View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_38 (Length: 445)

Name: NF11737A_low_38
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_38
NF11737A_low_38
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (81-442)||(33223584-33223945)
chr4 (81-442)||(20891643-20892004)
chr4 (79-442)||(3264042-3264405)
chr4 (81-439)||(11206481-11206839)
chr4 (81-442)||(27901047-27901408)
chr4 (79-439)||(44661114-44661474)
chr4 (79-442)||(15246585-15246948)
chr4 (81-439)||(29452787-29453145)
chr4 (97-442)||(15002630-15002975)
chr4 (79-445)||(1648525-1648891)
chr4 (79-442)||(15319812-15320174)
chr4 (79-441)||(15078297-15078659)
chr4 (79-442)||(8706579-8706942)
chr4 (79-364)||(15414274-15414559)
chr4 (278-442)||(15358537-15358701)
chr4 (81-241)||(15358370-15358530)
chr4 (114-298)||(14850389-14850573)
chr4 (114-353)||(14303001-14303240)
chr4 (114-253)||(19777816-19777955)
chr4 (114-253)||(23956597-23956736)
chr4 (114-353)||(27712086-27712325)
chr4 (113-253)||(14160320-14160460)
chr4 (102-234)||(16148580-16148712)
chr4 (102-234)||(16152726-16152858)
chr4 (114-253)||(8052646-8052785)
chr4 (114-253)||(8387262-8387401)
chr4 (114-253)||(12477450-12477589)
chr4 (114-253)||(29038427-29038566)
chr4 (114-353)||(40473790-40474029)
chr4 (99-253)||(14681417-14681571)
chr4 (114-253)||(18298055-18298194)
chr4 (114-238)||(18226469-18226593)
chr4 (99-253)||(12524526-12524680)
chr4 (114-253)||(16354468-16354607)
chr4 (114-334)||(1639448-1639668)
chr4 (204-334)||(14691671-14691801)
chr4 (114-253)||(15146908-15147047)
chr4 (114-253)||(7091282-7091421)
chr4 (114-165)||(14695051-14695102)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (81-442)||(10468244-10468605)
chr6 (81-445)||(5296601-5296965)
chr6 (79-441)||(14380860-14381222)
chr6 (79-442)||(21472126-21472489)
chr6 (79-439)||(24364940-24365300)
chr6 (81-442)||(8762328-8762689)
chr6 (79-442)||(19453945-19454308)
chr6 (97-445)||(28282224-28282572)
chr6 (79-442)||(25768716-25769079)
chr6 (79-316)||(19435653-19435890)
chr6 (93-430)||(34644993-34645330)
chr6 (79-442)||(18795215-18795578)
chr6 (79-442)||(21563525-21563888)
chr6 (79-442)||(21569384-21569747)
chr6 (93-442)||(19879823-19880172)
chr6 (81-442)||(15459861-15460222)
chr6 (175-445)||(27560106-27560376)
chr6 (186-442)||(22796132-22796388)
chr6 (79-298)||(19488665-19488884)
chr6 (271-442)||(17416011-17416182)
chr6 (114-358)||(22434478-22434722)
chr6 (114-358)||(22442876-22443120)
chr6 (114-253)||(2874231-2874370)
chr6 (114-253)||(16626145-16626284)
chr6 (114-353)||(24312596-24312835)
chr6 (114-353)||(25113166-25113405)
chr6 (114-253)||(27188150-27188289)
chr6 (114-253)||(27260951-27261090)
chr6 (114-253)||(29591348-29591487)
chr6 (100-442)||(15896619-15896961)
chr6 (114-397)||(5838647-5838930)
chr6 (114-253)||(20636729-20636868)
chr6 (114-253)||(25609289-25609428)
chr6 (114-353)||(28262625-28262864)
chr6 (114-353)||(28341374-28341613)
chr6 (99-253)||(1542497-1542651)
chr6 (99-253)||(27566393-27566547)
chr6 (82-334)||(18197121-18197376)
chr6 (99-298)||(18966705-18966904)
chr6 (99-253)||(18436319-18436477)
chr6 (114-334)||(23079102-23079322)
chr6 (99-358)||(19865296-19865555)
chr6 (114-253)||(22078118-22078257)
chr6 (114-253)||(22761883-22762022)
chr6 (79-149)||(14379310-14379380)
chr6 (114-253)||(18407370-18407509)
chr6 (137-353)||(28291823-28292039)
chr6 (114-238)||(16962873-16962997)
chr6 (114-253)||(27330861-27331000)
chr6 (114-253)||(27391601-27391740)
chr6 (113-184)||(16098833-16098904)
chr6 (99-214)||(16927053-16927168)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (81-441)||(32572-32932)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (79-441)||(12456354-12456716)
chr7 (81-442)||(13022008-13022369)
chr7 (81-433)||(12457300-12457652)
chr7 (81-445)||(15341079-15341443)
chr7 (79-442)||(16949707-16950069)
chr7 (79-442)||(642-1005)
chr7 (105-439)||(13967929-13968263)
chr7 (79-439)||(14285611-14285971)
chr7 (81-442)||(15101840-15102201)
chr7 (81-441)||(13666189-13666549)
chr7 (79-442)||(11305498-11305861)
chr7 (79-433)||(8211363-8211717)
chr7 (81-445)||(14130521-14130885)
chr7 (81-445)||(14434339-14434703)
chr7 (79-439)||(49152955-49153315)
chr7 (79-439)||(26117840-26118200)
chr7 (81-442)||(19147862-19148223)
chr7 (81-442)||(20747261-20747622)
chr7 (97-445)||(23505123-23505471)
chr7 (82-445)||(18053191-18053554)
chr7 (93-442)||(19613326-19613675)
chr7 (87-442)||(16071537-16071892)
chr7 (79-442)||(11387663-11388026)
chr7 (81-442)||(14263481-14263842)
chr7 (79-442)||(12206035-12206398)
chr7 (245-439)||(6414165-6414359)
chr7 (120-441)||(21662612-21662933)
chr7 (82-442)||(15625202-15625562)
chr7 (114-423)||(11771533-11771842)
chr7 (99-253)||(15204458-15204612)
chr7 (114-353)||(8708344-8708583)
chr7 (114-353)||(10871734-10871973)
chr7 (114-253)||(13686903-13687042)
chr7 (114-353)||(18551050-18551289)
chr7 (114-353)||(44790643-44790882)
chr7 (99-253)||(12688340-12688494)
chr7 (99-253)||(15153934-15154088)
chr7 (99-353)||(18178481-18178735)
chr7 (114-247)||(14040540-14040673)
chr7 (114-247)||(14350570-14350703)
chr7 (105-353)||(11552385-11552633)
chr7 (114-253)||(8199467-8199606)
chr7 (114-253)||(11236505-11236644)
chr7 (114-253)||(14333236-14333374)
chr7 (123-253)||(15160358-15160488)
chr7 (114-253)||(23202905-23203044)
chr7 (114-253)||(23509032-23509171)
chr7 (114-238)||(9596911-9597035)
chr7 (114-238)||(16610-16732)
chr7 (99-253)||(14955397-14955547)
chr7 (114-253)||(321329-321468)
chr7 (114-192)||(14212574-14212652)
chr7 (114-179)||(13354063-13354128)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (81-428)||(30-377)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (79-442)||(43475-43838)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (81-442)||(23079521-23079882)
chr5 (79-442)||(24619725-24620088)
chr5 (79-442)||(24715956-24716319)
chr5 (79-442)||(24748984-24749347)
chr5 (81-439)||(20342860-20343218)
chr5 (79-442)||(25848650-25849013)
chr5 (79-439)||(24797827-24798187)
chr5 (79-442)||(22235350-22235713)
chr5 (79-439)||(14886421-14886781)
chr5 (79-442)||(22503254-22503617)
chr5 (97-445)||(17268782-17269130)
chr5 (79-439)||(37542811-37543171)
chr5 (79-442)||(21890189-21890552)
chr5 (81-442)||(20822028-20822389)
chr5 (81-442)||(22462527-22462888)
chr5 (82-442)||(28894375-28894735)
chr5 (82-442)||(28915846-28916206)
chr5 (82-442)||(28923201-28923561)
chr5 (81-442)||(20774334-20774695)
chr5 (79-442)||(21831191-21831554)
chr5 (79-442)||(21563403-21563766)
chr5 (81-301)||(21496789-21497009)
chr5 (93-298)||(21680222-21680427)
chr5 (308-445)||(22381771-22381908)
chr5 (97-334)||(21407839-21408076)
chr5 (84-353)||(22135350-22135619)
chr5 (114-253)||(14999204-14999343)
chr5 (114-353)||(19770642-19770881)
chr5 (114-253)||(26738192-26738331)
chr5 (114-353)||(29475538-29475777)
chr5 (114-353)||(41771524-41771763)
chr5 (114-440)||(20467562-20467887)
chr5 (99-253)||(22349205-22349359)
chr5 (114-353)||(27611036-27611275)
chr5 (114-253)||(27684865-27685004)
chr5 (114-253)||(16357284-16357423)
chr5 (114-353)||(22332352-22332591)
chr5 (114-253)||(27519189-27519328)
chr5 (114-253)||(34567276-34567415)
chr5 (114-353)||(37290961-37291200)
chr5 (114-253)||(21338762-21338901)
chr5 (114-253)||(27667955-27668094)
chr5 (114-253)||(40709562-40709701)
chr5 (120-253)||(25423971-25424104)
chr5 (114-238)||(18776567-18776691)
chr5 (114-334)||(23471930-23472150)
chr5 (114-358)||(23574414-23574658)
chr5 (114-253)||(23440992-23441131)
chr5 (114-253)||(21881731-21881870)
chr5 (121-234)||(20800249-20800362)
chr5 (114-167)||(23517394-23517447)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (81-445)||(4705-5069)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (79-442)||(13152-13515)
scaffold0034 (93-442)||(4218-4567)
scaffold0034 (81-442)||(68062-68423)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (79-442)||(31416165-31416528)
chr8 (105-442)||(29303143-29303480)
chr8 (81-439)||(6604388-6604746)
chr8 (81-442)||(6679838-6680199)
chr8 (81-442)||(16270917-16271278)
chr8 (79-442)||(803364-803727)
chr8 (79-442)||(1266965-1267328)
chr8 (79-442)||(12305485-12305848)
chr8 (99-442)||(27355275-27355618)
chr8 (79-439)||(14565872-14566232)
chr8 (81-442)||(23655654-23656015)
chr8 (81-442)||(20975344-20975705)
chr8 (79-442)||(19852138-19852501)
chr8 (79-442)||(19858174-19858537)
chr8 (81-445)||(22051587-22051951)
chr8 (97-445)||(31570551-31570899)
chr8 (79-436)||(22371673-22372030)
chr8 (81-439)||(21841147-21841505)
chr8 (79-442)||(20388826-20389189)
chr8 (79-376)||(20009611-20009907)
chr8 (201-442)||(22061246-22061487)
chr8 (99-357)||(20395843-20396094)
chr8 (114-367)||(22248143-22248396)
chr8 (114-253)||(17673749-17673888)
chr8 (116-334)||(22377182-22377400)
chr8 (116-334)||(22383357-22383575)
chr8 (114-253)||(19483790-19483929)
chr8 (99-253)||(23949835-23949989)
chr8 (114-253)||(19113606-19113745)
chr8 (84-247)||(18857499-18857662)
chr8 (114-253)||(22988112-22988251)
chr8 (114-253)||(23650957-23651096)
chr8 (99-253)||(21921447-21921601)
chr8 (114-260)||(22128684-22128830)
chr8 (114-253)||(21393591-21393730)
chr8 (114-253)||(21788085-21788224)
chr8 (118-353)||(22119904-22120139)
chr8 (79-193)||(20985238-20985352)
chr8 (114-253)||(21043361-21043500)
chr8 (114-238)||(22132767-22132891)
chr8 (114-238)||(30312870-30312994)
chr8 (140-253)||(12274441-12274554)
chr8 (121-253)||(21251857-21251992)
chr8 (114-238)||(22040790-22040914)
chr8 (114-253)||(19978883-19979022)
chr8 (93-179)||(25283346-25283432)
chr8 (114-238)||(32601075-32601199)
chr8 (114-253)||(21166264-21166403)
chr8 (93-179)||(25283120-25283206)
chr8 (114-238)||(15534311-15534438)
chr8 (114-253)||(16407771-16407911)
chr8 (103-161)||(22623579-22623637)
chr8 (114-179)||(22316181-22316246)
chr8 (93-165)||(23156717-23156789)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (81-445)||(45206-45570)
scaffold0114 (198-445)||(44194-44441)
scaffold0114 (81-290)||(20744-20953)
scaffold0114 (119-253)||(19632-19766)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (81-445)||(260997-261361)
scaffold0005 (114-253)||(278116-278255)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (79-442)||(19651840-19652203)
chr2 (79-442)||(1064043-1064406)
chr2 (79-442)||(20828551-20828914)
chr2 (79-442)||(20833277-20833640)
chr2 (79-442)||(31830950-31831313)
chr2 (81-442)||(24948881-24949242)
chr2 (79-439)||(11357662-11358022)
chr2 (81-442)||(23277068-23277429)
chr2 (97-445)||(27788030-27788378)
chr2 (97-445)||(12574642-12574990)
chr2 (76-354)||(23294315-23294593)
chr2 (93-442)||(27364881-27365230)
chr2 (186-442)||(24642034-24642290)
chr2 (81-442)||(27209962-27210323)
chr2 (135-442)||(21125003-21125310)
chr2 (97-368)||(45529877-45530148)
chr2 (79-368)||(23111101-23111391)
chr2 (97-276)||(30210723-30210901)
chr2 (114-353)||(24710415-24710654)
chr2 (114-253)||(27371750-27371889)
chr2 (99-353)||(24876557-24876811)
chr2 (114-353)||(21144864-21145103)
chr2 (114-353)||(22324679-22324918)
chr2 (114-253)||(24262851-24262990)
chr2 (114-253)||(41608208-41608347)
chr2 (99-253)||(10869331-10869485)
chr2 (114-253)||(9610617-9610756)
chr2 (114-253)||(16925841-16925980)
chr2 (114-253)||(16999481-16999620)
chr2 (114-253)||(16923370-16923509)
chr2 (114-253)||(16982633-16982772)
chr2 (114-253)||(17064198-17064337)
chr2 (114-253)||(17067856-17067995)
chr2 (114-253)||(27218497-27218636)
chr2 (114-251)||(21890541-21890678)
chr2 (100-334)||(24819495-24819729)
chr2 (114-244)||(44385392-44385522)
chr2 (114-253)||(23066872-23067011)
chr2 (114-251)||(24707305-24707442)
chr2 (114-352)||(21325089-21325327)
chr2 (114-215)||(24676008-24676109)
chr2 (385-442)||(23294250-23294307)
chr2 (114-253)||(22756288-22756427)
chr2 (114-253)||(23107553-23107692)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (79-441)||(249306-249668)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (81-442)||(16337990-16338351)
chr3 (79-439)||(10384261-10384621)
chr3 (79-442)||(18133822-18134185)
chr3 (79-439)||(28754611-28754971)
chr3 (95-442)||(11303265-11303612)
chr3 (81-442)||(16827681-16828041)
chr3 (79-442)||(16329136-16329500)
chr3 (79-442)||(14574219-14574576)
chr3 (87-445)||(16835994-16836352)
chr3 (79-442)||(47124234-47124597)
chr3 (81-442)||(12360020-12360381)
chr3 (97-445)||(8758576-8758924)
chr3 (97-445)||(41177809-41178157)
chr3 (79-442)||(17492920-17493283)
chr3 (81-359)||(11960647-11960925)
chr3 (97-445)||(4678725-4679073)
chr3 (97-445)||(13942311-13942659)
chr3 (81-445)||(16380406-16380770)
chr3 (97-445)||(44777534-44777882)
chr3 (93-442)||(13971610-13971959)
chr3 (93-442)||(14086963-14087312)
chr3 (81-310)||(31694664-31694893)
chr3 (81-302)||(31939333-31939554)
chr3 (81-442)||(10419523-10419884)
chr3 (79-442)||(15227939-15228302)
chr3 (263-442)||(13322312-13322491)
chr3 (81-223)||(13319980-13320122)
chr3 (82-334)||(15248535-15248787)
chr3 (82-379)||(15015246-15015543)
chr3 (114-253)||(15347767-15347906)
chr3 (114-353)||(15724456-15724695)
chr3 (114-353)||(20061576-20061815)
chr3 (114-353)||(26791921-26792160)
chr3 (304-442)||(15952669-15952807)
chr3 (114-253)||(10006069-10006208)
chr3 (114-253)||(10906679-10906818)
chr3 (114-353)||(15588914-15589153)
chr3 (114-334)||(15209279-15209499)
chr3 (114-253)||(5424452-5424591)
chr3 (114-253)||(13253159-13253298)
chr3 (114-253)||(15339738-15339877)
chr3 (114-253)||(16636242-16636381)
chr3 (114-253)||(17490319-17490458)
chr3 (114-253)||(43163566-43163705)
chr3 (114-253)||(16411804-16411943)
chr3 (114-253)||(16491703-16491842)
chr3 (114-353)||(6601105-6601344)
chr3 (114-253)||(48425916-48426055)
chr3 (114-353)||(53384540-53384779)
chr3 (114-237)||(14876020-14876143)
chr3 (114-224)||(15402039-15402149)
chr3 (114-334)||(9523107-9523327)
chr3 (114-238)||(16806448-16806572)
chr3 (114-353)||(16756107-16756346)
chr3 (114-238)||(16692648-16692772)
chr3 (114-253)||(16371882-16372020)
chr3 (114-368)||(12498602-12498856)
chr3 (99-253)||(15062213-15062367)
chr3 (81-142)||(13300000-13300061)
chr3 (81-142)||(13310658-13310719)
chr3 (105-180)||(14580455-14580530)
chr3 (114-238)||(14126116-14126240)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (79-442)||(41609-41972)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (79-442)||(56151-56514)
scaffold0076 (93-442)||(32942-33291)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (81-443)||(5589-5950)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (80-442)||(24098924-24099286)
chr1 (79-442)||(31539317-31539680)
chr1 (81-442)||(20295088-20295449)
chr1 (87-442)||(20939391-20939746)
chr1 (102-442)||(20835231-20835571)
chr1 (79-439)||(37677759-37678119)
chr1 (79-442)||(19662457-19662824)
chr1 (79-442)||(19854989-19855344)
chr1 (81-442)||(20856082-20856444)
chr1 (81-349)||(21951678-21951946)
chr1 (243-445)||(22432600-22432802)
chr1 (114-353)||(21837715-21837954)
chr1 (99-352)||(50619584-50619837)
chr1 (114-353)||(21831068-21831307)
chr1 (114-253)||(33390384-33390523)
chr1 (114-253)||(41353017-41353156)
chr1 (114-368)||(20139580-20139834)
chr1 (114-253)||(16349954-16350093)
chr1 (99-253)||(19107233-19107387)
chr1 (114-253)||(51332848-51332987)
chr1 (114-253)||(16373394-16373533)
chr1 (114-253)||(21749806-21749945)
chr1 (99-237)||(19760213-19760351)
chr1 (114-256)||(22109884-22110026)
chr1 (114-256)||(22113733-22113875)
chr1 (119-253)||(22361604-22361738)
chr1 (114-253)||(20250667-20250805)
chr1 (114-238)||(16078011-16078135)
chr1 (114-215)||(21025076-21025177)
chr1 (114-238)||(17044370-17044494)
chr1 (385-442)||(16369973-16370030)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (81-442)||(26953-27314)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (81-442)||(323396-323757)
scaffold0004 (87-442)||(202727-203082)
scaffold0004 (243-442)||(118260-118459)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (81-440)||(81085-81444)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (79-442)||(41584-41947)
scaffold0010 (81-442)||(46652-47013)
scaffold0010 (114-334)||(2721-2934)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (96-442)||(40430-40776)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (81-445)||(57100-57464)
scaffold0053 (79-442)||(48285-48648)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (81-432)||(20096-20447)
scaffold0104 (81-432)||(22916-23267)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (79-442)||(19812-20175)
scaffold0058 (135-179)||(75513-75557)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (79-433)||(15964-16318)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (93-442)||(2280-2629)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (81-445)||(51433-51797)
scaffold0067 (81-445)||(60467-60831)
scaffold0067 (81-445)||(66855-67219)
scaffold0067 (81-145)||(26389-26453)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (81-439)||(194957-195315)
scaffold0011 (81-441)||(149263-149623)
scaffold0011 (114-358)||(25819-26063)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (81-442)||(6491-6852)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (81-442)||(13552-13913)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (81-445)||(5902-6266)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (81-442)||(556-917)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (81-442)||(3443-3804)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (81-439)||(5445-5803)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (81-442)||(25118-25479)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (81-441)||(7753-8113)
scaffold0222 (81-442)||(2608-2969)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (79-442)||(100800-101166)
scaffold0020 (114-238)||(181095-181219)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (81-440)||(22629-22988)
scaffold0261 (81-440)||(14450-14809)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (79-442)||(27917-28280)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (81-439)||(20678-21036)
scaffold0298 (82-336)||(11311-11565)
scaffold0298 (82-336)||(15081-15335)
scaffold0298 (340-442)||(12873-12975)
scaffold0298 (340-442)||(16643-16745)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (81-442)||(51116-51477)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (81-445)||(12039-12402)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (79-442)||(3483-3846)
scaffold0403 (114-334)||(7172-7392)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (79-441)||(27217-27579)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (81-442)||(10710-11071)
scaffold0235 (81-442)||(20924-21285)
scaffold0235 (114-179)||(26761-26826)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (81-445)||(48459-48824)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (81-442)||(32102-32464)
scaffold0106 (171-253)||(14920-15002)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (93-442)||(113251-113600)
scaffold0029 (84-442)||(95258-95616)
scaffold0029 (114-253)||(109097-109236)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (81-441)||(10486-10846)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (82-442)||(19541-19901)
scaffold0090 (82-442)||(23703-24063)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (79-442)||(1223-1586)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (79-442)||(5122-5485)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (81-442)||(575-936)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (93-442)||(49779-50128)
scaffold0028 (99-253)||(9355-9509)
scaffold0028 (99-253)||(15817-15971)
scaffold0028 (99-253)||(44035-44189)
scaffold0028 (99-178)||(887-966)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (79-445)||(400-766)
scaffold0139 (81-178)||(28173-28270)
scaffold0139 (81-178)||(34426-34523)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (79-441)||(28750-29112)
scaffold0026 (114-253)||(29826-29965)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (102-442)||(6510-6851)
scaffold0149 (102-442)||(10941-11282)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (114-442)||(6322-6650)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (134-442)||(17843-18151)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (79-376)||(313-609)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (81-442)||(561-922)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (81-337)||(7398-7654)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (81-439)||(486-845)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (79-368)||(24323-24611)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (195-442)||(891-1138)
scaffold0120 (79-164)||(802-887)
scaffold0120 (114-253)||(12939-13078)
scaffold0120 (114-235)||(6922-7040)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (120-442)||(6876-7198)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (93-336)||(12996-13241)
scaffold0124 (340-442)||(11580-11682)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (81-322)||(20694-20935)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (79-359)||(10059-10339)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (79-438)||(18055-18404)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (163-441)||(47817-48095)
scaffold0108 (79-143)||(48095-48159)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (212-445)||(11458-11691)
scaffold0518 (81-177)||(11690-11786)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (81-442)||(40012-40373)
scaffold0064 (153-442)||(28093-28382)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (99-286)||(3024-3211)
scaffold0751 (213-442)||(2486-2715)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (87-292)||(945-1150)
scaffold0232 (287-437)||(2336-2486)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (115-442)||(25006-25333)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (93-298)||(34024-34229)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (80-239)||(2582-2741)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (87-328)||(4582-4823)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (265-442)||(114877-115054)
scaffold0001 (81-191)||(89698-89808)
scaffold0001 (81-191)||(90376-90486)
scaffold0001 (117-253)||(390489-390625)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (99-442)||(1600-1943)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (99-358)||(15653-15912)
scaffold0040 (114-253)||(112774-112913)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (99-368)||(4863-5131)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (114-334)||(4671-4891)
scaffold0270 (114-334)||(11801-12021)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (82-334)||(17231-17483)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (82-348)||(14333-14599)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (114-331)||(218703-218920)
scaffold0012 (82-253)||(229924-230095)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (82-334)||(116159-116411)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (309-442)||(49464-49597)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (114-358)||(17457-17701)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (93-333)||(85784-86023)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (84-358)||(3916-4190)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (82-368)||(59521-59807)
scaffold0023 (114-375)||(3743-4004)
scaffold0023 (119-238)||(131003-131122)
scaffold0023 (114-158)||(28658-28702)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (114-359)||(9745-9990)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (82-334)||(4831-5083)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (114-253)||(7617-7756)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (114-353)||(7720-7959)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (99-253)||(8247-8401)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (114-238)||(19288-19412)
scaffold0324 (114-193)||(14497-14576)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (114-238)||(22763-22887)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (114-253)||(6895-7034)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (99-253)||(1338-1492)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (79-181)||(2736-2838)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (82-442)||(7145-7505)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (114-334)||(6849-7069)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (114-253)||(1557-1696)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (114-253)||(16536-16675)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (114-253)||(577-716)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (114-253)||(39106-39245)
scaffold0042 (114-256)||(66283-66425)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (114-244)||(1304-1434)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (100-334)||(11469-11703)
scaffold0018 (100-334)||(17661-17895)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (114-238)||(2161-2285)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (114-442)||(32039-32367)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (114-238)||(19353-19477)
scaffold0017 (114-253)||(56898-57037)
scaffold0017 (114-238)||(196764-196888)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (114-253)||(2348-2487)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (114-253)||(50313-50452)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (114-235)||(3273-3394)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (116-237)||(26232-26353)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (114-215)||(32859-32960)
scaffold0109 (114-238)||(9492-9616)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (114-238)||(3691-3815)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (114-346)||(1681-1913)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (114-238)||(13364-13488)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (118-334)||(8377-8593)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (114-253)||(25855-25994)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (99-253)||(6102-6256)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (114-215)||(220-321)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (114-181)||(18501-18568)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (99-166)||(10287-10354)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (114-253)||(8278-8417)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (114-253)||(102114-102253)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (204-334)||(12294-12424)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (135-253)||(1-119)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (114-215)||(4639-4740)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (114-215)||(79780-79881)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (114-238)||(3090-3214)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (114-238)||(8686-8810)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (114-238)||(3100-3224)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (144-334)||(15739-15922)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (81-132)||(3-54)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (114-193)||(109-188)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (114-215)||(63317-63418)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (114-238)||(24394-24518)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (81-132)||(2107-2158)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (113-179)||(8220-8286)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (93-179)||(32678-32764)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33223945 - 33223584
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33223945 ttgaagaagttgattctagaagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 33223846  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  33223845 ccagtttgaaacgagatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 33223746  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33223745 ggatgtaccggaatggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttggattgttgtcgac 33223646  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33223645 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggc 33223584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20892004 - 20891643
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20892004 ttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggt 20891905  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20891904 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgtt 20891805  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  20891804 ggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgac 20891705  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20891704 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggc 20891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 3264042 - 3264405
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264042 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 3264141  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  3264142 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 3264241  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  3264242 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 3264341  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3264342 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 3264405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 11206481 - 11206839
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206481 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 11206580  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  11206581 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 11206680  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  11206681 ggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgac 11206780  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11206781 cgattgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagtt 11206839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27901408 - 27901047
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27901408 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 27901309  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  27901308 ctggtttgaagagggatgtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgtt 27901209  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  27901208 ggatgtaccggagtggaaatgggacagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtagac 27901109  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27901108 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 27901047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 44661114 - 44661474
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661114 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 44661213  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||  | ||||| ||||| |  ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  44661214 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagttcttttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggctgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccg 44661313  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  44661314 ttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 44661413  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44661414 accggttgacaaagtcggcacacttcattcctatcaatatcaattatccggtagcgcagtt 44661474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15246948 - 15246585
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15246948 agttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 15246849  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| |   ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15246848 gtctgagctgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 15246749  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  15246748 ttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 15246649  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  15246648 acaggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatattagttatccaatagctcagttggc 15246585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 29452787 - 29453145
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29452787 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggt 29452886  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||   |||||||||||| || || || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  29452887 ctggtttgaaaagagatgttgctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggtggagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 29452986  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  29452987 agatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgac 29453086  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  29453087 cggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaacatcagttatccggtagcgcagtt 29453145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 442
Target Start/End: Original strand, 15002630 - 15002975
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||    
T  15002630 tagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtga 15002729  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  15002730 tgttgctcattttgtctatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttagatgtgccagagcgg 15002829  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    |||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||    
T  15002830 aagtgggagatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcgg 15002929  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  15002930 cacactttattccgatcaatgttagttatccggtagctcggttggc 15002975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 445
Target Start/End: Original strand, 1648525 - 1648891
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1648525 agttgaaaaggttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtg 1648624  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| ||||||||  | || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  1648625 gtctggtttgaagagggatgtcgcacagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccg 1648724  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| || | || ||| |||| || |    
T  1648725 ttggatatactggagtggaaatgggacagcatttctatggattttgtaacgagtttacctaatactccgagagggcataattctatatgggttgtggtcg 1648824  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |   | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1648825 ataggttgactaagtcggcacatttcattcctattaatattagttattcggtagctcagttggctga 1648891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15320174 - 15319812
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  15320174 agttgaaaaagttgattttaaaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtg 15320075  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15320074 gtccggtttgaaacgtgatgttgcatagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaa-atcagaagcctgcagggttgttgacaccg 15319976  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| |  |||||||||||| |||  || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15319975 ttagatgtgcgagagtggaagtgggacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgttg 15319876  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | ||||||| ||||  || || || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15319875 ataggttgacgaactcggggcattttatcccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 15319812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 79 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15078659 - 15078297
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15078659 agttgaaaaagttgattctggaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtg 15078560  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    || ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||     
T  15078559 gttcggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttaatgacacca 15078460  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15078459 ttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgttg 15078360  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    |   | ||| ||||||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  15078359 aaaggttgatgaagtcggcgcattttattccgatcaatattagttttccggtagcttagttgg 15078297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8706942 - 8706579
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
T  8706942 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtaacttaagtattcatccgagagctacaaagatgtatcatgacttaaagaaattgttttggtg 8706843  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  8706842 gtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccg 8706743  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||| ||  | || || || |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  8706742 ttagatgtgccggagtggaaatgagatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggtggttgttg 8706643  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  8706642 atagattgacgaagtcggcgcactttattccaatcaatattagttttccggtggctcagttggc 8706579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 364
Target Start/End: Original strand, 15414274 - 15414559
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15414274 agttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 15414373  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||     
T  15414374 gtccggttttaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgctgaaacca 15414473  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccat 364  Q
    || ||||| || |||||||| ||| | || || || ||||| || || || |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||    
T  15414474 ttagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttactgaatacttcgagagggcatgatgccat 15414559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 15358537 - 15358701
Alignment:
Q  278 gttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtg 377  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  15358537 gttggatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttctgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtc 15358636  T
Q  378 gaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358637 gacaggttgacgaagtcggcacacttcattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggc 15358701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 241
Target Start/End: Original strand, 15358370 - 15358530
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358370 ttgaaaaagttgattttagagtaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggt 15358469  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaa 241  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15358470 ctggtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 15358530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 298
Target Start/End: Original strand, 14850389 - 14850573
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  14850389 agtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 14850488  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14850489 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaa 14850573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 14303001 - 14303240
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14303001 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 14303100  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  14303101 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 14303200  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14303201 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 14303240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 19777816 - 19777955
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19777816 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 19777915  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  19777916 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 19777955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23956736 - 23956597
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  23956736 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 23956637  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  23956636 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 23956597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27712325 - 27712086
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27712325 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27712226  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||   || || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  27712225 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctactaggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 27712126  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  27712125 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27712086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14160460 - 14160320
Alignment:
Q  113 gagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtg 212  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||    
T  14160460 gagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtg 14160361  T
Q  213 tatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  14160360 tattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 14160320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16148712 - 16148580
Alignment:
Q  102 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttg 201  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  16148712 gaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtcg 16148613  T
Q  202 ctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcaga 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16148612 ctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 16148580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16152858 - 16152726
Alignment:
Q  102 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttg 201  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  16152858 gaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtcg 16152759  T
Q  202 ctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcaga 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16152758 ctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 16152726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 8052646 - 8052785
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8052646 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 8052745  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  8052746 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 8052785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8387401 - 8387262
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8387401 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 8387302  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  8387301 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 8387262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12477589 - 12477450
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  12477589 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 12477490  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  12477489 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 12477450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 29038427 - 29038566
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  29038427 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 29038526  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  29038527 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 29038566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40474029 - 40473790
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40474029 agtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 40473930  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  40473929 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 40473830  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  40473829 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 40473790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14681571 - 14681417
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||| | |||||||||||||| |    
T  14681571 gaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatg 14681472  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  14681471 tggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 14681417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18298194 - 18298055
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18298194 agtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 18298095  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  ||||| |||||| ||||| || |||||    
T  18298094 attcctgtttagtttgtcggaagtcgaaagtcgagcatca 18298055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 18226469 - 18226593
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18226469 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacaatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 18226568  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  18226569 attcctgtttagtttgtcagaagtc 18226593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12524680 - 12524526
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  12524680 gaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 12524581  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || | |||||||||| | |||||   |||||||||||| |||||||| |||||    
T  12524580 tggcacggtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 12524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 16354468 - 16354607
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||   | || |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||    
T  16354468 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16354567  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | | ||||  |||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  16354568 attcctatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatca 16354607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 1639448 - 1639668
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || |||||  | |||||||    
T  1639448 agtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcatattttgtgt 1639547  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | |||||   |||||| ||||| ||||| || ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||| |||| |||||||||||| | || || ||    
T  1639548 attcttgtttggtttgtcaaaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatataccagagtggaagtgggatagcatatc 1639647  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  1639648 catggattttgtgacgagttt 1639668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14691801 - 14691671
Alignment:
Q  204 cagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgga 303  Q
    ||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  14691801 cagttggtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagtggaaatggg 14691702  T
Q  304 acagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||    
T  14691701 atagcatatccatggattttgtgacgagttt 14691671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 15146908 - 15147047
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||| ||| || |||||| | || || || ||||||||||    
T  15146908 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtcgtctggattgaaatgcgatgtggcacagtttgtgt 15147007  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | | |||   |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15147008 attcctatttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 15147047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7091421 - 7091282
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| | ||||   ||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  7091421 agtaacttaagtatttatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaatttgtgt 7091322  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | || |||||| || || ||||| |||||    
T  7091321 attcttgtttgatttatcagaaatcgaaggttgagcatca 7091282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14695102 - 14695051
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaaga 165  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  14695102 agtagcttgagtactcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaga 14695051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 10468244 - 10468605
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10468244 ttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 10468343  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10468344 ccggtttgaagcatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 10468443  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  10468444 ggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatagatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgaagcaatttgggttgttgtcgac 10468543  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10468544 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggc 10468605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 5296601 - 5296965
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296601 ttgaaaaagttgattttagaagaaagttacaagagtagcttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 5296700  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  5296701 ccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttatcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 5296800  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||     
T  5296801 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgactagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgat 5296900  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5296901 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaacatcaattatcgggtagctcagttggctga 5296965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 79 - 441
Target Start/End: Original strand, 14380860 - 14381222
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380860 agttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 14380959  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||    
T  14380960 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggattgttgacaccg 14381059  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |    
T  14381060 ttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcg 14381159  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  14381160 acaggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatattagttacctggtagctcagttgg 14381222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21472489 - 21472126
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21472489 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtg 21472390  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21472389 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 21472290  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  21472289 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctccatgaattttgcgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 21472190  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||| || || || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21472189 acaggttgacgaagtcggcgcattttatcccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 21472126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24365300 - 24364940
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24365300 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtg 24365201  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24365200 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 24365101  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  24365100 ttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatatctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 24365001  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  24365000 accggttgacaaagtcggcacacttcattcctatcaatatcaattatccggcagcgcagtt 24364940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 8762328 - 8762689
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8762328 ttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggt 8762427  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8762428 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 8762527  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  8762528 ggatgtgccggagtggaagtgggacgacatttatatggattttgtgacgagtttaccgaacactcagagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgac 8762627  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8762628 aggttgacgaagtcggcgcactttattctgattgatatcaattatccggtagctcagttggc 8762689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19454308 - 19453945
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19454308 agttgaaaaaattgattttcgaggaaagtcacaagagtaacttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtg 19454209  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  19454208 gtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggttgttgacaccg 19454109  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  19454108 ttggatgtgccggagtggaattgggatatcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggttg 19454009  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454008 acaggttgacaaagtcagcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 19453945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Original strand, 28282224 - 28282572
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28282224 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 28282323  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28282324 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 28282423  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  28282424 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 28282523  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28282524 cacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 28282572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25769079 - 25768716
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25769079 agttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgattttaagaaattgttttggtg 25768980  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  25768979 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacacca 25768880  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||| || |||||| |||||||| |||| || |    
T  25768879 ttagatgtgccagagtggaagtgggacagtatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatacttcgaggggacatgatgccatttgggttgtcgtcg 25768780  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | ||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25768779 atacgttgacgaagtcggcgcattttatttcgatcaatattagttttccagtagctcagttggc 25768716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 79 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19435890 - 19435653
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19435890 agttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 19435791  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  19435790 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttatgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 19435691  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19435690 ttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctat 19435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 430
Target Start/End: Original strand, 34644993 - 34645330
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||   |||||||| |    
T  34644993 attttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtaccacgacttgaaaaagctgttttggtgggttggtttgaagc 34645092  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34645093 gtgatgttgctcagtttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 34645192  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  34645193 gtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtagtcgatagattgacgaag 34645292  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggt 430  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  34645293 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggt 34645330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18795578 - 18795215
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  18795578 agttgaaaaagttgatcttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtg 18795479  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||  ||||||||||| |||     
T  18795478 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgccagaagtctaaggtcgagcatcagaagcctgcagggttgttgatacca 18795379  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||| | || ||| |||| || |    
T  18795378 ttagatgttccagagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacaattttaccaaacactccgaggggacatgattctatatgggttgtggtcg 18795279  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18795278 ataggttgacgaagtcagcgcactttattccgataaatatcagttttccggtagctcagttggc 18795215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 21563525 - 21563888
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21563525 agttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtg 21563624  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||| ||    
T  21563625 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcg 21563724  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||| || |    
T  21563725 ttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcg 21563824  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21563825 ataggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagttatcaggtagctcagttggc 21563888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 21569384 - 21569747
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21569384 agttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtg 21569483  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||| ||    
T  21569484 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcg 21569583  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||| || |    
T  21569584 ttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcg 21569683  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21569684 ataggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagttatctggtagctcagttggc 21569747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19879823
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |    
T  19880172 attttggaagaaagccacaagagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagc 19880073  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19880072 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcctgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccaga 19879973  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  19879972 gtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgaggggatatgattcaatatgggttgtggtcgatagattgacgaag 19879873  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||| | || ||||||||    
T  19879872 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccgatggcgcagttggc 19879823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15460222 - 15459861
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  15460222 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggt 15460123  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||    || || || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15460122 ctggattgaagaaggatgtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgtt 15460023  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||| ||||||| |||    
T  15460022 ggatataccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgac 15459923  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  15459922 aggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatataagttatccagtagctcagctggc 15459861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 175 - 445
Target Start/End: Original strand, 27560106 - 27560376
Alignment:
Q  175 ggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgac 274  Q
    ||||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  27560106 ggtggtctgggttgaagagagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaggattgttgac 27560205  T
Q  275 accgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgtt 374  Q
     || |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | ||     
T  27560206 gccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtggtg 27560305  T
Q  375 gtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    || ||   | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560306 gttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctga 27560376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 442
Target Start/End: Original strand, 22796132 - 22796388
Alignment:
Q  186 ttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatg 285  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22796132 ttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatg 22796231  T
Q  286 taccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggt 385  Q
    | ||  |||||||||||||||  || |  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   | |    
T  22796232 tgccaaagtggaagtggaacaacatatacatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggtt 22796331  T
Q  386 gacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22796332 gacaaagtcgacacactttattccgatcattattagttatccggtagctcagttggc 22796388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Original strand, 19488665 - 19488884
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19488665 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 19488764  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||   ||||||||||||||     
T  19488765 gtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgatcattagaagcctgctgggttgttgacacca 19488864  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  19488865 ttagatgtgccggagtggaa 19488884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 271 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17416182 - 17416011
Alignment:
Q  271 tgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggat 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  17416182 tgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagaggacatgatgccatttgggt 17416083  T
Q  371 tgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     || || |||  | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17416082 agtagtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggc 17416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22434722 - 22434478
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||    
T  22434722 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 22434623  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||  || ||  | |||| || ||  | |||||||| ||| | ||||| ||    
T  22434622 attcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtatcgttagacgtggcagagtggaaatgggatagtatatc 22434523  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||    
T  22434522 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 22434478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22443120 - 22442876
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||    
T  22443120 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 22443021  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||  || ||  | |||| || ||  | |||||||| ||| | ||||| ||    
T  22443020 attcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtatcgttagacgtggcagagtggaaatgggatagtatatc 22442921  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||    
T  22442920 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 22442876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 2874231 - 2874370
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  2874231 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 2874330  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  2874331 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 2874370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 16626145 - 16626284
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16626145 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16626244  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  16626245 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 16626284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 24312596 - 24312835
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24312596 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 24312695  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  24312696 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 24312795  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24312796 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 24312835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25113405 - 25113166
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  25113405 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 25113306  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| || |||   ||  || ||  ||| || |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||    
T  25113305 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtaccagaatggaaatgggatagtatatc 25113206  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  25113205 gatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 25113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27188289 - 27188150
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27188289 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgt 27188190  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27188189 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 27188150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 27260951 - 27261090
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27260951 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgt 27261050  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27261051 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 27261090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 29591348 - 29591487
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  29591348 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 29591447  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  29591448 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 29591487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15896961 - 15896619
Alignment:
Q  100 aagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgt 199  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  15896961 aagagagtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgt 15896862  T
Q  200 tgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaag 299  Q
     || |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||| ||  | |  | ||||||||  |||||||     
T  15896861 ggcacagtttgtatattcatgtctaatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgatggtatctatagatgtaccaaagtggaaa 15896762  T
Q  300 tggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcac 399  Q
    ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||| |||| |||     |||||| |  |||| ||   | ||||||||||||| |    
T  15896761 tgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgaaagggaatggcgttatttgggtgattgttgataggttgacgaagtcggctc 15896662  T
Q  400 acttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | |||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15896661 atttcattccgattaatatcagttttcctgtatctcagttggc 15896619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 397
Target Start/End: Original strand, 5838647 - 5838930
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5838647 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtttggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 5838746  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || || || ||||| || |||   ||  || ||  | |||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  5838747 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccggaatggaaatgggatagtatatc 5838846  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggc 397  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||  | |||||| || |||| |||  | |||||||||||||    
T  5838847 catggattttgtgactagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggc 5838930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 20636729 - 20636868
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20636729 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgt 20636828  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  20636829 attcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatca 20636868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 25609289 - 25609428
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | || ||||| | ||||||||    
T  25609289 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgtgatgttgcaccgtttgtgt 25609388  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25609389 attcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatca 25609428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 28262625 - 28262864
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  28262625 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtttgtgt 28262724  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| || || || ||||| || ||    ||| || ||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  28262725 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatc 28262824  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  28262825 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 28262864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 28341374 - 28341613
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  28341374 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtttgtgt 28341473  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| || || || ||||| || ||    ||| || ||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  28341474 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatc 28341573  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  28341574 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 28341613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 1542497 - 1542651
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  1542497 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 1542596  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | ||  ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  1542597 tggcatagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 1542651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 27566393 - 27566547
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || |||||||| || |    
T  27566393 gaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatg 27566492  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || || ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  27566493 tggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 27566547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 334
Target Start/End: Original strand, 18197121 - 18197376
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  18197121 tgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttggtggtc 18197220  T
Q  182 cgg---tttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
     ||    |||||||| || || || |||||||||||| | ||||| | ||   ||||||| || ||||| ||||| || |||  ||||||| |||||||     
T  18197221 gggattattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgattttctagaagtcaaaggttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacct 18197320  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    || ||| |||| |||||||| ||| | || || |  |||||||| |||||||||||    
T  18197321 ttagatataccagagtggaaatgggatagcatatgcatggattttgtgacgagttt 18197376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 298
Target Start/End: Original strand, 18966705 - 18966904
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  | |||||  | || |    
T  18966705 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttgctggtctaggttgaatagtgatg 18966804  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    |  | || ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||| || |||   |||||| ||||||| || ||||| || ||||||||    
T  18966805 tgccacaatttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaaggtgagcatcataaacctggtgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaa 18966904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18436477 - 18436319
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc----cggtttgaaacga 194  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||     || |||||  ||    
T  18436477 gaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtctgggtgggttgaagtga 18436378  T
Q  195 gacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || || || || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18436377 gatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgttagaagtctaaagttgaacatca 18436319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23079322 - 23079102
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || ||  | |||||||    
T  23079322 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtagcataatttgtgt 23079223  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||| || ||  | | || |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||    
T  23079222 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgttgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgagatagtatatc 23079123  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  23079122 catggattttgtgacgagttt 23079102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19865555 - 19865296
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||  | || |||||||| || |||||||| || |    
T  19865555 gaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcattatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatg 19865456  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    | || |||||||||||| | |||||   |||||||||||| ||  |||||||||| || |||   ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||    
T  19865455 tggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaa 19865356  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||    
T  19865355 atgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 19865296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 22078118 - 22078257
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  22078118 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaaattattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 22078217  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  22078218 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 22078257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 22761883 - 22762022
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||    
T  22761883 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttatgt 22761982  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | || ||||||||| || ||||| |||||    
T  22761983 attcttgtttgatttttcagaagtcgaaggttgagcatca 22762022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 149
Target Start/End: Original strand, 14379310 - 14379380
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatg 149  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14379310 agttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagctacaaagatg 14379380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 18407370 - 18407509
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||| |||    
T  18407370 agtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttgctagtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttttgt 18407469  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  18407470 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 18407509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 353
Target Start/End: Original strand, 28291823 - 28292039
Alignment:
Q  137 agctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaag 236  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  28291823 agctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaag 28291922  T
Q  237 tctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttac 336  Q
    || || || || ||||| || ||    ||| || ||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  28291923 tcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgc 28292022  T
Q  337 caaacactccgagaggg 353  Q
    | || ||||||||||||    
T  28292023 cgaatactccgagaggg 28292039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 16962873 - 16962997
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| | |||||  | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||    
T  16962873 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaatatattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggcacagtttgtgt 16962972  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    |  | ||||| | ||||||||||||    
T  16962973 actcttgtttgatttgtcagaagtc 16962997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331000
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||| || ||||||||  | || || || |||||||    
T  27330861 agtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgt 27330960  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  27330961 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 27331000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 27391601 - 27391740
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||| || ||||||||  | || || || |||||||    
T  27391601 agtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgt 27391700  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  27391701 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 27391740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16098904 - 16098833
Alignment:
Q  113 gagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgg 184  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16098904 gagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtggcccgg 16098833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Original strand, 16927053 - 16927168
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | |||||    ||||||||||| || ||||| || || |    
T  16927053 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagagattttggtggtctggattgaagcgcgatg 16927152  T
Q  199 ttgctcagtttgtgta 214  Q
    | || |||||||||||    
T  16927153 tggcacagtttgtgta 16927168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Original strand, 32572 - 32932
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32572 ttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggt 32671  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  32672 ccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 32771  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||    
T  32772 ggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgctatcgac 32871  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  32872 cggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatgtcagttacccggtagcacagttgg 32932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12456716 - 12456354
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12456716 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 12456617  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  12456616 gtccagtttgaaacgtgacgtagctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccg 12456517  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  12456516 ttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 12456417  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12456416 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttgg 12456354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13022369 - 13022008
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13022369 ttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 13022270  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||| ||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  13022269 ccgttttgaagtgtgatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaatgttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 13022170  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  13022169 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagttaaccaaacactccgagggggcatgatgccatttgggttgttgtcgac 13022070  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13022069 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttggc 13022008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12457652 - 12457300
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12457652 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 12457553  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  12457552 ccgatttgaagtgagatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 12457453  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||    
T  12457452 ggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtttacggaacactccgagagggcatgatgctatttaggttgttgtagac 12457353  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagc 433  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12457352 cggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagc 12457300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 15341443 - 15341079
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15341443 ttgaaaaagttaattttagaagaaattcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggt 15341344  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15341343 ccggtttgaaacgtgacgtagctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 15341244  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     
T  15341243 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttatgacgagtttaccaaacaccccgagaggacatgattctatatgggttgtagtcgat 15341144  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15341143 aggttgacaaagttggcacactttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 15341079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 16949707 - 16950069
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16949707 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccacgatttga-gaaactgttttggtg 16949805  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  16949806 gtccggtttcaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttaacaccg 16949905  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |    
T  16949906 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccgagcactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcg 16950005  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16950006 acaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggc 16950069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 642 - 1005
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  642 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 741  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  742 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcg 841  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |    
T  842 ttagatgtgccggagtggaagtgggacaatatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtcattgtcg 941  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  942 acaggttgacgaagtcagcacatttcattccgatcaatatcagttatctggtagcacagttggc 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 105 - 439
Target Start/End: Original strand, 13967929 - 13968263
Alignment:
Q  105 agtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctc 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13967929 agtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctc 13968028  T
Q  205 agtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaa 304  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13968029 agtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactggaagtggga 13968128  T
Q  305 cagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttc 404  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||     
T  13968129 cagtatctctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttt 13968228  T
Q  405 attcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  13968229 attcctattaatataagttatccggtagcgcagtt 13968263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 14285611 - 14285971
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285611 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 14285710  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  14285711 gtccggtttgaaacgtgacgttgctcattttgtatacgcatacttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 14285810  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || |    
T  14285811 ttggatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattttgtaacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcg 14285910  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||  | ||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  14285911 acaggttgacgaagtcgacgcacttcattccgattaacatcagttatccggtagcacagtt 14285971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 15101840 - 15102201
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15101840 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 15101939  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15101940 ctgggttgaaacgtgatgtttcttagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 15102039  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  15102040 ggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagacggcatgatgccatttgggtggttgtcgac 15102139  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
        ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15102140 agattgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggc 15102201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13666549 - 13666189
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13666549 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 13666450  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  13666449 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcgaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgat 13666350  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  13666349 ggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 13666250  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
      | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13666249 aggttgacaaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 13666189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 11305498 - 11305861
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11305498 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 11305597  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11305598 gtccgatttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 11305697  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  11305698 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 11305797  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11305798 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 11305861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 79 - 433
Target Start/End: Original strand, 8211363 - 8211717
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8211363 agttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttaaagaaattgttttggtg 8211462  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  8211463 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccg 8211562  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |    
T  8211563 ttagatgtaccggagtggaagtgagacagtatctctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcg 8211662  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagc 433  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211663 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagc 8211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 14130885 - 14130521
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14130885 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 14130786  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14130785 ccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 14130686  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || ||     
T  14130685 agatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgat 14130586  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14130585 aggttgacaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctga 14130521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 14434703 - 14434339
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14434703 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 14434604  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14434603 ccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 14434504  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || ||     
T  14434503 agatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgat 14434404  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14434403 aggttgacaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctga 14434339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 49153315 - 49152955
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49153315 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 49153216  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  49153215 gtccggtttgaaaaaagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaaatccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 49153116  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  49153115 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 49153016  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  49153015 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagtt 49152955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 26117840 - 26118200
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26117840 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 26117939  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  26117940 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccg 26118039  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  26118040 ttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 26118139  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26118140 accggttgacaaagtcggcacacttcattcctatcaatatcaattatccggtagcgcagtt 26118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19148223 - 19147862
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19148223 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggt 19148124  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  19148123 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 19148024  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| || || ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||     
T  19148023 ggatgtgccagaatggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactcctagagggtatgatgccatttgggttgttgtcgat 19147924  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19147923 aggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 19147862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20747622 - 20747261
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20747622 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggt 20747523  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20747522 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 20747423  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| || || ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||     
T  20747422 ggatgtgccagaatggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggtatgatgccatttgggttgttgtcgat 20747323  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20747322 aggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 20747261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Original strand, 23505123 - 23505471
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  23505123 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 23505222  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23505223 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtgg 23505322  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  23505323 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 23505422  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23505423 cacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctga 23505471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 445
Target Start/End: Original strand, 18053191 - 18053554
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18053191 tgaaaaagttaatcttagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtc 18053290  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| |||    
T  18053291 tgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattg 18053390  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||      
T  18053391 gatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgaatttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgata 18053490  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
     | |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18053491 ggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 18053554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19613675 - 19613326
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  19613675 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagc 19613576  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19613575 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 19613476  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  19613475 gtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggttgatagattgacgaag 19613376  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  19613375 tcggcgcactttattccgataaatatcagtttttcggtggctcagttggc 19613326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 87 - 442
Target Start/End: Original strand, 16071537 - 16071892
Alignment:
Q  87 aagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtt 186  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  | |    
T  16071537 aagttgattttagaggaaagccatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatataccatgatttgaagaaattattttggtggtctaggt 16071636  T
Q  187 tgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16071637 tgaaacgtgatgttggtcagtttgtttatgcatgtttgactcgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgt 16071736  T
Q  287 accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtg 386  Q
     |  |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||   | ||    
T  16071737 gctagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaacactcaaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttg 16071836  T
Q  387 acgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16071837 acgaagtcggcacactttcttccgatcaatattagttatccggtagctcagttggc 16071892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 11387663 - 11388026
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  11387663 agttgaaaaagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtg 11387762  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  11387763 gtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacca 11387862  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||| || ||||||    
T  11387863 ttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttctacggattttatgacgagtttaccgaatactccgatagggcatgatgctatttgggtttttgtgg 11387962  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  11387963 ataggttgacgaagtcagcgcactttattccgataaatatcagttttccggtacctcagctggc 11388026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 14263481 - 14263842
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  14263481 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacagaaatagcctaagtattcatccaggaactacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggt 14263580  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  14263581 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcgtggttgttgacaccgtt 14263680  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| || |||||||||||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||     
T  14263681 agatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatgaattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatgatgccatttgcgttgttgtcgat 14263780  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14263781 aggttaacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 14263842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 12206035 - 12206398
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12206035 agttgaaaaggttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtttcatgacttgaagaaattgttttggtg 12206134  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||     
T  12206135 gtccggtttgaagcgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacacca 12206234  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || || ||||| ||| | || || || ||||| || || || ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||| |    
T  12206235 ttagatgttccagaatggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccaaatactctgagagggcatgatgtcatatggatggttgttg 12206334  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     ||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || ||||||||    
T  12206335 atagattgaagaagtcagcacactttattccaattaatattagttttccagtggcacagttggc 12206398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6414359 - 6414165
Alignment:
Q  245 tgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacact 344  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6414359 tgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatggattttgtgacgagtttacctaacact 6414260  T
Q  345 ccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6414259 ccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatatcagttatccgatagctcagtt 6414165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662612
Alignment:
Q  120 ttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21662834  T
Q  220 gtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatgga 319  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  21662833 gtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgttgggttgttgacacctttagatgttccagagtggacgtgggatagtatatccatgga 21662734  T
Q  320 tttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatc 419  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||| | |||||| |  |||||||     ||||||||||||| || || ||||| || || |||    
T  21662733 ttttgtgacgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactgacgaagtcggctcattttattccgattaacatc 21662634  T
Q  420 agttatccggtagctcagttgg 441  Q
    | || ||| ||| |||||||||    
T  21662633 aattttcctgtatctcagttgg 21662612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15625562 - 15625202
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15625562 tgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 15625463  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || |||||| |  | || || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| || |||   |||||| ||||||| ||     
T  15625462 tgggttgaaatgtaatgtggcacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtagagcatcagaaacctgctgggttgatgacaccttta 15625363  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    |  || || |||||||| ||| | | ||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||| ||||  | |||||| |  |||||||      
T  15625362 ggcgtgccagagtggaaatgggatactatatccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaaaagggaatgactctatttgggtgattgtggata 15625263  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
       ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  15625262 gattgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggc 15625202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 423
Target Start/End: Original strand, 11771533 - 11771842
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  11771533 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 11771632  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| | || |||  ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||| | || || ||    
T  11771633 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcattagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatc 11771732  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatc 413  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||| ||||  | |||||| |  |||| ||     ||||||||||||| || |||||||| ||     
T  11771733 catggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcatttcattccgata 11771832  T
Q  414 aatatcagtt 423  Q
    ||||||||||    
T  11771833 aatatcagtt 11771842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15204612 - 15204458
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| || |    
T  15204612 gaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacgtgatg 15204513  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15204512 tggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatca 15204458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8708583 - 8708344
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |    
T  8708583 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgttt 8708484  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  8708483 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 8708384  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8708383 gatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8708344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10871973 - 10871734
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||    
T  10871973 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgt 10871874  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| || |||   ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  10871873 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 10871774  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  10871773 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 10871734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13687042 - 13686903
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  13687042 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 13686943  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | || |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13686942 attcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatca 13686903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 18551050 - 18551289
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18551050 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcataatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 18551149  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  18551150 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 18551249  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18551250 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 18551289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 44790643 - 44790882
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  44790643 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgt 44790742  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| || ||    ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  44790743 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 44790842  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  44790843 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 44790882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12688494 - 12688340
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||| |  ||||||||||||| |    
T  12688494 gaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggcctagtttgaaacgagatg 12688395  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  12688394 tggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 12688340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 15153934 - 15154088
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  15153934 gaagagagtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaatttgttttggtggtctggattgaaacgtgatg 15154033  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15154034 ttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 15154088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18178735 - 18178481
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  18178735 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 18178636  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    | || || ||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||| || ||||| || ||    ||| || ||  ||| |||||| | || || |||||    
T  18178635 tggcacaatttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatctgccagaatggaa 18178536  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18178535 atgggatagtatatctatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 18178481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14040673 - 14040540
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  14040673 agtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 14040574  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttga 247  Q
    || | ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  14040573 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttga 14040540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14350703 - 14350570
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  14350703 agtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 14350604  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttga 247  Q
    || | ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  14350603 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttga 14350570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 353
Target Start/End: Original strand, 11552385 - 11552633
Alignment:
Q  105 agtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctc 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||  | || |||||| | |||||||||||||| || || |    
T  11552385 agtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattgaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcac 11552484  T
Q  205 agtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaa 304  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||| || ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| |    
T  11552485 agtttgtgtattcctgtttagtttgtcataagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatggga 11552584  T
Q  305 cagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11552585 tagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 11552633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8199606 - 8199467
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8199606 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 8199507  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  8199506 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 8199467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 11236505 - 11236644
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  11236505 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 11236604  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  ||||||||| || |||||||| |||||    
T  11236605 attcttgtttagtttgtcagaaatcgaaagttgagcatca 11236644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14333374 - 14333236
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14333374 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcttg-tggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 14333276  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  14333275 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 14333236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 253
Target Start/End: Original strand, 15160358 - 15160488
Alignment:
Q  123 agtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtt 222  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || |    
T  15160358 agtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgct 15160457  T
Q  223 taacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15160458 tagtttgtcagaagtctaaagttgagcatca 15160488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 23202905 - 23203044
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  23202905 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgt 23203004  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  ||||||||| || |||||  |||||||    
T  23203005 attcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatca 23203044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 23509032 - 23509171
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  23509032 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgt 23509131  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  ||||||||| || |||||  |||||||    
T  23509132 attcctgtttagtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatca 23509171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9597035 - 9596911
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||    
T  9597035 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttatggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 9596936  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  9596935 attcctgtttagtttgtcagaagtc 9596911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 16610 - 16732
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16610 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaa--tgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16707  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  16708 attcctgtttagtttgtcagaagtc 16732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14955547 - 14955397
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||| | |||||||||| ||| |    
T  14955547 gaagagagtcacaggagtagcttgagtattcat----gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacaagatg 14955452  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || ||||||||| || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  14955451 tggcacagtttgtgaattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 14955397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 321329 - 321468
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||| || || || | |||||| |    
T  321329 agtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtat 321428  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||   ||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||    
T  321429 atttttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatca 321468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14212652 - 14212574
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||    
T  14212652 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaac 14212574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13354128 - 13354063
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  13354128 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtgg 13354063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 81 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 377 - 30
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 278  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  277 ccggtttgaaacatgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgtt 178  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  177 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 78  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccg 428  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  77 aggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccg 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43838 - 43475
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43838 agttgaagaagttaattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtg 43739  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||  | ||||||||||||||    
T  43738 gtccggtttgaaacttgacgtagctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcatggttgttgacaccg 43639  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  43638 ttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgtcatttgggttgttgtcg 43539  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43538 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatctggtagcacagttggc 43475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 23079521 - 23079882
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079521 ttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaaaagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 23079620  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23079621 ccggtttgaaacgcgacgtagctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 23079720  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  23079721 ggatgtgccggagtggaagtcggacaatatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgac 23079820  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23079821 cggttgacgaagtcggcacatttcattcatattaatatcagttatccggtagcacagttggc 23079882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 24619725 - 24620088
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24619725 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtg 24619824  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  24619825 gtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccg 24619924  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  24619925 ttggatgtaccggagtggaaatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 24620024  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  24620025 atcggttgacgaagtcggcacatttcattccaataaatattagttatccggtagcagagttggc 24620088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 24715956 - 24716319
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24715956 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtg 24716055  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  24716056 gtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccg 24716155  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  24716156 ttggatgtaccggagtggaaatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 24716255  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  24716256 atcggttgacgaagtcggcacatttcattccaataaatattagttatccggtagcagagttggc 24716319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 24748984 - 24749347
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24748984 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtg 24749083  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  24749084 gtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccg 24749183  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  24749184 ttggatgtactggagtggaaatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 24749283  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  24749284 atcggttgacgaagtcggcacatttcattccaataaatattagttatccggtagcagagttggc 24749347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20343218 - 20342860
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343218 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggt 20343119  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20343118 ccagtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 20343019  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |||    
T  20343018 ggacgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtcgttgtcgac 20342919  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20342918 cggttgaggaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagtt 20342860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25849013 - 25848650
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25849013 agttgaagaagttgattcttgatgatagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtg 25848914  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  25848913 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgaattgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 25848814  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||| |    
T  25848813 ttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagagcatgacgctatttgggttgttgtcg 25848714  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25848713 accggttgatgaagtcggcacactttattcctatcaatatcagttatccagtagcacagttggc 25848650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 24797827 - 24798187
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797827 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 24797926  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24797927 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 24798026  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||| | ||||| |    
T  24798027 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatgccatttgggtagttgtcg 24798126  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24798127 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagtt 24798187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 22235350 - 22235713
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  22235350 agttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttagtg 22235449  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22235450 gtctggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccg 22235549  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | | |||| || |    
T  22235550 ttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatattggttgtggtcg 22235649  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22235650 acaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatattagttattcggtagcttagttggc 22235713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 14886421 - 14886781
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14886421 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 14886520  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  14886521 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 14886620  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||| | ||||| |    
T  14886621 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatgccatttgggtagttgtcg 14886720  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14886721 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagtt 14886781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22503617 - 22503254
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22503617 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagtaggttgagtattcagcccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtg 22503518  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  22503517 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgtcaccg 22503418  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  22503417 ttggatgtatcggagtggaagtgggacagtatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgaaagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 22503318  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22503317 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttggc 22503254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Original strand, 17268782 - 17269130
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17268782 tagaggaaagtcacaagagtagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 17268881  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17268882 tgtcgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaaggttgaccatcagaaacctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccagagtgg 17268981  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  17268982 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 17269081  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17269082 cacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctga 17269130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 37542811 - 37543171
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    |||||||||| || ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37542811 agttgaagaaattgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 37542910  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37542911 gtccggtatgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 37543010  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  37543011 ttagatgtaccagagtggaagtgggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 37543110  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37543111 accggttgacaaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagtt 37543171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 21890189 - 21890552
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21890189 agttgaaaaagttgagtttggaagaaagccacaaaagtagctttagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtg 21890288  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21890289 gtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgttcgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgaagggttgttgacaccg 21890388  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||      
T  21890389 ttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttacaaaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtct 21890488  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21890489 ataggttgacgaagtcgacacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 21890552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20822389 - 20822028
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20822389 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggt 20822290  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||| |||||    || || || | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||   || ||||||||||||||    
T  20822289 ccggattgaagaaggatgtcgcacggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcgggattgttgacaccgtt 20822190  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || |||    
T  20822189 ggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtagttgac 20822090  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20822089 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatataagttatccagtagctcagttggc 20822028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22462888 - 22462527
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22462888 ttgaagaagttgattttggaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggt 22462789  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||    |  || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||    
T  22462788 ctggtttgaagaaggctgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgtt 22462689  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  22462688 ggaggtaccagagtggaaatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagac 22462589  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22462588 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 22462527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Original strand, 28894375 - 28894735
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||||||    
T  28894375 tgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtc 28894474  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     ||||||||    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   ||| |||||||||||||||    
T  28894475 tggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttg 28894574  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||      
T  28894575 gatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgata 28894674  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28894675 ggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 28894735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Original strand, 28915846 - 28916206
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||||||    
T  28915846 tgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtc 28915945  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     ||||||||    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   ||| |||||||||||||||    
T  28915946 tggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttg 28916045  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||      
T  28916046 gatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgata 28916145  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28916146 ggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 28916206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Original strand, 28923201 - 28923561
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||||||    
T  28923201 tgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtc 28923300  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     ||||||||    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   ||| |||||||||||||||    
T  28923301 tggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttg 28923400  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||      
T  28923401 gatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgata 28923500  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28923501 ggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 28923561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20774695 - 20774334
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  20774695 ttgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacctgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggt 20774596  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||    
T  20774595 ctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgtt 20774496  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||||| |||||| | || ||| |||| || |||    
T  20774495 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgtcaagtttacctaatacttcgagaggacatgattcgatatgggttgtggtagac 20774396  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20774395 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 20774334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 21831191 - 21831554
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21831191 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 21831290  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  21831291 gtccggattgaagcgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcaaaaatctaaagttgaacatcagaagcctactgggttgttgacaccg 21831390  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| |||||||| || ||  | || || |  |||||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  21831391 ttagatgtgccggagtgaaaatgagatagcatatgcatggattttgtaacaagattaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgttg 21831490  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     || |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  21831491 atagattgtcgaagtcggcgcactttattccaatcaatattagttttccggtggctcagttggc 21831554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 21563403 - 21563766
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21563403 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 21563502  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||||     
T  21563503 gtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgccataaatctaaagttgaacatcagaaacttgttgggttgttgacacca 21563602  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||| |    
T  21563603 ttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagtttaccgaatactccaagagggcacgatgccatttgggtagttgttg 21563702  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     ||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  21563703 atagattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttccggtggctcagttggc 21563766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21497009 - 21496789
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  21497009 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggt 21496910  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21496909 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgtt 21496810  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtg 301  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  21496809 agatgtgccagagtggaagtg 21496789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 298
Target Start/End: Original strand, 21680222 - 21680427
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |    
T  21680222 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagc 21680321  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21680322 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 21680421  T
Q  293 gtggaa 298  Q
    ||||||    
T  21680422 gtggaa 21680427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 308 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 22381908 - 22381771
Alignment:
Q  308 tatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcatt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||   | |||||||||||||||||||||||    
T  22381908 tatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttctggttgataggttgacgaagtcggcacacttcatt 22381809  T
Q  408 cctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381808 cctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 22381771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21408076 - 21407839
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    ||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21408076 tagaacaaagtcacagaagtaatttgagtattcatgcaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaatttattttggtggtccgggttgaagcgaga 21407977  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     || || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| | || ||||||||||| || ||| | || ||||||    
T  21407976 tgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcaaaagttgaacaccagaaacctgttggtttgttgacacctttagatattccagagtgg 21407877  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    |||||| | | ||| || |||||||| |||||||||||    
T  21407876 aagtgggataatatatccatggattttgtgacgagttt 21407839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22135619 - 22135350
Alignment:
Q  84 aagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccg 183  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |    
T  22135619 aagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctg 22135520  T
Q  184 gtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttgga 283  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  || ||  ||| || ||    
T  22135519 gtttgaaacgaggtgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaaacctactggagtgatggtacctttaga 22135420  T
Q  284 tgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
    ||| || || ||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  22135419 tgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 22135350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 14999204 - 14999343
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14999204 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 14999303  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14999304 attcctgtttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatca 14999343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19770881 - 19770642
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19770881 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 19770782  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  19770781 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 19770682  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  19770681 catggattttgtgacaagtttgccaaatactccgagaggg 19770642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 26738192 - 26738331
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  26738192 agtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 26738291  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  26738292 attcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatca 26738331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 29475538 - 29475777
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |  |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  29475538 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 29475637  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  29475638 attcatgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 29475737  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  29475738 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 29475777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41771763 - 41771524
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  41771763 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 41771664  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  41771663 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 41771564  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  41771563 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 41771524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 440
Target Start/End: Original strand, 20467562 - 20467887
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||| || || || |||||||| |    
T  20467562 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttggtttggtggtcggggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtat 20467661  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || ||||||| | |||| | ||||| |||||||| ||| | || |||   |||||| ||||| | || || || || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  20467662 attcatgtttgatttgttaaaagtcaaaagttgagcattagaaacctgctgggttgatgacatctttagaagtgccagagtggaaatgggatagtatatc 20467761  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatc 413  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||| |||| || |||||| |  |||||||     ||||||||||||| || |||||||| ||     
T  20467762 catggattttgtgacaagtttgccgaatactccaaaagggaatgacactatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggctca-ttcattccgatt 20467860  T
Q  414 aatatcagttatccggtagctcagttg 440  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20467861 aatatcagttgtcctgtatctcagttg 20467887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22349359 - 22349205
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  22349359 gaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 22349260  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22349259 tggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 22349205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27611275 - 27611036
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27611275 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27611176  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| || ||    ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  27611175 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 27611076  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  27611075 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27611036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 27684865 - 27685004
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27684865 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27684964  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  27684965 attcctgtttagtttgtcagaagtctaaaattgagcatca 27685004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16357423 - 16357284
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16357423 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16357324  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  16357323 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 16357284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 22332352 - 22332591
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22332352 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 22332451  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  22332452 attcctgtttagtttgccagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccggaatggaagtgggatagtatatc 22332551  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22332552 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22332591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27519328 - 27519189
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27519328 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27519229  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27519228 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 27519189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34567415 - 34567276
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  34567415 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 34567316  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  34567315 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 34567276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 37290961 - 37291200
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  37290961 agtagcttgagtattcatccgggagccacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 37291060  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||   ||||||||||  |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  37291061 attcctgtttagtctgtcagaagtagaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 37291160  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37291161 catggattttgtgacgagtttgccaaacactcctagaggg 37291200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 21338762 - 21338901
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || |||||||| || || || ||||| ||||    
T  21338762 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgt 21338861  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21338862 attcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatca 21338901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 27667955 - 27668094
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27667955 agtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27668054  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  27668055 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 27668094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40709701 - 40709562
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40709701 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 40709602  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  40709601 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 40709562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25424104 - 25423971
Alignment:
Q  120 ttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| | |    
T  25424104 ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgtattctt 25424005  T
Q  220 gtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  25424004 gtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatca 25423971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18776691 - 18776567
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18776691 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 18776592  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  18776591 attcttgtttagtttgtcagaagtc 18776567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23472150 - 23471930
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||  | || ||  |||| || |    
T  23472150 agtagcttaagtattcatccgggagctagaacgatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgttatgtggcatagttggtat 23472051  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| | ||||| || ||| ||||  ||||||| ||| | || || ||    
T  23472050 attcctgtttgatatgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatataccatagtggaaatgggatagcatatc 23471951  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  23471950 catggattttgtgacgagttt 23471930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23574658 - 23574414
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  23574658 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 23574559  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||| || |||   ||  || ||  | | || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  23574558 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 23574459  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||    
T  23574458 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 23574414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23441131 - 23440992
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||    
T  23441131 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtagcacaatttgtgt 23441032  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  23441031 attcttgtttagtttgtcataagtcgaagattgaacatca 23440992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21881870 - 21881731
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||| || |||||||  | || |||||||| || |||||||  || || || ||||||||||    
T  21881870 agtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatcataatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacacgatgtcgcacagtttgtgt 21881771  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21881770 attcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgaacatca 21881731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20800362 - 20800249
Alignment:
Q  121 tgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatg 220  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||| | ||    
T  20800362 tgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctg 20800263  T
Q  221 tttaacttgtcaga 234  Q
    ||||  ||||||||    
T  20800262 tttagtttgtcaga 20800249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23517447 - 23517394
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaa 167  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  23517447 agtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaaa 23517394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 4705 - 5069
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4705 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggt 4804  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  4805 ccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 4904  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||     
T  4905 ggatgtatcggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatggattgtggtcgat 5004  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005 aggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 5069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 13152 - 13515
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 13251  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||    
T  13252 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcacaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccg 13351  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |    
T  13352 ttagatgtgccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtaacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgttg 13451  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13452 acaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggc 13515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 4218 - 4567
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4218 attttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattcgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagc 4317  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4318 gtgacgtcgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccgga 4417  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||| || |||| |||    
T  4418 gtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaagttgacaaag 4517  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4518 tcggcgcactttattccgattaatattagttatccggtggctcagttggc 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 68423 - 68062
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  68423 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggt 68324  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  68323 ctggtttgaagagggatgtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctacagggttgttgacaccgtt 68224  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  68223 ggatgtactggagtggaaatgggacaacatttctatggactttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgac 68124  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  68123 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 68062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 31416165 - 31416528
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31416165 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 31416264  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  31416265 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtttatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 31416364  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |    
T  31416365 ttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgagcactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcg 31416464  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31416465 acaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggc 31416528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Original strand, 29303143 - 29303480
Alignment:
Q  105 agtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctc 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29303143 agtcacaagagtaggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgctc 29303242  T
Q  205 agtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaa 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29303243 agtttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaaagtggaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggga 29303342  T
Q  305 cagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttc 404  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||    
T  29303343 tagtatctctatggatttcgtgacgaatttaccaaacacttcgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttc 29303442  T
Q  405 attcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29303443 attcctattaatatcagttattcggtagcacaattggc 29303480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6604746 - 6604388
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6604746 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggt 6604647  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  6604646 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgtt 6604547  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  6604546 agatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatttgggttgttgtcgac 6604447  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6604446 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagtt 6604388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6680199 - 6679838
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6680199 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggt 6680100  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  6680099 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgtt 6680000  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  6679999 agatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgac 6679900  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6679899 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 6679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 16270917 - 16271278
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16270917 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggt 16271016  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  16271017 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgtt 16271116  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||    
T  16271117 agatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgac 16271216  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16271217 cggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttacccggtagcacagttggc 16271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 803364 - 803727
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  803364 agttgaagaagttgattctagaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 803463  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||   |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  803464 gtctggtttgaaaagagatgttgctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 803563  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  803564 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctacggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 803663  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  803664 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 803727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1267328 - 1266965
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1267328 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtg 1267229  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1267228 gtccggtttgaaacgtgacgttgcccattttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 1267129  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| | || ||| |||| || |    
T  1267128 ttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactcttagaggacacgattctatatgggttgtggtcg 1267029  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1267028 acaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatcctgtagcacagttggc 1266965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12305848 - 12305485
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305848 agttgaagaagttaattcttgaagagagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 12305749  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12305748 gtccggtttgaattgtgatgttgctcagtttttttatgcttgttttatttgtcagaagtctaaggttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 12305649  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||| |    
T  12305648 ttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgaccttaccgaacactccgagagggtatgacactatttgagttgttgtcg 12305549  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12305548 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttggc 12305485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 99 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27355618 - 27355275
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27355618 gaagatagtcacaagagtagattgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatg 27355519  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27355518 ttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggtttttgacaccgttagatgtactggagtggaa 27355419  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggca 398  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  27355418 gtgggacagtatctctatggattttgtgacgaatttaccgaacactccgagagggcatgacgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcgaca 27355319  T
Q  399 cacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27355318 cacttcattcccatcaatatcagttatccggtagaacagttggc 27355275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14566232 - 14565872
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14566232 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 14566133  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  14566132 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 14566033  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |    
T  14566032 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcg 14565933  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    | | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14565932 atcggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagtt 14565872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23656015 - 23655654
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23656015 ttgaaaaagttgattctggaagaaggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 23655916  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  23655915 ctgggttgaaacgtgacgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttattaacaccgtt 23655816  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  23655815 agatgtgccggagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtagttgtcgac 23655716  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | |||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23655715 aggttgacgaagtcggcacacttcattttgattaatattagttatccggtagcttagttggc 23655654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 20975344 - 20975705
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20975344 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatacgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggt 20975443  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  20975444 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtatatgcatgtttgacttgctagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgtt 20975543  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  20975544 ggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgaatttaccacatactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgac 20975643  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20975644 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccgatagctcagttggc 20975705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19852501 - 19852138
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19852501 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 19852402  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  19852401 gtccggtttgaaacgtgatgttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccg 19852302  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  19852301 ttcgatgtgccagagtggaagtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 19852202  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | |||||||||||| ||| || ||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  19852201 acaggttgacgaagtcggtacattttatttcgatcaatattagttttccggtagcacagttggc 19852138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19858537 - 19858174
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19858537 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 19858438  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  19858437 gtccggtttgaaacgtgatgttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccg 19858338  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  19858337 ttcgatgtgccagagtggaagtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 19858238  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | |||||||||||| ||| || ||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  19858237 acaggttgacgaagtcggtacattttatttcgatcaatattagttttccggtagcacagttggc 19858174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 22051951 - 22051587
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22051951 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtaggttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 22051852  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  22051851 ccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttatgtatgcatgtttgacttgctagaagtctaacattgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgtt 22051752  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||| |||| |  ||     
T  22051751 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttactaaacactccgagaagacatgattctatttgggttgtgggtgat 22051652  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22051651 aggttgacaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctga 22051587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Original strand, 31570551 - 31570899
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  31570551 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 31570650  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31570651 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 31570750  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  31570751 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 31570850  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  31570851 cacattttattcctatcaacattagttattcggtagctcagttggctga 31570899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 79 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22372030 - 22371673
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  22372030 agttgaaaaagttgattatagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtg 22371931  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  22371930 gtccagattgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 22371831  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  22371830 ttagatgtgcctgagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggtagttgttg 22371731  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctca 436  Q
    |   | ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  22371730 ataggttgacgaagtcggcgcattttattccgatcaatattagttttccggtagctca 22371673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21841505 - 21841147
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21841505 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggt 21841406  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  21841405 ctgggttgaaacgtgatgttgctatgtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 21841306  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| | || || ||     
T  21841305 agatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtggtggtcgat 21841206  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
      | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21841205 aggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccagtagctcagtt 21841147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20389189 - 20388826
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  20389189 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacatacgtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttagtg 20389090  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||| ||||| || || ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||     
T  20389089 gtccggattgaagcgtgatgttgtacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacacca 20388990  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | || || || |||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  20388989 ttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatatccatggattgtgtgacaagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtagttgttg 20388890  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  20388889 atagattgacgaagtcggcacactttattccaatcaatattagttttccagtggctcagttggc 20388826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 376
Target Start/End: Original strand, 20009611 - 20009907
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20009611 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgatttgaagaaattattttggtg 20009710  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  20009711 gtccg-tttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacacca 20009809  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgt 376  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20009810 ttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggaatgatgccatttgggttgttgt 20009907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 442
Target Start/End: Original strand, 22061246 - 22061487
Alignment:
Q  201 gctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22061246 gctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgaacatcagaagcctgcagggttattgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 22061345  T
Q  301 ggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcaca 400  Q
    || | || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| | || ||| |||| || |||  | |||  |||||||| ||    
T  22061346 gggatagcatttctatggattttgtgatgagtttaccaaacactacgagaggacacgattctatatgggttgtggtcgacaggttgagaaagtcggcgca 22061445  T
Q  401 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  22061446 cttcattcctattaacatcaagtatccggtagctcagttggc 22061487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 357
Target Start/End: Original strand, 20395843 - 20396094
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  20395843 gaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 20395942  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    | || |||||||| ||| ||||||| | ||||||       |||||||| ||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  20395943 tggcacagtttgtttattcatgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaa 20396035  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatg 357  Q
     ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20396036 atgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggcatg 20396094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 367
Target Start/End: Original strand, 22248143 - 22248396
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  22248143 agtagcttgtgtattcatccgggagctacgaggatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 22248242  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| ||| | || || ||    
T  22248243 attcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatc 22248342  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttg 367  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||| |||| |||| || |||||    
T  22248343 catggattttgtgacgattttgccgtatactccgaaagggaatgacacgatttg 22248396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 17673749 - 17673888
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  17673749 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 17673848  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  17673849 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 17673888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 22377182 - 22377400
Alignment:
Q  116 tagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||||||||||    
T  22377182 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgtat 22377281  T
Q  216 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttcta 315  Q
     | ||||| | |||||| || || | |||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || |||||||| |||||| | ||| | || || || |    
T  22377282 tcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgggaatgggatagcatatcca 22377381  T
Q  316 tggatttcgtgacgagttt 334  Q
    || |||| |||||||||||    
T  22377382 tgaattttgtgacgagttt 22377400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 22383357 - 22383575
Alignment:
Q  116 tagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||||||||||    
T  22383357 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgtat 22383456  T
Q  216 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttcta 315  Q
     | ||||| | |||||| || || | |||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || |||||||| |||||| | ||| | || || || |    
T  22383457 tcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgggaatgggatagcatatcca 22383556  T
Q  316 tggatttcgtgacgagttt 334  Q
    || |||| |||||||||||    
T  22383557 tgaattttgtgacgagttt 22383575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 19483790 - 19483929
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19483790 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 19483889  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  19483890 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 19483929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23949989 - 23949835
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || |    
T  23949989 gaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaaagtgatg 23949890  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||    
T  23949889 tggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtcgagcatca 23949835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19113745 - 19113606
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19113745 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 19113646  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  19113645 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 19113606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18857662 - 18857499
Alignment:
Q  84 aagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccg 183  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |    
T  18857662 aagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctg 18857563  T
Q  184 gtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttga 247  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  18857562 gtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtactcctgtttagtttgtcaaaagtcgaaagttga 18857499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22988251 - 22988112
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||||||||    
T  22988251 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatatggcacagtttgtgt 22988152  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22988151 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 22988112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23651096 - 23650957
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23651096 agtatcttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 23650997  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  23650996 attcttgttggatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 23650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 21921447 - 21921601
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  21921447 gaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatg 21921546  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  21921547 ttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcaaaggttgagcatca 21921601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 260
Target Start/End: Original strand, 22128684 - 22128830
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22128684 agtagtttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 22128783  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcct 260  Q
    || | ||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  22128784 attcctgtttagtttgtcagaaatcaaaagttgagcatcagaagcct 22128830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 21393591 - 21393730
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21393591 agtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgt 21393690  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  21393691 atgcttgtttgatttgccagaagtcgaaggttgagcatca 21393730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 21788085 - 21788224
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21788085 agtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgt 21788184  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  21788185 atgcttgtttgatttgccagaagtcgaaggttgagcatca 21788224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 353
Target Start/End: Original strand, 22119904 - 22120139
Alignment:
Q  118 gcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgc 217  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || | |||||| |||||||||| ||| || || ||||| |||||| |    
T  22119904 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacaagatgtggcacagttcgtgtattc 22120003  T
Q  218 atgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatg 317  Q
     ||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| || ||| | ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||| || |||    
T  22120004 ctgtttagtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgttggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggacagtatatccatg 22120103  T
Q  318 gatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22120104 gattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22120139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 20985238 - 20985352
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20985238 agttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtatcttaagtattcacccgagagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 20985337  T
Q  179 gtccggtttgaaacg 193  Q
    ||| |||||| ||||    
T  20985338 gtctggtttgtaacg 20985352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21043500 - 21043361
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||    
T  21043500 agtaacttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacaatttgtgt 21043401  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | |||||   ||||||||| || || ||||| |||||    
T  21043400 attcttgtttggtttgtcagaaatcgaaggttgagcatca 21043361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 22132767 - 22132891
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||     
T  22132767 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtga 22132866  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | || |||  ||||||||||||    
T  22132867 attcctgcttagtttgtcagaagtc 22132891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 30312870 - 30312994
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||| |||| || || |||||||| |    
T  30312870 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtct 30312969  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  30312970 attcctgtttagtttgtcagaagtc 30312994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Original strand, 12274441 - 12274554
Alignment:
Q  140 tacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtct 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  12274441 tacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcg 12274540  T
Q  240 aaagttgaacatca 253  Q
    ||||| || |||||    
T  12274541 aaagtcgagcatca 12274554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21251992 - 21251857
Alignment:
Q  121 tgagtattcatcagggagctacaa---agatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgc 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| |   ||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  21251992 tgagtattcatccgggagctacgacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttacacagtttgtatattc 21251893  T
Q  218 atgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  21251892 ttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 21251857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22040914 - 22040790
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  22040914 agtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 22040815  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  22040814 attcctgtttagtttgtcagaagtc 22040790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19979022 - 19978883
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || || ||||| || || || ||||||||||    
T  19979022 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattaaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 19978923  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | |||||   |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19978922 attcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 19978883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25283432 - 25283346
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||  || |||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  25283432 attttggaagaaggtcacaagagtagtttaagtattcatctaggagtgacgaagatgtatcaggatttgaagaaattgttttggtgg 25283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32601199 - 32601075
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||| | || ||  | || |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  32601199 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatataaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgt 32601100  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | || |||  ||||||||||||    
T  32601099 attcctgcttagtttgtcagaagtc 32601075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 21166264 - 21166403
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || ||||||||  | |||||||| || || || ||||||||||    
T  21166264 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 21166363  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | |||||   || ||||||||| ||  ||||||||||    
T  21166364 attcctgtttggtttatcagaagtcgaagattgaacatca 21166403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25283206 - 25283120
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  25283206 attttggaagaaggtcacaggagtagtttaagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 25283120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15534438 - 15534311
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgattt-gaagaaa--ctgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttg 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||   | || |||||||| |||||||||||||| || ||  | || |    
T  15534438 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttagaaaaaaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcataattcg 15534339  T
Q  211 tgtatgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  15534338 tgtattcctgtttagtttgtcagaagtc 15534311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 16407771 - 16407911
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgg-tttgaaacgagacgttgctcagtttgtg 212  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||| ||| || |||||||||||| |  || |||||||||    
T  16407771 agtagcttgagtattcacccaggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtagtctggatttgaaacgagatgcggcacagtttgtg 16407870  T
Q  213 tatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16407871 tattcctatttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 16407911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Original strand, 22623579 - 22623637
Alignment:
Q  103 aaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttg 161  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22623579 aaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 22623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22316246 - 22316181
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  22316246 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtgg 22316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Original strand, 23156717 - 23156789
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaaga 165  Q
    ||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  23156717 attttggacgaaggtcataagagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaaga 23156789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 45570 - 45206
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45570 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgtttcggtggt 45471  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  45470 ccggtttgaaacgcgacgttgctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 45371  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  45370 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 45271  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45270 aggttgacaaagtcggaacacttcatccctattaacatgagttatccggtagctcagttggctga 45206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 198 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 44441 - 44194
Alignment:
Q  198 gttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44441 gttgctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 44342  T
Q  298 agtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggc 397  Q
    | ||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||   | |||| |||||||     
T  44341 aatgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcgga 44242  T
Q  398 acacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44241 acacttcatccctattaacatgagttatccggtagctcagttggctga 44194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20953 - 20744
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  20953 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcatgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggt 20854  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  20853 ccggtttgaaacgtgatgtagctcaatttatttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgcaaggttgttgacaccgtt 20754  T
Q  281 ggatgtaccg 290  Q
    ||||||||||    
T  20753 ggatgtaccg 20744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 253
Target Start/End: Original strand, 19632 - 19766
Alignment:
Q  119 cttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgca 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |     
T  19632 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagttcgtgtattct 19731  T
Q  219 tgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  19732 tgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatca 19766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 261361 - 260997
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  261361 ttgaaaaagttaattttagaagaaggtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 261262  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  261261 ccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacgccgtt 261162  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||| |||| || ||     
T  261161 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactctgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgat 261062  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  261061 aggttgacaaagtcggcacactttattcctatcaacatcagttatccgatagctcaattggctga 260997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 278116 - 278255
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||    
T  278116 agtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgt 278215  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || |||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  278216 attcatgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 278255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 19651840 - 19652203
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  19651840 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtg 19651939  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  19651940 gtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaacgttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccg 19652039  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |    
T  19652040 ttggatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttagtgacaagtataccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtag 19652139  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19652140 acaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggc 19652203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1064406 - 1064043
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064406 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 1064307  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1064306 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 1064207  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  1064206 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 1064107  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1064106 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagttggc 1064043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20828914 - 20828551
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828914 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 20828815  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20828814 gtccggtttaaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 20828715  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  20828714 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 20828615  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20828614 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 20828551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20833640 - 20833277
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20833640 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 20833541  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20833540 gtccggtttaaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 20833441  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  20833440 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 20833341  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20833340 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 20833277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31831313 - 31830950
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    |||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31831313 agttaaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 31831214  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  31831213 gtccggtatgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 31831114  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  31831113 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 31831014  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31831013 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttacccggtagcgcagttggc 31830950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24949242 - 24948881
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24949242 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 24949143  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||    
T  24949142 ccagtttgaagcgtgacgttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgatatcgtt 24949043  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  24949042 ggatgtgccggagttgaaatgggataggatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 24948943  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||| ||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24948942 aggttgatgaagttggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 24948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 11357662 - 11358022
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11357662 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtg 11357761  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  11357762 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccg 11357861  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |    
T  11357862 ttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcg 11357961  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  11357962 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcaattatccggtagcgcagtt 11358022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23277429 - 23277068
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  23277429 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggt 23277330  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  23277329 ccggtttgaagcatgacgtcgctcaatttgtatatgcgtgcttgagttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacactgtt 23277230  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  23277229 agatgtgccggaatggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgattttaccgaacactccaagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 23277130  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23277129 aggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 23277068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 27788378 - 27788030
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27788378 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 27788279  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27788278 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 27788179  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | || || ||   | ||||||||||||    
T  27788178 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtcgtggttgataggttgacgaagtcgg 27788079  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27788078 cacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 27788030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 12574990 - 12574642
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12574990 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 12574891  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574890 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 12574791  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | || || ||   | ||||||||||||    
T  12574790 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtagtggttgataggttgacgaagtcgg 12574691  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12574690 cacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 12574642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23294593 - 23294315
Alignment:
Q  76 ataagttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttg 175  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23294593 ataatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 23294494  T
Q  176 gtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgaca 275  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23294493 gtggtccggtttgaagtgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgaca 23294394  T
Q  276 ccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggc 354  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23294393 ccgttggatgtgccggagtgaaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggc 23294315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 27364881 - 27365230
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  27364881 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagc 27364980  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27364981 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccgga 27365080  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  27365081 gtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaag 27365180  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27365181 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggc 27365230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24642290 - 24642034
Alignment:
Q  186 ttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatg 285  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24642290 ttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccgttggatg 24642191  T
Q  286 taccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggt 385  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||  | |    
T  24642190 tgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggtt 24642091  T
Q  386 gacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642090 gacgaagtcggcacactttattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggc 24642034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 27209962 - 27210323
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27209962 ttgaagaagttgatattagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggt 27210061  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||    || || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||||||||    
T  27210062 ctggtttgaagaaggatgtcgctcgttttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgtt 27210161  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  27210162 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttatatggattttgtgataagtttacctaatactccgagggggcatgattctatatgggttgtggtagac 27210261  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27210262 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 27210323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 135 - 442
Target Start/End: Original strand, 21125003 - 21125310
Alignment:
Q  135 ggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcaga 234  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  21125003 ggagctacagagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatcttgctcaatttgtttatgcatgtttggcttgtcaga 21125102  T
Q  235 agtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21125103 agtctaaggttgagcatcacaagtctacagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagttt 21125202  T
Q  335 accaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagct 434  Q
    ||| || ||||||||||| |||| | |||||||| ||||| | ||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  21125203 accgaatactccgagaggacatggtgccatttgggttgttttcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagct 21125302  T
Q  435 cagttggc 442  Q
    ||||||||    
T  21125303 cagttggc 21125310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45530148 - 45529877
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45530148 tagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgaga 45530049  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     || || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||| |  ||||||    
T  45530048 tgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttctagagtgg 45529949  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
    |||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||| | ||||||    
T  45529948 aagtgggatagtatgtccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgcgatttgg 45529877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23111391 - 23111101
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttga-gtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggt 177  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  23111391 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacataagtagctttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggt 23111292  T
Q  178 ggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacacc 277  Q
    ||||||| || ||  | || ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  23111291 ggtccggatttaagtgtgatgttgcacagtttgtatatgcatatttgacttgccagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacacc 23111192  T
Q  278 gttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
     || ||||| || |||||||| ||| | |  || || |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23111191 attagatgtgccagagtggaaatgggataacatatccatggattttgtaacaagtttacccaatactccaagagggcatgatgctatttgg 23111101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Original strand, 30210723 - 30210901
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  30210723 tagaagaaagtcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttt-ggtggtccgggttgaagcgaga 30210821  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacac 276  Q
     || || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||    
T  30210822 tgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacac 30210901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24710654 - 24710415
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24710654 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 24710555  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  24710554 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 24710455  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  24710454 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 24710415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27371889 - 27371750
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  27371889 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27371790  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27371789 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 27371750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 353
Target Start/End: Original strand, 24876557 - 24876811
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||  |||||||||||||| |    
T  24876557 gaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatg 24876656  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||    
T  24876657 tggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaa 24876756  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  24876757 atgggatagtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 24876811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 21144864 - 21145103
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21144864 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 21144963  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  21144964 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 21145063  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  21145064 gatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 21145103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 22324679 - 22324918
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22324679 agtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 22324778  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  22324779 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 22324878  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22324879 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22324918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24262990 - 24262851
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24262990 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 24262891  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  24262890 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 24262851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 41608208 - 41608347
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||    
T  41608208 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgt 41608307  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41608308 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgaacatca 41608347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10869485 - 10869331
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  10869485 gaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 10869386  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  10869385 tggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 10869331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9610756 - 9610617
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  9610756 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 9610657  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  9610656 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 9610617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16925980 - 16925841
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16925980 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgt 16925881  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  16925880 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 16925841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16999620 - 16999481
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16999620 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgt 16999521  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  16999520 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 16999481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16923509 - 16923370
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16923509 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16923410  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  16923409 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 16923370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16982772 - 16982633
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16982772 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16982673  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  16982672 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 16982633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17064337 - 17064198
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  17064337 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 17064238  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  17064237 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 17064198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17067995 - 17067856
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  17067995 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 17067896  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  17067895 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 17067856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27218636 - 27218497
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  27218636 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttaaaacgagatgtggcacagtttgtgt 27218537  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27218536 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 27218497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 21890541 - 21890678
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21890541 agtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaagcgcgatgttgcacaatttgtgt 21890640  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacat 251  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  21890641 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgaacat 21890678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 334
Target Start/End: Original strand, 24819495 - 24819729
Alignment:
Q  100 aagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||  | |||||| |  | ||    
T  24819495 aagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgt 24819594  T
Q  200 tgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaag 299  Q
     || || ||||||||| | |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||     
T  24819595 ggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaa 24819694  T
Q  300 tggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    ||| | || || || |||||||| |||||||||||    
T  24819695 tgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 24819729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Original strand, 44385392 - 44385522
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||| |||    
T  44385392 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttatgt 44385491  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagt 244  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||    
T  44385492 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 44385522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23067011 - 23066872
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  23067011 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatattgcacagtttgtgt 23066912  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  23066911 attattgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 23066872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Original strand, 24707305 - 24707442
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| |||||  | || ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||    
T  24707305 agtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgt 24707404  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacat 251  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||    
T  24707405 attcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacat 24707442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Original strand, 21325089 - 21325327
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || |||||||| || ||||| || || || |    
T  21325089 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaattcgtat 21325188  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||| || |||   ||  || ||  | | || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  21325189 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 21325288  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagg 352  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  21325289 catggatttcgtgacgagttttccgaatactcctagagg 21325327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24676109 - 24676008
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  24676109 agtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 24676010  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  24676009 at 24676008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23294307 - 23294250
Alignment:
Q  385 tgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23294307 tgacgaagtcggcgcactttattccgattaaaatcagttatccggtagctcagttggc 23294250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 22756288 - 22756427
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || ||||||||  | |||||||| || || || ||||||||||    
T  22756288 agtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 22756387  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | |||||   |||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  22756388 attcctgtttggtttgtaagaagtcgaagattgaacatca 22756427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 23107553 - 23107692
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || ||| |||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  23107553 agtaacttgagtattaatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggcggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 23107652  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | |||||   |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  23107653 attcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 23107692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 79 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 249668 - 249306
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  249668 agttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 249569  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  249568 gtccggtttgaaacgtgacgtagctcattttgtatatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccg 249469  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |    
T  249468 ttggatgtaccggagtcgaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgcaatttgggttattgtcg 249369  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    ||  | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  249368 acaggttgacgaagtcggcacatttcattccaattaatatcagttatccggtagcacagttgg 249306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 16337990 - 16338351
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16337990 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagtaggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggt 16338089  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  16338090 ccggtttgaaacgagatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgttagaagtctaaagttgagcatcagaagcctgcagggttgttcacaccgtt 16338189  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  16338190 ggatgtaccggagtggaagtgggacaatatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatgacgccatttgggttgttgtcgac 16338289  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16338290 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttacccggtagcacagttggc 16338351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10384621 - 10384261
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10384621 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtg 10384522  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10384521 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 10384422  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  10384421 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 10384322  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10384321 accggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagtt 10384261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 18133822 - 18134185
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18133822 agttgaaaaagttaattttggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtg 18133921  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  18133922 gtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacattagaagcctgcagggttgttgacaccg 18134021  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |    
T  18134022 ttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttcaatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcg 18134121  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134122 acaggttgacgaattcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 18134185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28754971 - 28754611
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28754971 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 28754872  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  28754871 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 28754772  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  28754771 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacaccccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 28754672  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28754671 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagtt 28754611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 95 - 442
Target Start/End: Original strand, 11303265 - 11303612
Alignment:
Q  95 tttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacga 194  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |     
T  11303265 tttagaggaaaggcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccgggttgaaatgt 11303364  T
Q  195 gacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagt 294  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11303365 gatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagt 11303464  T
Q  295 ggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtc 394  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || || |||  | ||||||||||    
T  11303465 ggaagtgggacaacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtcgtcgtcgacaggttgacgaagtc 11303564  T
Q  395 ggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11303565 ggcacactttattccgatcaatattagttatctggtagctcagttggc 11303612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 16827681 - 16828041
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16827681 ttgaaaaagttgattttagaggaaacccacaaaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggt 16827780  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  16827781 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 16827880  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||     
T  16827881 agatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatgccatttgggttg-tgtggat 16827979  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16827980 aggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggc 16828041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 16329136 - 16329500
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  16329136 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtg 16329235  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||| || ||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  16329236 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcaaaagtccaaggttgagcatcaaaagcttgcaaggttgttgacaccg 16329335  T
Q  279 tt-ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtg 377  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||     
T  16329336 ttaggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtc 16329435  T
Q  378 gaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16329436 aaccggttgacgaagtcagcacacttcattcctatcaatatcagttacccggtagcacagttggc 16329500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14574576 - 14574219
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  14574576 agttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtg 14574477  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  14574476 gtctgggttgaaacgagatgttgctcggtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcg 14574377  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  14574376 ttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 14574277  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  14574276 acaggttgacgaagtcggcacactttatt-cta-----atcagttatccggtagctcagttggc 14574219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 445
Target Start/End: Original strand, 16835994 - 16836352
Alignment:
Q  87 aagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtt 186  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16835994 aagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtt 16836093  T
Q  187 tgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16836094 tgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgcgtgcttcacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgt 16836193  T
Q  287 accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtg 386  Q
     ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||| || ||| || ||    
T  16836194 gccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccaagaggacatgattctatttgggttgtggtcgacaagttg 16836293  T
Q  387 acgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16836294 acaaagtcggcgcacttcattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctga 16836352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47124597 - 47124234
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47124597 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 47124498  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  47124497 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 47124398  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||  | |||||| | ||||| |    
T  47124397 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgaggaggcatgacgctatttgggtagttgtcg 47124298  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47124297 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttacccggtagcgcagttggc 47124234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 12360020 - 12360381
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12360020 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 12360119  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||    
T  12360120 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctcaggttgaatattagaagcctgcagggttgttgacacagtt 12360219  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||    
T  12360220 ggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatatgggttgtggtcgac 12360319  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | |||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  12360320 aggttgacaaagttggcgcactttattccgattaatatcaaatatccgatagctcagttggc 12360381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Original strand, 8758576 - 8758924
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  8758576 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaagcgaga 8758675  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8758676 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 8758775  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  8758776 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 8758875  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8758876 cacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 8758924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 41178157 - 41177809
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41178157 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 41178058  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41178057 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 41177958  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  41177957 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 41177858  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41177857 cacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctga 41177809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17493283 - 17492920
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17493283 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattctggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtg 17493184  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  17493183 gtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttttgtatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 17493084  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||| |    
T  17493083 ttggatgtaccagagttgaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatgatgccatatgggttattgtcg 17492984  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     ||||||||||||| || || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17492983 atagattgacgaagtcggcgcattttattccaattaatatcaattatccggtagctcagttggc 17492920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 359
Target Start/End: Original strand, 11960647 - 11960925
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960647 ttgaagaagttgattcttgaagagagtcacgatagtagtttgagtattcacccaggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 11960746  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  11960747 ccggtttgaaacgagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgtt 11960846  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 359  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11960847 ggatgtaccggagtggaaatgagacagtatttctatggattttgtgacgagttttccaaacactccgagaggacatgat 11960925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4679073 - 4678725
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  4679073 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 4678974  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4678973 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtgg 4678874  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | || || ||   | ||||||||||||    
T  4678873 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcgg 4678774  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4678773 cacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctga 4678725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 13942659 - 13942311
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13942659 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 13942560  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13942559 tgttgctcatttcgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacatcattggatgtaccggagtgg 13942460  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| || ||   | ||||||||||||    
T  13942459 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcgg 13942360  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13942359 cacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctga 13942311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 16380406 - 16380770
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16380406 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 16380505  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
     ||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  16380506 acgggttgaattgagatgtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcaggattgttgacgccgtt 16380605  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || ||     
T  16380606 ggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacaagcttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgat 16380705  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
        || | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16380706 agattgtcaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctga 16380770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 97 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 44777882 - 44777534
Alignment:
Q  97 tagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgaga 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  44777882 tagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgaga 44777783  T
Q  197 cgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgg 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44777782 tgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcccgcaggattgttgacaccattggatgtaccagagtgg 44777683  T
Q  297 aagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcgg 396  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||| | || || ||   | ||||||||||||    
T  44777682 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaagggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcgg 44777583  T
Q  397 cacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777582 cacattttattcctatcaacatcaattatccggtagctcagttggctga 44777534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 13971610 - 13971959
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  13971610 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagc 13971709  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13971710 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccgga 13971809  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  13971810 gtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaag 13971909  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13971910 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggc 13971959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14087312 - 14086963
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |    
T  14087312 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagc 14087213  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14087212 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 14087113  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  14087112 gtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaag 14087013  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14087012 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggc 14086963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 81 - 310
Target Start/End: Original strand, 31694664 - 31694893
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  31694664 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggt 31694763  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  31694764 ccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 31694863  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtat 310  Q
      |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31694864 aaatgtgccggagtggaagtgggacagtat 31694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31939554 - 31939333
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||    
T  31939554 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagggtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggt 31939455  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  31939454 ccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagccttcagggttgttgacaccgtt 31939355  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtgg 302  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  31939354 agatgtgccggagtggaagtgg 31939333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 10419523 - 10419884
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  10419523 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggt 10419622  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |  | |||||    || || || | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||    
T  10419623 ctagattgaagaaggatgtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcgggattgttgacaccgtt 10419722  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||| | || ||| ||||||| |||    
T  10419723 ggatataccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacccaataccccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgac 10419822  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  10419823 aggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatataagttatccagtagctcagctggc 10419884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15228302 - 15227939
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15228302 agttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 15228203  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||      
T  15228202 gtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcttgttgggttgttgacacta 15228103  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || || ||||| ||  |||| ||| | || || || ||||| || || || |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |    
T  15228102 ttagaagtaccagaaaggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatatgggtagttgttg 15228003  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |     |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| || ||| || ||||||||    
T  15228002 atagattgacgaagtcagcacactttattccgattaatattagttttctggtggcacagttggc 15227939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 442
Target Start/End: Original strand, 13322312 - 13322491
Alignment:
Q  263 agggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |     
T  13322312 agggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacagcatctctatggattttgtgacgagtttacctaatactccgagaggacatgattct 13322411  T
Q  363 atttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    || ||| |||| || |||  | ||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13322412 atatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 13322491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 223
Target Start/End: Original strand, 13319980 - 13320122
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13319980 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggt 13320079  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgttt 223  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13320080 ctggtttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtatgcgtgttt 13320122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15248787 - 15248535
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15248787 tgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 15248688  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || |||||||| || || || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||   ||| || ||  | | ||     
T  15248687 tgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaaacctgctgggatgatggtatcttta 15248588  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  15248587 gatgtactagagtggaaatgggacagcatatccatggattttgtgacgagttt 15248535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Original strand, 15015246 - 15015543
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||||| |||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||     
T  15015246 tgaagaagatgattatggaagaaattcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtt 15015345  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
    | | ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| | ||     
T  15015346 caggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacaccagaaacctgttgggatgttgacatcttta 15015445  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgga 379  Q
    ||| | || |||||||||||| | ||||| || |||||||| |||| ||||||  | || ||||| | ||| |||||| | ||||||||  |||||||    
T  15015446 gatattcccgagtggaagtgggatagtatatccatggattttgtgaagagtttgtcgaatactccaaaaggacatgatgcgatttggataattgtgga 15015543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 15347767 - 15347906
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15347767 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 15347866  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15347867 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 15347906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 15724456 - 15724695
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15724456 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 15724555  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  15724556 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 15724655  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15724656 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 15724695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 20061576 - 20061815
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20061576 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 20061675  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  20061676 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 20061775  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  20061776 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 20061815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 26791921 - 26792160
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  26791921 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 26792020  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  26792021 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 26792120  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26792121 gatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 26792160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 304 - 442
Target Start/End: Original strand, 15952669 - 15952807
Alignment:
Q  304 acagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacactt 403  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  15952669 acagcatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggctgacgaagtcggcacactt 15952768  T
Q  404 cattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  15952769 tattccgatcaatattgcttatccggtagctcagttggc 15952807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10006208 - 10006069
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  10006208 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 10006109  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  10006108 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 10006069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10906818 - 10906679
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  10906818 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 10906719  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  10906718 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 10906679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 15588914 - 15589153
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15588914 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 15589013  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  15589014 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 15589113  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  15589114 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 15589153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15209499 - 15209279
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  15209499 agtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgt 15209400  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||| || |||   ||| || ||  | | || |||||||| |||||||| ||| | || || ||    
T  15209399 attcctgtttgatttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatc 15209300  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  15209299 catggattttgtgacgagttt 15209279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 5424452 - 5424591
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  5424452 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 5424551  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  5424552 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 5424591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13253298 - 13253159
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  13253298 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 13253199  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  13253198 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 13253159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15339877 - 15339738
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15339877 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 15339778  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15339777 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 15339738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16636381 - 16636242
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16636381 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16636282  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  16636281 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 16636242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17490458 - 17490319
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17490458 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcttagtttgtgt 17490359  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  17490358 attcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatca 17490319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43163705 - 43163566
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  43163705 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 43163606  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  43163605 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 43163566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 16411804 - 16411943
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16411804 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16411903  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  16411904 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 16411943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 16491703 - 16491842
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  16491703 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaatttgttttggtggtccagattgtaacgcgacgttgcacagtttgtgt 16491802  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  16491803 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 16491842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6601344 - 6601105
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  6601344 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttttggtggtctagtttgaaacaagatgtggcacagtttgtgt 6601245  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| || || || ||||| || ||    ||| || ||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  6601244 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatc 6601145  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  6601144 gatggattttgtgacaagttttccgaatactccgagaggg 6601105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48426055 - 48425916
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  48426055 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 48425956  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |  | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  48425955 aatcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 48425916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 53384540 - 53384779
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  53384540 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 53384639  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | || |||  |||||||||||| || || || ||||| || ||    ||| || ||  ||| ||||||||  |||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  53384640 attcctgcttagtttgtcagaagtcaaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgtcggaatggaaatgggatagtatatc 53384739  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  53384740 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 53384779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 14876020 - 14876143
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  14876020 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 14876119  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagt 237  Q
    || | ||||||  || ||||||||    
T  14876120 attcctgtttagtttatcagaagt 14876143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 15402039 - 15402149
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15402039 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaatattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 15402138  T
Q  214 atgcatgttta 224  Q
    || | ||||||    
T  15402139 attcctgttta 15402149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9523327 - 9523107
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||  |  | ||||| || ||||| ||||||||||    
T  9523327 agtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctagactcaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 9523228  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||| ||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  9523227 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatgataccattagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 9523128  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  9523127 catggattttgtgacaagttt 9523107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 16806448 - 16806572
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  16806448 agtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 16806547  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  16806548 attcctgtttagtttgtcagaagtc 16806572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 16756107 - 16756346
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | || ||  | || ||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16756107 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagattttctgggggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16756206  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  ||||||| |||| || || || ||||| || ||    ||| || ||  ||| |||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  16756207 attcctgtttagtttgtcaggagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgctggaatggaaatgggatagtatatc 16756306  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16756307 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16756346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16692772 - 16692648
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || || || |||||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  16692772 agtagcttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcaggacttaaagaagattttctggtggtctggtttgaagcgagatgtggcgcagtttgtgt 16692673  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  16692672 attcctgtttagtttgtcagaagtc 16692648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16372020 - 16371882
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  16372020 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctgg-ttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 16371922  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16371921 attcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 16371882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12498856 - 12498602
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||| | || || || || |||||||    
T  12498856 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaatgcgatgtggcacaatttgtgt 12498757  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  || ||||||| || |||   ||  || ||  | |||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  12498756 attcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattaaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 12498657  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| |||| || ||||||    
T  12498656 tatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagagggaatgacacaatttgg 12498602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15062367 - 15062213
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||||  || |    
T  15062367 gaagagagtcataggagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacttgatg 15062268  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | ||  ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15062267 tggcatagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 15062213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 142
Target Start/End: Original strand, 13300000 - 13300061
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctac 142  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13300000 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctac 13300061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 142
Target Start/End: Original strand, 13310658 - 13310719
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctac 142  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13310658 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctac 13310719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 180
Target Start/End: Original strand, 14580455 - 14580530
Alignment:
Q  105 agtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14580455 agtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 14580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 14126116 - 14126240
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||    
T  14126116 agtagcttgagcattcaaccgggagctacgaagatgtatcaagatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtgacacagtttgtgt 14126215  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || |  |||||  ||||||||||||    
T  14126216 attcccgtttagtttgtcagaagtc 14126240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41972 - 41609
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41972 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtg 41873  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  41872 gtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 41773  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |    
T  41772 ttggatatgccggagtggaagtgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcg 41673  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41672 acaggttgatgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 41609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 56151 - 56514
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56151 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtg 56250  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  56251 gtccggtttgaagcgtgaagttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 56350  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| |||| || |    
T  56351 ttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttctatggatttggagccaagtttaccaaacacttcgagagggtatgatgctatatgggttgtggtcg 56450  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56451 acaggttgacgaagtcggcgcacttcattcctattaatattagttatccggtagcacagttggc 56514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33291
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |    
T  32942 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagc 33041  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33042 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 33141  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  33142 gtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaag 33241  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33242 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggc 33291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 81 - 443
Target Start/End: Original strand, 5589 - 5950
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  5589 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaa-aagctattttggtggt 5687  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5688 ccagtttgaaacgtgacgtagctcagtttgtgtatgcatgtttgtcttgttagaagtctaaagttgaatatcagaagcctacagggttgttgacaccgtt 5787  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  5788 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 5887  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggct 443  Q
      | |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5888 aggttgacaaagtcgacacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggct 5950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 442
Target Start/End: Original strand, 24098924 - 24099286
Alignment:
Q  80 gttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24098924 gttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 24099023  T
Q  180 tccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgt 279  Q
    ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  24099024 tccggtttgaagcatgatgttgctcattttgtttatgcttgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgt 24099123  T
Q  280 tggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgga 379  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||    
T  24099124 tagatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttgtgacaagtttaccgaacactacgagagggcatgatgctatttgggttattgtcga 24099223  T
Q  380 ccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24099224 caggttgacgaagtcggcacatttcattccaatcaatatcagttatccggtagcacagttggc 24099286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 31539317 - 31539680
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31539317 agttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 31539416  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  31539417 gtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 31539516  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  31539517 ttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 31539616  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31539617 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 31539680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20295449 - 20295088
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20295449 ttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggt 20295350  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20295349 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 20295250  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| || |||| |||    
T  20295249 ggatgtaccggactggaagtgggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttattgtcgac 20295150  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  20295149 cggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttactcggtagcacagttggc 20295088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 87 - 442
Target Start/End: Original strand, 20939391 - 20939746
Alignment:
Q  87 aagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20939391 aagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtt 20939490  T
Q  187 tgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20939491 tgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgt 20939590  T
Q  287 accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtg 386  Q
     ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||    
T  20939591 gccggagtggaagtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacgctccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttg 20939690  T
Q  387 acgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||| | ||||| ||| | || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20939691 acgaagtcgacgcactttatttcgattaatatcaattattcggtagctcagttggc 20939746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 102 - 442
Target Start/End: Original strand, 20835231 - 20835571
Alignment:
Q  102 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  20835231 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 20835330  T
Q  202 ctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtg 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20835331 ctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagatgtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 20835430  T
Q  302 gaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacac 401  Q
    | | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||  | |||| |||||| | ||     
T  20835431 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacatgttgacaaagtcgacgcat 20835530  T
Q  402 ttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20835531 tttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 20835571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 37678119 - 37677759
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37678119 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtg 37678020  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37678019 gtccggtttgaaaagggatgttgcttagtttgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 37677920  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  37677919 ttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtaactagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcg 37677820  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37677819 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagtt 37677759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 19662457 - 19662824
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19662457 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtg 19662556  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  19662557 gtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagagttgttgacaccg 19662656  T
Q  279 ttggatgt----accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgtt 374  Q
    ||||||||     ||||||||||||||| | || |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| ||||     
T  19662657 ttggatgtgccggccggagtggaagtggtatagcatttttatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatgtgggttgtg 19662756  T
Q  375 gtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662757 gtcgacaggttgacgaagtcggcacactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 19662824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19855344 - 19854989
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  19855344 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagaatagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtg 19855245  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  19855244 gtctgggttgaaacgggatattgctcaaattgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccg 19855145  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||      
T  19855144 ttggatgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggt-- 19855047  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
          |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19855046 ------tgacaaagtcggcgcactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggc 19854989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 20856082 - 20856444
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20856082 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggt 20856181  T
Q  181 ccggtttgaaacgag-acgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgt 279  Q
    | ||||| |||  || | || |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||    
T  20856182 ctggttttaaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttcacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgt 20856281  T
Q  280 tggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgga 379  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||    
T  20856282 tggaggtaccagagtggaaatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtaga 20856381  T
Q  380 ccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |  | ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20856382 caggttgacgaagtcggcgcacttcattctgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 20856444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 81 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21951946 - 21951678
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21951946 ttgaagaagttgatccttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggt 21951847  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  21951846 ccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 21951747  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgag 349  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21951746 ggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgag 21951678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 445
Target Start/End: Original strand, 22432600 - 22432802
Alignment:
Q  243 gttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaaca 342  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22432600 gttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaaca 22432699  T
Q  343 ctccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||||||||| || | || ||| |||| || ||   | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22432700 ctccgagagggcataattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggc 22432799  T
Q  443 tga 445  Q
    |||    
T  22432800 tga 22432802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21837954 - 21837715
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21837954 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 21837855  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||| || ||  ||| || || || || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  21837854 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 21837755  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21837754 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcccagaggg 21837715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 50619584 - 50619837
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  50619584 gaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatg 50619683  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    | || |||||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||   ||| |  ||  | | || |||||||| ||||||||    
T  50619684 tggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggattatggtatctttagatgtaccagagtggaa 50619783  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagg 352  Q
     ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  50619784 atgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagg 50619837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21831307 - 21831068
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21831307 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 21831208  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  21831207 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 21831108  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21831107 catggattttgtgacgagttttccaaatactcctagaggg 21831068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 33390384 - 33390523
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  33390384 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 33390483  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  33390484 attcctgtttagtttgccagaagtcgaaagttgagcatca 33390523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 41353017 - 41353156
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  41353017 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 41353116  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  41353117 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 41353156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20139834 - 20139580
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  20139834 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtct 20139735  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| | || |||   ||  || ||  | | || ||||| |  |||||||| ||| | ||||| ||    
T  20139734 attcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatc 20139635  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||    
T  20139634 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaatgacacaatttgg 20139580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 16349954 - 16350093
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16349954 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 16350053  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  16350054 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 16350093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19107387 - 19107233
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||  |||||||| ||||| |    
T  19107387 gaagagagccacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaagcgagatg 19107288  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  19107287 tggcacagtttgtgtattcatgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 19107233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 51332848 - 51332987
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  51332848 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 51332947  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  51332948 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 51332987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16373533 - 16373394
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||  | || |||||||    
T  16373533 agtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgacgtgacacaatttgtgt 16373434  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | || || | || | ||||||| |||||||| |||||    
T  16373433 attcttgcttgatttttaagaagtcgaaagttgagcatca 16373394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21749945 - 21749806
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || || |||||||    
T  21749945 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 21749846  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  21749845 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 21749806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 19760213 - 19760351
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  19760213 gaagagagtcacataagtagcttgagtatccatccaggagctataaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 19760312  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagt 237  Q
    | || |||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||    
T  19760313 tggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcaaaagt 19760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22110026 - 22109884
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||||||||    
T  22110026 agtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcacagtttgtgt 22109927  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaa 256  Q
    || | ||||| | |||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  22109926 attcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatcaaaa 22109884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22113875 - 22113733
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||||||||    
T  22113875 agtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcacagtttgtgt 22113776  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaa 256  Q
    || | ||||| | |||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  22113775 attcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatcaaaa 22113733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 253
Target Start/End: Original strand, 22361604 - 22361738
Alignment:
Q  119 cttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgca 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||| |     
T  22361604 cttgagtattcatccgggagctacgaagatctatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcatagtttgtgtattct 22361703  T
Q  219 tgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  22361704 tgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatca 22361738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20250805 - 20250667
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||  ||  ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20250805 agtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggt-tggactgaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 20250707  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | | ||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20250706 attcttatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 20250667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 16078011 - 16078135
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || | |||||| ||||||||| | || || || ||||||||||    
T  16078011 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgt 16078110  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||   |||||||||||    
T  16078111 attcctgtttagtctgtcagaagtc 16078135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21025177 - 21025076
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  21025177 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 21025078  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  21025077 at 21025076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 17044370 - 17044494
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||| ||| || ||  |||||||||    
T  17044370 agtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacaagatgtggcaaagtttgtgt 17044469  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | || |||  ||||||||||||    
T  17044470 attcctgcttagtttgtcagaagtc 17044494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16370030 - 16369973
Alignment:
Q  385 tgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  16370030 tgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatagctcagttggc 16369973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27314 - 26953
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27314 ttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 27215  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  27214 ccggtttgaaaagatatgttgctcattttgtttatgcttgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 27115  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||| |||    
T  27114 tgatgtaccgtagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctgtttgggttgttgtcgac 27015  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27014 cggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggc 26953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 323757 - 323396
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  323757 ttgaaaaagttaattttggaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 323658  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  323657 ccggtttgaagcgtgacgtcactcattttgtgtacgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcttgcagggttgttgacaccgtt 323558  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  323557 ggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 323458  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  323457 aagttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 323396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 442
Target Start/End: Original strand, 202727 - 203082
Alignment:
Q  87 aagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |    
T  202727 aagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccgcat 202826  T
Q  187 tgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    | |||||  | ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||| |||||    
T  202827 tcaaacgtaatgttgcacagtttgtatatgaatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacatcgttagatgt 202926  T
Q  287 accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtg 386  Q
     ||||||||||| | | | || || || |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     ||    
T  202927 gccggagtggaaataggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggtggttgttgatagattg 203026  T
Q  387 acgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  203027 acgaagtcggcacactttattccaatcaatattagttttccagtggctcagttggc 203082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118260
Alignment:
Q  243 gttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaaca 342  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  118459 gttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttacctaaca 118360  T
Q  343 ctccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  118359 ctccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacatgttgatgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 118260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 81085 - 81444
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  81085 ttgaaaaagttgattcttgaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggt 81184  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  81185 ccggtttgaaatgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtgagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 81284  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  81285 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 81384  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttg 440  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  81385 aggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttg 81444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 41584 - 41947
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41584 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 41683  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  41684 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 41783  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |    
T  41784 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcg 41883  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41884 accggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggc 41947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 46652 - 47013
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  46652 ttgaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacaaaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 46751  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  46752 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgaagggttgttgacaccgtt 46851  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||  ||    
T  46852 ggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcaac 46951  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  46952 aggttgacgaagtcggcgcattttattccgattaatatcaattatccgatagcttagttggc 47013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2934 - 2721
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  2934 agtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 2835  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | ||||||       |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || |||||||| || ||||| ||| | || || ||    
T  2834 attcctgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagaatggaaatgggatagcatatc 2742  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
      ||||||| |||||||||||    
T  2741 cgtggattttgtgacgagttt 2721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 96 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 40776 - 40430
Alignment:
Q  96 ttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |    
T  40776 ttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaaacgtg 40677  T
Q  196 acgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtg 295  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  40676 atgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtg 40577  T
Q  296 gaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcg 395  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | |||||||||||    
T  40576 gaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcg 40477  T
Q  396 gcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40476 gcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggc 40430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 57100 - 57464
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  57100 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggt 57199  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  57200 ccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 57299  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||    
T  57300 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgac 57399  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  57400 aggttgacgaagtcggcgcacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 57464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 48285 - 48648
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  48285 agttgaaaaagttgattttggaagaaagccataggagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 48384  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||  | |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  48385 gtctaggttgaaacctgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 48484  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||| | || |||||||||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48485 ttagatatgccagagtggaagtgggacaacatttccattgattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttggattgttgtcg 48584  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | |||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  48585 ataggttgacgaagtcggcaaactttcttccgatcaatattagttttccgatagctcagttggc 48648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 81 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20447 - 20096
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20447 ttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggt 20348  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20347 ccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 20248  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||    
T  20247 agatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgacatttgggttattgtcgac 20148  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtag 432  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20147 aggttgacgaaatcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtag 20096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 81 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23267 - 22916
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23267 ttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggt 23168  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23167 ccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 23068  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||    
T  23067 agatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgacatttgggttattgtcgac 22968  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtag 432  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22967 aggttgacgaaatcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtag 22916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20175 - 19812
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20175 agttgaaaaagttgattttagaagagagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctactaatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtg 20076  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20075 gtccggtttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 19976  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || |    
T  19975 ttggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaaagggcatgatgctatatgggttgtggtcg 19876  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19875 acaggttgacaaagtcggcgcacttcattcctattaatatcagttatctcgtagctcagttggc 19812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 75557 - 75513
Alignment:
Q  135 ggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  75557 ggagcgacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtgg 75513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 79 - 433
Target Start/End: Original strand, 15964 - 16318
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964 agttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 16063  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16064 gtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatggctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 16163  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||| |    
T  16164 ttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcataacgctatttgggttgttgtcg 16263  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagc 433  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16264 accggttgacaaagtcggcacacttcattcctatcaatatcaattatccggtagc 16318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2629 - 2280
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  2629 attttagaggaaagtcacaagagtagcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaaaa 2530  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  2529 gtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgttgggtttttgacaccgtttgatgtgccgga 2430  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   | ||||||||    
T  2429 gtggaagtgggacagtatttctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaag 2330  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329 tcggcacactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 51433 - 51797
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51433 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggt 51532  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  51533 ctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 51632  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  51633 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 51732  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51733 aggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 51797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 60467 - 60831
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  60467 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggt 60566  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  60567 ctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 60666  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  60667 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 60766  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  60767 aggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 60831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 66855 - 67219
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  66855 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggt 66954  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  66955 ctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 67054  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||     
T  67055 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgat 67154  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  67155 aggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 67219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26453 - 26389
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaa 145  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26453 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaa 26389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 194957 - 195315
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  194957 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggt 195056  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  195057 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctacagggttgttgacaccgtt 195156  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  195157 ggatgtgccggagtggaagttggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 195256  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
      | |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  195257 aggttgacaaagtcggcgcactttattccgattaatatcatttatccggtagctcagtt 195315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 149623 - 149263
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  149623 ttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 149524  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  149523 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaatgttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 149424  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| | |||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||    
T  149423 ggatgtgctggagtgtaattgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttactgaacactccgagagggcatgattccatatgggttgtggtcgac 149324  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
      | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  149323 aggttgacgaagtcggcacatttcattccgattaatatcagttatccggtagctcagttgg 149263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Original strand, 25819 - 26063
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||||||||    
T  25819 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacacgatgtggcacagtttgtgt 25918  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || | |  ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||| | || || ||    
T  25919 attcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacttgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatggcatagcatatc 26018  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||| ||||    
T  26019 catggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaatga 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 6491 - 6852
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6491 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 6590  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  6591 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgct 6690  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  6691 ggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 6790  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6791 aggttgacgaagtcggcgcactttattctgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 6852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 13552 - 13913
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13552 ttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 13651  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  13652 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgtt 13751  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  13752 ggatgtaccagagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 13851  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13852 aggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaacatcagttatccggtagctcagttggc 13913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 6266 - 5902
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  6266 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggt 6167  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  6166 ccagtttgaagcgagatgtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggtttgttgacaccgtt 6067  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||    
T  6066 ggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgac 5967  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5966 aggttgacgaagtcggcgcacttcattcctattaacattagttatcctgtagctcagttggctga 5902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 917 - 556
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  917 ttgaaaaagttagttttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggt 818  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  817 ccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgtt 718  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| |||| || |||    
T  717 ggatgtgccgaagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagagggcatgatactatatgggttgtggtcgac 618  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     || ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  617 aagttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatctggtagctcagttggc 556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3804 - 3443
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3804 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttagtggt 3705  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3704 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgtt 3605  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  3604 ggatgtggcggaatggaagtgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgac 3505  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3504 aggttgacgaagtcggcacattttattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggc 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5445
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5803 ttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggt 5704  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  5703 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 5604  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| || || ||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  5603 agatgtgccagactggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaataatacgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgac 5504  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
      | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5503 aggttgacgaagttggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagctcagtt 5445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 25118 - 25479
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  25118 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggt 25217  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||    
T  25218 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggtttttgacaccgtt 25317  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  25318 ggatgtgccggagtggaagtgggaaaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggttgac 25417  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | |||||||||| || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25418 aggttgacgaagtcagcgcactttattccaattattatcagttatccggtagctcagttggc 25479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8113 - 7753
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8113 ttgaaaaagttaattttagaggagagtcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggt 8014  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8013 ccagtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 7914  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  7913 ggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctctggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgac 7814  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
     || ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7813 aagttgatgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatctggtagctcagttgg 7753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 2608 - 2969
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2608 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 2707  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  2708 ccggtttgaagcgtgatgtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacataagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 2807  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| | || | | ||||| | |||    
T  2808 agatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatgaattttgtgacgagtatagcaaacactccaagagggcacgatgctatataggttgttatcgac 2907  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  2908 aggttgacgaagtcggcgcacttcattcctattaatatcagttatctggtagcatagttggc 2969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 100800 - 101166
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtatt---catcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttg 175  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  100800 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattattcatctgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 100899  T
Q  176 gtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgaca 275  Q
    |||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  100900 gtggtctgatttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgaca 100999  T
Q  276 ccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |    
T  101000 ccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtgacgagtttgccaaacactccaagagggcatgatgccatttgggtcgtgg 101099  T
Q  376 tggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | ||   | |||||||||||||||| || || || || ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  101100 tagataggttgacgaagtcggcacattttatcccgataaatattagttttctggtagctcagttggc 101166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 181219 - 181095
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  181219 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 181120  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | |||||   ||||||||||||    
T  181119 attcctgtttggtttgtcagaagtc 181095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 22629 - 22988
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22629 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 22728  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  22729 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgctgggttgttgacaccgtt 22828  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  22829 ggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgac 22928  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttg 440  Q
      | |||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22929 aggttgacgaagtcggcacaatttattccgatcaatcttagttatccggtagctcagttg 22988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 81 - 440
Target Start/End: Original strand, 14450 - 14809
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14450 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggt 14549  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  14550 ctgggttgaaacgtgatgttactaagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgtt 14649  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  14650 ggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgac 14749  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttg 440  Q
      | |||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14750 aggttgacgaagtcggcacaatttattccgatcaatcttagttatccggtagctcagttg 14809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28280 - 27917
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  28280 agttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtg 28181  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  28180 gtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcacggttgttgacaccg 28081  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| |    
T  28080 ttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagaggacatgatgccatttgggtggttgtcg 27981  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27980 acaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccgttagctcagttggc 27917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21036 - 20678
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  21036 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgt 20937  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20936 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagttggtgtatgcgtgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgtt 20837  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  20836 ggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttatgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgattccatttgggttgttgttgac 20737  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736 aggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttacccggtagctcagtt 20678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 336
Target Start/End: Original strand, 11311 - 11565
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11311 tgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtc 11410  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  11411 cggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttg 11510  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttac 336  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11511 gatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 336
Target Start/End: Original strand, 15081 - 15335
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15081 tgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtc 15180  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15181 cggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttg 15280  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttac 336  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15281 gatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Original strand, 12873 - 12975
Alignment:
Q  340 acactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12873 acactcctagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagtt 12972  T
Q  440 ggc 442  Q
    |||    
T  12973 ggc 12975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Original strand, 16643 - 16745
Alignment:
Q  340 acactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16643 acactcctagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagtt 16742  T
Q  440 ggc 442  Q
    |||    
T  16743 ggc 16745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 51116 - 51477
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  51116 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtaacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggt 51215  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  51216 ctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 51315  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||     
T  51316 agatgtgccagagtggaagtgggacagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaaggcatgatgccatttgggttgttgtcgat 51415  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  51416 aggttgacgaagtcgtcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 51477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 12039 - 12402
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12039 ttgaaaaagttaattttagatgaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggt 12138  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
     |||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||  |||||||||||| |||||    
T  12139 tcggtttgaattgtgatgtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgac-ccgtt 12237  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||    
T  12238 ggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgattttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgac 12337  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
      | ||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12338 aggttgacgaagtcgacgcacttcattggtatcaacatcaattatccggtagctcagttggctga 12402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3846 - 3483
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3846 agttgaaaaagtttattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 3747  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3746 gtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagactaaggttgagcatcagaagcctgtagggttgttgacaccg 3647  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||| |    
T  3646 ttagatgtgccggagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacactcccagagggcgtgatgccatttgggtggttgtcg 3547  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3546 ataggttgacaaagtccgcgcactttattccgatcaatattagttatccgatagctcagttggc 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7392 - 7172
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||    
T  7392 agtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtccgaattgaaacgtgacgttgcacaatttgtgt 7293  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |||   ||  || ||  | |||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  7292 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcaaaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 7193  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  7192 catggattttgtgacgagttt 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27579 - 27217
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27579 agttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 27480  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |    
T  27479 gtccggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacactg 27380  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  27379 ttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 27280  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    |   | |||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27279 ataggttgacgaagtcagcgcattttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 27217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 10710 - 11071
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10710 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 10809  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  10810 ccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgtt 10909  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  10910 ggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtctacctaacactccgagagggcatgatgcgatatgggttgtggtcgac 11009  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     |  |||| |||| ||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11010 aaattgacaaagttggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 20924 - 21285
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20924 ttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 21023  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    || ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  21024 ccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgtt 21123  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  21124 ggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtctacctaacactccgagagggcatgatgcgatatgggttgtggtcgac 21223  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     |  |||| |||| ||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21224 aaattgacaaagttggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26826 - 26761
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  26826 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcatgatttgaagaggttgttttggtgg 26761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 445
Target Start/End: Original strand, 48459 - 48824
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  48459 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcataagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggt 48558  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaac-ttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgt 279  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||   | |  ||   ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  48559 ccggtttgaaacgtgacgtagctcagtttgaaaaagtttgaaaaaagttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgcatggttgttgacaccgt 48658  T
Q  280 tggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgga 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||    
T  48659 tggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttagtgacaagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcga 48758  T
Q  380 ccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
       | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48759 taggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatctggtagctcagttggctga 48824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32464 - 32102
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgtttt-ggtgg 179  Q
    ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32464 ttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgtttttggtgg 32365  T
Q  180 tccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgt 279  Q
    || || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  32364 tctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaatcctgtagggctgttgacaccgt 32265  T
Q  280 tggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgga 379  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  32264 tggatgtgcaggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtttttga 32165  T
Q  380 ccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
       | | || |||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32164 taggttaacaaagtcggtgctctttattccaatcaatatcagttatccggtagctcaattggc 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15002 - 14920
Alignment:
Q  171 ttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| || ||||| |||||    
T  15002 ttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgagcatca 14920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 113600 - 113251
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||  ||||||| |    
T  113600 attttggaagaaagtcacaagaatagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagc 113501  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  113500 gtgatgttgcttagtttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 113401  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  113400 gtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagaggacatgattcaatatgggttgtagtcgatagattgacgaag 113301  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| | |||| || ||||||||    
T  113300 tcggcgcactttattccaataaatatcagttttacggtggcgcagttggc 113251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 84 - 442
Target Start/End: Original strand, 95258 - 95616
Alignment:
Q  84 aagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |    
T  95258 aagaagttaattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctg 95357  T
Q  184 gtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttgga 283  Q
    |||||||    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   ||| |||||||||||||||||    
T  95358 gtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttgga 95457  T
Q  284 tgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccag 383  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| | || ||| ||||||| |||  |    
T  95458 tgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacccaataccccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgacagg 95557  T
Q  384 gtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  95558 ttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatataagttacccagtagctcagttggc 95616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 109097 - 109236
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  109097 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 109196  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  109197 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 109236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 81 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10846 - 10486
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10846 ttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacagaagtagcctaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggt 10747  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |  | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10746 ctaggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 10647  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||| | || |||||||||||| | || ||||  |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||     
T  10646 agatatgccagagtggaagtgggatagcattttcatggattttgtgacgagtttaccgaatagtccgagagggcatgatgtcatttgggttgttgtcgat 10547  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
      | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10546 aggttgacgaagtcggcacactttattccaatcaatattagttttccggtagctcagttgg 10486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19901 - 19541
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19901 tgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtc 19802  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
    |||||||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||     
T  19801 cggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccttta 19702  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||| || || ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||      
T  19701 gatgtgccagaatggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatgatgctatttgggttgtggtggata 19602  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     | |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19601 ggttgacgaagtcagcgcactttattccgatcaatataagttttccggtagctcagttggc 19541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24063 - 23703
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24063 tgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtc 23964  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
    |||||||||  | || |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||     
T  23963 cggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccttta 23864  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||| || || ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||      
T  23863 gatgtgccagaatggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatgatgctatttgggttgtggtggata 23764  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     | |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23763 ggttgacgaagtcagcgcactttattccgatcaatataagttttccggtagctcagttggc 23703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Original strand, 1223 - 1586
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1223 agttgaaaatgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 1322  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  1323 gtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacacca 1422  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |    
T  1423 ttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttatgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgctgtcg 1522  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  1523 ataggttgacgaagtaggcacattttattccgatcaatattagttttccggtagcttagttggc 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5485 - 5122
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||  ||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5485 agttgaaaaagtcgattttggaagaaatacacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtg 5386  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5385 gtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 5286  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| ||  ||||||||||| |||  || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  5285 ttagatgtgccatagtggaagtgggacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 5186  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |   | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  5185 ataggttgacgaagtcggcacattttattccgatcaatattagttttccgatagctcagttggc 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 575
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  936 ttgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 837  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | ||||||||    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||  ||| |||||||| |||||    
T  836 ctggtttgaagaaggatgtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacgccgtt 737  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||| |||| || |||    
T  736 ggatgtaccggagtggaaatgggacaacatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccaagagggcatgattctatatgggttgtggtcgac 637  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  636 aggttgacgaaatcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 442
Target Start/End: Original strand, 49779 - 50128
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |    
T  49779 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagc 49878  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49879 gtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 49978  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaag 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||| | || ||| |||| || ||     ||||||||    
T  49979 gtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacataatactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaag 50078  T
Q  393 tcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  50079 tcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggc 50128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9509 - 9355
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  9509 gaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 9410  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  9409 tggcacagtttgtgtattcctgtctagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 9355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15971 - 15817
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  15971 gaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 15872  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||  ||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  15871 tggcacagtttgtgtattcctgactagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44189 - 44035
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  44189 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 44090  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  44089 tggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 44035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 178
Target Start/End: Original strand, 887 - 966
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  887 gaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 445
Target Start/End: Original strand, 400 - 766
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||  |||||| | ||||||||||    
T  400 agttgaaaaagttgattttcgaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatgacctgaagagattgttttggtg 499  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  500 gtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccg 599  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || ||||| |||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  600 ttagatgtgccagagtgaaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttactgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcg 699  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    |   | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  700 ataggttgacgaagtcggcacattttattccgatcaatattagttttctggtagctcaattggctga 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28270 - 28173
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  28270 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 28173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34523 - 34426
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  34523 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29112 - 28750
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29112 agttgaaaaagttgattttggaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 29013  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || | ||||||  ||||||||| |||| |    
T  29012 gtctgggttgaaacgtgatgttgcttagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagaattagaagcctgcagggttgttaacactg 28913  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgg 378  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||      
T  28912 ttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtct 28813  T
Q  379 accaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    |   | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28812 ataggttgacgaagtcggcacattttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 28750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29965 - 29826
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||   |||||| || ||| || |||||||| || |||||  |||||||||    
T  29965 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaggttgtttttgtcgtctggattgaaacgcgatgttgcagagtttgtgt 29866  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  29865 attcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgaccatca 29826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 102 - 442
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6851
Alignment:
Q  102 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  6510 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 6609  T
Q  202 ctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtg 301  Q
    |||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||  | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  6610 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 6709  T
Q  302 gaacagtatttctatgga-tttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcaca 400  Q
    | |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||   | |||| |||||||| ||    
T  6710 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcgca 6809  T
Q  401 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6810 ctttattctgatcaatgttagttatccggtagctcagttggc 6851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 102 - 442
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11282
Alignment:
Q  102 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  10941 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 11040  T
Q  202 ctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtg 301  Q
    |||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||  | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11041 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 11140  T
Q  302 gaacagtatttctatgga-tttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcaca 400  Q
    | |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||   | |||| |||||||| ||    
T  11141 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcgca 11240  T
Q  401 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11241 ctttattctgatcaatgttagttatccggtagctcagttggc 11282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 442
Target Start/End: Original strand, 6322 - 6650
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |    
T  6322 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacaatttctat 6421  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| || ||    
T  6422 aggcatgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatgagaagcctgcaggattgttgacaccgttagattttccagagtggaagtgggacagcatctc 6521  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatc 413  Q
     |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   | ||||||||||||| || || || || |||    
T  6522 catggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcgcattttatcccgatc 6621  T
Q  414 aatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6622 aatattagttttccggtagctcagttggc 6650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 442
Target Start/End: Original strand, 17843 - 18151
Alignment:
Q  134 gggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcag 233  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  17843 gggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagatgttgttttggtggtctgggttaaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgttag 17942  T
Q  234 aagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtt 333  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||  | ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17943 aagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttagatgtggcagagtgaaagtgggacagcatttccatggatttcgtaacgagtt 18042  T
Q  334 taccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagc 433  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18043 taccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaagttgacaaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccagtagc 18142  T
Q  434 tcagttggc 442  Q
    |||||||||    
T  18143 tcagttggc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 79 - 376
Target Start/End: Original strand, 313 - 609
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  313 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtg 412  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  413 gtccggtttgaaacgtgacgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcatgca-ggttgttgacaccg 511  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgt 376  Q
    || |||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  512 ttagatgtacctgagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgagagggcatgacaccattagggttgttgt 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 922 - 561
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  922 ttgaaaaagttgattttggtagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggt 823  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
      || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  822 ttgggttgaaacgtgatgttgctcagttcgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 723  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||| | ||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||  | |||| ||     
T  722 agatttgccaaagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactctgagagggcatgatgccatttgggattttgtcgat 623  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
      | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  622 aggttgacgaagtcgacacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttggc 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Original strand, 7398 - 7654
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7398 ttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggt 7497  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7498 ccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgagttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 7597  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttacc 337  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7598 ggatgtactggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacc 7654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 486 - 845
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcatttt-agaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  486 ttgaagaagttgatttttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtgg 585  T
Q  180 tccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgt 279  Q
    || ||||||||    || || |||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||    
T  586 tctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttatcggaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgt 685  T
Q  280 tggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtgga 379  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||    
T  686 tggaagtaccagagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtaga 785  T
Q  380 ccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    |  | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  786 caggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagtt 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 79 - 368
Target Start/End: Original strand, 24323 - 24611
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24323 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtataatgacttgaagaaattgttttggtg 24422  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  24423 gtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcttgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccg 24522  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||| | |||| ||| |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24523 ttagatgtgccgaagtggaaatgggatagta-ttccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggcatgataccatttgg 24611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 195 - 442
Target Start/End: Original strand, 891 - 1138
Alignment:
Q  195 gacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagt 294  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  891 gacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagt 990  T
Q  295 ggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtc 394  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||||||||||    
T  991 ggaagtgggacctaatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtc 1090  T
Q  395 ggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 ggcacactatattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 1138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Original strand, 802 - 887
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaag 164  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  802 agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaag 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13078 - 12939
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13078 agtaacttgagtattcaccctggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggttgtctggactgaaacgagatgttgcacagttcgtgt 12979  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  12978 attcttgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 12939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7040 - 6922
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | |||    ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  7040 agtagcttgagtattcatccaggagctacgaagatgtaccacgatctaaagt---tgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgt 6944  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaa 235  Q
    || | ||||| | |||||||||    
T  6943 atacttgtttgatttgtcagaa 6922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 6876
Alignment:
Q  120 ttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    || || |||| |||||| |||||||    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtatatgcat 7099  T
Q  220 gtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatgga 319  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  7098 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggaaagttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 6999  T
Q  320 tttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatc 419  Q
    ||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || |||  | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  6998 ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattccatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatc 6899  T
Q  420 agttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6898 agttatccggtagctcagttggc 6876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 93 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13241 - 12996
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcaggga-gctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggt-ggtccggtttgaa 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13241 attttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggaagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaa 13142  T
Q  191 acgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccg 290  Q
     || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13141 gcgtgatgtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccg 13042  T
Q  291 gagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttac 336  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13041 gagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 12996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11682 - 11580
Alignment:
Q  340 acactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagtt 439  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||| |||| || |||  | ||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11682 acactcctagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagtt 11583  T
Q  440 ggc 442  Q
    |||    
T  11582 ggc 11580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 322
Target Start/End: Original strand, 20694 - 20935
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  20694 ttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatctatcttgatttgaagaagcttttttggtggt 20793  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    | || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20794 ctgggttgaagcgtgatgttgctcagtttgtctatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtt 20893  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggattt 322  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  20894 ggatgtgccggagtggaaatgggacagcatttctatggattt 20935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Original strand, 10059 - 10339
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10059 agttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctaaaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtg 10158  T
Q  179 gtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccg 278  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||     
T  10159 gtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacacca 10258  T
Q  279 ttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 359  Q
    || ||||| || || ||||| ||| | || || || ||||| || || || ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  10259 ttagatgtgccagaatggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccaaatacctcgagagggcatgat 10339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18404 - 18055
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttgg-t 177  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  18404 agttgaaaaagttgattctggaagaaagtaacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatcatttgaagaaattgtttttgat 18305  T
Q  178 ggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacacc 277  Q
    |||  || |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  18304 ggtttgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgagcatcagaagccttcagggttgttgactcc 18205  T
Q  278 gttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtg 377  Q
    ||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||        
T  18204 gttagatgtgccagagtggaagtgggacatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgtgagagcatgatgccatttgggttgt---- 18109  T
Q  378 gaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagt 438  Q
           ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18108 -------tgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccagtagctcagt 18055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 163 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 48095 - 47817
Alignment:
Q  163 agaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctat 262  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||     
T  48095 agaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtttatgcatgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctac 47996  T
Q  263 agggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatacc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||    
T  47995 agggttgttgaccccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaggccctgatgcc 47896  T
Q  363 atttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttgg 441  Q
    |||||| ||||||| ||   | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47895 atttgggttgttgtcgataggttgactaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttgg 47817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 48159 - 48095
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctaca 143  Q
    ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48159 agttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctaca 48095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 11691 - 11458
Alignment:
Q  212 gtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||    
T  11691 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgggataacatt 11592  T
Q  312 tctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattccta 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||| |||| || ||   | |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11591 tctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggtttgattctatatggtttgtggtcgataggttgacaaagtcggtacacttcattccta 11492  T
Q  412 tcaatatcagttatccggtagctcagttggctga 445  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11491 ttaacatcagttatccggtagctcagttggctga 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11786 - 11690
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggt 177  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  11786 ttgaaaaagttgatcttagaagaaagtcataagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 40012 - 40373
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40012 ttgaaaaagttgattttagaagatattcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatttatcatgacttgaagaaattgttttggtggt 40111  T
Q  181 ccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgtt 280  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || | |   |||||||||||||| ||    
T  40112 ccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaaacttgctgggttgttgacaccatt 40211  T
Q  281 ggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggac 380  Q
     ||||| || |||||||| ||| | || || || |||||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||     
T  40212 agatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaaggggacatgataccatttgggtagttgttgat 40311  T
Q  381 caggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
        ||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  40312 agattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttccggtggctcagttggc 40373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 442
Target Start/End: Original strand, 28093 - 28382
Alignment:
Q  153 catgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatc 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28093 catgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatc 28192  T
Q  253 aaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagg 352  Q
    | || | |   |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | || || || |||||||| || || |||||||| || ||||| || ||    
T  28193 agaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagggg 28292  T
Q  353 gcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     ||||||||||||||| | ||||| ||     ||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  28293 acatgataccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttccggtggctcagttggc 28382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3211 - 3024
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  3211 gaagaatgtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatg 3112  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  3111 ttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgt 3024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2715 - 2486
Alignment:
Q  213 tatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtattt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||  ||||    
T  2715 tatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtagaagtgggacaacattt 2616  T
Q  313 ctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctat 412  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| |||  | ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  2615 ccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcacgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcaacacactttattccgat 2516  T
Q  413 caatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2515 caataatagttatccggtagctcagttggc 2486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 292
Target Start/End: Original strand, 945 - 1150
Alignment:
Q  87 aagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtt 186  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || |    
T  945 aagttgattctagaagaaagtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggt 1044  T
Q  187 tgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  1045 tgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgcagggttgttgacaccgttagatgt 1144  T
Q  287 accgga 292  Q
     |||||    
T  1145 gccgga 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 287 - 437
Target Start/End: Original strand, 2336 - 2486
Alignment:
Q  287 accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtg 386  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||   | |     
T  2336 accggagtggaagtgggacggcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgataggtta 2435  T
Q  387 acgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcag 437  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2436 acgaagtcggcacactttattccaattaatatcaattatccggtagctcag 2486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Original strand, 25006 - 25333
Alignment:
Q  115 gtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgta 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||    
T  25006 gtagcttgagtattcattagggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgta 25105  T
Q  215 tgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttct 314  Q
    | ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||| | ||     
T  25106 ttcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgttgggttgttgacaccgttagatgtgccgtagtggaaatgggatagtgtatcc 25205  T
Q  315 atggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatca 414  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| |  |||||||     ||||||||||||| || |||||||| || |    
T  25206 atggattttgtcacgagtttgccgaatactccaagagggcatgacgctatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggctcatttcattccaatta 25305  T
Q  415 atatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | ||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  25306 acatcagttttcttgtatctcagttggc 25333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34229 - 34024
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |    
T  34229 attttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagc 34130  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    | || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34129 gtgatgttgctcaatttttttatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaatcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccgga 34030  T
Q  293 gtggaa 298  Q
    ||||||    
T  34029 gtggaa 34024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 2582 - 2741
Alignment:
Q  80 gttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  2582 gttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtgg 2681  T
Q  180 tccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtct 239  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2682 tccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtct 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4823 - 4582
Alignment:
Q  87 aagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtt 186  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||  | |    
T  4823 aagttgattttagaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccgggagctaaaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtcttggt 4724  T
Q  187 tgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgt 286  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  4723 tgaaacgtgatattgctcagtttttttatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgt 4624  T
Q  287 accggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgac 328  Q
     || |||||||||||| | || || || |||||||| |||||    
T  4623 gccagagtggaagtggtatagcatatccatggattttgtgac 4582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 115054 - 114877
Alignment:
Q  265 ggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccat 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  115054 ggttgttgacaccgttggatgtgctggagtggaagtggaatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctat 114955  T
Q  365 ttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     ||| |||| || |||    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  114954 atgggttgtggttgacagattgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggc 114877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 89698 - 89808
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  89698 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 89797  T
Q  181 ccggtttgaaa 191  Q
    | || ||||||    
T  89798 ctgggttgaaa 89808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 90376 - 90486
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggt 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  90376 ttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 90475  T
Q  181 ccggtttgaaa 191  Q
    | || ||||||    
T  90476 ctgggttgaaa 90486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 253
Target Start/End: Original strand, 390489 - 390625
Alignment:
Q  117 agcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||     
T  390489 agcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtatt 390588  T
Q  217 catgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  390589 cttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 390625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1943 - 1600
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| || |    
T  1943 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctaggttgaaacgtgatg 1844  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    |  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||| |  || |||||    
T  1843 tgacacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgctagaatggaa 1744  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggca 398  Q
     ||| | ||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||  | |||||| |  |||||||     |||||||||||||     
T  1743 atgggatagtatatacatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagaggacatgacgctatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggct 1644  T
Q  399 cacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    || |||||||  || || ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  1643 catttcattctgattaacatcagttttcctgtatctcagttggc 1600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15912 - 15653
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15912 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctactaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgagacg 15813  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    | || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| || |||  ||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||    
T  15812 tggcacagtttgtgtattactgtttgatttgtcagaagtcaaaagttcagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccatagtggaa 15713  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     ||| | || || || |||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||| ||||    
T  15712 atgggatagcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactacgagagggaatga 15653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 112774 - 112913
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || || |||||||    
T  112774 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 112873  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  112874 attcttgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 112913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 368
Target Start/End: Original strand, 4863 - 5131
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| |    
T  4863 gaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgatttgaagaagttattttggtggtccgggttaaagcgagatg 4962  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||   |||||||||||||| || ||| | || ||||||||    
T  4963 ttgcacaatttgtgtatgcatgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgaacatcacaaaacttctgggttgttgacacctttagatattccagagtggaa 5062  T
Q  299 gtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
    |||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||  ||||| |||||| | ||||||    
T  5063 gtgggatagtatatc-atggattttgtgacgagtttgccgaatactcaaagaggacatgatgcgatttgg 5131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4891 - 4671
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| || || ||  |||||||||    
T  4891 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgt 4792  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| || || ||    
T  4791 attcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaaatagaatagcatatc 4692  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  4691 catggattttgtgacgagttt 4671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12021 - 11801
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| || || ||  |||||||||    
T  12021 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgt 11922  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| || || ||    
T  11921 attcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaaatagaatagcatatc 11822  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  11821 catggattttgtgacgagttt 11801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 334
Target Start/End: Original strand, 17231 - 17483
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17231 tgaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 17330  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || |||||||| || || || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||  | | ||     
T  17331 tgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaaaaacctgttgggttgatgctatcttta 17430  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  17431 gatgtgccagagtggaaatgcaatagtatatccatgaattttgtgacgagttt 17483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Original strand, 14333 - 14599
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14333 tgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 14432  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || |||||||  || ||  | |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||  |||| || ||| | |||||| ||||||| ||     
T  14433 tgggttgaaacatgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgatttgttagaagtcaaaagttgagtatcagaaacctgttgggttgatgacaccttta 14532  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccga 348  Q
    ||||| || |||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  14533 gatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggaatttgtgacgagtttgccgaatactccga 14599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 331
Target Start/End: Original strand, 218703 - 218920
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||     
T  218703 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtga 218802  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||| ||| | || || ||    
T  218803 attcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacaccattagatataccagagtggaaatgggatagcatatc 218902  T
Q  314 tatggatttcgtgacgag 331  Q
     |||||||| ||||||||    
T  218903 catggattttgtgacgag 218920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 230095 - 229924
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||    
T  230095 tgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttggtttggtggtc 229996  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
     || |||||||| || || || || ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  229995 tggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaaaattgagcatca 229924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 334
Target Start/End: Original strand, 116159 - 116411
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  116159 tgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtc 116258  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || |||||||| || || || |||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||| || |||    ||||| ||||||| ||     
T  116259 tgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcatgtttgatttctcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctaggttgatgacaccttta 116358  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    || || || |||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  116359 gaagtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 116411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 309 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 49597 - 49464
Alignment:
Q  309 atttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattc 408  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  49597 atttctatggattttgtggcgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaagttgacgaagtcggcgcacttcattc 49498  T
Q  409 ctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49497 cgattaatatcagttaaccggtagctcagttggc 49464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17701 - 17457
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||  | |||||| | || || || ||||||||||    
T  17701 agtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaatgcgatgtggcacagtttgtgt 17602  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| ||| | || || ||    
T  17601 attcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatc 17502  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  17501 catggattttgtgacgagtttgccgaacactccgaaagggaatga 17457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 333
Target Start/End: Original strand, 85784 - 86023
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaac 192  Q
    ||||| |||||||||||||  || |  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| |    
T  85784 attttggaagaaagtcacataagcaatttgagtatttatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattt-ggtggtccgggttgaagc 85882  T
Q  193 gagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccgga 292  Q
    |||| || || || |||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||| ||  |    
T  85883 gagatgtggcacaatttgtgcatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttccaaa 85982  T
Q  293 gtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtt 333  Q
    |||||||||| | | ||| || |||||||| ||||||||||    
T  85983 gtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagtt 86023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4190 - 3916
Alignment:
Q  84 aagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccg 183  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4190 aagaagatgattttggaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctg 4091  T
Q  184 gtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttgga 283  Q
    | |||||||| || || || || ||| | ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||  |||| || ||||||| || ||    
T  4090 ggttgaaacgtgatgtggcacaatttatttattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggctgatgacacctttaga 3991  T
Q  284 tgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 358  Q
    ||| || |||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| ||||    
T  3990 tgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttttcgaacactccgaaagggaatga 3916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 59807 - 59521
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||||    
T  59807 tgaagaagatgattatggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattttaagaagttattttggtggtc 59708  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
    ||| ||||| ||| | || || || |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||| || || ||||  |||||||||||||| ||     
T  59707 cgggttgaagcgacatgtggcacaatttgggtatgcgtgtttaatttgtcagaagttaaaagatgaacaccagaaacctactgggttgttgacaccttta 59608  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttgg 368  Q
    ||| | |  |||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||| | ||||||    
T  59607 gatattcgagagtggaagtgggatagtatatccatggattttgtgacgattttgccaaatactccaaaaggacatgatgcgatttgg 59521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 375
Target Start/End: Original strand, 3743 - 4004
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| || || || || |||||||    
T  3743 agtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 3842  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||| || ||  | | || ||||| || |||||||| ||| | || || ||    
T  3843 attcctgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgttgggatgatggtatctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatc 3942  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttg 375  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||| |||| || |||||||||||||    
T  3943 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttggattgttg 4004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 131122 - 131003
Alignment:
Q  119 cttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgca 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||| |     
T  131122 cttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcaaagtttgtgtattct 131023  T
Q  219 tgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  131022 tgtttgatttgtcagaagtc 131003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 28658 - 28702
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgat 158  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  28658 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgat 28702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9990 - 9745
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||||| || || ||  |||||||||    
T  9990 agtagcttgagcattcatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggactgaaacgtgatgtggcatagtttgtgt 9891  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| | | | ||||| ||    
T  9890 attcttgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcaaaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtgccagagtggaaataggatagtatatc 9791  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgat 359  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||| ||| |||| |||||    
T  9790 catggattttgtgacgagttttccgaatactacgaaagggaatgat 9745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4831
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  5083 tgaagaagatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtc 4984  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
     || |||||| | || || || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||  ||| ||| ||||||| ||     
T  4983 tgggttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcaggtttgatgacaccttta 4884  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||| |  |||||||| ||| | || || || |||||||| |||||||||||    
T  4883 tatgttctagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 7617 - 7756
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7617 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgt 7716  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||| ||||||| || |||||||||||    
T  7717 attcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgaacatca 7756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7959 - 7720
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7959 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 7860  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   ||  || ||  ||| || ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||    
T  7859 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 7760  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 353  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  7759 catggattttgtgacgagttttccaaatactcctagaggg 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8401 - 8247
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| |    
T  8401 gaagagagtcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 8302  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  8301 tggcacagtttgtgtattcctgtctagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 8247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 19288 - 19412
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  19288 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacggtttgtgt 19387  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||    
T  19388 atgcttgtttgatttgccagaagtc 19412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 14497 - 14576
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacg 193  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14497 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacg 14576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22887 - 22763
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |    
T  22887 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtat 22788  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  22787 attcctgtttagtttgtcagaagtc 22763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7034 - 6895
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7034 agtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgt 6935  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  6934 attcttgtttgatttgtcataagtcgaaggttgaacatca 6895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 1338 - 1492
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||| ||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  1338 gaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatatatcatgatctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaaacgtgatg 1437  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1438 tggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Original strand, 2736 - 2838
Alignment:
Q  79 agttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 178  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  2736 agttgaaaaatttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 2835  T
Q  179 gtc 181  Q
    |||    
T  2836 gtc 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 442
Target Start/End: Original strand, 7145 - 7505
Alignment:
Q  82 tgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    |||||||| | ||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||    
T  7145 tgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtc 7244  T
Q  182 cggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttg 281  Q
      | |||||||| || || ||  ||||||| ||| |||||||   |||||||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||| ||  | | ||     
T  7245 tcggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtatattcatgtttggtttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctgttgggttgatggtatcttta 7344  T
Q  282 gatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggacc 381  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||| ||||  | |||||| |  |||| ||      
T  7345 gatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcccaaagggaatgacgctatttgggtgattgttgata 7444  T
Q  382 aggtgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
     | ||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  7445 ggttgacgaagtcgactcatttcattccgattaatatcagttttcccgtgtctcagttggc 7505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7069 - 6849
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | || ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  7069 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgt 6970  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | || || | |||||||||||| || ||||| ||||| || |||   ||  || ||  | |||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  6969 attcttgcttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgcctgagtggaaatgggatagtatatc 6870  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagttt 334  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  6869 catggattttgtgacgagttt 6849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1696 - 1557
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||    
T  1696 agtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgcaccatgatttgaagatgttgttttgatggtctggattgaagcgtgatgttgcacggtttgtgt 1597  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1596 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 1557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16675 - 16536
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  16675 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 16576  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  16575 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 16536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 716 - 577
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||    
T  716 agtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgttgcacaatttgtgt 617  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  616 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 39106 - 39245
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| || |||||||| || || || || |||||||    
T  39106 agtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatctgaagaaaattttatggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgt 39205  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39206 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatca 39245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 66425 - 66283
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  66425 agtagcttgagtatccatctgggagctacgaaaatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 66326  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaa 256  Q
    |  | ||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  66325 actcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcaaaa 66283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1434 - 1304
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||| |||    
T  1434 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttatgt 1335  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagt 244  Q
    || | ||||||  |||||||||||| |||||    
T  1334 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 334
Target Start/End: Original strand, 11469 - 11703
Alignment:
Q  100 aagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||  | |||||| |  | ||    
T  11469 aagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgt 11568  T
Q  200 tgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaag 299  Q
     || || ||||||||| | |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||     
T  11569 ggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaa 11668  T
Q  300 tggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    ||| | || || || |||||||| |||||||||||    
T  11669 tgggatagaatatccatggattttgtgacgagttt 11703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 334
Target Start/End: Original strand, 17661 - 17895
Alignment:
Q  100 aagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||  | |||||| |  | ||    
T  17661 aagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcattatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgt 17760  T
Q  200 tgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaag 299  Q
     || || ||||||||| | |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||     
T  17761 ggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaa 17860  T
Q  300 tggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    ||| | || || || |||||||| |||||||||||    
T  17861 tgggatagaatatccatggattttgtgacgagttt 17895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2285 - 2161
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  2285 agtaacttgagtattcatccgggagctccgaagatgtagcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgt 2186  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||| | ||||||||||||    
T  2185 attcttgttttatttgtcagaagtc 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 442
Target Start/End: Original strand, 32039 - 32367
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  32039 agtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 32138  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || | | ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  | | || |||||||| |||||||| ||| | || || ||    
T  32139 attcctatttaatttgtgagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatc 32238  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgataccatttggattgttgtggaccaggtgacgaagtcggcacacttcattcctatc 413  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||| |||| || |||||| |  |||| ||     ||||||||||| | || |||||||| ||     
T  32239 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcatttcattccgatt 32338  T
Q  414 aatatcagttatccggtagctcagttggc 442  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  32339 aatatcagttttcctgtgtctcagttggc 32367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 19353 - 19477
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  19353 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatggtttaaagaagatcttctggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgt 19452  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  19453 attcctgtttagtttgtcagaagtc 19477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 57037 - 56898
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||    
T  57037 agtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 56938  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  56937 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaaattgagcatca 56898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 196764 - 196888
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  196764 agtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttatggtggtctggattgaaacgagatgtggcatagtttgtgt 196863  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | |||||   ||||||||||||    
T  196864 attcttgtttggtttgtcagaagtc 196888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2487 - 2348
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || || ||||||||||    
T  2487 agtagcttaagtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctggattaaaacgggatgtggcacagtttgtgt 2388  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||    
T  2387 attcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatca 2348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50452 - 50313
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||| ||    
T  50452 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatctaaagaagttattttgctggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgcgt 50353  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  50352 attcttgtttgatttgccagaagtcgaaagttgagcatca 50313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3394 - 3273
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||  |||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  3394 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 3295  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaa 235  Q
    || | ||||| | |||||||||    
T  3294 attcttgtttgatttgtcagaa 3273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 237
Target Start/End: Original strand, 26232 - 26353
Alignment:
Q  116 tagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtat 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| |||    
T  26232 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatat 26331  T
Q  216 gcatgtttaacttgtcagaagt 237  Q
     | ||||| | |||||||||||    
T  26332 tcttgtttgatttgtcagaagt 26353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 32859 - 32960
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  32859 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 32958  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  32959 at 32960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9616 - 9492
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  9616 agtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 9517  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | |||||   ||||||||||||    
T  9516 attcctgtttggtttgtcagaagtc 9492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 3691 - 3815
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  3691 agtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 3790  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | |||||   ||||||||||||    
T  3791 attcctgtttggtttgtcagaagtc 3815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1681
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || || || |||||||    
T  1913 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtgatctaggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 1814  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttc 313  Q
    || |  |||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  ||  || ||    | || ||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  1813 attctggtttgatttgtcagaagtcgaaagttgaggatcaaaaacctactggaatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaagtgggatagtatatc 1714  T
Q  314 tatggatttcgtgacgagtttaccaaacactcc 346  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1713 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcc 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13488 - 13364
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||| | || || || ||||||||||    
T  13488 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgt 13389  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | ||||||  ||||||||||||    
T  13388 attcctgtttagtttgtcagaagtc 13364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 334
Target Start/End: Original strand, 8377 - 8593
Alignment:
Q  118 gcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgc 217  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||| |    
T  8377 gcttaagtatccatccgggagctacgcagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattc 8476  T
Q  218 atgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatg 317  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||| || |||   ||  || ||  | | || |||||||| |||||||| ||| | ||||| || |||    
T  8477 atgtttgatttgttagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcgggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagtatatccatg 8576  T
Q  318 gatttcgtgacgagttt 334  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8577 gattttgtgacgagttt 8593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25994 - 25855
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||   | || |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||    
T  25994 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 25895  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | | ||||  |||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  25894 attcctatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatca 25855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6256 - 6102
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacg 198  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||| | |||||  |||||| ||||||  | |||||||| || |    
T  6256 gaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctatgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttagtggtctagattgaaacgcgatg 6157  T
Q  199 ttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    |||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||    
T  6156 ttgcacaatttgtgtattcttgtttgacttgttagaagtcgaaggttgagcatca 6102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 220 - 321
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  220 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 319  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  320 at 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Original strand, 18501 - 18568
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 181  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18501 agtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 18568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 10287 - 10354
Alignment:
Q  99 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaa 166  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10287 gaagagagtcacagaagtagcttgagtatacatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaa 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8278
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||| || | || || ||||||||||    
T  8417 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttcaaaagaaatgtggcacagtttgtgt 8318  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | ||||||  |||||||||||| ||||| || |||||    
T  8317 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatca 8278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 102253 - 102114
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| || |||||||  || ||  | ||||||||||    
T  102253 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgtcacagtttgtgt 102154  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatca 253  Q
    || | | ||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  102153 attcctatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatca 102114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12424 - 12294
Alignment:
Q  204 cagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgga 303  Q
    ||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  12424 cagttggtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagtggaaatggg 12325  T
Q  304 acagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||    
T  12324 atagcatatccatggattttgtgacgagttt 12294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Original strand, 1 - 119
Alignment:
Q  135 ggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcaga 234  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||    
T  1 ggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcaga 100  T
Q  235 agtctaaagttgaacatca 253  Q
    | || || ||||| |||||    
T  101 aatcgaaggttgagcatca 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4740
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  4639 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 4738  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  4739 at 4740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 79780 - 79881
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||    
T  79780 agtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 79879  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  79880 at 79881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3214 - 3090
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  3214 agtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 3115  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | |||||   ||||||||||||    
T  3114 attcctgtttggtttgtcagaagtc 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8810 - 8686
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  8810 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatgacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgt 8711  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | || |||  ||||||||||||    
T  8710 attcctgcttagtttgtcagaagtc 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 3100 - 3224
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| | || |||||||| || | |||||| || || || ||||||||||    
T  3100 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggatcgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 3199  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
     | | |||||   ||||||||||||    
T  3200 gttcttgtttggtttgtcagaagtc 3224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 15739 - 15922
Alignment:
Q  144 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaag 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || || || |||||||||||| | ||||| | ||||||       ||||    
T  15739 aagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca-------aaag 15831  T
Q  244 ttgaacatcaaaagcctatagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtggaacagtatttctatggatttcgtgacgagttt 334  Q
    |||| ||||| || |||  || | || ||||||| || |||||||| |||||||| ||| | || || || |||||||| |||||||||||    
T  15832 ttgagcatcagaaacctgcagcgatgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttt 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 3
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatc 132  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54 ttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 109 - 188
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacg 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| | || | |||||| |||||||||||    
T  109 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtttcatgatctgaagaaaattttctagtggtctggtttgaaacg 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 63317 - 63418
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | |||||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  63317 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcgcagtttgtgt 63416  T
Q  214 at 215  Q
    ||    
T  63417 at 63418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24518 - 24394
Alignment:
Q  114 agtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagacgttgctcagtttgtgt 213  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||||||    |||||||| || || || ||||||||||    
T  24518 agtagcttgagaattcatcgaggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctaaattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 24419  T
Q  214 atgcatgtttaacttgtcagaagtc 238  Q
    || | |||||   ||||||||||||    
T  24418 attcctgtttggtttgtcagaagtc 24394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 132
Target Start/End: Original strand, 2107 - 2158
Alignment:
Q  81 ttgaagaagttcattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatc 132  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2107 ttgaaaaagttgattttagagaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatc 2158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8286 - 8220
Alignment:
Q  113 gagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  8286 gagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggctgttttggtgg 8220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 32678 - 32764
Alignment:
Q  93 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatcagggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 179  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  32678 attttagacgaaggtcataaaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University