View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_61 (Length: 422)

Name: NF11737A_low_61
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_61
NF11737A_low_61
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (15-405)||(9905121-9905511)
chr2 (15-405)||(9770311-9770700)
chr2 (15-405)||(39177646-39178036)
chr2 (15-405)||(11402724-11403114)
chr2 (15-405)||(10269858-10270248)
chr2 (15-405)||(27224302-27224692)
chr2 (15-405)||(43348275-43348665)
chr2 (15-345)||(40225164-40225494)
chr2 (15-345)||(4212763-4213093)
chr2 (15-345)||(22957333-22957663)
chr2 (20-345)||(29247094-29247419)
chr2 (15-345)||(43085567-43085897)
chr2 (15-345)||(34797831-34798161)
chr2 (15-345)||(24335364-24335694)
chr2 (15-275)||(35255864-35256124)
chr2 (15-275)||(35266488-35266748)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (15-405)||(10633924-10634314)
chr3 (15-405)||(13124611-13125001)
chr3 (15-405)||(14468537-14468927)
chr3 (15-405)||(23760210-23760600)
chr3 (15-405)||(12245088-12245478)
chr3 (15-405)||(4746635-4747025)
chr3 (15-405)||(12293720-12294110)
chr3 (15-405)||(16426689-16427079)
chr3 (15-405)||(24391049-24391439)
chr3 (15-405)||(24662786-24663176)
chr3 (15-405)||(5624928-5625318)
chr3 (15-405)||(5873231-5873621)
chr3 (15-405)||(41686565-41686955)
chr3 (15-402)||(8777574-8777961)
chr3 (15-405)||(5513588-5513978)
chr3 (15-405)||(5544551-5544941)
chr3 (15-405)||(38197687-38198077)
chr3 (15-405)||(39375001-39375391)
chr3 (15-405)||(11279930-11280320)
chr3 (15-345)||(20680792-20681122)
chr3 (15-405)||(28321768-28322158)
chr3 (15-344)||(37869375-37869704)
chr3 (15-344)||(37877893-37878222)
chr3 (31-345)||(19781350-19781664)
chr3 (31-345)||(6217647-6217961)
chr3 (15-345)||(13380262-13380592)
chr3 (15-345)||(13390856-13391186)
chr3 (15-277)||(18486907-18487169)
chr3 (15-282)||(9990922-9991186)
chr3 (16-275)||(6498007-6498266)
chr3 (29-275)||(12185385-12185628)
chr3 (15-195)||(16388628-16388808)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (15-405)||(31841072-31841462)
chr5 (15-405)||(6983460-6983850)
chr5 (15-405)||(14037695-14038085)
chr5 (15-405)||(14560871-14561261)
chr5 (15-405)||(23303932-23304322)
chr5 (15-405)||(24574726-24575116)
chr5 (15-405)||(24590879-24591269)
chr5 (15-405)||(39493703-39494093)
chr5 (15-405)||(24819693-24820083)
chr5 (15-405)||(27467815-27468205)
chr5 (15-402)||(35223163-35223550)
chr5 (15-405)||(9343608-9343998)
chr5 (15-405)||(14449827-14450217)
chr5 (15-405)||(15996113-15996503)
chr5 (15-405)||(23369589-23369979)
chr5 (15-405)||(23704433-23704823)
chr5 (15-405)||(30230244-30230634)
chr5 (15-405)||(36585333-36585723)
chr5 (15-405)||(42050433-42050823)
chr5 (15-405)||(24815567-24815957)
chr5 (15-345)||(22154234-22154564)
chr5 (15-345)||(40398080-40398410)
chr5 (15-345)||(5293356-5293686)
chr5 (15-345)||(27606235-27606565)
chr5 (64-345)||(39360214-39360495)
chr5 (51-345)||(34779600-34779894)
chr5 (15-275)||(17726707-17726967)
chr5 (15-275)||(17614850-17615110)
chr5 (15-275)||(31356324-31356584)
chr5 (15-275)||(37732780-37733040)
chr5 (15-214)||(15766617-15766816)
chr5 (15-214)||(27045052-27045251)
chr5 (15-195)||(31445721-31445901)
chr5 (19-275)||(36695486-36695739)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (15-405)||(4995329-4995719)
chr4 (19-405)||(14847475-14847861)
chr4 (15-405)||(21999350-21999740)
chr4 (15-405)||(453495-453885)
chr4 (15-405)||(10748132-10748522)
chr4 (15-405)||(10961901-10962291)
chr4 (15-405)||(36021221-36021611)
chr4 (15-405)||(30934021-30934412)
chr4 (15-345)||(16258791-16259121)
chr4 (15-405)||(27659543-27659933)
chr4 (15-345)||(27822529-27822859)
chr4 (64-345)||(24025068-24025349)
chr4 (31-345)||(19951994-19952308)
chr4 (64-345)||(27190863-27191144)
chr4 (64-345)||(17921073-17921354)
chr4 (15-353)||(40467578-40467916)
chr4 (15-275)||(55752919-55753179)
chr4 (15-275)||(24643252-24643512)
chr4 (15-214)||(49510464-49510663)
chr4 (86-275)||(18760160-18760349)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (20-402)||(1464-1846)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (15-405)||(22450281-22450671)
chr6 (15-405)||(26867674-26868064)
chr6 (15-405)||(26028292-26028682)
chr6 (15-405)||(12724378-12724768)
chr6 (15-405)||(25790586-25790976)
chr6 (15-405)||(3664298-3664688)
chr6 (15-402)||(27375664-27376051)
chr6 (15-402)||(27466021-27466408)
chr6 (15-405)||(16951877-16952267)
chr6 (15-345)||(12857789-12858119)
chr6 (15-345)||(32969550-32969880)
chr6 (54-369)||(27496621-27496936)
chr6 (15-345)||(34814767-34815097)
chr6 (31-345)||(9120095-9120409)
chr6 (15-244)||(32308753-32308982)
chr6 (15-214)||(27344612-27344811)
chr6 (15-214)||(27405352-27405551)
chr6 (15-195)||(26024624-26024804)
chr6 (19-275)||(4633799-4634052)
chr6 (239-405)||(28566552-28566718)
chr6 (224-275)||(26036691-26036742)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (19-405)||(44311-44697)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (17-405)||(12733391-12733779)
chr1 (15-405)||(7510131-7510521)
chr1 (15-405)||(51653451-51653841)
chr1 (15-402)||(5836058-5836445)
chr1 (15-402)||(47615516-47615903)
chr1 (15-405)||(35398088-35398478)
chr1 (15-405)||(35645614-35646004)
chr1 (15-405)||(36244007-36244397)
chr1 (15-345)||(12620794-12621124)
chr1 (15-405)||(3174448-3174838)
chr1 (15-405)||(38097944-38098334)
chr1 (64-345)||(5647345-5647626)
chr1 (15-345)||(21866518-21866848)
chr1 (15-345)||(19181773-19182103)
chr1 (31-345)||(4170173-4170487)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (15-405)||(8009684-8010074)
chr7 (15-405)||(464587-464977)
chr7 (15-405)||(26397711-26398101)
chr7 (15-405)||(40049719-40050109)
chr7 (15-402)||(42868727-42869114)
chr7 (15-402)||(26693359-26693746)
chr7 (15-405)||(2713228-2713618)
chr7 (15-405)||(9088132-9088522)
chr7 (15-345)||(169782-170112)
chr7 (15-405)||(11008084-11008474)
chr7 (15-345)||(8620256-8620586)
chr7 (15-345)||(17957792-17958122)
chr7 (15-345)||(4214902-4215232)
chr7 (15-345)||(22092036-22092366)
chr7 (20-345)||(9436164-9436489)
chr7 (20-345)||(21000086-21000411)
chr7 (15-276)||(5688428-5688689)
chr7 (31-345)||(6874909-6875223)
chr7 (15-275)||(1990449-1990709)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (15-405)||(3356200-3356590)
chr8 (15-405)||(9344017-9344407)
chr8 (15-405)||(44484031-44484421)
chr8 (15-405)||(36295840-36296230)
chr8 (15-402)||(36080824-36081211)
chr8 (15-405)||(244726-245116)
chr8 (15-405)||(13696135-13696525)
chr8 (15-345)||(6153979-6154309)
chr8 (31-345)||(26114204-26114518)
chr8 (15-345)||(15788297-15788627)
chr8 (64-405)||(29079358-29079699)
chr8 (15-345)||(19131601-19131924)
chr8 (304-405)||(808135-808236)
chr8 (86-275)||(32085397-32085586)
chr8 (157-204)||(19932164-19932211)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (15-405)||(34032-34422)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (15-405)||(44525-44915)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (15-370)||(5193-5548)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (47-345)||(21277-21575)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (15-353)||(5261-5599)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (15-346)||(2044-2375)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (15-275)||(3994-4254)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (15-353)||(50566-50904)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (86-275)||(4279-4468)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9905511 - 9905121
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9905511 ggacatcatccaaatcctccacctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 9905412  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9905411 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttc 9905312  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  |||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||||    
T  9905311 aggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgtacatccagatgatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgacta 9905212  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  9905211 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 9905121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9770700 - 9770311
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9770700 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 9770601  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  9770600 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 9770501  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  9770500 aagctgatcttcttgttgta-ggtttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 9770402  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  9770401 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 9770311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39178036 - 39177646
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39178036 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 39177937  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  39177936 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgtctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 39177837  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  39177836 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatatggatgtgatgagtgacta 39177737  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39177736 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 39177646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11403114 - 11402724
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11403114 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 11403015  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  11403014 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 11402915  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  11402914 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 11402815  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11402814 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaattagcctcatcttgactagagttgccccattgat 11402724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 10269858 - 10270248
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10269858 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 10269957  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  10269958 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggctacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 10270057  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     | || || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  10270058 agactgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 10270157  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10270158 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 10270248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 27224302 - 27224692
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27224302 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 27224401  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  27224402 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 27224501  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || |||| ||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  27224502 aagctgattttctggttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 27224601  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27224602 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 27224692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 43348275 - 43348665
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  43348275 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 43348374  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  43348375 ttctgcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 43348474  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || | ||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  43348475 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacattcaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 43348574  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43348575 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 43348665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 40225164 - 40225494
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40225164 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 40225263  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  40225264 ttcagcaaggtattattccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 40225363  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  40225364 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 40225463  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  40225464 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 40225494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 4212763 - 4213093
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4212763 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 4212862  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  4212863 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 4212962  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  4212963 aagctgatcttcagattgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 4213062  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  4213063 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 4213093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22957663 - 22957333
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22957663 ggacatcatccaaatcctccatttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 22957564  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  22957563 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 22957464  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  22957463 aagctgatcttctgattgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 22957364  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22957363 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 22957333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 345
Target Start/End: Original strand, 29247094 - 29247419
Alignment:
Q  20 tcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29247094 tcatccaagtcctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 29247193  T
Q  120 caagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggct 219  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||   ||    
T  29247194 caagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaaact 29247293  T
Q  220 aatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatca 319  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || | ||||||||||| ||||    
T  29247294 tatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgactagatca 29247393  T
Q  320 gatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  29247394 gatatggcatcagattcatgcatatc 29247419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 43085567 - 43085897
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43085567 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 43085666  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| | |||    
T  43085667 atcagcgagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttc 43085766  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || | |||||||||||    
T  43085767 aagcttatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgacta 43085866  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43085867 gatcagatatggcatcagattcatgcatatc 43085897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34798161 - 34797831
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34798161 ggacattatccaaatcttccacttcttcctgaatagtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagccgcatc 34798062  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  34798061 ttgagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 34797962  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  34797961 aagctgatcttcttgttgtagcttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccagtggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 34797862  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34797861 ggtcagatattacatcagattcatgcatatc 34797831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24335694 - 24335364
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24335694 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaaggttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 24335595  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||| | |||    
T  24335594 ttcagccagatattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatatatctcttcagggacatctttc 24335495  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24335494 aagatgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24335395  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24335394 gatcagatattgcatcagattcatgcatatc 24335364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 35255864 - 35256124
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35255864 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 35255963  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  35255964 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 35256063  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || ||||  || || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  35256064 aagctgattttctgattataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 35256124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 35266488 - 35266748
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35266488 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 35266587  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  35266588 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 35266687  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || ||||  || || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  35266688 aagctgattttctgattataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 35266748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10634314 - 10633924
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10634314 ggacatcatccaaatcctccacttcctcatgaatagtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 10634215  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  10634214 atcagcaaggtatacttccttggtgatatgcttcttcttggattttctgcctttagccacaggcagagcaccactatacatttcatcagggacatccttc 10634115  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |   ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    
T  10634114 agatcaatcttcttattgtaggttttgtagaagtccatgatgtaagccctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgacta 10634015  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  10634014 gatcagatatgacatcagattcatgcatatttgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatctttaccagagttgccccattgat 10633924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 13124611 - 13125001
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13124611 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggaaatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 13124710  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  13124711 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 13124810  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  13124811 aagctgatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtatgctctctgcacatccagaggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 13124910  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  13124911 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 13125001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 14468537 - 14468927
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14468537 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctaagcaccctcctcagtagcatc 14468636  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  14468637 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacagacagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 14468736  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  14468737 aagctgatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtatgctctctgcacatccagaggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 14468836  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  14468837 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 14468927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 23760210 - 23760600
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760210 ggacatcatccaaatcctccacctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 23760309  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||    
T  23760310 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctatctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttc 23760409  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || | |||||||||||    
T  23760410 aagctgatctttttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatggggatgtgatgagtgacta 23760509  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  23760510 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 23760600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12245478 - 12245088
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245478 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctaaatggtggtcaatgcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 12245379  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12245378 atcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttc 12245279  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  |||||| || ||||| |  |||||||| |||| |||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    
T  12245278 aggtcaatctttttcttgtaagacttgtagaattccatgatgaaagtcctttgcacatccagaggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgacta 12245179  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  12245178 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatattgaccagagttgccccattgat 12245088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 4746635 - 4747025
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4746635 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 4746734  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  4746735 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 4746834  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  4746835 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 4746934  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4746935 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 4747025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12294110 - 12293720
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12294110 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 12294011  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  12294010 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 12293911  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  12293910 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 12293811  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12293810 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 12293720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16427079 - 16426689
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16427079 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatagtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 16426980  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  16426979 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 16426880  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  16426879 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 16426780  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16426779 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 16426689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24391439 - 24391049
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24391439 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 24391340  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  24391339 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 24391240  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24391239 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24391140  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24391139 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 24391049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 24662786 - 24663176
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24662786 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 24662885  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  24662886 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 24662985  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24662986 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24663085  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24663086 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 24663176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5625318 - 5624928
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5625318 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 5625219  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  5625218 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttgaccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 5625119  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  5625118 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 5625019  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5625018 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 5624928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5873621 - 5873231
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5873621 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 5873522  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  5873521 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 5873422  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  5873421 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 5873322  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5873321 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaattagcctcatcttgactagagttgccccattgat 5873231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 41686565 - 41686955
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41686565 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 41686664  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  41686665 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 41686764  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  41686765 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 41686864  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41686865 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgattagagttgccccattgat 41686955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Original strand, 8777574 - 8777961
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8777574 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 8777673  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  8777674 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatccttt 8777773  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  8777774 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagacta 8777873  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||||    
T  8777874 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaatctagtttctggcaagttgagaccagcttcattttgaccaaggttgccccatt 8777961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 5513588 - 5513978
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5513588 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 5513687  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  5513688 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 5513787  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  5513788 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 5513887  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5513888 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcatgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 5513978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5544941 - 5544551
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5544941 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 5544842  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  5544841 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctatttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 5544742  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  5544741 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatctttcttgcaaatggggatgtgatgagtgacta 5544642  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5544641 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 5544551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 38197687 - 38198077
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38197687 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 38197786  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  38197787 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 38197886  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  38197887 aagctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 38197986  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38197987 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 38198077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 39375001 - 39375391
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39375001 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 39375100  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  39375101 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 39375200  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  39375201 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 39375300  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39375301 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 39375391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11280320 - 11279930
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11280320 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 11280221  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || | | | |||    
T  11280220 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttc 11280121  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  11280120 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 11280021  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  11280020 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 11279930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20681122 - 20680792
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20681122 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 20681023  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  20681022 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 20680923  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  20680922 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 20680823  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  20680822 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 20680792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28322158 - 28321768
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28322158 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 28322059  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  28322058 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 28321959  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  28321958 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 28321859  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  28321858 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 28321768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 37869375 - 37869704
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37869375 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaattgtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 37869474  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  37869475 atcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 37869574  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || | |||||||||||    
T  37869575 aagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgacta 37869674  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatat 344  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37869675 gatcagatatggcatcagattcatgcatat 37869704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 37877893 - 37878222
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37877893 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaattgtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 37877992  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  37877993 atcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 37878092  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || | |||||||||||    
T  37878093 aagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgacta 37878192  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatat 344  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37878193 gatcagatatggcatcagattcatgcatat 37878222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Original strand, 19781350 - 19781664
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  19781350 ctccacttcctcttgaatagtggacaaagttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattct 19781449  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||| |||||||| |    
T  19781450 tccttggtgatctgcttcttctttgattttctaccttttgccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttct 19781549  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19781550 tgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatc 19781649  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  19781650 agattcatgcatatc 19781664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6217961 - 6217647
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| |||||||  |||| |||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  6217961 ctccacttcctcttgaatagtggacaaggtagatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattct 6217862  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||| |||||||| |    
T  6217861 tccttggtgatctgcttcttctttgattttctgcctttggctacaggcagatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttct 6217762  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||| || |||||||||  ||||    
T  6217761 tgtaagtcttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccagaggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgattagatcagatattgcatc 6217662  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  6217661 agattcatgcatatc 6217647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13380592 - 13380262
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13380592 ggacattatccaaatcttccacttcttcctgaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 13380493  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||    
T  13380492 ttgagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttc 13380393  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  13380392 aagctgatcttcttgttgtaggatttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 13380293  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13380292 ggtcagatattgcatcagattcatgcatatc 13380262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13391186 - 13390856
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13391186 ggacattatccaaatcttccacttcttcctgaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 13391087  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||    
T  13391086 ttgagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttc 13390987  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  13390986 aagctgatcttcttgttgtaggatttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 13390887  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13390886 ggtcagatattgcatcagattcatgcatatc 13390856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 18486907 - 18487169
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18486907 ggacatcatccaaatcctccacatcttcctgaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 18487006  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  18487007 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatccttt 18487106  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccaga 277  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18487107 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccaga 18487169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9991186 - 9990922
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||  |  | || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9991186 ggacatcatccaaatcctcctcttcct---gaatggtggacattgcaggtttgacaattttagccttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatc 9991090  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  9991089 accagcaagatattcctccttggtgattggcttattcttggattttctgcctttggccactggcaaagcaccaccatacatttcctcaggaacatccttc 9990990  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatc 282  Q
     ||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  9990989 aggtcaatcttcttgttgtaggatttgtaaaagtccatgatgaatgccctttgaacatccaaaggatc 9990922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6498266 - 6498007
Alignment:
Q  16 gacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatca 115  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6498266 gacaacatccaaatcttcctcctcttcctgaatggtggacattgcaggtttgacatttttagccttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatca 6498167  T
Q  116 tcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcg 215  Q
     |||||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||      
T  6498166 ccagcaagatattcctccttggtgattggcttattcttggattttctgcctatggccactggcaaagcaccaccatacatttcgtcagggacatccttta 6498067  T
Q  216 ggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    ||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |  |||||||||| ||||    
T  6498066 ggtcaatcttcttgttgtaggatttgtaaaagtccatgatgaattccctttgaacatcca 6498007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 12185385 - 12185628
Alignment:
Q  29 tcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggatt 128  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||  | |    
T  12185385 tcctcctcttcct---gaatggtggacattgcaggtttgtcatttttagccttctggtgcttctgaacacccttctcagaatcatcaccagcaagatact 12185481  T
Q  129 cttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttctt 228  Q
    | |||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |  ||| | ||| |||||  ||| || ||||     
T  12185482 cctccttggtgattggctttttcttggatttcctgcctttgaccacaggcaaagcaccaccatacatctggtcaagaacatccttcaagctgattttctc 12185581  T
Q  229 gttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  12185582 attgtaggttttgtagaagtccatgatgtatgccctttgaacatcca 12185628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16388808 - 16388628
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||  |||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16388808 ggacttcatccaagtcctccacttcttcttgaatggtgaaaatagctggtttttccttcttagcattctggtgcttttgagcacccttctcagaagcatc 16388709  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacat 195  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  16388708 accagcaagatattcctccttggtgatcagctttttcttggattttctgtctttggccacatgcaatgcaccaccatacat 16388628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 31841462 - 31841072
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31841462 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 31841363  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  31841362 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 31841263  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  31841262 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 31841163  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  31841162 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 31841072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6983850 - 6983460
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6983850 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 6983751  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  6983750 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 6983651  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  6983650 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 6983551  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6983550 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 6983460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14038085 - 14037695
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14038085 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 14037986  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  14037985 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 14037886  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  14037885 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 14037786  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14037785 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 14037695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 14560871 - 14561261
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14560871 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 14560970  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  14560971 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 14561070  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  14561071 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 14561170  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14561171 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 14561261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23304322 - 23303932
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23304322 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 23304223  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  23304222 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 23304123  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  23304122 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 23304023  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23304022 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 23303932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24575116 - 24574726
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24575116 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 24575017  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  24575016 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 24574917  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24574916 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24574817  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24574816 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 24574726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 24590879 - 24591269
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24590879 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 24590978  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  24590979 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 24591078  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24591079 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24591178  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24591179 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 24591269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 39493703 - 39494093
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39493703 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 39493802  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  39493803 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 39493902  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  39493903 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 39494002  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39494003 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 39494093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 24819693 - 24820083
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24819693 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 24819792  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  24819793 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgtttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 24819892  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24819893 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24819992  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24819993 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 24820083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27468205 - 27467815
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27468205 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 27468106  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  27468105 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 27468006  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  27468005 aggcttattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 27467906  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27467905 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaaccagcctcatcttgactagagttgccccattgat 27467815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35223550 - 35223163
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223550 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacatagcagttttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 35223451  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  35223450 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatccttt 35223351  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  35223350 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagacta 35223251  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||||    
T  35223250 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaatctagtttctggcaagttgagaccagcttcattttgaccaaggttgccccatt 35223163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9343998 - 9343608
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9343998 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 9343899  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  9343898 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 9343799  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  9343798 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 9343699  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9343698 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 9343608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 14449827 - 14450217
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14449827 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttctttgctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 14449926  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  14449927 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 14450026  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  14450027 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 14450126  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14450127 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcaacctcatcttgactagagttgccccattgat 14450217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 15996113 - 15996503
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15996113 ggacatcatccaaatcctccacctcctcaagaatggtggacatagcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 15996212  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  || |||| |   |||    
T  15996213 ttcagcaaggtattattccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttctgggatatatttc 15996312  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
       || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  15996313 taactgatcttcttgttgtagcttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 15996412  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  15996413 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 15996503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23369979 - 23369589
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23369979 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 23369880  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  23369879 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 23369780  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  23369779 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 23369680  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23369679 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 23369589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23704823 - 23704433
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23704823 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 23704724  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  23704723 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 23704624  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  23704623 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 23704524  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23704523 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 23704433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 30230244 - 30230634
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30230244 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 30230343  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  30230344 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 30230443  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  30230444 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 30230543  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30230544 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 30230634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 36585333 - 36585723
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36585333 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttgactttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 36585432  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  36585433 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 36585532  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  36585533 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 36585632  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36585633 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 36585723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 42050823 - 42050433
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  42050823 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccaccttagtagcatc 42050724  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  42050723 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 42050624  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  42050623 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 42050524  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42050523 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 42050433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24815957 - 24815567
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24815957 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtagacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 24815858  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  24815857 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 24815758  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||| ||||  | |||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  24815757 aggctgattttcttgctgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 24815658  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24815657 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 24815567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22154564 - 22154234
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22154564 ggacatcatccaaatccttcacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttctttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 22154465  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  22154464 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 22154365  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  22154364 aagctgatcttctgattgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 22154265  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  22154264 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 22154234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40398410 - 40398080
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| ||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40398410 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaaagttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 40398311  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  40398310 ttcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgccttttgtcacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 40398211  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  40398210 aagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 40398111  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40398110 gatcagatatggcatcagattcatgcatatc 40398080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 5293356 - 5293686
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5293356 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 5293455  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| | |||    
T  5293456 atcagcaagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttc 5293555  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  5293556 aagctaatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 5293655  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5293656 gattagatatggtatcagattcatgcatatc 5293686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 27606235 - 27606565
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27606235 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 27606334  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  27606335 atcagcaagatactcttccttggtgatcttcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 27606434  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || | |||||||||||    
T  27606435 aagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccttttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatatgatgagtgacta 27606534  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27606535 gatcagatatggcatcagattcatgcatatc 27606565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39360495 - 39360214
Alignment:
Q  64 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 163  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39360495 tttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagccagatattcttccttggtgatctggttcttcttagactttctg 39360396  T
Q  164 cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccc 263  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39360395 cctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccc 39360296  T
Q  264 tttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39360295 tttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatc 39360214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 51 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34779894 - 34779600
Alignment:
Q  51 tggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttctt 150  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  34779894 tggacattgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcctccttggtgatctgcttttt 34779795  T
Q  151 cttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtcc 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||  |  ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  34779794 cttggactttctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagtcaatcttcttcttgtaagatttgtagaagtcc 34779695  T
Q  251 aagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    | |||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||| ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34779694 atgatgtaagtcctttgcacatccaggggattcttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatc 34779600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17726967 - 17726707
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  17726967 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 17726868  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17726867 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 17726768  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  17726767 aagctgattttctggttataggttttgtagtggtccatgatatatgccctttgaacctcca 17726707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17615110 - 17614850
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  17615110 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 17615011  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17615010 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 17614911  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  17614910 aagctgattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 17614850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31356584 - 31356324
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  31356584 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 31356485  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  31356484 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 31356385  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  31356384 aagctgattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 31356324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 37732780 - 37733040
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  37732780 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 37732879  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  37732880 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcaactcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 37732979  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  37732980 aagctgattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 37733040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15766816 - 15766617
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  15766816 ggacatcttccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 15766717  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  15766716 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctacttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 15766617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 27045052 - 27045251
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  27045052 ggacatcttccaaatcttccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 27045151  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  27045152 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 27045251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31445901 - 31445721
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31445901 ggacttcatccaagtcctccacttcttcttgaatagtggacatagctggtttttccttcttagctttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatc 31445802  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacat 195  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31445801 accagcaagatattcctccttggtgatcagctttttcttggattttctgcctttggccacaggcaatgcaccaccatacat 31445721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36695739 - 36695486
Alignment:
Q  19 atcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatca 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||  |  | || || || |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36695739 atcatccgaatcctcctcttcct---gaatggtagacatagcagatttgacaattttagcctttttgtgcttctgagcacccttctcagaagcatcacca 36695643  T
Q  119 gcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggc 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||  ||    
T  36695642 gcaagatattcttctttggtgattggcttagttttggacttcctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacatttggtcaggaacatccttcaagc 36695543  T
Q  219 taatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    | || |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  36695542 tgattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 36695486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4995719 - 4995329
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4995719 ggacatcatccaaatcctcctcctcctcaagaatggtggagatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 4995620  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  4995619 atcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcttcagggacatccttc 4995520  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  |||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || | |||||||||||    
T  4995519 aggtcaatctttttcttgtaggatttgtagaattccatgatgaaagttctttgcacatccagaggatctttcttgcatatggggatgtgatgagtgacta 4995420  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| || || |||| ||||||||||||    
T  4995419 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatattgaccagagctgccccattgat 4995329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14847861 - 14847475
Alignment:
Q  19 atcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatca 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14847861 atcatccaaatcctccacttcttcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttca 14847762  T
Q  119 gcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggc 218  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||    
T  14847761 gcaaggtattcttcgttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacagacagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagc 14847662  T
Q  219 taatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatc 318  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | ||||||||||| |||    
T  14847661 tgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatc 14847562  T
Q  319 agatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  14847561 agatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 14847475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 21999350 - 21999740
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21999350 ggacatcatccaaatcctccaccccctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 21999449  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  || |||| | | |||    
T  21999450 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttgaccacaggcagatcaccaccatacatctcttctgggatatctttc 21999549  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  21999550 aagctgatcttcttgttgtagcttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 21999649  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  21999650 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 21999740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 453495 - 453885
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  453495 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 453594  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| | | |||    
T  453595 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggatatctttc 453694  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  453695 aagctgatcttcttgttgtagcttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 453794  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  453795 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 453885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10748522 - 10748132
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10748522 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 10748423  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  10748422 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 10748323  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  10748322 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 10748223  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10748222 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 10748132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10962291 - 10961901
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10962291 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 10962192  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  10962191 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 10962092  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  10962091 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 10961992  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10961991 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 10961901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 36021221 - 36021611
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36021221 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 36021320  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  || |||| | | |||    
T  36021321 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcactaccatacatttcttctgggatatctttc 36021420  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  36021421 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 36021520  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36021521 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 36021611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30934412 - 30934021
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30934412 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 30934313  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg-cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacaccctt 213  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| | | ||    
T  30934312 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgccctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggatatcttt 30934213  T
Q  214 cgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgact 313  Q
    |  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | ||||||||||    
T  30934212 caagctgatcttcttgttgtagcttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgact 30934113  T
Q  314 aaatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  30934112 agatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 30934021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 16258791 - 16259121
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16258791 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 16258890  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  16258891 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 16258990  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  16258991 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtatgctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 16259090  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  16259091 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 16259121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 27659543 - 27659933
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27659543 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 27659642  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || | | | |||    
T  27659643 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttc 27659742  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  27659743 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 27659842  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27659843 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 27659933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27822859 - 27822529
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27822859 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacattgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 27822760  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  27822759 atcagcaagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 27822660  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  27822659 aagttaatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagtcatttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 27822560  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27822559 gatcagatatgacatcagattcatgcatatc 27822529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24025349 - 24025068
Alignment:
Q  64 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24025349 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttctg 24025250  T
Q  164 cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccc 263  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24025249 cctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttctttttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccc 24025150  T
Q  264 tttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||  | || | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24025149 tttgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatc 24025068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19952308 - 19951994
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  19952308 ctccacttcctcttgaatagtggacaaagttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattct 19952209  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| |||||||| |    
T  19952208 tccttggtgatctgcttcttcttagactttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttct 19952109  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  19952108 tgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatc 19952009  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  19952008 agattcatgcatatc 19951994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Original strand, 27190863 - 27191144
Alignment:
Q  64 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 163  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27190863 tttttccttcttagctttctaatgcttctgagcacccttctcagtagcatcctcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctg 27190962  T
Q  164 cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccc 263  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190963 cctttggccacatgcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccc 27191062  T
Q  264 tttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27191063 tttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatatc 27191144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Original strand, 17921073 - 17921354
Alignment:
Q  64 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17921073 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcatccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttctg 17921172  T
Q  164 cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccc 263  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  17921173 cctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatattctttttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctc 17921272  T
Q  264 tttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    | || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17921273 tctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatc 17921354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40467916 - 40467578
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||| | |||| ||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40467916 ggacttcatccaagtccttcacttcttcttgaatggtggaaatagatggtttttccttcttagctttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatc 40467817  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||  | |||    
T  40467816 accagcaagatattcctccttggtgatcagttttttcttggattttctgcctttggccacaggcaatgcaccaccatacatctccttagggacgtctttc 40467717  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | ||   |||||||||||    
T  40467716 aagtcaatcttcttgttgtaagttttgtagaagtccatgatgtaaaccctttgcacatccaggggatctttcttgcaaatagggatgagatgagtgacta 40467617  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatcta 353  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40467616 gatcagatatggcatcagattcatgcatatcagtatcta 40467578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 55753179 - 55752919
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  55753179 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 55753080  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  55753079 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 55752980  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  55752979 aagctgattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 55752919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 24643252 - 24643512
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  24643252 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 24643351  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  24643352 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 24643451  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || ||||  || || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  24643452 aagctgattttctgattataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 24643512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 49510464 - 49510663
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  49510464 ggacatcttccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 49510563  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  49510564 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 49510663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18760349 - 18760160
Alignment:
Q  86 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  18760349 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttctttggtgattggcttagtcttggatttcctgcctttggccacaggcaaagcac 18760250  T
Q  186 caccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    |||||||||| |  ||||| ||| |||||  ||| || ||||  ||||| | |||||| || |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  18760249 caccatacatctggtcaggaacatccttcaagctgattttctgtttgtaggatttgtaaaaatccacgatatatgccctttgaacctcca 18760160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1464
Alignment:
Q  20 tcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 119  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846 tcatccaattcctccatttcttcctgaatggtgaacatagcaggtttttctttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 1747  T
Q  120 caagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggct 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||  |||    
T  1746 caaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctacctttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctcaggaacatccttcaagct 1647  T
Q  220 aatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatca 319  Q
     || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1646 gattttctcgttgtaggttttgtagaagtccatgatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatatgaatctcattagagactagatca 1547  T
Q  320 gatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||  |||| || || ||||||||||||||    
T  1546 gatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgagatcagtctcatattgaccagagttgccccatt 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22450671 - 22450281
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22450671 ggacatcatccaaatcctcctcctcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctaagcacccttctcagtagcatc 22450572  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  22450571 atcagcaaggtattcttccttggtgatctgctttttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcttcagggacatccttc 22450472  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  |||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||| |||  ||||| || |||| ||| || |||||||||||  | || | |||||||||||    
T  22450471 aggtcaatctttttcttgtaggatttgtagaattccatgatgaaagttctttgcacatccataggttctttcttgcatatggggatgtgatgagtgacta 22450372  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  22450371 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatattgaccagagttgccccattgat 22450281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 26867674 - 26868064
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26867674 ggacctcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 26867773  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  26867774 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 26867873  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  26867874 aggctgatcttcttgttgtagcttttgtagtagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 26867973  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  26867974 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaggttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 26868064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 26028292 - 26028682
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26028292 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 26028391  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | | |||    
T  26028392 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggatatctttc 26028491  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  26028492 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 26028591  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26028592 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 26028682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12724768 - 12724378
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12724768 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 12724669  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  12724668 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 12724569  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  12724568 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 12724469  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12724468 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 12724378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 25790586 - 25790976
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25790586 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 25790685  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  25790686 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 25790785  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  25790786 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 25790885  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25790886 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 25790976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 3664298 - 3664688
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3664298 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 3664397  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  3664398 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcgtctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 3664497  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  3664498 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 3664597  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3664598 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 3664688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Original strand, 27375664 - 27376051
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27375664 ggacttcatccaagtcctccacttcctcttgaatagtggacattgcagatttttccttcttaactttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 27375763  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  27375764 atcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctcagggacatccttc 27375863  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | ||   ||||||||| |    
T  27375864 aggtcaatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccatgatgtaagccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatagggatgagatgagtgacca 27375963  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||| | ||||  ||||||| |  |||||||| |||||    
T  27375964 gatcagatatggcatcagattcatgcatatcagtatctagtttcttgaatgttggaatcagtctcatctttagaagagttgctccatt 27376051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Original strand, 27466021 - 27466408
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27466021 ggacttcatccaagtcctccacttcctcttgaatagtggacattgcagatttttccttcttaactttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 27466120  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  27466121 atcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctcagggacatccttc 27466220  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | ||   ||||||||| |    
T  27466221 aggtcaatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccatgatgtaagccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatagggatgagatgagtgacca 27466320  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||| | ||||  ||||||| |  |||||||| |||||    
T  27466321 gatcagatatggcatcagattcatgcatatcagtatctagtttcttgaatgttggaatcagtctcatctttagaagagttgctccatt 27466408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 16951877 - 16952267
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16951877 ggacaccatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 16951976  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  16951977 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 16952076  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  16952077 aggctgattttcttgttgtagcttttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 16952176  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16952177 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 16952267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 12857789 - 12858119
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12857789 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 12857888  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  12857889 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 12857988  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  12857989 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaaaatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 12858088  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12858089 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 12858119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32969880 - 32969550
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32969880 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggttttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 32969781  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  32969780 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcaggaacatctttc 32969681  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  32969680 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 32969581  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  32969580 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 32969550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 369
Target Start/End: Original strand, 27496621 - 27496936
Alignment:
Q  54 acatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttctt 153  Q
    |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27496621 acatagtagatttatccttcctggccttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcatcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctt 27496720  T
Q  154 ggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaag 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||   ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||      
T  27496721 ggactttctgcttttagccacaggcagagcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaaactaattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaga 27496820  T
Q  254 atgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatcta 353  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27496821 atgtatgccttttgaacatccaggggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaagcta 27496920  T
Q  354 ctgtcttgcaagttga 369  Q
     | |||||||||||||    
T  27496921 gtttcttgcaagttga 27496936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34815097 - 34814767
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34815097 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 34814998  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  34814997 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctacctttggtcacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 34814898  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| | ||  | || | |||||||||||    
T  34814897 aagctgatcttctgattgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgtagatggggatgtgatgagtgacta 34814798  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  34814797 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 34814767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9120409 - 9120095
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| |||||||  |||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  9120409 ctccacttcctcttgaatagtggacattgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactct 9120310  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||| | |||  |||||||||||| |    
T  9120309 tccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcatggacatctttcaagctaatcttcttct 9120210  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9120209 tgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatcaaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatc 9120110  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  9120109 agattcatgcatatc 9120095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32308982 - 32308753
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32308982 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttaacttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 32308883  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  32308882 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccaaaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 32308783  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtag 244  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||    
T  32308782 aagctgattttctggttataggttttgtag 32308753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 27344612 - 27344811
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  27344612 ggacatcttccaaattctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttacctttttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 27344711  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  27344712 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 27344811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 27405352 - 27405551
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  27405352 ggacatcttccaaattctccacttcctcaagaatggtggacatagcagattttacctttttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 27405451  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  27405452 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 27405551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 26024624 - 26024804
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26024624 ggacatcatccgaatcttcctcctcttcctgaatggtggacattgcaggtttgtcatttttagccttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatc 26024723  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacat 195  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26024724 accagcaagatattcctccttggtgattggctttttcttggatttcctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacat 26024804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Original strand, 4633799 - 4634052
Alignment:
Q  19 atcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatca 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||  |  | || || || |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4633799 atcatccgaatcctcctcttcct---gaatggtagacatagcagatttgacaattttagcctttttgtgcttctgagcacccttctcagaagcatcacca 4633895  T
Q  119 gcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggc 218  Q
    |||||  ||||||| ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||  ||    
T  4633896 gcaagatattcttctttggtgattggcttagttttggacttcctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacatttggtcaggaacatccttcaagc 4633995  T
Q  219 taatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  4633996 taattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 4634052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 239 - 405
Target Start/End: Original strand, 28566552 - 28566718
Alignment:
Q  239 ttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcat 338  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||||||  | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28566552 ttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatttaggggatctttcttgcatattgggatgtgatgagtgactagatcagttatgacatcagattcat 28566651  T
Q  339 gcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
    ||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  28566652 gcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 28566718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Original strand, 26036691 - 26036742
Alignment:
Q  224 ttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  26036691 ttctcgttgtaggttttgtagaagtccatgatgtatgccctttgaacatcca 26036742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44697 - 44311
Alignment:
Q  19 atcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatca 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44697 atcatccaaatcctccacttcttcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttca 44598  T
Q  119 gcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggc 218  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||    
T  44597 gcaaggtattcttcgttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacagacagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagc 44498  T
Q  219 taatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatc 318  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | ||||||||||| |||    
T  44497 tgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatc 44398  T
Q  319 agatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  44397 agatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaagtcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 44311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 12733391 - 12733779
Alignment:
Q  17 acatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcat 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12733391 acatcatccaaatcctccacctcctcacgaatggtggacatagcaaatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatctt 12733490  T
Q  117 cagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgg 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  || |||| | | |||      
T  12733491 cagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttctgggatatctttcaa 12733590  T
Q  217 gctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaa 316  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | ||||||||||| |    
T  12733591 gctgatcttcttgttgtagcttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactaga 12733690  T
Q  317 tcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  12733691 tcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 12733779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 7510131 - 7510521
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7510131 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 7510230  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  7510231 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 7510330  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  7510331 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 7510430  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7510431 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 7510521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 51653841 - 51653451
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51653841 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccatctcagtagcatc 51653742  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  51653741 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 51653642  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  51653641 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccatctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 51653542  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51653541 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 51653451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Original strand, 5836058 - 5836445
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836058 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacatagcagttttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 5836157  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  5836158 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatccttt 5836257  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  5836258 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagacta 5836357  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||||    
T  5836358 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaatctagtttctggcaagttgagaccagcttcattttgaccaaggttgccccatt 5836445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 47615903 - 47615516
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47615903 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 47615804  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  47615803 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatccttt 47615704  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  47615703 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagacta 47615604  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||||    
T  47615603 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaatctagtttctggcaagttgagaccagcttcattttgaccaaggttgccccatt 47615516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 35398478 - 35398088
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35398478 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttatccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 35398379  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  35398378 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 35398279  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  35398278 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 35398179  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35398178 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 35398088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 35646004 - 35645614
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35646004 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 35645905  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  35645904 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagagtttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 35645805  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  35645804 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 35645705  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35645704 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 35645614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 36244397 - 36244007
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36244397 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 36244298  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  36244297 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 36244198  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  36244197 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 36244098  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36244097 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 36244007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12621124 - 12620794
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12621124 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 12621025  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  12621024 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 12620925  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
       || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  12620924 aaactgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 12620825  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12620824 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 12620794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 3174448 - 3174838
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3174448 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 3174547  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || | | | |||    
T  3174548 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttc 3174647  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  3174648 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 3174747  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3174748 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 3174838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 38097944 - 38098334
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38097944 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 38098043  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  38098044 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 38098143  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  38098144 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 38098243  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  38098244 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 38098334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5647626 - 5647345
Alignment:
Q  64 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5647626 tttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagccagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctg 5647527  T
Q  164 cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccc 263  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5647526 cctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccc 5647427  T
Q  264 tttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5647426 tttgcacatccagtggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatc 5647345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 21866518 - 21866848
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21866518 ggacattatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggatagagttgatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 21866617  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||    
T  21866618 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcctagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttc 21866717  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  21866718 aagctgatcttcagattgtaggttttgtagaactccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 21866817  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21866818 gatcagatattgcatcagattcatgcatatc 21866848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 19181773 - 19182103
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19181773 ggacttcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 19181872  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| | |||    
T  19181873 atcagtaagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttc 19181972  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
       || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| || || ||| | || | |||||||||||    
T  19181973 aaacttatcttcttcttataagttttgtagaagtccaagatgcaagccctttgcacatccaggggatcctttttacagatagggatgtgatgagtgacta 19182072  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19182073 gatcagatatggcatcagattcatgcatatc 19182103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Original strand, 4170173 - 4170487
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  4170173 ctccacttcctcttgaatagtggacaaagttgatttttctttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatactct 4170272  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||| | |||  ||| |||||||| |    
T  4170273 tccttggtgatctgcttcttctttgattttctgccttttgccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcatggacatctttcaagctgatcttcttct 4170372  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | || |||||||| |||||||||| ||||    
T  4170373 tgtaagttttgtagaagttcaagatgtaggtcctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgattagtgactagatcagatatggcatc 4170472  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  4170473 agattcatgcatatc 4170487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8010074 - 8009684
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8010074 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 8009975  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  8009974 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 8009875  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  8009874 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgaacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 8009775  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8009774 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 8009684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 464977 - 464587
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  464977 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 464878  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| | | |||    
T  464877 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggatatctttc 464778  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || | |||||||||||    
T  464777 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatggggatgtgatgagtgacta 464678  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  464677 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 464587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26398101 - 26397711
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26398101 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 26398002  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  26398001 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 26397902  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  26397901 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 26397802  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26397801 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaattagcctcatcttgactagagttgccccattgat 26397711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 40050109 - 40049719
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40050109 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 40050010  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  40050009 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 40049910  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  40049909 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 40049810  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40049809 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttaaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 40049719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Original strand, 42868727 - 42869114
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42868727 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 42868826  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  42868827 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcaggaacatccttc 42868926  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  42868927 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagacta 42869026  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||||    
T  42869027 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaatctagtttctggcaagttgagaccagcttcattttgaccaaggttgccccatt 42869114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26693746 - 26693359
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26693746 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 26693647  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  26693646 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 26693547  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  26693546 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 26693447  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26693446 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccatt 26693359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 2713618 - 2713228
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||  |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2713618 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacaatgcagatttttctttctgagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 2713519  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  2713518 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 2713419  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  2713418 aagctgatcttcttgttgtagcttttgtagtagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 2713319  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  2713318 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaggttgaaatcagcctcatcttgaccagagttgccccattgat 2713228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 9088132 - 9088522
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  9088132 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcatccacctcagtagcatc 9088231  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  9088232 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 9088331  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  9088332 aggctgattttcttgttgtagttcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 9088431  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  9088432 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 9088522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 169782 - 170112
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  169782 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 169881  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  169882 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 169981  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  169982 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 170081  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  170082 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 170112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 11008084 - 11008474
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11008084 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 11008183  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  11008184 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 11008283  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  11008284 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 11008383  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  11008384 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 11008474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 8620256 - 8620586
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8620256 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 8620355  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  8620356 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 8620455  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  8620456 aagctgatcttcagattgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 8620555  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  8620556 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 8620586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17958122 - 17957792
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17958122 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 17958023  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  17958022 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 17957923  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  17957922 aagctgatcttcagattgtaggttttgtagaagtccaagatgtagactctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 17957823  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  17957822 gatcagatattgcatcagattcacgcatatc 17957792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 4214902 - 4215232
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4214902 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttcattcttggttttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 4215001  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  4215002 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcaaggacatctttc 4215101  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||| ||    
T  4215102 aagctgatattcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgatta 4215201  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  4215202 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 4215232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 22092036 - 22092366
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22092036 ggacattatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggatagagttgatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 22092135  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  22092136 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttc 22092235  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  22092236 aagctgatcttcagattgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 22092335  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22092336 gatcagatattgcatcagattcatgcatatc 22092366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 345
Target Start/End: Original strand, 9436164 - 9436489
Alignment:
Q  20 tcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 119  Q
    |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9436164 tcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 9436263  T
Q  120 caagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggct 219  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||  |||    
T  9436264 caagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgtctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagct 9436363  T
Q  220 aatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatca 319  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| ||||    
T  9436364 tatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatca 9436463  T
Q  320 gatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  9436464 gatatggcatcagattcatgcatatc 9436489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21000411 - 21000086
Alignment:
Q  20 tcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 119  Q
    |||||||| | |||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21000411 tcatccaagttctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcag 21000312  T
Q  120 caagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggct 219  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| | |||  |||    
T  21000311 caagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttggccataggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttcaagct 21000212  T
Q  220 aatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatca 319  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| ||||    
T  21000211 aatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatccttcttgcaaatagggatgtgatgagtgactagatca 21000112  T
Q  320 gatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  21000111 gatatggcatcagattcatgcatatc 21000086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 5688428 - 5688689
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5688428 ggacttcatccaagtcctccatttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 5688527  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  5688528 atcagcaagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttctgcctttagccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 5688627  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccag 276  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5688628 aagctaatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccag 5688689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6875223 - 6874909
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| ||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  6875223 ctccacttcctcttgaatagtggacaaagttgatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcactcttctcagtagcatcttcagcaagatattct 6875124  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||| |||||||| |    
T  6875123 tccttggtgatctgcttcttctttgattttctgtcttttgccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttct 6875024  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | || | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6875023 tgtaagttttgtaaaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttccagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatc 6874924  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  6874923 agattcatgcatatc 6874909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 1990449 - 1990709
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  1990449 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttctttgctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 1990548  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  1990549 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttc 1990648  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  1990649 aagctgattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 1990709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3356590 - 3356200
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3356590 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatatcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccatctcagtagcatc 3356491  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  3356490 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 3356391  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  3356390 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 3356291  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3356290 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 3356200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 9344017 - 9344407
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9344017 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 9344116  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  9344117 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 9344216  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  9344217 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 9344316  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9344317 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 9344407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 44484031 - 44484421
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44484031 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 44484130  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  44484131 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 44484230  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  44484231 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 44484330  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44484331 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 44484421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 36295840 - 36296230
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36295840 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 36295939  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  36295940 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 36296039  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  36296040 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 36296139  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36296140 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaattagcctcatcttgactagagttgccccattgat 36296230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Original strand, 36080824 - 36081211
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36080824 ggacatcatccaaatcctccacttcttcctgaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 36080923  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  36080924 atcagctagatactcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcaggaacatccttc 36081023  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  36081024 aagctgattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagacta 36081123  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccatt 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||||    
T  36081124 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaatctagtttctggcaagttgagaccagcttcattttgaccaaggttgccccatt 36081211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 244726 - 245116
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  244726 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 244825  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | |||    
T  244826 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttc 244925  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  244926 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 245025  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  245026 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 245116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13696525 - 13696135
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13696525 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 13696426  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || | | | |||    
T  13696425 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttc 13696326  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  13696325 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 13696226  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  13696225 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttgctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactaaggttgccccattgat 13696135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 6153979 - 6154309
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6153979 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatc 6154078  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  6154079 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttc 6154178  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||  | || | |||||||||||    
T  6154179 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttacagatggggatgtgatgagtgacta 6154278  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  6154279 gatcagatattgcatctgattcacgcatatc 6154309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 345
Target Start/End: Original strand, 26114204 - 26114518
Alignment:
Q  31 ctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattct 130  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  26114204 ctccacttcctctagaatagtggacaaagtagatttttccttcttaactttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattct 26114303  T
Q  131 tccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| |||||||| |    
T  26114304 tccttagtgatctgcttcttctttgattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttct 26114403  T
Q  231 tgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatc 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26114404 tgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccagaggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatc 26114503  T
Q  331 agattcatgcatatc 345  Q
    |||||||||||||||    
T  26114504 agattcatgcatatc 26114518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15788627 - 15788297
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15788627 ggacatcatccaaatcttccacttcttcctgaatagtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatc 15788528  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||    
T  15788527 ttcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttc 15788428  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  | || | |||||||||||    
T  15788427 aagctgatcttcttgttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatctaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgacta 15788328  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15788327 gatcagatattgcatcagattcatgcatatc 15788297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 405
Target Start/End: Original strand, 29079358 - 29079699
Alignment:
Q  64 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 163  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  29079358 ttttgccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctg 29079457  T
Q  164 cctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccc 263  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | | ||| |||| || |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| ||||    
T  29079458 cctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtataagatgtaggccc 29079557  T
Q  264 tttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgca 363  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  29079558 tctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgca 29079657  T
Q  364 agttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29079658 tgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 29079699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 19131601 - 19131924
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19131601 ggacttcatccaagtcctccacttcctcttgaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 19131700  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| | |||    
T  19131701 atcagcaagatactcttccttggtgatctgcttcttctttgactttct-------gccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttc 19131793  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
       || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || | |||||||||||    
T  19131794 aaacttatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgacta 19131893  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19131894 gatcagatatggcatcagattcatgcatatc 19131924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 304 - 405
Target Start/End: Original strand, 808135 - 808236
Alignment:
Q  304 atgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  808135 atgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcctgcatgttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattg 808234  T
Q  404 at 405  Q
    ||    
T  808235 at 808236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32085586 - 32085397
Alignment:
Q  86 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  32085586 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttccttggtgattggcttagtcttggatttcctgcctttggccacaggcaaagcac 32085487  T
Q  186 caccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    |||||||||| |  ||||| ||| |||||  ||| || |||| ||| || | ||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  32085486 caccatacatctggtcaggaacatccttcaagctgattttctggttataggatttgtagaaatccatgatatatgccctttgaacctcca 32085397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 19932164 - 19932211
Alignment:
Q  157 ctttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagg 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19932164 ctttctgcttttggccacaggcagagcacctccatacattgtctcagg 19932211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Original strand, 34032 - 34422
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34032 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatc 34131  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  || |||| | | |||    
T  34132 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccactatacatttcttctgggatatctttc 34231  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  34232 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 34331  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34332 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 34422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44915 - 44525
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  44915 ggacatcatccaaatcctccacttcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttctttgctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatt 44816  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || | | | |||    
T  44815 ttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttc 44716  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  44715 aggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgacta 44616  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaagtcagcttcatcttaactagagttgccccattgat 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44615 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaaatcagcctcatcttgactagagttgccccattgat 44525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 5193 - 5548
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5193 ggacttcatccaattcctccacttcttcctgaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctaatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 5292  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  5293 atcagctagatattcttccttggtgatctgcttcttcttggattttctgcctttagccacaggcaaagcaccaccatacatttcctcaaggacatccttc 5392  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
     ||  |||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    
T  5393 aggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccagaggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgacta 5492  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctactgtcttgcaagttgaa 370  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5493 gatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttgcaagttgaa 5548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 345
Target Start/End: Original strand, 21277 - 21575
Alignment:
Q  47 atggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgct 146  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  21277 atggtggacatagagggtttttcctttttggctctctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatattcctctttggtgatctgct 21376  T
Q  147 tcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaa 246  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21377 tcttctttgattttctacttttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctctgggatatccttcaggtcaatcttcttgttgtatgttttgtagaa 21476  T
Q  247 gtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatc 345  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477 gtctatgatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatatc 21575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 353
Target Start/End: Original strand, 5261 - 5599
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5261 ggacttcatccaagtcctccacttcttcttgaatagtggacatagcagatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 5360  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  5361 atcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttcttggattttctgcctttggccacaggcaaggcaccaccatacatctcctcagggacatcgttc 5460  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      |  ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||| | ||||| |||||||| ||| | ||   ||| ||||| |    
T  5461 aagtcaatcttctttttgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacctcccggggatctttcttgcaaatagggatgagatgtgtgacca 5560  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatcta 353  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5561 gatcagatatggcatcagattcatgcatatcagtatcta 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 346
Target Start/End: Original strand, 2044 - 2375
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2044 ggacttcatccaagtcctccacttcttcttgaatggtgaaaatagctggtttttccttcttaactttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatc 2143  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| | |||    
T  2144 accagcaagatattcctccttggtgatcagctttttcttggattttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttc 2243  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
      |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | ||   ||||||||| |    
T  2244 aagtcaatcttcttgttgtaagttttgtagaagtccatgatgtaaaccctttgcacctccaggggatctttcttgcaaatagggatgagatgagtgacca 2343  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatct 346  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2344 gatcagatatggcatcagattcatgcatatct 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 3994
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4254 ggacatcatcctaatcttcctcctcttcctgaatggtggacattgcaggtttgtcatttttagccttctggtgcttctgagcacctttctcagaagcatc 4155  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4154 accagcaagatattcctccttggtgattggctttttcttggattttctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacatttcctcagggacatccttc 4055  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
     ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  4054 aggtcaatcttcttgttgtaggttttgtaaaagtccatgatgtatgccctttgaacatcca 3994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50904 - 50566
Alignment:
Q  15 ggacatcatccaaatcctcctcttcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatc 114  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  50904 ggacttcatccaagtcctccacttcctcttgaatggtgaaaacagctggtttttccttcttagctttctggtgcttctgagctcccttttcagaagcatc 50805  T
Q  115 atcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacattttctcagggacacccttc 214  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | |||    
T  50804 accagcaagatattcctccttggtgatcagctttctcttggattttctacctttggccacaggcagtgcaccaccaaacatttcatcagggacatctttc 50705  T
Q  215 gggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtccagaggatccttcttgcatatatgaatctcatgagtgacta 314  Q
         |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | || | |||||| |  |    
T  50704 aaatcaatcttcttgttataagttttgtagaagtccattatgtaaaccctttgcacatccaggggatctttcttgcaaatggggatttgatgagtaatca 50605  T
Q  315 aatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatcta 353  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  50604 aatcagatattgcatcagattcatgcatgtcagtatcta 50566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 275
Target Start/End: Original strand, 4279 - 4468
Alignment:
Q  86 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagggattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  4279 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttctttggtgattggcttagttttggacttcctgcctttggccacaggcaaagcac 4378  T
Q  186 caccatacattttctcagggacacccttcgggctaatcttcttgttgtatgttttgtagaagtccaagatgtaagccctttgaacgtcca 275  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||  |||||| |||| ||| || |||||||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  4379 caccatacatttggtcaggaacatccttcaagctaattttctggttataggttttgtagtgatccatgatatatgccctttgaacctcca 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University