View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_544 (Length: 225)

Name: NF11737A_low_544
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_544
NF11737A_low_544
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-219)||(46144486-46144704)
chr1 (1-223)||(52399333-52399548)
chr1 (1-219)||(49998580-49998798)
chr1 (1-219)||(40437534-40437751)
chr1 (56-185)||(17022300-17022429)
chr1 (35-180)||(17607686-17607829)
chr1 (63-190)||(33396059-33396188)
chr1 (64-138)||(20821724-20821799)
chr1 (64-138)||(77353-77428)
chr1 (99-138)||(41213023-41213062)
chr1 (99-135)||(37235319-37235355)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (1-219)||(18968807-18969024)
chr3 (1-219)||(43428798-43429016)
chr3 (1-219)||(25105222-25105444)
chr3 (3-219)||(17319841-17320056)
chr3 (3-219)||(21167986-21168196)
chr3 (4-219)||(4146943-4147158)
chr3 (4-219)||(14816962-14817177)
chr3 (4-219)||(4163450-4163665)
chr3 (15-219)||(6229911-6230114)
chr3 (6-188)||(34558609-34558790)
chr3 (29-185)||(17203407-17203563)
chr3 (43-185)||(12020692-12020834)
chr3 (33-185)||(15549259-15549411)
chr3 (56-176)||(8603428-8603548)
chr3 (64-191)||(19061081-19061209)
chr3 (64-190)||(17759761-17759888)
chr3 (64-138)||(5229398-5229473)
chr3 (56-175)||(27050475-27050593)
chr3 (64-153)||(17392104-17392195)
chr3 (87-139)||(17385633-17385685)
chr3 (67-141)||(38377137-38377212)
chr3 (99-138)||(41660382-41660421)
chr3 (95-129)||(21663499-21663533)
chr3 (1-62)||(5229261-5229322)
chr3 (87-128)||(10711358-10711399)
chr3 (87-139)||(8023014-8023066)
chr3 (99-135)||(38812350-38812386)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (1-219)||(6450-6668)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-219)||(7468964-7469182)
chr8 (2-219)||(24266717-24266934)
chr8 (3-219)||(24553839-24554055)
chr8 (1-219)||(38636927-38637137)
chr8 (19-212)||(29296621-29296810)
chr8 (6-188)||(15932067-15932246)
chr8 (6-188)||(26010185-26010358)
chr8 (56-180)||(17284006-17284130)
chr8 (64-190)||(17265616-17265744)
chr8 (95-184)||(23227377-23227466)
chr8 (48-142)||(25608796-25608891)
chr8 (95-188)||(19332983-19333077)
chr8 (55-138)||(18042873-18042957)
chr8 (64-138)||(11543283-11543358)
chr8 (64-138)||(22312438-22312513)
chr8 (64-142)||(24238310-24238389)
chr8 (55-138)||(45560530-45560614)
chr8 (67-138)||(33171031-33171102)
chr8 (67-138)||(22498625-22498697)
chr8 (1-49)||(25609017-25609065)
chr8 (1-47)||(11543487-11543533)
chr8 (1-47)||(22312642-22312688)
chr8 (1-47)||(45560365-45560411)
chr8 (1-46)||(25294943-25294988)
chr8 (1-46)||(25756963-25757008)
chr8 (87-139)||(18179083-18179135)
chr8 (99-135)||(37655004-37655040)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (4-219)||(6455390-6455605)
chr5 (4-219)||(24082826-24083041)
chr5 (4-219)||(29912769-29912984)
chr5 (3-219)||(5622699-5622909)
chr5 (2-216)||(26561057-26561264)
chr5 (1-172)||(33627652-33627823)
chr5 (29-185)||(21224000-21224154)
chr5 (56-176)||(14343079-14343199)
chr5 (99-189)||(18532161-18532251)
chr5 (67-190)||(21108270-21108394)
chr5 (64-138)||(11964720-11964795)
chr5 (99-189)||(22055125-22055215)
chr5 (65-138)||(20455419-20455493)
chr5 (1-62)||(20455244-20455305)
chr5 (87-128)||(24851812-24851853)
chr5 (93-129)||(17301584-17301620)
chr5 (99-135)||(24226825-24226861)
chr5 (99-135)||(37982199-37982235)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (4-219)||(1297-1512)
scaffold0174 (95-219)||(21436-21561)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (2-219)||(32350793-32351010)
chr6 (15-212)||(18630892-18631085)
chr6 (3-142)||(22463375-22463514)
chr6 (29-188)||(29604303-29604462)
chr6 (57-213)||(25649874-25650024)
chr6 (43-185)||(22363497-22363639)
chr6 (30-185)||(21621868-21622023)
chr6 (103-219)||(15006013-15006130)
chr6 (65-190)||(11374178-11374305)
chr6 (67-185)||(25918421-25918539)
chr6 (55-153)||(31162201-31162299)
chr6 (4-82)||(33539670-33539750)
chr6 (55-142)||(16375154-16375241)
chr6 (95-190)||(29161868-29161964)
chr6 (64-138)||(16135053-16135128)
chr6 (64-176)||(5485657-5485768)
chr6 (65-194)||(4173002-4173131)
chr6 (64-138)||(21930666-21930741)
chr6 (96-142)||(17857741-17857787)
chr6 (65-194)||(4228611-4228740)
chr6 (87-124)||(23090078-23090115)
chr6 (1-62)||(23220659-23220720)
chr6 (95-138)||(18104827-18104870)
chr6 (67-134)||(19852973-19853040)
chr6 (67-138)||(34965680-34965751)
chr6 (87-129)||(15482225-15482267)
chr6 (3-49)||(16135254-16135300)
chr6 (95-137)||(23220471-23220513)
chr6 (96-128)||(14874841-14874873)
chr6 (1-49)||(17084505-17084553)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (4-219)||(31499923-31500139)
chr7 (15-218)||(4437569-4437771)
chr7 (18-218)||(4444970-4445169)
chr7 (6-188)||(16921193-16921374)
chr7 (6-219)||(48354058-48354264)
chr7 (1-219)||(14939497-14939707)
chr7 (1-219)||(15367090-15367300)
chr7 (2-219)||(33558413-33558624)
chr7 (4-219)||(34242379-34242587)
chr7 (6-188)||(9609984-9610165)
chr7 (6-188)||(9837556-9837737)
chr7 (29-185)||(17225206-17225362)
chr7 (29-185)||(16918318-16918474)
chr7 (64-191)||(16382270-16382399)
chr7 (64-190)||(45148303-45148431)
chr7 (64-141)||(8564899-8564977)
chr7 (64-138)||(4483498-4483573)
chr7 (95-142)||(19066381-19066428)
chr7 (64-138)||(21676354-21676429)
chr7 (64-138)||(28719224-28719299)
chr7 (55-153)||(21539488-21539586)
chr7 (55-153)||(15979389-15979487)
chr7 (1-62)||(4483686-4483747)
chr7 (1-46)||(21539386-21539431)
chr7 (93-129)||(17910748-17910784)
chr7 (67-138)||(9322388-9322459)
chr7 (99-138)||(20584240-20584279)
chr7 (1-46)||(8564773-8564818)
chr7 (1-62)||(28719413-28719474)
chr7 (98-142)||(3193397-3193441)
chr7 (99-135)||(9057990-9058026)
chr7 (62-124)||(14973908-14973966)
chr7 (62-124)||(15403384-15403442)
chr7 (87-131)||(17150771-17150815)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-219)||(38763498-38763710)
chr4 (1-219)||(12732863-12733081)
chr4 (6-176)||(18275570-18275739)
chr4 (4-212)||(42707475-42707679)
chr4 (2-83)||(18241001-18241082)
chr4 (99-189)||(10105523-10105613)
chr4 (99-189)||(31114517-31114607)
chr4 (99-189)||(15676248-15676338)
chr4 (95-184)||(7187268-7187357)
chr4 (100-185)||(19823802-19823887)
chr4 (64-138)||(19558102-19558177)
chr4 (88-142)||(17213192-17213246)
chr4 (64-141)||(24237655-24237733)
chr4 (64-141)||(49070594-49070672)
chr4 (64-140)||(54364894-54364971)
chr4 (67-138)||(5372022-5372094)
chr4 (87-139)||(10115712-10115764)
chr4 (99-138)||(41257711-41257750)
chr4 (87-128)||(11923447-11923488)
chr4 (87-128)||(13933541-13933582)
chr4 (99-143)||(10238812-10238856)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (6-188)||(68233-68414)
scaffold0009 (96-142)||(255777-255823)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (2-223)||(25132894-25133110)
chr2 (4-219)||(24881318-24881533)
chr2 (29-142)||(9782201-9782313)
chr2 (86-185)||(40641639-40641738)
chr2 (99-189)||(24342740-24342830)
chr2 (95-184)||(19665386-19665475)
chr2 (95-176)||(6093580-6093661)
chr2 (55-153)||(45619350-45619448)
chr2 (64-195)||(20272110-20272243)
chr2 (64-140)||(24562193-24562270)
chr2 (64-138)||(18534598-18534672)
chr2 (1-62)||(18534785-18534846)
chr2 (87-128)||(39668592-39668633)
chr2 (99-135)||(43641597-43641633)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (6-200)||(3231-3425)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (6-188)||(1344-1526)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (6-188)||(98430-98611)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (6-188)||(29837-30018)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (6-180)||(12187-12360)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (18-176)||(198640-198797)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (4-153)||(2225-2374)
scaffold0387 (180-213)||(2380-2413)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (15-212)||(23317-23509)
scaffold0021 (37-212)||(19073-19244)
scaffold0021 (37-212)||(28649-28820)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (2-153)||(1061-1210)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (35-178)||(52047-52188)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (29-185)||(5464-5620)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (48-193)||(11331-11478)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (29-185)||(472-628)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (48-193)||(10662-10809)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (162-219)||(25363-25420)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (64-141)||(4711-4789)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (66-141)||(9552-9628)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (96-180)||(105965-106049)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (99-185)||(50304-50390)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (64-219)||(15213-15370)
scaffold0317 (1-46)||(14998-15043)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (95-190)||(1570-1666)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (67-138)||(44935-45007)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (64-141)||(2299-2376)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (64-153)||(12473-12562)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-62)||(1411-1472)
scaffold0090 (1-62)||(5791-5852)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (67-138)||(34787-34858)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (67-138)||(130656-130727)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (99-138)||(85189-85228)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (96-142)||(346-392)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (1-45)||(12240-12284)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (99-135)||(78191-78227)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46144704 - 46144486
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46144704 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 46144605  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144604 gtgtggatgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 46144505  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46144504 gtttgcattattgagtctt 46144486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52399548 - 52399333
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||    
T  52399548 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgttgactcttaattgat-------atgttgatt 52399456  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52399455 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttagtgtatgtatatgttgagta 52399356  T
Q  201 gtttgcattattgagtcttcgct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52399355 gtttgcattattgagtcttcgct 52399333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 49998580 - 49998798
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49998580 tgttgaactatatgatatagttggagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 49998679  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998680 gtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtagttttatattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 49998779  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  49998780 gtttgcattatcgagtctt 49998798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 40437534 - 40437751
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  40437534 tgttgaactataggatataattgaagttgattaatgaatacatgttgattaattgtgacattttggtgatgactcttaattggataatgacatgatgatt 40437633  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||     
T  40437634 gtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac-tttacattgtgttgatgtatgtattcgttgagtg 40437732  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40437733 gtttgcattattgagtctt 40437751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17022429 - 17022300
Alignment:
Q  56 tgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaatt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17022429 tgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaatt 17022330  T
Q  156 ggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17022329 ggagatgtacttttacattgtgttgttgta 17022300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17607829 - 17607686
Alignment:
Q  35 tgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||   | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607829 tgaatacatgttgatgaattatgatcatta--taatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 17607732  T
Q  135 ttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttg 180  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  17607731 ttgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttg 17607686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33396188 - 33396059
Alignment:
Q  63 ttggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtc 161  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |      
T  33396188 ttggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattttgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggt 33396089  T
Q  162 gtacttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33396088 gtacttttacattgttgttggtgaatgtat 33396059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20821799 - 20821724
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20821799 tggtgatgactctcaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20821724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Original strand, 77353 - 77428
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  77353 tggtgatgacttttaattgatttatgacttgattgattgcgtggacgtaaatatttgataatgaaattgttgttga 77428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Original strand, 41213023 - 41213062
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41213023 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41213062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 37235319 - 37235355
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37235319 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37235355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18969024 - 18968807
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18969024 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 18968925  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattg-gtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18968924 gtgtcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaatgt-gtacttttacattgtgttggtatatgtatatgttgagt 18968826  T
Q  200 agtttgcattattgagtctt 219  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  18968825 ag-ttgcattattgggtctt 18968807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 43428798 - 43429016
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43428798 tgttgaactatatgatatagtggaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 43428897  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43428898 gcgtggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatgcgttgagta 43428997  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  43428998 gtttgtattattgagtctt 43429016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 25105222 - 25105444
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25105222 tgttgaactaaatgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 25105321  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttgg----tgtatgtatatgttg 196  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  25105322 gtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatgtatatgttg 25105421  T
Q  197 agtagtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25105422 agtagtttgcattattgagtctt 25105444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Original strand, 17319841 - 17320056
Alignment:
Q  3 ttgaactatatgatatagttgaagtggatt-aatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17319841 ttgaactataggatatagttgaagttgatttaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacattttgattg 17319940  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319941 tgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac--ttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 17320038  T
Q  202 tttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17320039 tttgcattattgagtctt 17320056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Original strand, 21167986 - 21168196
Alignment:
Q  3 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgt 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21167986 ttgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgt 21168085  T
Q  103 gtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagt 202  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  21168086 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgttggtg------tatgttgagtagt 21168179  T
Q  203 ttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  21168180 ttgcattattgagtctt 21168196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 4146943 - 4147158
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4146943 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 4147042  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4147043 tggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgttcttttacattgtgttggcatatgtatatgtcgagtagtt 4147142  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||| |||||    
T  4147143 tgcattattgggtctt 4147158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 14816962 - 14817177
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  14816962 tgaactatagaacatagttgaagttgatttatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaaatgaataatgacatgttgatcgtg 14817061  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14817062 tggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 14817161  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  14817162 tgcattattgagtctt 14817177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 4163450 - 4163665
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  4163450 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattggg 4163549  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||    
T  4163550 tggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggcatgtgtatatgtcgagtactt 4163649  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||| |||||    
T  4163650 tgcattattgggtctt 4163665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 6229911 - 6230114
Alignment:
Q  15 atatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaat 114  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6229911 atatagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaat 6230009  T
Q  115 gcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattga 214  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6230010 gttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtgtacttttatattgtgttggcatatgtatatgtttagtagtttgcattattga 6230109  T
Q  215 gtctt 219  Q
    |||||    
T  6230110 gtctt 6230114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34558790 - 34558609
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  34558790 aactatatgatgcagttgaagttgtctaatgaatacatgttaatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgagtgtgtg 34558692  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34558691 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 34558609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17203563 - 17203407
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17203563 gattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 17203464  T
Q  129 ttgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17203463 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 17203407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12020834 - 12020692
Alignment:
Q  43 tgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12020834 tgttgatgaattgtgatattttggcggtgtctcttaaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagtt 12020735  T
Q  143 aagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
       |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12020734 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 12020692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15549411 - 15549259
Alignment:
Q  33 aatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgt 132  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15549411 aatgaatgtatgttgatgaattgtgatattttggtggtgatacttaattgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgt 15549312  T
Q  133 tgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||| ||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15549311 tgttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 15549259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8603548 - 8603428
Alignment:
Q  56 tgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||      
T  8603548 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaa 8603449  T
Q  156 ggtgtcgtacttttacattgt 176  Q
    || |  |||||||||||||||    
T  8603448 ggaggtgtacttttacattgt 8603428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Original strand, 19061081 - 19061209
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |    
T  19061081 tggtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 19061179  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtata 191  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19061180 tacttttacattgttgttggtgaatgtata 19061209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Original strand, 17759761 - 17759888
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |    
T  17759761 tggtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 17759859  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17759860 tacttttacattgttgttggtgaatgtat 17759888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Original strand, 5229398 - 5229473
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5229398 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 5229473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27050593 - 27050475
Alignment:
Q  56 tgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaatt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |||  |||||||| |    
T  27050593 tgataatttggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattggtggtgaa-ttactcaatgtaaat 27050495  T
Q  156 ggtgtcgtacttttacattg 175  Q
    || |  ||||||||||||||    
T  27050494 ggaggggtacttttacattg 27050475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17392195 - 17392104
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatg--cttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||| | ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17392195 tggtgatgactcttatttgaattgtgactttttgattgtgtggacgtaaatatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaa 17392104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17385685 - 17385633
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaa 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  17385685 atgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttggtgaa 17385633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 141
Target Start/End: Original strand, 38377137 - 38377212
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  38377137 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattattgtcgaagt 38377212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41660421 - 41660382
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41660421 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21663533 - 21663499
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaat 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21663533 ttgattgtgtggatgtaaattcttgataatgcaat 21663499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5229261 - 5229322
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  5229261 tgttgaacaatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 5229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Original strand, 10711358 - 10711399
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10711358 atgacttgttgattgtgtggatctaaatacttgataatgcaa 10711399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8023066 - 8023014
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaa 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  8023066 atgacttgttgattgtatggatgtaagtatttgataatgcaattgttggtgaa 8023014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 38812350 - 38812386
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38812350 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 38812386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6668 - 6450
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6668 tgttgaactatatgatatacttggagtggattaatatatacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 6569  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6568 gtatggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttgaagttgagaaatgtaattggaggtgtacttttacactgtgttggtgtatgtatatgttgagta 6469  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6468 gtttgcattattgagtctt 6450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7469182 - 7468964
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7469182 tgttgaactatatgatatagttgaagctgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 7469083  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469082 gtgtgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 7468983  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7468982 gtttgcattattgagtctt 7468964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24266934 - 24266717
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24266934 gttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattg 24266835  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24266834 tgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatttgtttagtag 24266735  T
Q  202 tttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24266734 tttgcattattgagtctt 24266717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Original strand, 24553839 - 24554055
Alignment:
Q  3 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgt 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  24553839 ttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttcgagatgactcttaattgaataatgacatgttgcttgt 24553938  T
Q  103 gtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagt 202  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24553939 gtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatggtgagtaat 24554038  T
Q  203 ttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  24554039 ttgcattattgagtctt 24554055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 38636927 - 38637137
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  38636927 tgttgaactatatgatatagttggagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatgttgatgatgactcttaattgaataatgacatattgatt 38637026  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||        ||||||| |||||||||||    
T  38637027 gtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacat--------tgtatgtttatgttgagta 38637118  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  38637119 gtttgcattatggagtctt 38637137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29296810 - 29296621
Alignment:
Q  19 agttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29296810 agttgaagttgattaatgaatacatgttgatgtactatgatattt-ggtgatgactcttaaataaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatactt 29296712  T
Q  119 gataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatt 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29296711 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtg--tgtatgagttgagtag-ttgcattatt 29296621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15932246 - 15932067
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    |||||| |||| ||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15932246 aactatgtgatgtagatgaagt--attaatgaatgcatattgatgaattgtgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 15932150  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15932149 gatgtaaatgcttgataatgcaaatgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttgtatgt 15932067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26010358 - 26010185
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26010358 aactatgtgatgtagttgaagttaattaatgaatacaagttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 26010260  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  26010259 gatg--------tgataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacattgtattgttgtatgt 26010185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17284130 - 17284006
Alignment:
Q  56 tgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaatt 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17284130 tgatattttggtggtgactcttaattgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaatt 17284031  T
Q  156 ggtgtcgtacttttacattgtgttg 180  Q
    || |  ||||||||||||| |||||    
T  17284030 ggaggtgtacttttacattatgttg 17284006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17265744 - 17265616
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |    
T  17265744 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 17265645  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17265644 tacttttacattgttgttggtgaatgtat 17265616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 23227377 - 23227466
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgt 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  23227377 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 23227466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25608891 - 25608796
Alignment:
Q  48 atgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25608891 atgaatgatgataatgtggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 25608796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 19332983 - 19333077
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattg-tgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19332983 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgttgttggtgaatgt 19333077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 18042873 - 18042957
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18042873 atgataatgtggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 18042957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11543358 - 11543283
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11543358 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttga 11543283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22312513 - 22312438
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312513 tggtgatgactcttaatttatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 22312438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24238389 - 24238310
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24238389 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagtt 24238310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 45560530 - 45560614
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45560530 atgatagtctggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 45560614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33171102 - 33171031
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33171102 tgatgactcttaattgaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 33171031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 22498625 - 22498697
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22498625 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacgtgattatgcaattgttgttga 22498697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 25609065 - 25609017
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  25609065 tgttgaactatatgatatagttgatgtggattaatacatatatgttgat 25609017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 11543533 - 11543487
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttg 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  11543533 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttg 11543487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 22312688 - 22312642
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttg 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  22312688 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttg 22312642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 45560365 - 45560411
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttg 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  45560365 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttg 45560411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25294988 - 25294943
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  25294988 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgtt 25294943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25757008 - 25756963
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  25757008 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgtt 25756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18179135 - 18179083
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaa 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  18179135 atgacttgttgattgtatggatgtaagtatttgataatgcaattgttggtgaa 18179083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 37655004 - 37655040
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37655004 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37655040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6455605 - 6455390
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6455605 tgaactataaaatataattgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 6455506  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattgg-tgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6455505 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgt-gtactcttacattgcgttggtgtatgtatatgttgagtagt 6455407  T
Q  203 ttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  6455406 ttgcattattgagtctt 6455390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24083041 - 24082826
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24083041 tgaactatagaatatagttgaagttaattaatgattatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 24082942  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24082941 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgcatgtatatgttgagtagtt 24082842  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||| |||||    
T  24082841 tgcattattgggtctt 24082826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29912984 - 29912769
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  29912984 tgaactataaaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggggacgactcttaatggaatgatgacatgttgattgtg 29912885  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29912884 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgtaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 29912785  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  29912784 tgcattattgagtctt 29912769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Original strand, 5622699 - 5622909
Alignment:
Q  3 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgt 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5622699 ttgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgt 5622798  T
Q  103 gtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagt 202  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  5622799 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgttggtg------tatgttgagtagt 5622892  T
Q  203 ttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  5622893 ttgcattattgagtctt 5622909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 26561057 - 26561264
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  26561057 gttgaactataa-atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatatgttggtgatgactcttaattgaataacgacatgttgattg 26561155  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 201  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  26561156 tgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtg------tatgttgagtag 26561249  T
Q  202 tttgcattattgagt 216  Q
    |||||||||||||||    
T  26561250 tttgcattattgagt 26561264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 33627652 - 33627823
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  33627652 tgttgaactatatgatatagttgaagttgattaataaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgact 33627751  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttaca 172  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  33627752 gtgtggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Original strand, 21224000 - 21224154
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21224000 gattaatgaatgagtgttgatgaattgtgatattttggtg--gactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 21224097  T
Q  129 ttgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21224098 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttgttgta 21224154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 14343079 - 14343199
Alignment:
Q  56 tgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaatt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||      
T  14343079 tgatattttggtgataactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaa 14343178  T
Q  156 ggtgtcgtacttttacattgt 176  Q
    || |  |||||||||||||||    
T  14343179 ggagatgtacttttacattgt 14343199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532251
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgta 189  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 18532251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21108394 - 21108270
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtac 165  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  ||||    
T  21108394 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 21108295  T
Q  166 ttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21108294 -tttacattgttgttggtgaatgtat 21108270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11964795 - 11964720
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11964795 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 11964720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055215
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattgg-tgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgta 189  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgt-gtacttttacattgtgttgatgtatgta 22055215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Original strand, 20455419 - 20455493
Alignment:
Q  65 ggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20455419 ggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgccattgttgttga 20455493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 20455244 - 20455305
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  20455244 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 20455305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Original strand, 24851812 - 24851853
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24851812 atgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 24851853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 129
Target Start/End: Original strand, 17301584 - 17301620
Alignment:
Q  93 tgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaat 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17301584 tgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 17301620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 24226825 - 24226861
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24226825 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 24226861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37982235 - 37982199
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37982235 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37982199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1512 - 1297
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  1512 tgaactatagaatatagttgaagttgactaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacttcttgattgtg 1413  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1412 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttgcattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 1313  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  1312 tgcattattgagtctt 1297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 21436 - 21561
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatg 193  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||  ||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21436 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataataaaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggagatgtaattttacattgttgttggtgaatgtatatg 21534  T
Q  194 ttgagt-agtttgcattattgagtctt 219  Q
    |   || | ||||||||||||||||||    
T  21535 tgaggtgattttgcattattgagtctt 21561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32351010 - 32350793
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32351010 gttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggagatgactcttaattgaataatgacatgttgattg 32350911  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 201  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32350910 tgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcacgtatatgttgagtag 32350811  T
Q  202 tttgcattattgagtctt 219  Q
    || ||||||| |||||||    
T  32350810 ttggcattatcgagtctt 32350793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Original strand, 18630892 - 18631085
Alignment:
Q  15 atatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaat 114  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18630892 atatagctaaagttgattaatgaatatatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaat 18630990  T
Q  115 gcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatt 212  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18630991 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttggtg--tgtatgagttgagtag-ttgcattatt 18631085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 22463375 - 22463514
Alignment:
Q  3 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgt 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||    
T  22463375 ttgaactataggatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttatttgaataacaacatgttgattgt 22463474  T
Q  103 gtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22463475 gtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29604462 - 29604303
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29604462 gattaatgaatatatgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattaaataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgcaa 29604363  T
Q  129 ttgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29604362 ttgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtatatgt 29604303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25650024 - 25649874
Alignment:
Q  57 gatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25650024 gatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattc 25649925  T
Q  157 gtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattg 213  Q
    | |  ||| ||||||||||||||  ||      ||||||||||||||||||||||||    
T  25649924 gaggtgtaattttacattgtgttcttg------tatgttgagtagtttgcattattg 25649874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Original strand, 22363497 - 22363639
Alignment:
Q  43 tgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22363497 tgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagtt 22363596  T
Q  143 aagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
       |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  22363597 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttgta 22363639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21622023 - 21621868
Alignment:
Q  30 attaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaat 129  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  21622023 attaatgaatgtgtgttgatgaactgtgatagtttggtgatgactattaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgctcgatagtgcaat 21621924  T
Q  130 tgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||    
T  21621923 tgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggtttacttttacattgtgttgttgta 21621868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 15006013 - 15006130
Alignment:
Q  103 gtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag- 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15006013 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattggtgtatgtatatgttgagtagt 15006112  T
Q  202 tttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15006113 tttgcattattgggtctt 15006130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Original strand, 11374178 - 11374305
Alignment:
Q  65 ggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgt 163  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  ||    
T  11374178 ggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgt 11374277  T
Q  164 acttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11374278 acttttacattgttgttggtgaatgtat 11374305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25918539 - 25918421
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtact 166  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |   ||||    
T  25918539 tgataactcttaattgtataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctact 25918440  T
Q  167 tttacattgtgttggtgta 185  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  25918439 tttacattgtgttgttgta 25918421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 31162201 - 31162299
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31162201 atgataatgtggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 31162299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 33539670 - 33539750
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaat--gaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattg 82  Q
    |||||||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33539670 tgaactatagaatatagatgaagttgattaatatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattg 33539750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16375241 - 16375154
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16375241 atgataatatggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 16375154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 29161868 - 29161964
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29161868 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtgtacttttacattgttgttggtgaatgtat 29161964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16135128 - 16135053
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16135128 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttga 16135053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 176
Target Start/End: Original strand, 5485657 - 5485768
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattgg-tgtcg 162  Q
    |||||||| |||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||| ||| |    
T  5485657 tggtgatgtctcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggatgt-g 5485754  T
Q  163 tacttttacattgt 176  Q
    ||||||||||||||    
T  5485755 tacttttacattgt 5485768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 4173002 - 4173131
Alignment:
Q  65 ggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgt-aattggtgtcgt 163  Q
    |||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| || || ||| ||    
T  4173002 ggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtatgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaaatgatgt-gt 4173099  T
Q  164 acttttacattg-tgttggtgtatgtatatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4173100 acttttacattgttgttggtgaatgtatatgt 4173131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21930741 - 21930666
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  21930741 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgtaattgttgttga 21930666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 142
Target Start/End: Original strand, 17857741 - 17857787
Alignment:
Q  96 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17857741 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagtt 17857787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Original strand, 4228611 - 4228740
Alignment:
Q  65 ggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgt-aattggtgtcgt 163  Q
    |||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| || || ||| ||    
T  4228611 ggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtacgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaaatgatgt-gt 4228708  T
Q  164 acttttacattg-tgttggtgtatgtatatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4228709 acttttacattgttgttggtgaatgtatatgt 4228740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 124
Target Start/End: Original strand, 23090078 - 23090115
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23090078 atgacttgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 23090115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23220720 - 23220659
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  23220720 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 23220659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 138
Target Start/End: Original strand, 18104827 - 18104870
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18104827 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttga 18104870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19853040 - 19852973
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 134  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19853040 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 19852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34965751 - 34965680
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34965751 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtgaacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 34965680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 15482225 - 15482267
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaat 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15482225 atgacttgttgattatgtggatgtaaatgctttataatgcaat 15482267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16135300 - 16135254
Alignment:
Q  3 ttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 49  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  16135300 ttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgat 16135254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23220513 - 23220471
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttg 137  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23220513 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttg 23220471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 128
Target Start/End: Original strand, 14874841 - 14874873
Alignment:
Q  96 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14874841 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 14874873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17084505 - 17084553
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgat 49  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||    
T  17084505 tgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatatgttgat 17084553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31500139 - 31499923
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31500139 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgctgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaatattgacatgttgattgtg 31500040  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta-tgtatatgttgagtagt 202  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31500039 tggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtattgtatatgttgagtagt 31499940  T
Q  203 ttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||| ||||||    
T  31499939 ttgcattatttagtctt 31499923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4437771 - 4437569
Alignment:
Q  15 atatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaat 114  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4437771 atatagttgaagttgattactgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaat 4437672  T
Q  115 gcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattga 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4437671 acttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgt-tgtatatgttgagttgtttgcattattga 4437573  T
Q  215 gtct 218  Q
    ||||    
T  4437572 gtct 4437569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4445169 - 4444970
Alignment:
Q  18 tagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgct 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4445169 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcataattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatact 4445070  T
Q  118 tgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4445069 tgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgt-tgtatatgttgagttgtttgcattattgagtc 4444971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Original strand, 16921193 - 16921374
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  16921193 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatagtgtg 16921291  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16921292 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 16921374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48354264 - 48354058
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48354264 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 48354166  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||    
T  48354165 gatgtaaatgcttgataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttg 48354072  T
Q  206 cattattgagtctt 219  Q
    |||||||| |||||    
T  48354071 cattattgggtctt 48354058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14939707 - 14939497
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14939707 tgttgaactaaatgatatagttgaagtgtatcaatgaatacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 14939608  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||        ||||||| |||||||||||    
T  14939607 gtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat--------tgtatgtttatgttgagta 14939516  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14939515 gtttgcattattgagtctt 14939497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15367300 - 15367090
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15367300 tgttgaactaaatgatatagttgaagtgtatcaatgaatacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatt 15367201  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||        ||||||| |||||||||||    
T  15367200 gtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat--------tgtatgtttatgttgagta 15367109  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15367108 gtttgcattattgagtctt 15367090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33558624 - 33558413
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||    
T  33558624 gttgaactatataatatagttgaagttgattaatgaatacttgttgttgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataacgacatattgattg 33558525  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||      ||||||||||||    
T  33558524 tgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttcgtg------tatgttgagtag 33558431  T
Q  202 tttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33558430 tttgcattattgagtctt 33558413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 34242379 - 34242587
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  34242379 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttatttgaataatgacatgttaattgtg 34242477  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||      ||||||||||||||    
T  34242478 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacatttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtt 34242571  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||| |||||    
T  34242572 tgcattattgggtctt 34242587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9610165 - 9609984
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9610165 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtg 9610067  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9610066 gatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 9609984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9837737 - 9837556
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9837737 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtg 9837639  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattg-gtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9837638 gatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgtatgt-gtacttttacattgtgttgttgtatgt 9837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Original strand, 17225206 - 17225362
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17225206 gattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 17225305  T
Q  129 ttgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17225306 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 17225362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16918474 - 16918318
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918474 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 16918375  T
Q  129 ttgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16918374 ttgttgttgaagttgtaaaatgtaattggaggtgtaattttacattgtgttgttgta 16918318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16382399 - 16382270
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |    
T  16382399 tggtgatgactcttaattgaattatgacttaattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 16382300  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtata 191  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16382299 tacttttacattgttgttggtgaatgtata 16382270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45148431 - 45148303
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| ||| |  |    
T  45148431 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtg 45148332  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45148331 tacttttacattgttgttggtgaatgtat 45148303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Original strand, 8564899 - 8564977
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8564899 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtttggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 8564977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4483573 - 4483498
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4483573 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 4483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19066428 - 19066381
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19066428 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 19066381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Original strand, 21676354 - 21676429
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21676354 tggtgatgactctaaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 21676429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28719299 - 28719224
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28719299 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttga 28719224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 21539488 - 21539586
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21539488 atgataatgtggtgatgactcttatttaaattgtgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaa 21539586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 15979389 - 15979487
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |    |||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15979389 atgataatgtggtgatgactcttacttaaatcgtgacttgttgattgtggggacgtaaatagttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 15979487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4483747 - 4483686
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  4483747 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 4483686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21539386 - 21539431
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21539386 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatacatgtt 21539431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17910784 - 17910748
Alignment:
Q  93 tgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17910784 tgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 17910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 9322388 - 9322459
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || |  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9322388 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtatggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 9322459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Original strand, 20584240 - 20584279
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20584240 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20584279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 8564773 - 8564818
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  8564773 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgtt 8564818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28719474 - 28719413
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  28719474 tgttgaactatatgatagagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 28719413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 142
Target Start/End: Original strand, 3193397 - 3193441
Alignment:
Q  98 attgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3193397 attgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagtt 3193441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 9057990 - 9058026
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9057990 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 9058026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 124
Target Start/End: Original strand, 14973908 - 14973966
Alignment:
Q  62 tttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14973908 tttggtgatgactctta-ttga---atgacttgttgattgtgtggatgtaaatatttgataat 14973966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 124
Target Start/End: Original strand, 15403384 - 15403442
Alignment:
Q  62 tttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15403384 tttggtgatgactctta-ttga---atgacttgttgattgtgtggatgtaaatatttgataat 15403442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 131
Target Start/End: Original strand, 17150771 - 17150815
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattg 131  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17150771 atgacttgttgattgtatggatgtaaatagttgataatgcaattg 17150815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38763710 - 38763498
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaatta-tgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  38763710 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaatttgtgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatggcatgttgat 38763612  T
Q  100 tgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||    
T  38763611 tgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagt 38763518  T
Q  200 agtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  38763517 agtttgcattattgggtctt 38763498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12733081 - 12732863
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  12733081 tgttgaactataggatatagttgaagttgattgatgaatacatgttgattaattgtgacattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgacgatt 12732982  T
Q  101 gtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12732981 gtgtggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtattcgttgagta 12732882  T
Q  201 gtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12732881 gtttgcattattgagtctt 12732863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18275739 - 18275570
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18275739 aactatgtgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 18275641  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  18275640 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 18275570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42707679 - 42707475
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  42707679 tgaactatgtaatatagttaaagttgattattggatatatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgactcttgattgaataatgacatgctgattgtg 42707581  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  42707580 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgta--tataagttgagtag-t 42707484  T
Q  204 tgcattatt 212  Q
    |||||||||    
T  42707483 tgcattatt 42707475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 18241001 - 18241082
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattga 83  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18241001 gttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattga 18241082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105613
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgta 189  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 10105613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114517
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgta 189  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 31114517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676338
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgta 189  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatgta 15676338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 7187268 - 7187357
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgt 184  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  7187268 ttgactgtgtggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 7187357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 19823802 - 19823887
Alignment:
Q  100 tgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  19823802 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 19823887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19558177 - 19558102
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19558177 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 19558102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 142
Target Start/End: Original strand, 17213192 - 17213246
Alignment:
Q  88 tgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17213192 tgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagtt 17213246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24237733 - 24237655
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24237733 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgagtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 24237655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49070672 - 49070594
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49070672 tggttatgactcttaattgatctatgacttgattgattatgtggacgttaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 49070594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Original strand, 54364894 - 54364971
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaag 140  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  54364894 tggtaatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatgtaaacacttgataattcaattgttgttgaag 54364971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 5372022 - 5372094
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  5372022 tgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtcattgttgttga 5372094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Original strand, 10115712 - 10115764
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaa 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  10115712 atgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaa 10115764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Original strand, 41257711 - 41257750
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41257711 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 41257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Original strand, 11923447 - 11923488
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11923447 atgacttgttgattgtgtggatgtaagtacttgataatgcaa 11923488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13933582 - 13933541
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13933582 atgacttgttgattgtgtgaatgtaaatacttgataatgcaa 13933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 10238812 - 10238856
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtta 143  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10238812 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgatgtta 10238856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 68414 - 68233
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  68414 aactacatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgattaatgacatgttgattgtgtg 68316  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  68315 gacgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 68233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 142
Target Start/End: Original strand, 255777 - 255823
Alignment:
Q  96 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  255777 tgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 255823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25133110 - 25132894
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||| |||    
T  25133110 gttgaacaatagaatatagttgaagttgattaatgaatacctgatgatgaattgtgatattttggtgatgactctgaat-----aatgacatgttggttg 25133016  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtag 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25133015 tgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtatatgttgagtag 25132916  T
Q  202 tttgcattattgagtcttcgct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25132915 tttgcattattgagtcttcgct 25132894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24881533 - 24881318
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24881533 tgaactatagaacatagttgaagttgattaatgattatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttgaatgaataatgacatgttgattgtg 24881434  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24881433 tggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtgtatgttgagtagtt 24881334  T
Q  204 tgcattattgagtctt 219  Q
     ||||||||| |||||    
T  24881333 ggcattattgggtctt 24881318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Original strand, 9782201 - 9782313
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9782201 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgataatt-ggtggtgactcttcaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgcaa 9782299  T
Q  129 ttgttgttgaagtt 142  Q
    ||||||||||||||    
T  9782300 ttgttgttgaagtt 9782313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 185
Target Start/End: Original strand, 40641639 - 40641738
Alignment:
Q  86 aatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |  ||||||||||| | ||||| ||||    
T  40641639 aatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactttgttgttgta 40641738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342830
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgta 189  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgta 24342830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19665475 - 19665386
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgt 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||    
T  19665475 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgttggtgt 19665386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6093661 - 6093580
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgt 176  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  6093661 ttgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgt 6093580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Original strand, 45619350 - 45619448
Alignment:
Q  55 atgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||    |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  45619350 atgataatgtggtgatgactcatatttgaattgtgacttgttgattgtgtagacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttaatcaatgtaa 45619448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20272243 - 20272110
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||| || ||||||| |||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  |  |    
T  20272243 tggtgatgactcttatttgaattatgacttgattgattgagtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtg 20272144  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgtt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20272143 tacttttacattgttgttggtgaatgtatatgtt 20272110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Original strand, 24562193 - 24562270
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaag 140  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24562193 tggtgatgacttttgattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaag 24562270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18534672 - 18534598
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18534672 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaa-tacttgataatgcaattgttgttga 18534598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18534846 - 18534785
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  18534846 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 18534785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Original strand, 39668592 - 39668633
Alignment:
Q  87 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39668592 atgacctgttgattgtatggatgtaaatgcttgataatgcaa 39668633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43641633 - 43641597
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43641633 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 43641597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 200
Target Start/End: Original strand, 3231 - 3425
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  3231 aactatagaatatagttgaagttgattaatcaatacgtgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgatgattgtgtg 3330  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 200  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331 gacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagta 3425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1526
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  1344 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtg 1443  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1444 gatgtaaatgcatgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 1526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Original strand, 98430 - 98611
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  98430 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacgtgttgatgaattatgatcttt-ggtgacgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 98528  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  98529 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 98611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30018 - 29837
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30018 aactatatgatgtagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgaccttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 29920  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgt 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29919 gatgtaaatgcttggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 29837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12360 - 12187
Alignment:
Q  6 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12360 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttag-tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 12262  T
Q  106 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  12261 gatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacattgtgttg 12187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 198640 - 198797
Alignment:
Q  18 tagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgct 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  198640 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatcttt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgtt 198738  T
Q  118 tgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  198739 tgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 198797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2374
Alignment:
Q  4 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2225 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgataattttgtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 2324  T
Q  104 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2325 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaa 2374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 213
Target Start/End: Original strand, 2380 - 2413
Alignment:
Q  180 ggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2380 ggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattg 2413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Original strand, 23317 - 23509
Alignment:
Q  15 atatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaat 114  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23317 atatagttaaagttgattaatgaatatatgttgatgaagtatgatattt--gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaat 23414  T
Q  115 gcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatt 212  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23415 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttagattgtgttgctg--tgtataagttgagtag-ttgcattatt 23509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 19073 - 19244
Alignment:
Q  37 aatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgtt 136  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19073 aatatatgttgatgaagtatgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 19171  T
Q  137 gaagttaagcaatgtaattgg-tgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatt 212  Q
    | |||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19172 ggagttgaacaatgtaactggatgt-gtacttttacattgtgttggtg--tgtataagttgagtag-ttgcattatt 19244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 28649 - 28820
Alignment:
Q  37 aatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgtt 136  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28649 aatatatgttgatgaagtatgatattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 28747  T
Q  137 gaagttaagcaatgtaattgg-tgtcgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattatt 212  Q
    | |||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28748 ggagttgaacaatgtaactggatgt-gtacttttacattgtgttggtg--tgtataagttgagtag-ttgcattatt 28820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1210
Alignment:
Q  2 gttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattg 101  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  1061 gttgaactatagagtatagttgaagttgattaatgaatacatgatgatgaattgtgatattttgatgatgact--taattgaataatgacatgttgattg 1158  T
Q  102 tgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1159 tgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52188 - 52047
Alignment:
Q  35 tgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||  || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52188 tgaatacatgttgatgaattataatcctt--gtcatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttg 52091  T
Q  135 ttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgt 178  Q
    |||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  52090 ttgaagttgagcaatgtaattggaggtttacttttacattgtgt 52047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5620 - 5464
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaa 128  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5620 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaa 5521  T
Q  129 ttgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |  ||| | ||||||||||||| ||||    
T  5520 ttgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgta 5464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11478 - 11331
Alignment:
Q  48 atgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagc 146  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11478 atgaatgatgataatgtggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatc 11379  T
Q  147 aatgtaattggtgtcgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatg 193  Q
    |||||||  || |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11378 aatgtaaaaggaggtgtacttttacattgttgttggtgaatgtatatg 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 472
Alignment:
Q  29 gattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtga-tgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgca 127  Q
    |||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  628 gattaatgaatgtgtgttgatgaatggtgatattt-ggtgaatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgca 530  T
Q  128 attgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    |||||||||| ||||   ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  529 attgttgttggagttttacaaagtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 193
Target Start/End: Original strand, 10662 - 10809
Alignment:
Q  48 atgaattatgatattttggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagc 146  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  10662 atgaatgatgataatgtggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatc 10761  T
Q  147 aatgtaattggtgtcgtacttttacattg-tgttggtgtatgtatatg 193  Q
    |||||||  || |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10762 aatgtaaaaggagatgtacttttacattgttgttggtgaatgtatatg 10809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 219
Target Start/End: Original strand, 25363 - 25420
Alignment:
Q  162 gtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctt 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363 gtacttttacattgtgttggagtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctt 25420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4789 - 4711
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4789 tggttatgactcttaattgatctatgacttgattgattgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9628 - 9552
Alignment:
Q  66 gtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9628 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 9552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 180
Target Start/End: Original strand, 105965 - 106049
Alignment:
Q  96 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttg 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  105965 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttg 106049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50390 - 50304
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcgtacttttacattgtgttggtgta 185  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |  ||| | ||||||||||||| ||||    
T  50390 ttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgta 50304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 15213 - 15370
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttg-attgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggtgtcg 162  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || || |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||| ||| |  |    
T  15213 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgatggattgtgtggaagtaaatactttataattcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggaggtg 15311  T
Q  163 tacttttacattg-tgttggtgtatgtatatgttgagt-agtttgcattattgagtctt 219  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||   || | ||||||||||||||||||    
T  15312 tacttttacattgtttttggtgaatgtatatgtgaggtgattttgcattattgagtctt 15370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 14998 - 15043
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgtt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  14998 tgttgaactatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatgtt 15043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 1570 - 1666
Alignment:
Q  95 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattgg-tgtcgtacttttacattg-tgttggtgtatgtat 190  Q
    |||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1570 ttgattatgtggacgtaattacttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgt-gtacttttacattgttgttggtgaatgtat 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 44935 - 45007
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44935 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttga 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2376
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 141  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2299 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattaattgtgtggac-taaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12562 - 12473
Alignment:
Q  64 tggtgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||| | | ||||||||    
T  12562 tggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgcacgtaaatacttgataatgcaattgattttgaagatgatcaatgtaa 12473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 1411 - 1472
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  1411 tgttgaactatatgatatagttgacgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 1472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5791 - 5852
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||    
T  5791 tgttgaactatatgatatagttgacgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 34787 - 34858
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34787 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttga 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 130727 - 130656
Alignment:
Q  67 tgatgactcttaattgatcaatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  130727 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 130656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 85228 - 85189
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 138  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  85228 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 85189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 346
Alignment:
Q  96 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 142  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  392 tgattatgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgttgaagtt 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 12240 - 12284
Alignment:
Q  1 tgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  12240 tgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 12284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 78191 - 78227
Alignment:
Q  99 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  78191 ttgtgtggacgtaaattcttgataatgcaattgttgt 78227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University