View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_446 (Length: 238)

Name: NF11737A_low_446
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_446
NF11737A_low_446
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (13-220)||(123369-123584)
scaffold0029 (177-219)||(77391-77433)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (13-220)||(9582893-9583108)
chr7 (13-220)||(16119849-16120064)
chr7 (13-220)||(14551098-14551314)
chr7 (13-216)||(23515067-23515278)
chr7 (13-220)||(8717865-8718080)
chr7 (13-220)||(13673856-13674071)
chr7 (13-220)||(18593352-18593567)
chr7 (13-220)||(18618117-18618332)
chr7 (20-220)||(538755-538964)
chr7 (20-220)||(4312564-4312772)
chr7 (20-220)||(12567020-12567229)
chr7 (21-220)||(12548805-12549012)
chr7 (20-220)||(8780936-8781146)
chr7 (20-218)||(9003958-9004165)
chr7 (20-220)||(20108375-20108584)
chr7 (61-219)||(48801777-48801935)
chr7 (65-220)||(13657926-13658081)
chr7 (61-220)||(11921307-11921463)
chr7 (23-220)||(9264939-9265145)
chr7 (157-220)||(16465616-16465679)
chr7 (61-220)||(16532150-16532311)
chr7 (61-220)||(16633351-16633512)
chr7 (164-220)||(825783-825839)
chr7 (164-220)||(4461242-4461298)
chr7 (164-220)||(14221718-14221774)
chr7 (164-220)||(15916776-15916832)
chr7 (164-220)||(18287761-18287817)
chr7 (164-220)||(27291496-27291552)
chr7 (157-220)||(15206584-15206647)
chr7 (162-220)||(5397273-5397331)
chr7 (171-220)||(15065935-15065984)
chr7 (167-220)||(9194544-9194597)
chr7 (164-216)||(6713072-6713124)
chr7 (164-219)||(4791383-4791438)
chr7 (164-219)||(15348532-15348587)
chr7 (164-204)||(15522517-15522557)
chr7 (177-219)||(15940731-15940773)
chr7 (61-90)||(16465743-16465772)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (13-220)||(15699555-15699770)
chr6 (13-220)||(22165549-22165764)
chr6 (13-220)||(22243812-22244027)
chr6 (13-220)||(22061503-22061718)
chr6 (20-220)||(24855245-24855453)
chr6 (13-220)||(22767116-22767331)
chr6 (13-220)||(20170242-20170458)
chr6 (20-220)||(18448140-18448349)
chr6 (20-220)||(23023093-23023302)
chr6 (20-220)||(25625691-25625899)
chr6 (23-220)||(2181063-2181269)
chr6 (28-220)||(18854026-18854226)
chr6 (20-216)||(20107784-20107989)
chr6 (20-220)||(21560554-21560762)
chr6 (20-220)||(25631269-25631477)
chr6 (20-220)||(25963248-25963457)
chr6 (20-220)||(25967895-25968104)
chr6 (61-220)||(29595745-29595904)
chr6 (61-220)||(30671807-30671967)
chr6 (157-220)||(18184874-18184937)
chr6 (163-220)||(35270971-35271028)
chr6 (157-220)||(18731868-18731931)
chr6 (157-220)||(20218981-20219044)
chr6 (157-220)||(22113006-22113069)
chr6 (164-220)||(11204004-11204060)
chr6 (20-140)||(19585622-19585750)
chr6 (14-109)||(20016339-20016443)
chr6 (164-216)||(23517835-23517887)
chr6 (164-220)||(29686601-29686657)
chr6 (20-60)||(29686449-29686489)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (13-220)||(11496614-11496829)
chr4 (13-220)||(13822913-13823128)
chr4 (19-220)||(42709731-42709940)
chr4 (14-220)||(15254349-15254563)
chr4 (21-220)||(10630758-10630965)
chr4 (20-220)||(3354646-3354855)
chr4 (21-220)||(18291945-18292153)
chr4 (21-220)||(17484910-17485118)
chr4 (20-220)||(18081459-18081669)
chr4 (21-220)||(38426745-38426938)
chr4 (61-220)||(56580539-56580700)
chr4 (20-220)||(45234232-45234441)
chr4 (157-220)||(14653998-14654061)
chr4 (164-218)||(15865647-15865701)
chr4 (164-220)||(10650547-10650603)
chr4 (164-220)||(15260109-15260165)
chr4 (164-220)||(16682913-16682969)
chr4 (169-220)||(15409534-15409585)
chr4 (164-220)||(9488878-9488934)
chr4 (160-220)||(8092427-8092487)
chr4 (171-219)||(17296250-17296298)
chr4 (23-90)||(8092559-8092634)
chr4 (20-60)||(12515042-12515081)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (13-220)||(10602472-10602687)
chr3 (13-220)||(13504881-13505096)
chr3 (13-220)||(11947407-11947622)
chr3 (13-220)||(7600355-7600570)
chr3 (13-220)||(15556942-15557157)
chr3 (13-220)||(16448760-16448975)
chr3 (13-220)||(16373565-16373780)
chr3 (13-220)||(12187076-12187291)
chr3 (13-220)||(37942378-37942593)
chr3 (13-220)||(9360971-9361186)
chr3 (21-219)||(12193491-12193697)
chr3 (13-216)||(6814868-6815079)
chr3 (13-220)||(10147011-10147226)
chr3 (13-220)||(15645001-15645216)
chr3 (13-220)||(10160173-10160388)
chr3 (13-219)||(13187418-13187632)
chr3 (21-219)||(3245589-3245795)
chr3 (20-220)||(13097711-13097919)
chr3 (21-220)||(2721305-2721511)
chr3 (20-220)||(4382751-4382961)
chr3 (21-220)||(13001425-13001634)
chr3 (20-220)||(20156515-20156722)
chr3 (20-220)||(13690608-13690816)
chr3 (61-220)||(10546936-10547097)
chr3 (20-220)||(1992803-1993011)
chr3 (20-220)||(11398215-11398424)
chr3 (20-220)||(14348588-14348797)
chr3 (23-220)||(17387839-17388045)
chr3 (23-220)||(22637702-22637908)
chr3 (21-220)||(3279191-3279399)
chr3 (20-220)||(12160207-12160416)
chr3 (13-212)||(17045697-17045902)
chr3 (13-212)||(17047857-17048062)
chr3 (164-220)||(27356728-27356784)
chr3 (163-220)||(13601220-13601277)
chr3 (164-220)||(3339226-3339282)
chr3 (164-220)||(12776534-12776590)
chr3 (164-220)||(13136210-13136266)
chr3 (164-220)||(20584262-20584318)
chr3 (169-220)||(15946773-15946824)
chr3 (162-220)||(14445768-14445826)
chr3 (13-103)||(16655798-16655897)
chr3 (164-220)||(15619283-15619339)
chr3 (164-220)||(13195458-13195514)
chr3 (165-220)||(8686387-8686442)
chr3 (157-220)||(20225754-20225817)
chr3 (169-220)||(13068306-13068357)
chr3 (189-220)||(2005499-2005530)
chr3 (13-60)||(13601062-13601108)
chr3 (164-220)||(16703307-16703363)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (13-220)||(22665062-22665277)
chr2 (13-220)||(22044660-22044875)
chr2 (13-220)||(25357511-25357726)
chr2 (13-220)||(16775651-16775866)
chr2 (13-220)||(117543-117758)
chr2 (13-220)||(17590407-17590622)
chr2 (13-220)||(24795285-24795500)
chr2 (20-220)||(11615-11823)
chr2 (13-220)||(27627580-27627796)
chr2 (20-220)||(25144757-25144966)
chr2 (21-220)||(5500265-5500473)
chr2 (20-220)||(25804267-25804475)
chr2 (21-220)||(23798922-23799129)
chr2 (22-215)||(25370890-25371091)
chr2 (63-220)||(23644001-23644160)
chr2 (66-220)||(24178193-24178348)
chr2 (164-220)||(23159385-23159441)
chr2 (164-220)||(23570642-23570698)
chr2 (164-220)||(27631655-27631711)
chr2 (164-220)||(27768816-27768872)
chr2 (169-220)||(24171510-24171561)
chr2 (20-140)||(24502168-24502297)
chr2 (157-220)||(24506802-24506865)
chr2 (164-220)||(23257570-23257625)
chr2 (164-216)||(24321328-24321380)
chr2 (157-220)||(25337651-25337714)
chr2 (159-201)||(23648123-23648165)
chr2 (174-219)||(29955868-29955913)
chr2 (175-219)||(19805618-19805662)
chr2 (171-219)||(21512567-21512615)
chr2 (164-219)||(24019068-24019123)
chr2 (177-219)||(17334606-17334648)
chr2 (20-60)||(15532753-15532792)
chr2 (20-60)||(24019228-24019267)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (13-220)||(27046874-27047089)
chr1 (13-220)||(17094601-17094816)
chr1 (13-220)||(21798662-21798878)
chr1 (13-220)||(20237456-20237671)
chr1 (20-220)||(52938621-52938830)
chr1 (23-216)||(8653126-8653327)
chr1 (132-220)||(14070632-14070720)
chr1 (20-220)||(3989944-3990154)
chr1 (61-220)||(19364085-19364244)
chr1 (162-216)||(19875648-19875702)
chr1 (157-220)||(21784472-21784535)
chr1 (157-220)||(4027832-4027895)
chr1 (164-217)||(16382578-16382631)
chr1 (157-220)||(8947515-8947578)
chr1 (177-219)||(18478234-18478276)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (13-220)||(20595831-20596046)
chr5 (13-220)||(20602117-20602332)
chr5 (13-220)||(20608408-20608623)
chr5 (13-220)||(15735534-15735749)
chr5 (13-220)||(23748051-23748266)
chr5 (13-195)||(23710701-23710892)
chr5 (20-220)||(24940540-24940749)
chr5 (13-220)||(18072900-18073115)
chr5 (13-220)||(24953174-24953389)
chr5 (21-202)||(20622170-20622359)
chr5 (13-220)||(20790714-20790929)
chr5 (20-220)||(23600636-23600845)
chr5 (20-220)||(24219752-24219961)
chr5 (20-216)||(20444843-20445048)
chr5 (34-220)||(21387410-21387605)
chr5 (164-220)||(22317513-22317569)
chr5 (164-220)||(25006808-25006864)
chr5 (164-220)||(30759655-30759711)
chr5 (157-220)||(18484212-18484275)
chr5 (24-220)||(20916456-20916660)
chr5 (170-220)||(25116171-25116221)
chr5 (164-220)||(26847803-26847859)
chr5 (175-220)||(25175261-25175306)
chr5 (164-216)||(22855723-22855775)
chr5 (21-136)||(20575510-20575633)
chr5 (20-90)||(22948518-22948596)
chr5 (175-219)||(27270563-27270607)
chr5 (171-219)||(17412736-17412784)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (13-220)||(15678-15893)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (13-220)||(21382093-21382309)
chr8 (13-220)||(21098794-21099009)
chr8 (13-220)||(21104115-21104330)
chr8 (13-220)||(23911441-23911655)
chr8 (13-220)||(8314467-8314683)
chr8 (13-220)||(8322846-8323062)
chr8 (20-220)||(21843524-21843733)
chr8 (20-220)||(21939996-21940206)
chr8 (20-220)||(20038981-20039189)
chr8 (21-220)||(17620755-17620961)
chr8 (20-220)||(16418620-16418830)
chr8 (21-220)||(23454945-23455154)
chr8 (61-220)||(24034069-24034230)
chr8 (109-220)||(20712537-20712649)
chr8 (21-209)||(14352181-14352378)
chr8 (164-220)||(11346953-11347009)
chr8 (164-220)||(19767684-19767740)
chr8 (164-220)||(22370102-22370158)
chr8 (169-220)||(20002279-20002330)
chr8 (108-220)||(21538652-21538765)
chr8 (164-220)||(22033555-22033611)
chr8 (164-220)||(22099655-22099711)
chr8 (164-220)||(22102552-22102608)
chr8 (169-220)||(21831181-21831232)
chr8 (169-220)||(22817755-22817806)
chr8 (171-219)||(18572977-18573025)
chr8 (177-219)||(19902174-19902216)
chr8 (20-64)||(20712470-20712514)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (13-220)||(1038-1253)
scaffold0404 (147-220)||(3451-3524)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-220)||(615-831)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (23-220)||(2852-3058)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (20-220)||(220-428)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (20-220)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (61-220)||(11105-11264)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (62-220)||(164403-164562)
scaffold0011 (157-219)||(172254-172316)
scaffold0011 (157-220)||(161995-162058)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (21-220)||(14662-14869)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-220)||(831-1041)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (20-220)||(2287-2496)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-220)||(120954-121162)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (23-220)||(482-687)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (20-220)||(7941-8149)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (102-220)||(10206-10325)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (20-220)||(1108-1318)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (73-220)||(8720-8869)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (20-220)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (61-220)||(97726-97887)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (65-220)||(35104-35251)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (20-220)||(510-718)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (61-218)||(12452-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (61-218)||(232789-232946)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (119-220)||(38508-38610)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (157-220)||(5232-5295)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (157-220)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (157-220)||(50506-50569)
scaffold0035 (177-219)||(88361-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (162-220)||(912-970)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (164-220)||(2762-2818)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (169-220)||(12743-12794)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (157-220)||(13002-13065)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (157-216)||(22159-22218)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (164-220)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (164-220)||(54849-54905)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (22-216)||(37722-37922)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (157-220)||(1839-1902)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (157-220)||(37743-37806)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (164-219)||(1193-1248)
scaffold0094 (20-60)||(1041-1080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (157-220)||(22756-22818)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (157-220)||(45228-45291)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (170-220)||(72572-72622)
scaffold0037 (170-220)||(84762-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (175-220)||(18218-18263)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (20-61)||(2859-2900)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (164-204)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (177-217)||(3251-3291)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (20-60)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123584
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  123569 gtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 77433 - 77391
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  77433 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 77391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  9583093 gtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119849
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  16119864 gtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551314
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa---------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  14551298 tgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515278
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  205 gtgggggagttt 216  Q
    ||||||||||||    
T  23515267 gtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718080
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  8718065 gtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674071
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  13674056 atgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593352
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  18593367 atgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618332
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  18618317 atgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga---------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 538765  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  538764 gagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 4312763  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  4312764 agtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggg 12567219  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  12567220 gagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||  | | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548912 gagacatgta-tttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgggg 12548814  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  12548813 agtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaag--------aaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  112 ggagacat--gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||| || ||    ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8780947  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  8780946 ggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 9004157  T
Q  211 gagtttga 218  Q
    ||||||||    
T  9004158 gagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||    ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  20108575 gagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48801935 - 48801777
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac--tgttggt- 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||   ||||  |     
T  48801935 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttatt 48801839  T
Q  158 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48801838 gctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 13657926 - 13658081
Alignment:
Q  65 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||   ||||| |    
T  13657926 aatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgaggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctacca 13658025  T
Q  165 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13658026 tgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11921463 - 11921307
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgc 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||    
T  11921463 aagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgc 11921368  T
Q  160 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921367 taccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  115 gacatgtgcttta-attgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 213  Q
    |||||  | |||  ||||||||||||| || ||    || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T
Q  214 tttgatg 220  Q
    |||||||    
T  9264945 tttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16465679 - 16465616
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465679 tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 16532150 - 16532311
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   ||    
T  16532150 aagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatg 16532249  T
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16532250 ctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16633512 - 16633351
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   ||    
T  16633512 aagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatg 16633413  T
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16633412 ctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461242
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 220
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  162 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  171 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  167 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4791438 - 4791383
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791438 atgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Original strand, 15940731 - 15940773
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15940731 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 15940773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16465772 - 16465743
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465772 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 16465743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699770
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  15699755 gtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165549
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  22165564 gtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244027
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  22244012 gtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061503
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  22061518 atgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24855255  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  24855254 gagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767116
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  22767132 tatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170458
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ctgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  203 gtgtgggggagtttgatg 220  Q
    || |||||||||||||||    
T  20170441 gtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18448339  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  18448340 gagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23023292  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  23023293 gagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggggg 25625890  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  25625891 agtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||        |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  115 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 213  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T
Q  214 tttgatg 220  Q
    |||||||    
T  2181263 tttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  120 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgat 18854225  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  18854226 g 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  112 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||| || | || || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattgaattgtcatatgtt-tatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20107791  T
Q  210 ggagttt 216  Q
    |||||||    
T  20107790 ggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||        ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 21560563  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  21560562 agtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac--tgttggt-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 208  Q
     |||| ||  | |||||||||||||||||   ||||||   ||||  | ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 25631281  T
Q  209 gggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||    
T  25631280 gggagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25963447  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  25963448 gagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25968094  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  25968095 gagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 29595745 - 29595904
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgct 160  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||  ||||    
T  29595745 aagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggggagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgct 29595844  T
Q  161 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29595845 accatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgagggagtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30671967 - 30671807
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  |||    
T  30671967 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgc 30671868  T
Q  160 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671867 tactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184874
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 220
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  163 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585622
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcat 140  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattgtattgtcat 19585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata--------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaag 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  105 ccctt 109  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686489
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496614
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  11496629 gtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823128
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  13823113 gtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  19 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 42709741  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  42709740 gagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254563
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  106 ccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  206 tgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  15254549 tgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  10630957 agtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggg 3354845  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  3354846 gagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggggg 18292144  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  18292145 agtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 17484919  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  17484918 agtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18081470  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  18081469 ggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 212  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||             || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 38426930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 56580700 - 56580539
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    | ||   ||    
T  56580700 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatg 56580601  T
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580600 ctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||   ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggg 45234242  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  45234241 gagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092427
Alignment:
Q  160 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  171 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtac 90  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 12515042 - 12515081
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12515042 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 12515081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602472
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  10602487 gtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504881
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  13504896 gtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  11947607 gtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600570
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  7600555 atgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556942
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  15556957 gtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448760
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  16448775 atgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373565
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  16373581 tatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187076
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  12187092 tatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942593
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  37942577 tatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360971
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  9360986 atgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggggg 12193499  T
Q  212 agtttgat 219  Q
    ||||||||    
T  12193498 agtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815079
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  204 tgtgggggagttt 216  Q
    | || ||||||||    
T  6815067 tatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147226
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  10147210 tatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645216
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||        ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  15645200 tatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160173
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  10160189 tatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187418
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  204 tgtgggggagtttgat 219  Q
    | ||||||||||||||    
T  13187433 tatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 212  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 3245596  T
Q  213 gtttgat 219  Q
    |||||||    
T  3245595 gtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||        ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggggg 13097910  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  13097911 agtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 212  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| | |||    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2721405 gagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggga 2721503  T
Q  213 gtttgatg 220  Q
    ||||||||    
T  2721504 gtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4382950  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  4382951 ggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13001435  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  13001434 gagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaag--------aaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || || |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggg 20156525  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  20156524 gagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||        ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggggg 13690807  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  13690808 agtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10547097 - 10546936
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||| || |  ||  ||    
T  10547097 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatg 10546998  T
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10546997 ctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |    
T  1992903 ggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagag 1993002  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  1993003 agtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  112 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
     |||||||  | ||| |||||||||||| | || ||    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggg 11398414  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  11398415 gagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||| || ||   || | |  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 14348598  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  14348597 gagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  115 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 213  Q
    || ||  | ||||||||||||||||  |||||    ||||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T
Q  214 tttgatg 220  Q
    |||||||    
T  17388039 tttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  115 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 213  Q
    | |||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T
Q  214 tttgatg 220  Q
    |||||||    
T  22637902 tttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||        |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatata-actgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||| || ||   | ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggggg 3279390  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  3279391 agtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata-------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |       ||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  ||||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttga 12160317  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160316 ggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 12160217  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  12160216 gagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 17045697 - 17045902
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata-------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||       ||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  17045697 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aagc 17045794  T
Q  106 ccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045795 ctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17045894  T
Q  205 gtggggga 212  Q
    ||||||||    
T  17045895 gtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 17047857 - 17048062
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata-------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||       ||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  17047857 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aagc 17047954  T
Q  106 ccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047955 ctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17048054  T
Q  205 gtggggga 212  Q
    ||||||||    
T  17048055 gtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 220
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  163 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  162 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata--------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195458
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  165 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225754
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068357
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 220
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  189 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 13601062 - 13601108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13601062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 13601108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 16703307 - 16703363
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16703307 atgtttataccttttgctttaggttaagcaaagattcaagcatggaggagtttgatg 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665277
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  22665262 gtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044660
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  22044675 atgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357726
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  25357711 atgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775866
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  16775851 atgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117758
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  117743 gtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17590606  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  17590607 atgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795285
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  24795300 atgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggggg 11624  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  11623 agtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627796
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  27627780 tatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25144767  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  25144766 gagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaag--------aaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 5500274  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  5500273 agtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25804276  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  25804275 agtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaag--------aaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 212  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggga 23798930  T
Q  213 gtttgatg 220  Q
    ||||||||    
T  23798929 gtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  114 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttggt-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||  |||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25370895  T
Q  211 gagtt 215  Q
    |||||    
T  25370894 gagtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 220
Target Start/End: Original strand, 23644001 - 23644160
Alignment:
Q  63 gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   ||||    
T  23644001 gaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttgaggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgct 23644100  T
Q  161 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644101 accatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  66 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  165 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502297
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata--------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttga 24502267  T
Q  112 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcat 140  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  24502268 ggagacataagtttttaattgaattgtcat 24502297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506865
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321380
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337651
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 201
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 201  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 219
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  174 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  175 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  171 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019068
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatgggggaatttgat 24019068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17334648 - 17334606
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17334648 ttgcttgaggacaatcaatggttcaagtgtgggggagtttgat 17334606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 15532753 - 15532792
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15532753 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24019267 - 24019228
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24019267 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 24019228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047089
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  27047074 gtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094601
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  17094616 gtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798662
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  21798678 tatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237671
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  20237656 gtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 52938631  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  52938630 gagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  115 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac--tgttggt-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   ||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 8653322  T
Q  212 agttt 216  Q
    |||||    
T  8653323 agttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  132 aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggg 3990143  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  3990144 ggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 19364085 - 19364244
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||    
T  19364085 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgct 19364184  T
Q  161 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364185 gctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  162 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18478276 - 18478234
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18478276 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 18478234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595831
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  20595846 gtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602117
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  20602132 gtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608408
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  20608423 gtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735749
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  15735734 gtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748266
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  23748251 atgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24940739  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  24940740 gagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073115
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  18073099 tatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953174
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  24953190 tatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790714
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  20790730 tatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23600646  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    || |||||||    
T  23600645 gaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggg 24219951  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  24219952 gagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaag--------aaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggg 20444849  T
Q  211 gagttt 216  Q
    ||||||    
T  20444848 gagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  34 cttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  126 t-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916456
Alignment:
Q  24 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  116 acatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 215  Q
    ||||| | ||| ||| ||||||| | ||  ||     ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||    
T  20916560 acatgagttttgatttaattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagtt 20916461  T
Q  216 tgatg 220  Q
    |||||    
T  20916460 tgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  170 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  175 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855775
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 216  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575633
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattg 136  Q
    |||||||| | ||| |||||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaattg 20575633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata--------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  175 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  171 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15893
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  15878 gtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382309
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaa-ttgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  21382293 tatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098794
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  21098809 gtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104115
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  21104130 gtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911655
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  23911640 atgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314683
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | |||||||||||||||    
T  8314667 tatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322846
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    | || ||||||||||||    
T  8322862 tatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 21843534  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  21843533 gagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 21940007  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  21940006 ggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
     |||||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  20038989 agtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||        ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttgg-ttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 212  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggga 17620953  T
Q  213 gtttgatg 220  Q
    ||||||||    
T  17620954 gtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 16418631  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  16418630 ggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  113 gagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 210  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23455045 gagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  23455145 gagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 24034069 - 24034230
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgata-taactgttggtg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |  || |  |  ||  ||    
T  24034069 aagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatattaatctcgtttattg 24034168  T
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034169 ctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  109 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  208 ggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||    
T  20712637 ggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  113 gagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||| | || || || |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Original strand, 21538652 - 21538765
Alignment:
Q  108 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 206  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21538652 ttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgt 21538751  T
Q  207 gggggagtttgatg 220  Q
    |||||| |||||||    
T  21538752 gggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033555
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099655
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  171 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19902216 - 19902174
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19902216 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 19902174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712514
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga 64  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaaga 20712514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1253
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 104  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  105 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  205 gtgggggagtttgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  1238 atgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3524
Alignment:
Q  147 taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3451 taactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 615
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggttgaataaa--------gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  104 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 203  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  204 tgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  631 tgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  115 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 213  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T
Q  214 tttgatg 220  Q
    |||||||    
T  2858 tttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  320 ggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 419  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  420 agtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggg 251880  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  251879 gagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 11105 - 11264
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||    
T  11105 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgct 11204  T
Q  161 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11205 accatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  62 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  161 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172316
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||        |||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 212  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 14670  T
Q  213 gtttgatg 220  Q
    ||||||||    
T  14669 gtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1030  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  1031 ggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 2297  T
Q  211 gagtttgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  2296 gagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  113 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| | | |  | | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 121153  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  121154 agtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--------aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  115 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 214  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 681  T
Q  215 ttgatg 220  Q
    ||||||    
T  682 ttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
     |||||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  8141 agtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  102 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  201 aagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10225 aagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1307  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  1308 ggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8869
Alignment:
Q  73 agtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgttta 170  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  171 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa--------agaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 110  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||        ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  111 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 58639  T
Q  210 ggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  58638 ggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 97887 - 97726
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   ||    
T  97887 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatg 97788  T
Q  159 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97787 ctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35251 - 35104
Alignment:
Q  65 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||  |||||| |    
T  35251 aatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagccttaaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctacca 35160  T
Q  165 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35159 tgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaag--------aaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 111  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  112 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 211  Q
    ||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggggg 519  T
Q  212 agtttgatg 220  Q
    |||||||||    
T  518 agtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 12452 - 12609
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttggt- 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||  |     
T  12452 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgtttatt 12548  T
Q  158 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12549 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 232946 - 232789
Alignment:
Q  61 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttggt- 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||  |     
T  232946 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgtttatt 232850  T
Q  158 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232849 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  119 tgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  218 atg 220  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5295
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 88403 - 88361
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  88403 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 88361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 220
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  162 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  169 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13065 - 13002
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13065 tgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagtttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Original strand, 37722 - 37922
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata-------aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||       ||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  37722 cacacacactcacttgaaacttgtt-gttgggttgaataggttcgcaaggaatacttgatgttgtgattagtgtacacttgaaatt-aagcctttgagga 37819  T
Q  115 gacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 213  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||| |  ||    ||||  || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37820 gacataagattttaattgaattgtcatattttaattttgtttatgttgctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggag 37919  T
Q  214 ttt 216  Q
    |||    
T  37920 ttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1902
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 1041 - 1080
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1041 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  157 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  170 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  170 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18263
Alignment:
Q  175 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2900
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataa 2900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  164 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Original strand, 3251 - 3291
Alignment:
Q  177 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 217  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3251 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5869 - 5830
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5869 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University