  6280 ttgaaaatttggaggccttacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaattgaatatga 6181  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6180 ggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaac 6081  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| | |||||||    
T  6080 gttgcacatgtttgttatgatg 6059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15642 - 15421
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  15642 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatga 15543  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  15542 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagag 15443  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  15442 gttgcatatgtctgctatgatg 15421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 8637 - 8847
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  8637 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatga 8736  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8737 ggcacagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 8836  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  8837 tttgcatatgt 8847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5960 - 5739
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  5960 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgataaaaaagaattgaatatga 5861  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5860 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagac 5761  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  5760 gttgcacatgtctgctatgatg 5739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11326 - 11102
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || || |||||||    
T  11326 gtgttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaata 11227  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  11226 tgaggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaa 11127  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| ||||| ||||  |||||||||    
T  11126 gacgttgcacatgtctgctatgatg 11102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16170 - 16103
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16170 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2412 - 2213
Alignment:
Q  25 gagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  2412 gagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtagg 2313  T
Q  125 tggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| ||||  ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2312 tggcttgaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgt 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3706 - 3496
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   | |||  |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3706 ttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaatatctgagatatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 3607  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3606 ggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 3507  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  3506 gttgcacatgt 3496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1390 - 1200
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1390 tggagacattatttgtacggttccaggtttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 1291  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1290 aatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 17994 - 18212
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| |  ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17994 aagatatggagacattatttgtaaggttctagattaaaagtgttcaaagatcataaaagtatgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 18093  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18094 aacgaaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 18193  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18194 gcatatgtccgctatgatg 18212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5398 - 5180
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5398 aagatatggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 5299  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5298 agcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 5199  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  5198 gcatatgtccactatgatg 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12528 - 12310
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12528 aagatatggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 12429  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12428 agcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 12329  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  12328 gcatatgtccactatgatg 12310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 47810 - 48031
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  47810 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatga 47909  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47910 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagac 48009  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  48010 gttgcacatgtctgctatgatg 48031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 56623 - 56844
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  56623 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaatgatcaaaagagtctaaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatga 56722  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  56723 ggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagac 56822  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
      |||| ||||  |||||||||    
T  56823 gctgcacatgtctgctatgatg 56844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 109160 - 108939
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  109160 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgattagaaagaattgaatatga 109061  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  109060 ggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagac 108961  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  108960 gttgcacatgtctgctatgatg 108939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 55764 - 55876
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55764 gtgttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatatttattcgatcagaaagaattgaata 55863  T
Q  111 tgaggcagcgaag 123  Q
    |||||||||||||    
T  55864 tgaggcagcgaag 55876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 62936 - 63028
Alignment:
Q  143 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  62936 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatg 63028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3234
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  3441 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagac 3342  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||  ||||||| | ||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3341 agcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 3242  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
    ||||||||    
T  3241 gcatatgt 3234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 46175 - 46385
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  46175 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 46274  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  46275 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaac 46374  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  46375 gttgcatatgt 46385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 41109 - 41319
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  41109 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 41208  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  41209 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 41308  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  41309 gttgcacatgt 41319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4639 - 4421
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  4639 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagac 4540  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    ||| ||||||||| || ||| | || |||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
T  4539 agcaaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagacttt 4440  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||||  |||||||||    
T  4439 acatatgtctgctatgatg 4421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 25312 - 25530
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| |    
T  25312 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagac 25411  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  25412 aacgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgtt 25511  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  25512 gcatatgtccgctatgatg 25530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 150099 - 149890
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| || ||| | |||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  150099 ttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagtattttgggatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 150000  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  149999 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 149901  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||| ||||||    
T  149900 attgaatatgt 149890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 194480 - 194690
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  194480 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagtattcggtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 194579  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  194580 ggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagac 194679  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  194680 gttgcatatgt 194690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 181454 - 181244
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  181454 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 181355  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||    
T  181354 ggcaatgaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttggtgctgatgctttgagtagaaaaac 181255  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  181254 tttgcatatgt 181244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 11578 - 11783
Alignment:
Q  30 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  11578 attatttgtatggttcgagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggct 11677  T
Q  130 agagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgct 229  Q
     |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||  ||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  11678 tgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgct 11777  T
Q  230 atgatg 235  Q
    ||||||    
T  11778 atgatg 11783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28154 - 27934
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28154 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 28055  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||| | ||||||    
T  28054 ggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagca-gaagac 27956  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||| ||||||  |||||||||    
T  27955 gttggatatgtctgctatgatg 27934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 59990 - 60141
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  59990 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 60089  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  60090 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaatta 60141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 50956 - 51107
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  50956 ttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatga 51055  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51056 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaatta 51107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 66378 - 66529
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  66378 ttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatga 66477  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  66478 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaatta 66529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44304 - 44103
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44304 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaattatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 44205  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44204 gatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacattgcatat 44105  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  44104 gt 44103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 522 - 310
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  522 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 423  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  422 gatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatat 323  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  322 gtctgctatgatg 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 585 - 473
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  585 gtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaata 486  T
Q  111 tgaggcagcgaag 123  Q
    |||||||||||||    
T  485 tgaggcagcgaag 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4270 - 4058
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  4270 tggaggcattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaa 4171  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||    
T  4170 gatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatat 4071  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  4070 gtctgctatgatg 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 42910 - 43093
Alignment:
Q  41 ggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaa 140  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  42910 ggttctagatttgaagtgttcagtaatcataaaagtttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagacagcgaaggtggctagaattgctaa 43009  T
Q  141 aggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  43010 aagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgt 43093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 11979 - 12182
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  11979 tatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcg 12078  T
Q  121 aagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 220  Q
     |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||   | | |||||| | ||| |  || ||||| || || |||||||||||||||||| | |||||     
T  12079 gagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactaagttatcatctagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcac 12178  T
Q  221 atgt 224  Q
    ||||    
T  12179 atgt 12182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 55676 - 55886
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  55676 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcataagagtatgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 55775  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55776 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 55875  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  55876 attgcatatgt 55886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41788 - 41578
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  41788 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41689  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41688 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 41589  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  41588 tttgcatatgt 41578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 32456 - 32652
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32456 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 32555  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32556 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 32652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20650 - 20440
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  20650 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcataagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 20551  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20550 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagac 20451  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  20450 attgcatatgt 20440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Original strand, 57976 - 58146
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  57976 tggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 58075  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgca 193  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||||||||||    
T  58076 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 68900 - 68690
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  68900 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcatgatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaattatttgtttgatcataaagaattgaacatga 68801  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  68800 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 68701  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  68700 attgcacatgt 68690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 3729 - 3939
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| |||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  3729 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgaccagaaagaattgaacatga 3828  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3829 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagac 3928  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  3929 gttgcatatgt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 12684 - 12894
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  12684 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 12783  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12784 ggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 12883  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  12884 attgcatatgt 12894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 6930 - 7131
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  6930 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 7029  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7030 gatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 7129  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  7130 gt 7131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 80608 - 80829
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  80608 ttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtatgaaatatttatttgaccagaaggaattgaacatga 80707  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  80708 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagac 80807  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  80808 actacatatgtctgctatgatg 80829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 218202 - 218414
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  218202 atatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcaatcata---gtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagc 218298  T
Q  120 gaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    |||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  218299 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 218398  T
Q  220 tatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| | ||||||||    
T  218399 tatgtccactatgatg 218414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 287
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| |||    
T  499 tggagatattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaattttgaaatatttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaa 400  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  399 gatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatat 300  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  299 gtctgctatgatg 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 5865 - 6088
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||    
T  5865 ttgaaaatttggagacattatttgtacgactctagatttgaggtgtttagcgataacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaggaattgaacatga 5964  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgt--tgttgcagatgccttgagtaggaag 211  Q
    ||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  5965 ggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaag 6064  T
Q  212 acattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    || ||||| ||||  |||||||||    
T  6065 acgttgcacatgtctgctatgatg 6088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35000 - 34792
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  35000 ttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 34901  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34900 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 34801  T
Q  214 attgcatat 222  Q
    | |||||||    
T  34800 actgcatat 34792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28660 - 28539
Alignment:
Q  101 gaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgcct 200  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  28660 gaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgt 28561  T
Q  201 tgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  28560 tgagcaggaagacactgcatat 28539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Original strand, 98 - 155
Alignment:
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  98 agctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatg 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 39533 - 39756
Alignment:
Q  11 gtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  39533 gtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgagatatttatttgatcaaaaggaattgaata 39632  T
Q  111 tgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  39633 tgaggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatga-tttatttttaattatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaa 39731  T
Q  211 gacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||    
T  39732 gacgttgcatatgtctgctatgatg 39756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 15260 - 15479
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||     
T  15260 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgaga 15359  T
Q  116 cagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15360 cagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgt 15459  T
Q  216 tgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  15460 tgcatatgtccactatgatg 15479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 1630 - 1840
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  1630 ttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagcctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 1729  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1730 ggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagac 1829  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  1830 gttgcacatgt 1840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 3048 - 3258
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  3048 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatga 3147  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||||||||| || |  |||| | ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  3148 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagac 3247  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  3248 gttgcacatgt 3258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1413 - 1203
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  1413 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccagaaagaattgaacatga 1314  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  1313 ggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagac 1214  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||| ||||    
T  1213 attgcacatgt 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6224
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  6014 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 6113  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  6114 ggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaat 6213  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  6214 gttgcatatgt 6224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  30 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 30061 - 30271
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  30061 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatga 30160  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||||||||| || |  |||| | ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  30161 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagac 30260  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  30261 gttgcacatgt 30271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13730 - 13520
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  13730 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 13631  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13630 ggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 13531  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||| ||||    
T  13530 gttgcacatgt 13520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 6584 - 6793
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  6584 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 6683  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6684 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 6783  T
Q  214 attgcatatg 223  Q
     |||||||||    
T  6784 tttgcatatg 6793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6743 - 6522
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  6743 ttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 6644  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6643 ggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagac 6544  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  6543 acttcatatgtatgctatgatg 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 483 - 284
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  483 tggagagattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 384  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  383 ggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 846 - 1053
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||    
T  846 aagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaagtattcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgatccaaaggaattcaatatgaggc 945  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| || ||| | || || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  946 agcgtaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacatt 1045  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
    ||||||||    
T  1046 gcatatgt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 2131 - 2341
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  2131 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 2230  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | |||||| ||||| || | || |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2231 gacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaac 2330  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  2331 gttgcatatgt 2341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8569 - 8380
Alignment:
Q  35 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagt 134  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||     
T  8569 ttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagc 8470  T
Q  135 tgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    || | ||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8469 tgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgcatatgt 8380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42447 - 42237
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||| ||||||| || || ||||    
T  42447 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgtttttagtgatcataagagtcttaaatatttatttgattagaaggagtttaacatga 42348  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  42347 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 42248  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  42247 gctgcatatgt 42237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 15489 - 15699
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  15489 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 15588  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15589 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagac 15688  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  15689 tttgcatatgt 15699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10829 - 10746
Alignment:
Q  152 tttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10829 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatg 10746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 115684 - 115902
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  115684 aagatttggagacattatttgtatggttatagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagac 115783  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
      ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  115784 cacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 115883  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  115884 acatatgtccgctatgatg 115902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32913 - 32720
Alignment:
Q  42 gttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaa 141  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||    
T  32913 gttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaa 32814  T
Q  142 ggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||| |  |||| ||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  32813 ggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatg 32720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 9593 - 9805
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  9593 tggagacattatttctacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtctgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgta 9692  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| ||| ||| |||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  9693 ggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcattt 9792  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  9793 gtcagctatgatg 9805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26375 - 26283
Alignment:
Q  143 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26375 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 26283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 25
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  176 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 77  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  76 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaatta 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 13075 - 13286
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  13075 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 13174  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||| || || |||||||||||||| || || | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13175 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 13274  T
Q  214 attgcatatgtt 225  Q
      ||||||||||    
T  13275 gctgcatatgtt 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 2651 - 2861
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  2651 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 2750  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  2751 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 2850  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  2851 tttgcatatgt 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 13860 - 14078
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |    
T  13860 aagatttggagacattatttgtatggctctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatttgagac 13959  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| ||||| || ||| | || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  13960 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 14059  T
Q  217 gcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  14060 acatatgtccgctatgatg 14078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24924 - 24714
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  24924 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 24825  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24824 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 24725  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  24724 tttgcatatgt 24714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14228
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14438 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14339  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14338 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 14239  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  14238 tttgcatatgt 14228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 1619 - 1820
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  1619 tggagacattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 1718  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| || |||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  1719 gatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 1818  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  1819 gt 1820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3118 - 2897
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  3118 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacatga 3019  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||| ||| | |||||||||||  |||| |||||||     
T  3018 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagat 2919  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  2918 gttgcatatgtctgctatgatg 2897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2970
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  3111 ttgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttgaggtgttcagtgatcacacgagtttgaaatatttgttcgataagaaggagttgaatataa 3012  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 155  Q
    |||||| ||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||    
T  3011 ggcagcaaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttg 2970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 749 - 954
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  749 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatga 848  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | || ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  849 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagac 948  T
Q  214 attgca 219  Q
     |||||    
T  949 gttgca 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 250134 - 249933
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  250134 tggaggcattatttgtacggtttcagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 250035  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  250034 gatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatat 249935  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  249934 gt 249933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 10665 - 10864
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  10665 ttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 10764  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  10765 ggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 10848 - 11043
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||  ||| || ||||| ||||||||| ||||||||     
T  10848 cattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggt 10947  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10948 tagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgt 11043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 14618 - 14813
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||  ||| || ||||| ||||||||| ||||||||     
T  14618 cattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggt 14717  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| || | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14718 tagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgt 14813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21513 - 21362
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  21513 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 21414  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||||||||||    
T  21413 ggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaatta 21362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35628 - 35421
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| |||| | || ||||||||     
T  35628 cattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctaaaatattttttcaatcagaaagatttgaacatgaagtagagaagatggt 35529  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgc 228  Q
    ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  ||    
T  35528 tagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtctgc 35429  T
Q  229 tatgatgt 236  Q
    ||||||||    
T  35428 tatgatgt 35421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 854 - 644
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||| ||||||||    
T  854 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagcgttcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaatggaatatga 755  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | ||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  754 gacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagac 655  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     || |||||||    
T  654 cttacatatgt 644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 5112 - 5322
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||| | ||||||||||||    
T  5112 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaggtaattgaatatga 5211  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| || |  |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5212 ggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagac 5311  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     || |||||||    
T  5312 cttacatatgt 5322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 464 - 684
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  464 ttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgaccataaaagtttaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 563  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  564 ggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattacca-tcgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagac 662  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||  |||||||||    
T  663 gttgcatatgtctgctatgatg 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20379 - 20158
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||    
T  20379 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatga 20280  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  20279 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagac 20180  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     || || ||||  |||||||||    
T  20179 gttacacatgtcggctatgatg 20158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24320
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||    
T  24541 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatga 24442  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24441 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagac 24342  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     || || ||||  |||||||||    
T  24341 gttacacatgtcggctatgatg 24320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10233 - 10448
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  10233 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatga 10332  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10333 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaac 10432  T
Q  214 attgcatatgttcgct 229  Q
      ||||||||| ||||    
T  10433 gctgcatatgtccgct 10448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 20447 - 20662
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  20447 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatga 20546  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20547 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaac 20646  T
Q  214 attgcatatgttcgct 229  Q
      ||||||||| ||||    
T  20647 gctgcatatgtccgct 20662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 89311 - 89442
Alignment:
Q  104 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttga 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  89311 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 89410  T
Q  204 gtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  89411 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 89442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 89989 - 90120
Alignment:
Q  104 ttgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttga 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  89989 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 90088  T
Q  204 gtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  90089 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 90120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 83 - 1
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgcggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 235
Target Start/End: Original strand, 9859 - 10013
Alignment:
Q  81 agtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagc 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9859 agtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagc 9958  T
Q  181 taatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||||  || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||    
T  9959 caatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16340 - 16550
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  16340 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16439  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16440 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 16539  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  16540 tttgcatatgt 16550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 25658 - 25879
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25658 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25757  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| |  || |  |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  25758 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctctgagtagaaagac 25857  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  25858 tttgcatatgtttgctttgatg 25879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 27042 - 27252
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27042 ttgaagatttggaggcaatatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27141  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27142 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagac 27241  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  27242 tttgcatatgt 27252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 20353 - 20457
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20353 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcaaaaaagtctaaaatatttatttgatcataaggaattgaacatga 20452  T
Q  114 ggcag 118  Q
     ||||    
T  20453 agcag 20457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28054 - 27833
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||    
T  28054 ttgaaaatttggaggcaatatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgaccaaaaggaattgaacatga 27955  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  ||| |||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27954 ggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagac 27855  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     || || ||||  |||||||||    
T  27854 gtttcacatgtctgctatgatg 27833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 32104 - 32305
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  32104 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaa 32203  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  32204 gatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatat 32303  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  32304 gt 32305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23735 - 23534
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23735 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 23636  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||| | ||| || | || |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23635 ggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatat 23536  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  23535 gt 23534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20891 - 20714
Alignment:
Q  47 agatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggatt 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||| || | || ||||    
T  20891 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagatt 20792  T
Q  147 atgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  20791 atgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgt 20714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 50651 - 50872
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| |||| ||| | || || ||||||||||    
T  50651 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtattcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatga 50750  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  50751 ggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaac 50850  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||  |||||||||    
T  50851 gttgcacatgtctgctatgatg 50872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 72718 - 72509
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgag 114  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  72718 tgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgag 72619  T
Q  115 gcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaca 214  Q
    |||| |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| ||||||||| || |  |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||     
T  72618 gcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgatttatcaccccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagact 72519  T
Q  215 ttgcatatgt 224  Q
    ||||||||||    
T  72518 ttgcatatgt 72509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15961 - 15751
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  15961 ttgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatga 15862  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| |  || |  |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  15861 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagac 15762  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  15761 tttgcatatgt 15751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25492 - 25282
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  25492 ttgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatga 25393  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| |  || |  |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  25392 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagac 25293  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  25292 tttgcatatgt 25282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6741 - 6628
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||     
T  6741 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatttgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgc 6642  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||  ||||||||    
T  6641 ggcaaagaagatgg 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 32189 - 32399
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||    
T  32189 ttgaagatttggaagcattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagaatttgaagtacttgtttaatcagaaagagttgaatatga 32288  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||| ||| | || |  || ||| |||  || |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  32289 ggcaaagaaggtggttggaatatcttaagcatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 32388  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  32389 tttgcatatgt 32399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Original strand, 2148 - 2316
Alignment:
Q  56 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttg 155  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||| |||     
T  2148 gtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttta 2247  T
Q  156 gtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  2248 gtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgt 2316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6704 - 6494
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  6704 ttgaaaatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 6605  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  6604 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtc 6505  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  6504 tttgcatatgt 6494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Original strand, 24699 - 24873
Alignment:
Q  61 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttg 160  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  24699 tagtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttg 24798  T
Q  161 aattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  24799 aattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgtttgctttgatg 24873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28463 - 28253
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||| | || ||||    
T  28463 ttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaattatttatttgaccagaaggaacttaacatga 28364  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||  || ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||    
T  28363 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaac 28264  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  28263 attgcatatgt 28253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25356 - 25146
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25356 ttgaagatttggaggcattatctttatggttcgaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25257  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || || | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25256 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 25157  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  25156 tttgcatatgt 25146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 133265 - 133475
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  133265 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 133364  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| ||| || |  || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  133365 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttaacatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 133464  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  133465 tttgcatatgt 133475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19577 - 19356
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  19577 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatga 19478  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  19477 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgcttttagtagaaagac 19378  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  19377 tttgcatatgtttgctttgatg 19356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 343
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||    
T  524 aagatttggaggcattatctgtattgttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggc 425  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgc 198  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || || |||||||| || || ||||   |||||||||||||||||||    
T  424 agcgaaggtggctggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 6464 - 6660
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |    
T  6464 aagatttggaggcactacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttatttgaacagaaggagttgaacatgagac 6563  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || | |||||| | ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6564 agaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagac 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 235
Target Start/End: Original strand, 248 - 421
Alignment:
Q  62 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttga 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |  || ||||| | ||| |||   ||||    
T  248 agtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcataaggagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatctcaaggactttgattttcagttga 347  T
Q  162 attatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  348 gttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtccgctttgatg 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8780 - 8585
Alignment:
Q  29 cattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggc 128  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||     
T  8780 cattatttgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaatatggt 8681  T
Q  129 tagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||||||  | |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8680 tggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgt 8585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 992 - 782
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  992 ttgaatatttggagtcattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatga 893  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| |||||||| |  | |  || ||||| | ||| |||   |||| |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  892 ggcagagaagatggttgaaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 793  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  792 tttgcatatgt 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 100338 - 100548
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||  | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  100338 ttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcattaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatga 100437  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| |  | ||||| ||  | |||||||||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  100438 ggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagac 100537  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
    |||||||||||    
T  100538 attgcatatgt 100548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181508
Alignment:
Q  188 gttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatg 181508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 96622 - 96473
Alignment:
Q  86 ttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||    
T  96622 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 96523  T
Q  186 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  96522 tagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatg 96473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 7669 - 7876
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 116  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||    
T  7669 aagatatgaagacattaactgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagc 7768  T
Q  117 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || |||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||   |||| |||||| || |  |  |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||  ||    
T  7769 agagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtacaaagatttt 7868  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
    ||||||||    
T  7869 gcatatgt 7876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 2728 - 2831
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  2728 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 2827  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  2828 ggca 2831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4438
Alignment:
Q  97 gaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||| |||    
T  4311 gaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggat 4410  T
Q  197 gccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    || ||||| |||||||| || |||||||    
T  4411 gcgttgagcaggaagaccttacatatgt 4438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10824 - 10614
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10824 ttgaggatttggaggcataatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 10725  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || || |||| ||| |||   |||| |||||||||  | |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10724 ggcatagaagatggttggaatatcttaatgattttgattttcagttgagttatcaccctaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagac 10625  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
     ||||||||||    
T  10624 tttgcatatgt 10614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Original strand, 14157 - 14285
Alignment:
Q  95 cagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  14157 cagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca-gtaaagacaatgtggttgcag 14255  T
Q  195 atgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14256 atgctttgagcaggaagacgttgcatatgt 14285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Original strand, 22336 - 22464
Alignment:
Q  95 cagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcag 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  22336 cagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca-gtaaagacaatgtggttgcag 22434  T
Q  195 atgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22435 atgctttgagcaggaagacgttgcatatgt 22464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6260
Alignment:
Q  41 ggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaa 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |    
T  6151 ggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttga 6250  T
Q  141 aggattatga 150  Q
    ||||||||||    
T  6251 aggattatga 6260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10691
Alignment:
Q  41 ggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaa 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |    
T  10582 ggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttga 10681  T
Q  141 aggattatga 150  Q
    ||||||||||    
T  10682 aggattatga 10691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 6265 - 6327
Alignment:
Q  173 ggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  6265 ggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 6327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 10696 - 10758
Alignment:
Q  173 ggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  10696 ggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 10758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24868 - 24776
Alignment:
Q  143 gattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  24868 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatg 24776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 85304 - 85516
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  85304 tggaggcattatctgtatggttctagatttgaattgttcagcgatcataaaagttttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcaacgaa 85403  T
Q  123 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| || ||   |||||||||||| || || |||||||| || || ||||   |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  85404 ggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatat 85503  T
Q  223 gttcgctatgatg 235  Q
    ||  |||||||||    
T  85504 gtctgctatgatg 85516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 92925 - 92834
Alignment:
Q  36 tgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgg 127  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  92925 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 92834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Original strand, 64 - 219
Alignment:
Q  69 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatca 168  Q
    |||| |||||||  ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  64 acaaaagtttgagatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaatacca 163  T
Q  169 cccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
     |||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  164 tccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgt 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1721 - 1608
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  1721 tggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaa 1622  T
Q  123 gatggctagagttg 136  Q
    | ||||| ||||||    
T  1621 ggtggcttgagttg 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8149 - 8036
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  8149 tggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaa 8050  T
Q  123 gatggctagagttg 136  Q
    | ||||| ||||||    
T  8049 ggtggcttgagttg 8036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5417 - 5340
Alignment:
Q  158 ttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5417 ttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatg 5340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 34743 - 34675
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  34743 tgaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagt 34675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  35 ttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggct 129  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  95 ttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4074 - 3853
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||    
T  4074 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcatttaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatga 3975  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   |||| |||||  || || |  ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||    
T  3974 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcttcccgggaaggctaatgttgttattgatgctttgagtagaaagac 3875  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  3874 tttgcatatgtttgctttgatg 3853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 11486 - 11599
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  11486 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaaagagttgaatatga 11585  T
Q  114 ggcagcgaagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  11586 ggcagaggagatgg 11599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 13590 - 13811
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||     
T  13590 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatgg 13689  T
Q  114 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||   |||||||| | || |  || ||||||| ||| |||   | || |||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  13690 ggccaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagtggagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttaagtagaaagac 13789  T
Q  214 attgcatatgttcgctatgatg 235  Q
     ||||||| ||| ||| |||||    
T  13790 tttgcataagtttgctttgatg 13811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1596
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1552 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 8469 - 8513
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15588 - 15478
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||| |    
T  15588 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatta 15489  T
Q  114 ggcagcgaaga 124  Q
    ||||| |||||    
T  15488 ggcagagaaga 15478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 8897 - 8947
Alignment:
Q  68 cacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcag 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  8897 cacaagagtttgaagtacttgttcgatcaaaaggcgttgaatatgaggcag 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 1578 - 1678
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  | ||||||||||    
T  1578 ttgaagattttgagacattatttgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagtttaaagtacttgtttgataagaaatagttgaatatga 1677  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  1678 g 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 12053
Alignment:
Q  158 ttgaattatcacccaggtatagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgt 12053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Original strand, 2 - 59
Alignment:
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  2 agctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 59  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8537 - 8492
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  8537 gctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactttgcatatgt 8492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1054 - 1005
Alignment:
Q  186 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatg 235  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1054 ttgtagcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatg 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University