View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_4 (Length: 653)

Name: NF11737A_low_4
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_4
NF11737A_low_4
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (1-653)||(19716261-19716913)
chr2 (1-542)||(19720824-19721365)
chr2 (1-646)||(23274147-23274792)
chr2 (1-652)||(23097262-23097913)
chr2 (1-652)||(12576901-12577552)
chr2 (1-646)||(20848143-20848785)
chr2 (462-652)||(23113271-23113461)
chr2 (177-267)||(28350808-28350898)
chr2 (487-640)||(11351441-11351594)
chr2 (453-640)||(21322962-21323149)
chr2 (144-267)||(21901470-21901593)
chr2 (468-643)||(22733485-22733660)
chr2 (500-643)||(23074420-23074563)
chr2 (494-640)||(22742703-22742849)
chr2 (487-640)||(9338142-9338295)
chr2 (487-640)||(9486776-9486929)
chr2 (487-640)||(16983800-16983953)
chr2 (487-640)||(17001560-17001713)
chr2 (498-643)||(23105469-23105614)
chr2 (500-640)||(23064973-23065113)
chr2 (489-653)||(24678034-24678198)
chr2 (492-640)||(24817575-24817723)
chr2 (487-640)||(22323072-22323225)
chr2 (487-640)||(24712594-24712747)
chr2 (487-640)||(27220576-27220729)
chr2 (487-640)||(27373829-27373982)
chr2 (487-640)||(44383300-44383453)
chr2 (453-653)||(45673708-45673908)
chr2 (487-653)||(23029191-23029357)
chr2 (487-640)||(10871410-10871563)
chr2 (42-160)||(10871887-10872005)
chr2 (579-653)||(24657480-24657554)
chr2 (487-640)||(23204874-23205027)
chr2 (3-160)||(24265407-24265564)
chr2 (480-545)||(30208643-30208708)
chr2 (207-267)||(22462931-22462991)
chr2 (219-267)||(23205247-23205295)
chr2 (219-267)||(23676851-23676899)
chr2 (42-166)||(44382858-44382982)
chr2 (415-534)||(19817513-19817632)
chr2 (45-163)||(9338616-9338734)
chr2 (45-163)||(9487250-9487368)
chr2 (45-174)||(17002023-17002152)
chr2 (579-640)||(21142863-21142924)
chr2 (34-267)||(23116336-23116569)
chr2 (579-640)||(24874572-24874633)
chr2 (466-534)||(22739363-22739431)
chr2 (487-534)||(23676584-23676631)
chr2 (207-277)||(11351161-11351231)
chr2 (465-534)||(22280771-22280840)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-653)||(53130-53782)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-646)||(22074-22719)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-645)||(164108-164752)
scaffold0023 (494-640)||(30774-30920)
scaffold0023 (426-643)||(47115-47331)
scaffold0023 (579-643)||(152036-152100)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (1-646)||(22027427-22028072)
chr8 (1-646)||(22053852-22054497)
chr8 (1-653)||(31413679-31414331)
chr8 (12-642)||(16268382-16269012)
chr8 (1-646)||(29300573-29301218)
chr8 (9-652)||(19985163-19985806)
chr8 (1-646)||(28983900-28984545)
chr8 (1-652)||(21928411-21929062)
chr8 (24-652)||(22373852-22374480)
chr8 (414-646)||(28989119-28989351)
chr8 (9-652)||(20391069-20391712)
chr8 (506-646)||(27357525-27357665)
chr8 (468-643)||(22421506-22421681)
chr8 (498-643)||(21253937-21254082)
chr8 (490-643)||(22523538-22523691)
chr8 (471-639)||(22375071-22375239)
chr8 (453-640)||(19980962-19981149)
chr8 (494-653)||(21164178-21164337)
chr8 (416-643)||(22990037-22990264)
chr8 (498-643)||(21391505-21391650)
chr8 (498-643)||(21780831-21780976)
chr8 (498-643)||(21785999-21786144)
chr8 (490-649)||(22245651-22245810)
chr8 (490-649)||(22246069-22246228)
chr8 (487-640)||(17671655-17671808)
chr8 (487-640)||(19115395-19115548)
chr8 (487-640)||(20015896-20016049)
chr8 (34-267)||(30310324-30310557)
chr8 (487-640)||(32603140-32603293)
chr8 (144-267)||(6606759-6606882)
chr8 (487-640)||(18859572-18859725)
chr8 (487-640)||(22117808-22117961)
chr8 (487-640)||(22126592-22126745)
chr8 (468-640)||(22031098-22031270)
chr8 (57-264)||(22523881-22524088)
chr8 (42-160)||(22126150-22126268)
chr8 (579-640)||(15536378-15536439)
chr8 (34-175)||(15536843-15536984)
chr8 (487-640)||(22042822-22042975)
chr8 (487-640)||(30310777-30310930)
chr8 (1-96)||(21970698-21970793)
chr8 (1-96)||(22004228-22004323)
chr8 (42-160)||(18860049-18860167)
chr8 (579-640)||(22129342-22129403)
chr8 (114-166)||(19481335-19481387)
chr8 (42-150)||(22117366-22117474)
chr8 (579-640)||(19481797-19481858)
chr8 (489-534)||(20649990-20650035)
chr8 (34-267)||(22043195-22043428)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (1-646)||(12357459-12358104)
chr3 (1-652)||(16831460-16832111)
chr3 (1-643)||(31941458-31942100)
chr3 (1-643)||(31692117-31692759)
chr3 (1-646)||(18131279-18131923)
chr3 (1-652)||(11958113-11958764)
chr3 (2-652)||(17188920-17189570)
chr3 (1-652)||(24189850-24190500)
chr3 (1-652)||(8744322-8744973)
chr3 (1-652)||(13944570-13945221)
chr3 (3-646)||(16326641-16327286)
chr3 (1-646)||(16825211-16825858)
chr3 (1-646)||(47126496-47127141)
chr3 (1-646)||(10408520-10409165)
chr3 (1-646)||(12180896-12181541)
chr3 (1-646)||(17494198-17494847)
chr3 (1-646)||(28756871-28757516)
chr3 (1-652)||(14290464-14291115)
chr3 (1-418)||(16384304-16384721)
chr3 (251-644)||(11949107-11949500)
chr3 (9-652)||(12857436-12858078)
chr3 (1-540)||(35982839-35983378)
chr3 (399-621)||(13317864-13318086)
chr3 (225-640)||(10417201-10417616)
chr3 (434-652)||(16378299-16378517)
chr3 (453-646)||(12509867-12510060)
chr3 (153-652)||(15230149-15230648)
chr3 (153-652)||(15236017-15236516)
chr3 (489-646)||(12272890-12273047)
chr3 (552-646)||(14575538-14575632)
chr3 (415-651)||(15013115-15013351)
chr3 (468-643)||(12843513-12843688)
chr3 (468-643)||(15262175-15262350)
chr3 (1-367)||(13317501-13317867)
chr3 (3-267)||(2036846-2037110)
chr3 (3-267)||(2040587-2040851)
chr3 (3-267)||(14039677-14039941)
chr3 (158-267)||(15008673-15008782)
chr3 (487-640)||(15345674-15345827)
chr3 (487-640)||(16638321-16638474)
chr3 (487-640)||(43165223-43165376)
chr3 (487-640)||(48427995-48428148)
chr3 (487-651)||(15065608-15065772)
chr3 (487-640)||(10008148-10008301)
chr3 (487-640)||(10908758-10908911)
chr3 (487-640)||(12889257-12889410)
chr3 (487-640)||(13255238-13255391)
chr3 (487-640)||(15358631-15358784)
chr3 (487-640)||(15713485-15713638)
chr3 (487-640)||(24185738-24185891)
chr3 (3-103)||(10416979-10417079)
chr3 (42-176)||(15713043-15713177)
chr3 (487-640)||(3688491-3688644)
chr3 (51-160)||(10008625-10008734)
chr3 (51-160)||(10909235-10909344)
chr3 (487-640)||(14873997-14874150)
chr3 (487-640)||(15586821-15586974)
chr3 (9-109)||(2245612-2245712)
chr3 (42-166)||(3688962-3689086)
chr3 (498-638)||(14578848-14578988)
chr3 (487-640)||(15399946-15400099)
chr3 (579-640)||(16754222-16754283)
chr3 (57-262)||(19727686-19727890)
chr3 (579-640)||(20059575-20059636)
chr3 (34-97)||(16695255-16695318)
chr3 (487-650)||(16804376-16804539)
chr3 (560-643)||(17492396-17492479)
chr3 (228-370)||(12501751-12501893)
chr3 (45-163)||(16638795-16638913)
chr3 (45-163)||(43165697-43165815)
chr3 (487-640)||(5422359-5422512)
chr3 (42-163)||(6597077-6597198)
chr3 (579-640)||(6603283-6603344)
chr3 (81-198)||(12508577-12508694)
chr3 (579-640)||(16694712-16694773)
chr3 (34-267)||(23078993-23079226)
chr3 (579-640)||(26790934-26790995)
chr3 (579-640)||(53382539-53382600)
chr3 (207-267)||(23414939-23414999)
chr3 (207-346)||(11861195-11861334)
chr3 (45-163)||(13255712-13255830)
chr3 (42-163)||(6603757-6603878)
chr3 (489-534)||(8271830-8271875)
chr3 (489-534)||(13964786-13964831)
chr3 (34-95)||(14873561-14873622)
chr3 (42-163)||(16753688-16753809)
chr3 (489-534)||(17201299-17201344)
chr3 (489-534)||(30150021-30150066)
chr3 (227-267)||(16695085-16695125)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-643)||(194-836)
scaffold0222 (10-646)||(20766-21402)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-643)||(98290-98932)
scaffold0020 (41-652)||(175934-176544)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-646)||(19437789-19438434)
chr6 (1-646)||(14376765-14377410)
chr6 (1-652)||(18797471-18798122)
chr6 (1-646)||(19455810-19456455)
chr6 (1-643)||(10465697-10466339)
chr6 (1-628)||(19465973-19466600)
chr6 (81-646)||(24515343-24515908)
chr6 (1-652)||(21566840-21567491)
chr6 (1-646)||(24367187-24367832)
chr6 (1-653)||(34642434-34643087)
chr6 (1-640)||(15462129-15462768)
chr6 (153-652)||(21474381-21474880)
chr6 (24-652)||(25770625-25771253)
chr6 (81-652)||(19486223-19486794)
chr6 (468-643)||(23081213-23081388)
chr6 (468-653)||(18405260-18405445)
chr6 (523-643)||(20010825-20010945)
chr6 (471-646)||(18182686-18182861)
chr6 (453-640)||(22436662-22436849)
chr6 (1-267)||(16813806-16814072)
chr6 (177-267)||(8720730-8720820)
chr6 (57-267)||(30677929-30678139)
chr6 (468-640)||(30678340-30678512)
chr6 (487-640)||(29589774-29589927)
chr6 (426-634)||(5836502-5836710)
chr6 (1-229)||(19881600-19881828)
chr6 (1-103)||(20010350-20010452)
chr6 (487-640)||(2872137-2872290)
chr6 (487-640)||(16574683-16574836)
chr6 (487-640)||(16620544-16620697)
chr6 (468-653)||(16924956-16925141)
chr6 (453-640)||(23085126-23085313)
chr6 (487-640)||(28312423-28312576)
chr6 (494-640)||(19867480-19867626)
chr6 (24-114)||(21474903-21474993)
chr6 (579-653)||(27559396-27559470)
chr6 (45-163)||(28312897-28313015)
chr6 (579-640)||(24293209-24293270)
chr6 (45-150)||(27205902-27206007)
chr6 (45-150)||(27243221-27243326)
chr6 (579-640)||(28260624-28260685)
chr6 (579-640)||(28285231-28285292)
chr6 (579-640)||(28339373-28339434)
chr6 (57-264)||(23081592-23081799)
chr6 (579-640)||(25115345-25115406)
chr6 (487-640)||(27190229-27190382)
chr6 (487-640)||(27258858-27259011)
chr6 (42-160)||(2871695-2871813)
chr6 (42-160)||(5836121-5836239)
chr6 (181-263)||(25958782-25958864)
chr6 (45-163)||(29589335-29589453)
chr6 (489-534)||(16379710-16379755)
chr6 (489-534)||(16647306-16647351)
chr6 (207-267)||(21764978-21765038)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (1-653)||(16947163-16947815)
chr7 (1-652)||(14283065-14283716)
chr7 (1-646)||(13676364-13677003)
chr7 (1-652)||(13024252-13024902)
chr7 (1-652)||(11385120-11385771)
chr7 (1-643)||(12459544-12460186)
chr7 (1-652)||(18050644-18051295)
chr7 (81-646)||(15099374-15099939)
chr7 (12-652)||(19149918-19150558)
chr7 (12-652)||(20749317-20749957)
chr7 (1-646)||(26091489-26092134)
chr7 (1-646)||(12798195-12798837)
chr7 (1-646)||(13965359-13966004)
chr7 (1-646)||(40924508-40925153)
chr7 (1-652)||(14260937-14261588)
chr7 (1-646)||(21755325-21755970)
chr7 (1-646)||(49155214-49155859)
chr7 (1-646)||(26115281-26115926)
chr7 (323-652)||(14140586-14140915)
chr7 (1-350)||(14144870-14145219)
chr7 (415-652)||(15343338-15343575)
chr7 (1-494)||(12712354-12712847)
chr7 (130-652)||(12203620-12204142)
chr7 (1-229)||(13004795-13005023)
chr7 (487-640)||(15146122-15146275)
chr7 (487-640)||(14957472-14957625)
chr7 (487-640)||(44788550-44788703)
chr7 (39-638)||(15627444-15628043)
chr7 (487-640)||(8710523-8710676)
chr7 (487-640)||(11550301-11550454)
chr7 (487-640)||(14335314-14335467)
chr7 (468-640)||(17703635-17703807)
chr7 (468-643)||(14042610-14042785)
chr7 (468-643)||(14352640-14352815)
chr7 (487-653)||(9591269-9591435)
chr7 (42-160)||(15157814-15157932)
chr7 (577-643)||(18180658-18180724)
chr7 (487-640)||(11234412-11234565)
chr7 (487-640)||(13688959-13689112)
chr7 (487-640)||(18587370-18587523)
chr7 (43-267)||(16726196-16726420)
chr7 (43-267)||(17703210-17703434)
chr7 (40-267)||(9591655-9591882)
chr7 (579-640)||(8200966-8201027)
chr7 (487-640)||(15158256-15158409)
chr7 (42-160)||(11233970-11234088)
chr7 (42-160)||(18181138-18181256)
chr7 (487-640)||(12690420-12690572)
chr7 (1-50)||(15810715-15810764)
chr7 (45-160)||(13689436-13689551)
chr7 (487-534)||(16726640-16726687)
chr7 (586-640)||(10873608-10873662)
chr7 (1-163)||(10873853-10874015)
chr7 (489-534)||(4442951-4442996)
chr7 (489-534)||(7826924-7826969)
chr7 (489-534)||(13459057-13459102)
chr7 (489-534)||(27104975-27105020)
chr7 (489-534)||(27173305-27173350)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-643)||(8169-8811)
scaffold0235 (1-643)||(18383-19025)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-646)||(64309-64954)
scaffold0067 (1-646)||(48887-49532)
scaffold0067 (1-646)||(57921-58566)
scaffold0067 (1-646)||(29576-30221)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (1-653)||(24096391-24097043)
chr1 (1-647)||(19857242-19857888)
chr1 (45-646)||(20832721-20833321)
chr1 (1-652)||(21742328-21742979)
chr1 (1-652)||(21738812-21739463)
chr1 (1-646)||(22015521-22016166)
chr1 (1-646)||(48425842-48426487)
chr1 (1-642)||(20074485-20075126)
chr1 (1-646)||(52988710-52989354)
chr1 (1-646)||(38909602-38910247)
chr1 (1-646)||(31536773-31537418)
chr1 (1-646)||(37680018-37680663)
chr1 (1-646)||(20297350-20297997)
chr1 (12-507)||(21961135-21961630)
chr1 (1-643)||(20853536-20854178)
chr1 (414-646)||(18710354-18710586)
chr1 (468-646)||(16379032-16379210)
chr1 (468-643)||(21751988-21752163)
chr1 (34-267)||(21228365-21228598)
chr1 (494-640)||(22496525-22496671)
chr1 (487-640)||(24785119-24785272)
chr1 (39-267)||(18273115-18273343)
chr1 (494-640)||(20081645-20081791)
chr1 (577-646)||(12200487-12200556)
chr1 (487-640)||(16347857-16348010)
chr1 (487-640)||(33388291-33388444)
chr1 (487-640)||(51330754-51330907)
chr1 (57-267)||(16379411-16379621)
chr1 (45-160)||(51330315-51330430)
chr1 (487-640)||(21833246-21833399)
chr1 (487-640)||(21842156-21842309)
chr1 (42-166)||(16354063-16354187)
chr1 (468-640)||(17042258-17042430)
chr1 (44-166)||(16347417-16347539)
chr1 (1-175)||(21752456-21752630)
chr1 (579-640)||(19109312-19109373)
chr1 (34-269)||(17041825-17042059)
chr1 (57-196)||(22117102-22117241)
chr1 (42-160)||(21833723-21833841)
chr1 (480-529)||(21045379-21045428)
chr1 (1-61)||(16670684-16670744)
chr1 (57-229)||(21044986-21045158)
chr1 (114-166)||(41350560-41350612)
chr1 (489-534)||(20828656-20828701)
chr1 (489-534)||(20928104-20928149)
chr1 (579-640)||(41351022-41351083)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-646)||(1659-2304)
scaffold0034 (1-382)||(11613-11994)
scaffold0034 (1-646)||(70324-70969)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-652)||(203327-203978)
scaffold0003 (579-640)||(424266-424327)
scaffold0003 (42-160)||(424746-424864)
[»] scaffold0010 (6 HSPs)
scaffold0010 (1-646)||(39042-39685)
scaffold0010 (523-646)||(44656-44779)
scaffold0010 (432-643)||(4870-5081)
scaffold0010 (3-103)||(180548-180648)
scaffold0010 (207-267)||(14755-14815)
scaffold0010 (579-640)||(14382-14443)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-646)||(4916-5561)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-653)||(23077791-23078443)
chr5 (1-646)||(23563054-23563699)
chr5 (25-652)||(17266244-17266871)
chr5 (1-646)||(25850909-25851554)
chr5 (1-646)||(20345119-20345764)
chr5 (1-646)||(22505516-22506161)
chr5 (12-646)||(14883888-14884522)
chr5 (3-640)||(20824296-20824933)
chr5 (385-643)||(20778753-20779011)
chr5 (385-640)||(28892212-28892467)
chr5 (1-643)||(22464790-22465432)
chr5 (11-652)||(21983073-21983714)
chr5 (1-267)||(21870164-21870430)
chr5 (1-267)||(21874444-21874710)
chr5 (414-652)||(21561324-21561562)
chr5 (415-640)||(21631699-21631924)
chr5 (3-267)||(16257924-16258188)
chr5 (3-267)||(22591643-22591907)
chr5 (3-267)||(22595198-22595462)
chr5 (144-267)||(23669848-23669971)
chr5 (468-643)||(25429279-25429454)
chr5 (39-264)||(23474431-23474656)
chr5 (468-643)||(26736080-26736255)
chr5 (487-653)||(21882622-21882788)
chr5 (487-640)||(16359363-16359516)
chr5 (426-643)||(23474053-23474270)
chr5 (487-640)||(29473445-29473598)
chr5 (487-640)||(34569355-34569508)
chr5 (487-640)||(40711641-40711794)
chr5 (1-107)||(28891828-28891934)
chr5 (487-640)||(14997111-14997264)
chr5 (487-640)||(18781975-18782128)
chr5 (487-640)||(20803458-20803611)
chr5 (487-640)||(22330259-22330412)
chr5 (487-636)||(22350784-22350933)
chr5 (487-640)||(27521267-27521420)
chr5 (42-163)||(27521741-27521862)
chr5 (487-640)||(37288868-37289021)
chr5 (487-640)||(41773703-41773856)
chr5 (1-160)||(29472962-29473121)
chr5 (158-265)||(43122685-43122792)
chr5 (42-160)||(22329817-22329935)
chr5 (487-640)||(19772821-19772974)
chr5 (487-640)||(23460832-23460985)
chr5 (487-640)||(27613217-27613370)
chr5 (487-640)||(27682772-27682925)
chr5 (207-267)||(18782348-18782408)
chr5 (154-266)||(21561064-21561176)
chr5 (42-160)||(19773298-19773416)
chr5 (42-160)||(22138006-22138124)
chr5 (579-640)||(21342878-21342939)
chr5 (45-198)||(21410437-21410590)
chr5 (579-640)||(22137529-22137590)
chr5 (487-640)||(27665862-27666015)
chr5 (453-529)||(21410106-21410182)
chr5 (45-160)||(14996672-14996787)
chr5 (57-264)||(21631341-21631548)
chr5 (45-163)||(16359837-16359955)
chr5 (42-160)||(27682330-27682448)
chr5 (45-163)||(34569829-34569947)
chr5 (1-61)||(28911674-28911734)
chr5 (1-61)||(28926942-28927002)
chr5 (42-150)||(37288426-37288534)
chr5 (206-264)||(21883012-21883070)
chr5 (42-160)||(22351257-22351375)
chr5 (489-534)||(23508633-23508678)
chr5 (489-534)||(24584159-24584204)
chr5 (487-595)||(23525957-23526065)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (1-643)||(17191-17833)
scaffold0348 (85-643)||(4640-5198)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-652)||(263172-263823)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-643)||(40013-40655)
scaffold0114 (468-643)||(17523-17698)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-646)||(9481-10124)
scaffold0243 (468-643)||(24119-24294)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-646)||(8566-9211)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-643)||(16150562-16151204)
chr4 (1-643)||(16154708-16155350)
chr4 (16-646)||(14993086-14993716)
chr4 (3-646)||(20892954-20893597)
chr4 (1-652)||(51603496-51604147)
chr4 (1-642)||(53750174-53750815)
chr4 (1-646)||(3261498-3262143)
chr4 (1-609)||(15266736-15267344)
chr4 (1-646)||(11203936-11204581)
chr4 (1-646)||(44658570-44659215)
chr4 (12-646)||(29450252-29450886)
chr4 (24-643)||(15073285-15073904)
chr4 (1-556)||(7357280-7357835)
chr4 (1-646)||(27903308-27903952)
chr4 (1-361)||(18259649-18260009)
chr4 (480-649)||(14697021-14697190)
chr4 (416-643)||(15894-16121)
chr4 (558-646)||(15354301-15354389)
chr4 (426-643)||(14162396-14162613)
chr4 (69-267)||(8708979-8709177)
chr4 (39-265)||(13879413-13879639)
chr4 (450-512)||(15354229-15354291)
chr4 (468-653)||(16350465-16350650)
chr4 (487-640)||(17092079-17092232)
chr4 (81-264)||(14697406-14697589)
chr4 (487-640)||(8050553-8050706)
chr4 (487-640)||(12479529-12479682)
chr4 (487-640)||(14300909-14301062)
chr4 (487-640)||(14683496-14683649)
chr4 (487-640)||(16233922-16234075)
chr4 (487-640)||(19635065-19635218)
chr4 (487-640)||(23958676-23958829)
chr4 (487-637)||(8389344-8389494)
chr4 (42-160)||(14300467-14300585)
chr4 (494-640)||(15144829-15144975)
chr4 (487-640)||(18224376-18224529)
chr4 (487-640)||(19775723-19775876)
chr4 (487-640)||(27714265-27714418)
chr4 (40-267)||(13513652-13513879)
chr4 (579-640)||(16250872-16250933)
chr4 (34-267)||(18223950-18224183)
chr4 (34-267)||(18604296-18604529)
chr4 (487-640)||(40475969-40476122)
chr4 (487-634)||(13513285-13513432)
chr4 (42-160)||(14683973-14684091)
chr4 (34-166)||(16248153-16248285)
chr4 (42-166)||(8389812-8389936)
chr4 (42-160)||(19635542-19635660)
chr4 (489-534)||(14999681-14999726)
chr4 (605-646)||(15258850-15258891)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-652)||(9495-10144)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (17-643)||(6993-7619)
scaffold0664 (1-49)||(6-54)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-643)||(54002-54644)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-652)||(252-903)
scaffold0476 (468-653)||(10731-10916)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (1-643)||(5964-6606)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-606)||(8728-9333)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (1-645)||(522-1166)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-646)||(50057-50702)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-653)||(251567-252216)
scaffold0009 (40-267)||(229598-229825)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-646)||(590-1235)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (153-646)||(325659-326151)
scaffold0004 (1-359)||(319482-319840)
scaffold0004 (433-651)||(200607-200825)
scaffold0004 (155-267)||(200338-200450)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-646)||(1018-1663)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-646)||(7696-8341)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-646)||(34289-34934)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-646)||(5757-6401)
scaffold0035 (468-638)||(41282-41452)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (6-646)||(514065-514705)
scaffold0001 (426-643)||(495975-496192)
scaffold0001 (492-640)||(441611-441759)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (204-643)||(764-1203)
scaffold0203 (1-163)||(3758-3920)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (54-646)||(36891-37483)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (3-646)||(10929-11572)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (131-652)||(4982-5503)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (1-571)||(1555-2125)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (17-646)||(413-1042)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (54-652)||(30086-30684)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (1-646)||(41687-42332)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (1-627)||(70079-70705)
scaffold0046 (480-652)||(60685-60857)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-646)||(5133-5777)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-646)||(42650-43295)
scaffold0102 (453-640)||(50504-50691)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (3-646)||(66817-67460)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (207-646)||(65211-65650)
scaffold0053 (1-472)||(62479-62950)
scaffold0053 (1-185)||(65029-65213)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (12-640)||(4022-4650)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-652)||(63246-63877)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (1-445)||(5206-5650)
scaffold0167 (465-646)||(1072-1253)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (1-514)||(1194-1707)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (9-652)||(987-1630)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (9-652)||(28000-28643)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-652)||(43126-43777)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (24-652)||(29473-30100)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-475)||(2754-3222)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (9-651)||(5549-6191)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (12-652)||(1667-2305)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (1-519)||(1314-1832)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (1-391)||(15279-15669)
scaffold0074 (450-646)||(15075-15271)
scaffold0074 (471-640)||(6071-6240)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (152-651)||(115509-116008)
scaffold0029 (3-640)||(93603-94240)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (220-646)||(29886-30312)
scaffold0088 (1-174)||(30334-30507)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (279-646)||(12679-13046)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (1-303)||(799-1101)
scaffold1530 (385-646)||(535-796)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (399-646)||(151519-151766)
scaffold0011 (1-361)||(153729-154089)
scaffold0011 (468-643)||(23707-23882)
scaffold0011 (489-541)||(175708-175760)
scaffold0011 (489-534)||(73792-73837)
scaffold0011 (489-534)||(78173-78218)
scaffold0011 (489-534)||(182054-182099)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (1-542)||(579-1125)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (12-533)||(51716-52237)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (1-476)||(5562-6034)
scaffold0523 (6-519)||(11455-11968)
scaffold0523 (471-652)||(2817-2998)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (414-646)||(11761-11993)
scaffold0443 (219-361)||(12034-12176)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (276-652)||(11906-12282)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (420-646)||(9353-9579)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (1-342)||(4161-4501)
scaffold0017 (494-640)||(195038-195184)
scaffold0017 (468-653)||(17240-17425)
scaffold0017 (471-640)||(24264-24433)
scaffold0017 (214-376)||(16986-17148)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (3-511)||(512-1020)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (1-259)||(33079-33337)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (450-646)||(11-207)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (80-445)||(70-435)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (341-587)||(19016-19262)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-267)||(5609-5875)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (461-646)||(1-186)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-316)||(249-564)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (453-646)||(20687-20880)
scaffold0261 (1-382)||(12121-12500)
scaffold0261 (1-382)||(20301-20680)
scaffold0261 (453-646)||(12507-12700)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (3-234)||(2195-2426)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-267)||(115955-116221)
scaffold0031 (481-646)||(110562-110727)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-474)||(16761-17234)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (3-267)||(1013-1277)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (452-652)||(4247-4447)
scaffold0585 (54-209)||(621-775)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (414-652)||(11776-12012)
scaffold0509 (217-264)||(12162-12209)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (1-337)||(23630-23966)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (1-248)||(3215-3462)
scaffold0490 (57-176)||(313-432)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (25-307)||(961-1243)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (503-652)||(49086-49235)
[»] scaffold0130 (4 HSPs)
scaffold0130 (414-646)||(4012-4241)
scaffold0130 (153-265)||(3751-3863)
scaffold0130 (487-640)||(7972-8125)
scaffold0130 (225-267)||(7710-7752)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (503-652)||(21797-21946)
[»] scaffold0100 (3 HSPs)
scaffold0100 (39-264)||(16354-16579)
scaffold0100 (415-521)||(16730-16836)
scaffold0100 (594-640)||(21485-21531)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (57-640)||(5046-5629)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (416-643)||(55592-55819)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (453-643)||(23457-23647)
scaffold0018 (492-640)||(9549-9697)
scaffold0018 (1-96)||(23005-23100)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (487-643)||(2456-2612)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (468-643)||(4389-4564)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (574-653)||(3450-3529)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (487-653)||(8355-8521)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (57-643)||(6828-7414)
scaffold0270 (57-643)||(13958-14544)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (416-643)||(14388-14615)
scaffold0342 (57-169)||(14028-14140)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (468-643)||(13653-13828)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (207-653)||(36443-36889)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (453-651)||(1946-2144)
scaffold0148 (53-262)||(2335-2544)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (489-643)||(14039-14193)
scaffold0120 (489-534)||(25242-25287)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (498-643)||(11084-11229)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (426-638)||(15111-15323)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (550-646)||(26064-26160)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (471-643)||(17833-18005)
scaffold0040 (468-643)||(111081-111256)
scaffold0040 (46-264)||(18179-18397)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (75-643)||(216201-216769)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (468-643)||(1944-2119)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (468-643)||(40681-40856)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (3-150)||(17687-17834)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (468-643)||(8178-8353)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (385-514)||(1364-1493)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (1-174)||(13761-13934)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (453-643)||(15377-15555)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (415-640)||(26310-26535)
scaffold0042 (494-640)||(37020-37166)
scaffold0042 (144-264)||(26686-26806)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (468-643)||(552-727)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (487-638)||(942-1093)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (468-643)||(57788-57963)
scaffold0077 (63-264)||(57383-57584)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (498-636)||(14873-15011)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (468-653)||(29102-29287)
scaffold0181 (228-376)||(28862-29010)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (487-640)||(22205-22358)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (487-640)||(7194-7347)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (498-643)||(8905-9047)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (426-625)||(3524-3723)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (494-637)||(1-144)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (468-643)||(7913-8088)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (550-624)||(1185-1259)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (169-267)||(1270-1368)
scaffold0609 (39-247)||(7908-8116)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (426-640)||(18608-18822)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (490-643)||(4538-4691)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (498-643)||(24916-25061)
scaffold0218 (489-534)||(1147-1192)
[»] scaffold0080 (8 HSPs)
scaffold0080 (487-640)||(31841-31994)
scaffold0080 (487-640)||(37307-37460)
scaffold0080 (498-643)||(54592-54737)
scaffold0080 (579-653)||(10523-10597)
scaffold0080 (579-640)||(13178-13239)
scaffold0080 (34-267)||(9979-10212)
scaffold0080 (34-267)||(12634-12867)
scaffold0080 (207-264)||(32213-32270)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (9-109)||(750-850)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (468-640)||(10332-10504)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (9-109)||(25949-26049)
scaffold0098 (174-262)||(25808-25896)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (487-643)||(17892-18048)
scaffold0028 (487-643)||(11424-11580)
scaffold0028 (487-534)||(55068-55115)
scaffold0028 (606-643)||(53682-53719)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (40-267)||(5329-5556)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (494-640)||(34915-35061)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (487-640)||(10326-10479)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (487-636)||(21566-21715)
scaffold0081 (487-636)||(36990-37139)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (487-640)||(3382-3535)
scaffold0044 (468-640)||(17118-17290)
scaffold0044 (40-267)||(17491-17718)
scaffold0044 (42-160)||(3859-3977)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (490-643)||(104182-104335)
scaffold0006 (57-263)||(104561-104767)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (31-267)||(139347-139583)
scaffold0008 (489-538)||(131684-131733)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (41-267)||(210-436)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (177-264)||(30896-30983)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (41-267)||(12871-13097)
scaffold0109 (487-640)||(13317-13470)
scaffold0109 (579-640)||(41113-41174)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (579-640)||(1317-1378)
[»] scaffold0259 (3 HSPs)
scaffold0259 (579-640)||(8216-8277)
scaffold0259 (487-534)||(8322-8369)
scaffold0259 (42-88)||(8765-8811)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (487-653)||(86-252)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (42-160)||(49100-49218)
scaffold0007 (487-534)||(48729-48776)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (487-640)||(962-1115)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (583-640)||(12621-12678)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (465-534)||(13502-13571)
scaffold0467 (489-534)||(816-861)
[»] scaffold1881 (2 HSPs)
scaffold1881 (219-267)||(405-453)
scaffold1881 (579-640)||(765-826)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (43-267)||(119-343)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (181-265)||(36161-36245)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (227-267)||(171449-171489)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (66-196)||(20-149)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (40-166)||(168-294)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (579-653)||(11641-11715)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (169-262)||(4874-4967)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (489-534)||(5499-5544)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (57-166)||(11460-11569)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (489-534)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (489-534)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (489-534)||(24027-24072)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (489-534)||(8221-8266)
scaffold0021 (489-534)||(90566-90611)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (579-643)||(3556-3620)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (489-541)||(3556-3608)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 473; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 19716261 - 19716913
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  19716261 tcaagagagccattggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgat 19716360  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19716361 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaat 19716460  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  19716461 aggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 19716560  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  19716561 gtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaa 19716660  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19716661 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcct 19716760  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19716761 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatgg 19716860  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19716861 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaga 19716913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 19720824 - 19721365
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  19720824 tcaagagagccattggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgat 19720923  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19720924 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaat 19721023  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  19721024 aggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 19721123  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  19721124 gtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaa 19721223  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19721224 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcct 19721323  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcatt 542  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19721324 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23274792 - 23274147
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||  || ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  23274792 tcaagagggctattggttatcagaaaataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtgat 23274693  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || |||||||| ||||||||| | || |  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  23274692 gagtgaacgtaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagcagtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 23274593  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  23274592 aggagagatgctcctactgaaattgtttgcaacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 23274493  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||  | || || ||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||| || ||    
T  23274492 gacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgcacacaaccgaa 23274393  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23274392 gaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 23274293  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23274292 ttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatgg 23274193  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23274192 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 23274147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 23097262 - 23097913
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || || | ||||||||| || || || ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23097262 tcaagagggcctttggctatcagaagatcagaactttttctgagtttgtaagtagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgat 23097361  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |||||||   |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||     
T  23097362 gagtgagcggagaggtaaagcacatcagagtctccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagaggaggcccaag 23097461  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||| || ||||||| |||||    
T  23097462 aggagagatgctcctgctgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatcagaagaagtgcttcaagtgtg 23097561  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | | | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  23097562 gtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaa 23097661  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23097662 gaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtacttgattctttaatagtactcct 23097761  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| || |    
T  23097762 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagatgg 23097861  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23097862 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 23097913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12577552 - 12576901
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| || |||||    
T  12577552 tcaagagagccataggataccaacagattagaattttttctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgat 12577453  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | |    
T  12577452 gagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagt 12577353  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | ||| |||||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12577352 aagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtg 12577253  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||    
T  12577252 gacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaa 12577153  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12577152 gaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcct 12577053  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  12577052 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatgg 12576953  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12576952 ttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgag 12576901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20848785 - 20848143
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  20848785 tcaagagagctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattat 20848686  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | ||||   ||||     
T  20848685 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggat--ccaag 20848588  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  20848587 aggagagatgctcctgttgagattgtt-gctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 20848489  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  20848488 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 20848389  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20848388 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 20848289  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  20848288 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 20848189  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20848188 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 20848143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 462 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 23113461 - 23113271
Alignment:
Q  462 cgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttata 561  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| | || | ||||| ||||    
T  23113461 cgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatata 23113362  T
Q  562 agttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    | |||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23113361 aattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 23113271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28350898 - 28350808
Alignment:
Q  177 ttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28350898 ttgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 28350808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 11351441 - 11351594
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| ||| | | ||||||||    
T  11351441 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatat 11351540  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11351541 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11351594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 453 - 640
Target Start/End: Original strand, 21322962 - 21323149
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| || || ||||||||||  ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |    
T  21322962 aatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 21323061  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21323062 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21323149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21901593 - 21901470
Alignment:
Q  144 tacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcg 243  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || || || ||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21901593 tacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtg 21901494  T
Q  244 agaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  21901493 agaagggccacaagagtaatgttt 21901470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733660
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||  || |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 22733660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23074563 - 23074420
Alignment:
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  |||||||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||     
T  23074563 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23074464  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23074463 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23074420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 22742703 - 22742849
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  22742703 tactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22742802  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22742803 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 9338295 - 9338142
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  9338295 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 9338196  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9338195 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9338142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 9486929 - 9486776
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  9486929 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 9486830  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9486829 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9486776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16983953 - 16983800
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16983953 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16983854  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16983853 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16983800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17001713 - 17001560
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||    
T  17001713 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatat 17001614  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17001613 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Original strand, 23105469 - 23105614
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||| ||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  23105469 cctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 23105568  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23105569 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23105614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 500 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23065113 - 23064973
Alignment:
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  |||||||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||     
T  23065113 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23065014  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23065013 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 24678198 - 24678034
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 588  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||  |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| ||| | | ||||||||||    
T  24678198 aataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatga 24678099  T
Q  589 aaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  24678098 atggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 24678034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 640
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817723
Alignment:
Q  492 agtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 591  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  592 gagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24817723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 22323072 - 22323225
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22323072 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22323171  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22323172 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 24712747 - 24712594
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  24712747 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24712648  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24712647 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24712594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27220729 - 27220576
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27220729 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27220630  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27220629 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27220576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373829
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27373829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 44383300 - 44383453
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  44383300 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 44383399  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44383400 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 44383453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 653
Target Start/End: Original strand, 45673708 - 45673908
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||||| |||| ||| |||||| |  | |    
T  45673708 aatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgatt 45673807  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  45673808 gtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgag 45673907  T
Q  653 a 653  Q
    |    
T  45673908 a 45673908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 653
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029357
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||| ||||  || ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 23029357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10871563 - 10871410
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  10871563 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10871464  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10871463 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 10871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10872005 - 10871887
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  10872005 gatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcgtcctaagc 10871906  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  10871905 cgtacagtgcccctgctga 10871887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 653
Target Start/End: Original strand, 24657480 - 24657554
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  24657480 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 24657554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23205027 - 23204874
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   |  ||||| |  | |||| || |   |||||| | | ||| ||||||||    
T  23205027 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatat 23204928  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23204927 gaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24265564 - 24265407
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    ||||| || |||||||||||  || | ||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  |||    
T  24265564 aagagggcgattgggtatcaacagctgagagttttttcagacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 24265465  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctga 160  Q
     |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  24265464 atgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 24265407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 545
Target Start/End: Original strand, 30208643 - 30208708
Alignment:
Q  480 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgct 545  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  30208643 tgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgct 30208708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 22462931 - 22462991
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22462931 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 22462991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23205295 - 23205247
Alignment:
Q  219 gagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23205295 gagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 23205247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23676899 - 23676851
Alignment:
Q  219 gagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23676899 gagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 23676851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 166
Target Start/End: Original strand, 44382858 - 44382982
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  44382858 gatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 44382957  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  44382958 cgtacagtgcccccgctgacaaggg 44382982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19817632 - 19817513
Alignment:
Q  415 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||   | |||||||| || || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||     
T  19817632 gtgggaatgtgtttgctttagctggtactcagacatcgaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactac 19817533  T
Q  515 agatactagtgctactcatt 534  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  19817532 agatactggtgctacacatt 19817513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9338734 - 9338616
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  9338734 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 9338635  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  9338634 acagtgcccccgctgacaa 9338616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9487368 - 9487250
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  9487368 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 9487269  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  9487268 acagtgcccccgctgacaa 9487250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17002152 - 17002023
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||  | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  17002152 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 17002053  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaagggaaagcaga 174  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17002052 acagtgcccctgctgataaaggaaaacaga 17002023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 21142863 - 21142924
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  21142863 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 21142924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 23116336 - 23116569
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  | |||||||||||||||  | | |||| | |    ||||||  ||||||||||    
T  23116336 ttttccctgatttagtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaaggttgttaatgagaggaagactaagggcaagcagagtcg 23116435  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      |||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| || | ||||| ||||||| |    
T  23116436 ccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcagagattgtttgtttc 23116535  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23116536 aactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 23116569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 24874572 - 24874633
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24874572 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctct 24874633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 534
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  466 ttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23676631 - 23676584
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23676631 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcatt 23676584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 277
Target Start/End: Original strand, 11351161 - 11351231
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaagga 277  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  11351161 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccaaagga 11351231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  465 cttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 53130 - 53782
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  53130 tcaagagagccattgggtatcaaaagattagaatcttctcggatttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagacaccaaggctcattataaggtgat 53229  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  53230 gagtgagcgaagagataagggacatcaagttcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaat 53329  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  53330 aggagagatgctcttgctgggatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaaatgattcaggtgtg 53429  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | |||||| |||| ||    
T  53430 gtcaaaaaggacacatcctagttgattgcaagcgtggtgacgtggtatgttataactgtaatgaagagggccatatcagttcacaatgcacatagccgaa 53529  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53530 gaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 53629  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  || |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  53630 ttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatgg 53729  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53730 ttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 53782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22719 - 22074
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||| | ||||||    
T  22719 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattatatggtgat 22620  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22619 gagtgggcgaaggggtaagggacagtagagtcttcctaaaccatacagtgcccctgccgacaaaggaaatcaaagactgaatgatgagaggaggcccaat 22520  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22519 aggagagatgctcctgttgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttactaaggatgagaagaaatgcttcaagtgtg 22420  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  22419 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaa 22320  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22319 gaaggttagaaccgttggtatagtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 22220  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22219 ttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 22120  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22119 ttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttg 22074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 645
Target Start/End: Original strand, 164108 - 164752
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||||||||||||    
T  164108 tcaagagagccattgggtatcagaagatcagaattttctccgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggagaacacgaaagctcattacaaggtgat 164207  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  164208 gagtgaacgaagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaatcatacagtgcccctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaat 164307  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || || ||||||||||    
T  164308 aggagagacgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgttctaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtg 164407  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |  || ||||| ||    
T  164408 gtcagaaaggacacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatcagttcgcattatactcagccgaa 164507  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  164508 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 164607  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  164608 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataagaaaggggaaatgg 164707  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgttt 645  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  164708 ttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgttt 164752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30920
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 426 - 643
Target Start/End: Original strand, 47115 - 47331
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   || ||||| ||  |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||| || |||    
T  47115 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtg 47214  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||| |||||    
T  47215 ctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttc 47313  T
Q  626 agtgactacttctcttgt 643  Q
     |||||||||||||||||    
T  47314 ggtgactacttctcttgt 47331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 579 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 152036
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 152036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 22027427 - 22028072
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||| || || |  |||| |||||| ||||||||    
T  22027427 tcaagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagatcattataaggtgat 22027526  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22027527 gagtgagcgaagtggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaat 22027626  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  22027627 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgataaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 22027726  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||||  ||| |||||| ||| | || || ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  22027727 gtcagaagggtcacacattagctgattgtaagaggggagacgttgtttgctataactacaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaa 22027826  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22027827 gaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 22027926  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  22027927 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaaatgg 22028026  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22028027 ttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttg 22028072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22054497 - 22053852
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  22054497 tcaagagagccataggataccaacagattagaattttctctgatttggtgagtcgttgcaggatctgtgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 22054398  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| |||    
T  22054397 gagtgagcgaagaggtaagggacggcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaat 22054298  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22054297 aggagagatgcttctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcagatgtg 22054198  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  22054197 gtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaa 22054098  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22054097 gaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 22053998  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22053997 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 22053898  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22053897 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 22053852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 31413679 - 31414331
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||    
T  31413679 tcaaaagagctattgggtatcagaagattaaaattttctctaagttggtaaacagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaaatgat 31413778  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||     
T  31413779 gagtgagcgaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagcgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagaggaggcccaag 31413878  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||| || |   |  |||||||  || || || |||||||    
T  31413879 aggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccataagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtg 31413978  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| || |||||| ||||  |||| || ||| | ||    
T  31413979 gtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagtcgaa 31414078  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31414079 gaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 31414178  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  31414179 ttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatgg 31414278  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31414279 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaga 31414331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 642
Target Start/End: Original strand, 16268382 - 16269012
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||  | ||||||||| | |    
T  16268382 attgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaatagttgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaatataatgagtgagagga 16268481  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  | ||||||||| |||||||||| | ||| |||| | |||||||| || | |||||||||    
T  16268482 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcctaagaagagagatgc 16268581  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||     
T  16268582 tccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 16268681  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| || || || ||||| | |||||| |||||| ||||  ||||  |  |||| ||||||| |||||    
T  16268682 catagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaa 16268781  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268782 ctggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 16268881  T
Q  512 tatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaact 611  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16268882 tattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaact 16268981  T
Q  612 acagctaagggttcagtgactacttctcttg 642  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16268982 ccagctaagggttcagtaactacttctcttg 16269012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 29300573 - 29301218
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||    
T  29300573 tcaaaagagctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttagtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtaat 29300672  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||| | |||||||| | |||||||||||     
T  29300673 gagtgagaggaggggtaagggacattagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaag 29300772  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||| |||||| | | ||||| || |||||||  |||||||| || | |||||||||||| |||| || |   |  ||||| |  || || || |||||||    
T  29300773 aggggagatgttcccgctgaaattgtttgttttaagtgtggtgaaagaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgaaaggaagtgttttaggtgtg 29300872  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||  |||| |  ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||| || ||||| ||    
T  29300873 gtcagagaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctactataactgcaatgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaa 29300972  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29300973 gaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 29301072  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  29301073 ttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 29301172  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29301173 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 29301218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 19985806 - 19985163
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985806 gccattggttatcaaaagataataaatttttctgatttggtaagcagttgtaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 19985707  T
Q  109 gcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagaga 208  Q
    |||| || |||||| ||||||||||| | || || || |||| |||||| |||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||    
T  19985706 gcagtggcaagggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgcggacaagggtaaacagaggatgattgatgagaggaggcctaagaggagaga 19985607  T
Q  209 tgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaa 308  Q
    |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |      |||||||| || |  ||||| ||||| ||||||    
T  19985606 tgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggcgaaaaaagccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtatttcagatgtggacagaaa 19985507  T
Q  309 ggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggtta 408  Q
     |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||  | ||  ||||||   |||| |||||||||     
T  19985506 tgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacagtgcaagaagcctaagaaggttc 19985407  T
Q  409 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgc 508  Q
    | || ||||| || || |||||||||||| ||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985406 ggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 19985307  T
Q  509 tattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaa 608  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19985306 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 19985207  T
Q  609 actacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19985206 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 19985163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28984545 - 28983900
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||| ||| | || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  28984545 tcaaaagagccattggatatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagattat 28984446  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||     
T  28984445 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaagggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaag 28984346  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  28984345 aggagagatgctccagttgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 28984246  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  28984245 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 28984146  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || ||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28984145 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 28984046  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |    
T  28984045 ttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatgg 28983946  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28983945 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 28983900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21929062 - 21928411
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21929062 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgat 21928963  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |      
T  21928962 gagtgagcgtagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctagg 21928863  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||   | ||  || ||||||| || || ||||| |||    
T  21928862 aggagagatgctcctactgagattctttgtttcaagtgtggcgaaaagggccacgagagtaatgtaagtgaccgag-atgagaagaagtgtttcagatgt 21928764  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||| |||||  | ||  | ||||   |||| |    
T  21928763 ggacagaaaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacaatgcaagaagccca 21928664  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||| | || ||||| || |||||||| |||||| ||| ||| | |   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21928663 agaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 21928564  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||     
T  21928563 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggcgaaatg 21928464  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21928463 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 21928411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22374480 - 22373852
Alignment:
Q  24 aagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 123  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374480 aagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatcaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 22374381  T
Q  124 agcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagat 223  Q
    || |||||||| | ||||| || |||| |||||||| ||| || || || ||  | |||||  |||||||||| |  ||||||||| || || |||||||    
T  22374380 agtagagtcgtccgaaaccgtatagtgcccctgctgtcaaaggtaaacaaagacttaatgaggagaggaggcctaggaggagagattctcctactgagat 22374281  T
Q  224 cgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagtt 323  Q
     || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |      ||||| || || || || ||||||||  |||||||||||||  ||| |    
T  22374280 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 22374181  T
Q  324 gattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaag 423  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| || |||||  | ||  ||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || |    
T  22374180 gattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaagg 22374081  T
Q  424 tgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactag 523  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22374080 tgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 22373981  T
Q  524 tgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggt 623  Q
    ||||||||||  |||||||| | || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22373980 tgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 22373881  T
Q  624 tcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22373880 tcagtaactacttctcttgtttgtttgag 22373852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 414 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28989351 - 28989119
Alignment:
Q  414 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 513  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28989351 ggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 28989252  T
Q  514 tagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactac 613  Q
    | |||||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  28989251 ttgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactcc 28989152  T
Q  614 agctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28989151 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 28989119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20391712 - 20391069
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||||||||| ||||| ||    || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20391712 gccattgggtatcaaaagatcaggcaattttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaagaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagc 20391613  T
Q  109 gcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagaga 208  Q
    | ||    || || |||||  ||||| | || || |||||||  ||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||| || || || |||||    
T  20391612 ggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagtagaga 20391513  T
Q  209 tgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaa 308  Q
    || | || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |     |||||||| || |||||| | |||||  |||||    
T  20391512 tgttccttctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttccaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaa 20391413  T
Q  309 ggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggtta 408  Q
    || || ||  |||  || ||||||||||||||| |||| || |  || ||  ||||||| || ||| |  ||||  ||||||   |||| ||||||| |     
T  20391412 gggcatactatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctc 20391313  T
Q  409 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgc 508  Q
      || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20391312 agacaggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttc 20391213  T
Q  509 tattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaa 608  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| | ||| | ||   ||| |  |||||||| |||||||||    
T  20391212 tattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaa 20391113  T
Q  609 actacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20391112 actccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 20391069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357525
Alignment:
Q  506 tgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgtt 605  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  606 gaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 27357525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421681
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22421681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 21254082 - 21253937
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21254082 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21253983  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21253982 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21253937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 490 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523538
Alignment:
Q  490 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 589  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  590 aggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
     ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 639
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375239
Alignment:
Q  471 agaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 570  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  571 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctc 639  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| || || || |||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc 22375239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 453 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 19981149 - 19980962
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| || || ||||||||||  ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |    
T  19981149 aatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 19981050  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19981049 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 494 - 653
Target Start/End: Original strand, 21164178 - 21164337
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||| ||| |||||| | || ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 21164277  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  21164278 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaga 21164337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22990264 - 22990037
Alignment:
Q  416 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 515  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||  | ||||||||||  ||||  ||| | ||||| |||||| ||||||||||     
T  22990264 tgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattatt 22990165  T
Q  516 gatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacag 615  Q
    |||||||||||||  |||| ||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  22990164 gatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 22990065  T
Q  616 ctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22990064 cgaagggttcggtgactacttctcttgt 22990037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Original strand, 21391505 - 21391650
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21391505 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21391604  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21391605 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21391650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Original strand, 21780831 - 21780976
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21780831 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21780930  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21780931 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21780976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786144
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21786144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 490 - 649
Target Start/End: Original strand, 22245651 - 22245810
Alignment:
Q  490 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 589  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22245651 atagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaa 22245750  T
Q  590 aggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgctt 649  Q
     ||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22245751 tggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgctt 22245810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 490 - 649
Target Start/End: Original strand, 22246069 - 22246228
Alignment:
Q  490 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 589  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22246069 atagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaa 22246168  T
Q  590 aggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgctt 649  Q
     ||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22246169 tggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgctt 22246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 17671655 - 17671808
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  17671655 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 17671754  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17671755 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17671808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 19115548 - 19115395
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  19115548 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19115449  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115448 gaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 19115395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 20015896 - 20016049
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  20015896 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 20015995  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20015996 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 30310324 - 30310557
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| |||||||||||    
T  30310324 ttttccctgatttagtgaatagttgcagaatctacgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggtcagcagagtcg 30310423  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      ||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| || || ||||||| |    
T  30310424 ccctaaaccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttc 30310523  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310524 aactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 30310557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 32603293 - 32603140
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  32603293 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 32603194  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32603193 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 32603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Original strand, 6606759 - 6606882
Alignment:
Q  144 tacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcg 243  Q
    |||||||| |||  |||||  ||| |||| || ||||||||| ||||||| || || || ||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  6606759 tacagtgttcctattgacagaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtg 6606858  T
Q  244 agaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  6606859 agaagggccacaagagtaatgttt 6606882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 18859725 - 18859572
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18859725 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18859626  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18859625 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18859572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 22117808 - 22117961
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  |  ||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22117808 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22117907  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22117908 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 22126592 - 22126745
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22126592 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22126691  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22126692 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctct 22126745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031098
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctct 22031098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22524088 - 22523881
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||| ||| | || |||| ||| |||||||||||| |  ||| |||||| | ||| || || |||||||||||| | || || ||||||| |||||    
T  22524088 tgcaggatttataaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgcccctg 22523989  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| |||||||| || ||  | |||||| ||||| |||| |  | || ||||||| ||| |||||| || || || |  |||||||||||||||||||     
T  22523988 ctgataagggaaaacaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtgtgctatacttgtggcgagaaaggccacag 22523889  T
Q  257 gagtaatg 264  Q
    ||||||||    
T  22523888 gagtaatg 22523881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 22126150 - 22126268
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  22126150 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 22126249  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  22126250 cgtacagtgcccccgctga 22126268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 15536439 - 15536378
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15536439 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15536984 - 15536843
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| |||||||||||    
T  15536984 ttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatagtaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcg 15536885  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagag 175  Q
      |||| || || |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  15536884 ccctaagccttatagtgcccctgccgataagggcaagcagag 15536843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22042975 - 22042822
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || ||| || || | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22042975 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 22042876  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||  ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22042875 gattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 30310777 - 30310930
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  30310777 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 30310876  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30310877 gaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctct 30310930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 21970698 - 21970793
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaagg 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| ||||| ||||    
T  21970698 tcaagagagccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21970793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 22004228 - 22004323
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaagg 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22004228 tcaagagagccattggttatcagaagattataaacttttctaagttggtgagtagctgtaggatttatgaagatgataccaaagctcattataagg 22004323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18860167 - 18860049
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  18860167 gatttggttaatagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 18860068  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  18860067 cgtacagtgcccccgctga 18860049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 22129342 - 22129403
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22129342 tctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22129403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 166
Target Start/End: Original strand, 19481335 - 19481387
Alignment:
Q  114 ggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||    
T  19481335 ggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaggg 19481387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 22117366 - 22117474
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||| |||||| |||| |    
T  22117366 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcaaagtcgtcctaagc 22117465  T
Q  142 catacagtg 150  Q
    | |||||||    
T  22117466 cgtacagtg 22117474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 19481797 - 19481858
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  19481797 tctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctct 19481858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22043428 - 22043195
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| ||||||||||     
T  22043428 ttttccctgatttggttaatagatgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtca 22043329  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      |||| || || |||| |||| |||||||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |  |||||||   ||||| |    
T  22043328 ccctaagccttatagtgcccctactgacaagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccaactgagattacttgtttc 22043229  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22043228 aattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 22043195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 12357459 - 12358104
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12357459 tcaagagagccattaggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaggtgat 12357558  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  12357559 gagtgagcgcagaggtaagggacatcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagtagaggctgaatgatgagaggaggcccaag 12357658  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||||    
T  12357659 aggagagatactcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 12357758  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || |||||| ||||  |||| ||||| || ||    
T  12357759 gtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaa 12357858  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12357859 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacct 12357958  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12357959 ttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatgg 12358058  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12358059 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 12358104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 16831460 - 16832111
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  16831460 tcaagagagccatagggtaccaacagataagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 16831559  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| |||    
T  16831560 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcatcctaagccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaat 16831659  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  16831660 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 16831759  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  16831760 gtcagaagggtcacgtgttagcggactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaa 16831859  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16831860 gaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 16831959  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  16831960 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatgg 16832059  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16832060 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 16832111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 31942100 - 31941458
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  31942100 tcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgat 31942001  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||  | || ||| ||||||||||| | || || || ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31942000 gagtgatcgaaggagcaaaggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaat 31941901  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  31941900 aggagaaatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 31941801  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  31941800 gtcagaagggacacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacgcagccgaa 31941701  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31941700 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 31941601  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31941600 ttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 31941501  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  31941500 ttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgt 31941458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 31692117 - 31692759
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  31692117 tcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgat 31692216  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||  | || ||||||||||||||| | || || || ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31692217 gagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaat 31692316  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  31692317 aggagaaatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 31692416  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  31692417 gttagaagggacacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtacgcagccgaa 31692516  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31692517 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 31692616  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31692617 ttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 31692716  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31692717 ttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgt 31692759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 18131279 - 18131923
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  18131279 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatatggtgagtagctgtaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaagtgat 18131378  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||  ||||| || |||||||||||||     
T  18131379 gagtgaacggagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagagactgaataatgagaggaggcccaag 18131478  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || |||||||||||||    
T  18131479 aggagagatgctcctgttgagattgattgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 18131578  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||| |  ||| | |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||  | |||||  ||||  |||| || || |  ||    
T  18131579 gtcagaaaggacacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtcatattagttcgcagtgtactcaactgaa 18131678  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18131679 gaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 18131778  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  18131779 ttaattgctattataga-cctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacgg 18131877  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18131878 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 18131923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 11958113 - 11958764
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  |||||| |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  11958113 tcaaaagagctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcgggatttatgaggaagacacaaaagttcattacaaggtgat 11958212  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || || |||||  |||||||| | |||||||  ||     
T  11958213 gagtgagaggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagaatgaatgatgataggaggcttaag 11958312  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||| || |   |  |||||||  || || ||||||||||    
T  11958313 aggagagatgctcctgctgaaattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtttcaggtgtg 11958412  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| || |||||||  ||  |||| || || ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  11958413 gtcagaaaggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaagtcatatcagttcatagtgtactcagccgaa 11958512  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11958513 gaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcct 11958612  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11958613 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 11958712  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11958713 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 11958764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 2 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17189570 - 17188920
Alignment:
Q  2 caagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatg 101  Q
    |||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||| ||| ||||| | |||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  17189570 caagagggctattggataccagaagatcagaaacttctttgagttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacaaaagctcattacaaggtgatg 17189471  T
Q  102 agtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | || || |||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |    
T  17189470 agtgaccgcagaggcaagggccagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctaacaagggaaagcagagatttaatgatgagaggaggtccaaga 17189371  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtgg 301  Q
    ||||||||||| ||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  17189370 ggagagatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 17189271  T
Q  302 tcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaag 401  Q
    |||||||||||||||  | | | | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||  |||| || |||||||||    
T  17189270 tcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaag 17189171  T
Q  402 aaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctt 501  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17189170 aagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctt 17189071  T
Q  502 taattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagt 601  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| || ||    
T  17189070 taattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatggagggagagatggt 17188971  T
Q  602 tgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17188970 tgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgag 17188920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24190500 - 24189850
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| || || |||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  24190500 tcaagagggctattggataccagaagatcagaaacttctctgatttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacgaaagctcattacaaggtgat 24190401  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    || ||| |||||||| ||||  |||||||||||| | || || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||     
T  24190400 gactgaccgcagaggcaaggc-cagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggtacaag 24190302  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  24190301 aggagagatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 24190202  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | | | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||  |||| || ||||||||    
T  24190201 gtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaa 24190102  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24190101 gaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 24190002  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  24190001 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatgaagggagagatgg 24189902  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  24189901 ttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgag 24189850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 8744322 - 8744973
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| || |||||    
T  8744322 tcaagagagccataggataccagcagattagaattttctctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgat 8744421  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||  |||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | |    
T  8744422 gagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccgactgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagt 8744521  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | ||| |||||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  8744522 aagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtg 8744621  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| || || |||||||||| || ||    
T  8744622 gacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacaaccgaa 8744721  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8744722 gaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 8744821  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  8744822 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatgg 8744921  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744922 ttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 8744973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13945221 - 13944570
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  13945221 tcaagagagccataggataccaacagattagaattttctctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 13945122  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||  |||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | |    
T  13945121 gagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccgactgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagt 13945022  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | ||| |||||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  13945021 aagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtg 13944922  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||    
T  13944921 gacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaa 13944822  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13944821 gaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 13944722  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13944721 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatgg 13944622  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13944621 ttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgag 13944570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 646
Target Start/End: Original strand, 16326641 - 16327286
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  16326641 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatga 16326740  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    ||||| | || || |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||||||| | | |||||||| | ||||| ||||| ||    
T  16326741 gtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctgacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaaaaggtgaatgatgataggagacccaagag 16326840  T
Q  203 gagaga-tgcttctgctgaga-tcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |   |  |||||||  ||||| ||||||||||    
T  16326841 gagagactgctcctgctgagacttgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtg 16326940  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||   ||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| |||||| ||||  |||| ||  |||| ||    
T  16326941 gtcagaagggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtactaagccgaa 16327040  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16327041 gaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 16327140  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16327141 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 16327240  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16327241 ttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttg 16327286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 16825211 - 16825858
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16825211 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgat 16825310  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || || || |||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||     
T  16825311 gagtgagcgcagaggcaagggacagctgagtcgtccgaagccgtatagtgcccctcctgacaagggtaagtagagattgaaagatgagaggaggcccaag 16825410  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | |||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |      |||||||| || |||||||||||||    
T  16825411 atgagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgatgagaagaagtgcttcaggtgtg 16825510  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || | |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| ||| || || || |||||| |||   |||| || ||||| ||    
T  16825511 gtaaaaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggtcatatcagtttgcagtgtacgcagcctaa 16825610  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaata--gtactc 498  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  16825611 gaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtactc 16825710  T
Q  499 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaat 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16825711 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaat 16825810  T
Q  599 agttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16825811 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 16825858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 47127141 - 47126496
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  47127141 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattat 47127042  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| | |||||||||||     
T  47127041 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaag 47126942  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  47126941 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 47126842  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  47126841 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 47126742  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47126741 gaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 47126642  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |    
T  47126641 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatgg 47126542  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47126541 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 47126496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10409165 - 10408520
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  10409165 tcaaaagagctattggatatcagcagatcagagttttttctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 10409066  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||||| || |||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  10409065 gagtgagaggaggggtaagggacaccagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaagatgggtgatgataggaggcccaag 10408966  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  10408965 aggagagatgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 10408866  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  10408865 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 10408766  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10408765 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 10408666  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  10408665 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 10408566  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10408565 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 10408520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12181541 - 12180896
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |   |||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  12181541 tcaagagaaccattggctatcagaaaataaggaacttctctgaattggtaagcggctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 12181442  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  12181441 gagtgaacgaagaggcaagggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagtagaggttaaatgatgagaggaggaccaag 12181342  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||| ||  |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |   |  |||||||| || |||||||| ||||    
T  12181341 aggagagatgctcctactgacattttttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaaagtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagttgtg 12181242  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||| |||||| | || || |||||| |||| ||||| || || || ||    
T  12181241 gtcggaaaggacacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcaaccgaa 12181142  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12181141 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 12181042  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12181041 ttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatgg 12180942  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12180941 ttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 12180896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 17494847 - 17494198
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||| || || ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  17494847 tcaagagagccattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattacaaggtgat 17494748  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac----aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcc 196  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17494747 gagtgagcgcagagccaagggacaacaaagtcgttcgaagccatatagtgctcctgctggctgagaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcc 17494648  T
Q  197 caataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcagg 296  Q
    ||| ||||||||||||  | ||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |   |  |||||||| || |||| ||||    
T  17494647 caagaggagagatgctcatactgagattgtttgcttcaaatgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgct-cagg 17494549  T
Q  297 tgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagc 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||| ||  |||| || |||||||||||||| || || |||||  ||||  |||| || || |    
T  17494548 tgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaac 17494449  T
Q  397 caaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtac 496  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  | || |||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17494448 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 17494349  T
Q  497 tcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaa 596  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17494348 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 17494249  T
Q  597 atagttgttg-aaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17494248 atggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttg 17494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28757516 - 28756871
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  28757516 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 28757417  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  28757416 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 28757317  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  28757316 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 28757217  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| | ||| || |||||  ||||  ||||  |  |||| ||    
T  28757216 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaa 28757117  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28757116 gaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 28757017  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  28757016 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 28756917  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28756916 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 28756871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 14290464 - 14291115
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |  || || || || |||||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  14290464 tcaagagggctattggttatcaaaagataagaaatttttctgaattggaaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgat 14290563  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  14290564 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaag 14290663  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |      |||||||| || ||||| |||||||    
T  14290664 aggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagatgagaagaagtgctttaggtgtg 14290763  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||  | |||||||| |||||  | ||  ||||||   |||| ||    
T  14290764 gacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcctaa 14290863  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14290864 gaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcat 14290963  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14290964 ttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatgg 14291063  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14291064 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 14291115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 16384304 - 16384721
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  16384304 tcaagagagccataggataccaacagattagaattttctctgatttggtaagttgctgtaggatctatgaggaggacagcaaagctcattataaggtgat 16384403  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| |||    
T  16384404 gagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccatacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaat 16384503  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  16384504 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaagtccacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 16384603  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  16384604 gtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaa 16384703  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgg 418  Q
    |||||||||||| |||||    
T  16384704 gaaggttagaactggtgg 16384721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 251 - 644
Target Start/End: Original strand, 11949107 - 11949500
Alignment:
Q  251 ccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| || |||||||| ||     
T  11949107 ccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgc 11949206  T
Q  351 tataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagta 450  Q
    ||||||||||| || || || || ||| |||   |||| ||  || | ||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |    
T  11949207 tataactgcaatgaggaaggtcacatcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaacca 11949306  T
Q  451 ctaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaa 550  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11949307 ctagtgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 11949406  T
Q  551 atgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtt 644  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11949407 atgtggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 652
Target Start/End: Original strand, 12857436 - 12858078
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12857436 gccattggctaccaaaagataagaattttttttgatttggtgagtagctgtagaatctatgaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagc 12857535  T
Q  109 gcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagaga 208  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||  |  |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  12857536 gtagaggcaagggacagtagagtcgtccaaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacaaggactgaatgatgagaggaggcctaaaaggagaga 12857635  T
Q  209 tgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaa 308  Q
    |||| || ||||||| || |||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||| | |      |||||||| || || ||| | |||||  |||||    
T  12857636 tgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaagggccacatgagtaatgtatgtgactgtgatgagaagaagtgtttccgatgtggaaagaaa 12857735  T
Q  309 ggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggtta 408  Q
    |||||||   ||| ||| ||||||||| ||||| |||| || || || ||  | ||||| || |||||  | || |||||||   |||| ||||||| |     
T  12857736 ggacacataatagctgagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgtagtgcaggaagcctaagaaggctc 12857835  T
Q  409 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgc 508  Q
      || ||||| || |||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857836 tgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggac-gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 12857934  T
Q  509 tattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaa 608  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |    ||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  12857935 tattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaa 12858034  T
Q  609 actacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12858035 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 12858078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 35983378 - 35982839
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  35983378 tcaagagggctattggttatcataagataagaaatttttctgaattggtaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgat 35983279  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||  ||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  35983278 gagtgagtgcagaggtaagggacagcagagttgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaag 35983179  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || ||| |||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  | |||||||| || || ||||| |||    
T  35983178 aggagagatgctcctactgtgattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccga-gatgagaagaagtgtttcagatgt 35983080  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||||  ||||  | || || ||||| |    
T  35983079 ggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcattgtacgcagccta 35982980  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| |||||| |     |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  35982979 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactct 35982880  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttca 540  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  35982879 tttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 399 - 621
Target Start/End: Original strand, 13317864 - 13318086
Alignment:
Q  399 aagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactc 498  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13317864 aagaaggtcagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 13317963  T
Q  499 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaat 598  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13317964 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaat 13318063  T
Q  599 agttgttgaaactacagctaagg 621  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  13318064 ggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 225 - 640
Target Start/End: Original strand, 10417201 - 10417616
Alignment:
Q  225 gtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttg 324  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||     | |  |    
T  10417201 gtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggcgg 10417300  T
Q  325 attgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagt 424  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    || ||||| || ||  ||||  ||||| | || || |||||||| ||||| || || |||||    
T  10417301 attgcaagcgtggagatattgtttgttttaactgtggtgatgagggtcacattagttcgcagtgcccgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagt 10417400  T
Q  425 gtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagt 524  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10417401 atttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggt 10417500  T
Q  525 gctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggtt 624  Q
    ||||| |||| |||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  10417501 gctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtt 10417600  T
Q  625 cagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||||||||    
T  10417601 cagtgactacttctct 10417616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 434 - 652
Target Start/End: Original strand, 16378299 - 16378517
Alignment:
Q  434 gactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  16378299 gactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcat 16378398  T
Q  534 tatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgacta 633  Q
    | |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16378399 tgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaacta 16378498  T
Q  634 cttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16378499 cttctcttgtttgcttgag 16378517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 453 - 646
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12510060
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 12509966  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||  || |||||||| |||||    
T  12509967 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttg 12510060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15230648 - 15230149
Alignment:
Q  153 cctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcc 252  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| || || | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  15230648 cctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggcc 15230549  T
Q  253 acaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgtta 352  Q
    ||||||||||||||| ||     |||||||| || || ||| | |||||  ||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||| |||| || |     
T  15230548 acaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgctt 15230449  T
Q  353 taactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtact 452  Q
     || ||  | ||||| || ||| |  | ||  | ||||   |||| ||||||| |   || ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||    |    
T  15230448 caattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggtt 15230349  T
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| || | |    
T  15230348 aatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 15230249  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
     ||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  15230248 ttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgag 15230149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15236516 - 15236017
Alignment:
Q  153 cctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcc 252  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| || || | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  15236516 cctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggcc 15236417  T
Q  253 acaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgtta 352  Q
    ||||||||||||||| ||     |||||||| || || ||| | |||||  ||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||| |||| || |     
T  15236416 acaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgctt 15236317  T
Q  353 taactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtact 452  Q
     || ||  | ||||| || ||| |  | ||  | ||||   |||| ||||||| |   || ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||    |    
T  15236316 caattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggtt 15236217  T
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| || | |    
T  15236216 aatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 15236117  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
     ||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  15236116 ttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgag 15236017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 489 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272890
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | | ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  589 aaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 12272890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 552 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14575632 - 14575538
Alignment:
Q  552 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14575632 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 14575538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 415 - 651
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013351
Alignment:
Q  415 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||   | |||||||| || || ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  515 agatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactaca 614  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| |  | | ||||||  |||||||||| | ||| | ||   |||||| || ||||| ||||| |||||  ||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 15013314  T
Q  615 gctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttga 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  15013315 gctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttga 15013351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843688
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
     | | | | | ||  ||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262175
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgt 15262175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 13317501 - 13317867
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| || |||||||  || || ||||||||||| || ||||  || ||||| || |||| |||    
T  13317501 tcaagagagccattggatatcagaagatcataaatttctcggagttggtgagcagttgtaggatatatgaggaggatacaaaggctcactataaggcgat 13317600  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||| |||   ||   |||||| |||   |||||  | || || |||||||  ||||||||||| ||||| || |  || |||||| |||||||||| |      
T  13317601 gagcgagaagaggaataagggccagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaatattaaatgatgagaggaggcctagg 13317700  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     ||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||  || || |||||||| || || ||||| ||||    
T  13317701 gggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcaaaaggccacaaaagtaatgtttgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtg 13317800  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaaga 367  Q
    |||| ||||| ||     |||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  13317801 gtcaaaaaggtcatgttttagcggattgcaagcgtggggatgtggtttgttataactgtaatgaaga 13317867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 2036846 - 2037110
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | |  |    
T  2036846 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcactataagattagaa 2036945  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac-aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
     |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   || ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| || || |    
T  2036946 atgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaaccaaggggaa-cagagattgactgatgagaggagacctaaga 2037044  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2037045 ggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 2037110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 2040587 - 2040851
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | |  |    
T  2040587 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcactataagattagaa 2040686  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac-aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
     |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   || ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| || || |    
T  2040687 atgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaaccaaggggaa-cagagattgactgatgagaggagacctaaga 2040785  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2040786 ggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 2040851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14039941 - 14039677
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | |  |    
T  14039941 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcactataagattagaa 14039842  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac-aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
     |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   || ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| || || |    
T  14039841 atgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaaccaaggggaa-cagagattgactgatgagaggagacctaaga 14039743  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14039742 ggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 14039677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 267
Target Start/End: Original strand, 15008673 - 15008782
Alignment:
Q  158 tgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaag 257  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| || || |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15008673 tgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagagaggccacaag 15008772  T
Q  258 agtaatgttt 267  Q
    ||||||||||    
T  15008773 agtaatgttt 15008782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 15345674 - 15345827
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15345674 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 15345773  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15345774 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15345827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16638474 - 16638321
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| || | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16638474 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16638375  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16638374 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16638321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 43165376 - 43165223
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  43165376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 43165277  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43165276 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 43165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 48428148 - 48427995
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  48428148 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 48428049  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48428048 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 48427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 487 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065608
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttga 651  Q
    ||| ||||| || ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttga 15065608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10008301 - 10008148
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  10008301 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10008202  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10008201 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10908911 - 10908758
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  10908911 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10908812  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10908811 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10908758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12889410 - 12889257
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  12889410 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12889311  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12889310 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12889257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13255391 - 13255238
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  13255391 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 13255292  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13255291 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 15358784 - 15358631
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15358784 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15358685  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15358684 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 15713485 - 15713638
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15713485 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15713584  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15713585 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 24185891 - 24185738
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  24185891 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 24185792  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24185791 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 24185738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 10416979 - 10417079
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||    
T  10416979 aagagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaactggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatga 10417078  T
Q  103 g 103  Q
    |    
T  10417079 g 10417079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 15713043 - 15713177
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  15713043 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 15713142  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaagggaaagcagagg 176  Q
    | ||||||| ||| ||||| || || |||||||||    
T  15713143 cgtacagtgcccccgctgataaagggaagcagagg 15713177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 3688644 - 3688491
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||    | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  3688644 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 3688545  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3688544 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 3688491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10008734 - 10008625
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtg 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  10008734 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 10008635  T
Q  151 tccctgctga 160  Q
     |||||||||    
T  10008634 cccctgctga 10008625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10909344 - 10909235
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtg 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  10909344 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 10909245  T
Q  151 tccctgctga 160  Q
     |||||||||    
T  10909244 cccctgctga 10909235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874150
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||| || |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 15586821 - 15586974
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15586821 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15586920  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15586921 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 15586974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 2245612 - 2245712
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2245612 gccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctttaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtgagc 2245711  T
Q  109 g 109  Q
    |    
T  2245712 g 2245712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3689086 - 3688962
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  3689086 gatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 3688987  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  3688986 cgtacagtgcccccgctgacaaggg 3688962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 498 - 638
Target Start/End: Original strand, 14578848 - 14578988
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| ||||| |    
T  14578848 cctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagaga 14578947  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttct 638  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14578948 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 14578988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 15399946 - 15400099
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15399946 ttaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15400045  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15400046 gaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctct 15400099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 16754222 - 16754283
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16754222 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19727890 - 19727686
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||  ||||| |||| | | || || |||||||  ||||    
T  19727890 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagaaaaggcaaggt-cagcaaagtcttccaaagccttacagtgctcctg 19727792  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||| || | || ||||| |  ||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||    
T  19727791 ctgataagggcaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctaaaaagaaagatgttgttgctgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataa 19727692  T
Q  257 gagtaa 262  Q
    ||||||    
T  19727691 gagtaa 19727686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 20059575 - 20059636
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20059575 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20059636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16695318 - 16695255
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggt 97  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  16695318 ttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggt 16695255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 650
Target Start/End: Original strand, 16804376 - 16804539
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | | ||||||    
T  16804376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatat 16804475  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttg 650  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  16804476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttg 16804539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492396
Alignment:
Q  560 taagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgt 17492396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12501893 - 12501751
Alignment:
Q  228 tgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgatt 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||| |  || ||||| ||| |||||||  |||| || |||||  ||| |||||    
T  12501893 tgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgatt 12501794  T
Q  328 gcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagaggg 370  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||    
T  12501793 gcaagcatggtgatattgtgtgtttcaattgcaaggaagaggg 12501751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16638913 - 16638795
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  16638913 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 16638814  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  16638813 acagtgcccccgctgacaa 16638795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43165815 - 43165697
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  43165815 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 43165716  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  43165715 acagtgcccccgctgacaa 43165697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422512
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 5422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6597198 - 6597077
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  6597198 gatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 6597099  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaa 163  Q
    | ||||||| ||| ||||||||    
T  6597098 cgtacagtgcccccgctgacaa 6597077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 6603344 - 6603283
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6603344 tctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 6603283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 12508577 - 12508694
Alignment:
Q  81 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttga 180  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||| | ||||| |||||| | || || |||||||  || ||||| |||||  |||||||| |||    
T  12508577 aaagctcattacaaggctatgagtgagaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctccggctgataagggtgagcagagggtga 12508676  T
Q  181 atgattagaggaggccca 198  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  12508677 atgatgagaagaggccca 12508694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16694773 - 16694712
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16694773 tctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctct 16694712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 23078993 - 23079226
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||| |  ||| |||||| |    |||||| |||||||||||    
T  23078993 ttttctccgagttggtgaacagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcg 23079092  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      |||| || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||   ||  | ||  |||| |  | ||  |||||| |||||| ||| |||||||      
T  23079093 ccctaagccttatagtgcccctgctgataagggaaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgtgattgtttgtttt 23079192  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23079193 aattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 23079226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 26790934 - 26790995
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26790934 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 26790995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 53382539 - 53382600
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53382539 tctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 53382600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 23414939 - 23414999
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414939 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaactatggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 23414999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11861334 - 11861195
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcaga 306  Q
    |||||| |||| ||||| || | || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||| | ||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  11861334 gatgctcctgcggagattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggtaaga 11861235  T
Q  307 aaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgt 346  Q
    | || || ||  ||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  11861234 agggtcatactttagctgattgcaagcatagtgatattgt 11861195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13255830 - 13255712
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || |  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  13255830 ttggttaatagctgcaggatctacgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 13255731  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  13255730 acagtgcccccgctgacaa 13255712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6603878 - 6603757
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  6603878 gatttggttaacagctgtaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 6603779  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaa 163  Q
    | ||||||| ||| ||||||||    
T  6603778 cgtacagtgcccccgctgacaa 6603757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Original strand, 14873561 - 14873622
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaag 95  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||    
T  14873561 ttttctctgagttggtgaacagttgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattacaag 14873622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Original strand, 16753688 - 16753809
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||| |||||| |||| |    
T  16753688 gatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagc 16753787  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaa 163  Q
    | ||||||| ||| ||||||||    
T  16753788 cgtacagtgcccccgctgacaa 16753809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17201344 - 17201299
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17201344 aatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcatt 17201299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16695125 - 16695085
Alignment:
Q  227 ttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16695125 ttgtttcaattgtggcgagaaaggccgcaagagtaatgttt 16695085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 194 - 836
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  194 tcaagagagccattggctatcagaagataagaatcttctctgatttggtgagtagttgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 293  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  294 gagtgaacgaagaggtaagggacaacagagtcaccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcagatattgaatgatgagaggaggcccaat 393  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  394 aggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaaatgtggcaggaaaggccacaagagtgatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtg 493  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  494 gtcagaaaggacacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacagccgaa 593  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  594 gaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 693  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||||| |    
T  694 ttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatgg 793  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  794 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21402 - 20766
Alignment:
Q  10 ccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcg 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21402 ccattggctatcagaagataagaaatttctccgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaagataggaaagctcattacaaggtgatgagtgagcg 21303  T
Q  110 cagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagat 209  Q
     | ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21302 taaaggcaagggacagtagagtcgtcctaaaccgtatagtgcccctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagat 21203  T
Q  210 gcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaag 309  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  21202 gcttctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagg 21103  T
Q  310 gacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttag 409  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| || ||  |  | || ||||||||||| || ||||||| |||| ||||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  21102 gacacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgaggagggccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttag 21003  T
Q  410 aaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgct 509  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002 aaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgct 20903  T
Q  510 attatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaa 609  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20902 attatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaa 20803  T
Q  610 ctacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20802 ctccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 20766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 98290 - 98932
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| |||||  ||||||| ||||  || |||||||||||||| ||    
T  98290 tcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatcaatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtaat 98389  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  98390 gagtgaaaggagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtgctcatgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 98489  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  98490 tggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 98589  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  98590 gtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaa 98689  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  98690 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcct 98789  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  98790 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaaatgg 98889  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  98890 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 98932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 176544 - 175934
Alignment:
Q  41 tgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaa 140  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  176544 tgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaa 176445  T
Q  141 ccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtg 240  Q
    || || ||||  |||||  |||| |  || |||||  |||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || | ||||| || |||| ||||||||    
T  176444 ccgtatagtgctcctgccaacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctacagagattgtctgtttcaagtgtg 176345  T
Q  241 gcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtga 340  Q
    | || |||||||||||||||||||| | |      |||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  176344 gtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtga 176245  T
Q  341 tgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggt 440  Q
    |||||| || ||||| ||  | ||||| || |||||  | ||  ||||||   |||   |||||| |   || ||||| || |||||||| |||||||||    
T  176244 tgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagctttagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggt 176145  T
Q  441 acgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttca 540  Q
    ||||| | |  |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  176144 acgcaaactgttaataaagaccgacttatcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 176046  T
Q  541 ttgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  176045 ttgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctct 175946  T
Q  641 tgtttgcttgag 652  Q
    |||||| |||||    
T  175945 tgtttgtttgag 175934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 19438434 - 19437789
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  || ||| ||||||||||  |    
T  19438434 tcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggcttattacaaggtagt 19438335  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  19438334 gagtgaaaggagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 19438235  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  19438234 aggagagatgctcctgctgagatcgttcgttacaagtgtggtgagaaaggccacttgagtaatgtttgtactaaagatgagaataagtgtttcaggtgtg 19438135  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  19438134 gtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatcagttcgcagtgcacacagccgaa 19438035  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19438034 gaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 19437935  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19437934 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaaatgg 19437835  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19437834 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 19437789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 14376765 - 14377410
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  14376765 tcaagagagacattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggttagtagctgcaggatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 14376864  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||  | |||||||||||||||||| | || || || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14376865 gagtgatcgaaggagcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggagacccaat 14376964  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  14376965 aggagagatgctcctgttgatgttgtttgctacaagtgcggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 14377064  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  | || |||||||| ||    
T  14377065 gtcagaaaggacacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatcagttcgcaatgtacacagccgaa 14377164  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14377165 gaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcct 14377264  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14377265 ttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 14377364  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  14377365 ttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttg 14377410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18798122 - 18797471
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  18798122 tcaagagggctattggataccagaagatcagaaacttctctgagttggtaagtagctgcagaatctatgaagaggacacagaagctcattacaaggtgat 18798023  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||     
T  18798022 gagtgaccgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaag 18797923  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||| |||||| |||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| | ||||| ||||||||||    
T  18797922 aggagggatgctcctgtggatattgtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgcactaaagatgagcagaaatgtttcaggtgtg 18797823  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||| ||||  ||||||| || |||||    
T  18797822 gtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaaggccatatcagttcacagtgcactcaaccaaa 18797723  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18797722 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 18797623  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |    
T  18797622 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaaggagagatgg 18797523  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18797522 ttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgag 18797471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 19456455 - 19455810
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || || |  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |    
T  19456455 tcaagagaggtattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggt 19456356  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||     
T  19456355 gagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaag 19456256  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| || |||||||||||      
T  19456255 aggagagatactcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggt 19456156  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||||| || || |||||  |||| ||||| || || |||||    
T  19456155 gtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaa 19456056  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| ||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19456055 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 19455956  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19455955 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatgg 19455856  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19455855 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 19455810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 10465697 - 10466339
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  10465697 tcaagagggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgat 10465796  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||  | ||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||     
T  10465797 gagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaag 10465896  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |   |  |||||||  ||||| || |||||||    
T  10465897 aggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtg 10465996  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| || |||||  ||||  |||| || ||||| ||    
T  10465997 gtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaa 10466096  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10466097 gaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 10466196  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  10466197 ttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 10466296  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10466297 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 10466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 19466600 - 19465973
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || || |  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |    
T  19466600 tcaagagaggtattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggt 19466501  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||     
T  19466500 gagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaag 19466401  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| || |||||||||||      
T  19466400 aggagagatactcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggt 19466301  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||||| || || |||||  |||| ||||| || || |||||    
T  19466300 gtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaa 19466201  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| ||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19466200 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 19466101  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19466100 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 19466001  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagt 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19466000 ttgttgaaactccagctaagggttcagt 19465973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 81 - 646
Target Start/End: Original strand, 24515343 - 24515908
Alignment:
Q  81 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttga 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24515343 aaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggcaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaaacagaggctga 24515442  T
Q  181 atgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatga 280  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  24515443 atgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatga 24515542  T
Q  281 gaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgt 380  Q
    ||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  24515543 gaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagt 24515642  T
Q  381 tcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaatt 480  Q
    ||  |||| || || || | || |||||| |||||||| || |||||| |  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  24515643 tcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtactt 24515742  T
Q  481 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24515743 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatc 24515842  T
Q  581 tgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  24515843 tgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttg 24515908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 21566840 - 21567491
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21566840 tcaagagggccattggctatcagaagatcaggactttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgat 21566939  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||||||||     
T  21566940 gagtgagcggaggagtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaag 21567039  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  21567040 aggagagatgctcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 21567139  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | | | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  |  | |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  21567140 gtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgataaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaa 21567239  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  21567240 gaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttat 21567339  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    | ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || |    
T  21567340 tcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagatgg 21567439  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21567440 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 21567491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24367832 - 24367187
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||| ||| ||||| || || || || || ||| ||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  24367832 tcaagagagccattggatatcagcagatcagagtcttctatgagttggttaacaggtgtagaatctatcaagaagacaccaaagctcattacaagataat 24367733  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  24367732 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 24367633  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  24367632 aggagagatgctcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 24367533  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| | ||| || |||||  ||||  ||||| |  | || ||    
T  24367532 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgccctgaaccgaa 24367433  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24367432 gaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 24367333  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||   | | |||||||||||||||| ||||| |    
T  24367332 ttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaaatgg 24367233  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  24367232 ttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttg 24367187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 34642434 - 34643087
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| | | ||||| ||| | | ||||||||| || ||||||||||||   |  |||||||||||||||||    
T  34642434 tcaagagggccattggctatcaaaagatcagaactctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaagggctcattacaaggtgat 34642533  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || |||||||| ||||||||| |||| || || ||||  |||||||  |||||||||||  |  |||||||| | ||||| ||| |     
T  34642534 gagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgaaaggagaccccaa 34642633  T
Q  201 agga-gagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
     ||| ||||  || |||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  34642634 gggaagagacactcctgcggagatagtttgctttaagtgtggcgagaagggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 34642733  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    || ||||| || |||    ||| |||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| |  ||||| |||||| ||||| ||||||| || || |    
T  34642734 ggacagaagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgatattgtatgctacaactgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccga 34642833  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |   | ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  34642834 agaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccc 34642933  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  | |||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  34642934 tttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatg 34643033  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34643034 gtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaga 34643087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 15462768 - 15462129
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15462768 tcaagagagccattggatatcagaagatcaggattttctcggagttggtgagtagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagctcattacaaggtgat 15462669  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||   ||   |||||| |||   |||||  | || || |||||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||||| |||||  ||| |      
T  15462668 gagtgagaagaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctaacaaaggcaaacagagattgaatgatgagaggcagcctaga 15462569  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     |||||||  || ||| |||  | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||||| || |    
T  15462568 gggagagagactcctgttgatgttgtgtgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccagagatgagaagaaatgtttcagatgcg 15462469  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||| ||     | | ||| |||||||| || ||| | || |||||||||||    || |||||||| ||  ||||  ||||||| || || ||    
T  15462468 gtcagaaaggtcatgtgttggctgagtgcaagcggggagatatcgtgtgttataactgtggtgaggagggccacattagttcgcagtgcacgcaacctaa 15462369  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15462368 gaaggtcagaactggaggaaaagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 15462269  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15462268 ttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 15462169  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15462168 ttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 15462129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 153 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21474880 - 21474381
Alignment:
Q  153 cctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcc 252  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  21474880 cctgctgacaagggtaagcagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcc 21474781  T
Q  253 acaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgtta 352  Q
    ||||||||||||| | |      |||||||| || || ||| | |||||  |||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| |||| || ||    
T  21474780 acaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattgtgtgcta 21474681  T
Q  353 taactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtact 452  Q
     || ||  | |||||||| |||||  ||||| ||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  21474680 caattgtgatgaagagggtcatattagttctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacttct 21474581  T
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | || | |    
T  21474580 aatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgatt 21474481  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  21474480 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgag 21474381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25771253 - 25770625
Alignment:
Q  24 aagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 123  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25771253 aagataaggaatttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattatagagtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 25771154  T
Q  124 agcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagat 223  Q
    | ||||||||| |  |||| || ||||  ||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  25771153 aacagagtcgtccgtaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagat 25771054  T
Q  224 cgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagtt 323  Q
     || |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| | | |      |||||||| || || ||  | |||||   ||||||||||||  ||  |    
T  25771053 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagaataatttatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttcgatgtgggacgaaaggacacacattatct 25770954  T
Q  324 gattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaag 423  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || || ||  | ||||| || |||||  | ||| ||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |    
T  25770953 gattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaagg 25770854  T
Q  424 tgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactag 523  Q
    ||||| | |||||| ||| ||| | |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25770853 tgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattgg 25770754  T
Q  524 tgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggt 623  Q
    ||||| ||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  25770753 tgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggt 25770654  T
Q  624 tcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  25770653 tcaatcactacttctcttgtttgtttgag 25770625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 652
Target Start/End: Original strand, 19486223 - 19486794
Alignment:
Q  81 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttga 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    || || |||||  ||||||| || || |||||||  ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  19486223 aaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggaacaaaggccagcaaggtcgttcgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattga 19486322  T
Q  181 atgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatga 280  Q
    ||||| ||||||| || || || ||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |     |||||    
T  19486323 atgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatga 19486422  T
Q  281 gaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgt 380  Q
    ||| || |||||| | |||||  ||||||| || ||  |||  || ||||||| ||||||| |||| || |  || ||  ||||||| || ||| |  ||    
T  19486423 gaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcatggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagt 19486522  T
Q  381 tcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaatt 480  Q
    ||  ||||||   |||| ||||||| |    | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19486523 tcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtactt 19486622  T
Q  481 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||  | ||    
T  19486623 gtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtc 19486722  T
Q  581 tgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
       |||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19486723 aagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgag 19486794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081213
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 23081213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 653
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405445
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgaga 18405445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 643
Target Start/End: Original strand, 20010825 - 20010945
Alignment:
Q  523 gtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaaggg 622  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  20010825 gtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaaggg 20010924  T
Q  623 ttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  20010925 ttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 471 - 646
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182861
Alignment:
Q  471 agaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 570  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||   | ||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  571 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttg 18182861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 453 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22436849 - 22436662
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  | |    
T  22436849 aatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgatt 22436750  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22436749 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16814072 - 16813806
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || || || ||||||| ||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | |     
T  16814072 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttccgagttggtgagtagctacatgatatatgaggaggataccaaagctcactataagattag 16813973  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    || |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   |||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||| || ||     
T  16813972 gaatgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacagagattgaatgatgagaggagacctaag 16813873  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16813872 aggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 16813806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 267
Target Start/End: Original strand, 8720730 - 8720820
Alignment:
Q  177 ttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8720730 ttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgatcctgatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 8720820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 267
Target Start/End: Original strand, 30677929 - 30678139
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||| |||| | || || ||||  |  ||||    
T  30677929 tgcaggatctatgaggaagataccaaagctaattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagaatcgtccaaagccttacaacgctcctg 30678028  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||| |  | || |||| || |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  30678029 ctgataaatgtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaagtgtggtgagaagagccacaa 30678128  T
Q  257 gagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||    
T  30678129 gagtaatgttt 30678139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 640
Target Start/End: Original strand, 30678340 - 30678512
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| | || ||| ||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  30678340 atcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgg 30678439  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || | ||| | ||   |||| | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  30678440 gtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctct 30678512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 29589774 - 29589927
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  29589774 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 29589873  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29589874 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 426 - 634
Target Start/End: Original strand, 5836502 - 5836710
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    ||||||||| ||  | |||||||||| ||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||    
T  5836502 tttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 5836601  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| |||||| || | ||||||||||  |||||| | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  5836602 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 5836701  T
Q  626 agtgactac 634  Q
     || |||||    
T  5836702 ggtaactac 5836710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19881828 - 19881600
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | | || || ||| | | ||||||||| || ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  19881828 tcaagagggccattggttatcagaagatcagaactctttccgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgat 19881729  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || |||| ||| || |||||| |||| || ||||| | ||||||||  |||||||||||  |  |||||||| |||| || |||||     
T  19881728 gagtgaacggaggggcaaggaacaacaaagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaag 19881629  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttg 229  Q
     | |||||  || |||||||||| |||||    
T  19881628 ggaagagacactcctgctgagatagtttg 19881600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 20010350 - 20010452
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||||    
T  20010350 tcaagagagccattggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgat 20010449  T
Q  101 gag 103  Q
    |||    
T  20010450 gag 20010452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 2872137 - 2872290
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  2872137 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 2872236  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2872237 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 2872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16574836 - 16574683
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16574836 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16574737  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16574736 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 16620544 - 16620697
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16620544 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16620643  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16620644 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16620697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 653
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925141
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 16925141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 640
Target Start/End: Original strand, 23085126 - 23085313
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||||||| | || |||||||  ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||| |||| ||| |||| | || | |    
T  23085126 aatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgttgatt 23085225  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
     ||||| |||||||||| |   | | ||   |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23085226 atgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23085313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 28312576 - 28312423
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| | || |||| || |   |||||| | |   | ||||||||    
T  28312576 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28312477  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28312476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867480
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||  | ||| | ||| ||||||| | |    
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19867480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21474993 - 21474903
Alignment:
Q  24 aagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagag 114  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21474993 aagataaggaatttttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagag 21474903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 653
Target Start/End: Original strand, 27559396 - 27559470
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  27559396 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 27559470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28313015 - 28312897
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||  | |  ||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  28313015 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 28312916  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  28312915 acagtgcccccgctgacaa 28312897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 24293209 - 24293270
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24293209 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24293270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27206007 - 27205902
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  27206007 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 27205908  T
Q  145 acagtg 150  Q
    ||||||    
T  27205907 acagtg 27205902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Original strand, 27243221 - 27243326
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  27243221 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 27243320  T
Q  145 acagtg 150  Q
    ||||||    
T  27243321 acagtg 27243326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 28260624 - 28260685
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28260624 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28260685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 28285292 - 28285231
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28285292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28285231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 28339373 - 28339434
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28339373 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28339434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23081799 - 23081592
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||| |||||||||||| |  ||| |||||| | ||  || || |||||||||||| | || || |||||||   |||    
T  23081799 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctgctg 23081700  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| || |||||||| ||  | |||||| ||||| |||| |  | || ||||||| ||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  23081699 ctgataaaggaaagcaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaa 23081600  T
Q  257 gagtaatg 264  Q
    ||||||||    
T  23081599 gagtaatg 23081592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25115406 - 25115345
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25115406 tctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 25115345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27190382 - 27190229
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | || |||||    
T  27190382 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27190283  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| || || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27190282 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 27258858 - 27259011
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | || |||||    
T  27258858 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27258957  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| || || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27258958 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 2871695 - 2871813
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||| |  ||| |||| | |  || |||||||| ||||||||| |||| |    
T  2871695 gatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagc 2871794  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
      ||||||| |||||||||    
T  2871795 tgtacagtgcccctgctga 2871813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 5836121 - 5836239
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||    ||| |||||| |  || |||||||| ||||||||| |||| |    
T  5836121 gatttggttaatagctgcaggatttacgaagaggataccaaagctcactacaagactgtgaatgagcggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagc 5836220  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | || |||| |||||||||    
T  5836221 cgtatagtgcccctgctga 5836239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 25958782 - 25958864
Alignment:
Q  181 atgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaat 263  Q
    ||||| ||||||| || || || ||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25958782 atgatgagaggagacctaagagtagagatgctcctactgagattgtttgctacaggtgtggtaagaaaggccacaggagtaat 25958864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Original strand, 29589335 - 29589453
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  29589335 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 29589434  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| |||  |||||||    
T  29589435 acagtgcccccactgacaa 29589453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21765038 - 21764978
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21765038 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 21764978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 16947163 - 16947815
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16947163 tcaaaagagccattgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcagaatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 16947262  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  16947263 gagtgagagaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagagaaggcccaag 16947362  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |   |  |||||||  || ||  | |||||||    
T  16947363 aggagagatgctccagttgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtgttaggtgtg 16947462  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |  ||||  ||    
T  16947463 gtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagagggtcatatcagttcacagtgtattcagctgaa 16947562  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16947563 gaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcat 16947662  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  16947663 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatgg 16947762  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16947763 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaga 16947815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 14283065 - 14283716
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  14283065 tcaagagagtcatagggtagcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacactaaagctcattacaaggtgat 14283164  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | ||   ||||||||||||||||||  | || || || |||| ||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||  |    
T  14283165 gagtgagagaaggaataagggacagcagagtcgcccgaagccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagactcaatgatgagaggaggcccgtt 14283264  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14283265 aggagagatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 14283364  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |  ||||| ||||||| ||    
T  14283365 gtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaa 14283464  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14283465 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 14283564  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    || |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14283565 ttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 14283664  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14283665 ttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 14283716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 13677003 - 13676364
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13677003 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgat 13676904  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    | ||      ||||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  13676903 gtgt------agaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaag 13676810  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || | |||||||||||    
T  13676809 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtg 13676710  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||  | || || ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||  |||| || ||    
T  13676709 gacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaa 13676610  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13676609 gaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 13676510  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13676509 ttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 13676410  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13676409 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 13676364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13024902 - 13024252
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13024902 tcaaaagagctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgat 13024803  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||     
T  13024802 gagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaag 13024703  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||   |   ||||||  ||||| ||||||||||    
T  13024702 aggagagatgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttatggtagatatgagaggaaatgtttcaggtgtg 13024603  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| || |||||| ||||| |||| || ||||| ||    
T  13024602 gttagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaa 13024503  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13024502 gaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag-actcct 13024404  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  13024403 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatgg 13024304  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13024303 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 13024252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 11385120 - 11385771
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  11385120 tcaagagggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaagatgat 11385219  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||||||||     
T  11385220 gagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaag 11385319  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  11385320 aggagagatgctcctgctgagatagtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 11385419  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | | | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||  ||||||| || |||||    
T  11385420 gtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcaaccaaa 11385519  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11385520 gaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 11385619  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| || |    
T  11385620 ttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaaggagagatgg 11385719  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11385720 ttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgag 11385771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 12460186 - 12459544
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  12460186 tcaagagggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgat 12460087  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||  | ||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||     
T  12460086 gagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaag 12459987  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |   |  |||||||  ||||| || |||||||    
T  12459986 aggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtg 12459887  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| || |||||  ||||  |||| || ||||| ||    
T  12459886 gtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaa 12459787  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12459786 gaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 12459687  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  12459686 ttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 12459587  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12459586 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 12459544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 18050644 - 18051295
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  18050644 tcaagagagccataggataccagcagattagaattttctctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 18050743  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||  ||  |||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | |    
T  18050744 gagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgctccgactgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagt 18050843  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | ||| |||||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  18050844 aagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtg 18050943  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||    
T  18050944 gacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgttataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaa 18051043  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18051044 gaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 18051143  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  18051144 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatgg 18051243  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18051244 ttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgag 18051295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 81 - 646
Target Start/End: Original strand, 15099374 - 15099939
Alignment:
Q  81 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |  || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15099374 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgacgccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaa 15099473  T
Q  181 atgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatga 280  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   |  |||||    
T  15099474 atgatgggaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatga 15099573  T
Q  281 gaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgt 380  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || |||||| ||    
T  15099574 gaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagt 15099673  T
Q  381 tcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaatt 480  Q
    ||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15099674 tcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatcagatgtactt 15099773  T
Q  481 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15099774 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatc 15099873  T
Q  581 tgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15099874 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 15099939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 19150558 - 19149918
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150558 attggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 19150459  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
     |||||||||||||||||||||| | || || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  19150458 taggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 19150359  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | || |||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |      ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  19150358 tcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagga 19150259  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    |||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||||  ||||  |||| || || || ||||||| ||| |    
T  19150258 cacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctagga 19150159  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150158 taggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 19150059  T
Q  512 tatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaact 611  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19150058 tatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaact 19149959  T
Q  612 acagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19149958 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 19149918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20749957 - 20749317
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749957 attggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 20749858  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
     |||||||||||||||||||||| | || || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  20749857 taggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 20749758  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | || |||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |      ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  20749757 tcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagga 20749658  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    |||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || |||||  ||||  |||| || || || ||||||| ||| |    
T  20749657 cacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctagga 20749558  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749557 taggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 20749458  T
Q  512 tatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaact 611  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20749457 tatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaact 20749358  T
Q  612 acagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20749357 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 20749317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 26091489 - 26092134
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  26091489 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 26091588  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  26091589 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 26091688  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  26091689 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 26091788  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  26091789 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 26091888  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26091889 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 26091988  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  26091989 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 26092088  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26092089 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 26092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 12798195 - 12798837
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12798195 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctctttacaaggtgat 12798294  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  12798295 gagtgagcgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggctcaag 12798394  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||| || ||||||||||||    
T  12798395 aggagagatgctcatactgatattgtttgtttcaagtgtgga---aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgt 12798490  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||| ||||  |||| |||||||| |    
T  12798491 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacacagccta 12798590  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||| ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12798591 agaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 12798690  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||     
T  12798691 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatg 12798790  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12798791 gttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttg 12798837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 13965359 - 13966004
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | || ||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || | ||    
T  13965359 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgttggatttatgaagaagacaccaaagctcattaccagataat 13965458  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| || | |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  13965459 gagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 13965558  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |   || ||||| |  ||||||||||||||||    
T  13965559 aggagagatgctcctgctgagattgattgctacaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgatagaaaatgcttcaggtgtg 13965658  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| |||| || || || ||||| | |||||| |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  13965659 gtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 13965758  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13965759 gaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 13965858  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  13965859 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 13965958  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  13965959 ttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttg 13966004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 40924508 - 40925153
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| | | | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  40924508 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcaaagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattat 40924607  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  40924608 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 40924707  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  40924708 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 40924807  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  40924808 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 40924907  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40924908 gaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 40925007  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |    
T  40925008 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatgg 40925107  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40925108 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 40925153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 14260937 - 14261588
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14260937 tcaagagggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 14261036  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || || || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||     
T  14261037 cagtgagcgcaaaggtaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagtagagactgaatgatgagaggaggcctaag 14261136  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaag-gatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
     ||||| ||||| || |||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||  | |||||||| || | ||| ||||||    
T  14261137 gggagatatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgcgt-catcgagatgagaagaagtactttaggtgt 14261235  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
     ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||||  ||||  |||  |  ||||| |    
T  14261236 agtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtttatgcagccta 14261335  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14261336 agaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcc 14261435  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||     
T  14261436 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatg 14261535  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14261536 gttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgag 14261588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21755970 - 21755325
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||    
T  21755970 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacatcaaagctcattacaagataat 21755871  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| || | |||| |||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| | | |||||| ||     
T  21755870 gagtgagaggaggggtaagggacaacaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaatatgagtgatgacatgaggcctaag 21755771  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |   || |||||||  || || ||||||||||    
T  21755770 aggagagatgctccctctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtg 21755671  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||||  ||| ||| || |||||||| ||| |||| || || |||||||| | |||||| |||||  | ||  ||||  |  |||| ||    
T  21755670 gtcagaagggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagctcacagtgtcctgagccgaa 21755571  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21755570 gaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 21755471  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |    
T  21755470 ttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaaatgg 21755371  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21755370 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 21755325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 49155859 - 49155214
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  49155859 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttagttaatagatgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattat 49155760  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||     
T  49155759 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgaggataggaggcccaag 49155660  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  49155659 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 49155560  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || || |   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  49155559 gtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 49155460  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49155459 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 49155360  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |    
T  49155359 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatgg 49155260  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  49155259 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 49155214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 26115281 - 26115926
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  26115281 tcaagagagccattggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 26115380  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||| | |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||| |||| | |||||||||||     
T  26115381 gagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcccaag 26115480  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  26115481 aggagagatgctccggctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 26115580  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| | ||| || |||||  || |  ||||  |  | || ||    
T  26115581 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaa 26115680  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26115681 gaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 26115780  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  26115781 ttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 26115880  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26115881 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 26115926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 323 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14140915 - 14140586
Alignment:
Q  323 tgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  14140915 tgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataattgtaacgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtgggaag 14140816  T
Q  423 gtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacta 522  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14140815 gtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 14140716  T
Q  523 gtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaaggg 622  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14140715 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 14140616  T
Q  623 ttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14140615 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 14140586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14145219 - 14144870
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||| |||||||||||| | | |||||||| ||||| || |  |  ||||||||||| ||||||||    
T  14145219 tcaagagagccataggataccaacagattagaattttccctgatttggtgagtcgttgcaggatctatgaggagggcaccaaagctcattataaggtgat 14145120  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||  ||    
T  14145119 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccatat 14145020  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14145019 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtatggcgagaaaggccacaagagtaacgtttgtaccaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtg 14144920  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgt 350  Q
    |||| || || |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14144919 gtcaaaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgt 14144870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 415 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15343575 - 15343338
Alignment:
Q  415 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343575 gtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 15343476  T
Q  515 agatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactaca 614  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15343475 agacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 15343376  T
Q  615 gctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15343375 gctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgag 15343338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Original strand, 12712354 - 12712847
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| ||| | | ||||||||| || ||||| ||||||   || ||||||| |||||||||    
T  12712354 tcaagagggccattggctatcagaagattagaactctttatgagttgataagtagctgcagaatctatgaggaagattcaaaggctcattccaaggtgat 12712453  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || |||||||| ||||||||| |||| || |||||||  |||||||  |||||||||||  |  |||||||| |||| || |||||     
T  12712454 gagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaag 12712553  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     | |||||  || ||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  12712554 ggaagagacactcctgttgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 12712653  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || |||    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||  |||| ||||||| || |  ||    
T  12712654 gacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgatattgtatgctataactgcaatggggagggtcatatcaattctcagtgcactcaacggaa 12712753  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagt 494  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |  || ||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12712754 gaaggttaggaccagcgggaaagtgtttgccttggcgggtacgcaaaccacaaatcaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 652
Target Start/End: Original strand, 12203620 - 12204142
Alignment:
Q  130 gtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttg 229  Q
    ||||| |||| || |||||||  ||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||| || || |||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  12203620 gtcgtcctaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgtgattgtttg 12203719  T
Q  230 ttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgc 329  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||     |||||||| || |||||| | |||||  ||||||| || ||  ||| ||| |||    
T  12203720 ctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgcttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgc 12203819  T
Q  330 aagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttg 429  Q
    ||||||| |||| |||| || |  || ||  | ||||| || ||| |  | ||  | ||||   |||| ||||||| |   || ||||| || |||||||    
T  12203820 aagcgtgatgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttg 12203919  T
Q  430 cattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctac 529  Q
    ||||||| |||||  |||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12203920 cattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctac 12204019  T
Q  530 tcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtg 629  Q
     |||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |     
T  12204020 acattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaata 12204119  T
Q  630 actacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12204120 actacttctcttgtttgtttgag 12204142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13005023 - 13004795
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| ||| | | ||||||||| || ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  13005023 tcaagagggccattggttatcagaagatcaggattctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgat 13004924  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||  |  |||||||| |||| || |||||     
T  13004923 gagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggcaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaag 13004824  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttg 229  Q
     | |||||  || |||||||||| |||||    
T  13004823 ggaagagacactcctgctgagatagtttg 13004795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 15146122 - 15146275
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||||| | | | | || |||||    
T  15146122 ttaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatat 15146221  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15146222 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14957625 - 14957472
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  14957625 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14957526  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14957525 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 14957472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 44788550 - 44788703
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||    
T  44788550 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatat 44788649  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44788650 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 44788703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 15628043 - 15627444
Alignment:
Q  39 tctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttcta 138  Q
    ||||| ||||| | ||| ||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||| | || || |||||| | |    
T  15628043 tctgaattggtaagtagttgccggatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttatgaatgagaggaaaagtaagagtcaacaaagtcgtccaa 15627944  T
Q  139 aaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtg 238  Q
    | || |||||||  |||||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| |||||| |  | || |||| || |||||||  | ||||| ||||| ||    
T  15627943 agccttacagtgctcctgctgataagggtaaacaaagggtgaatgatgagaagaggcctagaaagaaagatactcctgctgaagttgtttgctacaactg 15627844  T
Q  239 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggt 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | || |||   ||||| |||  | || |||   |||||| ||||||| || ||  |    || ||||||| || |    
T  15627843 tggtgagaaaggccacaagagtaacgcttgtacttgggatgtgaaacagtgtttccattgtggtaagaaagggcatactattacagaatgcaagcatgat 15627744  T
Q  339 gatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactg 438  Q
    ||||| || ||||  |||||||| |||||||| |||||  ||||  |||| |   |||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  15627743 gatgtggtgtgtttcaactgcaatgaagagggtcatattggttcgcagtgaaagtagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctttgactg 15627644  T
Q  439 gtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattattt 538  Q
    ||||||| |     |||||||||||  | || | |||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| |||    
T  15627643 gtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgatacgcattgttt 15627544  T
Q  539 cattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttct 638  Q
     |||||  || | ||||||  || ||||||| | | | | ||   |||||| |  ||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15627543 tattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 15627444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 8710676 - 8710523
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  8710676 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8710577  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8710576 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8710523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 11550301 - 11550454
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||| || | ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  11550301 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatat 11550400  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11550401 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14335467 - 14335314
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  14335467 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14335368  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14335367 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14335314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 468 - 640
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703807
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctct 17703807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042610
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352640
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 9591435 - 9591269
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| | || |||| || |   | |||| | | | | ||||||||    
T  9591435 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 9591336  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  9591335 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 9591269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 15157814 - 15157932
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  15157814 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 15157913  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  15157914 cgtacagtgcccctgctga 15157932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 18180724 - 18180658
Alignment:
Q  577 tatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18180724 tatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 18180658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 11234412 - 11234565
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  11234412 ttaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 11234511  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11234512 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11234565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13689112 - 13688959
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  13689112 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatat 13689013  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13689012 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 18587370 - 18587523
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18587370 ttaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18587469  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18587470 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18587523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 16726196 - 16726420
Alignment:
Q  43 atttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaacc 142  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| |||||||||||  |||||||    
T  16726196 atttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcgaaagaccaagggccagcagagtcgccctaaacc 16726295  T
Q  143 atacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggc 242  Q
     || |||| |||| |||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| || || ||||||| ||| ||||||    
T  16726296 ttaaagtgcccctactgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggc 16726395  T
Q  243 gagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16726396 gggaaaggccacaagagtaatgttt 16726420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 17703210 - 17703434
Alignment:
Q  43 atttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaacc 142  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| |||||||||||  |||||||    
T  17703210 atttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaacc 17703309  T
Q  143 atacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggc 242  Q
     || |||| |||| |||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| || || ||||||| ||| ||||||    
T  17703310 ttatagtgcccctactgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggc 17703409  T
Q  243 gagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  17703410 gggaaaggccacaagagtaatgttt 17703434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9591882 - 9591655
Alignment:
Q  40 ctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  | |||||||||||||||  | | |||| | |     ||||| |||||||||||  ||||    
T  9591882 ctgatttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccagagctcattacaaggttgttaatgagaggaagaccaagggccagcagagtcgccctaa 9591783  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
     || || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||  ||  |||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| ||||| || |||| ||| |||    
T  9591782 gccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgt 9591683  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9591682 ggcgagaaaggccacaagagcaatgttt 9591655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200966
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8200966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 15158256 - 15158409
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15158256 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15158355  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15158356 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 15158409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 11233970 - 11234088
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  11233970 gatttggtcaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 11234069  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  11234070 cgtacagtgcccccgctga 11234088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18181256 - 18181138
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| ||||||| | |||| |    
T  18181256 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcttcctaagc 18181157  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  18181156 cgtacagtgcccccgctga 18181138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12690572 - 12690420
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  12690572 ttaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12690474  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||   |||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12690473 gagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12690420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15810764 - 15810715
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtg 50  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15810764 tcaaaagagctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtg 15810715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13689551 - 13689436
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| ||||||||| |||| || |    
T  13689551 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacaccagagtcgtcctaagccgt 13689452  T
Q  145 acagtgtccctgctga 160  Q
    |||||| |||| ||||    
T  13689451 acagtgcccctactga 13689436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 534
Target Start/End: Original strand, 16726640 - 16726687
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16726640 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacatt 16726687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873608
Alignment:
Q  586 tgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10873608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10874015 - 10873853
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || |||||||||||  || | ||| ||||  | |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  |    
T  10874015 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 10873916  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaa 163  Q
    || |||| | |  || | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  10873915 gaatgagaggaagggcaggggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaa 10873853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 8169 - 8811
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||| | | ||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  8169 tcaagagagccattgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgat 8268  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||     
T  8269 gagtgaccgcaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaag 8368  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  8369 aggagagatgctcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtg 8468  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||  || || ||    
T  8469 gtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaa 8568  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8569 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcct 8668  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8669 ttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 8768  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8769 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 8811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 18383 - 19025
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||| | | ||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  18383 tcaagagagccattgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgat 18482  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||     
T  18483 gagtgaccgcaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaag 18582  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  18583 aggagagatgctcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtg 18682  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||  || || ||    
T  18683 gtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaa 18782  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18783 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcct 18882  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18883 ttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 18982  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18983 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 19025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 64309 - 64954
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| || ||    ||||||||||| ||||||||    
T  64309 tcaagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgat 64408  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||    
T  64409 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaat 64508  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  64509 aggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtg 64608  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||    
T  64609 gtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaa 64708  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  64709 gaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 64808  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  64809 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 64908  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  64909 ctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttg 64954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 48887 - 49532
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| || ||    ||||||||||| ||||||||    
T  48887 tcaagagagccatagggtatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgat 48986  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||    
T  48987 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaat 49086  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49087 aggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtg 49186  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||    
T  49187 gtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaa 49286  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49287 gaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 49386  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  49387 ttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 49486  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49487 ctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttg 49532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 57921 - 58566
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| || ||    ||||||||||| ||||||||    
T  57921 tcaagagagccatagggtatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgat 58020  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||    
T  58021 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaat 58120  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  58121 aggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtg 58220  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||||||  ||||  |||||||||| || ||    
T  58221 gtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaaccgaa 58320  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58321 gaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 58420  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  58421 ttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 58520  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58521 ctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttg 58566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 30221 - 29576
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  30221 tcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 30122  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||     
T  30121 gagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaag 30022  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||| | || |||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  30021 aggagagatgttcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 29922  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||| || |||||||| |||| |||||| ||| |||| ||  | || |||||||  ||||| || || || |||||| ||||  |||| || || || ||    
T  29921 gtcaaaagggacacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaa 29822  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29821 gaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 29722  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29721 ttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 29622  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29621 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 29576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 24096391 - 24097043
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||     
T  24096391 tcaaaagagctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgac 24096490  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||     
T  24096491 gagtgagcgaagaagtaagggacaacagagtcgtcctaaaccttatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaag 24096590  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |   |  |||||||  || || || |||||||    
T  24096591 aggagagatgctcctgttgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtg 24096690  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| || |||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  24096691 gtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagccgaa 24096790  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24096791 gaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcct 24096890  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  24096891 ttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatgg 24096990  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24096991 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgaga 24097043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 19857888 - 19857242
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| | ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19857888 tcaagagagccattggctatcagaagattagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaagatctatgaagaggatactaaggctcattacaaggtgat 19857789  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  19857788 gagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaag 19857689  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  19857688 aggagagatgcttctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtg 19857589  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||  |||| |||||||||| ||| || || || |||||  ||||  |||| || || || ||    
T  19857588 gtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaa 19857489  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19857488 gaaggttatgaccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 19857389  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19857388 ttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 19857289  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgc 647  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19857288 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgc 19857242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 45 - 646
Target Start/End: Original strand, 20832721 - 20833321
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    |||||||  ||||| || || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20832721 ttggtgagcagctgtagaatctatgaataagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgtagaggcaagggacagcagagtcgtcctaaac-at 20832819  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcga 244  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20832820 atagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctacaagtgtggcga 20832919  T
Q  245 gaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgtt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||    
T  20832920 gaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaattgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagatgtt 20833019  T
Q  345 gtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 444  Q
    || |||||||||||||| || || || || ||| ||||  |||| || || || | ||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  20833020 gtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggaaggttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgc 20833119  T
Q  445 agagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgc 544  Q
    | |  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||     
T  20833120 aaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgt 20833219  T
Q  545 tattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtt 644  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20833220 tattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtt 20833319  T
Q  645 tg 646  Q
    ||    
T  20833320 tg 20833321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 21742328 - 21742979
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21742328 tcaagagggctattggttatgagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 21742427  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||  ||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||     
T  21742428 gagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctactgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaag 21742527  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  | |||||||| || ||||| ||||||    
T  21742528 aggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccga-gatgagaagaagtgctttaggtgt 21742626  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || || |||||  ||||  |||| || ||||| |    
T  21742627 ggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagccta 21742726  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  21742727 agaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 21742826  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||     
T  21742827 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatg 21742926  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21742927 gttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgag 21742979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 21738812 - 21739463
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21738812 tcaagagggctattggctatcaaaaggtaaggaatttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 21738911  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| || | || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  21738912 gagtgaccgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagcgcccatgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaag 21739011  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||| |||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |      |||||||| || ||||| |||||||    
T  21739012 aggagaggtgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtg 21739111  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | || || ||||  || ||||| || |||||| ||||  |||| ||  |||| ||    
T  21739112 gtcagaaaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacggagcctaa 21739211  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21739212 gaaggttaggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 21739311  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21739312 ttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatgg 21739411  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  21739412 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgag 21739463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 22015521 - 22016166
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22015521 tcaagagggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagttacgaaagctcattacaaggtgat 22015620  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||| ||| ||||  | |||||| |||||||||| ||     
T  22015621 gagtgagcgtaggggaaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagaataaatgatgagaggaggccaaag 22015720  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | |||||||||| || |  | || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||||||||| |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  22015721 aagagagatgctcctacaaatattgtttgattcaagtgtggagaaaaaggccaaaaaagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 22015820  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||  |||   |||| || ||||| ||    
T  22015821 gtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcatattagtttgcagtgtacgcagccgaa 22015920  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22015921 gaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcat 22016020  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22016021 ttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 22016120  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22016121 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 22016166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 48426487 - 48425842
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  48426487 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 48426388  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  48426387 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 48426288  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  48426287 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 48426188  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  48426187 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 48426088  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48426087 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 48425988  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  48425987 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 48425888  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48425887 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 48425842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 642
Target Start/End: Original strand, 20074485 - 20075126
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||| || |||| ||| | |||||||| ||||| || |  || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  20074485 tcaaaagagctattgggtattagcagatcagattcttctctgagttggttaacatgtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 20074584  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||   |||||||||| |||||||||| | ||| |||| | |||||||  ||     
T  20074585 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgcttctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcttaag 20074684  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||  || |||||||||||||    
T  20074685 aggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtagtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtg 20074784  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||| | | | ||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||| | |||||| ||||||  |||  ||||  |  |||| ||    
T  20074785 gtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcaattcgcagtgtcctgagccgaa 20074884  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20074885 gaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 20074984  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  20074985 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 20075084  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttg 642  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20075085 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 52989354 - 52988710
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||  | ||    
T  52989354 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaa-taat 52989256  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| | |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||| ||     
T  52989255 gagtgagaggaggggtaagggacagcaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaag 52989156  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |   || |||||||  || || ||||||||||    
T  52989155 aggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtg 52989056  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| |||||| ||||  | ||  |  | || ||    
T  52989055 gtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacaatgtcctgaaccgaa 52988956  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52988955 gaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 52988856  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  52988855 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 52988756  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52988755 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 52988710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 38909602 - 38910247
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  38909602 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 38909701  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||| | | || ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| | |||||||||||     
T  38909702 gagtgggaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaag 38909801  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  38909802 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 38909901  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  38909902 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 38910001  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38910002 gaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 38910101  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |    
T  38910102 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatgg 38910201  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38910202 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 38910247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 31536773 - 31537418
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  31536773 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 31536872  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||     
T  31536873 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgaatgatgataggagacccaag 31536972  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  31536973 aggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtg 31537072  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||  ||||  ||||  |  |||| ||    
T  31537073 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagtgtcctgagccgaa 31537172  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31537173 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 31537272  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |    
T  31537273 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatgg 31537372  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31537373 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 31537418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 37680663 - 37680018
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  37680663 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctttgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 37680564  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  37680563 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 37680464  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  37680463 aggagagatactcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 37680364  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||| | ||| || |||||  ||||  ||||  |  |||| |     
T  37680363 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgag 37680264  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37680263 gaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 37680164  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |    
T  37680163 ttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatgg 37680064  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37680063 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 37680018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20297997 - 20297350
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |   | || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  20297997 tcaaaagagccattgggtatcagtagatcatggtgttttctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 20297898  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||| ||||||||||||| |||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  20297897 gagtgagaggaggggtaagggacatcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaagggaaaacagaagatgggtgatgacaggaggcccaag 20297798  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   || |||||||  || |||||||||||||    
T  20297797 aggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaatgccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtg 20297698  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||| | ||| || |||||  |||| |||||  |  || | ||    
T  20297697 gttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcatagtgtcctgagtcgaa 20297598  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattga-ctggtacgcag-agtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactc 498  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20297597 gaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttgagctggttattaccactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactc 20297498  T
Q  499 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaat 598  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  20297497 ctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaat 20297398  T
Q  599 agttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297397 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 20297350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21961630 - 21961135
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || ||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  21961630 attgggtatcagcagatcagagtcttctctgaattggtaaacagatgcataatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 21961531  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  21961530 gaggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctccttctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgc 21961431  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |   || |||||||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  21961430 tccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggga 21961331  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    ||||   ||| ||| || |||||||| ||| |||| || || |||||||| | |||||| |||||| ||||  ||||| |  |||| |||||||||||||    
T  21961330 cacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgccctgagccgaagaaggttagaa 21961231  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattg 507  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961230 ctggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 20853536 - 20854178
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||||    
T  20853536 tcaagagagccattggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgat 20853635  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||| |||   ||   |||||| |||   |||||  | || || |||||||  ||| || |||| || || || || ||||||||| |||||  ||| ||     
T  20853636 gagcgagaaaaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcctaag 20853735  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     ||||| ||||| ||| |||  | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || |    
T  20853736 gggagaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcagatgcg 20853835  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || || |   | | ||| ||||||||||| ||| | || |||| ||| ||   ||| |||||||| ||  | ||  ||||||| || || ||    
T  20853836 gtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggccacattagctcgcagtgcacgcaacctaa 20853935  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| |||||  | ||||| || || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20853936 gaaggtcagaacttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 20854035  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20854036 ttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatgg 20854135  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20854136 ttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 20854178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 414 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18710586 - 18710354
Alignment:
Q  414 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 513  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710586 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 18710487  T
Q  514 tagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactac 613  Q
    || | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  18710486 taaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactcc 18710387  T
Q  614 agctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18710386 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 18710354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16379210 - 16379032
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16379210 atcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16379111  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||   | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16379110 gtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttg 16379032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||| ||||||| | ||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 21228365 - 21228598
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc-gcagaggtaagggacagcagagtc 132  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||| | |||  |||||| ||||||||||    
T  21228365 ttttccctgatttagttaatagctgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcagaagac-taagggccagcagagtc 21228463  T
Q  133 gttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgtta 232  Q
    |  |||| || || |||| ||||||||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| ||||| |||||||     
T  21228464 gccctaagccctatagtgcccctgctgataagggtaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgttt 21228563  T
Q  233 caagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228564 caactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 21228598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 22496525 - 22496671
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  22496525 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22496624  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22496625 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22496671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 24785119 - 24785272
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| ||||||||||    
T  24785119 ttaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatat 24785218  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24785219 gaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctct 24785272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18273343 - 18273115
Alignment:
Q  39 tctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttcta 138  Q
    ||||| ||||||| |||||| || || ||||| || ||||  || |||||||| ||||| | ||||||||| ||    ||||| |||||  ||||| | |    
T  18273343 tctgaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtccga 18273244  T
Q  139 aaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtg 238  Q
    | || |||||||  |||| |||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||| || || || ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||    
T  18273243 agccctacagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgttacaagtg 18273144  T
Q  239 tggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18273143 tggtgagaagggccacaagagtaatgttt 18273115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 20081645 - 20081791
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  20081645 tactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 20081744  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20081745 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20081791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 577 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200487
Alignment:
Q  577 tatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 12200487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 16347857 - 16348010
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16347857 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16347956  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16347957 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16348010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388444
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 33388444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 51330754 - 51330907
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  51330754 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 51330853  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51330854 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 51330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16379621 - 16379411
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||||| | |||    
T  16379621 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcctctg 16379522  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| ||||| || |||||  | |||||| |||||||||| |  | || ||||| |  ||||||||| ||||| ||    ||||| ||||||||||||||    
T  16379521 ctgataagggcaaacagagagttaatgatgagaggaggccgagaaagaaagatgttgttgctgagattgtttgctatgcttgtggtgagaaaggccacaa 16379422  T
Q  257 gagtaatgttt 267  Q
     ||||||||||    
T  16379421 aagtaatgttt 16379411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 51330315 - 51330430
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  51330315 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 51330414  T
Q  145 acagtgtccctgctga 160  Q
    |||||| |||||||||    
T  51330415 acagtgcccctgctga 51330430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 21833399 - 21833246
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  21833399 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 21833300  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21833299 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 21842309 - 21842156
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||||| || | |||| || |   || ||| | | | | ||||||||    
T  21842309 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatat 21842210  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21842209 gaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21842156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 166
Target Start/End: Original strand, 16354063 - 16354187
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  16354063 gatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 16354162  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  16354163 cgtacagtgcccccgctgacaaggg 16354187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 640
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042430
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17042430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 166
Target Start/End: Original strand, 16347417 - 16347539
Alignment:
Q  44 tttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaacca 143  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| ||     
T  16347417 tttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccg 16347516  T
Q  144 tacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  16347517 tacagtgcccccgctgacaaggg 16347539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21752630 - 21752456
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||  || | ||||||||  ||||||  || |||||||| ||||| |||||||  ||  ||||||||||| |  |    
T  21752630 tcaagagagcaattggttactagaagatccgagtcttctctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaagataccaagactcattacaagattgt 21752531  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagag 175  Q
    || |||||| | || |||||| |||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  21752530 gaatgagcgaaaagctaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgccactgctgataagggaaaacagag 21752456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 19109373 - 19109312
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19109373 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19109312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 269
Target Start/End: Original strand, 17041825 - 17042059
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  | |||||||||||||||  | | |||| | |    |||||| |||||||||||    
T  17041825 ttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaaggttgttaatgagaggaagactaagggccagcagagtcg 17041924  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      |||| || || |||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| || | |||||  |||||| |    
T  17041925 ccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagatt-tttgtttc 17042023  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat 269  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17042024 aactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttat 17042059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22117241 - 22117102
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |||||| | || || |||||||| ||||    
T  22117241 tgcagaatatacgaggaagatactaaggctcattacaaggttttgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgttcctg 22117142  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcc 196  Q
    |||| |||||||| || ||  | |||||| ||||||||||    
T  22117141 ctgataagggaaaacaaagagttaatgatgagaggaggcc 22117102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21833841 - 21833723
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  21833841 gatttggttaatagctgcaggatctatggagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 21833742  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  21833741 cgtacagtgcccccgctga 21833723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 529
Target Start/End: Original strand, 21045379 - 21045428
Alignment:
Q  480 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctac 529  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21045379 tgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 16670684 - 16670744
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcag 61  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16670684 tcaaaagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcag 16670744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 229
Target Start/End: Original strand, 21044986 - 21045158
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| | || | | ||| ||||| ||||| |||||| | || || |||||||  ||||    
T  21044986 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaataagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21045085  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttg 229  Q
    |||| ||||| ||||| ||  | |||||| ||||||| || |  | || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21045086 ctgataagggcaagcaaagagttaatgatgagaggagaccaagaaagaaagatgctactgctgagattgtttg 21045158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 166
Target Start/End: Original strand, 41350560 - 41350612
Alignment:
Q  114 ggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||    
T  41350560 ggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaggg 41350612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 41351022 - 41351083
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41351022 tctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctct 41351083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 1659 - 2304
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1659 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagcagcatgatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgat 1758  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||     
T  1759 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaag 1858  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || |||||||||||||    
T  1859 aggatagatgctcctgctgaaattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 1958  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || |||||| ||||  |||| ||||| || ||    
T  1959 gtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaa 2058  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    |||| |||| |    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2059 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcct 2158  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |    
T  2159 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggatatgg 2258  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2259 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 2304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 11613 - 11994
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  11613 tcaagagagccatagggtatcaaaagattaaaattttctctgatttggtaagcagctgcaggatatatgaagaggacactaaggctcattataaggtgat 11712  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||     
T  11713 gagtgagagaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagagacttaatgatgagaggaggcccaag 11812  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  11813 aggagagatgctcctactgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 11912  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttc 382  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || |||||||| || |||||| ||||    
T  11913 gtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgttacatttggaacgaagaaggtcatatcagttc 11994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 70969 - 70324
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||  || ||||| || ||||||||    
T  70969 tcaaaagagccattgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtatgatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgat 70870  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||| |||   ||   |||||| |||   |||||  | || || |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||| |      
T  70869 gagcgagaagaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacattgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagg 70770  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     ||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |  || || |||||||| || || ||||| || |    
T  70769 gggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagggtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgcg 70670  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||| ||||| ||     | | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||  ||||  ||||||| || || ||    
T  70669 gtcataaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggccacattagttcacagtgcacgcaacctaa 70570  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70569 gaaggtcagaactggaggaaaagtatttgttttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 70470  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  70469 ttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattg 70370  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  70369 ttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttg 70324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 203978 - 203327
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  203978 tcaagagagccatagggtaccaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 203879  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  |    
T  203878 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgtt 203779  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  203778 aggagagatgctcctggtgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 203679  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||    |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||    
T  203678 gtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaa 203579  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  203578 gaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 203479  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  203478 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 203379  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  203378 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 203327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 424327 - 424266
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  424327 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 424864 - 424746
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||| || ||| |||||| |  || ||||||||||| |||||| |||| |    
T  424864 gatttggttaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagc 424765  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | |||| || |||||||||    
T  424764 cgtacaatgcccctgctga 424746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 39042 - 39685
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39042 tcaagagagccattgggtaccagaagattagaattttct--gagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcattacaaggtgat 39139  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  39140 gagtgaacgaagaggtaagggacagcagagtcttcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaag 39239  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || |||||||||||||    
T  39240 aggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 39339  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || | |||| ||||  |||| |||||  | ||    
T  39340 gtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcgtatcagttcgcagtgtacacaatcgaa 39439  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39440 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 39539  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  39540 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 39639  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39640 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 39685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 523 - 646
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44779
Alignment:
Q  523 gtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaaggg 622  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  623 ttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttg 44779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 432 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 4870
Alignment:
Q  432 ttgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactc 531  Q
    ||||||||||||||||     |||||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  5081 ttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacac 4982  T
Q  532 attatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgac 631  Q
    ||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  4981 attgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaac 4882  T
Q  632 tacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||||    
T  4881 tacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 180548 - 180648
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||    
T  180548 aagagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaaatggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatga 180647  T
Q  103 g 103  Q
    |    
T  180648 g 180648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14815 - 14755
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14815 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgttt 14755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14443 - 14382
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14443 tctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 4916 - 5561
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4916 tcaagagagccattgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcatgatatatgaggaagacactaaagctcattacaaggtgat 5015  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||| |      
T  5016 gagtgaacgaagaggtaaaggaaagtagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaaggctgaataatgagaggtggcctagg 5115  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   ||||||||||| || |||||||||||||    
T  5116 aggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 5215  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||  | |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| | || ||    
T  5216 gtcagaagggacacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacataaccgaa 5315  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5316 gaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 5415  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  5416 ttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatgg 5515  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5516 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 5561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 23077791 - 23078443
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  23077791 tcaaaagagctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtaat 23077890  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||| | |||||||| | |||||||||||     
T  23077891 gagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaag 23077990  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||| || |||| || |   |  |||||||  ||||| ||||||||||    
T  23077991 aggagagatgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtg 23078090  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  23078091 gtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaa 23078190  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23078191 gaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 23078290  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  23078291 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatgg 23078390  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23078391 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaga 23078443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 23563054 - 23563699
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| ||||    
T  23563054 tcaagagagccattggttatcagaagattagaaatttctttaatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacactaaagctcattacaagatgat 23563153  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| || | || || || ||||  |||||||| ||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  23563154 gagtgaacgtagaggtaagggacagaagagttgtccgaagccgtatagtgctcctgctgaaaaggataagcagaggttaaataatgagaggaggcccaag 23563253  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  23563254 aggagagatgctcctactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 23563353  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||| ||   ||| |||||||||||||| || || || |||||  ||||  |||| || ||||| ||    
T  23563354 gtcagaaaggacacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtacgcagccgaa 23563453  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23563454 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 23563553  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |    
T  23563554 ttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaaatgg 23563653  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23563654 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 23563699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 652
Target Start/End: Original strand, 17266244 - 17266871
Alignment:
Q  25 agataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggaca 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17266244 agattagaattttctctgatttggtaagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaaagggca 17266343  T
Q  125 gcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatc 224  Q
     ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | || ||| |||||| ||||||||||     
T  17266344 tcagagtcgtcctaaaccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagata 17266443  T
Q  225 gtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttg 324  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||  |    
T  17266444 gtgtgttttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccgaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgctagccg 17266543  T
Q  325 attgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagt 424  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  17266544 attgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagt 17266643  T
Q  425 gtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagt 524  Q
     ||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17266644 ttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggt 17266743  T
Q  525 gctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggtt 624  Q
    |||||||||| |||||||||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17266744 gctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 17266843  T
Q  625 cagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266844 cagtgactacttctcttgtttgcttgag 17266871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 25851554 - 25850909
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  25851554 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagttttctctgagttggttaataggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 25851455  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  25851454 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 25851355  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || ||||| |  || |||||||||||||    
T  25851354 aggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtg 25851255  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||  |||| ||| | ||||||||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| |||||  ||||  ||||  |  |||| ||    
T  25851254 gtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaa 25851155  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25851154 gaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcat 25851055  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  25851054 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 25850955  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  25850954 ttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttg 25850909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20345764 - 20345119
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  20345764 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaataggtgcagaatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataat 20345665  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  20345664 gagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 20345565  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |   || ||||| |  || |||||||||||||    
T  20345564 aggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaagcccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtg 20345465  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||| |  || || |||||  ||||  ||||  |  |||| ||    
T  20345464 gtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaa 20345365  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20345364 gaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 20345265  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  20345264 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 20345165  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20345164 ttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttg 20345119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22506161 - 22505516
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | || ||| | |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  22506161 tcaaaagagctattggatatcagcaaatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataat 22506062  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||| ||     
T  22506061 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaag 22505962  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   || || ||||  || |||||||||||||    
T  22505961 aggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtg 22505862  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||  ||||| | | ||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| || ||| ||||  ||||  |  | || ||    
T  22505861 gtcagatgggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgtcctgaaccgaa 22505762  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22505761 gaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcct 22505662  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |    
T  22505661 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatgg 22505562  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22505561 ttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttg 22505516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 646
Target Start/End: Original strand, 14883888 - 14884522
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||| | |    
T  14883888 attgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagagga 14883987  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||  |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  14883988 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgc 14884087  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |   |  ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||     
T  14884088 tccagctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgggagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 14884187  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    ||||   | | ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||  ||||  ||||  |  |||| | ||||  |||||    
T  14884188 cacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaa 14884287  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884288 ttggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 14884387  T
Q  512 tatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaact 611  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14884388 tattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaact 14884487  T
Q  612 acagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14884488 ccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 14884522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 20824933 - 20824296
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  20824933 aagagagccattgggtatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttacgaggaggatacgaagactcattacaaggtgatga 20824834  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    | |||   ||   |||||| |||   || ||  | || || |||||||  |||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||    |  ||  |    
T  20824833 gcgagaagaggaataagggtcagagtagccgcccgaagccctacagtgctcctgctaataaaggaaaacagagattgaatgatgagagaccacaaaaagg 20824734  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggt 302  Q
    || | ||||| ||| |||  | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  20824733 gaaaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggt 20824634  T
Q  303 cagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaaga 402  Q
    |||||||| ||     | || || ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    || || || || ||  ||||  ||||||| || || ||||    
T  20824633 cagaaaggtcatgtgttggtggactgcaagcgtggagatattgtttgttttaactgtggtgatgaaggtcacattagttcgcagtgcacgcaacctaaga 20824534  T
Q  403 aggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttt 502  Q
    |||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20824533 aggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 20824434  T
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||    
T  20824433 aattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtt 20824334  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20824333 gttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 20824296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 385 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 20779011 - 20778753
Alignment:
Q  385 agtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgttt 484  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20779011 agtgcactcaacctaagaaggtcagaaccggaggaaaggtattcgctttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgttt 20778912  T
Q  485 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  20778911 ctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgat 20778812  T
Q  585 atgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20778811 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgt 20778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 385 - 640
Target Start/End: Original strand, 28892212 - 28892467
Alignment:
Q  385 agtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgttt 484  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28892212 agtgcactcaacctaagaaggtcagaaccggaggaaaagtattcgctttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgttt 28892311  T
Q  485 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgat 584  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  28892312 ctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgat 28892411  T
Q  585 atgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28892412 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 28892467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22465432 - 22464790
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | ||||||| |||||| || || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||||    
T  22465432 tcaagagagccattggatatcagaagatcataattttctcataattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgat 22465333  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||| |||   ||   |||||| |||   |||||  | || || |||||||  ||| || |||| || ||  | || ||||||||| |||||  ||| ||     
T  22465332 gagcgagaaaaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaataaagattgaatgatgagaggcagcctaag 22465233  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     ||||| ||||| ||| |||  |  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||  |   | |||||||| ||||| ||||| || |    
T  22465232 gggagaaatgctcctgttgatgttatttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcatccaagatgagaagaaatgtttcagatgcg 22465133  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || || |   | | ||| ||||||||||| ||| | || |||| ||| ||   ||| |||||||| ||  | ||  ||||||| || || ||    
T  22465132 gtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggccacattagctcgcagtgcacgcaacctaa 22465033  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| ||||  || ||||| || || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22465032 gaaggtcagaattggagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 22464933  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22464932 ttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatgg 22464833  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22464832 ttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 22464790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 652
Target Start/End: Original strand, 21983073 - 21983714
Alignment:
Q  11 cattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgc 110  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| || ||||  ||||| || || ||||| || ||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||     
T  21983073 cattggttatcaaaagatcagaaaattttctgaatttgtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagctcattataagtttatgagtgagcgg 21983172  T
Q  111 agaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatg 210  Q
    ||    || || |||||  ||||| | || || |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| || || || |||||||    
T  21983173 aggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgttcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatg 21983272  T
Q  211 cttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagg 310  Q
     | |||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |     |||||||| || |||||| | |||||  |||||||    
T  21983273 ttcctgctgagattgtttgctataggtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttcgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagg 21983372  T
Q  311 acacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttaga 410  Q
     || ||  |||  || ||||||||||||||| |||| || |  || ||  ||||||| || ||| |  ||||  ||||||   |||| ||||||| |       
T  21983373 gcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcag 21983472  T
Q  411 accggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgcta 510  Q
     | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21983473 gcaggtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattacta 21983572  T
Q  511 ttatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaac 610  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||    
T  21983573 ttattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaac 21983672  T
Q  611 tacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21983673 tccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 21983714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 21870164 - 21870430
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21870164 tcaagagggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgat 21870263  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || || |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||     
T  21870264 gagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaag 21870363  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21870364 aggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgttt 21870430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 21874444 - 21874710
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21874444 tcaagagggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgat 21874543  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || || |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| ||     
T  21874544 gagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaag 21874643  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21874644 aggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgttt 21874710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 414 - 652
Target Start/End: Original strand, 21561324 - 21561562
Alignment:
Q  414 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 513  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21561324 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctatta 21561423  T
Q  514 tagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactac 613  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||||||||| || | ||||| |||||||| ||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  21561424 ttgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 21561523  T
Q  614 agctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21561524 agctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 21561562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 415 - 640
Target Start/End: Original strand, 21631699 - 21631924
Alignment:
Q  415 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||     |||||||||||  | || |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21631699 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattat 21631798  T
Q  515 agatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactaca 614  Q
      ||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||||| | ||| | ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  21631799 taatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactcca 21631898  T
Q  615 gctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21631899 gctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 16257924 - 16258188
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | | ||    
T  16257924 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcactataagattagga 16258023  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac-aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
     |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   || ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| || || |    
T  16258024 atgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaaccaaggggaa-cagagattgactgatgagaggagacctaaga 16258122  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16258123 ggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 16258188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 22591643 - 22591907
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | | ||    
T  22591643 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcactataagattagga 22591742  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac-aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
     |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   || ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| || || |    
T  22591743 atgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaaccaaggggaa-cagagattgactgatgagaggagacctaaga 22591841  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22591842 ggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 22591907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 22595198 - 22595462
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | | ||    
T  22595198 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttccgagttggtgaatagctgcaggatatatgaggaggataccaaagctcactataagattagga 22595297  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgac-aagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaata 201  Q
     |||||| ||    ||||| || ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||   || ||||| || ||||| |||| |||| ||||||| || || |    
T  22595298 atgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaaccaaggggaa-cagagattgactgatgagaggagacctaaga 22595396  T
Q  202 ggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22595397 ggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 22595462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23669971 - 23669848
Alignment:
Q  144 tacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcg 243  Q
    |||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||| |    
T  23669971 tacagtgctcctgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgctcctgctgagattgtttcctaccagtgtggtg 23669872  T
Q  244 agaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23669871 agaaaggccacaagagtaatgttt 23669848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429279
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | | ||||  ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | ||| | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 25429279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23474656 - 23474431
Alignment:
Q  39 tctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttcta 138  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |||||| | |    
T  23474656 tctgagttggtgagcagctgcagaatacatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaa 23474557  T
Q  139 aaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtg 238  Q
    | || |||| ||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||  | || ||| | |  ||||||||| ||||| ||||  ||    
T  23474556 agccttacattgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccagaaagaaagaagttgttgctgagattgtttgctacacttg 23474457  T
Q  239 tggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23474456 tggtgagaaaggccataagagtaatg 23474431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736255
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||| || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgt 26736255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 487 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21882788 - 21882622
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  21882788 ttaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatat 21882689  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21882688 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 21882622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16359516 - 16359363
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16359516 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16359417  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16359416 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16359363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23474270 - 23474053
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    |||||||||||||||| |||||     |||||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| |||||  |||    
T  23474270 tttgcattgactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtg 23474171  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| | | | |  |  ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  23474170 ctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23474071  T
Q  626 agtgactacttctcttgt 643  Q
     |||||||||||||||||    
T  23474070 ggtgactacttctcttgt 23474053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 29473445 - 29473598
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  29473445 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 29473544  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29473545 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29473598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 34569508 - 34569355
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  34569508 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 34569409  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34569408 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 34569355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 40711794 - 40711641
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  40711794 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 40711695  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40711694 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 40711641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 28891828 - 28891934
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||||||||    
T  28891828 tcaaaagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagttgctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgat 28891927  T
Q  101 gagtgag 107  Q
    |||||||    
T  28891928 gagtgag 28891934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 14997111 - 14997264
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  14997111 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14997210  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14997211 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 14997264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 18782128 - 18781975
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18782128 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18782029  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18782028 gaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctct 18781975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803458
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||| | || ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 20803458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 22330259 - 22330412
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22330259 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22330358  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22330359 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22350933 - 22350784
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  22350933 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 22350834  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactactt 636  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22350833 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22350784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27521420 - 27521267
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27521420 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatat 27521321  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27521320 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27521267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27521862 - 27521741
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27521862 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagc 27521763  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaa 163  Q
    | ||||||| ||||||||||||    
T  27521762 cgtacagtgcccctgctgacaa 27521741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 37288868 - 37289021
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  37288868 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 37288967  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37288968 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 41773856 - 41773703
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  41773856 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 41773757  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41773756 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29472962 - 29473121
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || |||||||| ||  || ||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  |    
T  29472962 tcaagagggcgattgggtaccaacagctaagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaatgctcactacaaggtagt 29473061  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctga 160  Q
    || |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  29473062 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctga 29473121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43122792 - 43122685
Alignment:
Q  158 tgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaag 257  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| || || |||||||||| |  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  43122792 tgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcatgcagagattgtttgctacaagtgtggcgagaggggccacaag 43122693  T
Q  258 agtaatgt 265  Q
    ||||||||    
T  43122692 agtaatgt 43122685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 22329817 - 22329935
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  22329817 gatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 22329916  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  22329917 cgtacagtgcccctgctga 22329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 19772974 - 19772821
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  19772974 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19772875  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19772874 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19772821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23460985 - 23460832
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||  ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  23460985 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatat 23460886  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| | ||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23460885 gaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27613370 - 27613217
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27613370 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27613271  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27613270 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 27613217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 27682772 - 27682925
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | | ||||||    
T  27682772 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatat 27682871  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27682872 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27682925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18782408 - 18782348
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782408 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 18782348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 266
Target Start/End: Original strand, 21561064 - 21561176
Alignment:
Q  154 ctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcca 253  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||| ||||||| || || || ||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |||||    
T  21561064 ctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgcttcaagtgtggtaagaagggcca 21561163  T
Q  254 caagagtaatgtt 266  Q
    |||||||||||||    
T  21561164 caagagtaatgtt 21561176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19773416 - 19773298
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  19773416 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 19773317  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  19773316 cgtacagtgcccccgctga 19773298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22138124 - 22138006
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||| |  |||  ||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  22138124 gatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaagatactaaggctcactataagattgtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 22138025  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  22138024 cgtacagtgcccctgctga 22138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21342939
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21410590 - 21410437
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| || |  ||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||||   || || ||||||  |||||| |    
T  21410590 ttggtgagtagctgcagaatttatgaagatgacaccaaagctcattataagattatgaatgagcggaggggtaagcaccaacaaagtcgtggtaaacctt 21410491  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggccca 198  Q
    ||||||  || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  21410490 acagtgctccagctgataagggtaagcatagggtgaatgataagaggaggccca 21410437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22137590 - 22137529
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22137590 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 27665862 - 27666015
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27665862 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27665961  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  27665962 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 27666015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 21410182 - 21410106
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctac 529  Q
    |||||||| || || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  21410182 aatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctac 21410106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 14996672 - 14996787
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||| ||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  14996672 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 14996771  T
Q  145 acagtgtccctgctga 160  Q
    |||||| |||||||||    
T  14996772 acagtgcccctgctga 14996787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 264
Target Start/End: Original strand, 21631341 - 21631548
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| | |  |||| | | ||||| |||||| | || || |||||||  ||||    
T  21631341 tgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaagggtaggagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21631440  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| ||||| || || ||| ||||||||  ||||||||| |  | || |||| || |||||||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||     
T  21631441 ctgataagggtaaacaaagggtgaatgatgtgaggaggcctagaaagaaagatactactgctgaggttgtttgctacacttgtggtgagaaaggccacac 21631540  T
Q  257 gagtaatg 264  Q
    ||||||||    
T  21631541 gagtaatg 21631548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16359955 - 16359837
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  16359955 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 16359856  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  16359855 acagtgcccccgctgacaa 16359837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 27682330 - 27682448
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  27682330 gatttggttaatagctacaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 27682429  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  27682430 cgtacagtgcccctgctga 27682448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34569947 - 34569829
Alignment:
Q  45 ttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccat 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| || |    
T  34569947 ttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgt 34569848  T
Q  145 acagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  34569847 acagtgcccccgctgacaa 34569829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 28911674 - 28911734
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcag 61  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  28911674 tcaaaagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcag 28911734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 28926942 - 28927002
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcag 61  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  28926942 tcaaaagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcag 28927002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 37288426 - 37288534
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  37288426 gatttggttaatagctgcagaatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 37288525  T
Q  142 catacagtg 150  Q
    | |||||||    
T  37288526 cgtacagtg 37288534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21883070 - 21883012
Alignment:
Q  206 agatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21883070 agatgtttctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatg 21883012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22351375 - 22351257
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||| |  |||  ||| | |  || ||||| ||||||||||||  ||| |    
T  22351375 gatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactacaagatagtgaacgagaggaagggcaaggggcagcagagtcgtcataagc 22351276  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  22351275 cgtacagtgcccctgctga 22351257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 487 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 23526065 - 23525957
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||| |  | ||||||| || ||||||| | | | | ||||||||    
T  23526065 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatat 23525966  T
Q  587 gaaaggaga 595  Q
    ||| |||||    
T  23525965 gaatggaga 23525957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 17191 - 17833
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  17191 tcaagagagccatagggtagcaacagattagaatcttctctgatttggtaaatcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgat 17290  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||| |||    
T  17291 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaaacaaagactgaatgatgagaggaggccgaat 17390  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  17391 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgctttaggtgtg 17490  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
     ||| || || |||||  |||  |||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||    
T  17491 atcaaaagggtcacacattagcggattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaa 17590  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17591 gaaggttagaactggtgggaaaatgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 17690  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17691 ttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 17790  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17791 ttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 85 - 643
Target Start/End: Original strand, 4640 - 5198
Alignment:
Q  85 ctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatga 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4640 ctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgccccttttgacaagggaaagcaaagactgaatga 4739  T
Q  185 ttagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaat 284  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||     
T  4740 tgagaggaggccaaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggccagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaag 4839  T
Q  285 aaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttctt 384  Q
    || |||||||||||||| ||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  4840 aagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatcagtactc 4939  T
Q  385 agtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgttt 484  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4940 agtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgttt 5039  T
Q  485 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgat 584  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  5040 ctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgat 5139  T
Q  585 atgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5140 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 5198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 263823 - 263172
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||| || || |  |||| |||||| ||||||||    
T  263823 tcaagagagccatagggtaccaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagttcattataaggtgat 263724  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  |    
T  263723 gagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcttaagccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgtt 263624  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  263623 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 263524  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||    |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||    
T  263523 gtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaa 263424  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  263423 gaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 263324  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  263323 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 263224  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  263223 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 263172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 40655 - 40013
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||| ||||||| | | | ||||| || ||| |||| || |  ||||||||||| ||||||||    
T  40655 tcaagagagccatagggtaccaatatattagaatcttctctaatttggtaagtcgttgcagaatctataaagaggacacaaaagctcattataaggtgat 40556  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||    
T  40555 gagtgagcgaagaggtatgggacaacagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaat 40456  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  40455 aggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtg 40356  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||| || ||||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  40355 gttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaa 40256  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40255 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 40156  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |  || |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  40155 ttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 40056  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40055 ttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgt 40013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17698
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || |  |  |  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgt 17698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 9481 - 10124
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  || || |||| ||| |||| ||||||||||||    
T  9481 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaatcttctctgagttggtgagtagctgcaggatat--gaggaggatactaaggctctttacaaggtgat 9578  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||     
T  9579 gagtgaacgaagaggtaaaggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcttgctgataagggaaagcaaaggatgaatgatgagaggaggccaaac 9678  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |   ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9679 aggagagatgctcctgctgatattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 9778  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||  | || || || || ||    
T  9779 gtcagaaaggacacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatataagttcacaatgtacgcaaccgaa 9878  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9879 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcct 9978  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9979 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatgg 10078  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10079 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 10124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24294
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 24294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 9211 - 8566
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||| ||||| | ||||||||  || ||||| || || |  ||| |||||||  |||||||    
T  9211 tcaagagagccattgggtaccagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagtagctgcataatctatgaggaggacacgaaatctcattattaggtgat 9112  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||  | || ||||||||||||||| | || || || ||||  ||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| || |||||     
T  9111 gagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagctgaatgatgagagaagacccaag 9012  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  9011 aggagagatgctcctgatgagattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 8912  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| || || ||    
T  8911 gtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatatcagttcgcagtgcactcaaccgaa 8812  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8811 gaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 8712  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8711 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatgg 8612  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8611 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 16151204 - 16150562
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  16151204 tcaagagagccattgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgat 16151105  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||||||| | || || || ||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  16151104 gagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaag 16151005  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16151004 aggagagatgctcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 16150905  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||  | ||  | ||||   | || ||    
T  16150904 gtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaa 16150805  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16150804 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcct 16150705  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16150704 ttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatgg 16150605  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16150604 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 16150562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 16155350 - 16154708
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  16155350 tcaagagagccattgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgat 16155251  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||||||| | || || || ||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  16155250 gagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaag 16155151  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16155150 aggagagatgctcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 16155051  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||  | ||  | ||||   | || ||    
T  16155050 gtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaaccgaa 16154951  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16154950 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcct 16154851  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16154850 ttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatgg 16154751  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16154750 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 16154708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 646
Target Start/End: Original strand, 14993086 - 14993716
Alignment:
Q  16 ggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagagg 115  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14993086 ggtatcagaagataagaaacttttctgatttggtaagtagttgcagaatttatgaagaggatatgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagagg 14993185  T
Q  116 taagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttct 215  Q
     |||||||| |||||||||   || || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14993186 caagggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcct 14993285  T
Q  216 gctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacaca 315  Q
     |||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |      ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993286 actgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgagaagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacaca 14993385  T
Q  316 ccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccgg 415  Q
    |  ||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| || || || |||||| ||||  |||| || || || ||||||||||| || ||    
T  14993386 ctttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacagg 14993485  T
Q  416 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 515  Q
    ||| || |||||||| |||| ||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993486 tggcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 14993585  T
Q  516 gatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacag 615  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14993586 gatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 14993685  T
Q  616 ctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14993686 ctaagggttcactaactacttctcttgtttg 14993716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20893597 - 20892954
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | || ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  20893597 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggtaaacagttgcaggatttacaaagaagacaccaaagctcattacaagataatga 20893498  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    ||||| | || || |||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||| || ||    
T  20893497 gtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagag 20893398  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggt 302  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |   |  |||||||  || |||||||||||||||    
T  20893397 gagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggt 20893298  T
Q  303 cagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaaga 402  Q
    ||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||| ||| |||| |  || |||||||| |||||||| |||||| ||||  |||| ||  |||| ||||    
T  20893297 cagaagggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcatatcagttcgcagtgtactgagccgaaga 20893198  T
Q  403 aggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttt 502  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20893197 aggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 20893098  T
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20893097 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 20892998  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20892997 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 20892954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 51603496 - 51604147
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| || |||||    
T  51603496 tcaagagagccataggataccagcagattagaattttctctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgat 51603595  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||  |||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | |    
T  51603596 gagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccgactgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagt 51603695  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | ||| |||||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  51603696 aagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtg 51603795  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || ||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||    
T  51603796 gacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtgtgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaa 51603895  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51603896 gaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 51603995  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  51603996 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatgg 51604095  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604096 ttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 51604147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 642
Target Start/End: Original strand, 53750174 - 53750815
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || || || |  ||||||||||| || |||||    
T  53750174 tcaagagagccataggataccagcagattagaattttctctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgat 53750273  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||  |||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | |    
T  53750274 gagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccgactgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagt 53750373  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    | ||| |||||| |||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  53750374 aagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtg 53750473  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| || ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||    
T  53750474 gacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaa 53750573  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53750574 gaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 53750673  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  53750674 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatgg 53750773  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttg 642  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750774 ttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 3261498 - 3262143
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  3261498 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 3261597  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  3261598 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 3261697  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  3261698 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 3261797  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  3261798 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 3261897  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3261898 gaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 3261997  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  3261998 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 3262097  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3262098 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 3262143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 15267344 - 15266736
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | | |||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  15267344 tcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttgataagtagctgcaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 15267245  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  15267244 gagtgaacgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 15267145  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |  | || ||||| | ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  15267144 aggagagatgctcctacgaatattgtttgcttcaagtgtgatgagaagggccataagagtaatgtttgtgacagag-atgagaagaagtgcttcaggtgt 15267046  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  15267045 ggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccga 15266946  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || ||  ||||||| |  |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15266945 agaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagttgtttctttaatagtactcc 15266846  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  15266845 tttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 15266746  T
Q  600 gttgttgaaa 609  Q
    ||||||||||    
T  15266745 gttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 11203936 - 11204581
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  11203936 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 11204035  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||| ||| | |||||||| | ||||| |||||     
T  11204036 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagatgaatgatgataggagacccaag 11204135  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  11204136 aggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtg 11204235  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||  |||| | | ||||||||||| ||| |||| || || || ||||| | |||||| |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  11204236 gtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 11204335  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11204336 aaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 11204435  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |    
T  11204436 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatgg 11204535  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11204536 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 11204581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 44658570 - 44659215
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  44658570 tcaagagagccattggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataat 44658669  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||| ||||| |||||||||| | ||  | || | |||||||||||     
T  44658670 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaaaggaaagcagaagatgggtcatgataggaggcccaag 44658769  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  44658770 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 44658869  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| | |||  | |||||  ||||  ||||  |  | || ||    
T  44658870 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttcacagtgtcctgaaccgaa 44658969  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44658970 gaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 44659069  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  44659070 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatgg 44659169  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44659170 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 44659215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 646
Target Start/End: Original strand, 29450252 - 29450886
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||| | |    
T  29450252 attggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaataggtgcaaaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagagga 29450351  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    | ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||| || |||||||||||    
T  29450352 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcctaagaggagagatgc 29450451  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |   ||||| |  || || ||||||||||||||||| ||     
T  29450452 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaggagatgataggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggt 29450551  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || || ||| ||||  ||||  |  |||| ||||||  |||||    
T  29450552 cacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaa 29450651  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
      || || || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29450652 ttgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 29450751  T
Q  512 tatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaact 611  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29450752 tattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaact 29450851  T
Q  612 acagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29450852 ccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 29450886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 15073904 - 15073285
Alignment:
Q  24 aagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 123  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15073904 aagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggac 15073805  T
Q  124 agcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagat 223  Q
    ||| ||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| |  || |||||  |||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || |||||||    
T  15073804 agctgagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagat 15073705  T
Q  224 cgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagtt 323  Q
     || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |      |||||||| || || || ||||||||  |||||||||||||  ||| |    
T  15073704 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 15073605  T
Q  324 gattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaag 423  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||| ||  | ||||| || |||||  | ||  ||||||   |||| ||||||| |   || ||||| || |    
T  15073604 gattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatataagctcacagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaagg 15073505  T
Q  424 tgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactag 523  Q
    ||||| | ||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15073504 tgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 15073405  T
Q  524 tgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggt 623  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | |||||  ||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15073404 tgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 15073305  T
Q  624 tcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  15073304 tcagtaactacttctcttgt 15073285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7357835 - 7357280
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||| ||| | || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||| | ||    
T  7357835 tcaaaagagctattgggtatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaggctcattacaagataat 7357736  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||| ||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  7357735 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 7357636  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||  || |||||||||||||    
T  7357635 aggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttatggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtg 7357536  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| |||||  ||||  ||||  |  |||| ||    
T  7357535 gtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaa 7357436  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7357435 gaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 7357336  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgc 556  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  7357335 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 27903952 - 27903308
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||  || ||||| || ||||||||    
T  27903952 tcaagagagtcat-gggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtaagatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgat 27903854  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||| |||   ||   |||||| |||   |||||  | || || |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||| |      
T  27903853 gagcgagaagaggaataagggccagagtagtcgcccgaagccctacaatgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagg 27903754  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
     ||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| || || ||||| ||||    
T  27903753 gggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtg 27903654  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||| ||     | | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||| | ||  ||||  ||||||| || || ||    
T  27903653 gtcagaaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggcaacattagttcacagtgcacgcaacctaa 27903554  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| |||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27903553 gaaggtcagaacttgaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcct 27903454  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |    
T  27903453 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatgg 27903354  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27903353 tcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttg 27903308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18260009 - 18259649
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  18260009 tcaagagggctattggttactagaaaataagaaacttctctgatttagtaagtagctacaggatctatgaagaagatacaaaatctcattacaaggtgat 18259910  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| | | || || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  18259909 gagtgagcgtaggggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 18259810  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||| ||||||| || || | || ||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  18259809 aggacagatgctcctactaatattgtttgctttaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 18259710  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaa 361  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||    
T  18259709 gtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctataactgcaa 18259649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 480 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14697190 - 14697021
Alignment:
Q  480 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 579  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | |    
T  14697190 tgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgt 14697091  T
Q  580 ctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgctt 649  Q
    |  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14697090 cgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgctt 14697021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 416 - 643
Target Start/End: Original strand, 15894 - 16121
Alignment:
Q  416 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 515  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |   || ||||| ||  | |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  15894 tgggagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattatt 15993  T
Q  516 gatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacag 615  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  15994 gatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 16093  T
Q  616 ctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16094 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 558 - 646
Target Start/End: Original strand, 15354301 - 15354389
Alignment:
Q  558 tataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15354301 tataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttg 15354389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 426 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 14162613 - 14162396
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |   || ||||| || || |||||||||| ||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  14162613 tttgcattgacgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtg 14162514  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||  ||| |||||| || | ||||||| |||||||| | | | | | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14162513 ctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14162414  T
Q  626 agtgactacttctcttgt 643  Q
     || ||||||||||||||    
T  14162413 ggtaactacttctcttgt 14162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8709177 - 8708979
Alignment:
Q  69 gaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaa 168  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    || || |||||  ||||| | || |  || ||||  ||||||||||| || |    
T  8709177 gaagaggatatcaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagctctatagtgctcctgctgacaaaggga 8709078  T
Q  169 agcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| || || || | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8709077 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaatagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 8708979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13879639 - 13879413
Alignment:
Q  39 tctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttcta 138  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || ||||| || ||||  || |||||||| ||||| | ||||||||| ||    ||||| |||||  ||||| | |    
T  13879639 tctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtccga 13879540  T
Q  139 aaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtg 238  Q
    | || |||||||  |||| |||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||| || || || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13879539 agccctacagtgctcctgatgacaaagggtagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgtttctactgagattgtttgttacaagtg 13879440  T
Q  239 tggcgagaaaggccacaagagtaatgt 265  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13879439 tggtgagaagggccacaagagtaatgt 13879413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 512
Target Start/End: Original strand, 15354229 - 15354291
Alignment:
Q  450 actaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354229 actagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 653
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350650
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || | | | | || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 16350650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 17092079 - 17092232
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  17092079 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatat 17092178  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17092179 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17092232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14697589 - 14697406
Alignment:
Q  81 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttga 180  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |||||| | || || |||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  14697589 aaagctcattacaaagttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattga 14697490  T
Q  181 atgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    ||||| |||||||||| |  | || ||||||| |||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14697489 atgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctactgctgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatg 14697406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 8050553 - 8050706
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  8050553 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8050652  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8050653 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12479682 - 12479529
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  12479682 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12479583  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12479582 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12479529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 14300909 - 14301062
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  14300909 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14301008  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14301009 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14683649 - 14683496
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  14683649 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14683550  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14683549 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14683496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 16233922 - 16234075
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16233922 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16234021  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16234022 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16234075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 19635218 - 19635065
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  19635218 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19635119  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19635118 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23958829 - 23958676
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  23958829 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 23958730  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23958729 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23958676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 8389494 - 8389344
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  8389494 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8389395  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttc 637  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8389394 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 8389344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Original strand, 14300467 - 14300585
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  14300467 gatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 14300566  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  14300567 cgtacagtgcccctgctga 14300585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15144975
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||| ||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctct 15144975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224529
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18224529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 19775723 - 19775876
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  19775723 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19775822  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19775823 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27714418 - 27714265
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27714418 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27714319  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27714318 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 27714265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13513879 - 13513652
Alignment:
Q  40 ctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  | |||||||||||||||  | | |||| | |     ||||| |||||||||||  ||||    
T  13513879 ctgatttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccagagctcattacaaggttgttaatgagaggaagaccaagggccagcagagtcgccctaa 13513780  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
     || || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||  ||  |||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| ||||| || |||| ||| |||    
T  13513779 gccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgt 13513680  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13513679 ggcgagaaaggccacaagagcaatgttt 13513652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 16250872 - 16250933
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16250872 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 18223950 - 18224183
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||  || ||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| |||||||||||    
T  18223950 ttttccctgatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcg 18224049  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      |||| || || |||| ||||| ||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||  |||| || | ||  |||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  18224050 ccctaagccttatagtgcccctgttgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttc 18224149  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18224150 aactgtggcgagaaaggccacaagtgtaatgttt 18224183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 18604296 - 18604529
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcg 133  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||  | | |||| | |    |||||| |||||||||||    
T  18604296 ttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccatagctcattacaaggttgttaatgagaggaagactaagggccagcagagtcg 18604395  T
Q  134 ttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttac 233  Q
      |||| || || | || ||||||||| ||||| ||||||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| || | |||||  ||||||      
T  18604396 ccctaagccttataatgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgtttt 18604495  T
Q  234 aagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18604496 aactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 18604529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 40476122 - 40475969
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  40476122 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 40476023  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40476022 gaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 40475969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13513432 - 13513285
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| | || |||| || |   | |||| | | | | ||||||||    
T  13513432 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 13513333  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactac 634  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13513332 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14684091 - 14683973
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||| |  |||  ||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  14684091 gatttggtcaatagttgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataagattgtgaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 14683992  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  14683991 catacagtgcccctgctga 14683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Original strand, 16248153 - 16248285
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc-gcagaggtaagggacagcagagtc 132  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||| | |||  |||||| ||||||||||    
T  16248153 ttttccctgatttggttaatagctgcaggatctataaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcagaaga-ctaagggccagcagagtc 16248251  T
Q  133 gttctaaaccatacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    |  |||| || || |||| ||||||||| |||||    
T  16248252 gccctaagccctatagtgcccctgctgataaggg 16248285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8389936 - 8389812
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||  | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  8389936 gatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 8389837  T
Q  142 catacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  8389836 cgtacagtgcccccgctgacaaggg 8389812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19635660 - 19635542
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||||||| || |||| |    
T  19635660 gatttggttaatagttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagttgtcctaagc 19635561  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  19635560 cgtacagtgcccccgctga 19635542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258850
Alignment:
Q  605 tgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttg 15258850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 9495 - 10144
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| | | | |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  9495 tcaagagagccatagtgtaccaacagattagaattttctc-gatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgat 9593  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||  | |||||| |||||||||||  |    
T  9594 gagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataagggtaagctgagacttaatgatgagaggaggcccgtt 9693  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9694 aggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 9793  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||| || |||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||| ||| ||    
T  9794 gttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagtgccatatcagtacacagtgcacactgccgaa 9893  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9894 gaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatga-tataggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 9992  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9993 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 10092  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10093 ttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgag 10144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 6993
Alignment:
Q  17 gtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggt 116  Q
    |||||||||||| || |  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||| || ||  |     
T  7619 gtatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagc 7520  T
Q  117 aagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctg 216  Q
    || ||||||||||||||| | || || || ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7519 aaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctg 7420  T
Q  217 ctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacac 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7419 ctgagattgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacac 7320  T
Q  317 cctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggt 416  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| |||||  | ||  | ||||   |||| |||||| |||| ||||||    
T  7319 tctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggt 7220  T
Q  417 gggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 516  Q
    || |||||||||||  | ||||| ||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7219 ggtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 7120  T
Q  517 atactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagc 616  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7119 acactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 7020  T
Q  617 taagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7019 taagggttcagtaactacttctcttgt 6993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 6
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggt 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  54 tcaagagagccattgggtatcagaagatcaggaacttctctgaattggt 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 54644 - 54002
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  54644 tcaaaagagccattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattataaggtgat 54545  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||  | || ||||| ||||||||| | || || || ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54544 gagtgatcgaaggagcaaaggacatcagagtcgtccaaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaat 54445  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  54444 agatgaaatgctcttgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtg 54345  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||   ||||||||| || ||    
T  54344 gtcagaagggacacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagctcacggtgcacacaaccgaa 54245  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
     |||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54244 aaaggttaggaccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 54145  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||| |    
T  54144 ttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatgg 54045  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  54044 ttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgt 54002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 252 - 903
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  252 tcaagagggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgat 351  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| || |||||     
T  352 gagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtccccctgctgacaagggaaagcaacggctgaatgatgagagaagacccaag 451  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  452 aggagagatgctcctactgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 551  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | | | |||||| |   ||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  552 gtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggaatgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaa 651  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  652 gaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 751  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  752 ttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagatgg 851  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  852 ttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgag 903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10731
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||| |||| | ||||||  ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 10731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 643
Target Start/End: Original strand, 5964 - 6606
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||| | |   |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| || |||||    
T  5964 tcaagagagccataggataccaacagattagaattttctctgatttggtaagtcattgcaggatttatgaggaggacaccaaagctcattataaagtgat 6063  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||| |||    
T  6064 gagtgaacgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaat 6163  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6164 aggagagatgctcctgtcgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 6263  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || |||   |||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| || || |||||||||| |  ||    
T  6264 gtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtggcgatattgtatgctataattgtaacgaatagggccacatcagtactcagtgcacacaacagaa 6363  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6364 gaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcct 6463  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6464 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 6563  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6564 ttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 606
Target Start/End: Original strand, 8728 - 9333
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  8728 tcaagagagccattgggtatcagaaggttagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcatgacaaggttat 8827  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  8828 gagtgaacgaagaggtaaaggatagcagagttgtcataaaccatatagtgctcctgcagacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaag 8927  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |   ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8928 aggagagatgcttctgctaagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaagccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtg 9027  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || || |||  |||  |||| |||||  | ||    
T  9028 gtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaatcaattcgcagtgtacacaaacgaa 9127  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9128 gaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 9227  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9228 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatgg 9327  T
Q  601 ttgttg 606  Q
    ||||||    
T  9328 ttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 645
Target Start/End: Original strand, 522 - 1166
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  522 tcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttctgaggaagataccaaagctcattacaaggtgat 621  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | || || || ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  622 gagtgaacatagaggcaagggacagcaaagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaaggggaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 721  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || | || || | ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  722 aggagagatgctcctacggacattgattgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 821  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||  |||| || ||||||||    
T  822 gtcagaagggacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatcagttcgcagtgtacgcagccaaa 921  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  922 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactccc 1021  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  1022 ttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatgg 1121  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgttt 645  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1122 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 50702 - 50057
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50702 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgat 50603  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | || || || |||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||     
T  50602 gagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtggtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcatagatggaatgatgagaggaggcccaag 50503  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||||| || || |||||||||    
T  50502 aggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcaggtgt 50404  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||| || || || |||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  50403 ggtcagaaaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacccagccta 50304  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50303 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcc 50204  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  50203 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaatt 50104  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50103 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 50057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 252216 - 251567
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  252216 tcaaaagagctattaggtatcagaagattagaattttctctgaattggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgat 252117  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||  ||||||| ||  ||||| || | | |||||||| | |||||||||||     
T  252116 gagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgccacaggaaaacataagatgaatgatgataggaggcccaag 252017  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  || |||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||| ||  ||| || |   |  |||||||  ||||| || |||||||    
T  252016 aggagagatgctcttgttgagattgtgtgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagctatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtg 251917  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| || |||||| ||||  |||| || |||||       
T  251916 gtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagcc--- 251820  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  251819 gaaggctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttct 251720  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  251719 ttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatgg 251620  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  251619 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaga 251567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 229598 - 229825
Alignment:
Q  40 ctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || ||||||||||||||  ||| |||| | |    |||||  |||||||||||  ||||    
T  229598 ctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaagactaaggaccagcagagtcgccctaa 229697  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
     || || |||| ||||||||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| |||| ||  |||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  229698 gccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaataagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaattgt 229797  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  229798 ggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 229825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 590 - 1235
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  590 tcaagagagccattggttatcagaaaaaaagaaatttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacaacaaagctcattacaaggtgat 689  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || || || | ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||     
T  690 gagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccgtataatgctcctgctgacaagggtaagaagaggttaaatgatgagaggaggcccaag 789  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  790 aggagagatgctcctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 889  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||| || || || |||||| ||||  |||| || || || ||    
T  890 gtcagaaaggatacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaa 989  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  990 gaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 1089  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || | |||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1090 ttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 1189  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1190 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 1235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 153 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 326151 - 325659
Alignment:
Q  153 cctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcc 252  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  326151 cctgctaacaagggtaagcagaggctgaatgatgagaggaggcc-aataggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgagaaagacc 326053  T
Q  253 acaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgtta 352  Q
    ||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| || |||||||| |||||    
T  326052 acaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgtta 325953  T
Q  353 taactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtact 452  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  325952 taactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccact 325853  T
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  325852 agtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 325753  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  325752 gtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 325659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 319840 - 319482
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  319840 tcaagagagccattgggtatcagaagataaagaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 319741  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
     ||||| || || || || ||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  319740 aagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaggataagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaat 319641  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||||    
T  319640 aggagagatgctcctgctgggattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 319541  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgc 359  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  319540 gtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgttataactgc 319482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 433 - 651
Target Start/End: Original strand, 200607 - 200825
Alignment:
Q  433 tgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactca 532  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  200607 tgactggtacgcagacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacaca 200706  T
Q  533 ttatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgact 632  Q
    || |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  200707 ttgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 200806  T
Q  633 acttctcttgtttgcttga 651  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  200807 acttctctcgtttgtttga 200825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Original strand, 200338 - 200450
Alignment:
Q  155 tgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccac 254  Q
    ||||||||| || ||| | || ||||||||| ||||||| || || || ||||| | | ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  200338 tgctgacaaagggaagtaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagaagttcctaatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccac 200437  T
Q  255 aagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||||    
T  200438 aagagtaatgttt 200450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1663
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1018 tcaagagggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 1117  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||     
T  1118 gagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaag 1217  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  1218 aggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 1317  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||| ||| |||| || || |  ||||| || || || |||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  1318 gtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaa 1417  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1418 gaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 1517  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1518 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatgg 1617  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  1618 ttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttg 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8341 - 7696
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  8341 tcaagagggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 8242  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||     
T  8241 gagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaag 8142  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  8141 aggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 8042  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||| ||| |||| || || |  ||||| || || || |||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  8041 gtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaa 7942  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7941 gaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 7842  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7841 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatgg 7742  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  7741 ttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttg 7696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 34934 - 34289
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  34934 tcaagagtgccattggttattagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgat 34835  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |  || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||     
T  34834 gagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagctgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcaaaggttaaatgatgagaggaggcccaag 34735  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  34734 aggagagatgctcctactgacattgtttgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 34635  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||  |||| ||||| || ||||| ||    
T  34634 gttagaaaggacacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgtagtgtacgcagccgaa 34535  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34534 gaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 34435  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  34434 ttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatgg 34335  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  34334 ttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttg 34289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 6401 - 5757
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||| ||| ||||  |  ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  6401 tcaagagagccattggctatcagaaaataaggaacttctttgaattgggaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 6302  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || || ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||     
T  6301 gagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaagggtaagca-aggttaaatgatgagaggaggcccaag 6203  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| || |||||||| ||||    
T  6202 aggagagatgctcttactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagatgtg 6103  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||  |||| ||||| || ||    
T  6102 gtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatattagttcacagtgtacacaaccgaa 6003  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||| |  ||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6002 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 5903  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5902 ttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatgg 5803  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5802 ttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttg 5757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 638
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41452
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||  | | |||| ||  || ||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgg 41381  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttct 638  Q
    || | ||| | ||   |||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382 gtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 646
Target Start/End: Original strand, 514065 - 514705
Alignment:
Q  6 agagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtg 105  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||    
T  514065 agagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtg 514164  T
Q  106 agcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggag 205  Q
    || | || |||||||||||||||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||| ||| | |||||||| | |||||||| || |||||    
T  514165 agaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagaagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggag 514264  T
Q  206 agatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcag 305  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   || || ||||  || ||||||||||||||||||    
T  514265 agatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcag 514364  T
Q  306 aaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaagg 405  Q
    || ||||||| | ||  ||| || ||| |||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| |||||| ||||  ||||  |  | || |||||||    
T  514365 aagggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaagg 514464  T
Q  406 ttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaat 505  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  514465 ttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaat 514564  T
Q  506 tgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgtt 605  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  514565 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 514664  T
Q  606 gaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  514665 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 514705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 426 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 495975
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||  | ||||||||||  ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 495993  T
Q  626 agtgactacttctcttgt 643  Q
     |||||||||||||||||    
T  495992 ggtgactacttctcttgt 495975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441611
Alignment:
Q  492 agtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 591  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| |||||| || | ||||||| ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  592 gagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 441611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 204 - 643
Target Start/End: Original strand, 764 - 1203
Alignment:
Q  204 agagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtc 303  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  764 agagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggcaagaaaggccataagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 863  T
Q  304 agaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaa 403  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||| || || || | |||    
T  864 agaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaa 963  T
Q  404 ggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttta 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |  |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  964 ggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 1063  T
Q  504 attgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttg 603  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1064 attgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttg 1163  T
Q  604 ttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1164 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 3758 - 3920
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  3758 tcaagagagccattgggtatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgat 3857  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaa 163  Q
    |||||| || ||  | || ||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||    
T  3858 gagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaa 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 54 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 37483 - 36891
Alignment:
Q  54 agctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtcc 153  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||  |    
T  37483 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 37384  T
Q  154 ctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcca 253  Q
     ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || |||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37383 ttgccgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagacactcctactgatattttttgcttcaagtgtggcgagaaaggcca 37284  T
Q  254 caagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttat 353  Q
    |||||||||||||| |   || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| |||| || |||    
T  37283 caagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctat 37184  T
Q  354 aactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtacta 453  Q
    |||||||| || || || |||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||||||| |  ||||    
T  37183 aactgcaatgaggaaggtcatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaacta 37084  T
Q  454 atgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatg 553  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | ||    
T  37083 atgaagacagacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattg 36984  T
Q  554 tgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36983 tgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttg 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11572 - 10929
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  11572 aagagagttattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatga 11473  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    ||||| | || |||||||| ||||||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| || || ||    
T  11472 gtgagaggaggggtaagggtcagcagattcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagattttgaatgatgataggagtcctaagag 11373  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggt 302  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |   |  |||||||  || |||||||||||||||    
T  11372 gagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggt 11273  T
Q  303 cagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaaga 402  Q
    ||||| |||||| | |||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||  |||| || ||||| ||||    
T  11272 cagaagggacacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatcagctcacagtgtactcagccgaaga 11173  T
Q  403 aggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttt 502  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11172 aggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 11073  T
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11072 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatactt 10973  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10972 gttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttg 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 131 - 652
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5503
Alignment:
Q  131 tcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgt 230  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  4982 tcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgt 5081  T
Q  231 tacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgca 330  Q
    || ||| |||  || ||||||||||| |  |||| || |   |   ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  5082 taaaagagtgatgaaaaaggccacaaaaacaatgcttgtggtagaaatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgta 5181  T
Q  331 agcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgc 430  Q
    ||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5182 agcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgc 5281  T
Q  431 attgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctact 530  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5282 attgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctact 5381  T
Q  531 cattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtga 630  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5382 cattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 5481  T
Q  631 ctacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  5482 ctacttctctagtttgcttgag 5503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 1555 - 2125
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1555 tcaagagggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgat 1654  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||| ||||||||     
T  1655 gagtgagcggaggggtaagggaaaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaag 1754  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  1755 aggagagatgctactgctgaaataatttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 1854  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | | | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  1855 gtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaa 1954  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1955 gaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 2054  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttt 571  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||    
T  2055 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggttt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1042 - 413
Alignment:
Q  17 gtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggt 116  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||| | || |||    
T  1042 gtatcagcagatcagaatcttctctgagttggttaacagatgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggt 943  T
Q  117 aagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctg 216  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| | |||||||| || |||||||||||| ||     
T  942 aagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagttgattgatgataggaggcctaagaggagagatgctcctt 843  T
Q  217 ctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacac 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |   || |||||||  || ||||||||||| |||||||| || ||||     
T  842 ctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaa 743  T
Q  317 cctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggt 416  Q
      ||| ||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||| | |||||| |||||  ||||  ||||  |  | || |||||||||||||| ||     
T  742 tttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatataagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactggg 643  T
Q  417 gggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatag 516  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  642 ggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattg 543  T
Q  517 atactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagc 616  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  542 atactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagc 443  T
Q  617 taagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  442 taagggttcagtaactacttctcttgtttg 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 54 - 652
Target Start/End: Original strand, 30086 - 30684
Alignment:
Q  54 agctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtcc 153  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||  |    
T  30086 agctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattactagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaaaccttacagtgctc 30185  T
Q  154 ctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcca 253  Q
    |||||||||| || || |||| | |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30186 ctgctgacaaagggaaacagaagatgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggcca 30285  T
Q  254 caagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttat 353  Q
    |||||| |||| || |   |  ||| |||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||| ||| || |||  ||| ||  ||||||| ||     
T  30286 caagagcaatgcttgtggtagagataagaggaaatgttttaggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacattgtatgctac 30385  T
Q  354 aactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtacta 453  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||  |||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  30386 aactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagacaacaa 30485  T
Q  454 atgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  30486 atgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatg 30585  T
Q  554 tgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30586 tgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 30684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 42332 - 41687
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| | | | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  42332 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcaaagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattat 42233  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  42232 gagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 42133  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  42132 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 42033  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |  || || |||||| ||||  ||||  |  |||| ||    
T  42032 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaa 41933  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||  |||||  || || || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41932 gaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 41833  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |    
T  41832 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatgg 41733  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41732 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 41687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 70705 - 70079
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  70705 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgat 70606  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  70605 gagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaag 70506  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  || ||||||| || || ||||| |||    
T  70505 aggagagatgctcctactgagattatttgctttaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcagatgt 70407  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||||  ||||  |||| || ||||| |    
T  70406 ggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagccta 70307  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  70306 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcc 70207  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  70206 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatg 70107  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcag 627  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  70106 gttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 480 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60685
Alignment:
Q  480 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 579  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  580 ctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 60685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 5777 - 5133
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||| | ||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  5777 tcaagagggctattggttatcagaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctacaagatttatgaagaggataccaaagctcattacaaagtgat 5678  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||| |   || || ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  5677 gagtgagcatagagtcaagggacagcagagtcatcggaagccgtacagtgcccctactgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcc-aag 5579  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||| || ||||||||||||    
T  5578 aggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgt 5480  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||| ||||  |||| || ||||| |    
T  5479 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagccta 5380  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||  |||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5379 agaagtctaggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 5280  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||     
T  5279 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatg 5180  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  5179 gttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttg 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43295 - 42650
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  43295 tcaagagggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaagatctatgatgaggatacaaaagctcattacaaggtgat 43196  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  43195 gagtaagcgccgaggcaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaag 43096  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||| || ||||| ||||||    
T  43095 aggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgttgtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgctttaggtgt 42997  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
     ||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||| |||||||| || || || || || | ||| || |||||  ||||  |||| || || || |    
T  42996 agtcagaaaggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatattagttcgcagtgtacgcaaccta 42897  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    ||||| |||| || ||||| || |||||||| || |||||| |||| |    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42896 agaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 42797  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  42796 tttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 42697  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42696 gttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttg 42650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 453 - 640
Target Start/End: Original strand, 50504 - 50691
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| || || ||||||||||  ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |    
T  50504 aatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 50603  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50604 gtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 646
Target Start/End: Original strand, 66817 - 67460
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  66817 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtgttctctgatttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatga 66916  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    ||||| | || || ||||||||||||| |||| |||| || |||||||  |||| |||||| |||||| ||| | |||||||| | ||||| ||||| ||    
T  66917 gtgagaggaggggcaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgttgacaaaggaaagtagatgatgaatgatgataggagacccaagag 67016  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggt 302  Q
    |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |   |   ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  67017 gagagatgctccttccgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagacatgagaggaaatgtttcaggtgtggt 67116  T
Q  303 cagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaaga 402  Q
    || || ||||||| ||||| ||| || |||| ||| ||  |||| || || |||||||| | ||| || |||||  ||||  | || |   |||| ||||    
T  67117 caaaagggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcgcaatgtagtgagccgaaga 67216  T
Q  403 aggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttt 502  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  67217 gggttagaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 67316  T
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||  |  || |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  67317 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggtt 67416  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67417 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 67460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 207 - 646
Target Start/End: Original strand, 65211 - 65650
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcaga 306  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  65211 gatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcaga 65310  T
Q  307 aaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggt 406  Q
    ||||||||||  | | | |||| ||| | || |||||||| |||||||| ||  | || || ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  65311 aaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggt 65410  T
Q  407 tagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaatt 506  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  65411 taggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaatt 65510  T
Q  507 gctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttg 606  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  65511 gctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 65610  T
Q  607 aaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65611 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 65650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 62479 - 62950
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  62479 tcaagagggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgat 62578  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  62579 gagtgagcgtagaggcaaggggcagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaag 62678  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    | |||||||| || ||||| |||||||    
T  62679 aggagagatgctcctactgatattgtttaattcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccatgatgagaagaagtgctttaggtgtg 62778  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| || ||| | || |||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  62779 gtcagaaagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaa 62878  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcag 472  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||    
T  62879 gaaagttaggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 65029 - 65213
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  65029 tcaagagagccattggttatcagaaaatcagaaatttctctgagttggtgagtagctgcagaatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgat 65128  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgat 185  Q
    ||||||| | ||   ||| ||||| ||||||||  | || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  65129 gagtgagagaaggaataatggacaacagagtcgcccgaagccatatagtgcccctgctgataagggcaagcagagactgaatgat 65213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 640
Target Start/End: Original strand, 4022 - 4650
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4022 attggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagttgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtgagcgca 4121  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  4122 gaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 4221  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| | |      |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  4222 tcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaagactacaaaagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagga 4321  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    |||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||||  ||||  |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  4322 cacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttagga 4421  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4422 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctat 4521  T
Q  512 tatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaact 611  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4522 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaact 4621  T
Q  612 acagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4622 ccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 63246 - 63877
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  || ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  63246 tcaagagggctattggttatgagaagataagaaacttttctgaattggtaagtagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 63345  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||                    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||     
T  63346 gagtgagcgtagaggcaaggtacagcagagtc--------------------cctgctgacaagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaag 63425  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgt 299  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||| || || |||||||||    
T  63426 aggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgataaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgtttcaggtgt 63524  T
Q  300 ggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaa 399  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||| |||| || || ||||  || || || || |||||| ||||  |||| || ||||| |    
T  63525 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagccta 63624  T
Q  400 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcc 499  Q
    |||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  63625 agaaggttaggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactct 63724  T
Q  500 tttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  63725 tttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 63824  T
Q  600 gttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  63825 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 63877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 5650 - 5206
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5650 tcaagagaaccattgggtatcagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgat 5551  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  5550 gagtgaacgaagaggtaaaggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgataagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccacg 5451  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||||    
T  5450 aggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgcggcgagaaaggccacaggagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 5351  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||||||||||||  ||| | |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||  |||| || || || ||    
T  5350 gttagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcaaccgaa 5251  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 445  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  5250 gaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgca 5206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1072
Alignment:
Q  465 cttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagt 564  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  565 tgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttg 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 1194 - 1707
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1194 tcaaaagagctatagggtatcagaagatcagagtcttctctgagttggtaagcagctgtaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgat 1293  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||   |||||||| | |||||||||||     
T  1294 gagtgagaggagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggaaaacagaaaatgaatgatgataggaggcccaag 1393  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |   |  |||| ||  ||||| || |||||||    
T  1394 aggagagatgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgtgaggaaatgttttaggtgtg 1493  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    || |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||| ||  |||| || || |||||||| ||||| || |||||| ||||  |||| || ||||| ||    
T  1494 gttagaagggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccgaa 1593  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1594 gaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 1693  T
Q  501 ttaattgctattat 514  Q
    ||||||||||||||    
T  1694 ttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 652
Target Start/End: Original strand, 987 - 1630
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  987 gccattggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagc 1086  T
Q  109 gcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  1087 gcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagaga 1186  T
Q  209 tgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaa 308  Q
    |||| || || |||| || ||||  || ||||| || |||||||||||| ||||||| | |      |||||||| || || ||| | |||||  |||||    
T  1187 tgctcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaa 1286  T
Q  309 ggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggtta 408  Q
    ||||||||  | | ||| || |||||||||||| |||| || || || ||  | |||||||| |||||  | ||| ||||||   |||| ||||||| |     
T  1287 ggacacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctc 1386  T
Q  409 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgc 508  Q
      || ||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1387 tgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 1486  T
Q  509 tattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaa 608  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1487 tattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 1586  T
Q  609 actacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  1587 actccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgag 1630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 652
Target Start/End: Original strand, 28000 - 28643
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28000 gccattggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagc 28099  T
Q  109 gcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  28100 gcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagaga 28199  T
Q  209 tgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaa 308  Q
    |||| || || |||| || ||||  || ||||| || |||||||||||| ||||||| | |      |||||||| || || ||| | |||||  |||||    
T  28200 tgctcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaa 28299  T
Q  309 ggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggtta 408  Q
    ||||||||  | | ||| || |||||||||||| |||| || || || ||  | |||||||| |||||  | ||| ||||||   |||| ||||||| |     
T  28300 ggacacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctc 28399  T
Q  409 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgc 508  Q
      || ||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28400 tgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 28499  T
Q  509 tattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaa 608  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28500 tattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 28599  T
Q  609 actacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  28600 actccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgag 28643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 652
Target Start/End: Original strand, 43126 - 43777
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| |  ||||| ||||||||| |||| ||||  |||  |||||||||||||||    
T  43126 tcaagagggctattggttatcaaaagataaggaatttctcagatttggtaagcagctgtaggatatattaagaggataccaaatgtcattacaaggtgat 43225  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  || ||||  ||| || |||| || || |||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  43226 gagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccaaaactgtatagtgctccttctaacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaag 43325  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||| | || || ||||||||||||||||| | |      |||||||| || ||||| |||||||    
T  43326 aggagagatgctcctaatgagattgtctgtttcaagtgtcgtgaaaagggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtg 43425  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||  | ||  ||||||   |||| ||    
T  43426 gacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagagggtcatattagctcgcagtgcaagaagcccaa 43525  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43526 gaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 43625  T
Q  501 ttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatag 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||| |    
T  43626 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatgg 43725  T
Q  601 ttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43726 ttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgag 43777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 24 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 30100 - 29473
Alignment:
Q  24 aagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30100 aagataagaattt-ctctgatttggtgagtagttgtagaatctatgaagaggatacaaaggctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 30002  T
Q  124 agcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagat 223  Q
    ||||||||||| | ||||| |  ||||  ||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||  ||||||    
T  30001 agcagagtcgtccgaaaccgtctagtgctcctgctgacaaaggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagat 29902  T
Q  224 cgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagtt 323  Q
     || | || ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||   | |||||||| || || ||| |||||||   ||||||||||||  ||| |    
T  29901 agtctatttcaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaaccatgatgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagct 29802  T
Q  324 gattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaag 423  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||| || |||||  | ||  ||||||   |||| ||||||| |   || ||||| || |    
T  29801 gagtgcaagcgtggtgatgttgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaagg 29702  T
Q  424 tgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactag 523  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29701 tgtttgctctgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactag 29602  T
Q  524 tgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggt 623  Q
    ||||||||||| |||||||||  || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29601 tgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 29502  T
Q  624 tcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  29501 tcagtaactacttcacttgtttgtttgag 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 3222 - 2754
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3222 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgat 3123  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    | ||      ||||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  3122 gtgt------agaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaag 3029  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || | |||||||||||    
T  3028 aggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagttcttcaggtgtg 2929  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||  | || || ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||  |||| || ||    
T  2928 gacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaa 2829  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagagg 475  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  2828 gaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagagg 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 6191 - 5549
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| |  ||||  || ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6191 gccattggttatcaaaagataaggaatttctcggatttggtaagcagctttagaatatatgaagaggatacgaaagctcattataaagtgatgagtgagc 6092  T
Q  109 gcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagaga 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  6091 gcagaggtaagggtcagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggagaga 5992  T
Q  209 tgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaa 308  Q
    |||  ||  |||||  || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |      ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  5991 tgcccctaatgagactgtctatttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagataagaagaagtgtttcagatgtggacagaaa 5892  T
Q  309 ggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggtta 408  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||  | || |||||||   | || |||||||||     
T  5891 ggacacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacacattagctcgtagtgcaagaaacctaagaaggttc 5792  T
Q  409 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgc 508  Q
    |||||||||| |  ||||||||  | | ||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5791 gaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 5692  T
Q  509 tattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaa 608  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||   | ||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5691 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 5592  T
Q  609 actacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttga 651  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  5591 actccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttga 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2305 - 1667
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2305 attggttatcagaagataagaaatttttctgaattagtaagcagctgtagaatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtgagcgca 2206  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||| |  ||||   |||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  2205 gaggtaagggatagtagagtcgtccgaaaccgtt-agtgcttctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggtgagatgc 2107  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttat-acaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagg 310  Q
    | || |||| ||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  || ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  2106 tcctactgaaattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgag-atgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaagg 2008  T
Q  311 acacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttaga 410  Q
    ||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||  | ||  ||||||   |||| |||||| || |     
T  2007 acatactttagctgattgtaagcgtgg-gatgttgtatgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaagtttcgg 1909  T
Q  411 accggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgcta 510  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1908 acaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 1809  T
Q  511 ttatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaac 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  1808 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaac 1709  T
Q  611 tacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  1708 tccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgag 1667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 519
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1832
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||||||  | ||    
T  1314 tcaaaagagctattgggtatcagcagataagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaacataat 1413  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||| |||| | |||||||| ||     
T  1414 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcataagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcctaag 1513  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |   || |||||||  || |||||||||||||    
T  1514 aggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggacacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtg 1613  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||| ||  || | || || |||||||| | |||||| |||||| ||||  ||||  |  | || ||    
T  1614 gtcagaagggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcccgaaccgaa 1713  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcct 500  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1714 gaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 1813  T
Q  501 ttaattgctattatagata 519  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  1814 ttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15669 - 15279
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  15669 tcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggaaacgaaagctcattacaaggtgat 15570  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || |   | || ||||| ||||||||| | || || || ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15569 gagtgatcgaatgagcaaaggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagcgaaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaat 15470  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  15469 aggagagatgctcctgctgagattttctgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggacgagaagaagtgcttcaggtgtg 15370  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcac 391  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  15369 gtcagaaatgacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcac 15279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 450 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15271 - 15075
Alignment:
Q  450 actaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctatta 549  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  15271 actaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattg 15172  T
Q  550 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  15171 aatgtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttg 15075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6071
Alignment:
Q  471 agaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 570  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| ||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  6240 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtc 6141  T
Q  571 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    |   | | ||  ||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6140 ttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 6071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 116008 - 115509
Alignment:
Q  152 ccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggc 251  Q
    ||||||||  |||||||||||  |  |||||||| |||| ||||||||  | |||||  || ||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  116008 ccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagggaagagacactcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggc 115909  T
Q  252 cacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgtt 351  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||    ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  115908 cacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatatagtatgct 115809  T
Q  352 ataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtac 451  Q
    |||| ||||| |  ||||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |  ||    
T  115808 ataattgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtatgcaaaccac 115709  T
Q  452 taatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaa 551  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |  |     
T  115708 aaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagag 115609  T
Q  552 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttga 651  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  115608 tgtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttga 115509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 640
Target Start/End: Original strand, 93603 - 94240
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||    
T  93603 aagagagccataggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatga 93702  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    | |||   ||   |||||| |||   || ||  | || || |||||||  |||||| |||| || || | ||| ||||||||| ||||    |  ||  |    
T  93703 gcgagaagaggaataagggtcagagtagccgcccgaagccctacagtgctcctgctaacaaaggcaaaccgagattgaatgatgagagaccacaaaaagg 93802  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggt 302  Q
    || | ||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||  | |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  93803 gaaaaatgctcctgttgaggttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggt 93902  T
Q  303 cagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaaga 402  Q
    |||||||| ||     | |  |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    || ||||| || ||  ||||  ||||||| || || ||||    
T  93903 cagaaaggtcatgtgttggcggattgcaagcgtggagatattgtttgttttaactgtggtgatgagggtcacattagttcgcagtgcactcaacctaaga 94002  T
Q  403 aggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttt 502  Q
    |||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94003 aggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 94102  T
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  94103 aattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 94202  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  94203 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 94240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 220 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 30312 - 29886
Alignment:
Q  220 agatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccct 319  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |   |  |||||||  || || |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30312 agattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtttgtggtagagatgagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacct 30213  T
Q  320 agttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtggg 419  Q
    || ||| || |||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||  ||||  |  |||| |||||||||||||  |||||     
T  30212 agctgaatgtaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtgga 30113  T
Q  420 aaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 519  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30112 aaggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 30013  T
Q  520 ctagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaa 619  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  30012 ctggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 29913  T
Q  620 gggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||   || ||||||||||||||    
T  29912 gggttcaagaaccacttctcttgtttg 29886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30507 - 30334
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||   ||    
T  30507 tcaatagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagacaat 30408  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcaga 174  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30407 gagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaga 30334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 279 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 13046 - 12679
Alignment:
Q  279 gagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcc 378  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||     
T  13046 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatca 12947  T
Q  379 gttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaa 478  Q
    ||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| |     |||||||||| ||||||||| ||||     
T  12946 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgcaaacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtac 12847  T
Q  479 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgta 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  12846 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 12747  T
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12746 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 12679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1101 - 799
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  1101 tcaagagagccattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggataataaggctcattacaaggtgat 1002  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||     
T  1001 gagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaag 902  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || | |||||||||||    
T  901 aggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggctagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtg 802  T
Q  301 gtc 303  Q
    |||    
T  801 gtc 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 385 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 535
Alignment:
Q  385 agtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgttt 484  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  796 agtgtacacaaccgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgttt 697  T
Q  485 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  696 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgat 597  T
Q  585 atgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  596 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 399 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 151766 - 151519
Alignment:
Q  399 aagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactc 498  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  151766 aagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactc 151667  T
Q  499 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaat 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  151666 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaat 151567  T
Q  599 agttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  151566 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 151519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 154089 - 153729
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  154089 tcaagagagccattggttatcagaagattagaaacttctctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggagacgaaagctcattacaaggtgat 153990  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    | |||| |  |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||     
T  153989 gggtgaacaaagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcccaag 153890  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||||||||| | |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  153889 aggagagatgctcccactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaagccataagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 153790  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaa 361  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||    
T  153789 gtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaa 153729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23882
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 541
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcat 541  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73837
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 73837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78218
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 78218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 579 - 1125
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| |  |||||| | ||||| |  ||||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||||||||||    
T  579 tcaagagagccattggctatcagagaataaggaacttctctaaattggtaaccagctgtaggatttatgaggaggacacgaaatctcattacaaggtgat 678  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||   |||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||     
T  679 gagtgaatgtagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtactcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcccaag 778  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||   || || ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |   |  |||||||| || ||||||| |||||    
T  779 aggagagatgctcctatggatattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcatgtgtg 878  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttc--tt---agtgcacacag 395  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| || || || ||| ||||  ||   |||| |||||     
T  879 gtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcacatcagttcagttcgcagtgtacacaa 978  T
Q  396 ccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagta 495  Q
    || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  979 ccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaataata 1078  T
Q  496 ctcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcatt 542  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  1079 cgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 52237 - 51716
Alignment:
Q  12 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  52237 attggttatcaaaagataaggaatatttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaggctcattataaagtgatgagtgagcgca 52138  T
Q  112 gaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgc 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||  || ||||  ||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  52137 gaggtaagggacagcagagccgtccgaaactgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 52038  T
Q  212 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 311  Q
    | || |||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |      |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  52037 tcctactgagattatctgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtaagaaagga 51938  T
Q  312 cacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaa 411  Q
    |||||  ||| | ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  | ||||| ||  ||||  ||||  |||| || ||||||||||||||| | |    
T  51937 cacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaaggtaatattagttcacagtgtacgcagccaaagaaggttcgga 51838  T
Q  412 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctat 511  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51837 caggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctat 51738  T
Q  512 tatagatactagtgctactcat 533  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  51737 tatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6034 - 5562
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  6034 tcaagagggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagcttattacaaggtgat 5935  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || || ||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||     
T  5934 gagtgagcgcagaggtaagggacaacatagtcgtccgaagccgtatag---ccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcttaag 5838  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |      |||||||| || ||||| |||||||    
T  5837 aggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtg 5738  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||| || |||||| ||||  |||| || || || ||    
T  5737 gtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaa 5638  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggt 476  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  5637 gaaggttaggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 519
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11968
Alignment:
Q  6 agagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtg 105  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||    
T  11455 agagccattgggtatcaacagatcagagtcttttcggagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtg 11554  T
Q  106 agcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggag 205  Q
    || | || ||||||||||| |||| |||| |||| || |||| ||  | ||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||| |||||| |||||    
T  11555 agaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaagcccaagaggag 11654  T
Q  206 agatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcag 305  Q
    ||||||  | | |||||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||  ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  11655 agatgcaccagatgagattgtatgatacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcag 11754  T
Q  306 aaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaagg 405  Q
    || || ||||   ||| |||  |||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| | ||| || |||||  || |  ||||  |  | || ||||||     
T  11755 aagggtcacagtttagctgaaagcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaaga 11854  T
Q  406 ttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaat 505  Q
     |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11855 ctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaat 11954  T
Q  506 tgctattatagata 519  Q
    ||||||||| ||||    
T  11955 tgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2817
Alignment:
Q  471 agaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 570  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | ||   ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  571 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 2817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 414 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11993 - 11761
Alignment:
Q  414 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 513  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11993 ggtggaaaggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 11894  T
Q  514 tagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactac 613  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  11893 tagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 11794  T
Q  614 agctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11793 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttg 11761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 12034
Alignment:
Q  219 gagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccc 318  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| |  || |||||||||||||||||||| || ||||       
T  12176 gagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtt 12077  T
Q  319 tagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaa 361  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||  || | ||||| ||||||||    
T  12076 tagctgaatgcaagcgtggggacattatctgttacaactgcaa 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 276 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12282 - 11906
Alignment:
Q  276 gatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccata 375  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||| |||| ||| |||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  12282 gatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacata 12183  T
Q  376 tccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagagg 475  Q
    |  ||||  |||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||    
T  12182 ttagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagagg 12083  T
Q  476 taattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 575  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | |||    
T  12082 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtt 11983  T
Q  576 gtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
     | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11982 atgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 11906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 420 - 646
Target Start/End: Original strand, 9353 - 9579
Alignment:
Q  420 aaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 519  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9353 aaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagaca 9452  T
Q  520 ctagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaa 619  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  9453 ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaa 9552  T
Q  620 gggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9553 gggttcagtaactacttctcttgtttg 9579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 4161 - 4501
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4161 tcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaa-ctcattacaaggtgat 4259  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||| ||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||     
T  4260 gagtgaacgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtacactgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaag 4359  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  4360 aggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccaaaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtg 4459  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatg 342  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  4460 gtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggtgatg 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 195038 - 195184
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  |||    
T  195038 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 195137  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  195138 gagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 653
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17425
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 17425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 471 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24264
Alignment:
Q  471 agaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 570  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| | || | |||| ||  || |||| |     
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  571 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    | ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctct 24264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Original strand, 16986 - 17148
Alignment:
Q  214 ctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggaca 313  Q
    ||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || |||| | ||| ||||| ||| |||||||  |||| || ||    
T  16986 ctgctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcactgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtca 17085  T
Q  314 caccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatat 376  Q
    |||  ||| ||| ||||||| ||||||| | || ||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  17086 cacattagctgactgcaagcatggtgatatcgtgtgtttcaactgcaaagaagagggtcatat 17148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 511
Target Start/End: Original strand, 512 - 1020
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  |||| | |||||||| | ||||    
T  512 aagatagctattgggtatcagcagattagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagtttattacaagataatga 611  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    || || | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  |||  |||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||| || ||    
T  612 gttagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctattgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagag 711  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggt 302  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |   || || ||||  || |||||||||||||||    
T  712 gagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtttggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggt 811  T
Q  303 cagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaaga 402  Q
    || || |||||||   ||| ||| || |||||||| ||  |||| || |||||||| || | |||||| |||||  ||||  ||||  |  | || ||||    
T  812 caaaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtcatattagttcgcagtgtcctgaaccgaaga 911  T
Q  403 aggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactccttt 502  Q
    ||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  912 aggttagaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 1011  T
Q  503 aattgctat 511  Q
    |||||||||    
T  1012 aattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 33079 - 33337
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33079 tcaaaagagctattgggtatcaaaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgat 33178  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||     
T  33179 gagtgagcgaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaag 33278  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagag 259  Q
    |||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33279 aggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 33337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 450 - 646
Target Start/End: Original strand, 11 - 207
Alignment:
Q  450 actaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctatta 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||     
T  11 actaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttg 110  T
Q  550 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  111 attgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 445
Target Start/End: Original strand, 70 - 435
Alignment:
Q  80 taaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || || | ||  |||||||||||||| |||||||||||     
T  70 taaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtaaaatgctcctgctgacaagggtaagcagaggtta 169  T
Q  180 aatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatg 279  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||| || |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |  ||||    
T  170 aatgatgagaggaggcccaagagcagagaggctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatg 269  T
Q  280 agaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccg 379  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| || || || |||||  |    
T  270 agaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattag 369  T
Q  380 ttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 445  Q
    |||  | || || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  370 ttcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 341 - 587
Target Start/End: Original strand, 19016 - 19262
Alignment:
Q  341 tgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggt 440  Q
    |||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  19016 tgttatatgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggt 19115  T
Q  441 acgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttca 540  Q
    ||||| |  |||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19116 acgcaaaccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttca 19215  T
Q  541 ttgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 587  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19216 ttgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 5609 - 5875
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5609 tcaagagggctattggttatcagaaaataataaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgat 5708  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || || || ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||     
T  5709 gagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccaag 5808  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5809 aggagagatgctcctactgatattgtttattacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 461 - 646
Target Start/End: Original strand, 1 - 186
Alignment:
Q  461 ccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttat 560  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  || |||| |||    
T  1 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatat 100  T
Q  561 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  101 aagttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttg 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 249 - 564
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |  || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  249 tcaagagagccattggttatcagaagattaaaaacttctctgatttggtaagcagttgcaggatttatgaggaggacaggaaagctcattacaaggtgat 348  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||| | || ||||||||||||||||| |||||| | || || || ||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||     
T  349 gagtaaacgtagaggtaagggacagcacagtcgtccgaagccgtatagtgctccttctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagagaaggcccaag 448  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   |  |||||||| || |||||||||||||    
T  449 aggagagatgctcctatagatattgtttgtttcaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtagtgtttgtgatacagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 548  T
Q  301 gtcagaaaggacacac 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  549 gtcagaaaggacacac 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 453 - 646
Target Start/End: Original strand, 20687 - 20880
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |    
T  20687 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 20786  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20787 gtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 20880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 12121 - 12500
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||||||    
T  12121 tcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgat 12220  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||| | || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  12221 gagtgatcgtagaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaag 12320  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||    |    |||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || ||||| |||||||    
T  12321 aggagagatgagggtaagtaga--gattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtg 12418  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttc 382  Q
     |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||    
T  12419 ctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttc 12500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 20301 - 20680
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||||||    
T  20301 tcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgat 20400  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||| | || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  20401 gagtgatcgtagaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaag 20500  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    ||||||||||    |    |||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||| || ||||| |||||||    
T  20501 aggagagatgagggtaagtaga--gattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtg 20598  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttc 382  Q
     |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||    
T  20599 ctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttc 20680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 453 - 646
Target Start/End: Original strand, 12507 - 12700
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |    
T  12507 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 12606  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||| ||||| |||| | | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12607 gtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttg 12700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2426 - 2195
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || | | | |||| ||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||||    
T  2426 aagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttagtaagtcgttgcaagatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatga 2327  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||    
T  2326 gtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctactgacaaaggaaagcaaaggttgaatgatgagaggaggcggaatag 2227  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttaca 234  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2226 gagagatgctcctgctgagatagtttgttaca 2195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 116221 - 115955
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  116221 tcaagagggctattggttatcagaaaataagaaatttctctgatttggtaagcagctgtaggatctgtgaagaagatttgaaagctcattacaaggtgat 116122  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || || ||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||     
T  116121 gagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagactgaatgatgagaggaggcctaag 116022  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||| |||||| || |||| || ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  116021 aggagggatgctcctactgatattgtttgtttcatgtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 115955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 481 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110562
Alignment:
Q  481 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  581 tgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 110562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 17234 - 16761
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||||| |  || || || |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  17234 tcaagagggctattggctatcaatagataaggaatttttctgaattggtaagcagatgtagaatatatgaagagaataccaaagctcattacaaggtgat 17135  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || || ||||  ||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||| ||     
T  17134 gagtgagcgcaaaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaagggtaagcagaaactgaatgatgagaggaggcctaag 17035  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |      |||||||| || ||||| |||||||    
T  17034 aggagagatgctcctactgagattatttgtttcaagtgtggagagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtg 16935  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaa 400  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || || || |||||  ||||  |||| || ||| | ||    
T  16934 gtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagactaa 16835  T
Q  401 gaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagag 474  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||| | ||| |||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||    
T  16834 gaaggttaggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtatgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1277
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  1013 aagagagctattgggtatcagcagatcagattcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttacgaagaagacaccaaagctcattacaagataatga 1112  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaatag 202  Q
    ||||| | || || ||||||||| ||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||| ||    
T  1113 gtgagaggaggggaaagggacagaagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagag 1212  T
Q  203 gagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1213 gagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 652
Target Start/End: Original strand, 4247 - 4447
Alignment:
Q  452 taatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaa 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |     
T  4247 taatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 4346  T
Q  552 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttga 651  Q
    ||||| |||||||||||| || || | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4347 tgtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttga 4446  T
Q  652 g 652  Q
    |    
T  4447 g 4447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 621 - 775
Alignment:
Q  54 agctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtcc 153  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  |    
T  621 agctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcac-ataaggtgatgagtgagtgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtacagtgctc 719  T
Q  154 ctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagat 209  Q
    |||||||||| || ||  ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  720 ctgctgacaaaggtaaatagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagagat 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 414 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11776
Alignment:
Q  414 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 513  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12012 ggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 11913  T
Q  514 tagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactac 613  Q
    ||||   | ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  |||  || | |||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  11912 tagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 11815  T
Q  614 agctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  11814 agctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgag 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12209 - 12162
Alignment:
Q  217 ctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12209 ctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatg 12162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 23630 - 23966
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||| ||| | ||    
T  23630 tcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaaactcattataagattat 23729  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||| | |||||||||||     
T  23730 gagtgagaggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaag 23829  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  23830 aggagagatgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtg 23929  T
Q  301 gtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtgg 337  Q
    ||||||| || ||||   ||| ||| |||||||||||    
T  23930 gtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtgg 23966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3462 - 3215
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  3462 tcaagagggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtacctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattataaggtgat 3363  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  3362 gagtgagcgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaag 3263  T
Q  201 aggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaa 248  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||    
T  3262 aggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggggagaaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 313
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || |||||| ||||||||||   |||| || ||||||| |||||    
T  432 tgcaggatctatgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtctccctaagccttacagtgcccctg 333  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagagg 176  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  332 ctgataagggaaaacagagg 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 307
Target Start/End: Original strand, 961 - 1243
Alignment:
Q  25 agataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggaca 124  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  961 agatcagaattttctctaatttggtgagtcgctgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgaagagtgagcgaagaggtaagggaca 1060  T
Q  125 gcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatc 224  Q
     |||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||||| | || ||  | |||||||||||||||     
T  1061 tcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagaagggtgcttctgctgagata 1160  T
Q  225 gtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaa 307  Q
    || || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  1161 gtatgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgtaccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaa 1243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 503 - 652
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49235
Alignment:
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 49235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 414 - 646
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4241
Alignment:
Q  414 ggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 513  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  4012 ggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctatta 4108  T
Q  514 tagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactac 613  Q
    | || ||| ||||||| | || |||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  4109 ttgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactcc 4208  T
Q  614 agctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4209 agctaagggttcagtaactacttatcttgtttg 4241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Original strand, 3751 - 3863
Alignment:
Q  153 cctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcc 252  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  3751 cctgctgacaaggggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgtttctgttgagattgtttgctacaagtgtggcgagaggggcc 3850  T
Q  253 acaagagtaatgt 265  Q
    |||||||||||||    
T  3851 acaagagtaatgt 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| || | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Original strand, 7710 - 7752
Alignment:
Q  225 gtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7710 gtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 7752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 503 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21797
Alignment:
Q  503 aattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagtt 602  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  603 gttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgag 652  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgag 21797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 264
Target Start/End: Original strand, 16354 - 16579
Alignment:
Q  39 tctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttcta 138  Q
    ||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||| | |    
T  16354 tctgaattggtgagaagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagagtcgtccaa 16453  T
Q  139 aaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtg 238  Q
    | || || ||||  |||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||||| |  | || |||| || |||||||| | ||||| ||||||||    
T  16454 agccttatagtgctcctgctgataaaggtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaagtg 16553  T
Q  239 tggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16554 tggtgagaagggccacaagagtaatg 16579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 521
Target Start/End: Original strand, 16730 - 16836
Alignment:
Q  415 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |     |||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16730 gtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattat 16829  T
Q  515 agatact 521  Q
     ||||||    
T  16830 tgatact 16836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 640
Target Start/End: Original strand, 21485 - 21531
Alignment:
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21485 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 5629 - 5046
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaa-ccatacagtgtccct 155  Q
    ||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| | |  |||| | | ||||| |||||| ||||| || |||||||| | |    
T  5629 tgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaagggtaggagtcagcaaagtcgt-ctaaagccttacagtgttctt 5531  T
Q  156 gctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccaca 255  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| |  | || |||| || |||||||| | ||||| |||   ||||| | |||||||||||    
T  5530 gctgataagggtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactgctgaggttgtttgctacccttgtggtgtgaaaggccaca 5431  T
Q  256 agagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataa 355  Q
    ||||||||| || |||   ||||| |||  | || ||| | |||||| ||||||| || ||  |    || || |||| || |||||| || ||||  ||    
T  5430 agagtaatgcttgtactggggatgtgaaacagtgtttccgttgtggtaagaaagggcatactattacagaatgtaagcatgatgatgtggtgtgtttcaa 5331  T
Q  356 ctgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaat 455  Q
     ||||| ||||| || |||||  ||||  ||||||   |||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||    
T  5330 atgcaatgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaat 5231  T
Q  456 gaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtg 555  Q
     |||||||  | || |||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||| | || | ||||    
T  5230 aaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtg 5131  T
Q  556 cttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| |||||||||| | ||| | |   ||||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5130 cttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 5046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 416 - 643
Target Start/End: Original strand, 55592 - 55819
Alignment:
Q  416 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 515  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |   || ||||| ||  | |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  55592 tgggagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattatt 55691  T
Q  516 gatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacag 615  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  55692 gatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 55791  T
Q  616 ctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  55792 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 453 - 643
Target Start/End: Original strand, 23457 - 23647
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||| || |      
T  23457 aatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgata 23556  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||| |||||||||| | | | | ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23557 gtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgt 23647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 640
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9697
Alignment:
Q  492 agtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 591  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  592 gagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 23005 - 23100
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaagg 96  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  | |  || ||||| ||||||| ||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23005 tcaagagggccattgggtatcaaaagatccgtaacttttctgagttggtgagtagctgcaaaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 23100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 487 - 643
Target Start/End: Original strand, 2456 - 2612
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||  | ||||||||  |||||||||| | ||| | ||||||||    
T  2456 ttaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatat 2555  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2556 gaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4389
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgt 4389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 574 - 653
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3529
Alignment:
Q  574 ttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3450 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 487 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 8521 - 8355
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||    
T  8521 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatat 8422  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  8421 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgaga 8355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 7414 - 6828
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||| | ||||| |||||  | || || |||||||  ||||    
T  7414 tgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctg 7315  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||| |  | || ||||||| ||| |||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||    
T  7314 ctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataa 7215  T
Q  257 gagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataac 356  Q
    |||||||| || | | | ||| | |||  | |||||  | |||||| ||||||| || || || | ||| || |||| || ||||||||| ||||  ||     
T  7214 gagtaatgcttgtcctagggacgtgaaacagtgctttcgttgtggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaagcatgatgatgttgtgtgtttcaat 7115  T
Q  357 tgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatg 456  Q
    ||||| || || || |||||  ||||  | || |   |||| |||||||     ||   ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||     ||||    
T  7114 tgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagacagagaatg 7015  T
Q  457 aggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgc 556  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||  | | || |||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||    
T  7014 aggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgc 6915  T
Q  557 ttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || |||||||||| | | | | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6914 ttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 14544 - 13958
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||| | ||||| |||||  | || || |||||||  ||||    
T  14544 tgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctg 14445  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| ||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||| |  | || ||||||| ||| |||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||    
T  14444 ctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataa 14345  T
Q  257 gagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataac 356  Q
    |||||||| || | | | ||| | |||  | |||||  | |||||| ||||||| || || || | ||| || |||| || ||||||||| ||||  ||     
T  14344 gagtaatgcttgtcctagggacgtgaaacagtgctttcgttgtggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaagcatgatgatgttgtgtgtttcaat 14245  T
Q  357 tgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatg 456  Q
    ||||| || || || |||||  ||||  | || |   |||| |||||||     ||   ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||     ||||    
T  14244 tgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagacagagaatg 14145  T
Q  457 aggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgc 556  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||  | | || |||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||    
T  14144 aggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgc 14045  T
Q  557 ttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || |||||||||| | | | | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14044 ttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 416 - 643
Target Start/End: Original strand, 14388 - 14615
Alignment:
Q  416 tgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 515  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||  | ||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||     
T  14388 tgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttatt 14487  T
Q  516 gatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacag 615  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  14488 gatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 14587  T
Q  616 ctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14588 ctaagggttcggtgactacttctcttgt 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Original strand, 14028 - 14140
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |||||| | || || |||||||  ||||    
T  14028 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 14127  T
Q  157 ctgacaagggaaa 169  Q
     ||| ||||||||    
T  14128 atgataagggaaa 14140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 13653 - 13828
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13653 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgg 13752  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13753 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgt 13828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 36889 - 36443
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcaga 306  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||| | ||| ||||| ||| |||||||  |||    
T  36889 gatgctcctgcggagatcgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaaga 36790  T
Q  307 aaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatccgttcttagtgcacacagccaaagaaggt 406  Q
    | || || ||  ||| ||||||||||||| ||||| |||| || | ||| ||||| |||||||| |||||  ||||| | ||||  |||   |||| ||     
T  36789 agggtcatacgttagctgattgcaagcgtagtgatattgtgtgctttaattgcaaggaagagggtcatattggttctcaatgcaagcagtttaagagggc 36690  T
Q  407 tagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgactt-atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaat 505  Q
        ||   ||| | ||| ||||| ||| ||||||| ||||     |||||||| | |||| |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |    
T  36689 gccgactactggtagagtttttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatc-acttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagt 36591  T
Q  506 tgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgtt 605  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||||| || |||||     
T  36590 tgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtc 36491  T
Q  606 gaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  36490 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 36443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 453 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 2144 - 1946
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| || || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |  | | |    
T  2144 aatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgatt 2045  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttga 651  Q
    |||||  |||||||||| |  || | ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  2044 gtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttga 1946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2544 - 2335
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtc 152  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||||    || |||||||| |||| || |||||||      
T  2544 tagctgcaggatttatgaggaagagaccaaagctcattataagatcatgaatgagcggaggggtaagaactagtagagtcgtcctaagccttacagtgct 2445  T
Q  153 cctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggcc 252  Q
    || ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | || ||||    ||||||||||  |||||| |   ||||| |||||||| |    
T  2444 ccggctgataagggtaagcagagggtgaatgatgagaggagacccaagaagaaagatatacctgctgagattctttgtttcctatgtggagagaaaggtc 2345  T
Q  253 acaagagtaa 262  Q
    ||||||||||    
T  2344 acaagagtaa 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 489 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14039
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 588  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  589 aaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Original strand, 11084 - 11229
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  11084 cctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 11183  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11184 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 11229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 426 - 638
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15323
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  626 agtgactacttct 638  Q
     ||||||||||||    
T  15311 ggtgactacttct 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 550 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 26160 - 26064
Alignment:
Q  550 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 646  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26160 aatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttg 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17833
Alignment:
Q  471 agaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 570  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  571 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |   | | ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111256
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgt 111256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18397 - 18179
Alignment:
Q  46 tggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccata 145  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||| |||| | | |||||| || ||| | |||||| | || || ||    
T  18397 tggtgagtagttgcagaatttatgaagaagataccaaagctcattacaaggctgtgaatgagaggaaaggtaaaggtcagaaaagtcgtccaaagcctta 18298  T
Q  146 cagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgag 245  Q
    || ||  |||||||| ||||| ||||| ||  | |||||| |||||||||| |  | || ||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  18297 caatgctcctgctgataagggtaagcaaagagttaatgatgagaggaggccaagaaagaaagatgctactgctgagattgtttgctacacttgtggtgag 18198  T
Q  246 aaaggccacaagagtaatg 264  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18197 aaaggccataagagtaatg 18179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 643
Target Start/End: Original strand, 216201 - 216769
Alignment:
Q  75 gatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcaga 174  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |||||| | || || |||||||  |||||||| ||||| ||||| |    
T  216201 gatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaa 216300  T
Q  175 ggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaa 274  Q
    | ||||||||| | |||||||| |  | || ||||| |  ||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| || | | |     
T  216301 gattgaatgataaaaggaggcctagaaagaaagatgatgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctag 216400  T
Q  275 ggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccat 374  Q
    ||||| |||    || ||  | |||||| |||| || || || ||   ||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||    
T  216401 ggatgtgaaacggtgttttcgttgtggtaagaaggggcatacgcttactgaatgtaagcatgatgatgttgtgtgttttaactgcaatgaagaaggtcat 216500  T
Q  375 atccgttcttagtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagag 474  Q
    ||  | ||  | ||||   |||| |||||||     ||   ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     |||||||| | | | |||||||    
T  216501 attgggtcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagag 216600  T
Q  475 gtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagt 574  Q
    |||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| | ||| |||  ||||| ||| | |     
T  216601 gtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgc 216700  T
Q  575 tgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | | ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  216701 tatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 216769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1944
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || |   | | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| ||| |  ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | ||| | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17834 - 17687
Alignment:
Q  3 aagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||    
T  17834 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatga 17735  T
Q  103 gtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtg 150  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  17734 gtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtg 17687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8178
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1493 - 1364
Alignment:
Q  385 agtgcacacagccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgttt 484  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||  | ||||| || || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1493 agtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggtattcgctttgactggtacacagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgttt 1394  T
Q  485 ctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1393 cttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13761 - 13934
Alignment:
Q  1 tcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgat 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||| |||| ||| | |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||    
T  13761 tcaagagagctattagatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattaaaagataat 13860  T
Q  101 gagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcaga 174  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  13861 gagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaga 13934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 453 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 15555 - 15377
Alignment:
Q  453 aatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaat 552  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||||||| | |    
T  15555 aatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgatt 15456  T
Q  553 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||| |||||||            ||  ||||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15455 gtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 15377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 26535 - 26310
Alignment:
Q  415 gtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 514  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||     |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  26535 gtgggagagtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattat 26436  T
Q  515 agatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactaca 614  Q
     |||| | ||||||| || | ||| |||| | || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  26435 tgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactcca 26336  T
Q  615 gctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26335 gctaagggttcggtgactacttctct 26310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37166
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||||| |||    
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26806 - 26686
Alignment:
Q  144 tacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcg 243  Q
    |||||||  |||||||  ||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||| |  | || |||| || |||||||| | ||||| || |  ||||| |    
T  26806 tacagtgctcctgctggtaagggtaagcaaagagtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactgctgaggttgtttgctatacttgtggtg 26707  T
Q  244 agaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26706 agaaaggccacaagagtaatg 26686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 552 - 727
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 487 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 942
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| || | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttct 638  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 57788 - 57963
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| | ||||||| |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 57963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Original strand, 57383 - 57584
Alignment:
Q  63 atatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgaca 162  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| | ||| || || ||||| |||||| | || || |||||||  |||||||| |    
T  57383 atatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgata 57482  T
Q  163 agggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaa 262  Q
    |||| ||||| ||  |||||||| |||||||||| |  | || ||||||| ||| |||||| ||||  || |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  57483 agggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttactatacttgtggcgagaaaggccataagagtaa 57582  T
Q  263 tg 264  Q
    ||    
T  57583 tg 57584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 498 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 15011 - 14873
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  15011 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 14912  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactactt 636  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14911 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 653
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29287
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 29287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 376
Target Start/End: Original strand, 28862 - 29010
Alignment:
Q  228 tgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttatacaaaggatgagaataaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgatt 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| |  || ||||| ||| |||||||  |||| || |||||  ||| ||| |    
T  28862 tgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctaaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgaat 28961  T
Q  328 gcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatat 376  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||  |||||||| | |||||| |||||    
T  28962 gcaagcatggtgatattgcgtgtttcaactgcaaagtagagggtcatat 29010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22358 - 22205
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22358 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 22259  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22258 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7347 - 7194
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  7347 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 7248  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7247 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 9047 - 8905
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |   ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  9047 cctttagttgctattattgatactggtgctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 8951  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8950 tggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgt 8905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 426 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 3723 - 3524
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   || ||||| ||  | |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||    
T  3723 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtg 3624  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3623 ctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 494 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 1
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | | ||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttc 637  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8088
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||||  |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    || | | | | ||| |||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 550 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 1259 - 1185
Alignment:
Q  550 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggtt 624  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1259 aatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 1270
Alignment:
Q  169 agcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || || || || |||| | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1368 agcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt 1270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8116 - 7908
Alignment:
Q  39 tctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttcta 138  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || ||||| || ||||  || |||||||| ||||| | ||||||||| ||    ||||| |||||  ||||| | |    
T  8116 tctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtccga 8017  T
Q  139 aaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtg 238  Q
    | || |||||||  |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| || || || || |||| | || ||||||| ||||||||||||||    
T  8016 agccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtg 7917  T
Q  239 tggcgagaa 247  Q
    ||| |||||    
T  7916 tggtgagaa 7908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 18822 - 18608
Alignment:
Q  426 tttgcattgactggtacgcagagtactaatgaggaccgacttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtg 525  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   || ||||| ||  | |||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  18822 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtg 18723  T
Q  526 ctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttc 625  Q
    |||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18722 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18623  T
Q  626 agtgactacttctct 640  Q
     ||||||||||||||    
T  18622 ggtgactacttctct 18608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 490 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4538
Alignment:
Q  490 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 589  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||| |||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  590 aggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
     ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25061
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  |||||  ||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgt 25061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 8)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 31994 - 31841
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | | ||||||    
T  31994 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatat 31895  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  31894 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 31841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 37460 - 37307
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | | ||||||    
T  37460 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatat 37361  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  37360 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 54737 - 54592
Alignment:
Q  498 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 597  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| |  |  | ||| ||||||| |||||||    
T  54737 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaa 54638  T
Q  598 tagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54637 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 54592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 653
Target Start/End: Original strand, 10523 - 10597
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  10523 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaga 10597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 13178 - 13239
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13178 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 9979 - 10212
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgag-cgcagaggtaagggacagcagagtc 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||| |  | | ||||  | |||   ||||| ||||||||||    
T  9979 ttttcgctgatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagattgttaatgagaagtaga-ccaagggtcagcagagtc 10077  T
Q  133 gttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgtta 232  Q
    |  ||||||| || |||| || |||||| ||||| ||||||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| || || |||||||     
T  10078 gccctaaaccttatagtgcccttgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgttt 10177  T
Q  233 caagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10178 caactatggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 10212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 12634 - 12867
Alignment:
Q  34 ttttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgag-cgcagaggtaagggacagcagagtc 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||| |  | | ||||  | |||   ||||| ||||||||||    
T  12634 ttttcgctgatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagattgttaatgagaagtaga-ccaagggtcagcagagtc 12732  T
Q  133 gttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgtta 232  Q
    |  ||||||| || |||| || |||||| ||||| ||||||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| || || |||||||     
T  12733 gccctaaaccttatagtgcccttgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgttt 12832  T
Q  233 caagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12833 caactatggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 12867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32270 - 32213
Alignment:
Q  207 gatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    |||||| |||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32270 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatg 32213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 750 - 850
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  750 gccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtgagc 849  T
Q  109 g 109  Q
    |    
T  850 g 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 468 - 640
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10504
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || ||  | | |||| |||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26049 - 25949
Alignment:
Q  9 gccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26049 gccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtgagc 25950  T
Q  109 g 109  Q
    |    
T  25949 g 25949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25896 - 25808
Alignment:
Q  174 aggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaa 262  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| |||  |||  || ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25896 aggttgaatgacgagaggatgcccaagagggaagagactcctgttgaaatagtttgttacaaatgtggtgagaaaggtcacaagagtaa 25808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 487 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17892
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||   | | |||| || |   ||| || | | | | ||||||||    
T  18048 ttaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 17949  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17948 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 11580 - 11424
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||   | | |||| || |   ||| || | | | | ||||||||    
T  11580 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 11481  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11480 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 11424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 55115 - 55068
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  55115 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 55068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53682
Alignment:
Q  606 gaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 53682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5556 - 5329
Alignment:
Q  40 ctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| |||||||||||  ||||    
T  5556 ctgatttggtgaatagctgcagaatctatgatgaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaa 5457  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
     || || |||| || |||||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  5456 gccttatagtgcccttgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgt 5357  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5356 ggcgagaagggccataagagtaatgttt 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 640
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35061
Alignment:
Q  494 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 593  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||| ||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  594 gaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctct 35061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10479 - 10326
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  10479 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10380  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10379 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 21715 - 21566
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | |||||| |    
T  21715 ttaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgattt 21616  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactactt 636  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21615 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 37139 - 36990
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | |||||| |    
T  37139 ttaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgattt 37040  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactactt 636  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37039 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3382
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  3535 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 3436  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3435 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 3382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17118
Alignment:
Q  468 atcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 567  Q
    |||||||||| |||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  568 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17718 - 17491
Alignment:
Q  40 ctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || |||||||||| |||  ||| |||||| |    |||||| |||||||||||  ||||    
T  17718 ctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacacggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaa 17619  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
     || || |||| ||||||||| ||||| || || ||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| ||||| || |||| ||| |||    
T  17618 gccctatagtgcccctgctgataagggcaaacatagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgt 17519  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  17518 ggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 17491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3859
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||||| |||| |    
T  3977 gatttggttaatagctgcaggacctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagc 3878  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  3877 cgtacagtgcccccgctga 3859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 104335 - 104182
Alignment:
Q  490 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 589  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||   ||| | ||  |||||||    
T  104335 atagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaa 104236  T
Q  590 aggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
     ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  104235 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 104767 - 104561
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||  ||||||||||| |  ||| |||||| | ||  || || |||||||||||| | || || || ||||  ||||    
T  104767 tgcaggatttatgaggaggatactaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctg 104668  T
Q  157 ctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaa 256  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||| |||| |  | || ||||||| ||| |||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  104667 ctgataagggaaaacagagaatgattgatgagaggcggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 104568  T
Q  257 gagtaat 263  Q
    |||||||    
T  104567 gagtaat 104561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 267
Target Start/End: Original strand, 139347 - 139583
Alignment:
Q  31 gaattttctctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagag 130  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||||||||||||  ||| |||||| |     ||||| ||||||||    
T  139347 gaattttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatacaaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagag 139446  T
Q  131 tcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgt 230  Q
    |||  |||| || || |||| ||||||||| ||||| || |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||| ||| || | ||||||||   |||     
T  139447 tcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatactccagctgagattacttgc 139546  T
Q  231 tacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  139547 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 139583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 538
Target Start/End: Original strand, 131684 - 131733
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattattt 538  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  131684 aatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcattattt 131733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 210
Alignment:
Q  41 tgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgag-cgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||  | |||   ||| | |||||||||||  ||||    
T  436 tgatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggatatcaaagctcattacaagattgttaatgagaagaaga-ccaagagccagcagagtcgccctaa 338  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
    ||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||  ||   ||| | |||| ||| || | ||  |||||| |||| || || ||||||| ||| |||    
T  337 accttatagtgcccctgcagataagggcaagcagagaatggtcgatgataggaagccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgt 238  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  237 ggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 264
Target Start/End: Original strand, 30896 - 30983
Alignment:
Q  177 ttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatg 264  Q
    ||||||||| |||||||  | || || ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30896 ttgaatgatgagaggagaactaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatg 30983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 12871 - 13097
Alignment:
Q  41 tgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgag-cgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||  | |||   ||| | |||||||||||  ||||    
T  12871 tgatttagtgaatagctgcaggatctatgaagaggatatcaaagctcattacaagattgttaatgagaagaaga-ccaagagccagcagagtcgccctaa 12969  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgt 239  Q
    ||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||  ||   ||| | |||| ||| || | ||  |||||| |||| || || ||||||| ||| |||    
T  12970 accttatagtgcccctgcagataagggcaagcagagaatggtcgatgataggaagccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgt 13069  T
Q  240 ggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13070 ggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 13097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 13317 - 13470
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  13317 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatat 13416  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| | ||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13417 gaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 41174 - 41113
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41174 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 1317 - 1378
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1317 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 8277 - 8216
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8277 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8369 - 8322
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8369 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 8322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 8811 - 8765
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctca 88  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  8811 gatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaagatactaaggctca 8765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 86
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||  ||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  252 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 153  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||| ||||| || || || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||    
T  152 gaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaga 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49218 - 49100
Alignment:
Q  42 gatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaac 141  Q
    |||||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||   |  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  49218 gatttggttaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctcattacaagatggtgaatgagaagaagggcaagggacagcagagtcgtcctaaac 49119  T
Q  142 catacagtgtccctgctga 160  Q
    | |||| || |||| ||||    
T  49118 cgtacaatgcccctactga 49100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 48776 - 48729
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  48776 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 48729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Original strand, 962 - 1115
Alignment:
Q  487 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||| ||    
T  962 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacat 1061  T
Q  587 gaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1062 gaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12621
Alignment:
Q  583 atatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  465 cttatcagaggtaattgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 267
Target Start/End: Original strand, 405 - 453
Alignment:
Q  219 gagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  405 gagattgtttgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgttt 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 765 - 826
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctct 640  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  765 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 119
Alignment:
Q  43 atttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaacc 142  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| | |||||||||  |||| ||    
T  343 atttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccggcagagtcgccctaagcc 244  T
Q  143 atacagtgtccctgctgacaagggaaagcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggc 242  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||  ||   ||| | ||| |||| || | ||  |||||| |||| ||||| || |||| ||| |||||     
T  243 ctatagtgcccctgctgataagggaaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaattgtggt 144  T
Q  243 gagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  143 gagaaaggccacaagagcaatgttt 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36245 - 36161
Alignment:
Q  181 atgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgt 265  Q
    ||||| ||||||| || || || ||||||||  || || |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36245 atgatgagaggagacctaagagaagagatgcccctactaagattgtttgctacaggtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 36161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 171489 - 171449
Alignment:
Q  227 ttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt 267  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  171489 ttgttacaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgttt 171449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 20
Alignment:
Q  66 tatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctgctgacaagg 165  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| | | ||| || || ||||| |||||| | || || |||||||  |||||||| ||||    
T  149 tatgaggaagataccaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaa-ggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagg 51  T
Q  166 gaaagcagaggttgaatgattagaggaggcc 196  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  50 gtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcc 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 294 - 168
Alignment:
Q  40 ctgatttggtgaatagctgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||  ||| |||||| |    |||||| |||||||||||  ||||    
T  294 ctgatttggtgaacagctgtaggatttatgaggaagacaccaaagctcatcacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaa 195  T
Q  140 accatacagtgtccctgctgacaaggg 166  Q
     || || |||| ||||||||| |||||    
T  194 gccctatagtgcccctgctgataaggg 168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 579 - 653
Target Start/End: Original strand, 11641 - 11715
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaga 653  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||    
T  11641 tctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgaga 11715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 262
Target Start/End: Original strand, 4874 - 4967
Alignment:
Q  169 agcagaggttgaatgattagaggaggcccaataggagagatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaa 262  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| | |  |||  || ||||||| || |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  4874 agcataggttgaatgacgagaggaggcccaagaaggaagagactcctgctgaaatagtttgttacaggtgtggtgagaagggtcacaagagtaa 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11569 - 11460
Alignment:
Q  57 tgcaggatatatgaagaagatattaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgttctaaaccatacagtgtccctg 156  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||| |||||    
T  11569 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtcccaagccttatagtgcccctg 11470  T
Q  157 ctgacaaggg 166  Q
    |||| |||||    
T  11469 ctgataaggg 11460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 579 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3556
Alignment:
Q  579 tctgatatgaaaggagaaatagttgttgaaactacagctaagggttcagtgactacttctcttgt 643  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgt 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  489 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattatttcat 541  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University